AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036216.01

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MsG0780036216.01.T01 AT1G26150 32.579 221 93 3 199 365 418 636 5.20e-25 108
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MsG0780036216.01.T01 AT5G56890 30.796 289 132 6 202 425 714 999 7.10e-25 108
MsG0780036216.01.T01 AT1G52290 27.586 290 138 5 201 423 133 417 8.56e-25 107
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MsG0780036216.01.T01 AT4G00330 29.210 291 137 7 198 421 106 394 1.21e-24 105
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MsG0780036216.01.T01 AT3G59110 33.333 198 118 5 241 429 275 467 1.80e-24 106
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MsG0780036216.01.T01 AT1G56720 31.687 243 142 8 197 429 228 456 8.65e-24 104
MsG0780036216.01.T01 AT1G56720 31.687 243 142 8 197 429 228 456 8.65e-24 104
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MsG0780036216.01.T01 AT4G03230 30.714 280 125 8 204 419 611 885 1.46e-23 104
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MsG0780036216.01.T01 AT4G23240 28.058 278 134 8 207 421 24 298 1.51e-23 102
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MsG0780036216.01.T01 AT1G61430 32.857 210 85 5 202 356 457 665 1.66e-23 104
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MsG0780036216.01.T01 AT1G77280 37.500 192 101 5 241 419 488 673 1.72e-23 104
MsG0780036216.01.T01 AT2G20300 29.433 282 138 6 202 425 340 618 1.78e-23 104
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MsG0780036216.01.T01 AT3G18810 28.049 246 114 5 201 383 327 572 2.04e-23 103
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MsG0780036216.01.T01 AT2G18890 36.943 157 94 3 264 416 175 330 2.21e-23 101
MsG0780036216.01.T01 AT1G34300 27.018 285 144 6 198 421 473 754 2.27e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT1G21240 28.374 289 142 7 194 420 397 682 2.39e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT4G39400 32.821 195 121 4 264 450 989 1181 2.52e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT4G00970 26.685 356 184 11 133 419 267 614 2.54e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT5G60320 27.586 290 134 8 198 421 335 614 2.99e-23 103
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MsG0780036216.01.T01 AT5G37450 30.258 271 123 7 207 416 627 892 3.19e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT4G23130 28.367 349 161 11 149 432 293 617 3.22e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT1G16670 36.022 186 105 5 243 419 130 310 3.25e-23 101
MsG0780036216.01.T01 AT5G18910 29.091 275 132 7 203 419 184 453 3.43e-23 102
MsG0780036216.01.T01 AT5G37450 30.258 271 123 7 207 416 603 868 3.44e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT5G37450 30.627 271 122 8 207 416 424 689 3.46e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT2G23200 28.521 284 135 6 199 419 476 754 3.49e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT1G56145 38.378 185 97 6 246 419 800 978 3.70e-23 103
MsG0780036216.01.T01 AT2G18890 36.025 161 98 3 260 416 171 330 4.13e-23 101
MsG0780036216.01.T01 AT4G11530 28.369 282 142 6 198 419 339 620 4.89e-23 102
