AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017740.01

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MsG0380017740.01.T01 AT5G16640 28.947 304 216 0 227 530 58 361 2.01e-41 156
MsG0380017740.01.T01 AT5G16640 28.155 206 148 0 319 524 45 250 3.12e-22 100
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MsG0380017740.01.T01 AT1G62680 27.704 379 233 4 53 391 156 533 1.76e-49 179
MsG0380017740.01.T01 AT1G62680 28.504 421 298 1 111 528 83 503 2.93e-74 246
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MsG0380017740.01.T01 AT1G62680 29.589 365 257 0 160 524 65 429 5.06e-54 192
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MsG0380017740.01.T01 AT2G06000 31.685 445 291 3 40 482 76 509 7.23e-71 237
MsG0380017740.01.T01 AT2G06000 29.567 416 284 6 115 525 105 516 9.69e-57 199
MsG0380017740.01.T01 AT2G06000 29.206 315 218 3 217 529 105 416 1.67e-35 140
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 29.423 520 328 3 46 527 202 720 5.36e-70 244
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 29.274 468 322 3 84 542 169 636 9.23e-62 221
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 30.332 422 291 1 112 530 162 583 2.45e-61 219
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 33.016 315 211 0 211 525 159 473 1.36e-51 191
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 26.226 469 341 3 54 518 525 992 5.99e-51 189
MsG0380017740.01.T01 AT5G55840 30.725 345 239 0 174 518 157 501 8.70e-50 185
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MsG0380017740.01.T01 AT1G79540 27.979 193 136 2 337 527 109 300 3.93e-14 75.9
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MsG0380017740.01.T01 AT5G61400 29.683 347 239 3 182 527 134 476 7.83e-40 154
MsG0380017740.01.T01 AT5G61400 28.097 331 235 1 65 392 291 621 3.75e-39 152
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MsG0380017740.01.T01 AT5G24830 28.883 412 286 3 82 486 125 536 4.77e-56 198
MsG0380017740.01.T01 AT5G24830 26.877 413 263 4 148 521 124 536 8.52e-49 178
MsG0380017740.01.T01 AT5G24830 28.378 296 204 4 23 311 277 571 4.04e-27 116
MsG0380017740.01.T01 AT1G13040 29.426 418 289 4 114 526 80 496 6.27e-58 202
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MsG0380017740.01.T01 AT1G13040 30.791 354 205 5 52 366 159 511 2.03e-41 157
MsG0380017740.01.T01 AT1G13040 25.575 348 258 1 181 527 10 357 2.64e-34 136
MsG0380017740.01.T01 AT1G13040 28.070 171 109 3 38 195 346 515 2.27e-12 70.1
MsG0380017740.01.T01 AT1G13040 29.426 418 289 4 114 526 80 496 6.27e-58 202
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MsG0380017740.01.T01 AT1G63630 30.729 192 133 0 339 530 10 201 1.38e-26 109
MsG0380017740.01.T01 AT1G63630 27.737 137 96 1 74 207 127 263 5.21e-17 82.0
MsG0380017740.01.T01 AT1G63630 28.571 133 91 2 46 175 135 266 1.38e-14 74.7
MsG0380017740.01.T01 AT2G35130 26.714 423 306 2 68 486 145 567 3.45e-49 179
MsG0380017740.01.T01 AT2G35130 23.980 392 297 1 135 525 145 536 1.94e-37 146
MsG0380017740.01.T01 AT2G35130 24.292 424 315 3 103 521 145 567 8.10e-37 144
MsG0380017740.01.T01 AT3G18020 25.771 551 326 7 59 527 72 621 8.10e-49 180
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MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 27.920 351 238 6 84 423 231 577 3.72e-36 145
MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 28.689 244 171 2 285 525 225 468 9.65e-32 131
MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 20.889 450 352 2 81 526 719 1168 3.45e-29 123
MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 25.397 441 311 8 41 471 401 833 3.48e-24 108
MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 24.733 469 318 11 76 525 330 782 3.24e-23 105
MsG0380017740.01.T01 AT3G18110 22.088 498 343 9 76 531 365 859 9.93e-23 103
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MsG0380017740.01.T01 AT3G60050 28.571 308 211 2 84 385 155 459 8.50e-36 140
MsG0380017740.01.T01 AT3G60050 28.197 305 213 3 56 356 163 465 5.93e-28 117
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MsG0380017740.01.T01 AT3G22670 24.280 243 178 5 287 525 168 408 2.47e-17 85.9
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MsG0380017740.01.T01 AT1G73400 25.714 350 251 6 146 487 160 508 1.03e-31 129
MsG0380017740.01.T01 AT1G73400 29.496 278 184 4 46 315 238 511 7.71e-29 121
MsG0380017740.01.T01 AT1G73400 32.203 177 116 3 353 526 232 407 1.26e-17 86.7
MsG0380017740.01.T01 AT1G73400 27.551 196 138 2 52 244 351 545 1.01e-13 74.3
MsG0380017740.01.T01 AT1G73400 28.488 172 117 3 387 553 231 401 1.28e-11 67.8
MsG0380017740.01.T01 AT5G14820 25.339 442 311 6 40 478 164 589 1.26e-39 153
MsG0380017740.01.T01 AT5G14820 24.679 389 287 3 137 525 186 568 1.94e-35 140
MsG0380017740.01.T01 AT1G19720 25.175 429 304 5 45 469 219 634 3.12e-39 154
MsG0380017740.01.T01 AT1G19720 24.242 462 321 8 88 530 73 524 2.53e-33 135
MsG0380017740.01.T01 AT1G19720 24.130 460 297 8 111 532 45 490 3.10e-31 129
MsG0380017740.01.T01 AT1G19720 24.201 438 310 9 76 506 113 535 3.46e-31 129
MsG0380017740.01.T01 AT5G25630 22.424 495 345 8 62 521 30 520 4.36e-39 151
MsG0380017740.01.T01 AT5G25630 23.269 361 244 6 56 384 164 523 9.69e-25 108
MsG0380017740.01.T01 AT1G52640 27.476 313 223 2 115 423 140 452 1.00e-38 149
MsG0380017740.01.T01 AT1G52640 28.182 330 231 4 63 387 159 487 3.78e-38 147
MsG0380017740.01.T01 AT1G52640 27.217 327 236 2 163 488 156 481 1.12e-35 140
