AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036292.01

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MsG0780036292.01.T01 AT2G33680 28.842 475 319 9 4 467 142 608 1.82e-52 192
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MsG0780036292.01.T01 AT2G33680 34.982 546 346 3 1 544 243 781 3.44e-102 327
MsG0780036292.01.T01 AT2G33680 28.842 475 319 9 4 467 142 608 1.82e-52 192
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MsG0780036292.01.T01 AT1G50270 33.817 482 311 5 39 518 102 577 7.62e-92 295
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MsG0780036292.01.T01 AT1G15510 30.351 313 207 4 119 426 66 372 9.25e-31 128
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MsG0780036292.01.T01 AT5G39350 29.659 499 342 2 1 495 178 671 2.65e-75 253
MsG0780036292.01.T01 AT5G39350 27.045 440 300 6 1 430 75 503 1.32e-41 160
MsG0780036292.01.T01 AT5G39350 31.124 347 226 4 24 368 3 338 1.06e-39 154
MsG0780036292.01.T01 AT2G20540 33.251 406 240 1 146 520 78 483 3.37e-75 248
MsG0780036292.01.T01 AT2G20540 23.653 334 210 8 25 321 62 387 7.55e-25 108
MsG0780036292.01.T01 AT2G20540 24.091 220 132 4 245 432 76 292 1.35e-15 80.1
MsG0780036292.01.T01 AT2G20540 21.304 230 172 4 4 230 174 397 9.79e-13 71.2
MsG0780036292.01.T01 AT4G25270 30.667 450 300 5 35 483 88 526 2.06e-74 247
MsG0780036292.01.T01 AT4G25270 24.390 328 226 6 8 328 162 474 1.35e-24 108
MsG0780036292.01.T01 AT3G05340 29.596 544 377 3 1 544 116 653 3.51e-74 249
MsG0780036292.01.T01 AT3G05340 28.413 271 179 5 165 424 63 329 1.21e-18 90.5
MsG0780036292.01.T01 AT4G04370 28.544 529 370 3 1 528 205 726 4.12e-74 251
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MsG0780036292.01.T01 AT1G17630 25.714 595 358 10 9 526 126 713 7.15e-60 212
MsG0780036292.01.T01 AT1G17630 27.835 194 136 2 168 357 74 267 5.27e-19 91.7
MsG0780036292.01.T01 AT1G32415 28.409 528 316 10 1 513 257 737 3.62e-59 211
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MsG0780036292.01.T01 AT5G08490 21.987 473 345 11 24 483 104 565 6.71e-24 106
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MsG0780036292.01.T01 AT2G25580 24.383 324 234 2 254 577 260 572 1.09e-30 127
MsG0780036292.01.T01 AT1G29710 25.967 362 241 6 226 583 97 435 4.05e-27 115
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MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 22.607 491 330 13 5 465 134 604 1.34e-24 108
MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 20.798 476 304 9 4 423 33 491 1.18e-15 80.9
MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 19.733 375 252 8 5 369 274 609 4.88e-15 79.0
MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 22.607 491 330 13 5 465 134 604 1.34e-24 108
MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 20.798 476 304 9 4 423 33 491 1.18e-15 80.9
MsG0780036292.01.T01 AT1G63080 19.733 375 252 8 5 369 274 609 4.88e-15 79.0
MsG0780036292.01.T01 AT2G16880 23.517 489 323 16 5 471 203 662 1.38e-24 108
MsG0780036292.01.T01 AT1G62930 22.535 426 294 10 5 409 149 559 5.23e-24 107
MsG0780036292.01.T01 AT1G62930 22.222 414 309 5 24 426 63 474 1.23e-16 84.0
MsG0780036292.01.T01 AT1G62930 22.295 305 188 6 5 268 289 585 1.18e-13 74.3
MsG0780036292.01.T01 AT5G02860 23.810 378 240 7 113 443 209 585 5.60e-24 107
MsG0780036292.01.T01 AT5G02860 20.408 539 353 14 5 482 207 730 7.69e-18 88.2
MsG0780036292.01.T01 AT5G02860 26.538 260 174 6 179 424 170 426 1.37e-17 87.4
MsG0780036292.01.T01 AT5G02860 20.000 440 321 11 7 426 315 743 1.64e-16 84.0
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MsG0780036292.01.T01 AT1G18900 20.000 255 194 4 115 360 402 655 1.86e-11 67.8
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MsG0780036292.01.T01 AT4G01570 27.717 184 118 4 180 351 592 772 9.19e-11 65.5
MsG0780036292.01.T01 AT2G35130 19.403 402 276 7 5 359 176 576 9.36e-11 65.1