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MsG0780036216.01.T01 AT4G33430 36.310 168 91 4 264 419 443 606 1.96e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT4G02420 26.132 287 145 6 198 421 337 619 1.97e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT5G01540 33.918 171 105 3 254 419 464 631 2.04e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT1G16110 30.870 230 100 6 184 358 409 634 2.14e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT1G70530 27.113 284 135 8 147 365 261 537 2.17e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT2G19230 36.269 193 98 6 241 419 654 835 2.68e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT3G13690 35.979 189 104 6 242 419 495 677 2.70e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT3G13690 35.979 189 104 6 242 419 495 677 2.70e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT3G13690 35.979 189 104 6 242 419 495 677 2.70e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT5G49470 29.697 165 105 3 255 419 299 452 2.78e-21 96.7
MsG0780036216.01.T01 AT1G79620 26.389 288 148 7 199 425 626 910 2.83e-21 97.8
MsG0780036216.01.T01 AT4G23200 29.592 294 133 9 207 435 332 616 2.91e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT1G70130 31.197 234 137 8 197 421 384 602 2.92e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT4G23180 27.273 286 139 8 198 419 335 615 3.17e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G59650 34.286 175 104 3 257 423 677 848 3.22e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT1G79620 25.694 288 150 7 199 425 652 936 3.25e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT5G59650 34.286 175 104 3 257 423 685 856 3.39e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT1G51800 37.079 178 93 5 254 419 680 850 3.55e-21 97.4
MsG0780036216.01.T01 AT4G28350 31.492 181 113 4 247 421 442 617 3.70e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT4G04960 30.876 217 94 6 198 358 334 550 3.72e-21 96.7
MsG0780036216.01.T01 AT4G00960 45.000 100 51 1 260 355 157 256 3.74e-21 93.6
MsG0780036216.01.T01 AT2G19230 36.269 193 98 6 241 419 653 834 3.77e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT4G21410 34.463 177 94 4 260 420 333 503 3.87e-21 96.7
MsG0780036216.01.T01 AT4G11490 27.174 276 135 6 207 419 317 589 3.88e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT1G61860 33.684 190 110 5 258 435 186 371 4.11e-21 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G02290 32.843 204 111 5 254 446 174 362 4.39e-21 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G02290 32.843 204 111 5 254 446 174 362 4.39e-21 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT1G24650 30.435 276 124 9 207 416 543 816 4.62e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G01020 34.254 181 104 5 254 423 170 346 4.76e-21 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT2G25220 32.420 219 90 4 206 369 141 356 4.87e-21 94.7
MsG0780036216.01.T01 AT2G37710 25.263 285 146 5 198 419 334 614 5.03e-21 96.7
MsG0780036216.01.T01 AT3G28690 33.333 177 104 3 258 423 133 306 5.15e-21 94.7
MsG0780036216.01.T01 AT5G46330 35.897 156 87 3 241 391 958 1105 5.17e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G46330 35.897 156 87 3 241 391 958 1105 5.17e-21 97.1
MsG0780036216.01.T01 AT4G11890 31.818 176 114 2 260 429 26 201 5.81e-21 92.0
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MsG0780036216.01.T01 AT2G13790 34.503 171 98 3 260 419 397 564 6.04e-21 96.3
MsG0780036216.01.T01 AT4G29450 34.328 201 115 5 241 427 659 856 6.08e-21 96.7
MsG0780036216.01.T01 AT1G66920 29.389 262 142 8 217 437 313 572 6.18e-21 96.3
MsG0780036216.01.T01 AT4G21410 34.463 177 94 4 260 420 458 628 6.99e-21 96.3
MsG0780036216.01.T01 AT1G05700 34.659 176 96 3 254 416 663 832 7.03e-21 96.3
