AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380011880.01

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MsG0380011880.01.T05 AT3G14460 39.480 423 238 7 12 421 484 901 1.02e-76 261
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MsG0380011880.01.T02 AT1G27180 30.242 248 142 7 56 296 796 1019 4.84e-11 63.9
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MsG0380011880.01.T03 AT3G14460 34.665 851 504 22 2 819 70 901 2.09e-126 413
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MsG0380011880.01.T03 AT1G58848 25.468 801 475 37 90 830 158 896 4.62e-31 132
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MsG0380011880.01.T03 AT1G12210 24.663 742 466 29 93 798 113 797 3.27e-30 128
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MsG0380011880.01.T03 AT5G48620 25.679 736 461 32 121 816 187 876 2.11e-25 113
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MsG0380011880.01.T03 AT1G61190 23.480 477 311 15 115 559 170 624 3.95e-25 112
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MsG0380011880.01.T03 AT1G12290 24.554 448 294 16 115 534 130 561 9.69e-24 108
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MsG0380011880.01.T03 AT1G61300 23.729 472 312 17 116 559 58 509 2.06e-23 107
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MsG0380011880.01.T03 AT5G43730 26.052 499 297 20 116 574 169 635 2.83e-22 103
MsG0380011880.01.T03 AT4G26090 25.314 478 292 19 120 562 176 623 2.41e-21 100
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MsG0380011880.01.T03 AT1G63350 24.170 542 351 21 62 572 118 630 1.12e-20 98.6
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MsG0380011880.01.T03 AT5G05400 23.731 729 436 30 119 797 175 833 7.72e-19 92.4
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MsG0380011880.01.T03 AT5G38340 24.911 562 333 30 78 596 11 526 1.03e-14 79.0
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MsG0380011880.01.T03 AT1G65850 25.632 554 306 27 108 596 111 623 5.06e-14 77.0
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MsG0380011880.01.T01 AT5G43470 25.514 729 456 29 184 873 187 867 1.00e-27 121
MsG0380011880.01.T01 AT5G43470 25.514 729 456 29 184 873 187 867 1.00e-27 121
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MsG0380011880.01.T01 AT1G12220 24.222 739 433 29 178 861 52 718 1.31e-25 114
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MsG0380011880.01.T01 AT1G10920 25.360 556 334 23 156 661 38 562 2.52e-25 113
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MsG0380011880.01.T01 AT5G48620 25.815 736 460 32 184 879 187 876 2.61e-25 113
MsG0380011880.01.T01 AT5G48620 25.815 736 460 32 184 879 187 876 2.61e-25 113
MsG0380011880.01.T01 AT5G48620 25.815 736 460 32 184 879 187 876 2.61e-25 113
MsG0380011880.01.T01 AT5G48620 25.815 736 460 32 184 879 187 876 2.61e-25 113
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MsG0380011880.01.T01 AT1G61190 23.272 593 375 22 72 622 70 624 3.46e-25 113
MsG0380011880.01.T01 AT1G61310 24.013 608 360 27 72 622 71 633 8.30e-25 112
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MsG0380011880.01.T01 AT5G43740 24.788 589 351 23 165 716 155 688 8.50e-25 111
MsG0380011880.01.T01 AT1G53350 23.883 783 453 32 156 873 161 865 3.99e-24 109
MsG0380011880.01.T01 AT1G12290 24.554 448 294 16 178 597 130 561 7.19e-24 108
MsG0380011880.01.T01 AT1G12290 24.554 448 294 16 178 597 130 561 7.19e-24 108
MsG0380011880.01.T01 AT1G12290 24.554 448 294 16 178 597 130 561 7.19e-24 108
MsG0380011880.01.T01 AT1G12290 24.554 448 294 16 178 597 172 603 9.93e-24 108
MsG0380011880.01.T01 AT1G58602 23.720 801 490 35 153 893 157 896 1.83e-23 107
MsG0380011880.01.T01 AT1G58602 23.720 801 490 35 153 893 157 896 1.83e-23 107
MsG0380011880.01.T01 AT1G61300 23.729 472 312 17 179 622 58 509 2.18e-23 107
MsG0380011880.01.T01 AT1G59620 24.930 718 428 32 153 832 22 666 5.42e-23 105
MsG0380011880.01.T01 AT5G63020 25.200 500 315 20 179 646 171 643 2.21e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G47250 26.009 446 275 18 184 599 178 598 2.30e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G43730 26.052 499 297 20 179 637 169 635 3.81e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G43730 26.052 499 297 20 179 637 169 635 3.81e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G43730 26.052 499 297 20 179 637 169 635 3.81e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G43730 26.052 499 297 20 179 637 169 635 3.81e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT5G43730 26.052 499 297 20 179 637 169 635 3.81e-22 103
MsG0380011880.01.T01 AT4G26090 25.105 478 293 19 183 625 176 623 2.22e-21 100
MsG0380011880.01.T01 AT1G59780 24.231 553 339 20 156 661 153 672 3.82e-21 100
MsG0380011880.01.T01 AT1G59780 24.231 553 339 20 156 661 158 677 4.40e-21 99.8
MsG0380011880.01.T01 AT1G51480 25.709 494 306 17 179 637 170 637 6.34e-21 99.4
MsG0380011880.01.T01 AT1G12280 23.961 722 429 29 173 861 133 767 7.32e-21 99.0
