AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003728.01

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MsG0180003728.01.T01 AT1G13630 30.000 460 309 3 2 448 279 738 7.84e-62 219
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MsG0180003728.01.T01 AT3G06920 25.455 220 164 0 1 220 643 862 1.91e-20 96.7
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MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 26.955 486 352 3 80 563 237 721 1.72e-58 210
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 24.518 571 391 4 6 539 233 800 2.15e-57 207
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 25.417 240 177 1 5 244 549 786 7.70e-19 91.3
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 31.529 425 275 5 10 426 307 723 3.58e-68 237
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 25.819 519 382 3 47 563 204 721 1.86e-58 210
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 24.953 537 363 4 6 505 233 766 4.59e-57 206
MsG0180003728.01.T01 AT1G30290 25.322 233 172 1 5 237 549 779 1.46e-18 90.5
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MsG0180003728.01.T01 AT5G04810 28.533 375 268 0 10 384 479 853 2.02e-46 176
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MsG0180003728.01.T01 AT1G11710 26.625 477 341 3 9 480 148 620 7.29e-50 183
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MsG0180003728.01.T01 AT5G40400 26.747 415 259 6 2 410 223 598 2.10e-33 135
MsG0180003728.01.T01 AT5G40400 25.740 439 267 6 137 517 91 528 2.38e-32 132
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MsG0180003728.01.T01 AT3G49730 25.056 443 283 6 12 445 164 566 1.66e-40 157
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MsG0180003728.01.T01 AT4G01570 23.878 490 345 6 14 476 288 776 1.98e-37 149
MsG0180003728.01.T01 AT4G01570 24.590 427 296 6 2 402 346 772 4.32e-32 132
MsG0180003728.01.T01 AT2G35130 25.768 423 301 5 86 502 156 571 8.83e-43 162
MsG0180003728.01.T01 AT2G35130 24.424 434 291 4 2 434 177 574 2.61e-34 138
MsG0180003728.01.T01 AT2G35130 24.033 362 274 1 113 473 148 509 3.52e-32 132
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 30.573 314 216 2 47 359 149 461 9.07e-43 160
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 28.052 385 273 4 48 430 81 463 5.92e-42 158
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 27.562 283 203 2 2 283 174 455 1.37e-34 137
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 31.636 275 186 2 257 530 149 422 2.85e-34 136
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 28.146 302 215 2 14 314 151 451 2.26e-33 134
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 27.731 238 167 2 1 236 209 443 1.03e-25 111
MsG0180003728.01.T01 AT1G53330 25.680 331 222 9 244 558 25 347 7.31e-13 71.6
MsG0180003728.01.T01 AT3G62470 26.357 387 283 2 9 395 189 573 1.04e-42 162
MsG0180003728.01.T01 AT3G62470 27.119 354 255 3 149 502 189 539 2.57e-36 144
MsG0180003728.01.T01 AT3G62470 26.590 346 245 4 122 465 231 569 8.22e-33 134
MsG0180003728.01.T01 AT3G62470 24.211 380 286 2 107 486 182 559 7.15e-31 128
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MsG0180003728.01.T01 AT3G62470 25.969 258 191 0 7 264 290 547 2.10e-26 114
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MsG0180003728.01.T01 AT3G23020 23.592 373 238 6 15 380 505 837 1.21e-21 100
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MsG0180003728.01.T01 AT1G18900 29.897 291 204 0 148 438 357 647 3.64e-39 154
MsG0180003728.01.T01 AT1G18900 28.024 339 234 4 39 373 320 652 6.91e-36 144
MsG0180003728.01.T01 AT1G18900 24.027 437 311 5 5 427 389 818 2.37e-28 121
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MsG0180003728.01.T01 AT3G59040 24.074 216 160 2 2 215 308 521 6.86e-15 78.6
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MsG0180003728.01.T01 AT2G35130 25.057 439 285 6 2 434 177 577 8.26e-33 134
MsG0180003728.01.T01 AT2G35130 24.110 365 273 2 113 473 148 512 2.94e-31 129
MsG0180003728.01.T01 AT3G53170 26.525 377 266 5 61 430 69 441 1.52e-32 131
MsG0180003728.01.T01 AT3G53170 25.449 334 212 2 188 484 92 425 5.60e-26 111
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MsG0180003728.01.T01 AT3G53170 22.769 325 175 5 1 251 115 437 8.57e-14 74.3
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MsG0180003728.01.T01 AT3G09650 24.038 312 213 4 14 301 413 724 2.10e-23 105
MsG0180003728.01.T01 AT3G09650 20.559 501 372 8 83 559 151 649 1.64e-19 93.6
MsG0180003728.01.T01 AT3G09650 27.099 262 173 3 4 263 476 721 1.25e-18 90.5
MsG0180003728.01.T01 AT3G09650 24.883 213 140 2 8 200 516 728 7.62e-13 72.0
MsG0180003728.01.T01 AT3G53170 26.829 369 259 5 61 422 119 483 1.60e-32 132
MsG0180003728.01.T01 AT3G53170 25.449 334 212 2 188 484 142 475 9.01e-26 111
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MsG0180003728.01.T01 AT4G13650 21.169 496 369 9 15 507 151 627 7.63e-20 94.7
MsG0180003728.01.T01 AT4G13650 21.171 444 330 7 38 478 72 498 3.91e-19 92.4
MsG0180003728.01.T01 AT4G13650 23.488 281 204 5 86 364 658 929 1.23e-11 68.6
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MsG0180003728.01.T01 AT2G36980 24.078 461 321 11 49 502 137 575 5.63e-26 113
MsG0180003728.01.T01 AT2G36980 21.711 456 306 9 83 504 33 471 6.49e-20 94.4
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MsG0180003728.01.T01 AT1G32415 25.524 286 181 7 188 466 33 293 7.33e-17 85.1