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MsG0780036216.01.T01 AT4G23140 33.526 173 102 3 260 419 452 624 8.31e-21 95.9
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MsG0780036216.01.T01 AT3G28690 33.523 176 103 3 259 423 234 406 8.93e-21 95.1
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MsG0780036216.01.T01 AT5G48740 24.490 392 199 11 60 358 421 808 9.22e-21 95.9
MsG0780036216.01.T01 AT4G00970 27.817 284 142 8 133 357 267 546 9.29e-21 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT3G05140 35.025 197 109 8 231 419 220 405 9.46e-21 94.7
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MsG0780036216.01.T01 AT2G18890 46.316 95 49 1 264 356 175 269 9.78e-21 92.4
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MsG0780036216.01.T01 AT1G51890 36.571 175 98 4 254 419 600 770 1.18e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT1G67720 34.503 171 100 4 258 419 705 872 1.20e-20 95.9
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MsG0780036216.01.T01 AT1G55200 35.484 186 100 6 264 438 483 659 1.22e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT1G55200 35.484 186 100 6 264 438 483 659 1.22e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT1G55200 35.484 186 100 6 264 438 483 659 1.22e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT5G65240 22.989 435 227 12 81 419 132 554 1.22e-20 95.1
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MsG0780036216.01.T01 AT4G11890 31.818 176 114 2 260 429 139 314 1.29e-20 93.2
MsG0780036216.01.T01 AT1G11350 44.762 105 56 1 255 357 608 712 1.32e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT1G51890 36.571 175 98 4 254 419 664 834 1.33e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT1G25320 32.212 208 115 6 241 423 490 696 1.35e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT2G19130 26.207 290 139 7 199 421 483 764 1.36e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT3G05140 35.025 197 109 8 231 419 268 453 1.36e-20 94.7
MsG0780036216.01.T01 AT4G11470 33.508 191 105 5 255 432 435 616 1.39e-20 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT4G11470 33.508 191 105 5 255 432 440 621 1.42e-20 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT5G65240 22.989 435 227 12 81 419 132 554 1.50e-20 95.1
MsG0780036216.01.T01 AT2G24130 33.014 209 114 5 242 424 761 969 1.57e-20 95.5
MsG0780036216.01.T01 AT4G11890 31.818 176 114 2 260 429 141 316 1.57e-20 93.2
MsG0780036216.01.T01 AT5G63940 32.159 227 132 6 230 446 437 651 1.64e-20 95.1

Find 83 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 145 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TAACAAGGATTTCTAAATTA+TGG 0.132003 7:-4781914 None:intergenic
GGATGGTCTTTCTTCTTATC+TGG 0.144813 7:+4781661 None:intergenic
ATATCTCTAATCGTTGTAAT+TGG 0.155475 7:+4781790 MsG0780036216.01.T01:CDS
AGTAAAACCATCATATTATT+TGG 0.190813 7:-4783635 None:intergenic
GAGCCTACTATTTCTGATTT+TGG 0.207587 7:+4783042 MsG0780036216.01.T01:CDS
TAAGTTGGATCAATACAATT+TGG 0.262449 7:-4782314 None:intergenic
TGTGGCACTTGAAACTTTAA+TGG 0.266154 7:+4783520 MsG0780036216.01.T01:CDS
ATCCTTGTTATAAGAGATAT+TGG 0.269950 7:+4781927 MsG0780036216.01.T01:CDS
GGAGAGAAGACCAATTCTTT+TGG 0.279242 7:-4781966 None:intergenic
ATTGATCCAACTTATGTCAT+AGG 0.293965 7:+4782323 MsG0780036216.01.T01:CDS
TGCATTGGAACCGGAGCTTA+TGG 0.305060 7:+4782635 MsG0780036216.01.T01:CDS
CTTATCTGGGGTTTGGTTGA+GGG 0.306298 7:+4781675 MsG0780036216.01.T01:CDS
