AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028659.01

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MsG0580028659.01.T01 AT3G02330 23.810 420 282 11 49 460 75 464 1.67e-23 104
MsG0580028659.01.T01 AT3G02330 25.532 235 170 3 232 463 33 265 1.06e-12 70.9
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MsG0580028659.01.T01 AT3G02010 25.581 473 317 11 2 463 89 537 4.68e-38 148
MsG0580028659.01.T01 AT3G02010 30.824 279 152 8 1 263 395 648 4.57e-28 118
MsG0580028659.01.T01 AT3G02010 23.118 372 247 12 119 458 67 431 2.23e-12 70.1
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 33.263 475 285 13 1 464 352 805 1.60e-68 236
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 29.399 466 294 12 2 453 40 484 2.29e-47 176
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 33.263 475 285 13 1 464 358 811 1.63e-68 236
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 29.399 466 294 12 2 453 46 490 2.21e-47 176
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 33.263 475 285 13 1 464 358 811 1.63e-68 236
MsG0580028659.01.T01 AT5G09950 29.399 466 294 12 2 453 46 490 2.21e-47 176
MsG0580028659.01.T01 AT3G01580 30.882 476 293 11 1 464 105 556 6.91e-68 229
MsG0580028659.01.T01 AT3G01580 26.452 465 304 15 11 463 13 451 9.64e-44 163
MsG0580028659.01.T01 AT3G01580 25.356 351 244 9 115 460 9 346 2.40e-24 107
MsG0580028659.01.T01 AT2G46050 31.172 478 288 10 2 465 81 531 9.04e-68 228
MsG0580028659.01.T01 AT2G46050 27.208 283 183 9 191 460 51 323 1.90e-21 97.8
MsG0580028659.01.T01 AT2G46050 33.889 180 107 4 1 178 285 454 7.62e-19 89.7
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MsG0580028659.01.T01 AT4G35130 26.882 465 307 13 8 465 80 518 8.67e-43 162
MsG0580028659.01.T01 AT4G35130 27.451 255 168 7 214 459 67 313 1.30e-18 89.4
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MsG0580028659.01.T01 AT4G31070 33.333 474 281 11 1 463 102 551 2.84e-67 227
MsG0580028659.01.T01 AT4G31070 27.586 406 266 10 60 458 60 444 2.09e-32 130
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MsG0580028659.01.T01 AT1G25360 24.385 447 269 18 2 405 229 649 7.70e-18 87.0
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MsG0580028659.01.T01 AT5G04780 28.293 205 138 4 251 452 38 236 2.94e-11 66.2
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MsG0580028659.01.T01 AT1G03540 28.010 407 267 12 60 463 64 447 2.01e-39 150
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MsG0580028659.01.T01 AT3G22150 30.252 476 296 14 1 464 260 711 2.62e-62 217
MsG0580028659.01.T01 AT3G22150 24.524 473 316 14 5 463 161 606 1.80e-34 137
MsG0580028659.01.T01 AT3G22150 25.984 508 314 17 3 464 50 541 6.59e-32 130
MsG0580028659.01.T01 AT1G56690 29.487 468 289 9 2 464 89 520 5.07e-62 214
MsG0580028659.01.T01 AT1G56690 24.365 394 257 12 3 387 183 544 4.64e-21 97.1
MsG0580028659.01.T01 AT4G04370 28.785 469 306 10 1 462 188 635 5.25e-62 215
MsG0580028659.01.T01 AT4G04370 29.574 470 298 12 1 463 90 533 1.08e-48 178
MsG0580028659.01.T01 AT4G04370 26.128 421 273 12 40 451 28 419 9.25e-32 129
MsG0580028659.01.T01 AT4G04370 26.263 198 136 4 258 451 26 217 1.34e-13 73.6
MsG0580028659.01.T01 AT1G71490 29.958 474 289 10 24 465 110 572 7.92e-62 213
MsG0580028659.01.T01 AT1G71490 24.153 443 274 11 61 463 47 467 1.08e-20 95.9
MsG0580028659.01.T01 AT1G71490 30.939 181 113 5 1 178 324 495 1.28e-15 80.1
MsG0580028659.01.T01 AT1G77010 29.038 520 298 11 2 464 134 639 9.73e-62 213
MsG0580028659.01.T01 AT1G77010 25.536 466 274 14 1 406 231 683 5.20e-21 96.7
MsG0580028659.01.T01 AT5G65570 30.769 468 294 13 4 464 111 555 1.63e-61 214
