AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012271.01


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MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 36.047 344 201 6 22 354 29 364 1.00e-58 210
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MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 54.444 180 53 1 426 576 489 668 5.59e-51 188
MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 36.047 344 201 6 22 354 29 364 1.28e-58 210
MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 54.444 180 53 1 426 576 491 670 5.05e-51 188
MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 36.047 344 201 6 22 354 39 374 1.35e-58 210
MsG0380012271.01.T01 AT1G11280 54.444 180 53 1 426 576 501 680 5.22e-51 188
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23320 47.479 238 89 3 372 576 114 348 1.57e-54 193
MsG0380012271.01.T01 AT4G23320 47.479 238 89 3 372 576 135 369 1.88e-54 193
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MsG0380012271.01.T01 AT1G67520 45.455 220 89 3 386 576 236 453 2.81e-53 192
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MsG0380012271.01.T01 AT4G03230 23.827 277 169 6 93 362 29 270 3.05e-16 82.8
MsG0380012271.01.T01 AT4G03230 53.234 201 64 2 406 576 497 697 6.92e-53 194
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MsG0380012271.01.T01 AT4G03230 29.178 377 242 7 4 362 1 370 9.24e-49 182
MsG0380012271.01.T01 AT4G04540 45.868 242 88 4 375 576 280 518 2.91e-52 190
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23270 47.926 217 77 3 393 576 278 491 1.15e-49 182
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23130 53.933 178 53 1 428 576 332 509 3.52e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G04570 45.887 231 83 5 384 576 287 513 3.76e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G23180 52.247 178 56 1 428 576 336 513 4.01e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G11480 49.490 196 66 2 414 576 294 489 4.59e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G11530 52.809 178 55 1 428 576 340 517 4.80e-49 181
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23140 49.010 202 69 3 408 576 316 516 5.88e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G23160 49.010 202 69 3 408 576 324 524 7.46e-49 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G11460 46.818 220 75 4 390 576 226 436 8.56e-49 179
MsG0380012271.01.T01 AT3G45860 46.083 217 83 3 393 576 301 516 9.65e-49 180
MsG0380012271.01.T01 AT4G05200 45.815 227 87 2 386 576 286 512 1.04e-48 180
MsG0380012271.01.T01 AT4G21230 44.269 253 100 4 357 576 254 498 1.05e-48 179
MsG0380012271.01.T01 AT4G05200 45.815 227 87 2 386 576 304 530 1.40e-48 180
MsG0380012271.01.T01 AT4G23310 44.828 232 89 3 384 576 402 633 1.63e-48 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G11460 46.818 220 75 4 390 576 301 511 2.08e-48 179
MsG0380012271.01.T01 AT4G23310 44.828 232 89 3 384 576 442 673 2.59e-48 181
MsG0380012271.01.T01 AT4G11490 44.298 228 97 2 378 576 260 486 3.12e-48 178
MsG0380012271.01.T01 AT4G11480 48.039 204 65 2 414 576 291 494 3.44e-48 178
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23290 53.933 178 53 1 428 576 351 528 9.51e-48 177
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MsG0380012271.01.T01 AT1G61360 52.809 178 55 1 428 576 405 582 1.70e-47 177
MsG0380012271.01.T01 AT1G61360 33.808 281 169 6 87 355 2 277 1.92e-37 148
MsG0380012271.01.T01 AT1G61360 52.809 178 55 1 428 576 405 582 1.70e-47 177
MsG0380012271.01.T01 AT1G61360 33.808 281 169 6 87 355 2 277 1.92e-37 148
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MsG0380012271.01.T01 AT4G21400 51.934 181 56 2 427 576 336 516 1.36e-45 171
MsG0380012271.01.T01 AT4G21400 51.934 181 56 2 427 576 348 528 1.74e-45 171
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MsG0380012271.01.T01 AT4G00960 50.556 180 58 2 428 576 44 223 4.91e-43 158
MsG0380012271.01.T01 AT4G23210 48.315 178 61 2 428 576 348 523 2.07e-41 157
MsG0380012271.01.T01 AT4G23210 48.315 178 61 2 428 576 348 523 2.07e-41 157
MsG0380012271.01.T01 AT4G23210 48.315 178 61 2 428 576 348 523 2.40e-41 157
MsG0380012271.01.T01 AT4G23210 48.315 178 61 2 428 576 348 523 6.91e-41 157
MsG0380012271.01.T01 AT4G23210 48.315 178 61 2 428 576 348 523 1.07e-40 157
MsG0380012271.01.T01 AT1G70530 31.785 409 199 13 208 570 108 482 1.10e-40 154
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MsG0380012271.01.T01 AT1G70530 31.785 409 199 13 208 570 108 482 2.46e-40 155
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MsG0380012271.01.T01 AT1G56140 37.555 229 101 4 382 576 636 856 4.82e-39 154
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MsG0380012271.01.T01 AT1G56120 37.500 232 103 4 379 576 650 873 8.13e-39 153
MsG0380012271.01.T01 AT4G23300 44.503 191 73 2 419 576 328 518 1.87e-38 150
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MsG0380012271.01.T01 AT1G70520 43.784 185 75 1 415 570 300 484 1.06e-37 148
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MsG0380012271.01.T01 AT5G40380 35.789 285 126 7 330 576 214 479 2.22e-37 146
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MsG0380012271.01.T01 AT1G53430 41.410 227 97 6 383 576 570 793 8.24e-37 147
MsG0380012271.01.T01 AT1G53430 41.228 228 98 6 382 576 610 834 9.00e-37 147
