AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039302.01

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MsG0780039302.01.T01 AT1G53330 24.359 234 158 3 137 369 154 369 1.81e-15 79.7
MsG0780039302.01.T01 AT1G53330 21.549 297 213 4 64 342 169 463 3.70e-12 69.3
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MsG0780039302.01.T01 AT4G26680 22.761 268 188 3 53 302 209 475 7.10e-15 77.8
MsG0780039302.01.T01 AT4G26680 23.642 313 202 9 84 369 117 419 2.48e-14 76.3
MsG0780039302.01.T01 AT3G14580 20.991 343 219 7 79 400 92 403 8.20e-15 77.0
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MsG0780039302.01.T01 AT2G19280 23.529 272 184 6 117 369 253 519 4.03e-12 69.7
MsG0780039302.01.T01 AT2G19280 23.239 284 195 5 66 347 392 654 2.34e-14 76.6
MsG0780039302.01.T01 AT2G19280 23.529 272 184 6 117 369 253 519 4.03e-12 69.7
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MsG0780039302.01.T01 AT5G49040 54.545 66 29 1 1 65 119 184 2.43e-14 72.4
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MsG0780039302.01.T01 AT2G17670 23.684 266 179 6 61 321 99 345 2.80e-14 74.7
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MsG0780039302.01.T01 AT5G10690 28.037 214 138 5 136 334 78 290 2.91e-14 76.3
MsG0780039302.01.T01 AT1G11710 26.875 160 115 1 173 330 151 310 5.96e-14 75.5
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MsG0780039302.01.T01 AT4G01400 25.000 252 163 7 122 369 107 336 3.28e-12 69.3
MsG0780039302.01.T01 AT3G18110 23.381 278 192 6 66 342 281 538 9.66e-14 75.1
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MsG0780039302.01.T01 AT2G21100 56.364 55 21 1 9 63 128 179 1.02e-13 70.5
MsG0780039302.01.T01 AT3G09650 23.022 278 192 8 73 346 405 664 1.06e-13 74.7
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MsG0780039302.01.T01 AT1G10910 22.628 274 193 3 63 318 182 454 1.86e-13 73.6
MsG0780039302.01.T01 AT1G10910 22.293 314 208 5 63 358 182 477 2.03e-13 73.6
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MsG0780039302.01.T01 AT1G74850 22.093 344 232 7 17 335 149 481 1.63e-11 67.8
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MsG0780039302.01.T01 AT1G11710 26.224 286 179 8 63 325 348 624 4.60e-11 66.2
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MsG0780039302.01.T01 AT1G55210 62.500 48 18 0 17 64 132 179 3.13e-13 68.9
MsG0780039302.01.T01 AT3G58090 50.769 65 31 1 1 64 200 264 3.19e-13 70.5
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MsG0780039302.01.T01 AT1G05600 24.923 325 209 6 66 369 171 481 1.29e-12 70.9
MsG0780039302.01.T01 AT1G65870 52.941 68 25 2 1 64 118 182 1.40e-12 67.0
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MsG0780039302.01.T01 AT1G74750 24.535 269 170 6 63 324 410 652 2.49e-12 70.5
MsG0780039302.01.T01 AT1G74750 24.535 269 170 6 63 324 410 652 2.49e-12 70.5
MsG0780039302.01.T01 AT1G18900 22.015 268 178 4 63 324 415 657 2.72e-12 70.1
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MsG0780039302.01.T01 AT1G18900 22.015 268 178 4 63 324 415 657 2.72e-12 70.1
MsG0780039302.01.T01 AT1G77360 25.161 310 194 6 63 372 219 490 2.86e-12 69.7
MsG0780039302.01.T01 AT3G17370 27.650 217 125 6 160 375 4 189 3.70e-12 66.2