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MsG0580028659.01.T01 AT5G37570 24.190 401 246 14 2 384 155 515 3.30e-16 81.6
MsG0580028659.01.T01 AT2G44880 29.701 468 286 15 8 464 66 501 2.29e-55 194
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MsG0580028659.01.T01 AT1G22830 30.220 182 113 6 1 178 366 537 7.22e-14 74.7
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MsG0580028659.01.T01 AT5G08490 25.914 301 202 9 160 452 15 302 9.58e-16 80.5
MsG0580028659.01.T01 AT5G08490 20.041 489 303 20 2 452 376 814 3.40e-11 66.2
MsG0580028659.01.T01 AT1G32415 27.692 520 287 12 3 454 149 647 1.32e-52 189
MsG0580028659.01.T01 AT1G32415 24.304 539 259 19 2 463 87 553 2.73e-27 115
MsG0580028659.01.T01 AT1G32415 34.807 181 105 4 2 178 410 581 3.28e-23 103
MsG0580028659.01.T01 AT5G08510 37.956 274 154 7 210 469 147 418 1.49e-52 185
MsG0580028659.01.T01 AT5G08510 35.912 181 103 4 2 178 158 329 7.98e-22 98.6
MsG0580028659.01.T01 AT5G08510 25.100 251 148 4 250 463 54 301 1.55e-16 82.4
MsG0580028659.01.T01 AT5G08510 23.544 412 250 12 7 393 31 402 4.38e-14 74.7
MsG0580028659.01.T01 AT1G74400 34.643 280 170 4 197 464 86 364 4.23e-52 182
MsG0580028659.01.T01 AT1G74400 27.128 188 117 6 2 178 110 288 3.00e-12 68.9
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MsG0580028659.01.T01 AT3G18840 22.869 481 266 11 72 458 4 473 1.37e-21 98.6
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MsG0580028659.01.T01 AT2G42920 27.765 425 250 9 77 464 43 447 1.62e-46 169
MsG0580028659.01.T01 AT2G42920 28.063 253 161 7 2 252 202 435 1.14e-23 104
MsG0580028659.01.T01 AT2G42920 24.769 432 278 16 8 406 74 491 7.92e-21 95.9
MsG0580028659.01.T01 AT1G09190 29.723 397 230 8 111 470 47 431 1.64e-46 168
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MsG0580028659.01.T01 AT3G56550 26.378 254 162 6 2 251 152 384 1.74e-21 97.8
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MsG0580028659.01.T01 AT1G34160 33.149 181 103 7 2 178 154 320 3.28e-17 84.7
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MsG0580028659.01.T01 AT3G62890 36.719 256 149 7 215 459 132 385 6.09e-41 154
MsG0580028659.01.T01 AT3G62890 28.462 260 158 8 2 252 138 378 3.43e-22 100
MsG0580028659.01.T01 AT5G03800 26.518 494 299 13 14 464 240 712 6.39e-41 157
MsG0580028659.01.T01 AT5G03800 23.930 514 326 15 2 471 124 616 8.84e-31 126
MsG0580028659.01.T01 AT5G03800 27.616 344 223 10 66 405 90 411 3.42e-25 109
MsG0580028659.01.T01 AT5G03800 30.043 233 136 9 1 227 461 672 6.03e-17 84.3
MsG0580028659.01.T01 AT3G50420 27.549 461 281 11 1 454 243 657 8.01e-41 156
MsG0580028659.01.T01 AT3G50420 25.934 482 318 14 1 465 141 600 6.05e-35 139
MsG0580028659.01.T01 AT3G50420 23.750 480 326 16 1 463 31 487 5.22e-25 108
MsG0580028659.01.T01 AT3G50420 24.543 383 248 13 92 458 23 380 5.17e-22 100
MsG0580028659.01.T01 AT1G09220 32.333 300 163 8 204 464 151 449 2.24e-40 152
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MsG0580028659.01.T01 AT5G65560 20.143 561 338 18 2 460 263 815 8.89e-14 74.3
MsG0580028659.01.T01 AT5G65560 21.477 447 272 15 26 451 186 574 1.36e-14 77.0
MsG0580028659.01.T01 AT5G65560 20.143 561 338 18 2 460 263 815 8.89e-14 74.3
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MsG0580028659.01.T01 AT5G01110 28.302 212 132 8 260 456 217 423 4.28e-14 75.1
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63080 23.504 234 167 5 241 463 237 469 8.76e-14 74.3
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63080 23.504 234 167 5 241 463 237 469 8.76e-14 74.3
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63080 23.504 234 167 5 241 463 237 469 8.76e-14 74.3
