AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580025213.01

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MsG0580025213.01.T01 AT4G20090 28.025 471 305 8 43 482 184 651 2.20e-50 183
MsG0580025213.01.T01 AT4G20090 26.113 494 343 8 11 487 112 600 6.10e-49 179
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MsG0580025213.01.T01 AT4G19440 25.792 442 316 5 76 509 268 705 5.24e-42 161
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MsG0580025213.01.T01 AT4G19440 27.119 354 247 4 87 434 489 837 5.26e-35 140
MsG0580025213.01.T01 AT4G19440 23.183 509 305 10 6 469 338 805 3.27e-32 132
MsG0580025213.01.T01 AT4G19440 28.740 254 176 2 58 307 566 818 1.40e-26 114
MsG0580025213.01.T01 AT4G19440 24.433 397 257 6 151 507 205 598 6.03e-25 109
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MsG0580025213.01.T01 AT5G61990 27.989 368 243 4 148 511 152 501 3.42e-34 138
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MsG0580025213.01.T01 AT5G61990 22.029 345 183 6 6 265 620 963 9.12e-14 74.7
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MsG0580025213.01.T01 AT3G07290 23.670 545 350 10 6 489 296 835 5.98e-40 155
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MsG0580025213.01.T01 AT1G31840 24.950 505 369 5 6 503 316 817 1.83e-43 165
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MsG0580025213.01.T01 AT1G30290 24.729 461 331 5 58 507 184 639 1.23e-42 162
MsG0580025213.01.T01 AT1G30290 25.287 435 272 8 4 392 340 767 1.65e-31 129
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MsG0580025213.01.T01 AT4G26800 25.392 319 199 2 207 523 3 284 8.49e-28 115
MsG0580025213.01.T01 AT4G26800 22.941 170 131 0 355 524 11 180 5.57e-11 64.7
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MsG0580025213.01.T01 AT5G04810 19.892 372 290 3 137 504 299 666 5.78e-24 106
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MsG0580025213.01.T01 AT4G26800 23.404 188 139 1 342 524 63 250 8.98e-12 67.8
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MsG0580025213.01.T01 AT2G36240 24.013 304 225 3 5 303 187 489 8.79e-23 102
MsG0580025213.01.T01 AT2G36240 22.321 336 218 3 114 443 191 489 2.65e-20 94.4
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MsG0580025213.01.T01 AT1G03560 23.667 469 324 8 43 492 149 602 1.80e-33 135
MsG0580025213.01.T01 AT1G03560 24.311 399 253 9 16 368 262 657 3.91e-25 110
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MsG0580025213.01.T01 AT1G74850 22.188 329 218 4 180 506 139 431 2.26e-22 101
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MsG0580025213.01.T01 AT5G57250 24.944 449 270 11 64 455 466 904 1.29e-27 118
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MsG0580025213.01.T01 AT5G57250 22.378 286 185 4 236 518 117 368 2.17e-15 80.1
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MsG0580025213.01.T01 AT3G16890 20.178 337 254 5 190 515 146 478 6.82e-17 84.3
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MsG0580025213.01.T01 AT5G11310 19.207 328 247 7 212 521 130 457 2.00e-15 79.7
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MsG0580025213.01.T01 AT1G73710 24.123 456 302 11 86 508 117 561 6.96e-21 97.4
MsG0580025213.01.T01 AT1G73710 22.302 417 314 5 83 492 307 720 1.14e-20 96.7
MsG0580025213.01.T01 AT1G73710 20.339 531 341 10 43 496 372 897 3.90e-17 85.5
MsG0580025213.01.T01 AT1G73710 21.097 474 335 11 51 503 484 939 3.96e-17 85.5
MsG0580025213.01.T01 AT5G38730 26.722 363 261 3 143 503 164 523 3.28e-34 136
MsG0580025213.01.T01 AT5G38730 23.971 413 272 5 101 508 188 563 2.15e-31 128
MsG0580025213.01.T01 AT5G38730 23.704 405 302 3 4 403 161 563 1.37e-30 126
MsG0580025213.01.T01 AT5G38730 26.794 209 148 4 301 507 147 352 1.92e-13 73.6
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MsG0580025213.01.T01 AT5G08310 27.632 380 260 5 80 453 438 808 1.68e-31 129
MsG0580025213.01.T01 AT5G08310 22.510 502 319 10 44 513 62 525 9.69e-26 112
MsG0580025213.01.T01 AT5G08310 24.272 515 360 9 11 500 248 757 4.70e-34 137
MsG0580025213.01.T01 AT5G08310 27.632 380 260 5 80 453 438 808 1.68e-31 129
MsG0580025213.01.T01 AT5G08310 22.510 502 319 10 44 513 62 525 9.69e-26 112
MsG0580025213.01.T01 AT2G31400 24.368 435 295 9 14 418 271 701 5.60e-34 137
MsG0580025213.01.T01 AT2G31400 25.067 375 258 9 82 444 269 632 7.31e-27 115
MsG0580025213.01.T01 AT2G31400 24.090 357 262 5 153 504 239 591 1.64e-25 111
MsG0580025213.01.T01 AT2G31400 24.706 340 251 4 185 521 236 573 1.06e-22 102
MsG0580025213.01.T01 AT2G31400 24.368 435 295 9 14 418 271 701 8.94e-34 136
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MsG0580025213.01.T01 AT2G41720 23.666 431 314 7 101 523 130 553 4.08e-26 113
MsG0580025213.01.T01 AT2G41720 21.470 517 383 12 14 515 110 618 1.42e-23 105
MsG0580025213.01.T01 AT2G37230 20.751 506 369 11 1 485 176 670 7.48e-28 118
MsG0580025213.01.T01 AT2G37230 21.730 474 341 10 72 523 176 641 8.69e-25 109