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MsG0180003728.01.T01 AT5G16860 23.303 442 289 12 2 435 317 716 9.30e-16 81.6
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MsG0180003728.01.T01 AT1G20230 20.661 363 270 4 113 472 43 390 7.77e-16 81.6
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MsG0180003728.01.T01 AT1G26500 23.167 341 180 8 215 515 98 396 1.19e-13 74.3
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 31.720 186 117 2 105 281 1 185 4.86e-25 103
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 35.165 182 108 2 245 417 1 181 2.45e-24 101
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 34.839 155 92 1 282 427 3 157 1.57e-21 93.2
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 33.333 183 112 2 211 384 2 183 2.12e-20 89.7
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 29.670 182 114 4 37 207 3 181 1.71e-19 87.0
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 31.214 173 110 1 146 309 7 179 2.21e-19 87.0
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 29.586 169 110 1 70 229 1 169 1.26e-18 84.7
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 27.869 183 122 2 2 175 3 184 2.32e-15 75.1
MsG0180003728.01.T01 AT1G63320 26.455 189 129 2 351 530 2 189 2.43e-15 75.1
MsG0180003728.01.T01 AT5G47360 24.062 320 236 3 9 321 124 443 5.15e-25 109
MsG0180003728.01.T01 AT5G47360 25.066 379 228 8 81 445 126 462 3.29e-24 106
MsG0180003728.01.T01 AT5G47360 26.821 302 181 3 185 481 125 391 1.12e-23 105
MsG0180003728.01.T01 AT5G47360 24.058 345 251 5 131 464 102 446 2.20e-21 98.2
MsG0180003728.01.T01 AT5G27270 24.548 387 291 1 13 399 633 1018 5.41e-25 111
MsG0180003728.01.T01 AT5G27270 24.234 359 271 1 56 414 641 998 6.62e-25 110
MsG0180003728.01.T01 AT5G27270 21.990 573 398 13 2 545 385 937 3.66e-20 95.9
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MsG0180003728.01.T01 AT5G19020 20.909 550 376 13 2 516 63 588 3.17e-23 105
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MsG0180003728.01.T01 AT3G53360 22.656 384 282 6 85 466 336 706 4.62e-21 98.2
MsG0180003728.01.T01 AT3G53360 20.112 537 341 13 40 504 88 608 1.14e-15 81.3
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MsG0180003728.01.T01 AT5G13230 18.914 534 382 9 2 504 71 584 4.41e-13 73.2
MsG0180003728.01.T01 AT4G14050 24.100 361 251 8 118 473 103 445 3.61e-21 98.2
MsG0180003728.01.T01 AT4G14050 19.863 438 298 9 2 403 25 445 1.85e-11 67.4
MsG0180003728.01.T01 AT1G09410 24.408 422 281 14 14 429 109 498 3.68e-21 98.6
MsG0180003728.01.T01 AT1G09410 22.564 390 226 12 122 509 19 334 5.97e-21 97.8
MsG0180003728.01.T01 AT1G09410 22.699 326 213 10 87 410 50 338 1.03e-16 84.3
MsG0180003728.01.T01 AT2G45350 24.941 425 282 13 113 527 114 511 4.40e-21 98.2
MsG0180003728.01.T01 AT2G45350 24.022 358 253 7 68 423 170 510 1.51e-19 93.2
MsG0180003728.01.T01 AT5G15300 26.571 350 224 11 2 342 134 459 5.31e-21 97.4
MsG0180003728.01.T01 AT5G15300 21.709 433 277 10 5 429 67 445 1.23e-16 84.0
MsG0180003728.01.T01 AT5G15300 20.946 296 184 7 223 481 75 357 4.14e-12 69.3
MsG0180003728.01.T01 AT2G40720 24.083 436 265 11 73 502 436 811 5.58e-21 98.2
MsG0180003728.01.T01 AT2G40720 18.883 609 360 16 14 510 132 718 8.69e-13 72.0
MsG0180003728.01.T01 AT3G12770 21.149 435 290 9 18 415 87 505 6.68e-21 97.8
MsG0180003728.01.T01 AT3G12770 20.650 431 319 7 105 529 69 482 1.09e-19 94.0
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MsG0180003728.01.T01 AT4G37170 21.739 460 301 13 10 429 45 485 1.11e-17 87.4
MsG0180003728.01.T01 AT4G37170 22.460 374 266 10 96 464 95 449 1.27e-17 87.4
MsG0180003728.01.T01 AT4G37170 20.403 397 249 8 145 531 31 370 2.26e-14 77.0
MsG0180003728.01.T01 AT3G62890 24.737 380 262 8 13 382 22 387 4.68e-19 91.7
MsG0180003728.01.T01 AT5G08305 22.716 405 258 8 113 516 39 389 4.68e-19 91.3
MsG0180003728.01.T01 AT5G08305 21.345 342 258 4 89 429 77 408 5.25e-19 91.3
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 20.518 502 369 14 14 510 116 592 5.07e-19 92.0
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 21.353 473 311 12 6 473 207 623 2.64e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 22.432 370 244 7 5 340 303 663 9.81e-14 75.1
MsG0180003728.01.T01 AT3G02330 19.959 491 356 9 12 482 142 615 5.47e-19 92.0
MsG0180003728.01.T01 AT3G02330 19.181 464 313 9 83 529 345 763 6.34e-15 79.0
MsG0180003728.01.T01 AT3G02330 23.077 260 189 5 60 316 543 794 3.98e-12 70.1
MsG0180003728.01.T01 AT3G26782 21.226 424 316 8 14 429 40 453 6.14e-19 91.3
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 20.437 504 367 15 14 510 109 585 6.37e-19 91.7
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 21.353 473 311 12 6 473 200 616 3.02e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT4G33990 22.432 370 244 7 5 340 296 656 1.21e-13 74.7
MsG0180003728.01.T01 AT5G13270 22.114 511 336 13 2 506 171 625 7.38e-19 91.3
MsG0180003728.01.T01 AT4G35130 22.371 447 282 8 32 472 46 433 1.02e-18 90.9
MsG0180003728.01.T01 AT4G35130 21.074 503 367 12 14 510 94 572 1.49e-18 90.5
MsG0180003728.01.T01 AT4G35130 20.628 446 269 12 14 423 195 591 1.81e-14 77.4
MsG0180003728.01.T01 AT4G35130 20.231 346 240 6 5 321 288 626 2.45e-12 70.5
MsG0180003728.01.T01 AT1G77010 21.986 423 308 7 2 423 209 610 1.08e-18 90.9
MsG0180003728.01.T01 AT1G77010 20.729 521 340 13 49 529 123 610 1.36e-17 87.4