MsG0380011880.01.T01 AT1G63350 24.170 542 351 21 125 635 118 630 9.51e-21 98.6
MsG0380011880.01.T01 AT1G63350 24.170 542 351 21 125 635 118 630 1.03e-20 98.6
MsG0380011880.01.T01 AT1G63350 24.170 542 351 21 125 635 118 630 1.03e-20 98.6
MsG0380011880.01.T01 AT1G63350 24.170 542 351 21 125 635 118 630 1.10e-20 98.6
MsG0380011880.01.T01 AT1G61190 23.276 464 303 17 178 622 170 599 1.93e-20 97.8
MsG0380011880.01.T01 AT1G69550 24.751 602 348 22 139 658 239 817 2.35e-20 97.8
MsG0380011880.01.T01 AT1G69550 32.229 332 179 17 561 869 910 1218 2.55e-14 78.2
MsG0380011880.01.T01 AT5G47260 26.371 474 312 17 179 635 166 619 5.43e-20 96.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G15890 24.421 475 323 14 185 637 17 477 6.94e-20 95.5
MsG0380011880.01.T01 AT1G61300 24.788 472 282 22 179 622 58 484 7.41e-20 95.5
MsG0380011880.01.T01 AT1G15890 24.421 475 323 14 185 637 177 637 1.95e-19 94.4
MsG0380011880.01.T01 AT5G05400 23.731 729 436 31 182 860 6 664 6.92e-19 92.4
MsG0380011880.01.T01 AT5G05400 23.731 729 436 31 182 860 6 664 6.92e-19 92.4
MsG0380011880.01.T01 AT5G05400 23.489 728 439 29 182 860 175 833 1.56e-18 91.7
MsG0380011880.01.T01 AT1G63360 24.824 568 371 18 125 658 83 628 2.32e-18 90.9
MsG0380011880.01.T01 AT1G63360 24.824 568 371 18 125 658 118 663 2.65e-18 90.9
MsG0380011880.01.T01 AT1G58410 23.471 605 357 25 153 674 157 738 5.43e-17 86.7
MsG0380011880.01.T01 AT1G58410 23.471 605 357 25 153 674 157 738 5.43e-17 86.7
MsG0380011880.01.T01 AT1G58410 23.471 605 357 25 153 674 157 738 5.43e-17 86.7
MsG0380011880.01.T01 AT3G04220 22.688 692 385 30 68 658 126 768 6.56e-17 86.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G63880 22.967 627 367 26 96 659 109 682 2.08e-16 84.7
MsG0380011880.01.T01 AT1G62630 24.170 542 346 16 345 861 335 836 2.87e-16 84.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G63880 22.967 627 367 26 96 659 109 682 3.17e-16 84.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G58410 24.682 551 314 24 153 661 157 648 7.72e-16 82.8
MsG0380011880.01.T01 AT1G10920 25.542 415 247 18 286 661 1 392 1.45e-15 81.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G10920 25.542 415 247 18 286 661 1 392 1.45e-15 81.3
MsG0380011880.01.T01 AT5G38340 24.911 562 333 30 141 659 11 526 9.21e-15 79.3
MsG0380011880.01.T01 AT5G38340 24.911 562 333 30 141 659 217 732 1.21e-14 79.3
MsG0380011880.01.T01 AT5G38340 24.911 562 333 30 141 659 217 732 1.21e-14 79.3
MsG0380011880.01.T01 AT1G65850 25.271 554 308 26 171 659 236 748 6.22e-14 77.0
MsG0380011880.01.T01 AT1G65850 25.271 554 308 26 171 659 111 623 7.07e-14 76.6
MsG0380011880.01.T01 AT1G65850 25.271 554 308 26 171 659 221 733 7.52e-14 76.6
MsG0380011880.01.T01 AT3G04220 22.482 685 378 31 68 659 126 750 1.12e-13 75.9
MsG0380011880.01.T01 AT3G44670 23.860 658 402 26 178 793 285 885 1.30e-13 75.9
MsG0380011880.01.T01 AT3G44670 23.860 658 402 26 178 793 285 885 1.30e-13 75.9
MsG0380011880.01.T01 AT5G38350 24.269 581 320 27 154 662 21 553 1.36e-13 75.5
MsG0380011880.01.T01 AT5G44870 24.118 709 402 30 167 784 261 924 7.16e-13 73.6
MsG0380011880.01.T01 AT4G11170 24.209 537 328 23 158 655 184 680 9.58e-13 73.2
MsG0380011880.01.T01 AT5G44870 24.000 700 396 29 176 784 6 660 1.12e-12 72.8
MsG0380011880.01.T01 AT2G16870 24.371 517 332 20 168 658 192 675 1.49e-11 68.9
MsG0380011880.01.T01 AT5G41750 23.423 555 339 23 154 656 182 702 7.67e-11 66.6
MsG0380011880.01.T01 AT5G41750 23.423 555 339 23 154 656 182 702 7.67e-11 66.6
MsG0380011880.01.T01 AT5G17680 25.336 521 320 21 148 638 175 656 8.19e-11 66.6
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MsG0380011880.01.T06 AT3G14470 38.863 422 241 6 1 407 492 911 6.94e-78 261
MsG0380011880.01.T06 AT3G14470 38.863 422 241 6 1 407 492 911 6.94e-78 261
MsG0380011880.01.T06 AT3G14460 39.524 420 236 7 1 407 487 901 3.76e-76 258
MsG0380011880.01.T06 AT1G69550 47.525 101 51 2 86 184 982 1082 3.50e-14 75.5
MsG0380011880.01.T06 AT1G69550 33.198 247 139 10 86 326 910 1136 4.00e-14 75.5
MsG0380011880.01.T06 AT1G69550 32.411 253 141 10 86 318 934 1176 1.56e-12 70.5
MsG0380011880.01.T06 AT1G58400 27.974 311 193 11 86 392 573 856 5.51e-11 65.1
MsG0380011880.01.T06 AT1G58400 27.974 311 193 11 86 392 583 866 6.03e-11 65.1
MsG0380011880.01.T06 AT1G58400 27.974 311 193 11 86 392 583 866 6.03e-11 65.1
MsG0380011880.01.T07 AT3G14470 40.653 337 186 5 1 325 577 911 7.38e-68 230
MsG0380011880.01.T07 AT3G14470 40.653 337 186 5 1 325 577 911 7.38e-68 230
MsG0380011880.01.T07 AT3G14460 42.169 332 177 6 4 325 575 901 1.07e-64 222
MsG0380011880.01.T07 AT1G69550 47.525 101 51 2 4 102 982 1082 2.18e-14 75.1
MsG0380011880.01.T07 AT1G69550 47.525 101 51 2 4 102 910 1010 2.54e-14 74.7
MsG0380011880.01.T07 AT1G69550 45.000 100 53 2 4 101 934 1033 1.38e-12 69.7
MsG0380011880.01.T07 AT1G69550 43.617 94 51 2 10 101 868 961 9.72e-11 63.9
MsG0380011880.01.T07 AT1G58400 27.974 311 193 11 4 310 573 856 2.57e-11 65.5
MsG0380011880.01.T07 AT1G58400 27.974 311 193 11 4 310 583 866 2.93e-11 65.5