MsG0780039302.01.T01 AT5G15010 25.714 210 150 4 136 344 303 507 3.87e-12 69.3
MsG0780039302.01.T01 AT2G38420 24.031 258 174 6 135 371 108 364 5.18e-12 68.6
MsG0780039302.01.T01 AT3G04130 22.059 340 226 4 64 383 172 492 7.11e-12 68.6
MsG0780039302.01.T01 AT3G04130 22.059 340 226 4 64 383 172 492 7.11e-12 68.6
MsG0780039302.01.T01 AT1G63630 31.538 130 71 2 240 369 10 121 1.13e-11 63.5
MsG0780039302.01.T01 AT1G61870 21.377 276 199 3 62 337 131 388 1.18e-11 67.4
MsG0780039302.01.T01 AT2G41720 20.323 310 211 4 66 375 374 647 4.18e-11 66.2
MsG0780039302.01.T01 AT2G41720 20.333 300 203 4 66 365 374 637 4.31e-11 66.2
MsG0780039302.01.T01 AT2G37230 22.115 208 161 1 134 341 184 390 4.79e-11 66.2
MsG0780039302.01.T01 AT2G37230 23.585 318 198 9 57 336 333 643 5.46e-11 65.9
MsG0780039302.01.T01 AT2G41720 20.323 310 211 4 66 375 242 515 4.98e-11 65.9
MsG0780039302.01.T01 AT3G59040 22.424 330 215 8 65 374 192 500 8.52e-11 65.1

Find 125 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 450 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACCTTCACTACATTGATTTC+TGG 0.195251 7:+61669534 MsG0780039302.01.T01:CDS
TACATTGATTTCTGGTCTAT+TGG 0.218960 7:+61669542 MsG0780039302.01.T01:CDS
TATCTCTCTTGTTCTATGTT+TGG 0.220058 7:+61672740 MsG0780039302.01.T01:CDS
TATTCATCTCTCTAACAATT+TGG 0.221435 7:-61670013 None:intergenic
ATCTCTCTTGTTCTATGTTT+GGG 0.227282 7:+61672741 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACCCTCAACACGGTTATTAA+TGG 0.233120 7:+61669426 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGGAATTAGGGATGCAATTA+AGG 0.234045 7:+61668715 MsG0780039302.01.T01:intron
AGTATTGAATGACATGTTAT+TGG 0.234195 7:+61669485 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTGTCGGAGGAGGTTGTTTA+TGG 0.254257 7:+61668991 MsG0780039302.01.T01:CDS
AATGGTAGCACCATCACTTT+TGG 0.272902 7:+61666352 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTAGAAGAAGGAGCTGAATT+TGG 0.273467 7:+61669174 MsG0780039302.01.T01:CDS
CTTCACAGTCAGAGAGTCTA+TGG 0.293273 7:-61670409 None:intergenic
AGGGGAAGGGATTGGGAAAG+TGG 0.308833 7:+61668812 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGTTTGGCGTTGAAAGTTCT+TGG 0.311054 7:+61673128 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTTAGGGAAATGCCTATAAT+TGG 0.317348 7:+61666398 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTCCTTCCACCGATTCAATA+AGG 0.319536 7:-61673243 None:intergenic
TTCTAATGATTCATAATTGT+TGG 0.341786 7:-61672822 None:intergenic
TTATAGCAATTAAATGAGTT+TGG 0.342841 7:+61673112 MsG0780039302.01.T01:intron
AGACCACTACCACCAATTAT+AGG 0.344419 7:-61666410 None:intergenic
AATAGAGTGATGCCTGAAAA+TGG 0.352290 7:+61669600 MsG0780039302.01.T01:CDS
ATCCTCCATGTCACACAGTC+AGG 0.367384 7:-61670050 None:intergenic
TCTTGTTCTATGTTTGGGTT+TGG 0.368011 7:+61672746 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCCCTAACCTTATCATAAAC+AGG 0.368028 7:-61666383 None:intergenic
ACATAGAACAAGAGAGATAT+TGG 0.371239 7:-61672736 None:intergenic
GTTTCTAAGGGGAAGGGATT+GGG 0.374598 7:+61668805 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTATTGAATGACATGTTATT+GGG 0.382868 7:+61669486 MsG0780039302.01.T01:CDS
GGTGAAAGTGGAAGATGAAT+TGG 0.397941 7:+61668865 MsG0780039302.01.T01:CDS
ATCCTGTTTATGATAAGGTT+AGG 0.398598 7:+61666381 MsG0780039302.01.T01:CDS
