AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017142.01

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MsG0380017142.01.T01 AT3G11460 32.848 481 315 3 226 698 21 501 3.84e-92 300
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MsG0380017142.01.T01 AT4G02750 24.605 443 289 9 95 534 192 592 1.74e-28 122
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MsG0380017142.01.T01 AT1G56570 23.235 439 317 9 27 455 90 518 3.21e-33 136
MsG0380017142.01.T01 AT1G56570 25.393 382 245 9 289 633 47 425 2.95e-32 133
MsG0380017142.01.T01 AT1G56570 24.783 230 157 6 19 241 284 504 4.18e-16 82.8
MsG0380017142.01.T01 AT1G56570 23.984 246 180 5 389 631 46 287 4.43e-13 73.2
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MsG0380017142.01.T01 AT5G59200 22.782 496 310 7 157 618 29 485 4.03e-27 117
MsG0380017142.01.T01 AT5G59200 26.897 290 164 6 14 267 88 365 6.68e-26 113
MsG0380017142.01.T01 AT5G59200 31.293 147 75 2 30 167 237 366 4.68e-14 75.9
MsG0380017142.01.T01 AT2G33760 31.944 432 290 2 272 699 26 457 1.19e-75 255
MsG0380017142.01.T01 AT2G33760 30.000 260 168 3 16 269 70 321 9.41e-35 140
MsG0380017142.01.T01 AT2G33760 24.533 375 267 5 173 533 22 394 2.58e-32 133
MsG0380017142.01.T01 AT2G33760 23.725 451 303 10 76 501 26 460 4.10e-32 132
MsG0380017142.01.T01 AT2G33760 26.457 223 145 6 19 232 178 390 2.08e-15 80.5
MsG0380017142.01.T01 AT1G06140 28.598 535 369 6 177 699 24 557 1.43e-75 254
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MsG0380017142.01.T01 AT2G44880 24.206 504 332 14 33 515 2 476 1.76e-35 142
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MsG0380017142.01.T01 AT2G44880 27.214 463 250 17 46 488 76 471 7.76e-37 146
MsG0380017142.01.T01 AT2G44880 24.890 454 300 13 83 515 2 435 1.77e-34 139
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MsG0380017142.01.T01 AT4G21065 28.659 164 115 2 467 630 1 162 9.19e-19 90.5
MsG0380017142.01.T01 AT4G21065 23.364 214 148 6 32 238 73 277 3.27e-12 69.7
MsG0380017142.01.T01 AT5G04780 28.873 426 301 2 275 699 84 508 5.78e-71 244
MsG0380017142.01.T01 AT5G04780 27.251 411 281 6 156 554 60 464 8.03e-40 156
MsG0380017142.01.T01 AT5G04780 22.908 502 362 9 41 527 46 537 7.80e-30 125
MsG0380017142.01.T01 AT5G04780 29.114 237 160 2 30 266 144 372 2.34e-29 124
MsG0380017142.01.T01 AT5G04780 25.767 163 112 2 32 194 247 400 1.68e-12 71.2
MsG0380017142.01.T01 AT3G46790 27.490 502 341 5 224 706 47 544 6.50e-71 244
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MsG0380017142.01.T01 AT1G53600 32.353 136 84 1 32 167 422 549 3.96e-13 73.6
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MsG0380017142.01.T01 AT4G31070 25.532 470 336 5 77 534 79 546 2.83e-47 177
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MsG0380017142.01.T01 AT1G74630 29.787 235 146 5 37 267 161 380 3.68e-27 117
MsG0380017142.01.T01 AT1G74630 24.221 289 192 10 32 312 253 522 2.34e-13 73.9
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MsG0380017142.01.T01 AT1G74630 25.681 514 331 13 50 554 15 486 7.78e-36 144
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MsG0380017142.01.T01 AT1G03510 24.167 360 221 9 122 434 12 366 6.31e-23 102
MsG0380017142.01.T01 AT1G03510 21.053 247 171 7 16 250 144 378 6.73e-11 65.5
MsG0380017142.01.T01 AT4G22760 29.741 501 302 8 225 685 71 561 8.63e-64 223
MsG0380017142.01.T01 AT4G22760 22.156 501 343 9 74 533 18 512 2.00e-34 139
MsG0380017142.01.T01 AT4G22760 23.518 523 314 13 35 520 91 564 4.39e-27 117
MsG0380017142.01.T01 AT4G22760 22.911 371 244 8 297 635 49 409 7.89e-18 88.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G31920 31.707 410 272 2 321 722 100 509 9.05e-64 223
MsG0380017142.01.T01 AT1G31920 26.115 314 223 4 125 429 100 413 7.90e-26 113
MsG0380017142.01.T01 AT1G31920 25.316 237 168 2 32 267 116 344 3.77e-21 98.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G31920 22.909 275 168 4 407 642 85 354 5.49e-17 85.5
MsG0380017142.01.T01 AT5G44230 30.233 430 261 5 306 698 5 432 9.55e-64 222
MsG0380017142.01.T01 AT5G44230 23.035 369 230 11 109 429 4 366 1.43e-22 102
MsG0380017142.01.T01 AT5G44230 22.593 270 167 4 32 267 36 297 1.77e-17 87.0
MsG0380017142.01.T01 AT3G18840 25.733 614 347 8 180 684 11 624 2.43e-63 224
MsG0380017142.01.T01 AT3G18840 22.794 544 306 9 74 508 11 549 8.99e-33 135
MsG0380017142.01.T01 AT3G18840 19.714 350 240 7 121 429 224 573 9.31e-14 75.5
MsG0380017142.01.T01 AT3G18840 27.807 187 127 4 67 249 403 585 9.98e-13 72.0
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MsG0380017142.01.T01 AT1G74400 25.278 360 216 11 174 516 82 405 2.22e-20 95.5
MsG0380017142.01.T01 AT1G74400 23.988 321 212 7 50 348 64 374 2.58e-19 92.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G09220 33.119 311 203 4 392 697 193 503 1.20e-54 196
MsG0380017142.01.T01 AT1G09220 25.723 346 207 9 47 348 120 459 9.54e-22 100
MsG0380017142.01.T01 AT1G09220 24.920 313 185 9 280 548 151 457 2.32e-18 89.4
MsG0380017142.01.T01 AT4G14050 35.294 306 186 4 392 687 122 425 7.21e-54 195
