AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029922.01


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MsG0580029922.01.T03 AT1G30420 30.478 1296 775 24 23 1222 203 1468 3.44e-178 566
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MsG0580029922.01.T03 AT1G30410 30.310 1290 781 24 25 1222 90 1353 1.25e-172 548
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MsG0580029922.01.T03 AT1G30410 30.371 1294 775 26 25 1222 205 1468 2.01e-171 548
MsG0580029922.01.T03 AT1G30410 30.371 1294 775 26 25 1222 205 1468 2.01e-171 548
MsG0580029922.01.T03 AT1G30410 30.448 1294 777 26 25 1222 205 1471 1.10e-170 546
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MsG0580029922.01.T03 AT2G07680 30.088 1253 735 24 58 1222 198 1397 4.51e-158 510
MsG0580029922.01.T03 AT2G07680 30.088 1253 735 24 58 1222 201 1400 6.18e-158 509
MsG0580029922.01.T03 AT2G07680 30.088 1253 735 24 58 1222 207 1406 9.76e-158 509
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MsG0580029922.01.T03 AT1G30410 28.957 1150 708 23 25 1095 205 1324 3.21e-139 458
MsG0580029922.01.T03 AT1G71330 55.312 320 94 4 503 783 3 312 3.01e-103 330
MsG0580029922.01.T03 AT2G07680 28.485 990 617 20 58 978 198 1165 6.10e-100 345
MsG0580029922.01.T03 AT1G30420 27.790 896 549 19 20 841 200 1071 6.84e-93 323
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MsG0580029922.01.T03 AT3G62150 29.707 239 147 4 1004 1222 401 638 1.40e-30 132
MsG0580029922.01.T03 AT3G62150 27.099 262 162 5 989 1222 1028 1288 1.96e-26 118
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MsG0580029922.01.T03 AT4G25450 26.800 250 125 6 447 648 474 713 1.71e-12 72.4
MsG0580029922.01.T03 AT1G70610 26.102 295 187 8 958 1230 411 696 4.20e-22 103
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MsG0580029922.01.T02 AT1G30410 30.310 1290 781 24 25 1222 90 1353 1.25e-172 548
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MsG0580029922.01.T02 AT1G30410 30.371 1294 775 26 25 1222 205 1468 2.01e-171 548
MsG0580029922.01.T02 AT1G30410 30.448 1294 777 26 25 1222 205 1471 1.10e-170 546
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MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.870 239 149 3 1004 1222 382 619 2.25e-30 130
MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.169 284 125 7 395 632 359 609 1.45e-15 82.8
MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.870 239 149 3 1004 1222 382 619 2.29e-30 130
MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.169 284 125 7 395 632 359 609 1.30e-15 82.8
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MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.169 284 125 7 395 632 359 609 1.50e-15 82.8
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MsG0580029922.01.T02 AT2G47000 28.169 284 125 7 395 632 359 609 1.91e-15 82.4
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MsG0580029922.01.T02 AT3G28360 23.810 420 239 15 289 646 824 1224 1.06e-13 76.6
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MsG0580029922.01.T02 AT1G28010 26.132 287 151 8 404 641 332 606 1.29e-16 86.3
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MsG0580029922.01.T02 AT2G36910 28.462 260 124 7 443 650 368 617 5.27e-15 81.3
MsG0580029922.01.T02 AT2G36910 30.043 233 105 9 453 636 1030 1253 1.93e-14 79.3
MsG0580029922.01.T02 AT3G28345 30.252 238 147 4 1004 1222 357 594 6.33e-25 113
MsG0580029922.01.T02 AT3G28345 26.168 428 259 15 822 1211 813 1221 2.59e-23 108
MsG0580029922.01.T02 AT3G28345 24.247 598 323 25 125 634 669 1224 6.38e-15 80.9
MsG0580029922.01.T02 AT3G28345 28.455 246 119 6 443 641 359 594 2.37e-14 79.0
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MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 23.624 436 260 10 822 1211 794 1202 5.16e-24 110
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 22.511 462 283 11 269 676 162 602 3.52e-18 91.3
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 22.359 407 231 11 291 634 821 1205 2.45e-12 72.4
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 27.211 294 187 7 962 1232 305 594 1.27e-24 112
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 23.624 436 260 10 822 1211 802 1210 5.22e-24 110
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 22.511 462 283 11 269 676 170 610 2.88e-18 91.7
MsG0580029922.01.T02 AT3G28415 22.359 407 231 11 291 634 829 1213 2.14e-12 72.4
MsG0580029922.01.T02 AT3G28390 30.544 239 145 5 1004 1222 345 582 3.16e-24 111
MsG0580029922.01.T02 AT3G28390 24.654 434 258 14 822 1211 798 1206 5.39e-24 110
MsG0580029922.01.T02 AT3G28390 24.295 461 273 13 269 676 171 608 8.87e-20 96.7
MsG0580029922.01.T02 AT3G28390 23.133 415 228 14 298 645 832 1222 2.08e-14 79.0
MsG0580029922.01.T02 AT1G70610 26.102 295 187 8 958 1230 230 515 9.18e-23 104
MsG0580029922.01.T02 AT4G25450 29.675 246 141 5 1004 1223 299 538 1.00e-22 104
MsG0580029922.01.T02 AT4G25450 26.800 250 125 6 447 648 305 544 2.03e-12 72.0
MsG0580029922.01.T02 AT4G25450 29.675 246 141 5 1004 1223 468 707 1.40e-22 105
MsG0580029922.01.T02 AT4G25450 26.800 250 125 6 447 648 474 713 1.71e-12 72.4
MsG0580029922.01.T02 AT1G70610 26.102 295 187 8 958 1230 411 696 4.20e-22 103
MsG0580029922.01.T02 AT1G10680 24.078 461 299 17 794 1222 155 596 1.23e-21 102
MsG0580029922.01.T02 AT1G10680 30.734 218 95 6 461 632 379 586 2.06e-15 82.4
MsG0580029922.01.T02 AT1G10680 25.543 184 116 3 1004 1167 980 1162 2.97e-15 82.0
MsG0580029922.01.T02 AT5G39040 28.571 287 143 7 414 654 374 644 2.22e-20 97.8
MsG0580029922.01.T02 AT5G39040 26.201 229 147 4 1004 1211 394 621 6.40e-20 96.3
MsG0580029922.01.T02 AT2G39480 30.942 223 130 7 1003 1203 975 1195 3.65e-18 91.3
MsG0580029922.01.T02 AT2G39480 26.840 231 141 5 1004 1211 230 455 1.79e-16 85.9
MsG0580029922.01.T02 AT2G39480 30.942 223 130 7 1003 1203 1155 1375 4.00e-18 91.3
MsG0580029922.01.T02 AT2G39480 26.840 231 141 5 1004 1211 410 635 1.99e-16 85.9
MsG0580029922.01.T02 AT1G67940 29.108 213 134 5 1014 1210 36 247 2.96e-17 83.6
MsG0580029922.01.T02 AT3G55320 28.455 246 152 7 987 1210 1140 1383 1.30e-16 86.3
MsG0580029922.01.T02 AT3G55320 26.923 234 137 6 1004 1211 412 637 3.22e-16 85.1

Find 13 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 768 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTGATGAAGACGAAAATTT+TGG 0.076851 5:-104006859 MsG0580029922.01.T01:intron
TTTCTATTAAACATGCTTAA+TGG 0.195848 5:+104006792 None:intergenic
TCGGACAGTGGACTTCTATC+AGG 0.301962 5:+104006890 None:intergenic
AAATGTAATATATAAGAATA+AGG 0.346798 5:-104006772 MsG0580029922.01.T01:three_prime_UTR
CTCCCCAACGACATTGTTAG+AGG 0.406047 5:-104006992 MsG0580029922.01.T01:CDS
CTAACAAAATTCTTCAGCCT+TGG 0.417872 5:+104006721 None:intergenic
TATCCTCTAACAATGTCGTT+GGG 0.432897 5:+104006989 None:intergenic
TATTGGTGTAGGACTTATTG+AGG 0.479421 5:-104007022 MsG0580029922.01.T01:intron
AAAATTTGAGTTGGACCTCA+TGG 0.489103 5:+104006930 None:intergenic
CGGACAGTGGACTTCTATCA+GGG 0.563087 5:+104006891 None:intergenic
TTATCCTCTAACAATGTCGT+TGG 0.571626 5:+104006988 None:intergenic
ATCCTCTAACAATGTCGTTG+GGG 0.623654 5:+104006990 None:intergenic
TTGTTGCAGAGTATACCATG+AGG 0.786356 5:-104006945 MsG0580029922.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! AAAATTAAATAGAAATTAGT+TGG + Chr5:104005331-104005350 None:intergenic 10.0%
!! AAATGTAATATATAAGAATA+AGG - Chr5:104014347-104014366 MsG0580029922.01.T01:intron 10.0%
!! AATTGAATAAAATAATGATT+TGG + Chr5:104007731-104007750 None:intergenic 10.0%
!! ATAAAAATTGAAAAGAAAAA+AGG - Chr5:104005021-104005040 MsG0580029922.01.T01:intron 10.0%
!! TATTTGTTTACAAAAAAAAA+GGG + Chr5:104013579-104013598 None:intergenic 10.0%
!! TCAAAAAAAAAAAAAGTAAT+AGG - Chr5:104007026-104007045 MsG0580029922.01.T01:intron 10.0%
!! TTATAGGTAAATTAATTTAA+AGG - Chr5:104006160-104006179 MsG0580029922.01.T01:intron 10.0%
!!! AAATATTTAAGATTTAAGTT+AGG + Chr5:104006413-104006432 None:intergenic 10.0%
!!! ATATAATGACATAATTTTAT+TGG - Chr5:104010795-104010814 MsG0580029922.01.T01:CDS 10.0%
!!! ATTACTTTTTTTTTTTTTGA+AGG + Chr5:104007026-104007045 None:intergenic 10.0%
!!! TAAATTTGTAATTTTATTTG+AGG + Chr5:104007210-104007229 None:intergenic 10.0%
!! AAACAACATAAAATAAATGA+TGG - Chr5:104006756-104006775 MsG0580029922.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!! AAATATGAGAAATACTTAAT+CGG - Chr5:104004788-104004807 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! AAATGCTATTAAAATTAAGT+AGG - Chr5:104015696-104015715 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! AAATGCTATTAAAATTAAGT+AGG + Chr5:104015715-104015696 None:intergenic 15.0%
!! AAATTAAATTGAATTGAGTA+GGG - Chr5:104015635-104015654 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! AATGCTATTAAAATTAAGTA+GGG - Chr5:104015697-104015716 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! AATGCTATTAAAATTAAGTA+GGG + Chr5:104015716-104015697 None:intergenic 15.0%