MsG0380011880.01.T07 AT1G58400 27.974 311 193 11 4 310 583 866 2.93e-11 65.5
MsG0380011880.01.T07 AT5G66900 38.095 105 64 1 4 107 675 779 7.54e-11 63.9
MsG0380011880.01.T07 AT5G66900 38.614 101 61 1 4 103 723 823 8.87e-11 63.9

Find 167 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 194 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTACCAACATGATGTATTTA+AGG 0.122394 3:-7314311 MsG0380011880.01.T01:CDS
TCCAATACCAGCAAATATTT+TGG 0.129971 3:+7315845 None:intergenic
TCTTCTTTCAAACGCTTTAA+TGG 0.145452 3:-7316295 MsG0380011880.01.T01:CDS
GATGATGGATCTTGTATTTA+TGG 0.206649 3:-7316145 MsG0380011880.01.T01:CDS
CGAATTGTGGTGATTGTTTA+TGG 0.206913 3:-7314284 MsG0380011880.01.T01:CDS
TAACAAATTTCCAATAGATT+TGG 0.230771 3:+7314875 None:intergenic
GTGGAATCAACTTTCCAAAT+TGG 0.239384 3:-7314350 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAACCTGAGAAGGAGTAATT+AGG 0.245809 3:+7316320 None:intergenic
GCCAGAGGACATGGGAAAAT+TGG 0.248868 3:-7314736 MsG0380011880.01.T01:CDS
CCCAAAATATTTGCTGGTAT+TGG 0.249912 3:-7315846 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTCTAATGGTAATGCTAAAA+AGG 0.271377 3:+7315010 None:intergenic
AACGAATCACCTAACCAATT+TGG 0.276087 3:+7314336 None:intergenic
TGATGATGATTTGAATGTTT+TGG 0.277843 3:-7315930 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATGTTTCCTAATCTCAGTTT+TGG 0.281987 3:+7314030 None:intergenic
GATAAATTTGGTCAATTGAA+TGG 0.291335 3:-7315050 MsG0380011880.01.T01:CDS
AACAAATTTCCAATAGATTT+GGG 0.295514 3:+7314876 None:intergenic
AGCACATAATTCCAGTAATC+TGG 0.297627 3:+7315482 None:intergenic
TGTTGTTGTCAGGCTGTAAA+AGG 0.300150 3:-7314770 MsG0380011880.01.T01:CDS
CGAACATAACTTACATGATA+TGG 0.301882 3:-7315114 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAGTCCTACAAGTTCTATTA+TGG 0.307399 3:-7316167 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATCACTAATGTTGGTGAAAC+AGG 0.308463 3:-7315776 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACTTTGATGCCAAACACTTT+TGG 0.314376 3:+7316186 None:intergenic
ATCTCCACACTGCATAAATA+TGG 0.315269 3:-7315138 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTTGCCAATTTCTTCTAGAT+TGG 0.317080 3:+7315580 None:intergenic
AGTGTATGCATTTCAAAGTT+TGG 0.324467 3:+7315188 None:intergenic
TATGACTCGTATGATAAATT+TGG 0.326428 3:-7315062 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACTGAGGTTCCCAAATCTAT+TGG 0.329074 3:-7314885 MsG0380011880.01.T01:CDS
GCTTCCACCCCTTGGACAAT+TGG 0.333039 3:-7314262 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTGCAGTTCTTGTTGTTGTC+AGG 0.333272 3:-7314780 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACAAATTGTCCCCAGATTAC+TGG 0.338709 3:-7315493 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATGCAATCCGTACAGATAAT+TGG 0.339388 3:-7314210 MsG0380011880.01.T01:CDS
GATTGCTGGTCTTTACTTGC+CGG 0.344871 3:-7315638 MsG0380011880.01.T01:CDS
TGATAGCTCAGTTGTATAAA+AGG 0.345280 3:+7315419 None:intergenic
TCTAGTTTGGCTATTTGTAT+TGG 0.352078 3:+7314666 None:intergenic
TTACTTGCCGGGCATGCATT+TGG 0.354249 3:-7315626 MsG0380011880.01.T01:CDS
CAATCCAATCTAGAAGAAAT+TGG 0.354275 3:-7315584 MsG0380011880.01.T01:CDS
GATTCCACCATAGCCTTTGA+TGG 0.356574 3:+7314365 None:intergenic
TAAACTTGATATTTCACTCT+TGG 0.362454 3:-7316590 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATTTCAACCATTTCCCTCCT+TGG 0.364474 3:-7314154 MsG0380011880.01.T01:CDS
AATTTACCCAAAATATTTGC+TGG 0.364826 3:-7315852 MsG0380011880.01.T01:CDS
GACGGTGATGATGGTAAAAT+AGG 0.369648 3:-7316076 MsG0380011880.01.T01:CDS
AGCTTAAGACAACGCTTCTC+AGG 0.371196 3:-7316564 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTACAATGATCCCGAGGTTA+AGG 0.371784 3:-7315996 MsG0380011880.01.T01:CDS
TGGGAAGAGTGGAACTTGAT+TGG 0.381523 3:-7314102 MsG0380011880.01.T01:CDS
CGAGGCAATCGTTCTTCTAA+TGG 0.382567 3:+7314996 None:intergenic
CTCTGAAAAGTGAAGATTGC+TGG 0.390839 3:-7315652 MsG0380011880.01.T01:CDS
CGAGCACAAGATCAATTTAG+TGG 0.393168 3:-7316217 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATAATTGGTACTGAGTTCTA+TGG 0.402934 3:-7314195 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACGCGCAATTGTTTCATTGT+TGG 0.409382 3:+7314936 None:intergenic
AACCTGAGAAGGAGTAATTA+GGG 0.409692 3:+7316321 None:intergenic
TATATTCAAGTTATCAAGAA+TGG 0.411259 3:+7315904 None:intergenic
TTGGCTTGAACTGCTTCAAA+AGG 0.413237 3:+7314516 None:intergenic
ATTTCCATTGTGGGTATTGA+AGG 0.414493 3:-7316049 MsG0380011880.01.T01:CDS
GTTCCAGTTCCAAAAGTGTT+TGG 0.414974 3:-7316195 MsG0380011880.01.T01:CDS
CCATTTGCTGCAGTAGCACT+TGG 0.415733 3:-7315530 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTGATGCATCGACGATCTAT+TGG 0.415740 3:-7315221 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTTTGAAGTTGGCTATTTGT+TGG 0.416500 3:-7316395 MsG0380011880.01.T01:intron
AACCCTAATTACTCCTTCTC+AGG 0.417507 3:-7316323 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTTCCACCCCTTGGACAATT+GGG 0.420574 3:-7314261 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTGAAAGAACTCATTATTGA+AGG 0.423247 3:-7314234 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATAGGAATTATTTCCATTGT+GGG 0.425855 3:-7316058 MsG0380011880.01.T01:CDS
