AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780037386.01

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MsG0780037386.01.T01 AT2G03380 24.550 444 256 11 2 409 102 502 2.34e-29 120
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MsG0780037386.01.T01 AT4G16835 24.315 292 200 6 97 381 101 378 1.48e-18 88.6
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MsG0780037386.01.T01 AT2G33680 31.486 397 226 4 30 416 305 665 7.02e-62 213
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MsG0780037386.01.T01 AT1G23450 25.292 257 185 4 114 369 46 296 3.43e-18 86.3
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MsG0780037386.01.T01 AT5G55840 23.920 301 209 6 77 362 192 487 1.60e-11 67.0
MsG0780037386.01.T01 AT1G13630 23.127 307 213 7 38 329 295 593 6.50e-13 71.2
MsG0780037386.01.T01 AT1G13630 23.127 307 213 7 38 329 282 580 6.75e-13 71.2
MsG0780037386.01.T01 AT1G11710 19.771 349 264 6 78 411 149 496 7.84e-13 70.9
MsG0780037386.01.T01 AT2G26790 22.143 420 267 16 17 413 319 701 9.94e-13 70.5
MsG0780037386.01.T01 AT2G26790 22.143 420 267 16 17 413 319 701 9.94e-13 70.5
MsG0780037386.01.T01 AT4G11690 20.375 427 306 11 6 409 93 508 1.03e-12 70.1
MsG0780037386.01.T01 AT1G12775 20.787 356 232 8 37 380 148 465 1.61e-12 69.7
MsG0780037386.01.T01 AT1G12775 20.000 405 265 11 5 360 191 585 7.26e-11 64.7
MsG0780037386.01.T01 AT4G26800 22.115 312 215 7 114 406 10 312 1.69e-12 69.3
MsG0780037386.01.T01 AT3G13150 27.624 181 122 3 198 370 136 315 1.83e-12 69.3
MsG0780037386.01.T01 AT3G13150 20.913 263 188 6 97 345 136 392 4.30e-11 65.1
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 21.257 334 237 8 30 347 61 384 1.96e-12 68.9
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 20.915 306 220 7 113 402 7 306 1.64e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 21.257 334 237 8 30 347 61 384 1.96e-12 68.9
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 20.915 306 220 7 113 402 7 306 1.64e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT4G16390 19.658 351 223 8 78 377 135 477 2.03e-12 69.3
MsG0780037386.01.T01 AT2G36240 23.102 303 209 9 82 367 192 487 2.12e-12 68.9
MsG0780037386.01.T01 AT4G26800 22.115 312 215 7 114 406 85 387 2.29e-12 68.9
MsG0780037386.01.T01 AT1G51965 21.839 348 220 8 9 313 275 613 2.43e-12 69.3
MsG0780037386.01.T01 AT4G26800 25.105 239 162 5 180 406 9 242 2.72e-12 68.2
MsG0780037386.01.T01 AT4G26800 24.812 266 177 8 74 324 4 261 5.16e-11 64.3
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 20.361 388 255 9 31 402 63 412 4.72e-12 68.2
MsG0780037386.01.T01 AT1G06580 21.257 334 237 8 30 347 167 490 5.06e-12 67.8
MsG0780037386.01.T01 AT1G31790 21.561 269 190 4 111 367 119 378 1.05e-11 66.6
MsG0780037386.01.T01 AT1G31790 32.479 117 78 1 37 152 286 402 1.10e-11 66.6
MsG0780037386.01.T01 AT1G53330 22.925 253 183 4 106 350 40 288 1.23e-11 66.2
MsG0780037386.01.T01 AT1G18900 21.203 349 240 10 29 360 286 616 1.30e-11 67.0
MsG0780037386.01.T01 AT1G18900 21.203 349 240 10 29 360 286 616 1.30e-11 67.0