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTTTCTTATAATGCTTTAA+TGG 0.178890 7:-6076695 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGTTAAATTGTTTAAGAATA+TGG 0.180934 7:-6076638 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGATTTAGCATTGAAGGTTT+TGG 0.291876 7:-6076437 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTGTGGTCAGATTAGAGATT+TGG 0.309800 7:-6076245 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCTGGAAATGATTAAGCAAC+TGG 0.344774 7:-6075153 MsG0780036292.01.T01:CDS
GGTGGGCGAACGAGTGGTTT+GGG 0.347224 7:-6076299 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGTGGTCAGATTAGAGATTT+GGG 0.353296 7:-6076244 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGAGAAGCAGTGGAAGTCTT+GGG 0.357334 7:-6076328 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTTTCTTATAATGCTTTAAT+GGG 0.359550 7:-6076694 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAGATTAGAGATTTGGGATT+GGG 0.359775 7:-6076238 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAACAAGGTTCAGCTATTGC+TGG 0.361110 7:-6075171 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTACATAGTGGTGAACATT+TGG 0.362317 7:-6076665 MsG0780036292.01.T01:CDS
CCGACAAAGGTTACATGGTT+TGG 0.369441 7:+6075674 None:intergenic
TGCAGCACGGCCTCAATATT+CGG 0.370441 7:+6075122 None:intergenic
CATACCACCACATTCCGATT+TGG 0.381943 7:+6076088 None:intergenic
TCATGTTGATTTAGCATTGA+AGG 0.384922 7:-6076443 MsG0780036292.01.T01:CDS
TCTATCTGCTTGTGTTCATC+TGG 0.387139 7:-6075648 MsG0780036292.01.T01:CDS
CATGCTCGAGTTGAGAAGTT+AGG 0.387922 7:-6075902 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGAGGACAACACAAGTGAAA+TGG 0.396785 7:-6075490 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGTTCTCTGATATGAGAAAT+CGG 0.399144 7:-6075799 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGGTGGGCGAACGAGTGGTT+TGG 0.399656 7:-6076300 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCATGTTGGTAGATATGTTT+GGG 0.407319 7:-6076156 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATTACGTATGTTGGTGTCAT+GGG 0.416482 7:-6076271 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGTGAATCTGCTTACGTGTA+TGG 0.426661 7:-6076017 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGAATCAATGCTGCCACCCT+TGG 0.429533 7:+6075832 None:intergenic
CCAAACCATGTAACCTTTGT+CGG 0.434995 7:-6075674 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTTGGTGTCATGGGGCTTTG+TGG 0.436625 7:-6076262 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTGTTTACCAAGTCCATGTT+GGG 0.438110 7:+6075739 None:intergenic
ATTCATCGAAATTATAACTT+GGG 0.440815 7:-6075428 MsG0780036292.01.T01:CDS
CATGCGCAGTTGTTGAAAAG+AGG 0.445198 7:-6076205 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTATTACGCGGATGGGTGC+CGG 0.450643 7:+6075011 None:intergenic
TATTCATCGAAATTATAACT+TGG 0.456215 7:-6075429 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGCATGTTGGTAGATATGTT+TGG 0.458519 7:-6076157 MsG0780036292.01.T01:CDS
TACATGGTTTGGACATTCTC+CGG 0.460969 7:+6075685 None:intergenic
GAGAGAAGCAGTGGAAGTCT+TGG 0.461823 7:-6076329 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAGGACAACACAAGTGAAAT+GGG 0.463779 7:-6075489 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGTATGCAAAGGCACGTAGC+TGG 0.475163 7:-6075334 MsG0780036292.01.T01:CDS
GGGACAGTGTTACAATGATT+AGG 0.475615 7:-6075313 MsG0780036292.01.T01:CDS
CTTTCTGCTTGTGCTCATAG+TGG 0.475761 7:-6076571 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTCTGCTTGTGCTCATAGT+GGG 0.476115 7:-6076570 MsG0780036292.01.T01:CDS
CCTCATGAAAATACCTTCTC+CGG 0.478960 7:-6075030 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATTAAGAATCGTGTTATTGT+CGG 0.480303 7:-6075878 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATGGGTGGTTATTTACATAG+TGG 0.487526 7:-6076676 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGGGATAGCATTACGTATGT+TGG 0.490385 7:-6076280 MsG0780036292.01.T01:CDS
ACGCGGATGGGTGCCGGAGA+AGG 0.490492 7:+6075017 None:intergenic
