AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016455.01

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MsG0380016455.01.T01 AT2G03380 32.701 211 128 6 12 209 408 617 4.97e-21 97.4
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MsG0380016455.01.T01 AT1G68930 23.784 185 133 3 46 222 344 528 7.19e-11 65.5
MsG0380016455.01.T01 AT1G68930 30.400 500 331 7 53 541 145 638 2.86e-75 253
MsG0380016455.01.T01 AT1G68930 28.297 417 252 5 65 439 24 435 9.03e-47 174
MsG0380016455.01.T01 AT1G68930 24.324 185 132 3 46 222 370 554 6.11e-11 65.9
MsG0380016455.01.T01 AT4G14050 31.535 482 316 6 49 517 2 482 5.29e-75 249
MsG0380016455.01.T01 AT4G14050 27.371 369 256 5 46 402 104 472 7.12e-35 139
MsG0380016455.01.T01 AT1G15510 29.401 568 318 8 46 535 195 757 1.34e-74 253
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MsG0380016455.01.T01 AT1G15510 22.840 324 201 6 246 525 66 384 2.88e-15 79.7
MsG0380016455.01.T01 AT5G46460 31.950 482 280 6 81 519 96 572 2.01e-74 250
MsG0380016455.01.T01 AT5G46460 32.414 290 194 1 100 389 53 340 7.60e-44 166
MsG0380016455.01.T01 AT5G46460 25.915 355 227 9 3 349 179 505 2.96e-22 101
MsG0380016455.01.T01 AT5G46460 25.498 251 156 5 182 430 40 261 9.27e-19 90.5
MsG0380016455.01.T01 AT4G37170 32.816 451 255 7 107 515 116 560 2.10e-74 249
MsG0380016455.01.T01 AT4G37170 28.378 148 102 1 255 402 66 209 5.76e-13 72.0
MsG0380016455.01.T01 AT5G15300 30.639 532 312 13 34 518 1 522 2.94e-74 246
MsG0380016455.01.T01 AT5G15300 23.834 386 245 5 16 355 81 463 3.23e-32 130
MsG0380016455.01.T01 AT5G15340 31.164 507 317 9 53 535 12 510 3.39e-74 248
MsG0380016455.01.T01 AT5G15340 21.951 369 269 8 13 365 77 442 2.27e-22 101
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MsG0380016455.01.T01 AT4G33990 28.390 236 159 4 206 439 77 304 2.08e-22 102
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MsG0380016455.01.T01 AT1G74630 32.596 497 283 10 53 504 26 515 1.83e-73 246
MsG0380016455.01.T01 AT5G19020 31.094 521 305 10 31 503 156 670 2.07e-73 247
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MsG0380016455.01.T01 AT5G19020 23.529 357 257 9 12 354 270 624 8.57e-19 90.5
MsG0380016455.01.T01 AT5G44230 33.886 422 266 8 111 521 15 434 4.25e-73 243
MsG0380016455.01.T01 AT5G44230 27.494 411 272 12 15 407 20 422 8.22e-36 141
MsG0380016455.01.T01 AT5G44230 29.070 258 148 4 227 450 5 261 2.06e-22 101
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MsG0380016455.01.T01 AT3G47840 25.540 278 199 3 117 386 44 321 1.11e-23 105
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MsG0380016455.01.T01 AT3G22150 23.765 425 268 10 31 434 88 477 3.28e-24 107
MsG0380016455.01.T01 AT3G22150 25.806 279 190 6 125 386 51 329 1.20e-17 87.0
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MsG0380016455.01.T01 AT2G42920 34.025 482 294 9 66 533 41 512 8.59e-72 239
MsG0380016455.01.T01 AT4G21300 30.427 562 305 10 53 533 245 801 8.78e-72 246
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MsG0380016455.01.T01 AT3G22690 32.990 194 129 1 241 433 101 294 1.85e-24 108
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MsG0380016455.01.T01 AT2G36980 25.402 311 221 6 29 329 176 485 1.53e-23 105
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MsG0380016455.01.T01 AT3G02330 25.626 519 317 13 1 507 137 598 1.71e-33 136
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MsG0380016455.01.T01 AT3G46790 24.633 341 244 5 144 474 46 383 2.10e-26 114
MsG0380016455.01.T01 AT3G46790 25.210 238 164 8 9 234 245 480 1.68e-12 70.5
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MsG0380016455.01.T01 AT3G25060 30.461 499 298 8 31 517 99 560 5.41e-71 238
MsG0380016455.01.T01 AT3G25060 28.933 356 223 7 38 389 3 332 1.72e-33 135
MsG0380016455.01.T01 AT2G20540 34.160 363 229 3 177 534 114 471 5.84e-71 236
MsG0380016455.01.T01 AT2G20540 28.947 304 205 5 35 328 65 367 2.26e-28 119
MsG0380016455.01.T01 AT3G25970 28.125 576 321 9 46 534 100 669 6.91e-71 240
MsG0380016455.01.T01 AT3G25970 23.861 461 269 9 70 449 23 482 7.49e-28 118
MsG0380016455.01.T01 AT3G25970 22.356 331 220 6 12 334 270 571 4.18e-19 91.7
MsG0380016455.01.T01 AT3G22690 30.769 520 346 8 34 542 222 738 7.89e-71 244
MsG0380016455.01.T01 AT3G22690 25.227 440 265 3 33 436 120 531 4.85e-37 147
MsG0380016455.01.T01 AT3G22690 32.990 194 129 1 241 433 101 294 1.79e-24 108
MsG0380016455.01.T01 AT2G41080 29.817 493 327 6 36 515 33 519 2.04e-70 238
MsG0380016455.01.T01 AT2G41080 24.898 245 176 2 212 452 17 257 1.51e-15 80.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G53600 31.933 476 278 6 86 519 212 683 2.13e-70 239
MsG0380016455.01.T01 AT1G53600 28.676 408 278 6 1 403 1 400 4.27e-42 161
MsG0380016455.01.T01 AT1G53600 31.933 476 278 6 86 519 212 683 2.13e-70 239
MsG0380016455.01.T01 AT1G53600 28.676 408 278 6 1 403 1 400 4.27e-42 161
MsG0380016455.01.T01 AT1G09190 32.505 483 300 11 52 517 6 479 2.32e-70 234
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MsG0380016455.01.T01 AT1G25360 28.462 390 229 7 63 407 30 414 2.41e-35 141
MsG0380016455.01.T01 AT1G25360 27.900 319 217 6 46 354 285 600 1.35e-33 136
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MsG0380016455.01.T01 AT1G71490 32.044 181 117 1 224 404 100 274 1.74e-22 102
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MsG0380016455.01.T01 AT5G43790 25.348 359 204 13 19 354 82 399 9.73e-18 86.3
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MsG0380016455.01.T01 AT1G17630 24.444 270 166 4 212 443 93 362 5.37e-19 91.3
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MsG0380016455.01.T01 AT5G39350 26.293 232 169 1 210 439 51 282 8.74e-18 87.4
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MsG0380016455.01.T01 AT2G33680 26.542 373 234 6 67 429 34 376 5.73e-35 140
MsG0380016455.01.T01 AT2G33680 28.059 613 346 11 12 536 80 685 2.99e-67 231
MsG0380016455.01.T01 AT2G33680 26.542 373 234 6 67 429 34 376 5.73e-35 140