MsG0580025213.01.T01 AT2G37230 22.016 377 246 5 130 493 164 505 1.49e-22 102
MsG0580025213.01.T01 AT2G37230 21.184 321 240 5 181 494 149 463 2.77e-13 73.2
MsG0580025213.01.T01 AT2G37230 23.024 291 184 5 218 507 119 370 5.71e-13 72.0
MsG0580025213.01.T01 AT2G41720 22.244 508 377 10 9 504 281 782 9.34e-28 118
MsG0580025213.01.T01 AT2G41720 23.666 431 314 7 101 523 130 553 4.94e-26 113
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MsG0580025213.01.T01 AT4G01030 22.375 581 363 15 15 513 7 581 3.20e-25 110
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MsG0580025213.01.T01 AT1G20300 20.690 348 258 6 83 419 188 528 6.28e-21 96.7
MsG0580025213.01.T01 AT1G20300 22.150 307 231 4 195 496 161 464 2.76e-20 94.7
MsG0580025213.01.T01 AT1G20300 20.906 287 222 2 220 504 154 437 1.91e-19 92.0
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MsG0580025213.01.T01 AT1G53330 25.767 326 234 3 69 388 36 359 4.27e-25 107
MsG0580025213.01.T01 AT1G53330 25.150 334 237 7 197 524 26 352 4.78e-23 101
MsG0580025213.01.T01 AT1G53330 20.213 282 184 5 6 282 114 359 1.48e-11 66.6
MsG0580025213.01.T01 AT2G35130 21.600 375 289 3 144 515 152 524 1.07e-24 108
MsG0580025213.01.T01 AT2G35130 20.952 420 323 4 106 518 145 562 3.18e-24 107
MsG0580025213.01.T01 AT2G35130 21.163 430 322 8 44 460 153 578 4.03e-20 94.4
MsG0580025213.01.T01 AT2G44880 23.611 432 260 13 67 488 64 435 3.40e-24 106
MsG0580025213.01.T01 AT3G22670 25.201 373 199 11 184 515 205 538 3.80e-24 106
MsG0580025213.01.T01 AT3G22670 26.296 270 193 4 239 504 153 420 8.08e-24 105
MsG0580025213.01.T01 AT3G22670 24.684 316 229 5 83 390 205 519 2.55e-23 103
MsG0580025213.01.T01 AT3G22670 22.541 244 181 4 249 488 200 439 3.18e-15 79.0
MsG0580025213.01.T01 AT2G44880 23.611 432 260 13 67 488 105 476 4.99e-24 106
MsG0580025213.01.T01 AT2G44880 23.611 432 260 13 67 488 105 476 4.99e-24 106
MsG0580025213.01.T01 AT1G80550 22.034 413 274 7 92 495 56 429 5.30e-24 105
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MsG0580025213.01.T01 AT4G32430 23.204 543 319 21 44 512 140 658 1.77e-16 83.2
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MsG0580025213.01.T01 AT1G05750 21.792 413 263 10 109 512 29 390 1.94e-16 82.4
MsG0580025213.01.T01 AT1G05750 22.000 250 190 2 101 350 125 369 1.82e-11 67.0
MsG0580025213.01.T01 AT1G10270 19.533 471 312 11 46 493 146 572 3.87e-16 82.4
MsG0580025213.01.T01 AT4G32430 23.417 521 303 20 67 512 27 526 4.79e-16 81.6
MsG0580025213.01.T01 AT5G46460 21.705 387 267 13 124 505 45 400 4.91e-16 81.6
MsG0580025213.01.T01 AT5G02830 20.711 478 333 11 11 473 232 678 5.15e-16 82.0
MsG0580025213.01.T01 AT5G02830 23.821 403 222 11 61 411 351 720 1.33e-15 80.5
MsG0580025213.01.T01 AT5G02830 23.429 350 215 15 162 496 282 593 5.18e-15 78.6
MsG0580025213.01.T01 AT5G02830 23.734 316 209 11 14 305 377 684 1.11e-12 71.2
MsG0580025213.01.T01 AT4G33990 22.022 445 314 10 72 508 144 563 6.98e-16 81.3
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MsG0580025213.01.T01 AT5G10690 27.313 227 144 8 21 227 52 277 1.20e-12 70.9
MsG0580025213.01.T01 AT5G10690 25.676 222 143 6 115 317 76 294 7.55e-12 68.2
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MsG0580025213.01.T01 AT1G56570 21.569 306 221 6 70 369 202 494 1.09e-12 70.9
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MsG0580025213.01.T01 AT5G27270 19.757 577 380 11 5 507 12 579 2.66e-12 70.1
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MsG0580025213.01.T01 AT4G18840 20.909 440 311 14 60 488 54 467 2.28e-13 73.2
MsG0580025213.01.T01 AT5G13230 22.166 397 251 12 122 512 288 632 2.54e-13 73.2
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MsG0580025213.01.T01 AT3G22150 20.417 480 312 13 45 510 281 704 4.84e-13 72.4
MsG0580025213.01.T01 AT2G37310 20.930 430 305 11 80 504 143 542 5.69e-13 72.0
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MsG0580025213.01.T01 AT2G40720 24.016 254 184 3 111 364 506 750 7.52e-13 71.6
MsG0580025213.01.T01 AT1G06140 22.697 304 192 5 84 350 178 475 7.56e-13 71.2
MsG0580025213.01.T01 AT3G15930 19.841 504 321 13 44 512 97 552 8.54e-13 71.6
MsG0580025213.01.T01 AT3G02330 22.000 300 208 4 71 350 473 766 8.68e-13 71.6
MsG0580025213.01.T01 AT3G56550 18.780 410 280 12 110 513 31 393 1.17e-12 70.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G56550 18.780 410 280 12 110 513 31 393 1.17e-12 70.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 20.038 529 376 11 7 493 106 629 1.45e-12 70.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 23.077 234 167 3 109 331 409 640 4.19e-12 69.3
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 21.839 348 235 10 200 514 202 545 4.82e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 20.038 529 376 11 7 493 106 629 1.45e-12 70.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 23.077 234 167 3 109 331 409 640 4.19e-12 69.3
