AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035127.01

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MsG0680035127.01.T01 AT5G46490 33.571 420 254 11 3 408 176 584 9.58e-47 179
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MsG0680035127.01.T01 AT5G45200 27.575 301 157 10 805 1051 664 957 6.80e-12 71.2
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MsG0680035127.01.T01 AT2G17050 27.273 473 245 17 774 1212 478 885 2.61e-17 89.0
MsG0680035127.01.T01 AT2G17050 27.432 915 533 34 89 936 46 896 1.77e-44 177
MsG0680035127.01.T01 AT2G17050 27.273 473 245 17 774 1212 478 885 2.32e-17 89.0
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MsG0680035127.01.T01 AT4G36140 29.741 232 149 5 1 224 202 427 1.01e-20 100
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MsG0680035127.01.T01 AT4G16990 28.750 320 210 8 8 325 124 427 1.56e-29 127
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MsG0680035127.01.T01 AT1G17610 31.333 300 187 8 19 312 127 413 1.65e-29 123
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MsG0680035127.01.T01 AT4G27220 24.849 829 486 37 89 844 142 906 1.08e-22 106
MsG0680035127.01.T01 AT1G17615 32.314 229 136 4 4 226 130 345 6.20e-22 100
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MsG0680035127.01.T01 AT1G72910 31.754 211 127 4 18 226 135 330 3.87e-19 91.7
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MsG0680035127.01.T01 AT1G12210 28.532 361 217 16 46 374 91 442 4.91e-18 90.9
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MsG0680035127.01.T01 AT1G61190 25.652 460 250 21 86 490 170 592 4.94e-16 84.3
MsG0680035127.01.T01 AT1G61300 24.831 443 263 17 86 475 58 483 5.64e-16 84.0
MsG0680035127.01.T01 AT1G61190 30.196 255 141 10 86 317 170 410 1.97e-15 82.4
MsG0680035127.01.T01 AT1G61180 25.764 458 253 18 86 492 169 590 2.58e-15 82.0
MsG0680035127.01.T01 AT1G61300 30.040 253 144 10 86 317 58 298 3.08e-15 81.6
MsG0680035127.01.T01 AT1G61180 25.764 458 253 18 86 492 169 590 3.79e-15 81.6
MsG0680035127.01.T01 AT5G04720 22.907 633 383 25 43 607 155 750 4.30e-15 81.3
MsG0680035127.01.T01 AT1G61310 30.588 255 140 10 86 317 171 411 5.85e-15 80.9
MsG0680035127.01.T01 AT5G66900 22.830 622 394 26 86 652 232 822 1.32e-14 79.7
MsG0680035127.01.T01 AT3G50950 24.074 540 327 20 67 559 160 663 1.37e-14 79.7
MsG0680035127.01.T01 AT3G50950 24.074 540 327 20 67 559 160 663 1.37e-14 79.7
MsG0680035127.01.T01 AT5G66900 22.830 622 394 25 86 652 184 774 1.75e-14 79.3
MsG0680035127.01.T01 AT1G63350 24.138 638 370 24 86 618 169 797 6.55e-14 77.4
MsG0680035127.01.T01 AT5G43730 27.476 313 201 9 86 374 169 479 8.16e-14 77.0
MsG0680035127.01.T01 AT5G43730 27.476 313 201 9 86 374 169 479 8.16e-14 77.0
MsG0680035127.01.T01 AT5G43730 27.476 313 201 9 86 374 169 479 8.16e-14 77.0
MsG0680035127.01.T01 AT5G43730 27.476 313 201 9 86 374 169 479 8.16e-14 77.0
MsG0680035127.01.T01 AT5G43730 27.476 313 201 9 86 374 169 479 8.16e-14 77.0
MsG0680035127.01.T01 AT1G15890 26.959 319 193 11 87 374 12 321 2.06e-13 75.5
MsG0680035127.01.T01 AT4G19050 28.325 406 210 18 598 935 489 881 4.58e-13 75.1
MsG0680035127.01.T01 AT4G19050 27.292 469 248 21 776 1176 486 929 5.07e-13 74.7
MsG0680035127.01.T01 AT4G19050 27.601 471 268 22 772 1219 462 882 2.73e-11 68.9
MsG0680035127.01.T01 AT4G10780 28.413 271 159 9 86 334 170 427 4.59e-13 74.7
MsG0680035127.01.T01 AT4G10780 28.413 271 159 9 86 334 170 427 5.05e-13 74.7
MsG0680035127.01.T01 AT1G15890 26.959 319 193 11 87 374 172 481 6.57e-13 74.3
MsG0680035127.01.T01 AT1G12280 26.761 284 194 8 61 335 151 429 1.58e-12 73.2
MsG0680035127.01.T01 AT4G33300 23.701 616 374 25 91 639 202 788 1.74e-12 72.8
MsG0680035127.01.T01 AT4G33300 23.701 616 374 25 91 639 202 788 1.74e-12 72.8
MsG0680035127.01.T01 AT1G63350 24.222 450 274 16 86 492 169 594 1.77e-12 72.8
MsG0680035127.01.T01 AT1G63350 24.222 450 274 15 86 492 169 594 1.94e-12 72.8
MsG0680035127.01.T01 AT1G63350 24.222 450 274 15 86 492 169 594 1.94e-12 72.8
MsG0680035127.01.T01 AT1G12290 28.514 249 153 9 86 317 172 412 2.11e-12 72.4
MsG0680035127.01.T01 AT1G12290 28.514 249 153 9 86 317 130 370 2.53e-12 72.4
MsG0680035127.01.T01 AT1G12290 28.514 249 153 9 86 317 130 370 2.53e-12 72.4
MsG0680035127.01.T01 AT1G12290 28.514 249 153 9 86 317 130 370 2.53e-12 72.4
MsG0680035127.01.T01 AT3G14460 22.984 496 320 22 70 515 168 651 3.15e-12 72.4
MsG0680035127.01.T01 AT3G14470 22.316 829 499 35 84 795 191 991 2.15e-11 69.3
MsG0680035127.01.T01 AT3G14470 22.316 829 499 35 84 795 191 991 2.15e-11 69.3
MsG0680035127.01.T01 AT4G27190 22.344 913 588 38 37 889 116 967 3.04e-11 68.9
MsG0680035127.01.T01 AT5G43740 26.978 278 178 10 46 312 138 401 3.88e-11 68.6
MsG0680035127.01.T01 AT5G43740 26.978 278 178 10 46 312 138 401 3.88e-11 68.6
MsG0680035127.01.T01 AT1G51480 28.125 256 171 7 86 330 170 423 5.57e-11 67.8
MsG0680035127.01.T01 AT1G58602 22.458 944 550 40 36 863 123 1000 8.12e-11 67.4
MsG0680035127.01.T01 AT1G58602 22.458 944 550 40 36 863 123 1000 8.12e-11 67.4

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Find 347 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AACATGAACCTTCAAATTTA+TGG 0.102615 6:+99386257 None:intergenic
CTTAGAATCTTGAATGTTAA+AGG 0.113474 6:-99383272 MsG0680035127.01.T01:CDS
TAAAATTGAAATCGTATATT+TGG 0.114537 6:-99385194 MsG0680035127.01.T01:CDS
AAGAAACATTCCTTATAATT+AGG 0.117068 6:+99385110 None:intergenic
TCCATTTCTCCCAATATTTC+TGG 0.133985 6:+99382597 None:intergenic
ATTCTTGGATTGAAGTAAAA+TGG 0.152381 6:-99385171 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACATGATTTGATTGAGGATA+TGG 0.155062 6:-99385501 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACCTGTGCTCAATGGCATTA+TGG 0.161289 6:-99384281 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCCAATACCCTTAGACTATT+TGG 0.166219 6:+99385064 None:intergenic
GACATTGCTTGTTGCCTAAA+AGG 0.175136 6:-99385647 MsG0680035127.01.T01:CDS
AAATCGTATATTTGGATTCT+TGG 0.198632 6:-99385186 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTTAAAACATTCATATATAT+TGG 0.221246 6:+99385860 None:intergenic
ACAGTAAGAAAGATCATATT+AGG 0.235919 6:-99385577 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTGCTAATGATTCATTAAAA+AGG 0.240219 6:+99382544 None:intergenic
TTTCTGAAAGGATGATCTTT+TGG 0.247759 6:+99386185 None:intergenic
ACCAGTAGTGGATGGGTTAT+TGG 0.256274 6:-99383862 MsG0680035127.01.T01:CDS
GCCCGTGGTGGATGGATTGC+TGG 0.259877 6:-99384422 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGAAAGCTTTCCAGAAATAT+TGG 0.261111 6:-99382607 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGAAACATTCCTTATAATTA+GGG 0.270596 6:+99385111 None:intergenic
AACATCTTCCAAATAGTCTA+AGG 0.272145 6:-99385072 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGCACTTCAACTATATCTTT+AGG 0.273420 6:+99385416 None:intergenic
ACCTGTGGTGGATGGATTGC+TGG 0.284633 6:-99383018 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACTTGTGGAAGACGGGTTTC+TGG 0.286218 6:-99384140 MsG0680035127.01.T01:CDS
AACTCACTTTGAGAACCTTT+TGG 0.286510 6:+99385708 None:intergenic
GCACTTCAACTATATCTTTA+GGG 0.294430 6:+99385417 None:intergenic
