AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028908.01

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MsG0580028908.01.T01 AT1G68690 43.986 291 153 5 374 661 370 653 2.25e-69 241
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MsG0580028908.01.T01 AT5G15080 41.017 295 156 6 374 657 135 422 2.52e-67 231
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MsG0580028908.01.T01 AT1G07570 39.274 303 166 7 367 657 54 350 2.02e-62 215
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MsG0580028908.01.T01 AT4G21410 40.264 303 165 7 356 651 207 500 1.95e-61 216
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MsG0580028908.01.T01 AT1G34210 36.000 150 85 4 1 142 36 182 7.35e-14 75.9
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MsG0580028908.01.T01 AT2G42960 35.849 318 180 6 374 691 176 469 1.63e-60 212
MsG0580028908.01.T01 AT2G42960 35.849 318 180 6 374 691 176 469 1.63e-60 212
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MsG0580028908.01.T01 AT2G07180 39.130 299 167 6 374 664 83 374 1.94e-60 210
MsG0580028908.01.T01 AT5G56460 40.136 294 160 6 374 657 69 356 2.09e-60 209
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MsG0580028908.01.T01 AT2G18470 46.256 227 116 3 374 600 277 497 3.89e-60 212
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MsG0580028908.01.T01 AT1G06700 39.100 289 168 6 374 657 61 346 1.04e-59 206
MsG0580028908.01.T01 AT1G60800 40.690 290 157 8 374 657 227 507 1.08e-59 211
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MsG0580028908.01.T01 AT5G45780 40.767 287 160 7 374 657 250 529 1.30e-59 211
MsG0580028908.01.T01 AT3G25560 33.566 429 251 10 255 657 161 581 1.32e-59 213
MsG0580028908.01.T01 AT1G30570 40.426 282 160 5 374 654 513 787 1.38e-59 216
MsG0580028908.01.T01 AT3G25560 33.566 429 251 10 255 657 161 581 1.40e-59 213
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MsG0580028908.01.T01 AT2G04300 34.043 423 235 13 255 654 406 807 3.33e-59 215
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MsG0580028908.01.T01 AT5G59270 39.789 284 164 4 374 657 361 637 5.20e-59 212
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MsG0580028908.01.T01 AT4G23280 36.607 336 191 8 338 657 287 616 1.38e-58 211
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MsG0580028908.01.T01 AT5G54590 42.105 285 148 7 374 657 108 376 3.66e-58 204
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MsG0580028908.01.T01 AT3G09010 35.915 284 176 4 374 657 39 316 2.20e-57 201
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MsG0580028908.01.T01 AT1G55610 40.000 280 161 5 374 650 852 1127 2.33e-57 212
MsG0580028908.01.T01 AT2G19230 32.974 464 256 15 227 657 397 838 2.36e-57 210
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MsG0580028908.01.T01 AT2G28990 33.478 460 244 15 242 657 405 846 2.62e-57 210
MsG0580028908.01.T01 AT2G28990 33.478 460 244 15 242 657 405 846 2.62e-57 210
MsG0580028908.01.T01 AT3G53810 40.210 286 163 5 374 657 340 619 2.73e-57 207
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MsG0580028908.01.T01 AT4G03230 39.865 296 171 5 363 657 572 861 3.18e-57 210
MsG0580028908.01.T01 AT4G03230 39.865 296 171 5 363 657 572 861 3.18e-57 210
MsG0580028908.01.T01 AT1G11330 38.312 308 169 7 364 657 495 795 3.18e-57 209
MsG0580028908.01.T01 AT4G23310 41.197 284 159 6 376 657 503 780 3.21e-57 209
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MsG0580028908.01.T01 AT1G11330 38.312 308 169 7 364 657 493 793 3.37e-57 209
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MsG0580028908.01.T01 AT4G00330 41.958 286 157 6 377 657 115 396 4.15e-57 200
MsG0580028908.01.T01 AT4G03230 39.865 296 171 5 363 657 514 803 4.19e-57 209
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MsG0580028908.01.T01 AT2G02800 37.415 294 168 6 374 657 76 363 4.26e-57 201
MsG0580028908.01.T01 AT5G11020 37.671 292 175 5 369 660 68 352 4.35e-57 199
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MsG0580028908.01.T01 AT5G11020 37.671 292 175 5 369 660 129 413 5.64e-57 201
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MsG0580028908.01.T01 AT5G03320 38.514 296 169 5 371 657 71 362 9.71e-57 199
MsG0580028908.01.T01 AT1G70530 41.343 283 141 4 323 584 244 522 9.82e-57 203
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MsG0580028908.01.T01 AT1G61490 37.539 317 176 7 367 676 476 777 3.93e-56 206
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MsG0580028908.01.T01 AT1G61430 37.380 313 186 6 367 678 452 755 4.88e-56 205
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MsG0580028908.01.T01 AT1G61390 37.538 333 175 9 347 661 476 793 1.17e-55 205
MsG0580028908.01.T01 AT1G61440 38.019 313 184 7 367 678 464 767 1.50e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT1G51830 33.178 428 238 14 255 654 245 652 1.59e-55 202
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MsG0580028908.01.T01 AT1G51830 33.178 428 238 14 255 654 252 659 1.71e-55 202
MsG0580028908.01.T01 AT5G62710 32.658 444 249 15 255 657 114 548 1.80e-55 200
MsG0580028908.01.T01 AT1G21210 40.068 292 166 5 362 650 388 673 1.81e-55 203
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MsG0580028908.01.T01 AT1G61440 38.019 313 184 7 367 678 469 772 1.95e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT1G78530 44.304 237 117 3 368 600 62 287 2.02e-55 192
MsG0580028908.01.T01 AT1G70740 37.908 306 169 6 373 666 42 338 2.09e-55 196
MsG0580028908.01.T01 AT3G04690 40.214 281 156 6 374 651 510 781 2.17e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT1G53430 36.552 290 179 4 368 657 615 899 2.22e-55 206
MsG0580028908.01.T01 AT1G61360 46.552 232 119 4 370 600 487 714 2.23e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT5G48740 40.418 287 158 6 374 657 601 877 2.30e-55 205
MsG0580028908.01.T01 AT3G59420 38.199 322 190 5 374 690 505 822 2.43e-55 205
MsG0580028908.01.T01 AT4G11480 34.444 360 217 10 307 657 244 593 2.50e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT4G23130 46.009 213 110 3 373 584 336 544 2.67e-55 199
MsG0580028908.01.T01 AT1G11340 38.047 297 173 6 371 666 505 791 2.74e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT4G11460 38.356 292 166 7 371 657 261 543 2.83e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT5G62710 32.658 444 249 15 255 657 148 582 2.93e-55 200
MsG0580028908.01.T01 AT1G61610 47.619 210 105 3 376 584 520 725 3.19e-55 202
MsG0580028908.01.T01 AT2G02220 32.028 434 257 10 255 657 579 1005 3.26e-55 205
MsG0580028908.01.T01 AT1G53430 36.552 290 179 4 368 657 656 940 3.27e-55 205
MsG0580028908.01.T01 AT4G11480 34.426 366 217 10 307 657 244 601 3.27e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G21590 37.631 287 168 6 374 657 362 640 3.77e-55 202
MsG0580028908.01.T01 AT1G61480 38.333 300 166 6 370 662 485 772 3.81e-55 203
