AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035778.01

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MsG0680035778.01.T01 AT2G13800 41.593 113 64 2 243 354 71 182 1.46e-13 75.5
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MsG0680035778.01.T01 AT1G51850 30.022 463 280 10 528 968 404 844 6.16e-54 203
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MsG0680035778.01.T01 AT1G61490 32.951 349 206 10 637 971 427 761 1.12e-50 192
MsG0680035778.01.T01 AT1G61490 32.951 349 206 10 637 971 427 761 1.12e-50 192
MsG0680035778.01.T01 AT1G61490 32.951 349 206 10 637 971 401 735 1.12e-50 192
MsG0680035778.01.T01 AT1G61490 32.951 349 206 10 637 971 401 735 1.12e-50 192
MsG0680035778.01.T01 AT3G21340 28.484 488 289 13 509 968 403 858 1.21e-50 194
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MsG0680035778.01.T01 AT5G38560 38.658 313 161 11 673 971 319 614 1.35e-50 191
MsG0680035778.01.T01 AT2G28960 29.565 460 281 12 528 971 278 710 1.65e-50 191
MsG0680035778.01.T01 AT4G02410 36.311 347 193 14 633 971 300 626 1.67e-50 190
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MsG0680035778.01.T01 AT1G56120 31.529 314 183 7 90 402 71 353 8.88e-27 118
MsG0680035778.01.T01 AT1G56120 30.488 328 187 8 268 586 76 371 3.11e-25 113
MsG0680035778.01.T01 AT1G56120 28.975 283 191 6 314 590 75 353 4.42e-20 97.1
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MsG0680035778.01.T01 AT4G23290 36.897 290 164 6 687 971 360 635 1.45e-47 182
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MsG0680035778.01.T01 AT2G11520 37.248 298 163 7 679 967 211 493 1.63e-47 178
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MsG0680035778.01.T01 AT3G09010 37.066 259 142 6 661 915 21 262 3.44e-46 168
MsG0680035778.01.T01 AT1G51910 30.973 452 279 15 528 971 413 839 3.49e-46 179
MsG0680035778.01.T01 AT5G03140 34.139 331 183 11 655 972 340 648 3.56e-46 178
MsG0680035778.01.T01 AT4G11490 31.781 365 223 9 614 971 248 593 3.65e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT4G23260 33.645 321 193 7 656 972 307 611 3.88e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT1G56145 28.919 370 234 7 625 971 619 982 4.16e-46 180
MsG0680035778.01.T01 AT1G56145 29.667 300 182 4 108 406 106 377 1.01e-26 118
MsG0680035778.01.T01 AT1G56145 28.660 321 188 6 275 586 103 391 9.16e-24 108
MsG0680035778.01.T01 AT1G56145 28.516 256 160 2 74 307 120 374 2.20e-21 101
MsG0680035778.01.T01 AT1G56145 26.852 324 202 7 213 533 92 383 4.20e-21 100
MsG0680035778.01.T01 AT4G34440 36.934 287 160 7 691 971 313 584 4.82e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT4G34440 36.934 287 160 7 691 971 313 584 4.82e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT3G25490 34.903 361 194 10 637 971 33 378 4.88e-46 172
MsG0680035778.01.T01 AT4G38830 37.241 290 163 6 685 968 339 615 5.07e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT1G52540 30.061 326 207 7 650 972 1 308 5.16e-46 169
MsG0680035778.01.T01 AT1G26150 40.625 256 121 10 670 917 414 646 5.51e-46 176
MsG0680035778.01.T01 AT4G32300 32.335 334 201 9 649 971 445 764 5.53e-46 179
MsG0680035778.01.T01 AT1G16120 34.038 426 222 15 591 973 292 701 5.66e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT4G23250 33.125 320 195 6 656 971 322 626 6.80e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT1G11330 33.010 412 220 15 597 971 403 795 7.13e-46 178
MsG0680035778.01.T01 AT3G07070 35.505 307 174 9 674 971 62 353 7.38e-46 171
MsG0680035778.01.T01 AT1G11050 36.039 308 157 10 691 978 296 583 7.51e-46 176
MsG0680035778.01.T01 AT3G45420 32.012 328 189 12 660 975 317 622 7.77e-46 176
MsG0680035778.01.T01 AT4G23280 31.367 373 215 8 626 971 256 614 7.85e-46 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G17250 26.714 700 383 22 26 632 52 714 7.87e-46 177
MsG0680035778.01.T01 AT4G04960 31.233 365 224 12 619 971 271 620 8.35e-46 176
MsG0680035778.01.T01 AT5G01020 33.667 300 177 5 681 971 60 346 9.07e-46 170
MsG0680035778.01.T01 AT1G21590 33.564 289 176 4 686 971 365 640 1.14e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT4G23250 33.333 321 192 7 658 971 326 631 1.19e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT5G10530 32.286 350 204 12 636 971 277 607 1.32e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT1G55200 34.202 307 173 9 691 991 380 663 1.44e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G55200 34.202 307 173 9 691 991 380 663 1.44e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G55200 34.202 307 173 9 691 991 380 663 1.44e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G55200 34.202 307 173 9 691 991 380 663 1.44e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G21590 33.564 289 176 4 686 971 405 680 1.61e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT2G18470 38.431 255 132 6 674 920 265 502 1.62e-45 173
MsG0680035778.01.T01 AT1G61610 40.789 228 121 4 687 912 522 737 1.70e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT4G13920 30.584 582 360 15 43 593 94 662 1.74e-45 177
MsG0680035778.01.T01 AT4G13920 27.707 628 309 19 77 567 183 802 1.12e-40 162
MsG0680035778.01.T01 AT4G13920 27.625 619 330 20 37 609 276 822 2.28e-34 142
MsG0680035778.01.T01 AT4G13920 28.571 434 246 11 197 589 84 494 3.75e-25 113
MsG0680035778.01.T01 AT4G21230 32.258 341 207 9 635 971 283 603 1.94e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT1G49730 32.105 380 210 10 621 971 268 628 1.98e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT3G23110 29.322 590 364 14 23 593 36 591 2.07e-45 177
MsG0680035778.01.T01 AT3G23110 31.269 323 205 7 291 602 114 430 1.16e-29 127
MsG0680035778.01.T01 AT3G23110 30.597 402 260 10 244 627 114 514 5.27e-29 125
MsG0680035778.01.T01 AT3G23110 25.000 460 228 8 65 412 297 751 3.99e-23 106