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MsG0380017740.01.T01 AT1G74750 29.352 293 206 1 179 471 358 649 2.86e-35 141
MsG0380017740.01.T01 AT1G74750 26.621 293 215 0 210 502 354 646 1.84e-33 136
MsG0380017740.01.T01 AT1G74750 28.322 286 202 1 115 397 361 646 2.32e-32 132
MsG0380017740.01.T01 AT1G74750 27.273 242 172 2 287 526 361 600 5.95e-29 122
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MsG0380017740.01.T01 AT3G59040 25.911 247 176 3 284 526 138 381 5.32e-19 90.9
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MsG0380017740.01.T01 AT3G13150 24.324 296 217 4 230 518 96 391 1.46e-25 111
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MsG0380017740.01.T01 AT2G38420 22.481 387 287 4 111 487 70 453 9.54e-30 122
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MsG0380017740.01.T01 AT2G38420 26.901 171 122 1 74 241 282 452 9.25e-12 67.8
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MsG0380017740.01.T01 AT3G53170 23.729 295 221 1 58 348 195 489 3.34e-19 91.3
MsG0380017740.01.T01 AT3G53170 23.789 227 170 1 54 277 262 488 3.51e-12 69.3
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MsG0380017740.01.T01 AT1G02420 26.606 218 157 1 74 288 242 459 5.58e-18 87.4
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MsG0380017740.01.T01 AT1G63630 35.971 139 89 0 138 276 3 141 5.12e-24 99.0
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MsG0380017740.01.T01 AT1G32415 27.018 285 180 8 239 521 30 288 4.57e-24 107
MsG0380017740.01.T01 AT1G32415 22.319 457 285 15 84 502 49 473 5.28e-22 100
MsG0380017740.01.T01 AT1G32415 23.478 345 232 9 186 523 48 367 3.90e-17 85.5
MsG0380017740.01.T01 AT1G32415 23.881 268 193 4 117 381 372 631 3.93e-17 85.5
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MsG0380017740.01.T01 AT5G15010 23.298 382 283 6 105 480 153 530 6.15e-26 112
MsG0380017740.01.T01 AT5G15010 28.169 213 145 4 54 262 314 522 1.83e-19 92.4
MsG0380017740.01.T01 AT5G15010 25.234 321 224 8 214 525 122 435 1.08e-15 80.5
MsG0380017740.01.T01 AT5G15010 24.260 169 128 0 46 214 341 509 1.11e-13 74.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G47360 25.281 356 244 7 202 539 117 468 5.57e-28 117
MsG0380017740.01.T01 AT5G47360 22.571 350 264 4 167 509 117 466 1.38e-25 110
MsG0380017740.01.T01 AT5G47360 28.736 261 175 4 49 299 172 431 1.52e-25 110
MsG0380017740.01.T01 AT5G47360 27.356 329 211 8 64 373 151 470 2.81e-25 109
MsG0380017740.01.T01 AT5G47360 22.222 324 242 4 112 425 129 452 2.64e-17 85.1
MsG0380017740.01.T01 AT1G55890 27.344 256 182 2 161 412 125 380 5.94e-28 116
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MsG0380017740.01.T01 AT1G55890 25.085 295 203 4 245 527 64 352 3.08e-27 114
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MsG0380017740.01.T01 AT5G46580 25.000 244 175 5 55 292 301 542 7.76e-13 71.6
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MsG0380017740.01.T01 AT2G27610 22.246 472 270 14 83 497 234 665 3.43e-16 82.8
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MsG0380017740.01.T01 AT1G03540 22.114 511 353 15 60 552 79 562 1.46e-21 99.0
MsG0380017740.01.T01 AT3G48250 24.490 343 250 4 180 518 263 600 1.43e-23 105
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MsG0380017740.01.T01 AT5G60960 22.053 263 195 4 210 463 206 467 1.13e-13 73.9
MsG0380017740.01.T01 AT5G60960 24.627 268 176 6 287 542 213 466 6.32e-11 65.5
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MsG0380017740.01.T01 AT3G53360 27.094 203 141 5 62 263 458 654 2.35e-11 67.0
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MsG0380017740.01.T01 AT2G33680 22.684 313 230 4 106 414 344 648 4.74e-18 88.6
MsG0380017740.01.T01 AT2G33680 23.148 540 341 17 31 525 73 583 7.85e-19 90.9
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MsG0380017740.01.T01 AT2G33680 23.148 540 341 17 31 525 9 519 8.27e-19 90.9
MsG0380017740.01.T01 AT2G33680 22.684 313 230 4 106 414 280 584 5.66e-18 88.2
MsG0380017740.01.T01 AT2G33680 23.148 540 341 17 31 525 64 574 9.28e-19 90.9
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MsG0380017740.01.T01 AT1G05750 23.416 363 256 8 79 434 37 384 9.73e-19 89.7
MsG0380017740.01.T01 AT1G05750 21.242 306 219 7 225 523 46 336 3.66e-17 85.1
MsG0380017740.01.T01 AT1G05750 21.714 350 253 7 78 422 109 442 2.41e-13 72.8
MsG0380017740.01.T01 AT1G19520 24.695 328 236 5 141 461 345 668 9.84e-19 90.5
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MsG0380017740.01.T01 AT5G19020 19.697 462 318 12 63 521 193 604 2.01e-16 83.2
MsG0380017740.01.T01 AT5G19020 20.844 403 260 8 115 513 109 456 2.33e-16 82.8
MsG0380017740.01.T01 AT4G04370 20.624 417 311 6 77 489 178 578 2.33e-17 86.3
MsG0380017740.01.T01 AT4G04370 19.268 519 350 14 49 525 53 544 1.24e-13 74.3
MsG0380017740.01.T01 AT4G04370 20.183 436 320 9 92 521 25 438 5.38e-11 65.9
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MsG0380017740.01.T01 AT5G67570 26.217 267 181 7 85 340 383 644 3.64e-13 72.8
MsG0380017740.01.T01 AT5G67570 22.951 244 165 5 283 524 289 511 6.15e-12 68.9
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MsG0380017740.01.T01 AT1G74630 19.937 316 235 7 212 525 82 381 6.36e-12 68.9
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MsG0380017740.01.T01 AT2G02980 22.691 379 237 11 76 447 92 421 1.77e-16 83.2
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MsG0380017740.01.T01 AT4G35130 21.812 298 211 5 56 346 312 594 4.40e-11 66.2
