AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032102.01

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MsG0680032102.01.T01 AT1G73066 35.959 292 177 5 58 348 311 593 8.04e-38 144
MsG0680032102.01.T01 AT1G73066 31.230 317 185 5 60 351 145 453 4.07e-31 125
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MsG0680032102.01.T01 AT4G08850 31.731 312 203 5 62 372 264 566 8.14e-32 127
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MsG0680032102.01.T01 AT1G33590 32.164 171 106 5 193 361 125 287 1.01e-13 72.8
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MsG0680032102.01.T01 AT1G17750 30.976 297 173 4 60 356 364 628 4.60e-32 128
MsG0680032102.01.T01 AT1G17750 34.300 207 133 2 73 278 496 700 1.73e-25 109
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MsG0680032102.01.T01 AT5G07180 34.101 217 142 1 58 274 286 501 1.32e-28 118
MsG0680032102.01.T01 AT5G07180 34.759 187 122 0 60 246 360 546 9.46e-21 95.1
MsG0680032102.01.T01 AT5G07180 28.571 224 118 6 167 380 84 275 7.67e-11 64.3
MsG0680032102.01.T01 AT1G66830 35.409 257 160 5 21 274 27 280 1.78e-33 132
MsG0680032102.01.T01 AT1G66830 33.333 186 121 3 130 313 64 248 7.18e-18 85.9
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MsG0680032102.01.T01 AT5G12940 32.039 206 133 3 61 264 159 359 4.33e-21 94.0
MsG0680032102.01.T01 AT5G12940 29.858 211 137 5 144 352 97 298 1.18e-12 68.9
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MsG0680032102.01.T01 AT4G13920 29.530 298 172 11 80 352 450 734 8.70e-18 85.9
MsG0680032102.01.T01 AT4G13920 29.193 322 193 10 44 356 184 479 1.85e-17 84.7
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MsG0680032102.01.T01 AT5G01950 31.734 271 173 6 10 272 23 289 1.24e-29 121
MsG0680032102.01.T01 AT5G01950 31.734 271 173 6 10 272 23 289 1.24e-29 121
MsG0680032102.01.T01 AT5G01950 31.734 271 173 6 10 272 23 289 1.24e-29 121
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MsG0680032102.01.T01 AT1G71390 30.721 319 179 9 65 356 203 506 2.96e-24 105
MsG0680032102.01.T01 AT1G71390 28.435 313 203 10 47 355 375 670 2.16e-20 93.6
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MsG0680032102.01.T01 AT1G56120 34.387 253 161 5 62 313 100 348 3.28e-29 120
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MsG0680032102.01.T01 AT1G65380 32.489 237 156 2 54 287 258 493 5.24e-25 107
MsG0680032102.01.T01 AT1G65380 28.309 272 174 4 60 313 339 607 9.21e-19 88.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G65380 32.927 246 135 7 136 358 77 315 8.11e-15 76.6
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MsG0680032102.01.T01 AT4G39400 27.647 340 193 6 55 348 411 743 6.65e-23 101
MsG0680032102.01.T01 AT4G39400 29.492 295 171 4 86 354 418 701 2.82e-22 99.8
MsG0680032102.01.T01 AT4G39400 29.179 329 188 10 52 373 117 407 3.43e-16 81.3
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MsG0680032102.01.T01 AT1G79620 29.480 346 207 12 11 351 28 341 1.44e-26 112
MsG0680032102.01.T01 AT1G79620 29.480 346 207 12 11 351 28 341 1.54e-26 112
