AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580025211.01

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MsG0580025211.01.T01 AT1G06710 23.878 557 324 13 11 514 132 641 2.91e-34 139
MsG0580025211.01.T01 AT1G06710 24.451 319 223 8 6 313 669 980 8.25e-17 85.1
MsG0580025211.01.T01 AT1G06710 25.835 449 272 6 83 470 339 787 7.61e-46 174
MsG0580025211.01.T01 AT1G06710 24.597 496 344 8 16 486 453 943 2.94e-43 167
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MsG0580025211.01.T01 AT1G06580 25.127 394 252 4 5 392 143 499 2.15e-31 128
MsG0580025211.01.T01 AT1G06580 24.013 304 211 4 185 486 28 313 5.57e-18 87.8
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MsG0580025211.01.T01 AT2G39230 26.829 369 253 6 44 401 482 844 1.64e-35 143
MsG0580025211.01.T01 AT2G39230 25.194 516 342 10 4 498 267 759 4.86e-34 139
MsG0580025211.01.T01 AT2G39230 22.222 477 317 6 52 485 148 613 9.46e-30 125
MsG0580025211.01.T01 AT2G39230 23.155 393 272 8 103 486 137 508 7.53e-20 94.7
MsG0580025211.01.T01 AT2G39230 25.424 295 178 6 11 264 554 847 1.23e-13 74.7
MsG0580025211.01.T01 AT5G41170 28.571 385 231 7 111 487 102 450 8.52e-43 161
MsG0580025211.01.T01 AT5G41170 29.283 321 186 3 63 343 125 444 6.63e-38 147
MsG0580025211.01.T01 AT5G41170 26.146 371 262 4 123 487 48 412 2.92e-37 145
MsG0580025211.01.T01 AT5G41170 24.262 305 197 2 6 307 207 480 7.24e-23 102
MsG0580025211.01.T01 AT5G28460 26.793 474 319 9 49 507 297 757 1.53e-42 164
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MsG0580025211.01.T01 AT1G63630 24.561 171 123 3 44 209 94 263 1.30e-13 72.0
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MsG0580025211.01.T01 AT2G06000 25.676 444 280 8 4 436 131 535 2.06e-37 146
MsG0580025211.01.T01 AT2G06000 27.614 373 210 8 174 503 95 450 6.79e-28 118
MsG0580025211.01.T01 AT2G01740 23.504 468 340 7 1 459 82 540 4.30e-38 149
MsG0580025211.01.T01 AT2G01740 25.648 386 262 7 111 483 86 459 4.85e-35 140
MsG0580025211.01.T01 AT2G01740 22.899 476 350 7 3 469 48 515 3.58e-34 137
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MsG0580025211.01.T01 AT5G65820 21.918 292 215 4 220 501 186 474 3.95e-14 75.9
MsG0580025211.01.T01 AT5G11310 26.119 402 228 10 111 488 130 486 9.59e-29 121
MsG0580025211.01.T01 AT5G11310 26.050 357 243 5 12 353 174 524 2.53e-28 120
MsG0580025211.01.T01 AT5G25630 24.433 397 288 5 44 430 78 472 1.02e-28 121
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MsG0580025211.01.T01 AT5G25630 25.994 327 214 12 5 313 93 409 1.06e-21 99.4
MsG0580025211.01.T01 AT5G25630 21.386 332 219 6 191 513 3 301 4.65e-13 72.4
MsG0580025211.01.T01 AT5G39980 19.553 537 383 9 17 509 125 656 1.77e-28 121
MsG0580025211.01.T01 AT5G18950 24.682 393 226 5 92 482 154 478 2.63e-28 119
MsG0580025211.01.T01 AT5G18950 24.515 412 263 8 79 485 78 446 4.62e-23 103
MsG0580025211.01.T01 AT5G18950 18.750 224 178 1 6 225 243 466 1.06e-12 71.2
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MsG0580025211.01.T01 AT1G17630 23.173 479 314 11 46 481 123 590 2.68e-25 111
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MsG0580025211.01.T01 AT1G18900 23.891 293 215 4 181 469 363 651 1.41e-17 87.4
MsG0580025211.01.T01 AT1G18900 24.934 381 232 8 76 440 326 668 1.28e-24 109
MsG0580025211.01.T01 AT1G18900 23.891 293 215 4 181 469 363 651 1.41e-17 87.4
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MsG0580025211.01.T01 AT1G53330 25.524 286 204 5 200 479 133 415 5.35e-20 94.0
MsG0580025211.01.T01 AT1G53330 20.264 227 176 2 6 228 218 443 6.27e-11 65.5
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MsG0580025211.01.T01 AT1G52640 21.348 356 240 4 149 499 140 460 5.99e-22 100
MsG0580025211.01.T01 AT1G52640 25.000 260 188 4 5 258 202 460 6.08e-20 94.0
MsG0580025211.01.T01 AT4G02750 21.868 439 280 9 80 485 125 533 2.77e-24 108
MsG0580025211.01.T01 AT4G02750 22.606 376 254 11 96 469 76 416 4.09e-21 98.6
MsG0580025211.01.T01 AT4G02750 22.287 341 227 11 119 456 67 372 2.62e-13 73.6
MsG0580025211.01.T01 AT4G01570 22.764 492 310 9 52 508 60 516 4.57e-24 107
MsG0580025211.01.T01 AT4G01570 21.868 439 275 6 6 432 122 504 1.24e-19 94.0
MsG0580025211.01.T01 AT4G01570 19.874 478 328 8 60 490 263 732 2.82e-18 89.4
MsG0580025211.01.T01 AT1G66345 22.532 395 267 4 101 491 184 543 5.10e-24 106
MsG0580025211.01.T01 AT1G66345 23.308 266 200 2 218 481 165 428 9.31e-22 99.8
MsG0580025211.01.T01 AT1G53330 26.480 321 220 4 78 388 45 359 6.21e-24 104
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MsG0580025211.01.T01 AT1G53330 25.260 289 207 5 197 479 26 311 2.92e-20 93.2
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MsG0580025211.01.T01 AT1G77405 23.653 334 202 8 179 496 162 458 4.67e-16 81.6
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MsG0580025211.01.T01 AT1G80150 24.211 285 158 7 176 456 151 381 1.41e-14 76.3
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MsG0580025211.01.T01 AT4G39620 25.778 225 154 4 103 316 155 377 2.61e-14 76.3
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MsG0580025211.01.T01 AT1G79490 23.137 255 187 3 100 350 265 514 3.57e-14 76.6
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MsG0580025211.01.T01 AT1G09410 21.981 414 245 13 83 494 19 356 3.27e-16 82.8
MsG0580025211.01.T01 AT3G24000 23.784 370 233 11 150 483 63 419 3.84e-17 85.5
MsG0580025211.01.T01 AT5G02830 21.339 478 330 11 11 473 232 678 5.42e-17 85.5