MsG0580028908.01.T01 AT3G59700 38.246 285 169 5 374 657 331 609 4.01e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G61370 47.619 210 105 4 376 584 345 550 4.34e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G51820 33.879 428 238 13 255 654 434 844 5.12e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT1G16120 40.845 284 162 3 374 657 422 699 6.32e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT4G11460 38.356 292 166 7 371 657 336 618 6.64e-55 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G28440 30.030 676 348 25 38 657 353 959 6.72e-55 204
MsG0580028908.01.T01 AT1G28440 29.900 301 169 13 1 288 23 294 9.99e-11 65.9
MsG0580028908.01.T01 AT1G21590 37.631 287 168 6 374 657 402 680 6.90e-55 202
MsG0580028908.01.T01 AT3G53840 40.925 281 158 4 378 653 351 628 7.35e-55 200
MsG0580028908.01.T01 AT2G13800 37.809 283 170 5 377 657 154 432 8.16e-55 196
MsG0580028908.01.T01 AT2G13800 37.809 283 170 5 377 657 154 432 8.16e-55 196
MsG0580028908.01.T01 AT2G37710 40.767 287 159 7 374 657 340 618 8.44e-55 200
MsG0580028908.01.T01 AT1G24030 40.574 244 139 4 420 660 11 251 8.61e-55 189
MsG0580028908.01.T01 AT1G49100 33.333 441 245 14 255 657 421 850 8.90e-55 203
MsG0580028908.01.T01 AT1G48210 40.417 240 131 4 368 600 55 289 9.17e-55 191
MsG0580028908.01.T01 AT1G48210 40.417 240 131 4 368 600 55 289 9.17e-55 191
MsG0580028908.01.T01 AT1G48210 40.417 240 131 4 368 600 55 289 9.17e-55 191
MsG0580028908.01.T01 AT1G70520 39.661 295 164 6 370 657 314 601 1.01e-54 199
MsG0580028908.01.T01 AT1G67520 35.366 328 200 7 343 664 218 539 1.09e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT1G61430 44.118 238 128 4 367 603 452 685 1.12e-54 200
MsG0580028908.01.T01 AT4G29180 33.570 423 240 11 256 657 445 847 1.15e-54 203
MsG0580028908.01.T01 AT2G19190 33.115 459 273 14 206 654 405 839 1.23e-54 202
MsG0580028908.01.T01 AT1G61430 44.118 238 128 4 367 603 475 708 1.31e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G61430 44.118 238 128 4 367 603 475 708 1.31e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G17230 40.138 289 160 6 374 657 792 1072 1.38e-54 204
MsG0580028908.01.T01 AT5G59260 39.799 299 162 6 373 667 347 631 1.41e-54 199
MsG0580028908.01.T01 AT2G25220 39.785 279 160 6 371 648 87 358 1.44e-54 192
MsG0580028908.01.T01 AT1G17230 40.138 289 160 6 374 657 792 1072 1.46e-54 204
MsG0580028908.01.T01 AT5G35960 39.649 285 159 7 374 657 127 399 1.54e-54 194
MsG0580028908.01.T01 AT4G04510 46.429 224 115 3 361 583 319 538 1.58e-54 199
MsG0580028908.01.T01 AT1G67520 35.366 328 200 7 343 664 247 568 1.65e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT1G67520 35.366 328 200 7 343 664 247 568 1.65e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT4G23190 41.803 244 133 4 342 584 315 550 1.66e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT4G04510 46.429 224 115 3 361 583 321 540 1.70e-54 199
MsG0580028908.01.T01 AT5G62230 29.750 679 380 21 44 660 226 869 1.79e-54 202
MsG0580028908.01.T01 AT5G63710 30.172 464 265 11 242 657 75 527 1.81e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT5G63710 30.172 464 265 11 242 657 75 527 1.81e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT2G28960 31.981 419 253 12 255 657 308 710 1.89e-54 200
MsG0580028908.01.T01 AT1G11340 44.783 230 120 4 371 599 573 796 2.20e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT5G63710 30.172 464 265 11 242 657 110 562 2.33e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT5G63710 30.172 464 265 11 242 657 111 563 2.66e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT2G25220 39.785 279 160 6 371 648 136 407 2.68e-54 193
MsG0580028908.01.T01 AT1G61370 47.619 210 105 4 376 584 496 701 2.72e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G07570 42.194 237 129 5 424 657 3 234 2.84e-54 189
MsG0580028908.01.T01 AT1G74360 38.614 303 169 5 365 661 798 1089 3.11e-54 202
MsG0580028908.01.T01 AT1G21240 41.509 265 141 5 390 650 163 417 3.16e-54 194
MsG0580028908.01.T01 AT4G23250 41.017 295 164 8 367 657 338 626 3.19e-54 202
MsG0580028908.01.T01 AT2G13800 37.809 283 170 5 377 657 271 549 3.25e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT2G13800 37.809 283 170 5 377 657 271 549 3.25e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT1G61400 36.170 329 185 8 367 691 486 793 3.66e-54 200
MsG0580028908.01.T01 AT2G23950 31.542 428 253 11 256 657 155 568 3.83e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT2G23950 36.806 144 86 3 4 142 41 184 1.13e-11 68.6
MsG0580028908.01.T01 AT1G26970 36.824 296 166 7 374 657 76 362 3.95e-54 192
MsG0580028908.01.T01 AT1G07560 32.636 478 265 15 236 668 385 850 4.01e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT1G51890 30.156 514 275 18 215 654 354 857 4.01e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT2G25220 39.785 279 160 6 371 648 141 412 4.36e-54 193
MsG0580028908.01.T01 AT1G67520 35.366 328 200 7 343 664 412 733 4.82e-54 199
MsG0580028908.01.T01 AT4G30520 37.884 293 168 7 374 664 296 576 4.98e-54 197
MsG0580028908.01.T01 AT3G55550 39.024 287 164 6 374 657 339 617 5.08e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT1G61430 37.025 316 186 7 367 678 475 781 5.17e-54 200
MsG0580028908.01.T01 AT5G35960 39.576 283 158 7 374 655 127 397 5.17e-54 191
MsG0580028908.01.T01 AT1G09970 27.794 680 390 21 19 671 356 961 6.61e-54 201
MsG0580028908.01.T01 AT2G23450 40.484 289 158 5 374 657 341 620 6.85e-54 198
MsG0580028908.01.T01 AT2G23450 40.484 289 158 5 374 657 341 620 6.85e-54 198

Find 189 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 306 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGGCACCTTGTTGCTCTTCT+TGG 0.190464 5:+88416958 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACATATCAAAATTAACTAAA+AGG 0.193484 5:-88418519 None:intergenic
TCAATTGAAGCTTTCCCTTC+TGG 0.208236 5:-88417255 None:intergenic
CAACTCTCAGCAAACCTTAA+AGG 0.213831 5:-88416055 None:intergenic
CAAAGGGTTTAATGGATTAA+AGG 0.239716 5:+88415642 MsG0580028908.01.T01:intron
GTTATTCACCCTCGGCATTC+TGG 0.250561 5:+88416603 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGGGTATGGGTTATCCTTTA+AGG 0.260580 5:+88416041 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAAGAGTGCCGTGGAGATTC+TGG 0.261019 5:-88415257 None:intergenic
ATATTGGGGCAAGGAGGTTT+TGG 0.284833 5:+88416805 MsG0580028908.01.T01:CDS
CACTAATGGGAACATTGATA+TGG 0.285002 5:+88416349 MsG0580028908.01.T01:CDS
AGGGCAAAGGTCGCAGATTT+TGG 0.294099 5:+88417216 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGTTGAGGTTGATAATATTA+AGG 0.295344 5:+88415946 MsG0580028908.01.T01:CDS
ATGTTCTTCTTTCGGTTGTT+GGG 0.311134 5:+88416020 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCGACCCGGATCCATGTAAA+TGG 0.318061 5:+88415181 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGAGATTCTGGCGACCGATT+TGG 0.320801 5:-88415245 None:intergenic
TGTGTTGCCAAAGGGTTTAA+TGG 0.322065 5:+88415634 MsG0580028908.01.T01:intron
ATCTTCGCTTCTTCCAAGTT+TGG 0.323973 5:+88418197 MsG0580028908.01.T01:CDS
CAAGTGAAAGAGGCGGTTTA+AGG 0.325225 5:-88415152 None:intergenic
GATGTTCTTCTTTCGGTTGT+TGG 0.328798 5:+88416019 MsG0580028908.01.T01:CDS
