AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012594.01

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MsG0380012594.01.T01 AT4G27190 24.311 798 405 28 94 781 167 875 6.36e-29 125
MsG0380012594.01.T01 AT4G27220 26.494 502 277 17 91 543 142 600 9.53e-29 124
MsG0380012594.01.T01 AT4G27220 26.494 502 277 17 91 543 134 592 1.14e-28 124
MsG0380012594.01.T01 AT1G12210 26.766 538 307 20 47 525 92 601 4.81e-28 122
MsG0380012594.01.T01 AT1G12210 26.766 538 307 20 47 525 92 601 4.81e-28 122
MsG0380012594.01.T01 AT1G12210 26.766 538 307 20 47 525 134 643 5.01e-28 122
MsG0380012594.01.T01 AT3G46730 27.018 570 314 21 17 520 112 645 2.20e-27 120
MsG0380012594.01.T01 AT1G10920 25.896 614 337 21 34 565 4 581 2.45e-27 119
MsG0380012594.01.T01 AT1G10920 25.896 614 337 21 34 565 4 581 2.45e-27 119
MsG0380012594.01.T01 AT1G10920 25.896 614 337 21 34 565 4 581 2.45e-27 119
MsG0380012594.01.T01 AT1G12220 26.165 558 318 22 47 543 13 537 1.17e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT1G12220 26.165 558 318 22 47 543 134 658 1.66e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT1G12220 26.165 558 318 22 47 543 134 658 1.66e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT1G62630 25.177 707 403 26 104 739 185 836 1.73e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT5G43730 24.100 722 423 24 88 738 169 836 1.75e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT5G43730 24.100 722 423 24 88 738 169 836 1.75e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT5G43730 24.100 722 423 24 88 738 169 836 1.75e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT5G43730 24.100 722 423 24 88 738 169 836 1.75e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT5G43730 24.100 722 423 24 88 738 169 836 1.75e-25 114
MsG0380012594.01.T01 AT1G12280 24.621 792 463 30 13 739 116 838 2.45e-25 113
MsG0380012594.01.T01 AT5G63020 23.764 627 348 24 2 549 63 638 7.05e-25 112
MsG0380012594.01.T01 AT1G51480 24.268 717 443 24 91 745 173 851 1.16e-24 111
MsG0380012594.01.T01 AT4G26090 24.509 763 476 26 66 759 154 885 2.08e-24 110
MsG0380012594.01.T01 AT1G12290 25.726 482 262 18 64 481 153 602 1.09e-23 108
MsG0380012594.01.T01 AT1G12290 25.726 482 262 18 64 481 111 560 1.58e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G12290 25.726 482 262 18 64 481 111 560 1.58e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G12290 25.726 482 262 18 64 481 111 560 1.58e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G63360 25.036 703 407 27 104 739 150 799 1.64e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G63360 25.036 703 407 27 104 739 185 834 1.85e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT5G05400 26.019 515 283 21 91 544 6 483 2.34e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT5G05400 26.019 515 283 21 91 544 6 483 2.34e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G59780 28.448 348 185 11 16 315 110 441 2.58e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT5G05400 26.019 515 283 21 91 544 175 652 2.72e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT1G59780 28.448 348 185 11 16 315 115 446 2.87e-23 107
MsG0380012594.01.T01 AT3G46530 29.167 312 165 11 52 317 148 449 4.25e-23 106
MsG0380012594.01.T01 AT5G47250 25.618 566 312 22 57 567 144 655 1.38e-22 104
MsG0380012594.01.T01 AT1G61300 24.431 483 251 18 57 484 38 461 2.26e-22 103
MsG0380012594.01.T01 AT5G43740 24.202 752 442 27 75 748 156 857 3.81e-22 103
MsG0380012594.01.T01 AT5G43740 24.202 752 442 27 75 748 156 857 3.81e-22 103
MsG0380012594.01.T01 AT4G10780 24.767 537 302 23 54 527 146 643 6.01e-22 102
MsG0380012594.01.T01 AT4G10780 24.767 537 302 23 54 527 146 643 6.69e-22 102
MsG0380012594.01.T01 AT1G61300 24.694 490 266 20 57 484 38 486 2.33e-21 100
MsG0380012594.01.T01 AT1G63350 24.259 742 435 27 64 739 150 830 4.09e-21 100
MsG0380012594.01.T01 AT1G63350 24.259 742 435 27 64 739 150 830 7.26e-21 99.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G63350 24.259 742 435 27 64 739 150 830 7.26e-21 99.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G63350 23.893 745 398 26 64 739 150 794 7.84e-21 99.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G61310 24.165 778 436 30 57 753 151 855 3.82e-20 97.1
MsG0380012594.01.T01 AT5G51630 24.397 705 394 26 91 707 142 795 2.56e-19 94.4
MsG0380012594.01.T01 AT5G51630 24.397 705 394 26 91 707 142 795 2.59e-19 94.7
MsG0380012594.01.T01 AT5G51630 24.397 705 394 26 91 707 206 859 2.86e-19 94.4
MsG0380012594.01.T01 AT5G51630 24.397 705 394 26 91 707 142 795 2.91e-19 94.4
MsG0380012594.01.T01 AT5G51630 24.397 705 394 26 91 707 142 795 2.91e-19 94.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G61190 22.775 764 439 29 57 754 150 828 9.79e-19 92.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G15890 25.806 372 216 14 47 374 133 488 3.12e-17 87.4
MsG0380012594.01.T01 AT1G15890 26.235 324 188 11 92 374 15 328 3.85e-17 87.0
MsG0380012594.01.T01 AT5G47260 22.779 698 421 26 101 739 179 817 3.18e-15 81.3
MsG0380012594.01.T01 AT1G69550 30.997 371 211 16 453 794 868 1222 7.47e-15 80.1
MsG0380012594.01.T01 AT1G10920 25.323 387 218 12 218 565 57 411 8.66e-15 79.0
MsG0380012594.01.T01 AT1G10920 25.323 387 218 12 218 565 57 411 8.66e-15 79.0
MsG0380012594.01.T01 AT4G11170 28.897 263 139 10 54 278 171 423 8.36e-11 67.0
MsG0380012594.01.T04 AT3G14470 39.808 520 279 8 1 497 401 909 4.24e-106 347
MsG0380012594.01.T04 AT3G14470 39.808 520 279 8 1 497 401 909 4.24e-106 347
MsG0380012594.01.T04 AT3G14460 39.208 505 286 7 8 497 401 899 6.51e-98 330
MsG0380012594.01.T04 AT3G14460 33.476 233 136 9 462 680 1113 1340 1.38e-12 72.0
MsG0380012594.01.T04 AT1G62630 26.453 499 292 18 8 479 386 836 3.69e-19 92.8
MsG0380012594.01.T04 AT3G07040 27.211 294 165 8 2 286 405 658 2.53e-18 90.5
MsG0380012594.01.T04 AT1G63360 25.859 495 298 20 8 479 386 834 2.07e-16 84.3
MsG0380012594.01.T04 AT1G63360 25.859 495 298 20 8 479 351 799 2.34e-16 84.0
MsG0380012594.01.T04 AT3G50950 27.342 395 242 17 5 385 395 758 1.10e-15 81.6
MsG0380012594.01.T04 AT3G50950 27.342 395 242 17 5 385 395 758 1.10e-15 81.6
