AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015298.01

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MsG0380015298.01.T01 AT2G16750 42.651 347 178 8 167 513 265 590 1.64e-74 247
MsG0380015298.01.T01 AT1G70460 42.282 298 161 6 167 462 341 629 4.94e-68 232
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MsG0380015298.01.T01 AT5G18610 36.182 351 198 6 159 489 62 406 1.00e-64 219
MsG0380015298.01.T01 AT4G35030 47.303 241 121 4 167 406 92 327 1.89e-64 213
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MsG0380015298.01.T01 AT1G68690 40.823 316 165 7 148 456 346 646 2.87e-63 219
MsG0380015298.01.T01 AT3G13690 40.741 297 164 7 167 462 399 684 3.29e-63 220
MsG0380015298.01.T01 AT3G13690 40.741 297 164 7 167 462 399 684 3.29e-63 220
MsG0380015298.01.T01 AT3G13690 40.741 297 164 7 167 462 399 684 3.29e-63 220
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MsG0380015298.01.T01 AT1G55200 40.940 298 162 8 167 462 367 652 3.75e-62 216
MsG0380015298.01.T01 AT1G55200 40.940 298 162 8 167 462 367 652 3.75e-62 216
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MsG0380015298.01.T01 AT5G18500 37.107 318 191 6 167 484 154 462 1.93e-58 201
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MsG0380015298.01.T01 AT5G18500 37.107 318 191 6 167 484 154 462 1.93e-58 201
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MsG0380015298.01.T01 AT5G18500 37.107 318 191 6 167 484 154 462 1.93e-58 201
MsG0380015298.01.T01 AT5G18500 37.107 318 191 6 167 484 154 462 1.93e-58 201
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MsG0380015298.01.T01 AT1G56720 38.411 302 173 7 167 466 167 457 2.84e-56 196
MsG0380015298.01.T01 AT1G56720 38.411 302 173 7 167 466 167 457 2.84e-56 196
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MsG0380015298.01.T01 AT2G28250 37.963 324 173 10 163 471 194 504 1.15e-55 196
MsG0380015298.01.T01 AT2G28250 37.963 324 173 10 163 471 194 504 1.15e-55 196
MsG0380015298.01.T01 AT2G28250 37.963 324 173 10 163 471 194 504 1.15e-55 196
MsG0380015298.01.T01 AT2G28250 37.963 324 173 10 163 471 194 504 1.15e-55 196
MsG0380015298.01.T01 AT3G17420 37.954 303 175 7 167 467 142 433 2.45e-55 192
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MsG0380015298.01.T01 AT4G02630 37.217 309 178 9 167 472 150 445 4.21e-55 192
MsG0380015298.01.T01 AT2G28930 35.505 307 182 6 163 460 56 355 4.65e-55 191
MsG0380015298.01.T01 AT2G17220 35.258 329 194 8 157 474 65 385 5.93e-55 190
MsG0380015298.01.T01 AT2G17220 35.258 329 194 8 157 474 66 386 6.40e-55 190
MsG0380015298.01.T01 AT5G10530 36.709 316 186 5 151 466 312 613 6.63e-55 195
MsG0380015298.01.T01 AT4G32710 40.483 331 177 9 167 493 377 691 8.16e-55 196
MsG0380015298.01.T01 AT2G42960 38.188 309 174 8 167 471 171 466 1.03e-54 192
MsG0380015298.01.T01 AT2G42960 38.188 309 174 8 167 471 171 466 1.03e-54 192
MsG0380015298.01.T01 AT2G42960 38.188 309 174 8 167 471 171 466 1.03e-54 192
MsG0380015298.01.T01 AT2G42960 38.188 309 174 8 167 471 171 466 1.03e-54 192
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MsG0380015298.01.T01 AT1G07570 37.097 310 173 7 163 460 52 351 2.05e-54 189
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MsG0380015298.01.T01 AT1G06700 36.027 297 182 6 167 460 56 347 1.97e-50 177
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MsG0380015298.01.T01 AT1G26970 36.129 310 173 7 163 460 67 363 3.79e-50 177
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MsG0380015298.01.T01 AT1G51830 36.426 291 172 7 166 456 375 652 4.81e-50 182
MsG0380015298.01.T01 AT2G13800 36.213 301 178 10 166 462 262 552 4.95e-50 181
MsG0380015298.01.T01 AT2G13800 36.213 301 178 10 166 462 262 552 4.95e-50 181
MsG0380015298.01.T01 AT2G30730 36.027 297 182 6 167 460 45 336 4.99e-50 175
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MsG0380015298.01.T01 AT4G23190 34.783 322 191 9 147 459 235 546 2.25e-49 179
MsG0380015298.01.T01 AT3G46340 34.915 295 180 6 166 460 574 856 2.42e-49 182