CTTTCTTCTTATCTGGGGTT+TGG 0.333382 7:+4781668 MsG0780036216.01.T01:CDS
AAAAGGTTAATGTTGTTAAA+GGG 0.338600 7:+4782923 MsG0780036216.01.T01:intron
GATGGTCTTTCTTCTTATCT+GGG 0.339626 7:+4781662 None:intergenic
TCTTATCTGGGGTTTGGTTG+AGG 0.340441 7:+4781674 MsG0780036216.01.T01:CDS
GTTTCTCGTTGCAAGTTCAT+TGG 0.359624 7:-4781865 None:intergenic
ACCATCATATTATTTGGAAC+TGG 0.360279 7:-4783629 None:intergenic
GATACATCTCTGTGCACTAT+TGG 0.378178 7:-4782988 None:intergenic
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG 0.386104 7:+4783093 MsG0780036216.01.T01:CDS
TGTGACACACATTTCATTGT+TGG 0.400340 7:-4783719 None:intergenic
ACTATAGTTGCTGGAACAAT+TGG 0.404773 7:+4783102 MsG0780036216.01.T01:CDS
GGATCAATACAATTTGGAAT+GGG 0.407748 7:-4782308 None:intergenic
TCACTCGAAAGAATGCTTGA+TGG 0.411917 7:-4783764 None:intergenic
AGGGACTATCCCAAAAGAAT+TGG 0.412380 7:+4781956 MsG0780036216.01.T01:CDS
GTTGTTAAAGGGGTTGCATT+TGG 0.413296 7:+4782934 MsG0780036216.01.T01:CDS
CTGAAACTCTCTTCAAAAGA+TGG 0.417046 7:-4782734 None:intergenic
TGCAGAGCTTGCATATACTA+TGG 0.420400 7:+4783460 MsG0780036216.01.T01:intron
AATTACATCTCAACTTCAAA+TGG 0.429409 7:+4781713 MsG0780036216.01.T01:CDS
AGTATAACTTGCAACGTTGA+TGG 0.429504 7:+4781819 MsG0780036216.01.T01:CDS
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG 0.447204 7:-4783094 None:intergenic
TTTCTCGTTGCAAGTTCATT+GGG 0.448061 7:-4781864 None:intergenic
TATCTCTAATCGTTGTAATT+GGG 0.449803 7:+4781791 MsG0780036216.01.T01:CDS
ACTTTAATGGGAAGACACCC+TGG 0.455155 7:+4783533 MsG0780036216.01.T01:CDS
CCCAGTTCCAAATAATATGA+TGG 0.458334 7:+4783628 MsG0780036216.01.T01:CDS
TTCATTGTTGGTCGAGAGGA+AGG 0.459111 7:-4783707 None:intergenic
GTGGCACTTGAAACTTTAAT+GGG 0.459876 7:+4783521 MsG0780036216.01.T01:CDS
GCAAATGCTATACTAAATAG+TGG 0.462431 7:+4781738 MsG0780036216.01.T01:CDS
AAAAGCGAGAAGGCTAAGAT+AGG 0.471672 7:-4782449 None:intergenic
ATGAGATATTGCATTGGAAC+CGG 0.472217 7:+4782626 MsG0780036216.01.T01:CDS
TGGATCAATACAATTTGGAA+TGG 0.475226 7:-4782309 None:intergenic
GTTCCAAAATCAGAAATAGT+AGG 0.480155 7:-4783045 None:intergenic
CCATCATATTATTTGGAACT+GGG 0.483360 7:-4783628 None:intergenic
TTGTTCCCTATGACATAAGT+TGG 0.486044 7:-4782329 None:intergenic
AAAGGTTAATGTTGTTAAAG+GGG 0.488498 7:+4782924 MsG0780036216.01.T01:intron
CAAGGTTGGAATTGGAAGGT+TGG 0.491601 7:-4782377 None:intergenic
TGTATATAGCTTTGCAGTTG+TGG 0.494657 7:+4783502 MsG0780036216.01.T01:CDS
TTGCTCTAATAATGTCATTG+TGG 0.500301 7:-4782589 None:intergenic
TGCTCTAATAATGTCATTGT+GGG 0.501298 7:-4782588 None:intergenic
CTTGCAAGGTTGGAATTGGA+AGG 0.523039 7:-4782381 None:intergenic
GGAGACGTTGGTCTAATACT+TGG 0.544325 7:-4783607 None:intergenic
GTAAACACTTCCATAAGCTC+CGG 0.545664 7:-4782645 None:intergenic
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG 0.546822 7:-4783077 None:intergenic
TTGATCCAACTTATGTCATA+GGG 0.551280 7:+4782324 MsG0780036216.01.T01:CDS
AGCTTATGGAAGTGTTTACA+AGG 0.559659 7:+4782649 MsG0780036216.01.T01:CDS
ATGGTCTTTCTTCTTATCTG+GGG 0.564374 7:+4781663 MsG0780036216.01.T01:CDS
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG 0.570162 7:+4782620 MsG0780036216.01.T01:CDS
GAAGGTTGGATATGAAATGT+TGG 0.575645 7:-4782363 None:intergenic
ATGCTATACTAAATAGTGGA+TGG 0.577476 7:+4781742 MsG0780036216.01.T01:CDS
GCACCTCTGCTTCATAGCCG+TGG 0.579538 7:-4782712 None:intergenic
TGAGCACATTAAAAGCGAGA+AGG 0.580722 7:-4782459 None:intergenic
AGTGATGACAGTATATCCCC+AGG 0.582918 7:-4783551 None:intergenic
ATAAGAGATATTGGACTACA+AGG 0.584676 7:+4781936 MsG0780036216.01.T01:CDS