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MsG0380012271.01.T01 AT4G21400 43.062 209 60 5 427 576 348 556 5.84e-36 142
MsG0380012271.01.T01 AT4G21400 43.062 209 60 5 427 576 348 556 5.84e-36 142
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MsG0380012271.01.T01 AT3G16030 30.877 285 164 8 4 267 8 280 3.10e-26 114
MsG0380012271.01.T01 AT3G16030 64.151 106 37 1 427 531 535 640 6.58e-36 143
MsG0380012271.01.T01 AT3G16030 30.877 285 164 8 4 267 8 280 3.10e-26 114
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MsG0380012271.01.T01 AT1G29730 42.938 177 72 2 428 576 661 836 4.37e-34 138
MsG0380012271.01.T01 AT1G29730 42.784 194 79 4 414 576 612 804 4.47e-34 138
MsG0380012271.01.T01 AT1G11050 34.432 273 139 6 343 576 194 465 5.29e-34 137
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MsG0380012271.01.T01 AT1G29750 35.983 239 116 5 372 576 611 846 3.24e-32 133
MsG0380012271.01.T01 AT1G29750 35.983 239 116 5 372 576 596 831 4.09e-32 132
MsG0380012271.01.T01 AT2G20300 42.529 174 74 2 428 576 337 509 4.21e-32 132
MsG0380012271.01.T01 AT5G37450 36.052 233 110 4 383 576 543 775 4.37e-32 132
MsG0380012271.01.T01 AT5G37450 36.052 233 110 4 383 576 591 823 4.60e-32 132
MsG0380012271.01.T01 AT5G38560 40.556 180 74 3 428 576 327 504 5.17e-32 131
MsG0380012271.01.T01 AT1G16130 35.686 255 114 8 368 576 330 580 5.24e-32 132
MsG0380012271.01.T01 AT5G37450 36.052 233 110 4 383 576 567 799 5.49e-32 132
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MsG0380012271.01.T01 AT1G21250 26.641 518 262 19 133 576 100 573 1.17e-31 130
MsG0380012271.01.T01 AT2G18470 39.665 179 79 2 426 576 270 447 1.38e-31 130
MsG0380012271.01.T01 AT2G18470 39.665 179 79 2 426 576 270 447 1.38e-31 130
MsG0380012271.01.T01 AT2G18470 39.665 179 79 2 426 576 270 447 1.38e-31 130
MsG0380012271.01.T01 AT1G49270 40.556 180 77 3 426 576 322 500 2.24e-31 129
MsG0380012271.01.T01 AT1G68690 40.110 182 81 2 422 576 359 539 2.37e-31 129
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MsG0380012271.01.T01 AT1G68690 40.110 182 81 2 422 576 359 539 2.37e-31 129
MsG0380012271.01.T01 AT1G68690 40.110 182 81 2 422 576 359 539 2.38e-31 129
MsG0380012271.01.T01 AT4G34440 39.891 183 81 2 422 576 294 475 2.57e-31 129
MsG0380012271.01.T01 AT4G34440 39.891 183 81 2 422 576 294 475 2.57e-31 129
MsG0380012271.01.T01 AT3G26940 41.667 180 75 3 427 576 61 240 2.65e-31 127
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MsG0380012271.01.T01 AT5G10530 35.547 256 115 9 363 576 251 498 4.10e-31 129
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MsG0380012271.01.T01 AT4G23160 52.846 123 53 2 408 526 904 1025 8.52e-31 128
MsG0380012271.01.T01 AT1G26150 40.437 183 80 2 422 576 412 593 8.92e-31 128
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MsG0380012271.01.T01 AT2G23450 30.970 268 151 4 331 570 245 506 1.23e-30 127
MsG0380012271.01.T01 AT1G10620 38.764 178 78 3 428 576 358 533 1.23e-30 127
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MsG0380012271.01.T01 AT1G25390 33.755 237 117 5 369 570 219 450 4.68e-30 125
MsG0380012271.01.T01 AT4G02410 38.991 218 98 6 393 576 303 519 4.96e-30 125
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MsG0380012271.01.T01 AT5G59260 34.247 219 106 4 387 576 310 519 5.34e-30 125
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MsG0380012271.01.T01 AT4G02420 39.216 204 89 6 407 576 312 514 5.90e-30 125
MsG0380012271.01.T01 AT1G01540 35.754 179 84 2 428 576 142 319 7.42e-30 123
MsG0380012271.01.T01 AT3G59730 33.071 254 125 6 360 576 258 503 9.42e-30 123
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MsG0380012271.01.T01 AT1G07650 38.542 192 85 3 417 576 628 818 1.60e-29 124
MsG0380012271.01.T01 AT4G32710 38.674 181 79 3 427 576 376 555 1.63e-29 124
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MsG0380012271.01.T01 AT5G02070 35.266 207 96 2 391 559 307 513 1.98e-29 123
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MsG0380012271.01.T01 AT1G09440 37.430 179 81 2 428 576 145 322 2.27e-29 121
MsG0380012271.01.T01 AT2G37050 37.118 229 103 5 386 576 543 768 2.89e-29 124
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MsG0380012271.01.T01 AT5G59670 34.906 212 103 3 398 576 520 729 6.68e-29 122
MsG0380012271.01.T01 AT3G24790 39.674 184 78 4 425 576 32 214 6.94e-29 118
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MsG0380012271.01.T01 AT3G24790 39.674 184 78 4 425 576 50 232 9.12e-29 118
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MsG0380012271.01.T01 AT5G15730 39.521 167 70 2 428 565 104 268 2.01e-28 118
MsG0380012271.01.T01 AT5G60300 31.295 278 138 6 343 576 239 507 2.27e-28 120
MsG0380012271.01.T01 AT5G60300 31.295 278 138 6 343 576 239 507 2.27e-28 120
MsG0380012271.01.T01 AT2G42960 36.667 180 81 3 428 576 171 348 2.54e-28 116
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MsG0380012271.01.T01 AT5G59270 38.202 178 80 3 428 576 340 516 3.44e-28 120
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MsG0380012271.01.T01 AT1G79620 39.375 160 69 1 428 559 652 811 7.76e-28 119
MsG0380012271.01.T01 AT1G79620 39.375 160 69 1 428 559 626 785 7.95e-28 119
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MsG0380012271.01.T01 AT1G56720 35.196 179 85 2 428 576 167 344 1.03e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT1G56720 35.196 179 85 2 428 576 167 344 1.03e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT1G56720 35.196 179 85 2 428 576 167 344 1.03e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT2G37710 39.888 178 77 3 428 576 335 511 1.11e-27 118