!! ACCTCAAAATATTATTAATT+GGG - Chr5:104006613-104006632 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! AGAACCAAAAAATATTTAAA+AGG + Chr5:104012851-104012870 None:intergenic 15.0%
!! AGATAAAAAGTAATAAAATC+TGG - Chr5:104015513-104015532 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! CATCATATAGTTATAAAAAT+TGG + Chr5:104008071-104008090 None:intergenic 15.0%
!! CTATTTGTTTACAAAAAAAA+AGG + Chr5:104013580-104013599 None:intergenic 15.0%
!! GTATAACATTTGTAATTTAA+GGG - Chr5:104016267-104016286 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! GTCTAATATGAAAAATATTT+GGG + Chr5:104005369-104005388 None:intergenic 15.0%
!! TAAATATTATATGCTGTATT+TGG + Chr5:104013628-104013647 None:intergenic 15.0%
!! TAAATTAAATTGAATTGAGT+AGG - Chr5:104015634-104015653 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! TAACAATATAACATCATTAT+AGG - Chr5:104006144-104006163 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! TACATTTAACTGAAAATATT+TGG + Chr5:104005304-104005323 None:intergenic 15.0%
!! TGTATAACATTTGTAATTTA+AGG - Chr5:104016266-104016285 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!! TGTCTAATATGAAAAATATT+TGG + Chr5:104005370-104005389 None:intergenic 15.0%
!! TTATATATAAATATGCAGTT+TGG + Chr5:104005845-104005864 None:intergenic 15.0%
!! TTGTCATTAATTTATAATGA+TGG - Chr5:104011119-104011138 MsG0580029922.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAAAACAAATTGCTTTTATA+AGG - Chr5:104015831-104015850 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!!! AAATTTTGCAATAATTTTTG+CGG - Chr5:104015547-104015566 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!!! AATTTTTAATATAAGGGATT+TGG + Chr5:104006240-104006259 None:intergenic 15.0%
!!! ACACAAATGTTTATTTTTTT+TGG - Chr5:104007373-104007392 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTAATTTTGTATTTGTGT+GGG - Chr5:104005341-104005360 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTACTATTTTATTAAGATA+TGG + Chr5:104007635-104007654 None:intergenic 15.0%
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!!! TAAAAATTGGATTTTTTTGA+AGG + Chr5:104008058-104008077 None:intergenic 15.0%
!!! TATTTAATTTTGTATTTGTG+TGG - Chr5:104005340-104005359 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTTATTAAGATATGGTT+CGG + Chr5:104007630-104007649 None:intergenic 15.0%
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!!! TGTCTGAATTTTTAATATAA+GGG + Chr5:104006246-104006265 None:intergenic 15.0%
!!! TTGATTTTGTATAAAAATCT+AGG - Chr5:104009427-104009446 MsG0580029922.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTGGCTATAAATATTTTATT+AGG + Chr5:104005395-104005414 None:intergenic 15.0%
!!! TTGTCTGAATTTTTAATATA+AGG + Chr5:104006247-104006266 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTAAGAATAATTTTCCA+TGG - Chr5:104014619-104014638 MsG0580029922.01.T01:intron 15.0%
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!! AAATTGTTTGTTTAATTGTG+TGG - Chr5:104010984-104011003 MsG0580029922.01.T01:CDS 20.0%
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!!! AATTCTTATGTATGTCTTTT+CGG - Chr5:104005617-104005636 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
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!!! ACTTTAAACAAAGTGTTATT+AGG + Chr5:104008265-104008284 None:intergenic 20.0%
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!!! ATTTTCTTCTTCTAAAACAA+GGG + Chr5:104012745-104012764 None:intergenic 20.0%
!!! CAAATACTTTGATTTTATCA+TGG - Chr5:104014465-104014484 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTCATTTGATAACTTAAAA+TGG - Chr5:104010889-104010908 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
!!! GCTTCCTTTTAAATATTTTT+TGG - Chr5:104012844-104012863 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
!!! TATCCTTTAGAATAATTTGT+CGG - Chr5:104011873-104011892 MsG0580029922.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTTCTTCTTCTAAAACA+AGG + Chr5:104012746-104012765 None:intergenic 20.0%
!!! TCAAGTTTTTCTCTAAAAAT+TGG + Chr5:104008938-104008957 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTCATCAAGTTTTTATTT+CGG + Chr5:104014251-104014270 None:intergenic 20.0%
!!! TTGTTTTAGAAGAAGAAAAT+AGG - Chr5:104012745-104012764 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAAAGCGAAAAAAGATT+CGG + Chr5:104006384-104006403 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTCTTCCTCATTTTTA+AGG - Chr5:104012579-104012598 MsG0580029922.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTTTTTTCCATTCAGAT+AGG - Chr5:104006828-104006847 MsG0580029922.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
! AAAAGGTTATATGAGAATCA+AGG - Chr5:104009127-104009146 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
! AAACAAATAGTACATGCATT+TGG - Chr5:104013590-104013609 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! AAACTAAAGTTTCTCTTGAT+AGG - Chr5:104009878-104009897 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTGAAGGTCAAAACAAT+AGG + Chr5:104006277-104006296 None:intergenic 25.0%
! AACAAGATTCTCATATGAAT+TGG + Chr5:104010635-104010654 None:intergenic 25.0%
! AACAGCTTAAATTATTAGGA+AGG - Chr5:104005642-104005661 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! AAGCTGGTGAATTATTTATA+GGG + Chr5:104015771-104015790 None:intergenic 25.0%
! AAGGAAAAAATGTGATTACT+TGG + Chr5:104007907-104007926 None:intergenic 25.0%
! AATATTTAAAAGGAAGCAAC+AGG + Chr5:104012841-104012860 None:intergenic 25.0%
! AATGATATAGAGTTATTGCA+GGG + Chr5:104006640-104006659 None:intergenic 25.0%
! ACAAAAGAGTCAATAAGATA+AGG + Chr5:104009091-104009110 None:intergenic 25.0%
! ACAAGATTCTCATATGAATT+GGG + Chr5:104010634-104010653 None:intergenic 25.0%
! ACAGAAGGAAATAGAAATAA+GGG - Chr5:104015225-104015244 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ACAGCTTAAATTATTAGGAA+GGG - Chr5:104005643-104005662 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ACATAGGTAGGTTATATAAA+TGG - Chr5:104014568-104014587 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ACATCTGGAAGATTATAAAT+AGG + Chr5:104009841-104009860 None:intergenic 25.0%
! ACTTTACTTTCTTGTGTATT+GGG - Chr5:104010108-104010127 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAAAAAGGATTAAATGGT+AGG - Chr5:104005034-104005053 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! AGAATCAACATATCTACAAT+TGG - Chr5:104013216-104013235 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! AGGAAAAAATGTGATTACTT+GGG + Chr5:104007906-104007925 None:intergenic 25.0%
! AGTATCAAAAATAGGACTAT+AGG + Chr5:104015865-104015884 None:intergenic 25.0%
! AGTGCAGAAAAACAAAATTA+GGG - Chr5:104015668-104015687 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ATAAAATTCACTTGTGAAAG+AGG - Chr5:104005176-104005195 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ATAAATCTCAAAGTTTCTCA+TGG - Chr5:104010042-104010061 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ATACAAAACAAAAATCACAC+AGG - Chr5:104014717-104014736 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! ATATTCGGCTTAAAAATTTG+GGG + Chr5:104006354-104006373 None:intergenic 25.0%
! ATATTTAAAAGGAAGCAACA+GGG + Chr5:104012840-104012859 None:intergenic 25.0%
! ATCTTTGCAATTTCTAAGTA+TGG + Chr5:104016162-104016181 None:intergenic 25.0%
! ATGAGGAAGAAAAAATAACA+TGG + Chr5:104012574-104012593 None:intergenic 25.0%
! ATTATAATCAAACACGTACA+CGG + Chr5:104015898-104015917 None:intergenic 25.0%
! ATTTGGTATATAATCTGTGA+TGG + Chr5:104012130-104012149 None:intergenic 25.0%
! CAAATCTATATAACATAGGT+AGG - Chr5:104014556-104014575 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! CATACTACAAAATAGTTATC+AGG - Chr5:104010538-104010557 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! CCTATGTTATATAGATTTGA+AGG + Chr5:104014555-104014574 None:intergenic 25.0%
! CCTTCAAATCTATATAACAT+AGG - Chr5:104014552-104014571 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! CTTGGAGAACAAAATTATAT+CGG - Chr5:104012677-104012696 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! CTTTCTAACTTTCCATTAAT+TGG - Chr5:104015139-104015158 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! GATAAATACTCACCAATATA+AGG + Chr5:104011090-104011109 None:intergenic 25.0%
! GATTTCTCAAAAATTTGAGT+TGG + Chr5:104014201-104014220 None:intergenic 25.0%
! GCTTGAATAACATAACAATT+AGG + Chr5:104005682-104005701 None:intergenic 25.0%
! GTATCAAAAATAGGACTATA+GGG + Chr5:104015864-104015883 None:intergenic 25.0%
! TAAGAAGTTGAAATACAGAA+TGG + Chr5:104007319-104007338 None:intergenic 25.0%
! TAATGATATAGAGTTATTGC+AGG + Chr5:104006641-104006660 None:intergenic 25.0%
! TACTTTACTTTCTTGTGTAT+TGG - Chr5:104010107-104010126 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
! TATCAAAAATAGGACTATAG+GGG + Chr5:104015863-104015882 None:intergenic 25.0%
! TATCAAGAATATCAAGGAAA+AGG + Chr5:104012450-104012469 None:intergenic 25.0%
! TATTATTAATACCGTTCTGA+CGG - Chr5:104005946-104005965 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TCTTTGCAATTTCTAAGTAT+GGG + Chr5:104016161-104016180 None:intergenic 25.0%
! TGAAGATTTGAATCATGAAT+CGG + Chr5:104010874-104010893 None:intergenic 25.0%