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MsG0380016455.01.T01 AT1G14470 28.428 299 158 11 46 326 279 539 2.18e-20 95.1
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MsG0380016455.01.T01 AT1G69350 28.269 283 168 3 205 452 133 415 3.49e-31 129
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MsG0380016455.01.T01 AT2G04860 26.463 393 218 9 66 387 69 461 5.49e-31 128
MsG0380016455.01.T01 AT2G04860 22.477 218 164 3 237 451 11 226 8.55e-12 68.6
MsG0380016455.01.T01 AT5G65570 28.777 556 301 11 43 515 64 607 4.20e-65 225
MsG0380016455.01.T01 AT1G32415 30.677 502 285 9 78 523 227 721 4.25e-65 226
MsG0380016455.01.T01 AT1G32415 27.178 574 342 16 6 526 6 556 1.41e-47 177
MsG0380016455.01.T01 AT2G36980 30.310 452 300 6 101 539 5 454 4.74e-65 219
MsG0380016455.01.T01 AT2G36980 25.402 311 221 6 29 329 33 342 5.26e-24 105
MsG0380016455.01.T01 AT2G36980 24.224 322 175 8 193 481 2 287 5.85e-12 68.6
MsG0380016455.01.T01 AT2G27610 28.972 535 337 7 8 534 256 755 7.12e-65 227
MsG0380016455.01.T01 AT2G27610 25.572 481 275 11 67 502 113 555 6.96e-30 125
MsG0380016455.01.T01 AT2G27610 28.169 213 153 0 227 439 46 258 4.10e-20 95.1
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MsG0380016455.01.T01 AT2G37320 22.788 373 246 8 44 407 117 456 1.11e-20 95.9
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MsG0380016455.01.T01 AT3G53360 26.593 361 227 4 53 406 73 402 7.99e-36 142
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MsG0380016455.01.T01 AT5G08490 27.978 361 208 9 67 412 142 465 1.75e-30 127
MsG0380016455.01.T01 AT5G08490 21.127 426 254 11 82 461 263 652 2.93e-16 82.8
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MsG0380016455.01.T01 AT1G22830 29.106 481 323 7 46 510 183 661 3.22e-62 217
MsG0380016455.01.T01 AT1G22830 23.469 392 282 7 12 389 50 437 7.75e-24 106
MsG0380016455.01.T01 AT1G22830 29.082 196 139 0 214 409 124 319 4.99e-20 94.4
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MsG0380016455.01.T01 AT3G18840 28.571 525 329 9 35 515 113 635 4.17e-62 216
MsG0380016455.01.T01 AT3G18840 27.696 473 255 13 62 455 8 472 6.85e-41 157
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MsG0380016455.01.T01 AT5G55740 33.480 227 145 2 206 426 105 331 1.33e-25 112
MsG0380016455.01.T01 AT5G55740 27.320 194 139 1 246 437 42 235 6.55e-11 65.9
MsG0380016455.01.T01 AT1G59720 35.277 343 206 8 207 535 185 525 1.12e-60 211
MsG0380016455.01.T01 AT1G59720 24.623 398 224 9 15 400 117 450 1.32e-23 105
MsG0380016455.01.T01 AT1G59720 30.348 201 134 4 241 436 116 315 2.06e-17 86.3
MsG0380016455.01.T01 AT1G59720 27.189 217 144 7 32 234 236 452 2.24e-11 67.0
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MsG0380016455.01.T01 AT4G04370 27.093 454 252 7 13 389 11 462 4.31e-43 164
MsG0380016455.01.T01 AT4G04370 30.653 199 133 2 242 439 14 208 4.94e-20 94.4
MsG0380016455.01.T01 AT4G32430 28.994 507 314 9 31 528 127 596 1.89e-60 211
MsG0380016455.01.T01 AT4G32430 25.714 245 172 4 154 397 27 262 1.11e-18 90.1
MsG0380016455.01.T01 AT4G25270 30.316 475 281 10 46 509 91 526 3.68e-60 207
MsG0380016455.01.T01 AT4G25270 25.073 343 200 9 30 357 177 477 3.47e-21 97.4
MsG0380016455.01.T01 AT1G74600 29.659 499 300 9 31 517 436 895 6.33e-60 213
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MsG0380016455.01.T01 AT1G74600 25.876 371 238 10 97 453 172 519 4.94e-24 107
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MsG0380016455.01.T01 AT3G63370 24.879 414 230 6 53 386 86 498 1.06e-33 137
MsG0380016455.01.T01 AT3G63370 24.490 490 285 12 10 452 247 698 1.95e-27 117
MsG0380016455.01.T01 AT3G63370 27.236 246 168 5 198 436 105 346 6.66e-24 107
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MsG0380016455.01.T01 AT1G19720 26.735 389 206 7 46 387 180 536 4.35e-31 129
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MsG0380016455.01.T01 AT4G31070 25.784 574 334 11 31 517 39 607 1.57e-54 194
MsG0380016455.01.T01 AT3G56550 27.530 494 320 11 49 535 7 469 7.80e-54 192
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MsG0380016455.01.T01 AT3G56550 27.530 494 320 11 49 535 7 469 7.80e-54 192
MsG0380016455.01.T01 AT3G56550 23.214 392 241 13 13 384 72 423 6.93e-17 84.3
MsG0380016455.01.T01 AT5G50390 28.025 471 298 6 53 515 129 566 8.91e-54 194
MsG0380016455.01.T01 AT5G50390 24.935 385 227 11 49 408 214 561 1.62e-20 95.9
MsG0380016455.01.T01 AT2G39620 27.966 472 256 11 68 458 321 789 8.20e-53 192
MsG0380016455.01.T01 AT2G39620 22.446 597 371 9 11 526 63 648 8.90e-31 127
MsG0380016455.01.T01 AT2G39620 24.668 377 241 7 117 452 37 411 3.55e-25 110
MsG0380016455.01.T01 AT4G19220 28.107 523 319 15 12 517 460 942 1.24e-52 193
MsG0380016455.01.T01 AT4G19220 26.782 463 272 12 30 451 271 707 1.91e-35 142
MsG0380016455.01.T01 AT4G19220 25.148 338 235 6 111 434 120 453 3.99e-23 104
MsG0380016455.01.T01 AT3G15130 27.621 496 310 9 12 493 72 532 2.23e-52 189
MsG0380016455.01.T01 AT3G15130 26.521 411 248 9 49 439 1 377 7.86e-38 148
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MsG0380016455.01.T01 AT5G14770 24.227 388 278 7 66 439 115 500 1.28e-25 112
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MsG0380016455.01.T01 AT3G04760 20.968 372 261 12 82 423 228 596 2.87e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT1G12300 22.511 462 318 10 74 510 150 596 5.82e-26 112
MsG0380016455.01.T01 AT1G12300 21.667 420 301 10 33 430 219 632 3.16e-20 94.7
MsG0380016455.01.T01 AT1G12300 26.471 204 145 2 237 436 52 254 8.83e-14 74.7
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MsG0380016455.01.T01 AT1G62590 23.821 403 252 9 53 436 235 601 3.51e-24 107
MsG0380016455.01.T01 AT1G09900 23.056 360 255 8 112 451 136 493 3.73e-25 110
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MsG0380016455.01.T01 AT1G09900 21.577 241 180 4 243 474 106 346 2.40e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT4G11690 25.069 363 247 9 105 445 192 551 4.14e-25 109
MsG0380016455.01.T01 AT4G11690 23.120 359 259 6 176 518 197 554 1.26e-21 99.0