MsG0380012271.01.T01 AT3G59110 36.667 180 81 3 428 576 178 355 1.20e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT1G21240 27.338 417 212 14 217 576 197 579 1.29e-27 118
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MsG0380012271.01.T01 AT4G39400 37.288 177 81 2 430 576 873 1049 1.47e-27 119
MsG0380012271.01.T01 AT3G45410 36.364 187 83 4 401 559 311 489 1.66e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT2G42960 36.667 180 81 3 428 576 171 348 1.66e-27 116
MsG0380012271.01.T01 AT2G42960 36.667 180 81 3 428 576 171 348 1.66e-27 116
MsG0380012271.01.T01 AT2G42960 36.667 180 81 3 428 576 171 348 1.66e-27 116
MsG0380012271.01.T01 AT2G42960 36.667 180 81 3 428 576 171 348 1.66e-27 116
MsG0380012271.01.T01 AT3G13380 37.079 178 81 2 430 576 848 1025 1.80e-27 118
MsG0380012271.01.T01 AT5G01950 38.750 160 70 1 428 559 529 688 1.81e-27 118
MsG0380012271.01.T01 AT5G38210 40.462 173 71 5 427 570 347 516 1.85e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT5G48740 30.576 278 142 5 339 576 506 772 1.88e-27 118
MsG0380012271.01.T01 AT5G07280 32.031 256 112 4 376 570 823 1077 1.89e-27 118
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MsG0380012271.01.T01 AT5G01950 38.750 160 70 1 428 559 614 773 2.37e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT5G01950 38.750 160 70 1 428 559 614 773 2.37e-27 117
MsG0380012271.01.T01 AT5G01950 38.750 160 70 1 428 559 614 773 2.37e-27 117
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MsG0380012271.01.T01 AT5G24080 34.821 224 110 4 386 576 348 568 5.90e-27 116
MsG0380012271.01.T01 AT1G21270 29.657 408 200 17 227 576 190 568 6.02e-27 116
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MsG0380012271.01.T01 AT5G54590 36.932 176 81 2 428 575 103 276 1.04e-26 113
MsG0380012271.01.T01 AT1G19390 34.225 187 94 1 410 567 421 607 1.06e-26 115
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MsG0380012271.01.T01 AT1G07570 38.624 189 75 5 428 576 56 243 1.52e-26 112
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MsG0380012271.01.T01 AT3G45430 33.333 228 109 5 384 576 288 507 3.44e-26 114
MsG0380012271.01.T01 AT5G01560 34.025 241 117 7 373 576 295 530 3.65e-26 114
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MsG0380012271.01.T01 AT5G18610 40.217 184 77 4 425 576 68 250 5.36e-26 112
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MsG0380012271.01.T01 AT3G23750 37.778 180 78 4 430 576 568 746 5.73e-26 113
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MsG0380012271.01.T01 AT5G38280 33.040 227 119 5 363 559 255 478 6.88e-26 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G78530 33.624 229 106 4 381 570 10 231 7.05e-26 109
MsG0380012271.01.T01 AT1G69790 36.757 185 80 5 428 576 72 255 7.87e-26 110
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MsG0380012271.01.T01 AT3G45420 33.824 204 98 5 401 576 319 513 9.62e-26 112
MsG0380012271.01.T01 AT3G46370 38.150 173 75 3 428 570 477 647 9.83e-26 112
MsG0380012271.01.T01 AT3G46370 38.150 173 75 3 428 570 477 647 9.83e-26 112
MsG0380012271.01.T01 AT5G35580 40.541 185 74 5 427 576 63 246 1.02e-25 111
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MsG0380012271.01.T01 AT2G43700 36.275 204 89 6 410 576 276 475 1.04e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT2G43700 36.275 204 89 6 410 576 276 475 1.04e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT2G43700 36.275 204 89 6 410 576 276 475 1.04e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT4G31110 36.095 169 78 1 427 565 440 608 1.06e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT4G31110 36.095 169 78 1 427 565 418 586 1.06e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT2G43700 36.275 204 89 6 410 576 300 499 1.06e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT4G31100 36.842 171 78 1 425 565 429 599 1.07e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT5G35580 40.541 185 74 5 427 576 75 258 1.11e-25 111
MsG0380012271.01.T01 AT1G07560 33.475 236 117 6 371 576 507 732 1.20e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G16260 35.196 179 86 2 427 576 377 554 1.32e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G16260 35.196 179 86 2 427 576 377 554 1.32e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT5G65240 34.112 214 106 4 380 559 222 434 1.33e-25 111
MsG0380012271.01.T01 AT1G55200 36.957 184 86 3 422 576 361 543 1.35e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G55200 36.957 184 86 3 422 576 361 543 1.35e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G55200 36.957 184 86 3 422 576 361 543 1.35e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G55200 36.957 184 86 3 422 576 361 543 1.35e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT5G65240 34.112 214 106 4 380 559 222 434 1.38e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT5G01950 38.182 165 69 2 428 559 614 778 1.43e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT1G16260 35.196 179 86 2 427 576 368 545 1.49e-25 112
MsG0380012271.01.T01 AT4G13190 37.696 191 88 3 417 576 48 238 1.55e-25 109
MsG0380012271.01.T01 AT1G17910 34.706 170 82 1 427 567 441 610 1.82e-25 111