MsG0780037386.01.T01 AT1G18900 21.203 349 240 10 29 360 286 616 1.30e-11 67.0
MsG0780037386.01.T01 AT1G18900 21.203 349 240 10 29 360 286 616 1.59e-11 67.0
MsG0780037386.01.T01 AT2G17525 23.154 298 194 7 70 351 178 456 1.66e-11 66.6
MsG0780037386.01.T01 AT2G17140 22.366 465 287 19 5 414 145 590 1.79e-11 66.6
MsG0780037386.01.T01 AT2G17140 22.366 465 287 19 5 414 145 590 1.79e-11 66.6
MsG0780037386.01.T01 AT1G53330 23.016 252 182 4 107 350 145 392 1.80e-11 66.2
MsG0780037386.01.T01 AT5G40400 23.548 310 205 9 70 362 232 526 2.50e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT5G40400 23.548 310 205 9 70 362 303 597 2.96e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT2G01740 22.129 357 246 11 31 369 182 524 3.19e-11 65.5
MsG0780037386.01.T01 AT4G20090 19.946 371 271 8 30 381 205 568 3.30e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT4G20090 19.946 371 271 8 30 381 205 568 3.30e-11 65.9
MsG0780037386.01.T01 AT1G19290 23.794 311 215 8 67 362 142 445 8.14e-11 64.7
MsG0780037386.01.T01 AT1G19290 23.794 311 215 8 67 362 142 445 8.14e-11 64.7

Find 80 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 88 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTAGTTTGTTTATGAATTT+TGG 0.072548 7:-24698581 MsG0780037386.01.T01:CDS
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CTGTCGGCTTGTTCTCATTC+TGG 0.227016 7:-24697975 MsG0780037386.01.T01:CDS
ATTGAATGTGATGTGGTTAT+TGG 0.232107 7:-24698206 MsG0780037386.01.T01:CDS
ATTTCAGTGTTTGCTCTTCA+TGG 0.233439 7:-24698080 MsG0780037386.01.T01:CDS
CATGCTCATGTGTTAAAGTT+TGG 0.274690 7:-24698638 MsG0780037386.01.T01:CDS
CCCTAAATTCCTAATACTTT+TGG 0.275836 7:+24697632 None:intergenic
AGCTCGTCATTTGATAGATT+TGG 0.282559 7:-24697724 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGTTGTAGACACGAAGTTTC+GGG 0.285035 7:+24698837 None:intergenic
CTCGCTACTGTAATCTTATC+TGG 0.292007 7:+24698305 None:intergenic
CCAAAAGTATTAGGAATTTA+GGG 0.293439 7:-24697632 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTGTTTGCTCTTCATGGATT+TGG 0.304443 7:-24698074 MsG0780037386.01.T01:CDS
ATGCATGGAAATATAGAATT+AGG 0.306633 7:-24697756 MsG0780037386.01.T01:CDS
CCTAATCATGTGACATTTGT+TGG 0.310672 7:-24698002 MsG0780037386.01.T01:CDS
ACAATGCTGCCAAAAGTATT+AGG 0.317696 7:-24697641 MsG0780037386.01.T01:CDS
ACTTGGAATTCGATTATTAC+AGG 0.343961 7:-24698410 MsG0780037386.01.T01:CDS
CCAACAAATGTCACATGATT+AGG 0.360743 7:+24698002 None:intergenic
AGATGGCGTTGAATTTGTTT+AGG 0.361719 7:-24698457 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGATGATAGCAATTGTTCTA+AGG 0.366846 7:-24698780 MsG0780037386.01.T01:CDS
AAAGGAAAAGTAAGATTATT+CGG 0.367630 7:+24698716 None:intergenic
GTTCTATAGACCATGGGAAA+TGG 0.371962 7:-24698256 MsG0780037386.01.T01:CDS
AACATCATGATTAGATCATA+TGG 0.382962 7:-24698818 MsG0780037386.01.T01:CDS
AGCATTGTACTTACCAGCTT+TGG 0.384606 7:+24697656 None:intergenic
ATGTTGTAGACACGAAGTTT+CGG 0.391037 7:+24698836 None:intergenic
AGATCATATGGATGCATAGA+AGG 0.397382 7:-24698806 MsG0780037386.01.T01:CDS
ACATAAACGTCTGGCTTCAT+TGG 0.401773 7:+24697807 None:intergenic