MsG0380017142.01.T01 AT4G14050 26.019 319 199 5 254 537 55 371 3.97e-26 114
MsG0380017142.01.T01 AT4G14050 26.201 229 137 2 71 267 67 295 5.27e-23 104
MsG0380017142.01.T01 AT4G14050 26.846 149 100 2 32 179 168 308 6.09e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT3G26630 29.948 384 236 4 272 622 37 420 2.60e-52 188
MsG0380017142.01.T01 AT3G26630 26.196 397 241 8 67 418 30 419 2.12e-28 119
MsG0380017142.01.T01 AT3G26630 31.923 260 137 3 47 274 118 369 3.41e-27 115
MsG0380017142.01.T01 AT3G26630 23.684 342 195 6 367 642 31 372 3.28e-17 85.5
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MsG0380017142.01.T01 AT3G51320 24.346 382 216 8 24 350 94 457 3.09e-24 107
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MsG0380017142.01.T01 AT1G62670 20.520 346 263 4 308 642 71 415 4.92e-13 73.2
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MsG0380017142.01.T01 AT1G63150 20.400 500 327 12 196 649 87 561 5.74e-18 88.6
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MsG0380017142.01.T01 AT1G74850 22.244 517 363 14 132 617 115 623 2.43e-14 77.4
MsG0380017142.01.T01 AT1G74850 20.623 514 357 12 191 683 140 623 3.97e-14 76.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G74850 25.359 209 146 5 490 689 177 384 2.01e-11 68.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 26.238 202 144 2 420 617 400 600 3.20e-14 77.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 21.405 299 223 4 282 568 359 657 6.67e-11 66.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 26.238 202 144 2 420 617 400 600 3.20e-14 77.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 21.405 299 223 4 282 568 359 657 6.67e-11 66.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 26.238 202 144 2 420 617 400 600 3.20e-14 77.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 21.405 299 223 4 282 568 359 657 6.67e-11 66.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 26.238 202 144 2 420 617 400 600 3.51e-14 77.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G18900 21.405 299 223 4 282 568 359 657 6.10e-11 66.6
MsG0380017142.01.T01 AT2G36240 22.936 327 229 7 323 632 162 482 8.58e-14 75.1
MsG0380017142.01.T01 AT2G17140 22.747 466 289 14 201 639 154 575 9.12e-14 75.5
MsG0380017142.01.T01 AT2G17140 19.138 580 381 15 13 558 107 632 4.46e-13 73.6
MsG0380017142.01.T01 AT2G17140 22.747 466 289 14 201 639 154 575 9.12e-14 75.5
MsG0380017142.01.T01 AT2G17140 19.138 580 381 15 13 558 107 632 4.46e-13 73.6
MsG0380017142.01.T01 AT5G18475 24.151 265 179 7 387 639 240 494 1.13e-13 74.7
MsG0380017142.01.T01 AT3G16010 22.439 410 269 10 191 564 232 628 1.56e-13 74.7
MsG0380017142.01.T01 AT3G16010 25.455 330 215 12 390 697 164 484 2.91e-12 70.5
MsG0380017142.01.T01 AT1G30290 19.298 513 374 10 75 554 261 766 1.81e-13 74.7
MsG0380017142.01.T01 AT3G04760 25.564 266 173 10 387 632 157 417 2.26e-13 73.9
MsG0380017142.01.T01 AT1G30290 19.298 513 374 10 75 554 261 766 2.32e-13 74.3
MsG0380017142.01.T01 AT4G11690 21.609 435 312 9 226 632 97 530 3.71e-13 73.2
MsG0380017142.01.T01 AT3G07290 24.907 269 189 5 380 636 222 489 3.84e-13 73.6
MsG0380017142.01.T01 AT3G07290 21.109 469 292 10 184 584 222 680 2.19e-12 71.2
MsG0380017142.01.T01 AT3G16890 20.467 557 382 10 114 611 102 656 4.81e-13 73.2
MsG0380017142.01.T01 AT3G16890 21.899 516 326 14 205 691 164 631 1.03e-11 68.9
MsG0380017142.01.T01 AT5G50280 25.444 338 222 11 316 632 271 599 6.29e-13 72.8
MsG0380017142.01.T01 AT3G04760 23.739 337 232 12 312 632 120 447 6.73e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT3G04760 23.162 272 196 5 380 641 116 384 9.44e-13 72.0
MsG0380017142.01.T01 AT3G04760 24.535 269 185 6 431 687 101 363 2.83e-11 67.4
MsG0380017142.01.T01 AT5G61400 22.162 370 249 7 206 562 248 591 6.93e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT5G61400 21.065 432 270 8 235 658 211 579 4.67e-12 70.1
MsG0380017142.01.T01 AT4G11690 19.662 473 302 11 226 632 97 557 7.47e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT4G11690 21.346 431 283 9 49 462 164 555 4.09e-12 70.1
MsG0380017142.01.T01 AT5G38730 20.166 362 268 7 219 562 131 489 7.86e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT1G03560 23.077 351 194 8 379 687 217 533 8.89e-13 72.4
MsG0380017142.01.T01 AT5G65820 25.610 246 173 4 381 618 211 454 1.07e-12 72.0
MsG0380017142.01.T01 AT4G34830 21.141 298 186 7 381 630 495 791 1.20e-12 72.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G74750 25.217 230 166 3 393 617 367 595 1.42e-12 71.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G74750 25.217 230 166 3 393 617 367 595 1.42e-12 71.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G74750 25.217 230 166 3 393 617 367 595 1.42e-12 71.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G74750 25.217 230 166 3 393 617 367 595 1.42e-12 71.6
MsG0380017142.01.T01 AT3G16890 20.868 484 322 10 187 611 46 527 2.94e-12 70.1
MsG0380017142.01.T01 AT3G16890 21.923 520 321 15 205 691 35 502 2.84e-11 67.0
