AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036339.01

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MsG0780036339.01.T01 AT1G62914 26.301 346 246 5 60 401 181 521 1.30e-34 139
MsG0780036339.01.T01 AT1G62914 25.108 231 172 1 58 288 284 513 6.36e-19 91.3
MsG0780036339.01.T01 AT1G64583 26.157 432 270 4 92 519 76 462 2.31e-39 152
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MsG0780036339.01.T01 AT1G64583 29.474 285 157 6 58 338 217 461 2.13e-23 104
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MsG0780036339.01.T01 AT1G53330 24.803 254 171 5 285 532 29 268 9.86e-15 77.0
MsG0780036339.01.T01 AT1G53330 28.718 195 118 4 465 638 60 254 3.87e-12 68.9
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MsG0780036339.01.T01 AT5G40400 22.166 397 263 6 250 615 249 630 5.27e-15 79.3
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MsG0780036339.01.T01 AT1G79490 21.538 390 237 8 258 638 189 518 4.42e-16 83.2
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MsG0780036339.01.T01 AT5G46580 24.000 325 231 3 165 483 183 497 6.48e-16 82.4
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MsG0780036339.01.T01 AT5G46580 22.884 319 208 8 333 642 211 500 8.91e-12 68.9
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MsG0780036339.01.T01 AT4G18840 21.250 400 269 12 152 537 93 460 2.13e-14 77.0
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MsG0780036339.01.T01 AT3G04750 22.043 372 254 10 169 530 167 512 1.17e-13 75.1
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MsG0780036339.01.T01 AT3G05240 22.366 465 310 17 168 621 72 496 2.01e-12 70.9
MsG0780036339.01.T01 AT3G20730 23.951 405 238 13 298 637 49 448 1.51e-13 74.3
MsG0780036339.01.T01 AT1G15510 21.584 505 313 14 167 615 195 672 1.54e-13 75.1
MsG0780036339.01.T01 AT1G15510 22.251 382 249 13 277 634 133 490 5.61e-13 73.2
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MsG0780036339.01.T01 AT2G21090 19.940 331 226 7 307 615 143 456 8.07e-11 65.9
MsG0780036339.01.T01 AT4G08210 20.074 538 314 13 168 615 40 551 9.28e-11 65.9
MsG0780036339.01.T01 AT2G40240 25.792 221 143 7 275 487 109 316 9.98e-11 64.7

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sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTTGATTCTTTGTGTAAAT+TGG 0.137841 7:-6663067 MsG0780036339.01.T01:CDS
TAACATACACTGCTCTAATT+TGG 0.193946 7:-6662078 MsG0780036339.01.T01:CDS
CTCTATACTGCCATGGTTAA+TGG 0.228442 7:-6662673 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGTTATACAATTATGATAAA+AGG 0.243611 7:-6662436 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTTAAAGAAATGGAGGAAAA+AGG 0.253456 7:-6662913 MsG0780036339.01.T01:CDS
GTTATGTGTGTTTGATGATA+TGG 0.290654 7:-6663553 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACAACATGATAAAGTGAAAA+TGG 0.298221 7:-6663685 MsG0780036339.01.T01:CDS
AACATACACTGCTCTAATTT+GGG 0.298715 7:-6662077 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGCTATATCCTTCATTGCTT+GGG 0.319204 7:-6663180 MsG0780036339.01.T01:CDS
TAGCTATATCCTTCATTGCT+TGG 0.337344 7:-6663181 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCAATGTTTGTTTAAAGAAA+TGG 0.340899 7:-6662923 MsG0780036339.01.T01:CDS
TATCAATGGATACTGTCTTC+AGG 0.348724 7:-6662962 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCTCTTCTGAAGACATAAA+AGG 0.360161 7:-6662277 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATAGCATAAGTGTGATGATT+AGG 0.379533 7:+6663621 None:intergenic
TATATTTCAACAGAAAGTTC+TGG 0.383501 7:-6662586 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCGAATTCTACAAGTTATAA+AGG 0.387662 7:-6661903 MsG0780036339.01.T01:CDS
CTTTATCATGTTGTACTAAA+CGG 0.389212 7:+6663694 None:intergenic
