AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003539.01

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MsG0180003539.01.T01 AT4G08450 30.818 159 105 3 584 740 764 919 2.64e-12 72.0
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MsG0180003539.01.T01 AT4G16920 32.444 712 428 18 1 696 1 675 5.81e-89 312
MsG0180003539.01.T01 AT4G16920 28.030 264 170 9 584 844 906 1152 3.72e-14 78.2
MsG0180003539.01.T01 AT5G46490 35.951 573 328 15 16 570 52 603 7.90e-89 299
MsG0180003539.01.T01 AT4G16920 32.444 712 428 18 1 696 1 675 8.08e-89 312
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MsG0180003539.01.T01 AT5G40910 28.892 713 443 18 195 880 2 677 4.79e-66 241
MsG0180003539.01.T01 AT1G72890 36.476 403 219 8 16 388 39 434 5.94e-66 231
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MsG0180003539.01.T01 AT5G40910 29.493 651 423 14 195 840 2 621 3.15e-65 238
MsG0180003539.01.T01 AT5G40060 31.197 593 317 16 215 731 11 588 5.29e-65 236
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MsG0180003539.01.T01 AT1G63750 26.177 722 415 16 171 838 1 658 1.44e-62 231
MsG0180003539.01.T01 AT4G19520 26.072 886 527 30 17 832 6 833 1.88e-62 233
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MsG0180003539.01.T01 AT4G19520 26.072 886 527 30 17 832 6 833 2.28e-62 233
MsG0180003539.01.T01 AT4G19520 35.714 168 95 4 18 183 1403 1559 2.94e-21 101
MsG0180003539.01.T01 AT4G19520 26.072 886 527 30 17 832 6 833 4.00e-62 232
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MsG0180003539.01.T01 AT4G19520 39.583 144 75 3 18 160 1403 1535 3.35e-21 101
MsG0180003539.01.T01 AT1G72910 37.468 387 213 8 3 387 1 360 6.37e-62 216
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MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 4.32e-61 222
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 4.63e-61 222
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.680 459 282 12 16 469 76 512 1.93e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.35e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.35e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.43e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.43e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.53e-60 221
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 32.627 472 286 13 3 469 1 445 3.53e-60 221
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MsG0180003539.01.T01 AT5G45210 28.591 724 437 29 17 700 36 719 1.58e-59 218
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MsG0180003539.01.T01 AT3G04210 34.063 411 247 12 13 412 63 460 4.99e-59 213
MsG0180003539.01.T01 AT3G04210 34.063 411 247 12 13 412 63 460 4.99e-59 213
MsG0180003539.01.T01 AT4G19530 24.850 1002 570 35 16 881 15 969 3.02e-58 219
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MsG0180003539.01.T01 AT4G19530 25.289 953 547 33 16 850 15 920 1.52e-57 217
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MsG0180003539.01.T01 AT5G45260 26.139 834 497 25 67 832 57 839 8.72e-56 212
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MsG0180003539.01.T01 AT5G45260 26.139 834 497 24 67 832 57 839 9.28e-56 211
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MsG0180003539.01.T01 AT2G17050 28.999 669 375 22 216 838 46 660 3.22e-48 188
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MsG0180003539.01.T01 AT3G25510 28.229 751 447 26 197 882 1 724 2.18e-47 185
MsG0180003539.01.T01 AT3G25510 28.253 269 152 8 580 838 570 807 7.59e-15 80.1
MsG0180003539.01.T01 AT3G25510 23.747 459 291 14 542 958 610 1051 1.24e-13 76.3
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MsG0180003539.01.T01 AT5G44870 25.220 682 437 16 215 838 11 677 1.06e-46 182
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MsG0180003539.01.T01 AT1G17610 29.505 444 274 10 3 438 1 413 6.01e-38 148
MsG0180003539.01.T01 AT5G40090 30.024 423 262 9 13 429 15 409 6.74e-36 142
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MsG0180003539.01.T01 AT1G57650 30.637 408 254 13 356 743 78 476 6.40e-33 136
MsG0180003539.01.T01 AT1G57650 30.713 407 253 13 356 742 78 475 7.56e-33 137
MsG0180003539.01.T01 AT1G57650 31.000 400 243 13 356 737 78 462 1.14e-32 136
MsG0180003539.01.T01 AT1G57650 30.713 407 253 13 356 742 78 475 1.46e-32 136
MsG0180003539.01.T01 AT2G20142 33.333 225 128 7 16 233 9 218 9.11e-29 118
MsG0180003539.01.T01 AT5G38344 40.816 147 81 2 16 162 60 200 1.10e-28 115
MsG0180003539.01.T01 AT4G04110 38.298 188 104 6 1 184 26 205 2.93e-28 114
MsG0180003539.01.T01 AT5G45240 22.748 655 429 22 72 714 44 633 1.10e-25 114
MsG0180003539.01.T01 AT5G45240 23.053 655 427 23 72 714 44 633 1.20e-25 114
MsG0180003539.01.T01 AT5G66900 25.646 503 291 21 299 737 272 755 8.33e-25 112
MsG0180003539.01.T01 AT5G66900 25.646 503 291 21 299 737 320 803 9.50e-25 112
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 3.08e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 3.08e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.15e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.18e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.27e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.27e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.27e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT4G16990 26.733 303 202 8 171 469 1 287 6.27e-24 108
MsG0180003539.01.T01 AT2G32140 35.838 173 103 4 17 186 22 189 1.51e-23 103
MsG0180003539.01.T01 AT1G47370 36.047 172 101 5 17 187 15 178 5.94e-23 102
MsG0180003539.01.T01 AT1G57630 37.580 157 87 5 16 169 22 170 4.11e-22 95.1
MsG0180003539.01.T01 AT1G57850 37.349 166 94 6 16 179 12 169 5.13e-22 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT5G44900 33.520 179 99 6 16 186 18 184 1.54e-21 95.9
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 173 346 2.40e-21 97.8
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 173 346 2.40e-21 97.8
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 173 346 2.40e-21 97.8
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 173 346 2.40e-21 97.8
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 174 347 4.04e-21 97.1
MsG0180003539.01.T01 AT5G45070 33.333 180 112 4 3 179 1 175 5.16e-21 96.7
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 344 517 2.40e-20 96.7
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 344 517 2.40e-20 96.7
MsG0180003539.01.T01 AT1G57830 38.406 138 74 4 17 152 22 150 3.16e-20 89.4
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 104 277 3.64e-20 94.7