ACAATTGGTTATATAGCCCC+AGG 0.584723 7:+4783117 MsG0780036216.01.T01:CDS
GATCAATACAATTTGGAATG+GGG 0.592269 7:-4782307 None:intergenic
GCTTGATGGTGTAAGTTCAA+TGG 0.596104 7:-4783750 None:intergenic
TATTTGGAACTGGGAGACGT+TGG 0.596933 7:-4783619 None:intergenic
CTTTAATGGGAAGACACCCT+GGG 0.599161 7:+4783534 MsG0780036216.01.T01:CDS
TCATTGTTGGTCGAGAGGAA+GGG 0.599905 7:-4783706 None:intergenic
ACATTTCATTGTTGGTCGAG+AGG 0.603964 7:-4783711 None:intergenic
AACTTATGTCATAGGGAACA+AGG 0.607070 7:+4782331 MsG0780036216.01.T01:CDS
CTATACTAAATAGTGGATGG+TGG 0.614097 7:+4781745 MsG0780036216.01.T01:CDS
TATCTTGCTAAACTCTGAGT+GGG 0.626474 7:+4783020 MsG0780036216.01.T01:CDS
AATGCAACAACTCTGCCGCA+TGG 0.637763 7:-4782680 None:intergenic
TTGAAGTTGAGATGTAATTG+TGG 0.643296 7:-4781709 None:intergenic
GTCCAATATCTCTTATAACA+AGG 0.652901 7:-4781929 None:intergenic
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG 0.653491 7:+4783019 MsG0780036216.01.T01:CDS
GTGATGACAGTATATCCCCA+GGG 0.653588 7:-4783550 None:intergenic
TAAGAGATATTGGACTACAA+GGG 0.663911 7:+4781937 MsG0780036216.01.T01:CDS
ACTCCACGGCTATGAAGCAG+AGG 0.665165 7:+4782709 MsG0780036216.01.T01:CDS
GTTGCATTAAAGAAACTCCA+CGG 0.676027 7:+4782695 MsG0780036216.01.T01:CDS
TACAAGGCACAATTACCATG+CGG 0.721721 7:+4782665 MsG0780036216.01.T01:CDS
TTTAATGGGAAGACACCCTG+GGG 0.768466 7:+4783535 MsG0780036216.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CTAAAAACATTATTTCATAT+CGG + Chr7:4783818-4783837 MsG0780036216.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAAAACATTATTTCATATC+GGG + Chr7:4783819-4783838 MsG0780036216.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAGTTTCTTTGTAATATAA+AGG + Chr7:4783375-4783394 MsG0780036216.01.T01:intron 15.0%
!!! CTTTTTTTTCAACATATATT+AGG - Chr7:4783333-4783352 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAGGTTAATGTTGTTAA+AGG + Chr7:4782922-4782941 MsG0780036216.01.T01:intron 20.0%
!! AAAAGGTTAATGTTGTTAAA+GGG + Chr7:4782923-4782942 MsG0780036216.01.T01:intron 20.0%
!! AAAGAAATGAATAAGTTACA+CGG - Chr7:4783167-4783186 None:intergenic 20.0%
!! AATAAAAAAAGGAATTACCT+GGG - Chr7:4783137-4783156 None:intergenic 20.0%
!! AGTAAAACCATCATATTATT+TGG - Chr7:4783638-4783657 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCCTACAATTATTTGAA+GGG + Chr7:4782284-4782303 MsG0780036216.01.T01:intron 20.0%
!! TAACAAGGATTTCTAAATTA+TGG - Chr7:4781917-4781936 None:intergenic 20.0%
!! TAATAAAAAAAGGAATTACC+TGG - Chr7:4783138-4783157 None:intergenic 20.0%
!! TATTTCCTACAATTATTTGA+AGG + Chr7:4782283-4782302 MsG0780036216.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTAATACCAAGTACATA+AGG + Chr7:4783273-4783292 MsG0780036216.01.T01:intron 20.0%
! AAAGGTTAATGTTGTTAAAG+GGG + Chr7:4782924-4782943 MsG0780036216.01.T01:intron 25.0%
! AAATTAGAACCTTATGTACT+TGG - Chr7:4783285-4783304 None:intergenic 25.0%
! AAGAAATGAATAAGTTACAC+GGG - Chr7:4783166-4783185 None:intergenic 25.0%
! AATTACATCTCAACTTCAAA+TGG + Chr7:4781713-4781732 MsG0780036216.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAAAAAGGAATTACCTG+GGG - Chr7:4783136-4783155 None:intergenic 25.0%
! ATATCTCTAATCGTTGTAAT+TGG + Chr7:4781790-4781809 MsG0780036216.01.T01:CDS 25.0%
! TATCTCTAATCGTTGTAATT+GGG + Chr7:4781791-4781810 MsG0780036216.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCCTTGTTATAAGAGATAT+TGG + Chr7:4781927-4781946 MsG0780036216.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAGTTGGATCAATACAATT+TGG - Chr7:4782317-4782336 None:intergenic 25.0%