MsG0380012271.01.T01 AT2G25220 36.810 163 74 1 428 561 134 296 2.05e-25 108
MsG0380012271.01.T01 AT1G21210 28.358 335 185 9 293 576 244 574 2.41e-25 111
MsG0380012271.01.T01 AT2G28990 39.665 179 75 5 428 576 567 742 2.45e-25 111
MsG0380012271.01.T01 AT2G28990 39.665 179 75 5 428 576 567 742 2.45e-25 111

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCAGTTATTGTGCAGTTAT+TGG 0.172290 3:+13883580 MsG0380012271.01.T01:CDS
TGGCTTAGCCAGATCATTTA+TGG 0.193454 3:+13885711 MsG0380012271.01.T01:CDS
CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG 0.206238 3:+13885347 MsG0380012271.01.T01:CDS
TGCCAAAATTTCAAACAAAA+TGG 0.224209 3:+13884164 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATCCCAAAGATAGCAGATTT+TGG 0.231250 3:+13885691 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAGCCAAAATCTGCTATCTT+TGG 0.271620 3:-13885694 None:intergenic
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG 0.273760 3:-13884136 None:intergenic
CGCCGCAATTCTTGATGAAT+TGG 0.274298 3:-13883552 None:intergenic
TTGTCGTTCCCTTTGCAATT+TGG 0.283803 3:-13883817 None:intergenic
TTGCAATTTAGAGAGAAAAT+TGG 0.288290 3:+13884804 MsG0380012271.01.T01:CDS
GGAGTTATTGCATTCATAAT+AGG 0.288422 3:+13884765 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATTGTGCAGTTATTGGATTC+AGG 0.288758 3:+13883587 MsG0380012271.01.T01:CDS
GAACTTCACAACGTCTTAAA+TGG 0.308698 3:+13884008 MsG0380012271.01.T01:CDS
GGAAGTCTTGTTATTCTTGA+TGG 0.312213 3:+13883506 MsG0380012271.01.T01:CDS
GGTCGGATCAGACACAAAAT+TGG 0.314529 3:+13884029 MsG0380012271.01.T01:CDS
CTGAAAAGTAACTTGGTTAC+TGG 0.326138 3:+13883701 MsG0380012271.01.T01:CDS
CCGTATTGCATAAACTGATT+TGG 0.339917 3:-13883305 None:intergenic
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG 0.354855 3:+13883726 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAGCGTGCTTGGACTGTTGC+AGG 0.366396 3:+13884744 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGAAGAAAGTATACACCATT+AGG 0.377003 3:-13883232 None:intergenic
GGCTTAGCCAGATCATTTAT+GGG 0.377541 3:+13885712 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGCCAAAATCTGCTATCTTT+GGG 0.388083 3:-13885693 None:intergenic
GGAGTTCCAGATGACACCTT+TGG 0.399105 3:-13883531 None:intergenic
AAGCTAGGAGAAGGTGGTTT+CGG 0.412830 3:+13885119 MsG0380012271.01.T01:CDS
CAAAATGGAAGTCGTCGAAT+TGG 0.415078 3:+13884179 MsG0380012271.01.T01:CDS
CTTTCCAATATGTGAATGCT+TGG 0.420269 3:+13884132 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGACGTTGTGAAGTTCCATA+TGG 0.421194 3:-13884001 None:intergenic
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG 0.428532 3:-13883725 None:intergenic
ATGGCTCCAAAGGTGTCATC+TGG 0.433337 3:+13883525 MsG0380012271.01.T01:CDS
GCCAAGAGATTGCTGTTAAG+AGG 0.437950 3:+13885252 MsG0380012271.01.T01:CDS
TTATAAGATGCCAATCCTAA+TGG 0.438550 3:+13883217 None:intergenic
AGCAGAAATTGAAGCGTGCT+TGG 0.451017 3:+13884733 MsG0380012271.01.T01:CDS
CCTCAAAACCAAATTGCAAA+GGG 0.451166 3:+13883809 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGTGTTCTGTTTAGAGAAAG+TGG 0.451386 3:-13883267 None:intergenic
TACCACGATGATGACGTATC+TGG 0.453751 3:-13884280 None:intergenic
CCTGGTAACACTTTCCTACC+TGG 0.454651 3:+13883671 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATCGAAAACTCGCCGTCAGC+AGG 0.458165 3:-13883764 None:intergenic
ACGTACAGGAGTATTTCTAT+TGG 0.459642 3:-13883450 None:intergenic
GATACCCTTGTTTCTGCAGC+TGG 0.459726 3:+13883329 MsG0380012271.01.T01:CDS
AACGCCAATACTTTGGCATA+TGG 0.460932 3:+13883390 MsG0380012271.01.T01:CDS
ACAAAATTGAATTGTCTCAA+TGG 0.465743 3:+13884223 MsG0380012271.01.T01:CDS
GGAACGACAACTATATTTAG+AGG 0.468825 3:+13883830 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGAGTTGTGCTAAATCCATA+TGG 0.472204 3:+13883986 MsG0380012271.01.T01:CDS
TAATCATCACACTGGTCTGC+AGG 0.474853 3:-13884070 None:intergenic
GTTATTCTTGATGGCTCCAA+AGG 0.475658 3:+13883515 MsG0380012271.01.T01:CDS
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG 0.475912 3:-13885719 None:intergenic
TTGGATTCAGGAAACCTTGT+CGG 0.477390 3:+13883599 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATTCATGCCCAACGGAAGCT+TGG 0.480261 3:+13885409 MsG0380012271.01.T01:CDS
TGGATTCAGGAAACCTTGTC+GGG 0.481568 3:+13883600 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAGAGGCTTTGTAATACATC+GGG 0.483961 3:+13885269 MsG0380012271.01.T01:CDS
GATCCACAACGCCAATACTT+TGG 0.484461 3:+13883383 MsG0380012271.01.T01:CDS
GCCTCTTAACAGCAATCTCT+TGG 0.487518 3:-13885253 None:intergenic
CCAAATCAGTTTATGCAATA+CGG 0.488383 3:+13883305 MsG0380012271.01.T01:CDS
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG 0.494173 3:+13884136 MsG0380012271.01.T01:CDS
TCCTCAAAACCAAATTGCAA+AGG 0.502679 3:+13883808 MsG0380012271.01.T01:CDS
TGTACCATATGCCAAAGTAT+TGG 0.504775 3:-13883394 None:intergenic
CGAATTGGTCTGGTGGGTGT+CGG 0.508062 3:+13884194 MsG0380012271.01.T01:CDS
GCCAAGTAGCTCCAGTGAAA+AGG 0.510239 3:-13883871 None:intergenic
TAAGTAATCCAAGCTTCCGT+TGG 0.511487 3:-13885417 None:intergenic
TGGAAGTCGTCGAATTGGTC+TGG 0.513926 3:+13884184 MsG0380012271.01.T01:CDS
GTCGGATCAGACACAAAATT+GGG 0.514166 3:+13884030 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAAGTATACACCATTAGGAT+TGG 0.518835 3:-13883227 None:intergenic
GCTAAAACAAATAGAGTGAT+GGG 0.519895 3:+13885748 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAGTAATCCAAGCTTCCGTT+GGG 0.529690 3:-13885416 None:intergenic
GGCTAAAACAAATAGAGTGA+TGG 0.530358 3:+13885747 MsG0380012271.01.T01:CDS