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MsG0380015298.01.T01 AT1G48210 36.949 295 172 8 171 460 60 345 2.76e-49 174
MsG0380015298.01.T01 AT1G48210 36.949 295 172 8 171 460 60 345 2.76e-49 174
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MsG0380015298.01.T01 AT1G51890 35.714 294 175 7 166 459 495 774 4.96e-49 181
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MsG0380015298.01.T01 AT3G62220 36.093 302 181 7 171 470 61 352 1.03e-48 172
MsG0380015298.01.T01 AT1G71830 35.644 303 181 10 164 462 287 579 1.07e-48 178
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MsG0380015298.01.T01 AT2G28990 35.811 296 177 7 165 460 565 847 2.14e-48 180
MsG0380015298.01.T01 AT1G51850 35.395 291 175 7 166 456 547 824 2.65e-48 179
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MsG0380015298.01.T01 AT1G67520 33.136 338 217 5 139 475 248 577 2.78e-48 176
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MsG0380015298.01.T01 AT5G58940 36.301 292 174 6 167 455 135 417 2.88e-48 174
MsG0380015298.01.T01 AT5G58940 36.301 292 174 6 167 455 135 417 2.88e-48 174
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MsG0380015298.01.T01 AT4G23280 34.185 313 196 6 165 476 330 633 1.41e-47 175
MsG0380015298.01.T01 AT1G51820 34.708 291 177 7 166 456 305 582 1.68e-47 174
MsG0380015298.01.T01 AT2G19230 36.610 295 172 7 167 460 559 839 1.70e-47 177
MsG0380015298.01.T01 AT2G37710 33.779 299 185 6 166 462 334 621 1.81e-47 175
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MsG0380015298.01.T01 AT1G56130 36.455 299 176 7 167 464 483 768 1.98e-47 176
MsG0380015298.01.T01 AT2G14510 36.893 309 180 8 148 455 533 827 2.00e-47 177
MsG0380015298.01.T01 AT1G24030 39.344 244 132 6 167 403 50 284 2.01e-47 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G70740 31.579 342 211 8 139 465 9 342 2.02e-47 170
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MsG0380015298.01.T01 AT4G00960 32.333 300 189 7 164 459 41 330 1.27e-44 162
MsG0380015298.01.T01 AT1G25390 35.017 297 182 6 167 461 279 566 1.36e-44 166
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MsG0380015298.01.T01 AT5G02070 34.564 298 177 7 167 455 351 639 1.39e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT4G23300 33.861 316 196 7 147 459 322 627 1.41e-44 167
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MsG0380015298.01.T01 AT4G29180 31.818 308 185 7 166 460 554 849 1.45e-44 169
MsG0380015298.01.T01 AT4G29180 31.818 308 185 7 166 460 556 851 1.54e-44 169
MsG0380015298.01.T01 AT2G43690 33.775 302 183 6 166 464 288 575 1.56e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G70530 33.639 327 199 9 167 491 311 621 1.64e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT3G21630 36.120 299 171 11 165 459 308 590 1.66e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT4G23230 35.333 300 175 6 165 459 323 608 1.67e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G29740 34.459 296 178 9 167 459 665 947 1.71e-44 169
MsG0380015298.01.T01 AT1G79680 34.364 291 178 7 167 455 421 700 1.73e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 328 611 1.75e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT2G48010 32.121 330 193 8 149 468 258 566 1.83e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT4G38830 32.615 325 200 9 146 461 306 620 1.93e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G29740 34.459 296 178 9 167 459 665 947 2.01e-44 168
MsG0380015298.01.T01 AT4G26540 32.759 348 205 12 143 480 731 1059 2.05e-44 168
MsG0380015298.01.T01 AT5G54590 33.887 301 176 9 161 459 97 376 2.17e-44 162
MsG0380015298.01.T01 AT5G54590 33.887 301 176 9 161 459 97 376 2.17e-44 162
MsG0380015298.01.T01 AT5G54590 33.887 301 176 9 161 459 97 376 2.17e-44 162
MsG0380015298.01.T01 AT5G56040 34.769 325 184 11 146 460 732 1038 2.23e-44 168
MsG0380015298.01.T01 AT1G80640 34.954 329 185 10 139 462 115 419 2.35e-44 162