! TGTTGAAAATGGTATTTACA+AGG - Chr5:104004714-104004733 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTACAAAAAAAAAGGGTGAA+GGG + Chr5:104013572-104013591 None:intergenic 25.0%
! TTATAGACCAAATATAACGA+GGG - Chr5:104004760-104004779 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTATTATGTGCAATATGATC+TGG - Chr5:104010498-104010517 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTGAAATACAGAATGGAATA+TGG + Chr5:104007312-104007331 None:intergenic 25.0%
! TTGAATTGAACAAAGAAACA+GGG + Chr5:104007706-104007725 None:intergenic 25.0%
! TTGATGTCTAAAAATTTCAC+AGG - Chr5:104005139-104005158 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTGTTTCATGTTATTGTTTG+TGG - Chr5:104008530-104008549 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTTACAAAAAAAAAGGGTGA+AGG + Chr5:104013573-104013592 None:intergenic 25.0%
! TTTATAGACCAAATATAACG+AGG - Chr5:104004759-104004778 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTTCCTAAATGGTTAGAAAT+TGG - Chr5:104012925-104012944 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
! TTTGAATTGAACAAAGAAAC+AGG + Chr5:104007707-104007726 None:intergenic 25.0%
!! AAATAATTTGCCTATCTGAA+TGG + Chr5:104006841-104006860 None:intergenic 25.0%
!! ATTTGCTAACATAACAATGA+TGG + Chr5:104009482-104009501 None:intergenic 25.0%
!! GAAGTTTCAAAATAAGTTGA+TGG - Chr5:104009525-104009544 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
!! TAACTATTTTGTAGTATGCA+CGG + Chr5:104010536-104010555 None:intergenic 25.0%
!! TATATTGTTTGGTGAAAACA+TGG - Chr5:104010226-104010245 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TATTGATCGATGGATTTAAA+TGG - Chr5:104016000-104016019 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TCTTTTATAGTTAGTGAGAA+TGG - Chr5:104013768-104013787 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TGACTTGTATACAAAACAAA+GGG - Chr5:104015112-104015131 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TGGTTTTTCTTCTTTCAATT+TGG - Chr5:104008303-104008322 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TTAAGTCATTGATAATCTCA+GGG - Chr5:104009002-104009021 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TTCATTATCTTTTGTTCCTT+GGG - Chr5:104014051-104014070 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TTGATGAAGACGAAAATTTT+GGG - Chr5:104014261-104014280 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!! TTGTGTTTAATCAAGTTGTT+TGG + Chr5:104007547-104007566 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTCTTAACCTCTTTTT+TGG - Chr5:104011143-104011162 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACAAATTGCTTTTATAAGG+TGG - Chr5:104015834-104015853 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! ACATTCTTTAAAATAGGCTT+TGG - Chr5:104013456-104013475 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! ATAGTCCTATTTTTGATACT+AGG - Chr5:104015865-104015884 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTATCAACTTTGTTTTAGC+AGG + Chr5:104015362-104015381 None:intergenic 25.0%
!!! CAAATGATTTTTTTTATCCG+TGG - Chr5:104005085-104005104 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! CCATGAAATAGCATTTTAAT+AGG - Chr5:104006112-104006131 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! CCGAACATTTTTTTTTTGAA+AGG + Chr5:104004991-104005010 None:intergenic 25.0%
!!! CCTATTAAAATGCTATTTCA+TGG + Chr5:104006115-104006134 None:intergenic 25.0%
!!! CTTAGTTTTTTGCACTAATA+TGG + Chr5:104015810-104015829 None:intergenic 25.0%
!!! GATTTTTGAAATTCATGCTA+AGG - Chr5:104012896-104012915 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! GTATTAATTTGTGTCATAGT+GGG - Chr5:104007091-104007110 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTCTTAACACTTTTTTTGA+AGG + Chr5:104015930-104015949 None:intergenic 25.0%
!!! TAAGGTTTTGTTTTCCTAAA+TGG - Chr5:104012914-104012933 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATCAACTTTGTTTTAGCA+GGG + Chr5:104015361-104015380 None:intergenic 25.0%
!!! TTCTGTTATCCTTCATTTTT+AGG - Chr5:104012867-104012886 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCTGTTTAACTACTTTTAC+TGG - Chr5:104008332-104008351 MsG0580029922.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGACTTGTATACAAAACAA+AGG - Chr5:104015111-104015130 MsG0580029922.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTCTTCTTCTAAAACAAG+GGG + Chr5:104012744-104012763 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTGAGGTTATAAAGCT+CGG + Chr5:104007974-104007993 None:intergenic 25.0%
AAAAAAGTAATAGGAGAGAG+AGG - Chr5:104007035-104007054 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
AAAAAGTAATAGGAGAGAGA+GGG - Chr5:104007036-104007055 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
AAAAGAAAATGGGCAAGAAA+TGG + Chr5:104011821-104011840 None:intergenic 30.0%
AAAATTCCAGCAGTAGAAAA+AGG + Chr5:104008800-104008819 None:intergenic 30.0%
AAACAATTTCACGATTGTTG+TGG + Chr5:104005479-104005498 None:intergenic 30.0%
AAATGGTAAGCAGATGATAA+AGG - Chr5:104011369-104011388 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
AAATTCCAGCAGTAGAAAAA+GGG + Chr5:104008799-104008818 None:intergenic 30.0%
AAGCCAATTTCTAACCATTT+AGG + Chr5:104012931-104012950 None:intergenic 30.0%
AAGGGATTTGGAGAAAAAAA+GGG + Chr5:104006228-104006247 None:intergenic 30.0%
AAGTAGGGATTAAACTTACA+AGG + Chr5:104015284-104015303 None:intergenic 30.0%
AAGTATATCACAACTGCATA+TGG - Chr5:104011462-104011481 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
AATCCCATATGAAAAACGTT+CGG - Chr5:104004815-104004834 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
AATGCATAAAGAACTTCCAA+TGG + Chr5:104011643-104011662 None:intergenic 30.0%
AATGTGATTACTTGGGATTA+AGG + Chr5:104007899-104007918 None:intergenic 30.0%
ACAAAATTATATCGGTCGAA+AGG - Chr5:104012685-104012704 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
ACAACAATCGTGAAATTGTT+TGG - Chr5:104005478-104005497 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
ACACATGTTAGTAATGGTAA+TGG - Chr5:104008722-104008741 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ACTCTTATTGAAGTCTATGT+TGG - Chr5:104011612-104011631 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ACTGAAAATACCAACTCTTT+CGG + Chr5:104009356-104009375 None:intergenic 30.0%
AGATTCGGAAGTCTAATATT+CGG + Chr5:104006369-104006388 None:intergenic 30.0%
AGATTTATGTTCTGCAAAGT+TGG + Chr5:104010030-104010049 None:intergenic 30.0%
AGGATATTTATAGACAAAGC+TGG - Chr5:104004734-104004753 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
AGGTATGACATACTCTATTA+AGG + Chr5:104011790-104011809 None:intergenic 30.0%
AGTACACTGATGAACAAATA+TGG - Chr5:104013330-104013349 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
AGTAGAATCAAAAACGACAT+CGG + Chr5:104011753-104011772 None:intergenic 30.0%
AGTTGCATTAATATTGCTCA+AGG - Chr5:104014512-104014531 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
ATAAATGTGACAAGATCACA+TGG + Chr5:104014896-104014915 None:intergenic 30.0%
ATCAGAACAAGAAGTAAAAC+AGG - Chr5:104011330-104011349 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ATCTAAACATGATACAAGCT+TGG - Chr5:104012634-104012653 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
ATCTGAGCGAATAATATGAA+CGG + Chr5:104011501-104011520 None:intergenic 30.0%
ATCTTTCATGACCTATAACA+AGG + Chr5:104011170-104011189 None:intergenic 30.0%
ATGTGAGACTCATAAGTAAT+AGG - Chr5:104006995-104007014 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTAGCAAATGTTCCATT+GGG - Chr5:104009490-104009509 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ATTACTCAAAGTGGAAAGTA+TGG - Chr5:104011196-104011215 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGGAAGGGTAAACATAA+TGG - Chr5:104005655-104005674 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
ATTGAGGATGTTTGAAGAAA+AGG + Chr5:104008026-104008045 None:intergenic 30.0%
ATTTGGTATCAGGTAATGTT+TGG - Chr5:104012089-104012108 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
CAAAACAAACATACAGTGAT+TGG + Chr5:104006808-104006827 None:intergenic 30.0%
CAACCGACAAATTATTCTAA+AGG + Chr5:104011879-104011898 None:intergenic 30.0%
CAAGATTAGAACACTATGAA+AGG - Chr5:104015420-104015439 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
CAAGCTGGTGAATTATTTAT+AGG + Chr5:104015772-104015791 None:intergenic 30.0%
CACAGAAGGAAATAGAAATA+AGG - Chr5:104015224-104015243 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
CAGTGCAGAAAAACAAAATT+AGG - Chr5:104015667-104015686 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
CATTTCAAAAGAGTTAAACC+AGG + Chr5:104010917-104010936 None:intergenic 30.0%
CTTTACTTTCTTGTGTATTG+GGG - Chr5:104010109-104010128 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCCATATAATGAAGTAG+AGG + Chr5:104006197-104006216 None:intergenic 30.0%
GATTTGGAAATCTTGTCATT+TGG - Chr5:104010296-104010315 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
GGCTAACAGCTTAAATTATT+AGG - Chr5:104005638-104005657 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
GTACACTGATGAACAAATAT+GGG - Chr5:104013331-104013350 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
GTATGTGATATATTGATCGA+TGG - Chr5:104015990-104016009 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