TAGACTATTTGGAAGATGTT+TGG 0.299560 6:+99385075 None:intergenic
ACCTCAAAACCCTAATTATA+AGG 0.303958 6:-99385120 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACCTCTCAGTTTGGCTTCAC+TGG 0.319516 6:-99384629 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATACATGGATTCCACATTTA+CGG 0.320306 6:+99381846 None:intergenic
CCTGTGCTCAATGGCATTAT+GGG 0.320695 6:-99384280 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACATGAACCTTCAAATTTAT+GGG 0.324108 6:+99386258 None:intergenic
ACCTCTCAAGTTGGCTTCGC+TGG 0.324567 6:-99383787 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGACTATTTGGAAGATGTTT+GGG 0.326260 6:+99385076 None:intergenic
GACTATAACAATTTATTAGA+TGG 0.326495 6:+99384458 None:intergenic
GAAAGCTTTCCAGAAATATT+GGG 0.331172 6:-99382606 MsG0680035127.01.T01:CDS
CAGCAAGTGGCTAATTTGTC+TGG 0.340647 6:-99386855 MsG0680035127.01.T01:CDS
GATAATGTTGTTAAGCTTGC+TGG 0.348062 6:+99382375 None:intergenic
TCCAGAAATATTGGGAGAAA+TGG 0.348104 6:-99382598 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTAGTGAAGTCAACTTTAG+AGG 0.350470 6:+99383927 None:intergenic
TAAAATCAAGTTACTGAATC+AGG 0.351974 6:-99382319 MsG0680035127.01.T01:intron
GTGGAATACTCCCGAGCTTC+CGG 0.355372 6:+99382964 None:intergenic
TCCTGAGTGTTAAAGGTTGC+AGG 0.358651 6:-99383968 MsG0680035127.01.T01:intron
CTGGAAAATGCAGTCGGTTA+TGG 0.359957 6:-99385442 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTGTTGCTGATTACCTAGT+TGG 0.360187 6:-99386415 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTATACGTTGCAACAATATC+AGG 0.360234 6:-99384660 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTGGCTTTCATTACAAGATA+AGG 0.361571 6:-99386836 MsG0680035127.01.T01:intron
AAGGATTATCAATTTCGTTC+TGG 0.367395 6:-99382123 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTTCCAAGACCAAACCATTC+AGG 0.369215 6:+99386022 None:intergenic
AATCATTAGCAGTGGGCTTC+CGG 0.371027 6:-99382533 MsG0680035127.01.T01:CDS
CATGATTTGATTGAGGATAT+GGG 0.371764 6:-99385500 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCAAATTGTGCTAGTCTTGA+GGG 0.382670 6:-99383329 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTGATTGCCCATAAATTTGA+AGG 0.388965 6:-99386265 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTTGAATGTTAAAGATTGC+CGG 0.396888 6:-99382983 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTATGAATTTACTCCAACTT+AGG 0.404354 6:+99382484 None:intergenic
GTAATATCTCTTCTGAATGT+TGG 0.405018 6:-99386370 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCCGTTGGCTTTAGAAGTAA+TGG 0.407657 6:-99385810 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTCAAGAGACGGAAACTTGA+TGG 0.415601 6:+99382800 None:intergenic
CTAATCATTGCTGCAAGCTT+AGG 0.417711 6:-99382833 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCCAATAACCCATCCACTAC+TGG 0.417716 6:+99383861 None:intergenic
TAATATCTCTTCTGAATGTT+GGG 0.418369 6:-99386369 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGTATTCCACCTCTCAGTT+TGG 0.423697 6:-99384638 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCCTCTTGCAGTGGATGGAA+TGG 0.423807 6:-99384566 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCAGCAACAGATAAAGTAAC+AGG 0.423977 6:+99386427 None:intergenic
AGCAATGCCCACTTGAGAAA+TGG 0.426860 6:+99383368 None:intergenic
CGTACAATAACATATGCTTC+TGG 0.427729 6:-99385836 MsG0680035127.01.T01:CDS
TATTACACGTTGTGATAGTC+TGG 0.428055 6:-99384596 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGGACTTGCTTTCAAGAAGA+TGG 0.428586 6:-99385146 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTTGTGGAAGACGGGTTTCT+GGG 0.428985 6:-99384139 MsG0680035127.01.T01:intron
CCGTTGGCTTTAGAAGTAAT+GGG 0.432209 6:-99385809 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATCATCCTTTCAGAAATAGT+TGG 0.432587 6:-99386178 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAAGAACTTGAAGAAATTGA+AGG 0.434704 6:-99382402 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTCTTGGATTGAAGTAAAAT+GGG 0.439454 6:-99385170 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATCCATGGTATCGGTGGTAT+AGG 0.443528 6:-99386319 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTACAGGCTGCGGCAAGCTT+AGG 0.451239 6:-99383679 MsG0680035127.01.T01:intron
GATGTTCAATTTACCGATCC+AGG 0.451372 6:-99381800 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTTAGAATCTTGAAGGCTAC+AGG 0.453030 6:-99384394 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCTGTGGTTGATGGGGTACT+TGG 0.453529 6:-99382876 MsG0680035127.01.T01:CDS
GACATTACATGATTTGATTG+AGG 0.456572 6:-99385507 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGACCTGAATGGTTTGGTCT+TGG 0.456958 6:-99386025 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTAAAGATTGCCGGAAGCTC+GGG 0.457705 6:-99382974 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGCAATTACAAGCTATTGC+TGG 0.458167 6:-99386049 MsG0680035127.01.T01:CDS
TAGATCTCATAGAAAATAAG+TGG 0.470711 6:-99381901 MsG0680035127.01.T01:CDS
AATCATGTGAATATTGACTT+TGG 0.470960 6:-99381878 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGTATTCCACTTCTCAAGA+TGG 0.471774 6:-99383657 MsG0680035127.01.T01:CDS
GACTATAACAATTTAAAAGA+TGG 0.473187 6:+99384317 None:intergenic
ACATATATTGTATGAGTCAC+TGG 0.473204 6:-99383441 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGAAAGAGTTGGACCTAAGT+TGG 0.473547 6:-99382497 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTCGAGAGTTTCCCACTTG+TGG 0.477263 6:-99384155 MsG0680035127.01.T01:CDS
TAGATAAACTTAAAATCTTG+AGG 0.483307 6:-99382716 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCGGTGTCAGGTAGATTGTT+GGG 0.483530 6:-99383299 MsG0680035127.01.T01:CDS
AAAACTTGCTAACGTGTCAC+GGG 0.483593 6:-99385973 MsG0680035127.01.T01:CDS
GATCTTTCTTACTGTTACCA+TGG 0.485104 6:+99385585 None:intergenic
GCTGGAAGACCTGAATGGTT+TGG 0.486787 6:-99386031 MsG0680035127.01.T01:CDS
GACTATCACAATATGAAAGA+TGG 0.489190 6:+99383618 None:intergenic
TTGATAATCCTTCCATGCAT+TGG 0.489347 6:+99382134 None:intergenic
TTCAAATTGTGCTAGTCTTG+AGG 0.491621 6:-99383330 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACCGGTGTCAGGTAGATTGT+TGG 0.491945 6:-99383300 MsG0680035127.01.T01:CDS
GTTTCCCACTTGTGGAAGAC+GGG 0.492014 6:-99384147 MsG0680035127.01.T01:CDS
GTTAAAGATTGCCGGAAGCT+CGG 0.493531 6:-99382975 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCCATAATGCCATTGAGCAC+AGG 0.494727 6:+99384280 None:intergenic
CAGAAGCATATGTTATTGTA+CGG 0.500930 6:+99385837 None:intergenic
AGAAACCCGTCTTCCACAAG+TGG 0.501415 6:+99384142 None:intergenic
TTAAAGGTTGCAAGAAGCTC+AGG 0.502350 6:-99383256 MsG0680035127.01.T01:CDS
CAGTAAGAAAGATCATATTA+GGG 0.502474 6:-99385576 MsG0680035127.01.T01:CDS
GGGTAAACTTAGAATCTTGA+AGG 0.504174 6:-99384401 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAATTTCCACTCGTGGCAGA+TGG 0.514787 6:-99383167 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGAATTCCACCTTTAGAGT+TGG 0.515563 6:-99383234 MsG0680035127.01.T01:CDS
CTCAATTTGTCATATTGCGA+TGG 0.516276 6:-99383900 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACAACTGAAAGAACAAAGGC+AGG 0.521223 6:+99382085 None:intergenic
CTCATAAAGATAAGTGACTC+TGG 0.521853 6:-99385536 MsG0680035127.01.T01:CDS