TTAAGAATCGTGTTATTGTC+GGG 0.493970 7:-6075877 MsG0780036292.01.T01:CDS
TATGGATCGAGAAGGTACTA+TGG 0.494456 7:-6075999 MsG0780036292.01.T01:CDS
TCAGATTAGAGATTTGGGAT+TGG 0.495066 7:-6076239 MsG0780036292.01.T01:CDS
GGAAGTCTTGGGGAGGATGG+TGG 0.495570 7:-6076317 MsG0780036292.01.T01:CDS
TAATTATCACAGTGAGAAGC+TGG 0.499147 7:-6075066 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGAACGCGCTTGTGGAATCT+AGG 0.500762 7:-6076357 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTGAAGGAATGCAGTGTCAT+GGG 0.501243 7:-6076540 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCTTAATGCTTGTGCAGGTA+TGG 0.502218 7:-6075951 MsG0780036292.01.T01:CDS
CTCTGTGTTGAACGCGCTTG+TGG 0.502320 7:-6076365 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTCATGAGGCCGTATGCTA+TGG 0.504497 7:+6075043 None:intergenic
ATCTCAATCCAACTCACTCC+AGG 0.511943 7:+6075257 None:intergenic
TTTGAAGGAATGCAGTGTCA+TGG 0.512828 7:-6076541 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAAGTCTTGGGGAGGATGGT+GGG 0.515513 7:-6076316 MsG0780036292.01.T01:CDS
TCTTATAATGCTTTAATGGG+TGG 0.516248 7:-6076691 MsG0780036292.01.T01:CDS
CATTACGTATGTTGGTGTCA+TGG 0.519341 7:-6076272 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTGTAAATTTCAATACACTC+TGG 0.519989 7:+6075191 None:intergenic
AGTGGAAGTCTTGGGGAGGA+TGG 0.520783 7:-6076320 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAGGATGGTGGGCGAACGAG+TGG 0.524736 7:-6076305 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCAGAGGGACCCTCGTGACA+TGG 0.527246 7:-6075381 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAACACCGACAAAGGTTACA+TGG 0.527928 7:+6075669 None:intergenic
TTTCAAGACATGCTGTCTGC+CGG 0.527971 7:-6075704 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTGATAAATATGTATTCCA+AGG 0.527980 7:-6075849 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTAGTAAACACATACTCATT+CGG 0.528438 7:+6076598 None:intergenic
GGGTATTCCCAACATGGACT+TGG 0.529598 7:-6075746 MsG0780036292.01.T01:CDS
CTTGTTTACCAAGTCCATGT+TGG 0.531348 7:+6075738 None:intergenic
TTAATGTTTGATGTATTTGT+TGG 0.535925 7:-6076181 MsG0780036292.01.T01:CDS
GGGATATATGCCGAATATTG+AGG 0.537379 7:-6075132 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTTCTCTGATATGAGAAATC+GGG 0.540656 7:-6075798 MsG0780036292.01.T01:CDS
ACTTGGAATGCTATGATATG+TGG 0.544426 7:-6075767 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTAGATATGTTTGGGAAATG+TGG 0.545637 7:-6076148 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATCTGGCTCTTGTAAACGAA+GGG 0.547454 7:-6075631 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAGAGGGACCCTCGTGACAT+GGG 0.550269 7:-6075380 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAGAAGCTGGCCATAGCATA+CGG 0.552166 7:-6075053 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTCATCGAAATTATAACTTG+GGG 0.553705 7:-6075427 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCACTACACCTGTGTGGTTG+CGG 0.554989 7:-6075555 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAGGGAAAGAAACGTAAAGA+AGG 0.556361 7:-6075282 MsG0780036292.01.T01:CDS
AATGATTAGGAAAATGATGA+GGG 0.558998 7:-6075300 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAGGTGTAGTGCTCCAATCC+CGG 0.560633 7:+6075566 None:intergenic
GTATGCAAAGGCACGTAGCT+GGG 0.563799 7:-6075333 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGAAGGAACCTGGAGTGAGT+TGG 0.565526 7:-6075265 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTGATAAATATGTATTCCAA+GGG 0.576019 7:-6075848 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATGACCGCTTACTTACAGAA+TGG 0.578552 7:-6076055 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATAAATATGTATTCCAAGGG+TGG 0.584004 7:-6075845 MsG0780036292.01.T01:CDS
TAGGCGTTTGAGAGAAGCAG+TGG 0.586002 7:-6076338 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAATGATTAGGAAAATGATG+AGG 0.587936 7:-6075301 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATTTCCATTCTGTAAGTAAG+CGG 0.588027 7:+6076051 None:intergenic