CGACAACCCTTTACAAGAAA+AGG 0.407759 7:+24698698 None:intergenic
TATGTATGGGGTGCATTACT+TGG 0.410830 7:-24697789 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTAGGAATTTAGGGTGTGTT+TGG 0.414089 7:-24697623 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTTGTTGGGTATTTGAGAAA+TGG 0.414884 7:-24698488 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTTTCAGCTTGTGCTCTGCT+AGG 0.416591 7:-24698278 MsG0780037386.01.T01:CDS
CACGCTGAAGCATCCTTCTC+AGG 0.426078 7:+24698113 None:intergenic
TTCTATAGACCATGGGAAAT+GGG 0.430207 7:-24698255 MsG0780037386.01.T01:CDS
GGCTTGTTCTCATTCTGGTT+TGG 0.432093 7:-24697970 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTTGGAACTCGATGGTTGTT+GGG 0.446310 7:-24698502 MsG0780037386.01.T01:CDS
CAAGCATAGTGATAAATTTG+TGG 0.450736 7:+24697894 None:intergenic
AAATATAGAATTAGGAGAAA+AGG 0.451499 7:-24697748 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGAAGCCAGACGTTTATGTA+TGG 0.458083 7:-24697803 MsG0780037386.01.T01:CDS
ACAGCACTTGTCAATATGTA+TGG 0.480862 7:-24698182 MsG0780037386.01.T01:CDS
AATTTATCACTATGCTTGCA+TGG 0.491333 7:-24697889 MsG0780037386.01.T01:CDS
GAATTTAGGGTGTGTTTGGT+AGG 0.491796 7:-24697619 None:intergenic
ATGAGAGAAATATTATAACT+TGG 0.499651 7:-24698427 MsG0780037386.01.T01:CDS
ATTACAGGGTTGGTTCAAGC+TGG 0.506161 7:-24698395 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTGTGAGAGATGTTGTTAGT+TGG 0.506907 7:-24698520 MsG0780037386.01.T01:CDS
AGTTGGAACTCGATGGTTGT+TGG 0.510299 7:-24698503 MsG0780037386.01.T01:CDS
GCACCCCATACATAAACGTC+TGG 0.515153 7:+24697798 None:intergenic
ATATAGAAAGCATGATTATG+AGG 0.518093 7:+24697699 None:intergenic
GAATTCGATTATTACAGGGT+TGG 0.521768 7:-24698405 MsG0780037386.01.T01:CDS
CATTCTGGTTTGGTAGAGCA+AGG 0.523174 7:-24697960 MsG0780037386.01.T01:CDS
TCTTCATGGATTTGGTAAGA+AGG 0.523962 7:-24698066 MsG0780037386.01.T01:CDS
GACATTTGTTGGACTACTGT+CGG 0.525725 7:-24697991 MsG0780037386.01.T01:CDS
GAAGCCAGACGTTTATGTAT+GGG 0.537839 7:-24697802 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTGCAATGTGGTGGTAGTAT+TGG 0.548992 7:-24698671 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTATGGGGTGCATTACTTGG+AGG 0.557948 7:-24697786 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTCAATATGTATGGCAAATG+TGG 0.559547 7:-24698173 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTTGGAATTCGATTATTACA+GGG 0.559673 7:-24698409 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTTGGAGGTTGTCAGATGCA+TGG 0.561848 7:-24697771 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTTTGGTAGAGCAAGGTCGC+TGG 0.563766 7:-24697953 MsG0780037386.01.T01:CDS
GAAGGATGCTTCAGCGTGGA+CGG 0.565846 7:-24698108 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTTTAACAATATGCCTGAGA+AGG 0.567835 7:-24698126 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTCTTGTAAAGGGTTGTCGT+AGG 0.570396 7:-24698694 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGCTAGGTTCTATAGACCAT+GGG 0.570609 7:-24698262 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGTGATATGTATGCCAAAGC+TGG 0.575898 7:-24697669 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTGGGTTGTCGAAGAATGCA+AGG 0.581559 7:-24698562 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTGCTAGGTTCTATAGACCA+TGG 0.583431 7:-24698263 MsG0780037386.01.T01:CDS