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MsG0580028659.01.T01 AT1G19290 26.168 214 146 5 204 405 252 465 1.71e-13 73.6
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63130 20.704 483 336 17 2 459 126 586 2.12e-13 72.8
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MsG0580028659.01.T01 AT1G06580 26.163 172 116 4 303 464 33 203 2.80e-13 71.6
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MsG0580028659.01.T01 AT1G31840 21.963 428 304 12 1 410 365 780 2.92e-13 72.8
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63400 22.222 234 170 5 241 463 257 489 9.64e-13 70.9
MsG0580028659.01.T01 AT2G16880 21.272 503 327 17 11 459 188 675 4.10e-13 72.0
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 28.108 185 125 4 265 442 283 466 5.48e-13 71.6
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 24.324 222 156 6 243 453 295 515 1.88e-11 66.6
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 28.108 185 125 4 265 442 308 491 5.51e-13 71.6
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 24.324 222 156 6 243 453 320 540 1.64e-11 67.0
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 28.108 185 125 4 265 442 286 469 5.95e-13 71.6
MsG0580028659.01.T01 AT2G35130 24.324 222 156 6 243 453 298 518 1.93e-11 66.6
MsG0580028659.01.T01 AT1G09680 22.892 249 177 6 226 460 254 501 8.06e-13 71.2
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MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 20.259 464 301 13 3 449 257 668 1.64e-12 70.5
MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 22.650 234 165 6 243 463 280 510 2.11e-12 70.1
MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 20.259 464 301 13 3 449 257 668 1.64e-12 70.5
MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 22.650 234 165 6 243 463 280 510 2.11e-12 70.1
MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 20.259 464 301 13 3 449 257 668 1.64e-12 70.5
MsG0580028659.01.T01 AT1G05670 22.650 234 165 6 243 463 280 510 2.11e-12 70.1
MsG0580028659.01.T01 AT1G13040 21.006 338 240 11 130 452 148 473 2.16e-12 69.7
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MsG0580028659.01.T01 AT1G62720 21.449 345 247 9 122 454 60 392 2.52e-12 69.3
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63230 30.065 153 95 5 314 455 77 228 2.96e-12 68.2
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MsG0580028659.01.T01 AT3G59040 23.759 282 191 10 199 461 160 436 8.61e-12 67.8
MsG0580028659.01.T01 AT3G53700 19.175 485 336 13 25 463 120 594 9.76e-12 67.8
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MsG0580028659.01.T01 AT1G63330 23.504 234 167 5 241 463 182 414 1.64e-11 67.0
MsG0580028659.01.T01 AT1G63330 23.504 234 167 5 241 463 182 414 1.64e-11 67.0
MsG0580028659.01.T01 AT2G41720 23.629 237 167 6 233 456 105 340 1.83e-11 67.0
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MsG0580028659.01.T01 AT2G41720 23.629 237 167 6 233 456 237 472 3.00e-11 66.2
MsG0580028659.01.T01 AT2G41720 23.629 237 167 6 233 456 237 472 3.01e-11 66.2
MsG0580028659.01.T01 AT1G63150 23.451 226 162 4 248 463 263 487 3.63e-11 65.9
MsG0580028659.01.T01 AT1G63150 23.451 226 162 4 248 463 263 487 3.63e-11 65.9
MsG0580028659.01.T01 AT4G16390 23.605 233 166 5 242 463 173 404 3.64e-11 65.9
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Find 86 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 100 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GCCTGCATGGTTGACCTTTA+TGG 0.168453 5:-84443184 MsG0580028659.01.T01:CDS
CTTGGACTGTTCTTGTTTCT+GGG 0.265850 5:-84444356 MsG0580028659.01.T01:CDS