GTCACCATGGTAGGGATCCA+TGG 0.522804 6:-99386334 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGAAGTGCTAGAACAAAATA+CGG 0.523677 6:-99385402 MsG0680035127.01.T01:intron
ACAAAGGCTCCGACAAAAGA+AGG 0.523985 6:-99386104 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATATGCTTCTGGCCTTCCGT+TGG 0.524137 6:-99385825 MsG0680035127.01.T01:CDS
TATAGATGATGTTGACAAGA+AGG 0.529076 6:-99386071 MsG0680035127.01.T01:CDS
AAAGAATCACCAAAAGAGCC+TGG 0.529730 6:-99385461 MsG0680035127.01.T01:CDS
TATCACAACTTGAAAGATTG+AGG 0.533463 6:+99382634 None:intergenic
TTTAAAAGCCCAGATATGTC+AGG 0.534470 6:+99384772 None:intergenic
TCTAGCAACCCATCCACAAT+GGG 0.536416 6:+99382735 None:intergenic
GCACTCGATCTTTCATATTG+TGG 0.537959 6:-99384181 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGTGACTCATACAATATATG+TGG 0.539499 6:+99383443 None:intergenic
CTTGCAGTGGATGGAATGGC+TGG 0.539896 6:-99384562 MsG0680035127.01.T01:CDS
GACGACTCAGTTGGTTTGCT+AGG 0.540992 6:-99384703 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTTCTCCAACTATTTCTGAA+AGG 0.542308 6:+99386173 None:intergenic
GATGATGAAGTCACCATGGT+AGG 0.542876 6:-99386343 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTAGTGAAGCCAACTCTAA+AGG 0.543438 6:+99383224 None:intergenic
TAGAATTCCACCTCTCAAGT+TGG 0.545477 6:-99383796 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGATAAACTTAAAATCTTGA+GGG 0.547009 6:-99382715 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGTATTCCATTTCTCAAGT+GGG 0.547288 6:-99383375 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGAGTATTCCATTTCTCAAG+TGG 0.547717 6:-99383376 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGCCTATACCACCGATACCA+TGG 0.549739 6:+99386317 None:intergenic
TGGATTGAAGTAAAATGGGA+TGG 0.550344 6:-99385166 MsG0680035127.01.T01:CDS
GCCATTCCATCCACTGCAAG+AGG 0.551130 6:+99384565 None:intergenic
AGTTTCCCACTTGTGGAAGA+CGG 0.551470 6:-99384148 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGTGAAGCCATCTTGAGAAG+TGG 0.553548 6:+99383650 None:intergenic
TTTAATGAATCATTAGCAGT+GGG 0.555705 6:-99382540 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACTACAATTGACGACTCAGT+TGG 0.556214 6:-99384712 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCCGTGGTGGATGGATTGCT+GGG 0.557008 6:-99384421 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTTGGGATTTCAATCCAACT+AGG 0.558384 6:+99386401 None:intergenic
AATGGGAATGTGCATTAGAT+CGG 0.559248 6:-99385757 MsG0680035127.01.T01:CDS
GGATTCTCATTCCGTAAATG+TGG 0.559520 6:-99381857 MsG0680035127.01.T01:CDS
TGATTGTTAAAGGTTGCAGT+AGG 0.560198 6:-99383403 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCAAGAGACGGAAACTTGAT+GGG 0.560633 6:+99382801 None:intergenic
CCCAGCAATCCATCCACCAC+GGG 0.562593 6:+99384421 None:intergenic
TTTGACTACCAATGCATGGA+AGG 0.562835 6:-99382142 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACTCTTCTCTTCTTCCTCCA+AGG 0.564902 6:+99385679 None:intergenic
GAGAAAATTCAGAGAAACAT+GGG 0.567424 6:-99386219 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCTGTGGTGGATGGATTGCT+GGG 0.568317 6:-99383017 MsG0680035127.01.T01:CDS
CGGGGTTGAGAGTACTTATG+AGG 0.577261 6:-99385954 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCGAGCAAAGCCAAGCTGAA+AGG 0.577913 6:+99384205 None:intergenic
CTATTGCTGGAAGACCTGAA+TGG 0.578131 6:-99386036 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTAATGAAGTCAGATTGAG+AGG 0.580437 6:+99384346 None:intergenic
ATGATTTGATTGAGGATATG+GGG 0.581749 6:-99385499 MsG0680035127.01.T01:CDS
TTTGATTGAGGATATGGGGA+AGG 0.582623 6:-99385495 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGCAATCCATCCACCACGGG+CGG 0.583358 6:+99384424 None:intergenic
CATTAGCAGTGGGCTTCCGG+TGG 0.584068 6:-99382530 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGATCAAGTTGTTCAAGAGA+CGG 0.586234 6:+99382789 None:intergenic
AACGAAGTCAACTTGAGAGG+TGG 0.586855 6:+99383509 None:intergenic
AGCAACCCATCCACAATGGG+TGG 0.590077 6:+99382738 None:intergenic
GTTTGCTAATGTGAAAGAGT+TGG 0.590376 6:-99382508 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATGATGAAGTCACCATGGTA+GGG 0.590694 6:-99386342 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCCTAATAAAGAGATCCAAA+AGG 0.591234 6:-99385723 MsG0680035127.01.T01:CDS
ATTAACATCACTCCCTGGAT+CGG 0.591311 6:+99381787 None:intergenic
CCCAGCAATCCATCCACCAC+AGG 0.591683 6:+99383017 None:intergenic
AGCAATCCATCCACCACAGG+TGG 0.591743 6:+99383020 None:intergenic
ATCTAGCAACCCATCCACAA+TGG 0.593896 6:+99382734 None:intergenic
AACGAAGTCAACATGAGAGG+TGG 0.594444 6:+99383086 None:intergenic
ATCGAGCAAACCACCAACCA+CGG 0.595634 6:+99383580 None:intergenic
ATGGTAGGGATCCATGGTAT+CGG 0.595812 6:-99386328 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACATCTTCCAAATAGTCTAA+GGG 0.595856 6:-99385071 MsG0680035127.01.T01:intron
AGCGAAGCCAACTTGAGAGG+TGG 0.597485 6:+99383789 None:intergenic
GATTGAGAGGTGGAATGCTA+CGG 0.597770 6:+99384359 None:intergenic
AACAATCCATCTGCCACGAG+TGG 0.598408 6:+99383161 None:intergenic
CTTTCACATTAGCAAACCAC+CGG 0.599191 6:+99382514 None:intergenic
GCTCTATTAACATCACTCCC+TGG 0.599217 6:+99381782 None:intergenic
CAACTGAAAGAACAAAGGCA+GGG 0.599330 6:+99382086 None:intergenic
ATGTTCAATTTACCGATCCA+GGG 0.600389 6:-99381799 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGTGAAGCCAACTCTAAAGG+TGG 0.600876 6:+99383227 None:intergenic
AGCAAACCACCAACCACGGG+AGG 0.601776 6:+99383584 None:intergenic
TCCAGCGAAGCCAACTTGAG+AGG 0.602435 6:+99383786 None:intergenic
AAAAGGTTATGAATTGTCGA+AGG 0.603805 6:-99385630 MsG0680035127.01.T01:CDS
AATAACCCATCCACTACTGG+TGG 0.604308 6:+99383864 None:intergenic
AACGAAGACAACATGAGAGG+TGG 0.604379 6:+99382945 None:intergenic
CATTGGTAGTCAAACCACTC+AGG 0.606503 6:+99382151 None:intergenic
TCTCGAAGAATTTCCACTCG+TGG 0.609446 6:-99383174 MsG0680035127.01.T01:CDS
CACTCAGGAATGTATGCTTG+TGG 0.609448 6:+99382166 None:intergenic
TCGAGCAAACCACCAACCAC+GGG 0.609554 6:+99383581 None:intergenic
AGTGAAGTCAACTTTAGAGG+TGG 0.609921 6:+99383930 None:intergenic
AGAGAAAATTCAGAGAAACA+TGG 0.610415 6:-99386220 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCCATTACTTCTAAAGCCAA+CGG 0.611215 6:+99385809 None:intergenic
GAAGAATGCTTTGCAGCAAG+TGG 0.614885 6:-99386868 MsG0680035127.01.T01:CDS
CAATGGATATACACGAGGCA+AGG 0.620459 6:-99386926 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCAAGTACCCCATCAACCAC+AGG 0.632156 6:+99382876 None:intergenic
AGCATAGTCAACTTGAGAGG+AGG 0.633123 6:+99382663 None:intergenic
TGACTAACAGGAACTGCATG+AGG 0.634079 6:-99382212 MsG0680035127.01.T01:intron
GAAACCCGTCTTCCACAAGT+GGG 0.635214 6:+99384143 None:intergenic
CGTAGCATAGTCAACTTGAG+AGG 0.636786 6:+99382660 None:intergenic
TAGAGTCATCGTCACAACAC+GGG 0.637037 6:-99385999 MsG0680035127.01.T01:CDS
CCCAACAATCTACCTGACAC+CGG 0.637936 6:+99383299 None:intergenic
AGTGAAGCCAAACTGAGAGG+TGG 0.640814 6:+99384631 None:intergenic
TCTAAAGTTGACTTCACTAG+AGG 0.640969 6:-99383925 MsG0680035127.01.T01:CDS
CACAAGCATACATTCCTGAG+TGG 0.642333 6:-99382165 MsG0680035127.01.T01:CDS
CGAAACAACTGAAAGAACAA+AGG 0.647918 6:+99382081 None:intergenic
TCCAGTGAAGCCAAACTGAG+AGG 0.647992 6:+99384628 None:intergenic
TCTAGCGAAGCTAACTTGAG+AGG 0.649290 6:+99384487 None:intergenic