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 173 346 4.26e-20 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 296 469 8.28e-20 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 296 469 8.28e-20 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 296 469 8.28e-20 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 296 469 8.28e-20 95.5
MsG0180003539.01.T01 AT4G23515 33.526 173 101 5 17 179 10 178 8.42e-20 91.3
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MsG0180003539.01.T01 AT5G45000 34.337 166 101 6 16 179 15 174 1.05e-19 93.6
MsG0180003539.01.T01 AT5G45000 36.134 119 75 1 17 135 216 333 6.60e-12 69.3
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 32.402 179 112 5 5 179 344 517 1.06e-19 95.1
MsG0180003539.01.T01 AT4G23515 34.857 175 96 6 17 179 10 178 1.49e-19 91.3
MsG0180003539.01.T01 AT1G57670 32.164 171 108 4 17 186 10 173 1.93e-19 92.4
MsG0180003539.01.T01 AT2G03300 33.533 167 97 5 17 179 8 164 2.21e-19 88.2
MsG0180003539.01.T01 AT5G45220 32.927 164 108 2 16 179 331 492 2.53e-19 93.2
MsG0180003539.01.T01 AT5G45220 29.787 188 111 6 1 183 1 172 1.30e-13 75.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G51270 34.868 152 91 4 5 153 344 490 5.78e-19 92.4
MsG0180003539.01.T01 AT4G11340 36.066 183 104 5 16 186 224 405 1.22e-18 90.9
MsG0180003539.01.T01 AT1G65390 33.133 166 103 4 17 179 23 183 1.24e-18 87.4
MsG0180003539.01.T01 AT2G03030 34.731 167 95 5 17 179 8 164 1.29e-18 85.9
MsG0180003539.01.T01 AT4G19920 29.508 183 118 5 17 195 51 226 2.46e-18 87.0
MsG0180003539.01.T01 AT1G65390 33.133 166 103 4 17 179 23 183 2.48e-18 87.0
MsG0180003539.01.T01 AT5G66910 23.000 500 314 19 298 737 273 761 4.62e-18 90.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G65390 34.337 166 94 4 17 182 23 173 1.03e-17 87.4
MsG0180003539.01.T01 AT5G45220 37.226 137 81 3 16 152 331 462 3.59e-17 86.7
MsG0180003539.01.T01 AT5G45220 29.787 188 111 6 1 183 1 172 1.16e-13 75.5
MsG0180003539.01.T01 AT5G44920 30.508 177 112 4 17 184 12 186 4.41e-17 82.8
MsG0180003539.01.T01 AT1G60320 34.694 147 89 3 14 160 22 161 4.47e-17 80.5
MsG0180003539.01.T01 AT1G09665 31.875 160 102 3 17 176 11 163 5.94e-17 80.1
MsG0180003539.01.T01 AT5G45080 36.842 152 88 7 3 152 1 146 4.01e-16 82.4
MsG0180003539.01.T01 AT5G44920 29.762 168 112 4 17 184 12 173 9.16e-15 75.9
MsG0180003539.01.T01 AT4G23510 30.058 173 109 5 17 179 11 181 1.58e-13 75.5
MsG0180003539.01.T01 AT4G23510 30.058 173 109 5 17 179 11 181 1.59e-13 75.1
MsG0180003539.01.T01 AT4G23510 30.058 173 109 5 17 179 11 181 1.95e-13 75.1
MsG0180003539.01.T01 AT5G43730 28.800 250 154 11 213 449 169 407 4.78e-13 73.9
MsG0180003539.01.T01 AT5G43730 28.800 250 154 11 213 449 169 407 4.78e-13 73.9
MsG0180003539.01.T01 AT5G43730 28.800 250 154 11 213 449 169 407 4.78e-13 73.9
MsG0180003539.01.T01 AT5G43730 28.800 250 154 11 213 449 169 407 4.78e-13 73.9
MsG0180003539.01.T01 AT5G43730 28.800 250 154 11 213 449 169 407 4.78e-13 73.9
MsG0180003539.01.T01 AT5G44910 27.778 144 99 2 17 160 12 150 6.50e-13 70.1
MsG0180003539.01.T01 AT4G19925 35.043 117 67 4 17 126 13 127 8.04e-13 70.1
MsG0180003539.01.T01 AT4G19910 38.393 112 65 4 18 128 9 117 1.18e-12 69.3
MsG0180003539.01.T01 AT4G27220 23.425 508 310 20 216 665 134 620 1.36e-11 69.3
MsG0180003539.01.T01 AT4G27220 23.425 508 310 20 216 665 142 628 1.52e-11 69.3
MsG0180003539.01.T01 AT3G14460 21.099 564 351 20 197 707 172 694 1.60e-11 69.3
MsG0180003539.01.T01 AT3G46530 24.869 382 218 17 195 525 164 527 2.02e-11 68.9
MsG0180003539.01.T01 AT1G12280 26.449 276 177 10 195 454 158 423 8.36e-11 67.0
MsG0180003539.01.T01 AT1G52900 33.000 100 63 1 16 115 38 133 9.20e-11 62.8

Find 219 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 269 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGGGACATACTGTTTCTTTC+TGG 0.124046 1:-63919826 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGCTATGAATATACTCTTTC+AGG 0.164126 1:-63919680 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTAATGAATGTCACCTTCTA+AGG 0.189915 1:-63920146 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATAGTGGGTTCCAACTTATT+TGG 0.196122 1:-63921685 MsG0180003539.01.T01:CDS
GACATCTTGCCTAATAATTC+TGG 0.201844 1:+63920519 None:intergenic
GCTCTTTATGTGATTCTTTC+CGG 0.205290 1:+63921359 None:intergenic
GTCCACATGGTAGGACTTTA+TGG 0.215121 1:-63922222 MsG0180003539.01.T01:CDS
CGTGAGGAACATACACAAAT+TGG 0.221335 1:-63919455 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGGAAGATACTTGGGACTTT+TGG 0.228410 1:+63920979 None:intergenic
TTAAGACTTCAAGTTTATTT+AGG 0.232749 1:+63920640 None:intergenic
CTTTCCATTCCAGTCTATTA+TGG 0.245317 1:+63921057 None:intergenic
CTGTAATCCAACAGGATATT+TGG 0.247563 1:+63922296 None:intergenic
GCAGAAAACCTTTCTAGATT+TGG 0.253029 1:+63920072 None:intergenic
CTCAATATATCCTTATGTTT+TGG 0.269992 1:+63920315 None:intergenic
TGAAAATGGCAATTCTCTTA+TGG 0.283349 1:+63920464 None:intergenic
ACCAAGTGTTCCTCAGCTTC+AGG 0.296991 1:-63923045 MsG0180003539.01.T01:CDS
CCTTCTAAGGGTCCTTCTAT+TGG 0.301884 1:-63920133 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTTCCATTCCAGTCTATTAT+GGG 0.303237 1:+63921058 None:intergenic
GAGATACTTCATGCTCATTA+TGG 0.317887 1:-63921493 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAGCAGCTGGTGGCTTTGGC+TGG 0.319207 1:-63921940 MsG0180003539.01.T01:CDS
AGAGGAGCAAAGTGTCTTTC+TGG 0.320720 1:-63921560 MsG0180003539.01.T01:CDS
CAGATTTGACATCTTCTTGA+AGG 0.326680 1:+63921033 None:intergenic
GGATATAGCTTGTTGCTTCA+AGG 0.328759 1:-63921539 MsG0180003539.01.T01:CDS
TCCCTTAGTTATAGAAATAG+TGG 0.344617 1:-63921701 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTATCTCTTTGATCTGAAAC+TGG 0.344826 1:-63919606 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACCCACTATTTCTATAACTA+AGG 0.345137 1:+63921699 None:intergenic
GTTAGATTGGACATTAAGTT+AGG 0.346168 1:-63922048 MsG0180003539.01.T01:CDS
GATGTGAGACATCGGGTATA+TGG 0.348873 1:+63920733 None:intergenic
ATATGAATACAAGTTTATTC+AGG 0.349116 1:-63922370 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTTTGGCTGGAGGACTTGAT+TGG 0.349880 1:-63921927 MsG0180003539.01.T01:CDS
AATATACTCTTTCAGGCAAT+TGG 0.351604 1:-63919673 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGGAGATGTTTCAAGTTGTA+TGG 0.355057 1:+63922093 None:intergenic
GAAAGTACGCATGCGGTAGA+AGG 0.359495 1:-63921838 MsG0180003539.01.T01:CDS
TCTTGATGATGTCGACAAAA+TGG 0.366013 1:-63921962 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTTGAAGTCTTAAATGCATA+TGG 0.367108 1:-63920630 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTTACGGTTGACCTCTCTTA+AGG 0.371316 1:-63920580 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGTCAAATATAGAAGAGATT+TGG 0.372216 1:-63920500 MsG0180003539.01.T01:CDS