CTTGATTCTTTGTGTAAATT+GGG 0.400215 7:-6663066 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACCGTGTAAGTAACAACATT+TGG 0.402007 7:+6662193 None:intergenic
GCATAGGCATAAACCTCTAT+AGG 0.408570 7:+6663411 None:intergenic
CATGTCTGATGACGGATATA+AGG 0.410779 7:-6663463 MsG0780036339.01.T01:CDS
TGATAAAGTGAAAATGGCTT+TGG 0.412262 7:-6663679 MsG0780036339.01.T01:CDS
GCCTATGCTGCGGTTATTCG+CGG 0.416686 7:-6663396 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCTTCATTGCTTGGGTGAGA+TGG 0.419755 7:-6663172 MsG0780036339.01.T01:CDS
GAAGACAGTATCCATTGATA+AGG 0.423344 7:+6662965 None:intergenic
GCCGCATAACAATATGAATT+CGG 0.424939 7:+6663513 None:intergenic
CTAATTTGGGGCTTGTTAAA+CGG 0.426036 7:-6662064 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACATTATACGCAACAACATC+AGG 0.426512 7:+6662883 None:intergenic
ACTGTGTAGGTAACTACATT+AGG 0.430186 7:+6662343 None:intergenic
CCATTTCTTTAAACAAACAT+TGG 0.436951 7:+6662923 None:intergenic
GGAGAATAAACATGAAAATC+AGG 0.439851 7:+6663303 None:intergenic
TAAAGTGAAAATGGCTTTGG+AGG 0.446349 7:-6663676 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATCTTATGTGTAGTAGAGTT+CGG 0.446628 7:+6662778 None:intergenic
CTTGTTTGAGAAGTTATTAG+AGG 0.446813 7:-6663895 MsG0780036339.01.T01:CDS
GACTGTCCATATAAATCAAA+AGG 0.448704 7:+6662812 None:intergenic
CATTTCTTTAAACAAACATT+GGG 0.452202 7:+6662924 None:intergenic
CACGTTCCATATTCCTTGCC+TGG 0.454384 7:+6662512 None:intergenic
ATCAATGGATACTGTCTTCA+GGG 0.460963 7:-6662961 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCCTCTCCTCTTCATATCC+TGG 0.464547 7:+6662371 None:intergenic
GGGTGAGATGGGTAAGGATT+CGG 0.464856 7:-6663160 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTGTTATGCGGCTTATATTG+AGG 0.466470 7:-6663502 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATTGAAGGTTATTGTTCAGT+AGG 0.468254 7:-6662751 MsG0780036339.01.T01:CDS
TGTTATGCGGCTTATATTGA+GGG 0.469718 7:-6663501 MsG0780036339.01.T01:CDS
TATTGACCAAGGACTAAAAC+CGG 0.469800 7:-6662107 MsG0780036339.01.T01:CDS
GGATACTGTAAGATCAATGA+TGG 0.470825 7:-6663270 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATTGTGCCAGGCAAGGAATA+TGG 0.470886 7:-6662518 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGAGGCTTATAACCTCTTCC+AGG 0.472865 7:-6662389 MsG0780036339.01.T01:CDS
CTTCATTGCTTGGGTGAGAT+GGG 0.474960 7:-6663171 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCTATGCTGCGGTTATTCGC+GGG 0.476040 7:-6663395 MsG0780036339.01.T01:CDS
TATTGTTCAGTAGGCAAGGT+TGG 0.482261 7:-6662742 MsG0780036339.01.T01:CDS
AAACAAACATTGGGCTTCAA+CGG 0.485195 7:+6662933 None:intergenic
CCATCTCACCCAAGCAATGA+AGG 0.485928 7:+6663172 None:intergenic
GCAGTGTATGTTACTCCATC+CGG 0.487009 7:+6662088 None:intergenic
TTCTTTGTGTAAATTGGGTA+AGG 0.488538 7:-6663061 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTTCTGTTGAAATATATCCT+TGG 0.489536 7:+6662593 None:intergenic
TATAAAGAAATCAAGAGGGT+TGG 0.490737 7:-6663651 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACCAACTGTCAAAACTGACT+TGG 0.492215 7:+6661781 None:intergenic
CACTACACGACCCTTATCAA+TGG 0.493916 7:-6662976 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACACATAAGATTATCATTGA+AGG 0.498154 7:-6662766 MsG0780036339.01.T01:CDS
CATATAAATCAAAAGGTCAA+TGG 0.500531 7:+6662819 None:intergenic
TTGCTTGGGTGAGATGGGTA+AGG 0.506245 7:-6663166 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGTATTAGCTGCATTGTGCC+AGG 0.512510 7:-6662530 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGGCAAGGTTGGAGAGGCTG+AGG 0.513150 7:-6662731 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACCTACACAGTTCTACTCCA+TGG 0.514772 7:-6662331 MsG0780036339.01.T01:CDS
AAAGATCTATAACTTTGAAA+AGG 0.520221 7:-6662152 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGAGAGTAATGCACCTATAG+AGG 0.521727 7:-6663424 MsG0780036339.01.T01:CDS