TGTGTAAGAGTGATCATCAA+CGG 0.649561 6:-99382031 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGTGTTAAAGGTTGCAGGA+AGG 0.650711 6:-99383964 MsG0680035127.01.T01:intron
AGTACCCCATCAACCACAGG+TGG 0.652246 6:+99382879 None:intergenic
GTGGTTTGACTACCAATGCA+TGG 0.653213 6:-99382146 MsG0680035127.01.T01:CDS
GATACCATGGATCCCTACCA+TGG 0.653243 6:+99386330 None:intergenic
AGCGAAGCTAACTTGAGAGG+AGG 0.658061 6:+99384490 None:intergenic
AGAGACGGAAACTTGATGGG+TGG 0.659021 6:+99382804 None:intergenic
TTACTTCTAAAGCCAACGGA+AGG 0.660840 6:+99385813 None:intergenic
GTAGGGATCCATGGTATCGG+TGG 0.661244 6:-99386325 MsG0680035127.01.T01:CDS
AGAATACTTCATGCTCACCA+TGG 0.661607 6:-99385602 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTCAAGTTAGCTTCGCTAG+AGG 0.662835 6:-99384485 MsG0680035127.01.T01:CDS
AAGAGCCTGGAAAATGCAGT+CGG 0.667286 6:-99385448 MsG0680035127.01.T01:CDS
GTAGAGTCATCGTCACAACA+CGG 0.674267 6:-99386000 MsG0680035127.01.T01:CDS
ACCCAGCAATCCATCCACCA+CGG 0.676254 6:+99384420 None:intergenic
TCTAACGAAGTCAACTTGAG+AGG 0.680642 6:+99383506 None:intergenic
GAGTTTCAATAATACAACAA+AGG 0.681972 6:-99386120 MsG0680035127.01.T01:CDS
AATGAAGTCAGATTGAGAGG+TGG 0.682286 6:+99384349 None:intergenic
AAACTTGCTAACGTGTCACG+GGG 0.686751 6:-99385972 MsG0680035127.01.T01:CDS
TCTAACGAAGTCAACATGAG+AGG 0.699311 6:+99383083 None:intergenic
TCTAACGAAGACAACATGAG+AGG 0.702521 6:+99382942 None:intergenic
AGAAGCAATGGATATACACG+AGG 0.735144 6:-99386931 None:intergenic
GTCTGATGATGAAGTCACCA+TGG 0.737424 6:-99386347 MsG0680035127.01.T01:CDS
GAGTTAACAAGTGTTAGACA+AGG 0.742718 6:-99386142 MsG0680035127.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATACATTATTATTTATTTGT+TGG - Chr6:99383799-99383818 MsG0680035127.01.T01:CDS 10.0%
!!! GTTTTTTTTTTTTTCATAAA+AGG - Chr6:99383445-99383464 MsG0680035127.01.T01:CDS 10.0%
!!! TATATTAATAAATCCATTTT+AGG - Chr6:99383773-99383792 MsG0680035127.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTAAAAATATTGATTGTTAA+AGG - Chr6:99385256-99385275 MsG0680035127.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTAAAACATTCATATATAT+TGG + Chr6:99382812-99382831 None:intergenic 10.0%
!! ATGGATTTATTAATATAAGA+TGG + Chr6:99383770-99383789 None:intergenic 15.0%
!! TAAAATTGAAATCGTATATT+TGG - Chr6:99383475-99383494 MsG0680035127.01.T01:CDS 15.0%
!! TGGATTTATTAATATAAGAT+GGG + Chr6:99383769-99383788 None:intergenic 15.0%
!! AAGAAACATTCCTTATAATT+AGG + Chr6:99383562-99383581 None:intergenic 20.0%
!! AGAAACATTCCTTATAATTA+GGG + Chr6:99383561-99383580 None:intergenic 20.0%
!! AGATAAACTTAAAATCTTGA+GGG - Chr6:99385954-99385973 MsG0680035127.01.T01:CDS 20.0%
!! AGTTATAAGAAATATCTCTT+GGG - Chr6:99382093-99382112 MsG0680035127.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAATGTTAACAACATTGAA+AGG + Chr6:99386425-99386444 None:intergenic 20.0%
!! GACTATAACAATTTAAAAGA+TGG + Chr6:99384355-99384374 None:intergenic 20.0%
!! GACTATAACAATTTATTAGA+TGG + Chr6:99384214-99384233 None:intergenic 20.0%
!! GGAAAAAAGTTATAACTAAT+TGG + Chr6:99381881-99381900 None:intergenic 20.0%
!! TAGATAAACTTAAAATCTTG+AGG - Chr6:99385953-99385972 MsG0680035127.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAGACATTACATTTTATGA+AGG + Chr6:99383382-99383401 None:intergenic 20.0%
!!! TACATTTTTTTTTTGTTGCA+GGG - Chr6:99382160-99382179 MsG0680035127.01.T01:CDS 20.0%
!!! TACTTTTCTTTTTCAATACA+TGG + Chr6:99386841-99386860 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTTGTGAAACTAGTTTT+AGG - Chr6:99382029-99382048 MsG0680035127.01.T01:CDS 20.0%
! AAATCGTATATTTGGATTCT+TGG - Chr6:99383483-99383502 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! AACATGAACCTTCAAATTTA+TGG + Chr6:99382415-99382434 None:intergenic 25.0%
! AAGACATAATGATTCACTAT+AGG - Chr6:99382118-99382137 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! AATAATGTATCGTCCTAAAA+TGG + Chr6:99383789-99383808 None:intergenic 25.0%
! ACAGTAAGAAAGATCATATT+AGG - Chr6:99383092-99383111 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! ACATGAACCTTCAAATTTAT+GGG + Chr6:99382414-99382433 None:intergenic 25.0%
! ACTTAAATCTTGAAAGCTAT+AGG - Chr6:99384556-99384575 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! AGACATAATGATTCACTATA+GGG - Chr6:99382119-99382138 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAAATACCTGACATATC+TGG - Chr6:99383888-99383907 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCTTGGATTGAAGTAAAA+TGG - Chr6:99383498-99383517 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGAAAAAGAAAAGTAGCA+TGG - Chr6:99386844-99386863 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! CAGTAAGAAAGATCATATTA+GGG - Chr6:99383093-99383112 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! CTGCTAATGATTCATTAAAA+AGG + Chr6:99386128-99386147 None:intergenic 25.0%
! CTTAGAATCTTGAATGTTAA+AGG - Chr6:99385397-99385416 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
! GAGTTATAAGAAATATCTCT+TGG - Chr6:99382092-99382111 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTTTCAATAATACAACAA+AGG - Chr6:99382549-99382568 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAAAGGGAATTGAAGAAT+GGG - Chr6:99382895-99382914 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAAATACCTGACATATCT+GGG - Chr6:99383889-99383908 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAACAAACAATGATGGTT+TGG - Chr6:99383294-99383313 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATCAAGTTACTGAATC+AGG - Chr6:99386350-99386369 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TAATATCTCTTCTGAATGTT+GGG - Chr6:99382300-99382319 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
! TAATTTAGACTGCTAAATCA+TGG + Chr6:99383335-99383354 None:intergenic 25.0%
! TAGATCTCATAGAAAATAAG+TGG - Chr6:99386768-99386787 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
! TTAAAAAGGGAATTGAAGAA+TGG - Chr6:99382894-99382913 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTTGGATTGAAGTAAAAT+GGG - Chr6:99383499-99383518 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAAATCTTAAACGTTAC+AGG - Chr6:99384974-99384993 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
! TTTAATGAATCATTAGCAGT+GGG - Chr6:99386129-99386148 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
!! AGATATTACATTTTGCGTTT+GGG + Chr6:99382288-99382307 None:intergenic 25.0%
!! AGTAACTTGATTTTACATGA+CGG + Chr6:99386345-99386364 None:intergenic 25.0%
!! ATATGTAAATGATGCGTTTT+TGG + Chr6:99386707-99386726 None:intergenic 25.0%
!! TCGAAAAATGCAACTTTTTA+TGG - Chr6:99386223-99386242 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTAATGAATCATTAGCAG+TGG - Chr6:99386128-99386147 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATACTTTTTTCTTCTGGAA+TGG - Chr6:99386662-99386681 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
!!! AATCATGTGAATATTGACTT+TGG - Chr6:99386791-99386810 MsG0680035127.01.T01:intron 25.0%
!!! CTACATTTTTTTTTTGTTGC+AGG - Chr6:99382159-99382178 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
!!! GGCTCTGATTTTATTAAAAA+GGG - Chr6:99382881-99382900 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAACTTTTTTCCTGATAAAC+TGG - Chr6:99381889-99381908 MsG0680035127.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGGTTATGAATTGTCGA+AGG - Chr6:99383039-99383058 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