TAGGGTGGATGTTCTTCTTT+CGG 0.338822 5:+88416012 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACAAGAATTGCAGGAACTTT+CGG 0.340118 5:+88417279 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCACCTTCGTTGTCTCCTAA+TGG 0.346298 5:+88416392 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCCATGTCAGGCCTTTGATA+TGG 0.349844 5:-88418019 None:intergenic
TGCAGGAACTTTCGGATACT+TGG 0.350303 5:+88417287 MsG0580028908.01.T01:CDS
CGGATCTCCCATGGCTCAAA+AGG 0.361800 5:-88415473 None:intergenic
GATCCTGTGTTGGTTGGATT+GGG 0.364926 5:+88416088 MsG0580028908.01.T01:CDS
AATGGTGGGAGTTCGGAAAA+TGG 0.368332 5:+88416434 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTTTCTAACAATCATCTCTT+CGG 0.368469 5:+88416290 MsG0580028908.01.T01:CDS
CTTCTTGGTTACTGCTTGGA+TGG 0.372887 5:+88416973 MsG0580028908.01.T01:CDS
GCAAATCCATACGGGCGATT+AGG 0.375389 5:-88418240 None:intergenic
TGAACCAGTGAGATTATTAT+CGG 0.375736 5:-88416222 None:intergenic
TTTCTAACAATCATCTCTTC+GGG 0.377263 5:+88416291 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGATCCTGTGTTGGTTGGAT+TGG 0.378041 5:+88416087 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTCTCCTTGGCGATGATATG+AGG 0.382096 5:+88417196 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCAATTGAAACAAGAATTGC+AGG 0.386517 5:+88417270 MsG0580028908.01.T01:CDS
CAGCTTTGGTGTAATATTGA+TGG 0.386853 5:+88417799 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGCTCTTCTTGGTTACTGCT+TGG 0.395481 5:+88416969 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCTTCGTTGATATCAATTGT+AGG 0.410093 5:-88417938 None:intergenic
CTAAGTGTTGTAAGTTGGTA+AGG 0.412409 5:-88415296 None:intergenic
ACGAATGCTGAAGACATATA+TGG 0.415255 5:+88418093 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACCATCCGCTGATGTAAAAT+CGG 0.419996 5:-88418262 None:intergenic
TACCACAAGCACTCAAGAAA+TGG 0.435098 5:+88418136 MsG0580028908.01.T01:CDS
GATTAAAGGTAGAGTCTTTG+TGG 0.435310 5:+88415656 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTCACTTGGTTGGTCCGACC+CGG 0.435468 5:+88415167 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGGGTCCATTTACATGGATC+CGG 0.437759 5:-88415186 None:intergenic
AAAAGTGATGTTAAGCTTAG+TGG 0.440167 5:+88415691 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAACCTTCAAATATTCTCCT+TGG 0.440885 5:+88417183 MsG0580028908.01.T01:CDS
AACCGCCTCTTTCACTTGGT+TGG 0.444537 5:+88415157 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGGTGAATAACTAATGCATT+TGG 0.445111 5:-88416591 None:intergenic
ACTCTGTGTAACACTTGTTA+AGG 0.445605 5:+88418433 MsG0580028908.01.T01:three_prime_UTR
ACCAATGCAAGTACGGGAAA+TGG 0.446214 5:+88416416 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGAGGCAGAAGAAGTTAAGC+AGG 0.446960 5:+88416559 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGTCCACTTCCAAGCTTAAA+CGG 0.451614 5:+88415342 MsG0580028908.01.T01:CDS
TACGGGAAATGGTGGGAGTT+CGG 0.454960 5:+88416427 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTATGAAGGTGCAAGTCAAC+TGG 0.456280 5:+88418164 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAAGTTGATGTGTTCAGCTT+TGG 0.462329 5:+88417785 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTACTTGCATTGGTACCATT+AGG 0.463862 5:-88416407 None:intergenic
ATGATGTGTGGGGCAATAGT+TGG 0.465492 5:+88416880 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGCAAAGTAGTAAGCTCATT+CGG 0.465705 5:-88416248 None:intergenic
AATGTGATTGTGAGCACTAA+TGG 0.465846 5:+88416335 MsG0580028908.01.T01:CDS
CTTTAAGGTTTGCTGAGAGT+TGG 0.468434 5:+88416056 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTAGAGTCTTTGTGGTTGAA+TGG 0.470892 5:+88415664 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACCATTTCCCGTACTTGCAT+TGG 0.472224 5:-88416417 None:intergenic
TTCTTGGTTACTGCTTGGAT+GGG 0.473395 5:+88416974 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCTTATCTAAGTACATTCTT+CGG 0.473538 5:-88417892 None:intergenic
TAATGGTACCAATGCAAGTA+CGG 0.475872 5:+88416409 MsG0580028908.01.T01:CDS
CATATCAAAATTAACTAAAA+GGG 0.480023 5:-88418518 None:intergenic
CTTCGTTGATATCAATTGTA+GGG 0.481130 5:-88417937 None:intergenic
AAACCGTTTAAGCTTGGAAG+TGG 0.483426 5:-88415345 None:intergenic
GTCCTGGTGATTGTGATCCT+AGG 0.486194 5:+88415993 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACAAGGTGCATGCTGTCCTC+AGG 0.486442 5:-88417860 None:intergenic
TGCCATTTCTTGAGTGCTTG+TGG 0.488173 5:-88418138 None:intergenic
ACAGAGTATAAGATTAATCA+TGG 0.494065 5:-88418417 None:intergenic
CTTAAACCGCCTCTTTCACT+TGG 0.494278 5:+88415153 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGTTCTTCTTTCGGTTGTTG+GGG 0.498661 5:+88416021 MsG0580028908.01.T01:CDS
GCTAATAATGCTAATGTGAA+AGG 0.500091 5:+88415534 MsG0580028908.01.T01:CDS
ATATTGATGGAGCTTATAAC+CGG 0.503966 5:+88417812 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAGCTCTAAGTGTTGTAAGT+TGG 0.504136 5:-88415301 None:intergenic
TGATGTGTGGGGCAATAGTT+GGG 0.506032 5:+88416881 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCGAAGAATGTACTTAGATA+AGG 0.506294 5:+88417892 MsG0580028908.01.T01:CDS
CTTCTTCTCTTGTCGAACAA+TGG 0.511631 5:+88418058 MsG0580028908.01.T01:CDS
GATATCAATTGTAGGGTCAA+TGG 0.512534 5:-88417930 None:intergenic
CTGCGATTCTCGTACCATCA+TGG 0.517647 5:-88416849 None:intergenic
AGGTTTGCTGAGAGTTGGAA+GGG 0.518458 5:+88416061 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAGTTTAAACCGTTTAAGCT+TGG 0.519001 5:-88415351 None:intergenic
ACTAATGGGAACATTGATAT+GGG 0.523545 5:+88416350 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCCTGGTGATTGTGATCCTA+GGG 0.524116 5:+88415994 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAGAAATGGCAGGCTTATGA+AGG 0.524119 5:+88418150 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAAACATGGGTCCATTTACA+TGG 0.527686 5:-88415192 None:intergenic
ACTCGGGTGGAATAAGAGAT+TGG 0.528780 5:+88417083 MsG0580028908.01.T01:CDS
ATGTGATTGTGAGCACTAAT+GGG 0.529689 5:+88416336 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCATCGCGTTAGATGTTGCA+AGG 0.529972 5:+88417106 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCTTCCGATAATAATCTCAC+TGG 0.532453 5:+88416218 MsG0580028908.01.T01:CDS
GCCATATCAAAGGCCTGACA+TGG 0.534705 5:+88418018 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTGTGGGGCAATAGTTGGGA+AGG 0.535580 5:+88416885 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTTTGTGTGTTATCCAAACT+TGG 0.535690 5:-88418210 None:intergenic
TGTTGAGTACCTCCATAGCT+TGG 0.536709 5:+88417131 MsG0580028908.01.T01:CDS
CGATTTGGATTCTTGTGACA+CGG 0.537532 5:-88415230 None:intergenic
AGTGGTTCGAGTCCTTCGTC+TGG 0.538326 5:-88417063 None:intergenic
AGCTTTGATGAGCCAAGCTA+TGG 0.538471 5:-88417143 None:intergenic
AACTTTAGTTGTCACACGGC+CGG 0.539189 5:-88417768 None:intergenic
TGGGAACATTGATATGGGTA+AGG 0.542818 5:+88416355 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGTTTATGAGTACATGCCGC+AGG 0.543678 5:+88417011 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAGGTTTGCTGAGAGTTGGA+AGG 0.545683 5:+88416060 MsG0580028908.01.T01:CDS
AAAGTGATGTTAAGCTTAGT+GGG 0.547281 5:+88415692 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCGCCAAGGAGAATATTTGA+AGG 0.548025 5:-88417186 None:intergenic