AATGGAGCAGCTGGTGGCTT+TGG 0.374645 1:-63921944 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTTTATGGTATTGGAGGCTT+GGG 0.377233 1:-63922207 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAAAGTAAGTTACGATGCTT+TGG 0.377310 1:-63921587 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATGGTAGGACTTTATGGTAT+TGG 0.377422 1:-63922216 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATTCCTCTTCAATTTCCTA+TGG 0.378173 1:-63923076 MsG0180003539.01.T01:CDS
TCTGTTATTGCCAAAACATA+AGG 0.380285 1:-63920325 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTCATTGCTGATCAATTTGA+AGG 0.382553 1:-63922153 MsG0180003539.01.T01:CDS
TATGTCCCCAGCTTTGGTAT+TGG 0.383073 1:+63919840 None:intergenic
GAATGGAAGGGTACATTAGA+TGG 0.388966 1:-63921649 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTGGAGAACGCAGCAGGTTA+TGG 0.389848 1:-63921336 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTTTGGTATTGGAACCAATC+AGG 0.389956 1:+63919851 None:intergenic
GCAATTTCACTTGTTGTACT+TGG 0.391901 1:+63922271 None:intergenic
AAAACATCTTCATAACTTGA+AGG 0.392453 1:+63921754 None:intergenic
ATCAGGAATCCCCTCAGTTC+CGG 0.394518 1:+63919868 None:intergenic
TCATCATCATCAGATGGTTT+AGG 0.394707 1:+63919755 None:intergenic
CGTGCAGTTTCATATGGTTC+AGG 0.403801 1:-63921727 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACTTTATGGTATTGGAGGCT+TGG 0.405264 1:-63922208 MsG0180003539.01.T01:CDS
TATGCTCTTTCCAAATAAGT+TGG 0.406160 1:+63921675 None:intergenic
GCATAAATCTTTGACAAGTT+AGG 0.407457 1:+63920360 None:intergenic
TTAAACCGTGCAGTTTCATA+TGG 0.408418 1:-63921733 MsG0180003539.01.T01:CDS
CAAAGTACTTGGAAGATACT+TGG 0.410259 1:+63920970 None:intergenic
GTGAAATTGCTTCTCGATAA+GGG 0.411205 1:-63922258 MsG0180003539.01.T01:CDS
TCCGGACAAGTTAGCAGCTT+GGG 0.417301 1:+63922634 None:intergenic
CCAATAGAAGGACCCTTAGA+AGG 0.419294 1:+63920133 None:intergenic
AAGTCTCTTGAGGAAATTAG+AGG 0.419938 1:-63920102 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGAAAATCACCTGTGTGAAC+TGG 0.424462 1:-63919552 MsG0180003539.01.T01:CDS
AACTTACTTTAAATATCTCC+TGG 0.425186 1:+63921599 None:intergenic
AGTGAAATTGCTTCTCGATA+AGG 0.425597 1:-63922259 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATGCGGTAGAAGGGTTGTA+TGG 0.429647 1:-63921829 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATCAATACCCTCAAAGTACT+TGG 0.434908 1:+63920959 None:intergenic
TAGAAGAATCCTACTGAGTC+AGG 0.435504 1:-63920019 MsG0180003539.01.T01:intron
TCTATTATGGGTTCCATTGA+GGG 0.435555 1:+63921070 None:intergenic
GCTGGAGGACTTGATTGGTT+CGG 0.442568 1:-63921922 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATTACAATTCACAATTCGAT+TGG 0.443016 1:-63920666 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTGGAAAGAGCATAGAAGAA+TGG 0.443931 1:-63921666 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATTGAGATTTGTTTGCCAAC+CGG 0.446739 1:-63919887 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAAAACCTTTCTAGATTTGG+TGG 0.447415 1:+63920075 None:intergenic
AAACAGTATGTCCCCAGCTT+TGG 0.449382 1:+63919834 None:intergenic
GATATAGCTTGTTGCTTCAA+GGG 0.451267 1:-63921538 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATTGGTTCCAATACCAAAGC+TGG 0.453448 1:-63919847 MsG0180003539.01.T01:CDS
CGACATCATACAGGGAGTTA+TGG 0.455856 1:-63922740 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTAGGACTTTATGGTATTGG+AGG 0.457482 1:-63922213 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAGGGTACCCTGGACTATAA+TGG 0.461017 1:+63922609 None:intergenic
ACTTGCAGTCATCCAATAGA+AGG 0.461455 1:+63920121 None:intergenic
CCCTGAAGCTGAGGAACACT+TGG 0.464001 1:+63923044 None:intergenic
CAAAGAAAACAGGCAAAACT+AGG 0.464177 1:+63922783 None:intergenic
CCAAGTGTTCCTCAGCTTCA+GGG 0.464952 1:-63923044 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGATCCACGCCAAAGAAAAC+AGG 0.465650 1:+63922773 None:intergenic
GAACTGAGGGGATTCCTGAT+TGG 0.468278 1:-63919865 MsG0180003539.01.T01:CDS
CAGCTGGTGGCTTTGGCTGG+AGG 0.470134 1:-63921937 MsG0180003539.01.T01:CDS
GACACTCGTGACGGTTTCAC+TGG 0.473289 1:-63923016 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGACTTGATTGGTTCGGTCG+TGG 0.473625 1:-63921916 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTACAATTCACAATTCGATT+GGG 0.473767 1:-63920665 MsG0180003539.01.T01:CDS
CCCTGGACTATAATGGTATC+CGG 0.474345 1:+63922616 None:intergenic
CATAACCTGCTGCGTTCTCC+AGG 0.475661 1:+63921337 None:intergenic
AGAGTCAAGTTGTGCGTCAA+TGG 0.475681 1:-63919701 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTCTATTATGGGTTCCATTG+AGG 0.477069 1:+63921069 None:intergenic
TCCGGATACCATTATAGTCC+AGG 0.477449 1:-63922617 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATGTTGCCAAATATCCTGT+TGG 0.480053 1:-63922303 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTATCTTCCAAGTACTTTGA+GGG 0.480494 1:-63920966 MsG0180003539.01.T01:intron
GGGTTAGAGCTATCTTCCAT+TGG 0.480821 1:+63922654 None:intergenic
ATGTGAGACATCGGGTATAT+GGG 0.482045 1:+63920734 None:intergenic
ATATATGAATTGTCCCTCAA+TGG 0.493646 1:-63921083 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACCCAAGCTGCTAACTTGTC+CGG 0.496769 1:-63922635 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAACACTTACTAACCTGTCA+TGG 0.500721 1:-63921865 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATACTCTTTCAGGCAATTGG+TGG 0.501043 1:-63919670 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACATGGAGCGATTGCACCAA+TGG 0.501961 1:-63922670 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACTGATGTGCGACATCATAC+AGG 0.503654 1:-63922749 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACTTGGGACTGTAATCCAAC+AGG 0.505054 1:+63922288 None:intergenic
CAATTTCACTTGTTGTACTT+GGG 0.506004 1:+63922272 None:intergenic
GGATTCCACCAAATCTAGAA+AGG 0.507845 1:-63920080 MsG0180003539.01.T01:CDS
AGTATCTTCCAAGTACTTTG+AGG 0.509166 1:-63920967 MsG0180003539.01.T01:CDS
GACATCTCCGACAGGATCAA+TGG 0.510308 1:-63922336 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGCGAAGATCTTGCTAAGCA+TGG 0.511409 1:-63922719 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATCAAGGGCCTTGTAGAGA+TGG 0.512920 1:+63922993 None:intergenic
CCCTTAGTTATAGAAATAGT+GGG 0.513986 1:-63921700 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGTGGATTCCCTTGTCATCA+AGG 0.514078 1:+63922978 None:intergenic
TTACGATGCTTTGGAGGAAG+AGG 0.519058 1:-63921578 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAAGAATCACATAAAGAGCC+TGG 0.520073 1:-63921355 MsG0180003539.01.T01:CDS
AGATTGGACATTAAGTTAGG+AGG 0.521307 1:-63922045 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATACAACTTGAAACATCTCC+AGG 0.524071 1:-63922091 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATCCGGACAAGTTAGCAGCT+TGG 0.527358 1:+63922633 None:intergenic