MsG0580025211.01.T01 AT5G02830 22.857 315 213 9 14 305 377 684 4.86e-11 66.2
MsG0580025211.01.T01 AT5G02830 24.324 296 173 14 203 483 321 580 7.73e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT5G15010 21.241 419 278 9 108 514 153 531 6.94e-17 84.7
MsG0580025211.01.T01 AT5G15010 24.898 245 141 4 76 315 297 503 2.30e-15 79.7
MsG0580025211.01.T01 AT1G25360 21.413 453 295 14 72 481 139 573 9.13e-17 84.7
MsG0580025211.01.T01 AT1G25360 21.658 374 251 12 91 446 21 370 1.43e-13 74.3
MsG0580025211.01.T01 AT1G02420 27.041 196 139 2 290 485 183 374 9.96e-17 84.0
MsG0580025211.01.T01 AT1G02420 27.419 186 129 2 115 297 179 361 7.92e-16 80.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G02420 29.082 196 131 3 80 274 179 367 4.64e-15 78.6
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MsG0580025211.01.T01 AT1G68930 21.108 379 275 8 114 486 70 430 5.47e-12 69.3
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MsG0580025211.01.T01 AT3G09040 20.417 480 303 10 72 481 444 914 1.97e-15 80.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G09040 20.417 480 303 10 72 481 444 914 1.97e-15 80.5
MsG0580025211.01.T01 AT1G26900 21.552 464 294 15 72 487 51 492 2.18e-15 79.7
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MsG0580025211.01.T01 AT3G29290 20.596 403 266 6 80 469 106 467 3.30e-15 79.3
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MsG0580025211.01.T01 AT4G18840 21.995 441 301 14 60 486 54 465 2.07e-14 76.6
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MsG0580025211.01.T01 AT3G46610 22.650 234 168 3 109 331 409 640 6.73e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G21090 21.197 401 257 8 114 474 80 461 4.38e-14 75.9
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MsG0580025211.01.T01 AT1G11630 23.333 270 168 3 146 415 150 380 8.02e-12 67.8
MsG0580025211.01.T01 AT1G11630 22.630 327 198 8 169 482 58 342 4.03e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G11290 20.800 500 305 15 16 507 206 622 2.10e-13 73.9
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MsG0580025211.01.T01 AT4G38150 26.087 138 99 1 178 315 130 264 1.16e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT4G38150 27.273 143 99 2 341 481 116 255 2.61e-13 71.6
MsG0580025211.01.T01 AT4G38150 26.087 138 99 1 178 315 130 264 1.16e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G39350 20.041 489 324 12 45 485 79 548 3.61e-13 73.2
MsG0580025211.01.T01 AT4G30825 20.190 421 326 6 70 483 477 894 3.93e-13 73.2
MsG0580025211.01.T01 AT4G30825 24.046 262 177 6 103 351 651 903 6.94e-13 72.4
MsG0580025211.01.T01 AT2G27800 22.831 219 153 3 115 317 206 424 4.20e-13 72.0
MsG0580025211.01.T01 AT2G27800 26.286 175 112 4 327 484 210 384 7.69e-12 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT2G27800 21.591 264 161 5 220 472 210 438 3.26e-11 66.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G08070 21.170 359 241 5 115 472 95 412 5.70e-13 72.4
MsG0580025211.01.T01 AT1G08070 21.170 359 241 5 115 472 199 516 8.51e-13 72.0
MsG0580025211.01.T01 AT1G08070 20.879 364 256 8 135 487 87 429 8.49e-12 68.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G13230 22.535 426 279 13 85 483 206 607 9.43e-13 72.0
MsG0580025211.01.T01 AT5G59600 23.721 430 242 13 58 483 99 446 1.12e-12 71.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G74630 21.090 422 298 13 72 481 28 426 1.39e-12 71.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G74630 21.676 346 247 8 100 436 156 486 4.35e-11 66.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G80880 22.630 327 210 7 27 350 205 491 1.45e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G80880 22.630 327 210 7 27 350 205 491 1.45e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G80880 22.630 327 210 7 27 350 205 491 1.45e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G74630 21.090 422 298 13 72 481 43 441 1.48e-12 71.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G74630 21.676 346 247 8 100 436 171 501 5.68e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT4G38010 21.896 443 287 14 49 483 74 465 1.50e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT4G14190 26.230 183 126 5 310 487 84 262 1.55e-12 70.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G53170 21.908 283 204 5 44 311 177 457 1.75e-12 70.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G53170 23.762 303 215 5 180 469 142 441 3.44e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT3G53170 23.295 352 237 10 95 422 122 464 6.25e-12 68.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G16860 21.204 382 227 12 80 423 126 471 1.77e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT5G16860 21.366 454 325 12 49 483 196 636 2.10e-11 67.4
MsG0580025211.01.T01 AT2G02750 21.680 369 227 8 144 470 28 376 1.83e-12 70.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G02750 21.901 242 182 3 113 350 295 533 1.68e-11 67.8
MsG0580025211.01.T01 AT4G13650 20.681 382 257 8 105 485 515 851 1.90e-12 71.2
MsG0580025211.01.T01 AT3G22690 19.906 427 316 8 72 490 125 533 2.51e-12 70.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G22690 19.906 427 316 8 72 490 125 533 2.61e-12 70.5
MsG0580025211.01.T01 AT2G18520 24.815 270 183 8 11 269 102 362 2.70e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT2G40720 23.622 254 185 3 111 364 506 750 2.76e-12 70.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G22690 19.906 427 316 8 72 490 125 533 2.95e-12 70.1