ATGCATTAGTTATTCACCCT+CGG 0.548133 5:+88416595 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTAAAATCGGCAAATCCATA+CGG 0.548983 5:-88418249 None:intergenic
ACATGTTTCAGGGACGGTGC+CGG 0.549231 5:+88415910 MsG0580028908.01.T01:intron
TGTACATAATAATTGTAAGG+TGG 0.550367 5:+88418304 MsG0580028908.01.T01:exon
CACACTGTAGCTGAATTAGC+TGG 0.551661 5:+88417977 MsG0580028908.01.T01:CDS
TAGCTGGTCATTGCAGTGCA+AGG 0.551722 5:+88417993 MsG0580028908.01.T01:CDS
AGTATACCTAATCGCCCGTA+TGG 0.553990 5:+88418234 MsG0580028908.01.T01:CDS
TAATGAAAGTGTGAAGATAA+CGG 0.554320 5:+88416632 MsG0580028908.01.T01:CDS
CAAGAAGAGCAACAAGGTGC+CGG 0.554669 5:-88416957 None:intergenic
TCGGACCAACCAAGTGAAAG+AGG 0.556077 5:-88415162 None:intergenic
TCTTCAGCATTCGTATCGGA+TGG 0.556800 5:-88418084 None:intergenic
GGGAATGATCCTGTGTTGGT+TGG 0.559032 5:+88416082 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAAGGGGAATGATCCTGTGT+TGG 0.565935 5:+88416078 MsG0580028908.01.T01:CDS
AATGGTACCAATGCAAGTAC+GGG 0.568979 5:+88416410 MsG0580028908.01.T01:CDS
CTAGTGCGTCTTGCTCCAGA+AGG 0.569127 5:+88417240 MsG0580028908.01.T01:CDS
CATCGCGTTAGATGTTGCAA+GGG 0.569849 5:+88417107 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTCTTCGGAACCATGCTACA+AGG 0.570623 5:-88417877 None:intergenic
TAAAATCGGCAAATCCATAC+GGG 0.570733 5:-88418248 None:intergenic
GACGAAGGACTCGAACCACT+CGG 0.571188 5:+88417066 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGATCTCCCATGGCTCAAAA+GGG 0.574780 5:-88415472 None:intergenic
GGGTCCATTTACATGGATCC+GGG 0.576110 5:-88415185 None:intergenic
ACATTCAATTGAGTTAGCAC+AGG 0.576934 5:-88416269 None:intergenic
GGATGGTAGATGATCATGCT+TGG 0.578571 5:+88418278 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTAACCGCATGACCCATGTC+AGG 0.578611 5:-88418031 None:intergenic
TCAAAGACACGGATCTCCCA+TGG 0.579337 5:-88415482 None:intergenic
AATGCAAGTACGGGAAATGG+TGG 0.580065 5:+88416419 MsG0580028908.01.T01:CDS
AGCTGGTCATTGCAGTGCAA+GGG 0.580308 5:+88417994 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGTCGTCGGAGCATGAAACA+TGG 0.581076 5:-88415206 None:intergenic
TCTTGTGACACGGTTGTCGT+CGG 0.583222 5:-88415220 None:intergenic
ATCACATTGCTCCTAAAACT+CGG 0.584722 5:-88416320 None:intergenic
TGAATTAATCAACTAGCTAG+TGG 0.585047 5:-88418556 None:intergenic
GTTTATGAGTACATGCCGCA+GGG 0.585444 5:+88417012 MsG0580028908.01.T01:CDS
TCTCCTTGGCGATGATATGA+GGG 0.588256 5:+88417197 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTTGATGAGCCAAGCTATGG+AGG 0.588450 5:-88417140 None:intergenic
CGTGTCACAAGAATCCAAAT+CGG 0.594524 5:+88415231 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGATCACAATCACCAGGACT+AGG 0.608134 5:-88415989 None:intergenic
TAATTTCAATACAGGTTCTG+AGG 0.608960 5:+88416752 MsG0580028908.01.T01:intron
GGTTTGCTGAGAGTTGGAAG+GGG 0.609083 5:+88416062 MsG0580028908.01.T01:CDS
TATGTCTTCAGCATTCGTAT+CGG 0.611805 5:-88418088 None:intergenic
ACAGCATGCACCTTGTAGCA+TGG 0.612262 5:+88417867 MsG0580028908.01.T01:CDS
AATCCCAATCCAACCAACAC+AGG 0.612310 5:-88416091 None:intergenic
CATCAACTTTAGTTGTCACA+CGG 0.616839 5:-88417772 None:intergenic
ACAAGCACTCAAGAAATGGC+AGG 0.618487 5:+88418140 MsG0580028908.01.T01:CDS
CAGTGAAAAGAATGATGTGT+GGG 0.618625 5:+88416869 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTGTAGGGTCAATGGCCTTG+CGG 0.619981 5:-88417922 None:intergenic
TACTTGGCACCAGAATATGC+AGG 0.620528 5:+88417303 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACCCTAGGATCACAATCACC+AGG 0.622556 5:-88415995 None:intergenic
TATAAAGGCGAACTCCATGA+TGG 0.622707 5:+88416835 MsG0580028908.01.T01:CDS
ACGAAGGACTCGAACCACTC+GGG 0.623507 5:+88417067 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGCCGCAGGGGACCCTAAGT+AGG 0.623783 5:+88417025 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAAAGAAGAACATCCACCCT+AGG 0.624685 5:-88416010 None:intergenic
AAGGACTCGAACCACTCGGG+TGG 0.625171 5:+88417070 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCATTTACATGGATCCGGGT+CGG 0.625655 5:-88415181 None:intergenic
TGGCGATGATATGAGGGCAA+AGG 0.627704 5:+88417203 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTTCTTCTTTCGGTTGTTGG+GGG 0.632309 5:+88416022 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTGCCCTCATATCATCGCCA+AGG 0.632905 5:-88417200 None:intergenic
ATCGGTCGCCAGAATCTCCA+CGG 0.635823 5:+88415249 MsG0580028908.01.T01:CDS
CTTGTGGTAAAGATAAGTCA+AGG 0.637316 5:-88418122 None:intergenic
AGAAGCATCTTTCAAAGACA+CGG 0.639654 5:-88415493 None:intergenic
TGTGGGGCAATAGTTGGGAA+GGG 0.642454 5:+88416886 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTCGTCGGAGCATGAAACAT+GGG 0.643509 5:-88415205 None:intergenic
AAGGCCTGACATGGGTCATG+CGG 0.646666 5:+88418027 MsG0580028908.01.T01:CDS
TGGTGATTGTGATCCTAGGG+TGG 0.651305 5:+88415997 MsG0580028908.01.T01:CDS
TATCTGATCCAGAATGCCGA+GGG 0.651977 5:-88416611 None:intergenic
GGGTTTGAGGAAGAGTGCCG+TGG 0.656825 5:-88415266 None:intergenic
GTGCAAGGGAGCCATATCAA+AGG 0.658739 5:+88418008 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTATCTGATCCAGAATGCCG+AGG 0.660856 5:-88416612 None:intergenic
AGTAACCAAGAAGAGCAACA+AGG 0.669422 5:-88416963 None:intergenic
AGATAAGGACACATTCCGCA+AGG 0.670699 5:+88417907 MsG0580028908.01.T01:CDS
TAGTGCGTCTTGCTCCAGAA+GGG 0.672371 5:+88417241 MsG0580028908.01.T01:CDS
CCATATCAAAGGCCTGACAT+GGG 0.676079 5:+88418019 MsG0580028908.01.T01:CDS
TTTATGAGTACATGCCGCAG+GGG 0.676410 5:+88417013 MsG0580028908.01.T01:CDS
GAGGCAGAAGAAGTTAAGCA+GGG 0.680495 5:+88416560 MsG0580028908.01.T01:CDS
ATCGCGTTAGATGTTGCAAG+GGG 0.683273 5:+88417108 MsG0580028908.01.T01:CDS
ATGCAAGTACGGGAAATGGT+GGG 0.683792 5:+88416420 MsG0580028908.01.T01:CDS
TACCTACTTAGGGTCCCCTG+CGG 0.695066 5:-88417027 None:intergenic
AATCTCTTATTCCACCCGAG+TGG 0.712843 5:-88417081 None:intergenic
ACTTGACGACAGTCAACCTG+AGG 0.714386 5:+88417844 MsG0580028908.01.T01:CDS
GGTGGGAGTTCGGAAAATGG+CGG 0.719358 5:+88416437 MsG0580028908.01.T01:CDS
GACCAACCAAGTGAAAGAGG+CGG 0.722389 5:-88415159 None:intergenic
GCAGTGAAAAGAATGATGTG+TGG 0.723491 5:+88416868 MsG0580028908.01.T01:CDS
AGTGAAAAGAATGATGTGTG+GGG 0.780412 5:+88416870 MsG0580028908.01.T01:CDS
GTACCATTAGGAGACAACGA+AGG 0.813065 5:-88416395 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTAAAAATATACCTACTT+AGG - Chr5:88417041-88417060 None:intergenic 15.0%
!! ACATATCAAAATTAACTAAA+AGG - Chr5:88418522-88418541 None:intergenic 15.0%
!! ATTAAAAATATACCTACTTA+GGG - Chr5:88417040-88417059 None:intergenic 15.0%
!! CATATCAAAATTAACTAAAA+GGG - Chr5:88418521-88418540 None:intergenic 15.0%
!!! TAAGTAGGTATATTTTTAAT+TGG + Chr5:88417040-88417059 MsG0580028908.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTGTACATAATAATTGTA+AGG + Chr5:88418301-88418320 MsG0580028908.01.T01:exon 15.0%
!! ATTAAAAGCTAAATGCAAAA+GGG - Chr5:88415603-88415622 None:intergenic 20.0%
!! TATTAAAAGCTAAATGCAAA+AGG - Chr5:88415604-88415623 None:intergenic 20.0%