MsG0380016455.01.T01 AT1G05670 23.392 342 210 7 176 466 280 620 5.64e-25 109
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MsG0380016455.01.T01 AT5G42310 19.807 414 239 12 87 441 309 688 2.44e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT2G34370 23.744 219 161 3 284 500 122 336 3.36e-15 78.6
MsG0380016455.01.T01 AT1G77340 23.920 301 200 10 124 406 106 395 5.02e-15 77.8
MsG0380016455.01.T01 AT1G77340 22.053 263 184 7 66 309 139 399 2.22e-12 69.3
MsG0380016455.01.T01 AT1G77340 21.739 368 267 9 154 507 34 394 8.46e-12 67.8
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 22.034 295 209 6 176 452 173 464 5.82e-15 78.2
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 21.359 309 193 7 178 471 140 413 1.75e-11 67.4
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 20.235 425 273 13 78 476 138 522 1.89e-11 67.0
MsG0380016455.01.T01 AT3G23020 20.479 376 246 7 179 504 300 672 7.87e-15 78.2
MsG0380016455.01.T01 AT3G23020 22.135 384 204 10 86 410 475 822 1.14e-13 74.7
MsG0380016455.01.T01 AT3G23020 21.528 432 256 10 64 443 278 678 7.04e-13 72.0
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 22.034 295 209 6 176 452 180 471 9.39e-15 77.8
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 21.359 309 193 7 178 471 147 420 2.18e-11 67.0
MsG0380016455.01.T01 AT3G59040 20.235 425 273 13 78 476 145 529 2.31e-11 67.0
MsG0380016455.01.T01 AT3G13160 24.111 253 173 6 88 321 112 364 2.11e-14 75.5
MsG0380016455.01.T01 AT5G40400 20.375 373 251 9 146 503 238 579 2.52e-14 76.3
MsG0380016455.01.T01 AT5G40400 20.375 373 251 9 146 503 309 650 2.91e-14 76.3
MsG0380016455.01.T01 AT1G74900 21.390 374 238 9 43 360 52 425 4.59e-14 75.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G74900 20.446 269 203 3 179 436 128 396 6.36e-11 65.1
MsG0380016455.01.T01 AT4G34830 22.145 289 181 7 176 451 501 758 5.03e-14 75.9
MsG0380016455.01.T01 AT4G34830 23.256 258 176 5 221 459 417 671 6.52e-11 65.9
MsG0380016455.01.T01 AT5G38730 21.467 368 254 9 74 413 195 555 7.00e-14 74.7
MsG0380016455.01.T01 AT5G38730 22.043 372 257 10 112 466 46 401 1.27e-11 67.8
MsG0380016455.01.T01 AT5G62370 26.923 182 124 2 210 382 239 420 7.91e-14 75.1
MsG0380016455.01.T01 AT5G62370 20.621 354 232 7 144 449 272 624 2.13e-13 73.9
MsG0380016455.01.T01 AT5G62370 22.715 383 261 13 82 436 582 957 7.89e-11 65.5
MsG0380016455.01.T01 AT3G18110 21.958 337 223 5 113 436 225 534 8.58e-14 75.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G19520 19.155 355 250 6 124 469 328 654 8.98e-14 74.7
MsG0380016455.01.T01 AT1G13040 21.713 327 203 7 176 450 148 473 1.01e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT1G13040 20.891 359 259 7 74 408 141 498 2.22e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G13040 21.713 327 203 7 176 450 148 473 1.01e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT1G13040 20.891 359 259 7 74 408 141 498 2.22e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT2G17525 22.337 291 213 4 159 436 161 451 1.13e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT2G17525 22.371 447 289 12 81 505 181 591 4.87e-13 72.4
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 23.279 305 182 6 164 417 172 475 1.18e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 23.279 305 182 6 164 417 172 475 1.31e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT4G19890 20.541 370 272 7 114 461 183 552 1.35e-13 74.3
MsG0380016455.01.T01 AT4G19890 20.556 360 255 8 74 406 244 599 8.38e-13 71.6
MsG0380016455.01.T01 AT4G19890 21.883 393 237 12 72 400 312 698 3.81e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT4G19890 23.830 235 163 7 285 507 158 388 3.67e-11 66.2
MsG0380016455.01.T01 AT1G16830 22.115 312 228 5 112 408 246 557 1.66e-13 73.6
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 23.279 305 182 6 164 417 172 475 1.88e-13 73.9
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 23.353 334 231 8 117 429 639 968 9.30e-11 65.5
MsG0380016455.01.T01 AT1G51965 19.949 391 264 8 69 441 225 584 3.87e-13 72.8
MsG0380016455.01.T01 AT5G28460 22.222 405 249 10 112 451 258 661 4.41e-13 72.4
MsG0380016455.01.T01 AT5G28460 22.327 318 222 6 112 407 405 719 9.81e-11 65.1
MsG0380016455.01.T01 AT5G28370 22.222 405 249 10 112 451 258 661 4.62e-13 72.4
MsG0380016455.01.T01 AT3G48810 22.069 290 171 7 68 302 302 591 9.40e-13 71.2
MsG0380016455.01.T01 AT3G48810 22.923 349 246 10 176 506 180 523 1.14e-12 71.2
MsG0380016455.01.T01 AT3G48810 21.315 441 293 11 53 475 187 591 9.28e-12 68.2
MsG0380016455.01.T01 AT3G61520 21.975 405 250 10 112 451 258 661 9.90e-13 71.6
MsG0380016455.01.T01 AT5G46100 23.755 261 167 7 96 328 171 427 1.20e-12 70.5
MsG0380016455.01.T01 AT5G65820 21.595 301 221 5 150 436 189 488 1.79e-12 70.5
MsG0380016455.01.T01 AT5G65820 22.925 253 184 4 240 483 184 434 8.70e-11 65.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G11710 22.131 366 258 8 165 510 207 565 2.13e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G11710 21.622 370 260 8 112 455 252 617 2.86e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT1G11710 22.131 366 258 8 165 510 178 536 2.37e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT1G11710 21.622 370 260 8 112 455 223 588 3.21e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT5G48730 22.526 293 208 9 180 454 188 479 2.62e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT5G48730 23.462 260 180 6 194 436 131 388 1.34e-11 67.4
MsG0380016455.01.T01 AT3G04130 22.697 304 210 6 147 436 171 463 2.67e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT3G04130 22.697 304 210 6 147 436 171 463 2.67e-12 69.7
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 25.391 256 175 6 176 417 17 270 2.71e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT5G27270 25.391 256 175 6 176 417 17 270 2.71e-12 70.1
MsG0380016455.01.T01 AT2G37230 23.204 362 230 12 12 356 112 442 4.78e-12 69.3