MsG0380015298.01.T01 AT2G43690 33.775 302 183 6 166 464 324 611 2.44e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT2G43690 33.775 302 183 6 166 464 324 611 2.44e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT2G23200 33.447 293 183 7 169 460 478 759 2.63e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT4G23260 34.576 295 185 5 165 459 314 600 2.79e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT4G23240 32.770 296 189 6 165 459 14 300 2.86e-44 160
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 452 735 3.28e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 452 735 3.28e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 478 761 3.37e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 478 761 3.37e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 478 761 3.37e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G61490 34.471 293 183 5 167 459 478 761 3.37e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT4G23250 33.333 315 202 5 165 479 345 651 3.56e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT4G23250 33.333 315 202 5 165 479 340 646 3.64e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT5G25930 36.066 305 177 9 165 462 674 967 3.66e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT4G23260 34.576 295 185 5 165 459 325 611 3.83e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT5G16000 34.539 304 182 10 163 462 296 586 4.10e-44 165
MsG0380015298.01.T01 AT2G29000 34.576 295 180 7 166 460 554 835 4.18e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G51870 33.904 292 177 8 166 456 572 848 4.51e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G51870 33.904 292 177 8 166 456 520 796 4.61e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G60800 35.314 303 181 11 164 462 219 510 5.02e-44 164
MsG0380015298.01.T01 AT1G49730 40.969 227 119 6 166 388 316 531 5.70e-44 165
MsG0380015298.01.T01 AT3G13065 35.179 307 179 9 158 460 394 684 6.44e-44 165
MsG0380015298.01.T01 AT4G04570 37.917 240 142 4 146 385 316 548 6.98e-44 164
MsG0380015298.01.T01 AT1G51910 34.304 309 185 9 166 473 562 853 7.66e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G66880 36.364 297 175 7 167 461 578 862 7.93e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT5G66790 35.836 293 176 6 167 455 302 586 8.11e-44 164
MsG0380015298.01.T01 AT1G66880 36.364 297 175 7 167 461 957 1241 8.12e-44 167
MsG0380015298.01.T01 AT1G16150 35.395 291 174 7 167 455 412 690 8.15e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT1G24650 34.520 281 176 6 175 453 543 817 9.50e-44 166
MsG0380015298.01.T01 AT2G19210 34.343 297 177 8 167 460 566 847 1.03e-43 166
MsG0380015298.01.T01 AT3G45430 35.811 296 178 7 166 461 331 614 1.04e-43 164
MsG0380015298.01.T01 AT3G45430 35.811 296 178 7 166 461 331 614 1.04e-43 164
MsG0380015298.01.T01 AT3G45430 35.811 296 178 7 166 461 331 614 1.04e-43 164
MsG0380015298.01.T01 AT2G26330 31.595 326 205 8 169 491 638 948 1.07e-43 166
MsG0380015298.01.T01 AT5G38210 35.505 307 184 7 167 471 342 636 1.11e-43 164
MsG0380015298.01.T01 AT4G11900 31.077 325 211 6 157 479 515 828 1.18e-43 166
MsG0380015298.01.T01 AT4G11900 31.077 325 211 6 157 479 446 759 1.30e-43 165
MsG0380015298.01.T01 AT4G04540 38.288 222 131 3 164 385 338 553 1.37e-43 163
MsG0380015298.01.T01 AT5G38210 35.505 307 184 7 167 471 360 654 1.49e-43 164
MsG0380015298.01.T01 AT5G24080 31.270 307 200 7 160 466 386 681 1.64e-43 165
MsG0380015298.01.T01 AT5G24080 31.270 307 200 7 160 466 386 681 1.64e-43 165
MsG0380015298.01.T01 AT1G60800 35.314 303 181 11 164 462 286 577 2.02e-43 163
MsG0380015298.01.T01 AT2G35620 31.790 324 201 7 146 462 264 574 2.30e-43 162
MsG0380015298.01.T01 AT2G35620 31.790 324 201 7 146 462 264 574 2.30e-43 162

Find 114 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 224 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCCTGTGGTCACAGATATT+TGG 0.206793 3:-68093349 MsG0380015298.01.T01:intron