GAAACATTACTAGGGTGTAA+TGG 0.535222 3:+13885223 MsG0380012271.01.T01:intron
GCAGCTGGAATATATGAAGC+TGG 0.538362 3:+13883344 MsG0380012271.01.T01:CDS
TAAAACATTACCTTGTACAC+TGG 0.541577 3:-13885143 None:intergenic
ATTGCTGTTGAGTTACGTAC+AGG 0.545683 3:-13883464 None:intergenic
CCAGGTAGGAAAGTGTTACC+AGG 0.546885 3:-13883671 None:intergenic
AGAGAAGGCAGATGGTGACT+TGG 0.551958 3:+13885037 MsG0380012271.01.T01:CDS
AATGAAGCTGAAAAGTAACT+TGG 0.554502 3:+13883694 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATTTGTTGCATTAGTGATGG+TGG 0.555442 3:-13885078 None:intergenic
TGGTTTCGGACCAGTGTACA+AGG 0.557978 3:+13885133 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATATTCCAGCTGCAGAAACA+AGG 0.559707 3:-13883334 None:intergenic
ATGCCAAAGTATTGGCGTTG+TGG 0.560332 3:-13883386 None:intergenic
GCAACCCACACAATAGTCCT+TGG 0.562603 3:-13883428 None:intergenic
TGTTTGTATCTTTCCCGACA+AGG 0.563617 3:-13883613 None:intergenic
TTCACAACGTCTTAAATGGT+CGG 0.564620 3:+13884012 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATTGGTCTGGTGGGTGTCGG+AGG 0.571775 3:+13884197 MsG0380012271.01.T01:CDS
TCTAAATTGCAATACAAGAA+CGG 0.572670 3:-13884793 None:intergenic
TACTAGGGTGTAATGGCAGA+TGG 0.577261 3:+13885230 MsG0380012271.01.T01:intron
CTTTGTAATACATCGGGACA+AGG 0.577508 3:+13885275 MsG0380012271.01.T01:CDS
TCCTCTGAAGATCCTGCTGA+CGG 0.582517 3:+13883752 MsG0380012271.01.T01:CDS
GTTATTTGTTGCATTAGTGA+TGG 0.587221 3:-13885081 None:intergenic
TTGAATTGTCTCAATGGTGA+TGG 0.587559 3:+13884229 MsG0380012271.01.T01:CDS
CTATATTTAGAGGAGGGTCG+TGG 0.587777 3:+13883840 MsG0380012271.01.T01:CDS
TAAGAGGCTTTGTAATACAT+CGG 0.592004 3:+13885268 MsG0380012271.01.T01:CDS
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG 0.600081 3:+13883423 MsG0380012271.01.T01:CDS
GTGTTCTGTTTAGAGAAAGT+GGG 0.603464 3:-13883266 None:intergenic
ATGCTGAAACTCACTGATCG+AGG 0.606211 3:+13883485 MsG0380012271.01.T01:CDS
CTCCAATTCATCAAGAATTG+CGG 0.613344 3:+13883550 MsG0380012271.01.T01:CDS
ACATTGTCTTACATTCCTCA+AGG 0.614636 3:-13884318 None:intergenic
TTTAGAGGAGGGTCGTGGAA+CGG 0.616941 3:+13883845 MsG0380012271.01.T01:CDS
AGTCGTCGAATTGGTCTGGT+GGG 0.621108 3:+13884188 MsG0380012271.01.T01:CDS
TACATCGGGACAAGGAGTTG+AGG 0.626175 3:+13885283 MsG0380012271.01.T01:CDS
TAACAAAAGCTTGAGCCTTG+AGG 0.628535 3:+13884303 MsG0380012271.01.T01:CDS
AAGTCGTCGAATTGGTCTGG+TGG 0.638725 3:+13884187 MsG0380012271.01.T01:CDS
ACGACAACTATATTTAGAGG+AGG 0.646325 3:+13883833 MsG0380012271.01.T01:CDS
CGACAACTATATTTAGAGGA+GGG 0.647945 3:+13883834 MsG0380012271.01.T01:CDS
GTTAGAGTTGATACCGCACA+AGG 0.648304 3:-13884095 None:intergenic
ATCACCAAGGACTATTGTGT+GGG 0.651931 3:+13883424 MsG0380012271.01.T01:CDS
TATTCCAGCTGCAGAAACAA+GGG 0.655561 3:-13883333 None:intergenic
CAATTCATCAAGAATTGCGG+CGG 0.657574 3:+13883553 MsG0380012271.01.T01:CDS
GCCGTCAGCAGGATCTTCAG+AGG 0.663902 3:-13883753 None:intergenic
ATCTACGAATTCATGCCCAA+CGG 0.676682 3:+13885401 MsG0380012271.01.T01:CDS
ACAAGGCATAATCATCACAC+TGG 0.677116 3:-13884078 None:intergenic
TCGATGAGGATAGATACTCA+CGG 0.677931 3:+13883782 MsG0380012271.01.T01:CDS
TGTGATGATTATGCCTTGTG+CGG 0.717485 3:+13884082 MsG0380012271.01.T01:CDS
TACCAGATACGTCATCATCG+TGG 0.735994 3:+13884278 MsG0380012271.01.T01:CDS
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG 0.738425 3:+13885726 MsG0380012271.01.T01:CDS
GGTACAAGAACATATCACCA+AGG 0.742464 3:+13883411 MsG0380012271.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATATAAAAAAGTTATTTCAT+CGG + Chr3:13885003-13885022 MsG0380012271.01.T01:CDS 10.0%
!! AAATAAGAGGATAATTAACT+TGG - Chr3:13885173-13885192 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTTTCAGAAACATTACT+AGG + Chr3:13885214-13885233 MsG0380012271.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTTTCAGAAACATTACTA+GGG + Chr3:13885215-13885234 MsG0380012271.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTCTAAGAACATGATTA+TGG + Chr3:13884626-13884645 MsG0380012271.01.T01:intron 20.0%
!!! TTATTCTTTTTATGATCTGA+GGG - Chr3:13884714-13884733 None:intergenic 20.0%
!!! TTCCATTTTGTTTGAAATTT+TGG - Chr3:13884169-13884188 None:intergenic 20.0%
! AACAGTGCTTAATAATATGA+AGG - Chr3:13884546-13884565 None:intergenic 25.0%
! ACAAAATTGAATTGTCTCAA+TGG + Chr3:13884223-13884242 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
! ACTGTTGTAAACTTGAAATT+AGG + Chr3:13884560-13884579 MsG0380012271.01.T01:intron 25.0%
! ATAAATTTCAGTCAACAAGA+AGG - Chr3:13884686-13884705 None:intergenic 25.0%
! ATAGAAGCTTACTATAACAA+AGG - Chr3:13884662-13884681 None:intergenic 25.0%
! CAAAAATGAAGTAAAGTTGA+TGG + Chr3:13885310-13885329 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
! TCTAAATTGCAATACAAGAA+CGG - Chr3:13884796-13884815 None:intergenic 25.0%
! TGCCAAAATTTCAAACAAAA+TGG + Chr3:13884164-13884183 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
! TTACATATCTTCATAGAACT+CGG + Chr3:13884455-13884474 MsG0380012271.01.T01:intron 25.0%
! TTCTCTGATAAAAATAAGCT+AGG + Chr3:13885104-13885123 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
! TTGCAATTTAGAGAGAAAAT+TGG + Chr3:13884804-13884823 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAGAAGTTTTACAAGATTA+CGG - Chr3:13885349-13885368 None:intergenic 25.0%
!! CTTATTCTTTTTATGATCTG+AGG - Chr3:13884715-13884734 None:intergenic 25.0%