MsG0380016455.01.T01 AT5G39980 22.162 370 234 9 104 451 177 514 6.28e-12 68.9
MsG0380016455.01.T01 AT1G66345 24.370 238 168 3 176 401 303 540 8.19e-12 68.2
MsG0380016455.01.T01 AT1G10910 22.316 354 252 11 100 431 116 468 8.51e-12 68.2
MsG0380016455.01.T01 AT1G10910 22.316 354 252 11 100 431 116 468 8.92e-12 68.2
MsG0380016455.01.T01 AT1G18900 23.256 258 184 4 145 388 400 657 1.34e-11 67.8
MsG0380016455.01.T01 AT1G18900 22.711 273 176 4 238 506 398 639 5.15e-11 66.2

Find 134 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 158 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAATGAGGTTCTTGAGTATT+TGG 0.127771 3:+83796583 MsG0380016455.01.T01:CDS
AAGGGTTCCGGTTCGGAATT+TGG 0.141457 3:+83796211 MsG0380016455.01.T01:CDS
CAAGTCACAACATTTCTTTC+AGG 0.203350 3:-83795840 None:intergenic
GAAACCTAATGAAACAGTTT+TGG 0.251219 3:+83796829 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGGCAATGATCGGCGCTTGC+TGG 0.260520 3:+83796852 MsG0380016455.01.T01:CDS
CAAACAAAGCAATTCCTTTC+GGG 0.263980 3:-83796125 None:intergenic
GAGAAAGCACTGAAGGCTTT+TGG 0.264607 3:+83796281 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGCTGGAATGCTATGATTGC+AGG 0.265084 3:+83796539 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTTGGGGAAATGGTAGTTAA+TGG 0.267819 3:+83796299 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGCTTTGTTTGGTCGTCTA+TGG 0.272708 3:+83796136 MsG0380016455.01.T01:CDS
CGGTTCGGAATTTGGAGATT+TGG 0.275053 3:+83796219 MsG0380016455.01.T01:CDS
GACATCGGAACCGGCTTTGA+TGG 0.330731 3:-83795733 None:intergenic
GGAGGAATATGGAATTGAAA+TGG 0.335642 3:+83796718 MsG0380016455.01.T01:CDS
ACTGTTTCATTAGGTTTCAT+TGG 0.338525 3:-83796824 None:intergenic
ATATCTAAAATGGAGGAATA+TGG 0.340056 3:+83796707 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAAATGGGCATCAGGCATTA+TGG 0.341016 3:+83796734 MsG0380016455.01.T01:CDS
TAACCAAGCATCATTGAAAA+AGG 0.344385 3:+83795587 MsG0380016455.01.T01:CDS
CAAATTGGTCTCATTCAATA+AGG 0.345766 3:+83795553 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTGAAAGTAATATCTAAAA+TGG 0.346247 3:+83796697 MsG0380016455.01.T01:CDS
CCGAAAGGAATTGCTTTGTT+TGG 0.353862 3:+83796126 MsG0380016455.01.T01:CDS
TCCGATGTCGATGTGTTCAT+TGG 0.359685 3:+83795747 MsG0380016455.01.T01:CDS
CCAAACAAAGCAATTCCTTT+CGG 0.373805 3:-83796126 None:intergenic
TGGGGTCGTGTGTTGTTTCA+TGG 0.375108 3:-83795635 None:intergenic
AGCTTGTGCTCATGGAGGTT+TGG 0.376910 3:+83796664 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGGGGAAATGGTAGTTAAT+GGG 0.377927 3:+83796300 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGGAAGAGCAGGGATGTTAA+AGG 0.386651 3:+83796775 MsG0380016455.01.T01:CDS
TATGTGCTTGTGCTCAGCTC+GGG 0.395793 3:+83796357 MsG0380016455.01.T01:CDS
GATTCATTCAGATATGAAAA+TGG 0.399566 3:+83796874 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGTGCTCAGCTCGGGGACT+TGG 0.402962 3:+83796364 MsG0380016455.01.T01:CDS
AATGAGGTTCTTGAGTATTT+GGG 0.405774 3:+83796584 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAGGAATATGGAATTGAAAT+GGG 0.409696 3:+83796719 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTCATTGCATTGTCCATTGA+CGG 0.412575 3:-83796567 None:intergenic
ATTGGTGGGTTTGCTAGGAA+TGG 0.418393 3:+83795966 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAAGTTTCACCTCAAATGAA+TGG 0.422376 3:+83797106 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGGATGCATGGTTGACCTCT+TGG 0.429926 3:+83796754 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTACTCTCAGCTTGTGCTCA+TGG 0.432873 3:+83796656 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAACACATCGACATCGGAAC+CGG 0.433781 3:-83795742 None:intergenic
AAATTGGTGGAATCACAAAT+TGG 0.434925 3:+83795538 MsG0380016455.01.T01:CDS
CAGCTCGGGGACTTGGATGC+TGG 0.435354 3:+83796371 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATTTGGAATTCCATGATTGC+TGG 0.436911 3:+83796236 MsG0380016455.01.T01:CDS
GCACATAGCCCATTCATTTG+AGG 0.442724 3:-83797115 None:intergenic
TCTTGAGTATTTGGGTAGGA+TGG 0.446664 3:+83796592 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTTGGTCGTCTATGGTTTG+TGG 0.450153 3:+83796143 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGATGGAGGAGTCAAATATA+AGG 0.450453 3:+83796609 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATGGAATTGAAATGGGCATC+AGG 0.451785 3:+83796726 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTTGGTCGTCTATGGTTTGT+GGG 0.452958 3:+83796144 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTTGCGTTTGAAGCAATGCC+GGG 0.454076 3:+83795915 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATAAGGAGTAGAATGGTTGA+TGG 0.457199 3:+83797010 MsG0380016455.01.T01:CDS
TCAATCCACTCAAAACAAAC+TGG 0.458040 3:-83796439 None:intergenic
GTAATAAACGTGACAGCATC+AGG 0.460903 3:-83796632 None:intergenic
ACATGGACTGTGATGGTTGA+TGG 0.462224 3:+83796050 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTATGCTAAGAAAGGGGAAA+TGG 0.464450 3:+83796073 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGAGTATTTGGGTAGGATGG+AGG 0.470504 3:+83796595 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGATGATTGGTGGGTTTGCT+AGG 0.470647 3:+83795961 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGATGCATGGTTGACCTCTT+GGG 0.471275 3:+83796755 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTGACCTCTTGGGAAGAGC+AGG 0.471716 3:+83796764 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTGTGCATACCCAGCAATCA+TGG 0.474679 3:-83796246 None:intergenic
AATCAACAGCAGAGTTACTA+AGG 0.476847 3:-83797069 None:intergenic
GGGAGAAAGCTGAAATGATA+AGG 0.481580 3:+83796993 MsG0380016455.01.T01:CDS
TAAGGTTCCGTATGAGTTGA+AGG 0.485992 3:+83796019 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGGTATGCACAGAATGGATT+TGG 0.486099 3:+83796257 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGGTGGGTTTGCTAGGAAT+GGG 0.487359 3:+83795967 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTATGTGCTTGTGCTCAGCT+CGG 0.487811 3:+83796356 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTTGTGGGTATTGTAAGAA+AGG 0.490282 3:+83796158 MsG0380016455.01.T01:CDS