!! TTTTGCATATGGAATTATGA+TGG + Chr7:4782557-4782576 MsG0780036216.01.T01:CDS 25.0%
ACAACAACAACAACAAAGAA+TGG + Chr7:4782527-4782546 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
ACGGGGATTGTAATAAAAAA+AGG - Chr7:4783148-4783167 None:intergenic 30.0%
AGAAATGAATAAGTTACACG+GGG - Chr7:4783165-4783184 None:intergenic 30.0%
ATAAGAGATATTGGACTACA+AGG + Chr7:4781936-4781955 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
ATTGATCCAACTTATGTCAT+AGG + Chr7:4782323-4782342 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
CAACATATATTAGGAAACTG+AGG - Chr7:4783324-4783343 None:intergenic 30.0%
CATAAAGCTTCACGATATTT+CGG - Chr7:4782793-4782812 None:intergenic 30.0%
CATTCCAGTGAGATTATTAT+CGG - Chr7:4782228-4782247 None:intergenic 30.0%
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG - Chr7:4783080-4783099 None:intergenic 30.0%
GCAAATGCTATACTAAATAG+TGG + Chr7:4781738-4781757 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
GTCCAATATCTCTTATAACA+AGG - Chr7:4781932-4781951 None:intergenic 30.0%
GTTCCAAAATCAGAAATAGT+AGG - Chr7:4783048-4783067 None:intergenic 30.0%
TAAGAGATATTGGACTACAA+GGG + Chr7:4781937-4781956 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
TCAAAAACATGATTCTTCTG+TGG - Chr7:4782826-4782845 None:intergenic 30.0%
TGCTCTAATAATGTCATTGT+GGG - Chr7:4782591-4782610 None:intergenic 30.0%
TGGAATTCAATTGGAGAAAA+AGG + Chr7:4782906-4782925 MsG0780036216.01.T01:intron 30.0%
TGGATCAATACAATTTGGAA+TGG - Chr7:4782312-4782331 None:intergenic 30.0%
TTATAAAATCACCATGAGCA+GGG - Chr7:4783439-4783458 None:intergenic 30.0%
TTGAAGTTGAGATGTAATTG+TGG - Chr7:4781712-4781731 None:intergenic 30.0%
TTGATCCAACTTATGTCATA+GGG + Chr7:4782324-4782343 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
TTGCTCTAATAATGTCATTG+TGG - Chr7:4782592-4782611 None:intergenic 30.0%
TTTATAAAATCACCATGAGC+AGG - Chr7:4783440-4783459 None:intergenic 30.0%
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG + Chr7:4782620-4782639 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
! ACCATCATATTATTTGGAAC+TGG - Chr7:4783632-4783651 None:intergenic 30.0%
! ATGCTATACTAAATAGTGGA+TGG + Chr7:4781742-4781761 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
! CCATCATATTATTTGGAACT+GGG - Chr7:4783631-4783650 None:intergenic 30.0%
! GATCAATACAATTTGGAATG+GGG - Chr7:4782310-4782329 None:intergenic 30.0%
! GGATCAATACAATTTGGAAT+GGG - Chr7:4782311-4782330 None:intergenic 30.0%
! TCTTTGTAATGTCGATTATG+TGG + Chr7:4782259-4782278 MsG0780036216.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCTCCAATTGAATTCCA+CGG - Chr7:4782906-4782925 None:intergenic 30.0%
!! ACGTTATTACTTTTCTTGCA+AGG - Chr7:4782398-4782417 None:intergenic 30.0%
!! TATTACTTTTCTTGCAAGGT+TGG - Chr7:4782394-4782413 None:intergenic 30.0%
!!! ATGGAGATTTGTTTTGCATA+TGG + Chr7:4782546-4782565 MsG0780036216.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTACTTGAACCTATTTTTG+TGG + Chr7:4783410-4783429 MsG0780036216.01.T01:intron 30.0%
AAAACATGATTCTTCTGTGG+AGG - Chr7:4782823-4782842 None:intergenic 35.0%
AACTTATGTCATAGGGAACA+AGG + Chr7:4782331-4782350 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
ACAAATCAAGATGAGTGAGT+TGG - Chr7:4781990-4782009 None:intergenic 35.0%
ACTATAGTTGCTGGAACAAT+TGG + Chr7:4783102-4783121 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG + Chr7:4783019-4783038 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
ATCTATGAGTACATAGAGAG+AGG + Chr7:4782845-4782864 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