GGTTCAAGCTGGCCATGCGA+AGG 0.604420 7:-24698384 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGGCCATGCGAAGGAGTCGT+TGG 0.605688 7:-24698375 MsG0780037386.01.T01:CDS
TGTTGTTAGTTGGAACTCGA+TGG 0.613113 7:-24698510 MsG0780037386.01.T01:CDS
GAGAAATGGTGAAGTTGAGA+TGG 0.614059 7:-24698474 MsG0780037386.01.T01:CDS
TATAAGCAAATGCTTAACAA+TGG 0.614652 7:-24698746 MsG0780037386.01.T01:CDS
AAGCCAGACGTTTATGTATG+GGG 0.627209 7:-24697801 MsG0780037386.01.T01:CDS
ATGCATGCACCCATTTCCCA+TGG 0.629481 7:+24698246 None:intergenic
GTTGTCGAAGAATGCAAGGA+AGG 0.634765 7:-24698558 MsG0780037386.01.T01:CDS
TTGATATTCTTAGTCGAGCG+AGG 0.638717 7:-24697866 MsG0780037386.01.T01:CDS
GTTCCAACGACTCCTTCGCA+TGG 0.648414 7:+24698372 None:intergenic
TGTCGTAGGTTGCAATGTGG+TGG 0.659302 7:-24698680 MsG0780037386.01.T01:CDS
TCATATGGATGCATAGAAGG+AGG 0.662466 7:-24698803 MsG0780037386.01.T01:CDS
AAACAACATTGAATGTGATG+TGG 0.665148 7:-24698213 MsG0780037386.01.T01:CDS
CTGAGAAGGATGCTTCAGCG+TGG 0.738293 7:-24698112 MsG0780037386.01.T01:CDS
GGTTGTCGTAGGTTGCAATG+TGG 0.782853 7:-24698683 MsG0780037386.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTAGTTTGTTTATGAATTT+TGG - Chr7:24697887-24697906 MsG0780037386.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTAGTTTGTTTATGAATTTT+GGG - Chr7:24697888-24697907 MsG0780037386.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGGAAAAGTAAGATTATT+CGG + Chr7:24697755-24697774 None:intergenic 20.0%
!! AAATATAGAATTAGGAGAAA+AGG - Chr7:24698720-24698739 MsG0780037386.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGAGAGAAATATTATAACT+TGG - Chr7:24698041-24698060 MsG0780037386.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGAATGATGTTTTTGTT+GGG - Chr7:24697855-24697874 MsG0780037386.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTGAATGATGTTTTTGT+TGG - Chr7:24697854-24697873 MsG0780037386.01.T01:CDS 20.0%
! AACATCATGATTAGATCATA+TGG - Chr7:24697650-24697669 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
! ATGCATGGAAATATAGAATT+AGG - Chr7:24698712-24698731 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
! TATAAGCAAATGCTTAACAA+TGG - Chr7:24697722-24697741 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTTTCCTTTTCTTGTAAA+GGG - Chr7:24697764-24697783 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATAGAAAGCATGATTATG+AGG + Chr7:24698772-24698791 None:intergenic 25.0%
!! TACTTTTCCTTTTCTTGTAA+AGG - Chr7:24697763-24697782 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCAAAAGTATTAGGAATTTA+GGG - Chr7:24698836-24698855 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGATTGCTTTTTAGAGA+TGG - Chr7:24698426-24698445 MsG0780037386.01.T01:CDS 25.0%
AAACAACATTGAATGTGATG+TGG - Chr7:24698255-24698274 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