CAAATCTCCAAATTCCGAAC+CGG 0.493823 3:-83796218 None:intergenic
ATTGGTGGGTATTTGAGAAA+TGG 0.494351 3:+83795873 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGTTGGAGTCAGATGATTGG+TGG 0.499167 3:+83795951 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTTGGAATTCCATGATTGCT+GGG 0.505556 3:+83796237 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTTGATGGATTCTGCGTGCA+AGG 0.506024 3:-83795718 None:intergenic
GTTGATGGGTATGCTAAGAA+AGG 0.507008 3:+83796065 MsG0380016455.01.T01:CDS
AAGTTTCACCTCAAATGAAT+GGG 0.515223 3:+83797107 MsG0380016455.01.T01:CDS
CATGGACTGTGATGGTTGAT+GGG 0.515432 3:+83796051 MsG0380016455.01.T01:CDS
ACTTGCGTTTGAAGCAATGC+CGG 0.516549 3:+83795914 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTGACTTGGAATGCAATGAT+TGG 0.516899 3:+83795855 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTATGCAAAATGTGGGGACT+TGG 0.523464 3:+83796469 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGAAATGATAAGGAGTAGAA+TGG 0.526322 3:+83797003 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGATGGGTATGCTAAGAAA+GGG 0.528061 3:+83796066 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTGGAGTCAGATGATTGGT+GGG 0.530028 3:+83795952 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGAGGATCTGAAAAGATACC+AGG 0.533217 3:+83797031 MsG0380016455.01.T01:CDS
GCAAGGATTTAACGTAATGA+AGG 0.536563 3:-83795701 None:intergenic
AGGAGTAGAATGGTTGATGG+AGG 0.537827 3:+83797013 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTAACAACAGTGAACTCATC+CGG 0.542093 3:-83796329 None:intergenic
TGGTGGGTTTGCTAGGAATG+GGG 0.548034 3:+83795968 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGTAGTTAATGGGTTTGAGC+CGG 0.548799 3:+83796310 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGACTTGGTTAATGCAAGGT+TGG 0.550524 3:+83796484 MsG0380016455.01.T01:CDS
ACCACATCCTTCAACTCATA+CGG 0.551530 3:-83796026 None:intergenic
TTGTAAGAAAGGTTGTGTCA+TGG 0.555034 3:+83796169 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTGAGTTGGAGTCAGATGAT+TGG 0.557739 3:+83795948 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGGTTGTGTCATGGAGGCTG+AGG 0.560926 3:+83796178 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGTAACTGAGGGATCATGGT+GGG 0.563120 3:-83795654 None:intergenic
CATCACATGATAGAATGTAA+AGG 0.563619 3:+83796404 MsG0380016455.01.T01:CDS
CGGGGAAAACGAGGGTGAGT+TGG 0.565492 3:+83795934 MsG0380016455.01.T01:CDS
CACGCAGAATCCATCAAAGC+CGG 0.566141 3:+83795723 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTGAAAGAAATGTTGTGACT+TGG 0.567409 3:+83795841 MsG0380016455.01.T01:CDS
GGAAATGGAAGATGCAAGAG+AGG 0.571334 3:+83796088 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATTTAACGTAATGAAGGAAG+AGG 0.577317 3:-83795695 None:intergenic
TCCAATGAACACATCGACAT+CGG 0.578420 3:-83795748 None:intergenic
AAGCAATGCCGGGGAAAACG+AGG 0.580817 3:+83795925 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATGGGGATACTGCAACTGCT+AGG 0.582873 3:+83795985 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTTGAGTAACTGAGGGATCA+TGG 0.583201 3:-83795658 None:intergenic
ATGTGCTTGTGCTCAGCTCG+GGG 0.584969 3:+83796358 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATTGCTGGGTATGCACAGAA+TGG 0.587686 3:+83796251 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGGTTCTTGAGTATTTGGGT+AGG 0.599049 3:+83796588 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTCTCAGCTTGTGCTCATGG+AGG 0.601705 3:+83796659 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATTTGGTGAGAAAGCACTGA+AGG 0.603804 3:+83796274 MsG0380016455.01.T01:CDS
CTTGGAATGCAATGATTGGT+GGG 0.605016 3:+83795859 MsG0380016455.01.T01:CDS
TATTTGAAAGTTGTAATGAG+AGG 0.608900 3:+83796507 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGCATACGCTGCAACAATGG+CGG 0.609671 3:-83795772 None:intergenic
CGCATGCTTTGAGTAACTGA+GGG 0.611583 3:-83795665 None:intergenic
ACTTGGAATGCAATGATTGG+TGG 0.615271 3:+83795858 MsG0380016455.01.T01:CDS
TCCGTATGAGTTGAAGGATG+TGG 0.617379 3:+83796025 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAAAGTAATATCTAAAATGG+AGG 0.617710 3:+83796700 MsG0380016455.01.T01:CDS
CATCAGGCATTATGGATGCA+TGG 0.622810 3:+83796742 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGTTGAAGGATGTGGTGACA+TGG 0.626187 3:+83796033 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGACATGTATGCAAAATGT+GGG 0.627387 3:+83796462 MsG0380016455.01.T01:CDS
ACATCCCTGCTCTTCCCAAG+AGG 0.627907 3:-83796769 None:intergenic
TGATGGGTATGCTAAGAAAG+GGG 0.629179 3:+83796067 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAACAAGTAACGAAGATGAT+CGG 0.629829 3:+83796899 MsG0380016455.01.T01:CDS
ATTGACATGTATGCAAAATG+TGG 0.634080 3:+83796461 MsG0380016455.01.T01:CDS
TCGCATGCTTTGAGTAACTG+AGG 0.639487 3:-83795666 None:intergenic
CGTCAATGGACAATGCAATG+AGG 0.659790 3:+83796568 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGACCTCTTGGGAAGAGCA+GGG 0.659877 3:+83796765 MsG0380016455.01.T01:CDS
AAGAGCAGGGATGTTAAAGG+AGG 0.671458 3:+83796778 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTAACTGAGGGATCATGGTG+GGG 0.675997 3:-83795653 None:intergenic
GTGGGGACTTGGTTAATGCA+AGG 0.679164 3:+83796480 MsG0380016455.01.T01:CDS
TTGCGTTTGAAGCAATGCCG+GGG 0.682214 3:+83795916 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAGTAACTGAGGGATCATGG+TGG 0.682874 3:-83795655 None:intergenic
AGGATGATTGAACTACACCC+TGG 0.686799 3:-83797049 None:intergenic
TGTGGTGACATGGACTGTGA+TGG 0.688569 3:+83796043 MsG0380016455.01.T01:CDS
GAGGATCTGAAAAGATACCA+GGG 0.692905 3:+83797032 MsG0380016455.01.T01:CDS
AGCAATGCCGGGGAAAACGA+GGG 0.696617 3:+83795926 MsG0380016455.01.T01:CDS
GTTGCAGCGTATGCAAAATG+TGG 0.722309 3:+83795780 MsG0380016455.01.T01:CDS
TAAGAAAGGTTGTGTCATGG+AGG 0.740327 3:+83796172 MsG0380016455.01.T01:CDS
TGACATGTATGCAAAATGTG+GGG 0.770917 3:+83796463 MsG0380016455.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGAAACAAGTCAAAAAAAT+TGG + Chr3:83795522-83795541 MsG0380016455.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTGAAAGTAATATCTAAAA+TGG + Chr3:83796697-83796716 MsG0380016455.01.T01:CDS 20.0%