TCTTGGAATTCGATGATTTC+AGG 0.272201 5:-84444033 MsG0580028659.01.T01:CDS
AATGCCTTGATACATGCTTA+TGG 0.277562 5:-84443481 MsG0580028659.01.T01:CDS
GAGGAGCAAAATGTTAAATA+TGG 0.305873 5:-84444228 MsG0580028659.01.T01:CDS
AGCAAGTGTTCTGGTGGTTT+CGG 0.324464 5:-84444126 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTTCATTACTTGGATCTTGC+AGG 0.333161 5:-84443087 MsG0580028659.01.T01:CDS
TTTAACAATGCCACATTACT+TGG 0.333969 5:-84443940 MsG0580028659.01.T01:CDS
TGAAACCTGATTCTGTGATT+TGG 0.337202 5:-84443111 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTTGCCACGATTTGGTTTCT+TGG 0.347394 5:-84443411 MsG0580028659.01.T01:CDS
GCAACAAAGGTTGCAGAATC+TGG 0.350124 5:+84443310 None:intergenic
CATATGTATTGCAATGGAAT+TGG 0.361783 5:-84443964 MsG0580028659.01.T01:CDS
TTCTTTATTCTCGGGTATGC+TGG 0.364159 5:-84444301 MsG0580028659.01.T01:CDS
GGTAGCGTGCATAATCTAAA+TGG 0.368446 5:+84444412 None:intergenic
CTCAAGTCTTATGCCATTCA+TGG 0.374446 5:-84443379 MsG0580028659.01.T01:CDS
ATCACAGAATCAGGTTTCAT+TGG 0.379086 5:+84443115 None:intergenic
TGCTATTATTTCTGTGTTTG+CGG 0.389427 5:-84443686 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAATGTTAAATATGGCTTGC+AGG 0.399407 5:-84444220 MsG0580028659.01.T01:CDS
ATATGTATTGCAATGGAATT+GGG 0.399485 5:-84443963 MsG0580028659.01.T01:CDS
GAACTCCAAATCACAGAATC+AGG 0.401523 5:+84443106 None:intergenic
CAAGAAACAAAATTTCTTCT+CGG 0.405433 5:+84444375 None:intergenic
ACTTGCAAAAGCAAATTCAT+TGG 0.407668 5:+84444266 None:intergenic
TAAATTTATCGGCTGCCATT+TGG 0.417878 5:+84443042 None:intergenic
ATACATGCTTATGGGAGGTC+TGG 0.421204 5:-84443472 MsG0580028659.01.T01:CDS
ATGCCTTGATACATGCTTAT+GGG 0.424115 5:-84443480 MsG0580028659.01.T01:CDS
AGTATAGAAATCTTATATCT+TGG 0.424491 5:-84444050 MsG0580028659.01.T01:CDS
TTCTCGGCATTTGATCAAAC+AGG 0.431492 5:+84444391 None:intergenic
TGAAATGGGTTGCCACGATT+TGG 0.439736 5:-84443419 MsG0580028659.01.T01:CDS
GGACTTGGCGACAAAGCTAT+TGG 0.444057 5:-84443997 MsG0580028659.01.T01:CDS
CTCGCGGCATGCAGCCACGC+TGG 0.448772 5:-84443283 MsG0580028659.01.T01:CDS
ACGATGTATAGCAAGTGTTC+TGG 0.450473 5:-84444135 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTTTCTGGGTATGCGCAGTT+TGG 0.450712 5:-84444342 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTGATTTGGAGTTCATTACT+TGG 0.462823 5:-84443097 MsG0580028659.01.T01:CDS
CACGCTGGATTTGTTGAAGA+AGG 0.465264 5:-84443268 MsG0580028659.01.T01:CDS
ACTAGATCTCTTTAAGCAAA+TGG 0.472237 5:-84443341 MsG0580028659.01.T01:CDS
GAAACATGGTGAGGCTGACT+TGG 0.475728 5:-84443065 MsG0580028659.01.T01:CDS
CTTGCAAAAGCAAATTCATT+GGG 0.480463 5:+84444267 None:intergenic
TCTTTCCAGCTCGTCCATAA+AGG 0.481878 5:+84443170 None:intergenic
TCCATAAAGGTCAACCATGC+AGG 0.486683 5:+84443183 None:intergenic
TGTTCTGGTGGTTTCGGTGG+AGG 0.492112 5:-84444120 MsG0580028659.01.T01:CDS
GATGAAGTTGACAGAAAAGA+AGG 0.499970 5:+84443641 None:intergenic
CACTCACAGGTAATTAAACA+AGG 0.500514 5:-84443529 MsG0580028659.01.T01:CDS
CTTGGATCTTGCAGGAAACA+TGG 0.502527 5:-84443079 MsG0580028659.01.T01:CDS
CATGTTCGCCACTTGTATCA+AGG 0.509895 5:+84443725 None:intergenic
CACTGTCTCACAGTTAAAAG+TGG 0.513845 5:-84443835 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTGAGGCTGACTTGGCCAAA+TGG 0.518444 5:-84443057 MsG0580028659.01.T01:CDS
GAATCATTGTACAAGTACTT+CGG 0.523391 5:-84443902 MsG0580028659.01.T01:CDS
AGTTGAAGTGGTAACTGCAT+TGG 0.534010 5:-84443800 MsG0580028659.01.T01:CDS
TTAAATATGTACTGTAAATG+TGG 0.534840 5:-84444435 None:intergenic
TGGAAAGATATTTGAGGCGG+AGG 0.535797 5:-84443155 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTAAAATCCTATGCAGACCT+AGG 0.537416 5:-84443778 MsG0580028659.01.T01:CDS