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MsG0380017740.01.T01 AT3G12770 25.514 243 168 5 73 312 254 486 2.58e-15 79.7
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MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.202 526 337 10 67 521 215 723 3.91e-16 82.4
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.388 294 225 3 213 506 158 439 1.59e-12 71.2
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 21.780 427 313 13 108 529 559 969 1.61e-11 67.8
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.202 526 337 10 67 521 240 748 3.98e-16 82.4
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.388 294 225 3 213 506 183 464 1.67e-12 70.9
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 21.780 427 313 13 108 529 584 994 1.77e-11 67.8
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.202 526 337 10 67 521 240 748 3.98e-16 82.4
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 19.388 294 225 3 213 506 183 464 1.67e-12 70.9
MsG0380017740.01.T01 AT3G09040 21.780 427 313 13 108 529 584 994 1.77e-11 67.8
MsG0380017740.01.T01 AT1G80150 31.765 170 115 1 280 448 136 305 4.02e-16 80.1
MsG0380017740.01.T01 AT1G80150 27.957 186 119 3 162 339 123 301 5.83e-14 73.6
MsG0380017740.01.T01 AT1G80150 26.425 193 138 1 88 276 116 308 8.81e-13 70.1
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 21.359 412 303 8 115 521 26 421 4.71e-16 81.6
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 21.448 359 259 8 83 434 94 436 5.58e-15 78.2
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 19.365 315 240 4 218 530 92 394 7.37e-13 71.6
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 21.359 412 303 8 115 521 26 421 4.71e-16 81.6
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 21.448 359 259 8 83 434 94 436 5.58e-15 78.2
MsG0380017740.01.T01 AT2G42920 19.365 315 240 4 218 530 92 394 7.37e-13 71.6
MsG0380017740.01.T01 AT1G71460 21.924 447 317 12 82 517 253 678 4.71e-16 82.0
MsG0380017740.01.T01 AT1G71460 20.472 381 266 10 82 448 150 507 5.14e-12 69.3
MsG0380017740.01.T01 AT2G17210 21.687 415 256 8 49 416 218 610 5.28e-16 82.0
MsG0380017740.01.T01 AT2G17210 20.714 420 304 8 112 521 210 610 2.60e-14 76.6
MsG0380017740.01.T01 AT2G17210 22.424 330 231 11 214 535 112 424 2.63e-12 70.1
MsG0380017740.01.T01 AT2G40240 27.404 208 147 2 217 422 109 314 5.33e-16 80.1
MsG0380017740.01.T01 AT2G40240 24.590 244 170 5 199 436 23 258 2.86e-15 77.8
MsG0380017740.01.T01 AT2G40240 24.272 206 149 2 115 315 109 312 2.52e-13 72.0
MsG0380017740.01.T01 AT2G40240 23.651 241 165 5 233 456 75 313 6.76e-13 70.9
MsG0380017740.01.T01 AT2G40240 22.680 291 209 5 263 550 52 329 3.70e-12 68.6
MsG0380017740.01.T01 AT4G02820 22.632 380 227 9 48 376 135 498 5.68e-16 81.3
MsG0380017740.01.T01 AT4G32430 20.222 450 309 10 107 521 71 505 6.11e-16 81.6
MsG0380017740.01.T01 AT4G32430 19.347 429 277 14 65 449 64 467 4.38e-13 72.4
MsG0380017740.01.T01 AT4G32430 20.445 494 340 12 64 521 161 637 6.13e-16 81.6
MsG0380017740.01.T01 AT4G32430 21.565 524 337 16 41 524 49 538 1.60e-15 80.5
MsG0380017740.01.T01 AT1G16480 21.328 497 358 10 60 546 82 555 6.24e-16 82.0
MsG0380017740.01.T01 AT1G16480 22.613 398 286 9 63 454 382 763 3.74e-13 73.2
MsG0380017740.01.T01 AT1G16480 21.328 497 358 10 60 546 65 538 7.14e-16 81.6
MsG0380017740.01.T01 AT1G16480 22.613 398 286 9 63 454 365 746 3.82e-13 73.2
MsG0380017740.01.T01 AT4G08210 21.087 460 301 12 49 467 12 450 7.21e-16 81.3
MsG0380017740.01.T01 AT3G25970 21.868 439 267 14 51 438 115 528 9.21e-16 81.3
MsG0380017740.01.T01 AT3G25970 18.908 513 307 10 108 519 30 534 1.14e-12 71.2
MsG0380017740.01.T01 AT5G66520 21.212 363 267 7 161 521 65 410 1.02e-15 80.9
MsG0380017740.01.T01 AT5G66520 22.977 309 196 7 77 352 149 448 1.63e-14 77.0
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 23.529 340 215 10 218 521 20 350 2.72e-15 79.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 21.053 342 251 7 82 416 21 350 1.00e-13 74.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 28.877 187 125 7 61 242 168 351 1.55e-13 73.9
MsG0380017740.01.T01 AT4G13650 22.143 420 294 9 53 465 304 697 2.75e-15 80.1
MsG0380017740.01.T01 AT4G13650 21.472 326 236 7 201 521 70 380 4.16e-11 66.6
MsG0380017740.01.T01 AT4G19191 20.858 513 310 14 52 521 97 556 2.75e-15 79.3
MsG0380017740.01.T01 AT4G19191 21.378 421 287 8 136 523 43 452 1.95e-14 76.6
MsG0380017740.01.T01 AT3G49710 21.622 444 315 12 88 521 53 473 2.78e-15 79.7
MsG0380017740.01.T01 AT3G49710 22.865 363 257 10 88 441 183 531 3.03e-14 76.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G50390 22.764 369 239 9 99 432 144 501 3.13e-15 79.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G50390 18.632 424 324 6 102 518 76 485 1.01e-13 74.7
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 23.529 340 215 10 218 521 117 447 3.79e-15 79.0
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 21.053 380 238 11 82 416 85 447 1.20e-13 74.3
MsG0380017740.01.T01 AT5G44230 28.877 187 125 7 61 242 265 448 1.59e-13 73.9

Find 124 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 154 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCCGCAAATTGGTTAAATT+TGG 0.136148 3:-100210052 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGAGAAAGCTTTGCAGCTTC+TGG 0.193421 3:-100209810 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATATTATAGGTCACAATATC+TGG 0.210642 3:+100209140 None:intergenic