! AAACAAGTCAAAAAAATTGG+TGG + Chr3:83795525-83795544 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
! GATTCATTCAGATATGAAAA+TGG + Chr3:83796874-83796893 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
! TATTTGAAAGTTGTAATGAG+AGG + Chr3:83796507-83796526 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
!! AAACCTAATGAAACAGTTTT+GGG + Chr3:83796830-83796849 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATCTAAAATGGAGGAATA+TGG + Chr3:83796707-83796726 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
!! GAAAGTAATATCTAAAATGG+AGG + Chr3:83796700-83796719 MsG0380016455.01.T01:CDS 25.0%
AAATTGGTGGAATCACAAAT+TGG + Chr3:83795538-83795557 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTTCACCTCAAATGAAT+GGG + Chr3:83797107-83797126 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
AATGAGGTTCTTGAGTATTT+GGG + Chr3:83796584-83796603 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
ACTGTTTCATTAGGTTTCAT+TGG - Chr3:83796827-83796846 None:intergenic 30.0%
ATTGACATGTATGCAAAATG+TGG + Chr3:83796461-83796480 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
ATTTAACGTAATGAAGGAAG+AGG - Chr3:83795698-83795717 None:intergenic 30.0%
CATCACATGATAGAATGTAA+AGG + Chr3:83796404-83796423 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
GAGGAATATGGAATTGAAAT+GGG + Chr3:83796719-83796738 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
TAACCAAGCATCATTGAAAA+AGG + Chr3:83795587-83795606 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
TGAAATGATAAGGAGTAGAA+TGG + Chr3:83797003-83797022 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
TTGACATGTATGCAAAATGT+GGG + Chr3:83796462-83796481 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
! AACCTAATGAAACAGTTTTG+GGG + Chr3:83796831-83796850 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
! CAAATTGGTCTCATTCAATA+AGG + Chr3:83795553-83795572 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
! GAAACCTAATGAAACAGTTT+TGG + Chr3:83796829-83796848 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGCTAGGAAGTTTTTTGATA+AGG + Chr3:83796001-83796020 MsG0380016455.01.T01:CDS 30.0%
AATCAACAGCAGAGTTACTA+AGG - Chr3:83797072-83797091 None:intergenic 35.0%
ATAAGGAGTAGAATGGTTGA+TGG + Chr3:83797010-83797029 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
CAAACAAAGCAATTCCTTTC+GGG - Chr3:83796128-83796147 None:intergenic 35.0%
CAAGTCACAACATTTCTTTC+AGG - Chr3:83795843-83795862 None:intergenic 35.0%
CAATGAGGTTCTTGAGTATT+TGG + Chr3:83796583-83796602 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
CCAAACAAAGCAATTCCTTT+CGG - Chr3:83796129-83796148 None:intergenic 35.0%
CTGAAAGAAATGTTGTGACT+TGG + Chr3:83795841-83795860 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
GAACAAGTAACGAAGATGAT+CGG + Chr3:83796899-83796918 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTTTCACCTCAAATGAA+TGG + Chr3:83797106-83797125 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
GCAAGGATTTAACGTAATGA+AGG - Chr3:83795704-83795723 None:intergenic 35.0%
GGAGGAATATGGAATTGAAA+TGG + Chr3:83796718-83796737 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
TCAATCCACTCAAAACAAAC+TGG - Chr3:83796442-83796461 None:intergenic 35.0%
TGACATGTATGCAAAATGTG+GGG + Chr3:83796463-83796482 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGGAAATGGTAGTTAAT+GGG + Chr3:83796300-83796319 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAAGAAAGGTTGTGTCA+TGG + Chr3:83796169-83796188 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGGGAAATGGTAGTTAA+TGG + Chr3:83796299-83796318 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGGTGGGTATTTGAGAAA+TGG + Chr3:83795873-83795892 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTGGAATTCCATGATTGC+TGG + Chr3:83796236-83796255 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTGTGGGTATTGTAAGAA+AGG + Chr3:83796158-83796177 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGGTATGCTAAGAAA+GGG + Chr3:83796066-83796085 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGAATTCCATGATTGCT+GGG + Chr3:83796237-83796256 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
!! ACCTAATGAAACAGTTTTGG+GGG + Chr3:83796832-83796851 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTGAGTTAATGCCCGAA+AGG + Chr3:83796111-83796130 MsG0380016455.01.T01:CDS 35.0%
ACCACATCCTTCAACTCATA+CGG - Chr3:83796029-83796048 None:intergenic 40.0%
ACTTGGAATGCAATGATTGG+TGG + Chr3:83795858-83795877 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTCTTGAGTATTTGGGT+AGG + Chr3:83796588-83796607 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAATTGAAATGGGCATC+AGG + Chr3:83796726-83796745 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
CAAATCTCCAAATTCCGAAC+CGG - Chr3:83796221-83796240 None:intergenic 40.0%
CTAACAACAGTGAACTCATC+CGG - Chr3:83796332-83796351 None:intergenic 40.0%
CTACGCAGCTTCAGAAAAAT+GGG + Chr3:83796973-83796992 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
CTCATTGCATTGTCCATTGA+CGG - Chr3:83796570-83796589 None:intergenic 40.0%
CTTGGAATGCAATGATTGGT+GGG + Chr3:83795859-83795878 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
GAGGATCTGAAAAGATACCA+GGG + Chr3:83797032-83797051 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
GGATGGAGGAGTCAAATATA+AGG + Chr3:83796609-83796628 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
GGGAGAAAGCTGAAATGATA+AGG + Chr3:83796993-83797012 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
GTAATAAACGTGACAGCATC+AGG - Chr3:83796635-83796654 None:intergenic 40.0%
GTATGCTAAGAAAGGGGAAA+TGG + Chr3:83796073-83796092 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
TAAGAAAGGTTGTGTCATGG+AGG + Chr3:83796172-83796191 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
TCCAATGAACACATCGACAT+CGG - Chr3:83795751-83795770 None:intergenic 40.0%
TCTACGCAGCTTCAGAAAAA+TGG + Chr3:83796972-83796991 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGAGTATTTGGGTAGGA+TGG + Chr3:83796592-83796611 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