MsG0580025211.01.T01 AT5G47460 20.113 353 234 8 100 418 74 412 3.13e-12 69.7
MsG0580025211.01.T01 AT2G02980 21.630 319 221 6 44 350 92 393 3.21e-12 69.7
MsG0580025211.01.T01 AT3G29230 19.710 345 256 8 115 450 215 547 3.30e-12 69.7
MsG0580025211.01.T01 AT3G29230 21.409 369 255 10 153 511 57 400 2.23e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT3G49170 20.432 509 340 16 72 571 260 712 3.41e-12 70.1
MsG0580025211.01.T01 AT5G48910 21.531 418 296 13 16 414 95 499 3.44e-12 69.7
MsG0580025211.01.T01 AT4G35130 20.833 240 185 2 111 350 360 594 3.62e-12 70.1
MsG0580025211.01.T01 AT2G01510 21.143 350 255 5 44 379 72 414 4.19e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT2G01510 21.143 350 255 5 44 379 72 414 4.19e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT3G49740 21.818 440 284 15 49 481 260 646 4.43e-12 69.7
MsG0580025211.01.T01 AT5G61370 24.153 236 133 4 87 311 214 414 4.87e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT5G61370 20.478 293 208 3 209 485 95 378 3.12e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G48730 21.639 305 228 6 159 456 129 429 5.26e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G42920 20.195 411 299 12 13 413 91 482 5.46e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G42920 20.195 411 299 12 13 413 91 482 5.46e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G30610 22.594 239 167 5 92 313 603 840 5.72e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT1G30610 25.238 210 147 4 112 315 589 794 9.53e-11 65.5
MsG0580025211.01.T01 AT4G33990 22.120 434 284 14 72 469 144 559 5.98e-12 69.3
MsG0580025211.01.T01 AT5G56310 22.372 371 245 11 114 481 76 406 6.56e-12 68.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G56310 21.714 350 256 8 9 350 74 413 2.54e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT4G33990 22.120 434 284 14 72 469 137 552 6.78e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G29760 18.537 410 312 9 80 483 130 523 8.40e-12 68.9
MsG0580025211.01.T01 AT2G37320 24.911 281 194 9 212 487 115 383 9.37e-12 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT3G56550 19.211 380 257 11 110 483 31 366 1.20e-11 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT3G56550 19.211 380 257 11 110 483 31 366 1.20e-11 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT5G10690 26.872 227 145 8 21 227 52 277 1.36e-11 67.8
MsG0580025211.01.T01 AT5G10690 26.872 227 145 8 21 227 52 277 1.36e-11 67.8
MsG0580025211.01.T01 AT3G23330 23.297 279 202 6 216 492 206 474 1.37e-11 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT2G37310 20.000 415 311 10 76 483 124 524 1.38e-11 67.8
MsG0580025211.01.T01 AT3G15130 21.117 412 267 15 115 481 71 469 1.39e-11 68.2
MsG0580025211.01.T01 AT1G12615 31.973 147 96 2 208 352 1 145 1.57e-11 63.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G23330 23.297 279 202 6 216 492 97 365 1.89e-11 67.4
MsG0580025211.01.T01 AT4G37170 20.347 403 301 9 83 480 87 474 2.13e-11 67.4
MsG0580025211.01.T01 AT2G28050 23.970 267 199 4 220 483 142 407 2.17e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT2G28050 24.797 246 171 5 103 339 196 436 6.12e-11 65.5
MsG0580025211.01.T01 AT2G46050 20.106 378 262 5 110 487 65 402 2.28e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT4G04370 20.188 426 274 13 71 453 36 438 2.44e-11 67.4
MsG0580025211.01.T01 AT1G59720 23.396 265 190 5 54 313 127 383 2.48e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT5G04780 20.072 279 218 2 72 350 153 426 2.65e-11 67.0
MsG0580025211.01.T01 AT5G13270 21.627 504 300 15 61 487 64 549 4.09e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT3G53360 20.860 465 314 11 25 481 211 629 4.17e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT3G53360 20.860 465 314 11 25 481 211 629 4.17e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT3G61170 20.317 379 255 6 119 461 62 429 4.28e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT5G27270 25.604 207 149 2 121 322 675 881 4.70e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT3G57430 22.472 267 187 4 106 361 430 687 4.74e-11 66.6
MsG0580025211.01.T01 AT1G56570 22.264 265 187 6 111 369 243 494 5.54e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT1G56570 22.264 265 187 6 111 369 243 494 5.54e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT3G13770 20.996 281 215 4 72 350 144 419 5.84e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT4G21170 22.440 459 286 17 31 469 173 581 6.60e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT3G02330 21.382 304 213 4 67 350 469 766 7.85e-11 65.9
MsG0580025211.01.T01 AT3G26630 21.851 389 270 13 105 481 42 408 8.54e-11 65.1
MsG0580025211.01.T01 AT1G74600 22.468 316 192 9 123 435 294 559 8.60e-11 65.5
MsG0580025211.01.T01 AT3G08820 18.367 441 316 7 44 483 74 471 9.69e-11 65.5

Find 135 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 174 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATATCTTCCATAAACTTTA+AGG 0.140740 5:+15368400 None:intergenic
TGGAAGTGCCTTAAAGTTTA+TGG 0.168237 5:-15368408 MsG0580025211.01.T01:CDS
GGGCTGTAAGTTTCTGTATT+TGG 0.206458 5:+15368359 None:intergenic
TTCTGCCTTCTTGACATAAA+AGG 0.215547 5:+15367738 None:intergenic
ACTTATAATATACTGATATA+TGG 0.246921 5:-15368977 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTATTGTAAGGAAGAGAATT+TGG 0.270249 5:-15369269 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTTATTCTCCATCTGCTTC+AGG 0.277521 5:+15369020 None:intergenic