CCAAATATTGTTCCTCTTGT+TGG 0.223257 3:-68094177 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTGATGGTGAATTTGGATAA+TGG 0.236350 3:-68094989 MsG0380015298.01.T01:CDS
CCAACAAGAGGAACAATATT+TGG 0.239866 3:+68094177 None:intergenic
GTGTGTGTAGGTAGGGTGTT+GGG 0.240574 3:-68094342 MsG0380015298.01.T01:intron
CTGTTGCTCATTCTTTGATT+AGG 0.243820 3:-68094898 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTGAAGTTGTAAATAGAAAT+AGG 0.281549 3:-68092332 MsG0380015298.01.T01:three_prime_UTR
GTTGAGGAGAATTGAGTCTT+TGG 0.287660 3:-68094936 MsG0380015298.01.T01:CDS
AATCTGTTCATTCTAGTTTC+AGG 0.301224 3:-68095078 MsG0380015298.01.T01:CDS
AAAACTGTCAAAGGAACATT+TGG 0.303990 3:-68093470 MsG0380015298.01.T01:CDS
AATGTTAGTGTTGGTTTCTA+TGG 0.312808 3:+68095363 None:intergenic
AGTTTGTAGTTATGTGATTT+CGG 0.313398 3:-68093536 MsG0380015298.01.T01:intron
AAGACTGATGTGTATGCTTT+TGG 0.322729 3:-68093291 MsG0380015298.01.T01:CDS
GAGACGAGAATCTAGTCTTA+TGG 0.336790 3:-68093209 MsG0380015298.01.T01:CDS
TGATGGTGAATTTGGATAAT+GGG 0.349186 3:-68094988 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTCTTCTTCACCTTTCAGTA+TGG 0.349544 3:+68092608 None:intergenic
CAACACTCCCTTGGTCTGTT+AGG 0.349658 3:-68093950 MsG0380015298.01.T01:CDS
GGGGAAGGTGCTTTACTTGT+GGG 0.379287 3:+68095542 None:intergenic
AGAAGAAAGAAGAATGTTAG+AGG 0.396214 3:+68093842 None:intergenic
AGCATACACATCAGTCTTAT+CGG 0.401282 3:+68093296 None:intergenic
CATTCTTCTTTCTTCTAAGA+AGG 0.403207 3:-68093835 MsG0380015298.01.T01:CDS
GTGCTAAAGGTTAGATGTGA+GGG 0.405407 3:-68092357 MsG0380015298.01.T01:three_prime_UTR
GATGAAAAGTCACTTGGCTT+TGG 0.413564 3:-68092496 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCAGAAAGTGTCGAAATTTG+AGG 0.419095 3:+68095275 None:intergenic
GTAGGTAGGGTGTTGGGGAG+AGG 0.419189 3:-68094336 MsG0380015298.01.T01:intron
AAGGTGCTTTACTTGTGGGG+TGG 0.422387 3:+68095546 None:intergenic
GCTATGGCTTATCTGCATAA+TGG 0.423939 3:-68093900 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCTAGGAGTTTCAGAGTTTG+AGG 0.426097 3:-68092469 MsG0380015298.01.T01:CDS
TCGTCTAATATCAAATGAAC+AGG 0.428217 3:-68092168 MsG0380015298.01.T01:three_prime_UTR
AGATTTCTGTGCATTGTGTT+GGG 0.429116 3:-68095411 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR
CTAATCAAAGAATGAGCAAC+AGG 0.436746 3:+68094899 None:intergenic
TTGGTGTACAAGTATGTCTC+AGG 0.437234 3:-68094123 MsG0380015298.01.T01:CDS
CCCTTGGTCTGTTAGGTACA+AGG 0.444764 3:-68093943 MsG0380015298.01.T01:CDS
AACCTTTGAGAAAAGGTAAC+GGG 0.447519 3:+68092274 None:intergenic
GGCTAAACCATATTTACAAA+AGG 0.448830 3:-68092775 MsG0380015298.01.T01:CDS
AACACAATGCACAGAAATCT+AGG 0.449218 3:+68095414 None:intergenic
GGGAGAAAGAAAGGTGGGAA+GGG 0.453261 3:-68093978 MsG0380015298.01.T01:CDS
GATTCTTGCTAGAGTGCTAA+AGG 0.453268 3:-68092370 MsG0380015298.01.T01:three_prime_UTR
GTGATTTCGGATTAGCTACA+TGG 0.454884 3:-68093523 MsG0380015298.01.T01:CDS
GGTGTGTGTAGGTAGGGTGT+TGG 0.457566 3:-68094343 MsG0380015298.01.T01:intron
TAGATTTCTGTGCATTGTGT+TGG 0.460726 3:-68095412 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR
TCTTTGATTAGGTTTAGTTA+TGG 0.461389 3:-68094887 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTCCTTTGCAAAACTGTCAA+AGG 0.465100 3:-68093479 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCTAAACCATATTTACAAAA+GGG 0.468942 3:-68092774 MsG0380015298.01.T01:CDS
AGACGAGAATCTAGTCTTAT+GGG 0.469040 3:-68093208 MsG0380015298.01.T01:intron
TTGAGATTCTCAAATCAAAT+CGG 0.470179 3:-68092705 MsG0380015298.01.T01:CDS
TATTGAAACGAAAAGGTCTC+CGG 0.474615 3:-68093232 MsG0380015298.01.T01:CDS
TGCTGTTGCAATTAAGCAGT+TGG 0.474651 3:-68094268 MsG0380015298.01.T01:CDS
GGTTAGTGAATCTCTTGTTA+AGG 0.476152 3:-68094966 MsG0380015298.01.T01:CDS
ACTTTGTAACCTTTGAGAAA+AGG 0.476175 3:+68092267 None:intergenic
AGGTGCTTTACTTGTGGGGT+GGG 0.481534 3:+68095547 None:intergenic
TTAGCTGAGTCTGGTGGGTG+TGG 0.490842 3:-68095130 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTTCTGTTCTCAAGTTGAGT+TGG 0.492403 3:-68095050 MsG0380015298.01.T01:CDS