TATGAATTTGCTATCATTGA+AGG 0.403696 7:+61666322 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACACTATAAGTCATCGAATT+CGG 0.404176 7:-61668770 None:intergenic
ATGCTCAACTTAGAACTCAT+TGG 0.409836 7:+61666453 MsG0780039302.01.T01:CDS
GGTTTCTAAGGGGAAGGGAT+TGG 0.411961 7:+61668804 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCTTAAACTCATGTTGTGTA+AGG 0.414788 7:+61669278 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGCACATTTAAAAGCTCTGT+TGG 0.420661 7:-61669363 None:intergenic
ATTGATTCATTCTGTAAAGT+TGG 0.420934 7:+61669021 MsG0780039302.01.T01:CDS
GAGGAATCCTGTTTATGATA+AGG 0.426161 7:+61666376 MsG0780039302.01.T01:CDS
ATCGGTGGAAGGAACATTGC+AGG 0.435013 7:+61673252 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTATTTGATCCTTATTGAAT+CGG 0.442392 7:+61673234 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTTGTGGGAGAGGGTGAAAG+TGG 0.444183 7:+61668853 MsG0780039302.01.T01:CDS
CGAGCATACTTATAAGGTAT+TGG 0.450111 7:+61669209 MsG0780039302.01.T01:CDS
AACTATAGCATCATATGTCT+TGG 0.451960 7:-61666483 None:intergenic
TGAAATGCTTGAGAGTGGTT+TGG 0.458370 7:+61668745 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGGTAGTAGTTTGTCGGAGG+AGG 0.464495 7:+61668981 MsG0780039302.01.T01:CDS
GCTGTGCGAGCATACTTATA+AGG 0.466410 7:+61669203 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGTCGGAGGAGGTTGTTTAT+GGG 0.469334 7:+61668992 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCCTGTTTATGATAAGGTTA+GGG 0.471393 7:+61666382 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACCATTAATAACCGTGTTGA+GGG 0.472820 7:-61669427 None:intergenic
TCACCGTCATTTGACAAGGT+TGG 0.473410 7:-61670122 None:intergenic
GGTTATCAGTTGTTAGAAGA+AGG 0.479387 7:+61669162 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTTAGAGAGATGAATAAGAA+TGG 0.488677 7:+61670020 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTTGATTTGCGGGTTTCTAA+GGG 0.490394 7:+61668793 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACCGTGTGGTAGTAGTTTGT+CGG 0.490756 7:+61668975 MsG0780039302.01.T01:CDS
GAGCATATCCTCTAGCAAAT+CGG 0.492927 7:-61666436 None:intergenic
ATGCCTATAATTGGTGGTAG+TGG 0.495021 7:+61666407 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGTAAAGTTGGAAGGTATCA+TGG 0.496911 7:+61669033 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTATTTAATCAGGTCAAGAC+AGG 0.500978 7:+61671784 MsG0780039302.01.T01:intron
GGGGAAGGGATTGGGAAAGT+GGG 0.501778 7:+61668813 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTAGTGAAGGTTACAACATC+AGG 0.502357 7:-61669522 None:intergenic
GGTCAAGACAGGACCGGCCA+AGG 0.504904 7:+61671795 MsG0780039302.01.T01:intron
TAATTATACGACACGTCACT+TGG 0.507233 7:-61669099 None:intergenic
CATCTTGTAAGTGTCTGATA+AGG 0.516915 7:+61672705 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGAGTTGATGTGTAAGTTGT+GGG 0.517656 7:+61668838 MsG0780039302.01.T01:CDS
GGAAGCTCTATGTCGTGTAT+TGG 0.528950 7:+61669233 MsG0780039302.01.T01:CDS
TATTGGATGTGGACAAGGCA+AGG 0.532201 7:+61669250 MsG0780039302.01.T01:CDS
GACAAGGTTGGATCTTCAGA+TGG 0.534145 7:-61670110 None:intergenic
ATTCATTCTGTAAAGTTGGA+AGG 0.534672 7:+61669025 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTGAAAGTGGAAGATGAATT+GGG 0.539689 7:+61668866 MsG0780039302.01.T01:CDS