GTTGACCTTTATGGACGAGC+TGG 0.543116 5:-84443175 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAGCTCTTCCTTGATACAAG+TGG 0.547080 5:-84443733 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAAAGAAGGAAAGCTTGCTC+AGG 0.550151 5:+84443655 None:intergenic
TAAAATCCTATGCAGACCTA+GGG 0.554942 5:-84443777 MsG0580028659.01.T01:CDS
TGCCGCGAGAAGCGCAACAA+AGG 0.564544 5:+84443297 None:intergenic
ATCATACTTCGGATGATGCA+TGG 0.569575 5:-84444092 MsG0580028659.01.T01:CDS
AACCTTTGTTGCGCTTCTCG+CGG 0.577313 5:-84443299 MsG0580028659.01.T01:CDS
TGTTGCTTTGAAAATGTCGT+TGG 0.580822 5:-84444190 MsG0580028659.01.T01:CDS
CAGGCATAGTGATCTAATTG+AGG 0.582236 5:+84443202 None:intergenic
ATTAGATCACTATGCCTGCA+TGG 0.582768 5:-84443197 MsG0580028659.01.T01:CDS
AATTACCTGTGAGTGAACTT+CGG 0.585605 5:+84443537 None:intergenic
AGATAAAACGCCAAGTAATG+TGG 0.585696 5:+84443930 None:intergenic
TAGCTTTGTCGCCAAGTCCA+CGG 0.586738 5:+84444001 None:intergenic
AGGCAATTGAAAATGTGTGC+CGG 0.593549 5:+84443599 None:intergenic
TTTGCGCATATGTATTGCAA+TGG 0.595235 5:-84443970 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAGTGTTCTGGTGGTTTCGG+TGG 0.595279 5:-84444123 MsG0580028659.01.T01:CDS
TCTTATTTCAGAAGTTGAAG+TGG 0.598810 5:-84443812 MsG0580028659.01.T01:CDS
TGGAGGTTGTGATCATACTT+CGG 0.599195 5:-84444103 MsG0580028659.01.T01:CDS
AACTTGTTCAGACAGAGCTA+AGG 0.605425 5:+84443447 None:intergenic
ACGAGCTGGAAAGATATTTG+AGG 0.609032 5:-84443161 MsG0580028659.01.T01:CDS
CCTCCCATAAGCATGTATCA+AGG 0.609658 5:+84443477 None:intergenic
ATGTATAGCAAGTGTTCTGG+TGG 0.612424 5:-84444132 MsG0580028659.01.T01:CDS
TGCAACCGAAGTTCACTCAC+AGG 0.624003 5:-84443542 MsG0580028659.01.T01:CDS
AGCTGGAAAGATATTTGAGG+CGG 0.640527 5:-84443158 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAGTGTGCTTAGCGCTTGTG+AGG 0.640662 5:-84444247 MsG0580028659.01.T01:CDS
ACTCACAGGTAATTAAACAA+GGG 0.667340 5:-84443528 MsG0580028659.01.T01:CDS
GCGAACATGATATTGTGTCA+TGG 0.674047 5:-84443711 MsG0580028659.01.T01:CDS
AAAATCCTATGCAGACCTAG+GGG 0.675836 5:-84443776 MsG0580028659.01.T01:CDS
CCTTGATACATGCTTATGGG+AGG 0.676436 5:-84443477 MsG0580028659.01.T01:CDS
AACTCTATGACTGAAAGACA+TGG 0.694335 5:-84443232 MsG0580028659.01.T01:CDS
AATTCCAAGAAACCAAATCG+TGG 0.695392 5:+84443407 None:intergenic
CTTCTTCAACAAATCCAGCG+TGG 0.717201 5:+84443269 None:intergenic
AAATCCTATGCAGACCTAGG+GGG 0.734996 5:-84443775 MsG0580028659.01.T01:CDS
ATCTTGCAGGAAACATGGTG+AGG 0.741545 5:-84443074 MsG0580028659.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGTATAGAAATCTTATATCT+TGG - Chr5:84443412-84443431 MsG0580028659.01.T01:CDS 20.0%
! ATATGTATTGCAATGGAATT+GGG - Chr5:84443499-84443518 MsG0580028659.01.T01:CDS 25.0%
! CAAGAAACAAAATTTCTTCT+CGG + Chr5:84443090-84443109 None:intergenic 25.0%
!!! AGAGTGTTTTTCTTTATTCT+CGG - Chr5:84443152-84443171 MsG0580028659.01.T01:CDS 25.0%
ACTAGATCTCTTTAAGCAAA+TGG - Chr5:84444121-84444140 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
ACTCACAGGTAATTAAACAA+GGG - Chr5:84443934-84443953 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGCAAAAGCAAATTCAT+TGG + Chr5:84443199-84443218 None:intergenic 30.0%
CATATGTATTGCAATGGAAT+TGG - Chr5:84443498-84443517 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
CTTGCAAAAGCAAATTCATT+GGG + Chr5:84443198-84443217 None:intergenic 30.0%
GAATCATTGTACAAGTACTT+CGG - Chr5:84443560-84443579 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
GAGGAGCAAAATGTTAAATA+TGG - Chr5:84443234-84443253 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