GTTTATAACTCTCTTGTTCA+TGG 0.283270 5:-15368557 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTATTATAAATGACAGTATT+TGG 0.286818 5:+15369397 None:intergenic
TTGCAGCTTATTAAGAATAA+TGG 0.289372 5:-15369427 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTTGCTTCATGCACTTTGT+AGG 0.292325 5:-15369375 MsG0580025211.01.T01:CDS
AACGGAGGCTGCTGAGGTTC+TGG 0.308459 5:-15369143 MsG0580025211.01.T01:CDS
GGCTTACAATACATTGATAA+AGG 0.310188 5:-15369083 MsG0580025211.01.T01:CDS
CGTGGTGATGATTATACGTT+TGG 0.327852 5:-15369505 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGACCTTCAGAAAGCTTTGC+AGG 0.331404 5:-15368309 MsG0580025211.01.T01:intron
GACTTGGCTTACAAGTTTCA+TGG 0.332869 5:-15369634 MsG0580025211.01.T01:CDS
ACTTTCGACACGATGATTAG+AGG 0.339207 5:-15368872 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTGGAGAGAGTTGAGAGCTT+GGG 0.347919 5:-15369124 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTGCCCTTTAGAGCCATCTT+TGG 0.348696 5:+15368790 None:intergenic
ACTAGGATTGTTTGCCTCTT+CGG 0.354342 5:+15367890 None:intergenic
CCTCCTCAATATCTCCTTCA+AGG 0.362902 5:+15367775 None:intergenic
GAACGTATATGTCGAGGATT+TGG 0.365724 5:-15367997 MsG0580025211.01.T01:CDS
GCTAATAAGCTAAATGATAC+AGG 0.366934 5:-15367693 MsG0580025211.01.T01:CDS
AAATTGTAGGAATTTAATAA+TGG 0.371971 5:-15368023 MsG0580025211.01.T01:intron
GCTTACAATACATTGATAAA+GGG 0.373145 5:-15369082 MsG0580025211.01.T01:CDS
AGGGACTTTGTTTAACGAAT+AGG 0.376461 5:-15369471 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGTGAAAGAGGATATTGATA+TGG 0.377654 5:-15369569 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTCTTCATTGCAGCAGTACT+AGG 0.385741 5:+15367873 None:intergenic
ATATTAAACGTAACCTCGTT+CGG 0.388159 5:+15369304 None:intergenic
TGAGTCTAGAATGTTGGATT+TGG 0.403018 5:-15368948 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTATAATATACTGATATAT+GGG 0.409622 5:-15368976 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTTGATATCTGCTTATTGTA+AGG 0.413293 5:-15369281 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATATTATAAGTATCCACATT+TGG 0.419968 5:+15368989 None:intergenic
CTTCATGCACTTTGTAGGAA+TGG 0.423463 5:-15369370 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTGAAGCAGATGGAGAATAA+AGG 0.428651 5:-15369019 MsG0580025211.01.T01:CDS
CCCTACAATAGCATAATATA+TGG 0.432019 5:-15368761 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATGCTTCTGTCAACAGCTCT+AGG 0.432837 5:+15368674 None:intergenic
ACCATATATTATGCTATTGT+AGG 0.433139 5:+15368760 None:intergenic
GAAACCAAAGATGGCTCTAA+AGG 0.433706 5:-15368794 MsG0580025211.01.T01:CDS
TATTAAACGTAACCTCGTTC+GGG 0.439944 5:+15369305 None:intergenic
CCCGCCTGGTCATTCCAGTC+CGG 0.448414 5:+15369671 None:intergenic
ACATTCAATGCTATCATCAC+TGG 0.448563 5:-15368452 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTCATGCACTTTGTAGGAAT+GGG 0.452595 5:-15369369 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATATCTTCATAACAATTGTC+CGG 0.455926 5:-15369702 MsG0580025211.01.T01:CDS
AAGCATATTGAGAACTCAAT+GGG 0.456813 5:-15367847 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTTGGATGTTCTTGTGAAAG+AGG 0.461284 5:-15369581 MsG0580025211.01.T01:CDS
GACGAAATGCCTACCTCAAT+CGG 0.462893 5:-15369742 None:intergenic
ATCTGAGTTTCTATCAAAGA+TGG 0.466433 5:-15368708 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTCCAGTCCGGGACAGTCCC+CGG 0.467880 5:+15369683 None:intergenic
GAGCAAGAGCAGAACCTTGA+AGG 0.468145 5:-15367789 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTAGGAATGGGAAGGTTGGT+AGG 0.469352 5:-15369357 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGTCGAAAGTAACGAAGTTC+CGG 0.473180 5:+15368885 None:intergenic
GGTCATCACAGTTCTTGACT+TGG 0.477193 5:-15369650 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTAGTCACTGTAACAACATC+AGG 0.477519 5:+15369199 None:intergenic
TTTAATGATATGAAGACAGA+TGG 0.486370 5:-15368914 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGGAGAGAGTTGAGAGCTTG+GGG 0.489565 5:-15369123 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTTGTTTAACGAATAGGAT+TGG 0.492594 5:-15369466 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTCCGGGGACTGTCCCGGAC+TGG 0.493104 5:-15369685 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTGGTGATGATTATACGTTT+GGG 0.494322 5:-15369504 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGAAGACAGATGGGATCAAC+CGG 0.495644 5:-15368904 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATTAGAGGTTTGTGTTCAGA+AGG 0.501831 5:-15368857 MsG0580025211.01.T01:CDS
TACATAACACATCAATCAAA+GGG 0.503084 5:+15368339 None:intergenic
TCTGGAGAGAGTTGAGAGCT+TGG 0.505553 5:-15369125 MsG0580025211.01.T01:CDS
AAACCAAAGATGGCTCTAAA+GGG 0.508090 5:-15368793 MsG0580025211.01.T01:CDS
GAGTTATAAACTAGAATACT+TGG 0.508299 5:+15368569 None:intergenic
CTCTTGCTCATCACTCCTAT+CGG 0.508301 5:+15367803 None:intergenic
CCCCACTCACAAGTCTCAAA+AGG 0.511460 5:-15367958 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTCTTCATAGCTGCAGATGA+AGG 0.513803 5:+15367918 None:intergenic
TAAGCATATTGAGAACTCAA+TGG 0.514321 5:-15367848 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTACATAACACATCAATCAA+AGG 0.515987 5:+15368338 None:intergenic
CAAAAGGAGGCAGCTATCAC+AGG 0.518861 5:-15367942 MsG0580025211.01.T01:CDS
TATCTTCATAACAATTGTCC+GGG 0.523229 5:-15369701 MsG0580025211.01.T01:CDS