MsG0680035778.01.T01 AT1G79680 38.989 277 151 7 695 967 438 700 2.27e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G11300 35.345 348 192 10 639 971 429 758 2.34e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT4G21400 36.620 284 155 9 693 967 352 619 2.34e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT4G21400 34.951 309 167 10 677 967 339 631 2.63e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT1G21240 36.808 307 170 9 673 971 134 424 2.94e-45 171
MsG0680035778.01.T01 AT1G70450 34.915 295 169 8 685 971 44 323 3.01e-45 168
MsG0680035778.01.T01 AT4G23260 34.483 290 172 5 687 972 325 600 3.14e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT1G70130 31.937 382 223 15 603 971 247 604 3.46e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT3G05360 27.637 673 391 16 25 605 35 703 4.07e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G16110 39.490 314 157 8 607 902 335 633 4.66e-45 173
MsG0680035778.01.T01 AT5G59270 30.814 344 217 9 634 971 293 621 4.73e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 29.393 626 343 16 58 593 79 695 5.02e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 30.541 573 313 16 74 590 288 831 2.29e-44 174
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 29.888 358 203 9 64 378 479 831 5.14e-24 109
MsG0680035778.01.T01 AT3G13690 35.135 296 166 8 691 980 412 687 5.07e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT3G13690 35.135 296 166 8 691 980 412 687 5.07e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT3G13690 35.135 296 166 8 691 980 412 687 5.07e-45 175
MsG0680035778.01.T01 AT4G23280 35.336 283 164 6 694 971 348 616 5.42e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT5G59270 30.814 344 217 9 634 971 290 618 5.54e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT4G35030 34.576 295 172 7 687 975 101 380 5.64e-45 169
MsG0680035778.01.T01 AT4G35030 34.576 295 172 7 687 975 101 380 5.64e-45 169
MsG0680035778.01.T01 AT4G35030 34.576 295 172 7 687 975 101 380 5.64e-45 169
MsG0680035778.01.T01 AT4G35030 34.576 295 172 7 687 975 101 380 5.64e-45 169
MsG0680035778.01.T01 AT5G59270 30.588 340 216 9 637 971 313 637 5.65e-45 174
MsG0680035778.01.T01 AT4G00960 36.066 244 140 5 734 971 10 243 5.86e-45 164
MsG0680035778.01.T01 AT1G07870 34.437 302 178 8 677 971 89 377 6.01e-45 168
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 36.170 282 162 6 694 971 644 911 6.29e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 34.866 261 140 5 97 355 99 331 5.74e-31 132
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 30.800 250 145 4 366 589 103 350 3.60e-24 110
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 29.514 288 176 6 300 586 109 370 3.19e-21 100
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 31.048 248 143 3 77 301 127 369 5.09e-18 90.1
MsG0680035778.01.T01 AT1G29730 28.986 276 164 6 291 563 124 370 1.10e-17 89.4
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 29.393 626 343 16 58 593 16 632 6.49e-45 176
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 30.314 574 313 16 74 590 225 768 3.07e-44 174
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 25.443 621 373 15 56 595 138 749 2.04e-33 139
MsG0680035778.01.T01 AT3G11010 29.888 358 203 9 64 378 416 768 4.84e-24 109

Find 166 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 209 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATGCAAAAGTTGCTGATTT+TGG 0.126725 6:+112125166 MsG0680035778.01.T01:CDS
GAACATTTATATAGATATTT+TGG 0.129357 6:-112122985 None:intergenic
CCTTTGGTGCATGTTATTTC+TGG 0.140889 6:-112122841 None:intergenic
GGGAAAATACCAAATGATTT+TGG 0.165130 6:+112123555 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGTACACTTCCTTCTGATTT+TGG 0.166233 6:+112123699 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCAACTTGGTTATGCTTAA+TGG 0.173420 6:-112123279 None:intergenic
CAAACACCTCTTATTGTTCT+TGG 0.198314 6:+112122818 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATGCTTAATGGAAGCTTTAA+AGG 0.200244 6:-112123267 None:intergenic
GGTTGGATCATTTGGTTATA+TGG 0.203527 6:+112125240 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTACATGTATTGTTCAAATT+TGG 0.205186 6:+112123317 MsG0680035778.01.T01:CDS
CTTGATCAAAATCAGCTTAA+AGG 0.209922 6:+112124173 MsG0680035778.01.T01:CDS
CATGGTAAGTTACAAAATTT+AGG 0.219495 6:+112123798 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGCAAAATGAAAATTTGATA+TGG 0.220264 6:-112122669 None:intergenic
GATGCTTGTGTATGAGTATT+TGG 0.220363 6:+112124934 MsG0680035778.01.T01:CDS
TCAAGAGCAACAGAAATTTA+AGG 0.227944 6:+112124807 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTATCAAATAATAGTTTAAC+TGG 0.249937 6:+112123393 MsG0680035778.01.T01:CDS
CTTTACGGAAATAGTCTATT+TGG 0.253319 6:+112123465 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGTAAATGACCGATTGAAAT+TGG 0.254690 6:-112124275 None:intergenic
GCAAGCAAGAATTATCTTAA+TGG 0.260027 6:+112124101 MsG0680035778.01.T01:CDS
AATACAACACTGTTAACTTT+TGG 0.262977 6:-112123584 None:intergenic
CAGCTTTGGTGTTATCCTAT+TGG 0.265387 6:+112125632 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCCAATTGGAGTATCTTCT+TGG 0.268132 6:+112124057 MsG0680035778.01.T01:CDS
TCAGCTTTGGTTGGATCATT+TGG 0.288538 6:+112125232 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTAGTCCATTGAGTTGATTT+TGG 0.294972 6:-112124250 None:intergenic
TCCTTATGACATTCAAAGTT+TGG 0.299614 6:+112123056 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTGAGCGAAGTGTACCTTTA+CGG 0.304312 6:+112123450 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCGCAGAGAATAATCTTAT+AGG 0.304449 6:+112123534 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGCTAGCATTGGAAAATTCT+TGG 0.307786 6:+112124639 MsG0680035778.01.T01:CDS
TATTGCTTTCTGCTTGAATA+TGG 0.309637 6:-112125722 None:intergenic