MsG0380012594.01.T04 AT1G69550 30.997 371 211 16 193 534 868 1222 1.91e-14 78.2
MsG0380012594.01.T04 AT1G58400 27.043 514 318 23 4 496 401 878 5.25e-14 76.3
MsG0380012594.01.T04 AT1G58400 27.043 514 318 23 4 496 401 878 5.25e-14 76.3
MsG0380012594.01.T04 AT1G58400 27.043 514 318 23 4 496 391 868 6.42e-14 76.3
MsG0380012594.01.T04 AT4G27220 27.305 282 164 9 8 283 354 600 9.51e-14 75.5
MsG0380012594.01.T04 AT4G27220 27.305 282 164 9 8 283 346 592 1.10e-13 75.5
MsG0380012594.01.T04 AT1G58848 24.502 502 313 19 13 488 412 873 1.29e-13 75.1
MsG0380012594.01.T04 AT1G59218 24.502 502 313 19 13 488 412 873 1.29e-13 75.1
MsG0380012594.01.T04 AT1G59218 24.502 502 313 19 13 488 412 873 1.29e-13 75.1
MsG0380012594.01.T04 AT1G59218 24.502 502 313 19 13 488 412 873 1.29e-13 75.1
MsG0380012594.01.T04 AT1G58848 24.502 502 313 19 13 488 412 873 1.29e-13 75.1
MsG0380012594.01.T04 AT1G51480 24.395 496 316 17 13 485 392 851 6.22e-12 69.7
MsG0380012594.01.T04 AT5G43730 24.248 499 303 17 8 478 385 836 1.21e-11 68.9
MsG0380012594.01.T04 AT5G43730 24.248 499 303 17 8 478 385 836 1.21e-11 68.9
MsG0380012594.01.T04 AT5G43730 24.248 499 303 17 8 478 385 836 1.21e-11 68.9
MsG0380012594.01.T04 AT5G43730 24.248 499 303 17 8 478 385 836 1.21e-11 68.9
MsG0380012594.01.T04 AT5G43730 24.248 499 303 17 8 478 385 836 1.21e-11 68.9
MsG0380012594.01.T04 AT1G12290 29.258 229 132 9 8 221 389 602 4.13e-11 67.0
MsG0380012594.01.T04 AT1G12290 29.258 229 132 9 8 221 347 560 4.29e-11 67.0
MsG0380012594.01.T04 AT1G12290 29.258 229 132 9 8 221 347 560 4.29e-11 67.0
MsG0380012594.01.T04 AT1G12290 29.258 229 132 9 8 221 347 560 4.29e-11 67.0

Find 214 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 257 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCAAGAAGCTTTCCATTTC+AGG 0.079361 3:+20428184 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAAGGAAGGCTTCAAATTTC+AGG 0.128089 3:+20427863 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGATCATATTCTTAAAATTA+AGG 0.208903 3:+20427385 MsG0380012594.01.T01:CDS
AATCAGTAACTATGCCATTA+TGG 0.211451 3:+20427198 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTATAGGTACAATGATTTC+TGG 0.216454 3:+20428223 MsG0380012594.01.T01:CDS
CATCACATCTCTTTAGTTCT+AGG 0.226672 3:-20428483 None:intergenic
TGATGTTGCGGCAACAAATT+TGG 0.242578 3:+20427910 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGTAGTGGTGATTGTGAAAT+TGG 0.253750 3:+20426120 MsG0380012594.01.T01:CDS
AACTGAATGGATTAAAATAT+TGG 0.263729 3:+20426917 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTACAATCCCCAAGCCAATT+TGG 0.267571 3:-20428091 None:intergenic
GTTAGAACAATGTTTCAAAT+TGG 0.272791 3:+20427658 MsG0380012594.01.T01:CDS
CCGTTTAGCCATGGATCTTC+TGG 0.281268 3:+20426645 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCTCTCGAAGCCATCAATTT+AGG 0.285245 3:-20428853 None:intergenic
CAAATGCGACGCGTCCGTTT+AGG 0.285621 3:-20427326 None:intergenic
TTGCCGATCAACTCAAGATT+TGG 0.286580 3:-20426816 None:intergenic
CCTGCCTCGGTATTCTTTGA+TGG 0.308789 3:-20428062 None:intergenic
TTAAGCAAGGATTTGAAGAT+AGG 0.311116 3:+20426028 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAGGCAGGAGCTTTCCAAAT+TGG 0.314660 3:+20428077 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTGGAAGTTGAAGACTTCTT+TGG 0.321789 3:+20428619 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTCAAGACTAAAATATTTGC+AGG 0.333596 3:+20427490 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATACAGCATACAAATGGAAT+TGG 0.334401 3:-20427618 None:intergenic
ACTCGAGATTTAATAGTTGA+TGG 0.334936 3:-20428970 None:intergenic
TTAGTATCTCTAGAATTGTT+AGG 0.335994 3:+20428115 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGCTGATCAAAAGGATAGAT+TGG 0.339198 3:+20426083 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAACAACGCTTCAGATTAGA+AGG 0.341014 3:-20427011 None:intergenic
AAATGCGACGCGTCCGTTTA+GGG 0.341069 3:-20427325 None:intergenic
GAATTGAAGCCTGCAATTCT+TGG 0.344701 3:-20428438 None:intergenic
TATTGATTGCCAAGAATTGC+AGG 0.349421 3:+20428429 MsG0380012594.01.T01:CDS
AACACATCTCTCTGTCTTAG+AGG 0.350010 3:+20428006 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAAGAGGACCATTGTAGATT+TGG 0.352168 3:-20428643 None:intergenic
GATCATATTCTTAAAATTAA+GGG 0.354503 3:+20427386 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGCCTCACGAGGTTTCTATT+TGG 0.361366 3:-20428037 None:intergenic
ATCAGTATAATGAGTGTGAT+TGG 0.363324 3:+20426348 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTTAGGACATCTTTCTATT+CGG 0.366469 3:-20428837 None:intergenic
GGAGCTTTCCAAATTGGCTT+GGG 0.374150 3:+20428083 MsG0380012594.01.T01:CDS
ACTGCCCAAGTGGTGGTAAC+TGG 0.375795 3:-20428153 None:intergenic
GATACTACCAACTGCACCTT+TGG 0.379704 3:+20426230 MsG0380012594.01.T01:intron
TTGCAGGTGTTGTCCCTCTC+TGG 0.380138 3:+20427506 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATTCGGAGGCTGCATAGAT+TGG 0.384157 3:-20428821 None:intergenic
CATTTGGTGCTGCCTTGATT+TGG 0.384593 3:+20427343 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATTCCATCGCAGCCTGAAA+TGG 0.390580 3:-20428197 None:intergenic
CCTTTAGCTCTAGAAACATT+GGG 0.390920 3:+20426867 MsG0380012594.01.T01:CDS
GCAATTTGAACTTAAAGCTT+GGG 0.391880 3:+20426425 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAGCTTGGTAGACCCTCTTC+TGG 0.401871 3:-20429046 None:intergenic
AGAAAGATGTCCTAAATTGA+TGG 0.404565 3:+20428843 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAAGTTTCAAGGGATCTAAA+TGG 0.404579 3:-20428265 None:intergenic
CCCAATGTTTCTAGAGCTAA+AGG 0.407767 3:-20426867 None:intergenic
ATCAGTAACTATGCCATTAT+GGG 0.408672 3:+20427199 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATCTCACCCGAGCAATTCTC+AGG 0.409252 3:+20426478 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGACAAAAGTGAAGAAGAGT+TGG 0.413939 3:+20427130 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTAAACGGACGCGTCGCATT+TGG 0.417077 3:+20427327 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAGGAAGGCTTCAAATTTCA+GGG 0.419487 3:+20427864 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGCAATTTGAACTTAAAGCT+TGG 0.421055 3:+20426424 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATGGCATAGTTACTGATTGT+TGG 0.425302 3:-20427193 None:intergenic