GTTCCTTAAAATTTCAGATG+TGG + Chr5:104009575-104009594 None:intergenic 30.0%
GTTGCATTAATATTGCTCAA+GGG - Chr5:104014513-104014532 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
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!! AACTTTAGTTTGTGCTATCA+TGG + Chr5:104009869-104009888 None:intergenic 30.0%
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!! TACAAGGTCGCTATTTTATA+GGG - Chr5:104015728-104015747 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
!! TACAAGGTCGCTATTTTATA+GGG + Chr5:104015747-104015728 None:intergenic 30.0%
!! TAGCTTTAAAAACAGTTGCT+TGG - Chr5:104008398-104008417 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
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!! TTACAAGGTCGCTATTTTAT+AGG + Chr5:104015746-104015727 None:intergenic 30.0%
!! TTGAAGGATGTTTGTTATTG+AGG + Chr5:104008042-104008061 None:intergenic 30.0%
!! TTTGTATCTGTGGTTACTTT+TGG - Chr5:104009736-104009755 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAAGAGTTGGTATTTTCAGT+TGG - Chr5:104009356-104009375 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
!!! AATATTTTGAGGTGTTGAGT+TGG + Chr5:104006606-104006625 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTTCAAGCTCTTCAAAT+TGG - Chr5:104011522-104011541 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATCGGTTTTAAAAACAAAC+AGG - Chr5:104014752-104014771 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
!!! GTGACAAAGTTTTGTTCTTT+TGG - Chr5:104008283-104008302 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
!!! TGCTTTTTTGTGTTTTTCCA+CGG + Chr5:104005105-104005124 None:intergenic 30.0%
!!! TGGTTTGTTTTTCTGTTATG+TGG - Chr5:104008631-104008650 MsG0580029922.01.T01:intron 30.0%
!!! TTCCATTCTTTTTTAGAGCT+TGG - Chr5:104008491-104008510 MsG0580029922.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAGCTCTTGCCCTAATA+GGG - Chr5:104006473-104006492 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
AAAACAAAAATCACACAGGC+GGG - Chr5:104014721-104014740 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
AACCACTATCACTCAAATCT+TGG - Chr5:104007861-104007880 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
AACTCGTTCAAGAAGAAGAA+AGG - Chr5:104011406-104011425 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
AAGTAGGGACTAAACTTACA+AGG - Chr5:104015712-104015731 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
AATTATAGCAGTGATGTCTC+AGG - Chr5:104012019-104012038 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
AATTCCAGCAGTAGAAAAAG+GGG + Chr5:104008798-104008817 None:intergenic 35.0%
AATTGGAAGCAACTATTGGA+TGG - Chr5:104011539-104011558 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
ACAAACATGAAACTGACTGA+TGG - Chr5:104012341-104012360 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
ACATCAGAAAACAAAACCCA+AGG + Chr5:104014070-104014089 None:intergenic 35.0%
ACCGACATTCCTTATCAAAT+TGG - Chr5:104011963-104011982 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
ACTCGTTCAAGAAGAAGAAA+GGG - Chr5:104011407-104011426 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAACAAGAACCCTTTG+TGG + Chr5:104008444-104008463 None:intergenic 35.0%
AGAAGTTATTCGATGTGCAA+TGG + Chr5:104013961-104013980 None:intergenic 35.0%
AGAGTCTAACTTCTTCCATT+AGG + Chr5:104007121-104007140 None:intergenic 35.0%
AGATAACCCATGAAGGAAAA+TGG + Chr5:104008149-104008168 None:intergenic 35.0%
AGGGATTTGGAGAAAAAAAG+GGG + Chr5:104006227-104006246 None:intergenic 35.0%
AGTAAAGCCTTAACACTTTC+AGG - Chr5:104009274-104009293 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
AGTGGTTGAAGGAAAAAACT+AGG + Chr5:104007848-104007867 None:intergenic 35.0%
ATAAGAGTTGTTCCTTCAAC+AGG + Chr5:104011600-104011619 None:intergenic 35.0%
ATACCACTAGTTACAAAGGT+TGG + Chr5:104016399-104016418 None:intergenic 35.0%
ATAGACCAAATATAACGAGG+GGG - Chr5:104004762-104004781 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
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ATGCCTAATTAGTCGAACAA+AGG + Chr5:104005555-104005574 None:intergenic 35.0%
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ATTTGATTCAGCAAACCCTT+AGG - Chr5:104013907-104013926 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
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CAATAAGTCCTACACCAATA+AGG + Chr5:104014097-104014116 None:intergenic 35.0%
CACTTTGCAGAAACAATTTC+CGG - Chr5:104012272-104012291 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
CATGTTTAGATTCAGACCAT+AGG + Chr5:104012625-104012644 None:intergenic 35.0%
CCAAAAGACAAATGTAGTCA+CGG + Chr5:104009704-104009723 None:intergenic 35.0%
CTAACAAAATTCTTCAGCCT+TGG + Chr5:104014401-104014420 None:intergenic 35.0%
CTCATCAGAGAATAGTCAAT+GGG + Chr5:104014690-104014709 None:intergenic 35.0%
CTCCATGTCATCTAAATTGA+AGG + Chr5:104006290-104006309 None:intergenic 35.0%
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CTTCAATTTAGATGACATGG+AGG - Chr5:104006288-104006307 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
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GAAAAACTTGAAGCTGATTG+TGG - Chr5:104008947-104008966 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
GACCTTCAATTTAGATGACA+TGG - Chr5:104006285-104006304 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
GATAACCCATGAAGGAAAAT+GGG + Chr5:104008148-104008167 None:intergenic 35.0%
GATATGGAATCTTTGCAACT+TGG - Chr5:104012659-104012678 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
GATGAAGTTCGAAAGAAAGA+AGG - Chr5:104013496-104013515 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
GATGGGAAAATTACTCAAAG+TGG - Chr5:104011187-104011206 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
GATTTCCAAATCCTTCTTCA+AGG + Chr5:104010288-104010307 None:intergenic 35.0%
GCAAACAAAGATGAGCAAAA+TGG - Chr5:104011352-104011371 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
GCAAATGAGCCAATTTGATA+AGG + Chr5:104011975-104011994 None:intergenic 35.0%
GCACTTAAGTATGAGCAAAA+AGG + Chr5:104013693-104013712 None:intergenic 35.0%
GCCAATTTGATAAGGAATGT+CGG + Chr5:104011967-104011986 None:intergenic 35.0%
GCTATCATGGAAATTACATC+TGG + Chr5:104009856-104009875 None:intergenic 35.0%
GGCAAGAAATGGAAAAATGT+AGG + Chr5:104011810-104011829 None:intergenic 35.0%
GGTGATACACATGTTAGTAA+TGG - Chr5:104008716-104008735 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
GTAACCACAGATACAAATGT+AGG + Chr5:104009733-104009752 None:intergenic 35.0%
GTAGAATCAAAAACGACATC+GGG + Chr5:104011752-104011771 None:intergenic 35.0%
GTTCAGGTCAAAGAAAAAGA+AGG - Chr5:104008467-104008486 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTGTTTGTTTCCACAA+AGG - Chr5:104008427-104008446 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TAAAAAGCTCTTGCCCTAAT+AGG - Chr5:104006472-104006491 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TAAGAAAACCTTAGACCTTG+AGG - Chr5:104008868-104008887 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TAATATGGAACTGAGTTAGC+TGG + Chr5:104015795-104015814 None:intergenic 35.0%
TAGAATCAAAAACGACATCG+GGG + Chr5:104011751-104011770 None:intergenic 35.0%
TATAACAAGGGCCAAAAAAG+AGG + Chr5:104011157-104011176 None:intergenic 35.0%
TATATCACAACTGCATATGG+AGG - Chr5:104011465-104011484 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
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TATTGGTGTAGGACTTATTG+AGG - Chr5:104014097-104014116 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TCAACTTCCACTTTAGCAAT+AGG + Chr5:104013747-104013766 None:intergenic 35.0%
TCTCATCAGAGAATAGTCAA+TGG + Chr5:104014691-104014710 None:intergenic 35.0%
TCTGTTTCATTCATGAACCT+TGG - Chr5:104008103-104008122 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TCTTAAACTCCTCCCTATTA+GGG + Chr5:104006488-104006507 None:intergenic 35.0%
TCTTCAACCTATTGCTAAAG+TGG - Chr5:104013737-104013756 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TGACCTTTGTTCGACTAATT+AGG - Chr5:104005549-104005568 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TGAGTTAACAGTTCAATGCT+TGG - Chr5:104008584-104008603 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TGCTATATTGTTGCGATAGA+TGG + Chr5:104007276-104007295 None:intergenic 35.0%
TGCTCATACTTAAGTGCATA+AGG - Chr5:104013696-104013715 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TGGAAGACAACATATCTAAG+CGG + Chr5:104012418-104012437 None:intergenic 35.0%
TGTTAAGCTACGCTAAGTTT+AGG + Chr5:104010674-104010693 None:intergenic 35.0%
TGTTTGTTTAATTGTGTGGC+AGG - Chr5:104010988-104011007 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGCTAGATAACCCATGA+AGG + Chr5:104008156-104008175 None:intergenic 35.0%
TTAGTGAGAATGGTGAGAAT+TGG - Chr5:104013778-104013797 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TTATCCTCTAACAATGTCGT+TGG + Chr5:104014134-104014153 None:intergenic 35.0%
TTCTCTTGTAATGATCCCAA+TGG + Chr5:104009508-104009527 None:intergenic 35.0%