MsG0580025213.01.T01 AT3G46610 21.839 348 235 10 200 514 202 545 4.82e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT2G27800 22.831 219 153 3 115 317 206 424 2.20e-12 69.7
MsG0580025213.01.T01 AT2G27800 26.490 151 105 3 61 206 269 418 8.26e-11 64.7
MsG0580025213.01.T01 AT5G61370 24.576 236 132 4 87 311 214 414 2.23e-12 69.7
MsG0580025213.01.T01 AT5G61370 20.745 376 256 6 160 515 55 408 4.61e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT5G27270 19.584 577 381 11 5 507 217 784 2.65e-12 70.1
MsG0580025213.01.T01 AT5G27270 25.604 207 149 2 121 322 675 881 6.25e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT5G27270 19.584 577 381 11 5 507 217 784 2.68e-12 70.1
MsG0580025213.01.T01 AT5G59600 25.874 286 169 9 255 504 186 464 2.95e-12 69.3
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 25.806 155 110 2 341 493 116 267 3.79e-12 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 26.812 138 98 1 178 315 130 264 8.35e-12 66.6
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 25.806 155 110 2 341 493 116 267 3.79e-12 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 26.812 138 98 1 178 315 130 264 8.35e-12 66.6
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 25.806 155 110 2 341 493 116 267 3.79e-12 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT4G38150 26.812 138 98 1 178 315 130 264 8.35e-12 66.6
MsG0580025213.01.T01 AT2G46050 20.301 399 274 6 110 508 65 419 4.69e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G47840 21.277 517 309 19 67 506 94 589 4.87e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT3G50420 22.034 472 272 16 115 508 162 615 5.11e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT2G01390 26.772 127 93 0 371 497 136 262 5.44e-12 68.6
MsG0580025213.01.T01 AT4G21170 21.591 264 187 5 50 297 325 584 5.60e-12 68.6
MsG0580025213.01.T01 AT5G67570 23.034 356 221 6 177 514 286 606 5.73e-12 68.9
MsG0580025213.01.T01 AT2G18520 24.444 270 184 8 11 269 102 362 6.57e-12 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT2G18520 23.228 254 173 6 113 355 133 375 4.24e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT3G53170 22.105 285 201 6 44 311 177 457 7.19e-12 68.2
MsG0580025213.01.T01 AT3G53170 23.762 303 215 6 180 469 142 441 6.06e-11 65.1
MsG0580025213.01.T01 AT5G52630 22.727 352 216 11 166 512 100 400 7.70e-12 68.2
MsG0580025213.01.T01 AT2G33760 22.899 345 242 8 20 350 38 372 8.28e-12 68.2
MsG0580025213.01.T01 AT3G60040 32.143 112 76 0 381 492 494 605 9.71e-12 68.2
MsG0580025213.01.T01 AT3G60040 30.645 124 84 1 201 324 489 610 8.96e-11 65.1
MsG0580025213.01.T01 AT2G02750 21.074 242 184 3 113 350 295 533 1.20e-11 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT2G02750 20.099 403 260 8 144 504 28 410 5.51e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT3G60040 32.143 112 76 0 381 492 713 824 1.22e-11 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT3G60040 32.143 112 76 0 381 492 714 825 1.24e-11 67.8
MsG0580025213.01.T01 AT3G01580 21.277 517 324 16 45 488 24 530 1.65e-11 67.4
MsG0580025213.01.T01 AT5G04780 20.430 279 217 2 72 350 153 426 1.73e-11 67.4
MsG0580025213.01.T01 AT5G13770 20.588 306 204 5 212 517 247 513 2.22e-11 67.0
MsG0580025213.01.T01 AT2G40240 26.108 203 132 5 149 343 109 301 2.69e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT1G12615 31.724 145 95 2 208 350 1 143 3.09e-11 62.4
MsG0580025213.01.T01 AT4G14190 23.936 188 136 4 310 493 84 268 3.98e-11 65.9
MsG0580025213.01.T01 AT4G04370 21.514 502 341 15 6 487 142 610 4.10e-11 66.2
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 22.137 131 101 1 368 497 208 338 5.91e-11 64.7
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 30.556 144 95 2 153 295 203 342 7.33e-11 64.3
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 22.137 131 101 1 368 497 208 338 5.91e-11 64.7
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 30.556 144 95 2 153 295 203 342 7.33e-11 64.3
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 22.137 131 101 1 368 497 208 338 5.91e-11 64.7
MsG0580025213.01.T01 AT5G03560 30.556 144 95 2 153 295 203 342 7.33e-11 64.3
MsG0580025213.01.T01 AT1G74600 21.896 443 270 16 96 490 200 614 6.10e-11 65.9
MsG0580025213.01.T01 AT2G42920 19.465 411 302 12 13 413 91 482 6.46e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT2G42920 19.465 411 302 12 13 413 91 482 6.46e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT1G71490 22.192 365 230 12 146 504 108 424 6.54e-11 65.5
MsG0580025213.01.T01 AT5G03800 22.028 286 205 7 213 493 141 413 8.27e-11 65.5

Find 121 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 135 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAAAGCTTTGCAGGTCTTTC+TGG 0.094357 5:-15378646 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGAAAGTGCCTTAAAGTTTA+TGG 0.097189 5:-15378754 MsG0580025213.01.T01:CDS
AATATCTTCCATAAACTTTA+AGG 0.140740 5:+15378746 None:intergenic