!! TCATGTTCAATTTGTAAAAA+TGG + Chr5:88417548-88417567 MsG0580028908.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTGTTAATTTTCAAAAGAT+GGG + Chr5:88416138-88416157 MsG0580028908.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTGTTAATTTTCAAAAGA+TGG + Chr5:88416137-88416156 MsG0580028908.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAGCTTTTAATAAACTTGA+AGG + Chr5:88415611-88415630 MsG0580028908.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGAACATGAAAAACATTTT+AGG - Chr5:88417538-88417557 None:intergenic 20.0%
! AAAAAAATACCTGCATATTC+TGG - Chr5:88417315-88417334 None:intergenic 25.0%
! AAACATGGTAATTTCAATAC+AGG + Chr5:88416744-88416763 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
! ACAGAGTATAAGATTAATCA+TGG - Chr5:88418420-88418439 None:intergenic 25.0%
! ATTTAGGAGGATTGAAAAAT+TGG + Chr5:88415794-88415813 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
! ATTTGTGCTTGATTAATCTT+GGG + Chr5:88417679-88417698 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
! TATTTGTGCTTGATTAATCT+TGG + Chr5:88417678-88417697 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
! TGGGAATACTAACTAAAAAT+TGG - Chr5:88417382-88417401 None:intergenic 25.0%
! TGTACATAATAATTGTAAGG+TGG + Chr5:88418304-88418323 MsG0580028908.01.T01:exon 25.0%
! TTCAGCGAGAAAAATATATT+GGG + Chr5:88416790-88416809 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
! TTGACTAATAACATGTTTCA+GGG + Chr5:88415900-88415919 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
! TTTCAGCGAGAAAAATATAT+TGG + Chr5:88416789-88416808 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTGATCAATATATTGACT+TGG + Chr5:88417425-88417444 MsG0580028908.01.T01:intron 25.0%
!! TAATGAAAGTGTGAAGATAA+CGG + Chr5:88416632-88416651 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAAGGGATAATTCTTTTAC+TGG + Chr5:88415828-88415847 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATTGGAAGTTTTGAGTTTA+AGG + Chr5:88415811-88415830 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGGAAGTTTTGAGTTTAA+GGG + Chr5:88415812-88415831 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAACTTGTTATCTTTTTTCA+TGG + Chr5:88418382-88418401 MsG0580028908.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TGTTGAGGTTGATAATATTA+AGG + Chr5:88415946-88415965 MsG0580028908.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGTGATGTTAAGCTTAG+TGG + Chr5:88415691-88415710 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
AAACCAGCAAAAAAATCACT+AGG - Chr5:88415420-88415439 None:intergenic 30.0%
AAACCTTCAAATATTCTCCT+TGG + Chr5:88417183-88417202 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTGATGTTAAGCTTAGT+GGG + Chr5:88415692-88415711 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
ACTAATGGGAACATTGATAT+GGG + Chr5:88416350-88416369 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
AGATATTCAAATGGTTGAAG+CGG + Chr5:88416720-88416739 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
ATATTGATGGAGCTTATAAC+CGG + Chr5:88417812-88417831 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGGATTACTTGTAGTAA+TGG + Chr5:88416105-88416124 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
CCTTATCTAAGTACATTCTT+CGG - Chr5:88417895-88417914 None:intergenic 30.0%
CTTCGTTGATATCAATTGTA+GGG - Chr5:88417940-88417959 None:intergenic 30.0%
CTTGACTAATAACATGTTTC+AGG + Chr5:88415899-88415918 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
CTTTAATCCATTAAACCCTT+TGG - Chr5:88415644-88415663 None:intergenic 30.0%
GAATATGACTTCTTTAACTG+AGG + Chr5:88415732-88415751 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
GACTATCACAGCATTTATTT+GGG - Chr5:88417401-88417420 None:intergenic 30.0%
GATTTAAGCTTAGCAAAATC+TGG - Chr5:88416183-88416202 None:intergenic 30.0%
GCTAATAATGCTAATGTGAA+AGG + Chr5:88415534-88415553 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCTAACAATCATCTCTT+CGG + Chr5:88416290-88416309 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
TAATTTCAATACAGGTTCTG+AGG + Chr5:88416752-88416771 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
TCAATTGAAACAAGAATTGC+AGG + Chr5:88417270-88417289 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
TCAGCGAGAAAAATATATTG+GGG + Chr5:88416791-88416810 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCGTTGATATCAATTGT+AGG - Chr5:88417941-88417960 None:intergenic 30.0%
TGAACCAGTGAGATTATTAT+CGG - Chr5:88416225-88416244 None:intergenic 30.0%
TGAATTAATCAACTAGCTAG+TGG - Chr5:88418559-88418578 None:intergenic 30.0%
TGACTATCACAGCATTTATT+TGG - Chr5:88417402-88417421 None:intergenic 30.0%
TTAACAGCATGAAGTTGTAA+AGG - Chr5:88417489-88417508 None:intergenic 30.0%
TTGGGATTACTTGTAGTAAT+GGG + Chr5:88416106-88416125 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
TTTCTAACAATCATCTCTTC+GGG + Chr5:88416291-88416310 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
! CTTCAATTCAACAACTTTTC+AGG + Chr5:88415321-88415340 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTTTGTGGTATCTTTGAT+TGG + Chr5:88416510-88416529 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
!! AAACTCTCTTCAAGTTTTCA+TGG + Chr5:88415368-88415387 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
!! CAAAGGGTTTAATGGATTAA+AGG + Chr5:88415642-88415661 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
!! TCTTGGTTTTCTGTTTGTTT+AGG + Chr5:88416535-88416554 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCTGTTTGTTTAGGATG+AGG + Chr5:88416541-88416560 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTTCAATCCTCCTAAATC+AGG - Chr5:88415793-88415812 None:intergenic 30.0%
!!! CGGTTTAAGGTTGTTTTTTA+GGG - Chr5:88415142-88415161 None:intergenic 30.0%
!!! TAAGTTGGTAAGGTTTTGAA+GGG - Chr5:88415289-88415308 None:intergenic 30.0%
!!! TGAAATTGCTGTTTTGACAA+AGG + Chr5:88416927-88416946 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGACTGGTATTTTGATTGAA+TGG + Chr5:88417616-88417635 MsG0580028908.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCCTAGTGATTTTTTTGC+TGG + Chr5:88415414-88415433 MsG0580028908.01.T01:CDS 30.0%
AAAAATATATTGGGGCAAGG+AGG + Chr5:88416799-88416818 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
AATGTGATTGTGAGCACTAA+TGG + Chr5:88416335-88416354 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
ACAAGAATTGCAGGAACTTT+CGG + Chr5:88417279-88417298 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
ACATTCAATTGAGTTAGCAC+AGG - Chr5:88416272-88416291 None:intergenic 35.0%
ACCTCATCACTGAAAAAATC+AGG - Chr5:88415567-88415586 None:intergenic 35.0%
ACGAATGCTGAAGACATATA+TGG + Chr5:88418093-88418112 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAAAGAATGATGTGTG+GGG + Chr5:88416870-88416889 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
ATCACATTGCTCCTAAAACT+CGG - Chr5:88416323-88416342 None:intergenic 35.0%
ATGCATTAGTTATTCACCCT+CGG + Chr5:88416595-88416614 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGATTGTGAGCACTAAT+GGG + Chr5:88416336-88416355 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTCTTCTTTCGGTTGTT+GGG + Chr5:88416020-88416039 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAATCTTCTTCGCATGT+GGG + Chr5:88416460-88416479 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