GTTAGGTACAAGGTTGCAGT+TGG 0.495943 3:-68093933 MsG0380015298.01.T01:CDS
GTATGTCTCAGGAGGAAGCT+TGG 0.497293 3:-68094112 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCATGGTTGTTAGCTGAGTC+TGG 0.500890 3:-68095139 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCAGTTGGACAAGGAAGATA+AGG 0.502200 3:-68094253 MsG0380015298.01.T01:CDS
TTCCCATGTTGGAAGTACTC+AGG 0.502703 3:+68093324 None:intergenic
CTCAAATTGCACTTCAGTTG+AGG 0.502980 3:+68092723 None:intergenic
TTACAGGGAGAAAGAAAGGT+GGG 0.503319 3:-68093983 MsG0380015298.01.T01:intron
AGGGGAAGGTGCTTTACTTG+TGG 0.505399 3:+68095541 None:intergenic
TATCGGATACTTTCCCATGT+TGG 0.505948 3:+68093313 None:intergenic
AGTTGGGATTGCAGAAGCTA+TGG 0.507297 3:-68093916 MsG0380015298.01.T01:CDS
GCAATAATCTCATGTATGCT+AGG 0.507625 3:+68092630 None:intergenic
TGTGTGTAGGTAGGGTGTTG+GGG 0.518783 3:-68094341 MsG0380015298.01.T01:intron
AGGATCGAGCAACTCTTCAA+TGG 0.519073 3:+68092743 None:intergenic
TTCTTCTAAGAAGGCTCCAA+AGG 0.520101 3:-68093826 MsG0380015298.01.T01:intron
TCCCATGTTGGAAGTACTCA+GGG 0.520564 3:+68093325 None:intergenic
TGCAATTAAGCAGTTGGACA+AGG 0.524635 3:-68094262 MsG0380015298.01.T01:CDS
AAGAAGGAGAGATAGGAAGA+AGG 0.529135 3:+68095583 None:intergenic
GGAAACCTATTGAAACGAAA+AGG 0.530327 3:-68093239 MsG0380015298.01.T01:CDS
AAGACTAGATTCTCGTCTCC+CGG 0.534759 3:+68093213 None:intergenic
AAACTAGAATGAACAGATTG+TGG 0.541533 3:+68095082 None:intergenic
GTGAGATTGTGTATGCTACT+AGG 0.544217 3:-68094865 MsG0380015298.01.T01:CDS
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GCTACTAGGAATTTCTCTAA+AGG 0.552663 3:-68094851 MsG0380015298.01.T01:intron
GGTTGTTAGCTGAGTCTGGT+GGG 0.555357 3:-68095135 MsG0380015298.01.T01:CDS
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AATCATCAATTCTCTACAGA+AGG 0.558143 3:+68094218 None:intergenic
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CACACAAGCAATCTTCATCT+CGG 0.579447 3:+68092307 None:intergenic
AGTGATCAGTACCGTGCAAG+TGG 0.581528 3:+68094085 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! ACAAAACTTATTTGCTAACT+TGG + Chr3:68094631-68094650 None:intergenic 25.0%
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!! TATAGATTTTCATTGTTTGC+GGG - Chr3:68095486-68095505 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
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!!! GTTCAATTCAGATTTTGATT+TGG - Chr3:68095513-68095532 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
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TCATTCTCTCAAATTGTTAC+TGG - Chr3:68094050-68094069 MsG0380015298.01.T01:intron 30.0%
TCGTCTAATATCAAATGAAC+AGG - Chr3:68095560-68095579 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
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! TTTTTGTGGGTTTTTCTTGA+TGG + Chr3:68092526-68092545 None:intergenic 30.0%
!! AATCTGTTCATTCTAGTTTC+AGG - Chr3:68092650-68092669 MsG0380015298.01.T01:CDS 30.0%
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!!! TTTTTTCTTTTGGAGACAAC+AGG + Chr3:68095146-68095165 None:intergenic 30.0%
AACACAATGCACAGAAATCT+AGG + Chr3:68092317-68092336 None:intergenic 35.0%
ACCCACAAAAACGATGAAAA+TGG - Chr3:68092535-68092554 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
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CCAAATATTGTTCCTCTTGT+TGG - Chr3:68093551-68093570 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
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GAGATTATTGCCATACTGAA+AGG - Chr3:68095110-68095129 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
GATGGTGAATTTGGATAATG+GGG - Chr3:68092741-68092760 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
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GGAAACCTATTGAAACGAAA+AGG - Chr3:68094489-68094508 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
GGTTAGTGAATCTCTTGTTA+AGG - Chr3:68092762-68092781 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
TAGATTTCTGTGCATTGTGT+TGG - Chr3:68092316-68092335 MsG0380015298.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TATTGAAACGAAAAGGTCTC+CGG - Chr3:68094496-68094515 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