TTTGAGTAACTGAGGGATCA+TGG - Chr3:83795661-83795680 None:intergenic 40.0%
! ATGAGAGGAATGTTTTCTGC+TGG + Chr3:83796522-83796541 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! CCGAAAGGAATTGCTTTGTT+TGG + Chr3:83796126-83796145 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! GTGACTTGGAATGCAATGAT+TGG + Chr3:83795855-83795874 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGATGGGTATGCTAAGAA+AGG + Chr3:83796065-83796084 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! TAAGGTTCCGTATGAGTTGA+AGG + Chr3:83796019-83796038 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! TGATGGGTATGCTAAGAAAG+GGG + Chr3:83796067-83796086 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGTCGTCTATGGTTTGT+GGG + Chr3:83796144-83796163 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTGCATACGCTGCAACAA+TGG - Chr3:83795778-83795797 None:intergenic 40.0%
!! AGGCTGAGGATATTTTTCGA+AGG + Chr3:83796192-83796211 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGGTGAGAAAGCACTGA+AGG + Chr3:83796274-83796293 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATATTTTTCGAAGGGTTC+CGG + Chr3:83796199-83796218 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!! GGCTGAGGATATTTTTCGAA+GGG + Chr3:83796193-83796212 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGCTTTGTTTGGTCGTCTA+TGG + Chr3:83796136-83796155 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGAAAGCACTGAAGGCTTTT+GGG + Chr3:83796282-83796301 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
!!! GAGCCTTTTTCAATGATGCT+TGG - Chr3:83795593-83795612 None:intergenic 40.0%
!!! GTGAACCAGTTTGTTTTGAG+TGG + Chr3:83796434-83796453 MsG0380016455.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGCAGGGATGTTAAAGG+AGG + Chr3:83796778-83796797 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
AGGATGATTGAACTACACCC+TGG - Chr3:83797052-83797071 None:intergenic 45.0%
AGTAACTGAGGGATCATGGT+GGG - Chr3:83795657-83795676 None:intergenic 45.0%
AGTTGAAGGATGTGGTGACA+TGG + Chr3:83796033-83796052 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGGAGTCAGATGATTGG+TGG + Chr3:83795951-83795970 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCTGGGTATGCACAGAA+TGG + Chr3:83796251-83796270 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
CATCAGGCATTATGGATGCA+TGG + Chr3:83796742-83796761 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
CGTCAATGGACAATGCAATG+AGG + Chr3:83796568-83796587 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GAAATGGGCATCAGGCATTA+TGG + Chr3:83796734-83796753 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GCACATAGCCCATTCATTTG+AGG - Chr3:83797118-83797137 None:intergenic 45.0%
GCCCCCAAAACTGTTTCATT+AGG - Chr3:83796836-83796855 None:intergenic 45.0%
GGAAATGGAAGATGCAAGAG+AGG + Chr3:83796088-83796107 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GGAGGATCTGAAAAGATACC+AGG + Chr3:83797031-83797050 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GTATGCAAAATGTGGGGACT+TGG + Chr3:83796469-83796488 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCAGCGTATGCAAAATG+TGG + Chr3:83795780-83795799 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGAGTCAGATGATTGGT+GGG + Chr3:83795952-83795971 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGGTCGTCTATGGTTTG+TGG + Chr3:83796143-83796162 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
TCCGATGTCGATGTGTTCAT+TGG + Chr3:83795747-83795766 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
TGAGTATTTGGGTAGGATGG+AGG + Chr3:83796595-83796614 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGGAATGCTATGATTGC+AGG + Chr3:83796539-83796558 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
TTATGTGCTTGTGCTCAGCT+CGG + Chr3:83796356-83796375 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! ACATGGACTGTGATGGTTGA+TGG + Chr3:83796050-83796069 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTGCGTTTGAAGCAATGC+CGG + Chr3:83795914-83795933 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGCAGGTTTTGCCGTCAA+TGG + Chr3:83796554-83796573 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! CATGGACTGTGATGGTTGAT+GGG + Chr3:83796051-83796070 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! CGCATGCTTTGAGTAACTGA+GGG - Chr3:83795668-83795687 None:intergenic 45.0%
! CGGTTCGGAATTTGGAGATT+TGG + Chr3:83796219-83796238 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! GGACTTGGTTAATGCAAGGT+TGG + Chr3:83796484-83796503 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTATGCACAGAATGGATT+TGG + Chr3:83796257-83796276 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! GTGAGTTGGAGTCAGATGAT+TGG + Chr3:83795948-83795967 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! TCCGTATGAGTTGAAGGATG+TGG + Chr3:83796025-83796044 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
! TCGCATGCTTTGAGTAACTG+AGG - Chr3:83795669-83795688 None:intergenic 45.0%
!! ACTGAAGGCTTTTGGGGAAA+TGG + Chr3:83796289-83796308 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! AGATGATTGGTGGGTTTGCT+AGG + Chr3:83795961-83795980 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGAGTAGAATGGTTGATGG+AGG + Chr3:83797013-83797032 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGGTGGGTTTGCTAGGAA+TGG + Chr3:83795966-83795985 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTAGTTAATGGGTTTGAGC+CGG + Chr3:83796310-83796329 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGGTGGGTTTGCTAGGAAT+GGG + Chr3:83795967-83795986 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGATGGATTCTGCGTGCA+AGG - Chr3:83795721-83795740 None:intergenic 45.0%
!! TTTTTCGAAGGGTTCCGGTT+CGG + Chr3:83796204-83796223 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!!! ACAGTTTTGGGGGCAATGAT+CGG + Chr3:83796842-83796861 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAAAGCACTGAAGGCTTTTG+GGG + Chr3:83796283-83796302 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAGAAAGCACTGAAGGCTTT+TGG + Chr3:83796281-83796300 MsG0380016455.01.T01:CDS 45.0%
