AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028007.01


Find 316 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 787 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 73076981 73088976 73076981 ID=MsG0580028007.01;Name=MsG0580028007.01
Chr5 mRNA 73076981 73088976 73076981 ID=MsG0580028007.01.T01;Parent=MsG0580028007.01;Name=MsG0580028007.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.31;_QI=0|0|0|1|1|1|23|0|1424
Chr5 exon 73088645 73088976 73088645 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23579;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73088408 73088528 73088408 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23578;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73088116 73088252 73088116 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23577;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73087929 73088013 73087929 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23576;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73085076 73085238 73085076 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23575;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73084719 73084795 73084719 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23574;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73084463 73084607 73084463 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23573;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73083771 73084072 73083771 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23572;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73083405 73083686 73083405 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23571;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73082914 73083230 73082914 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23570;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73082672 73082832 73082672 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23569;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73082493 73082596 73082493 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23568;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73081966 73082122 73081966 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23567;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73081743 73081802 73081743 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23566;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73081480 73081616 73081480 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23565;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73081025 73081357 73081025 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23564;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73080650 73080940 73080650 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23563;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73079376 73079509 73079376 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23562;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73078767 73078994 73078767 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23561;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73078455 73078626 73078455 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23560;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73078277 73078364 73078277 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23559;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73077987 73078153 73077987 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23558;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 exon 73076981 73077262 73076981 ID=MsG0580028007.01.T01:exon:23557;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73088645 73088976 73088645 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73088408 73088528 73088408 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73088116 73088252 73088116 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73087929 73088013 73087929 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73085076 73085238 73085076 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73084719 73084795 73084719 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73084463 73084607 73084463 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73083771 73084072 73083771 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73083405 73083686 73083405 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73082914 73083230 73082914 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73082672 73082832 73082672 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73082493 73082596 73082493 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73081966 73082122 73081966 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73081743 73081802 73081743 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73081480 73081616 73081480 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73081025 73081357 73081025 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73080650 73080940 73080650 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73079376 73079509 73079376 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73078767 73078994 73078767 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73078455 73078626 73078455 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73078277 73078364 73078277 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73077987 73078153 73077987 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Chr5 CDS 73076981 73077262 73076981 ID=MsG0580028007.01.T01:cds;Parent=MsG0580028007.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580028007.01.T01