CACTGAATTGCCAGAGGACA+TGG 0.426328 3:-7314745 MsG0380011880.01.T01:CDS
GTGATGCAAGATCTATCAAT+TGG 0.429980 3:-7315814 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTTCTTGTCGGCAAACATAC+TGG 0.435835 3:-7314621 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATCAACTTTCCAAATTGGTT+AGG 0.437505 3:-7314345 MsG0380011880.01.T01:CDS
TGTTTATGGCTTCCACCCCT+TGG 0.439106 3:-7314270 MsG0380011880.01.T01:CDS
TCTCAACTCAGGTTCAGTTA+AGG 0.439999 3:+7313990 None:intergenic
CATTAGTGACACTGCATTGA+GGG 0.440507 3:-7314694 MsG0380011880.01.T01:CDS
GAAGTTGCAAATAAATGTTA+TGG 0.440944 3:-7315557 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACTTTGTCTGACTTTCTTGT+CGG 0.443648 3:-7314633 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACAAGTTCTATTATGGATGA+TGG 0.452258 3:-7316160 MsG0380011880.01.T01:CDS
GTTAAGGAAAGAAATTTGTC+AGG 0.456320 3:+7314006 None:intergenic
TCATCCATAATAGAACTTGT+AGG 0.461171 3:+7316163 None:intergenic
AAAAGTGCTGTCTTTGAAGT+TGG 0.461463 3:-7316406 MsG0380011880.01.T01:intron
TCAAATTTCTCCTTAACCTC+GGG 0.463845 3:+7315986 None:intergenic
GTGGAACTTGATTGGAGGTA+TGG 0.464898 3:-7314094 MsG0380011880.01.T01:CDS
CAACTGTCAAAGAGAATTCA+AGG 0.464939 3:+7313900 None:intergenic
CTCAAATTTCTCCTTAACCT+CGG 0.465381 3:+7315985 None:intergenic
CTTCTAGATTGGATTGGCGT+TGG 0.466876 3:+7315591 None:intergenic
CAATTTCTTCTAGATTGGAT+TGG 0.467717 3:+7315585 None:intergenic
AAGTGCCCAAAACTGAGATT+AGG 0.470511 3:-7314036 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAAATTTGGTAGTTCAGTTG+TGG 0.472593 3:-7315325 MsG0380011880.01.T01:CDS
GAGGGAAATGGTTGAAATGA+AGG 0.477599 3:+7314159 None:intergenic
GGCAATGATTGCACCGGTAG+AGG 0.477688 3:+7313961 None:intergenic
CAAACATACTGGTGGATTGA+TGG 0.479184 3:-7314610 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAATATTTGCTGGTATTGGA+TGG 0.480127 3:-7315842 MsG0380011880.01.T01:CDS
GGATTGATGGTTGGAGAGCT+AGG 0.481603 3:-7314597 MsG0380011880.01.T01:CDS
GCACATAATTCCAGTAATCT+GGG 0.482063 3:+7315483 None:intergenic
CCAAGTGCTACTGCAGCAAA+TGG 0.486311 3:+7315530 None:intergenic
ATTGTGGGTATTGAAGGTAT+TGG 0.487867 3:-7316043 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTTCTCACACTAAGATTGAA+AGG 0.496827 3:-7314833 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAACCTCTGTAGCTAAATCA+TGG 0.497189 3:+7315162 None:intergenic
AATAGGAATTATTTCCATTG+TGG 0.497776 3:-7316059 MsG0380011880.01.T01:CDS
AATATTTGCTGGTATTGGAT+GGG 0.498466 3:-7315841 MsG0380011880.01.T01:CDS
AGAGTCTCCAAGGAGGGAAA+TGG 0.501757 3:+7314147 None:intergenic
CATTTGCTGCAGTAGCACTT+GGG 0.509812 3:-7315529 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATTGCTGGTCTTTACTTGCC+GGG 0.516314 3:-7315637 MsG0380011880.01.T01:CDS
CAAGTAGTGGACAGAAAGAA+AGG 0.517388 3:+7315679 None:intergenic
TAAAGCTTGCACGTTTCACT+AGG 0.517527 3:+7314807 None:intergenic
GGAAAATATCCTCTTCTACA+TGG 0.518443 3:-7314576 MsG0380011880.01.T01:CDS
TGGTAAAACAACCCTTGCTA+AGG 0.518545 3:-7316023 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTGAATACATGATTTAATGA+TGG 0.523154 3:+7313940 None:intergenic
ACATTCTCCAAATGCATGCC+CGG 0.527454 3:+7315619 None:intergenic
TGGCTTGAACTGCTTCAAAA+GGG 0.528799 3:+7314517 None:intergenic
ATGTGCTAGAAAGTGACATT+CGG 0.531341 3:-7315466 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATATTTGCTGGTATTGGATG+GGG 0.533505 3:-7315840 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTGAAAAGTCTCACCATCAA+AGG 0.535559 3:-7314378 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTGTCTAGTGACGGTGATGA+TGG 0.538926 3:-7316085 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTCAAAATGTAGAGTCTCCA+AGG 0.539753 3:+7314137 None:intergenic
TCAGATTACCCAATTGTCCA+AGG 0.540794 3:+7314253 None:intergenic
GTTCAGTTGTGGATTGCAGA+AGG 0.548925 3:-7315314 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTCACCATCAAAGGCTATGG+TGG 0.549797 3:-7314369 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTCAGTACCAATTATCTGTA+CGG 0.550220 3:+7314203 None:intergenic
CAGATTACCCAATTGTCCAA+GGG 0.551171 3:+7314254 None:intergenic
CTCACTCTCAGCTTCTGTGA+AGG 0.555984 3:-7316665 None:intergenic
GACAGAAAGAAAGGTTCGCA+TGG 0.559060 3:+7315688 None:intergenic
ACTTTGCAACGCAATGTCTG+AGG 0.561418 3:+7316361 None:intergenic
AGTCTCACCATCAAAGGCTA+TGG 0.561429 3:-7314372 MsG0380011880.01.T01:CDS
AATGATGGCAATGATTGCAC+CGG 0.571529 3:+7313955 None:intergenic
ATCATAGCGATGATTTGCTG+TGG 0.573249 3:-7316528 MsG0380011880.01.T01:CDS
TCGACGATCTATTGGTAATG+AGG 0.574732 3:-7315213 MsG0380011880.01.T01:CDS
AGTAGAATCGTCCATAGACC+AGG 0.581956 3:-7315288 MsG0380011880.01.T01:CDS
GTTGAGAGAATGTCCTCTAC+CGG 0.582194 3:-7313974 MsG0380011880.01.T01:CDS
GCTTAAGACAACGCTTCTCA+GGG 0.582264 3:-7316563 MsG0380011880.01.T01:CDS
GAAGAGTGGAACTTGATTGG+AGG 0.582998 3:-7314099 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTTTGCAACGCAATGTCTGA+GGG 0.583415 3:+7316362 None:intergenic
AAATATCAAGTTTAGTGCTG+TGG 0.584781 3:+7316599 None:intergenic
CTGATGAATATCACTAATGT+TGG 0.585494 3:-7315785 MsG0380011880.01.T01:CDS