AACCATTAATAACCGTGTTG+AGG 0.540988 7:-61669428 None:intergenic
ATCCTTATTGAATCGGTGGA+AGG 0.541413 7:+61673241 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTTATTTGATGAGGAAGAGA+GGG 0.546224 7:+61669070 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTTATGATCTTACCCTTGGC+CGG 0.546592 7:-61671808 None:intergenic
TCGTATAATTATATCATACA+TGG 0.547483 7:+61669111 MsG0780039302.01.T01:CDS
CTAGGATTGTTTATTTGATG+AGG 0.548630 7:+61669061 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGATGTGTAAGTTGTGGGAG+AGG 0.548636 7:+61668843 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGGCCCCTGACTGTGTGACA+TGG 0.549215 7:+61670045 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTTTATTTGATGAGGAAGAG+AGG 0.559347 7:+61669069 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCCTCCATGTCACACAGTCA+GGG 0.559531 7:-61670049 None:intergenic
AGGAAGGTGTTGACGAGACT+AGG 0.561778 7:+61669298 MsG0780039302.01.T01:CDS
AAACTCATGTTGTGTAAGGA+AGG 0.563409 7:+61669282 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTTGCGGGTTTCTAAGGGGA+AGG 0.570655 7:+61668798 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACCAGAAATCAATGTAGTGA+AGG 0.572785 7:-61669535 None:intergenic
TTTGATCCTTATTGAATCGG+TGG 0.574474 7:+61673237 MsG0780039302.01.T01:CDS
CTTATCAGACACTTACAAGA+TGG 0.575030 7:-61672704 None:intergenic
AGGGAAATGCCTATAATTGG+TGG 0.578046 7:+61666401 MsG0780039302.01.T01:CDS
GAAGGTATCATGGTGCGGCT+AGG 0.581086 7:+61669043 MsG0780039302.01.T01:CDS
GCATACTTATAAGGTATTGG+TGG 0.581495 7:+61669212 MsG0780039302.01.T01:CDS
GAGAGTTGATGTGTAAGTTG+TGG 0.584321 7:+61668837 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTTGATGAAATGCTTGAGAG+TGG 0.586885 7:+61668740 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTGCGGGTTTCTAAGGGGAA+GGG 0.587380 7:+61668799 MsG0780039302.01.T01:CDS
TGTGAGGGATGTGACACTGC+TGG 0.592423 7:+61670314 MsG0780039302.01.T01:CDS
GGATTCCTCCCCAAAAGTGA+TGG 0.592612 7:-61666362 None:intergenic
TTTATCACCGTCATTTGACA+AGG 0.597559 7:-61670126 None:intergenic
GTCAAGACAGGACCGGCCAA+GGG 0.600554 7:+61671796 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTCTTAAAAGTGCCCAATGG+TGG 0.603038 7:-61673208 None:intergenic
TAGCTTATCAGACACTTACA+AGG 0.605996 7:+61672775 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCGTGTATTGGATGTGGACA+AGG 0.606762 7:+61669245 MsG0780039302.01.T01:CDS
TATCATACATGGACTAAGCA+AGG 0.612412 7:+61669122 MsG0780039302.01.T01:CDS
TAATCAGGTCAAGACAGGAC+CGG 0.617859 7:+61671789 MsG0780039302.01.T01:intron
ATTGGATGTGGACAAGGCAA+GGG 0.619789 7:+61669251 MsG0780039302.01.T01:CDS
GATCCAACCTTGTCAAATGA+CGG 0.619837 7:+61670119 MsG0780039302.01.T01:CDS
ATCATTGAAGGAAAGTACAA+TGG 0.628749 7:+61666334 MsG0780039302.01.T01:CDS
TAATCACATCGGTCTGACAA+TGG 0.631495 7:-61669404 None:intergenic
AGATTATGAAGCTGCTGTGA+GGG 0.633059 7:+61670299 MsG0780039302.01.T01:intron
AAGGACGGTGATTGTATGCG+AGG 0.636108 7:+61669141 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTCACAGTCAGAGAGTCTAT+GGG 0.639471 7:-61670408 None:intergenic
TCTATGTCGTGTATTGGATG+TGG 0.640816 7:+61669239 MsG0780039302.01.T01:CDS
CCCCTGACTGTGTGACATGG+AGG 0.642224 7:+61670048 MsG0780039302.01.T01:CDS
CCTCCATGTCACACAGTCAG+GGG 0.646154 7:-61670048 None:intergenic