ATGGCAGCTTCCGATGGAAGCGAGTACTTCGAAATCGGATCAATCGGAAGCGAGAGTTTTGCGAGAGCGTCGAATGCAGAATGGGTGGAGGAAGACGAAGAGGAGCTTCATTGGGCGGCGCTTTCACGTTTACCGTCGCAGAAACGCATCAACTTCGCCGTCCTCCGTGCTTCATCTTCCCGTCAACCTTCAAAGGAAAACACTGGCGAGAATTTAGTCGATGTGAGAAAATTGAATCGGTTTAACCGTGAGCTCGTCGTTAAAAAAGCACTAGCTACAAATGATCAAGATAATTACAAGCTTCTCTCCGCCATTAAAGAACGCCTCGATAGGGCTGGAATTGAGGTACCGAAGATTGAAGTTAGGTATACGAATTTGACTGTGAGTGCTGATGTTCTAATCGGTTCACGAGCTTTACCGACTCTGTTCAATTACACTCGCGATGCATTAGAGTGGCGTCATCAAACCAGGAAGGTGATTATTGTTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTTAGATTGTAAAAGTTTCTGTGATTTTGATGACAAAGTTGTTACTATTTTTGTGTGGTTGAAATGGGGGATTGAATCGGAAAAAACGATGACTTTGCTACTTGGACCTCCAGGTTCCGGCAAATCCTCTTTACTTATGGCTCTCGCGGGAAAACTTGATAAAAATTTGAAGAAAACTGGTAGCATAACATACAACGGCCATGAGATAGATGAATTTTATGTTAGAAGGACTTCTGCATACATTAGCCAAACAGATAATCACATTCCTGAACTGACAGTGCGAGAAACTCTGGATTTTGGTGCTAGATGTCAAGGGGCAGAAGAAGGTTTTGCAGAATACACGAAAGATCTGGGCCACCTAGAGAACGAAAGGAACATACGACCTAGTCCAGAAATAGACGCATTTATGAAGGCATCCTCTGTTGGGGGTAAAAAGCACAGTGTGAACACTGATTACATTTTGAAGGTACTTGGTCTTGATGTATGTTCAGATACAATAGTTGGTAACGAAATGACCAGGGGAGTCTCCGGGGGCCAAAGAAAGAGAGTTACAACAGGCGAAATGATCGTTGGTCCTAGAAAAACGCTATTTATGGACGAAATATCAACTGGGCTTGATAGCTCTACTACATACCAGATAGTGAAATGCATAAAGAATTTTGTTCATCAGATGGAGGCTACAGTACTCATGGCACTCCTTCAACCAGCTCCTGAAACATTTGAGCTATTTGATGATCTGGTGCTTCTGTCCGAAGGGCATGTTATATATGAAGGCCCTAGAGAAGATGTGCTTGAATTTTTTGAGTCAATAGGTTTTCAACTTCCACCACGTAAGGGGATTGCAGACTTCCTTCAAGAGGTCACCTCTCAAAAGGATCAAGCACAATACTGGGCTGATCCTTCTAAACCATATGAATTTATCTCAGTTCGTGAGATTGCAGAAGCCTTTAGAAATTCTAGATTTGGAAGGTATATGGACTCCTTACAGGCTCATCCATATGATAAATCGAAGTGCCATCCTTCAGCTTTGGCTCAAAAAAAATATGCTGTGTCAAAATTGGAGGTCACAAAAGCTTGCTTTAACCGAGAAGTCCTTTTGATCAAAAGGCATAGTTTCCTTTATATTTTTAGAACCTTCCAGGTTGCTTTTGTTGGATTCGTCACATGTACAATATTCCTGCGAACAAGGTTGCATCCTACAGATGAGTCTTATGGGAGCCTTTATCTCTCTGCTCTATTCTTTGGGCTTGTTCACATGATGTTTAATGGGTTTTCTGAGCTTCCTTTGATGATATCGCGGCTCCCAGTATTTTACAAGCAAAGAGATAATTTATTCTATCCTGCATGGGCATGGTCTTTTACCAGTTGGATTCTCCGTGTACCTTACTCTGTTATTGAGGCTCTTATATGGGCTGCTGTTGTATATTACAGTGTTGGATTTGCTCCTGCAGCAGGAAGGTTTTTTCGCTACATGTTTATACTTTTTGTAGTGCACCAAATGGCATTAGGTCTTTTCGGGATGATGGCTTCTATTGCACGGGATATGGTTCTTGCCAATACATTTGGCTCAGCTGCACTGTTGATTATTTTCTTGCTGGGAGGATTTATTGTACCTAAAGAAATGATCAAGCCGTGGTGGATATGGGGCTACTGGTTGTCACCCCTTACCTATGGACAACGTGCAATTACAGTTAATGAATTTACTGCTTCCAGATGGATGAAGAAATCAGCAATTGGGAACACCACAGTAGGTTACAACATCCTCGTTTCAAACAATCTACCAGTTGACGATTACTGGTATTGGGCTGGTGCTGGAATTTTAATACTCTATGCAATTTTTTTCAATAGCATGGTCACTCTGGCCTTGGCCTATCTGAATCCACTTCAAAAGGCACGCACAGTTATCCCTCTGGATGATGATGGTTCAGGAAAGGATTCTGTTAGTAATCAGGTCTCTGAAATGAGTACCCATTCCAGGTCTAGAAGAGGCAACAGTAATTCGAAGGGGATGATTCTTCCATTTCAACCATTGACAATGACATTCCATAATGTCAATTATTATGTTGATATGCCAAAGGAAATTAGAAATCAAGGCATAGTTGAAACAAAGTTGCAACTCTTATCAGATGTAAGCGGAGTTTTCTCACCGGGTGTCCTGACAGCACTAGTGGGGTCTAGTGGGGCTGGAAAGACCACTCTAATGGATGTACTTGCTGGCAGGAAAACTGGAGGGTATATAGAAGGGGACATCAAAATATCTGGTTACCCAAAAGAGCAACAGACATTTGCCAGAATATCGGGATATGTTGAACAAAATGATATACATTCTCCTCAAGTTACCATTGAGGAGTCGCTGTGGTTTTCTGCATCTCTTCGCCTTCCAAAGGAAATCAGCATTGATAAAAGACGTGAATTTGTTGAACAAGTAATGAAACTGGTTGAGCTTGATTCTTTGAGATATGCTTTGGTTGGTATGCCAGGTAGTTCTGGTTTATCAACAGAGCAGAGGAAGAGATTAACAATTGCAGTGGAGCTTGTAGCAAACCCTTCCATTATTTTTATGGACGAGCCTACATCTGGACTTGATGCTCGTGCAGCAGCTATTGTTATGCGAACTGTTCGCAACACTGTTGATACTGGAAGAACTGTTGTCTGTACCATACATCAACCAAGTATTGATATTTTTGAAGCATTTGATGAAGGAATCACTGGTGTCGCCCCTATTCCAAGTGGCTACAATCCAGCTACCTGGGTACTTGAGGTCACTACGCCTGCTGTTGAAGAGAGAATTGGTTCAGATTTTGCTGAAATTTACAAGAATTCAGCGCAATTCAGGGGGGTGGAGGCTTCTATTTTGGAATTCGAGCGTCCTCCTGCAGGATTCCAACCACTGAAGTTTGACACAATATATTCACAAAATCCGTTGTCCCAATTTTATCTGTGCTTATGGAAACAAAATCTTGTGTACTGGAGAAGCCCGTCATATAATGCCATGAGGATGTACTTCACCACAATCAGTGCTTTGATATTTGGTAGTGTATTTTGGGATATTGGTTCAAAAAGATCATCAACGCAAGAGCTGTTTGTGCTTATGGGAGCTCTTTATTCTGCGTGCTTGTTTCTTGGGGTAAACAACGCTTCTTCTGTACAACCAATTGTTTCAATAGAAAGGACAGTATTTTATAGAGAGAAAGCAGCAGGAATGTACACTCCATTGGCATATGGAGCAGCCCAGGGACTTGTAGAGATACCATACATTGCTGTTCAGACAATAGTGTTTGGCTTAATAACATATTTTATGGTCAATTTTGAGAAGACAGCCGGGAAGTTTTTGCTCTATCTATTGTTCATGTTCTTAACCTTTACCTACTTCACCTTTTATGGAATGATGGCTGTTGGTCTTACACCTTCACAACAATTTGCTGCTGTTATTTCTTCAGCATTTTACTCCCTGTGGAATCTTCTTTCTGGTTTTCTTATCCCAAAATCACATATTCCTGGATGGTGGATTTGGTTCTACTATATCTGCCCTGTTCAATGGACATTACGTGGCATTATAACATCTCAGCTTGGTGATGTAGAAACAAGAATTGTGGGACCAGGATTCGAAGGCACTGTGAAAGAGTATTTATCTGTAACTCTTGGATATGATCAGAAAATCAACGGAATTTCGTCCGTGGGTCTTTCTGTGATAGTTCTCATTGCATTTATTCTCCTATTCTTTGGTAGTTTTGCTGCATCAGTCAAATTATTGAATTTCCAGAAGAGATAA