CATTGTAAAGAACCTTAGCA+AGG 0.587006 3:+7316011 None:intergenic
ATTTGCTGCAGTAGCACTTG+GGG 0.587405 3:-7315528 MsG0380011880.01.T01:CDS
TCAAGGGGAACATCATCAGT+TGG 0.588572 3:+7313917 None:intergenic
ATATGCAGGAGTGGGAAGAG+TGG 0.589288 3:-7314113 MsG0380011880.01.T01:CDS
GAGAAAGATTTAAGTACCGC+AGG 0.590963 3:+7314850 None:intergenic
TATTTAAGGATCTCGAATTG+TGG 0.591121 3:-7314297 MsG0380011880.01.T01:CDS
AATACCTTCAATACCCACAA+TGG 0.594833 3:+7316045 None:intergenic
GGTTCGCATGGGTAGTGCAA+AGG 0.600183 3:+7315700 None:intergenic
AGAAATTTGAGTTAAAAGTG+TGG 0.602657 3:-7315973 MsG0380011880.01.T01:CDS
CATACTGGTGGATTGATGGT+TGG 0.603721 3:-7314606 MsG0380011880.01.T01:CDS
CGTCCATGATTTAGCTACAG+AGG 0.604599 3:-7315165 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACATTAGTGACACTGCATTG+AGG 0.604918 3:-7314695 MsG0380011880.01.T01:CDS
TCAGACATTGCGTTGCAAAG+TGG 0.605268 3:-7316359 MsG0380011880.01.T01:CDS
GATCCTTAAATACATCATGT+TGG 0.606267 3:+7314308 None:intergenic
ATAAACAGAAATGAAACAAG+TGG 0.609868 3:-7315884 MsG0380011880.01.T01:CDS
CTTGTCGGCAAACATACTGG+TGG 0.612864 3:-7314618 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAATGTAGAGTCTCCAAGGA+GGG 0.614340 3:+7314141 None:intergenic
TCGTTGTTTGCTATCAAACA+AGG 0.617117 3:-7314976 MsG0380011880.01.T01:CDS
ATGTTGGTGAAACAGGAAGT+AGG 0.617663 3:-7315769 MsG0380011880.01.T01:CDS
AGAGGACATTCTCTCAACTC+AGG 0.617774 3:+7313979 None:intergenic
ATTGTAAAGAACCTTAGCAA+GGG 0.624795 3:+7316012 None:intergenic
ACTGAATTGCCAGAGGACAT+GGG 0.624999 3:-7314744 MsG0380011880.01.T01:CDS
AACTGTCAAAGAGAATTCAA+GGG 0.628225 3:+7313901 None:intergenic
TTGGAAATTTGTTATACCTG+CGG 0.632074 3:-7314866 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTACCCAATTGTCCAAGGGG+TGG 0.633469 3:+7314258 None:intergenic
AAAGAAGACGAAACCTGAGA+AGG 0.637145 3:+7316310 None:intergenic
AGATTACCCAATTGTCCAAG+GGG 0.639351 3:+7314255 None:intergenic
ACTTTGATGTACTAGTGTCA+AGG 0.642591 3:-7315247 MsG0380011880.01.T01:CDS
ACAGAAAGAAAGGTTCGCAT+GGG 0.642635 3:+7315689 None:intergenic
TCGTCCATATTTATGCAGTG+TGG 0.653358 3:+7315134 None:intergenic
ACTGTCAAAGAGAATTCAAG+GGG 0.662233 3:+7313902 None:intergenic
CATAACTTATCATACAGTAG+AGG 0.662533 3:-7315089 MsG0380011880.01.T01:CDS
CACATAATTCCAGTAATCTG+GGG 0.664693 3:+7315484 None:intergenic
GGTTCTTTACAATGATCCCG+AGG 0.667232 3:-7316002 MsG0380011880.01.T01:CDS
TAGGATCATCATCACAACAC+AGG 0.679195 3:-7315750 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAAATGTAGAGTCTCCAAGG+AGG 0.712464 3:+7314140 None:intergenic
AAGGCTCACTGAATTGCCAG+AGG 0.717130 3:-7314751 MsG0380011880.01.T01:CDS
AAACTACAAAAGCATCACTG+AGG 0.766230 3:-7314901 MsG0380011880.01.T01:CDS
TTGTTTGATAGCAAACAACG+AGG 0.825612 3:+7314978 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AACAAATTTCCAATAGATTT+GGG + Chr3:7315694-7315713 None:intergenic 20.0%
!! TAACAAATTTCCAATAGATT+TGG + Chr3:7315695-7315714 None:intergenic 20.0%
!!! TACCAAATTTTTTTCTATGA+TGG + Chr3:7315233-7315252 None:intergenic 20.0%
!!! TATATTCAAGTTATCAAGAA+TGG + Chr3:7314666-7314685 None:intergenic 20.0%
! AATAGGAATTATTTCCATTG+TGG - Chr3:7314508-7314527 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! AATTTACCCAAAATATTTGC+TGG - Chr3:7314715-7314734 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAACAGAAATGAAACAAG+TGG - Chr3:7314683-7314702 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGGAATTATTTCCATTGT+GGG - Chr3:7314509-7314528 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! CTGAATACATGATTTAATGA+TGG + Chr3:7316630-7316649 None:intergenic 25.0%
! GAAGTTGCAAATAAATGTTA+TGG - Chr3:7315010-7315029 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! GATAAATTTGGTCAATTGAA+TGG - Chr3:7315517-7315536 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! GTCCATCATAGAAAAAAATT+TGG - Chr3:7315228-7315247 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! TAAACTTGATATTTCACTCT+TGG - Chr3:7313977-7313996 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! TATGACTCGTATGATAAATT+TGG - Chr3:7315505-7315524 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
! TTACCAACATGATGTATTTA+AGG - Chr3:7316256-7316275 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
!! AGAAATTTGAGTTAAAAGTG+TGG - Chr3:7314594-7314613 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCTAATGGTAATGCTAAAA+AGG + Chr3:7315560-7315579 None:intergenic 25.0%
!!! ACGATTATTTTAAGACAACA+CGG - Chr3:7314081-7314100 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGACAAGTTAGTTTTAGAAT+GGG - Chr3:7316095-7316114 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAGCAAAGCAGTTTTTTAA+CGG + Chr3:7315187-7315206 None:intergenic 25.0%
!!! TAGACAAGTTAGTTTTAGAA+TGG - Chr3:7316094-7316113 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATGATGATTTGAATGTTT+TGG - Chr3:7314637-7314656 MsG0380011880.01.T01:CDS 25.0%
AAATATCAAGTTTAGTGCTG+TGG + Chr3:7313971-7313990 None:intergenic 30.0%
AAGTCCTACAAGTTCTATTA+TGG - Chr3:7314400-7314419 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