GATGTGTAAGTTGTGGGAGA+GGG 0.647858 7:+61668844 MsG0780039302.01.T01:CDS
ACAAGTTACAAAGCAAAGTG+AGG 0.651707 7:+61670078 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGAGATGAATAAGAATGGAG+TGG 0.660075 7:+61670025 MsG0780039302.01.T01:CDS
TTGATTTGCGGGTTTCTAAG+GGG 0.661539 7:+61668794 MsG0780039302.01.T01:CDS
GTGTGGTAGTAGTTTGTCGG+AGG 0.664920 7:+61668978 MsG0780039302.01.T01:CDS
CGTGTTGAGGGTAATCACAT+CGG 0.671068 7:-61669415 None:intergenic
TAGATTATGAAGCTGCTGTG+AGG 0.673401 7:+61670298 MsG0780039302.01.T01:intron
ATACATGGACTAAGCAAGGA+CGG 0.675632 7:+61669126 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGTTGGAAGGTATCATGGTG+CGG 0.675657 7:+61669038 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCATTCTTAAAAGTGCCCAA+TGG 0.676311 7:-61673211 None:intergenic
CGATGTGATTACCCTCAACA+CGG 0.683235 7:+61669416 MsG0780039302.01.T01:CDS
AGGGATGTGACACTGCTGGA+AGG 0.688075 7:+61670318 MsG0780039302.01.T01:CDS
GCTCATTCTGTATAAAACCA+CGG 0.699184 7:-61670353 None:intergenic
CTTATCAGACACTTACAAGG+TGG 0.712915 7:+61672778 MsG0780039302.01.T01:CDS
TCCGACAAACTACTACCACA+CGG 0.716433 7:-61668976 None:intergenic
ATTGCGGAAGAGTTACCGTG+TGG 0.767161 7:+61668961 MsG0780039302.01.T01:CDS
GAAGGAAACAACATGCACCG+TGG 0.776913 7:+61670336 MsG0780039302.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAAATTATGAATGAAAT+TGG - Chr7:61670968-61670987 None:intergenic 10.0%
!! AATATTATAGCTATATATAT+TGG - Chr7:61669951-61669970 None:intergenic 10.0%
!! AGAAATATTCAAAATTTAAT+CGG + Chr7:61672883-61672902 MsG0780039302.01.T01:intron 10.0%
!!! AGTAATATATAAATTAGTTT+TGG - Chr7:61666695-61666714 None:intergenic 10.0%
!! ACAATATACTTATGTTATAT+GGG + Chr7:61667766-61667785 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!! ACTAAAGTAATAACAATTAA+GGG + Chr7:61667593-61667612 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!! ATTAAAATGTTTCGTTAATA+TGG + Chr7:61667731-61667750 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!! TACATATTCATATTAACATT+GGG + Chr7:61667137-61667156 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!! TAGTTATTTAACTATTAGAT+GGG - Chr7:61672053-61672072 None:intergenic 15.0%
!! TATAAGGATTAATATAACAT+GGG - Chr7:61667968-61667987 None:intergenic 15.0%
!! TATATAATAGGAAAACTTAT+CGG - Chr7:61671737-61671756 None:intergenic 15.0%
!! TTAGTTATTTAACTATTAGA+TGG - Chr7:61672054-61672073 None:intergenic 15.0%
!! TTATAAGGATTAATATAACA+TGG - Chr7:61667969-61667988 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTATTGATTATGTACTA+TGG + Chr7:61666578-61666597 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTCAATTAAGTTTTTGAAT+CGG + Chr7:61671266-61671285 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!!! GATATTTTAACAACTATAAA+AGG + Chr7:61666849-61666868 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!!! TTAATGGGTTATATTTATAT+GGG + Chr7:61671434-61671453 MsG0780039302.01.T01:intron 15.0%
!! AATGAAAAATAAATGGAGTT+GGG + Chr7:61670806-61670825 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! ACTTGAATGATACAATTAAT+TGG - Chr7:61672546-61672565 None:intergenic 20.0%
!! CACAATATACTTATGTTATA+TGG + Chr7:61667765-61667784 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! CACTAAAGTAATAACAATTA+AGG + Chr7:61667592-61667611 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! CATATAAATATAACCCATTA+AGG - Chr7:61671435-61671454 None:intergenic 20.0%