AACATCTTCCAAATAGTCTA+AGG - Chr6:99383597-99383616 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
AAGGATTATCAATTTCGTTC+TGG - Chr6:99386546-99386565 MsG0680035127.01.T01:intron 30.0%
ACATATATTGTATGAGTCAC+TGG - Chr6:99385228-99385247 MsG0680035127.01.T01:intron 30.0%
ACATCTTCCAAATAGTCTAA+GGG - Chr6:99383598-99383617 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
ACATGATTTGATTGAGGATA+TGG - Chr6:99383168-99383187 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
ACCTCAAAACCCTAATTATA+AGG - Chr6:99383549-99383568 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
AGACTATTTGGAAGATGTTT+GGG + Chr6:99383596-99383615 None:intergenic 30.0%
AGAGAAAATTCAGAGAAACA+TGG - Chr6:99382449-99382468 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
AGCACTTCAACTATATCTTT+AGG + Chr6:99383256-99383275 None:intergenic 30.0%
AGTGACTCATACAATATATG+TGG + Chr6:99385229-99385248 None:intergenic 30.0%
ATACATGGATTCCACATTTA+CGG + Chr6:99386826-99386845 None:intergenic 30.0%
ATCATCCTTTCAGAAATAGT+TGG - Chr6:99382491-99382510 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
ATGATTTGATTGAGGATATG+GGG - Chr6:99383170-99383189 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
CATGATTTGATTGAGGATAT+GGG - Chr6:99383169-99383188 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
CTATGAATTTACTCCAACTT+AGG + Chr6:99386188-99386207 None:intergenic 30.0%
CTTAAAATCCTGAGTGTTAA+AGG - Chr6:99384694-99384713 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGCTTTCCAGAAATATT+GGG - Chr6:99386063-99386082 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAACTTGAAGAAATTGA+AGG - Chr6:99386267-99386286 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GACATTACATGATTTGATTG+AGG - Chr6:99383162-99383181 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GACTATCACAATATGAAAGA+TGG + Chr6:99385054-99385073 None:intergenic 30.0%
GAGAAAATTCAGAGAAACAT+GGG - Chr6:99382450-99382469 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GCAAAAATATGTTGCAGAAA+TGG - Chr6:99381779-99381798 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
GCACTTCAACTATATCTTTA+GGG + Chr6:99383255-99383274 None:intergenic 30.0%
GTAATATCTCTTCTGAATGT+TGG - Chr6:99382299-99382318 MsG0680035127.01.T01:intron 30.0%
GTGAATTGTTTATGACTAAC+AGG - Chr6:99386445-99386464 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TAGACTATTTGGAAGATGTT+TGG + Chr6:99383597-99383616 None:intergenic 30.0%
TATAGATGATGTTGACAAGA+AGG - Chr6:99382598-99382617 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TATCACAACTTGAAAGATTG+AGG + Chr6:99386038-99386057 None:intergenic 30.0%
TCCTAATAAAGAGATCCAAA+AGG - Chr6:99382946-99382965 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGAATGTTAAAGATTGC+CGG - Chr6:99385686-99385705 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGCTTTCCAGAAATAT+TGG - Chr6:99386062-99386081 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TTATACGTTGCAACAATATC+AGG - Chr6:99384009-99384028 MsG0680035127.01.T01:intron 30.0%
TTGATTGCCCATAAATTTGA+AGG - Chr6:99382404-99382423 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
TTGCATATGGTAAGTTTCTT+TGG + Chr6:99383674-99383693 None:intergenic 30.0%
TTTCCTGATAAACTGGTTAA+GGG - Chr6:99381896-99381915 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTTTTGGATCTCTTTATT+AGG + Chr6:99382950-99382969 None:intergenic 30.0%
! AGGTTCATGTTTTCTTGAAA+AGG - Chr6:99382424-99382443 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! CAGAAGCATATGTTATTGTA+CGG + Chr6:99382835-99382854 None:intergenic 30.0%
! CTTTTTATGGAAGCTTATCT+TGG - Chr6:99386236-99386255 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! GAGATATTACATTTTGCGTT+TGG + Chr6:99382289-99382308 None:intergenic 30.0%
! TCAAAAGAACCTTCTTTTGT+CGG + Chr6:99382577-99382596 None:intergenic 30.0%
! TCCTTATAATTAGGGTTTTG+AGG + Chr6:99383553-99383572 None:intergenic 30.0%
! TCGACAATTCATAACCTTTT+AGG + Chr6:99383039-99383058 None:intergenic 30.0%
! TCTTGAAAGTTTTCCATATG+TGG - Chr6:99384654-99384673 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! TGAAGTGCTAGAACAAAATA+CGG - Chr6:99383267-99383286 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCCTGATAAACTGGTTA+AGG - Chr6:99381895-99381914 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGAATGTCAAAGAATGC+AGG - Chr6:99385545-99385564 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
!! GGGCTCTGATTTTATTAAAA+AGG - Chr6:99382880-99382899 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTCTCCAACTATTTCTGAA+AGG + Chr6:99382499-99382518 None:intergenic 30.0%
!! TTTCTGAAAGGATGATCTTT+TGG + Chr6:99382487-99382506 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTCTTCTGGAATGGTT+GGG - Chr6:99386667-99386686 MsG0680035127.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTTTTTGTTGCAGGGA+TGG - Chr6:99382164-99382183 MsG0680035127.01.T01:CDS 30.0%
AATGGGAATGTGCATTAGAT+CGG - Chr6:99382912-99382931 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
AGGTGGAATAATCCTGATAT+TGG + Chr6:99384587-99384606 None:intergenic 35.0%
ATGTTCAATTTACCGATCCA+GGG - Chr6:99386870-99386889 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
CATAGAAATCCATCCACATA+TGG + Chr6:99384670-99384689 None:intergenic 35.0%
CGAAACAACTGAAAGAACAA+AGG + Chr6:99386591-99386610 None:intergenic 35.0%
CGTACAATAACATATGCTTC+TGG - Chr6:99382833-99382852 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
CTCAATTTGTCATATTGCGA+TGG - Chr6:99384769-99384788 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
CTCATAAAGATAAGTGACTC+TGG - Chr6:99383133-99383152 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAAAAAACCGACCAACA+TGG + Chr6:99381952-99381971 None:intergenic 35.0%
GAAAAAGAAAAGTAGCATGG+AGG - Chr6:99386847-99386866 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
GAGTATTCCATTTCTCAAGT+GGG - Chr6:99385294-99385313 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
GAGTTAACAAGTGTTAGACA+AGG - Chr6:99382527-99382546 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
GATAATGTTGTTAAGCTTGC+TGG + Chr6:99386297-99386316 None:intergenic 35.0%
GATCTTTCTTACTGTTACCA+TGG + Chr6:99383087-99383106 None:intergenic 35.0%
GGGTAAACTTAGAATCTTGA+AGG - Chr6:99384268-99384287 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
GTCAGAGCTAAAATTGCATA+TGG + Chr6:99383687-99383706 None:intergenic 35.0%
GTGCGTAAAACAAACAATGA+TGG - Chr6:99383289-99383308 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
TATTACACGTTGTGATAGTC+TGG - Chr6:99384073-99384092 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
TCAGCAACAGATAAAGTAAC+AGG + Chr6:99382245-99382264 None:intergenic 35.0%
TCCAATACCCTTAGACTATT+TGG + Chr6:99383608-99383627 None:intergenic 35.0%
TCCAGAAATATTGGGAGAAA+TGG - Chr6:99386071-99386090 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
TCCATTTCTCCCAATATTTC+TGG + Chr6:99386075-99386094 None:intergenic 35.0%
TCTAATGAAGTCAGATTGAG+AGG + Chr6:99384326-99384345 None:intergenic 35.0%
TCTAGTGAAGTCAACTTTAG+AGG + Chr6:99384745-99384764 None:intergenic 35.0%