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MsG0680032102.01.T01 AT1G63430 33.493 209 128 5 22 227 30 230 1.34e-24 106
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MsG0680032102.01.T01 AT4G13810 25.256 293 165 8 71 313 324 612 1.12e-11 67.0
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MsG0680032102.01.T01 AT1G74180 26.367 311 150 8 61 295 188 495 1.96e-18 87.8
MsG0680032102.01.T01 AT1G74180 25.762 361 190 10 57 348 521 872 3.11e-16 81.3
MsG0680032102.01.T01 AT1G74180 25.497 302 188 7 86 360 431 722 2.50e-14 75.5
MsG0680032102.01.T01 AT5G67200 35.294 204 103 5 18 221 33 207 1.45e-20 94.0
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MsG0680032102.01.T01 AT2G01820 27.577 388 182 15 48 348 54 429 5.51e-19 89.7
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MsG0680032102.01.T01 AT2G35620 37.975 158 94 3 19 174 32 187 4.71e-17 83.2
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MsG0680032102.01.T01 AT1G53730 31.111 180 117 4 50 228 63 236 8.92e-16 79.7
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MsG0680032102.01.T01 AT4G03390 33.696 184 112 5 50 231 66 241 1.68e-15 79.0
MsG0680032102.01.T01 AT4G03390 28.796 191 107 4 80 270 70 231 2.61e-13 72.0
MsG0680032102.01.T01 AT4G18760 35.751 193 113 5 58 246 189 374 1.70e-15 78.2
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MsG0680032102.01.T01 AT5G63710 37.778 135 80 3 22 155 56 187 2.08e-15 78.2
MsG0680032102.01.T01 AT5G63710 37.778 135 80 3 22 155 57 188 2.50e-15 78.2
MsG0680032102.01.T01 AT3G20190 31.606 193 96 6 18 180 51 237 2.50e-15 78.2
MsG0680032102.01.T01 AT3G20190 30.539 167 107 5 128 292 90 249 2.56e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT2G36570 28.000 225 105 6 50 271 55 225 2.51e-15 78.2
MsG0680032102.01.T01 AT5G40170 29.474 285 157 11 80 358 322 568 3.31e-15 77.8
MsG0680032102.01.T01 AT5G40170 26.807 332 195 12 33 358 64 353 7.03e-13 70.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G40170 30.769 195 95 6 61 221 515 703 4.69e-12 68.2
MsG0680032102.01.T01 AT1G34210 40.000 120 69 1 131 247 68 187 3.41e-15 77.8
MsG0680032102.01.T01 AT1G34210 30.409 171 93 2 33 202 45 190 2.28e-14 75.1
MsG0680032102.01.T01 AT1G34210 40.000 120 69 1 131 247 68 187 3.41e-15 77.8
MsG0680032102.01.T01 AT1G34210 30.409 171 93 2 33 202 45 190 2.28e-14 75.1
MsG0680032102.01.T01 AT1G60630 34.450 209 100 9 16 221 22 196 3.90e-15 77.4
MsG0680032102.01.T01 AT1G60630 37.589 141 80 4 134 274 68 200 2.99e-12 68.6
MsG0680032102.01.T01 AT3G14350 32.584 178 113 4 50 227 63 233 5.00e-15 77.4
MsG0680032102.01.T01 AT5G24100 32.212 208 110 6 19 224 33 211 5.46e-15 77.0
MsG0680032102.01.T01 AT5G24100 32.168 143 93 2 132 273 72 211 2.70e-13 71.6
MsG0680032102.01.T01 AT3G14350 32.584 178 113 4 50 227 26 196 6.62e-15 77.0
MsG0680032102.01.T01 AT3G14350 32.584 178 113 4 50 227 63 233 6.76e-15 77.0
MsG0680032102.01.T01 AT1G27190 34.146 164 101 4 17 174 25 187 8.00e-15 76.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G69550 28.920 287 180 5 76 354 924 1194 8.85e-15 77.0
MsG0680032102.01.T01 AT1G69550 28.674 279 191 3 76 354 876 1146 6.12e-14 74.3