ACAAGTTCTATTATGGATGA+TGG - Chr3:7314407-7314426 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
AGTGTATGCATTTCAAAGTT+TGG + Chr3:7315382-7315401 None:intergenic 30.0%
ATCAACTTTCCAAATTGGTT+AGG - Chr3:7316222-7316241 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTAAAGAACCTTAGCAA+GGG + Chr3:7314558-7314577 None:intergenic 30.0%
CAATCCAATCTAGAAGAAAT+TGG - Chr3:7314983-7315002 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
CAATTTCTTCTAGATTGGAT+TGG + Chr3:7314985-7315004 None:intergenic 30.0%
CATAACTTATCATACAGTAG+AGG - Chr3:7315478-7315497 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
CGAACATAACTTACATGATA+TGG - Chr3:7315453-7315472 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
CTGAAAGAACTCATTATTGA+AGG - Chr3:7316333-7316352 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
CTGATGAATATCACTAATGT+TGG - Chr3:7314782-7314801 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
GATCCTTAAATACATCATGT+TGG + Chr3:7316262-7316281 None:intergenic 30.0%
GTTAAGGAAAGAAATTTGTC+AGG + Chr3:7316564-7316583 None:intergenic 30.0%
TATTTAAGGATCTCGAATTG+TGG - Chr3:7316270-7316289 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
TCATCCATAATAGAACTTGT+AGG + Chr3:7314407-7314426 None:intergenic 30.0%
TCTTCTTTCAAACGCTTTAA+TGG - Chr3:7314272-7314291 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
TGATAGCTCAGTTGTATAAA+AGG + Chr3:7315151-7315170 None:intergenic 30.0%
TTTCTCACACTAAGATTGAA+AGG - Chr3:7315734-7315753 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCCAATTTCTTCTAGAT+TGG + Chr3:7314990-7315009 None:intergenic 30.0%
! AAAATTTGGTAGTTCAGTTG+TGG - Chr3:7315242-7315261 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
! AAATATTTGCTGGTATTGGA+TGG - Chr3:7314725-7314744 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
! AATATTTGCTGGTATTGGAT+GGG - Chr3:7314726-7314745 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
! AGACTTTTCAAATTCGTTGA+GGG + Chr3:7316180-7316199 None:intergenic 30.0%
! ATAATTGGTACTGAGTTCTA+TGG - Chr3:7316372-7316391 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
! ATGTTTCCTAATCTCAGTTT+TGG + Chr3:7316540-7316559 None:intergenic 30.0%
! CCAATACCAGCAAATATTTT+GGG + Chr3:7314724-7314743 None:intergenic 30.0%
! TCCAATACCAGCAAATATTT+TGG + Chr3:7314725-7314744 None:intergenic 30.0%
! TCGCTCTTTCATTTTCATAT+TGG + Chr3:7316073-7316092 None:intergenic 30.0%
! TCTAGTTTGGCTATTTGTAT+TGG + Chr3:7315904-7315923 None:intergenic 30.0%
! TGTTTCCTAATCTCAGTTTT+GGG + Chr3:7316539-7316558 None:intergenic 30.0%
!! GATGATGGATCTTGTATTTA+TGG - Chr3:7314422-7314441 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
!! TCTACATTTTGAGAATATGC+AGG - Chr3:7316440-7316459 MsG0380011880.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGAAATTTGTTATACCTG+CGG - Chr3:7315701-7315720 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGTTTCGAGATTTTCTAGTT+TGG + Chr3:7315917-7315936 None:intergenic 30.0%
!!! TTAGTTTTAGAATGGGATTG+TGG - Chr3:7316102-7316121 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTATTTTAAGACAACACGGT+TGG - Chr3:7314085-7314104 MsG0380011880.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTCTATGATGGACTTCTT+CGG + Chr3:7315223-7315242 None:intergenic 30.0%
AAACCTCTGTAGCTAAATCA+TGG + Chr3:7315408-7315427 None:intergenic 35.0%
AAACCTGAGAAGGAGTAATT+AGG + Chr3:7314250-7314269 None:intergenic 35.0%
AACCTGAGAAGGAGTAATTA+GGG + Chr3:7314249-7314268 None:intergenic 35.0%
AACGAATCACCTAACCAATT+TGG + Chr3:7316234-7316253 None:intergenic 35.0%
AATACCTTCAATACCCACAA+TGG + Chr3:7314525-7314544 None:intergenic 35.0%
ACTTTGATGTACTAGTGTCA+AGG - Chr3:7315320-7315339 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
ACTTTGTCTGACTTTCTTGT+CGG - Chr3:7315934-7315953 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
AGCACATAATTCCAGTAATC+TGG + Chr3:7315088-7315107 None:intergenic 35.0%
ATCTCCACACTGCATAAATA+TGG - Chr3:7315429-7315448 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
ATGCAATCCGTACAGATAAT+TGG - Chr3:7316357-7316376 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGCTAGAAAGTGACATT+CGG - Chr3:7315101-7315120 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
CACATAATTCCAGTAATCTG+GGG + Chr3:7315086-7315105 None:intergenic 35.0%
CATTGTAAAGAACCTTAGCA+AGG + Chr3:7314559-7314578 None:intergenic 35.0%
CGAATTGTGGTGATTGTTTA+TGG - Chr3:7316283-7316302 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
CTCAAATTTCTCCTTAACCT+CGG + Chr3:7314585-7314604 None:intergenic 35.0%
CTCAGTACCAATTATCTGTA+CGG + Chr3:7316367-7316386 None:intergenic 35.0%
GCACATAATTCCAGTAATCT+GGG + Chr3:7315087-7315106 None:intergenic 35.0%
GGAAAATATCCTCTTCTACA+TGG - Chr3:7315991-7316010 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
GTGATGCAAGATCTATCAAT+TGG - Chr3:7314753-7314772 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
GTGGAATCAACTTTCCAAAT+TGG - Chr3:7316217-7316236 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
TCAAATTTCTCCTTAACCTC+GGG + Chr3:7314584-7314603 None:intergenic 35.0%