AATTGTTGTGACTGTCTTGT+TGG 0.316953 6:+112124571 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGGAATATCAGCACTGAAAT+AGG 0.325273 6:-112123109 None:intergenic
CTTCAATATAGTTCATTTGA+TGG 0.325303 6:+112123171 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCTAGTATTGGAAGGCTTA+AGG 0.329841 6:+112123131 MsG0680035778.01.T01:CDS
TCGCAGAGAATAATCTTATA+GGG 0.335127 6:+112123535 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTTATATCGCGATGAATTAT+CGG 0.335847 6:-112125112 None:intergenic
CTTGTTCAACCTTGAACTCT+TGG 0.335912 6:+112123218 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATTAATGCTTCAACCACATT+TGG 0.339034 6:-112123495 None:intergenic
AACACCCACATGACAATATT+AGG 0.342753 6:+112122640 None:intergenic
TGTTACACACATTGCTTAGA+AGG 0.349461 6:+112125868 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTGATCAAAATCAGCTTAAA+GGG 0.353633 6:+112124174 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGTATTGTTCAAATTTGGTT+GGG 0.361841 6:+112123322 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTAAGATATCCTATGCTTTG+TGG 0.370213 6:-112123636 None:intergenic
ACAAGACAGTCACAACAATT+AGG 0.373057 6:-112124568 None:intergenic
TGTGTGTAACACCTTCTTCA+TGG 0.374502 6:-112125856 None:intergenic
CTGAGATGTGTGAGTATAGA+AGG 0.374593 6:-112124347 None:intergenic
AGCAACAATCTTTCAAGATT+AGG 0.377021 6:-112124152 None:intergenic
GGGGAAATTCCTGAGGCTAT+TGG 0.380028 6:+112123342 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGGACCATGGAATATGAATT+TGG 0.392259 6:+112123929 MsG0680035778.01.T01:CDS
CATCTCTTGCACAATGGGCT+TGG 0.392851 6:+112125697 MsG0680035778.01.T01:CDS
AAAGCCTCACATTGGTCTCT+TGG 0.399305 6:+112124533 MsG0680035778.01.T01:CDS
GCTGATATTCCTTCTAGTAT+TGG 0.400397 6:+112123120 MsG0680035778.01.T01:CDS
AAGAGACCAATGTGAGGCTT+TGG 0.404635 6:-112124531 None:intergenic
AGGTATAGTTTGAGTTATGT+TGG 0.412420 6:-112122893 None:intergenic
AGTAATGGAACAAAGTTGTT+TGG 0.416999 6:+112125767 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATCCTATTGGAACTTACAAC+TGG 0.418585 6:+112125645 MsG0680035778.01.T01:CDS
AACAAGTTACCAATTTCATC+AGG 0.419514 6:-112123201 None:intergenic
AAATGAGTCATTAGCTATGT+TGG 0.421284 6:+112124991 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTGGAACTCTTCCTGTCAAA+TGG 0.421694 6:-112124397 None:intergenic
CGCAACATGTCGTCCTTGAT+TGG 0.423112 6:+112125020 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTATTCATCTCTTGCACAAT+GGG 0.426338 6:+112125692 MsG0680035778.01.T01:CDS
CAATCCTGTGACAGAACCTT+TGG 0.427690 6:-112122857 None:intergenic
TGTTGTGCAGCCACTTGTCT+AGG 0.428790 6:-112124967 None:intergenic
GTCATTAGCTATGTTGGATT+CGG 0.430329 6:+112124997 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCTGGCCAAGAACAATAAG+AGG 0.432753 6:-112122824 None:intergenic
TCCTGAGGCTATTGGTGAAA+TGG 0.434364 6:+112123350 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATGGCTATTTGCAATCGCTT+TGG 0.434679 6:-112125043 None:intergenic
CCAGAGAACTTGTGTTATCA+TGG 0.435714 6:+112123780 MsG0680035778.01.T01:CDS
AATGGTTGCATTGGAAAACT+TGG 0.438415 6:+112123368 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTTTAACACCATGTCAGCTT+TGG 0.438703 6:+112125219 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCCATGATATTACATCAGA+TGG 0.439423 6:-112124203 None:intergenic
AAGATTGATGTATTCAGCTT+TGG 0.440103 6:+112125618 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATCATCGGAAGTGGAGGATT+CGG 0.440975 6:+112124731 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTAAGCCTTCCAATACTAGA+AGG 0.442848 6:-112123129 None:intergenic
AGGAGGCAACAAATAATTAG+AGG 0.447042 6:-112123247 None:intergenic
TACCAGTTGTAAGTTCCAAT+AGG 0.450095 6:-112125647 None:intergenic
GACAGAGGAATGATATTGTC+GGG 0.451767 6:+112125910 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGAAGAGTTGTTAGCTCTTG+AGG 0.452057 6:-112124131 None:intergenic
GCTAGATTCTTAACGAAGCC+AGG 0.452883 6:+112125193 MsG0680035778.01.T01:CDS
GCTCAAATTTAAAGTCACTA+AGG 0.457309 6:-112124228 None:intergenic
GCAAAATGAAAATTTGATAT+GGG 0.458771 6:-112122668 None:intergenic
GCTAGCATTGGAAAATTCTT+GGG 0.462056 6:+112124640 MsG0680035778.01.T01:CDS
CCATGATAACACAAGTTCTC+TGG 0.464963 6:-112123780 None:intergenic
AGGACATATCCAAGAGTTCA+AGG 0.473183 6:-112123227 None:intergenic
TTGTACTTGAACAATTTGTC+AGG 0.473300 6:+112123606 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTCCAAGAAGATACTCCAAT+TGG 0.473935 6:-112124059 None:intergenic
TTCATGGAAGGTCTACTAGA+AGG 0.475708 6:-112125840 None:intergenic
TTCCATCTGATGTAATATCA+TGG 0.477085 6:+112124201 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTCTGTCACAGGATTGACTT+TGG 0.482462 6:+112122864 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTGTCAATGAATAAATTTGT+TGG 0.482509 6:+112123027 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGACTAATTCCAATTTCAAT+CGG 0.482840 6:+112124266 MsG0680035778.01.T01:CDS
GCAATCGCTTTGGCCAATCA+AGG 0.483348 6:-112125033 None:intergenic
CATCAAATGAACTATATTGA+AGG 0.483637 6:-112123170 None:intergenic
ATGTATTGTTCAAATTTGGT+TGG 0.488517 6:+112123321 MsG0680035778.01.T01:CDS
ACCAAACTTTGAATGTCATA+AGG 0.489788 6:-112123057 None:intergenic
TTATCGGAGGCGAGCAATCA+TGG 0.491973 6:-112125096 None:intergenic
AAGAGCTCGAAGCTTCGTTT+CGG 0.493375 6:+112124831 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTTAAGGACAAATTTGCAAA+GGG 0.494204 6:-112124501 None:intergenic
GGGAGCTCATTTCATTTCAA+AGG 0.494769 6:+112124660 MsG0680035778.01.T01:CDS
AACTCTTCCTGTCAAATGGT+TGG 0.497249 6:-112124393 None:intergenic
TTCATATTCCATGGTCCACC+AGG 0.501722 6:-112123924 None:intergenic
TGAAGGTCACATATGAAAGA+AGG 0.504525 6:-112122913 None:intergenic
GAACAAAATATCATCGGAAG+TGG 0.506699 6:+112124722 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGCGATTGCAAATAGCCATT+GGG 0.507109 6:+112125047 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTGAGCCAAAATCAACTCAA+TGG 0.507154 6:+112124245 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGGGAAGGAGGGATTGTGTT+CGG 0.508175 6:+112125888 MsG0680035778.01.T01:CDS