GAACCTTGAAGGAGATATTG+AGG 0.524691 5:-15367778 MsG0580025211.01.T01:CDS
TCAGAAGGAAGAATTGAAGA+TGG 0.524938 5:-15368842 MsG0580025211.01.T01:CDS
CCGCCTGGTCATTCCAGTCC+GGG 0.528102 5:+15369672 None:intergenic
TAGGAATGGGAAGGTTGGTA+GGG 0.529793 5:-15369356 MsG0580025211.01.T01:CDS
ACTTCATTTCCTGAAGCAGA+TGG 0.534343 5:-15369029 MsG0580025211.01.T01:CDS
CCATATATTATGCTATTGTA+GGG 0.535302 5:+15368761 None:intergenic
ATGGAAGATATTACTGCAAG+AGG 0.537680 5:-15368389 MsG0580025211.01.T01:CDS
ACACGGGTTAGCTCCGATTG+AGG 0.538279 5:+15369729 None:intergenic
CTAATAAGCTAAATGATACA+GGG 0.541225 5:-15367692 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTTGTAGGAATGGGAAGGT+TGG 0.544470 5:-15369361 MsG0580025211.01.T01:CDS
GAGAGAGTTGAGAGCTTGGG+GGG 0.549392 5:-15369121 MsG0580025211.01.T01:CDS
AGCATTGAATGTGGATGCAA+TGG 0.551763 5:+15368463 None:intergenic
CTTTGATTGATGTGTTATGT+AGG 0.553334 5:-15368337 MsG0580025211.01.T01:CDS
GGAGTGGGAAAAGTGAAAGT+TGG 0.554220 5:-15369052 MsG0580025211.01.T01:CDS
CATTTCATTGATAAGCTCAA+CGG 0.554620 5:+15368505 None:intergenic
CATTCAATGCTATCATCACT+GGG 0.559411 5:-15368451 MsG0580025211.01.T01:CDS
GATTGATGTGTTATGTAGGA+AGG 0.561613 5:-15368333 MsG0580025211.01.T01:CDS
CAATTGTCCGGGGACTGTCC+CGG 0.568814 5:-15369690 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTACAATACATTGATAAAG+GGG 0.569220 5:-15369081 MsG0580025211.01.T01:CDS
AGAAAGAGTATGATGAAGAG+TGG 0.572329 5:-15369532 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGCACTTTGTAGGAATGGGA+AGG 0.574117 5:-15369365 MsG0580025211.01.T01:CDS
TCTGAGTTTCTATCAAAGAT+GGG 0.576049 5:-15368707 MsG0580025211.01.T01:CDS
ACGTGTAACGGAGGCTGCTG+AGG 0.578213 5:-15369149 MsG0580025211.01.T01:CDS
TAAAGGCTATCTTCCAAATG+TGG 0.580097 5:-15369002 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATGATGAAGAGTGGTGTTCG+TGG 0.584964 5:-15369523 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGATGTTGTTACAGTGACTA+AGG 0.585940 5:-15369197 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTAATGATATGAAGACAGAT+GGG 0.589797 5:-15368913 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATGCGACGCTGGACGTGTAA+CGG 0.590245 5:-15369161 MsG0580025211.01.T01:CDS
TATGATAAGATGCTTGATGA+AGG 0.590564 5:-15368599 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGCTTCTGTCAACAGCTCTA+GGG 0.592973 5:+15368675 None:intergenic
AGACCTGCAAAGCTTTCTGA+AGG 0.594638 5:+15368306 None:intergenic
GGGTTAGCTCCGATTGAGGT+AGG 0.594847 5:+15369733 None:intergenic
TTAATGGAGGAAACCAAAGA+TGG 0.598508 5:-15368803 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATTATACAGAAATGCAAGGA+AGG 0.603954 5:-15368647 MsG0580025211.01.T01:CDS
GGAGAGAGTTGAGAGCTTGG+GGG 0.604923 5:-15369122 MsG0580025211.01.T01:CDS
CACTCACAAGTCTCAAAAGG+AGG 0.615384 5:-15367955 MsG0580025211.01.T01:CDS
GACTATTATACAGAAATGCA+AGG 0.619471 5:-15368651 MsG0580025211.01.T01:CDS
GCATTGAATGTGGATGCAAT+GGG 0.621516 5:+15368464 None:intergenic
AAGAACTGTGATGACCCGCC+TGG 0.627967 5:+15369657 None:intergenic
TAGCTGATGAAGAGACCGAT+AGG 0.628739 5:-15367818 MsG0580025211.01.T01:CDS
CCCGGACTGGAATGACCAGG+CGG 0.635672 5:-15369672 MsG0580025211.01.T01:CDS
CCGGACTGGAATGACCAGGC+GGG 0.635844 5:-15369671 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGTCCCGGACTGGAATGACC+AGG 0.641533 5:-15369675 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGGTGCGAACGTATATGTCG+AGG 0.643380 5:-15368003 MsG0580025211.01.T01:CDS
TATGAAGAGTGTATCCGAAG+AGG 0.645378 5:-15367904 MsG0580025211.01.T01:CDS
GCAACATGGTAGTATTCGAG+AGG 0.646901 5:-15368528 MsG0580025211.01.T01:CDS
CTTGAAGGAGATATTGAGGA+GGG 0.648751 5:-15367774 MsG0580025211.01.T01:CDS
AAGCTTGATGAATGAGATGG+TGG 0.654331 5:-15369329 MsG0580025211.01.T01:CDS
TTATGAAGATATCTTCACAC+GGG 0.658436 5:+15369713 None:intergenic
CCTTGAAGGAGATATTGAGG+AGG 0.659221 5:-15367775 MsG0580025211.01.T01:CDS
GTTGAGATTCTATGCGACGC+TGG 0.672941 5:-15369172 MsG0580025211.01.T01:CDS
GATAAGATGCTTGATGAAGG+TGG 0.673309 5:-15368596 MsG0580025211.01.T01:CDS
TAGAAGCTTGATGAATGAGA+TGG 0.684427 5:-15369332 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGAGATGGTGGACCCGAACG+AGG 0.684946 5:-15369317 MsG0580025211.01.T01:CDS
ATCTTCATAACAATTGTCCG+GGG 0.687849 5:-15369700 MsG0580025211.01.T01:CDS
AGTGATGATAGCATTGAATG+TGG 0.691708 5:+15368454 None:intergenic
GTTATGAAGATATCTTCACA+CGG 0.692112 5:+15369712 None:intergenic
TAAGCAAAATCGTTTCGACG+AGG 0.695607 5:-15368732 MsG0580025211.01.T01:CDS
TAATAAGCTAAATGATACAG+GGG 0.698331 5:-15367691 MsG0580025211.01.T01:CDS
CGACGCTGGACGTGTAACGG+AGG 0.698597 5:-15369158 MsG0580025211.01.T01:CDS
TGTTGTTACAGTGACTAAGG+TGG 0.702290 5:-15369194 MsG0580025211.01.T01:CDS
AATAAGCTAAATGATACAGG+GGG 0.712990 5:-15367690 MsG0580025211.01.T01:CDS
AGCATATTGAGAACTCAATG+GGG 0.752636 5:-15367846 MsG0580025211.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATTGTAGGAATTTAATAA+TGG - Chr5:15369387-15369406 MsG0580025211.01.T01:CDS 15.0%
!! ACAATTTCATAAACTAAATT+GGG + Chr5:15369374-15369393 None:intergenic 15.0%
!! ACTTATAATATACTGATATA+TGG - Chr5:15368433-15368452 MsG0580025211.01.T01:CDS 15.0%
!! CTTATAATATACTGATATAT+GGG - Chr5:15368434-15368453 MsG0580025211.01.T01:CDS 15.0%
!! TACAATTTCATAAACTAAAT+TGG + Chr5:15369375-15369394 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTAGTTTATGAAATTGT+AGG - Chr5:15369374-15369393 MsG0580025211.01.T01:CDS 15.0%
!! AATATCTTCCATAAACTTTA+AGG + Chr5:15369013-15369032 None:intergenic 20.0%
!! ATATTATAAGTATCCACATT+TGG + Chr5:15368424-15368443 None:intergenic 20.0%