TGTATTTGTTGGTAGCATGT+TGG 0.591282 7:-6076170 MsG0780036292.01.T01:CDS
GACAATCTTCACATATCCGA+AGG 0.596860 7:+6074986 None:intergenic
CTGGAAATGATTAAGCAACT+GGG 0.597217 7:-6075152 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCTATCAAACATGTATGCAA+AGG 0.601362 7:-6075345 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAAATCGGAATGTGGTGGTA+TGG 0.602105 7:-6076087 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGCAGATAGAACACCGACAA+AGG 0.602214 7:+6075661 None:intergenic
CATCTGGCTCTTGTAAACGA+AGG 0.602463 7:-6075632 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTACGTATGTTGGTGTCATG+GGG 0.603185 7:-6076270 MsG0780036292.01.T01:CDS
GGTATGGCGGCACTCAGACA+TGG 0.605982 7:-6075935 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGAAACGTAAAGAAGGAACC+TGG 0.607173 7:-6075275 MsG0780036292.01.T01:CDS
CTTGGAATGCTATGATATGT+GGG 0.607460 7:-6075766 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAGAAGCAGTGGAAGTCTTG+GGG 0.609627 7:-6076327 MsG0780036292.01.T01:CDS
CAGAGCTGGTATGCTTGAAG+AGG 0.613359 7:-6075525 MsG0780036292.01.T01:CDS
CGGTTTGCCAAATCGGAATG+TGG 0.613664 7:-6076095 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATCTTCCACATCATGCAGCA+CGG 0.616316 7:+6075109 None:intergenic
TAAACACATACTCATTCGGT+TGG 0.616710 7:+6076602 None:intergenic
TGATGTGGAAGATGAACAGA+AGG 0.617742 7:-6075099 MsG0780036292.01.T01:CDS
TGAGGCCGTGCTGCATGATG+TGG 0.621352 7:-6075114 MsG0780036292.01.T01:CDS
AAGAGGCTGAGAACTTCATG+AGG 0.624437 7:-6075508 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTGTATTGAAATTTACAACA+AGG 0.625285 7:-6075186 MsG0780036292.01.T01:CDS
GTATATGTCCCCATGTCACG+AGG 0.630541 7:+6075371 None:intergenic
ATCTGAAGAAAAGACGTGGA+CGG 0.642344 7:+6075226 None:intergenic
AACCGCAAAAGTGAACTCGT+TGG 0.643234 7:+6075976 None:intergenic
AAGCAGTGGAAGTCTTGGGG+AGG 0.651117 7:-6076324 MsG0780036292.01.T01:CDS
GAAATCGGGATATTATCACT+TGG 0.654388 7:-6075784 MsG0780036292.01.T01:CDS
AGAGGGACCCTCGTGACATG+GGG 0.655527 7:-6075379 MsG0780036292.01.T01:CDS
TAATGCTTGTGCAGGTATGG+CGG 0.657406 7:-6075948 MsG0780036292.01.T01:CDS
GCACAAAACCGCAACCACAC+AGG 0.665920 7:+6075547 None:intergenic
ATATGTGGGTATTCCCAACA+TGG 0.669706 7:-6075752 MsG0780036292.01.T01:CDS
CTTACGTGTATGGATCGAGA+AGG 0.672841 7:-6076007 MsG0780036292.01.T01:CDS
TTTGCCAAATCGGAATGTGG+TGG 0.687738 7:-6076092 MsG0780036292.01.T01:CDS
TATATGTCCCCATGTCACGA+GGG 0.696807 7:+6075372 None:intergenic
TTCCATCTGAAGAAAAGACG+TGG 0.696890 7:+6075222 None:intergenic
TGAAATGGGATGTTGTTGCG+TGG 0.730451 7:-6075475 MsG0780036292.01.T01:CDS
ATTGGAGCACTACACCTGTG+TGG 0.777603 7:-6075561 MsG0780036292.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TGTTAAATTGTTTAAGAATA+TGG - Chr7:6075048-6075067 MsG0780036292.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTCATCGAAATTATAACTT+GGG - Chr7:6076258-6076277 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTTCTTATAATGCTTTAAT+GGG - Chr7:6074992-6075011 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! TATTCATCGAAATTATAACT+TGG - Chr7:6076257-6076276 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTTTCTTATAATGCTTTAA+TGG - Chr7:6074991-6075010 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAATGTTTGATGTATTTGT+TGG - Chr7:6075505-6075524 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGATAAATATGTATTCCAA+GGG - Chr7:6075838-6075857 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGATAAATATGTATTCCA+AGG - Chr7:6075837-6075856 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTTTGTTTAAATTTGGTT+TGG - Chr7:6075168-6075187 MsG0780036292.01.T01:CDS 20.0%
! AATGATTAGGAAAATGATGA+GGG - Chr7:6076386-6076405 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
! GTGTATTGAAATTTACAACA+AGG - Chr7:6076500-6076519 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATCGAAATTATAACTTG+GGG - Chr7:6076259-6076278 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTAAATTTCAATACACTC+TGG + Chr7:6076498-6076517 None:intergenic 25.0%