TCATTTGGTTATATGGCTCC+AGG 0.508824 6:+112125247 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATGAACTATATTGAAGGTGC+AGG 0.511467 6:-112123164 None:intergenic
CAAATAGACTATTTCCGTAA+AGG 0.512340 6:-112123464 None:intergenic
CATTTGCAATATCTCAACCT+TGG 0.513627 6:+112123081 MsG0680035778.01.T01:CDS
GCTTATGAAAATCATTTAAG+TGG 0.514018 6:+112123822 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGACAAATTTGCAAAGGGTG+AGG 0.518553 6:-112124496 None:intergenic
GTATTGTTCAAATTTGGTTG+GGG 0.521690 6:+112123323 MsG0680035778.01.T01:CDS
AAGCGATTGCAAATAGCCAT+TGG 0.524411 6:+112125046 MsG0680035778.01.T01:CDS
TAGTAGACCTTCCATGAAGA+AGG 0.528546 6:+112125845 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTCACCAAATTCATATTCCA+TGG 0.529055 6:-112123933 None:intergenic
AACACCATGTCAGCTTTGGT+TGG 0.531014 6:+112125223 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTAAAATTCCTGGTGGACCA+TGG 0.532476 6:+112123916 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATTGCTCAATATTCTAACTT+CGG 0.532926 6:-112124855 None:intergenic
GACCAATGTGAGGCTTTGGT+TGG 0.533977 6:-112124527 None:intergenic
GACATGGTGTTAAACTGTCC+TGG 0.537120 6:-112125211 None:intergenic
ATCAGACATAGTTTCCTCAA+TGG 0.538930 6:+112124697 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATATTCCTTCTAGTATTGGA+AGG 0.539051 6:+112123124 MsG0680035778.01.T01:CDS
CTATCATCCAACCATTTGAC+AGG 0.540298 6:+112124386 MsG0680035778.01.T01:CDS
CAAATCAAGATACTCAAGCT+TGG 0.542701 6:-112123007 None:intergenic
GTTGCTTGACAATGAAGTAA+TGG 0.544312 6:+112125752 MsG0680035778.01.T01:CDS
CAAAATATCATCGGAAGTGG+AGG 0.544387 6:+112124725 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGATCCAACCAAAGCTGACA+TGG 0.548552 6:-112125227 None:intergenic
CACACATTGCTTAGAAGGGA+AGG 0.548670 6:+112125873 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGCACCAAAGGTTCTGTCAC+AGG 0.549057 6:+112122853 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATAAGACATAATAAGTTCAC+TGG 0.553532 6:+112123963 MsG0680035778.01.T01:CDS
ACCATTTCACCAATAGCCTC+AGG 0.558587 6:-112123351 None:intergenic
GGACAGAGGAATGATATTGT+CGG 0.558915 6:+112125909 MsG0680035778.01.T01:CDS
GTTGTGTTGCATCTCTAATG+AGG 0.565815 6:+112124904 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATAGCCATTGGGATTGCTCA+CGG 0.573252 6:+112125058 MsG0680035778.01.T01:CDS
TATTGGTGAAATGGTTGCAT+TGG 0.574039 6:+112123359 MsG0680035778.01.T01:CDS
ACATAGGTTAAACCGTCGAC+TGG 0.584242 6:-112124770 None:intergenic
GTTACACACATTGCTTAGAA+GGG 0.592942 6:+112125869 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATGGCAGAACAAAATATCAT+CGG 0.594129 6:+112124716 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGTATTCATCTCTTGCACAA+TGG 0.596396 6:+112125691 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGTAACACCTTCTTCATGGA+AGG 0.598727 6:-112125852 None:intergenic
CCAGAAATAACATGCACCAA+AGG 0.602584 6:+112122841 MsG0680035778.01.T01:CDS
GGAGAGATTCCACAAAGCAT+AGG 0.606214 6:+112123627 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGATAGATCAAGAACACTGA+GGG 0.608552 6:-112124300 None:intergenic
CTTAATGGAAGCTTTAAAGG+AGG 0.622575 6:-112123264 None:intergenic
CATTGCTTAGAAGGGAAGGA+GGG 0.622585 6:+112125877 MsG0680035778.01.T01:CDS
GAGGGATTGTGTTCGGACAG+AGG 0.623383 6:+112125895 MsG0680035778.01.T01:CDS
AACCAACCAAAGCCTCACAT+TGG 0.625394 6:+112124525 MsG0680035778.01.T01:CDS
GAGTGAATACCAAAATCAGA+AGG 0.627965 6:-112123708 None:intergenic
GAGTATAGAAGGTATTTCGC+CGG 0.628210 6:-112124336 None:intergenic
ACATTGCTTAGAAGGGAAGG+AGG 0.628312 6:+112125876 MsG0680035778.01.T01:CDS
TTTGGTTGGGGAAATTCCTG+AGG 0.632876 6:+112123335 MsG0680035778.01.T01:CDS
AGATCAAGAACACTGAGGGA+AGG 0.639586 6:-112124296 None:intergenic
ATATCGCGATGAATTATCGG+AGG 0.644238 6:-112125109 None:intergenic
AACATAGCAGCCTAGACAAG+TGG 0.644482 6:+112124957 MsG0680035778.01.T01:CDS
ATTTGGAGAGATACCAAATG+TGG 0.644820 6:+112123482 MsG0680035778.01.T01:CDS
TGCTGAAATCAACATGTGTG+AGG 0.646608 6:-112122939 None:intergenic
TTAAGCAAGAACAAACCACT+AGG 0.652900 6:-112123423 None:intergenic
AGGTGTTTGATGAGTTCCAG+TGG 0.660805 6:-112122804 None:intergenic
TTAAACCGTCGACTGGAATG+CGG 0.664444 6:-112124763 None:intergenic
GTATACCGCATTCCAGTCGA+CGG 0.668920 6:+112124758 MsG0680035778.01.T01:CDS
CACTGAAATAGGTTGAACCA+AGG 0.680502 6:-112123098 None:intergenic
ACAGAGGAATGATATTGTCG+GGG 0.691386 6:+112125911 MsG0680035778.01.T01:CDS
CGGAAGTGGAGGATTCGGAA+CGG 0.700154 6:+112124736 MsG0680035778.01.T01:CDS
CAAACCGTGAGCAATCCCAA+TGG 0.702359 6:-112125062 None:intergenic
CTGATAGATCAAGAACACTG+AGG 0.705524 6:-112124301 None:intergenic
CAAACCAAGAGACCAATGTG+AGG 0.751745 6:-112124537 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATAAGGAATATATTTGT+TGG - Chr6:112125308-112125327 None:intergenic 15.0%
!! TTATCAAATAATAGTTTAAC+TGG + Chr6:112123393-112123412 MsG0680035778.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTGAAATCAACAATTTTA+AGG + Chr6:112123749-112123768 MsG0680035778.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATAAGTTACAATCAATTTTA+CGG + Chr6:112124029-112124048 MsG0680035778.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATAATTTTGTAAACACATTA+AGG - Chr6:112125485-112125504 None:intergenic 15.0%
!!! ATTGAAATCAACAATTTTAA+GGG + Chr6:112123750-112123769 MsG0680035778.01.T01:CDS 15.0%
!!! GAACATTTATATAGATATTT+TGG - Chr6:112122988-112123007 None:intergenic 15.0%
!! AGCAAAATGAAAATTTGATA+TGG - Chr6:112122672-112122691 None:intergenic 20.0%
!! GCAAAATGAAAATTTGATAT+GGG - Chr6:112122671-112122690 None:intergenic 20.0%
!! TAACAAACTAATCTTTCTAA+TGG - Chr6:112125352-112125371 None:intergenic 20.0%