MsG0180003728.01.T01 AT1G77010 20.868 484 323 10 14 461 154 613 6.34e-15 78.6
MsG0180003728.01.T01 AT4G15720 22.727 352 253 9 187 532 61 399 1.33e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT4G15720 23.276 348 253 6 85 428 64 401 3.87e-18 89.0
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 26.066 211 156 0 252 462 99 309 1.54e-18 88.2
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 25.000 204 153 0 87 290 109 312 1.84e-17 84.7
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 21.845 206 161 0 16 221 108 313 2.58e-15 78.2
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 24.731 279 183 5 106 362 41 314 1.23e-14 76.3
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 23.856 306 229 4 236 540 15 317 6.25e-14 73.9
MsG0180003728.01.T01 AT2G40240 22.545 275 209 2 158 431 42 313 2.87e-12 68.9
MsG0180003728.01.T01 AT2G20540 23.642 313 226 4 118 429 77 377 1.62e-18 89.4
MsG0180003728.01.T01 AT3G58590 20.889 450 312 11 5 424 271 706 1.68e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT3G58590 20.236 509 374 14 5 509 205 685 9.04e-18 87.8
MsG0180003728.01.T01 AT3G58590 21.606 523 369 15 17 530 82 572 3.31e-16 82.8
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 36 527 1.76e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 184 588 2.30e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 10 432 8.15e-12 68.9
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 36 527 1.76e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 184 588 2.30e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 10 432 8.15e-12 68.9
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 36 527 1.76e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 184 588 2.30e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 10 432 8.15e-12 68.9
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 111 602 1.82e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 259 663 1.89e-15 80.5
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 85 507 9.38e-12 68.6
MsG0180003728.01.T01 AT3G56030 26.389 216 152 3 228 438 60 273 1.83e-18 87.8
MsG0180003728.01.T01 AT3G56030 28.019 207 146 1 87 290 127 333 2.55e-18 87.4
MsG0180003728.01.T01 AT3G56030 22.801 307 197 4 158 461 60 329 4.86e-16 80.5
MsG0180003728.01.T01 AT3G56030 24.766 214 150 4 156 362 126 335 1.05e-12 70.5
MsG0180003728.01.T01 AT5G40405 22.338 385 277 8 84 463 70 437 1.92e-18 89.7
MsG0180003728.01.T01 AT5G40405 22.338 385 277 8 84 463 70 437 1.92e-18 89.7
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 91 582 1.98e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 239 643 2.58e-15 80.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 65 487 8.94e-12 68.9
MsG0180003728.01.T01 AT4G14050 23.035 369 261 8 110 473 42 392 2.14e-18 89.4
MsG0180003728.01.T01 AT2G29760 21.394 416 301 7 17 426 133 528 2.18e-18 89.7
MsG0180003728.01.T01 AT2G29760 19.954 436 302 7 104 505 79 501 3.58e-18 89.4
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 100 591 2.19e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 248 652 2.24e-15 80.5
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 74 496 1.07e-11 68.6
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 100 591 2.19e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 248 652 2.24e-15 80.5
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 74 496 1.07e-11 68.6
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 21.183 524 329 14 2 473 100 591 2.19e-18 90.1
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 20.290 414 251 9 85 428 248 652 2.24e-15 80.5
MsG0180003728.01.T01 AT2G33680 18.694 444 330 10 46 479 74 496 1.07e-11 68.6
MsG0180003728.01.T01 AT5G44230 23.380 355 247 10 89 437 21 356 2.20e-18 89.4
MsG0180003728.01.T01 AT5G44230 23.377 308 203 10 19 317 91 374 1.65e-12 70.9
MsG0180003728.01.T01 AT3G51320 23.757 362 248 6 46 391 28 377 2.23e-18 89.4
MsG0180003728.01.T01 AT3G51320 25.177 282 187 6 140 417 107 368 1.41e-12 70.9

Find 122 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 158 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCCTCGATGTTTCCCGTTTC+AGG 0.117089 1:-67360386 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTATTATAAGTTACAGTATT+TGG 0.182942 1:+67361746 None:intergenic
GATGCCTAAAAGGGTGTAAT+TGG 0.234406 1:-67360535 MsG0180003728.01.T01:intron
AGCCTTAATCAAAACATTAA+AGG 0.236797 1:+67362258 None:intergenic
CGAAGAAGCTTCTCAACTTA+TGG 0.300343 1:-67361270 MsG0180003728.01.T01:CDS
CCAAGGCATCGCTAAATTTA+CGG 0.300889 1:+67360652 None:intergenic
ACTTATAACTCGTTGATATC+TGG 0.320999 1:-67361839 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACCCTTTGCTAACAAGAATT+CGG 0.322148 1:+67361669 None:intergenic
TTGCCAGAGTTTCCATCATT+TGG 0.322581 1:-67360801 MsG0180003728.01.T01:CDS
TACGTTTAATACTTTGATAC+AGG 0.340989 1:-67361630 MsG0180003728.01.T01:CDS
TCCTCAAGCATCAAAATTGC+AGG 0.344328 1:+67362211 None:intergenic
TTTAAGCACGAGCGACCTTC+TGG 0.363993 1:-67360422 MsG0180003728.01.T01:CDS
TCTCATTGAACTCATCAATA+TGG 0.378617 1:-67360736 MsG0180003728.01.T01:CDS
AACTGTTTCTGTGAATGTTT+TGG 0.379972 1:-67362056 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTGTACAACACTTTGATAGA+TGG 0.380162 1:-67361419 MsG0180003728.01.T01:CDS
CTGAATAATGCTTGAATCAC+AGG 0.384093 1:+67360990 None:intergenic
CCCTTTGCTAACAAGAATTC+GGG 0.386885 1:+67361670 None:intergenic