TGCGATGGAATAGAGATTAT+AGG 0.427092 3:+20428208 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTGGATGAATCTGCGATATA+TGG 0.427172 3:+20426252 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGAAGGCTTGCTAAAGTATC+GGG 0.430040 3:+20427103 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAGGGCAGTTTATTATTCAT+AGG 0.431783 3:-20429009 None:intergenic
CAAATTATACAGCATACAAA+TGG 0.434498 3:-20427624 None:intergenic
GTCACTGATATTATCAGCCT+TGG 0.437355 3:-20428461 None:intergenic
GTCTCTGTTGCAATTGTCGT+TGG 0.439032 3:-20426545 None:intergenic
TTTGAAGCCTTCCTTGAAGA+TGG 0.439270 3:-20427856 None:intergenic
GGGTCATCCTTTGTGGATCT+CGG 0.440869 3:+20428542 MsG0380012594.01.T01:CDS
AATTGCCATCTAGCTTGAAA+AGG 0.441605 3:+20428521 MsG0380012594.01.T01:CDS
GCAGTTTATTATTCATAGGT+TGG 0.444417 3:-20429005 None:intergenic
AGAGTGAGTTAATCAAGCTT+TGG 0.450907 3:+20427075 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTGAAAAGGGTCATCCTTTG+TGG 0.455748 3:+20428535 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTTTCCATTTCAGGCTGCGA+TGG 0.457115 3:+20428193 MsG0380012594.01.T01:CDS
GCGGAACTCAACCATCTTCA+AGG 0.458169 3:+20427845 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAGAAGGAAGGTGTTGAGGC+AGG 0.458634 3:-20428390 None:intergenic
AGGAGCTTTCCAAATTGGCT+TGG 0.460362 3:+20428082 MsG0380012594.01.T01:CDS
TACAAAGCTCTTGAAGCAAA+GGG 0.462527 3:-20428339 None:intergenic
ACCTTTAGCTCTAGAAACAT+TGG 0.463826 3:+20426866 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGCTGCCTTGATTTGGAAGA+TGG 0.464001 3:+20427350 MsG0380012594.01.T01:CDS
CCAGAAGATCCATGGCTAAA+CGG 0.465929 3:-20426645 None:intergenic
AGAGTTTCTTGCTGATCAAA+AGG 0.466401 3:+20426074 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATCACCATCTTCCAAATCA+AGG 0.468318 3:-20427355 None:intergenic
TCAGATTAGAAGGGAAGTTA+AGG 0.468978 3:-20427001 None:intergenic
ATTGTTTCAGAGAATTGAGT+TGG 0.474937 3:-20428891 None:intergenic
ACTACCAACTGCACCTTTGG+TGG 0.476519 3:+20426233 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTTGTTGCCGCAACATCAGC+GGG 0.481527 3:-20427905 None:intergenic
AGAGTTCCGCTTACTAATAG+AGG 0.481962 3:+20427283 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAGTCTGATGGTAGAAGCGC+AGG 0.483795 3:+20427415 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGTTCCCAGTTACCACCACT+TGG 0.484568 3:+20428148 MsG0380012594.01.T01:CDS
GACAAAAGTGAAGAAGAGTT+GGG 0.485917 3:+20427131 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAGGCTTCAAATTTCAGGGT+TGG 0.487958 3:+20427868 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTGAACGCGTGCAGTGCAAA+AGG 0.490929 3:-20428730 None:intergenic
AGGTAACTCAATCTAAGTAC+GGG 0.491479 3:-20426981 None:intergenic
TTGCAATCTCAGTGTGAGAA+AGG 0.492158 3:-20427589 None:intergenic
TACAGCATACAAATGGAATT+GGG 0.492611 3:-20427617 None:intergenic
CTGAAGGCTTGCTAAAGTAT+CGG 0.494058 3:+20427102 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGGATTTGACATTAAACAGT+TGG 0.494253 3:+20427823 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATACAAAGCTCTTGAAGCAA+AGG 0.494672 3:-20428340 None:intergenic
TTATACTGATTATGCGTACA+AGG 0.496527 3:-20426335 None:intergenic
AGAAAATAGTAGAAAAGTGC+GGG 0.498902 3:+20426838 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAATCTACAATGGTCCTCTT+CGG 0.499115 3:+20428645 MsG0380012594.01.T01:CDS
GCTGATCAAAAGGATAGATT+GGG 0.499416 3:+20426084 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATATGATGAATGGAGAGAAA+TGG 0.499990 3:+20427967 MsG0380012594.01.T01:CDS
GCTCAAATCGCAAAGTTTCA+AGG 0.501024 3:-20428276 None:intergenic
TAGTACTTACCATCCCATAA+TGG 0.502361 3:-20427212 None:intergenic
CATGAATGGACAAAGTAGAA+AGG 0.503547 3:-20429069 None:intergenic
TAAGCATGTCATATGATGAA+TGG 0.503927 3:+20427957 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAGGTAACTCAATCTAAGTA+CGG 0.504899 3:-20426982 None:intergenic
GGTCATCCTTTGTGGATCTC+GGG 0.505344 3:+20428543 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTTGATCAGCAAGAAACTCT+AGG 0.509799 3:-20426071 None:intergenic
CATTGTAAACAAGCCGGGCA+AGG 0.511016 3:-20426386 None:intergenic
TTCTCAAACTCATAGCCCTT+CGG 0.515990 3:-20427053 None:intergenic
GATTTAGCAAAATCAGTGTC+AGG 0.519412 3:+20427260 MsG0380012594.01.T01:CDS
GATGGCTTCGAGAGAGGAGT+GGG 0.519925 3:+20428861 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAACATGAGAGAATGAAGAT+TGG 0.521293 3:-20428752 None:intergenic
GACAAAGTAGAAAGGGAGCT+TGG 0.521939 3:-20429061 None:intergenic
ATGAATGGACAAAGTAGAAA+GGG 0.524850 3:-20429068 None:intergenic
CTGCCCAAGTGGTGGTAACT+GGG 0.526321 3:-20428152 None:intergenic
TCGGAGGCTGCATAGATTGG+AGG 0.526970 3:-20428818 None:intergenic
TCACTGATATTATCAGCCTT+GGG 0.527987 3:-20428460 None:intergenic
TGGGTAAGACAACCCTTGCC+CGG 0.530981 3:+20426373 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTTGACATTAAACAGTTGG+CGG 0.533087 3:+20427826 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATCCAAATCTTGAGTTGAT+CGG 0.533325 3:+20426813 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAAATTGCTCATGTATCTTG+TGG 0.534184 3:-20426410 None:intergenic
TGAGCACATGTCAGAATGGA+AGG 0.535790 3:+20428294 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATCAAGCTTTGGATGGCTGA+AGG 0.536088 3:+20427086 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCTCGACAGCTTGCCAGAAG+AGG 0.536417 3:+20429033 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGGAAAGCTTCTTGAGAGAG+TGG 0.537235 3:-20428177 None:intergenic
ATTGGAGGGCAGCTGCCTCC+CGG 0.537873 3:-20428803 None:intergenic
AAATTCCCTGAGAATTGCTC+GGG 0.538677 3:-20426484 None:intergenic
CCATCAAAGAATACCGAGGC+AGG 0.541250 3:+20428062 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTGGTCATTGTAAACAAGCC+GGG 0.541484 3:-20426391 None:intergenic
ATGTGCAAGAAATCCCTAAA+CGG 0.542266 3:+20427312 MsG0380012594.01.T01:CDS
GATGGAAGAAGACTCTCCTC+TGG 0.544276 3:-20428952 None:intergenic
CTACTACTTCCGTTTAGCCA+TGG 0.551595 3:+20426636 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTACGTCATCTTAATCTGAA+AGG 0.552266 3:+20427716 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAAATTCCCTGAGAATTGCT+CGG 0.552571 3:-20426485 None:intergenic