TCCTTCCTGACCAATTTATT+TGG 0.151856 5:-15378605 MsG0580025213.01.T01:CDS
GGGCTGTAAGTTTCTGTATT+TGG 0.206458 5:+15378705 None:intergenic
ACTTACAATATACTGATATA+TGG 0.246029 5:-15379323 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTATTGTAAGGAAGAGAATT+TGG 0.270249 5:-15379615 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTTATTCTCCATCTGCTTC+AGG 0.277521 5:+15379366 None:intergenic
GGCTTACAATACATTGATAA+AGG 0.280697 5:-15379429 MsG0580025213.01.T01:CDS
GTTTATAACTCTCTTGTTCA+TGG 0.283270 5:-15378903 MsG0580025213.01.T01:CDS
GTATTATAAATGACAGTATT+TGG 0.286818 5:+15379743 None:intergenic
TTGCAGCTTATTAAGAATAA+TGG 0.289372 5:-15379773 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTTGCTTCATGCACTTTGT+AGG 0.292325 5:-15379721 MsG0580025213.01.T01:CDS
ACAGTGATTTCCAAATAAAT+TGG 0.302344 5:+15378595 None:intergenic
GTGCCCTTTAGAGCCTTCTT+TGG 0.318925 5:+15379136 None:intergenic
CGTGGTGATGATTATACGTT+TGG 0.327852 5:-15379851 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGACCTTCAGAAAGCTTTGC+AGG 0.331404 5:-15378655 MsG0580025213.01.T01:CDS
GACTTGGCTTACAAGTTTCA+TGG 0.332869 5:-15379980 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTGAGAGAGTTGAGAGCTT+GGG 0.343142 5:-15379470 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATATTAAACGTAACCTCATT+CGG 0.358797 5:+15379650 None:intergenic
ACTTTCGACACGATGATTAG+AGG 0.367654 5:-15379218 MsG0580025213.01.T01:CDS
GCTTACAATACATTGATAAA+GGG 0.373145 5:-15379428 MsG0580025213.01.T01:CDS
CCATATATTATGCTATTATA+AGG 0.374742 5:+15379107 None:intergenic
AGGGACTTTGTTTAACGAAT+AGG 0.376461 5:-15379817 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGTGAAAGAGGATATTGATA+TGG 0.377654 5:-15379915 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGAGTCTAGAATGTTGGATT+TGG 0.385389 5:-15379294 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTACAATATACTGATATAT+GGG 0.400931 5:-15379322 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTTGATATCTGCTTATTGTA+AGG 0.413293 5:-15379627 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTCATGCACTTTGTAGGAA+TGG 0.423463 5:-15379716 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTGAAGCAGATGGAGAATAA+AGG 0.428651 5:-15379365 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTTGCAGGTCTTTCTGGAAA+TGG 0.430748 5:-15378640 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATGCTTCTGTCAACAGCTCT+AGG 0.432837 5:+15379020 None:intergenic
TATTAAACGTAACCTCATTC+GGG 0.447420 5:+15379651 None:intergenic
CCCGCCTGGTCATTCCAGTC+CGG 0.448414 5:+15380017 None:intergenic
CCTTATAATAGCATAATATA+TGG 0.449938 5:-15379107 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTCATGCACTTTGTAGGAAT+GGG 0.452595 5:-15379715 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATATTGTAAGTATCCACATT+TGG 0.453472 5:+15379335 None:intergenic
ATATCTTCATAACAATTGTC+CGG 0.455926 5:-15380048 MsG0580025213.01.T01:CDS
GAAACCAAAGAAGGCTCTAA+AGG 0.457036 5:-15379140 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTTGGATGTTCTTGTGAAAG+AGG 0.461284 5:-15379927 MsG0580025213.01.T01:CDS
GACGAAATGCCTACCTCAAT+CGG 0.462893 5:-15380088 None:intergenic
ATCTGAGTTTCTATCAAAGA+TGG 0.466433 5:-15379054 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTCCAGTCCGGGACAGTCCC+CGG 0.467880 5:+15380029 None:intergenic
GTAGGAATGGGAAGGTTGGT+AGG 0.469352 5:-15379703 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGTCGAAAGTAACAAAGTTC+CGG 0.475738 5:+15379231 None:intergenic
TGATGTTGTTACTGTGACTA+AGG 0.476549 5:-15379543 MsG0580025213.01.T01:CDS
GGTCATCACAGTTCTTGACT+TGG 0.477193 5:-15379996 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTTAATGATATGAAGACAGA+TGG 0.486370 5:-15379260 MsG0580025213.01.T01:CDS
ACATAGATTATTTACTCTAG+TGG 0.491738 5:-15378527 None:intergenic
GATTTCCAAATAAATTGGTC+AGG 0.491956 5:+15378600 None:intergenic
CTTTGTTTAACGAATAGGAT+TGG 0.492594 5:-15379812 MsG0580025213.01.T01:CDS
GTCCGGGGACTGTCCCGGAC+TGG 0.493104 5:-15380031 MsG0580025213.01.T01:CDS
GTGGTGATGATTATACGTTT+GGG 0.494322 5:-15379850 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGAAGACAGATGGGATCAAC+CGG 0.495644 5:-15379250 MsG0580025213.01.T01:CDS
GCTTGAGAGAGTTGAGAGCT+TGG 0.501503 5:-15379471 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATTAGAGGTTTGTGTTCAGA+AGG 0.501831 5:-15379203 MsG0580025213.01.T01:CDS
TACATAACACATCAATCAAA+GGG 0.503084 5:+15378685 None:intergenic
TCCAAATAAATTGGTCAGGA+AGG 0.504206 5:+15378604 None:intergenic
AAACCAAAGAAGGCTCTAAA+GGG 0.508090 5:-15379139 MsG0580025213.01.T01:CDS
TACCTCAATCGGAGCTAACC+CGG 0.508152 5:-15380077 MsG0580025213.01.T01:CDS
GAGTTATAAACTAGAATACT+TGG 0.508299 5:+15378915 None:intergenic
TGATAAGCTCAACGGCCTCT+CGG 0.512249 5:+15378859 None:intergenic
CTACATAACACATCAATCAA+AGG 0.515987 5:+15378684 None:intergenic
TTAGTCACAGTAACAACATC+AGG 0.521294 5:+15379545 None:intergenic
ATGGGAAGGTTGGTAGGGCT+AGG 0.521628 5:-15379697 MsG0580025213.01.T01:CDS