TATTGGAACTCATTACTGGA+CGG - Chr3:68094468-68094487 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
TGAGTTAACACTTTGCGAAA+TGG - Chr3:68094543-68094562 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
TGTGTTGGAAATGTTAGTGT+TGG + Chr3:68092377-68092396 None:intergenic 35.0%
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TTCCTTTGCAAAACTGTCAA+AGG - Chr3:68094249-68094268 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCTCAAATTGTTACTGG+TGG - Chr3:68094053-68094072 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
TTCTTCTTCACCTTTCAGTA+TGG + Chr3:68095123-68095142 None:intergenic 35.0%
TTGTTAAGGAGTTGAAGTTG+AGG - Chr3:68092776-68092795 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
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! AAGACTGATGTGTATGCTTT+TGG - Chr3:68094437-68094456 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
! AGCATACACATCAGTCTTAT+CGG + Chr3:68094435-68094454 None:intergenic 35.0%
! CCTTTCCCCTTTTGTAAATA+TGG + Chr3:68094963-68094982 None:intergenic 35.0%
! GAAAATGAGTTGACCACAAT+TGG - Chr3:68093186-68093205 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
! GAATTCGGTTTTTCATGTGT+TGG - Chr3:68092490-68092509 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
! GGGAGAGAATTTTGTAAAGA+AGG + Chr3:68092164-68092183 None:intergenic 35.0%
! TTCCTTTGACAGTTTTGCAA+AGG + Chr3:68094254-68094273 None:intergenic 35.0%
! TTGACAGTTTTGCAAAGGAA+AGG + Chr3:68094249-68094268 None:intergenic 35.0%
!! AGACGAGAATCTAGTCTTAT+GGG - Chr3:68094520-68094539 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
!! GACCATTTTCATCGTTTTTG+TGG + Chr3:68092540-68092559 None:intergenic 35.0%
!! TGCATTGAGCTGTGTTTTTA+GGG - Chr3:68093415-68093434 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
!! TTGTTGACACATTGATTTGC+AGG - Chr3:68094932-68094951 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTCTGTTCTCAAGTTGAGT+TGG - Chr3:68092678-68092697 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACGGTTTTGATGGTGAATT+TGG - Chr3:68092732-68092751 MsG0380015298.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAGAGAGAGTGTGTTTTTTA+TGG + Chr3:68092224-68092243 None:intergenic 35.0%
!!! GGTTGTTTTTGGTTTTGTTG+TGG + Chr3:68092435-68092454 None:intergenic 35.0%
!!! TGATTTTTAGCCTCCAATTG+TGG + Chr3:68093202-68093221 None:intergenic 35.0%
!!! TGCTTTTGGAGTGGTTTTAT+TGG - Chr3:68094451-68094470 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
!!! TGTTTTTGGTTTTGTTGTGG+TGG + Chr3:68092432-68092451 None:intergenic 35.0%
!!! TTCTAGTTTTAGGGTGTGTT+TGG - Chr3:68093017-68093036 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTAGGGTGTGTTTGGTTTT+AGG - Chr3:68093024-68093043 MsG0380015298.01.T01:intron 35.0%
AAGAAGGAGAGATAGGAAGA+AGG + Chr3:68092148-68092167 None:intergenic 40.0%
AGTGCTAAAGGTTAGATGTG+AGG - Chr3:68095370-68095389 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAAACGAAAAGGTCTCC+GGG - Chr3:68094497-68094516 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
CACACAAGCAATCTTCATCT+CGG + Chr3:68095424-68095443 None:intergenic 40.0%
CTCAAATTGCACTTCAGTTG+AGG + Chr3:68095008-68095027 None:intergenic 40.0%
GAGTTCTTCAAATGCTGCAA+CGG - Chr3:68092714-68092733 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
GATGAAAAGTCACTTGGCTT+TGG - Chr3:68095232-68095251 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
GCTATGGCTTATCTGCATAA+TGG - Chr3:68093828-68093847 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGAAAACATCTCACCTT+TGG + Chr3:68093921-68093940 None:intergenic 40.0%
GGAAGATAAGGAATCTGCTA+AGG - Chr3:68093487-68093506 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGATTGTGTATGCTACT+AGG - Chr3:68092863-68092882 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
GTGCTAAAGGTTAGATGTGA+GGG - Chr3:68095371-68095390 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGGAGAATTGAGTCTT+TGG - Chr3:68092792-68092811 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TAGTCTTCGATCCTAACTGT+CGG + Chr3:68093976-68093995 None:intergenic 40.0%