AATTTATCACTATGCTTGCA+TGG - Chr7:24698579-24698598 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGGAATTCGATTATTAC+AGG - Chr7:24698058-24698077 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
ATTGAATGTGATGTGGTTAT+TGG - Chr7:24698262-24698281 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
CAAGCATAGTGATAAATTTG+TGG + Chr7:24698577-24698596 None:intergenic 30.0%
CTTGGAATTCGATTATTACA+GGG - Chr7:24698059-24698078 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
TGATGATAGCAATTGTTCTA+AGG - Chr7:24697688-24697707 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
! CCCTAAATTCCTAATACTTT+TGG + Chr7:24698839-24698858 None:intergenic 30.0%
!! GCCAAAAGTATTAGGAATTT+AGG - Chr7:24698835-24698854 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTTAGAGATGGAAAAAGC+TGG - Chr7:24698436-24698455 MsG0780037386.01.T01:CDS 30.0%
ACAGCACTTGTCAATATGTA+TGG - Chr7:24698286-24698305 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
AGATCATATGGATGCATAGA+AGG - Chr7:24697662-24697681 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
AGCTCGTCATTTGATAGATT+TGG - Chr7:24698744-24698763 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTGTAGACACGAAGTTT+CGG + Chr7:24697635-24697654 None:intergenic 35.0%
ATTTCAGTGTTTGCTCTTCA+TGG - Chr7:24698388-24698407 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
CACTCAAAAACTGCATTTCA+TGG + Chr7:24698126-24698145 None:intergenic 35.0%
CATGCTCATGTGTTAAAGTT+TGG - Chr7:24697830-24697849 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
CCAACAAATGTCACATGATT+AGG + Chr7:24698469-24698488 None:intergenic 35.0%
CCTAATCATGTGACATTTGT+TGG - Chr7:24698466-24698485 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
CTTTAACAATATGCCTGAGA+AGG - Chr7:24698342-24698361 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
GAATTCGATTATTACAGGGT+TGG - Chr7:24698063-24698082 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
GTCAATATGTATGGCAAATG+TGG - Chr7:24698295-24698314 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTTGGGTATTTGAGAAA+TGG - Chr7:24697980-24697999 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
TTCTATAGACCATGGGAAAT+GGG - Chr7:24698213-24698232 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGAGAGATGTTGTTAGT+TGG - Chr7:24697948-24697967 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
! AGATGGCGTTGAATTTGTTT+AGG - Chr7:24698011-24698030 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTCATGGATTTGGTAAGA+AGG - Chr7:24698402-24698421 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGGAATTTAGGGTGTGTT+TGG - Chr7:24698845-24698864 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
!! ACAATGCTGCCAAAAGTATT+AGG - Chr7:24698827-24698846 MsG0780037386.01.T01:CDS 35.0%
AAGCCAGACGTTTATGTATG+GGG - Chr7:24698667-24698686 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
AGCATTGTACTTACCAGCTT+TGG + Chr7:24698815-24698834 None:intergenic 40.0%
CGACAACCCTTTACAAGAAA+AGG + Chr7:24697773-24697792 None:intergenic 40.0%
CTCGCTACTGTAATCTTATC+TGG + Chr7:24698166-24698185 None:intergenic 40.0%