ACTTATGGATCAGATGATAA+TGG 0.389243 1:-67361255 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGCTGATATTGTGCAAACTA+TGG 0.391858 1:-67361156 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAATTATACGTGAATTTGTC+AGG 0.394205 1:+67361221 None:intergenic
GGTAAAGATGCTGAAGAATA+TGG 0.394388 1:-67360497 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGGGAATGTTAATGATGCTT+TGG 0.395888 1:-67361909 MsG0180003728.01.T01:CDS
AATTGGAAATCACCTCATTC+TGG 0.401436 1:-67360518 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATATGGTGGAGTTCAAAATC+TGG 0.405133 1:-67360480 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGTTAGCAAAGGGTTGTTGC+CGG 0.406289 1:-67361660 MsG0180003728.01.T01:CDS
CCTCGATGTTTCCCGTTTCA+GGG 0.410245 1:-67360385 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATTGATGTTGTTGAAAGAAA+TGG 0.411683 1:-67361471 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGTGTAAAGCACATCAATTA+AGG 0.412067 1:-67362234 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGGGCTTTGTTCTTTATCAA+TGG 0.418139 1:-67360766 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTGATCAGATGGAACTTCTC+GGG 0.425974 1:-67361355 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTGCAGGAGGTTTCTGAGGA+AGG 0.427137 1:-67361986 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTTACCTATGGGACTCTTAT+CGG 0.431461 1:-67361107 MsG0180003728.01.T01:CDS
GGCTTCAAATGGGTGTGAAC+CGG 0.434857 1:-67361135 MsG0180003728.01.T01:CDS
AACTTTCACCACGTTGATGC+AGG 0.437894 1:-67362155 MsG0180003728.01.T01:CDS
CCCGAATTCTTGTTAGCAAA+GGG 0.442161 1:-67361670 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTCCCATAGGTAACGATATC+CGG 0.448306 1:+67361116 None:intergenic
GAATTAAAAGTAACCTGATC+AGG 0.452055 1:+67361956 None:intergenic
ATCCAAGATACCACCGAGAT+TGG 0.453539 1:+67360629 None:intergenic
GTGCAAACTATGGCTTCAAA+TGG 0.453826 1:-67361146 MsG0180003728.01.T01:CDS
TAAGTTAGGTGAATTTGAAA+AGG 0.455418 1:-67361810 MsG0180003728.01.T01:CDS
CTTACATACTTCTGCAGAGT+TGG 0.456551 1:-67361194 MsG0180003728.01.T01:CDS
AAATCAACAGCCTCTTGTAT+TGG 0.459332 1:+67360852 None:intergenic
CCGTAAATTTAGCGATGCCT+TGG 0.460573 1:-67360652 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGCAGGAGGTTTCTGAGGAA+GGG 0.461442 1:-67361985 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTTCACATTCTCCCTGAAAC+GGG 0.464634 1:+67360374 None:intergenic
GAACCGGATATCGTTACCTA+TGG 0.466660 1:-67361119 MsG0180003728.01.T01:CDS
CGCTAAATTTACGGATCTTG+AGG 0.467287 1:+67360661 None:intergenic
ATACTGTATGTGAACTCGTC+AGG 0.467304 1:+67361536 None:intergenic
TAATGATGCTTTGGATATTG+TGG 0.467367 1:-67361900 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTTGATCAGATGGAACTTCT+CGG 0.469201 1:-67361356 MsG0180003728.01.T01:CDS
TCAAGACTATACCTTTCATC+TGG 0.477265 1:+67361030 None:intergenic
ATATCTGGAATGTGTAAGTT+AGG 0.478743 1:-67361824 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACAGTTGAGATGTTGGAGAA+AGG 0.486684 1:-67360828 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACTTATTAGTGCTATGTGTA+AGG 0.488616 1:-67361723 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGCGATGCCTTGGCCAATCT+CGG 0.493443 1:-67360642 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGTTCACATTCTCCCTGAAA+CGG 0.493879 1:+67360373 None:intergenic
GCCCGAATTCTTGTTAGCAA+AGG 0.496246 1:-67361671 MsG0180003728.01.T01:CDS
CGAAGCGCTTAAGTTTGTGC+AGG 0.502186 1:-67362002 MsG0180003728.01.T01:CDS
AAACCAAATGATGGAAACTC+TGG 0.509774 1:+67360798 None:intergenic
TCAGCATCTTTACCAGAATG+AGG 0.515363 1:+67360506 None:intergenic
ATCGGTGGACTATGTAGAGC+TGG 0.516248 1:-67361089 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATTGAAGAAGGTGATTTGAA+TGG 0.517936 1:-67362127 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTGACAGTTTATGTTATGAA+AGG 0.518101 1:-67361508 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGAAGGAAGAGAACTAAAGA+AGG 0.532934 1:-67360969 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATGGTTTGTGTAAAAGCAGA+AGG 0.534205 1:-67361400 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACAGTTTATGTTATGAAAGG+AGG 0.535178 1:-67361505 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTATTAAACGTACAAACATC+CGG 0.538011 1:+67361641 None:intergenic
TTCGAGGAGATGAAGATCAA+AGG 0.542020 1:-67361566 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAGTTATAAGTATACACATC+AGG 0.547122 1:+67361851 None:intergenic
TGGAGGCGAGTGGCTGTGCT+AGG 0.548835 1:-67361451 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGCAAGTAAGCTTCTTCGAT+CGG 0.550807 1:-67361054 MsG0180003728.01.T01:CDS
CTTCGATCGGTCCAGATGAA+AGG 0.554132 1:-67361041 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTGTATGTTATAGCATCTGG+TGG 0.554816 1:+67360909 None:intergenic
TGATTCAAGCATTATTCAGA+AGG 0.556014 1:-67360986 MsG0180003728.01.T01:CDS
TCATTCGAAGATGATTAATG+AGG 0.557990 1:-67362302 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGCGCTTAAGTTTGTGCAGG+AGG 0.562200 1:-67361999 MsG0180003728.01.T01:CDS
CTCCACCATTACACAGGCCA+CGG 0.565380 1:+67360877 None:intergenic
TCGAGGAGATGAAGATCAAA+GGG 0.567210 1:-67361565 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAAAGCGCAAATGTCGGAAA+GGG 0.573793 1:-67360706 MsG0180003728.01.T01:CDS
GGAGGAGATATTTGATCAGA+TGG 0.576073 1:-67361366 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATGGATCAGATGATAATGGA+AGG 0.576884 1:-67361251 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGAACTCATCAATATGGTGA+TGG 0.583122 1:-67360730 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACATCTCCATCGCAATATCT+CGG 0.584938 1:+67361588 None:intergenic