ATGAGATATTGCATTGGAAC+CGG + Chr7:4782626-4782645 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
ATGGTCTTTCTTCTTATCTG+GGG + Chr7:4781663-4781682 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
CCCAGTTCCAAATAATATGA+TGG + Chr7:4783628-4783647 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
CGAAATATCGTGAAGCTTTA+TGG + Chr7:4782791-4782810 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
CTGAAACTCTCTTCAAAAGA+TGG - Chr7:4782737-4782756 None:intergenic 35.0%
GAAGGTTGGATATGAAATGT+TGG - Chr7:4782366-4782385 None:intergenic 35.0%
GAGAGATTTCCTAGTGAATA+TGG - Chr7:4782111-4782130 None:intergenic 35.0%
GTGGCACTTGAAACTTTAAT+GGG + Chr7:4783521-4783540 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCATTAAAGAAACTCCA+CGG + Chr7:4782695-4782714 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
TATAAAATCACCATGAGCAG+GGG - Chr7:4783438-4783457 None:intergenic 35.0%
TATCTTGCTAAACTCTGAGT+GGG + Chr7:4783020-4783039 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
TCGACATTACAAAGAGATTG+AGG - Chr7:4782254-4782273 None:intergenic 35.0%
TCTCACCTTCAAGAGAATTA+TGG - Chr7:4782158-4782177 None:intergenic 35.0%
TGTGACACACATTTCATTGT+TGG - Chr7:4783722-4783741 None:intergenic 35.0%
TGTGGCACTTGAAACTTTAA+TGG + Chr7:4783520-4783539 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
TTGCACCATAATTCTCTTGA+AGG + Chr7:4782150-4782169 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
TTGTCCGATAATAATCTCAC+TGG + Chr7:4782221-4782240 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
TTGTCCTCTAATTCTCTTGA+AGG + Chr7:4782078-4782097 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
TTGTCTCACAATCATCTTGA+AGG + Chr7:4782006-4782025 MsG0780036216.01.T01:intron 35.0%
TTGTTCCCTATGACATAAGT+TGG - Chr7:4782332-4782351 None:intergenic 35.0%
TTTCTCGTTGCAAGTTCATT+GGG - Chr7:4781867-4781886 None:intergenic 35.0%
! AGTATAACTTGCAACGTTGA+TGG + Chr7:4781819-4781838 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
! GAGAGAAGACCAATTCTTTT+GGG - Chr7:4781968-4781987 None:intergenic 35.0%
! TGTATATAGCTTTGCAGTTG+TGG + Chr7:4783502-4783521 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCTTGCAAGGTTGGAAT+TGG - Chr7:4782388-4782407 None:intergenic 35.0%
!! AGCTTATGGAAGTGTTTACA+AGG + Chr7:4782649-4782668 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
!! CTATACTAAATAGTGGATGG+TGG + Chr7:4781745-4781764 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAGCCTACTATTTCTGATTT+TGG + Chr7:4783042-4783061 MsG0780036216.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGCGAGAAGGCTAAGAT+AGG - Chr7:4782452-4782471 None:intergenic 40.0%
AAATCGAGATGAGTGAGCTT+GGG - Chr7:4782060-4782079 None:intergenic 40.0%
ACAATTGGTTATATAGCCCC+AGG + Chr7:4783117-4783136 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
ACATTTCATTGTTGGTCGAG+AGG - Chr7:4783714-4783733 None:intergenic 40.0%
AGGGACTATCCCAAAAGAAT+TGG + Chr7:4781956-4781975 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
CCTCTAATTCTCTTGAAGGT+GGG + Chr7:4782082-4782101 MsG0780036216.01.T01:intron 40.0%
GATACATCTCTGTGCACTAT+TGG - Chr7:4782991-4783010 None:intergenic 40.0%
GTAAACACTTCCATAAGCTC+CGG - Chr7:4782648-4782667 None:intergenic 40.0%
GTTGTTAAAGGGGTTGCATT+TGG + Chr7:4782934-4782953 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCTCGTTGCAAGTTCAT+TGG - Chr7:4781868-4781887 None:intergenic 40.0%
TACAAGGCACAATTACCATG+CGG + Chr7:4782665-4782684 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
TAGAAGCCGTGGAATTCAAT+TGG + Chr7:4782897-4782916 MsG0780036216.01.T01:intron 40.0%