MsG0680032102.01.T01 AT1G69550 29.801 302 198 5 65 361 812 1104 6.49e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G48480 30.841 214 113 7 18 229 35 215 9.03e-15 76.3
MsG0680032102.01.T01 AT5G58150 31.687 243 156 6 76 313 129 366 1.23e-14 76.3
MsG0680032102.01.T01 AT5G58150 26.129 310 209 7 47 348 52 349 1.56e-12 69.7
MsG0680032102.01.T01 AT3G03770 29.889 271 173 7 36 294 45 310 1.51e-14 75.9
MsG0680032102.01.T01 AT3G03770 29.889 271 173 7 36 294 45 310 1.51e-14 75.9
MsG0680032102.01.T01 AT3G03770 29.889 271 173 7 36 294 45 310 1.51e-14 75.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G45780 37.255 153 93 3 22 173 42 192 2.44e-14 75.1
MsG0680032102.01.T01 AT5G45780 32.022 178 100 5 127 291 71 240 1.15e-11 66.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G60800 40.496 121 70 1 53 173 2 120 2.44e-14 75.1
MsG0680032102.01.T01 AT5G49780 29.778 225 124 5 96 287 5 228 2.78e-14 75.1
MsG0680032102.01.T01 AT5G49290 28.249 354 174 13 86 375 126 463 3.28e-14 74.7
MsG0680032102.01.T01 AT5G49290 29.655 290 168 7 86 347 4 285 6.66e-14 73.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G49290 29.537 281 163 9 58 313 315 585 2.14e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G49290 26.361 349 184 7 65 348 250 590 3.49e-12 68.6
MsG0680032102.01.T01 AT5G45780 38.028 142 86 2 33 173 9 149 4.75e-14 73.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G45780 32.022 178 100 5 127 291 28 197 9.87e-12 67.0
MsG0680032102.01.T01 AT2G31880 32.143 168 83 6 107 271 86 225 6.73e-14 73.6
MsG0680032102.01.T01 AT2G31880 29.167 192 102 3 39 221 58 224 2.22e-13 72.0
MsG0680032102.01.T01 AT2G31880 31.034 145 98 1 157 301 88 230 3.98e-12 68.2
MsG0680032102.01.T01 AT1G64210 28.037 214 124 4 17 229 23 207 7.80e-14 73.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G64210 34.400 125 79 2 149 273 81 202 8.36e-11 63.9
MsG0680032102.01.T01 AT1G11130 36.250 160 92 5 71 227 2 154 9.11e-14 73.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G24650 25.085 295 201 10 10 295 14 297 1.11e-13 73.2
MsG0680032102.01.T01 AT2G17440 27.619 210 121 8 95 279 286 489 2.56e-13 71.6
MsG0680032102.01.T01 AT2G17440 29.151 271 172 12 83 351 229 481 1.71e-11 66.2
MsG0680032102.01.T01 AT4G33430 30.472 233 122 7 22 247 31 230 3.70e-13 71.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G56130 29.670 182 121 3 91 270 3 179 3.74e-13 71.6
MsG0680032102.01.T01 AT1G56130 30.102 196 130 5 72 266 8 197 2.57e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT1G56130 29.375 160 111 2 137 296 1 158 2.59e-11 65.9
MsG0680032102.01.T01 AT3G19230 32.653 147 90 4 7 149 346 487 1.23e-12 69.7
MsG0680032102.01.T01 AT3G05990 38.614 101 60 2 50 149 394 493 1.79e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G10290 28.910 211 117 6 22 228 33 214 2.00e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G10290 28.910 211 117 6 22 228 33 214 2.00e-12 68.9
MsG0680032102.01.T01 AT5G45800 30.047 213 133 7 35 243 38 238 3.49e-12 68.2
MsG0680032102.01.T01 AT5G45800 30.047 213 133 7 35 243 38 238 6.23e-12 67.8