GACATTACATAACTTGATAG+AGG 0.529882 1:-63921401 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAGAGCCTGGAGAACGCAGC+AGG 0.530495 1:-63921342 MsG0180003539.01.T01:CDS
CGTACTTTCTATCCCATGAC+AGG 0.531345 1:+63921852 None:intergenic
CAATGGAACCCATAATAGAC+TGG 0.531908 1:-63921066 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAACAGCAACTACATGTGGC+TGG 0.534332 1:-63919914 MsG0180003539.01.T01:intron
TTTGGAAGATGTGAGACATC+GGG 0.535981 1:+63920726 None:intergenic
CTTAAGAGAGGTCAACCGTA+AGG 0.536261 1:+63920581 None:intergenic
AGTAAGTTACGATGCTTTGG+AGG 0.536674 1:-63921584 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAAGTTAGGAGGTGTTAGTG+AGG 0.536768 1:-63922034 MsG0180003539.01.T01:CDS
TCAATGGCCTTGACGAGTGA+CGG 0.541092 1:+63922911 None:intergenic
AAAGAGCATAGAAGAATGGA+AGG 0.551157 1:-63921662 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAAACATCATGTTGGAGTGT+TGG 0.557208 1:-63921461 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAGTTAGGAGGTGTTAGTGA+GGG 0.558869 1:-63922033 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTACAAGGCCCTTGATGACA+AGG 0.559293 1:-63922987 MsG0180003539.01.T01:CDS
AACACTTACTAACCTGTCAT+GGG 0.559343 1:-63921864 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTGCTTCGTTCAGCAGAGTG+TGG 0.559344 1:+63919324 None:intergenic
GTCCAAACAAAATGAAGAAG+AGG 0.559550 1:+63922847 None:intergenic
ATTCACTGCTACAAGACAAA+GGG 0.561354 1:-63922809 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAAGGATATATTGAGTTCCA+TGG 0.564319 1:-63920307 MsG0180003539.01.T01:CDS
CCCACTATTTCTATAACTAA+GGG 0.564722 1:+63921700 None:intergenic
ACTTGAATTGTTGAAGTGGA+TGG 0.565575 1:-63921797 MsG0180003539.01.T01:CDS
ACACGGGTAAAGAAATCGTC+CGG 0.566848 1:-63921378 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAAGTACGCATGCGGTAGAA+GGG 0.569015 1:-63921837 MsG0180003539.01.T01:CDS
CACAATCATCAATGAAAGTG+TGG 0.569345 1:+63922960 None:intergenic
AAAGTACTTGGAAGATACTT+GGG 0.569744 1:+63920971 None:intergenic
TAGTAAGTGTTTGTCTCGAG+TGG 0.572569 1:+63921876 None:intergenic
TGTTTGCCAACCGGAACTGA+GGG 0.576239 1:-63919878 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTGGTTCCAATACCAAAGCT+GGG 0.576937 1:-63919846 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTTCACTGGCCATCTCTACA+AGG 0.577310 1:-63923002 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTAAGAGAGGTCAACCGTAA+GGG 0.578453 1:+63920582 None:intergenic
GGATGACTGCAAGTCTCTTG+AGG 0.579891 1:-63920112 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAACCCATAATAGACTGGAA+TGG 0.580611 1:-63921061 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGACATTCATTAAGACACTC+TGG 0.580865 1:+63920156 None:intergenic
GTGGATTCCCTTGTCATCAA+GGG 0.582153 1:+63922979 None:intergenic
TGTCACTGCCCCTGAAGCTG+AGG 0.582995 1:+63923035 None:intergenic
GAGCTTCAGTTGATCGAGGA+GGG 0.585424 1:-63919494 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTGTTTGCCAACCGGAACTG+AGG 0.585891 1:-63919879 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATAGAAGAGATTTGGTTGAG+TGG 0.586146 1:-63920492 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAGCACTTGAATTGTTGAAG+TGG 0.587641 1:-63921801 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAAGAGAGGTCAACCGTAAG+GGG 0.589603 1:+63920583 None:intergenic
CACACAATGTGAGAACTACT+CGG 0.591737 1:+63920226 None:intergenic
ATGCGGTAGAAGGGTTGTAT+GGG 0.593580 1:-63921828 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAATGAATGTCACCTTCTAA+GGG 0.595242 1:-63920145 MsG0180003539.01.T01:CDS
TGTCGACAAAATGGAGCAGC+TGG 0.597209 1:-63921953 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATATAGCTTGTTGCTTCAAG+GGG 0.599264 1:-63921537 MsG0180003539.01.T01:CDS
ATTTGGAAGATGTGAGACAT+CGG 0.600216 1:+63920725 None:intergenic
CAAGTGTTCCTCAGCTTCAG+GGG 0.600407 1:-63923043 MsG0180003539.01.T01:CDS
TAATCAAAGACATCTCCGAC+AGG 0.600898 1:-63922344 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAAATGTTACTTGAAAATCT+GGG 0.602170 1:+63920390 None:intergenic
GATGATGAGGTCCACATGGT+AGG 0.604642 1:-63922231 MsG0180003539.01.T01:CDS
TATTCACTGCTACAAGACAA+AGG 0.605782 1:-63922810 MsG0180003539.01.T01:CDS
AATCACACCGTCACTCGTCA+AGG 0.608478 1:-63922918 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTGATGTGCGACATCATACA+GGG 0.609575 1:-63922748 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATTGCATAAAACATCATGT+TGG 0.610416 1:-63921469 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTCCATGGTGGCTTCAAATG+TGG 0.613438 1:-63920292 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAAGCAAAGAACAAAGGACG+TGG 0.614554 1:-63919308 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAGTTGCAATTCCTTAAGAG+AGG 0.615481 1:+63920569 None:intergenic
AGGGGCAGTGACACTCGTGA+CGG 0.617082 1:-63923025 MsG0180003539.01.T01:CDS
TTCCACATTTGAAGCCACCA+TGG 0.622504 1:+63920290 None:intergenic
TCCTCACGAAAATTGAAACT+CGG 0.623165 1:+63919470 None:intergenic
AGTCTCTTGAGGAAATTAGA+GGG 0.625517 1:-63920101 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTATGATGTCGCACATCAGT+AGG 0.629519 1:+63922752 None:intergenic
CGACAAAATGGAGCAGCTGG+TGG 0.630829 1:-63921950 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATAATAGACTGGAATGGAA+AGG 0.630940 1:-63921056 MsG0180003539.01.T01:CDS
GACTTAACATTATACGAGGG+TGG 0.631327 1:-63920417 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGAATCCCCTCAGTTCCGGT+TGG 0.632147 1:+63919872 None:intergenic
ACATAACTTGATAGAGGACA+CGG 0.632211 1:-63921395 MsG0180003539.01.T01:CDS
CCGGATACCATTATAGTCCA+GGG 0.632389 1:-63922616 MsG0180003539.01.T01:intron
AGTAGAGCTTCAGTTGATCG+AGG 0.640284 1:-63919498 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAGAGAGGTCAACCGTAAGG+GGG 0.642489 1:+63920584 None:intergenic
CGATAAGGGATATGATGATG+AGG 0.643691 1:-63922244 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTTGAAGAAGAAAAGAAGCA+CGG 0.644545 1:-63919423 MsG0180003539.01.T01:CDS
AAACTAACAGCAACTACATG+TGG 0.647190 1:-63919918 MsG0180003539.01.T01:intron
AGAGCTTCAGTTGATCGAGG+AGG 0.653273 1:-63919495 MsG0180003539.01.T01:CDS
TACAAGGCCCTTGATGACAA+GGG 0.654879 1:-63922986 MsG0180003539.01.T01:CDS
GATGATTGTGATCTTGAGAG+AGG 0.654948 1:-63922947 MsG0180003539.01.T01:CDS
AGAGAGGTCAACCGTAAGGG+GGG 0.664329 1:+63920585 None:intergenic
CTGAACCATATGAAACTGCA+CGG 0.665097 1:+63921728 None:intergenic
ATATGATGATGAGGTCCACA+TGG 0.665328 1:-63922235 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTATTTCTATAACTAAGGGA+AGG 0.666201 1:+63921704 None:intergenic
TCGTGACTTAACATTATACG+AGG 0.667933 1:-63920421 MsG0180003539.01.T01:CDS
AACAACAAACCTGACTCAGT+AGG 0.670383 1:+63920010 None:intergenic
CTGAACGAAGCAAAGAACAA+AGG 0.672449 1:-63919314 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAATTACAATCATAAAACAA+AGG 0.672984 1:-63922011 MsG0180003539.01.T01:CDS