MsG0380017142.01.T01 AT1G20300 19.465 411 289 5 219 617 147 527 3.14e-12 70.1
MsG0380017142.01.T01 AT1G02060 21.429 420 288 10 226 610 141 553 3.79e-12 70.1
MsG0380017142.01.T01 AT1G08610 22.373 295 217 4 351 634 172 465 5.19e-12 69.7
MsG0380017142.01.T01 AT5G46680 27.092 251 166 7 379 617 39 284 6.27e-12 68.9
MsG0380017142.01.T01 AT1G10910 23.529 238 163 5 423 647 170 401 1.29e-11 68.6
MsG0380017142.01.T01 AT1G10910 23.529 238 163 5 423 647 170 401 1.59e-11 68.2
MsG0380017142.01.T01 AT1G11710 20.559 501 321 11 168 604 166 653 2.41e-11 67.8
MsG0380017142.01.T01 AT1G11710 20.559 501 321 11 168 604 137 624 2.61e-11 67.4
MsG0380017142.01.T01 AT4G26800 19.817 328 240 7 341 655 1 318 6.84e-11 65.1
MsG0380017142.01.T01 AT4G26800 20.120 333 243 7 336 655 141 463 6.91e-11 65.9
MsG0380017142.01.T01 AT4G26800 20.120 333 243 7 336 655 66 388 7.03e-11 65.5

Find 136 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 163 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCACGTTAGCCTGTAAAATT+TGG 0.218146 3:+92522283 None:intergenic
GTGCAGGGCTCGTCGCATTT+TGG 0.261184 3:+92522319 None:intergenic
TTTGGAATTAAAGCTGGTTT+TGG 0.270382 3:-92521850 MsG0380017142.01.T01:CDS
AATCACCTTCTTGGGAGTTT+TGG 0.271160 3:-92520729 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATCTCTAGCTATTCTGTAAA+AGG 0.274434 3:-92521421 MsG0380017142.01.T01:CDS
GCATGCATAGTTGCTCTATT+AGG 0.280063 3:-92520611 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATATCAGGTTATAGTTTATA+TGG 0.286861 3:-92520815 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTCAGCCCGATTCTGCTGTC+TGG 0.299401 3:-92520538 MsG0380017142.01.T01:CDS
AAGTATTAACATGAATAAAT+TGG 0.302532 3:+92522130 None:intergenic
CTAACAATTGTAGTTTGATT+AGG 0.308636 3:+92521931 None:intergenic
ACCAGATAAAATCACCTTCT+TGG 0.313613 3:-92520738 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATTTGTGGGTATTCGCATAA+TGG 0.314603 3:-92522009 MsG0380017142.01.T01:CDS
ACGAGAAGAGTGTTGTTTCT+TGG 0.321411 3:-92521738 MsG0380017142.01.T01:CDS
CTTACAGAGACGTTGTTTCA+TGG 0.322653 3:-92522041 MsG0380017142.01.T01:CDS
GGACTTGAGCAGAAAGCTTT+TGG 0.324392 3:-92520794 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGTGGAGGAGATGGATGTTC+AGG 0.324845 3:-92520338 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTATATCTAACTGAATAGTT+TGG 0.327973 3:+92521368 None:intergenic
TGTATCGGCAAATGCATTTC+CGG 0.329879 3:-92521602 MsG0380017142.01.T01:CDS
AATTGAATTTATAAACAAAA+TGG 0.329948 3:-92520564 MsG0380017142.01.T01:CDS
GGATGCACTTTCCACGGTTA+TGG 0.341833 3:-92521280 MsG0380017142.01.T01:CDS
ACATGGAATTCTATGATATC+TGG 0.347383 3:-92521133 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGAGAGATTGGGTTTGAATC+TGG 0.349491 3:+92522166 None:intergenic
TAACGCCACGTTTGAGAGAT+TGG 0.353277 3:+92522154 None:intergenic
GGTAGATCCATTCATGGGTT+TGG 0.353853 3:-92521868 MsG0380017142.01.T01:CDS
ACATGGAATGCCATCATATC+AGG 0.357575 3:-92520830 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGAGTGAAACAGAGAAAGAT+TGG 0.364580 3:+92522347 None:intergenic
GTATGCTAAATGTGATGATT+TGG 0.370689 3:-92521791 MsG0380017142.01.T01:CDS
CATGGAATGTATTGATTTGT+GGG 0.375483 3:-92522023 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGCTCCCCAGACAGCAGAAT+CGG 0.385206 3:+92520532 None:intergenic
CCATTTCACCAAACAAAAGT+TGG 0.388407 3:+92521761 None:intergenic
TAACATCAAGGATCCATGTT+TGG 0.390148 3:-92520855 MsG0380017142.01.T01:CDS
AAAGCAAGGGTTCACATATA+TGG 0.390343 3:-92521500 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGGGTTGTCTAATGATTGTT+TGG 0.394110 3:-92521248 MsG0380017142.01.T01:CDS
TCAAATCTTTATGCCATTGT+TGG 0.394446 3:-92520404 MsG0380017142.01.T01:CDS
AATGATTGTTTGGTTGCAAA+TGG 0.395360 3:-92521238 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTTGTGGGTATTCGCATAAT+GGG 0.405091 3:-92522008 MsG0380017142.01.T01:CDS
CCAGATGCAGTTGCTTTGAT+TGG 0.411048 3:-92521343 MsG0380017142.01.T01:CDS
CCAGATAAAATCACCTTCTT+GGG 0.411735 3:-92520737 MsG0380017142.01.T01:CDS
TCCAACGAGAGGTGAAGCTT+GGG 0.413379 3:-92520490 MsG0380017142.01.T01:CDS
GCTTTGATTGGTGTACTTCA+TGG 0.421933 3:-92521331 MsG0380017142.01.T01:CDS
GGAAGGTTTCCAACCTAGTT+CGG 0.422218 3:-92521641 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGCTTCTGTTGTTACTTCGC+TGG 0.424308 3:-92521536 MsG0380017142.01.T01:CDS
AATGTCATGACTGAAGAGTA+TGG 0.426507 3:-92520659 MsG0380017142.01.T01:CDS
CAAATCTTTATGCCATTGTT+GGG 0.427410 3:-92520403 MsG0380017142.01.T01:CDS
CTTCAAGGTAGATCCATTCA+TGG 0.428128 3:-92521874 MsG0380017142.01.T01:CDS
CCAATCAAAGCAACTGCATC+TGG 0.432711 3:+92521343 None:intergenic
AACGCCACGTTTGAGAGATT+GGG 0.441143 3:+92522155 None:intergenic
TCAGCCCGATTCTGCTGTCT+GGG 0.444522 3:-92520537 MsG0380017142.01.T01:CDS
TCATGGAATGTATTGATTTG+TGG 0.447363 3:-92522024 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTTATGCCATTGTTGGGAGA+TGG 0.458942 3:-92520397 MsG0380017142.01.T01:CDS
CATGCATAATGTTGCAGACT+CGG 0.459501 3:+92520629 None:intergenic
TTTAATTCCAAACCCATGAA+TGG 0.461210 3:+92521861 None:intergenic