CACTAATGGGAACATTGATA+TGG + Chr5:88416349-88416368 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGAAAAGAATGATGTGT+GGG + Chr5:88416869-88416888 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
CATCAACTTTAGTTGTCACA+CGG - Chr5:88417775-88417794 None:intergenic 35.0%
CCGAAGAATGTACTTAGATA+AGG + Chr5:88417892-88417911 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
CTAATAACATGTTTCAGGGA+CGG + Chr5:88415904-88415923 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
CTTGTGGTAAAGATAAGTCA+AGG - Chr5:88418125-88418144 None:intergenic 35.0%
GAGAAAAATATATTGGGGCA+AGG + Chr5:88416796-88416815 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTTAAACCGTTTAAGCT+TGG - Chr5:88415354-88415373 None:intergenic 35.0%
GATATCAATTGTAGGGTCAA+TGG - Chr5:88417933-88417952 None:intergenic 35.0%
GATATTCAAATGGTTGAAGC+GGG + Chr5:88416721-88416740 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
GATTAAAGGTAGAGTCTTTG+TGG + Chr5:88415656-88415675 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
GGGTGAATAACTAATGCATT+TGG - Chr5:88416594-88416613 None:intergenic 35.0%
GTAAAATCGGCAAATCCATA+CGG - Chr5:88418252-88418271 None:intergenic 35.0%
GTTTGTGTGTTATCCAAACT+TGG - Chr5:88418213-88418232 None:intergenic 35.0%
TAAAATCGGCAAATCCATAC+GGG - Chr5:88418251-88418270 None:intergenic 35.0%
TAATGGTACCAATGCAAGTA+CGG + Chr5:88416409-88416428 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
TATGTCTTCAGCATTCGTAT+CGG - Chr5:88418091-88418110 None:intergenic 35.0%
TCTTCCGATAATAATCTCAC+TGG + Chr5:88416218-88416237 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
TGACTTCTTTAACTGAGGTT+TGG + Chr5:88415737-88415756 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
TGAGATGGGAGATATTCAAA+TGG + Chr5:88416711-88416730 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
TTGATTGTGTTAGCTGTGAT+TGG + Chr5:88416484-88416503 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
TTTCAAAAGATGGGTCTTAC+TGG + Chr5:88416147-88416166 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
! ACTCTGTGTAACACTTGTTA+AGG + Chr5:88418433-88418452 MsG0580028908.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! CAGCTTTGGTGTAATATTGA+TGG + Chr5:88417799-88417818 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGTTGATGTGTTCAGCTT+TGG + Chr5:88417785-88417804 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCTCTAAGTGTTGTAAGT+TGG - Chr5:88415304-88415323 None:intergenic 35.0%
!! AGAAGCATCTTTCAAAGACA+CGG - Chr5:88415496-88415515 None:intergenic 35.0%
!! ATTTTTAATTGGCCAGACGA+AGG + Chr5:88417051-88417070 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
!! CTAAGTGTTGTAAGTTGGTA+AGG - Chr5:88415299-88415318 None:intergenic 35.0%
!! TTGCAGTCTAATGGGTTTAA+TGG + Chr5:88415760-88415779 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
!!! ACCTGATTTTTTCAGTGATG+AGG + Chr5:88415563-88415582 MsG0580028908.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTGCCGATTTTACATCAG+CGG + Chr5:88418257-88418276 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCGGTTTAAGGTTGTTTTTT+AGG - Chr5:88415143-88415162 None:intergenic 35.0%
!!! GGTTTTGGAACGGTTTATAA+AGG + Chr5:88416820-88416839 MsG0580028908.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTAAGTTGGTAAGGTTTTGA+AGG - Chr5:88415290-88415309 None:intergenic 35.0%
AAACCGTTTAAGCTTGGAAG+TGG - Chr5:88415348-88415367 None:intergenic 40.0%
AAGAAATGGCAGGCTTATGA+AGG + Chr5:88418150-88418169 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
AATATCTCCCATCTCACTGT+TGG - Chr5:88416707-88416726 None:intergenic 40.0%
AATCCTCCTAAATCAGGCAA+AGG - Chr5:88415787-88415806 None:intergenic 40.0%
AATGGTACCAATGCAAGTAC+GGG + Chr5:88416410-88416429 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
AATGGTCCTTTGCCTGATTT+AGG + Chr5:88415778-88415797 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
ACCATCCGCTGATGTAAAAT+CGG - Chr5:88418265-88418284 None:intergenic 40.0%
AGATAGTCGTTTGCATGTCA+GGG - Chr5:88417737-88417756 None:intergenic 40.0%
AGTAACCAAGAAGAGCAACA+AGG - Chr5:88416966-88416985 None:intergenic 40.0%
ATATCTCCCATCTCACTGTT+GGG - Chr5:88416706-88416725 None:intergenic 40.0%
ATCTTCGCTTCTTCCAAGTT+TGG + Chr5:88418197-88418216 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
CAACTCTCAGCAAACCTTAA+AGG - Chr5:88416058-88416077 None:intergenic 40.0%
CGTGTCACAAGAATCCAAAT+CGG + Chr5:88415231-88415250 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTTCTCTTGTCGAACAA+TGG + Chr5:88418058-88418077 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
GAAACATGGGTCCATTTACA+TGG - Chr5:88415195-88415214 None:intergenic 40.0%
GAACTAACATGCTTTCCTCT+TGG + Chr5:88417589-88417608 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
GATGTTCTTCTTTCGGTTGT+TGG + Chr5:88416019-88416038 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAAATCTTCTTCGCATG+TGG + Chr5:88416459-88416478 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
GCAGTGAAAAGAATGATGTG+TGG + Chr5:88416868-88416887 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
GGCAAAGTAGTAAGCTCATT+CGG - Chr5:88416251-88416270 None:intergenic 40.0%
GTAGAGTCTTTGTGGTTGAA+TGG + Chr5:88415664-88415683 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TAAATGCAAAAGGGCAAACC+AGG - Chr5:88415594-88415613 None:intergenic 40.0%
TACCACAAGCACTCAAGAAA+TGG + Chr5:88418136-88418155 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TAGGGTGGATGTTCTTCTTT+CGG + Chr5:88416012-88416031 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TATAAAGGCGAACTCCATGA+TGG + Chr5:88416835-88416854 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TCAATTGAAGCTTTCCCTTC+TGG - Chr5:88417258-88417277 None:intergenic 40.0%
TCGCCAAGGAGAATATTTGA+AGG - Chr5:88417189-88417208 None:intergenic 40.0%
TGGGAACATTGATATGGGTA+AGG + Chr5:88416355-88416374 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTTGCCAAAGGGTTTAA+TGG + Chr5:88415634-88415653 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
TGTTCTTCTTTCGGTTGTTG+GGG + Chr5:88416021-88416040 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
TTAAGTCCAACCAACGAACT+AGG - Chr5:88415861-88415880 None:intergenic 40.0%
TTCTTGGTTACTGCTTGGAT+GGG + Chr5:88416974-88416993 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTTTGGTTGCAGTCTAAT+GGG + Chr5:88415752-88415771 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
! ATGATAACCCTTTTGAGCCA+TGG + Chr5:88415465-88415484 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
! CGATTTGGATTCTTGTGACA+CGG - Chr5:88415233-88415252 None:intergenic 40.0%
! GTACTTGCATTGGTACCATT+AGG - Chr5:88416410-88416429 None:intergenic 40.0%
! TGATAACCCTTTTGAGCCAT+GGG + Chr5:88415466-88415485 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
! TTATGAAGGTGCAAGTCAAC+TGG + Chr5:88418164-88418183 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
! TTCAGTGATGAGGTTTTTCC+TGG + Chr5:88415573-88415592 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