!!! AAGCTTGGATTACTTATTTT+TGG + Chr3:13885424-13885443 MsG0380012271.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTATCATAACTTTTTCACC+TGG - Chr3:13884834-13884853 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTAGTACTTACCTTACT+CGG - Chr3:13885198-13885217 None:intergenic 25.0%
AAAGTATACACCATTAGGAT+TGG - Chr3:13883230-13883249 None:intergenic 30.0%
AAATTATTGATGGGATTGCT+CGG + Chr3:13885581-13885600 MsG0380012271.01.T01:intron 30.0%
AATGAAGCTGAAAAGTAACT+TGG + Chr3:13883694-13883713 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
ACCTGAAGTAACAATTTAAG+TGG - Chr3:13884982-13885001 None:intergenic 30.0%
ATCAGTTATTGTGCAGTTAT+TGG + Chr3:13883580-13883599 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG - Chr3:13883728-13883747 None:intergenic 30.0%
CACGAAGTAAATTACTAGAT+TGG + Chr3:13885545-13885564 MsG0380012271.01.T01:intron 30.0%
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG + Chr3:13883726-13883745 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
CCAAATCAGTTTATGCAATA+CGG + Chr3:13883305-13883324 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG + Chr3:13885347-13885366 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
CTATATATATCGAACTGACA+AGG - Chr3:13884509-13884528 None:intergenic 30.0%
CTTAGCATGAGAATATGTTA+TGG - Chr3:13885498-13885517 None:intergenic 30.0%
GATAAAAATAAGCTAGGAGA+AGG + Chr3:13885110-13885129 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
GCTAAAACAAATAGAGTGAT+GGG + Chr3:13885748-13885767 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
GGAGTTATTGCATTCATAAT+AGG + Chr3:13884765-13884784 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
TAAAACATTACCTTGTACAC+TGG - Chr3:13885146-13885165 None:intergenic 30.0%
TAACCTGAGAGCAATAAATT+AGG - Chr3:13885468-13885487 None:intergenic 30.0%
TGAAGATATGTAAATACGTC+AGG - Chr3:13884448-13884467 None:intergenic 30.0%
! ACCACTTAAATTGTTACTTC+AGG + Chr3:13884978-13884997 MsG0380012271.01.T01:intron 30.0%
! ACTTTGGTTTAACAACATTG+TGG + Chr3:13884408-13884427 MsG0380012271.01.T01:intron 30.0%
! AGAAGAAAGTATACACCATT+AGG - Chr3:13883235-13883254 None:intergenic 30.0%
! GTTATTTGTTGCATTAGTGA+TGG - Chr3:13885084-13885103 None:intergenic 30.0%
! TAAGAGGCTTTGTAATACAT+CGG + Chr3:13885268-13885287 MsG0380012271.01.T01:CDS 30.0%
AAAAATAAGCTAGGAGAAGG+TGG + Chr3:13885113-13885132 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
AAGCCAAAATCTGCTATCTT+TGG - Chr3:13885697-13885716 None:intergenic 35.0%
AAGCGCTTGGAAATTATTGA+TGG + Chr3:13885571-13885590 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
AATTATTGATGGGATTGCTC+GGG + Chr3:13885582-13885601 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
AATTCAGATATCAGAGATGG+TGG + Chr3:13884373-13884392 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
ACATTGTCTTACATTCCTCA+AGG - Chr3:13884321-13884340 None:intergenic 35.0%
ACCTTACTCGGTAAAATAAG+AGG - Chr3:13885186-13885205 None:intergenic 35.0%
ACGACAACTATATTTAGAGG+AGG + Chr3:13883833-13883852 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTTGTGCTAAATCCATA+TGG + Chr3:13883986-13884005 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
AGCCAAAATCTGCTATCTTT+GGG - Chr3:13885696-13885715 None:intergenic 35.0%
AGCGCTTGGAAATTATTGAT+GGG + Chr3:13885572-13885591 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
AGTGTTCTGTTTAGAGAAAG+TGG - Chr3:13883270-13883289 None:intergenic 35.0%
ATTGTGCAGTTATTGGATTC+AGG + Chr3:13883587-13883606 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
CAACCTAATTTATTGCTCTC+AGG + Chr3:13885462-13885481 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
CATGTTCTTAGAAATAGCAC+AGG - Chr3:13884622-13884641 None:intergenic 35.0%
CCGTATTGCATAAACTGATT+TGG - Chr3:13883308-13883327 None:intergenic 35.0%
CCTCAAAACCAAATTGCAAA+GGG + Chr3:13883809-13883828 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
CGACAACTATATTTAGAGGA+GGG + Chr3:13883834-13883853 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
CTCCAATTCATCAAGAATTG+CGG + Chr3:13883550-13883569 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAAAGTAACTTGGTTAC+TGG + Chr3:13883701-13883720 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
CTGAGAGCAATAAATTAGGT+TGG - Chr3:13885464-13885483 None:intergenic 35.0%
CTTTCCAATATGTGAATGCT+TGG + Chr3:13884132-13884151 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
GAAACATTACTAGGGTGTAA+TGG + Chr3:13885223-13885242 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
GAACTTCACAACGTCTTAAA+TGG + Chr3:13884008-13884027 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
GCAAATTCAGATATCAGAGA+TGG + Chr3:13884370-13884389 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
GGAACGACAACTATATTTAG+AGG + Chr3:13883830-13883849 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
GGCTAAAACAAATAGAGTGA+TGG + Chr3:13885747-13885766 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
GTGTTCTGTTTAGAGAAAGT+GGG - Chr3:13883269-13883288 None:intergenic 35.0%
TCCTCAAAACCAAATTGCAA+AGG + Chr3:13883808-13883827 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
TGTACCATATGCCAAAGTAT+TGG - Chr3:13883397-13883416 None:intergenic 35.0%
TTCACAACGTCTTAAATGGT+CGG + Chr3:13884012-13884031 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
TTGAATTGTCTCAATGGTGA+TGG + Chr3:13884229-13884248 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAGGCTTTGTAATACATC+GGG + Chr3:13885269-13885288 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