TGTGGTCATTGTAAACAAGC+CGG 0.552807 3:-20426392 None:intergenic
CGGAGGCTGCATAGATTGGA+GGG 0.554469 3:-20428817 None:intergenic
TAGGACATCTTTCTATTCGG+AGG 0.554522 3:-20428834 None:intergenic
AAGTAATGGACAGTCATGAA+TGG 0.556324 3:-20429083 None:intergenic
CTCGACAGCTTGCCAGAAGA+GGG 0.556713 3:+20429034 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCAGTATAATGAGTGTGATT+GGG 0.557405 3:+20426349 MsG0380012594.01.T01:CDS
CGATATCTGTAACGGGAATG+TGG 0.558841 3:+20426599 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCTGGCAAGCTGTCGAGACA+AGG 0.558978 3:-20429028 None:intergenic
TTGGGCTTATCTTAAAGCGT+TGG 0.561030 3:-20427448 None:intergenic
CTTTGATGGTTAGCCTCACG+AGG 0.563408 3:-20428048 None:intergenic
ATTGCCATCTAGCTTGAAAA+GGG 0.567105 3:+20428522 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGAAGCGTATAGTGAAGACT+TGG 0.568214 3:+20426515 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGATGCCACCGAATATAAGT+AGG 0.568400 3:+20427753 MsG0380012594.01.T01:CDS
TGCAAAGAAGGAAGGTGTTG+AGG 0.570630 3:-20428394 None:intergenic
ATGGTAGAAGCGCAGGGTTG+TGG 0.570756 3:+20427422 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGAAGGAAGGTGTTGAGGCA+GGG 0.571602 3:-20428389 None:intergenic
TCATCCACCAAAGGTGCAGT+TGG 0.572147 3:-20426237 None:intergenic
CTCAAATCGCAAAGTTTCAA+GGG 0.572479 3:-20428275 None:intergenic
TAAATTGATGGCTTCGAGAG+AGG 0.572616 3:+20428855 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAATTGCAACAGAGACTAGC+TGG 0.573807 3:+20426552 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTGTAAACAAGCCGGGCAA+GGG 0.574819 3:-20426385 None:intergenic
AACTCAACCATCTTCAAGGA+AGG 0.575873 3:+20427849 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAGCTTTCCAAATTGGCTTG+GGG 0.577557 3:+20428084 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATATGTGGCGTTTATCAGAC+GGG 0.579008 3:+20426946 MsG0380012594.01.T01:CDS
CCGGAAAACGATTCTAGCCA+TGG 0.580213 3:-20428784 None:intergenic
GTAACGGGAATGTGGAATGT+TGG 0.581317 3:+20426607 MsG0380012594.01.T01:CDS
TACGAGATTGCAACCAGAGA+GGG 0.581409 3:-20427519 None:intergenic
TGAGTTAATCAAGCTTTGGA+TGG 0.581426 3:+20427079 MsG0380012594.01.T01:CDS
GATATGTGGCGTTTATCAGA+CGG 0.584298 3:+20426945 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATATGGTAGAGAGAACGAAA+AGG 0.585015 3:+20426269 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTAGAACTAAAGAGATGTGA+TGG 0.586587 3:+20428484 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTTCCCAGTTACCACCACTT+GGG 0.591537 3:+20428149 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCTTACTTCCAGAAGATCCA+TGG 0.592330 3:-20426653 None:intergenic
ACATGTCAGAATGGAAGGAA+TGG 0.592352 3:+20428299 MsG0380012594.01.T01:CDS
GGAATTGACAAATTCAGTAG+TGG 0.592373 3:+20426105 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTTAACCTACTTATATTCGG+TGG 0.595069 3:-20427758 None:intergenic
GCAGTCTAACTATAACATGT+TGG 0.601780 3:+20428692 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTTGTTGCCGCAACATCAG+CGG 0.602553 3:-20427906 None:intergenic
AAGAAGACTCTCCTCTGGAA+AGG 0.605372 3:-20428947 None:intergenic
TATTGATCCCGCTGATGTTG+CGG 0.607241 3:+20427898 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTTTAGCTCTAGAAACATTG+GGG 0.608632 3:+20426868 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCATGTTGTACGATAGTCCA+TGG 0.612473 3:+20428767 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATTGCAGGCTTCAATTCCCA+AGG 0.612890 3:+20428444 MsG0380012594.01.T01:CDS
GATTTGAGCACATGTCAGAA+TGG 0.615008 3:+20428290 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATAATGAGTGTGATTGGGA+TGG 0.615302 3:+20426353 MsG0380012594.01.T01:CDS
TACCACCCTCTATTAGTAAG+CGG 0.616554 3:-20427289 None:intergenic
TGATGGCTTCGAGAGAGGAG+TGG 0.622175 3:+20428860 MsG0380012594.01.T01:CDS
GATGAATGGAGAGAAATGGA+TGG 0.623011 3:+20427971 MsG0380012594.01.T01:CDS
AATTTGGAAAGCTCCTGCCT+CGG 0.623494 3:-20428075 None:intergenic
AAATATTGGAGACTGATATG+TGG 0.624393 3:+20426931 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAGTTCCGCTTACTAATAGA+GGG 0.626134 3:+20427284 MsG0380012594.01.T01:CDS
TCTTTGGTCCAAATCTACAA+TGG 0.626392 3:+20428635 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTGGCAAGCTGTCGAGACAA+GGG 0.631230 3:-20429027 None:intergenic
GAGTGGAACTGCCCAAGTGG+TGG 0.633284 3:-20428160 None:intergenic
TAAGGGACTACACAGTCTGA+TGG 0.638234 3:+20427403 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTAACTATGCCATTATGGGA+TGG 0.638571 3:+20427203 MsG0380012594.01.T01:CDS
AATCTTGGAGTCCTTTCCAG+AGG 0.638861 3:+20428936 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATAATGAGTGTGATTGGGAT+GGG 0.640717 3:+20426354 MsG0380012594.01.T01:CDS
AACGCTTTAAGATAAGCCCA+AGG 0.643063 3:+20427450 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATTGTGACAACGCATGACA+AGG 0.648713 3:+20426677 MsG0380012594.01.T01:CDS
ATCGCAGATTCATCCACCAA+AGG 0.649157 3:-20426246 None:intergenic
ACAGCTACACATATCCGAAG+AGG 0.652753 3:-20428659 None:intergenic
TCTCACCCGAGCAATTCTCA+GGG 0.655486 3:+20426479 MsG0380012594.01.T01:CDS
CAATGACCCGAGATCCACAA+AGG 0.659140 3:-20428549 None:intergenic
AAGAAAATAGTAGAAAAGTG+CGG 0.662420 3:+20426837 MsG0380012594.01.T01:CDS
AACAACGCTTCAGATTAGAA+GGG 0.669162 3:-20427010 None:intergenic
AAAATAGTAGAAAAGTGCGG+GGG 0.682492 3:+20426840 MsG0380012594.01.T01:CDS
GTGCAGTGCAAAAGGCAATG+AGG 0.686885 3:-20428722 None:intergenic
GAAGGCTTGCTAAAGTATCG+GGG 0.688189 3:+20427104 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTTGTTGTGGGAAAGCAGCG+TGG 0.690398 3:+20427803 MsG0380012594.01.T01:CDS
AAATAGTAGAAAAGTGCGGG+GGG 0.692810 3:+20426841 MsG0380012594.01.T01:CDS
TTCCGCTTACTAATAGAGGG+TGG 0.692830 3:+20427287 MsG0380012594.01.T01:CDS
GAAAATAGTAGAAAAGTGCG+GGG 0.696499 3:+20426839 MsG0380012594.01.T01:CDS
AGTCTGATGGTAGAAGCGCA+GGG 0.698716 3:+20427416 MsG0380012594.01.T01:CDS
AACCAAATAGAAACCTCGTG+AGG 0.701988 3:+20428035 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTACGAGATTGCAACCAGAG+AGG 0.704581 3:-20427520 None:intergenic
ATGGCTTCGAGAGAGGAGTG+GGG 0.704958 3:+20428862 MsG0380012594.01.T01:CDS
TATGTGGCGTTTATCAGACG+GGG 0.722185 3:+20426947 MsG0380012594.01.T01:CDS