TATCGGATACTTTCCCATGT+TGG + Chr3:68094418-68094437 None:intergenic 40.0%
TCAGTGTCATGTATCATGTC+TGG - Chr3:68094083-68094102 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TGCAATTAAGCAGTTGGACA+AGG - Chr3:68093466-68093485 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TGCTGTTGCAATTAAGCAGT+TGG - Chr3:68093460-68093479 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TGTGTGAGAACTAGAGAAGA+TGG + Chr3:68092409-68092428 None:intergenic 40.0%
TTACAGGGAGAAAGAAAGGT+GGG - Chr3:68093745-68093764 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TTAGGTACAAGGTTGCAGTT+GGG - Chr3:68093796-68093815 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TTCCTGTGGTCACAGATATT+TGG - Chr3:68094379-68094398 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TTGCAAAGGAAAGGAACTGA+AGG + Chr3:68094240-68094259 None:intergenic 40.0%
TTGGTGTACAAGTATGTCTC+AGG - Chr3:68093605-68093624 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
TTTACAGGGAGAAAGAAAGG+TGG - Chr3:68093744-68093763 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
! AATGAGTTGACCACAATTGG+AGG - Chr3:68093189-68093208 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
! AGATGGTGATGAATGTGTGT+TGG + Chr3:68092392-68092411 None:intergenic 40.0%
! GATTCTTGCTAGAGTGCTAA+AGG - Chr3:68095358-68095377 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGACCTTTTCGTTTCAAT+AGG + Chr3:68094497-68094516 None:intergenic 40.0%
! GTGCATTGAGCTGTGTTTTT+AGG - Chr3:68093414-68093433 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
! TTCCCGTTACCTTTTCTCAA+AGG - Chr3:68095452-68095471 MsG0380015298.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
! TTCTTCTAAGAAGGCTCCAA+AGG - Chr3:68093902-68093921 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
!! AAATGCTGCAACGGTTTTGA+TGG - Chr3:68092723-68092742 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGACGAGAATCTAGTCTTA+TGG - Chr3:68094519-68094538 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
!! GCAGAAAGTGTCGAAATTTG+AGG + Chr3:68092456-68092475 None:intergenic 40.0%
!! GTGATTTCGGATTAGCTACA+TGG - Chr3:68094205-68094224 MsG0380015298.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGTGTATGCTTTTGGAG+TGG - Chr3:68094442-68094461 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
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!!! GCATTGAGCTGTGTTTTTAG+GGG - Chr3:68093416-68093435 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
!!! GTGTTTTTAGGGGAAGAGTT+GGG - Chr3:68093426-68093445 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
!!! TGTGTTTTTAGGGGAAGAGT+TGG - Chr3:68093425-68093444 MsG0380015298.01.T01:intron 40.0%
AAGACTAGATTCTCGTCTCC+CGG + Chr3:68094518-68094537 None:intergenic 45.0%
ACCAAAAACAAACCCTCCTC+GGG + Chr3:68093590-68093609 None:intergenic 45.0%
ACCAATCAGAACGAGTTGTG+TGG + Chr3:68094164-68094183 None:intergenic 45.0%
ACCTTGTACCTAACAGACCA+AGG + Chr3:68093789-68093808 None:intergenic 45.0%
AGGATCGAGCAACTCTTCAA+TGG + Chr3:68094988-68095007 None:intergenic 45.0%
AGTTGGGATTGCAGAAGCTA+TGG - Chr3:68093812-68093831 MsG0380015298.01.T01:intron 45.0%
CACCAAAAACAAACCCTCCT+CGG + Chr3:68093591-68093610 None:intergenic 45.0%
CCAATCAGAACGAGTTGTGT+GGG + Chr3:68094163-68094182 None:intergenic 45.0%
CCTTGTACCTAACAGACCAA+GGG + Chr3:68093788-68093807 None:intergenic 45.0%
CTTCAGAGCACAACAAAGCA+TGG - Chr3:68092572-68092591 MsG0380015298.01.T01:CDS 45.0%
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! TGTGATGGTGTGTGTAGGTA+GGG - Chr3:68093379-68093398 MsG0380015298.01.T01:intron 45.0%
!! TCCCATGTTGGAAGTACTCA+GGG + Chr3:68094406-68094425 None:intergenic 45.0%
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!! TTCCCATGTTGGAAGTACTC+AGG + Chr3:68094407-68094426 None:intergenic 45.0%
!! TTTTGTATTGACCCCGAGGA+GGG - Chr3:68093575-68093594 MsG0380015298.01.T01:intron 45.0%