Protein sequence

>MsG0580028007.01.T01

MAASDGSEYFEIGSIGSESFARASNAEWVEEDEEELHWAALSRLPSQKRINFAVLRASSSRQPSKENTGENLVDVRKLNRFNRELVVKKALATNDQDNYKLLSAIKERLDRAGIEVPKIEVRYTNLTVSADVLIGSRALPTLFNYTRDALEWRHQTRKVIIVSSPPSSLDCKSFCDFDDKVVTIFVWLKWGIESEKTMTLLLGPPGSGKSSLLMALAGKLDKNLKKTGSITYNGHEIDEFYVRRTSAYISQTDNHIPELTVRETLDFGARCQGAEEGFAEYTKDLGHLENERNIRPSPEIDAFMKASSVGGKKHSVNTDYILKVLGLDVCSDTIVGNEMTRGVSGGQRKRVTTGEMIVGPRKTLFMDEISTGLDSSTTYQIVKCIKNFVHQMEATVLMALLQPAPETFELFDDLVLLSEGHVIYEGPREDVLEFFESIGFQLPPRKGIADFLQEVTSQKDQAQYWADPSKPYEFISVREIAEAFRNSRFGRYMDSLQAHPYDKSKCHPSALAQKKYAVSKLEVTKACFNREVLLIKRHSFLYIFRTFQVAFVGFVTCTIFLRTRLHPTDESYGSLYLSALFFGLVHMMFNGFSELPLMISRLPVFYKQRDNLFYPAWAWSFTSWILRVPYSVIEALIWAAVVYYSVGFAPAAGRFFRYMFILFVVHQMALGLFGMMASIARDMVLANTFGSAALLIIFLLGGFIVPKEMIKPWWIWGYWLSPLTYGQRAITVNEFTASRWMKKSAIGNTTVGYNILVSNNLPVDDYWYWAGAGILILYAIFFNSMVTLALAYLNPLQKARTVIPLDDDGSGKDSVSNQVSEMSTHSRSRRGNSNSKGMILPFQPLTMTFHNVNYYVDMPKEIRNQGIVETKLQLLSDVSGVFSPGVLTALVGSSGAGKTTLMDVLAGRKTGGYIEGDIKISGYPKEQQTFARISGYVEQNDIHSPQVTIEESLWFSASLRLPKEISIDKRREFVEQVMKLVELDSLRYALVGMPGSSGLSTEQRKRLTIAVELVANPSIIFMDEPTSGLDARAAAIVMRTVRNTVDTGRTVVCTIHQPSIDIFEAFDEGITGVAPIPSGYNPATWVLEVTTPAVEERIGSDFAEIYKNSAQFRGVEASILEFERPPAGFQPLKFDTIYSQNPLSQFYLCLWKQNLVYWRSPSYNAMRMYFTTISALIFGSVFWDIGSKRSSTQELFVLMGALYSACLFLGVNNASSVQPIVSIERTVFYREKAAGMYTPLAYGAAQGLVEIPYIAVQTIVFGLITYFMVNFEKTAGKFLLYLLFMFLTFTYFTFYGMMAVGLTPSQQFAAVISSAFYSLWNLLSGFLIPKSHIPGWWIWFYYICPVQWTLRGIITSQLGDVETRIVGPGFEGTVKEYLSVTLGYDQKINGISSVGLSVIVLIAFILLFFGSFAASVKLLNFQKR*