CAAGGGGTATAGATTGACAA+TGG 0.673165 1:-63921521 MsG0180003539.01.T01:CDS
CTCGGACACATTCATCTGAG+AGG 0.676604 1:+63920244 None:intergenic
TGGTTCCAATACCAAAGCTG+GGG 0.677341 1:-63919845 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAATCCATAGGAAATTGAAG+AGG 0.683940 1:+63923072 None:intergenic
TACCATAAAGTCCTACCATG+TGG 0.684579 1:+63922220 None:intergenic
ATCTTGCTAAGCATGGAGAG+AGG 0.685278 1:-63922712 MsG0180003539.01.T01:CDS
GGATATATTGAGTTCCATGG+TGG 0.689855 1:-63920304 MsG0180003539.01.T01:CDS
CGTGACTTAACATTATACGA+GGG 0.693761 1:-63920420 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTTTGCCAACCGGAACTGAG+GGG 0.694446 1:-63919877 MsG0180003539.01.T01:CDS
GTGCTTCGTCCAGTTCACAC+AGG 0.697714 1:+63919543 None:intergenic
TGGGATAGAAAGTACGCATG+CGG 0.699159 1:-63921845 MsG0180003539.01.T01:CDS
CATAACTTGATAGAGGACAC+GGG 0.700778 1:-63921394 MsG0180003539.01.T01:CDS
GCATAGTTGATAGAAAACAC+AGG 0.704827 1:+63922869 None:intergenic
CACTTGGTATGTGAATCCAT+AGG 0.710350 1:+63923060 None:intergenic
AAGAGCATAGAAGAATGGAA+GGG 0.711431 1:-63921661 MsG0180003539.01.T01:CDS
GAAGAAGAAAAGAAGCACGG+AGG 0.754957 1:-63919420 MsG0180003539.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAACACTTATTATAAAAAA+TGG - Chr1:63921379-63921398 MsG0180003539.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAAGAAAGAAAATATAAAA+AGG + Chr1:63919827-63919846 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTTCTTTTTTTGTTAAAA+GGG - Chr1:63921262-63921281 MsG0180003539.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTTTCTTTTTTTGTTAAA+AGG - Chr1:63921261-63921280 MsG0180003539.01.T01:intron 10.0%
!! AAATCATAAATATACACAAT+TGG + Chr1:63921527-63921546 None:intergenic 15.0%
!! AAAAATTCTAGATTCTTCAA+TGG + Chr1:63919497-63919516 None:intergenic 20.0%
!! AAACAAGATATAAGTATAGT+AGG + Chr1:63919802-63919821 None:intergenic 20.0%
!! AACAAGATATAAGTATAGTA+GGG + Chr1:63919801-63919820 None:intergenic 20.0%
!! ATATGAATACAAGTTTATTC+AGG - Chr1:63920019-63920038 MsG0180003539.01.T01:intron 20.0%
!! GAATTACAATCATAAAACAA+AGG - Chr1:63920378-63920397 MsG0180003539.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAATATAATATTACGCGA+TGG + Chr1:63922447-63922466 None:intergenic 20.0%
!! TCTATATATTATCTGTATTG+TGG - Chr1:63921230-63921249 MsG0180003539.01.T01:intron 20.0%
!! TGTATTTATGATTCTGATAT+TGG - Chr1:63919961-63919980 MsG0180003539.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAAATGTTACTTGAAAATC+TGG + Chr1:63922003-63922022 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATGTTACTTGAAAATCT+GGG + Chr1:63922002-63922021 None:intergenic 20.0%
!!! AAGCACTTTTAAAAAATGAA+TGG - Chr1:63922863-63922882 MsG0180003539.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATGAGAACTTTTCTAAATT+TGG + Chr1:63921684-63921703 None:intergenic 20.0%
!!! AGAATAACAGATTTTATAGA+AGG + Chr1:63922604-63922623 None:intergenic 20.0%
!!! GAATAACAGATTTTATAGAA+GGG + Chr1:63922603-63922622 None:intergenic 20.0%
!!! TCTAATTTTCTCTTTCTATA+AGG + Chr1:63923015-63923034 None:intergenic 20.0%
!!! TTAAGACTTCAAGTTTATTT+AGG + Chr1:63921752-63921771 None:intergenic 20.0%
! AAAACATCTTCATAACTTGA+AGG + Chr1:63920638-63920657 None:intergenic 25.0%
! AACTTACTTTAAATATCTCC+TGG + Chr1:63920793-63920812 None:intergenic 25.0%
! ATTACAATTCACAATTCGAT+TGG - Chr1:63921723-63921742 MsG0180003539.01.T01:CDS 25.0%
! CCAAAATAACAAGAAAAACA+TGG - Chr1:63919702-63919721 MsG0180003539.01.T01:CDS 25.0%
! GAGAAATATGTGTAATTAAG+TGG + Chr1:63921212-63921231 None:intergenic 25.0%
! TATGCACTAACTTATCTTAT+TGG - Chr1:63919986-63920005 MsG0180003539.01.T01:intron 25.0%
! TGCACTAGTATTTGATATAT+AGG - Chr1:63922408-63922427 MsG0180003539.01.T01:intron 25.0%
! TGTCAAATATAGAAGAGATT+TGG - Chr1:63921889-63921908 MsG0180003539.01.T01:CDS 25.0%
! TTACAATTCACAATTCGATT+GGG - Chr1:63921724-63921743 MsG0180003539.01.T01:CDS 25.0%
!! CTCAATATATCCTTATGTTT+TGG + Chr1:63922077-63922096 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTCTTTCTATAAGGAT+TGG + Chr1:63923010-63923029 None:intergenic 25.0%
!!! ATCATCTAGTTTTTTGAACA+AGG - Chr1:63921480-63921499 MsG0180003539.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCATGTTTTTCTTGTTATTT+TGG + Chr1:63919705-63919724 None:intergenic 25.0%
!!! CTGAGATTTTGAAATGAAAA+TGG + Chr1:63921942-63921961 None:intergenic 25.0%
!!! TCTATTTAAGCTTTAAGATG+AGG + Chr1:63919868-63919887 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTGTTAAAAGGGAAC+TGG - Chr1:63921268-63921287 MsG0180003539.01.T01:intron 25.0%
AATATACTCTTTCAGGCAAT+TGG - Chr1:63922716-63922735 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
ATATATGAATTGTCCCTCAA+TGG - Chr1:63921306-63921325 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
CATTGCATAAAACATCATGT+TGG - Chr1:63920920-63920939 MsG0180003539.01.T01:intron 30.0%
CCCTTAGTTATAGAAATAGT+GGG - Chr1:63920689-63920708 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
CTTGAAGTCTTAAATGCATA+TGG - Chr1:63921759-63921778 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
GACATTACATAACTTGATAG+AGG - Chr1:63920988-63921007 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
GATTCCTAATAAAAAGATCC+AGG - Chr1:63920772-63920791 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
GCATAAATCTTTGACAAGTT+AGG + Chr1:63922032-63922051 None:intergenic 30.0%
GTTAGATTGGACATTAAGTT+AGG - Chr1:63920341-63920360 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGTAAGTTACGATGCTT+TGG - Chr1:63920802-63920821 MsG0180003539.01.T01:intron 30.0%
TAAGGATATATTGAGTTCCA+TGG - Chr1:63922082-63922101 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TAATCATCATCATCATCAGA+TGG + Chr1:63922643-63922662 None:intergenic 30.0%
TAATGAATGTCACCTTCTAA+GGG - Chr1:63922244-63922263 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TATGCTCTTTCCAAATAAGT+TGG + Chr1:63920717-63920736 None:intergenic 30.0%
TCCCTTAGTTATAGAAATAG+TGG - Chr1:63920688-63920707 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TCTGTTATTGCCAAAACATA+AGG - Chr1:63922064-63922083 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAATGGCAATTCTCTTA+TGG + Chr1:63921928-63921947 None:intergenic 30.0%
TTAATGAATGTCACCTTCTA+AGG - Chr1:63922243-63922262 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TTCATTGCTGATCAATTTGA+AGG - Chr1:63920236-63920255 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
TTTCCATTCCAGTCTATTAT+GGG + Chr1:63921334-63921353 None:intergenic 30.0%
! AAAGTACTTGGAAGATACTT+GGG + Chr1:63921421-63921440 None:intergenic 30.0%
! AATCATGACTTCACTCTTTT+TGG - Chr1:63921154-63921173 MsG0180003539.01.T01:intron 30.0%
! ATCTCCTGGATCTTTTTATT+AGG + Chr1:63920779-63920798 None:intergenic 30.0%