GGATAGAGCAATTGAGTATT+TGG 0.221503 3:-100209189 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTTTCAAAATTCAAAACTTC+TGG 0.260287 3:-100210181 MsG0380017740.01.T01:CDS
CTAGATGACATGAAGGTTAA+AGG 0.273868 3:-100209590 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGGATTTATTCGTGAGAAAA+AGG 0.275193 3:-100208898 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACCATTTGAGGATAATTCTA+TGG 0.282402 3:+100210111 None:intergenic
TTCTTATCGCTGGTATTTGC+AGG 0.283304 3:-100209538 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTGAATTAGATCATGGGTTT+AGG 0.296500 3:-100210030 MsG0380017740.01.T01:CDS
TGGATTGTAACTCAAGGAAT+TGG 0.303743 3:+100209244 None:intergenic
CAATAATCATCTCCGCAAAT+TGG 0.309315 3:-100210062 MsG0380017740.01.T01:CDS
TAAATTTCTTGAACCATTTG+AGG 0.350035 3:+100210099 None:intergenic
TTCAAAACTTCTGGTTTAAA+CGG 0.356624 3:-100210172 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACATTATAGGTTATAACATT+AGG 0.361588 3:+100209866 None:intergenic
CGGTAGGGCTATTGATATCT+TGG 0.364993 3:-100209294 MsG0380017740.01.T01:CDS
AAATGGTTCAAGAAATTTAG+AGG 0.373577 3:-100210095 MsG0380017740.01.T01:CDS
GAGGGATGCTGAGAGATTAT+TGG 0.374422 3:-100209399 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACATACACTTCACTGATTGC+AGG 0.379697 3:-100208918 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGCAGTAAGCAAAATATTAT+AGG 0.390024 3:+100209127 None:intergenic
CACCAAATTTAACCAATTTG+CGG 0.397293 3:+100210050 None:intergenic
TTGGAAATTATAGAAGATTC+CGG 0.402162 3:-100209896 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGAATAACATGTCATCCTA+TGG 0.405053 3:-100209485 MsG0380017740.01.T01:CDS
CACTTACAACTCAATCATGT+TGG 0.407363 3:-100208814 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTATTATAAGTAATTATAAC+TGG 0.407525 3:+100209035 None:intergenic
AAATTTGGTGAATTAGATCA+TGG 0.408873 3:-100210037 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATTGGCTGACATGATTCATA+AGG 0.416392 3:-100209381 MsG0380017740.01.T01:CDS
AACTACGCAAAATGATATGA+TGG 0.420638 3:+100209441 None:intergenic
AGTTACAATCCATTGCTTCA+TGG 0.423056 3:-100209233 MsG0380017740.01.T01:CDS
CTGAATCAGTTGAGCAGTAA+AGG 0.428896 3:-100209065 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATTGTTTCATGATAGGGAAC+TGG 0.429655 3:-100208233 MsG0380017740.01.T01:intron
ACCGTCAATCAAAACATTAT+AGG 0.430136 3:+100209853 None:intergenic
ATTTGGAAGTAATGGTGTCT+AGG 0.432902 3:-100209172 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACTTTCAATGTTCTTATCGC+TGG 0.442666 3:-100209548 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATTGAAGGCATTGCTTATGA+AGG 0.444904 3:-100208693 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGGATTAGCTGAGGAGGCTC+TGG 0.445816 3:-100208673 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTTGGAAGTAATGGTGTCTA+GGG 0.446127 3:-100209171 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTTACAATCCATTGCTTCAT+GGG 0.447164 3:-100209232 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACTTACAACTCAATCATGTT+GGG 0.448355 3:-100208813 MsG0380017740.01.T01:CDS
TAAGAAAGCTACACGAGTCT+TGG 0.453423 3:-100209915 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACATATACCATTCTTATTGA+AGG 0.453931 3:-100208708 MsG0380017740.01.T01:CDS
TGAGGATAATTCTATGGCAT+TGG 0.457145 3:+100210117 None:intergenic
TTCCATGACTTGGAAAGATT+AGG 0.460060 3:-100208855 MsG0380017740.01.T01:CDS
GCCATAGAATTATCCTCAAA+TGG 0.462562 3:-100210112 MsG0380017740.01.T01:CDS
TACCTAATCTTTCCAAGTCA+TGG 0.465835 3:+100208853 None:intergenic
ATTAACTTCTTGTGTCGAAA+AGG 0.466169 3:-100209323 MsG0380017740.01.T01:CDS
GAAGTGTATGTAATTACATC+GGG 0.466848 3:+100208930 None:intergenic
TTGGCTGACATGATTCATAA+GGG 0.467310 3:-100209380 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACATTGAAAGTAGCCACATC+AGG 0.467967 3:+100209560 None:intergenic
GTATTATAAGTAACAACATT+AGG 0.470518 3:+100209770 None:intergenic
ATTGTGTACGTAACCACATC+AGG 0.479980 3:+100209665 None:intergenic
TATGGTAGTTCTTGATAGAA+TGG 0.480126 3:-100209705 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTCGAAAAGGTTTGCTCGGT+AGG 0.486706 3:-100209310 MsG0380017740.01.T01:CDS
AATCATGTTGGGTCTCTGTA+AGG 0.488932 3:-100208802 MsG0380017740.01.T01:CDS
TCTTGATAGAATGGTACAAA+GGG 0.491074 3:-100209696 MsG0380017740.01.T01:CDS
GGATTGTAACTCAAGGAATT+GGG 0.491560 3:+100209245 None:intergenic
AATTGAGTATTTGGAAGTAA+TGG 0.495589 3:-100209180 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGCAATGCCTTCAATAAGAA+TGG 0.498433 3:+100208701 None:intergenic
TTGCGTAGTTTGTGTGGTAC+TGG 0.500086 3:-100209428 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATTGACGGTTACTGCAAAGC+CGG 0.503150 3:-100209839 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTAGTGCAAGCAATGACATC+AGG 0.503689 3:+100209971 None:intergenic
TTGACGGTTACTGCAAAGCC+GGG 0.504741 3:-100209838 MsG0380017740.01.T01:CDS
TGAATCAGTTGAGCAGTAAA+GGG 0.516490 3:-100209064 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATCAGGAGGAATGTCACCTT+GGG 0.518367 3:+100209988 None:intergenic
TCGATGGGCTTTCAAAGGTA+GGG 0.518543 3:-100209007 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTTTGTGTGGTACTGGAAGT+TGG 0.522758 3:-100209421 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACTTATAATACAGTTATCGA+TGG 0.525746 3:-100209023 MsG0380017740.01.T01:CDS
CTTACTGCTTTATGCAAAGA+CGG 0.529247 3:-100209113 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGTAAATTGCAGCAAGCTA+TGG 0.531195 3:-100209723 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGTGTCGAAAAGGTTTGCT+CGG 0.533666 3:-100209314 MsG0380017740.01.T01:CDS