TATCTTCATAACAATTGTCC+GGG 0.523229 5:-15380047 MsG0580025213.01.T01:CDS
TCAGAAGGAAGAATTGAAGA+TGG 0.524938 5:-15379188 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTGAGAGAGTTGAGAGCTTG+GGG 0.527917 5:-15379469 MsG0580025213.01.T01:CDS
CCGCCTGGTCATTCCAGTCC+GGG 0.528102 5:+15380018 None:intergenic
TAGGAATGGGAAGGTTGGTA+GGG 0.529793 5:-15379702 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTTCTGGAAATGGTAGAGA+AGG 0.533401 5:-15378631 MsG0580025213.01.T01:CDS
ACTTCATTTCCTGAAGCAGA+TGG 0.534343 5:-15379375 MsG0580025213.01.T01:CDS
CCGTGTAACGGAGGCTGCAG+AGG 0.535821 5:-15379495 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATGGAAGATATTACTGCAAG+AGG 0.537680 5:-15378735 MsG0580025213.01.T01:CDS
ACCCGGGTTAGCTCCGATTG+AGG 0.538172 5:+15380075 None:intergenic
CTAGAGTAAATAATCTATGT+TGG 0.541671 5:+15378530 None:intergenic
CTTTGTAGGAATGGGAAGGT+TGG 0.544470 5:-15379707 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATGCAATGCTGGCCGTGTAA+CGG 0.547752 5:-15379507 MsG0580025213.01.T01:CDS
AGCATTGAATGTGGATGCAA+TGG 0.551763 5:+15378809 None:intergenic
GAGAGAGTTGAGAGCTTGGG+GGG 0.551878 5:-15379467 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTTGATTGATGTGTTATGT+AGG 0.553334 5:-15378683 MsG0580025213.01.T01:CDS
GGAGTGGGAAAAGTGAAAGT+TGG 0.554220 5:-15379398 MsG0580025213.01.T01:CDS
CATTTCATTGATAAGCTCAA+CGG 0.554620 5:+15378851 None:intergenic
GATTGATGTGTTATGTAGGA+AGG 0.561613 5:-15378679 MsG0580025213.01.T01:CDS
AGAAAGAGTATGATGGAGAG+TGG 0.568059 5:-15379878 MsG0580025213.01.T01:CDS
CAATTGTCCGGGGACTGTCC+CGG 0.568814 5:-15380036 MsG0580025213.01.T01:CDS
CTTACAATACATTGATAAAG+GGG 0.569220 5:-15379427 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATGATGGAGAGTGGTGTTCG+TGG 0.569482 5:-15379869 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGCACTTTGTAGGAATGGGA+AGG 0.574117 5:-15379711 MsG0580025213.01.T01:CDS
TCTGAGTTTCTATCAAAGAT+GGG 0.576049 5:-15379053 MsG0580025213.01.T01:CDS
TAAAGGCTATCTTCCAAATG+TGG 0.580097 5:-15379348 MsG0580025213.01.T01:CDS
GGGTTAGCTCCGATTGAGGT+AGG 0.586010 5:+15380079 None:intergenic
TTAATGATATGAAGACAGAT+GGG 0.589797 5:-15379259 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTAACGAATAGGATTGGTGA+AGG 0.590395 5:-15379806 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATTATACAGAAATGCAAGGA+AGG 0.591536 5:-15378993 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGCTTCTGTCAACAGCTCTA+GGG 0.592973 5:+15379021 None:intergenic
AGACCTGCAAAGCTTTCTGA+AGG 0.594638 5:+15378652 None:intergenic
TGTTGTTACTGTGACTAAGG+TGG 0.597816 5:-15379540 MsG0580025213.01.T01:CDS
ACCTCAATCGGAGCTAACCC+GGG 0.598370 5:-15380076 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTAATGGAGGAAACCAAAGA+AGG 0.602995 5:-15379149 MsG0580025213.01.T01:CDS
TATGATAAGATGATTGATGA+AGG 0.611522 5:-15378945 MsG0580025213.01.T01:CDS
GTTGAGATTCTATGCAATGC+TGG 0.613348 5:-15379518 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGAGAGAGTTGAGAGCTTGG+GGG 0.616780 5:-15379468 MsG0580025213.01.T01:CDS
CCTCTGCAGCCTCCGTTACA+CGG 0.618393 5:+15379495 None:intergenic
GACTATTATACAGAAATGCA+AGG 0.619471 5:-15378997 MsG0580025213.01.T01:CDS
GCATTGAATGTGGATGCAAT+GGG 0.621516 5:+15378810 None:intergenic
TGAGATGGTGGACCCGAATG+AGG 0.625731 5:-15379663 MsG0580025213.01.T01:CDS
AAGAACTGTGATGACCCGCC+TGG 0.627967 5:+15380003 None:intergenic
GTTATGAAGATATCTTCACC+CGG 0.628223 5:+15380058 None:intergenic
CCCGGACTGGAATGACCAGG+CGG 0.635672 5:-15380018 MsG0580025213.01.T01:CDS
CCGGACTGGAATGACCAGGC+GGG 0.635844 5:-15380017 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTTCTGGAAATGGTAGAGAA+GGG 0.636712 5:-15378630 MsG0580025213.01.T01:CDS
TGTCCCGGACTGGAATGACC+AGG 0.641533 5:-15380021 MsG0580025213.01.T01:CDS
GAGCTTGATGAATGAGATGG+TGG 0.663260 5:-15379675 MsG0580025213.01.T01:CDS
CAATGCTGGCCGTGTAACGG+AGG 0.666774 5:-15379504 MsG0580025213.01.T01:CDS
AGTGATGATAGCATTGAATG+TGG 0.678228 5:+15378800 None:intergenic
TAGGAGCTTGATGAATGAGA+TGG 0.684427 5:-15379678 MsG0580025213.01.T01:CDS
ATCTTCATAACAATTGTCCG+GGG 0.687849 5:-15380046 MsG0580025213.01.T01:CDS
TTATGAAGATATCTTCACCC+GGG 0.689024 5:+15380059 None:intergenic
GATAAGATGATTGATGAAGG+TGG 0.695783 5:-15378942 MsG0580025213.01.T01:CDS
GCAACACGCTAGTATCCGAG+AGG 0.751015 5:-15378874 MsG0580025213.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATATCTTCCATAAACTTTA+AGG + Chr5:15379869-15379888 None:intergenic 20.0%
!! ACTTACAATATACTGATATA+TGG - Chr5:15379289-15379308 MsG0580025213.01.T01:CDS 20.0%
!! CCATATATTATGCTATTATA+AGG + Chr5:15379508-15379527 None:intergenic 20.0%
!! CCTTATAATAGCATAATATA+TGG - Chr5:15379505-15379524 MsG0580025213.01.T01:CDS 20.0%
!! CTTACAATATACTGATATAT+GGG - Chr5:15379290-15379309 MsG0580025213.01.T01:CDS 20.0%
!! GTATTATAAATGACAGTATT+TGG + Chr5:15378872-15378891 None:intergenic 20.0%
!!! GAAGATTTTTAACTCAATTT+TGG - Chr5:15378667-15378686 MsG0580025213.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTCAATTTTGGAGTTAA+TGG - Chr5:15379447-15379466 MsG0580025213.01.T01:CDS 20.0%