AAGACTAGATTATGCTGAAA+AGG 0.464192 3:-92520885 MsG0380017142.01.T01:CDS
GTTGCTCTATTAGGTAAAGA+AGG 0.466382 3:-92520602 MsG0380017142.01.T01:CDS
CATGGGTTTGGAATTAAAGC+TGG 0.467131 3:-92521856 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTCATTATCGTAACCGAACT+AGG 0.467553 3:+92521628 None:intergenic
GGGTCTGCTTCTGAGGCAGC+AGG 0.471750 3:+92522368 None:intergenic
CATTGTTATGTTGTCAAATG+TGG 0.475174 3:-92521571 MsG0380017142.01.T01:CDS
CACGGTTATGGTGTGAAGAG+TGG 0.475438 3:-92521268 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGGCGAAATATAACAAGTGC+AGG 0.478230 3:+92522303 None:intergenic
ATCCAACGAGAGGTGAAGCT+TGG 0.481200 3:-92520491 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGGTAAAGAAGGCTTGTTCA+AGG 0.481949 3:-92520591 MsG0380017142.01.T01:CDS
CTAGCAATAGTAATGGCATC+TGG 0.483553 3:+92521040 None:intergenic
GTTTCTTGGAATACTATGAT+TGG 0.485140 3:-92521724 MsG0380017142.01.T01:CDS
GAGTGAAACAGAGAAAGATT+GGG 0.486880 3:+92522348 None:intergenic
AGGATCCATGTTTGGCAACA+TGG 0.488897 3:-92520847 MsG0380017142.01.T01:CDS
GGTGAAGCTTGGGGAGTGCT+TGG 0.491626 3:-92520480 MsG0380017142.01.T01:CDS
CATTTCACCAAACAAAAGTT+GGG 0.494669 3:+92521762 None:intergenic
TATGATATCTGGCTGTGTGC+AGG 0.496391 3:-92521122 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATTGATTTGTACATGAAACT+TGG 0.500728 3:-92522102 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTATGCCATTGTTGGGAGAT+GGG 0.501194 3:-92520396 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATGAAAGATAGTGGAGGAGA+TGG 0.501633 3:-92520347 MsG0380017142.01.T01:CDS
GCATTCCATGTTGCCAAACA+TGG 0.503191 3:+92520842 None:intergenic
GCTCCCCAGACAGCAGAATC+GGG 0.514424 3:+92520533 None:intergenic
GTATTCAAATAGACTTCACT+TGG 0.514864 3:+92520263 None:intergenic
CAGCTTGGTAACCTGCGGAT+TGG 0.515128 3:-92520998 MsG0380017142.01.T01:CDS
TAAACTATAACCTGATATGA+TGG 0.515851 3:+92520820 None:intergenic
TTATCGTAACCGAACTAGGT+TGG 0.517694 3:+92521632 None:intergenic
GGGATGATGTAGCAAGGGTG+AGG 0.518265 3:-92520376 MsG0380017142.01.T01:CDS
AAAGATTGGGTCTGCTTCTG+AGG 0.518657 3:+92522361 None:intergenic
GGGATTTGTCTATTTAGGAC+TGG 0.519068 3:-92520690 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGGGAAATGATGAAAGATAG+TGG 0.519907 3:-92520356 MsG0380017142.01.T01:CDS
GTTAGTTTGTTACCTTCTTG+TGG 0.521528 3:-92521913 MsG0380017142.01.T01:CDS
GCTATTGGATGCACTTTCCA+CGG 0.528010 3:-92521286 MsG0380017142.01.T01:CDS
CCCCAAGCTTCACCTCTCGT+TGG 0.529753 3:+92520489 None:intergenic
ATATCTGGCTGTGTGCAGGC+TGG 0.533596 3:-92521118 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATCATAAAACAGAGATAAAG+CGG 0.535567 3:+92521177 None:intergenic
CAATCCGCAGGTTACCAAGC+TGG 0.536341 3:+92520999 None:intergenic
CGCTGCATAGTTACATTCTG+AGG 0.539677 3:-92520970 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTCAAGGTAGATCCATTCAT+GGG 0.540972 3:-92521873 MsG0380017142.01.T01:CDS
GATGAACAATGAGTGAAAGA+AGG 0.542010 3:+92522210 None:intergenic
TATTCTAAACTGCAAGAACA+AGG 0.542195 3:-92520767 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATGATTGTTTGGTTGCAAAT+GGG 0.544603 3:-92521237 MsG0380017142.01.T01:CDS
TACGATAATGAATCTTGTAT+CGG 0.554089 3:-92521617 MsG0380017142.01.T01:CDS
AATACTATGATTGGTGCCTA+TGG 0.556006 3:-92521715 MsG0380017142.01.T01:CDS
GGAGATGGGATGATGTAGCA+AGG 0.559567 3:-92520382 MsG0380017142.01.T01:CDS
GTTTGTCTATATGCAAAGCA+AGG 0.562191 3:-92521514 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGCTGCCAAAACTCCCAAGA+AGG 0.572030 3:+92520724 None:intergenic
TTCTCTAAAATGAGCATGTG+TGG 0.573182 3:-92521070 MsG0380017142.01.T01:CDS
AAACATGTTGCGTGCATGAG+AGG 0.577686 3:+92522074 None:intergenic
GCAGCGTCTCTCCAATCCGC+AGG 0.583407 3:+92520987 None:intergenic
GGATGATGTAGCAAGGGTGA+GGG 0.587160 3:-92520375 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTTGGCAGCATGCACGCACG+GGG 0.589430 3:-92520711 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTTAAAGAGATGCTGAAGGA+AGG 0.592728 3:-92521658 MsG0380017142.01.T01:CDS
AAATAGACTAGCAATAGTAA+TGG 0.595721 3:+92521033 None:intergenic
ATAGACATGTATAGCAAGTG+TGG 0.598023 3:-92520908 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTGCTTTAAAGAGATGCTGA+AGG 0.599594 3:-92521662 MsG0380017142.01.T01:CDS
AGCTCAAAACAACCACAAGA+AGG 0.600082 3:+92521901 None:intergenic
ACGGTTATGGTGTGAAGAGT+GGG 0.602800 3:-92521267 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGGAAAGTCAAGTGATGCCA+TGG 0.603621 3:-92521098 MsG0380017142.01.T01:CDS
TCTATTTGAATACAAGCACT+TGG 0.606253 3:-92520253 MsG0380017142.01.T01:CDS
ACATTCTGAGGAACAATGTG+AGG 0.608005 3:-92520958 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATAGAATTCCATGTGATCAG+TGG 0.610821 3:+92521142 None:intergenic
CATCCAATAGCAAAATGTGA+AGG 0.614198 3:+92521298 None:intergenic
GGTCTGCTTCTGAGGCAGCA+GGG 0.617791 3:+92522369 None:intergenic
GAGATGGGATGATGTAGCAA+GGG 0.625458 3:-92520381 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTTGTCTATATGCAAAGCAA+GGG 0.627448 3:-92521513 MsG0380017142.01.T01:CDS
GTTGCCAGCTTGGTAACCTG+CGG 0.629505 3:-92521003 MsG0380017142.01.T01:CDS