CGATGGGCTTTCAAAGGTAG+GGG 0.533948 3:-100209006 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATCGCTGGTATTTGCAGGGA+AGG 0.534484 3:-100209533 MsG0380017740.01.T01:CDS
CAAAGCTTTCTCTATCTCCC+CGG 0.535836 3:+100209820 None:intergenic
TATTATAGGTCACAATATCT+GGG 0.539009 3:+100209141 None:intergenic
TGCTTTATGCAAAGACGGGA+AGG 0.539842 3:-100209108 MsG0380017740.01.T01:CDS
CTTATAATACAGTTATCGAT+GGG 0.541418 3:-100209022 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATATGATGGGTAAACACATC+CGG 0.542480 3:+100209455 None:intergenic
CTGGTATTTGCAGGGAAGGT+AGG 0.543689 3:-100209529 MsG0380017740.01.T01:CDS
CTTAAACGAATGATTTCCCA+AGG 0.544023 3:-100210004 MsG0380017740.01.T01:CDS
TATTTGCAGGGAAGGTAGGT+TGG 0.546635 3:-100209525 MsG0380017740.01.T01:CDS
TGACAAAACCCATGAAGCAA+TGG 0.547348 3:+100209224 None:intergenic
GTCATCCTATGGTTGTGAAC+CGG 0.547849 3:-100209474 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATCGATGGGCTTTCAAAGGT+AGG 0.550729 3:-100209008 MsG0380017740.01.T01:CDS
AATTTGGTGAATTAGATCAT+GGG 0.550818 3:-100210036 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTGTGGTACTGGAAGTTGGA+GGG 0.553485 3:-100209417 MsG0380017740.01.T01:CDS
ACATGTAAAGAGAGTGGAGT+TGG 0.554029 3:-100209629 MsG0380017740.01.T01:CDS
CATCAGGAGGAATGTCACCT+TGG 0.555907 3:+100209987 None:intergenic
TTACTGCTTTATGCAAAGAC+GGG 0.557676 3:-100209112 MsG0380017740.01.T01:CDS
AGTTATCGATGGGCTTTCAA+AGG 0.560443 3:-100209012 MsG0380017740.01.T01:CDS
TCGAAAAGGTTTGCTCGGTA+GGG 0.561305 3:-100209309 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATGGTATATGTAGCTTCAGT+AGG 0.563604 3:+100208720 None:intergenic
TGAAGTGTATGTAATTACAT+CGG 0.570211 3:+100208929 None:intergenic
AACTGTTGGATGAGATGTGC+CGG 0.570470 3:-100208965 MsG0380017740.01.T01:CDS
CATCGGGTTTAAGACCTCTC+CGG 0.576813 3:+100208946 None:intergenic
AGAGCATGCTGTGAAACTGT+TGG 0.581501 3:-100208979 MsG0380017740.01.T01:CDS
TAAAGGATGTAAACCTGATG+TGG 0.589655 3:-100209573 MsG0380017740.01.T01:CDS
TACGTACACAATATTGATAG+AGG 0.591224 3:-100209654 MsG0380017740.01.T01:CDS
GAGGCGACATGTAAAGAGAG+TGG 0.591769 3:-100209635 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGGGAATACAACCATGGCT+TGG 0.592039 3:+100209263 None:intergenic
ACTACGCAAAATGATATGAT+GGG 0.595629 3:+100209442 None:intergenic
TTCTTGATAGAATGGTACAA+AGG 0.598473 3:-100209697 MsG0380017740.01.T01:CDS
AAGCAATGGATTGTAACTCA+AGG 0.598505 3:+100209238 None:intergenic
TGCTTATGAAGGATTAGCTG+AGG 0.603158 3:-100208682 MsG0380017740.01.T01:CDS
TGTGTGGTACTGGAAGTTGG+AGG 0.603182 3:-100209418 MsG0380017740.01.T01:CDS
TCTTATCGCTGGTATTTGCA+GGG 0.612627 3:-100209537 MsG0380017740.01.T01:CDS
TAAAGAGAGTGGAGTTGGTG+AGG 0.616057 3:-100209624 MsG0380017740.01.T01:CDS
GAAACTGCTAGATGACATGA+AGG 0.617896 3:-100209597 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGGAAGTAATGGTGTCTAG+GGG 0.620295 3:-100209170 MsG0380017740.01.T01:CDS
AAGGGAGTGTTATCCTGATG+TGG 0.623018 3:-100209678 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGGAGAAGATGCCAAGCCA+TGG 0.624407 3:-100209275 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGAATGAGTTGTGCGACAG+AGG 0.627080 3:-100208645 MsG0380017740.01.T01:CDS
ATTTGCAAAACTGACGCATG+AGG 0.628646 3:+100209948 None:intergenic
CACATCCGGTTCACAACCAT+AGG 0.630133 3:+100209469 None:intergenic
TTATGAAGGATTAGCTGAGG+AGG 0.633269 3:-100208679 MsG0380017740.01.T01:CDS
GTGCAAGCAATGACATCAGG+AGG 0.645109 3:+100209974 None:intergenic
ATATTGAAAGTAACAACACT+AGG 0.645630 3:+100209350 None:intergenic
TGAGTTGTAAGTGAAAGCAT+TGG 0.681535 3:+100208824 None:intergenic
TGACGGTTACTGCAAAGCCG+GGG 0.682105 3:-100209837 MsG0380017740.01.T01:CDS
TATAACATTAGGAACAACAC+CGG 0.689437 3:+100209877 None:intergenic
AGGAATTGGGAATACAACCA+TGG 0.691736 3:+100209258 None:intergenic
TTTATGCAAAGACGGGAAGG+TGG 0.694387 3:-100209105 MsG0380017740.01.T01:CDS
TTGGATGAGATGTGCCGGAG+AGG 0.694425 3:-100208960 MsG0380017740.01.T01:CDS
AATGAGGTATATCTTGAACA+AGG 0.716207 3:-100208182 MsG0380017740.01.T01:CDS
GAGGTATATCTTGAACAAGG+AGG 0.759337 3:-100208179 MsG0380017740.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GTATTATAAGTAATTATAAC+TGG + Chr3:100209336-100209355 None:intergenic 15.0%
!!! TTATCTTGCTAATATATTTT+AGG - Chr3:100210056-100210075 MsG0380017740.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATTATAGGTTATAACATT+AGG + Chr3:100208505-100208524 None:intergenic 20.0%
!! ACCAAATATATAACATGATT+TGG - Chr3:100210106-100210125 MsG0380017740.01.T01:CDS 20.0%
!! ACCAAATCATGTTATATATT+TGG + Chr3:100210110-100210129 None:intergenic 20.0%
!! GTATTATAAGTAACAACATT+AGG + Chr3:100208601-100208620 None:intergenic 20.0%
!! TGATTTATTGTTTCATGATA+GGG - Chr3:100210129-100210148 MsG0380017740.01.T01:CDS 20.0%
! AAATGGTTCAAGAAATTTAG+AGG - Chr3:100208273-100208292 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
! AATTGAGTATTTGGAAGTAA+TGG - Chr3:100209188-100209207 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! ACATATACCATTCTTATTGA+AGG - Chr3:100209660-100209679 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! ACCAGAATTAAAAGAAAAAG+TGG - Chr3:100210158-100210177 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAATACAGTTATCGA+TGG - Chr3:100209345-100209364 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! AGCAGTAAGCAAAATATTAT+AGG + Chr3:100209244-100209263 None:intergenic 25.0%
! ATATTATAGGTCACAATATC+TGG + Chr3:100209231-100209250 None:intergenic 25.0%
! ATATTGAAAGTAACAACACT+AGG + Chr3:100209021-100209040 None:intergenic 25.0%