!! TTACATGTATTGTTCAAATT+TGG + Chr6:112123317-112123336 MsG0680035778.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTCAATGAATAAATTTGT+TGG + Chr6:112123027-112123046 MsG0680035778.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACTTTCAATTTTTTCAACT+TGG - Chr6:112123295-112123314 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTACAAGAATGAATTTTC+TGG + Chr6:112123894-112123913 MsG0680035778.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTACAATTTTCAATTGATTT+TGG - Chr6:112123855-112123874 None:intergenic 20.0%
! ACACAATTAGATCAAACTTA+AGG - Chr6:112125548-112125567 None:intergenic 25.0%
! ATAAGACATAATAAGTTCAC+TGG + Chr6:112123963-112123982 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATTGTTCAAATTTGGT+TGG + Chr6:112123321-112123340 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGCTCAATATTCTAACTT+CGG - Chr6:112124858-112124877 None:intergenic 25.0%
! CATCAAATGAACTATATTGA+AGG - Chr6:112123173-112123192 None:intergenic 25.0%
! CATGCATAGAATGTAAAATA+AGG - Chr6:112125322-112125341 None:intergenic 25.0%
! CATGGTAAGTTACAAAATTT+AGG + Chr6:112123798-112123817 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! CTTCAATATAGTTCATTTGA+TGG + Chr6:112123171-112123190 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! GCTTATGAAAATCATTTAAG+TGG + Chr6:112123822-112123841 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! TGAGAAAAACATAAAGGAAT+TGG - Chr6:112125285-112125304 None:intergenic 25.0%
! TGTATTGTTCAAATTTGGTT+GGG + Chr6:112123322-112123341 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTTAAAAGTCGTAACAAA+CGG + Chr6:112125410-112125429 MsG0680035778.01.T01:intron 25.0%
! TTGATCAAAATCAGCTTAAA+GGG + Chr6:112124174-112124193 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAAGGACAAATTTGCAAA+GGG - Chr6:112124504-112124523 None:intergenic 25.0%
! TTTATATCGCGATGAATTAT+CGG - Chr6:112125115-112125134 None:intergenic 25.0%
!! AAAAACAAGCAACATACTTT+TGG + Chr6:112125132-112125151 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAACAAGCAACATACTTTT+GGG + Chr6:112125133-112125152 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
!! AATACAACACTGTTAACTTT+TGG - Chr6:112123587-112123606 None:intergenic 25.0%
!! ATACTCGAAGAAAAATTTTG+AGG - Chr6:112123996-112124015 None:intergenic 25.0%
!! CTATCAGAAAATCAATTTTC+CGG + Chr6:112124317-112124336 MsG0680035778.01.T01:CDS 25.0%
!! GCTGAATTTTCAAATTCAAT+TGG - Chr6:112124419-112124438 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTAAGGACAAATTTGCAA+AGG - Chr6:112124505-112124524 None:intergenic 25.0%
AAATGAGTCATTAGCTATGT+TGG + Chr6:112124991-112125010 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
AACAAGTTACCAATTTCATC+AGG - Chr6:112123204-112123223 None:intergenic 30.0%
AAGATTGATGTATTCAGCTT+TGG + Chr6:112125618-112125637 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAACTTTGAATGTCATA+AGG - Chr6:112123060-112123079 None:intergenic 30.0%
AGCAACAATCTTTCAAGATT+AGG - Chr6:112124155-112124174 None:intergenic 30.0%
ATGGCAGAACAAAATATCAT+CGG + Chr6:112124716-112124735 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
ATTAATGCTTCAACCACATT+TGG - Chr6:112123498-112123517 None:intergenic 30.0%
CAAATAGACTATTTCCGTAA+AGG - Chr6:112123467-112123486 None:intergenic 30.0%
CTTGATCAAAATCAGCTTAA+AGG + Chr6:112124173-112124192 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
CTTTACGGAAATAGTCTATT+TGG + Chr6:112123465-112123484 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
GCAAGCAAGAATTATCTTAA+TGG + Chr6:112124101-112124120 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
GGACTAATTCCAATTTCAAT+CGG + Chr6:112124266-112124285 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
GTATTGTTCAAATTTGGTTG+GGG + Chr6:112123323-112123342 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGAAAGCTGAAACAAAC+AGG + Chr6:112125521-112125540 MsG0680035778.01.T01:intron 30.0%
TATTGCTTTCTGCTTGAATA+TGG - Chr6:112125725-112125744 None:intergenic 30.0%
TCAAGAGCAACAGAAATTTA+AGG + Chr6:112124807-112124826 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTATGACATTCAAAGTT+TGG + Chr6:112123056-112123075 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TCGCAGAGAATAATCTTATA+GGG + Chr6:112123535-112123554 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TTAACTGGAAAAATTCCTAG+TGG + Chr6:112123408-112123427 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TTAAGATATCCTATGCTTTG+TGG - Chr6:112123639-112123658 None:intergenic 30.0%
TTCAACTTGGTTATGCTTAA+TGG - Chr6:112123282-112123301 None:intergenic 30.0%
TTCAGCAAAAATTTCATTCC+TGG + Chr6:112122955-112122974 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATCTGATGTAATATCA+TGG + Chr6:112124201-112124220 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATGATATTACATCAGA+TGG - Chr6:112124206-112124225 None:intergenic 30.0%
TTCGCAGAGAATAATCTTAT+AGG + Chr6:112123534-112123553 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
TTGTACTTGAACAATTTGTC+AGG + Chr6:112123606-112123625 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAGCTTTTTGAACAATTC+TGG + Chr6:112124446-112124465 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! AGGTATAGTTTGAGTTATGT+TGG - Chr6:112122896-112122915 None:intergenic 30.0%
! AGTAATGGAACAAAGTTGTT+TGG + Chr6:112125767-112125786 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! AGTTACAATCAATTTTACGG+TGG + Chr6:112124032-112124051 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! ATATTCCTTCTAGTATTGGA+AGG + Chr6:112123124-112123143 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! ATGCTTAATGGAAGCTTTAA+AGG - Chr6:112123270-112123289 None:intergenic 30.0%
! ATGTGCAACATTTTCAAACT+TGG + Chr6:112125795-112125814 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! GAAAAGATGCATTCTTTTGT+AGG - Chr6:112122780-112122799 None:intergenic 30.0%
! GCTCAAATTTAAAGTCACTA+AGG - Chr6:112124231-112124250 None:intergenic 30.0%
! GGGAAAATACCAAATGATTT+TGG + Chr6:112123555-112123574 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! TGGAGTTTTCCAAAATCATT+TGG - Chr6:112123567-112123586 None:intergenic 30.0%