TGATTGTTAAAGGTTGCAGT+AGG - Chr6:99385266-99385285 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
TGGATTGAAGTAAAATGGGA+TGG - Chr6:99383503-99383522 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
TGGCAAAAATATCCTTCATG+TGG - Chr6:99383629-99383648 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
TGTGTAAGAGTGATCATCAA+CGG - Chr6:99386638-99386657 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
TTCCTGATAAACTGGTTAAG+GGG - Chr6:99381897-99381916 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTTGGATAAAAACCCGA+TGG + Chr6:99383659-99383678 None:intergenic 35.0%
TTTAAAAGCCCAGATATGTC+AGG + Chr6:99383900-99383919 None:intergenic 35.0%
! AGAGTATTCCATTTCTCAAG+TGG - Chr6:99385293-99385312 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
! AGATCAAGTTGTTCAAGAGA+CGG + Chr6:99385883-99385902 None:intergenic 35.0%
! CATATCTGGGCTTTTAAACT+TGG - Chr6:99383902-99383921 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! CTGGCTTTCATTACAAGATA+AGG - Chr6:99381833-99381852 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGTTTTCCATATGTGGA+TGG - Chr6:99384658-99384677 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! GCTGAATCATACGTGTATTT+TGG - Chr6:99383412-99383431 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTGCTAATGTGAAAGAGT+TGG - Chr6:99386161-99386180 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! TCCAAATAGTCTAAGGGTAT+TGG - Chr6:99383604-99383623 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! TCTAAAGTTGACTTCACTAG+AGG - Chr6:99384744-99384763 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATAATCCTTCCATGCAT+TGG + Chr6:99386538-99386557 None:intergenic 35.0%
! TTTGGGATTTCAATCCAACT+AGG + Chr6:99382271-99382290 None:intergenic 35.0%
!! AAAAACTTGCTAACGTGTCA+CGG - Chr6:99382695-99382714 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
!! AACTCACTTTGAGAACCTTT+TGG + Chr6:99382964-99382983 None:intergenic 35.0%
!! ATAGTCTAAGGGTATTGGAA+TGG - Chr6:99383609-99383628 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTCTTTTGGTGATTCTTTT+CGG + Chr6:99383207-99383226 None:intergenic 35.0%
!! TCAAATTGTGCTAGTCTTGA+GGG - Chr6:99385340-99385359 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
!! TTCAAATTGTGCTAGTCTTG+AGG - Chr6:99385339-99385358 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
!! TTGCATTTTTCGATACATGC+AGG + Chr6:99386216-99386235 None:intergenic 35.0%
!!! ACGGCAATACTTTTTTCTTC+TGG - Chr6:99386657-99386676 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
!!! ATGCTTTTGAGTTGCTTGTA+TGG - Chr6:99382759-99382778 MsG0680035127.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTTTCTTCTGGAATGGT+TGG - Chr6:99386666-99386685 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
!!! GTGGAGATACTTTTTCAGTA+AGG - Chr6:99383721-99383740 MsG0680035127.01.T01:intron 35.0%
AAAGAATCACCAAAAGAGCC+TGG - Chr6:99383208-99383227 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
AATGAAGTCAGATTGAGAGG+TGG + Chr6:99384323-99384342 None:intergenic 40.0%
ACAACTGAAAGAACAAAGGC+AGG + Chr6:99386587-99386606 None:intergenic 40.0%
ACTACAATTGACGACTCAGT+TGG - Chr6:99383957-99383976 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
AGAATACTTCATGCTCACCA+TGG - Chr6:99383067-99383086 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTAAACGTTACAGGCTG+CGG - Chr6:99384980-99384999 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
ATGATGAAGTCACCATGGTA+GGG - Chr6:99382327-99382346 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
ATTAACATCACTCCCTGGAT+CGG + Chr6:99386885-99386904 None:intergenic 40.0%
CAACTGAAAGAACAAAGGCA+GGG + Chr6:99386586-99386605 None:intergenic 40.0%
CTAATCATTGCTGCAAGCTT+AGG - Chr6:99385836-99385855 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
CTATAGGTTGCTCCAATATC+AGG - Chr6:99384572-99384591 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
CTGACTTTACATCACTTGAG+TGG - Chr6:99383702-99383721 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
CTTAGAATCTTGAAGGCTAC+AGG - Chr6:99384275-99384294 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCACATTAGCAAACCAC+CGG + Chr6:99386158-99386177 None:intergenic 40.0%
GAGCAATTACAAGCTATTGC+TGG - Chr6:99382620-99382639 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
GAGTATTCCACTTCTCAAGA+TGG - Chr6:99385012-99385031 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
GATGTTCAATTTACCGATCC+AGG - Chr6:99386869-99386888 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
GATTATTCCACCTCTCAAGA+TGG - Chr6:99384594-99384613 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
GCACTCGATCTTTCATATTG+TGG - Chr6:99384488-99384507 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
GGATTCTCATTCCGTAAATG+TGG - Chr6:99386812-99386831 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
TAGAATTCCACCTCTCAAGT+TGG - Chr6:99384873-99384892 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
TCAAGAGACGGAAACTTGAT+GGG + Chr6:99385871-99385890 None:intergenic 40.0%
TCCTTCATGTGGTTTACCAT+CGG - Chr6:99383640-99383659 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
TCTAACGAAGTCAACATGAG+AGG + Chr6:99385589-99385608 None:intergenic 40.0%
TCTAACGAAGTCAACTTGAG+AGG + Chr6:99385166-99385185 None:intergenic 40.0%
TCTAGTGAAGCCAACTCTAA+AGG + Chr6:99385448-99385467 None:intergenic 40.0%
TGAAAGAGTTGGACCTAAGT+TGG - Chr6:99386172-99386191 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
TTAAAGGTTGCAAGAAGCTC+AGG - Chr6:99385413-99385432 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAGAGACGGAAACTTGA+TGG + Chr6:99385872-99385891 None:intergenic 40.0%
TTGTTCTACACCATGTTGGT+CGG - Chr6:99381939-99381958 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
TTTGACTACCAATGCATGGA+AGG - Chr6:99386527-99386546 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
TTTGATTGAGGATATGGGGA+AGG - Chr6:99383174-99383193 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! AGTGAAGTCAACTTTAGAGG+TGG + Chr6:99384742-99384761 None:intergenic 40.0%
! AGTTTTTCACCTGTGCTCAA+TGG - Chr6:99384380-99384399 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! ATCTGGGCTTTTAAACTTGG+AGG - Chr6:99383905-99383924 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTTTCCTCTTGCAGTGGA+TGG - Chr6:99384098-99384117 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
! GACATTGCTTGTTGCCTAAA+AGG - Chr6:99383022-99383041 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTTTTCAACCTTTCAGCT+TGG - Chr6:99384454-99384473 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! TCTGTTGCTGATTACCTAGT+TGG - Chr6:99382254-99382273 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
! TCTTGAGAGTTTTCTACCTG+TGG - Chr6:99384931-99384950 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
! TGAAAGTTTTCCACCCATTG+TGG - Chr6:99385921-99385940 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
! TGGACTTGCTTTCAAGAAGA+TGG - Chr6:99383523-99383542 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAACTTGCTAACGTGTCAC+GGG - Chr6:99382696-99382715 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAGTGAGTTTTGATGCCT+TGG - Chr6:99382973-99382992 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! CCCATTACTTCTAAAGCCAA+CGG + Chr6:99382863-99382882 None:intergenic 40.0%