! CTTATAATACAGTTATCGAT+GGG - Chr3:100209346-100209365 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! GTGATTTATTGTTTCATGAT+AGG - Chr3:100210128-100210147 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTCAAAATTCAAAACTTC+TGG - Chr3:100208187-100208206 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATTTCTTGAACCATTTG+AGG + Chr3:100208272-100208291 None:intergenic 25.0%
! TATTATAGGTCACAATATCT+GGG + Chr3:100209230-100209249 None:intergenic 25.0%
! TGAAGTGTATGTAATTACAT+CGG + Chr3:100209442-100209461 None:intergenic 25.0%
! TTGGAAATTATAGAAGATTC+CGG - Chr3:100208472-100208491 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
!! AAATTTGGTGAATTAGATCA+TGG - Chr3:100208331-100208350 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
!! AATTTGGTGAATTAGATCAT+GGG - Chr3:100208332-100208351 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
!! GTTTTGTCAAGAAAAAAAGA+TGG - Chr3:100209158-100209177 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
!! TATCAAAATTTTCCATGACT+TGG - Chr3:100209503-100209522 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
!! TATTGTTATTGTGACATGAT+AGG - Chr3:100209903-100209922 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
!! TCACAACATTTTCGTAAAAA+TGG - Chr3:100208223-100208242 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
!!! ACCTATAATGTTTTGATTGA+CGG - Chr3:100208514-100208533 MsG0380017740.01.T01:intron 25.0%
!!! AGTTTTGAATTTTGAAACAG+TGG + Chr3:100208185-100208204 None:intergenic 25.0%
!!! TCCACTTTTTCTTTTAATTC+TGG + Chr3:100210162-100210181 None:intergenic 25.0%
!!! TTCAAAACTTCTGGTTTAAA+CGG - Chr3:100208196-100208215 MsG0380017740.01.T01:CDS 25.0%
AACTACGCAAAATGATATGA+TGG + Chr3:100208930-100208949 None:intergenic 30.0%
AATGAGGTATATCTTGAACA+AGG - Chr3:100210186-100210205 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
ACCATTTGAGGATAATTCTA+TGG + Chr3:100208260-100208279 None:intergenic 30.0%
ACCGTCAATCAAAACATTAT+AGG + Chr3:100208518-100208537 None:intergenic 30.0%
ACTACGCAAAATGATATGAT+GGG + Chr3:100208929-100208948 None:intergenic 30.0%
ACTTACAACTCAATCATGTT+GGG - Chr3:100209555-100209574 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
AGGATTTATTCGTGAGAAAA+AGG - Chr3:100209470-100209489 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
ATTAACTTCTTGTGTCGAAA+AGG - Chr3:100209045-100209064 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCATCCATCCTACATAT+TGG + Chr3:100209785-100209804 None:intergenic 30.0%
CACCAAATTTAACCAATTTG+CGG + Chr3:100208321-100208340 None:intergenic 30.0%
GAAGTGTATGTAATTACATC+GGG + Chr3:100209441-100209460 None:intergenic 30.0%
TACGTACACAATATTGATAG+AGG - Chr3:100208714-100208733 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
TATAACATTAGGAACAACAC+CGG + Chr3:100208494-100208513 None:intergenic 30.0%
TATGGTAGTTCTTGATAGAA+TGG - Chr3:100208663-100208682 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGATAGAATGGTACAAA+GGG - Chr3:100208672-100208691 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTGATAGAATGGTACAA+AGG - Chr3:100208671-100208690 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATAACATGTCATCCTA+TGG - Chr3:100208883-100208902 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTTCCTTATACTTCTACA+TGG - Chr3:100209811-100209830 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGCATGTCAGTTTTATTAGA+AGG - Chr3:100209938-100209957 MsG0380017740.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTAGCTTTCTTAGTTTTAC+CGG + Chr3:100208446-100208465 None:intergenic 30.0%
AAACTGCTTGAGTGATGATA+TGG - Chr3:100210006-100210025 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
ACTTTCAATGTTCTTATCGC+TGG - Chr3:100208820-100208839 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
AGCAATGCCTTCAATAAGAA+TGG + Chr3:100209670-100209689 None:intergenic 35.0%
AGTTACAATCCATTGCTTCA+TGG - Chr3:100209135-100209154 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
ATGGTATATGTAGCTTCAGT+AGG + Chr3:100209651-100209670 None:intergenic 35.0%
ATTCGTGAGAAAAAGGTTGA+TGG - Chr3:100209477-100209496 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGCTGACATGATTCATA+AGG - Chr3:100208987-100209006 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTTTCATGATAGGGAAC+TGG - Chr3:100210135-100210154 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGAAGTAATGGTGTCT+AGG - Chr3:100209196-100209215 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
CAATAATCATCTCCGCAAAT+TGG - Chr3:100208306-100208325 MsG0380017740.01.T01:intron 35.0%
CACTTACAACTCAATCATGT+TGG - Chr3:100209554-100209573 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
CTAGATGACATGAAGGTTAA+AGG - Chr3:100208778-100208797 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
CTCCGCAAATTGGTTAAATT+TGG - Chr3:100208316-100208335 MsG0380017740.01.T01:intron 35.0%
CTTAAACGAATGATTTCCCA+AGG - Chr3:100208364-100208383 MsG0380017740.01.T01:intron 35.0%
CTTACTGCTTTATGCAAAGA+CGG - Chr3:100209255-100209274 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAAAAGCTCTGCAAAAA+AGG - Chr3:100209752-100209771 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
GCCATAGAATTATCCTCAAA+TGG - Chr3:100208256-100208275 MsG0380017740.01.T01:intron 35.0%
GGATAGAGCAATTGAGTATT+TGG - Chr3:100209179-100209198 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
GGATTGTAACTCAAGGAATT+GGG + Chr3:100209126-100209145 None:intergenic 35.0%
GTGAATTAGATCATGGGTTT+AGG - Chr3:100208338-100208357 MsG0380017740.01.T01:intron 35.0%