! CCAATCTAACTGTTTTCAAA+AGG + Chr1:63920331-63920350 None:intergenic 30.0%
! GAGAGTTTTCCAGAATTATT+AGG - Chr1:63921861-63921880 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
! TTATCTCTTTGATCTGAAAC+TGG - Chr1:63922783-63922802 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGCTTTAAGATGAGGTTAT+TGG + Chr1:63919861-63919880 None:intergenic 30.0%
!! ACCCACTATTTCTATAACTA+AGG + Chr1:63920693-63920712 None:intergenic 30.0%
!! AGCTTTAAGATGAGGTTATT+GGG + Chr1:63919860-63919879 None:intergenic 30.0%
!! CAATTTCACTTGTTGTACTT+GGG + Chr1:63920120-63920139 None:intergenic 30.0%
!! CCCACTATTTCTATAACTAA+GGG + Chr1:63920692-63920711 None:intergenic 30.0%
!! CCTTTTGAAAACAGTTAGAT+TGG - Chr1:63920328-63920347 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
!! CTATTTCTATAACTAAGGGA+AGG + Chr1:63920688-63920707 None:intergenic 30.0%
!! TACTTTGAGGGTATTGATAT+GGG - Chr1:63921435-63921454 MsG0180003539.01.T01:CDS 30.0%
AAAAACACCATTGATCCTGT+CGG + Chr1:63920063-63920082 None:intergenic 35.0%
AAAACATCATGTTGGAGTGT+TGG - Chr1:63920928-63920947 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
AAACACTTACTAACCTGTCA+TGG - Chr1:63920524-63920543 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AAACTAACAGCAACTACATG+TGG - Chr1:63922471-63922490 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
AAAGAATCACATAAAGAGCC+TGG - Chr1:63921034-63921053 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AACACTTACTAACCTGTCAT+GGG - Chr1:63920525-63920544 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AAGCACTTGAATTGTTGAAG+TGG - Chr1:63920588-63920607 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AAGTCTCTTGAGGAAATTAG+AGG - Chr1:63922287-63922306 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ACATAACTTGATAGAGGACA+CGG - Chr1:63920994-63921013 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGAATTGTTGAAGTGGA+TGG - Chr1:63920592-63920611 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AGATTGGACATTAAGTTAGG+AGG - Chr1:63920344-63920363 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AGTATCTTCCAAGTACTTTG+AGG - Chr1:63921422-63921441 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AGTCTCTTGAGGAAATTAGA+GGG - Chr1:63922288-63922307 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAATTGCTTCTCGATA+AGG - Chr1:63920130-63920149 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ATACAACTTGAAACATCTCC+AGG - Chr1:63920298-63920317 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ATGGTAGGACTTTATGGTAT+TGG - Chr1:63920173-63920192 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACTGCTACAAGACAAA+GGG - Chr1:63919580-63919599 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGAAGATGTGAGACAT+CGG + Chr1:63921667-63921686 None:intergenic 35.0%
CAAAGAAAACAGGCAAAACT+AGG + Chr1:63919609-63919628 None:intergenic 35.0%
CACAATCATCAATGAAAGTG+TGG + Chr1:63919432-63919451 None:intergenic 35.0%
CAGATTTGACATCTTCTTGA+AGG + Chr1:63921359-63921378 None:intergenic 35.0%
CATAATAGACTGGAATGGAA+AGG - Chr1:63921333-63921352 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
CATTCCTCTTCAATTTCCTA+TGG - Chr1:63919313-63919332 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
CGTGACTTAACATTATACGA+GGG - Chr1:63921969-63921988 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
CTGTAATCCAACAGGATATT+TGG + Chr1:63920096-63920115 None:intergenic 35.0%
CTTTCCATTCCAGTCTATTA+TGG + Chr1:63921335-63921354 None:intergenic 35.0%
GAAAACCTTTCTAGATTTGG+TGG + Chr1:63922317-63922336 None:intergenic 35.0%
GAATCCATAGGAAATTGAAG+AGG + Chr1:63919320-63919339 None:intergenic 35.0%
GACATCTTGCCTAATAATTC+TGG + Chr1:63921873-63921892 None:intergenic 35.0%
GAGATACTTCATGCTCATTA+TGG - Chr1:63920896-63920915 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
GCAGAAAACCTTTCTAGATT+TGG + Chr1:63922320-63922339 None:intergenic 35.0%
GCTCTTTATGTGATTCTTTC+CGG + Chr1:63921033-63921052 None:intergenic 35.0%
GGCTATGAATATACTCTTTC+AGG - Chr1:63922709-63922728 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
GTATCTTCCAAGTACTTTGA+GGG - Chr1:63921423-63921442 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
GTCCAAACAAAATGAAGAAG+AGG + Chr1:63919545-63919564 None:intergenic 35.0%
GTGAAATTGCTTCTCGATAA+GGG - Chr1:63920131-63920150 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
GTTGAAGAAGAAAAGAAGCA+CGG - Chr1:63922966-63922985 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
TATTCACTGCTACAAGACAA+AGG - Chr1:63919579-63919598 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
TCATCATCATCAGATGGTTT+AGG + Chr1:63922637-63922656 None:intergenic 35.0%
TCCTCACGAAAATTGAAACT+CGG + Chr1:63922922-63922941 None:intergenic 35.0%
TCGTGACTTAACATTATACG+AGG - Chr1:63921968-63921987 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
TCTATTATGGGTTCCATTGA+GGG + Chr1:63921322-63921341 None:intergenic 35.0%
TGACATTCATTAAGACACTC+TGG + Chr1:63922236-63922255 None:intergenic 35.0%
TGGAAAAAACTAGCATGAGA+TGG + Chr1:63921192-63921211 None:intergenic 35.0%
TTAAACCGTGCAGTTTCATA+TGG - Chr1:63920656-63920675 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGAGCATAGAAGAATGGA+AGG - Chr1:63920727-63920746 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAGCATAGAAGAATGGAA+GGG - Chr1:63920728-63920747 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! ATAGAAGAGATTTGGTTGAG+TGG - Chr1:63921897-63921916 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAATACCCTCAAAGTACT+TGG + Chr1:63921433-63921452 None:intergenic 35.0%
! ATTGAGATTTGTTTGCCAAC+CGG - Chr1:63922502-63922521 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
! CAAAGTACTTGGAAGATACT+TGG + Chr1:63921422-63921441 None:intergenic 35.0%
! CTAGAAAGGTTTTCTGCAAT+TGG - Chr1:63922323-63922342 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! TGCCTCTTCTTCATTTTGTT+TGG - Chr1:63919540-63919559 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGAAAGAGCATAGAAGAA+TGG - Chr1:63920723-63920742 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
!! ATAGTGGGTTCCAACTTATT+TGG - Chr1:63920704-63920723 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
!! ATATAGCTTGTTGCTTCAAG+GGG - Chr1:63920852-63920871 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
!! GATATAGCTTGTTGCTTCAA+GGG - Chr1:63920851-63920870 MsG0180003539.01.T01:intron 35.0%
!! GCAATTTCACTTGTTGTACT+TGG + Chr1:63920121-63920140 None:intergenic 35.0%
!! GCATAGTTGATAGAAAACAC+AGG + Chr1:63919523-63919542 None:intergenic 35.0%
!! GCTTTAAGATGAGGTTATTG+GGG + Chr1:63919859-63919878 None:intergenic 35.0%
!! GTACTTTGAGGGTATTGATA+TGG - Chr1:63921434-63921453 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTTGATGATGTCGACAAAA+TGG - Chr1:63920427-63920446 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGAGATGTTTCAAGTTGTA+TGG + Chr1:63920299-63920318 None:intergenic 35.0%