TTTAACAATGCCACATTACT+TGG - Chr5:84443522-84443541 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! AAATGTTAAATATGGCTTGC+AGG - Chr5:84443242-84443261 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! GAACAAGTTTTTGCTGAAAT+GGG - Chr5:84444029-84444048 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! GAGTGTTTTTCTTTATTCTC+GGG - Chr5:84443153-84443172 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! TCATCGAGAAAATTTTGTGT+TGG - Chr5:84443839-84443858 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTATTTCAGAAGTTGAAG+TGG - Chr5:84443650-84443669 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
! TGAACAAGTTTTTGCTGAAA+TGG - Chr5:84444028-84444047 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
!! CGAGAAGAAATTTTGTTTCT+TGG - Chr5:84443088-84443107 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCTATTATTTCTGTGTTTG+CGG - Chr5:84443776-84443795 MsG0580028659.01.T01:CDS 30.0%
AACTCTATGACTGAAAGACA+TGG - Chr5:84444230-84444249 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
AATGCCTTGATACATGCTTA+TGG - Chr5:84443981-84444000 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
AATTACCTGTGAGTGAACTT+CGG + Chr5:84443928-84443947 None:intergenic 35.0%
AATTCCAAGAAACCAAATCG+TGG + Chr5:84444058-84444077 None:intergenic 35.0%
AGATAAAACGCCAAGTAATG+TGG + Chr5:84443535-84443554 None:intergenic 35.0%
ATCACAGAATCAGGTTTCAT+TGG + Chr5:84444350-84444369 None:intergenic 35.0%
ATGCCTTGATACATGCTTAT+GGG - Chr5:84443982-84444001 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
CACTCACAGGTAATTAAACA+AGG - Chr5:84443933-84443952 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
GATGAAGTTGACAGAAAAGA+AGG + Chr5:84443824-84443843 None:intergenic 35.0%
TAAAATCCTATGCAGACCTA+GGG - Chr5:84443685-84443704 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGGAATTCGATGATTTC+AGG - Chr5:84443429-84443448 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
TGAAACCTGATTCTGTGATT+TGG - Chr5:84444351-84444370 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCGCATATGTATTGCAA+TGG - Chr5:84443492-84443511 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
! GAGAAAATTTTGTGTTGGAC+CGG - Chr5:84443844-84443863 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
! GTGATTTGGAGTTCATTACT+TGG - Chr5:84444365-84444384 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
! TAAATTTATCGGCTGCCATT+TGG + Chr5:84444423-84444442 None:intergenic 35.0%
!! TGTTGCTTTGAAAATGTCGT+TGG - Chr5:84443272-84443291 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTTCAGGTTTTCAATTCCG+TGG - Chr5:84443444-84443463 MsG0580028659.01.T01:CDS 35.0%
AAAATCCTATGCAGACCTAG+GGG - Chr5:84443686-84443705 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTCTTCCTTGATACAAG+TGG - Chr5:84443729-84443748 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
ACGAGCTGGAAAGATATTTG+AGG - Chr5:84444301-84444320 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
ACGATGTATAGCAAGTGTTC+TGG - Chr5:84443327-84443346 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
AGCTGGAAAGATATTTGAGG+CGG - Chr5:84444304-84444323 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
AGGCAATTGAAAATGTGTGC+CGG + Chr5:84443866-84443885 None:intergenic 40.0%
AGTTGAAGTGGTAACTGCAT+TGG - Chr5:84443662-84443681 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
ATCATACTTCGGATGATGCA+TGG - Chr5:84443370-84443389 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
ATGTATAGCAAGTGTTCTGG+TGG - Chr5:84443330-84443349 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
ATTAGATCACTATGCCTGCA+TGG - Chr5:84444265-84444284 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
CACTGTCTCACAGTTAAAAG+TGG - Chr5:84443627-84443646 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