GGTAACTCAATCTAAGTACG+GGG 0.722599 3:-20426980 None:intergenic
AGAGAGTGGAACTGCCCAAG+TGG 0.724694 3:-20428163 None:intergenic
ACGCTTTAAGATAAGCCCAA+GGG 0.726622 3:+20427451 MsG0380012594.01.T01:CDS
CTAACCATCAAAGAATACCG+AGG 0.755998 3:+20428058 MsG0380012594.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGATCATATTCTTAAAATTA+AGG + Chr3:20427385-20427404 MsG0380012594.01.T01:CDS 15.0%
!! GATCATATTCTTAAAATTAA+GGG + Chr3:20427386-20427405 MsG0380012594.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTAACCTACTTATATT+CGG - Chr3:20427764-20427783 None:intergenic 15.0%
!! ACTTCAATTAAATAAATTGG+AGG + Chr3:20426731-20426750 MsG0380012594.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTATTTAATTGAAGTAGC+CGG - Chr3:20426728-20426747 None:intergenic 20.0%
!! GCTACTTCAATTAAATAAAT+TGG + Chr3:20426728-20426747 MsG0380012594.01.T01:intron 20.0%
!!! AACTGAATGGATTAAAATAT+TGG + Chr3:20426917-20426936 MsG0380012594.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAAATTTTATGAAACTGAA+TGG + Chr3:20426904-20426923 MsG0380012594.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTAAATAGAATTTTCTCTA+GGG - Chr3:20428581-20428600 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTAAATAGAATTTTCTCT+AGG - Chr3:20428582-20428601 None:intergenic 20.0%
! AAAAGTTGTTATGCCATATT+TGG + Chr3:20426180-20426199 MsG0380012594.01.T01:intron 25.0%
! AAGAAAATAGTAGAAAAGTG+CGG + Chr3:20426837-20426856 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
! ATTATAGGTACAATGATTTC+TGG + Chr3:20428223-20428242 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
! CAAATTATACAGCATACAAA+TGG - Chr3:20427627-20427646 None:intergenic 25.0%
! GTTAGAACAATGTTTCAAAT+TGG + Chr3:20427658-20427677 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAGACTAAAATATTTGC+AGG + Chr3:20427490-20427509 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATTTAATTGAAGTAGCC+GGG - Chr3:20426727-20426746 None:intergenic 25.0%
!! ATTTAGGACATCTTTCTATT+CGG - Chr3:20428840-20428859 None:intergenic 25.0%
!! ATTTCCAATTTTTGCAAAGA+AGG - Chr3:20428409-20428428 None:intergenic 25.0%
!!! TAGTGATGATTTTGAAATCT+TGG + Chr3:20428921-20428940 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAGTATCTCTAGAATTGTT+AGG + Chr3:20428115-20428134 MsG0380012594.01.T01:CDS 25.0%
AAAGTTTCAAGGGATCTAAA+TGG - Chr3:20428268-20428287 None:intergenic 30.0%
AAATATTGGAGACTGATATG+TGG + Chr3:20426931-20426950 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
AAGGGCAGTTTATTATTCAT+AGG - Chr3:20429012-20429031 None:intergenic 30.0%
AAGGTAACTCAATCTAAGTA+CGG - Chr3:20426985-20427004 None:intergenic 30.0%
AATCAGTAACTATGCCATTA+TGG + Chr3:20427198-20427217 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTCATTACTACCAAATA+TGG - Chr3:20426196-20426215 None:intergenic 30.0%
ACTCGAGATTTAATAGTTGA+TGG - Chr3:20428973-20428992 None:intergenic 30.0%
AGAAAGATGTCCTAAATTGA+TGG + Chr3:20428843-20428862 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
AGCAATTTGAACTTAAAGCT+TGG + Chr3:20426424-20426443 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
ATACAGCATACAAATGGAAT+TGG - Chr3:20427621-20427640 None:intergenic 30.0%
ATATGATGAATGGAGAGAAA+TGG + Chr3:20427967-20427986 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGTAACTATGCCATTAT+GGG + Chr3:20427199-20427218 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGTATAATGAGTGTGAT+TGG + Chr3:20426348-20426367 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATGGACAAAGTAGAAA+GGG - Chr3:20429071-20429090 None:intergenic 30.0%
ATGAGTTTGCAAAAATCTGA+AGG - Chr3:20427692-20427711 None:intergenic 30.0%
ATTGTTTCAGAGAATTGAGT+TGG - Chr3:20428894-20428913 None:intergenic 30.0%
ATTTGACATTAAACAGTTGG+CGG + Chr3:20427826-20427845 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
GCAATTTGAACTTAAAGCTT+GGG + Chr3:20426425-20426444 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
GCAGTTTATTATTCATAGGT+TGG - Chr3:20429008-20429027 None:intergenic 30.0%
TAAGCATGTCATATGATGAA+TGG + Chr3:20427957-20427976 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
TACAGCATACAAATGGAATT+GGG - Chr3:20427620-20427639 None:intergenic 30.0%
TCAGTATAATGAGTGTGATT+GGG + Chr3:20426349-20426368 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
TGAGTTTGCAAAAATCTGAA+GGG - Chr3:20427691-20427710 None:intergenic 30.0%
TGGATTTGACATTAAACAGT+TGG + Chr3:20427823-20427842 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
TTAAGCAAGGATTTGAAGAT+AGG + Chr3:20426028-20426047 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
TTACGTCATCTTAATCTGAA+AGG + Chr3:20427716-20427735 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
TTTAACCTACTTATATTCGG+TGG - Chr3:20427761-20427780 None:intergenic 30.0%
! AACAAATTTTTCTGTACCCT+TGG - Chr3:20427470-20427489 None:intergenic 30.0%
! ACAAATTTTTCTGTACCCTT+GGG - Chr3:20427469-20427488 None:intergenic 30.0%
! AGAAAATAGTAGAAAAGTGC+GGG + Chr3:20426838-20426857 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTGTTCATCATGCTTTTG+TGG + Chr3:20426773-20426792 MsG0380012594.01.T01:intron 30.0%
! TTATACTGATTATGCGTACA+AGG - Chr3:20426338-20426357 None:intergenic 30.0%
! TTTGTTCATCATGCTTTTGT+GGG + Chr3:20426774-20426793 MsG0380012594.01.T01:intron 30.0%
! TTTTAGACGATATCTGTAAC+GGG + Chr3:20426592-20426611 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATAGAATTTTCTCTAGGG+CGG - Chr3:20428578-20428597 None:intergenic 30.0%
!! GTTTTAGACGATATCTGTAA+CGG + Chr3:20426591-20426610 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
!! TATCCAAATCTTGAGTTGAT+CGG + Chr3:20426813-20426832 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTTCGCTTTTTATTAAGCA+AGG + Chr3:20426015-20426034 MsG0380012594.01.T01:CDS 30.0%
AAACAACGCTTCAGATTAGA+AGG - Chr3:20427014-20427033 None:intergenic 35.0%
AAATCTACAATGGTCCTCTT+CGG + Chr3:20428645-20428664 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AACAACGCTTCAGATTAGAA+GGG - Chr3:20427013-20427032 None:intergenic 35.0%
AAGGAAGGCTTCAAATTTCA+GGG + Chr3:20427864-20427883 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAAGTAGCATCAATCAT+GGG + Chr3:20426696-20426715 MsG0380012594.01.T01:intron 35.0%