GCTTTGTTCTTTATCAATGG+AGG 0.589522 1:-67360763 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACGTTTAATACTTTGATACA+GGG 0.590318 1:-67361629 MsG0180003728.01.T01:CDS
AACCGGATATCGTTACCTAT+GGG 0.595225 1:-67361118 MsG0180003728.01.T01:CDS
GTTTGTGCAGGAGGTTTCTG+AGG 0.595328 1:-67361990 MsG0180003728.01.T01:CDS
CATTCGAAGATGATTAATGA+GGG 0.595762 1:-67362301 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGCAAACTATGGCTTCAAAT+GGG 0.597187 1:-67361145 MsG0180003728.01.T01:CDS
GATACCACCGAGATTGGCCA+AGG 0.597466 1:+67360635 None:intergenic
TGAATAATGCTTGAATCACA+GGG 0.601725 1:+67360991 None:intergenic
ACTTTCACCACGTTGATGCA+GGG 0.602322 1:-67362154 MsG0180003728.01.T01:CDS
CGTGGCCTGTGTAATGGTGG+AGG 0.602715 1:-67360876 MsG0180003728.01.T01:CDS
TATTGCGATGGAGATGTTCG+AGG 0.604507 1:-67361582 MsG0180003728.01.T01:CDS
CAGAAGGATTGAAGATGCGG+AGG 0.607963 1:-67361384 MsG0180003728.01.T01:CDS
CTTGAGGAAATGGCAAATCA+CGG 0.612056 1:-67362196 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGAAAGCGCAAATGTCGGAA+AGG 0.614908 1:-67360707 MsG0180003728.01.T01:CDS
AAGCAGAAGGATTGAAGATG+CGG 0.618148 1:-67361387 MsG0180003728.01.T01:CDS
TGATCAGATGGAACTTCTCG+GGG 0.621230 1:-67361354 MsG0180003728.01.T01:CDS
GATGGAGAAAGCGCAAATGT+CGG 0.624834 1:-67360712 MsG0180003728.01.T01:CDS
AAGAATTCGGGCAAGATCAG+TGG 0.633064 1:+67361682 None:intergenic
TCCACCGATAAGAGTCCCAT+AGG 0.633346 1:+67361103 None:intergenic
TTCCGTGGCCTGTGTAATGG+TGG 0.633458 1:-67360879 MsG0180003728.01.T01:CDS
AGGGAAACATCTATGATCAG+AGG 0.638152 1:-67360687 MsG0180003728.01.T01:CDS
CAAGAACCGAGATATTGCGA+TGG 0.640310 1:-67361594 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACCTATGGGACTCTTATCGG+TGG 0.640630 1:-67361104 MsG0180003728.01.T01:CDS
AAAGATGCTGAAGAATATGG+TGG 0.640973 1:-67360494 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAGTTCAAAATCTGGACTCG+AGG 0.644095 1:-67360472 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAGGCTAAATTGCAGAATTG+CGG 0.644185 1:-67360453 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTGGTCCTCCACCATTACAC+AGG 0.648337 1:+67360871 None:intergenic
TGGATCAGATGATAATGGAA+GGG 0.648500 1:-67361250 MsG0180003728.01.T01:CDS
ATCACAGGGTTATAAGCATG+AGG 0.649345 1:+67361005 None:intergenic
CCCTGAAACGGGAAACATCG+AGG 0.656407 1:+67360385 None:intergenic
GCTGAACAATGACAGCCAGA+AGG 0.657763 1:+67360407 None:intergenic
GATGTTGTTGAAAGAAATGG+AGG 0.667932 1:-67361468 MsG0180003728.01.T01:CDS
GATGCCTTGGCCAATCTCGG+TGG 0.668487 1:-67360639 MsG0180003728.01.T01:intron
TGGTGGAGGACCAATACAAG+AGG 0.668727 1:-67360862 MsG0180003728.01.T01:CDS
ACGTATAACACACTTATCGA+CGG 0.678939 1:-67361314 MsG0180003728.01.T01:CDS
GAGTGGCTGTGCTAGGAATG+CGG 0.685301 1:-67361444 MsG0180003728.01.T01:CDS
TTGAAAGAAATGGAGGCGAG+TGG 0.718946 1:-67361461 MsG0180003728.01.T01:CDS
AATAAAACCCTGCATCAACG+TGG 0.719211 1:+67362147 None:intergenic
TGGCTGTGCTAGGAATGCGG+TGG 0.722017 1:-67361441 MsG0180003728.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTATTATAAGTTACAGTATT+TGG + Chr1:67360940-67360959 None:intergenic 20.0%
!! TTTGAAGATGAAAAAACAAA+TGG - Chr1:67360582-67360601 MsG0180003728.01.T01:intron 20.0%
!!! AACCTTTAATGTTTTGATTA+AGG - Chr1:67360423-67360442 MsG0180003728.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATGAGTCAATAATATCTTTT+GGG + Chr1:67362089-67362108 None:intergenic 20.0%
! AAGATGAAAAAACAAATGGT+GGG - Chr1:67360586-67360605 MsG0180003728.01.T01:intron 25.0%
! ACGTTTAATACTTTGATACA+GGG - Chr1:67361054-67361073 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
! AGCCTTAATCAAAACATTAA+AGG + Chr1:67360428-67360447 None:intergenic 25.0%
! ATTGATGTTGTTGAAAGAAA+TGG - Chr1:67361212-67361231 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
! TAAGTTAGGTGAATTTGAAA+AGG - Chr1:67360873-67360892 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
! TACGTTTAATACTTTGATAC+AGG - Chr1:67361053-67361072 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
! TTGACAGTTTATGTTATGAA+AGG - Chr1:67361175-67361194 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTGTATGTTATAGCATC+TGG + Chr1:67361780-67361799 None:intergenic 25.0%
!! CATGAGTCAATAATATCTTT+TGG + Chr1:67362090-67362109 None:intergenic 25.0%
!! TGAGTCAATAATATCTTTTG+GGG + Chr1:67362088-67362107 None:intergenic 25.0%
!! TGGATTTTATGATTGAGAAA+GGG - Chr1:67360803-67360822 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACTTTTAATTCTTTGGTGAA+TGG - Chr1:67360739-67360758 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTTTAATTCTTTGGTGAAT+GGG - Chr1:67360740-67360759 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCAGGTTACTTTTAATTCTT+TGG - Chr1:67360732-67360751 MsG0180003728.01.T01:CDS 25.0%
ACAGTTTATGTTATGAAAGG+AGG - Chr1:67361178-67361197 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATAACTCGTTGATATC+TGG - Chr1:67360844-67360863 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATGGATCAGATGATAA+TGG - Chr1:67361428-67361447 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATTAGTGCTATGTGTA+AGG - Chr1:67360960-67360979 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
AGATGAAAAAACAAATGGTG+GGG - Chr1:67360587-67360606 MsG0180003728.01.T01:intron 30.0%
ATTGAAGAAGGTGATTTGAA+TGG - Chr1:67360556-67360575 MsG0180003728.01.T01:intron 30.0%