!! TTTTTGTATTGACCCCGAGG+AGG - Chr3:68093574-68093593 MsG0380015298.01.T01:intron 45.0%
AGGGAGAAAGAAAGGTGGGA+AGG - Chr3:68093749-68093768 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
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CAACACTCCCTTGGTCTGTT+AGG - Chr3:68093778-68093797 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
CCAAAAACAAACCCTCCTCG+GGG + Chr3:68093589-68093608 None:intergenic 50.0%
CCCACACAACTCGTTCTGAT+TGG - Chr3:68094160-68094179 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
CCCCTGAGTACTTCCAACAT+GGG - Chr3:68094402-68094421 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
CCCTTGGTCTGTTAGGTACA+AGG - Chr3:68093785-68093804 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
GCATGGTTGTTAGCTGAGTC+TGG - Chr3:68092589-68092608 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
GGCCAAATATCTGTGACCAC+AGG + Chr3:68094384-68094403 None:intergenic 50.0%
GGGAGAAAGAAAGGTGGGAA+GGG - Chr3:68093750-68093769 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
GGTTGTTAGCTGAGTCTGGT+GGG - Chr3:68092593-68092612 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
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TGGTTGTTAGCTGAGTCTGG+TGG - Chr3:68092592-68092611 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
! AAGGTGCTTTACTTGTGGGG+TGG + Chr3:68092185-68092204 None:intergenic 50.0%
! GTGTGATGGTGTGTGTAGGT+AGG - Chr3:68093378-68093397 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
! GTGTGTGTAGGTAGGGTGTT+GGG - Chr3:68093386-68093405 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
!! AGGGGAAGGTGCTTTACTTG+TGG + Chr3:68092190-68092209 None:intergenic 50.0%
!! CACTTGGCTTTGGCAATGCT+AGG - Chr3:68095242-68095261 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
!! CCCATGTTGGAAGTACTCAG+GGG + Chr3:68094405-68094424 None:intergenic 50.0%
!! GGGAAGGTGCTTTACTTGTG+GGG + Chr3:68092188-68092207 None:intergenic 50.0%
!! GGGGAAGGTGCTTTACTTGT+GGG + Chr3:68092189-68092208 None:intergenic 50.0%
!! TCTGTGTAGCACCGACAGTT+AGG - Chr3:68093962-68093981 MsG0380015298.01.T01:CDS 50.0%
!! TGTGTGTAGGTAGGGTGTTG+GGG - Chr3:68093387-68093406 MsG0380015298.01.T01:intron 50.0%
GCCCCTGAGTACTTCCAACA+TGG - Chr3:68094401-68094420 MsG0380015298.01.T01:intron 55.0%
GGTGTGTGTAGGTAGGGTGT+TGG - Chr3:68093385-68093404 MsG0380015298.01.T01:intron 55.0%
! TTAGCTGAGTCTGGTGGGTG+TGG - Chr3:68092598-68092617 MsG0380015298.01.T01:CDS 55.0%
!! CCCCGAGGAGGGTTTGTTTT+TGG - Chr3:68093586-68093605 MsG0380015298.01.T01:intron 55.0%
CAGCGCGATACCGACACATG+TGG - Chr3:68094012-68094031 MsG0380015298.01.T01:intron 60.0%
! AGCTTGGAGCGCCACTTGCA+CGG - Chr3:68093632-68093651 MsG0380015298.01.T01:intron 60.0%
! CACATGTGTCGGTATCGCGC+TGG + Chr3:68094014-68094033 None:intergenic 60.0%
!! GTAGGTAGGGTGTTGGGGAG+AGG - Chr3:68093392-68093411 MsG0380015298.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 68092103 68095647 68092103 ID=MsG0380015298.01;Name=MsG0380015298.01
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Chr3 exon 68092103 68092796 68092103 ID=MsG0380015298.01.T01:exon:174;Parent=MsG0380015298.01.T01
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Chr3 exon 68094097 68094354 68094097 ID=MsG0380015298.01.T01:exon:170;Parent=MsG0380015298.01.T01
Chr3 exon 68094852 68095647 68094852 ID=MsG0380015298.01.T01:exon:169;Parent=MsG0380015298.01.T01
Chr3 five_prime_UTR 68095396 68095647 68095396 ID=MsG0380015298.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0380015298.01.T01
Chr3 CDS 68094852 68095395 68094852 ID=MsG0380015298.01.T01:cds;Parent=MsG0380015298.01.T01
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Chr3 CDS 68092443 68092796 68092443 ID=MsG0380015298.01.T01:cds;Parent=MsG0380015298.01.T01
Chr3 three_prime_UTR 68092103 68092442 68092103 ID=MsG0380015298.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0380015298.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0380015298.01.T01

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