!! CGTGTGTATTAAAAAAAAAT+AGG - Chr7:61671848-61671867 None:intergenic 20.0%
!! GAAAATACTAACATATCATA+TGG + Chr7:61667247-61667266 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! GTACATATTCATATTAACAT+TGG + Chr7:61667136-61667155 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAAAATGAAAAGAAAGAG+TGG + Chr7:61666946-61666965 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! TCGATTATTTGTATTTAATC+AGG + Chr7:61671774-61671793 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! TCGTATAATTATATCATACA+TGG + Chr7:61669111-61669130 MsG0780039302.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAGAATCATATATGTTCTT+AGG - Chr7:61672001-61672020 None:intergenic 20.0%
!! TTATAGCAATTAAATGAGTT+TGG + Chr7:61673112-61673131 MsG0780039302.01.T01:intron 20.0%
!! TTATTTGATCCTTATTGAAT+CGG + Chr7:61673234-61673253 MsG0780039302.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTTGATCCTTATTGAAT+CGG - Chr7:61673253-61673234 None:intergenic 20.0%
!! TTCTAATGATTCATAATTGT+TGG - Chr7:61672825-61672844 None:intergenic 20.0%
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AAAAACCCGAATGCATCATT+CGG - Chr7:61669686-61669705 None:intergenic 35.0%
AAACTCATGTTGTGTAAGGA+AGG + Chr7:61669282-61669301 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
AAAGAGAGAGAAACGTTGAT+GGG - Chr7:61668412-61668431 None:intergenic 35.0%
AACATAGAAGAGAGAGACAA+TGG + Chr7:61671469-61671488 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
AACCATTAATAACCGTGTTG+AGG - Chr7:61669431-61669450 None:intergenic 35.0%
AATAGAGTGATGCCTGAAAA+TGG + Chr7:61669600-61669619 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
ACAACAAACGTGACAATTGT+TGG + Chr7:61672860-61672879 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
ACAACAAACGTGACAATTGT+TGG - Chr7:61672879-61672860 None:intergenic 35.0%
ACAAGAGACCATGTTTGAAA+TGG - Chr7:61668506-61668525 None:intergenic 35.0%
ACAAGTTACAAAGCAAAGTG+AGG + Chr7:61670078-61670097 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
ACCAGAAATCAATGTAGTGA+AGG - Chr7:61669538-61669557 None:intergenic 35.0%
ACCATTAATAACCGTGTTGA+GGG - Chr7:61669430-61669449 None:intergenic 35.0%
AGAGATGAATAAGAATGGAG+TGG + Chr7:61670025-61670044 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
AGCACATTTAAAAGCTCTGT+TGG - Chr7:61669366-61669385 None:intergenic 35.0%
AGTTTGTGGTTGAAAGTTCT+TGG - Chr7:61672304-61672323 None:intergenic 35.0%
ATCAGTGTCCAATGTCTATT+CGG + Chr7:61668145-61668164 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
ATGAAGGATTTGGATTTGTG+AGG - Chr7:61668299-61668318 None:intergenic 35.0%
ATGCTCAACTTAGAACTCAT+TGG + Chr7:61666453-61666472 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAGACATAGAGAACAAT+AGG + Chr7:61671488-61671507 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
ATTATGCATGTTTGGATGAG+AGG + Chr7:61666799-61666818 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
CATCTTGTAAGTGTCTGATA+AGG + Chr7:61672705-61672724 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
CGAGCATACTTATAAGGTAT+TGG + Chr7:61669209-61669228 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