! TGTGCAACATTTTCAAACTT+GGG + Chr6:112125796-112125815 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTGGTGAGAAAAACATAA+AGG - Chr6:112125291-112125310 None:intergenic 30.0%
!! GAATTTTCTGGTAAAATTCC+TGG + Chr6:112123906-112123925 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATGCAAAAGTTGCTGATTT+TGG + Chr6:112125166-112125185 MsG0680035778.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATTTTTTTCACAGCAACAT+AGG - Chr6:112124789-112124808 None:intergenic 30.0%
!!! TTAGTCCATTGAGTTGATTT+TGG - Chr6:112124253-112124272 None:intergenic 30.0%
AATGGTTGCATTGGAAAACT+TGG + Chr6:112123368-112123387 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
AATTGTTGTGACTGTCTTGT+TGG + Chr6:112124571-112124590 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
ACAAGACAGTCACAACAATT+AGG - Chr6:112124571-112124590 None:intergenic 35.0%
AGGAGGCAACAAATAATTAG+AGG - Chr6:112123250-112123269 None:intergenic 35.0%
AGTATTCATCTCTTGCACAA+TGG + Chr6:112125691-112125710 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGACATAGTTTCCTCAA+TGG + Chr6:112124697-112124716 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
ATCCTATTGGAACTTACAAC+TGG + Chr6:112125645-112125664 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGAGAGATACCAAATG+TGG + Chr6:112123482-112123501 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
CAAACACCTCTTATTGTTCT+TGG + Chr6:112122818-112122837 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
CAAATCAAGATACTCAAGCT+TGG - Chr6:112123010-112123029 None:intergenic 35.0%
CATTTGCAATATCTCAACCT+TGG + Chr6:112123081-112123100 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GAACAAAATATCATCGGAAG+TGG + Chr6:112124722-112124741 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GAGTGAATACCAAAATCAGA+AGG - Chr6:112123711-112123730 None:intergenic 35.0%
GATGCTTGTGTATGAGTATT+TGG + Chr6:112124934-112124953 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GCTGATATTCCTTCTAGTAT+TGG + Chr6:112123120-112123139 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAATGACCGATTGAAAT+TGG - Chr6:112124278-112124297 None:intergenic 35.0%
GGTTGGATCATTTGGTTATA+TGG + Chr6:112125240-112125259 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GTATTCATCTCTTGCACAAT+GGG + Chr6:112125692-112125711 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GTCACCAAATTCATATTCCA+TGG - Chr6:112123936-112123955 None:intergenic 35.0%
GTCATTAGCTATGTTGGATT+CGG + Chr6:112124997-112125016 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GTTACACACATTGCTTAGAA+GGG + Chr6:112125869-112125888 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCTTGACAATGAAGTAA+TGG + Chr6:112125752-112125771 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
TACCAGTTGTAAGTTCCAAT+AGG - Chr6:112125650-112125669 None:intergenic 35.0%
TATTGGTGAAATGGTTGCAT+TGG + Chr6:112123359-112123378 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGGTCACATATGAAAGA+AGG - Chr6:112122916-112122935 None:intergenic 35.0%
TGATAGATCAAGAACACTGA+GGG - Chr6:112124303-112124322 None:intergenic 35.0%
TGGACCATGGAATATGAATT+TGG + Chr6:112123929-112123948 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
TGTTACACACATTGCTTAGA+AGG + Chr6:112125868-112125887 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGCAAGAACAAACCACT+AGG - Chr6:112123426-112123445 None:intergenic 35.0%
TTAAGCCTTCCAATACTAGA+AGG - Chr6:112123132-112123151 None:intergenic 35.0%
TTGAGCCAAAATCAACTCAA+TGG + Chr6:112124245-112124264 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! AATTGGTCGTTCATTTTACC+TGG - Chr6:112125268-112125287 None:intergenic 35.0%
! AGCTAGCATTGGAAAATTCT+TGG + Chr6:112124639-112124658 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAATATCAGCACTGAAAT+AGG - Chr6:112123112-112123131 None:intergenic 35.0%
! ATGAACTATATTGAAGGTGC+AGG - Chr6:112123167-112123186 None:intergenic 35.0%
! GATATTTTGTTCTGCCATTG+AGG - Chr6:112124714-112124733 None:intergenic 35.0%
! GCTAGCATTGGAAAATTCTT+GGG + Chr6:112124640-112124659 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! GGTACTTTTCCTGATGAAAT+TGG + Chr6:112123192-112123211 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! GTCTCTATGAACAAGTTTTC+AGG + Chr6:112123678-112123697 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCAATTGGAGTATCTTCT+TGG + Chr6:112124057-112124076 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTAGTATTGGAAGGCTTA+AGG + Chr6:112123131-112123150 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTACGGTGGAATTCCAAT+TGG + Chr6:112124044-112124063 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATATTTTGGAAACTCACC+AGG - Chr6:112122976-112122995 None:intergenic 35.0%
!! CTTAATGGAAGCTTTAAAGG+AGG - Chr6:112123267-112123286 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCTGGTAAAATTCCTGG+TGG + Chr6:112123909-112123928 MsG0680035778.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGGCTTTGGTTGGTTTTTTA+AGG - Chr6:112124520-112124539 None:intergenic 35.0%
AACTCTTCCTGTCAAATGGT+TGG - Chr6:112124396-112124415 None:intergenic 40.0%
AAGCGATTGCAAATAGCCAT+TGG + Chr6:112125046-112125065 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
ACAGAGGAATGATATTGTCG+GGG + Chr6:112125911-112125930 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGTAAAAAAGCTACTCG+TGG + Chr6:112125663-112125682 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
AGCGATTGCAAATAGCCATT+GGG + Chr6:112125047-112125066 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
AGGACATATCCAAGAGTTCA+AGG - Chr6:112123230-112123249 None:intergenic 40.0%
ATATCGCGATGAATTATCGG+AGG - Chr6:112125112-112125131 None:intergenic 40.0%
ATGGCTATTTGCAATCGCTT+TGG - Chr6:112125046-112125065 None:intergenic 40.0%
CAAAATATCATCGGAAGTGG+AGG + Chr6:112124725-112124744 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