TGATACTCACTGTATTGCTT+TGG - Chr3:7314126-7314145 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAAAGTCTCACCATCAA+AGG - Chr3:7316189-7316208 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTTGATGCCAAACACTTT+TGG + Chr3:7314384-7314403 None:intergenic 35.0%
! ATATTTGCTGGTATTGGATG+GGG - Chr3:7314727-7314746 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
! ATCACTAATGTTGGTGAAAC+AGG - Chr3:7314791-7314810 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
! CCCAAAATATTTGCTGGTAT+TGG - Chr3:7314721-7314740 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGTTTTCCATGTAGAAG+AGG + Chr3:7316003-7316022 None:intergenic 35.0%
! GACATTTTGTAGTTGTGAGA+TGG + Chr3:7316025-7316044 None:intergenic 35.0%
! GAGACTTTTCAAATTCGTTG+AGG + Chr3:7316181-7316200 None:intergenic 35.0%
! TTGTTTGATAGCAAACAACG+AGG + Chr3:7315592-7315611 None:intergenic 35.0%
!! AAAAGTGCTGTCTTTGAAGT+TGG - Chr3:7314161-7314180 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! AAACTACAAAAGCATCACTG+AGG - Chr3:7315666-7315685 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTCTTCACCAACTTTTTCC+TGG + Chr3:7315300-7315319 None:intergenic 35.0%
!! ATTGTGGGTATTGAAGGTAT+TGG - Chr3:7314524-7314543 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTCCATTGTGGGTATTGA+AGG - Chr3:7314518-7314537 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTTGAGAATATGCAGGAG+TGG - Chr3:7316445-7316464 MsG0380011880.01.T01:intron 35.0%
!! CATCTTTTGTTGTCTAGTGA+CGG - Chr3:7314473-7314492 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTGAAGTTGGCTATTTGT+TGG - Chr3:7314172-7314191 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGGATTTTCATGATGATG+AGG - Chr3:7314103-7314122 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! TCGTTGTTTGCTATCAAACA+AGG - Chr3:7315591-7315610 MsG0380011880.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGAGAATATGCAGGAGT+GGG - Chr3:7316446-7316465 MsG0380011880.01.T01:intron 35.0%
AAAATGTAGAGTCTCCAAGG+AGG + Chr3:7316430-7316449 None:intergenic 40.0%
AAAGAAGACGAAACCTGAGA+AGG + Chr3:7314260-7314279 None:intergenic 40.0%
AAATGTAGAGTCTCCAAGGA+GGG + Chr3:7316429-7316448 None:intergenic 40.0%
AACCCTAATTACTCCTTCTC+AGG - Chr3:7314244-7314263 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
AAGTGCCCAAAACTGAGATT+AGG - Chr3:7316531-7316550 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
AATGATGGCAATGATTGCAC+CGG + Chr3:7316615-7316634 None:intergenic 40.0%
ACAAATTGTCCCCAGATTAC+TGG - Chr3:7315074-7315093 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
ACAGAAAGAAAGGTTCGCAT+GGG + Chr3:7314881-7314900 None:intergenic 40.0%
ACATTAGTGACACTGCATTG+AGG - Chr3:7315872-7315891 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
ACGCGCAATTGTTTCATTGT+TGG + Chr3:7315634-7315653 None:intergenic 40.0%
ACTGAGGTTCCCAAATCTAT+TGG - Chr3:7315682-7315701 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
AGATTACCCAATTGTCCAAG+GGG + Chr3:7316315-7316334 None:intergenic 40.0%
ATTTCAACCATTTCCCTCCT+TGG - Chr3:7316413-7316432 MsG0380011880.01.T01:intron 40.0%
CAGATTACCCAATTGTCCAA+GGG + Chr3:7316316-7316335 None:intergenic 40.0%
CATTAGTGACACTGCATTGA+GGG - Chr3:7315873-7315892 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
CGAGCACAAGATCAATTTAG+TGG - Chr3:7314350-7314369 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
CTCAAAATGTAGAGTCTCCA+AGG + Chr3:7316433-7316452 None:intergenic 40.0%
GAGGGAAATGGTTGAAATGA+AGG + Chr3:7316411-7316430 None:intergenic 40.0%
TAAAGCTTGCACGTTTCACT+AGG + Chr3:7315763-7315782 None:intergenic 40.0%
TAGGATCATCATCACAACAC+AGG - Chr3:7314817-7314836 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATTACCCAATTGTCCA+AGG + Chr3:7316317-7316336 None:intergenic 40.0%
TCCATAGACCAGGAAAAAGT+TGG - Chr3:7315289-7315308 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
TCGTCCATATTTATGCAGTG+TGG + Chr3:7315436-7315455 None:intergenic 40.0%
TCTCAACTCAGGTTCAGTTA+AGG + Chr3:7316580-7316599 None:intergenic 40.0%
TGGCTTGAACTGCTTCAAAA+GGG + Chr3:7316053-7316072 None:intergenic 40.0%
TGGTAAAACAACCCTTGCTA+AGG - Chr3:7314544-7314563 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGTTGTCAGGCTGTAAA+AGG - Chr3:7315797-7315816 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
TTACAATGATCCCGAGGTTA+AGG - Chr3:7314571-7314590 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
TTTCTTGTCGGCAAACATAC+TGG - Chr3:7315946-7315965 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
! ATGTTGGTGAAACAGGAAGT+AGG - Chr3:7314798-7314817 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
! CTCTGAAAAGTGAAGATTGC+TGG - Chr3:7314915-7314934 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
! GAGAAAGATTTAAGTACCGC+AGG + Chr3:7315720-7315739 None:intergenic 40.0%
! TTGATGCATCGACGATCTAT+TGG - Chr3:7315346-7315365 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGCTTGAACTGCTTCAAA+AGG + Chr3:7316054-7316073 None:intergenic 40.0%
!! ACCAACTTTTTCCTGGTCTA+TGG + Chr3:7315293-7315312 None:intergenic 40.0%