TTCTGTTCTTGACAGTGATA+TGG - Chr5:104013977-104013996 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TTCTTGATATCAATTCCACC+TGG - Chr5:104012461-104012480 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TTGGAGTTAAAAGAGACCAA+AGG - Chr5:104008758-104008777 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTACTTGTATGCTCATA+GGG - Chr5:104009755-104009774 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGTTGTGAATGAGTCTA+AGG - Chr5:104008234-104008253 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
TTTCTTCTTCTTGAACGAGT+TGG + Chr5:104011407-104011426 None:intergenic 35.0%
TTTGGTACTTGTATGCTCAT+AGG - Chr5:104009754-104009773 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTCCACACTTGAATCAT+TGG - Chr5:104011276-104011295 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! ACTGACTTTATGGAACTTGT+TGG - Chr5:104011238-104011257 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCTGAAGAATTTTGTTAG+AGG - Chr5:104014401-104014420 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! ATACAGGATCTCACCTTTTA+AGG - Chr5:104010453-104010472 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! ATCTAAAATAACTGCGCTCA+GGG - Chr5:104009636-104009655 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! ATGATTTTTGCATCTTCAGC+TGG - Chr5:104011848-104011867 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! CAAATAAGGAGGAAAGTACA+AGG + Chr5:104014970-104014989 None:intergenic 35.0%
! CGTGACTACATTTGTCTTTT+GGG - Chr5:104009702-104009721 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! CTTAAACCCATTTTCCTTCA+TGG - Chr5:104008139-104008158 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! CTTCAAGAGTCTCTTTTGAA+TGG - Chr5:104008695-104008714 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! GAGCAAAAAGGTACATCATT+TGG + Chr5:104013681-104013700 None:intergenic 35.0%
! GATGAAGACGAAAATTTTGG+GGG - Chr5:104014263-104014282 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! GGCTGAAGAATTTTGTTAGA+GGG - Chr5:104014402-104014421 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! GTGACTACATTTGTCTTTTG+GGG - Chr5:104009703-104009722 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! GTTTGAAGAAAAGGGTATAG+TGG + Chr5:104008017-104008036 None:intergenic 35.0%
! GTTTGGTGAAAACATGGTTA+GGG - Chr5:104010232-104010251 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TAACATTGGGACTGACTTTA+TGG - Chr5:104011228-104011247 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! TACTTTCCTCCTTATTTGCA+AGG - Chr5:104014972-104014991 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TACTTTTACTGGTATGCAAG+TGG - Chr5:104008343-104008362 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
! TATCTAAAATAACTGCGCTC+AGG - Chr5:104009635-104009654 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TCGTAGGGGTTAGAAATTTT+TGG - Chr5:104015080-104015099 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TCTTTTTCTTTGACCTGAAC+TGG + Chr5:104008467-104008486 None:intergenic 35.0%
! TGTTTGGTGAAAACATGGTT+AGG - Chr5:104010231-104010250 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGTGATCAGACAGTTAT+AGG - Chr5:104010314-104010333 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
! TTTTACCCCCTCGTTATATT+TGG + Chr5:104004770-104004789 None:intergenic 35.0%
! TTTTCCCGTACATTGAGAAA+AGG + Chr5:104005272-104005291 None:intergenic 35.0%
! TTTTCTCAATGTACGGGAAA+AGG - Chr5:104005271-104005290 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! AAAATTTGAGTTGGACCTCA+TGG + Chr5:104014192-104014211 None:intergenic 35.0%
!! ATCAATTAGAAGTGTCGTAG+GGG - Chr5:104015066-104015085 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTGAGTGATAGTGGTTGA+AGG + Chr5:104007859-104007878 None:intergenic 35.0%
!! CAAGTTTTTATTTCGGACAG+TGG + Chr5:104014244-104014263 None:intergenic 35.0%
!! CACCAAGCTCTAAAAAAGAA+TGG + Chr5:104008496-104008515 None:intergenic 35.0%
!! CGATTGACTTGCTAAATATG+AGG + Chr5:104005237-104005256 None:intergenic 35.0%
!! CTGCAAAGTGTTGAATGATT+GGG + Chr5:104012262-104012281 None:intergenic 35.0%
!! GCATTGTTACTTTGTACAGT+TGG - Chr5:104011672-104011691 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
!! GGGGGAAGTATCTTATTAAT+AGG - Chr5:104014288-104014307 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! GTTTTTGATTCTACTCCAAG+TGG - Chr5:104011758-104011777 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTGCAAAGTGTTGAATGAT+TGG + Chr5:104012263-104012282 None:intergenic 35.0%
!! TGATTGACCTGAAAGTGTTA+AGG + Chr5:104009284-104009303 None:intergenic 35.0%
!! TGCAAAGTGTTGAATGATTG+GGG + Chr5:104012261-104012280 None:intergenic 35.0%
!! TTGGCTTTTGAATTGTGCTT+TGG - Chr5:104012944-104012963 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! TTGGTCTCTTTTAACTCCAA+GGG + Chr5:104008758-104008777 None:intergenic 35.0%
!! TTGTAATGATTTGCTGTCCA+TGG - Chr5:104013023-104013042 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! TTTCATGGTGGATTGAAAAC+TGG - Chr5:104013102-104013121 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!! TTTGGTCTCTTTTAACTCCA+AGG + Chr5:104008759-104008778 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTTTTTGGCTTTCGCAC+CGG - Chr5:104007385-104007404 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! CAACTTCAGCTTTTTTTCCA+AGG - Chr5:104014381-104014400 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! CAGTTTTAGTTTCATGGGTT+TGG - Chr5:104008197-104008216 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! CGGTTTTAAAAACAAACAGG+CGG - Chr5:104014755-104014774 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! GGTTGATGGGAATTTTTCTT+GGG - Chr5:104009987-104010006 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! GGTTTTAAAAACAAACAGGC+GGG - Chr5:104014756-104014775 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! GTCCTATTTTTGATACTAGG+TGG - Chr5:104015868-104015887 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! GTCTAAAGCCCTTGTTTTAA+TGG + Chr5:104006332-104006351 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTTAAAACCGATCCCAT+CGG + Chr5:104014748-104014767 None:intergenic 35.0%
!!! TCTTTTTTGGCCCTTGTTAT+AGG - Chr5:104011156-104011175 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGATGTGGTGTCATTTTGTT+TGG - Chr5:104008611-104008630 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGTTGATGGGAATTTTTCT+TGG - Chr5:104009986-104010005 MsG0580029922.01.T01:intron 35.0%
!!! TTCTTGTTTTTCTCCAGTTC+AGG - Chr5:104008451-104008470 MsG0580029922.01.T01:CDS 35.0%
AAAATAGGCCAGATCCTTCT+TGG - Chr5:104012760-104012779 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
AAACGAATGACGTGTACAGA+AGG + Chr5:104006554-104006573 None:intergenic 40.0%
AAAGAGACAGAGAACAAGGT+TGG + Chr5:104007805-104007824 None:intergenic 40.0%
AAATTGAACATGAGACCTCG+AGG - Chr5:104016313-104016332 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
AACGAATGACGTGTACAGAA+GGG + Chr5:104006553-104006572 None:intergenic 40.0%
AAGCAACTATTGGATGGCTT+GGG - Chr5:104011545-104011564 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAAGACTTTGACAGAGA+AGG - Chr5:104014991-104015010 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
AATCTGTGATGGTAAAGCCT+TGG + Chr5:104012119-104012138 None:intergenic 40.0%
AATGCAATGACAGTGACACT+TGG - Chr5:104013385-104013404 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
AATGGTGAGAATTGGAGCAT+GGG - Chr5:104013786-104013805 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
ACAATGCAACACTCCATTTG+GGG - Chr5:104006514-104006533 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
ACACTTCAAATCCTTGAGGT+TGG - Chr5:104005416-104005435 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
ACACTTGAATCATTGGATGG+AGG - Chr5:104011283-104011302 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCAATTGAAGTGGTTGA+TGG - Chr5:104009973-104009992 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
ACCAATATAAGGTCAGCAGT+AGG + Chr5:104011079-104011098 None:intergenic 40.0%
ACCTAAACGTGATAGTTCAC+GGG + Chr5:104012225-104012244 None:intergenic 40.0%
ACCTACTGCTGACCTTATAT+TGG - Chr5:104011075-104011094 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGGATTAAGGTTAACG+TGG + Chr5:104007890-104007909 None:intergenic 40.0%
ACTTGTCTGTCATCTTGATC+AGG + Chr5:104014792-104014811 None:intergenic 40.0%
AGAATCTTCCCTGATTCAAG+TGG + Chr5:104009784-104009803 None:intergenic 40.0%
AGCAGTTAGCATTTGGTATC+AGG - Chr5:104012079-104012098 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
AGTCTTCCTTGCAAATAAGG+AGG + Chr5:104014981-104015000 None:intergenic 40.0%
ATACAGAATGGAATATGGCG+TGG + Chr5:104007307-104007326 None:intergenic 40.0%
ATCCTCTAACAATGTCGTTG+GGG + Chr5:104014132-104014151 None:intergenic 40.0%
ATGAGGATCCTTAAACTGCA+AGG - Chr5:104009595-104009614 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAATGACAGTGACACTT+GGG - Chr5:104013386-104013405 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
ATGGCGATCTGCTTAACATT+GGG - Chr5:104011215-104011234 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
ATGTTCTGCAAAGTTGGACT+AGG + Chr5:104010024-104010043 None:intergenic 40.0%
ATTCATCTATGCTGTCTTCC+AGG - Chr5:104011914-104011933 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCAAGTCATCAAGACGA+AGG + Chr5:104009915-104009934 None:intergenic 40.0%