CATTCGAAGATGATTAATGA+GGG - Chr1:67360382-67360401 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
GAAGATGAAAAAACAAATGG+TGG - Chr1:67360585-67360604 MsG0180003728.01.T01:intron 30.0%
GAATTAAAAGTAACCTGATC+AGG + Chr1:67360730-67360749 None:intergenic 30.0%
GAATTATACGTGAATTTGTC+AGG + Chr1:67361465-67361484 None:intergenic 30.0%
GAGTTATAAGTATACACATC+AGG + Chr1:67360835-67360854 None:intergenic 30.0%
GTATTAAACGTACAAACATC+CGG + Chr1:67361045-67361064 None:intergenic 30.0%
TCATTCGAAGATGATTAATG+AGG - Chr1:67360381-67360400 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
TCTCATTGAACTCATCAATA+TGG - Chr1:67361947-67361966 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
TGAATAATGCTTGAATCACA+GGG + Chr1:67361695-67361714 None:intergenic 30.0%
TGATTCAAGCATTATTCAGA+AGG - Chr1:67361697-67361716 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
TGTGTAAAGCACATCAATTA+AGG - Chr1:67360449-67360468 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACAAAATTGTTTTCCG+TGG - Chr1:67361789-67361808 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
! ATATCTGGAATGTGTAAGTT+AGG - Chr1:67360859-67360878 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTCCAATTACACCCTTTT+AGG + Chr1:67362155-67362174 None:intergenic 30.0%
! GTGGATTTTATGATTGAGAA+AGG - Chr1:67360802-67360821 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
! TAATGATGCTTTGGATATTG+TGG - Chr1:67360783-67360802 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
! TGATTTTACAGTTGAGATGT+TGG - Chr1:67361848-67361867 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTTTGATGCTTGAGGAAA+TGG - Chr1:67360477-67360496 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAATGGGTTTTGTAGAATT+GGG - Chr1:67360755-67360774 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
!!! AACTGTTTCTGTGAATGTTT+TGG - Chr1:67360627-67360646 MsG0180003728.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTTCCATCATTTGGTTTTT+TGG - Chr1:67361890-67361909 MsG0180003728.01.T01:CDS 30.0%
AAAGATGCTGAAGAATATGG+TGG - Chr1:67362189-67362208 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
AAATCAACAGCCTCTTGTAT+TGG + Chr1:67361834-67361853 None:intergenic 35.0%
AATTGGAAATCACCTCATTC+TGG - Chr1:67362165-67362184 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
ACCCTTTGCTAACAAGAATT+CGG + Chr1:67361017-67361036 None:intergenic 35.0%
ACGTATAACACACTTATCGA+CGG - Chr1:67361369-67361388 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGGAAGAGAACTAAAGA+AGG - Chr1:67361714-67361733 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
AGCTGATATTGTGCAAACTA+TGG - Chr1:67361527-67361546 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
CTGAATAATGCTTGAATCAC+AGG + Chr1:67361696-67361715 None:intergenic 35.0%
GATGTTGTTGAAAGAAATGG+AGG - Chr1:67361215-67361234 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAAGATGCTGAAGAATA+TGG - Chr1:67362186-67362205 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
GTGTACAACACTTTGATAGA+TGG - Chr1:67361264-67361283 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGACTATACCTTTCATC+TGG + Chr1:67361656-67361675 None:intergenic 35.0%
TGAACTCATCAATATGGTGA+TGG - Chr1:67361953-67361972 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
TGCAAACTATGGCTTCAAAT+GGG - Chr1:67361538-67361557 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
TGGGAATGTTAATGATGCTT+TGG - Chr1:67360774-67360793 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
TTGTATGTTATAGCATCTGG+TGG + Chr1:67361777-67361796 None:intergenic 35.0%
TTTGATCAGATGGAACTTCT+CGG - Chr1:67361327-67361346 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
! AAAAAACAAATGGTGGGGTA+TGG - Chr1:67360592-67360611 MsG0180003728.01.T01:intron 35.0%
! AAACCAAATGATGGAAACTC+TGG + Chr1:67361888-67361907 None:intergenic 35.0%
! ATATGGTGGAGTTCAAAATC+TGG - Chr1:67362203-67362222 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGTTTGTGTAAAAGCAGA+AGG - Chr1:67361283-67361302 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
! GAGACTTTTCAGAGAAATGA+TGG - Chr1:67361740-67361759 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
! GCTTTGTTCTTTATCAATGG+AGG - Chr1:67361920-67361939 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
! GTGAATGGTTTTTGCAAAGA+AGG - Chr1:67360649-67360668 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGGCTTTGTTCTTTATCAA+TGG - Chr1:67361917-67361936 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGGATCAGATGATAATGGA+AGG - Chr1:67361432-67361451 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGAATGGGTTTTGTAGAAT+TGG - Chr1:67360754-67360773 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGATCAGATGATAATGGAA+GGG - Chr1:67361433-67361452 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATGCAGGGTTTTATTGAAGA+AGG - Chr1:67360544-67360563 MsG0180003728.01.T01:intron 35.0%
!!! TCCATCATTTGGTTTTTTGG+CGG - Chr1:67361893-67361912 MsG0180003728.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCTGTGAATGTTTTGGTGAA+TGG - Chr1:67360634-67360653 MsG0180003728.01.T01:intron 35.0%
AACCGGATATCGTTACCTAT+GGG - Chr1:67361565-67361584 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
AAGCAGAAGGATTGAAGATG+CGG - Chr1:67361296-67361315 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
AATAAAACCCTGCATCAACG+TGG + Chr1:67360539-67360558 None:intergenic 40.0%
ACAGTTGAGATGTTGGAGAA+AGG - Chr1:67361855-67361874 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