!! CCGTTGGCTTTAGAAGTAAT+GGG - Chr6:99382860-99382879 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGAATTCCACCTTTAGAGT+TGG - Chr6:99385435-99385454 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGTCTTGAGGGTTTTCTAC+CGG - Chr6:99385351-99385370 MsG0680035127.01.T01:intron 40.0%
!! TCCGTTGGCTTTAGAAGTAA+TGG - Chr6:99382859-99382878 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! TGACTTGTTCTACACCATGT+TGG - Chr6:99381935-99381954 MsG0680035127.01.T01:CDS 40.0%
!! TTACTTCTAAAGCCAACGGA+AGG + Chr6:99382859-99382878 None:intergenic 40.0%
!!! ATGATGCGTTTTTGGCTGAT+TGG + Chr6:99386699-99386718 None:intergenic 40.0%
AACGAAGTCAACATGAGAGG+TGG + Chr6:99385586-99385605 None:intergenic 45.0%
AACGAAGTCAACTTGAGAGG+TGG + Chr6:99385163-99385182 None:intergenic 45.0%
AAGAGCCTGGAAAATGCAGT+CGG - Chr6:99383221-99383240 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
AATAACCCATCCACTACTGG+TGG + Chr6:99384808-99384827 None:intergenic 45.0%
ACAAAGGCTCCGACAAAAGA+AGG - Chr6:99382565-99382584 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
ACCTGTGCTCAATGGCATTA+TGG - Chr6:99384388-99384407 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
ACTCTTCTCTTCTTCCTCCA+AGG + Chr6:99382993-99383012 None:intergenic 45.0%
AGCAATGCCCACTTGAGAAA+TGG + Chr6:99385304-99385323 None:intergenic 45.0%
AGCATAGTCAACTTGAGAGG+AGG + Chr6:99386009-99386028 None:intergenic 45.0%
AGCCCCTTAACCAGTTTATC+AGG + Chr6:99381902-99381921 None:intergenic 45.0%
AGTGAAGCCATCTTGAGAAG+TGG + Chr6:99385022-99385041 None:intergenic 45.0%
AGTTTCCCACTTGTGGAAGA+CGG - Chr6:99384521-99384540 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
ATCTAGCAACCCATCCACAA+TGG + Chr6:99385938-99385957 None:intergenic 45.0%
ATGGTAGGGATCCATGGTAT+CGG - Chr6:99382341-99382360 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
CACAAGCATACATTCCTGAG+TGG - Chr6:99386504-99386523 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
CACTCAGGAATGTATGCTTG+TGG + Chr6:99386506-99386525 None:intergenic 45.0%
CCTGTGCTCAATGGCATTAT+GGG - Chr6:99384389-99384408 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCATGTGGTTTACCATC+GGG - Chr6:99383641-99383660 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
CGTAGCATAGTCAACTTGAG+AGG + Chr6:99386012-99386031 None:intergenic 45.0%
CTATTGCTGGAAGACCTGAA+TGG - Chr6:99382633-99382652 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAAAATGCAGTCGGTTA+TGG - Chr6:99383227-99383246 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
CTTCCAAGACCAAACCATTC+AGG + Chr6:99382650-99382669 None:intergenic 45.0%
GAAGAATGCTTTGCAGCAAG+TGG - Chr6:99381801-99381820 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
GAGTATTCCACCTCTCAGTT+TGG - Chr6:99384031-99384050 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
GAGTGTTAAAGGTTGCAGGA+AGG - Chr6:99384705-99384724 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
GATGATGAAGTCACCATGGT+AGG - Chr6:99382326-99382345 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
GATTGAGAGGTGGAATGCTA+CGG + Chr6:99384313-99384332 None:intergenic 45.0%
GCTCTATTAACATCACTCCC+TGG + Chr6:99386890-99386909 None:intergenic 45.0%
GTAGAGTCATCGTCACAACA+CGG - Chr6:99382669-99382688 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
GTGGTTTGACTACCAATGCA+TGG - Chr6:99386523-99386542 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
GTTAAAGATTGCCGGAAGCT+CGG - Chr6:99385694-99385713 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
TAGAGTCATCGTCACAACAC+GGG - Chr6:99382670-99382689 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
TCCAATAACCCATCCACTAC+TGG + Chr6:99384811-99384830 None:intergenic 45.0%
TCCTGAGTGTTAAAGGTTGC+AGG - Chr6:99384701-99384720 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGCAACCTTTAACACTC+AGG + Chr6:99384705-99384724 None:intergenic 45.0%
TCTAACGAAGCCATCTTGAG+AGG + Chr6:99384607-99384626 None:intergenic 45.0%
TCTAGCAACCCATCCACAAT+GGG + Chr6:99385937-99385956 None:intergenic 45.0%
TCTAGCGAAGCTAACTTGAG+AGG + Chr6:99384185-99384204 None:intergenic 45.0%
TCTCGAAGAATTTCCACTCG+TGG - Chr6:99385495-99385514 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
TGACTAACAGGAACTGCATG+AGG - Chr6:99386457-99386476 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
TTAAAGATTGCCGGAAGCTC+GGG - Chr6:99385695-99385714 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! AATCATTAGCAGTGGGCTTC+CGG - Chr6:99386136-99386155 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! AGTGAAGCCAACTCTAAAGG+TGG + Chr6:99385445-99385464 None:intergenic 45.0%
! AGTTTTCCACCCATTGTGGA+TGG - Chr6:99385925-99385944 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! AGTTTTCCACCTGTGGTTGA+TGG - Chr6:99385784-99385803 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! CAGCAAGTGGCTAATTTGTC+TGG - Chr6:99381814-99381833 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! CATAACCGACTGCATTTTCC+AGG + Chr6:99383229-99383248 None:intergenic 45.0%
! CATTGGTAGTCAAACCACTC+AGG + Chr6:99386521-99386540 None:intergenic 45.0%
! CTGCATTTTCCAGGCTCTTT+TGG + Chr6:99383220-99383239 None:intergenic 45.0%
! GGAGATTTTTCCTCTTGCAG+TGG - Chr6:99384094-99384113 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
! GTCTGATGATGAAGTCACCA+TGG - Chr6:99382322-99382341 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTTCCACCCATTGTGGAT+GGG - Chr6:99385926-99385945 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTTCCACCTGTGGTTGAT+GGG - Chr6:99385785-99385804 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! TCTCAAGTTAGCTTCGCTAG+AGG - Chr6:99384184-99384203 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTGAGAGTTTTCCACCTG+TGG - Chr6:99385636-99385655 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGAGTTTTCTACCTGTGG+TGG - Chr6:99384934-99384953 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
!! AAACTTGCTAACGTGTCACG+GGG - Chr6:99382697-99382716 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCAGTAGTGGATGGGTTAT+TGG - Chr6:99384807-99384826 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! AGACCTGAATGGTTTGGTCT+TGG - Chr6:99382644-99382663 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTGAGTTTTGATGCCTTGG+AGG - Chr6:99382976-99382995 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTTTTCCACCAGTAGTGGA+TGG - Chr6:99384799-99384818 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTTTTCTACCTGTGGTGGA+TGG - Chr6:99384938-99384957 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
!! ATCCATGGTATCGGTGGTAT+AGG - Chr6:99382350-99382369 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTTCCACCTGTGGTTGATG+GGG - Chr6:99385786-99385805 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTTTCCACCAGTAGTGGAT+GGG - Chr6:99384800-99384819 MsG0680035127.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTTTCTACCTGTGGTGGAT+GGG - Chr6:99384939-99384958 MsG0680035127.01.T01:intron 45.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTCATAAAA+GGG - Chr6:99383446-99383465 MsG0680035127.01.T01:CDS 5.0%