AGCTTGTGCTCATGGAGGTT+TGG + Chr3:83796664-83796683 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
ATGGGGATACTGCAACTGCT+AGG + Chr3:83795985-83796004 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
CACGCAGAATCCATCAAAGC+CGG + Chr3:83795723-83795742 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
CTGTGCATACCCAGCAATCA+TGG - Chr3:83796249-83796268 None:intergenic 50.0%
GAACACATCGACATCGGAAC+CGG - Chr3:83795745-83795764 None:intergenic 50.0%
GAGTAACTGAGGGATCATGG+TGG - Chr3:83795658-83795677 None:intergenic 50.0%
GGATGCATGGTTGACCTCTT+GGG + Chr3:83796755-83796774 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
GGGAAGAGCAGGGATGTTAA+AGG + Chr3:83796775-83796794 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
GTAACTGAGGGATCATGGTG+GGG - Chr3:83795656-83795675 None:intergenic 50.0%
GTACTCTCAGCTTGTGCTCA+TGG + Chr3:83796656-83796675 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
TATGTGCTTGTGCTCAGCTC+GGG + Chr3:83796357-83796376 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
TGCATACGCTGCAACAATGG+CGG - Chr3:83795775-83795794 None:intergenic 50.0%
TGGATGCATGGTTGACCTCT+TGG + Chr3:83796754-83796773 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
TTGACCTCTTGGGAAGAGCA+GGG + Chr3:83796765-83796784 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
! CTTGCGTTTGAAGCAATGCC+GGG + Chr3:83795915-83795934 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
! GTGGGGACTTGGTTAATGCA+AGG + Chr3:83796480-83796499 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
! TGTGGTGACATGGACTGTGA+TGG + Chr3:83796043-83796062 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
! TTGCGTTTGAAGCAATGCCG+GGG + Chr3:83795916-83795935 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
!! AAGGGTTCCGGTTCGGAATT+TGG + Chr3:83796211-83796230 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGGGTCGTGTGTTGTTTCA+TGG - Chr3:83795638-83795657 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGGGTTTGCTAGGAATG+GGG + Chr3:83795968-83795987 MsG0380016455.01.T01:CDS 50.0%
AAGCAATGCCGGGGAAAACG+AGG + Chr3:83795925-83795944 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
ACATCCCTGCTCTTCCCAAG+AGG - Chr3:83796772-83796791 None:intergenic 55.0%
AGCAATGCCGGGGAAAACGA+GGG + Chr3:83795926-83795945 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
AGGTTGTGTCATGGAGGCTG+AGG + Chr3:83796178-83796197 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
ATGTGCTTGTGCTCAGCTCG+GGG + Chr3:83796358-83796377 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
CTCTCAGCTTGTGCTCATGG+AGG + Chr3:83796659-83796678 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
GTTGACCTCTTGGGAAGAGC+AGG + Chr3:83796764-83796783 MsG0380016455.01.T01:CDS 55.0%
! CAACTCACCCTCGTTTTCCC+CGG - Chr3:83795936-83795955 None:intergenic 55.0%
! GACATCGGAACCGGCTTTGA+TGG - Chr3:83795736-83795755 None:intergenic 55.0%
CGGGGAAAACGAGGGTGAGT+TGG + Chr3:83795934-83795953 MsG0380016455.01.T01:CDS 60.0%
TTGTGCTCAGCTCGGGGACT+TGG + Chr3:83796364-83796383 MsG0380016455.01.T01:CDS 60.0%
CAGCTCGGGGACTTGGATGC+TGG + Chr3:83796371-83796390 MsG0380016455.01.T01:CDS 65.0%
GGGCAATGATCGGCGCTTGC+TGG + Chr3:83796852-83796871 MsG0380016455.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 83795516 83797144 83795516 ID=MsG0380016455.01;Name=MsG0380016455.01
Chr3 mRNA 83795516 83797144 83795516 ID=MsG0380016455.01.T01;Parent=MsG0380016455.01;Name=MsG0380016455.01.T01;_AED=0.10;_eAED=0.10;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|542
Chr3 exon 83795516 83797144 83795516 ID=MsG0380016455.01.T01:exon:14059;Parent=MsG0380016455.01.T01
Chr3 CDS 83795516 83797144 83795516 ID=MsG0380016455.01.T01:cds;Parent=MsG0380016455.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380016455.01.T01

ATGAACATGAAACAAGTCAAAAAAATTGGTGGAATCACAAATTGGTCTCATTCAATAAGGAACAACAGTACTAACCAAGCATCATTGAAAAAGGCTCTTGTTTTGTACAAACAAACTCGCCATGAAACAACACACGACCCCACCATGATCCCTCAGTTACTCAAAGCATGCGATTCTCACCTCTTCCTTCATTACGTTAAATCCTTGCACGCAGAATCCATCAAAGCCGGTTCCGATGTCGATGTGTTCATTGGAACCGCCATTGTTGCAGCGTATGCAAAATGTGGTGTTGTTTGCGATGCATGCAAGTTGTTTGATTTTATGCCTGAAAGAAATGTTGTGACTTGGAATGCAATGATTGGTGGGTATTTGAGAAATGGTGACGCTGAATCTGCGTTACTTGCGTTTGAAGCAATGCCGGGGAAAACGAGGGTGAGTTGGAGTCAGATGATTGGTGGGTTTGCTAGGAATGGGGATACTGCAACTGCTAGGAAGTTTTTTGATAAGGTTCCGTATGAGTTGAAGGATGTGGTGACATGGACTGTGATGGTTGATGGGTATGCTAAGAAAGGGGAAATGGAAGATGCAAGAGAGGTTTTTGAGTTAATGCCCGAAAGGAATTGCTTTGTTTGGTCGTCTATGGTTTGTGGGTATTGTAAGAAAGGTTGTGTCATGGAGGCTGAGGATATTTTTCGAAGGGTTCCGGTTCGGAATTTGGAGATTTGGAATTCCATGATTGCTGGGTATGCACAGAATGGATTTGGTGAGAAAGCACTGAAGGCTTTTGGGGAAATGGTAGTTAATGGGTTTGAGCCGGATGAGTTCACTGTTGTTAGTGTTTTATGTGCTTGTGCTCAGCTCGGGGACTTGGATGCTGGAAAACAGATGCATCACATGATAGAATGTAAAGGAATAGCTGTGAACCAGTTTGTTTTGAGTGGATTGATTGACATGTATGCAAAATGTGGGGACTTGGTTAATGCAAGGTTGGTATTTGAAAGTTGTAATGAGAGGAATGTTTTCTGCTGGAATGCTATGATTGCAGGTTTTGCCGTCAATGGACAATGCAATGAGGTTCTTGAGTATTTGGGTAGGATGGAGGAGTCAAATATAAGGCCTGATGCTGTCACGTTTATTACTGTACTCTCAGCTTGTGCTCATGGAGGTTTGGTGAGCGAAGCGTTGAAAGTAATATCTAAAATGGAGGAATATGGAATTGAAATGGGCATCAGGCATTATGGATGCATGGTTGACCTCTTGGGAAGAGCAGGGATGTTAAAGGAGGCATATGAGTTAATAAAAAGAATGCCAATGAAACCTAATGAAACAGTTTTGGGGGCAATGATCGGCGCTTGCTGGATTCATTCAGATATGAAAATGGCAGAACAAGTAACGAAGATGATCGGTGCAGACACTGCTACATGTGTTAATTCGCACAATGTGCTTCTGTCAAATATCTACGCAGCTTCAGAAAAATGGGAGAAAGCTGAAATGATAAGGAGTAGAATGGTTGATGGAGGATCTGAAAAGATACCAGGGTGTAGTTCAATCATCCTTAGTAACTCTGCTGTTGATTTAAGCATAAGTGAAGAAGTTTCACCTCAAATGAATGGGCTATGTGCAATCTAA
Protein sequence

>MsG0380016455.01.T01

MNMKQVKKIGGITNWSHSIRNNSTNQASLKKALVLYKQTRHETTHDPTMIPQLLKACDSHLFLHYVKSLHAESIKAGSDVDVFIGTAIVAAYAKCGVVCDACKLFDFMPERNVVTWNAMIGGYLRNGDAESALLAFEAMPGKTRVSWSQMIGGFARNGDTATARKFFDKVPYELKDVVTWTVMVDGYAKKGEMEDAREVFELMPERNCFVWSSMVCGYCKKGCVMEAEDIFRRVPVRNLEIWNSMIAGYAQNGFGEKALKAFGEMVVNGFEPDEFTVVSVLCACAQLGDLDAGKQMHHMIECKGIAVNQFVLSGLIDMYAKCGDLVNARLVFESCNERNVFCWNAMIAGFAVNGQCNEVLEYLGRMEESNIRPDAVTFITVLSACAHGGLVSEALKVISKMEEYGIEMGIRHYGCMVDLLGRAGMLKEAYELIKRMPMKPNETVLGAMIGACWIHSDMKMAEQVTKMIGADTATCVNSHNVLLSNIYAASEKWEKAEMIRSRMVDGGSEKIPGCSSIILSNSAVDLSISEEVSPQMNGLCAI*