!! AAGGGTTTTACTATTTGAAT+CGG - Chr7:6076073-6076092 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTAAGAATCGTGTTATTGT+CGG - Chr7:6075808-6075827 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATGGGTTTTTGTTTAAATT+TGG - Chr7:6075163-6075182 MsG0780036292.01.T01:CDS 25.0%
ATAAATATGTATTCCAAGGG+TGG - Chr7:6075841-6075860 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCCATTCTGTAAGTAAG+CGG + Chr7:6075638-6075657 None:intergenic 30.0%
CAATGATTAGGAAAATGATG+AGG - Chr7:6076385-6076404 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
GTAGTAAACACATACTCATT+CGG + Chr7:6075091-6075110 None:intergenic 30.0%
TCTTATAATGCTTTAATGGG+TGG - Chr7:6074995-6075014 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCTCTGATATGAGAAAT+CGG - Chr7:6075887-6075906 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
TTTACATAGTGGTGAACATT+TGG - Chr7:6075021-6075040 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
! CTTACAGAATGGAAATTTTG+AGG - Chr7:6075642-6075661 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
! TTAAGAATCGTGTTATTGTC+GGG - Chr7:6075809-6075828 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
!! TCATGTTGATTTAGCATTGA+AGG - Chr7:6075243-6075262 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATTTAGCATTGAAGGTTT+TGG - Chr7:6075249-6075268 MsG0780036292.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGGAATGCTATGATATG+TGG - Chr7:6075919-6075938 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
ATCCGCGTAATAAAAACCTT+CGG - Chr7:6076684-6076703 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
ATGGGTGGTTATTTACATAG+TGG - Chr7:6075010-6075029 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
CTGGAAATGATTAAGCAACT+GGG - Chr7:6076534-6076553 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAATGCTATGATATGT+GGG - Chr7:6075920-6075939 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
GAAATCGGGATATTATCACT+TGG - Chr7:6075902-6075921 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
GCTATCAAACATGTATGCAA+AGG - Chr7:6076341-6076360 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
GTAGATATGTTTGGGAAATG+TGG - Chr7:6075538-6075557 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
GTTCTCTGATATGAGAAATC+GGG - Chr7:6075888-6075907 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
TAAACACATACTCATTCGGT+TGG + Chr7:6075087-6075106 None:intergenic 35.0%
TAATTATCACAGTGAGAAGC+TGG - Chr7:6076620-6076639 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
TGTGGTCAGATTAGAGATTT+GGG - Chr7:6075442-6075461 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGGTCAGATTAGAGATT+TGG - Chr7:6075441-6075460 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTTACCAAGTCCATGTT+GGG + Chr7:6075950-6075969 None:intergenic 35.0%
! AAGGTTTTTATTACGCGGAT+GGG + Chr7:6076684-6076703 None:intergenic 35.0%
! AGCATGTTGGTAGATATGTT+TGG - Chr7:6075529-6075548 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! ATCCGAAGGTTTTTATTACG+CGG + Chr7:6076689-6076708 None:intergenic 35.0%
! CAGATTAGAGATTTGGGATT+GGG - Chr7:6075448-6075467 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! GCATGTTGGTAGATATGTTT+GGG - Chr7:6075530-6075549 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! TCAGATTAGAGATTTGGGAT+TGG - Chr7:6075447-6075466 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAGAAACTATTTTGCAGA+GGG - Chr7:6076290-6076309 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! TTGCAGAAACTATTTTGCAG+AGG - Chr7:6076289-6076308 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTGACGGTTTGCCAAAT+CGG - Chr7:6075584-6075603 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTACGTATGTTGGTGTCAT+GGG - Chr7:6075415-6075434 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