CAGAAAAAGAGAGCTAGCAT+TGG + Chr6:112124628-112124647 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
CCAGAAATAACATGCACCAA+AGG + Chr6:112122841-112122860 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
CCAGAGAACTTGTGTTATCA+TGG + Chr6:112123780-112123799 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
CCATGATAACACAAGTTCTC+TGG - Chr6:112123783-112123802 None:intergenic 40.0%
CTATCATCCAACCATTTGAC+AGG + Chr6:112124386-112124405 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
CTGAGATGTGTGAGTATAGA+AGG - Chr6:112124350-112124369 None:intergenic 40.0%
CTGATAGATCAAGAACACTG+AGG - Chr6:112124304-112124323 None:intergenic 40.0%
CTTGTTCAACCTTGAACTCT+TGG + Chr6:112123218-112123237 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
GACAGAGGAATGATATTGTC+GGG + Chr6:112125910-112125929 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
GGACAGAGGAATGATATTGT+CGG + Chr6:112125909-112125928 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
GGGAGCTCATTTCATTTCAA+AGG + Chr6:112124660-112124679 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
GTCCAAGAAGATACTCCAAT+TGG - Chr6:112124062-112124081 None:intergenic 40.0%
GTTGTGTTGCATCTCTAATG+AGG + Chr6:112124904-112124923 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
GTTTAACACCATGTCAGCTT+TGG + Chr6:112125219-112125238 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
TAGTAGACCTTCCATGAAGA+AGG + Chr6:112125845-112125864 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
TCATTTGGTTATATGGCTCC+AGG + Chr6:112125247-112125266 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
TGCTGAAATCAACATGTGTG+AGG - Chr6:112122942-112122961 None:intergenic 40.0%
TGTAACACCTTCTTCATGGA+AGG - Chr6:112125855-112125874 None:intergenic 40.0%
TGTGTGTAACACCTTCTTCA+TGG - Chr6:112125859-112125878 None:intergenic 40.0%
TTCATGGAAGGTCTACTAGA+AGG - Chr6:112125843-112125862 None:intergenic 40.0%
TTCTGGCCAAGAACAATAAG+AGG - Chr6:112122827-112122846 None:intergenic 40.0%
TTGAGCGAAGTGTACCTTTA+CGG + Chr6:112123450-112123469 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAACTCTTCCTGTCAAA+TGG - Chr6:112124400-112124419 None:intergenic 40.0%
! ATGCATCTTTTCTCAACCAC+TGG + Chr6:112122788-112122807 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
! CACTGAAATAGGTTGAACCA+AGG - Chr6:112123101-112123120 None:intergenic 40.0%
! GGTACACTTCCTTCTGATTT+TGG + Chr6:112123699-112123718 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
! TCAGCTTTGGTTGGATCATT+TGG + Chr6:112125232-112125251 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTGTCACAGGATTGACTT+TGG + Chr6:112122864-112122883 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
!! CAACATGTGTGAGGTTTTGA+AGG - Chr6:112122933-112122952 None:intergenic 40.0%
!! CAGCTTTGGTGTTATCCTAT+TGG + Chr6:112125632-112125651 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTGGTGCATGTTATTTC+TGG - Chr6:112122844-112122863 None:intergenic 40.0%
!! GAGTATAGAAGGTATTTCGC+CGG - Chr6:112124339-112124358 None:intergenic 40.0%
!!! GACTGTCTTGTTGGTTTTGT+TGG + Chr6:112124580-112124599 MsG0680035778.01.T01:CDS 40.0%
AACATAGCAGCCTAGACAAG+TGG + Chr6:112124957-112124976 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
AACCAACCAAAGCCTCACAT+TGG + Chr6:112124525-112124544 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGACCAATGTGAGGCTT+TGG - Chr6:112124534-112124553 None:intergenic 45.0%
AAGAGCTCGAAGCTTCGTTT+CGG + Chr6:112124831-112124850 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
ACATAGGTTAAACCGTCGAC+TGG - Chr6:112124773-112124792 None:intergenic 45.0%
ACATTGCTTAGAAGGGAAGG+AGG + Chr6:112125876-112125895 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
ACCATTTCACCAATAGCCTC+AGG - Chr6:112123354-112123373 None:intergenic 45.0%
AGATCAAGAACACTGAGGGA+AGG - Chr6:112124299-112124318 None:intergenic 45.0%
AGGTGTTTGATGAGTTCCAG+TGG - Chr6:112122807-112122826 None:intergenic 45.0%
ATAGCCATTGGGATTGCTCA+CGG + Chr6:112125058-112125077 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
ATCATCGGAAGTGGAGGATT+CGG + Chr6:112124731-112124750 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
CAAACCAAGAGACCAATGTG+AGG - Chr6:112124540-112124559 None:intergenic 45.0%
CAATCCTGTGACAGAACCTT+TGG - Chr6:112122860-112122879 None:intergenic 45.0%
CACACATTGCTTAGAAGGGA+AGG + Chr6:112125873-112125892 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
CATTGCTTAGAAGGGAAGGA+GGG + Chr6:112125877-112125896 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
GCTAGATTCTTAACGAAGCC+AGG + Chr6:112125193-112125212 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
GGACAAATTTGCAAAGGGTG+AGG - Chr6:112124499-112124518 None:intergenic 45.0%
GGAGAGATTCCACAAAGCAT+AGG + Chr6:112123627-112123646 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGAGGCTATTGGTGAAA+TGG + Chr6:112123350-112123369 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
TGATCCAACCAAAGCTGACA+TGG - Chr6:112125230-112125249 None:intergenic 45.0%
TTCATATTCCATGGTCCACC+AGG - Chr6:112123927-112123946 None:intergenic 45.0%
TTTGGTTGGGGAAATTCCTG+AGG + Chr6:112123335-112123354 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
! AAAGCCTCACATTGGTCTCT+TGG + Chr6:112124533-112124552 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
! AACACCATGTCAGCTTTGGT+TGG + Chr6:112125223-112125242 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
! GACATGGTGTTAAACTGTCC+TGG - Chr6:112125214-112125233 None:intergenic 45.0%
! GGAAGAGTTGTTAGCTCTTG+AGG - Chr6:112124134-112124153 None:intergenic 45.0%
! GTAAAATTCCTGGTGGACCA+TGG + Chr6:112123916-112123935 MsG0680035778.01.T01:CDS 45.0%
! TTAAACCGTCGACTGGAATG+CGG - Chr6:112124766-112124785 None:intergenic 45.0%
AGGGAAGGAGGGATTGTGTT+CGG + Chr6:112125888-112125907 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
CAAACCGTGAGCAATCCCAA+TGG - Chr6:112125065-112125084 None:intergenic 50.0%