!!! CTAGTTTTGCCTGTTTTCTT+TGG - Chr1:63919607-63919626 MsG0180003539.01.T01:CDS 35.0%
AACAACAAACCTGACTCAGT+AGG + Chr1:63922382-63922401 None:intergenic 40.0%
ACTTGCAGTCATCCAATAGA+AGG + Chr1:63922271-63922290 None:intergenic 40.0%
AGTAAGTTACGATGCTTTGG+AGG - Chr1:63920805-63920824 MsG0180003539.01.T01:intron 40.0%
ATACTCTTTCAGGCAATTGG+TGG - Chr1:63922719-63922738 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGAGACATCGGGTATAT+GGG + Chr1:63921658-63921677 None:intergenic 40.0%
CAATGGAACCCATAATAGAC+TGG - Chr1:63921323-63921342 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
CACACAATGTGAGAACTACT+CGG + Chr1:63922166-63922185 None:intergenic 40.0%
CACTTGGTATGTGAATCCAT+AGG + Chr1:63919332-63919351 None:intergenic 40.0%
CATAACTTGATAGAGGACAC+GGG - Chr1:63920995-63921014 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
CATGTTGCCAAATATCCTGT+TGG - Chr1:63920086-63920105 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
CGTGAGGAACATACACAAAT+TGG - Chr1:63922934-63922953 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
CTGAACCATATGAAACTGCA+CGG + Chr1:63920664-63920683 None:intergenic 40.0%
CTGAACGAAGCAAAGAACAA+AGG - Chr1:63923075-63923094 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GAACCCATAATAGACTGGAA+TGG - Chr1:63921328-63921347 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GACTTAACATTATACGAGGG+TGG - Chr1:63921972-63921991 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTGCAATTCCTTAAGAG+AGG + Chr1:63921823-63921842 None:intergenic 40.0%
GATGATTGTGATCTTGAGAG+AGG - Chr1:63919442-63919461 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GGATATATTGAGTTCCATGG+TGG - Chr1:63922085-63922104 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GGATTCCACCAAATCTAGAA+AGG - Chr1:63922309-63922328 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
GTCTATTATGGGTTCCATTG+AGG + Chr1:63921323-63921342 None:intergenic 40.0%
TAATCAAAGACATCTCCGAC+AGG - Chr1:63920045-63920064 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
TACCATAAAGTCCTACCATG+TGG + Chr1:63920172-63920191 None:intergenic 40.0%
TAGAAGAATCCTACTGAGTC+AGG - Chr1:63922370-63922389 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
TAGTAAGTGTTTGTCTCGAG+TGG + Chr1:63920516-63920535 None:intergenic 40.0%
TGAAAATCACCTGTGTGAAC+TGG - Chr1:63922837-63922856 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
TTAAGAGAGGTCAACCGTAA+GGG + Chr1:63921810-63921829 None:intergenic 40.0%
TTGGTTCCAATACCAAAGCT+GGG - Chr1:63922543-63922562 MsG0180003539.01.T01:intron 40.0%
TTTGGAAGATGTGAGACATC+GGG + Chr1:63921666-63921685 None:intergenic 40.0%
! ACAGGTGATTTTCATAACGC+TGG + Chr1:63922831-63922850 None:intergenic 40.0%
! ACTTTATGGTATTGGAGGCT+TGG - Chr1:63920181-63920200 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! ATAAGTATAGTAGGGTACCC+TGG + Chr1:63919793-63919812 None:intergenic 40.0%
! ATATGATGATGAGGTCCACA+TGG - Chr1:63920154-63920173 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGGTTCCAATACCAAAGC+TGG - Chr1:63922542-63922561 MsG0180003539.01.T01:intron 40.0%
! CAAGGGGTATAGATTGACAA+TGG - Chr1:63920868-63920887 MsG0180003539.01.T01:intron 40.0%
! CGATAAGGGATATGATGATG+AGG - Chr1:63920145-63920164 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTATGGTATTGGAGGCTT+GGG - Chr1:63920182-63920201 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTGGTATTGGAACCAATC+AGG + Chr1:63922541-63922560 None:intergenic 40.0%
! GAATGGAAGGGTACATTAGA+TGG - Chr1:63920740-63920759 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGGACTTTATGGTATTGG+AGG - Chr1:63920176-63920195 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! TCCGAGTTTCAATTTTCGTG+AGG - Chr1:63922918-63922937 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAAGATACTTGGGACTTT+TGG + Chr1:63921413-63921432 None:intergenic 40.0%
! TTTTCAAAAGGAGCTCTTCC+TGG + Chr1:63920319-63920338 None:intergenic 40.0%
!! AAGTTAGGAGGTGTTAGTGA+GGG - Chr1:63920356-63920375 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATATAGCTTGTTGCTTCA+AGG - Chr1:63920850-63920869 MsG0180003539.01.T01:intron 40.0%
!! TAAGTTAGGAGGTGTTAGTG+AGG - Chr1:63920355-63920374 MsG0180003539.01.T01:CDS 40.0%
AAACAGTATGTCCCCAGCTT+TGG + Chr1:63922558-63922577 None:intergenic 45.0%
AAAGTACGCATGCGGTAGAA+GGG - Chr1:63920552-63920571 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
ACACGGGTAAAGAAATCGTC+CGG - Chr1:63921011-63921030 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
ACTGATGTGCGACATCATAC+AGG - Chr1:63919640-63919659 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
ACTTGGGACTGTAATCCAAC+AGG + Chr1:63920104-63920123 None:intergenic 45.0%
AGTAGAGCTTCAGTTGATCG+AGG - Chr1:63922891-63922910 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
ATCTTGCTAAGCATGGAGAG+AGG - Chr1:63919677-63919696 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
ATGCGGTAGAAGGGTTGTAT+GGG - Chr1:63920561-63920580 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
CCAATAGAAGGACCCTTAGA+AGG + Chr1:63922259-63922278 None:intergenic 45.0%
CCCTGGACTATAATGGTATC+CGG + Chr1:63919776-63919795 None:intergenic 45.0%
CCGGATACCATTATAGTCCA+GGG - Chr1:63919773-63919792 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
CGACATCATACAGGGAGTTA+TGG - Chr1:63919649-63919668 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
CGTACTTTCTATCCCATGAC+AGG + Chr1:63920540-63920559 None:intergenic 45.0%
CGTGCAGTTTCATATGGTTC+AGG - Chr1:63920662-63920681 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
CTGATGTGCGACATCATACA+GGG - Chr1:63919641-63919660 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
CTTAAGAGAGGTCAACCGTA+AGG + Chr1:63921811-63921830 None:intergenic 45.0%
CTTACGGTTGACCTCTCTTA+AGG - Chr1:63921809-63921828 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCAAAGAACAAAGGACG+TGG - Chr1:63923081-63923100 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
GATGTGAGACATCGGGTATA+TGG + Chr1:63921659-63921678 None:intergenic 45.0%
GGGTTAGAGCTATCTTCCAT+TGG + Chr1:63919738-63919757 None:intergenic 45.0%
GTATGATGTCGCACATCAGT+AGG + Chr1:63919640-63919659 None:intergenic 45.0%
GTCCACATGGTAGGACTTTA+TGG - Chr1:63920167-63920186 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
GTGGATTCCCTTGTCATCAA+GGG + Chr1:63919413-63919432 None:intergenic 45.0%
TAACAGCAACTACATGTGGC+TGG - Chr1:63922475-63922494 MsG0180003539.01.T01:intron 45.0%
TAAGAGAGGTCAACCGTAAG+GGG + Chr1:63921809-63921828 None:intergenic 45.0%
TCCGGATACCATTATAGTCC+AGG - Chr1:63919772-63919791 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTCCAATACCAAAGCTG+GGG - Chr1:63922544-63922563 MsG0180003539.01.T01:intron 45.0%