!! TCGGCTAATGAAGCATTTTA+AGG - Chr7:6076092-6076111 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTATTTGTTGGTAGCATGT+TGG - Chr7:6075516-6075535 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAGGTTTTGGAAAGTGAGTA+TGG - Chr7:6075262-6075281 MsG0780036292.01.T01:CDS 35.0%
AGAAACGTAAAGAAGGAACC+TGG - Chr7:6076411-6076430 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
ATATGTGGGTATTCCCAACA+TGG - Chr7:6075934-6075953 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
ATCTGAAGAAAAGACGTGGA+CGG + Chr7:6076463-6076482 None:intergenic 40.0%
ATGACCGCTTACTTACAGAA+TGG - Chr7:6075631-6075650 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
CCAAACCATGTAACCTTTGT+CGG - Chr7:6076012-6076031 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
CCTCATGAAAATACCTTCTC+CGG - Chr7:6076656-6076675 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTTTACCAAGTCCATGT+TGG + Chr7:6075951-6075970 None:intergenic 40.0%
GACAATCTTCACATATCCGA+AGG + Chr7:6076703-6076722 None:intergenic 40.0%
GAGGACAACACAAGTGAAAT+GGG - Chr7:6076197-6076216 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
GAGGGAAAGAAACGTAAAGA+AGG - Chr7:6076404-6076423 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
GCTGGAAATGATTAAGCAAC+TGG - Chr7:6076533-6076552 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
GGGACAGTGTTACAATGATT+AGG - Chr7:6076373-6076392 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
GGGATATATGCCGAATATTG+AGG - Chr7:6076554-6076573 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TCTATCTGCTTGTGTTCATC+TGG - Chr7:6076038-6076057 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TGAGGACAACACAAGTGAAA+TGG - Chr7:6076196-6076215 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TGATGTGGAAGATGAACAGA+AGG - Chr7:6076587-6076606 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TGGGATAGCATTACGTATGT+TGG - Chr7:6075406-6075425 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TGTGAATCTGCTTACGTGTA+TGG - Chr7:6075669-6075688 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TTCCATCTGAAGAAAAGACG+TGG + Chr7:6076467-6076486 None:intergenic 40.0%
TTGAAGGAATGCAGTGTCAT+GGG - Chr7:6075146-6075165 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TTTCTGCTTGTGCTCATAGT+GGG - Chr7:6075116-6075135 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
TTTGAAGGAATGCAGTGTCA+TGG - Chr7:6075145-6075164 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
! AGTGCGAGGAAAGTTTTTGA+CGG - Chr7:6075571-6075590 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGGTTTTTATTACGCGGA+TGG + Chr7:6076685-6076704 None:intergenic 40.0%
! GTTTTGCTTAATGCTTGTGC+AGG - Chr7:6075730-6075749 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
! TACATGGTTTGGACATTCTC+CGG + Chr7:6076004-6076023 None:intergenic 40.0%
!! ATCTGGCTCTTGTAAACGAA+GGG - Chr7:6076055-6076074 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!! CATAGTGGGAGAGTTTTTGA+AGG - Chr7:6075130-6075149 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!! CATTACGTATGTTGGTGTCA+TGG - Chr7:6075414-6075433 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!! TATGGATCGAGAAGGTACTA+TGG - Chr7:6075687-6075706 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!! TTACGTATGTTGGTGTCATG+GGG - Chr7:6075416-6075435 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!!! AAGCATTTTAAGGTTGAGCC+GGG - Chr7:6076102-6076121 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
!!! GAAGCATTTTAAGGTTGAGC+CGG - Chr7:6076101-6076120 MsG0780036292.01.T01:CDS 40.0%
AACCGCAAAAGTGAACTCGT+TGG + Chr7:6075713-6075732 None:intergenic 45.0%
AAGAGGCTGAGAACTTCATG+AGG - Chr7:6076178-6076197 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
AGAGAAGCAGTGGAAGTCTT+GGG - Chr7:6075358-6075377 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGATAGAACACCGACAA+AGG + Chr7:6076028-6076047 None:intergenic 45.0%
ATCTCAATCCAACTCACTCC+AGG + Chr7:6076432-6076451 None:intergenic 45.0%
ATCTTCCACATCATGCAGCA+CGG + Chr7:6076580-6076599 None:intergenic 45.0%