! ACAGTGATTTCCAAATAAAT+TGG + Chr5:15380020-15380039 None:intergenic 25.0%
! ATATCTTCATAACAATTGTC+CGG - Chr5:15378564-15378583 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTAAACGTAACCTCATT+CGG + Chr5:15378965-15378984 None:intergenic 25.0%
! ATATTGTAAGTATCCACATT+TGG + Chr5:15379280-15379299 None:intergenic 25.0%
! CTAGAGTAAATAATCTATGT+TGG + Chr5:15380085-15380104 None:intergenic 25.0%
! CTTACAATACATTGATAAAG+GGG - Chr5:15379185-15379204 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTTAAAAATCTTCAAAGA+CGG + Chr5:15378662-15378681 None:intergenic 25.0%
! GAGTTATAAACTAGAATACT+TGG + Chr5:15379700-15379719 None:intergenic 25.0%
! GCTTACAATACATTGATAAA+GGG - Chr5:15379184-15379203 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TACATAACACATCAATCAAA+GGG + Chr5:15379930-15379949 None:intergenic 25.0%
! TATGATAAGATGATTGATGA+AGG - Chr5:15379667-15379686 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TTAATGATATGAAGACAGAT+GGG - Chr5:15379353-15379372 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTGTAAGGAAGAGAATT+TGG - Chr5:15378997-15379016 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TTGCAGCTTATTAAGAATAA+TGG - Chr5:15378839-15378858 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAATGATATGAAGACAGA+TGG - Chr5:15379352-15379371 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGATATCTGCTTATTGTA+AGG - Chr5:15378985-15379004 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTTATAGAAAGAGTATGA+TGG - Chr5:15378727-15378746 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAAGATGGTTTTTCAATTT+TGG - Chr5:15379438-15379457 MsG0580025213.01.T01:CDS 25.0%
ATCTGAGTTTCTATCAAAGA+TGG - Chr5:15379558-15379577 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
ATTATACAGAAATGCAAGGA+AGG - Chr5:15379619-15379638 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATTGATAAGCTCAA+CGG + Chr5:15379764-15379783 None:intergenic 30.0%
CTACATAACACATCAATCAA+AGG + Chr5:15379931-15379950 None:intergenic 30.0%
CTTTGATTGATGTGTTATGT+AGG - Chr5:15379929-15379948 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
GACTATTATACAGAAATGCA+AGG - Chr5:15379615-15379634 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
GATTTCCAAATAAATTGGTC+AGG + Chr5:15380015-15380034 None:intergenic 30.0%
GGCTTACAATACATTGATAA+AGG - Chr5:15379183-15379202 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
GTTTATAACTCTCTTGTTCA+TGG - Chr5:15379709-15379728 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
TATCTTCATAACAATTGTCC+GGG - Chr5:15378565-15378584 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
TATTAAACGTAACCTCATTC+GGG + Chr5:15378964-15378983 None:intergenic 30.0%
TCTGAGTTTCTATCAAAGAT+GGG - Chr5:15379559-15379578 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
TGTGAAAGAGGATATTGATA+TGG - Chr5:15378697-15378716 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTGTTTAACGAATAGGAT+TGG - Chr5:15378800-15378819 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAAAGTGCCTTAAAGTTTA+TGG - Chr5:15379858-15379877 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCAATTTTGGAGTTAATGG+AGG - Chr5:15379450-15379469 MsG0580025213.01.T01:CDS 30.0%
ATCTTCATAACAATTGTCCG+GGG - Chr5:15378566-15378585 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAAGATATTACTGCAAG+AGG - Chr5:15379877-15379896 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGAGGTTTGTGTTCAGA+AGG - Chr5:15379409-15379428 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
GATAAGATGATTGATGAAGG+TGG - Chr5:15379670-15379689 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
GATTGATGTGTTATGTAGGA+AGG - Chr5:15379933-15379952 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
GTTATGAAGATATCTTCACC+CGG + Chr5:15378557-15378576 None:intergenic 35.0%
TAAAGGCTATCTTCCAAATG+TGG - Chr5:15379264-15379283 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TCAGAAGGAAGAATTGAAGA+TGG - Chr5:15379424-15379443 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAATAAATTGGTCAGGA+AGG + Chr5:15380011-15380030 None:intergenic 35.0%
TCCTTCCTGACCAATTTATT+TGG - Chr5:15380007-15380026 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TGATGTTGTTACTGTGACTA+AGG - Chr5:15379069-15379088 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TGTCGAAAGTAACAAAGTTC+CGG + Chr5:15379384-15379403 None:intergenic 35.0%
TTAATGGAGGAAACCAAAGA+AGG - Chr5:15379463-15379482 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTCACAGTAACAACATC+AGG + Chr5:15379070-15379089 None:intergenic 35.0%
TTATGAAGATATCTTCACCC+GGG + Chr5:15378556-15378575 None:intergenic 35.0%
TTCATGCACTTTGTAGGAAT+GGG - Chr5:15378897-15378916 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATGTTCTTGTGAAAG+AGG - Chr5:15378685-15378704 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTGATAAAGGGGTTTTG+TGG - Chr5:15379193-15379212 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGACTTTGTTTAACGAAT+AGG - Chr5:15378795-15378814 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! AGTGATGATAGCATTGAATG+TGG + Chr5:15379815-15379834 None:intergenic 35.0%