TGTGGATTCCCTTGTCATCA+AGG + Chr1:63919414-63919433 None:intergenic 45.0%
TTCCATGGTGGCTTCAAATG+TGG - Chr1:63922097-63922116 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
TTTCACTGGCCATCTCTACA+AGG - Chr1:63919387-63919406 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! AGAGGAGCAAAGTGTCTTTC+TGG - Chr1:63920829-63920848 MsG0180003539.01.T01:intron 45.0%
! AGAGTCAAGTTGTGCGTCAA+TGG - Chr1:63922688-63922707 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! CCTTCTAAGGGTCCTTCTAT+TGG - Chr1:63922256-63922275 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! GAAGAAGAAAAGAAGCACGG+AGG - Chr1:63922969-63922988 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! GGGGACATACTGTTTCTTTC+TGG - Chr1:63922563-63922582 MsG0180003539.01.T01:intron 45.0%
! TACAAGGCCCTTGATGACAA+GGG - Chr1:63919403-63919422 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! TAGGGTACCCTGGACTATAA+TGG + Chr1:63919783-63919802 None:intergenic 45.0%
! TATGTCCCCAGCTTTGGTAT+TGG + Chr1:63922552-63922571 None:intergenic 45.0%
! TCAAGAGTTTTCCCCCCTTA+CGG - Chr1:63921793-63921812 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! TGGGATAGAAAGTACGCATG+CGG - Chr1:63920544-63920563 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
! TTCCACATTTGAAGCCACCA+TGG + Chr1:63922102-63922121 None:intergenic 45.0%
! TTTGCCTGTTTTCTTTGGCG+TGG - Chr1:63919612-63919631 MsG0180003539.01.T01:CDS 45.0%
!! TTACGATGCTTTGGAGGAAG+AGG - Chr1:63920811-63920830 MsG0180003539.01.T01:intron 45.0%
AAGAGAGGTCAACCGTAAGG+GGG + Chr1:63921808-63921827 None:intergenic 50.0%
AATCACACCGTCACTCGTCA+AGG - Chr1:63919471-63919490 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
ACATGGAGCGATTGCACCAA+TGG - Chr1:63919719-63919738 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
ACCAAGTGTTCCTCAGCTTC+AGG - Chr1:63919344-63919363 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCTTCAGTTGATCGAGG+AGG - Chr1:63922894-63922913 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
ATCAGGAATCCCCTCAGTTC+CGG + Chr1:63922524-63922543 None:intergenic 50.0%
ATCCGGACAAGTTAGCAGCT+TGG + Chr1:63919759-63919778 None:intergenic 50.0%
CAAGTGTTCCTCAGCTTCAG+GGG - Chr1:63919346-63919365 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
CATGCGGTAGAAGGGTTGTA+TGG - Chr1:63920560-63920579 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
CCAAGTGTTCCTCAGCTTCA+GGG - Chr1:63919345-63919364 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
CTCGGACACATTCATCTGAG+AGG + Chr1:63922148-63922167 None:intergenic 50.0%
CTTTGGCTGGAGGACTTGAT+TGG - Chr1:63920462-63920481 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
GAACTGAGGGGATTCCTGAT+TGG - Chr1:63922524-63922543 MsG0180003539.01.T01:intron 50.0%
GACATCTCCGACAGGATCAA+TGG - Chr1:63920053-63920072 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
GAGCTTCAGTTGATCGAGGA+GGG - Chr1:63922895-63922914 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
GATGATGAGGTCCACATGGT+AGG - Chr1:63920158-63920177 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
GGATCCACGCCAAAGAAAAC+AGG + Chr1:63919619-63919638 None:intergenic 50.0%
GGATGACTGCAAGTCTCTTG+AGG - Chr1:63922277-63922296 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
GGCGAAGATCTTGCTAAGCA+TGG - Chr1:63919670-63919689 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
TCCGGACAAGTTAGCAGCTT+GGG + Chr1:63919758-63919777 None:intergenic 50.0%
TGTCGACAAAATGGAGCAGC+TGG - Chr1:63920436-63920455 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
TGTTTGCCAACCGGAACTGA+GGG - Chr1:63922511-63922530 MsG0180003539.01.T01:intron 50.0%
TTGCTTCGTTCAGCAGAGTG+TGG + Chr1:63923068-63923087 None:intergenic 50.0%
TTGTTTGCCAACCGGAACTG+AGG - Chr1:63922510-63922529 MsG0180003539.01.T01:intron 50.0%
! ACCCAAGCTGCTAACTTGTC+CGG - Chr1:63919754-63919773 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
! CATCAAGGGCCTTGTAGAGA+TGG + Chr1:63919399-63919418 None:intergenic 50.0%
! CTACAAGGCCCTTGATGACA+AGG - Chr1:63919402-63919421 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
! GAAAGTACGCATGCGGTAGA+AGG - Chr1:63920551-63920570 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
! GCTGGAGGACTTGATTGGTT+CGG - Chr1:63920467-63920486 MsG0180003539.01.T01:CDS 50.0%
! TCAATGGCCTTGACGAGTGA+CGG + Chr1:63919481-63919500 None:intergenic 50.0%
AATGGAGCAGCTGGTGGCTT+TGG - Chr1:63920445-63920464 MsG0180003539.01.T01:CDS 55.0%
AGAGAGGTCAACCGTAAGGG+GGG + Chr1:63921807-63921826 None:intergenic 55.0%
CATAACCTGCTGCGTTCTCC+AGG + Chr1:63921055-63921074 None:intergenic 55.0%
CCCTGAAGCTGAGGAACACT+TGG + Chr1:63919348-63919367 None:intergenic 55.0%
CGACAAAATGGAGCAGCTGG+TGG - Chr1:63920439-63920458 MsG0180003539.01.T01:CDS 55.0%
CTGGAGAACGCAGCAGGTTA+TGG - Chr1:63921053-63921072 MsG0180003539.01.T01:CDS 55.0%
GACACTCGTGACGGTTTCAC+TGG - Chr1:63919373-63919392 MsG0180003539.01.T01:CDS 55.0%
GTGCTTCGTCCAGTTCACAC+AGG + Chr1:63922849-63922868 None:intergenic 55.0%
GTTTGCCAACCGGAACTGAG+GGG - Chr1:63922512-63922531 MsG0180003539.01.T01:intron 55.0%
!! GGACTTGATTGGTTCGGTCG+TGG - Chr1:63920473-63920492 MsG0180003539.01.T01:CDS 55.0%
AAGAGCCTGGAGAACGCAGC+AGG - Chr1:63921047-63921066 MsG0180003539.01.T01:CDS 60.0%
AGGGGCAGTGACACTCGTGA+CGG - Chr1:63919364-63919383 MsG0180003539.01.T01:CDS 60.0%
GGAATCCCCTCAGTTCCGGT+TGG + Chr1:63922520-63922539 None:intergenic 60.0%
TGTCACTGCCCCTGAAGCTG+AGG + Chr1:63919357-63919376 None:intergenic 60.0%
!! CAGCTGGTGGCTTTGGCTGG+AGG - Chr1:63920452-63920471 MsG0180003539.01.T01:CDS 65.0%
!! GAGCAGCTGGTGGCTTTGGC+TGG - Chr1:63920449-63920468 MsG0180003539.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 63919298 63923113 63919298 ID=MsG0180003539.01;Name=MsG0180003539.01
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Chr1 exon 63922617 63923113 63922617 ID=MsG0180003539.01.T01:exon:4755;Parent=MsG0180003539.01.T01
Chr1 exon 63921297 63922392 63921297 ID=MsG0180003539.01.T01:exon:4754;Parent=MsG0180003539.01.T01
Chr1 exon 63920967 63921128 63920967 ID=MsG0180003539.01.T01:exon:4753;Parent=MsG0180003539.01.T01
Chr1 exon 63920020 63920805 63920020 ID=MsG0180003539.01.T01:exon:4752;Parent=MsG0180003539.01.T01
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Chr1 CDS 63920967 63921128 63920967 ID=MsG0180003539.01.T01:cds;Parent=MsG0180003539.01.T01
Chr1 CDS 63920020 63920805 63920020 ID=MsG0180003539.01.T01:cds;Parent=MsG0180003539.01.T01
Chr1 CDS 63919298 63919930 63919298 ID=MsG0180003539.01.T01:cds;Parent=MsG0180003539.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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