ACATCTCCATCGCAATATCT+CGG + Chr1:67361098-67361117 None:intergenic 40.0%
ACTGCACTATGATGCCTAAA+AGG - Chr1:67362138-67362157 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
AGGGAAACATCTATGATCAG+AGG - Chr1:67361996-67362015 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
ATACTGTATGTGAACTCGTC+AGG + Chr1:67361150-67361169 None:intergenic 40.0%
ATCACAGGGTTATAAGCATG+AGG + Chr1:67361681-67361700 None:intergenic 40.0%
CCCGAATTCTTGTTAGCAAA+GGG - Chr1:67361013-67361032 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTTGCTAACAAGAATTC+GGG + Chr1:67361016-67361035 None:intergenic 40.0%
CGAAGAAGCTTCTCAACTTA+TGG - Chr1:67361413-67361432 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
CGCTAAATTTACGGATCTTG+AGG + Chr1:67362025-67362044 None:intergenic 40.0%
CTGCACTATGATGCCTAAAA+GGG - Chr1:67362139-67362158 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
CTTACATACTTCTGCAGAGT+TGG - Chr1:67361489-67361508 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAGGAAATGGCAAATCA+CGG - Chr1:67360487-67360506 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
GAGGCTAAATTGCAGAATTG+CGG - Chr1:67362230-67362249 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
GGAGGAGATATTTGATCAGA+TGG - Chr1:67361317-67361336 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
GTGCAAACTATGGCTTCAAA+TGG - Chr1:67361537-67361556 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
GTTACCTATGGGACTCTTAT+CGG - Chr1:67361576-67361595 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
TCAGCATCTTTACCAGAATG+AGG + Chr1:67362180-67362199 None:intergenic 40.0%
TCCGCCAAAAAACCAAATGA+TGG + Chr1:67361897-67361916 None:intergenic 40.0%
TCCTCAAGCATCAAAATTGC+AGG + Chr1:67360475-67360494 None:intergenic 40.0%
TCGAGGAGATGAAGATCAAA+GGG - Chr1:67361118-67361137 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
TGCAAGTAAGCTTCTTCGAT+CGG - Chr1:67361629-67361648 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
TTCGAGGAGATGAAGATCAA+AGG - Chr1:67361117-67361136 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
TTGATCAGATGGAACTTCTC+GGG - Chr1:67361328-67361347 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
TTGCCAGAGTTTCCATCATT+TGG - Chr1:67361882-67361901 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
! GATGCCTAAAAGGGTGTAAT+TGG - Chr1:67362148-67362167 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGTGAAAGTTTTCTCATC+AGG + Chr1:67360520-67360539 None:intergenic 40.0%
!! CCAAGGCATCGCTAAATTTA+CGG + Chr1:67362034-67362053 None:intergenic 40.0%
!!! CATTTGGTTTTTTGGCGGAA+GGG - Chr1:67361898-67361917 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCATTTGGTTTTTTGGCGGA+AGG - Chr1:67361897-67361916 MsG0180003728.01.T01:CDS 40.0%
AACTTTCACCACGTTGATGC+AGG - Chr1:67360528-67360547 MsG0180003728.01.T01:intron 45.0%
AAGAATTCGGGCAAGATCAG+TGG + Chr1:67361004-67361023 None:intergenic 45.0%
ACTTTCACCACGTTGATGCA+GGG - Chr1:67360529-67360548 MsG0180003728.01.T01:intron 45.0%
ATCCAAGATACCACCGAGAT+TGG + Chr1:67362057-67362076 None:intergenic 45.0%
ATCTCGGTGGTATCTTGGAT+AGG - Chr1:67362057-67362076 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAACCGAGATATTGCGA+TGG - Chr1:67361089-67361108 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
CCGTAAATTTAGCGATGCCT+TGG - Chr1:67362031-67362050 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
GAACCGGATATCGTTACCTA+TGG - Chr1:67361564-67361583 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTCAAAATCTGGACTCG+AGG - Chr1:67362211-67362230 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
GCCCGAATTCTTGTTAGCAA+AGG - Chr1:67361012-67361031 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
GTCCCATAGGTAACGATATC+CGG + Chr1:67361570-67361589 None:intergenic 45.0%
TATTGCGATGGAGATGTTCG+AGG - Chr1:67361101-67361120 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
TGATCAGATGGAACTTCTCG+GGG - Chr1:67361329-67361348 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
TGTTAGCAAAGGGTTGTTGC+CGG - Chr1:67361023-67361042 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
TTGAAAGAAATGGAGGCGAG+TGG - Chr1:67361222-67361241 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
! AGAAAGCGCAAATGTCGGAA+AGG - Chr1:67361976-67361995 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
! GAAAGCGCAAATGTCGGAAA+GGG - Chr1:67361977-67361996 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
! GATGGAGAAAGCGCAAATGT+CGG - Chr1:67361971-67361990 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
!! GCCTGCAATTTTGATGCTTG+AGG - Chr1:67360471-67360490 MsG0180003728.01.T01:CDS 45.0%
ACCTATGGGACTCTTATCGG+TGG - Chr1:67361579-67361598 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
AGCGCTTAAGTTTGTGCAGG+AGG - Chr1:67360684-67360703 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
CAGAAGGATTGAAGATGCGG+AGG - Chr1:67361299-67361318 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
CCTCGATGTTTCCCGTTTCA+GGG - Chr1:67362298-67362317 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
CTTCGATCGGTCCAGATGAA+AGG - Chr1:67361642-67361661 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
GCTGAACAATGACAGCCAGA+AGG + Chr1:67362279-67362298 None:intergenic 50.0%
GGCTTCAAATGGGTGTGAAC+CGG - Chr1:67361548-67361567 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
GTTTGTGCAGGAGGTTTCTG+AGG - Chr1:67360693-67360712 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