!! ATCATAGCGATGATTTGCTG+TGG - Chr3:7314039-7314058 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAACATACTGGTGGATTGA+TGG - Chr3:7315957-7315976 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAGTAGTGGACAGAAAGAA+AGG + Chr3:7314891-7314910 None:intergenic 40.0%
!! CAGCAATCTTCACTTTTCAG+AGG + Chr3:7314917-7314936 None:intergenic 40.0%
!! GACGGTGATGATGGTAAAAT+AGG - Chr3:7314491-7314510 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTCCAGTTCCAAAAGTGTT+TGG - Chr3:7314372-7314391 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
!! TCGACGATCTATTGGTAATG+AGG - Chr3:7315354-7315373 MsG0380011880.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATGCCAAACACTTTTGGAAC+TGG + Chr3:7314378-7314397 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTCAGAGGTGTCAAGTAG+TGG + Chr3:7314904-7314923 None:intergenic 40.0%
ACATTCTCCAAATGCATGCC+CGG + Chr3:7314951-7314970 None:intergenic 45.0%
ACTCACTGTATTGCTTTGGC+TGG - Chr3:7314130-7314149 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
ACTGAATTGCCAGAGGACAT+GGG - Chr3:7315823-7315842 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTGCAACGCAATGTCTG+AGG + Chr3:7314209-7314228 None:intergenic 45.0%
AGAGGACATTCTCTCAACTC+AGG + Chr3:7316591-7316610 None:intergenic 45.0%
AGCTTAAGACAACGCTTCTC+AGG - Chr3:7314003-7314022 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
AGTAGAATCGTCCATAGACC+AGG - Chr3:7315279-7315298 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
AGTCTCACCATCAAAGGCTA+TGG - Chr3:7316195-7316214 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
CGAGGCAATCGTTCTTCTAA+TGG + Chr3:7315574-7315593 None:intergenic 45.0%
CGTCCATGATTTAGCTACAG+AGG - Chr3:7315402-7315421 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGCAACGCAATGTCTGA+GGG + Chr3:7314208-7314227 None:intergenic 45.0%
GAAGAGTGGAACTTGATTGG+AGG - Chr3:7316468-7316487 MsG0380011880.01.T01:intron 45.0%
GACAGAAAGAAAGGTTCGCA+TGG + Chr3:7314882-7314901 None:intergenic 45.0%
GATTCCACCATAGCCTTTGA+TGG + Chr3:7316205-7316224 None:intergenic 45.0%
GCTTAAGACAACGCTTCTCA+GGG - Chr3:7314004-7314023 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCTTTACAATGATCCCG+AGG - Chr3:7314565-7314584 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
GTGGAACTTGATTGGAGGTA+TGG - Chr3:7316473-7316492 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
GTTGAGAGAATGTCCTCTAC+CGG - Chr3:7316593-7316612 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGGGGAACATCATCAGT+TGG + Chr3:7316653-7316672 None:intergenic 45.0%
TCAGACATTGCGTTGCAAAG+TGG - Chr3:7314208-7314227 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
TGGGAAGAGTGGAACTTGAT+TGG - Chr3:7316465-7316484 MsG0380011880.01.T01:intron 45.0%
TTGTCTAGTGACGGTGATGA+TGG - Chr3:7314482-7314501 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
! ACCAATTTTCCCATGTCCTC+TGG + Chr3:7315835-7315854 None:intergenic 45.0%
! ATTTGCTGCAGTAGCACTTG+GGG - Chr3:7315039-7315058 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
! CATTTGCTGCAGTAGCACTT+GGG - Chr3:7315038-7315057 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
! GTTCAGTTGTGGATTGCAGA+AGG - Chr3:7315253-7315272 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGCTGGTCTTTACTTGCC+GGG - Chr3:7314930-7314949 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
!! CATACTGGTGGATTGATGGT+TGG - Chr3:7315961-7315980 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGCAGTTCTTGTTGTTGTC+AGG - Chr3:7315787-7315806 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTCTAGATTGGATTGGCGT+TGG + Chr3:7314979-7314998 None:intergenic 45.0%
!! GATTGCTGGTCTTTACTTGC+CGG - Chr3:7314929-7314948 MsG0380011880.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCTCACTGAATTGCCAG+AGG - Chr3:7315816-7315835 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
AGAGTCTCCAAGGAGGGAAA+TGG + Chr3:7316423-7316442 None:intergenic 50.0%
ATATGCAGGAGTGGGAAGAG+TGG - Chr3:7316454-7316473 MsG0380011880.01.T01:intron 50.0%
CACTGAATTGCCAGAGGACA+TGG - Chr3:7315822-7315841 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
CTCACCATCAAAGGCTATGG+TGG - Chr3:7316198-7316217 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCACCCCTTGGACAATT+GGG - Chr3:7316306-7316325 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
CTTGTCGGCAAACATACTGG+TGG - Chr3:7315949-7315968 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
GCCAGAGGACATGGGAAAAT+TGG - Chr3:7315831-7315850 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
TGTTTATGGCTTCCACCCCT+TGG - Chr3:7316297-7316316 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
TTACCCAATTGTCCAAGGGG+TGG + Chr3:7316312-7316331 None:intergenic 50.0%
TTACTTGCCGGGCATGCATT+TGG - Chr3:7314941-7314960 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
! CCAAGTGCTACTGCAGCAAA+TGG + Chr3:7315040-7315059 None:intergenic 50.0%
! CCATTTGCTGCAGTAGCACT+TGG - Chr3:7315037-7315056 MsG0380011880.01.T01:CDS 50.0%
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! GGCAATGATTGCACCGGTAG+AGG + Chr3:7316609-7316628 None:intergenic 55.0%
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Protein sequence

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