TATTCAAATAGACTTCACTT+GGG 0.631298 3:+92520264 None:intergenic
GAGGCAGCAGGGAATCGTTG+TGG 0.631927 3:+92522380 None:intergenic
ATTCTAAACTGCAAGAACAA+GGG 0.634038 3:-92520766 MsG0380017142.01.T01:CDS
CAGCCCGATTCTGCTGTCTG+GGG 0.640328 3:-92520536 MsG0380017142.01.T01:CDS
TGCTTGTTGCATCCAACGAG+AGG 0.641777 3:-92520501 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATCATCCCATCTCCCAACAA+TGG 0.645963 3:+92520391 None:intergenic
GGCGAAATATAACAAGTGCA+GGG 0.651577 3:+92522304 None:intergenic
CACTCTTCACACCATAACCG+TGG 0.653361 3:+92521269 None:intergenic
CCAACGAGAGGTGAAGCTTG+GGG 0.658676 3:-92520489 MsG0380017142.01.T01:CDS
TCTCTAAAATGAGCATGTGT+GGG 0.666664 3:-92521069 MsG0380017142.01.T01:CDS
GCAGCAGGGAATCGTTGTGG+AGG 0.668066 3:+92522383 None:intergenic
AAAAGGTGATATAGAGTCTG+CGG 0.670794 3:-92521404 MsG0380017142.01.T01:CDS
CAAACCCAATCTCTCAAACG+TGG 0.679542 3:-92522159 MsG0380017142.01.T01:CDS
CATTCTGAGGAACAATGTGA+GGG 0.682663 3:-92520957 MsG0380017142.01.T01:CDS
GAAATGATGAAAGATAGTGG+AGG 0.687671 3:-92520353 MsG0380017142.01.T01:CDS
ATTGGTGCCTATGGTCAAAG+TGG 0.687934 3:-92521706 MsG0380017142.01.T01:CDS
TTGGCAGCATGCACGCACGG+GGG 0.731906 3:-92520710 MsG0380017142.01.T01:CDS
CTGGCGTGCATGTAACACAG+CGG 0.792021 3:+92522185 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTGAATTTATAAACAAAA+TGG - Chr3:92522061-92522080 MsG0380017142.01.T01:CDS 10.0%
!! AAGTATTAACATGAATAAAT+TGG + Chr3:92520498-92520517 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTATTAGATCACAAAAA+TGG - Chr3:92522179-92522198 MsG0380017142.01.T01:CDS 15.0%
!! AATGAAAAAGTGAATTCATT+TGG + Chr3:92520370-92520389 None:intergenic 20.0%
!! ATATCAGGTTATAGTTTATA+TGG - Chr3:92521810-92521829 MsG0380017142.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGAAAAAGTGAATTCATTT+GGG + Chr3:92520369-92520388 None:intergenic 20.0%
!! TTATATCTAACTGAATAGTT+TGG + Chr3:92521260-92521279 None:intergenic 20.0%
!!! AAAGGTATTTTATAACATCA+AGG - Chr3:92521758-92521777 MsG0380017142.01.T01:CDS 20.0%
! AAATAGACTAGCAATAGTAA+TGG + Chr3:92521595-92521614 None:intergenic 25.0%
! ATCATAAAACAGAGATAAAG+CGG + Chr3:92521451-92521470 None:intergenic 25.0%
! CTAACAATTGTAGTTTGATT+AGG + Chr3:92520697-92520716 None:intergenic 25.0%
! TAAACTATAACCTGATATGA+TGG + Chr3:92521808-92521827 None:intergenic 25.0%
! TACGATAATGAATCTTGTAT+CGG - Chr3:92521008-92521027 MsG0380017142.01.T01:CDS 25.0%
! TATTCAAATAGACTTCACTT+GGG + Chr3:92522364-92522383 None:intergenic 25.0%
! TTATTAGATCACAAAAATGG+TGG - Chr3:92522182-92522201 MsG0380017142.01.T01:CDS 25.0%
!! ACATAACAATGAACATTTTC+CGG + Chr3:92521045-92521064 None:intergenic 25.0%
!! ACATGTTAAGAGATAGTTTT+AGG - Chr3:92520671-92520690 MsG0380017142.01.T01:CDS 25.0%
!! TATATTTCGCCAAATTTTAC+AGG - Chr3:92520333-92520352 MsG0380017142.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGATTTGTACATGAAACT+TGG - Chr3:92520523-92520542 MsG0380017142.01.T01:CDS 25.0%
AAGACTAGATTATGCTGAAA+AGG - Chr3:92521740-92521759 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
AATGATTGTTTGGTTGCAAA+TGG - Chr3:92521387-92521406 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
ACATGGAATTCTATGATATC+TGG - Chr3:92521492-92521511 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
ATCTCTAGCTATTCTGTAAA+AGG - Chr3:92521204-92521223 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
ATGATTGTTTGGTTGCAAAT+GGG - Chr3:92521388-92521407 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTAAACTGCAAGAACAA+GGG - Chr3:92521859-92521878 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
CAAATCTTTATGCCATTGTT+GGG - Chr3:92522222-92522241 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
CATTGTTATGTTGTCAAATG+TGG - Chr3:92521054-92521073 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCACCAAACAAAAGTT+GGG + Chr3:92520866-92520885 None:intergenic 30.0%
GTATGCTAAATGTGATGATT+TGG - Chr3:92520834-92520853 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
GTATTCAAATAGACTTCACT+TGG + Chr3:92522365-92522384 None:intergenic 30.0%
GTTTCTTGGAATACTATGAT+TGG - Chr3:92520901-92520920 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
TATTCTAAACTGCAAGAACA+AGG - Chr3:92521858-92521877 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
TCAAATCTTTATGCCATTGT+TGG - Chr3:92522221-92522240 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
TCTATTTGAATACAAGCACT+TGG - Chr3:92522372-92522391 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
TTTAATTCCAAACCCATGAA+TGG + Chr3:92520767-92520786 None:intergenic 30.0%
TTTGTCTATATGCAAAGCAA+GGG - Chr3:92521112-92521131 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
! AACGTAATCAAGTCTTTTGT+GGG + Chr3:92521174-92521193 None:intergenic 30.0%
! TAACGTAATCAAGTCTTTTG+TGG + Chr3:92521175-92521194 None:intergenic 30.0%