MsG0680032102.01.T01 AT3G15410 29.218 243 162 9 76 318 89 321 8.14e-12 67.0
MsG0680032102.01.T01 AT3G15410 29.218 243 162 9 76 318 83 315 1.01e-11 67.0
MsG0680032102.01.T01 AT1G54475 41.346 104 61 0 118 221 6 109 1.02e-11 64.3
MsG0680032102.01.T01 AT2G20850 38.043 184 104 5 50 231 68 243 1.20e-11 66.6
MsG0680032102.01.T01 AT5G65240 32.044 181 95 5 22 200 26 180 1.40e-11 66.6
MsG0680032102.01.T01 AT2G20850 38.043 184 104 5 50 231 68 243 1.41e-11 66.6
MsG0680032102.01.T01 AT5G65240 32.044 181 95 5 22 200 26 180 1.47e-11 66.2
MsG0680032102.01.T01 AT5G65240 38.614 101 58 2 166 266 98 194 8.61e-11 63.9
MsG0680032102.01.T01 AT1G50610 30.256 195 97 7 17 180 45 231 6.05e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 846 1176 7.02e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 846 1176 7.02e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 848 1178 7.21e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 1010 1340 7.35e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 672 1002 7.59e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 672 1002 7.59e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27180 25.749 334 183 10 62 333 672 1002 7.59e-11 64.7
MsG0680032102.01.T01 AT1G27170 26.740 273 135 9 100 333 920 1166 7.72e-11 64.7

Find 80 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 97 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACAACTCACTACCACAATTT+TGG 0.066602 6:+33678637 MsG0680032102.01.T01:CDS
GGTTTGATCCAAACAAAATT+AGG 0.140090 6:+33677565 MsG0680032102.01.T01:CDS
TTACAAGATCTTTCCATTCT+AGG 0.154147 6:+33678458 MsG0680032102.01.T01:CDS
TCATTAACTGGAAATAATTT+TGG 0.161790 6:+33678569 MsG0680032102.01.T01:CDS
GATAAATTGCCTATGGAATT+TGG 0.169206 6:-33678602 None:intergenic
ATTGGAAACAACAACTTCTT+TGG 0.209291 6:+33677831 MsG0680032102.01.T01:CDS
CTACACGTGCTTTCATTAAC+TGG 0.229084 6:+33678557 MsG0680032102.01.T01:CDS
GAAGCATTTGCAATCGAAAT+AGG 0.232080 6:-33678368 None:intergenic
CTTAGGAAGCAACATGAATT+TGG 0.241553 6:+33678409 MsG0680032102.01.T01:CDS
GGTTTGGAATCAAACAATTT+AGG 0.257243 6:+33678479 MsG0680032102.01.T01:CDS
CATGTAACTGATATCTTTCT+AGG 0.281375 6:-33677758 None:intergenic
TCTGCAAAACGCTATGAAAA+AGG 0.306466 6:+33678689 MsG0680032102.01.T01:CDS
AGATCTTTCCATTCTAGGTT+TGG 0.347660 6:+33678463 MsG0680032102.01.T01:CDS
TTCCTAAGTCTAATTCTTGT+AGG 0.352834 6:-33678394 None:intergenic
GAGCAGTATGTCAGGTTTGT+AGG 0.354096 6:-33677933 None:intergenic
AAATCGAATATTTGAAGATT+GGG 0.355547 6:-33678317 None:intergenic
CATACAAAGCTCTTGAATCT+TGG 0.368271 6:+33677661 MsG0680032102.01.T01:CDS
GAGATGTTATAAAGACAATA+AGG 0.376682 6:-33678221 None:intergenic
GGGAGGGTGTGGAACATGTT+GGG 0.379183 6:-33678296 None:intergenic
AGGAAACCAAACTGATCATT+TGG 0.381849 6:+33677602 MsG0680032102.01.T01:CDS
GTTTGATCCAAACAAAATTA+GGG 0.389013 6:+33677566 MsG0680032102.01.T01:CDS
AAAATCGAATATTTGAAGAT+TGG 0.394945 6:-33678318 None:intergenic
GGGGAGGGTGTGGAACATGT+TGG 0.395693 6:-33678297 None:intergenic
CGGAGGAATCCCTTCATTCA+TGG 0.399894 6:+33678067 MsG0680032102.01.T01:CDS
GTAACACAAAATAACTTTCA+TGG 0.405889 6:+33678263 MsG0680032102.01.T01:CDS