TCACAATCATCTTGAAGGTC+AGG + Chr7:4782011-4782030 MsG0780036216.01.T01:intron 40.0%
TCACTCGAAAGAATGCTTGA+TGG - Chr7:4783767-4783786 None:intergenic 40.0%
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG + Chr7:4783093-4783112 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG - Chr7:4783097-4783116 None:intergenic 40.0%
TCCTCTAATTCTCTTGAAGG+TGG + Chr7:4782081-4782100 MsG0780036216.01.T01:intron 40.0%
TGAGCACATTAAAAGCGAGA+AGG - Chr7:4782462-4782481 None:intergenic 40.0%
TGCAGAGCTTGCATATACTA+TGG + Chr7:4783460-4783479 MsG0780036216.01.T01:intron 40.0%
! CTTTCTTCTTATCTGGGGTT+TGG + Chr7:4781668-4781687 MsG0780036216.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGAGAAGACCAATTCTTT+TGG - Chr7:4781969-4781988 None:intergenic 40.0%
!! GCTTGATGGTGTAAGTTCAA+TGG - Chr7:4783753-4783772 None:intergenic 40.0%
AATCGAGATGAGTGAGCTTG+GGG - Chr7:4782059-4782078 None:intergenic 45.0%
ACTTTAATGGGAAGACACCC+TGG + Chr7:4783533-4783552 MsG0780036216.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGGGGATCCACAAAAAT+AGG - Chr7:4783423-4783442 None:intergenic 45.0%
AGTGATGACAGTATATCCCC+AGG - Chr7:4783554-4783573 None:intergenic 45.0%
CAAATCAAGACGAGTGAGCT+TGG - Chr7:4782204-4782223 None:intergenic 45.0%
CAAATCGAGATCAGTGAGCT+TGG - Chr7:4782133-4782152 None:intergenic 45.0%
CAAATCGAGATGAGTGAGCT+TGG - Chr7:4782061-4782080 None:intergenic 45.0%
CAAGGTTGGAATTGGAAGGT+TGG - Chr7:4782380-4782399 None:intergenic 45.0%
CCCACCTTCAAGAGAATTAG+AGG - Chr7:4782085-4782104 None:intergenic 45.0%
CTTGCAAGGTTGGAATTGGA+AGG - Chr7:4782384-4782403 None:intergenic 45.0%
CTTTAATGGGAAGACACCCT+GGG + Chr7:4783534-4783553 MsG0780036216.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAGATTCGCAGTAAATG+CGG - Chr7:4782183-4782202 None:intergenic 45.0%
GGGGCCCTTCAAATAATTGT+AGG - Chr7:4782291-4782310 None:intergenic 45.0%
GGTGGGATACCATATTCACT+AGG + Chr7:4782099-4782118 MsG0780036216.01.T01:intron 45.0%
GTATGATGAAGTAGAAGCCG+TGG + Chr7:4782886-4782905 MsG0780036216.01.T01:intron 45.0%
GTGATGACAGTATATCCCCA+GGG - Chr7:4783553-4783572 None:intergenic 45.0%
TCATTGTTGGTCGAGAGGAA+GGG - Chr7:4783709-4783728 None:intergenic 45.0%
TTCATTGTTGGTCGAGAGGA+AGG - Chr7:4783710-4783729 None:intergenic 45.0%
TTGGGGAGATTTCCTAGTGA+AGG - Chr7:4782042-4782061 None:intergenic 45.0%
TTTAATGGGAAGACACCCTG+GGG + Chr7:4783535-4783554 MsG0780036216.01.T01:CDS 45.0%
! CTTATCTGGGGTTTGGTTGA+GGG + Chr7:4781675-4781694 MsG0780036216.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGACGTTGGTCTAATACT+TGG - Chr7:4783610-4783629 None:intergenic 45.0%
! TATTTGGAACTGGGAGACGT+TGG - Chr7:4783622-4783641 None:intergenic 45.0%
! TCTTATCTGGGGTTTGGTTG+AGG + Chr7:4781674-4781693 MsG0780036216.01.T01:CDS 45.0%
AATGCAACAACTCTGCCGCA+TGG - Chr7:4782683-4782702 None:intergenic 50.0%
GGGAGATTTCCTAGTGAAGG+AGG - Chr7:4782039-4782058 None:intergenic 50.0%
TGCATTGGAACCGGAGCTTA+TGG + Chr7:4782635-4782654 MsG0780036216.01.T01:CDS 50.0%
! TTTTGTGGATCCCCTGCTCA+TGG + Chr7:4783425-4783444 MsG0780036216.01.T01:intron 50.0%
ACTCCACGGCTATGAAGCAG+AGG + Chr7:4782709-4782728 MsG0780036216.01.T01:CDS 55.0%
GGTCAGGTACCTCCTTCACT+AGG + Chr7:4782027-4782046 MsG0780036216.01.T01:intron 55.0%
GCACCTCTGCTTCATAGCCG+TGG - Chr7:4782715-4782734 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 4781663 4783850 4781663 ID=MsG0780036216.01;Name=MsG0780036216.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0780036216.01.T01

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