GTTACAATCCATTGCTTCAT+GGG - Chr3:100209136-100209155 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TAAAGGATGTAAACCTGATG+TGG - Chr3:100208795-100208814 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TACCTAATCTTTCCAAGTCA+TGG + Chr3:100209518-100209537 None:intergenic 35.0%
TGAATCAGTTGAGCAGTAAA+GGG - Chr3:100209304-100209323 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGATAATTCTATGGCAT+TGG + Chr3:100208254-100208273 None:intergenic 35.0%
TGGATTGTAACTCAAGGAAT+TGG + Chr3:100209127-100209146 None:intergenic 35.0%
TTACTGCTTTATGCAAAGAC+GGG - Chr3:100209256-100209275 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCTGACATGATTCATAA+GGG - Chr3:100208988-100209007 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAAATTGCAGCAAGCTA+TGG - Chr3:100208645-100208664 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGAAGTAATGGTGTCTA+GGG - Chr3:100209197-100209216 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
! AACAGCCATGTAGAAGTATA+AGG + Chr3:100209819-100209838 None:intergenic 35.0%
! TGAGTTGTAAGTGAAAGCAT+TGG + Chr3:100209547-100209566 None:intergenic 35.0%
! TGTTGATTACTTGACTGCTA+GGG - Chr3:100210081-100210100 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCATGACTTGGAAAGATT+AGG - Chr3:100209513-100209532 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTTGATTACTTGACTGCT+AGG - Chr3:100210080-100210099 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCAATGGATTGTAACTCA+AGG + Chr3:100209133-100209152 None:intergenic 35.0%
!! ATATGATGGGTAAACACATC+CGG + Chr3:100208916-100208935 None:intergenic 35.0%
!! ATCATTTTGCGTAGTTTGTG+TGG - Chr3:100208934-100208953 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGAAGGCATTGCTTATGA+AGG - Chr3:100209675-100209694 MsG0380017740.01.T01:CDS 35.0%
AATCATGTTGGGTCTCTGTA+AGG - Chr3:100209566-100209585 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
ACATGTAAAGAGAGTGGAGT+TGG - Chr3:100208739-100208758 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
ACATTGAAAGTAGCCACATC+AGG + Chr3:100208811-100208830 None:intergenic 40.0%
AGAAAAAGTGGAACGCAATG+AGG - Chr3:100210170-100210189 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
AGGAATTGGGAATACAACCA+TGG + Chr3:100209113-100209132 None:intergenic 40.0%
ATTGTGTACGTAACCACATC+AGG + Chr3:100208706-100208725 None:intergenic 40.0%
ATTTGCAAAACTGACGCATG+AGG + Chr3:100208423-100208442 None:intergenic 40.0%
CTGAATCAGTTGAGCAGTAA+AGG - Chr3:100209303-100209322 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
GAAACTGCTAGATGACATGA+AGG - Chr3:100208771-100208790 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTATATCTTGAACAAGG+AGG - Chr3:100210189-100210208 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
GCAAGAAGTCGCTAACATAA+TGG + Chr3:100209872-100209891 None:intergenic 40.0%
TAAGAAAGCTACACGAGTCT+TGG - Chr3:100208453-100208472 MsG0380017740.01.T01:intron 40.0%
TACCAAGCCAATATGTAGGA+TGG - Chr3:100209775-100209794 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
TCTTATCGCTGGTATTTGCA+GGG - Chr3:100208831-100208850 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
TGACAAAACCCATGAAGCAA+TGG + Chr3:100209147-100209166 None:intergenic 40.0%
TTAGTGCAAGCAATGACATC+AGG + Chr3:100208400-100208419 None:intergenic 40.0%
TTCTTATCGCTGGTATTTGC+AGG - Chr3:100208830-100208849 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAGTAATGGTGTCTAG+GGG - Chr3:100209198-100209217 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGTACCAAGCCAATATGT+AGG - Chr3:100209771-100209790 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
! ACATACACTTCACTGATTGC+AGG - Chr3:100209450-100209469 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTATCGATGGGCTTTCAA+AGG - Chr3:100209356-100209375 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
! ATCCATCCTACATATTGGCT+TGG + Chr3:100209780-100209799 None:intergenic 40.0%
! ATGCGTCAGTTTTGCAAATC+CGG - Chr3:100208424-100208443 MsG0380017740.01.T01:intron 40.0%
! TTGTGTCGAAAAGGTTTGCT+CGG - Chr3:100209054-100209073 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTTATGAAGGATTAGCTG+AGG - Chr3:100209686-100209705 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
!! TTATGAAGGATTAGCTGAGG+AGG - Chr3:100209689-100209708 MsG0380017740.01.T01:CDS 40.0%
AACTGTTGGATGAGATGTGC+CGG - Chr3:100209403-100209422 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
AGAGAAAGCTTTGCAGCTTC+TGG - Chr3:100208558-100208577 MsG0380017740.01.T01:intron 45.0%
AGAGCATGCTGTGAAACTGT+TGG - Chr3:100209389-100209408 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGGAGGAATGTCACCTT+GGG + Chr3:100208383-100208402 None:intergenic 45.0%
ATTGACGGTTACTGCAAAGC+CGG - Chr3:100208529-100208548 MsG0380017740.01.T01:intron 45.0%
CAAAGCTTTCTCTATCTCCC+CGG + Chr3:100208551-100208570 None:intergenic 45.0%
CGGTAGGGCTATTGATATCT+TGG - Chr3:100209074-100209093 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
GAGGGATGCTGAGAGATTAT+TGG - Chr3:100208969-100208988 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
GTCATCCTATGGTTGTGAAC+CGG - Chr3:100208894-100208913 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
TATTTGCAGGGAAGGTAGGT+TGG - Chr3:100208843-100208862 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
TGCTTTATGCAAAGACGGGA+AGG - Chr3:100209260-100209279 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
TTGAATGAGTTGTGCGACAG+AGG - Chr3:100209723-100209742 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
TTGGGAATACAACCATGGCT+TGG + Chr3:100209108-100209127 None:intergenic 45.0%