CAAAGTTTCTCATGGCATGA+AGG - Chr5:104010050-104010069 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
CAAATGCTAACTGCTATCAC+GGG + Chr5:104012074-104012093 None:intergenic 40.0%
CAACACACTTCAAATCCTTG+AGG - Chr5:104005412-104005431 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CAAGAAGAAGAAAGGGAGAA+AGG - Chr5:104011414-104011433 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
CAAGGAAAAGGCAAATGTGA+TGG + Chr5:104012438-104012457 None:intergenic 40.0%
CAATCACCATGGATTCAAAG+CGG - Chr5:104010188-104010207 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CAATTTCACGATTGTTGTGG+AGG + Chr5:104005476-104005495 None:intergenic 40.0%
CACAATGCAACACTCCATTT+GGG - Chr5:104006513-104006532 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CACCTAAACGTGATAGTTCA+CGG + Chr5:104012226-104012245 None:intergenic 40.0%
CACTGATGAACAAATATGGG+AGG - Chr5:104013334-104013353 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CAGCAATTGAAGTGGTTGAT+GGG - Chr5:104009974-104009993 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CCAAATGCTAACTGCTATCA+CGG + Chr5:104012075-104012094 None:intergenic 40.0%
CCAGCAATGCCTTAAAAATG+AGG + Chr5:104012591-104012610 None:intergenic 40.0%
CCTTAAGGTTTGTGGAACAA+AGG - Chr5:104010154-104010173 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
CCTTTGTTCCACAAACCTTA+AGG + Chr5:104010157-104010176 None:intergenic 40.0%
CGTGGAATAAATTTGAGTGG+TGG - Chr5:104010341-104010360 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
CTATCTCCAATATCTAGCTG+AGG + Chr5:104008899-104008918 None:intergenic 40.0%
CTATTAAGGATTCGACCACT+TGG + Chr5:104011776-104011795 None:intergenic 40.0%
GAAAGGGAGAAAGGTAAAGT+TGG - Chr5:104011423-104011442 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
GAATCTTCCCTGATTCAAGT+GGG + Chr5:104009783-104009802 None:intergenic 40.0%
GAGCGTGGAATAAATTTGAG+TGG - Chr5:104010338-104010357 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
GATATTGGAGATAGTGTGGT+TGG - Chr5:104008905-104008924 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
GATCCTTAAACTGCAAGGAT+GGG - Chr5:104009600-104009619 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
GATGACAGACAAGTCTAAAG+AGG - Chr5:104014798-104014817 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
GATGTTCCTCAGCTAGATAT+TGG - Chr5:104008890-104008909 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
GCAGCAGCAATATTGAACTT+TGG + Chr5:104012377-104012396 None:intergenic 40.0%
GCTAGATATTGGAGATAGTG+TGG - Chr5:104008901-104008920 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
GCTTCTAATGGTTGAAGTAC+CGG + Chr5:104012294-104012313 None:intergenic 40.0%
GGATTGAAAACTGGCATTGT+TGG - Chr5:104013111-104013130 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
GGTCTCATGTTCAATTTGGA+TGG + Chr5:104016310-104016329 None:intergenic 40.0%
GTCTTAAACTCCTCCCTATT+AGG + Chr5:104006489-104006508 None:intergenic 40.0%
GTGAAAACATGGTTAGGGAA+AGG - Chr5:104010237-104010256 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
GTTGGCAACTTCAATCACTT+GGG + Chr5:104016381-104016400 None:intergenic 40.0%
GTTGGTACATGCATGATTTG+TGG - Chr5:104009374-104009393 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TACAGAATGGAATATGGCGT+GGG + Chr5:104007306-104007325 None:intergenic 40.0%
TAGACTAAGCATTATTCCGC+AGG - Chr5:104013257-104013276 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TAGTAATCACTCTTACACGC+AGG + Chr5:104014649-104014668 None:intergenic 40.0%
TATATCAACCTCGCCATATG+CGG + Chr5:104012787-104012806 None:intergenic 40.0%
TATGGCGATCTGCTTAACAT+TGG - Chr5:104011214-104011233 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TCAATGCTTGGTTTCTGATG+TGG - Chr5:104008596-104008615 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TCAGATTTGAATTACGCACC+TGG + Chr5:104012497-104012516 None:intergenic 40.0%
TCCACACTTGAATCATTGGA+TGG - Chr5:104011280-104011299 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TCCATCCAATGATTCAAGTG+TGG + Chr5:104011284-104011303 None:intergenic 40.0%
TCGAGGTCTCATGTTCAATT+TGG + Chr5:104016314-104016333 None:intergenic 40.0%
TCTCTCATGTCGAGTTCAAT+AGG - Chr5:104004839-104004858 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TGAAGCATGTTCCTTGAAGA+AGG - Chr5:104010274-104010293 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TGAGAATCAAGGCTATGTGT+TGG - Chr5:104009138-104009157 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TGATACAAGCTTGGGTGATA+TGG - Chr5:104012643-104012662 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TGCAAGTGGTTCAGAAGAAA+AGG - Chr5:104008357-104008376 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TGCACCTACATTTGTATCTG+TGG - Chr5:104009726-104009745 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
TTAAGGACACCTGACATCTT+CGG + Chr5:104010140-104010159 None:intergenic 40.0%
TTGCCAACCTTTGTAACTAG+TGG - Chr5:104016393-104016412 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TTGTTGCAGAGTATACCATG+AGG - Chr5:104014174-104014193 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
TTTCCCATCCTTGCAGTTTA+AGG + Chr5:104009606-104009625 None:intergenic 40.0%
! AACTGACTGATGGGTATTCT+CGG - Chr5:104012351-104012370 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
! AGACCCGAACGTTTTTCATA+TGG + Chr5:104004822-104004841 None:intergenic 40.0%
! AGTAGCTTTGCAAGTTACAC+TGG - Chr5:104009399-104009418 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
! AGTCATTGATAATCTCAGGG+TGG - Chr5:104009005-104009024 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
! ATTGTTGGTAGAACAGGTAG+TGG - Chr5:104013126-104013145 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
! CCGTGACTACATTTGTCTTT+TGG - Chr5:104009701-104009720 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
! CTCAAGGATTTGAAGTGTGT+TGG + Chr5:104005414-104005433 None:intergenic 40.0%
! GACCCGAACGTTTTTCATAT+GGG + Chr5:104004821-104004840 None:intergenic 40.0%
! GCTTTGGATAAGTGTCAACT+GGG - Chr5:104013472-104013491 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
! GTCAGAATCAAAGGCACAAA+TGG + Chr5:104005452-104005471 None:intergenic 40.0%
! TGATGATCCTTTTAGTGCTG+TGG - Chr5:104010424-104010443 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
! TTGTAGAGTGCTTAACACAG+AGG - Chr5:104009185-104009204 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGACGAAAATTTTGGGGGA+GGG - Chr5:104014267-104014286 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
!! CATATGGCGAGGTTGATATA+CGG - Chr5:104012787-104012806 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
!! TCTTCTTCTAAAACAAGGGG+AGG + Chr5:104012741-104012760 None:intergenic 40.0%
!! TTCTGAGACAGCAATTGAAG+TGG - Chr5:104009966-104009985 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
!! TTCTTTAGGTTGCAGCAACT+CGG - Chr5:104009214-104009233 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
!!! CCTCATTTTTAAGGCATTGC+TGG - Chr5:104012588-104012607 MsG0580029922.01.T01:intron 40.0%
!!! GTCTATGTTGGTTTTGCCAT+TGG - Chr5:104011624-104011643 MsG0580029922.01.T01:CDS 40.0%
AACCCTTAGGCAGCATTTCA+CGG - Chr5:104013920-104013939 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
AATAGCTCGTGCTCTTTACC+AGG - Chr5:104010382-104010401 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
AATCCGTGAAATGCTGCCTA+AGG + Chr5:104013926-104013945 None:intergenic 45.0%
AATTCCGAGAAGCTGGATCA+TGG + Chr5:104012003-104012022 None:intergenic 45.0%
ACATGAGAGCTAGCATGAGA+TGG + Chr5:104004907-104004926 None:intergenic 45.0%
ACTTTGACAGAGAAGGAGTC+AGG - Chr5:104014998-104015017 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
AGAATTGGAGCATGGGTCAA+AGG - Chr5:104013793-104013812 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
AGAGTTGTTCCTTCAACAGG+TGG + Chr5:104011597-104011616 None:intergenic 45.0%
AGCATATCGAACCTTCACCA+TGG + Chr5:104013043-104013062 None:intergenic 45.0%
AGCTGTATCAACTGATGCAG+TGG + Chr5:104013880-104013899 None:intergenic 45.0%
AGGAACATCCTCAAGGTCTA+AGG + Chr5:104008879-104008898 None:intergenic 45.0%
AGGGACTGTGAGAAGTAATC+TGG - Chr5:104013295-104013314 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
AGGTAATGTTTGGACCACCA+AGG - Chr5:104012099-104012118 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
ATAGATAGATATCCGCGTCC+TGG + Chr5:104010403-104010422 None:intergenic 45.0%
ATAGGGATCCCACTTGAATC+AGG - Chr5:104009772-104009791 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
ATATCAACCTCGCCATATGC+GGG + Chr5:104012786-104012805 None:intergenic 45.0%
ATATTGCTGCTGCGATGGAA+TGG - Chr5:104012384-104012403 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
ATCCGTGAAATGCTGCCTAA+GGG + Chr5:104013925-104013944 None:intergenic 45.0%
ATGGTATTCGCTTGGGATCT+AGG + Chr5:104016350-104016369 None:intergenic 45.0%
ATTGCTGTCTCAGAACTACC+AGG + Chr5:104009961-104009980 None:intergenic 45.0%
ATTTAGATGACATGGAGGGC+CGG - Chr5:104006293-104006312 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CAATTGGACTGCACGATTTG+AGG - Chr5:104013232-104013251 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CACAAGCTGCCACCAATTAA+TGG + Chr5:104015154-104015173 None:intergenic 45.0%