AGACAAAAGTGAAGAAGAGT+TGG + Chr3:20427130-20427149 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTGAGTTAATCAAGCTT+TGG + Chr3:20427075-20427094 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTTTCTTGCTGATCAAA+AGG + Chr3:20426074-20426093 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AGGTAACTCAATCTAAGTAC+GGG - Chr3:20426984-20427003 None:intergenic 35.0%
AGTAGTGGTGATTGTGAAAT+TGG + Chr3:20426120-20426139 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
ATAATGAGTGTGATTGGGAT+GGG + Chr3:20426354-20426373 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
ATACAAAGCTCTTGAAGCAA+AGG - Chr3:20428343-20428362 None:intergenic 35.0%
ATATGGTAGAGAGAACGAAA+AGG + Chr3:20426269-20426288 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGCAAGAAATCCCTAAA+CGG + Chr3:20427312-20427331 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTGCTCATGTATCTTG+TGG - Chr3:20426413-20426432 None:intergenic 35.0%
CAACATGAGAGAATGAAGAT+TGG - Chr3:20428755-20428774 None:intergenic 35.0%
CATGAATGGACAAAGTAGAA+AGG - Chr3:20429072-20429091 None:intergenic 35.0%
CCTTCCTTCTTTGCAAAAAT+TGG + Chr3:20428402-20428421 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
CTAGAACTAAAGAGATGTGA+TGG + Chr3:20428484-20428503 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
CTCAAATCGCAAAGTTTCAA+GGG - Chr3:20428278-20428297 None:intergenic 35.0%
GACAAAAGTGAAGAAGAGTT+GGG + Chr3:20427131-20427150 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
GATTTAGCAAAATCAGTGTC+AGG + Chr3:20427260-20427279 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
GCAGTCTAACTATAACATGT+TGG + Chr3:20428692-20428711 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
GCTGATCAAAAGGATAGATT+GGG + Chr3:20426084-20426103 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
GGAATTGACAAATTCAGTAG+TGG + Chr3:20426105-20426124 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGCTCTTGAAGCAAA+GGG - Chr3:20428342-20428361 None:intergenic 35.0%
TAGTACTTACCATCCCATAA+TGG - Chr3:20427215-20427234 None:intergenic 35.0%
TATAATGAGTGTGATTGGGA+TGG + Chr3:20426353-20426372 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TATCACCATCTTCCAAATCA+AGG - Chr3:20427358-20427377 None:intergenic 35.0%
TCACTGATATTATCAGCCTT+GGG - Chr3:20428463-20428482 None:intergenic 35.0%
TCAGATTAGAAGGGAAGTTA+AGG - Chr3:20427004-20427023 None:intergenic 35.0%
TCTTTGGTCCAAATCTACAA+TGG + Chr3:20428635-20428654 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TGCGATGGAATAGAGATTAT+AGG + Chr3:20428208-20428227 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TGCTGATCAAAAGGATAGAT+TGG + Chr3:20426083-20426102 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAAGTTGAAGACTTCTT+TGG + Chr3:20428619-20428638 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATCAGCAAGAAACTCT+AGG - Chr3:20426074-20426093 None:intergenic 35.0%
! AAAATAGTAGAAAAGTGCGG+GGG + Chr3:20426840-20426859 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! AATTGCCATCTAGCTTGAAA+AGG + Chr3:20428521-20428540 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGCATAGTTACTGATTGT+TGG - Chr3:20427196-20427215 None:intergenic 35.0%
! ATTGCCATCTAGCTTGAAAA+GGG + Chr3:20428522-20428541 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! CAGTGCTTTTCTTGAAAAGT+TGG + Chr3:20428600-20428619 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! CCAATTTTTGCAAAGAAGGA+AGG - Chr3:20428405-20428424 None:intergenic 35.0%
! GAAAATAGTAGAAAAGTGCG+GGG + Chr3:20426839-20426858 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! GCCATATTTGGTAGTAATGA+AGG + Chr3:20426192-20426211 MsG0380012594.01.T01:intron 35.0%
! TATTGATTGCCAAGAATTGC+AGG + Chr3:20428429-20428448 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGTTCTACGTTTCCGAA+GGG + Chr3:20427038-20427057 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTACGTTCAGACAGTCA+TGG + Chr3:20426306-20426325 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTGTTCTACGTTTCCGA+AGG + Chr3:20427037-20427056 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
!! ACCTTTAGCTCTAGAAACAT+TGG + Chr3:20426866-20426885 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGCTGACTGATTTTGTTGT+GGG + Chr3:20427791-20427810 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
!! CATCACATCTCTTTAGTTCT+AGG - Chr3:20428486-20428505 None:intergenic 35.0%
!! CCTTTAGCTCTAGAAACATT+GGG + Chr3:20426867-20426886 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTAGCTCTAGAAACATTG+GGG + Chr3:20426868-20426887 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAGTTAATCAAGCTTTGGA+TGG + Chr3:20427079-20427098 MsG0380012594.01.T01:CDS 35.0%
AAATTCCCTGAGAATTGCTC+GGG - Chr3:20426487-20426506 None:intergenic 40.0%
AACACATCTCTCTGTCTTAG+AGG + Chr3:20428006-20428025 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AACCAAATAGAAACCTCGTG+AGG + Chr3:20428035-20428054 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AACTCAACCATCTTCAAGGA+AGG + Chr3:20427849-20427868 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AAGGCTTCAAATTTCAGGGT+TGG + Chr3:20427868-20427887 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
ACATGTCAGAATGGAAGGAA+TGG + Chr3:20428299-20428318 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTTCCGCTTACTAATAG+AGG + Chr3:20427283-20427302 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AGATGCCACCGAATATAAGT+AGG + Chr3:20427753-20427772 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
ATATGTGGCGTTTATCAGAC+GGG + Chr3:20426946-20426965 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
ATTTAATTGAAGTAGCCGGG+TGG - Chr3:20426724-20426743 None:intergenic 40.0%
CAAGGAAGGCTTCAAATTTC+AGG + Chr3:20427863-20427882 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
CAAGGAAGTAGCATCAATCA+TGG + Chr3:20426695-20426714 MsG0380012594.01.T01:intron 40.0%
CTAACCATCAAAGAATACCG+AGG + Chr3:20428058-20428077 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
CTCAAGAAGCTTTCCATTTC+AGG + Chr3:20428184-20428203 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GAAATTCCCTGAGAATTGCT+CGG - Chr3:20426488-20426507 None:intergenic 40.0%
GAAGAGGACCATTGTAGATT+TGG - Chr3:20428646-20428665 None:intergenic 40.0%