! ATCCCAAAGATAGCAGATTT+TGG + Chr3:13885691-13885710 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTGTTGCATTAGTGATGG+TGG - Chr3:13885081-13885100 None:intergenic 35.0%
!! ACGTACAGGAGTATTTCTAT+TGG - Chr3:13883453-13883472 None:intergenic 35.0%
!! GAAGCTGGATTTTTCAACTT+TGG + Chr3:13883359-13883378 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAAGTCTTGTTATTCTTGA+TGG + Chr3:13883506-13883525 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
!! TTACTTTTCAGCTTCATTCC+AGG - Chr3:13883692-13883711 None:intergenic 35.0%
!!! TATTTGTTTTAGCCTCAGCT+TGG - Chr3:13885741-13885760 None:intergenic 35.0%
!!! TCCTCTTATTTTACCGAGTA+AGG + Chr3:13885182-13885201 MsG0380012271.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGGAAAGTTTTGATTATCC+TGG + Chr3:13883653-13883672 MsG0380012271.01.T01:CDS 35.0%
AACGCCAATACTTTGGCATA+TGG + Chr3:13883390-13883409 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
AAGTAATCCAAGCTTCCGTT+GGG - Chr3:13885419-13885438 None:intergenic 40.0%
ACAAGGCATAATCATCACAC+TGG - Chr3:13884081-13884100 None:intergenic 40.0%
AGACGTTGTGAAGTTCCATA+TGG - Chr3:13884004-13884023 None:intergenic 40.0%
AGAGAGAAAATTGGTAAGCC+AGG + Chr3:13884813-13884832 MsG0380012271.01.T01:intron 40.0%
ATATTCCAGCTGCAGAAACA+AGG - Chr3:13883337-13883356 None:intergenic 40.0%
ATCACCAAGGACTATTGTGT+GGG + Chr3:13883424-13883443 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
ATCTACGAATTCATGCCCAA+CGG + Chr3:13885401-13885420 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
ATTATTGATGGGATTGCTCG+GGG + Chr3:13885583-13885602 MsG0380012271.01.T01:intron 40.0%
CAAAATGGAAGTCGTCGAAT+TGG + Chr3:13884179-13884198 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
CAATTCATCAAGAATTGCGG+CGG + Chr3:13883553-13883572 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
CACAAAAAAGAGAAGGCAGA+TGG + Chr3:13885029-13885048 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG + Chr3:13884136-13884155 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG - Chr3:13884139-13884158 None:intergenic 40.0%
CTTTGTAATACATCGGGACA+AGG + Chr3:13885275-13885294 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
GACAAGGCAAAAGATGTAAC+AGG - Chr3:13884493-13884512 None:intergenic 40.0%
GGCTTAGCCAGATCATTTAT+GGG + Chr3:13885712-13885731 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
GGTACAAGAACATATCACCA+AGG + Chr3:13883411-13883430 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
GTCGGATCAGACACAAAATT+GGG + Chr3:13884030-13884049 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TAACAAAAGCTTGAGCCTTG+AGG + Chr3:13884303-13884322 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TAAGTAATCCAAGCTTCCGT+TGG - Chr3:13885420-13885439 None:intergenic 40.0%
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG + Chr3:13883423-13883442 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TATTCCAGCTGCAGAAACAA+GGG - Chr3:13883336-13883355 None:intergenic 40.0%
TCGATGAGGATAGATACTCA+CGG + Chr3:13883782-13883801 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TGGCTTAGCCAGATCATTTA+TGG + Chr3:13885711-13885730 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TGTGATGATTATGCCTTGTG+CGG + Chr3:13884082-13884101 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TGTTTGTATCTTTCCCGACA+AGG - Chr3:13883616-13883635 None:intergenic 40.0%
TTGGATTCAGGAAACCTTGT+CGG + Chr3:13883599-13883618 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG - Chr3:13885722-13885741 None:intergenic 40.0%
TTGTCGTTCCCTTTGCAATT+TGG - Chr3:13883820-13883839 None:intergenic 40.0%
! ACAGCTCTCAGAACTTTTTG+TGG + Chr3:13883633-13883652 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGCTGTTGAGTTACGTAC+AGG - Chr3:13883467-13883486 None:intergenic 40.0%
! CAGCTCTCAGAACTTTTTGT+GGG + Chr3:13883634-13883653 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
! GTTATTCTTGATGGCTCCAA+AGG + Chr3:13883515-13883534 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
! TCGGAAGCACAAAAAAGAGA+AGG + Chr3:13885022-13885041 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTCAGCTTCATTCCAGGT+AGG - Chr3:13883688-13883707 None:intergenic 40.0%
!!! CCCTTTGCAATTTGGTTTTG+AGG - Chr3:13883812-13883831 None:intergenic 40.0%
!!! GATGGCTTTTTGAAGTACAC+AGG + Chr3:13884247-13884266 MsG0380012271.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTAGGAGAAGGTGGTTT+CGG + Chr3:13885119-13885138 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGAAATTGAAGCGTGCT+TGG + Chr3:13884733-13884752 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
ATGCTGAAACTCACTGATCG+AGG + Chr3:13883485-13883504 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG + Chr3:13885726-13885745 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
CGCCGCAATTCTTGATGAAT+TGG - Chr3:13883555-13883574 None:intergenic 45.0%
CTATATTTAGAGGAGGGTCG+TGG + Chr3:13883840-13883859 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
GATCCACAACGCCAATACTT+TGG + Chr3:13883383-13883402 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
GCAGCTGGAATATATGAAGC+TGG + Chr3:13883344-13883363 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
GCCTCTTAACAGCAATCTCT+TGG - Chr3:13885256-13885275 None:intergenic 45.0%
GGGACTACTATATCTGCATC+AGG + Chr3:13885603-13885622 MsG0380012271.01.T01:intron 45.0%
GGTCGGATCAGACACAAAAT+TGG + Chr3:13884029-13884048 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
TACCAGATACGTCATCATCG+TGG + Chr3:13884278-13884297 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