CAGGCATAGTGATCTAATTG+AGG + Chr5:84444263-84444282 None:intergenic 40.0%
GAACTCCAAATCACAGAATC+AGG + Chr5:84444359-84444378 None:intergenic 40.0%
GCGAACATGATATTGTGTCA+TGG - Chr5:84443751-84443770 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
GGTAGCGTGCATAATCTAAA+TGG + Chr5:84443053-84443072 None:intergenic 40.0%
GTAAAATCCTATGCAGACCT+AGG - Chr5:84443684-84443703 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
GTTCATTACTTGGATCTTGC+AGG - Chr5:84444375-84444394 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
TGGAGGTTGTGATCATACTT+CGG - Chr5:84443359-84443378 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
TTCTCGGCATTTGATCAAAC+AGG + Chr5:84443074-84443093 None:intergenic 40.0%
TTCTTTATTCTCGGGTATGC+TGG - Chr5:84443161-84443180 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
! AAAAGAAGGAAAGCTTGCTC+AGG + Chr5:84443810-84443829 None:intergenic 40.0%
! AAAGTACGCGCAAGCTTTTA+AGG + Chr5:84443886-84443905 None:intergenic 40.0%
! AACTTGTTCAGACAGAGCTA+AGG + Chr5:84444018-84444037 None:intergenic 40.0%
! ATCTTTTGCTCGACCATGAA+TGG + Chr5:84444099-84444118 None:intergenic 40.0%
! CTCAAGTCTTATGCCATTCA+TGG - Chr5:84444083-84444102 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGGACTGTTCTTGTTTCT+GGG - Chr5:84443106-84443125 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
! TCTTGGACTGTTCTTGTTTC+TGG - Chr5:84443105-84443124 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATGGACTGTTTTTGAGTCGA+TGG - Chr5:84443389-84443408 MsG0580028659.01.T01:CDS 40.0%
AAATCCTATGCAGACCTAGG+GGG - Chr5:84443687-84443706 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
AGCAAGTGTTCTGGTGGTTT+CGG - Chr5:84443336-84443355 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
ATACATGCTTATGGGAGGTC+TGG - Chr5:84443990-84444009 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
ATCTTGCAGGAAACATGGTG+AGG - Chr5:84444388-84444407 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
CATGTTCGCCACTTGTATCA+AGG + Chr5:84443740-84443759 None:intergenic 45.0%
CCTCCCATAAGCATGTATCA+AGG + Chr5:84443988-84444007 None:intergenic 45.0%
CCTTGATACATGCTTATGGG+AGG - Chr5:84443985-84444004 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
CTTCTTCAACAAATCCAGCG+TGG + Chr5:84444196-84444215 None:intergenic 45.0%
CTTGGATCTTGCAGGAAACA+TGG - Chr5:84444383-84444402 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
GCAACAAAGGTTGCAGAATC+TGG + Chr5:84444155-84444174 None:intergenic 45.0%
TCCATAAAGGTCAACCATGC+AGG + Chr5:84444282-84444301 None:intergenic 45.0%
TCTTTCCAGCTCGTCCATAA+AGG + Chr5:84444295-84444314 None:intergenic 45.0%
! GGTTTTCAATTCCGTGGACT+TGG - Chr5:84443450-84443469 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
! TGGAAAGATATTTGAGGCGG+AGG - Chr5:84444307-84444326 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
!! CACGCTGGATTTGTTGAAGA+AGG - Chr5:84444194-84444213 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGCCACGATTTGGTTTCT+TGG - Chr5:84444051-84444070 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
!! TGAAATGGGTTGCCACGATT+TGG - Chr5:84444043-84444062 MsG0580028659.01.T01:CDS 45.0%
AACCTTTGTTGCGCTTCTCG+CGG - Chr5:84444163-84444182 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
AAGTGTGCTTAGCGCTTGTG+AGG - Chr5:84443215-84443234 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
AAGTGTTCTGGTGGTTTCGG+TGG - Chr5:84443339-84443358 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
AGTCAGAAATGTGACCCCCT+AGG + Chr5:84443704-84443723 None:intergenic 50.0%
GAAACATGGTGAGGCTGACT+TGG - Chr5:84444397-84444416 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