!! ATTATTTACTCTAGTGAATT+AGG - Chr5:15369235-15369254 MsG0580025211.01.T01:CDS 20.0%
!! CAATTTCATAAACTAAATTG+GGG + Chr5:15369373-15369392 None:intergenic 20.0%
!! GTATTATAAATGACAGTATT+TGG + Chr5:15368016-15368035 None:intergenic 20.0%
!! TTATTTACTCTAGTGAATTA+GGG - Chr5:15369236-15369255 MsG0580025211.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAAGATTTTTAACTCAATTT+TGG - Chr5:15367811-15367830 MsG0580025211.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTCAATTTTGGAGTTAA+TGG - Chr5:15368591-15368610 MsG0580025211.01.T01:CDS 20.0%
! ACCATATATTATGCTATTGT+AGG + Chr5:15368653-15368672 None:intergenic 25.0%
! ATATCTTCATAACAATTGTC+CGG - Chr5:15367708-15367727 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! CCATATATTATGCTATTGTA+GGG + Chr5:15368652-15368671 None:intergenic 25.0%
! CTAATAAGCTAAATGATACA+GGG - Chr5:15369718-15369737 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! CTTACAATACATTGATAAAG+GGG - Chr5:15368329-15368348 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTTAAAAATCTTCAAAGA+CGG + Chr5:15367806-15367825 None:intergenic 25.0%
! GAGTTATAAACTAGAATACT+TGG + Chr5:15368844-15368863 None:intergenic 25.0%
! GCTTACAATACATTGATAAA+GGG - Chr5:15368328-15368347 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! TAATAAGCTAAATGATACAG+GGG - Chr5:15369719-15369738 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! TACATAACACATCAATCAAA+GGG + Chr5:15369074-15369093 None:intergenic 25.0%
! TTAATGATATGAAGACAGAT+GGG - Chr5:15368497-15368516 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTGTAAGGAAGAGAATT+TGG - Chr5:15368141-15368160 MsG0580025211.01.T01:intron 25.0%
! TTGCAGCTTATTAAGAATAA+TGG - Chr5:15367983-15368002 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAATGATATGAAGACAGA+TGG - Chr5:15368496-15368515 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGATATCTGCTTATTGTA+AGG - Chr5:15368129-15368148 MsG0580025211.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAAGATGGTTTTTCAATTT+TGG - Chr5:15368582-15368601 MsG0580025211.01.T01:CDS 25.0%
AAGCATATTGAGAACTCAAT+GGG - Chr5:15369563-15369582 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
AATAAGCTAAATGATACAGG+GGG - Chr5:15369720-15369739 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
AATTAGGGAGTCTTCAAATT+TGG - Chr5:15369251-15369270 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
ATATTAAACGTAACCTCGTT+CGG + Chr5:15368109-15368128 None:intergenic 30.0%
ATCTGAGTTTCTATCAAAGA+TGG - Chr5:15368702-15368721 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
ATTATACAGAAATGCAAGGA+AGG - Chr5:15368763-15368782 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATTGATAAGCTCAA+CGG + Chr5:15368908-15368927 None:intergenic 30.0%
CCCTACAATAGCATAATATA+TGG - Chr5:15368649-15368668 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
CTACATAACACATCAATCAA+AGG + Chr5:15369075-15369094 None:intergenic 30.0%
CTTTGATTGATGTGTTATGT+AGG - Chr5:15369073-15369092 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
GACTATTATACAGAAATGCA+AGG - Chr5:15368759-15368778 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
GATTTCCAAATAAATTGGTC+AGG + Chr5:15369159-15369178 None:intergenic 30.0%
GCAGTGATTTCCAAATAAAT+TGG + Chr5:15369164-15369183 None:intergenic 30.0%
GCTAATAAGCTAAATGATAC+AGG - Chr5:15369717-15369736 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
GGCTTACAATACATTGATAA+AGG - Chr5:15368327-15368346 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
GTTATGAAGATATCTTCACA+CGG + Chr5:15367701-15367720 None:intergenic 30.0%
GTTTATAACTCTCTTGTTCA+TGG - Chr5:15368853-15368872 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TAAGCATATTGAGAACTCAA+TGG - Chr5:15369562-15369581 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TATCTTCATAACAATTGTCC+GGG - Chr5:15367709-15367728 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TATGATAAGATGCTTGATGA+AGG - Chr5:15368811-15368830 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TCATTCCTGACCAATTTATT+TGG - Chr5:15369151-15369170 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TCTGAGTTTCTATCAAAGAT+GGG - Chr5:15368703-15368722 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TGTGAAAGAGGATATTGATA+TGG - Chr5:15367841-15367860 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
TTATGAAGATATCTTCACAC+GGG + Chr5:15367700-15367719 None:intergenic 30.0%
! CTTTGTTTAACGAATAGGAT+TGG - Chr5:15367944-15367963 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTGGACAAGGAAAAAT+TGG - Chr5:15368982-15369001 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCAATTTTGGAGTTAATGG+AGG - Chr5:15368594-15368613 MsG0580025211.01.T01:CDS 30.0%
ACATTCAATGCTATCATCAC+TGG - Chr5:15368958-15368977 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
AGCATATTGAGAACTCAATG+GGG - Chr5:15369564-15369583 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
AGTAATTGTGACATCTGCTT+TGG - Chr5:15369295-15369314 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTCATAACAATTGTCCG+GGG - Chr5:15367710-15367729 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAAGATATTACTGCAAG+AGG - Chr5:15369021-15369040 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGAGGTTTGTGTTCAGA+AGG - Chr5:15368553-15368572 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAATGCTATCATCACT+GGG - Chr5:15368959-15368978 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