AAGACAGTATCCATTGATAA+GGG 0.522752 7:+6662966 None:intergenic
TTTGATGATATGGAGGAGGC+TGG 0.523024 7:-6663543 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCTCTTCATATCCTGGAAG+AGG 0.524113 7:+6662377 None:intergenic
AATCATGTGTGTTTCTCGAT+GGG 0.526677 7:-6663107 MsG0780036339.01.T01:CDS
TGAAATGTCAACCAAGGGAA+TGG 0.528008 7:-6662008 MsG0780036339.01.T01:CDS
TAGAATGAATTGCTTGCAAG+AGG 0.528390 7:-6662407 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTTGTGTAAATTGGGTAAGG+TGG 0.528879 7:-6663058 MsG0780036339.01.T01:CDS
CAATCATGTGTGTTTCTCGA+TGG 0.530902 7:-6663108 MsG0780036339.01.T01:CDS
CTTGTTAAACGGAAGGCTAA+AGG 0.540469 7:-6662053 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGGTTATTGTTCAGTAGGCA+AGG 0.543574 7:-6662746 MsG0780036339.01.T01:CDS
GTGTTTGCTAAAGCTTGTGT+TGG 0.547839 7:-6663816 MsG0780036339.01.T01:CDS
GTCACCACTTGGGATATGCA+AGG 0.548715 7:+6661979 None:intergenic
GTTTATTCTCCGTTGATCCG+TGG 0.550721 7:-6663291 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCACCACTTGGGATATGCAA+GGG 0.552926 7:+6661980 None:intergenic
TTGATTTATATGGACAGTCA+AGG 0.558860 7:-6662808 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCCGCGAATAACCGCAGCAT+AGG 0.560047 7:+6663395 None:intergenic
TTTGGGGCTTGTTAAACGGA+AGG 0.560660 7:-6662060 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATCGGGAGAGGATTTACGCT+CGG 0.563481 7:-6662466 MsG0780036339.01.T01:CDS
TAGAAAAGATCTTGATAGTG+AGG 0.563844 7:-6662842 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCAACTGTCAAAACTGACTT+GGG 0.567066 7:+6661782 None:intergenic
TTGTTTGAGAAGTTATTAGA+GGG 0.567119 7:-6663894 MsG0780036339.01.T01:CDS
GCGTATAATGTACTAGCCGC+CGG 0.567754 7:-6662871 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTCAGTAGGCAAGGTTGGAG+AGG 0.568514 7:-6662737 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCAAATGTTGTTACTTACA+CGG 0.569687 7:-6662194 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTATAACTTGTAGAATTCGA+CGG 0.569730 7:+6661906 None:intergenic
TTTAATGAAATTATTGACCA+AGG 0.571773 7:-6662118 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACACGATGACATGATTTCGA+AGG 0.572124 7:-6663229 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCAGGATATGAAGAGGAGA+GGG 0.572373 7:-6662372 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATGTGTGTTTGATGATATGG+AGG 0.573517 7:-6663550 MsG0780036339.01.T01:CDS
TCCGAATTCATATTGTTATG+CGG 0.582177 7:-6663514 MsG0780036339.01.T01:CDS
CACGATGACATGATTTCGAA+GGG 0.584240 7:-6663228 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCTACACAGTTCTACTCCAT+GGG 0.585354 7:-6662330 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTCAACTATACTGAGAGAGA+TGG 0.586187 7:-6662233 MsG0780036339.01.T01:CDS
AATAATAACATGTCTGATGA+CGG 0.588002 7:-6663471 MsG0780036339.01.T01:CDS
TGTGTTTGATGATATGGAGG+AGG 0.589524 7:-6663547 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATGTTTGTTTAAAGAAATGG+AGG 0.589985 7:-6662920 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTCTTTAAGCTGTCAAACCA+AGG 0.590309 7:-6662610 MsG0780036339.01.T01:CDS
AACTATACTGAGAGAGATGG+AGG 0.590608 7:-6662230 MsG0780036339.01.T01:CDS
CATTGATCTTACAGTATCCA+CGG 0.591079 7:+6663274 None:intergenic
AGGTTTATAAAGAAATCAAG+AGG 0.603814 7:-6663656 MsG0780036339.01.T01:CDS
TAGCTGCATTGTGCCAGGCA+AGG 0.605815 7:-6662525 MsG0780036339.01.T01:CDS
GTTATGCGGCTTATATTGAG+GGG 0.610306 7:-6663500 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACCTCTTCCAGGATATGAAG+AGG 0.612925 7:-6662378 MsG0780036339.01.T01:CDS
TATTATGAAATGTCAACCAA+GGG 0.613708 7:-6662013 MsG0780036339.01.T01:CDS