AACAATCCATCTGCCACGAG+TGG + Chr6:99385511-99385530 None:intergenic 50.0%
AACGAAGCCATCTTGAGAGG+TGG + Chr6:99384604-99384623 None:intergenic 50.0%
AGAAACCCGTCTTCCACAAG+TGG + Chr6:99384530-99384549 None:intergenic 50.0%
AGAGACGGAAACTTGATGGG+TGG + Chr6:99385868-99385887 None:intergenic 50.0%
AGCGAAGCTAACTTGAGAGG+AGG + Chr6:99384182-99384201 None:intergenic 50.0%
AGTGAAGCCAAACTGAGAGG+TGG + Chr6:99384041-99384060 None:intergenic 50.0%
ATCGAGCAAACCACCAACCA+CGG + Chr6:99385092-99385111 None:intergenic 50.0%
CCCAACAATCTACCTGACAC+CGG + Chr6:99385373-99385392 None:intergenic 50.0%
CCCATAATGCCATTGAGCAC+AGG + Chr6:99384392-99384411 None:intergenic 50.0%
CCCGATGGTAAACCACATGA+AGG + Chr6:99383644-99383663 None:intergenic 50.0%
GAAACCCGTCTTCCACAAGT+GGG + Chr6:99384529-99384548 None:intergenic 50.0%
GAATTTCCACTCGTGGCAGA+TGG - Chr6:99385502-99385521 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
GATACCATGGATCCCTACCA+TGG + Chr6:99382342-99382361 None:intergenic 50.0%
GCTGGAAGACCTGAATGGTT+TGG - Chr6:99382638-99382657 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
GTTTCCCACTTGTGGAAGAC+GGG - Chr6:99384522-99384541 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
TCCAGTGAAGCCAAACTGAG+AGG + Chr6:99384044-99384063 None:intergenic 50.0%
TCCTCTTGCAGTGGATGGAA+TGG - Chr6:99384103-99384122 MsG0680035127.01.T01:intron 50.0%
TCGAGCAAAGCCAAGCTGAA+AGG + Chr6:99384467-99384486 None:intergenic 50.0%
TCTCGAGAGTTTCCCACTTG+TGG - Chr6:99384514-99384533 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
TGCCTATACCACCGATACCA+TGG + Chr6:99382355-99382374 None:intergenic 50.0%
! ACCGGTGTCAGGTAGATTGT+TGG - Chr6:99385369-99385388 MsG0680035127.01.T01:intron 50.0%
! ACCTCTCAGTTTGGCTTCAC+TGG - Chr6:99384040-99384059 MsG0680035127.01.T01:intron 50.0%
! ACTTGTGGAAGACGGGTTTC+TGG - Chr6:99384529-99384548 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
! ATATGCTTCTGGCCTTCCGT+TGG - Chr6:99382844-99382863 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
! CCGGTGTCAGGTAGATTGTT+GGG - Chr6:99385370-99385389 MsG0680035127.01.T01:intron 50.0%
! CGAGAGTTTTCCACCAGTAG+TGG - Chr6:99384795-99384814 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
! CTTGTGGAAGACGGGTTTCT+GGG - Chr6:99384530-99384549 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
! TCTTGAGAGTTTTCCTCCCG+TGG - Chr6:99385072-99385091 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
! TGAGAGTTTTCCACCTGTGG+TGG - Chr6:99385639-99385658 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTTTTCCACCTGTGGTGGA+TGG - Chr6:99385643-99385662 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
!! CGGGGTTGAGAGTACTTATG+AGG - Chr6:99382715-99382734 MsG0680035127.01.T01:CDS 50.0%
!! GACGACTCAGTTGGTTTGCT+AGG - Chr6:99383966-99383985 MsG0680035127.01.T01:intron 50.0%
ACCCAGCAATCCATCCACCA+CGG + Chr6:99384252-99384271 None:intergenic 55.0%
AGCAACCCATCCACAATGGG+TGG + Chr6:99385934-99385953 None:intergenic 55.0%
AGCAATCCATCCACCACAGG+TGG + Chr6:99385652-99385671 None:intergenic 55.0%
AGCGAAGCCAACTTGAGAGG+TGG + Chr6:99384883-99384902 None:intergenic 55.0%
AGTACCCCATCAACCACAGG+TGG + Chr6:99385793-99385812 None:intergenic 55.0%
ATAAGCGACCCATCCACCAC+AGG + Chr6:99384950-99384969 None:intergenic 55.0%
CCAAGTACCCCATCAACCAC+AGG + Chr6:99385796-99385815 None:intergenic 55.0%
CTTGCAGTGGATGGAATGGC+TGG - Chr6:99384107-99384126 MsG0680035127.01.T01:intron 55.0%
GCCATTCCATCCACTGCAAG+AGG + Chr6:99384107-99384126 None:intergenic 55.0%
GTCACCATGGTAGGGATCCA+TGG - Chr6:99382335-99382354 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
GTGGAATACTCCCGAGCTTC+CGG + Chr6:99385708-99385727 None:intergenic 55.0%
TCCAGCGAAGCCAACTTGAG+AGG + Chr6:99384886-99384905 None:intergenic 55.0%
TCGAGCAAACCACCAACCAC+GGG + Chr6:99385091-99385110 None:intergenic 55.0%
TTACAGGCTGCGGCAAGCTT+AGG - Chr6:99384990-99385009 MsG0680035127.01.T01:intron 55.0%
! AGTTTTCCTCCCGTGGTTGG+TGG - Chr6:99385079-99385098 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
! GAGAGTTTTCCTCCCGTGGT+TGG - Chr6:99385076-99385095 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
! GAGGGTTTTCTACCGGTGTC+AGG - Chr6:99385358-99385377 MsG0680035127.01.T01:intron 55.0%
! GTAGGGATCCATGGTATCGG+TGG - Chr6:99382344-99382363 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
! TCTCAAGAGTTTTCCGCCCG+TGG - Chr6:99384232-99384251 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
!! ACCTCTCAAGTTGGCTTCGC+TGG - Chr6:99384882-99384901 MsG0680035127.01.T01:intron 55.0%
!! ACCTGTGGTGGATGGATTGC+TGG - Chr6:99385651-99385670 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
!! CCTGTGGTGGATGGATTGCT+GGG - Chr6:99385652-99385671 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
!! CCTGTGGTTGATGGGGTACT+TGG - Chr6:99385793-99385812 MsG0680035127.01.T01:CDS 55.0%
AGCAAACCACCAACCACGGG+AGG + Chr6:99385088-99385107 None:intergenic 60.0%
AGCAATCCATCCACCACGGG+CGG + Chr6:99384248-99384267 None:intergenic 60.0%
CCCAGCAATCCATCCACCAC+AGG + Chr6:99384251-99384270 None:intergenic 60.0%
CCCAGCAATCCATCCACCAC+GGG + Chr6:99384251-99384270 None:intergenic 60.0%
! CAAGAGTTTTCCGCCCGTGG+TGG - Chr6:99384235-99384254 MsG0680035127.01.T01:CDS 60.0%
! CATTAGCAGTGGGCTTCCGG+TGG - Chr6:99386139-99386158 MsG0680035127.01.T01:CDS 60.0%
!! AGTTTTCCGCCCGTGGTGGA+TGG - Chr6:99384239-99384258 MsG0680035127.01.T01:CDS 60.0%
!! CCCGTGGTGGATGGATTGCT+GGG - Chr6:99384248-99384267 MsG0680035127.01.T01:CDS 60.0%
!! GCCCGTGGTGGATGGATTGC+TGG - Chr6:99384247-99384266 MsG0680035127.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 99381745 99386946 99381745 ID=MsG0680035127.01;Name=MsG0680035127.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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MDIHEARCNVDSKNMLQKWKNALQQVANLSGFHYKIRDGYEYEFIQKIVELVSREIKPVTLSVADYLVGLKSQTQNVISLLNVGSDDEVTMVGIHGIGGIGKTTLALAVHNLIAHKFEGSCFLEKVRENSEKHGLLYLQKIILSEIVGEKKTELTSVRQGVSIIQQRLRQKKVLLIIDDVDKKEQLQAIAGRPEWFGLGSRVIVTTRDKNLLTCHGVESTYEVNVLNRKDAFELLVWKSFKNEKVSPIYMNVLNRTITYASGLPLALEVMGSDFIKKGIEEWECALDRYERVPNKEIQKVLKVSFDALEEEEKSVFLDIACCLKGYELSKVERILHAHHGNSKKDHIRVLVEKSLIKISDSGIMTLHDLIEDMGKEIVRKESPKEPGKCSRLWFPKDIVEVLEQNTGSSKIEIVYLDSWIEVKWDGLAFKKMENLKTLIIRNVSFSKSPKHLPNSLRNYMNLRVLNVDRSNFLIKIPDISGLLNLEEFSLQNCQNLTTIDDSVGLLGKLKIFKVIRCNNIRSIPPLSLASLEELDITRCDSLEIFPLAVDGMAGKLKILRVISCNNIKSFPPLKLASLEELHLINCYSLKSFPPVVDGLLGKLRILKATGCIKIRSIPPLNLTSLEELHLLNCYSLESFSPVLNGIMGKLKCLRVQNCNNIKSFQPFSLALLEALDLSYCGSLESFPLVEDGFLGCRKVSCIPPLKLTSLEELNLSYCDGLESFPPVVDGLLEKLKILRVTNCNRLSRIPPLKLASLEELDLSYCCGKLRSIPLLKMASLEQLHLSYCDSLESFPPVVGGLLDKLKILNFACCSKLKSIPPLKLTSLEHLDLSFCDSLESFPHILYESLEKLKILIVKGCSRLKSIPFLKWALLEKLDVSNCASLEGFLPVSGRLLGKLRILNVKGCKKLRRIPPLELASLEQLDLSYCVSLEEFPLVADGLLCKLRILNVKECRKLSSIPPLMLTSLEQLDLSYCCNLESFPPVVDGLLGKLRILNVKDCRKLGSIPPLMLSSLEKLDLSFCASLESFPPVVDGVLGKLKMLYANHCCKLRHFPPIKFPSLEQLDLSYCVSLESFPPIVDGLLDKLKILRVNNCSMLKTIPPLKLTMLRHLNLSSCDSLESFPEILGEMENITKIHLKCNLFNESLAVGFRWFANVKELDLSWSKFIVLPACIEKCNFLWKLILDNCEELEEIEGIPASLTTLSAFDCISLTPSCKIKLLNQELHEARNTSFLLPQAYIPEWFDYQCMEGLSISFWCRHKFPAFVLSVVSSTICSDSQTCVRVIINGNTFFFWNGWVISNQPKTHHLHIFHMQIEDFNDNLDVDLIENKWNHVNIDFGFSFRKCGIHVLKKKSSMEDVQFTDPGSDVNRASSSKLECDSFL*