GATTGATGTGTTATGTAGGA+AGG - Chr5:15369077-15369096 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
GTCTTCAAATTTGGTCCAAA+TGG - Chr5:15369260-15369279 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
TAAAGGCTATCTTCCAAATG+TGG - Chr5:15368408-15368427 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAGCTTGATGAATGAGA+TGG - Chr5:15368078-15368097 MsG0580025211.01.T01:intron 35.0%
TATTAAACGTAACCTCGTTC+GGG + Chr5:15368108-15368127 None:intergenic 35.0%
TCAGAAGGAAGAATTGAAGA+TGG - Chr5:15368568-15368587 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
TGATGTTGTTACAGTGACTA+AGG - Chr5:15368213-15368232 MsG0580025211.01.T01:intron 35.0%
TTAATGGAGGAAACCAAAGA+TGG - Chr5:15368607-15368626 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTCACTGTAACAACATC+AGG + Chr5:15368214-15368233 None:intergenic 35.0%
TTCAAATTTGGTCCAAATGG+TGG - Chr5:15369263-15369282 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
TTCATGCACTTTGTAGGAAT+GGG - Chr5:15368041-15368060 MsG0580025211.01.T01:intron 35.0%
TTCTGCCTTCTTGACATAAA+AGG + Chr5:15369675-15369694 None:intergenic 35.0%
TTTGGATGTTCTTGTGAAAG+AGG - Chr5:15367829-15367848 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTGATAAAGGGGTTTTG+TGG - Chr5:15368337-15368356 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! AGAAAGAGTATGATGAAGAG+TGG - Chr5:15367878-15367897 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGACTTTGTTTAACGAAT+AGG - Chr5:15367939-15367958 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! AGTGATGATAGCATTGAATG+TGG + Chr5:15368959-15368978 None:intergenic 35.0%
! GTGGTGATGATTATACGTTT+GGG - Chr5:15367906-15367925 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! TCACTCCTTTTATGTCAAGA+AGG - Chr5:15369667-15369686 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
! TGAGTCTAGAATGTTGGATT+TGG - Chr5:15368462-15368481 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! AAACCAAAGATGGCTCTAAA+GGG - Chr5:15368617-15368636 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! ACGTTTGGGATTTTGATGAA+GGG - Chr5:15367920-15367939 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTGTGAGTCTAGAATGT+TGG - Chr5:15368456-15368475 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! TACGTTTGGGATTTTGATGA+AGG - Chr5:15367919-15367938 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGAAGTGCCTTAAAGTTTA+TGG - Chr5:15369002-15369021 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGCAGGTCTTTTTGGAAA+TGG - Chr5:15369116-15369135 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTGGAAATGGTCGAGAA+GGG - Chr5:15369126-15369145 MsG0580025211.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTTGATGAATGAGATGG+TGG - Chr5:15368081-15368100 MsG0580025211.01.T01:intron 40.0%
ACTAGGATTGTTTGCCTCTT+CGG + Chr5:15369523-15369542 None:intergenic 40.0%
ACTCTGTTGAAACCACCATT+TGG + Chr5:15369278-15369297 None:intergenic 40.0%
ACTTCATTTCCTGAAGCAGA+TGG - Chr5:15368381-15368400 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTCGACACGATGATTAG+AGG - Chr5:15368538-15368557 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAGCAGATGGAGAATAA+AGG - Chr5:15368391-15368410 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
CTTCATGCACTTTGTAGGAA+TGG - Chr5:15368040-15368059 MsG0580025211.01.T01:intron 40.0%
CTTGAAGGAGATATTGAGGA+GGG - Chr5:15369636-15369655 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
CTTTATTCTCCATCTGCTTC+AGG + Chr5:15368393-15368412 None:intergenic 40.0%
CTTTGCTTCATGCACTTTGT+AGG - Chr5:15368035-15368054 MsG0580025211.01.T01:intron 40.0%
GAACCTTGAAGGAGATATTG+AGG - Chr5:15369632-15369651 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
GAACGTATATGTCGAGGATT+TGG - Chr5:15369413-15369432 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
GACTTGGCTTACAAGTTTCA+TGG - Chr5:15367776-15367795 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
GATAAGATGCTTGATGAAGG+TGG - Chr5:15368814-15368833 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
GCATTGAATGTGGATGCAAT+GGG + Chr5:15368949-15368968 None:intergenic 40.0%
GGGCTGTAAGTTTCTGTATT+TGG + Chr5:15369054-15369073 None:intergenic 40.0%
TAAGCAAAATCGTTTCGACG+AGG - Chr5:15368678-15368697 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
TGTCGAAAGTAACGAAGTTC+CGG + Chr5:15368528-15368547 None:intergenic 40.0%
TGTTGTTACAGTGACTAAGG+TGG - Chr5:15368216-15368235 MsG0580025211.01.T01:intron 40.0%
! AGCATTGAATGTGGATGCAA+TGG + Chr5:15368950-15368969 None:intergenic 40.0%
! CGTGGTGATGATTATACGTT+TGG - Chr5:15367905-15367924 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
! GAAAGCTTTGCAGGTCTTTT+TGG - Chr5:15369110-15369129 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
! TATGAAGAGTGTATCCGAAG+AGG - Chr5:15369506-15369525 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAAAGGGGTTTTGTGGAGT+GGG - Chr5:15368343-15368362 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTTTGGAAATGGTCGAGA+AGG - Chr5:15369125-15369144 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
!! GAAACCAAAGATGGCTCTAA+AGG - Chr5:15368616-15368635 MsG0580025211.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCCTTTTGAGACTTGTGAGT+GGG + Chr5:15369456-15369475 None:intergenic 40.0%
AGACCTGCAAAGCTTTCTGA+AGG + Chr5:15369107-15369126 None:intergenic 45.0%
ATGATGAAGAGTGGTGTTCG+TGG - Chr5:15367887-15367906 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
ATGCTTCTGTCAACAGCTCT+AGG + Chr5:15368739-15368758 None:intergenic 45.0%