CGATTGTAGTTAACCAAAGA+AGG - Chr7:61668563-61668582 None:intergenic 35.0%
CTATCCAGATAACAAGGAAA+TGG + Chr7:61670191-61670210 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
CTTATCAGACACTTACAAGA+TGG - Chr7:61672707-61672726 None:intergenic 35.0%
GAAAGGAAGTGAAAGAAAAG+AGG + Chr7:61670564-61670583 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GAGGAATCCTGTTTATGATA+AGG + Chr7:61666376-61666395 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
GCTCATTCTGTATAAAACCA+CGG - Chr7:61670356-61670375 None:intergenic 35.0%
GGTTAACTACAATCGTTTGA+TGG + Chr7:61668568-61668587 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GGTTATCAGTTGTTAGAAGA+AGG + Chr7:61669162-61669181 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
GTAGTGTCATAAAATCACCA+TGG + Chr7:61667076-61667095 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GTATGAATTGGTAGATTCTG+GGG + Chr7:61669920-61669939 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GTATTTAATCAGGTCAAGAC+AGG + Chr7:61671784-61671803 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GTGAAAGTGGAAGATGAATT+GGG + Chr7:61668866-61668885 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGGGAAATGCCTATAAT+TGG + Chr7:61666398-61666417 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCTTCATATTAGACTCA+TGG + Chr7:61670491-61670510 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
GTTTATTTGATGAGGAAGAG+AGG + Chr7:61669069-61669088 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
TAAAGACCGAATGATGCATT+CGG + Chr7:61669677-61669696 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TAACTGAGTGCATATTACGA+AGG + Chr7:61668014-61668033 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TAACTTGGCAATGACCATAA+CGG - Chr7:61673025-61673044 None:intergenic 35.0%
TAATTATACGACACGTCACT+TGG - Chr7:61669102-61669121 None:intergenic 35.0%
TACTTTGTCCCGTAAACTTT+AGG + Chr7:61666985-61667004 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TAGCTTATCAGACACTTACA+AGG + Chr7:61672775-61672794 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
TATGCTATGGTACTATGCAT+AGG + Chr7:61666540-61666559 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TATGGACAGATCAAACCTAA+AGG - Chr7:61667478-61667497 None:intergenic 35.0%
TCATTCAAAATCCCAAGACT+TGG + Chr7:61672386-61672405 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TCCAAAACCCATTTCAAACA+TGG + Chr7:61668495-61668514 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TCCCTAACCTTATCATAAAC+AGG - Chr7:61666386-61666405 None:intergenic 35.0%
TGAAAAATCATGGTGAACCA+TGG - Chr7:61667096-61667115 None:intergenic 35.0%
TGGAATTAGGGATGCAATTA+AGG + Chr7:61668715-61668734 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TGGACTTGATCAAAACAAGA+AGG + Chr7:61672433-61672452 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TGTAATAAGTGGGTACTATC+TGG - Chr7:61669736-61669755 None:intergenic 35.0%
TTAGAAGAAGGAGCTGAATT+TGG + Chr7:61669174-61669193 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
TTTAATAACATGGGTGGTGA+CGG + Chr7:61669703-61669722 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
TTTATCACCGTCATTTGACA+AGG - Chr7:61670129-61670148 None:intergenic 35.0%
TTTCTTAACTTATGCCCCAA+GGG - Chr7:61667807-61667826 None:intergenic 35.0%