CAAGATTCAAGAGCTTTGTA+TGG 0.413521 6:-33677660 None:intergenic
GTTTGATTCCAAACCTAGAA+TGG 0.415713 6:-33678471 None:intergenic
TTGGACAAGTTCCAAGTCTT+GGG 0.415721 6:+33678432 MsG0680032102.01.T01:CDS
AAGCATTTGCAATCGAAATA+GGG 0.416937 6:-33678367 None:intergenic
TTCAAAGAGCCGATTTCAAT+TGG 0.421324 6:-33678005 None:intergenic
GTTGGACAAGTTCCAAGTCT+TGG 0.434959 6:+33678431 MsG0680032102.01.T01:CDS
GTTCGGAGTAACAATTTAAC+CGG 0.435099 6:+33678047 MsG0680032102.01.T01:CDS
CATCCACTTCTGCAAGTGGC+AGG 0.437142 6:+33677692 MsG0680032102.01.T01:CDS
AGCTTCAAGCAATGACTGTT+CGG 0.440704 6:+33678030 MsG0680032102.01.T01:CDS
ATTAGGGCAGTGGCTGCAAT+AGG 0.441206 6:+33677582 MsG0680032102.01.T01:CDS
GGTAAAATACCAATTGAAAT+CGG 0.444072 6:+33677996 MsG0680032102.01.T01:CDS
TTTGCAGCAAATCAATTCTC+AGG 0.445539 6:+33678338 MsG0680032102.01.T01:CDS
TTTGAAGATTGGGGAGGGTG+TGG 0.446936 6:-33678307 None:intergenic
TTTCTGAAAACTTTCGACAT+TGG 0.449212 6:+33677813 MsG0680032102.01.T01:CDS
TGGAGAAATTCCGCAGGAGT+TGG 0.463345 6:+33677851 MsG0680032102.01.T01:CDS
GGAGAAATTCCGCAGGAGTT+GGG 0.465136 6:+33677852 MsG0680032102.01.T01:CDS
AAGACAATAAGGAATCTTAC+CGG 0.466049 6:-33678210 None:intergenic
GCAATGCCAAATGATCAGTT+TGG 0.471147 6:-33677608 None:intergenic
GGAAGCAACATGAATTTGGT+TGG 0.479722 6:+33678413 MsG0680032102.01.T01:CDS
GAAAGATTTCCCATGAATGA+AGG 0.480533 6:-33678077 None:intergenic
CTTTGTAACTCGTTCATGCA+TGG 0.480917 6:-33677730 None:intergenic
TTCAGTGGATAAATTGCCTA+TGG 0.484170 6:-33678609 None:intergenic
TTGAGTGGGAACCATCTCAT+TGG 0.484689 6:+33677975 MsG0680032102.01.T01:CDS
TGAGATTGGAGCAGTATGTC+AGG 0.486590 6:-33677941 None:intergenic
TCTTGTAAATTCCCAAGACT+TGG 0.490945 6:-33678443 None:intergenic
AGGGTGTGGAACATGTTGGG+TGG 0.495070 6:-33678293 None:intergenic
TCCTAAGTCTAATTCTTGTA+GGG 0.497399 6:-33678393 None:intergenic
TTTGCAATCGAAATAGGGAT+TGG 0.498492 6:-33678362 None:intergenic
AGTGAGTTGTTTAAGTTCAG+TGG 0.499254 6:-33678624 None:intergenic
TTGAGGAAACATATTTCTTG+TGG 0.504930 6:-33678149 None:intergenic
TTTGTAACTCGTTCATGCAT+GGG 0.507345 6:-33677729 None:intergenic
TTCCCTGCCACTTGCAGAAG+TGG 0.508085 6:-33677695 None:intergenic
GCCCTACAAGAATTAGACTT+AGG 0.520146 6:+33678392 MsG0680032102.01.T01:CDS
CTTCCATCCACTTCTGCAAG+TGG 0.520902 6:+33677688 MsG0680032102.01.T01:CDS
GAAAAGTGAGATTGGAAACA+TGG 0.528104 6:-33677794 None:intergenic
CTGCCACTTGCAGAAGTGGA+TGG 0.534896 6:-33677691 None:intergenic
CATGAATGAAGGGATTCCTC+CGG 0.541560 6:-33678066 None:intergenic
GGAGGAATCCCTTCATTCAT+GGG 0.541657 6:+33678068 MsG0680032102.01.T01:CDS
CTAGAAAGATATCAGTTACA+TGG 0.547108 6:+33677759 MsG0680032102.01.T01:CDS
AAGATTCAAGAGCTTTGTAT+GGG 0.551216 6:-33677659 None:intergenic
AAAGATTTCCCATGAATGAA+GGG 0.552827 6:-33678076 None:intergenic
AATCGAATATTTGAAGATTG+GGG 0.555631 6:-33678316 None:intergenic
TCCAAACAAAATTAGGGCAG+TGG 0.565624 6:+33677572 MsG0680032102.01.T01:CDS
CTCATCACTTATTGTCCTTG+CGG 0.566952 6:+33678241 MsG0680032102.01.T01:CDS
CGAATATTTGAAGATTGGGG+AGG 0.582066 6:-33678313 None:intergenic
ATCCACTTCTGCAAGTGGCA+GGG 0.588123 6:+33677693 MsG0680032102.01.T01:CDS