! TCAAAGTGGTCTTTTTAACA+AGG - Chr3:92520933-92520952 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! AATCCTTCACATTTTGCTAT+TGG - Chr3:92521324-92521343 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTATTGCTAGTCTATTTTC+TGG - Chr3:92521597-92521616 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! CATGGAATGTATTGATTTGT+GGG - Chr3:92520602-92520621 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! CTATTGCTAGTCTATTTTCT+GGG - Chr3:92521598-92521617 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! TCATGGAATGTATTGATTTG+TGG - Chr3:92520601-92520620 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTGGAATTAAAGCTGGTTT+TGG - Chr3:92520775-92520794 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATTAAAGCTGGTTTTGGTT+TGG - Chr3:92520780-92520799 MsG0380017142.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAGACCACTTTGACCAT+AGG + Chr3:92520929-92520948 None:intergenic 35.0%
AAAAGGTGATATAGAGTCTG+CGG - Chr3:92521221-92521240 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCAAGGGTTCACATATA+TGG - Chr3:92521125-92521144 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
AATGTCATGACTGAAGAGTA+TGG - Chr3:92521966-92521985 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
ACCAGATAAAATCACCTTCT+TGG - Chr3:92521887-92521906 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTGAAACAGAGAAAGAT+TGG + Chr3:92520281-92520300 None:intergenic 35.0%
AGGGAAATGATGAAAGATAG+TGG - Chr3:92522269-92522288 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
ATAGAATTCCATGTGATCAG+TGG + Chr3:92521486-92521505 None:intergenic 35.0%
ATAGACATGTATAGCAAGTG+TGG - Chr3:92521717-92521736 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGTGGGTATTCGCATAA+TGG - Chr3:92520616-92520635 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
CATCCAATAGCAAAATGTGA+AGG + Chr3:92521330-92521349 None:intergenic 35.0%
CCAGATAAAATCACCTTCTT+GGG - Chr3:92521888-92521907 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
CCATTTCACCAAACAAAAGT+TGG + Chr3:92520867-92520886 None:intergenic 35.0%
GAGTGAAACAGAGAAAGATT+GGG + Chr3:92520280-92520299 None:intergenic 35.0%
GATGAACAATGAGTGAAAGA+AGG + Chr3:92520418-92520437 None:intergenic 35.0%
GTTGCTCTATTAGGTAAAGA+AGG - Chr3:92522023-92522042 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTCTATATGCAAAGCA+AGG - Chr3:92521111-92521130 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
TAACATCAAGGATCCATGTT+TGG - Chr3:92521770-92521789 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
TGGGTTGTCTAATGATTGTT+TGG - Chr3:92521377-92521396 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGGTAGATCCATTCAT+GGG - Chr3:92520752-92520771 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
TTCATTATCGTAACCGAACT+AGG + Chr3:92521000-92521019 None:intergenic 35.0%
TTTAAAGAGATGCTGAAGGA+AGG - Chr3:92520967-92520986 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTGGGTATTCGCATAAT+GGG - Chr3:92520617-92520636 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
! AATACTATGATTGGTGCCTA+TGG - Chr3:92520910-92520929 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
! GAAATGATGAAAGATAGTGG+AGG - Chr3:92522272-92522291 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
! GTGAGGGTAGAAGATTTTAT+AGG - Chr3:92521684-92521703 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
! TCACGTTAGCCTGTAAAATT+TGG + Chr3:92520345-92520364 None:intergenic 35.0%
!! CATTTTAGAGAACAACTCCA+TGG + Chr3:92521547-92521566 None:intergenic 35.0%
!! CCAACTTTTGTTTGGTGAAA+TGG - Chr3:92520864-92520883 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTAGTTTGTTACCTTCTTG+TGG - Chr3:92520712-92520731 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTCTAAAATGAGCATGTGT+GGG - Chr3:92521556-92521575 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTGAGCTGATTCTTCA+AGG - Chr3:92520736-92520755 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTCTAAAATGAGCATGTG+TGG - Chr3:92521555-92521574 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGCTTTAAAGAGATGCTGA+AGG - Chr3:92520963-92520982 MsG0380017142.01.T01:CDS 35.0%
ACATGGAATGCCATCATATC+AGG - Chr3:92521795-92521814 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
AGCTCAAAACAACCACAAGA+AGG + Chr3:92520727-92520746 None:intergenic 40.0%
CATGCATAATGTTGCAGACT+CGG + Chr3:92521999-92522018 None:intergenic 40.0%
CTAGCAATAGTAATGGCATC+TGG + Chr3:92521588-92521607 None:intergenic 40.0%
CTTCAAGGTAGATCCATTCA+TGG - Chr3:92520751-92520770 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAAAACCACTGATCACA+TGG - Chr3:92521475-92521494 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
GCATGCATAGTTGCTCTATT+AGG - Chr3:92522014-92522033 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
GCTTTGATTGGTGTACTTCA+TGG - Chr3:92521294-92521313 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
GGCGAAATATAACAAGTGCA+GGG + Chr3:92520324-92520343 None:intergenic 40.0%
TGAGAGATTGGGTTTGAATC+TGG + Chr3:92520462-92520481 None:intergenic 40.0%
TGGCGAAATATAACAAGTGC+AGG + Chr3:92520325-92520344 None:intergenic 40.0%
TTATCGTAACCGAACTAGGT+TGG + Chr3:92520996-92521015 None:intergenic 40.0%
TTATGCCATTGTTGGGAGAT+GGG - Chr3:92522229-92522248 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