TGTCGAACTCTATACTGCCA+TGG 0.615528 7:-6662680 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTCCAGGATATGAAGAGGAG+AGG 0.617790 7:-6662373 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTATTATGAAATGTCAACCA+AGG 0.623212 7:-6662014 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTACAGTATCCACGGATCAA+CGG 0.623647 7:+6663282 None:intergenic
GGATGATGCGGTAAGTACGT+TGG 0.630106 7:-6663037 MsG0780036339.01.T01:CDS
ACATACACTGCTCTAATTTG+GGG 0.630352 7:-6662076 MsG0780036339.01.T01:CDS
ATTGGGTAAGGTGGATGATG+CGG 0.633555 7:-6663049 MsG0780036339.01.T01:CDS
AACTGACTTGGGATAACTCG+AGG 0.636530 7:+6661793 None:intergenic
GATACTGTAAGATCAATGAT+GGG 0.646203 7:-6663269 MsG0780036339.01.T01:CDS
GGTTTATAAAGAAATCAAGA+GGG 0.646919 7:-6663655 MsG0780036339.01.T01:CDS
CCCATGGAGTAGAACTGTGT+AGG 0.649114 7:+6662330 None:intergenic
GACCAAGGACTAAAACCGGA+TGG 0.650770 7:-6662103 MsG0780036339.01.T01:CDS
GGGATAACTCGAGGCACTAA+CGG 0.651640 7:+6661802 None:intergenic
ATCATGTGTGTTTCTCGATG+GGG 0.657100 7:-6663106 MsG0780036339.01.T01:CDS
AGAGGTTTATGCCTATGCTG+CGG 0.667040 7:-6663406 MsG0780036339.01.T01:CDS
AATGAAATTAGATAAAGCTG+AGG 0.667301 7:-6663361 MsG0780036339.01.T01:CDS
TTCACAATAGCCATTAACCA+TGG 0.681802 7:+6662663 None:intergenic
AAACCCTTGCATATCCCAAG+TGG 0.690118 7:-6661983 MsG0780036339.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGTTATACAATTATGATAAA+AGG - Chr7:6663206-6663225 MsG0780036339.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATAGAATTTCAAACTTTTTA+GGG + Chr7:6663898-6663917 None:intergenic 15.0%
!! CATTTCTTTAAACAAACATT+GGG + Chr7:6662721-6662740 None:intergenic 20.0%
!! TTCAGAAAAAAACAGAAAAA+AGG - Chr7:6663775-6663794 MsG0780036339.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTAATGAAATTATTGACCA+AGG - Chr7:6663524-6663543 MsG0780036339.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAGATCTATAACTTTGAAA+AGG - Chr7:6663490-6663509 MsG0780036339.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGATCTTTTCTAAATAAAC+CGG + Chr7:6662793-6662812 None:intergenic 20.0%
!!! GATAGAATTTCAAACTTTTT+AGG + Chr7:6663899-6663918 None:intergenic 20.0%
!!! GATCATATGATTTTTCAATA+AGG + Chr7:6663010-6663029 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTTGTTTGATTTTTTCAT+CGG - Chr7:6663158-6663177 MsG0780036339.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTCTGTTTTTTTCTGAA+GGG + Chr7:6663775-6663794 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTCTGTTTTTTTCTGA+AGG + Chr7:6663776-6663795 None:intergenic 20.0%
! AAGTTACAAGCAAAAATACT+TGG + Chr7:6661919-6661938 None:intergenic 25.0%
! AATAATAACATGTCTGATGA+CGG - Chr7:6662171-6662190 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! AATGAAATTAGATAAAGCTG+AGG - Chr7:6662281-6662300 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! ACAACATGATAAAGTGAAAA+TGG - Chr7:6661957-6661976 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! ACACATAAGATTATCATTGA+AGG - Chr7:6662876-6662895 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! ACAGAAAAAAGGAAAAAGAA+AGG - Chr7:6663786-6663805 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTGATTCTTTGTGTAAAT+TGG - Chr7:6662575-6662594 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! AGGTTTATAAAGAAATCAAG+AGG - Chr7:6661986-6662005 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTTTGTTTAAAGAAATGG+AGG - Chr7:6662722-6662741 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! CATATAAATCAAAAGGTCAA+TGG + Chr7:6662826-6662845 None:intergenic 25.0%
! CCAATGTTTGTTTAAAGAAA+TGG - Chr7:6662719-6662738 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! CCATTTCTTTAAACAAACAT+TGG + Chr7:6662722-6662741 None:intergenic 25.0%
! CTTGATTCTTTGTGTAAATT+GGG - Chr7:6662576-6662595 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTATCATGTTGTACTAAA+CGG + Chr7:6661951-6661970 None:intergenic 25.0%