CAAATCGGAATGTGGTGGTA+TGG - Chr7:6075599-6075618 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
CAACAAGGTTCAGCTATTGC+TGG - Chr7:6076515-6076534 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
CATACCACCACATTCCGATT+TGG + Chr7:6075601-6075620 None:intergenic 45.0%
CATGCGCAGTTGTTGAAAAG+AGG - Chr7:6075481-6075500 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
CCGACAAAGGTTACATGGTT+TGG + Chr7:6076015-6076034 None:intergenic 45.0%
CTTACGTGTATGGATCGAGA+AGG - Chr7:6075679-6075698 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCTGCTTGTGCTCATAG+TGG - Chr7:6075115-6075134 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
GAACACCGACAAAGGTTACA+TGG + Chr7:6076020-6076039 None:intergenic 45.0%
GCTTAATGCTTGTGCAGGTA+TGG - Chr7:6075735-6075754 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
TAATGCTTGTGCAGGTATGG+CGG - Chr7:6075738-6075757 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
TATATGTCCCCATGTCACGA+GGG + Chr7:6076317-6076336 None:intergenic 45.0%
TGAAATGGGATGTTGTTGCG+TGG - Chr7:6076211-6076230 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
TTTCAAGACATGCTGTCTGC+CGG - Chr7:6075982-6076001 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
TTTCATGAGGCCGTATGCTA+TGG + Chr7:6076646-6076665 None:intergenic 45.0%
TTTGCCAAATCGGAATGTGG+TGG - Chr7:6075594-6075613 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
! GTCCACGTCTTTTCTTCAGA+TGG - Chr7:6076462-6076481 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
!! CATCTGGCTCTTGTAAACGA+AGG - Chr7:6076054-6076073 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
!! CATGCTCGAGTTGAGAAGTT+AGG - Chr7:6075784-6075803 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
!!! CCGGAGAAGGTATTTTCATG+AGG + Chr7:6076659-6076678 None:intergenic 45.0%
!!! TTTTAAGGTTGAGCCGGGAT+TGG - Chr7:6076107-6076126 MsG0780036292.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGGAACCTGGAGTGAGT+TGG - Chr7:6076421-6076440 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
AGAATCAATGCTGCCACCCT+TGG + Chr7:6075857-6075876 None:intergenic 50.0%
CAGAGCTGGTATGCTTGAAG+AGG - Chr7:6076161-6076180 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
CGGTTTGCCAAATCGGAATG+TGG - Chr7:6075591-6075610 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAGCAGTGGAAGTCTTG+GGG - Chr7:6075359-6075378 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAGCTGGCCATAGCATA+CGG - Chr7:6076633-6076652 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
GAGAGAAGCAGTGGAAGTCT+TGG - Chr7:6075357-6075376 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
GGGTATTCCCAACATGGACT+TGG - Chr7:6075940-6075959 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
GTATATGTCCCCATGTCACG+AGG + Chr7:6076318-6076337 None:intergenic 50.0%
TAGGCGTTTGAGAGAAGCAG+TGG - Chr7:6075348-6075367 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
TGAACGCGCTTGTGGAATCT+AGG - Chr7:6075329-6075348 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
TGCAGCACGGCCTCAATATT+CGG + Chr7:6076567-6076586 None:intergenic 50.0%
TTTATTACGCGGATGGGTGC+CGG + Chr7:6076678-6076697 None:intergenic 50.0%
! ATTGGAGCACTACACCTGTG+TGG - Chr7:6076125-6076144 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
! GTATGCAAAGGCACGTAGCT+GGG - Chr7:6076353-6076372 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
! TGTATGCAAAGGCACGTAGC+TGG - Chr7:6076352-6076371 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
!! GGCCAACGAGTTCACTTTTG+CGG - Chr7:6075708-6075727 MsG0780036292.01.T01:CDS 50.0%
AAGCAGTGGAAGTCTTGGGG+AGG - Chr7:6075362-6075381 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
AGTGGAAGTCTTGGGGAGGA+TGG - Chr7:6075366-6075385 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
CAGGTGTAGTGCTCCAATCC+CGG + Chr7:6076123-6076142 None:intergenic 55.0%
CTCTGTGTTGAACGCGCTTG+TGG - Chr7:6075321-6075340 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