CACATGGAGACGAGATATTC+AGG + Chr5:104014880-104014899 None:intergenic 45.0%
CACCATGAAATGTGCAAGTC+AGG + Chr5:104013092-104013111 None:intergenic 45.0%
CAGGATCCAACCATGTTTGA+GGG - Chr5:104013276-104013295 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CATCAGTGTACTCTTCCAGT+GGG + Chr5:104013322-104013341 None:intergenic 45.0%
CATGAGAGCTAGCATGAGAT+GGG + Chr5:104004906-104004925 None:intergenic 45.0%
CCACAATGCAACACTCCATT+TGG - Chr5:104006512-104006531 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CCACCTGGAATCATAAATCC+AGG - Chr5:104012476-104012495 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CCATGGTGATTGAGCAACAT+AGG + Chr5:104010180-104010199 None:intergenic 45.0%
CCGTGATAGCAGTTAGCATT+TGG - Chr5:104012072-104012091 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
CCTATGTTGCTCAATCACCA+TGG - Chr5:104010177-104010196 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CCTGGATTTATGATTCCAGG+TGG + Chr5:104012479-104012498 None:intergenic 45.0%
CGTGAACTATCACGTTTAGG+TGG - Chr5:104012224-104012243 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
CTAATCTGACTCATGCGTAG+AGG - Chr5:104007432-104007451 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CTCATGTCGAGTTCAATAGG+AGG - Chr5:104004842-104004861 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
CTGCTATAATTCCGAGAAGC+TGG + Chr5:104012010-104012029 None:intergenic 45.0%
CTTCTCACTTTCACTTGGGT+GGG - Chr5:104008824-104008843 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GAAGATGTCAGGTGTCCTTA+AGG - Chr5:104010139-104010158 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCAACTATTGGATGGCT+TGG - Chr5:104011544-104011563 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAAAGCTTGACTCTTC+AGG - Chr5:104013514-104013533 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
GAATGGTGAGAATTGGAGCA+TGG - Chr5:104013785-104013804 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
GAGCCTTCTCACTTTCACTT+GGG - Chr5:104008820-104008839 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTGCTAATCCAACCTCA+AGG + Chr5:104005430-104005449 None:intergenic 45.0%
GATGATAAAGGTGAACCGCA+AGG - Chr5:104011381-104011400 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GATTCAAAGCGGCAAGATAG+AGG - Chr5:104010199-104010218 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
GCAACTTCAATCACTTGGGT+TGG + Chr5:104016377-104016396 None:intergenic 45.0%
GCACCTGGATTTATGATTCC+AGG + Chr5:104012482-104012501 None:intergenic 45.0%
GCTACGCTAAGTTTAGGTAG+TGG + Chr5:104010668-104010687 None:intergenic 45.0%
GGATCCTTAAACTGCAAGGA+TGG - Chr5:104009599-104009618 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
GGCCAAGATTTGAGTGATAG+TGG + Chr5:104007866-104007885 None:intergenic 45.0%
GGTCGCTCATGAATTAGCTA+AGG - Chr5:104004876-104004895 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
GGTTGGCAACTTCAATCACT+TGG + Chr5:104016382-104016401 None:intergenic 45.0%
GTTCAATATTGCTGCTGCGA+TGG - Chr5:104012379-104012398 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TAAAAACAAACAGGCGGGTC+TGG - Chr5:104014761-104014780 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
TAATTCATGAGCGACCCCAT+TGG + Chr5:104004872-104004891 None:intergenic 45.0%
TAGGGATCCCACTTGAATCA+GGG - Chr5:104009773-104009792 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TCAAACATGGTTGGATCCTG+CGG + Chr5:104013276-104013295 None:intergenic 45.0%
TCAAGACAGTGCCATACTTC+TGG - Chr5:104009301-104009320 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
TCAATAGGAGGCAAGCCAAT+GGG - Chr5:104004854-104004873 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
TCAGGTGTCCTTAAGGTTTG+TGG - Chr5:104010146-104010165 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TCATAGTCACAAGCAGTGCT+CGG + Chr5:104009249-104009268 None:intergenic 45.0%
TCATCAGTGTACTCTTCCAG+TGG + Chr5:104013323-104013342 None:intergenic 45.0%
TCTGTCGATGATAACTTCCC+CGG + Chr5:104013199-104013218 None:intergenic 45.0%
TGAGCATCCACAGCACTAAA+AGG + Chr5:104010434-104010453 None:intergenic 45.0%
TGAGCCTTCTCACTTTCACT+TGG - Chr5:104008819-104008838 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TGGGATTAAGGTTAACGTGG+TGG + Chr5:104007887-104007906 None:intergenic 45.0%
TGGTCTGATGGTATTCGCTT+GGG + Chr5:104016357-104016376 None:intergenic 45.0%
TGTCAGCACTTGCAACATTC+AGG - Chr5:104009803-104009822 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TTCAATAGGAGGCAAGCCAA+TGG - Chr5:104004853-104004872 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
TTCTACTGACCAAAGTGCAG+TGG - Chr5:104011938-104011957 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCACAGTCCCTCAAACA+TGG + Chr5:104013289-104013308 None:intergenic 45.0%
TTCTCCATGATCCAGCTTCT+CGG - Chr5:104011996-104012015 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
TTGGTCTGATGGTATTCGCT+TGG + Chr5:104016358-104016377 None:intergenic 45.0%
! AATCAAGTTGTTTGGCTCCG+TGG + Chr5:104007539-104007558 None:intergenic 45.0%
! ACTGGCATTGTTGGTAGAAC+AGG - Chr5:104013120-104013139 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! AGTGCTTAACACAGAGGCAT+TGG - Chr5:104009191-104009210 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! CTCCATTTGGGGTGCTTAAA+CGG - Chr5:104006525-104006544 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! CTGACTTGCACATTTCATGG+TGG - Chr5:104013090-104013109 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! GGTTAGGGAAAGGTATGAGA+AGG - Chr5:104010247-104010266 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! GGTTGATATACGGAACTTGC+AGG - Chr5:104012797-104012816 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
! GTTACCCCTTTTTCTACTGC+TGG - Chr5:104008791-104008810 MsG0580029922.01.T01:CDS 45.0%
! TCCATTTGGGGTGCTTAAAC+GGG - Chr5:104006526-104006545 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! AATCACTTGGGTTGGTCTGA+TGG + Chr5:104016369-104016388 None:intergenic 45.0%
!! AGACGAAAATTTTGGGGGAG+GGG - Chr5:104014268-104014287 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! ATCTTGCCGCTTTGAATCCA+TGG + Chr5:104010197-104010216 None:intergenic 45.0%
!! ATGGAGTGTTGCATTGTGGA+TGG + Chr5:104006511-104006530 None:intergenic 45.0%
!! CAAAGGCAGTTGGTTTGCTT+AGG - Chr5:104013810-104013829 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! CACAGAGGCATTGGTTCTTT+AGG - Chr5:104009200-104009219 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! CACCTTGGCGGATTAAAAAC+CGG + Chr5:104007407-104007426 None:intergenic 45.0%
!! CCAAATGGAGTGTTGCATTG+TGG + Chr5:104006515-104006534 None:intergenic 45.0%
!! GAAGACGAAAATTTTGGGGG+AGG - Chr5:104014266-104014285 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! GCAGTTGGTTTGCTTAGGTA+GGG - Chr5:104013815-104013834 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! GGCTTTGGATAAGTGTCAAC+TGG - Chr5:104013471-104013490 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! TGATTTGCTGTCCATGGTGA+AGG - Chr5:104013029-104013048 MsG0580029922.01.T01:intron 45.0%
!! TGTGGAGGTGTCAGAATCAA+AGG + Chr5:104005461-104005480 None:intergenic 45.0%
!!! ATAAGTAAATTTTTTTTTAT+AGG + Chr5:104015329-104015348 None:intergenic 5.0%
!!! ATATTGTTAATAATTTTTAA+CGG + Chr5:104005882-104005901 None:intergenic 5.0%
!!! TAAGTAAATTTTTTTTTATA+GGG + Chr5:104015328-104015347 None:intergenic 5.0%
!!! TGTATTATTTTAATATTAAA+AGG + Chr5:104006941-104006960 None:intergenic 5.0%
AAAACAAGGGGAGGCTCACT+AGG + Chr5:104012732-104012751 None:intergenic 50.0%
AACTGAGTTAGCTGGCAAGC+TGG + Chr5:104015787-104015806 None:intergenic 50.0%
AAGCTCTTGCCCTAATAGGG+AGG - Chr5:104006476-104006495 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
ACCCGTTTAAGCACCCCAAA+TGG + Chr5:104006530-104006549 None:intergenic 50.0%
ACGTATCCGGGGAATACTAC+CGG + Chr5:104007497-104007516 None:intergenic 50.0%
AGGGGGCTGCCATTAAAACA+AGG - Chr5:104006320-104006339 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
AGTGCTGTGGATGCTCATAC+AGG - Chr5:104010437-104010456 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
ATACGGAACTTGCAGGTAGC+TGG - Chr5:104012804-104012823 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
ATCGAACCGGTAGTATTCCC+CGG - Chr5:104007488-104007507 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
ATGATAACTTCCCCGGCAGT+AGG + Chr5:104013192-104013211 None:intergenic 50.0%
ATTCCCAGGGGAACAACACT+TGG + Chr5:104007470-104007489 None:intergenic 50.0%
CAATAGGAGGCAAGCCAATG+GGG - Chr5:104004855-104004874 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
CACAGTCCCTCAAACATGGT+TGG + Chr5:104013285-104013304 None:intergenic 50.0%
CACTTTGGTCAGTAGAAGCC+TGG + Chr5:104011935-104011954 None:intergenic 50.0%
CATAGTCACAAGCAGTGCTC+GGG + Chr5:104009248-104009267 None:intergenic 50.0%
CCACCCAAGTGAAAGTGAGA+AGG + Chr5:104008826-104008845 None:intergenic 50.0%
CCTTCTCACTTTCACTTGGG+TGG - Chr5:104008823-104008842 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
CTAGCTGAGGAACATCCTCA+AGG + Chr5:104008886-104008905 None:intergenic 50.0%
CTCCCCAACGACATTGTTAG+AGG - Chr5:104014127-104014146 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