! GGTTTATAAAGAAATCAAGA+GGG - Chr7:6661987-6662006 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TATATTTCAACAGAAAGTTC+TGG - Chr7:6663056-6663075 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TATTATGAAATGTCAACCAA+GGG - Chr7:6663629-6663648 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TCGAATTCTACAAGTTATAA+AGG - Chr7:6663739-6663758 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTATGAAATGTCAACCA+AGG - Chr7:6663628-6663647 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTTTGAGAAGTTATTAGA+GGG - Chr7:6661748-6661767 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAAAGAAATGGAGGAAAA+AGG - Chr7:6662729-6662748 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCTGTTGAAATATATCCT+TGG + Chr7:6663052-6663071 None:intergenic 25.0%
!! TTATAACTTGTAGAATTCGA+CGG + Chr7:6663739-6663758 None:intergenic 25.0%
!!! CATTGACCTTTTGATTTATA+TGG - Chr7:6662824-6662843 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTTGTTTGATTTTTTCATC+GGG - Chr7:6663159-6663178 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTTCATTTTCAAGTTACT+AGG - Chr7:6661881-6661900 MsG0780036339.01.T01:CDS 25.0%
AACATACACTGCTCTAATTT+GGG - Chr7:6663565-6663584 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
AAGACAGTATCCATTGATAA+GGG + Chr7:6662679-6662698 None:intergenic 30.0%
ATAGCATAAGTGTGATGATT+AGG + Chr7:6662024-6662043 None:intergenic 30.0%
ATCTTATGTGTAGTAGAGTT+CGG + Chr7:6662867-6662886 None:intergenic 30.0%
ATTGAAGGTTATTGTTCAGT+AGG - Chr7:6662891-6662910 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
CTTGTTTGAGAAGTTATTAG+AGG - Chr7:6661747-6661766 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
GACTGTCCATATAAATCAAA+AGG + Chr7:6662833-6662852 None:intergenic 30.0%
GATACTGTAAGATCAATGAT+GGG - Chr7:6662373-6662392 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
GGAGAATAAACATGAAAATC+AGG + Chr7:6662342-6662361 None:intergenic 30.0%
TAACATACACTGCTCTAATT+TGG - Chr7:6663564-6663583 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
TATAAAGAAATCAAGAGGGT+TGG - Chr7:6661991-6662010 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
TCCGAATTCATATTGTTATG+CGG - Chr7:6662128-6662147 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
TGATAAAGTGAAAATGGCTT+TGG - Chr7:6661963-6661982 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTTGTGTAAATTGGGTA+AGG - Chr7:6662581-6662600 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTTATATGGACAGTCA+AGG - Chr7:6662834-6662853 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTTTTCTAAATAAACCGG+CGG + Chr7:6662790-6662809 None:intergenic 30.0%
! ATTTTACGACATGAAATCGT+GGG - Chr7:6662308-6662327 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
! GTTATGTGTGTTTGATGATA+TGG - Chr7:6662089-6662108 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
! TATTTTACGACATGAAATCG+TGG - Chr7:6662307-6662326 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
! TCCAAATGTTGTTACTTACA+CGG - Chr7:6663448-6663467 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
!! TAGAAAAGATCTTGATAGTG+AGG - Chr7:6662800-6662819 MsG0780036339.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATGCTTGTTTTAATTTCCCA+TGG + Chr7:6663331-6663350 None:intergenic 30.0%
AAACAAACATTGGGCTTCAA+CGG + Chr7:6662712-6662731 None:intergenic 35.0%
AATCATGTGTGTTTCTCGAT+GGG - Chr7:6662535-6662554 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
ACATACACTGCTCTAATTTG+GGG - Chr7:6663566-6663585 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
ACATTATACGCAACAACATC+AGG + Chr7:6662762-6662781 None:intergenic 35.0%
ACCGTGTAAGTAACAACATT+TGG + Chr7:6663452-6663471 None:intergenic 35.0%
ACTGTGTAGGTAACTACATT+AGG + Chr7:6663302-6663321 None:intergenic 35.0%