TTTATGCAAAGACGGGAAGG+TGG - Chr3:100209263-100209282 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
! ATCGATGGGCTTTCAAAGGT+AGG - Chr3:100209360-100209379 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTGTGTGGTACTGGAAGT+TGG - Chr3:100208947-100208966 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
! TCGAAAAGGTTTGCTCGGTA+GGG - Chr3:100209059-100209078 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
! TCGATGGGCTTTCAAAGGTA+GGG - Chr3:100209361-100209380 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
! TTGCGTAGTTTGTGTGGTAC+TGG - Chr3:100208940-100208959 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGGGAGTGTTATCCTGATG+TGG - Chr3:100208690-100208709 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAAGAGAGTGGAGTTGGTG+AGG - Chr3:100208744-100208763 MsG0380017740.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCTGGTATTTGCAGGGA+AGG - Chr3:100208835-100208854 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
CACATCCGGTTCACAACCAT+AGG + Chr3:100208902-100208921 None:intergenic 50.0%
CATCAGGAGGAATGTCACCT+TGG + Chr3:100208384-100208403 None:intergenic 50.0%
CTGGTATTTGCAGGGAAGGT+AGG - Chr3:100208839-100208858 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
GAGGCGACATGTAAAGAGAG+TGG - Chr3:100208733-100208752 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
GTGCAAGCAATGACATCAGG+AGG + Chr3:100208397-100208416 None:intergenic 50.0%
TTGACGGTTACTGCAAAGCC+GGG - Chr3:100208530-100208549 MsG0380017740.01.T01:intron 50.0%
TTGGAGAAGATGCCAAGCCA+TGG - Chr3:100209093-100209112 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
! CATCGGGTTTAAGACCTCTC+CGG + Chr3:100209425-100209444 None:intergenic 50.0%
! CGATGGGCTTTCAAAGGTAG+GGG - Chr3:100209362-100209381 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
! GTCGAAAAGGTTTGCTCGGT+AGG - Chr3:100209058-100209077 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
! GTGTGGTACTGGAAGTTGGA+GGG - Chr3:100208951-100208970 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
! TGTGTGGTACTGGAAGTTGG+AGG - Chr3:100208950-100208969 MsG0380017740.01.T01:CDS 50.0%
TGACGGTTACTGCAAAGCCG+GGG - Chr3:100208531-100208550 MsG0380017740.01.T01:intron 55.0%
TTGGATGAGATGTGCCGGAG+AGG - Chr3:100209408-100209427 MsG0380017740.01.T01:CDS 55.0%
!! AGGATTAGCTGAGGAGGCTC+TGG - Chr3:100209695-100209714 MsG0380017740.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 100208172 100210218 100208172 ID=MsG0380017740.01;Name=MsG0380017740.01
Chr3 mRNA 100208172 100210218 100208172 ID=MsG0380017740.01.T01;Parent=MsG0380017740.01;Name=MsG0380017740.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|0.5|1|1|2|0|556
Chr3 exon 100208617 100210218 100208617 ID=MsG0380017740.01.T01:exon:17938;Parent=MsG0380017740.01.T01
Chr3 exon 100208172 100208240 100208172 ID=MsG0380017740.01.T01:exon:17937;Parent=MsG0380017740.01.T01
Chr3 CDS 100208617 100210218 100208617 ID=MsG0380017740.01.T01:cds;Parent=MsG0380017740.01.T01
Chr3 CDS 100208172 100208240 100208172 ID=MsG0380017740.01.T01:cds;Parent=MsG0380017740.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380017740.01.T01

ATGCATTTCGCCACTGTTTCAAAATTCAAAACTTCTGGTTTAAACGGTAAATCACAACATTTTCGTAAAAATGGTAATTCCAATGCCATAGAATTATCCTCAAATGGTTCAAGAAATTTAGAGGAGTTAGAGAACAATAATCATCTCCGCAAATTGGTTAAATTTGGTGAATTAGATCATGGGTTTAGGTTTCTTAAACGAATGATTTCCCAAGGTGACATTCCTCCTGATGTCATTGCTTGCACTAACCTCATGCGTCAGTTTTGCAAATCCGGTAAAACTAAGAAAGCTACACGAGTCTTGGAAATTATAGAAGATTCCGGTGTTGTTCCTAATGTTATAACCTATAATGTTTTGATTGACGGTTACTGCAAAGCCGGGGAGATAGAGAAAGCTTTGCAGCTTCTGGATCGCATGAGTGTTTCGCCTAATGTTGTTACTTATAATACTATTTTGTCTAGTTTGTGTGATACTTGTAAATTGCAGCAAGCTATGGTAGTTCTTGATAGAATGGTACAAAGGGAGTGTTATCCTGATGTGGTTACGTACACAATATTGATAGAGGCGACATGTAAAGAGAGTGGAGTTGGTGAGGCGATGAAACTGCTAGATGACATGAAGGTTAAAGGATGTAAACCTGATGTGGCTACTTTCAATGTTCTTATCGCTGGTATTTGCAGGGAAGGTAGGTTGGATGAAGCAATTAAGTTTTTGAATAACATGTCATCCTATGGTTGTGAACCGGATGTGTTTACCCATCATATCATTTTGCGTAGTTTGTGTGGTACTGGAAGTTGGAGGGATGCTGAGAGATTATTGGCTGACATGATTCATAAGGGTTGTTCTCCTAGTGTTGTTACTTTCAATATCTTGATTAACTTCTTGTGTCGAAAAGGTTTGCTCGGTAGGGCTATTGATATCTTGGAGAAGATGCCAAGCCATGGTTGTATTCCCAATTCCTTGAGTTACAATCCATTGCTTCATGGGTTTTGTCAAGAAAAAAAGATGGATAGAGCAATTGAGTATTTGGAAGTAATGGTGTCTAGGGGTTGTTACCCAGATATTGTGACCTATAATATTTTGCTTACTGCTTTATGCAAAGACGGGAAGGTGGACATTGCTGTTGAGTTGCTGAATCAGTTGAGCAGTAAAGGGTGCTCTCCAGTTATAATTACTTATAATACAGTTATCGATGGGCTTTCAAAGGTAGGGGAAATAGAGCATGCTGTGAAACTGTTGGATGAGATGTGCCGGAGAGGTCTTAAACCCGATGTAATTACATACACTTCACTGATTGCAGGATTTATTCGTGAGAAAAAGGTTGATGGTGCTATCAAAATTTTCCATGACTTGGAAAGATTAGGTATTAGCGCCAATGCTTTCACTTACAACTCAATCATGTTGGGTCTCTGTAAGGCTCAGCAAACTAGTCGTGCTATTGATCTTCTCGCTCATATGATAGAAAATGAATGCAAGCCTACTGAAGCTACATATACCATTCTTATTGAAGGCATTGCTTATGAAGGATTAGCTGAGGAGGCTCTGGAGTTGTTGAATGAGTTGTGCGACAGAGGATTTGTGAAGAAAAGCTCTGCAAAAAAGGGAACTGGACCAGAATTAAAAGAAAAAGTGGAACGCAATGAGGTATATCTTGAACAAGGAGGCTTGTGA
Protein sequence

>MsG0380017740.01.T01

MHFATVSKFKTSGLNGKSQHFRKNGNSNAIELSSNGSRNLEELENNNHLRKLVKFGELDHGFRFLKRMISQGDIPPDVIACTNLMRQFCKSGKTKKATRVLEIIEDSGVVPNVITYNVLIDGYCKAGEIEKALQLLDRMSVSPNVVTYNTILSSLCDTCKLQQAMVVLDRMVQRECYPDVVTYTILIEATCKESGVGEAMKLLDDMKVKGCKPDVATFNVLIAGICREGRLDEAIKFLNNMSSYGCEPDVFTHHIILRSLCGTGSWRDAERLLADMIHKGCSPSVVTFNILINFLCRKGLLGRAIDILEKMPSHGCIPNSLSYNPLLHGFCQEKKMDRAIEYLEVMVSRGCYPDIVTYNILLTALCKDGKVDIAVELLNQLSSKGCSPVIITYNTVIDGLSKVGEIEHAVKLLDEMCRRGLKPDVITYTSLIAGFIREKKVDGAIKIFHDLERLGISANAFTYNSIMLGLCKAQQTSRAIDLLAHMIENECKPTEATYTILIEGIAYEGLAEEALELLNELCDRGFVKKSSAKKGTGPELKEKVERNEVYLEQGGL*