! ATCACTGAATTTTGTGGACA+AGG - Chr5:15379829-15379848 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! GCTATCATCACTGAATTTTG+TGG - Chr5:15379823-15379842 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! GTGGTGATGATTATACGTTT+GGG - Chr5:15378762-15378781 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! TGAGTCTAGAATGTTGGATT+TGG - Chr5:15379318-15379337 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! TTAACGAATAGGATTGGTGA+AGG - Chr5:15378806-15378825 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCTGGAAATGGTAGAGAA+GGG - Chr5:15379982-15380001 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
!! AAACCAAAGAAGGCTCTAAA+GGG - Chr5:15379473-15379492 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
!! ACGTTTGGGATTTTGATGAA+GGG - Chr5:15378776-15378795 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTGTGAGTCTAGAATGT+TGG - Chr5:15379312-15379331 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAGCAAAATCGTTTTGACG+AGG - Chr5:15379534-15379553 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
!! TACGTTTGGGATTTTGATGA+AGG - Chr5:15378775-15378794 MsG0580025213.01.T01:CDS 35.0%
ACTTCATTTCCTGAAGCAGA+TGG - Chr5:15379237-15379256 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTCGACACGATGATTAG+AGG - Chr5:15379394-15379413 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAGCAGATGGAGAATAA+AGG - Chr5:15379247-15379266 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
CTTCATGCACTTTGTAGGAA+TGG - Chr5:15378896-15378915 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
CTTTATTCTCCATCTGCTTC+AGG + Chr5:15379249-15379268 None:intergenic 40.0%
CTTTGCTTCATGCACTTTGT+AGG - Chr5:15378891-15378910 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
GACTTGGCTTACAAGTTTCA+TGG - Chr5:15378632-15378651 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
GCATTGAATGTGGATGCAAT+GGG + Chr5:15379805-15379824 None:intergenic 40.0%
GGGCTGTAAGTTTCTGTATT+TGG + Chr5:15379910-15379929 None:intergenic 40.0%
GTTGAGATTCTATGCAATGC+TGG - Chr5:15379094-15379113 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
TAGGAGCTTGATGAATGAGA+TGG - Chr5:15378934-15378953 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGTTACTGTGACTAAGG+TGG - Chr5:15379072-15379091 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAAGAGTATGATGGAGAG+TGG - Chr5:15378734-15378753 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
! AGCATTGAATGTGGATGCAA+TGG + Chr5:15379806-15379825 None:intergenic 40.0%
! CGTGGTGATGATTATACGTT+TGG - Chr5:15378761-15378780 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTCTGGAAATGGTAGAGA+AGG - Chr5:15379981-15380000 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
! GAAACCAAAGAAGGCTCTAA+AGG - Chr5:15379472-15379491 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGCAGGTCTTTCTGGAAA+TGG - Chr5:15379972-15379991 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAAAGGGGTTTTGTGGAGT+GGG - Chr5:15379199-15379218 MsG0580025213.01.T01:CDS 40.0%
AGACCTGCAAAGCTTTCTGA+AGG + Chr5:15379963-15379982 None:intergenic 45.0%
ATGCTTCTGTCAACAGCTCT+AGG + Chr5:15379595-15379614 None:intergenic 45.0%
CTTGAGAGAGTTGAGAGCTT+GGG - Chr5:15379142-15379161 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGTAGGAATGGGAAGGT+TGG - Chr5:15378905-15378924 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGCTTTGCAGGTCTTTC+TGG - Chr5:15379966-15379985 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
GAGCTTGATGAATGAGATGG+TGG - Chr5:15378937-15378956 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTGGGAAAAGTGAAAGT+TGG - Chr5:15379214-15379233 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
GGTCATCACAGTTCTTGACT+TGG - Chr5:15378616-15378635 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGACAGATGGGATCAAC+CGG - Chr5:15379362-15379381 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
TGACCTTCAGAAAGCTTTGC+AGG - Chr5:15379957-15379976 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
TGCACTTTGTAGGAATGGGA+AGG - Chr5:15378901-15378920 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
TGCTTCTGTCAACAGCTCTA+GGG + Chr5:15379594-15379613 None:intergenic 45.0%
TTGAGAGAGTTGAGAGCTTG+GGG - Chr5:15379143-15379162 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
!! GATAAAGGGGTTTTGTGGAG+TGG - Chr5:15379198-15379217 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
!! TAGGAATGGGAAGGTTGGTA+GGG - Chr5:15378910-15378929 MsG0580025213.01.T01:CDS 45.0%
ATGCAATGCTGGCCGTGTAA+CGG - Chr5:15379105-15379124 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
GCTTGAGAGAGTTGAGAGCT+TGG - Chr5:15379141-15379160 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
TACCTCAATCGGAGCTAACC+CGG - Chr5:15378535-15378554 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