AGCTATATCCTTCATTGCTT+GGG - Chr7:6662462-6662481 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATGGATACTGTCTTCA+GGG - Chr7:6662681-6662700 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
CATTGATCTTACAGTATCCA+CGG + Chr7:6662371-6662390 None:intergenic 35.0%
GAAGACAGTATCCATTGATA+AGG + Chr7:6662680-6662699 None:intergenic 35.0%
GCCGCATAACAATATGAATT+CGG + Chr7:6662132-6662151 None:intergenic 35.0%
GGATACTGTAAGATCAATGA+TGG - Chr7:6662372-6662391 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TAGAATGAATTGCTTGCAAG+AGG - Chr7:6663235-6663254 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TAGCTATATCCTTCATTGCT+TGG - Chr7:6662461-6662480 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TATCAATGGATACTGTCTTC+AGG - Chr7:6662680-6662699 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TATTGACCAAGGACTAAAAC+CGG - Chr7:6663535-6663554 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TGTTATGCGGCTTATATTGA+GGG - Chr7:6662141-6662160 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TTCAACTATACTGAGAGAGA+TGG - Chr7:6663409-6663428 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TTCACAATAGCCATTAACCA+TGG + Chr7:6662982-6663001 None:intergenic 35.0%
TTCTTTAAGCTGTCAAACCA+AGG - Chr7:6663032-6663051 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTATGCGGCTTATATTG+AGG - Chr7:6662140-6662159 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTGTAAATTGGGTAAGG+TGG - Chr7:6662584-6662603 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGCTTTTTGTCACCACTT+GGG + Chr7:6663676-6663695 None:intergenic 35.0%
! ATGTGTGTTTGATGATATGG+AGG - Chr7:6662092-6662111 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
! TCCTCTTCTGAAGACATAAA+AGG - Chr7:6663365-6663384 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
! TCCTTTTATGTCTTCAGAAG+AGG + Chr7:6663369-6663388 None:intergenic 35.0%
! TTTTACGACATGAAATCGTG+GGG - Chr7:6662309-6662328 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
!! CTAATTTGGGGCTTGTTAAA+CGG - Chr7:6663578-6663597 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAAGTGAAAATGGCTTTGG+AGG - Chr7:6661966-6661985 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTTACACGGTTTTGATTGA+TGG - Chr7:6663461-6663480 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTGATTTTTTCATCGGGAG+AGG - Chr7:6663164-6663183 MsG0780036339.01.T01:CDS 35.0%
AACTATACTGAGAGAGATGG+AGG - Chr7:6663412-6663431 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
ACACGATGACATGATTTCGA+AGG - Chr7:6662413-6662432 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
ACCAACTGTCAAAACTGACT+TGG + Chr7:6663864-6663883 None:intergenic 40.0%
AGAGAGTAATGCACCTATAG+AGG - Chr7:6662218-6662237 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTATTGTTCAGTAGGCA+AGG - Chr7:6662896-6662915 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
ATCATGTGTGTTTCTCGATG+GGG - Chr7:6662536-6662555 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
CAATCATGTGTGTTTCTCGA+TGG - Chr7:6662534-6662553 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
CACGATGACATGATTTCGAA+GGG - Chr7:6662414-6662433 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
CTCTATACTGCCATGGTTAA+TGG - Chr7:6662969-6662988 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTTAAACGGAAGGCTAA+AGG - Chr7:6663589-6663608 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
GCATAGGCATAAACCTCTAT+AGG + Chr7:6662234-6662253 None:intergenic 40.0%
GTTATGCGGCTTATATTGAG+GGG - Chr7:6662142-6662161 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
TATTGTTCAGTAGGCAAGGT+TGG - Chr7:6662900-6662919 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATGTCAACCAAGGGAA+TGG - Chr7:6663634-6663653 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