AAAAGTGAGATTGGAAACAT+GGG 0.588829 6:-33677793 None:intergenic
GAATATTTGAAGATTGGGGA+GGG 0.591583 6:-33678312 None:intergenic
CTTCTTTGGAGAAATTCCGC+AGG 0.593531 6:+33677845 MsG0680032102.01.T01:CDS
GTGGGTGAGAACAATTTGTC+CGG 0.608340 6:+33678191 MsG0680032102.01.T01:CDS
CGGAGTAACAATTTAACCGG+AGG 0.608669 6:+33678050 MsG0680032102.01.T01:CDS
TTGTAACTCGTTCATGCATG+GGG 0.611199 6:-33677728 None:intergenic
GGTCAATTGCCAAATTCCAT+AGG 0.613487 6:+33678593 MsG0680032102.01.T01:CDS
AGCAACTGACCCAACTCCTG+CGG 0.673672 6:-33677861 None:intergenic
AAAGTGAGATTGGAAACATG+GGG 0.740897 6:-33677792 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! AAAATCGAATATTTGAAGAT+TGG - Chr6:33678321-33678340 None:intergenic 20.0%
!! AAATCGAATATTTGAAGATT+GGG - Chr6:33678320-33678339 None:intergenic 20.0%
!!! TCATTAACTGGAAATAATTT+TGG + Chr6:33678569-33678588 MsG0680032102.01.T01:CDS 20.0%
! AATCGAATATTTGAAGATTG+GGG - Chr6:33678319-33678338 None:intergenic 25.0%
! GAGATGTTATAAAGACAATA+AGG - Chr6:33678224-33678243 None:intergenic 25.0%
! GGTAAAATACCAATTGAAAT+CGG + Chr6:33677996-33678015 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
! GTAACACAAAATAACTTTCA+TGG + Chr6:33678263-33678282 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTGATCCAAACAAAATTA+GGG + Chr6:33677566-33677585 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAAAACAATGATTTGAGAT+TGG - Chr6:33677958-33677977 None:intergenic 25.0%
!! TTAACTGGAAATAATTTTGG+AGG + Chr6:33678572-33678591 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTAGGTAACTTTTCAACTA+TGG + Chr6:33678496-33678515 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCAAATCATTGTTTTTGAGT+GGG + Chr6:33677961-33677980 MsG0680032102.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGTGAGATTGGAAACAT+GGG - Chr6:33677796-33677815 None:intergenic 30.0%
AAAGATTTCCCATGAATGAA+GGG - Chr6:33678079-33678098 None:intergenic 30.0%
AAGACAATAAGGAATCTTAC+CGG - Chr6:33678213-33678232 None:intergenic 30.0%
AAGCATTTGCAATCGAAATA+GGG - Chr6:33678370-33678389 None:intergenic 30.0%
ATTGGAAACAACAACTTCTT+TGG + Chr6:33677831-33677850 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
CAAAAATTGTCAAGTGTTTG+AGG - Chr6:33678169-33678188 None:intergenic 30.0%
CATGTAACTGATATCTTTCT+AGG - Chr6:33677761-33677780 None:intergenic 30.0%
CTAGAAAGATATCAGTTACA+TGG + Chr6:33677759-33677778 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
GATAAATTGCCTATGGAATT+TGG - Chr6:33678605-33678624 None:intergenic 30.0%
GCTATAAAAACCCAAAATTG+TGG - Chr6:33678651-33678670 None:intergenic 30.0%
GGTTTGATCCAAACAAAATT+AGG + Chr6:33677565-33677584 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
TCCTAAGTCTAATTCTTGTA+GGG - Chr6:33678396-33678415 None:intergenic 30.0%
TTACAAGATCTTTCCATTCT+AGG + Chr6:33678458-33678477 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
TTCCTAAGTCTAATTCTTGT+AGG - Chr6:33678397-33678416 None:intergenic 30.0%
TTGAGGAAACATATTTCTTG+TGG - Chr6:33678152-33678171 None:intergenic 30.0%
! AAGATTCAAGAGCTTTGTAT+GGG - Chr6:33677662-33677681 None:intergenic 30.0%
! ACACTTGACAATTTTTGATG+TGG + Chr6:33678172-33678191 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