CACTCACAAGTCTCAAAAGG+AGG - Chr5:15369455-15369474 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
CCTCCTCAATATCTCCTTCA+AGG + Chr5:15369638-15369657 None:intergenic 45.0%
CCTTGAAGGAGATATTGAGG+AGG - Chr5:15369635-15369654 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
CTCTTCATAGCTGCAGATGA+AGG + Chr5:15369495-15369514 None:intergenic 45.0%
CTCTTCATTGCAGCAGTACT+AGG + Chr5:15369540-15369559 None:intergenic 45.0%
CTCTTGCTCATCACTCCTAT+CGG + Chr5:15369610-15369629 None:intergenic 45.0%
CTTTGTAGGAATGGGAAGGT+TGG - Chr5:15368049-15368068 MsG0580025211.01.T01:intron 45.0%
GCAACATGGTAGTATTCGAG+AGG - Chr5:15368882-15368901 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTGGGAAAAGTGAAAGT+TGG - Chr5:15368358-15368377 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
GGTCATCACAGTTCTTGACT+TGG - Chr5:15367760-15367779 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
TAGCTGATGAAGAGACCGAT+AGG - Chr5:15369592-15369611 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGACAGATGGGATCAAC+CGG - Chr5:15368506-15368525 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
TGACCTTCAGAAAGCTTTGC+AGG - Chr5:15369101-15369120 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
TGCACTTTGTAGGAATGGGA+AGG - Chr5:15368045-15368064 MsG0580025211.01.T01:intron 45.0%
TGCTTCTGTCAACAGCTCTA+GGG + Chr5:15368738-15368757 None:intergenic 45.0%
! GCTATCATCACTGGGTTTTG+TGG - Chr5:15368967-15368986 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
! GTTCATGGCTTTTCGCAACA+TGG - Chr5:15368868-15368887 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCACTGGGTTTTGTGGACA+AGG - Chr5:15368973-15368992 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
!! GATAAAGGGGTTTTGTGGAG+TGG - Chr5:15368342-15368361 MsG0580025211.01.T01:CDS 45.0%
!! TAGGAATGGGAAGGTTGGTA+GGG - Chr5:15368054-15368073 MsG0580025211.01.T01:intron 45.0%
!!! CCTTTTGAGACTTGTGAGTG+GGG + Chr5:15369455-15369474 None:intergenic 45.0%
!!! CTCCTTTTGAGACTTGTGAG+TGG + Chr5:15369457-15369476 None:intergenic 45.0%
!!! CTTTTGAGACTTGTGAGTGG+GGG + Chr5:15369454-15369473 None:intergenic 45.0%
CAAAAGGAGGCAGCTATCAC+AGG - Chr5:15369468-15369487 MsG0580025211.01.T01:CDS 50.0%
CCCCACTCACAAGTCTCAAA+AGG - Chr5:15369452-15369471 MsG0580025211.01.T01:CDS 50.0%
CTGGAGAGAGTTGAGAGCTT+GGG - Chr5:15368286-15368305 MsG0580025211.01.T01:intron 50.0%
GAGCAAGAGCAGAACCTTGA+AGG - Chr5:15369621-15369640 MsG0580025211.01.T01:CDS 50.0%
GTTGAGATTCTATGCGACGC+TGG - Chr5:15368238-15368257 MsG0580025211.01.T01:intron 50.0%
TCTGGAGAGAGTTGAGAGCT+TGG - Chr5:15368285-15368304 MsG0580025211.01.T01:intron 50.0%
TGGAGAGAGTTGAGAGCTTG+GGG - Chr5:15368287-15368306 MsG0580025211.01.T01:intron 50.0%
TGGTGCGAACGTATATGTCG+AGG - Chr5:15369407-15369426 MsG0580025211.01.T01:CDS 50.0%
! GTAGGAATGGGAAGGTTGGT+AGG - Chr5:15368053-15368072 MsG0580025211.01.T01:intron 50.0%
!! GTGCCCTTTAGAGCCATCTT+TGG + Chr5:15368623-15368642 None:intergenic 50.0%
AAGAACTGTGATGACCCGCC+TGG + Chr5:15367756-15367775 None:intergenic 55.0%
ATGCGACGCTGGACGTGTAA+CGG - Chr5:15368249-15368268 MsG0580025211.01.T01:intron 55.0%
GAGAGAGTTGAGAGCTTGGG+GGG - Chr5:15368289-15368308 MsG0580025211.01.T01:intron 55.0%
GGAGAGAGTTGAGAGCTTGG+GGG - Chr5:15368288-15368307 MsG0580025211.01.T01:intron 55.0%
!! ACACGGGTTAGCTCCGATTG+AGG + Chr5:15367684-15367703 None:intergenic 55.0%
!! GGGTTAGCTCCGATTGAGGT+AGG + Chr5:15367680-15367699 None:intergenic 55.0%
AACGGAGGCTGCTGAGGTTC+TGG - Chr5:15368267-15368286 MsG0580025211.01.T01:intron 60.0%
CAATTGTCCGGGGACTGTCC+CGG - Chr5:15367720-15367739 MsG0580025211.01.T01:CDS 60.0%
GGGGGGTTCACTTGATGCTG+TGG - Chr5:15368306-15368325 MsG0580025211.01.T01:intron 60.0%
! ACGTGTAACGGAGGCTGCTG+AGG - Chr5:15368261-15368280 MsG0580025211.01.T01:intron 60.0%
! AGACTTGTGAGTGGGGGTGC+TGG + Chr5:15369448-15369467 None:intergenic 60.0%
! TGTCCCGGACTGGAATGACC+AGG - Chr5:15367735-15367754 MsG0580025211.01.T01:CDS 60.0%
!! TGAGATGGTGGACCCGAACG+AGG - Chr5:15368093-15368112 MsG0580025211.01.T01:intron 60.0%
CCCGCCTGGTCATTCCAGTC+CGG + Chr5:15367742-15367761 None:intergenic 65.0%
CCGCCTGGTCATTCCAGTCC+GGG + Chr5:15367741-15367760 None:intergenic 65.0%
CGACGCTGGACGTGTAACGG+AGG - Chr5:15368252-15368271 MsG0580025211.01.T01:intron 65.0%
TTCCAGTCCGGGACAGTCCC+CGG + Chr5:15367730-15367749 None:intergenic 65.0%
! CCCGGACTGGAATGACCAGG+CGG - Chr5:15367738-15367757 MsG0580025211.01.T01:CDS 65.0%
! CCGGACTGGAATGACCAGGC+GGG - Chr5:15367739-15367758 MsG0580025211.01.T01:CDS 65.0%
GTCCGGGGACTGTCCCGGAC+TGG - Chr5:15367725-15367744 MsG0580025211.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 15367674 15369758 15367674 ID=MsG0580025211.01;Name=MsG0580025211.01
Chr5 mRNA 15367674 15369758 15367674 ID=MsG0580025211.01.T01;Parent=MsG0580025211.01;Name=MsG0580025211.01.T01;_AED=0.46;_eAED=0.57;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|603
Chr5 exon 15368310 15369758 15368310 ID=MsG0580025211.01.T01:exon:6234;Parent=MsG0580025211.01.T01
Chr5 exon 15367674 15368036 15367674 ID=MsG0580025211.01.T01:exon:6233;Parent=MsG0580025211.01.T01
Chr5 CDS 15368310 15369758 15368310 ID=MsG0580025211.01.T01:cds;Parent=MsG0580025211.01.T01
Chr5 CDS 15367674 15368036 15367674 ID=MsG0580025211.01.T01:cds;Parent=MsG0580025211.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580025211.01.T01

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Protein sequence

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