GAAGCCAGACGTTTATGTAT+GGG - Chr7:24698666-24698685 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAATGGTGAAGTTGAGA+TGG - Chr7:24697994-24698013 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
GTGTTTGCTCTTCATGGATT+TGG - Chr7:24698394-24698413 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
GTTCTATAGACCATGGGAAA+TGG - Chr7:24698212-24698231 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TATGTATGGGGTGCATTACT+TGG - Chr7:24698679-24698698 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TCATATGGATGCATAGAAGG+AGG - Chr7:24697665-24697684 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGCCAGACGTTTATGTA+TGG - Chr7:24698665-24698684 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TGCTAGGTTCTATAGACCAT+GGG - Chr7:24698206-24698225 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TGTGATATGTATGCCAAAGC+TGG - Chr7:24698799-24698818 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGTAGACACGAAGTTTC+GGG + Chr7:24697634-24697653 None:intergenic 40.0%
TGTTGTTAGTTGGAACTCGA+TGG - Chr7:24697958-24697977 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TTCTTGTAAAGGGTTGTCGT+AGG - Chr7:24697774-24697793 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TTGATATTCTTAGTCGAGCG+AGG - Chr7:24698602-24698621 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAATGTGGTGGTAGTAT+TGG - Chr7:24697797-24697816 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
! ACATAAACGTCTGGCTTCAT+TGG + Chr7:24698664-24698683 None:intergenic 40.0%
! GACATTTGTTGGACTACTGT+CGG - Chr7:24698477-24698496 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTTGAGTGCTGATGATG+TGG - Chr7:24698135-24698154 MsG0780037386.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGGAACTCGATGGTTGT+TGG - Chr7:24697965-24697984 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
CTGCTAGGTTCTATAGACCA+TGG - Chr7:24698205-24698224 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGAACTCGATGGTTGTT+GGG - Chr7:24697966-24697985 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTCGAAGAATGCAAGGA+AGG - Chr7:24697910-24697929 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTTGTTCTCATTCTGGTT+TGG - Chr7:24698498-24698517 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
! TTGGGTTGTCGAAGAATGCA+AGG - Chr7:24697906-24697925 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTACAGGGTTGGTTCAAGC+TGG - Chr7:24698073-24698092 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
!! CATTCTGGTTTGGTAGAGCA+AGG - Chr7:24698508-24698527 MsG0780037386.01.T01:CDS 45.0%
ATGCATGCACCCATTTCCCA+TGG + Chr7:24698225-24698244 None:intergenic 50.0%
CTTGGAGGTTGTCAGATGCA+TGG - Chr7:24698697-24698716 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
CTTTCAGCTTGTGCTCTGCT+AGG - Chr7:24698190-24698209 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
GCACCCCATACATAAACGTC+TGG + Chr7:24698673-24698692 None:intergenic 50.0%
GGTTGTCGTAGGTTGCAATG+TGG - Chr7:24697785-24697804 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
GTATGGGGTGCATTACTTGG+AGG - Chr7:24698682-24698701 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