CTGTGATGGTAAAGCCTTGG+TGG + Chr5:104012116-104012135 None:intergenic 50.0%
GAGAAGCTGGATCATGGAGA+AGG + Chr5:104011997-104012016 None:intergenic 50.0%
GAGAAGTAATCTGGACCCAC+TGG - Chr5:104013304-104013323 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
GCAGGATCCAACCATGTTTG+AGG - Chr5:104013275-104013294 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
GCCCGTGAACTATCACGTTT+AGG - Chr5:104012221-104012240 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
GGGGGCTGCCATTAAAACAA+GGG - Chr5:104006321-104006340 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
GGTTCGTGCAGTTCACTTGA+AGG - Chr5:104016084-104016103 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
GTCTGTGGTACTGTTGGATC+AGG - Chr5:104010078-104010097 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGACCACTTGTAGCATT+TGG - Chr5:104008842-104008861 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
GTTGCTGTCTGTGGTACTGT+TGG - Chr5:104010072-104010091 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
GTTGTCGAAAAGCTTCCACC+TGG - Chr5:104009940-104009959 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
TCAAAAACGACATCGGGGCA+CGG + Chr5:104011746-104011765 None:intergenic 50.0%
TCTTACACGCAGGTTCTCCA+TGG + Chr5:104014639-104014658 None:intergenic 50.0%
TGTCGGTATCCACTGCACTT+TGG + Chr5:104011950-104011969 None:intergenic 50.0%
TTCAACAGGTGGCTCGACTT+CGG + Chr5:104011586-104011605 None:intergenic 50.0%
TTGAACATGAGACCTCGAGG+AGG - Chr5:104016316-104016335 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
! AGATTAGTCGTCCACCTTGG+CGG + Chr5:104007419-104007438 None:intergenic 50.0%
! CAGTGATGTCTCAGGTTGCA+TGG - Chr5:104012027-104012046 MsG0580029922.01.T01:CDS 50.0%
! CGGACAGTGGACTTCTATCA+GGG + Chr5:104014231-104014250 None:intergenic 50.0%
! CGGTTTTTAATCCGCCAAGG+TGG - Chr5:104007405-104007424 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
! GCTGGTCTAGCTGTTACCTA+TGG - Chr5:104012606-104012625 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
! GGCCTGACTTGCACATTTCA+TGG - Chr5:104013087-104013106 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
! GGTAACAGTGTCACTGCCTT+TGG + Chr5:104008777-104008796 None:intergenic 50.0%
! GTCAGATTAGTCGTCCACCT+TGG + Chr5:104007422-104007441 None:intergenic 50.0%
! TCGGACAGTGGACTTCTATC+AGG + Chr5:104014232-104014251 None:intergenic 50.0%
! TGACCAAGTGTTGTTCCCCT+GGG - Chr5:104007464-104007483 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! ACGAAAATTTTGGGGGAGGG+GGG - Chr5:104014270-104014289 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! ACTGTGAGTGCCGAAAGAGT+TGG - Chr5:104009343-104009362 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! AGGTGTTGAGTTGGAGAGAC+GGG + Chr5:104006597-104006616 None:intergenic 50.0%
!! ATACTACCGGTTCGATTCCC+AGG + Chr5:104007484-104007503 None:intergenic 50.0%
!! GACGAAAATTTTGGGGGAGG+GGG - Chr5:104014269-104014288 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! GAGGTGTTGAGTTGGAGAGA+CGG + Chr5:104006598-104006617 None:intergenic 50.0%
!! GGCAGTTGGTTTGCTTAGGT+AGG - Chr5:104013814-104013833 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! GTCATAGTGGGAGTGCCTAA+TGG - Chr5:104007103-104007122 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
!! TACTACCGGTTCGATTCCCA+GGG + Chr5:104007483-104007502 None:intergenic 50.0%
!! TCTTGAACGAGTTGGCCTTG+CGG + Chr5:104011399-104011418 None:intergenic 50.0%
!!! CACCGGTTTTTAATCCGCCA+AGG - Chr5:104007402-104007421 MsG0580029922.01.T01:intron 50.0%
AAGGGGAGGCTCACTAGGAA+TGG + Chr5:104012727-104012746 None:intergenic 55.0%
ACTCGTTGAACCTACTGCCG+GGG - Chr5:104013179-104013198 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
CACGAGAGTGACCGTCAGAA+CGG + Chr5:104005960-104005979 None:intergenic 55.0%
CAGACAGTTATAGGCGAGCG+TGG - Chr5:104010323-104010342 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
CATCTTCCGCTTGTGTTGCG+TGG - Chr5:104013066-104013085 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
CGACTCGTTGAACCTACTGC+CGG - Chr5:104013177-104013196 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
CGCAACACAAGCGGAAGATG+TGG + Chr5:104013066-104013085 None:intergenic 55.0%
CGGCAGTAGGTTCAACGAGT+CGG + Chr5:104013179-104013198 None:intergenic 55.0%
CTCCTTCCAAGGACGTATCC+GGG + Chr5:104007509-104007528 None:intergenic 55.0%
GAAGTCGAGCCACCTGTTGA+AGG - Chr5:104011585-104011604 MsG0580029922.01.T01:CDS 55.0%
GACTCGTTGAACCTACTGCC+GGG - Chr5:104013178-104013197 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
GAGAGAGAGAGAGAGATGCG+AGG + Chr5:104014837-104014856 None:intergenic 55.0%
GAGCATGGGTCAAAGGCAGT+TGG - Chr5:104013800-104013819 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
GATCCTTCTTGGCCCGCATA+TGG - Chr5:104012771-104012790 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
GCTCCTTCCAAGGACGTATC+CGG + Chr5:104007510-104007529 None:intergenic 55.0%
GCTGTCTCAGAACTACCAGG+TGG + Chr5:104009958-104009977 None:intergenic 55.0%
GGCATGAAGGTTGCTGTCTG+TGG - Chr5:104010063-104010082 MsG0580029922.01.T01:CDS 55.0%
GTATTCCCCGGATACGTCCT+TGG - Chr5:104007500-104007519 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
GTGTGGCAGGAATGCTTGCT+GGG - Chr5:104011001-104011020 MsG0580029922.01.T01:CDS 55.0%
TAATGGCAGCCCCCTTAGAC+CGG + Chr5:104006315-104006334 None:intergenic 55.0%
TATGCGGGCCAAGAAGGATC+TGG + Chr5:104012771-104012790 None:intergenic 55.0%
TCAGGGATGCTGAACAAGGC+TGG - Chr5:104009653-104009672 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
TCCTTCCAAGGACGTATCCG+GGG + Chr5:104007508-104007527 None:intergenic 55.0%
TCGTGCTCTTTACCAGGACG+CGG - Chr5:104010388-104010407 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
TGTGTGGCAGGAATGCTTGC+TGG - Chr5:104011000-104011019 MsG0580029922.01.T01:CDS 55.0%
TGTTCCCCTGGGAATCGAAC+CGG - Chr5:104007475-104007494 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
TTGGAAGGAGCTCCTTGCCA+CGG - Chr5:104007519-104007538 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
! AGTTGTTTGGCTCCGTGGCA+AGG + Chr5:104007534-104007553 None:intergenic 55.0%
! CGTGATAGTTCACGGGCTGA+TGG + Chr5:104012218-104012237 None:intergenic 55.0%
! CTGACCAAGTGTTGTTCCCC+TGG - Chr5:104007463-104007482 MsG0580029922.01.T01:intron 55.0%
!! ACTACCGGTTCGATTCCCAG+GGG + Chr5:104007482-104007501 None:intergenic 55.0%
!! GGGGAAGTACCGAAGATGTC+AGG - Chr5:104010128-104010147 MsG0580029922.01.T01:CDS 55.0%
AATCACACAGGCGGGTCCGA+TGG - Chr5:104014729-104014748 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
ACATGGAGGGCCGGTCTAAG+GGG - Chr5:104006302-104006321 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
ATCACACAGGCGGGTCCGAT+GGG - Chr5:104014730-104014749 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
GACATGGAGGGCCGGTCTAA+GGG - Chr5:104006301-104006320 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
GCGCTCAGGGATGCTGAACA+AGG - Chr5:104009649-104009668 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
GGCTCGACTTCGGCTGAGAT+GGG + Chr5:104011576-104011595 None:intergenic 60.0%
GTCAGGCCACGCAACACAAG+CGG + Chr5:104013075-104013094 None:intergenic 60.0%
GTGGCAAGGAGCTCCTTCCA+AGG + Chr5:104007520-104007539 None:intergenic 60.0%
TCCCCGGATACGTCCTTGGA+AGG - Chr5:104007504-104007523 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
TCGCCATATGCGGGCCAAGA+AGG + Chr5:104012777-104012796 None:intergenic 60.0%
TGACATGGAGGGCCGGTCTA+AGG - Chr5:104006300-104006319 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
TGGCTCGACTTCGGCTGAGA+TGG + Chr5:104011577-104011596 None:intergenic 60.0%
TTCTTGGCCCGCATATGGCG+AGG - Chr5:104012776-104012795 MsG0580029922.01.T01:intron 60.0%
! TAGGAGTGTGCTCCTCCTCG+AGG + Chr5:104016331-104016350 None:intergenic 60.0%
ACAGGCGGGTCCGATGGGAT+CGG - Chr5:104014735-104014754 MsG0580029922.01.T01:intron 65.0%
CATGGAGGGCCGGTCTAAGG+GGG - Chr5:104006303-104006322 MsG0580029922.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 104004697 104016444 104004697 ID=MsG0580029922.01;Name=MsG0580029922.01
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Chr5 CDS 104008323 104008540 104008323 ID=MsG0580029922.01.T01:cds;Parent=MsG0580029922.01.T01
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Chr5 CDS 104006927 104007033 104006927 ID=MsG0580029922.01.T01:cds;Parent=MsG0580029922.01.T01
Chr5 three_prime_UTR 104006916 104006926 104006916 ID=MsG0580029922.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580029922.01.T01
Chr5 three_prime_UTR 104006679 104006853 104006679 ID=MsG0580029922.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580029922.01.T01
Chr5 three_prime_UTR 104004697 104004725 104004697 ID=MsG0580029922.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580029922.01.T01
Chr5 mRNA 104006654 104016444 104006654 ID=MsG0580029922.01.T02;Parent=MsG0580029922.01;Name=MsG0580029922.01.T02;_AED=0.25;_eAED=0.25;_QI=0|0.46|0.42|0.92|0.84|0.78|14|211|1233
Chr5 exon 104006654 104006853 104006654 ID=MsG0580029922.01.T02:exon:15167;Parent=MsG0580029922.01.T02
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