TACTAGGGTGTAATGGCAGA+TGG + Chr3:13885230-13885249 MsG0380012271.01.T01:intron 45.0%
TGGATTCAGGAAACCTTGTC+GGG + Chr3:13883600-13883619 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTTTTCACTGGAGCTACT+TGG + Chr3:13883870-13883889 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
! ACTAGATTGGACAAAGCGCT+TGG + Chr3:13885558-13885577 MsG0380012271.01.T01:intron 45.0%
! GCCAAGAGATTGCTGTTAAG+AGG + Chr3:13885252-13885271 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
! TAATCATCACACTGGTCTGC+AGG - Chr3:13884073-13884092 None:intergenic 45.0%
! TACCACGATGATGACGTATC+TGG - Chr3:13884283-13884302 None:intergenic 45.0%
! TGGAACGGATACCTTTTCAC+TGG + Chr3:13883860-13883879 MsG0380012271.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGCCAAAGTATTGGCGTTG+TGG - Chr3:13883389-13883408 None:intergenic 45.0%
!! GATATCAGAGATGGTGGAAG+TGG + Chr3:13884379-13884398 MsG0380012271.01.T01:intron 45.0%
!! GTTAGAGTTGATACCGCACA+AGG - Chr3:13884098-13884117 None:intergenic 45.0%
AGAGAAGGCAGATGGTGACT+TGG + Chr3:13885037-13885056 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
ATTCATGCCCAACGGAAGCT+TGG + Chr3:13885409-13885428 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
CCTGGTAACACTTTCCTACC+TGG + Chr3:13883671-13883690 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
GCAACCCACACAATAGTCCT+TGG - Chr3:13883431-13883450 None:intergenic 50.0%
GCCAAGTAGCTCCAGTGAAA+AGG - Chr3:13883874-13883893 None:intergenic 50.0%
GGAGTTCCAGATGACACCTT+TGG - Chr3:13883534-13883553 None:intergenic 50.0%
GTGGAAGTGGCTGCTTACTT+TGG + Chr3:13884392-13884411 MsG0380012271.01.T01:intron 50.0%
TACATCGGGACAAGGAGTTG+AGG + Chr3:13885283-13885302 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
TGGAAGTCGTCGAATTGGTC+TGG + Chr3:13884184-13884203 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
TGGTTTCGGACCAGTGTACA+AGG + Chr3:13885133-13885152 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
TTTAGAGGAGGGTCGTGGAA+CGG + Chr3:13883845-13883864 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
! AAGTCGTCGAATTGGTCTGG+TGG + Chr3:13884187-13884206 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
! AGTCGTCGAATTGGTCTGGT+GGG + Chr3:13884188-13884207 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
! TCCTCTGAAGATCCTGCTGA+CGG + Chr3:13883752-13883771 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGGCTCCAAAGGTGTCATC+TGG + Chr3:13883525-13883544 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
!! CCAGGTAGGAAAGTGTTACC+AGG - Chr3:13883674-13883693 None:intergenic 50.0%
!! GATACCCTTGTTTCTGCAGC+TGG + Chr3:13883329-13883348 MsG0380012271.01.T01:CDS 50.0%
AAGCGTGCTTGGACTGTTGC+AGG + Chr3:13884744-13884763 MsG0380012271.01.T01:CDS 55.0%
ATCGAAAACTCGCCGTCAGC+AGG - Chr3:13883767-13883786 None:intergenic 55.0%
! CGAATTGGTCTGGTGGGTGT+CGG + Chr3:13884194-13884213 MsG0380012271.01.T01:CDS 55.0%
! CTGACGGCGAGTTTTCGATG+AGG + Chr3:13883768-13883787 MsG0380012271.01.T01:CDS 55.0%
GCCGTCAGCAGGATCTTCAG+AGG - Chr3:13883756-13883775 None:intergenic 60.0%
!! ATTGGTCTGGTGGGTGTCGG+AGG + Chr3:13884197-13884216 MsG0380012271.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 13883224 13885777 13883224 ID=MsG0380012271.01;Name=MsG0380012271.01
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Chr3 exon 13884718 13884825 13884718 ID=MsG0380012271.01.T01:exon:13116;Parent=MsG0380012271.01.T01
Chr3 exon 13885000 13885154 13885000 ID=MsG0380012271.01.T01:exon:13115;Parent=MsG0380012271.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0380012271.01.T01

ATGCCAATCCTAATGGTGTATACTTTCTTCTTTTGCTTCATGCCCACTTTCTCTAAACAGAACACTTTTACTATTATTGCTCCAAATCAGTTTATGCAATACGGTGATACCCTTGTTTCTGCAGCTGGAATATATGAAGCTGGATTTTTCAACTTTGGAGATCCACAACGCCAATACTTTGGCATATGGTACAAGAACATATCACCAAGGACTATTGTGTGGGTTGCCAATAGAAATACTCCTGTACGTAACTCAACAGCAATGCTGAAACTCACTGATCGAGGAAGTCTTGTTATTCTTGATGGCTCCAAAGGTGTCATCTGGAACTCCAATTCATCAAGAATTGCGGCGGTGAAATCAGTTATTGTGCAGTTATTGGATTCAGGAAACCTTGTCGGGAAAGATACAAACAGCTCTCAGAACTTTTTGTGGGAAAGTTTTGATTATCCTGGTAACACTTTCCTACCTGGAATGAAGCTGAAAAGTAACTTGGTTACTGGTCCATATAGATATCTCACTTCTTGGAGATCCTCTGAAGATCCTGCTGACGGCGAGTTTTCGATGAGGATAGATACTCACGGTTTTCCTCAAAACCAAATTGCAAAGGGAACGACAACTATATTTAGAGGAGGGTCGTGGAACGGATACCTTTTCACTGGAGCTACTTGGCAAAGAAGTTATAATATATTGAATTACTCATTTGTGTTAACTGACAAAGAAGTCACTTTTCAATATGAAACTTTAAACAGTTTAATTATTACTAGAGTTGTGCTAAATCCATATGGAACTTCACAACGTCTTAAATGGTCGGATCAGACACAAAATTGGGAGATTATTACTAATGCTCCTGCAGACCAGTGTGATGATTATGCCTTGTGCGGTATCAACTCTAACTGCAATATTAATAACTTTCCAATATGTGAATGCTTGGAAGGTTTCATGCCAAAATTTCAAACAAAATGGAAGTCGTCGAATTGGTCTGGTGGGTGTCGGAGGAGAACAAAATTGAATTGTCTCAATGGTGATGGCTTTTTGAAGTACACAGGCATGAAGTTACCAGATACGTCATCATCGTGGTATAACAAAAGCTTGAGCCTTGAGGAATATCATAAAAAGAATAAGCAGAAATTGAAGCGTGCTTGGACTGTTGCAGGAGTTATTGCATTCATAATAGGACTAACCGTTCTTGTATTGCAATTTAGAGAGAAAATTGGTTATATAAAAAAGTTATTTCATCGGAAGCACAAAAAAGAGAAGGCAGATGGTGACTTGGCTACAATATTTGATTTTTCCACCATCACTAATGCAACAAATAACTTCTCTGATAAAAATAAGCTAGGAGAAGGTGGTTTCGGACCAGTGTACAAGGGTGTAATGGCAGATGGCCAAGAGATTGCTGTTAAGAGGCTTTGTAATACATCGGGACAAGGAGTTGAGGAGTTCAAAAATGAAGTAAAGTTGATGGCAACACTTCAACACCGTAATCTTGTAAAACTTCTTGGTTGTTCTATTCAACAAGATGAAAAGTTGTTGATCTACGAATTCATGCCCAACGGAAGCTTGGATTACTTATTTTTGGATTCTACACTGAGAATAATACATAGAGATCTCAAGACAAGCAATATTCTACTTGATATTGATATGATCCCAAAGATAGCAGATTTTGGCTTAGCCAGATCATTTATGGGAGACCAAGCTGAGGCTAAAACAAATAGAGTGATGGGAACATAG

Protein sequence

>MsG0380012271.01.T01

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