! AGTTTTCAGAAAAGTGAGAT+TGG - Chr6:33677805-33677824 None:intergenic 30.0%
! CACTTGACAATTTTTGATGT+GGG + Chr6:33678173-33678192 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
! GGTTTGGAATCAAACAATTT+AGG + Chr6:33678479-33678498 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGTATTTTACCAATGAGA+TGG - Chr6:33677989-33678008 None:intergenic 30.0%
! TTTCTGAAAACTTTCGACAT+TGG + Chr6:33677813-33677832 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTCAAATCATTGTTTTTGAG+TGG + Chr6:33677960-33677979 MsG0680032102.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTGAGATTGGAAACATG+GGG - Chr6:33677795-33677814 None:intergenic 35.0%
AGATCTTTCCATTCTAGGTT+TGG + Chr6:33678463-33678482 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAACCAAACTGATCATT+TGG + Chr6:33677602-33677621 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
CATACAAAGCTCTTGAATCT+TGG + Chr6:33677661-33677680 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
CTTAGGAAGCAACATGAATT+TGG + Chr6:33678409-33678428 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAGTGAGATTGGAAACA+TGG - Chr6:33677797-33677816 None:intergenic 35.0%
GAAAGATTTCCCATGAATGA+AGG - Chr6:33678080-33678099 None:intergenic 35.0%
GAATATTTGAAGATTGGGGA+GGG - Chr6:33678315-33678334 None:intergenic 35.0%
GTTCGGAGTAACAATTTAAC+CGG + Chr6:33678047-33678066 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGATTCCAAACCTAGAA+TGG - Chr6:33678474-33678493 None:intergenic 35.0%
TCTGCAAAACGCTATGAAAA+AGG + Chr6:33678689-33678708 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGTAAATTCCCAAGACT+TGG - Chr6:33678446-33678465 None:intergenic 35.0%
TTCAGTGGATAAATTGCCTA+TGG - Chr6:33678612-33678631 None:intergenic 35.0%
TTTGCAATCGAAATAGGGAT+TGG - Chr6:33678365-33678384 None:intergenic 35.0%
TTTGCAGCAAATCAATTCTC+AGG + Chr6:33678338-33678357 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTAACTCGTTCATGCAT+GGG - Chr6:33677732-33677751 None:intergenic 35.0%
! ACAACTCACTACCACAATTT+TGG + Chr6:33678637-33678656 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
! AGCTGCTCTTAACAATTTTG+AGG + Chr6:33678118-33678137 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
! AGTGAGTTGTTTAAGTTCAG+TGG - Chr6:33678627-33678646 None:intergenic 35.0%
! CAACTCACTACCACAATTTT+GGG + Chr6:33678638-33678657 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
! CAAGATTCAAGAGCTTTGTA+TGG - Chr6:33677663-33677682 None:intergenic 35.0%
! CTCAGCAATAACTCTTTTGT+AGG + Chr6:33677903-33677922 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGCATTTGCAATCGAAAT+AGG - Chr6:33678371-33678390 None:intergenic 35.0%
! GCTGCTCTTAACAATTTTGA+GGG + Chr6:33678119-33678138 MsG0680032102.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAAAGAGCCGATTTCAAT+TGG - Chr6:33678008-33678027 None:intergenic 35.0%
!! AGTTATTTTGTGTTACCGCA+AGG - Chr6:33678259-33678278 None:intergenic 35.0%
AGCTTCAAGCAATGACTGTT+CGG + Chr6:33678030-33678049 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
CGAATATTTGAAGATTGGGG+AGG - Chr6:33678316-33678335 None:intergenic 40.0%