TTTATGCCATTGTTGGGAGA+TGG - Chr3:92522228-92522247 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! AATCACCTTCTTGGGAGTTT+TGG - Chr3:92521896-92521915 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! ACATTCTGAGGAACAATGTG+AGG - Chr3:92521667-92521686 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTAAAGAAGGCTTGTTCA+AGG - Chr3:92522034-92522053 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! CATGGGTTTGGAATTAAAGC+TGG - Chr3:92520769-92520788 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! CATTCTGAGGAACAATGTGA+GGG - Chr3:92521668-92521687 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! CCCAAGAAGGTGATTTTATC+TGG + Chr3:92521891-92521910 None:intergenic 40.0%
! CTTACAGAGACGTTGTTTCA+TGG - Chr3:92520584-92520603 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGCTTCCCAACTTTTGTT+TGG - Chr3:92520856-92520875 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! GGGATTTGTCTATTTAGGAC+TGG - Chr3:92521935-92521954 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
! TGTATCGGCAAATGCATTTC+CGG - Chr3:92521023-92521042 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
!! ACGAGAAGAGTGTTGTTTCT+TGG - Chr3:92520887-92520906 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGAAAGATAGTGGAGGAGA+TGG - Chr3:92522278-92522297 MsG0380017142.01.T01:CDS 40.0%
AAACATGTTGCGTGCATGAG+AGG + Chr3:92520554-92520573 None:intergenic 45.0%
AAAGATTGGGTCTGCTTCTG+AGG + Chr3:92520267-92520286 None:intergenic 45.0%
AACGCCACGTTTGAGAGATT+GGG + Chr3:92520473-92520492 None:intergenic 45.0%
ACGGTTATGGTGTGAAGAGT+GGG - Chr3:92521358-92521377 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
AGGATCCATGTTTGGCAACA+TGG - Chr3:92521778-92521797 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
ATCATCCCATCTCCCAACAA+TGG + Chr3:92522237-92522256 None:intergenic 45.0%
CAAACCCAATCTCTCAAACG+TGG - Chr3:92520466-92520485 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
CACGGGGGATTTGTCTATTT+AGG - Chr3:92521930-92521949 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
CCAATCAAAGCAACTGCATC+TGG + Chr3:92521285-92521304 None:intergenic 45.0%
CGCTGCATAGTTACATTCTG+AGG - Chr3:92521655-92521674 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
GAGATGGGATGATGTAGCAA+GGG - Chr3:92522244-92522263 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
GCATTCCATGTTGCCAAACA+TGG + Chr3:92521786-92521805 None:intergenic 45.0%
GCTATTGGATGCACTTTCCA+CGG - Chr3:92521339-92521358 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGTTTCCAACCTAGTT+CGG - Chr3:92520984-92521003 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGATCCATTCATGGGTT+TGG - Chr3:92520757-92520776 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
TAACGCCACGTTTGAGAGAT+TGG + Chr3:92520474-92520493 None:intergenic 45.0%
TATGATATCTGGCTGTGTGC+AGG - Chr3:92521503-92521522 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
TGGAAAGTCAAGTGATGCCA+TGG - Chr3:92521527-92521546 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGGTGCCTATGGTCAAAG+TGG - Chr3:92520919-92520938 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
! CCAGATGCAGTTGCTTTGAT+TGG - Chr3:92521282-92521301 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
! GGACTTGAGCAGAAAGCTTT+TGG - Chr3:92521831-92521850 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
! TGCTTCTGTTGTTACTTCGC+TGG - Chr3:92521089-92521108 MsG0380017142.01.T01:CDS 45.0%
AGTGGAGGAGATGGATGTTC+AGG - Chr3:92522287-92522306 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
ATCCAACGAGAGGTGAAGCT+TGG - Chr3:92522134-92522153 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
CACGGTTATGGTGTGAAGAG+TGG - Chr3:92521357-92521376 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
CACTCTTCACACCATAACCG+TGG + Chr3:92521359-92521378 None:intergenic 50.0%
GGAGATGGGATGATGTAGCA+AGG - Chr3:92522243-92522262 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
GGATGATGTAGCAAGGGTGA+GGG - Chr3:92522250-92522269 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
GGATGCACTTTCCACGGTTA+TGG - Chr3:92521345-92521364 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
TCCAACGAGAGGTGAAGCTT+GGG - Chr3:92522135-92522154 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
TGCTGCCAAAACTCCCAAGA+AGG + Chr3:92521904-92521923 None:intergenic 50.0%
! TGCTTGTTGCATCCAACGAG+AGG - Chr3:92522124-92522143 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTTCTGGGTGTTGCCAGCT+TGG - Chr3:92521612-92521631 MsG0380017142.01.T01:CDS 50.0%
AGCTCCCCAGACAGCAGAAT+CGG + Chr3:92522096-92522115 None:intergenic 55.0%
ATATCTGGCTGTGTGCAGGC+TGG - Chr3:92521507-92521526 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
CAATCCGCAGGTTACCAAGC+TGG + Chr3:92521629-92521648 None:intergenic 55.0%
CCAACGAGAGGTGAAGCTTG+GGG - Chr3:92522136-92522155 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
CTGGCGTGCATGTAACACAG+CGG + Chr3:92520443-92520462 None:intergenic 55.0%
GGGATGATGTAGCAAGGGTG+AGG - Chr3:92522249-92522268 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
TCAGCCCGATTCTGCTGTCT+GGG - Chr3:92522088-92522107 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