TTACAGTATCCACGGATCAA+CGG + Chr7:6662363-6662382 None:intergenic 40.0%
! CCAACTGTCAAAACTGACTT+GGG + Chr7:6663863-6663882 None:intergenic 40.0%
! GAAAGCTTTTTGTCACCACT+TGG + Chr7:6663677-6663696 None:intergenic 40.0%
! GTGTTTGCTAAAGCTTGTGT+TGG - Chr7:6661826-6661845 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGTTTGATGATATGGAGG+AGG - Chr7:6662095-6662114 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
!! CAGTTTTGACAGTTGGTGTT+AGG - Chr7:6663867-6663886 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
!! CATGTCTGATGACGGATATA+AGG - Chr7:6662179-6662198 MsG0780036339.01.T01:CDS 40.0%
AAACCCTTGCATATCCCAAG+TGG - Chr7:6663659-6663678 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
ACCTACACAGTTCTACTCCA+TGG - Chr7:6663311-6663330 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
ACCTCTTCCAGGATATGAAG+AGG - Chr7:6663264-6663283 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
AGAGGCTTATAACCTCTTCC+AGG - Chr7:6663253-6663272 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
AGAGGTTTATGCCTATGCTG+CGG - Chr7:6662236-6662255 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
AGTATTAGCTGCATTGTGCC+AGG - Chr7:6663112-6663131 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGGTAAGGTGGATGATG+CGG - Chr7:6662593-6662612 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
ATTGTGCCAGGCAAGGAATA+TGG - Chr7:6663124-6663143 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
CACTACACGACCCTTATCAA+TGG - Chr7:6662666-6662685 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
CCTACACAGTTCTACTCCAT+GGG - Chr7:6663312-6663331 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
CTTCATTGCTTGGGTGAGAT+GGG - Chr7:6662471-6662490 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
GCAGTGTATGTTACTCCATC+CGG + Chr7:6663557-6663576 None:intergenic 45.0%
GTTTATTCTCCGTTGATCCG+TGG - Chr7:6662351-6662370 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
TCACCACTTGGGATATGCAA+GGG + Chr7:6663665-6663684 None:intergenic 45.0%
TCCAGGATATGAAGAGGAGA+GGG - Chr7:6663270-6663289 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
TCCTCTTCATATCCTGGAAG+AGG + Chr7:6663268-6663287 None:intergenic 45.0%
TGTCGAACTCTATACTGCCA+TGG - Chr7:6662962-6662981 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
TTCCAGGATATGAAGAGGAG+AGG - Chr7:6663269-6663288 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGATGATATGGAGGAGGC+TGG - Chr7:6662099-6662118 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
!! AACTGACTTGGGATAACTCG+AGG + Chr7:6663852-6663871 None:intergenic 45.0%
!! CCCAAGTCAGTTTTGACAGT+TGG - Chr7:6663860-6663879 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGGGGCTTGTTAAACGGA+AGG - Chr7:6663582-6663601 MsG0780036339.01.T01:CDS 45.0%
ATCGGGAGAGGATTTACGCT+CGG - Chr7:6663176-6663195 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
CACGTTCCATATTCCTTGCC+TGG + Chr7:6663133-6663152 None:intergenic 50.0%
CCATCTCACCCAAGCAATGA+AGG + Chr7:6662473-6662492 None:intergenic 50.0%
CCCATGGAGTAGAACTGTGT+AGG + Chr7:6663315-6663334 None:intergenic 50.0%
CCTTCATTGCTTGGGTGAGA+TGG - Chr7:6662470-6662489 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
GACCAAGGACTAAAACCGGA+TGG - Chr7:6663539-6663558 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
GCGTATAATGTACTAGCCGC+CGG - Chr7:6662771-6662790 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
GGATGATGCGGTAAGTACGT+TGG - Chr7:6662605-6662624 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
GGGTGAGATGGGTAAGGATT+CGG - Chr7:6662482-6662501 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
GTCACCACTTGGGATATGCA+AGG + Chr7:6663666-6663685 None:intergenic 50.0%
TCCCTCTCCTCTTCATATCC+TGG + Chr7:6663274-6663293 None:intergenic 50.0%