GAATTGAAGCCTGCAATTCT+TGG - Chr3:20428441-20428460 None:intergenic 40.0%
GAGTTCCGCTTACTAATAGA+GGG + Chr3:20427284-20427303 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GATATGTGGCGTTTATCAGA+CGG + Chr3:20426945-20426964 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GATGAATGGAGAGAAATGGA+TGG + Chr3:20427971-20427990 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGAGCACATGTCAGAA+TGG + Chr3:20428290-20428309 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GCTCAAATCGCAAAGTTTCA+AGG - Chr3:20428279-20428298 None:intergenic 40.0%
GGTAACTCAATCTAAGTACG+GGG - Chr3:20426983-20427002 None:intergenic 40.0%
GTAACTATGCCATTATGGGA+TGG + Chr3:20427203-20427222 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
GTCACTGATATTATCAGCCT+TGG - Chr3:20428464-20428483 None:intergenic 40.0%
GTGGATGAATCTGCGATATA+TGG + Chr3:20426252-20426271 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
TACCACCCTCTATTAGTAAG+CGG - Chr3:20427292-20427311 None:intergenic 40.0%
TAGGACATCTTTCTATTCGG+AGG - Chr3:20428837-20428856 None:intergenic 40.0%
TATTGTGACAACGCATGACA+AGG + Chr3:20426677-20426696 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
TCATGTTGTACGATAGTCCA+TGG + Chr3:20428767-20428786 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
TCTCTCGAAGCCATCAATTT+AGG - Chr3:20428856-20428875 None:intergenic 40.0%
TCTTACTTCCAGAAGATCCA+TGG - Chr3:20426656-20426675 None:intergenic 40.0%
TGATGTTGCGGCAACAAATT+TGG + Chr3:20427910-20427929 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGTCATTGTAAACAAGC+CGG - Chr3:20426395-20426414 None:intergenic 40.0%
TTACAATCCCCAAGCCAATT+TGG - Chr3:20428094-20428113 None:intergenic 40.0%
TTCTCAAACTCATAGCCCTT+CGG - Chr3:20427056-20427075 None:intergenic 40.0%
TTGAAAAGGGTCATCCTTTG+TGG + Chr3:20428535-20428554 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAATCTCAGTGTGAGAA+AGG - Chr3:20427592-20427611 None:intergenic 40.0%
TTGCCGATCAACTCAAGATT+TGG - Chr3:20426819-20426838 None:intergenic 40.0%
TTGGGCTTATCTTAAAGCGT+TGG - Chr3:20427451-20427470 None:intergenic 40.0%
! AAATAGTAGAAAAGTGCGGG+GGG + Chr3:20426841-20426860 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAGCGTATAGTGAAGACT+TGG + Chr3:20426515-20426534 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
! TAAATTGATGGCTTCGAGAG+AGG + Chr3:20428855-20428874 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGAAGCCTTCCTTGAAGA+TGG - Chr3:20427859-20427878 None:intergenic 40.0%
!! AACGCTTTAAGATAAGCCCA+AGG + Chr3:20427450-20427469 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
!! ACGCTTTAAGATAAGCCCAA+GGG + Chr3:20427451-20427470 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGACCCTTTTCAAGCTAGA+TGG - Chr3:20428529-20428548 None:intergenic 40.0%
!! CCCAATGTTTCTAGAGCTAA+AGG - Chr3:20426870-20426889 None:intergenic 40.0%
!! CTGAAGGCTTGCTAAAGTAT+CGG + Chr3:20427102-20427121 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGCTGACTGATTTTGTTG+TGG + Chr3:20427790-20427809 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAAGGCTTGCTAAAGTATC+GGG + Chr3:20427103-20427122 MsG0380012594.01.T01:CDS 40.0%
AATCTTGGAGTCCTTTCCAG+AGG + Chr3:20428936-20428955 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
AATTTGGAAAGCTCCTGCCT+CGG - Chr3:20428078-20428097 None:intergenic 45.0%
ACAGCTACACATATCCGAAG+AGG - Chr3:20428662-20428681 None:intergenic 45.0%
AGCCTCACGAGGTTTCTATT+TGG - Chr3:20428040-20428059 None:intergenic 45.0%
AGGAGCTTTCCAAATTGGCT+TGG + Chr3:20428082-20428101 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCAGATTCATCCACCAA+AGG - Chr3:20426249-20426268 None:intergenic 45.0%
ATTGCAGGCTTCAATTCCCA+AGG + Chr3:20428444-20428463 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
ATTGTAAACAAGCCGGGCAA+GGG - Chr3:20426388-20426407 None:intergenic 45.0%
CAATTGCAACAGAGACTAGC+TGG + Chr3:20426552-20426571 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
CCAGAAGATCCATGGCTAAA+CGG - Chr3:20426648-20426667 None:intergenic 45.0%
CTACTACTTCCGTTTAGCCA+TGG + Chr3:20426636-20426655 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
GACAAAGTAGAAAGGGAGCT+TGG - Chr3:20429064-20429083 None:intergenic 45.0%
GATACTACCAACTGCACCTT+TGG + Chr3:20426230-20426249 MsG0380012594.01.T01:intron 45.0%
GTCTCTGTTGCAATTGTCGT+TGG - Chr3:20426548-20426567 None:intergenic 45.0%
GTGGTCATTGTAAACAAGCC+GGG - Chr3:20426394-20426413 None:intergenic 45.0%
TAAGGGACTACACAGTCTGA+TGG + Chr3:20427403-20427422 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
TACGAGATTGCAACCAGAGA+GGG - Chr3:20427522-20427541 None:intergenic 45.0%
TATGTGGCGTTTATCAGACG+GGG + Chr3:20426947-20426966 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
TATTCCATCGCAGCCTGAAA+TGG - Chr3:20428200-20428219 None:intergenic 45.0%
TATTCGGAGGCTGCATAGAT+TGG - Chr3:20428824-20428843 None:intergenic 45.0%
TATTGATCCCGCTGATGTTG+CGG + Chr3:20427898-20427917 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
TGAGCACATGTCAGAATGGA+AGG + Chr3:20428294-20428313 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
TGGAAAGCTTCTTGAGAGAG+TGG - Chr3:20428180-20428199 None:intergenic 45.0%
TTCCGCTTACTAATAGAGGG+TGG + Chr3:20427287-20427306 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
! AAGAAGACTCTCCTCTGGAA+AGG - Chr3:20428950-20428969 None:intergenic 45.0%
! ATTTGTTGCCGCAACATCAG+CGG - Chr3:20427909-20427928 None:intergenic 45.0%
! CATGGCTAGAATCGTTTTCC+GGG + Chr3:20428785-20428804 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
! CCATGGCTAGAATCGTTTTC+CGG + Chr3:20428784-20428803 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
! CGATATCTGTAACGGGAATG+TGG + Chr3:20426599-20426618 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGCTTTCCAAATTGGCTT+GGG + Chr3:20428083-20428102 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
! GGCAGGGAACTTTTCAACTT+CGG - Chr3:20428376-20428395 None:intergenic 45.0%
! GTAACGGGAATGTGGAATGT+TGG + Chr3:20426607-20426626 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGGTGCAGTTGGTAGTATC+CGG - Chr3:20426230-20426249 None:intergenic 45.0%
!! ATCAAGCTTTGGATGGCTGA+AGG + Chr3:20427086-20427105 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