TCCACCGATAAGAGTCCCAT+AGG + Chr1:67361583-67361602 None:intergenic 50.0%
TGGTGGAGGACCAATACAAG+AGG - Chr1:67361821-67361840 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
TTGGTCCTCCACCATTACAC+AGG + Chr1:67361815-67361834 None:intergenic 50.0%
TTTAAGCACGAGCGACCTTC+TGG - Chr1:67362261-67362280 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
! CGAAGCGCTTAAGTTTGTGC+AGG - Chr1:67360681-67360700 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGGGTTTTCTCCTGATC+AGG - Chr1:67360714-67360733 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
! GTTTTCCGTGGCCTGTGTAA+TGG - Chr1:67361801-67361820 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
! TGCAGGAGGTTTCTGAGGAA+GGG - Chr1:67360698-67360717 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
!! ATCGGTGGACTATGTAGAGC+TGG - Chr1:67361594-67361613 MsG0180003728.01.T01:CDS 50.0%
AGCGATGCCTTGGCCAATCT+CGG - Chr1:67362041-67362060 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
CCCTGAAACGGGAAACATCG+AGG + Chr1:67362301-67362320 None:intergenic 55.0%
CTCCACCATTACACAGGCCA+CGG + Chr1:67361809-67361828 None:intergenic 55.0%
GAGTGGCTGTGCTAGGAATG+CGG - Chr1:67361239-67361258 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
GCCTCGATGTTTCCCGTTTC+AGG - Chr1:67362297-67362316 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
GGCCAATCTCGGTGGTATCT+TGG - Chr1:67362052-67362071 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
TTCCGTGGCCTGTGTAATGG+TGG - Chr1:67361804-67361823 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
! GATACCACCGAGATTGGCCA+AGG + Chr1:67362051-67362070 None:intergenic 55.0%
! GTGCAGGAGGTTTCTGAGGA+AGG - Chr1:67360697-67360716 MsG0180003728.01.T01:CDS 55.0%
CGTGGCCTGTGTAATGGTGG+AGG - Chr1:67361807-67361826 MsG0180003728.01.T01:CDS 60.0%
GATGCCTTGGCCAATCTCGG+TGG - Chr1:67362044-67362063 MsG0180003728.01.T01:CDS 60.0%
TGGCTGTGCTAGGAATGCGG+TGG - Chr1:67361242-67361261 MsG0180003728.01.T01:CDS 60.0%
TGGAGGCGAGTGGCTGTGCT+AGG - Chr1:67361232-67361251 MsG0180003728.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 67360376 67362329 67360376 ID=MsG0180003728.01;Name=MsG0180003728.01
Chr1 mRNA 67360376 67362329 67360376 ID=MsG0180003728.01.T01;Parent=MsG0180003728.01;Name=MsG0180003728.01.T01;_AED=0.22;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|619
Chr1 exon 67360640 67362329 67360640 ID=MsG0180003728.01.T01:exon:24077;Parent=MsG0180003728.01.T01
Chr1 exon 67360376 67360545 67360376 ID=MsG0180003728.01.T01:exon:24076;Parent=MsG0180003728.01.T01
Chr1 CDS 67360640 67362329 67360640 ID=MsG0180003728.01.T01:cds;Parent=MsG0180003728.01.T01
Chr1 CDS 67360376 67360545 67360376 ID=MsG0180003728.01.T01:cds;Parent=MsG0180003728.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003728.01.T01

ATGCTTCATTCGAAGATGATTAATGAGGGTATTGTTCTTGATGTTTCAACCTTTAATGTTTTGATTAAGGCTTTGTGTAAAGCACATCAATTAAGGCCTGCAATTTTGATGCTTGAGGAAATGGCAAATCACGGATTGAAGCCTGATGAGAAAACTTTCACCACGTTGATGCAGGGTTTTATTGAAGAAGGTGATTTGAATGGTGCTTTGAAGATGAAAAAACAAATGGTGGGGTATGGTTGTTTGCTTACAACTGTTTCTGTGAATGTTTTGGTGAATGGTTTTTGCAAAGAAGGTCGTGTTGACGAAGCGCTTAAGTTTGTGCAGGAGGTTTCTGAGGAAGGGTTTTCTCCTGATCAGGTTACTTTTAATTCTTTGGTGAATGGGTTTTGTAGAATTGGGAATGTTAATGATGCTTTGGATATTGTGGATTTTATGATTGAGAAAGGGTTTGATCCTGATGTGTATACTTATAACTCGTTGATATCTGGAATGTGTAAGTTAGGTGAATTTGAAAAGGCAATAGAAATTTTGCAACAAATGATTTTGAGAGAATGTTCTCCAAATACTGTAACTTATAATACACTTATTAGTGCTATGTGTAAGGAGAATGAAATTGAAGCTGCCACTGATCTTGCCCGAATTCTTGTTAGCAAAGGGTTGTTGCCGGATGTTTGTACGTTTAATACTTTGATACAGGGTCTATGCTTGAGCAAGAACCGAGATATTGCGATGGAGATGTTCGAGGAGATGAAGATCAAAGGGTGTAAACCTGACGAGTTCACATACAGTATATTGATTGACAGTTTATGTTATGAAAGGAGGCTTAAAGAAGCATTGATGTTGTTGAAAGAAATGGAGGCGAGTGGCTGTGCTAGGAATGCGGTGGTGTACAACACTTTGATAGATGGTTTGTGTAAAAGCAGAAGGATTGAAGATGCGGAGGAGATATTTGATCAGATGGAACTTCTCGGGGTGTCGAGAAGTTCTGTAACGTATAACACACTTATCGACGGTCTTTGTAAAAACAAGAGAGTCGAAGAAGCTTCTCAACTTATGGATCAGATGATAATGGAAGGGTTAAAGCCTGACAAATTCACGTATAATTCATTGCTTACATACTTCTGCAGAGTTGGAGATATAGAGAAAGCAGCTGATATTGTGCAAACTATGGCTTCAAATGGGTGTGAACCGGATATCGTTACCTATGGGACTCTTATCGGTGGACTATGTAGAGCTGGTAGAGTAGATGTTGCAAGTAAGCTTCTTCGATCGGTCCAGATGAAAGGTATAGTCTTGACTCCTCATGCTTATAACCCTGTGATTCAAGCATTATTCAGAAGGAAGAGAACTAAAGAAGGAATGAGACTTTTCAGAGAAATGATGGAAAAAAGTGATCCACCAGATGCTATAACATACAAAATTGTTTTCCGTGGCCTGTGTAATGGTGGAGGACCAATACAAGAGGCTGTTGATTTTACAGTTGAGATGTTGGAGAAAGGAATATTGCCAGAGTTTCCATCATTTGGTTTTTTGGCGGAAGGGCTTTGTTCTTTATCAATGGAGGACACTCTCATTGAACTCATCAATATGGTGATGGAGAAAGCGCAAATGTCGGAAAGGGAAACATCTATGATCAGAGGTTTCCTCAAGATCCGTAAATTTAGCGATGCCTTGGCCAATCTCGGTGGGTGTAATTGGAAATCACCTCATTCTGGTAAAGATGCTGAAGAATATGGTGGAGTTCAAAATCTGGACTCGAGGCTAAATTGCAGAATTGCGGTCAATACATTTAAGCACGAGCGACCTTCTGGCTGTCATTGTTCAGCCTCGATGTTTCCCGTTTCAGGGAGAATGTGA
Protein sequence

>MsG0180003728.01.T01

MLHSKMINEGIVLDVSTFNVLIKALCKAHQLRPAILMLEEMANHGLKPDEKTFTTLMQGFIEEGDLNGALKMKKQMVGYGCLLTTVSVNVLVNGFCKEGRVDEALKFVQEVSEEGFSPDQVTFNSLVNGFCRIGNVNDALDIVDFMIEKGFDPDVYTYNSLISGMCKLGEFEKAIEILQQMILRECSPNTVTYNTLISAMCKENEIEAATDLARILVSKGLLPDVCTFNTLIQGLCLSKNRDIAMEMFEEMKIKGCKPDEFTYSILIDSLCYERRLKEALMLLKEMEASGCARNAVVYNTLIDGLCKSRRIEDAEEIFDQMELLGVSRSSVTYNTLIDGLCKNKRVEEASQLMDQMIMEGLKPDKFTYNSLLTYFCRVGDIEKAADIVQTMASNGCEPDIVTYGTLIGGLCRAGRVDVASKLLRSVQMKGIVLTPHAYNPVIQALFRRKRTKEGMRLFREMMEKSDPPDAITYKIVFRGLCNGGGPIQEAVDFTVEMLEKGILPEFPSFGFLAEGLCSLSMEDTLIELINMVMEKAQMSERETSMIRGFLKIRKFSDALANLGGCNWKSPHSGKDAEEYGGVQNLDSRLNCRIAVNTFKHERPSGCHCSASMFPVSGRM*