GAAGTCTTGGGGAGGATGGT+GGG - Chr7:6075370-6075389 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
GCACAAAACCGCAACCACAC+AGG + Chr7:6076142-6076161 None:intergenic 55.0%
GCACTACACCTGTGTGGTTG+CGG - Chr7:6076131-6076150 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGGCGATGTTTTGAGTGCG+AGG - Chr7:6075557-6075576 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTGCGGTTTTGTGCAGAGC+TGG - Chr7:6076147-6076166 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTGGTGTCATGGGGCTTTG+TGG - Chr7:6075424-6075443 MsG0780036292.01.T01:CDS 55.0%
AGAGGGACCCTCGTGACATG+GGG - Chr7:6076307-6076326 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
CAGAGGGACCCTCGTGACAT+GGG - Chr7:6076306-6076325 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
GGAAGTCTTGGGGAGGATGG+TGG - Chr7:6075369-6075388 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
GGTATGGCGGCACTCAGACA+TGG - Chr7:6075751-6075770 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGGCGAACGAGTGGTTT+GGG - Chr7:6075387-6075406 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
TGAGGCCGTGCTGCATGATG+TGG - Chr7:6076572-6076591 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
! TGGTGGGCGAACGAGTGGTT+TGG - Chr7:6075386-6075405 MsG0780036292.01.T01:CDS 60.0%
GCAGAGGGACCCTCGTGACA+TGG - Chr7:6076305-6076324 MsG0780036292.01.T01:CDS 65.0%
!! GAGGATGGTGGGCGAACGAG+TGG - Chr7:6075381-6075400 MsG0780036292.01.T01:CDS 65.0%
!! ACGCGGATGGGTGCCGGAGA+AGG + Chr7:6076672-6076691 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 6074974 6076734 6074974 ID=MsG0780036292.01;Name=MsG0780036292.01
Chr7 mRNA 6074974 6076734 6074974 ID=MsG0780036292.01.T01;Parent=MsG0780036292.01;Name=MsG0780036292.01.T01;_AED=0.08;_eAED=0.09;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|586
Chr7 exon 6074974 6076734 6074974 ID=MsG0780036292.01.T01:exon:3274;Parent=MsG0780036292.01.T01
Chr7 CDS 6074974 6076734 6074974 ID=MsG0780036292.01.T01:cds;Parent=MsG0780036292.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036292.01.T01

ATGTCTCTTAGAAACGTTGTTTCTTATAATGCTTTAATGGGTGGTTATTTACATAGTGGTGAACATTTGGAAGTTGTTAAATTGTTTAAGAATATGGTTTCGTCGTTGTACCAACCGAATGAGTATGTGTTTACTACTGTTCTTTCTGCTTGTGCTCATAGTGGGAGAGTTTTTGAAGGAATGCAGTGTCATGGGTTTTTGTTTAAATTTGGTTTGGTTTTTCATCATTTTGTGAAAAGTGCTCTTGTTCATATGTATTCTAAGTGTTTTCATGTTGATTTAGCATTGAAGGTTTTGGAAAGTGAGTATGGTAGTAGTGATAATGATAATGCTGCTTTTTGTTATAACTCTGTGTTGAACGCGCTTGTGGAATCTAGGCGTTTGAGAGAAGCAGTGGAAGTCTTGGGGAGGATGGTGGGCGAACGAGTGGTTTGGGATAGCATTACGTATGTTGGTGTCATGGGGCTTTGTGGTCAGATTAGAGATTTGGGATTGGGTTTGCAAATTCATGCGCAGTTGTTGAAAAGAGGTTTAATGTTTGATGTATTTGTTGGTAGCATGTTGGTAGATATGTTTGGGAAATGTGGCGATGTTTTGAGTGCGAGGAAAGTTTTTGACGGTTTGCCAAATCGGAATGTGGTGGTATGGACATCTCTCATGACCGCTTACTTACAGAATGGAAATTTTGAGGAGACTGTGAATCTGCTTACGTGTATGGATCGAGAAGGTACTATGGCCAACGAGTTCACTTTTGCGGTTTTGCTTAATGCTTGTGCAGGTATGGCGGCACTCAGACATGGCGATCTATTGCATGCTCGAGTTGAGAAGTTAGGTATTAAGAATCGTGTTATTGTCGGGAATGCTTTGATAAATATGTATTCCAAGGGTGGCAGCATTGATTCTTCATATGATGTGTTCTCTGATATGAGAAATCGGGATATTATCACTTGGAATGCTATGATATGTGGGTATTCCCAACATGGACTTGGTAAACAAGCTTTACTACTGTTTCAAGACATGCTGTCTGCCGGAGAATGTCCAAACCATGTAACCTTTGTCGGTGTTCTATCTGCTTGTGTTCATCTGGCTCTTGTAAACGAAGGGTTTTACTATTTGAATCGGCTAATGAAGCATTTTAAGGTTGAGCCGGGATTGGAGCACTACACCTGTGTGGTTGCGGTTTTGTGCAGAGCTGGTATGCTTGAAGAGGCTGAGAACTTCATGAGGACAACACAAGTGAAATGGGATGTTGTTGCGTGGCGAGTATTGCTTAACGCGTGCAATATTCATCGAAATTATAACTTGGGGAAAAAAATTGCAGAAACTATTTTGCAGAGGGACCCTCGTGACATGGGGACATATACATTGCTATCAAACATGTATGCAAAGGCACGTAGCTGGGACAGTGTTACAATGATTAGGAAAATGATGAGGGAAAGAAACGTAAAGAAGGAACCTGGAGTGAGTTGGATTGAGATAAGAAATGCCGTCCACGTCTTTTCTTCAGATGGAAGCAATCATCCAGAGTGTATTGAAATTTACAACAAGGTTCAGCTATTGCTGGAAATGATTAAGCAACTGGGATATATGCCGAATATTGAGGCCGTGCTGCATGATGTGGAAGATGAACAGAAGGAAAGCTATCTTAATTATCACAGTGAGAAGCTGGCCATAGCATACGGCCTCATGAAAATACCTTCTCCGGCACCCATCCGCGTAATAAAAACCTTCGGATATGTGAAGATTGTCACACTGCTGTAA
Protein sequence

>MsG0780036292.01.T01

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