!! CATTTGGTGCTGCCTTGATT+TGG + Chr3:20427343-20427362 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
!! GAAGGCTTGCTAAAGTATCG+GGG + Chr3:20427104-20427123 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGCTTTCCAAATTGGCTTG+GGG + Chr3:20428084-20428103 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
!! TGCAAAGAAGGAAGGTGTTG+AGG - Chr3:20428397-20428416 None:intergenic 45.0%
!! TGCTGCCTTGATTTGGAAGA+TGG + Chr3:20427350-20427369 MsG0380012594.01.T01:CDS 45.0%
AAATGCGACGCGTCCGTTTA+GGG - Chr3:20427328-20427347 None:intergenic 50.0%
ACTACCAACTGCACCTTTGG+TGG + Chr3:20426233-20426252 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
ATCTCACCCGAGCAATTCTC+AGG + Chr3:20426478-20426497 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
ATGAAGGTAGACTCACACCC+CGG + Chr3:20426208-20426227 MsG0380012594.01.T01:intron 50.0%
CAATGACCCGAGATCCACAA+AGG - Chr3:20428552-20428571 None:intergenic 50.0%
CATCAATCATGGGATCCACC+CGG + Chr3:20426706-20426725 MsG0380012594.01.T01:intron 50.0%
CATTGTAAACAAGCCGGGCA+AGG - Chr3:20426389-20426408 None:intergenic 50.0%
CCATCAAAGAATACCGAGGC+AGG + Chr3:20428062-20428081 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
CCGGAAAACGATTCTAGCCA+TGG - Chr3:20428787-20428806 None:intergenic 50.0%
CCGTTTAGCCATGGATCTTC+TGG + Chr3:20426645-20426664 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
CCTGCCTCGGTATTCTTTGA+TGG - Chr3:20428065-20428084 None:intergenic 50.0%
CTACGAGATTGCAACCAGAG+AGG - Chr3:20427523-20427542 None:intergenic 50.0%
CTTTCCATTTCAGGCTGCGA+TGG + Chr3:20428193-20428212 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
GAGGCAGGAGCTTTCCAAAT+TGG + Chr3:20428077-20428096 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
GATGGAAGAAGACTCTCCTC+TGG - Chr3:20428955-20428974 None:intergenic 50.0%
GCGGAACTCAACCATCTTCA+AGG + Chr3:20427845-20427864 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
GGGTCATCCTTTGTGGATCT+CGG + Chr3:20428542-20428561 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
GGTCATCCTTTGTGGATCTC+GGG + Chr3:20428543-20428562 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
GTGCAGTGCAAAAGGCAATG+AGG - Chr3:20428725-20428744 None:intergenic 50.0%
GTTCCCAGTTACCACCACTT+GGG + Chr3:20428149-20428168 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
TCTCACCCGAGCAATTCTCA+GGG + Chr3:20426479-20426498 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
TGTTCCCAGTTACCACCACT+TGG + Chr3:20428148-20428167 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
TTTGTTGCCGCAACATCAGC+GGG - Chr3:20427908-20427927 None:intergenic 50.0%
! AGTCTGATGGTAGAAGCGCA+GGG + Chr3:20427416-20427435 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
! TCATCCACCAAAGGTGCAGT+TGG - Chr3:20426240-20426259 None:intergenic 50.0%
! TTTGTTGTGGGAAAGCAGCG+TGG + Chr3:20427803-20427822 MsG0380012594.01.T01:CDS 50.0%
!! AAGAAGGAAGGTGTTGAGGC+AGG - Chr3:20428393-20428412 None:intergenic 50.0%
!! AGAAGGAAGGTGTTGAGGCA+GGG - Chr3:20428392-20428411 None:intergenic 50.0%
!! AGGTGCAGTTGGTAGTATCC+GGG - Chr3:20426229-20426248 None:intergenic 50.0%
!! CTTTGATGGTTAGCCTCACG+AGG - Chr3:20428051-20428070 None:intergenic 50.0%
ACTGCCCAAGTGGTGGTAAC+TGG - Chr3:20428156-20428175 None:intergenic 55.0%
AGAGAGTGGAACTGCCCAAG+TGG - Chr3:20428166-20428185 None:intergenic 55.0%
ATGGCTTCGAGAGAGGAGTG+GGG + Chr3:20428862-20428881 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
CAAATGCGACGCGTCCGTTT+AGG - Chr3:20427329-20427348 None:intergenic 55.0%
CGGAGGCTGCATAGATTGGA+GGG - Chr3:20428820-20428839 None:intergenic 55.0%
CTAAACGGACGCGTCGCATT+TGG + Chr3:20427327-20427346 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
CTCGACAGCTTGCCAGAAGA+GGG + Chr3:20429034-20429053 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
CTGCCCAAGTGGTGGTAACT+GGG - Chr3:20428155-20428174 None:intergenic 55.0%
CTGGCAAGCTGTCGAGACAA+GGG - Chr3:20429030-20429049 None:intergenic 55.0%
GAGCTTGGTAGACCCTCTTC+TGG - Chr3:20429049-20429068 None:intergenic 55.0%
GATGGCTTCGAGAGAGGAGT+GGG + Chr3:20428861-20428880 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
GTGAACGCGTGCAGTGCAAA+AGG - Chr3:20428733-20428752 None:intergenic 55.0%
TCGGAGGCTGCATAGATTGG+AGG - Chr3:20428821-20428840 None:intergenic 55.0%
TCTCGACAGCTTGCCAGAAG+AGG + Chr3:20429033-20429052 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
TCTGGCAAGCTGTCGAGACA+AGG - Chr3:20429031-20429050 None:intergenic 55.0%
TGATGGCTTCGAGAGAGGAG+TGG + Chr3:20428860-20428879 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
TGGGTAAGACAACCCTTGCC+CGG + Chr3:20426373-20426392 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
! ATGGTAGAAGCGCAGGGTTG+TGG + Chr3:20427422-20427441 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
! CAGTCTGATGGTAGAAGCGC+AGG + Chr3:20427415-20427434 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
! GGCTAGAATCGTTTTCCGGG+AGG + Chr3:20428788-20428807 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
! TTGCAGGTGTTGTCCCTCTC+TGG + Chr3:20427506-20427525 MsG0380012594.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTGCAGTTGGTAGTATCCG+GGG - Chr3:20426228-20426247 None:intergenic 55.0%
GAGTGGAACTGCCCAAGTGG+TGG - Chr3:20428163-20428182 None:intergenic 60.0%
ATTGGAGGGCAGCTGCCTCC+CGG - Chr3:20428806-20428825 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 20426003 20429092 20426003 ID=MsG0380012594.01;Name=MsG0380012594.01
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Chr3 exon 20426801 20429092 20426801 ID=MsG0380012594.01.T01:exon:3659;Parent=MsG0380012594.01.T01
Chr3 exon 20426231 20426701 20426231 ID=MsG0380012594.01.T01:exon:3658;Parent=MsG0380012594.01.T01
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Chr3 mRNA 20427242 20429092 20427242 ID=MsG0380012594.01.T02;Parent=MsG0380012594.01;Name=MsG0380012594.01.T02;_AED=0.26;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|0|0|3|0|556
Chr3 exon 20428586 20429092 20428586 ID=MsG0380012594.01.T02:exon:3662;Parent=MsG0380012594.01.T02
Chr3 exon 20428206 20428474 20428206 ID=MsG0380012594.01.T02:exon:3661;Parent=MsG0380012594.01.T02
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