CTACACGTGCTTTCATTAAC+TGG + Chr6:33678557-33678576 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
CTCATCACTTATTGTCCTTG+CGG + Chr6:33678241-33678260 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGTAACTCGTTCATGCA+TGG - Chr6:33677733-33677752 None:intergenic 40.0%
GCAATGCCAAATGATCAGTT+TGG - Chr6:33677611-33677630 None:intergenic 40.0%
GCCCTACAAGAATTAGACTT+AGG + Chr6:33678392-33678411 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
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GGTCAATTGCCAAATTCCAT+AGG + Chr6:33678593-33678612 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
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TTGGACAAGTTCCAAGTCTT+GGG + Chr6:33678432-33678451 MsG0680032102.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAACTCGTTCATGCATG+GGG - Chr6:33677731-33677750 None:intergenic 40.0%
CATGAATGAAGGGATTCCTC+CGG - Chr6:33678069-33678088 None:intergenic 45.0%
CGGAGTAACAATTTAACCGG+AGG + Chr6:33678050-33678069 MsG0680032102.01.T01:CDS 45.0%
GAGCAGTATGTCAGGTTTGT+AGG - Chr6:33677936-33677955 None:intergenic 45.0%
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TGAGATTGGAGCAGTATGTC+AGG - Chr6:33677944-33677963 None:intergenic 45.0%
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! CTTCTTTGGAGAAATTCCGC+AGG + Chr6:33677845-33677864 MsG0680032102.01.T01:CDS 45.0%
! GCCACTGCCCTAATTTTGTT+TGG - Chr6:33677576-33677595 None:intergenic 45.0%
ATCCACTTCTGCAAGTGGCA+GGG + Chr6:33677693-33677712 MsG0680032102.01.T01:CDS 50.0%
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CGGAGGAATCCCTTCATTCA+TGG + Chr6:33678067-33678086 MsG0680032102.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCATCCACTTCTGCAAG+TGG + Chr6:33677688-33677707 MsG0680032102.01.T01:CDS 50.0%
GGAGAAATTCCGCAGGAGTT+GGG + Chr6:33677852-33677871 MsG0680032102.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGAAATTCCGCAGGAGT+TGG + Chr6:33677851-33677870 MsG0680032102.01.T01:CDS 50.0%
TTTGAAGATTGGGGAGGGTG+TGG - Chr6:33678310-33678329 None:intergenic 50.0%
AGCAACTGACCCAACTCCTG+CGG - Chr6:33677864-33677883 None:intergenic 55.0%
AGGGTGTGGAACATGTTGGG+TGG - Chr6:33678296-33678315 None:intergenic 55.0%
CATCCACTTCTGCAAGTGGC+AGG + Chr6:33677692-33677711 MsG0680032102.01.T01:CDS 55.0%
! CTGCCACTTGCAGAAGTGGA+TGG - Chr6:33677694-33677713 None:intergenic 55.0%
! GGGAGGGTGTGGAACATGTT+GGG - Chr6:33678299-33678318 None:intergenic 55.0%
! TTCCCTGCCACTTGCAGAAG+TGG - Chr6:33677698-33677717 None:intergenic 55.0%
! GGGGAGGGTGTGGAACATGT+TGG - Chr6:33678300-33678319 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 33677561 33678721 33677561 ID=MsG0680032102.01;Name=MsG0680032102.01
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Chr6 exon 33677561 33678721 33677561 ID=MsG0680032102.01.T01:exon:2716;Parent=MsG0680032102.01.T01
Chr6 CDS 33677561 33678721 33677561 ID=MsG0680032102.01.T01:cds;Parent=MsG0680032102.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680032102.01.T01

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Protein sequence

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