TTCAGCCCGATTCTGCTGTC+TGG - Chr3:92522087-92522106 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
! CAGCTTGGTAACCTGCGGAT+TGG - Chr3:92521627-92521646 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
! GTTGCCAGCTTGGTAACCTG+CGG - Chr3:92521622-92521641 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
! TTTTGGCAGCATGCACGCAC+GGG - Chr3:92521913-92521932 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTTTGGCAGCATGCACGCA+CGG - Chr3:92521912-92521931 MsG0380017142.01.T01:CDS 55.0%
CAGCCCGATTCTGCTGTCTG+GGG - Chr3:92522089-92522108 MsG0380017142.01.T01:CDS 60.0%
CCCCAAGCTTCACCTCTCGT+TGG + Chr3:92522139-92522158 None:intergenic 60.0%
GAGGCAGCAGGGAATCGTTG+TGG + Chr3:92520248-92520267 None:intergenic 60.0%
GCAGCAGGGAATCGTTGTGG+AGG + Chr3:92520245-92520264 None:intergenic 60.0%
GCTCCCCAGACAGCAGAATC+GGG + Chr3:92522095-92522114 None:intergenic 60.0%
TTTGGCAGCATGCACGCACG+GGG - Chr3:92521914-92521933 MsG0380017142.01.T01:CDS 60.0%
! GTGCAGGGCTCGTCGCATTT+TGG + Chr3:92520309-92520328 None:intergenic 60.0%
!! GGTCTGCTTCTGAGGCAGCA+GGG + Chr3:92520259-92520278 None:intergenic 60.0%
!! GGTGAAGCTTGGGGAGTGCT+TGG - Chr3:92522145-92522164 MsG0380017142.01.T01:CDS 60.0%
GCAGCGTCTCTCCAATCCGC+AGG + Chr3:92521641-92521660 None:intergenic 65.0%
TTGGCAGCATGCACGCACGG+GGG - Chr3:92521915-92521934 MsG0380017142.01.T01:CDS 65.0%
!! GGGTCTGCTTCTGAGGCAGC+AGG + Chr3:92520260-92520279 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 92520232 92522415 92520232 ID=MsG0380017142.01;Name=MsG0380017142.01
Chr3 mRNA 92520232 92522415 92520232 ID=MsG0380017142.01.T01;Parent=MsG0380017142.01;Name=MsG0380017142.01.T01;_AED=0.12;_eAED=0.12;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|727
Chr3 exon 92520232 92522415 92520232 ID=MsG0380017142.01.T01:exon:12616;Parent=MsG0380017142.01.T01
Chr3 CDS 92520232 92522415 92520232 ID=MsG0380017142.01.T01:cds;Parent=MsG0380017142.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380017142.01.T01

ATGAAGTTTACCTCCACAACGATTCCCTGCTGCCTCAGAAGCAGACCCAATCTTTCTCTGTTTCACTCTCTCTTCCAAAATGCGACGAGCCCTGCACTTGTTATATTTCGCCAAATTTTACAGGCTAACGTGAACCCAAATGAATTCACTTTTTCATTACTCATCAAAGCTTGTCTTTCATCTCCTTCTTTCACTCATTGTTCATCAACCGCTGTGTTACATGCACGCCAGATTCAAACCCAATCTCTCAAACGTGGCGTTAACCAATTTATTCATGTTAATACTTCTCTTATTGATTTGTACATGAAACTTGGTTTTACCTCTCATGCACGCAACATGTTTGATCAAATGTCTTACAGAGACGTTGTTTCATGGAATGTATTGATTTGTGGGTATTCGCATAATGGGTATCTTTATCATGCTGTTCAACTCTTTGTAGACATGTTAAGAGATAGTTTTAGGCCTAATCAAACTACAATTGTTAGTTTGTTACCTTCTTGTGGTTGTTTTGAGCTGATTCTTCAAGGTAGATCCATTCATGGGTTTGGAATTAAAGCTGGTTTTGGTTTGGATTCTCATTTGAATAATGCTCTTATGTCAATGTATGCTAAATGTGATGATTTGGAAGCTTCCCAACTTTTGTTTGGTGAAATGGACGAGAAGAGTGTTGTTTCTTGGAATACTATGATTGGTGCCTATGGTCAAAGTGGTCTTTTTAACAAGGCTATTCTTTGCTTTAAAGAGATGCTGAAGGAAGGTTTCCAACCTAGTTCGGTTACGATAATGAATCTTGTATCGGCAAATGCATTTCCGGAAAATGTTCATTGTTATGTTGTCAAATGTGGCTTTACAAATGATGCTTCTGTTGTTACTTCGCTGGTTTGTCTATATGCAAAGCAAGGGTTCACATATATGGCGAAACAGCTTTACAAATATTATCCCACAAAAGACTTGATTACGTTAACAGCGATAATCTCTAGCTATTCTGTAAAAGGTGATATAGAGTCTGCGGTTGAGTGTTTTATCCAAACTATTCAGTTAGATATAAAACCAGATGCAGTTGCTTTGATTGGTGTACTTCATGGAATTACTAATCCTTCACATTTTGCTATTGGATGCACTTTCCACGGTTATGGTGTGAAGAGTGGGTTGTCTAATGATTGTTTGGTTGCAAATGGGCTAATAAGTTTGTATTCTAGATTTGACGAGATAGAAGCCGCTTTATCTCTGTTTTATGATATGAGAGAAAAACCACTGATCACATGGAATTCTATGATATCTGGCTGTGTGCAGGCTGGAAAGTCAAGTGATGCCATGGAGTTGTTCTCTAAAATGAGCATGTGTGGGCAAAAACCAGATGCCATTACTATTGCTAGTCTATTTTCTGGGTGTTGCCAGCTTGGTAACCTGCGGATTGGAGAGACGCTGCATAGTTACATTCTGAGGAACAATGTGAGGGTAGAAGATTTTATAGGAACTGCTCTAATAGACATGTATAGCAAGTGTGGAAGACTAGATTATGCTGAAAAGGTATTTTATAACATCAAGGATCCATGTTTGGCAACATGGAATGCCATCATATCAGGTTATAGTTTATATGGACTTGAGCAGAAAGCTTTTGGTTGTTATTCTAAACTGCAAGAACAAGGGTTAAAACCAGATAAAATCACCTTCTTGGGAGTTTTGGCAGCATGCACGCACGGGGGATTTGTCTATTTAGGACTGGAATATTTCAATGTCATGACTGAAGAGTATGGTTTGACGCCGAGTCTGCAACATTATGCATGCATAGTTGCTCTATTAGGTAAAGAAGGCTTGTTCAAGGAAGCAATTGAATTTATAAACAAAATGGAGATTCAGCCCGATTCTGCTGTCTGGGGAGCTTTGTTAAATGCTTGTTGCATCCAACGAGAGGTGAAGCTTGGGGAGTGCTTGGCAAAAAAATTGTTTTTATTAGATCACAAAAATGGTGGATTTTATGTATTAATGTCAAATCTTTATGCCATTGTTGGGAGATGGGATGATGTAGCAAGGGTGAGGGAAATGATGAAAGATAGTGGAGGAGATGGATGTTCAGGTGTTAGTGTTATTGATGTGATTTCTGTTGATGACTCTAATAACAACTTAAGCCCAAGTGAAGTCTATTTGAATACAAGCACTTGGCAGCATTTGTGTCTATATTGA
Protein sequence

>MsG0380017142.01.T01

MKFTSTTIPCCLRSRPNLSLFHSLFQNATSPALVIFRQILQANVNPNEFTFSLLIKACLSSPSFTHCSSTAVLHARQIQTQSLKRGVNQFIHVNTSLIDLYMKLGFTSHARNMFDQMSYRDVVSWNVLICGYSHNGYLYHAVQLFVDMLRDSFRPNQTTIVSLLPSCGCFELILQGRSIHGFGIKAGFGLDSHLNNALMSMYAKCDDLEASQLLFGEMDEKSVVSWNTMIGAYGQSGLFNKAILCFKEMLKEGFQPSSVTIMNLVSANAFPENVHCYVVKCGFTNDASVVTSLVCLYAKQGFTYMAKQLYKYYPTKDLITLTAIISSYSVKGDIESAVECFIQTIQLDIKPDAVALIGVLHGITNPSHFAIGCTFHGYGVKSGLSNDCLVANGLISLYSRFDEIEAALSLFYDMREKPLITWNSMISGCVQAGKSSDAMELFSKMSMCGQKPDAITIASLFSGCCQLGNLRIGETLHSYILRNNVRVEDFIGTALIDMYSKCGRLDYAEKVFYNIKDPCLATWNAIISGYSLYGLEQKAFGCYSKLQEQGLKPDKITFLGVLAACTHGGFVYLGLEYFNVMTEEYGLTPSLQHYACIVALLGKEGLFKEAIEFINKMEIQPDSAVWGALLNACCIQREVKLGECLAKKLFLLDHKNGGFYVLMSNLYAIVGRWDDVARVREMMKDSGGDGCSGVSVIDVISVDDSNNNLSPSEVYLNTSTWQHLCLY*