CGCAACATGTCGTCCTTGAT+TGG + Chr6:112125020-112125039 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
GCAATCGCTTTGGCCAATCA+AGG - Chr6:112125036-112125055 None:intergenic 50.0%
GGGGAAATTCCTGAGGCTAT+TGG + Chr6:112123342-112123361 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
GTATACCGCATTCCAGTCGA+CGG + Chr6:112124758-112124777 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
TGCACCAAAGGTTCTGTCAC+AGG + Chr6:112122853-112122872 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
TGTTGTGCAGCCACTTGTCT+AGG - Chr6:112124970-112124989 None:intergenic 50.0%
TTATCGGAGGCGAGCAATCA+TGG - Chr6:112125099-112125118 None:intergenic 50.0%
! CATCTCTTGCACAATGGGCT+TGG + Chr6:112125697-112125716 MsG0680035778.01.T01:CDS 50.0%
! GACCAATGTGAGGCTTTGGT+TGG - Chr6:112124530-112124549 None:intergenic 50.0%
CGGAAGTGGAGGATTCGGAA+CGG + Chr6:112124736-112124755 MsG0680035778.01.T01:CDS 55.0%
GAGGGATTGTGTTCGGACAG+AGG + Chr6:112125895-112125914 MsG0680035778.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 112122649 112125959 112122649 ID=MsG0680035778.01;Name=MsG0680035778.01
Chr6 mRNA 112122649 112125959 112122649 ID=MsG0680035778.01.T01;Parent=MsG0680035778.01;Name=MsG0680035778.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|996
Chr6 exon 112122649 112125268 112122649 ID=MsG0680035778.01.T01:exon:15029;Parent=MsG0680035778.01.T01
Chr6 exon 112125589 112125959 112125589 ID=MsG0680035778.01.T01:exon:15030;Parent=MsG0680035778.01.T01
Chr6 CDS 112122649 112125268 112122649 ID=MsG0680035778.01.T01:cds;Parent=MsG0680035778.01.T01
Chr6 CDS 112125589 112125959 112125589 ID=MsG0680035778.01.T01:cds;Parent=MsG0680035778.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035778.01.T01

ATGACAATATTAGGCACATCCCATATCAAATTTTCATTTTGCTTTCATGCAGCATTCTTTCTAATTTTGTGTCATGCAAATTCTCAGTCTCAGCAAGAACACTTAATCTTATTAAAGATAAAGCTTCACCTACAAAAGAATGCATCTTTTCTCAACCACTGGAACTCATCAAACACCTCTTATTGTTCTTGGCCAGAAATAACATGCACCAAAGGTTCTGTCACAGGATTGACTTTGGTCAACTCCAACATAACTCAAACTATACCTTCTTTCATATGTGACCTTCAAAACCTCACACATGTTGATTTCAGCAAAAATTTCATTCCTGGTGAGTTTCCAAAATATCTATATAAATGTTCCAAGCTTGAGTATCTTGATTTGTCAATGAATAAATTTGTTGGCAAGATTCCTTATGACATTCAAAGTTTGGTTCATTTGCAATATCTCAACCTTGGTTCAACCTATTTCAGTGCTGATATTCCTTCTAGTATTGGAAGGCTTAAGGATTTGAGATTCCTGCACCTTCAATATAGTTCATTTGATGGTACTTTTCCTGATGAAATTGGTAACTTGTTCAACCTTGAACTCTTGGATATGTCCTCTAATTATTTGTTGCCTCCTTTAAAGCTTCCATTAAGCATAACCAAGTTGAAAAAATTGAAAGTTTTTTACATGTATTGTTCAAATTTGGTTGGGGAAATTCCTGAGGCTATTGGTGAAATGGTTGCATTGGAAAACTTGGATTTATCAAATAATAGTTTAACTGGAAAAATTCCTAGTGGTTTGTTCTTGCTTAAGAATTTGAGCGAAGTGTACCTTTACGGAAATAGTCTATTTGGAGAGATACCAAATGTGGTTGAAGCATTAATTTTGACAGAAATTGATTTCGCAGAGAATAATCTTATAGGGAAAATACCAAATGATTTTGGAAAACTCCAAAAGTTAACAGTGTTGTATTTGTACTTGAACAATTTGTCAGGAGAGATTCCACAAAGCATAGGATATCTTAAATCTTTAATAAATTTTGATGTCTCTATGAACAAGTTTTCAGGTACACTTCCTTCTGATTTTGGTATTCACTCAAAGCTTGAAGTTTTTCGAATTGAAATCAACAATTTTAAGGGAAAGTTACCAGAGAACTTGTGTTATCATGGTAAGTTACAAAATTTAGGTGCTTATGAAAATCATTTAAGTGGTGAGTTGCCAAAATCAATTGAAAATTGTAGTAACTTGCTTGTGCTAGAAATTTACAAGAATGAATTTTCTGGTAAAATTCCTGGTGGACCATGGAATATGAATTTGGTGACTTTCATTATAAGACATAATAAGTTCACTGGTGAAATGCCTCAAAATTTTTCTTCGAGTATTTCACTTTTTGATATAAGTTACAATCAATTTTACGGTGGAATTCCAATTGGAGTATCTTCTTGGACTAATGTGATTGAGTTTATAGCAAGCAAGAATTATCTTAATGGAAGTATTCCTCAAGAGCTAACAACTCTTCCTAATCTTGAAAGATTGTTGCTTGATCAAAATCAGCTTAAAGGGTCACTTCCATCTGATGTAATATCATGGAAATCCTTAGTGACTTTAAATTTGAGCCAAAATCAACTCAATGGACTAATTCCAATTTCAATCGGTCATTTACCTTCCCTCAGTGTTCTTGATCTATCAGAAAATCAATTTTCCGGCGAAATACCTTCTATACTCACACATCTCAGAAGTCTCAATCTCAATCTATCATCCAACCATTTGACAGGAAGAGTTCCAATTGAATTTGAAAATTCAGCTTATGATAGAAGCTTTTTGAACAATTCTGGTTTATGTGTTGATACACAAGCATTGAACCTCACCCTTTGCAAATTTGTCCTTAAAAAACCAACCAAAGCCTCACATTGGTCTCTTGGTTTGATTATTAGCCTAATTGTTGTGACTGTCTTGTTGGTTTTGTTGGCATCATTCAAGATTATCAAACGTTACAGAAAAAGAGAGCTAGCATTGGAAAATTCTTGGGAGCTCATTTCATTTCAAAGGCTAAACTTCACAGAATCAGACATAGTTTCCTCAATGGCAGAACAAAATATCATCGGAAGTGGAGGATTCGGAACGGTATACCGCATTCCAGTCGACGGTTTAACCTATGTTGCTGTGAAAAAAATCAAGAGCAACAGAAATTTAAGGCAAGAGCTCGAAGCTTCGTTTCGGTCCGAAGTTAGAATATTGAGCAATATTCGACATCGAAACATTGTGAAGTTGTTGTGTTGCATCTCTAATGAGGATTCTATGATGCTTGTGTATGAGTATTTGGAACATAGCAGCCTAGACAAGTGGCTGCACAACAAAAATGAGTCATTAGCTATGTTGGATTCGGCGCAACATGTCGTCCTTGATTGGCCAAAGCGATTGCAAATAGCCATTGGGATTGCTCACGGTTTGTGCTATATGCACCATGATTGCTCGCCTCCGATAATTCATCGCGATATAAAAACAAGCAACATACTTTTGGGTTCTGAATTCAATGCAAAAGTTGCTGATTTTGGCTTTGCTAGATTCTTAACGAAGCCAGGACAGTTTAACACCATGTCAGCTTTGGTTGGATCATTTGGTTATATGGCTCCAGAATATGTTCAAACAACTAGAGTCAATGAAAAGATTGATGTATTCAGCTTTGGTGTTATCCTATTGGAACTTACAACTGGTAAAAAAGCTACTCGTGGTGACGAGTATTCATCTCTTGCACAATGGGCTTGGCGCCATATTCAAGCAGAAAGCAATATAGAAGAGTTGCTTGACAATGAAGTAATGGAACAAAGTTGTTTGGATGAAATGTGCAACATTTTCAAACTTGGGATAATGTGTACTGCTACACGTCCTTCTAGTAGACCTTCCATGAAGAAGGTGTTACACACATTGCTTAGAAGGGAAGGAGGGATTGTGTTCGGACAGAGGAATGATATTGTCGGGGAATATGACATTGTTCCATTTCTTTAA
Protein sequence

>MsG0680035778.01.T01

MTILGTSHIKFSFCFHAAFFLILCHANSQSQQEHLILLKIKLHLQKNASFLNHWNSSNTSYCSWPEITCTKGSVTGLTLVNSNITQTIPSFICDLQNLTHVDFSKNFIPGEFPKYLYKCSKLEYLDLSMNKFVGKIPYDIQSLVHLQYLNLGSTYFSADIPSSIGRLKDLRFLHLQYSSFDGTFPDEIGNLFNLELLDMSSNYLLPPLKLPLSITKLKKLKVFYMYCSNLVGEIPEAIGEMVALENLDLSNNSLTGKIPSGLFLLKNLSEVYLYGNSLFGEIPNVVEALILTEIDFAENNLIGKIPNDFGKLQKLTVLYLYLNNLSGEIPQSIGYLKSLINFDVSMNKFSGTLPSDFGIHSKLEVFRIEINNFKGKLPENLCYHGKLQNLGAYENHLSGELPKSIENCSNLLVLEIYKNEFSGKIPGGPWNMNLVTFIIRHNKFTGEMPQNFSSSISLFDISYNQFYGGIPIGVSSWTNVIEFIASKNYLNGSIPQELTTLPNLERLLLDQNQLKGSLPSDVISWKSLVTLNLSQNQLNGLIPISIGHLPSLSVLDLSENQFSGEIPSILTHLRSLNLNLSSNHLTGRVPIEFENSAYDRSFLNNSGLCVDTQALNLTLCKFVLKKPTKASHWSLGLIISLIVVTVLLVLLASFKIIKRYRKRELALENSWELISFQRLNFTESDIVSSMAEQNIIGSGGFGTVYRIPVDGLTYVAVKKIKSNRNLRQELEASFRSEVRILSNIRHRNIVKLLCCISNEDSMMLVYEYLEHSSLDKWLHNKNESLAMLDSAQHVVLDWPKRLQIAIGIAHGLCYMHHDCSPPIIHRDIKTSNILLGSEFNAKVADFGFARFLTKPGQFNTMSALVGSFGYMAPEYVQTTRVNEKIDVFSFGVILLELTTGKKATRGDEYSSLAQWAWRHIQAESNIEELLDNEVMEQSCLDEMCNIFKLGIMCTATRPSSRPSMKKVLHTLLRREGGIVFGQRNDIVGEYDIVPFL*