TGTCGTAGGTTGCAATGTGG+TGG - Chr7:24697788-24697807 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
!! CTGTCGGCTTGTTCTCATTC+TGG - Chr7:24698493-24698512 MsG0780037386.01.T01:CDS 50.0%
CTGAGAAGGATGCTTCAGCG+TGG - Chr7:24698356-24698375 MsG0780037386.01.T01:CDS 55.0%
GAAGGATGCTTCAGCGTGGA+CGG - Chr7:24698360-24698379 MsG0780037386.01.T01:CDS 55.0%
GTTCCAACGACTCCTTCGCA+TGG + Chr7:24698099-24698118 None:intergenic 55.0%
GTTTGGTAGAGCAAGGTCGC+TGG - Chr7:24698515-24698534 MsG0780037386.01.T01:CDS 55.0%
! CACGCTGAAGCATCCTTCTC+AGG + Chr7:24698358-24698377 None:intergenic 55.0%
GGTTCAAGCTGGCCATGCGA+AGG - Chr7:24698084-24698103 MsG0780037386.01.T01:CDS 60.0%
TGGCCATGCGAAGGAGTCGT+TGG - Chr7:24698093-24698112 MsG0780037386.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 24697620 24698870 24697620 ID=MsG0780037386.01;Name=MsG0780037386.01
Chr7 mRNA 24697620 24698870 24697620 ID=MsG0780037386.01.T01;Parent=MsG0780037386.01;Name=MsG0780037386.01.T01;_AED=0.33;_eAED=0.33;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|416
Chr7 exon 24697620 24698870 24697620 ID=MsG0780037386.01.T01:exon:5746;Parent=MsG0780037386.01.T01
Chr7 CDS 24697620 24698870 24697620 ID=MsG0780037386.01.T01:cds;Parent=MsG0780037386.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780037386.01.T01

ATGATCAAATACCCGAAACTTCGTGTCTACAACATCATGATTAGATCATATGGATGCATAGAAGGAGGTGATGATAGCAATTGTTCTAAGGCTTTGATGTTGTATAAGCAAATGCTTAACAATGGCATTGTGCCGAATAATCTTACTTTTCCTTTTCTTGTAAAGGGTTGTCGTAGGTTGCAATGTGGTGGTAGTATTGGTGAAATTATTCATGCTCATGTGTTAAAGTTTGGATTTTTGAATGATGTTTTTGTTGGGAATTCTTTGATTAGTTTGTTTATGAATTTTGGGTTGTCGAAGAATGCAAGGAAGGTGTTTGATGAAATGTTTGTGAGAGATGTTGTTAGTTGGAACTCGATGGTTGTTGGGTATTTGAGAAATGGTGAAGTTGAGATGGCGTTGAATTTGTTTAGGAAGATGAATGAGAGAAATATTATAACTTGGAATTCGATTATTACAGGGTTGGTTCAAGCTGGCCATGCGAAGGAGTCGTTGGAACTTTGCCATGAAATGCAGTTTTTGAGTGCTGATGATGTGGTTAAACCAGATAAGATTACAGTAGCGAGTGTTCTTTCAGCTTGTGCTCTGCTAGGTTCTATAGACCATGGGAAATGGGTGCATGCATATTTAAGAAAAAACAACATTGAATGTGATGTGGTTATTGGAACAGCACTTGTCAATATGTATGGCAAATGTGGAGATGTGCAGCAAGCAATTGAGATCTTTAACAATATGCCTGAGAAGGATGCTTCAGCGTGGACGGCAATGATTTCAGTGTTTGCTCTTCATGGATTTGGTAAGAAGGCTTTTGATTGCTTTTTAGAGATGGAAAAAGCTGGAGTAAAGCCTAATCATGTGACATTTGTTGGACTACTGTCGGCTTGTTCTCATTCTGGTTTGGTAGAGCAAGGTCGCTGGTGCTTTGATGTAATGAAGCATGTTTACTCGATTGAACCACAAATTTATCACTATGCTTGCATGGTTGATATTCTTAGTCGAGCGAGGCTCTTCGATGAAGCACTGTTTCTCATAAGAAGCATGCCAATGAAGCCAGACGTTTATGTATGGGGTGCATTACTTGGAGGTTGTCAGATGCATGGAAATATAGAATTAGGAGAAAAGGTAGCTCGTCATTTGATAGATTTGGAGCCTCATAATCATGCTTTCTATATGAATTTATGTGATATGTATGCCAAAGCTGGTAAGTACAATGCTGCCAAAAGTATTAGGAATTTAGGGTGTGTTTGGTAG
Protein sequence

>MsG0780037386.01.T01

MIKYPKLRVYNIMIRSYGCIEGGDDSNCSKALMLYKQMLNNGIVPNNLTFPFLVKGCRRLQCGGSIGEIIHAHVLKFGFLNDVFVGNSLISLFMNFGLSKNARKVFDEMFVRDVVSWNSMVVGYLRNGEVEMALNLFRKMNERNIITWNSIITGLVQAGHAKESLELCHEMQFLSADDVVKPDKITVASVLSACALLGSIDHGKWVHAYLRKNNIECDVVIGTALVNMYGKCGDVQQAIEIFNNMPEKDASAWTAMISVFALHGFGKKAFDCFLEMEKAGVKPNHVTFVGLLSACSHSGLVEQGRWCFDVMKHVYSIEPQIYHYACMVDILSRARLFDEALFLIRSMPMKPDVYVWGALLGGCQMHGNIELGEKVARHLIDLEPHNHAFYMNLCDMYAKAGKYNAAKSIRNLGCVW*