TTCAGTAGGCAAGGTTGGAG+AGG - Chr7:6662905-6662924 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
TTGCTTGGGTGAGATGGGTA+AGG - Chr7:6662476-6662495 MsG0780036339.01.T01:CDS 50.0%
! CAAGGGTTTTGCCATTCCCT+TGG + Chr7:6663648-6663667 None:intergenic 50.0%
! GGGATAACTCGAGGCACTAA+CGG + Chr7:6663843-6663862 None:intergenic 50.0%
!! CTCCATCCGGTTTTAGTCCT+TGG + Chr7:6663544-6663563 None:intergenic 50.0%
CCTATGCTGCGGTTATTCGC+GGG - Chr7:6662247-6662266 MsG0780036339.01.T01:CDS 55.0%
GCCTATGCTGCGGTTATTCG+CGG - Chr7:6662246-6662265 MsG0780036339.01.T01:CDS 55.0%
TAGCTGCATTGTGCCAGGCA+AGG - Chr7:6663117-6663136 MsG0780036339.01.T01:CDS 55.0%
AGGCAAGGTTGGAGAGGCTG+AGG - Chr7:6662911-6662930 MsG0780036339.01.T01:CDS 60.0%
CCCGCGAATAACCGCAGCAT+AGG + Chr7:6662250-6662269 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 6661739 6663925 6661739 ID=MsG0780036339.01;Name=MsG0780036339.01
Chr7 mRNA 6661739 6663925 6661739 ID=MsG0780036339.01.T01;Parent=MsG0780036339.01;Name=MsG0780036339.01.T01;_AED=0.40;_eAED=0.40;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|728
Chr7 exon 6661739 6663925 6661739 ID=MsG0780036339.01.T01:exon:3607;Parent=MsG0780036339.01.T01
Chr7 CDS 6661739 6663925 6661739 ID=MsG0780036339.01.T01:cds;Parent=MsG0780036339.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036339.01.T01

ATGCATGACTTGTTTGAGAAGTTATTAGAGGGTGTTGATGTTGTTGAGAATAAAAAACATTACTTTGCTATACTTAGAGCATTTGATGTGTTTGCTAAAGCTTGTGTTGGTCTTAACATGTTTGATGAAGCATTTGACTTCTTGTTTCATTTTCAAGTTACTAGGTTTGAGATTCTTCCAAGTATTTTTGCTTGTAACTTTCTTATTAACCGTTTAGTACAACATGATAAAGTGAAAATGGCTTTGGAGGTTTATAAAGAAATCAAGAGGGTTGGTTTGTGTCCTAATCATCACACTTATGCTATTGTTATCAAGAGTTTGTGTAAGAATAGTGATGATTTGAAACACGTGTTATGTGTGTTTGATGATATGGAGGAGGCTGGTGTGACTCCGAATTCATATTGTTATGCGGCTTATATTGAGGGGTTGTGTAATAATAACATGTCTGATGACGGATATAAGGTGCTCGAACGATGTAGAGAGAGTAATGCACCTATAGAGGTTTATGCCTATGCTGCGGTTATTCGCGGGTTTTGTAATGAAATGAAATTAGATAAAGCTGAGGATGTATTTTACGACATGAAATCGTGGGGACTTGTTCCTGATTTTCATGTTTATTCTCCGTTGATCCGTGGATACTGTAAGATCAATGATGGGCTTAGAGCGAGATCGTTACACGATGACATGATTTCGAAGGGTATAGAGACAAATTGTGTGATTGTTAGCTATATCCTTCATTGCTTGGGTGAGATGGGTAAGGATTCGGAAGTTGTAGATGTATTTAAAGAAGTAAAGCAATCATGTGTGTTTCTCGATGGGGTAGCTTACAATATTGTACTTGATTCTTTGTGTAAATTGGGTAAGGTGGATGATGCGGTAAGTACGTTGGAAGAGTTGAAATCTATGAATATCGATTTAGATATCAAACACTACACGACCCTTATCAATGGATACTGTCTTCAGGGTAAAACCGTTGAAGCCCAATGTTTGTTTAAAGAAATGGAGGAAAAAGGATTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAATGTACTAGCCGCCGGTTTATTTAGAAAAGATCTTGATAGTGAGGCCATTGACCTTTTGATTTATATGGACAGTCAAGGTGTGAAGCCGAACTCTACTACACATAAGATTATCATTGAAGGTTATTGTTCAGTAGGCAAGGTTGGAGAGGCTGAGGCATATTTTAACAGTATGAAACATGAAAGTGTCGAACTCTATACTGCCATGGTTAATGGCTATTGTGAAGCTAACCTTATTGAAAAATCATATGATCTTTTCTTTAAGCTGTCAAACCAAGGATATATTTCAACAGAAAGTTCTGGTTTTGAGAAACTTAGCAAAGTAATGTGTTCTAAAGTATTAGCTGCATTGTGCCAGGCAAGGAATATGGAACGTGCTCGCTCTTTGTTTGATTTTTTCATCGGGAGAGGATTTACGCTCGGCGTTGTAAGTTATACAATTATGATAAAAGGTTATTGTAGAATGAATTGCTTGCAAGAGGCTTATAACCTCTTCCAGGATATGAAGAGGAGAGGGATCGAACCTAATGTAGTTACCTACACAGTTCTACTCCATGGGAAATTAAAACAAGCATATTTGAAAATGTGTTCCTCTTCTGAAGACATAAAAGGAAGTGATGCAACGTACAATGATTCAACTATACTGAGAGAGATGGAGGAAATGAAAGTTAGTCCAAATGTTGTTACTTACACGGTTTTGATTGATGGACACATAAAGATCTATAACTTTGAAAAGGCAATGAGATTCTTTAATGAAATTATTGACCAAGGACTAAAACCGGATGGAGTAACATACACTGCTCTAATTTGGGGCTTGTTAAACGGAAGGCTAAAGGAGTTAGCGATTATATATTATTATGAAATGTCAACCAAGGGAATGGCAAAACCCTTGCATATCCCAAGTGGTGACAAAAAGCTTTCAAAGTTTTTTCTTGACAGAAACAAGCTTGTAAAGTTAAACCGTCGAATTCTACAAGTTATAAAGGTGCACTTTCGCCCTTCAGAAAAAAACAGAAAAAAGGAAAAAGAAAGGCGCGATTTCAAAAGTAGTAAGTCAGTTTTGACCGTTAGTGCCTCGAGTTATCCCAAGTCAGTTTTGACAGTTGGTGTTAGGAGTTGCCCTAAAAAGTTTGAAATTCTATCAGTTTGA
Protein sequence

>MsG0780036339.01.T01

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