TGAGAGAGTTGAGAGCTTGG+GGG - Chr5:15379144-15379163 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
TGATAAGCTCAACGGCCTCT+CGG + Chr5:15379756-15379775 None:intergenic 50.0%
! ATGATGGAGAGTGGTGTTCG+TGG - Chr5:15378743-15378762 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
! GTAGGAATGGGAAGGTTGGT+AGG - Chr5:15378909-15378928 MsG0580025213.01.T01:CDS 50.0%
!! GTGCCCTTTAGAGCCTTCTT+TGG + Chr5:15379479-15379498 None:intergenic 50.0%
AAGAACTGTGATGACCCGCC+TGG + Chr5:15378612-15378631 None:intergenic 55.0%
ACCTCAATCGGAGCTAACCC+GGG - Chr5:15378536-15378555 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
GAGAGAGTTGAGAGCTTGGG+GGG - Chr5:15379145-15379164 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
GCAACACGCTAGTATCCGAG+AGG - Chr5:15379738-15379757 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
GGGGGGTTCACTTGATGTTG+TGG - Chr5:15379162-15379181 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
!! ATGGGAAGGTTGGTAGGGCT+AGG - Chr5:15378915-15378934 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGTTAGCTCCGATTGAGGT+AGG + Chr5:15378536-15378555 None:intergenic 55.0%
!! TGAGATGGTGGACCCGAATG+AGG - Chr5:15378949-15378968 MsG0580025213.01.T01:CDS 55.0%
CAATGCTGGCCGTGTAACGG+AGG - Chr5:15379108-15379127 MsG0580025213.01.T01:CDS 60.0%
CAATTGTCCGGGGACTGTCC+CGG - Chr5:15378576-15378595 MsG0580025213.01.T01:CDS 60.0%
CCTCTGCAGCCTCCGTTACA+CGG + Chr5:15379120-15379139 None:intergenic 60.0%
! TGTCCCGGACTGGAATGACC+AGG - Chr5:15378591-15378610 MsG0580025213.01.T01:CDS 60.0%
!! ACCCGGGTTAGCTCCGATTG+AGG + Chr5:15378540-15378559 None:intergenic 60.0%
CCCGCCTGGTCATTCCAGTC+CGG + Chr5:15378598-15378617 None:intergenic 65.0%
CCGCCTGGTCATTCCAGTCC+GGG + Chr5:15378597-15378616 None:intergenic 65.0%
TTCCAGTCCGGGACAGTCCC+CGG + Chr5:15378586-15378605 None:intergenic 65.0%
! CCCGGACTGGAATGACCAGG+CGG - Chr5:15378594-15378613 MsG0580025213.01.T01:CDS 65.0%
! CCGGACTGGAATGACCAGGC+GGG - Chr5:15378595-15378614 MsG0580025213.01.T01:CDS 65.0%
! CCGTGTAACGGAGGCTGCAG+AGG - Chr5:15379117-15379136 MsG0580025213.01.T01:CDS 65.0%
GTCCGGGGACTGTCCCGGAC+TGG - Chr5:15378581-15378600 MsG0580025213.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 15378530 15380104 15378530 ID=MsG0580025213.01;Name=MsG0580025213.01
Chr5 mRNA 15378530 15380104 15378530 ID=MsG0580025213.01.T01;Parent=MsG0580025213.01;Name=MsG0580025213.01.T01;_AED=0.46;_eAED=0.46;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|524
Chr5 exon 15378530 15380104 15378530 ID=MsG0580025213.01.T01:exon:6236;Parent=MsG0580025213.01.T01
Chr5 CDS 15378530 15380104 15378530 ID=MsG0580025213.01.T01:cds;Parent=MsG0580025213.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580025213.01.T01

ATGCCTACCTCAATCGGAGCTAACCCGGGTGAAGATATCTTCATAACAATTGTCCGGGGACTGTCCCGGACTGGAATGACCAGGCGGGTCATCACAGTTCTTGACTTGGCTTACAAGTTTCATGGTACGCCGTCTTTGAAGATTTTTAACTCAATTTTGGATGTTCTTGTGAAAGAGGATATTGATATGGCTAGAGAGTTTTATAGAAAGAGTATGATGGAGAGTGGTGTTCGTGGTGATGATTATACGTTTGGGATTTTGATGAAGGGACTTTGTTTAACGAATAGGATTGGTGAAGGTTTTAAGCTTTTGCAGCTTATTAAGAATAATGGTGTTACACCAAATACTGTCATTTATAATACTTTGCTTCATGCACTTTGTAGGAATGGGAAGGTTGGTAGGGCTAGGAGCTTGATGAATGAGATGGTGGACCCGAATGAGGTTACGTTTAATATTTTGATATCTGCTTATTGTAAGGAAGAGAATTTGGTTCAAGCTCTTGTTTTACTTGAGAAGTGCTTTGCATTGAGTCTTGTACCTGATGTTGTTACTGTGACTAAGGTGGTTGAGATTCTATGCAATGCTGGCCGTGTAACGGAGGCTGCAGAGGTGCTTGAGAGAGTTGAGAGCTTGGGGGGTTCACTTGATGTTGTGGCTTACAATACATTGATAAAGGGGTTTTGTGGAGTGGGAAAAGTGAAAGTTGGACTTCATTTCCTGAAGCAGATGGAGAATAAAGGCTATCTTCCAAATGTGGATACTTACAATATACTGATATATGGGTTTTGTGAGTCTAGAATGTTGGATTTGGCTCTTGATCTTTTTAATGATATGAAGACAGATGGGATCAACCGGAACTTTGTTACTTTCGACACGATGATTAGAGGTTTGTGTTCAGAAGGAAGAATTGAAGATGGTTTTTCAATTTTGGAGTTAATGGAGGAAACCAAAGAAGGCTCTAAAGGGCACATAAGTCCTTATAATAGCATAATATATGGTCTATTTAAGCAAAATCGTTTTGACGAGGCATCTGAGTTTCTATCAAAGATGGGAAAGTTGTTCCCTAGAGCTGTTGACAGAAGCATGACTATTATACAGAAATGCAAGGAAGGTGCAATTGAAGATGCAAAGAATATATATGATAAGATGATTGATGAAGGTGGTATTCCAAGTATTCTAGTTTATAACTCTCTTGTTCATGGCTTTTCGCAACACGCTAGTATCCGAGAGGCCGTTGAGCTTATCAATGAAATGATAAGTAATAACTGTTTTCCCATTGCATCCACATTCAATGCTATCATCACTGAATTTTGTGGACAAGGAAAAATTGAAAGTGCCTTAAAGTTTATGGAAGATATTACTGCAAGAGGTTGTGTACCAAATACAGAAACTTACAGCCCTTTGATTGATGTGTTATGTAGGAAGGATGACCTTCAGAAAGCTTTGCAGGTCTTTCTGGAAATGGTAGAGAAGGGTATCCTTCCTGACCAATTTATTTGGAAATCACTGTTACTTAGTTTGAGTCTACAAAAGAATTTCAGTAAGAATGTGTCCAACATAGATTATTTACTCTAG
Protein sequence

>MsG0580025213.01.T01

MPTSIGANPGEDIFITIVRGLSRTGMTRRVITVLDLAYKFHGTPSLKIFNSILDVLVKEDIDMAREFYRKSMMESGVRGDDYTFGILMKGLCLTNRIGEGFKLLQLIKNNGVTPNTVIYNTLLHALCRNGKVGRARSLMNEMVDPNEVTFNILISAYCKEENLVQALVLLEKCFALSLVPDVVTVTKVVEILCNAGRVTEAAEVLERVESLGGSLDVVAYNTLIKGFCGVGKVKVGLHFLKQMENKGYLPNVDTYNILIYGFCESRMLDLALDLFNDMKTDGINRNFVTFDTMIRGLCSEGRIEDGFSILELMEETKEGSKGHISPYNSIIYGLFKQNRFDEASEFLSKMGKLFPRAVDRSMTIIQKCKEGAIEDAKNIYDKMIDEGGIPSILVYNSLVHGFSQHASIREAVELINEMISNNCFPIASTFNAIITEFCGQGKIESALKFMEDITARGCVPNTETYSPLIDVLCRKDDLQKALQVFLEMVEKGILPDQFIWKSLLLSLSLQKNFSKNVSNIDYLL*