! TTTTGACAAAGGTTCGTCAC+CGG + Chr5:88416938-88416957 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTAAGGTTTGCTGAGAGT+TGG + Chr5:88416056-88416075 MsG0580028908.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTATCTTTGATTGGTCTCT+TGG + Chr5:88416518-88416537 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
!! TTGGGTGTTCGTTGATTTGT+CGG + Chr5:88417697-88417716 MsG0580028908.01.T01:intron 40.0%
!!! GTAAGGTTTTGAAGGGTTTG+AGG - Chr5:88415282-88415301 None:intergenic 40.0%
AAAATGGCTACGCGTGTCTT+CGG + Chr5:88417564-88417583 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
AACTTTAGTTGTCACACGGC+CGG - Chr5:88417771-88417790 None:intergenic 45.0%
AATACCAGTCACACTCCAAG+AGG - Chr5:88417607-88417626 None:intergenic 45.0%
AATCCCAATCCAACCAACAC+AGG - Chr5:88416094-88416113 None:intergenic 45.0%
AATCTCTTATTCCACCCGAG+TGG - Chr5:88417084-88417103 None:intergenic 45.0%
AATGCAAGTACGGGAAATGG+TGG + Chr5:88416419-88416438 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
AATGGTTGAAGCGGGAAACA+TGG + Chr5:88416729-88416748 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
ACAAGCACTCAAGAAATGGC+AGG + Chr5:88418140-88418159 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
ACCAATGCAAGTACGGGAAA+TGG + Chr5:88416416-88416435 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
ACCATTTCCCGTACTTGCAT+TGG - Chr5:88416420-88416439 None:intergenic 45.0%
ACTCGGGTGGAATAAGAGAT+TGG + Chr5:88417083-88417102 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
AGATAAGGACACATTCCGCA+AGG + Chr5:88417907-88417926 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
AGTATACCTAATCGCCCGTA+TGG + Chr5:88418234-88418253 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCGTTAGATGTTGCAAG+GGG + Chr5:88417108-88417127 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
ATGATGTGTGGGGCAATAGT+TGG + Chr5:88416880-88416899 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
ATGCAAGTACGGGAAATGGT+GGG + Chr5:88416420-88416439 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
CAAGTGAAAGAGGCGGTTTA+AGG - Chr5:88415155-88415174 None:intergenic 45.0%
CACACTGTAGCTGAATTAGC+TGG + Chr5:88417977-88417996 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
CAGATAGTCGTTTGCATGTC+AGG - Chr5:88417738-88417757 None:intergenic 45.0%
CATCGCGTTAGATGTTGCAA+GGG + Chr5:88417107-88417126 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
CCATATCAAAGGCCTGACAT+GGG + Chr5:88418019-88418038 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
CTTAAACCGCCTCTTTCACT+TGG + Chr5:88415153-88415172 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
CTTCTTGGTTACTGCTTGGA+TGG + Chr5:88416973-88416992 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGAAGAACATCCACCCT+AGG - Chr5:88416013-88416032 None:intergenic 45.0%
GACTATCTGCTTGCAGTTAC+CGG + Chr5:88417749-88417768 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
GAGGCAGAAGAAGTTAAGCA+GGG + Chr5:88416560-88416579 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GGATGGTAGATGATCATGCT+TGG + Chr5:88418278-88418297 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GGTCCACTTCCAAGCTTAAA+CGG + Chr5:88415342-88415361 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GTACCATTAGGAGACAACGA+AGG - Chr5:88416398-88416417 None:intergenic 45.0%
GTTCTTCTTTCGGTTGTTGG+GGG + Chr5:88416022-88416041 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTTCCTAGTTCGTTGGT+TGG + Chr5:88415852-88415871 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
GTTTATGAGTACATGCCGCA+GGG + Chr5:88417012-88417031 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGCATGTCAGGGTTAAG+AGG - Chr5:88417729-88417748 None:intergenic 45.0%
TACTTGGCACCAGAATATGC+AGG + Chr5:88417303-88417322 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TATCTGATCCAGAATGCCGA+GGG - Chr5:88416614-88416633 None:intergenic 45.0%
TCAACACCAGCACCAAAAAC+CGG - Chr5:88415932-88415951 None:intergenic 45.0%
TCACCTTCGTTGTCTCCTAA+TGG + Chr5:88416392-88416411 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TCATCGCGTTAGATGTTGCA+AGG + Chr5:88417106-88417125 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGGTGATTGTGATCCTA+GGG + Chr5:88415994-88416013 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TCTCCTTGGCGATGATATGA+GGG + Chr5:88417197-88417216 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TCTTCAGCATTCGTATCGGA+TGG - Chr5:88418087-88418106 None:intergenic 45.0%
TGAGGCAGAAGAAGTTAAGC+AGG + Chr5:88416559-88416578 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TGATGTGTGGGGCAATAGTT+GGG + Chr5:88416881-88416900 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGGAACTTTCGGATACT+TGG + Chr5:88417287-88417306 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TGCTCTTCTTGGTTACTGCT+TGG + Chr5:88416969-88416988 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TGGGTCCATTTACATGGATC+CGG - Chr5:88415189-88415208 None:intergenic 45.0%
TGTTGAGTACCTCCATAGCT+TGG + Chr5:88417131-88417150 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TGTTTATGAGTACATGCCGC+AGG + Chr5:88417011-88417030 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TTATCTGATCCAGAATGCCG+AGG - Chr5:88416615-88416634 None:intergenic 45.0%
TTCTCCTTGGCGATGATATG+AGG + Chr5:88417196-88417215 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TTCTTCGGAACCATGCTACA+AGG - Chr5:88417880-88417899 None:intergenic 45.0%
TTTATGAGTACATGCCGCAG+GGG + Chr5:88417013-88417032 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
TTTGATGAGCCAAGCTATGG+AGG - Chr5:88417143-88417162 None:intergenic 45.0%
! AATGGTGGGAGTTCGGAAAA+TGG + Chr5:88416434-88416453 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTGAAGGTGTGTTGCCAA+AGG + Chr5:88415625-88415644 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
! AGCTTTGATGAGCCAAGCTA+TGG - Chr5:88417146-88417165 None:intergenic 45.0%
! AGTGTGAAGATAACGGTTGC+AGG + Chr5:88416639-88416658 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
! ATATTGGGGCAAGGAGGTTT+TGG + Chr5:88416805-88416824 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGAAGGTGTGTTGCCAAA+GGG + Chr5:88415626-88415645 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
! GAGGTTTGGTTGCAGTCTAA+TGG + Chr5:88415751-88415770 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
! GGGGTATGGGTTATCCTTTA+AGG + Chr5:88416041-88416060 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
! GTCGTCAAGTGCTTTTCTTC+CGG - Chr5:88417834-88417853 None:intergenic 45.0%
! GTGTGAAGATAACGGTTGCA+GGG + Chr5:88416640-88416659 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
! TGCCATTTCTTGAGTGCTTG+TGG - Chr5:88418141-88418160 None:intergenic 45.0%
!! AAGGTTTGCTGAGAGTTGGA+AGG + Chr5:88416060-88416079 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! AGCTTTTGTTTGCCTAGTCC+TGG + Chr5:88415977-88415996 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGTTTGCTGAGAGTTGGAA+GGG + Chr5:88416061-88416080 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTCAAGTTTTCATGGCGAG+TGG + Chr5:88415375-88415394 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! GATCCTGTGTTGGTTGGATT+GGG + Chr5:88416088-88416107 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! TGATCCTGTGTTGGTTGGAT+TGG + Chr5:88416087-88416106 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGTGTTGTTCCTAGTTCGT+TGG + Chr5:88415848-88415867 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