GCCTGCATGGTTGACCTTTA+TGG - Chr5:84444278-84444297 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
GGACTTGGCGACAAAGCTAT+TGG - Chr5:84443465-84443484 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
GTTGACCTTTATGGACGAGC+TGG - Chr5:84444287-84444306 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
TGCAACCGAAGTTCACTCAC+AGG - Chr5:84443920-84443939 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
! CGGGTATGCTGGCATGTTTT+CGG - Chr5:84443172-84443191 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
! GTTTCTGGGTATGCGCAGTT+TGG - Chr5:84443120-84443139 MsG0580028659.01.T01:CDS 50.0%
!! TAGCTTTGTCGCCAAGTCCA+CGG + Chr5:84443464-84443483 None:intergenic 50.0%
TGTTCTGGTGGTTTCGGTGG+AGG - Chr5:84443342-84443361 MsG0580028659.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGAGGCTGACTTGGCCAAA+TGG - Chr5:84444405-84444424 MsG0580028659.01.T01:CDS 55.0%
GTGACCCCCTAGGTCTGCAT+AGG + Chr5:84443694-84443713 None:intergenic 60.0%
! TGCCGCGAGAAGCGCAACAA+AGG + Chr5:84444168-84444187 None:intergenic 60.0%
CTCGCGGCATGCAGCCACGC+TGG - Chr5:84444179-84444198 MsG0580028659.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 84443033 84444451 84443033 ID=MsG0580028659.01;Name=MsG0580028659.01
Chr5 mRNA 84443033 84444451 84443033 ID=MsG0580028659.01.T01;Parent=MsG0580028659.01;Name=MsG0580028659.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|472
Chr5 exon 84443033 84444451 84443033 ID=MsG0580028659.01.T01:exon:729;Parent=MsG0580028659.01.T01
Chr5 CDS 84443033 84444451 84443033 ID=MsG0580028659.01.T01:cds;Parent=MsG0580028659.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580028659.01.T01

ATGTACTGTAAATGTGGCCATTTAGATTATGCACGCTACCTGTTTGATCAAATGCCGAGAAGAAATTTTGTTTCTTGGACTGTTCTTGTTTCTGGGTATGCGCAGTTTGGTTTGATCAGAGAGTGTTTTTCTTTATTCTCGGGTATGCTGGCATGTTTTCGGCCCAATGAATTTGCTTTTGCAAGTGTGCTTAGCGCTTGTGAGGAGCAAAATGTTAAATATGGCTTGCAGGTACACGCTGTTGCTTTGAAAATGTCGTTGGATTGCAATGTGTATGTTGCAAATGCTCTTATTACGATGTATAGCAAGTGTTCTGGTGGTTTCGGTGGAGGTTGTGATCATACTTCGGATGATGCATGGACTGTTTTTGAGTCGATGGAGTATAGAAATCTTATATCTTGGAATTCGATGATTTCAGGTTTTCAATTCCGTGGACTTGGCGACAAAGCTATTGGTCTGTTTGCGCATATGTATTGCAATGGAATTGGGTTTAACAATGCCACATTACTTGGCGTTTTATCTTCTTTGAATCATTGTACAAGTACTTCGGATGACATCAACAACACACATCATCTGAAGAACTGTTTTCAATTACACTGTCTCACAGTTAAAAGTGGTCTTATTTCAGAAGTTGAAGTGGTAACTGCATTGGTAAAATCCTATGCAGACCTAGGGGGTCACATTTCTGACTGTTTTAAGCTCTTCCTTGATACAAGTGGCGAACATGATATTGTGTCATGGACTGCTATTATTTCTGTGTTTGCGGAGCGCGATCCTGAGCAAGCTTTCCTTCTTTTCTGTCAACTTCATCGAGAAAATTTTGTGTTGGACCGGCACACATTTTCAATTGCCTTAAAAGCTTGCGCGTACTTTGTCACTGAGAAAAATGCAACCGAAGTTCACTCACAGGTAATTAAACAAGGGTTTCACGACGACACAGTTGTTTCAAATGCCTTGATACATGCTTATGGGAGGTCTGGATCCTTAGCTCTGTCTGAACAAGTTTTTGCTGAAATGGGTTGCCACGATTTGGTTTCTTGGAATTCAATGCTCAAGTCTTATGCCATTCATGGTCGAGCAAAAGATGCACTAGATCTCTTTAAGCAAATGGATGTTCATCCAGATTCTGCAACCTTTGTTGCGCTTCTCGCGGCATGCAGCCACGCTGGATTTGTTGAAGAAGGAGCGCAAATTTTCAACTCTATGACTGAAAGACATGGTATTGCTCCTCAATTAGATCACTATGCCTGCATGGTTGACCTTTATGGACGAGCTGGAAAGATATTTGAGGCGGAGGAATTGATACGTAAAATGCCAATGAAACCTGATTCTGTGATTTGGAGTTCATTACTTGGATCTTGCAGGAAACATGGTGAGGCTGACTTGGCCAAATGGCAGCCGATAAATTTAAAAAGTTAG
Protein sequence

>MsG0580028659.01.T01

MYCKCGHLDYARYLFDQMPRRNFVSWTVLVSGYAQFGLIRECFSLFSGMLACFRPNEFAFASVLSACEEQNVKYGLQVHAVALKMSLDCNVYVANALITMYSKCSGGFGGGCDHTSDDAWTVFESMEYRNLISWNSMISGFQFRGLGDKAIGLFAHMYCNGIGFNNATLLGVLSSLNHCTSTSDDINNTHHLKNCFQLHCLTVKSGLISEVEVVTALVKSYADLGGHISDCFKLFLDTSGEHDIVSWTAIISVFAERDPEQAFLLFCQLHRENFVLDRHTFSIALKACAYFVTEKNATEVHSQVIKQGFHDDTVVSNALIHAYGRSGSLALSEQVFAEMGCHDLVSWNSMLKSYAIHGRAKDALDLFKQMDVHPDSATFVALLAACSHAGFVEEGAQIFNSMTERHGIAPQLDHYACMVDLYGRAGKIFEAEELIRKMPMKPDSVIWSSLLGSCRKHGEADLAKWQPINLKS*