!!! CTGTGATTGGTGCTGTTTTG+TGG + Chr5:88416497-88416516 MsG0580028908.01.T01:intron 45.0%
!!! TCGGGAAAGTACCGAGTTTT+AGG + Chr5:88416309-88416328 MsG0580028908.01.T01:CDS 45.0%
AACCGCCTCTTTCACTTGGT+TGG + Chr5:88415157-88415176 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
ACAGCATGCACCTTGTAGCA+TGG + Chr5:88417867-88417886 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
ACCCTAGGATCACAATCACC+AGG - Chr5:88415998-88416017 None:intergenic 50.0%
ACCGTACCCAACAGTGAGAT+GGG + Chr5:88416697-88416716 MsG0580028908.01.T01:intron 50.0%
ACTTGACGACAGTCAACCTG+AGG + Chr5:88417844-88417863 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
AGCTGGTCATTGCAGTGCAA+GGG + Chr5:88417994-88418013 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
CAAGAAGAGCAACAAGGTGC+CGG - Chr5:88416960-88416979 None:intergenic 50.0%
CCATTTACATGGATCCGGGT+CGG - Chr5:88415184-88415203 None:intergenic 50.0%
CCCATGTCAGGCCTTTGATA+TGG - Chr5:88418022-88418041 None:intergenic 50.0%
CTGCGATTCTCGTACCATCA+TGG - Chr5:88416852-88416871 None:intergenic 50.0%
CTTTCCTCTTGGAGTGTGAC+TGG + Chr5:88417600-88417619 MsG0580028908.01.T01:intron 50.0%
GAAGGGGAATGATCCTGTGT+TGG + Chr5:88416078-88416097 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
GACCAACCAAGTGAAAGAGG+CGG - Chr5:88415162-88415181 None:intergenic 50.0%
GCAAATCCATACGGGCGATT+AGG - Chr5:88418243-88418262 None:intergenic 50.0%
GCCATATCAAAGGCCTGACA+TGG + Chr5:88418018-88418037 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
GGATCACAATCACCAGGACT+AGG - Chr5:88415992-88416011 None:intergenic 50.0%
GGATCTCCCATGGCTCAAAA+GGG - Chr5:88415475-88415494 None:intergenic 50.0%
GGGTCCATTTACATGGATCC+GGG - Chr5:88415188-88415207 None:intergenic 50.0%
GGTCCTTTGCCTGATTTAGG+AGG + Chr5:88415781-88415800 MsG0580028908.01.T01:intron 50.0%
GTCCTGGTGATTGTGATCCT+AGG + Chr5:88415993-88416012 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
GTCGTCGGAGCATGAAACAT+GGG - Chr5:88415208-88415227 None:intergenic 50.0%
GTGCAAGGGAGCCATATCAA+AGG + Chr5:88418008-88418027 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
GTTATTCACCCTCGGCATTC+TGG + Chr5:88416603-88416622 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TAGCTGGTCATTGCAGTGCA+AGG + Chr5:88417993-88418012 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TAGTGCGTCTTGCTCCAGAA+GGG + Chr5:88417241-88417260 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TCAAAGACACGGATCTCCCA+TGG - Chr5:88415485-88415504 None:intergenic 50.0%
TCCCATCTCACTGTTGGGTA+CGG - Chr5:88416701-88416720 None:intergenic 50.0%
TCGGACCAACCAAGTGAAAG+AGG - Chr5:88415165-88415184 None:intergenic 50.0%
TCTTGTGACACGGTTGTCGT+CGG - Chr5:88415223-88415242 None:intergenic 50.0%
TCTTTCGGTTGTTGGGGGTA+TGG + Chr5:88416027-88416046 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TGGCGATGATATGAGGGCAA+AGG + Chr5:88417203-88417222 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TGGTGATTGTGATCCTAGGG+TGG + Chr5:88415997-88416016 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TGTCGTCGGAGCATGAAACA+TGG - Chr5:88415209-88415228 None:intergenic 50.0%
TGTGGGGCAATAGTTGGGAA+GGG + Chr5:88416886-88416905 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
TTAACCGCATGACCCATGTC+AGG - Chr5:88418034-88418053 None:intergenic 50.0%
TTGCCCTCATATCATCGCCA+AGG - Chr5:88417203-88417222 None:intergenic 50.0%
! AGGGCAAAGGTCGCAGATTT+TGG + Chr5:88417216-88417235 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
! CTTTCGGTTGTTGGGGGTAT+GGG + Chr5:88416028-88416047 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
! GGGAATGATCCTGTGTTGGT+TGG + Chr5:88416082-88416101 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
! TACGGGAAATGGTGGGAGTT+CGG + Chr5:88416427-88416446 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
! TGAAGATAACGGTTGCAGGG+CGG + Chr5:88416643-88416662 MsG0580028908.01.T01:intron 50.0%
! TTGTAGGGTCAATGGCCTTG+CGG - Chr5:88417925-88417944 None:intergenic 50.0%
!! GCCGATTTTACATCAGCGGA+TGG + Chr5:88418261-88418280 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTTTGCTGAGAGTTGGAAG+GGG + Chr5:88416062-88416081 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
!!! GGTTTTTGGTGCTGGTGTTG+AGG + Chr5:88415931-88415950 MsG0580028908.01.T01:CDS 50.0%
AAGGCCTGACATGGGTCATG+CGG + Chr5:88418027-88418046 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
ACAAGGTGCATGCTGTCCTC+AGG - Chr5:88417863-88417882 None:intergenic 55.0%
ACATGTTTCAGGGACGGTGC+CGG + Chr5:88415910-88415929 MsG0580028908.01.T01:intron 55.0%
ACGAAGGACTCGAACCACTC+GGG + Chr5:88417067-88417086 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
AGTGGTTCGAGTCCTTCGTC+TGG - Chr5:88417066-88417085 None:intergenic 55.0%
ATCGGTCGCCAGAATCTCCA+CGG + Chr5:88415249-88415268 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
CACCGTACCCAACAGTGAGA+TGG + Chr5:88416696-88416715 MsG0580028908.01.T01:intron 55.0%
CCGACCCGGATCCATGTAAA+TGG + Chr5:88415181-88415200 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
CGGATCTCCCATGGCTCAAA+AGG - Chr5:88415476-88415495 None:intergenic 55.0%
CGGCACCTTGTTGCTCTTCT+TGG + Chr5:88416958-88416977 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
CTAGTGCGTCTTGCTCCAGA+AGG + Chr5:88417240-88417259 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
GACGAAGGACTCGAACCACT+CGG + Chr5:88417066-88417085 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
GGAGATTCTGGCGACCGATT+TGG - Chr5:88415248-88415267 None:intergenic 55.0%
GGTGGGAGTTCGGAAAATGG+CGG + Chr5:88416437-88416456 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
GTGTGGGGCAATAGTTGGGA+AGG + Chr5:88416885-88416904 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
TACCTACTTAGGGTCCCCTG+CGG - Chr5:88417030-88417049 None:intergenic 55.0%
! TTCACTTGGTTGGTCCGACC+CGG + Chr5:88415167-88415186 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAGAGTGCCGTGGAGATTC+TGG - Chr5:88415260-88415279 None:intergenic 55.0%
!!! GGGGCAAGGAGGTTTTGGAA+CGG + Chr5:88416810-88416829 MsG0580028908.01.T01:CDS 55.0%
AAGGACTCGAACCACTCGGG+TGG + Chr5:88417070-88417089 MsG0580028908.01.T01:CDS 60.0%
ATGGCTACGCGTGTCTTCGG+AGG + Chr5:88417567-88417586 MsG0580028908.01.T01:intron 60.0%
TTGCAGGGCGGTGAGTGTGT+TGG + Chr5:88416655-88416674 MsG0580028908.01.T01:intron 60.0%
!! GGGTTTGAGGAAGAGTGCCG+TGG - Chr5:88415269-88415288 None:intergenic 60.0%
!!! ACGGTGCCGGTTTTTGGTGC+TGG + Chr5:88415923-88415942 MsG0580028908.01.T01:CDS 60.0%
!!! TCAGGGACGGTGCCGGTTTT+TGG + Chr5:88415917-88415936 MsG0580028908.01.T01:intron 60.0%
CAGGGCGGTGAGTGTGTTGG+AGG + Chr5:88416658-88416677 MsG0580028908.01.T01:intron 65.0%
TGCCGCAGGGGACCCTAAGT+AGG + Chr5:88417025-88417044 MsG0580028908.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 88415132 88418600 88415132 ID=MsG0580028908.01;Name=MsG0580028908.01
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