TTTGATCCTTATTGAATCGG+TGG + Chr7:61673237-61673256 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATCCTTATTGAATCGG+TGG - Chr7:61673256-61673237 None:intergenic 35.0%
TTTGATGAAATGCTTGAGAG+TGG + Chr7:61668740-61668759 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTCCATTTCCTTGTTATC+TGG - Chr7:61670198-61670217 None:intergenic 35.0%
! AGTCGACTCATACATTTAGA+GGG - Chr7:61670671-61670690 None:intergenic 35.0%
! ATAGAAGAGGCAAGAGTTTT+TGG + Chr7:61669789-61669808 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
! CAAGAGACCATGTTTGAAAT+GGG - Chr7:61668505-61668524 None:intergenic 35.0%
! CATTTCCTTGTTATCTGGAT+AGG - Chr7:61670193-61670212 None:intergenic 35.0%
! GCTTGTTAATGTTGTTTGCA+TGG - Chr7:61668234-61668253 None:intergenic 35.0%
! TAGCAACTTTTGATCGTGAT+TGG - Chr7:61672522-61672541 None:intergenic 35.0%
! TATCATACATGGACTAAGCA+AGG + Chr7:61669122-61669141 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTGTTCTATGTTTGGGTT+TGG + Chr7:61672746-61672765 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTAGTGCAGCATTAATAT+AGG - Chr7:61671342-61671361 None:intergenic 35.0%
! TTTTGATCAAGTCCACGTTA+TGG - Chr7:61672428-61672447 None:intergenic 35.0%
!! AATGTTAATTTGTGCCCTTG+GGG + Chr7:61667790-61667809 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!! ACCATGTTTGAAATGGGTTT+TGG - Chr7:61668499-61668518 None:intergenic 35.0%
!! ACCTTCACTACATTGATTTC+TGG + Chr7:61669534-61669553 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
!! AGAGTTGATGTGTAAGTTGT+GGG + Chr7:61668838-61668857 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTCGATATCACTTTTGTTT+CGG - Chr7:61668194-61668213 None:intergenic 35.0%
!! CTCATAAAATTGCTTTTGGG+TGG + Chr7:61667338-61667357 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!! GAAATGTTAATTTGTGCCCT+TGG + Chr7:61667788-61667807 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!! GCATACTTATAAGGTATTGG+TGG + Chr7:61669212-61669231 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
!! GGCATTTTGACAAGAAATCA+TGG + Chr7:61672910-61672929 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!! TCATTCTTAAAAGTGCCCAA+TGG - Chr7:61673214-61673233 None:intergenic 35.0%
!! TGTAAAGTTGGAAGGTATCA+TGG + Chr7:61669033-61669052 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTTAAAAGTACCCAATGG+TGG + Chr7:61672221-61672240 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!! TTTGATTTGCGGGTTTCTAA+GGG + Chr7:61668793-61668812 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTTGAAATGGGTTTTGGAA+TGG - Chr7:61668494-61668513 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTTGGCAGAGTGTTATA+TGG + Chr7:61669804-61669823 MsG0780039302.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTGATTTGCGGGTTTCTA+AGG + Chr7:61668792-61668811 MsG0780039302.01.T01:CDS 35.0%
AAACTATCATGGATCCCTGA+AGG - Chr7:61669830-61669849 None:intergenic 40.0%
AAAGACCGAATGATGCATTC+GGG + Chr7:61669678-61669697 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
AAATTAGACGTGTCCCATGT+CGG + Chr7:61668061-61668080 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
AACAATCTATGCGCATCGAA+CGG - Chr7:61668617-61668636 None:intergenic 40.0%
AACTATTAGATGGGACTTGG+AGG - Chr7:61672044-61672063 None:intergenic 40.0%
AAGGTTGCAGGTTCGATTAT+CGG - Chr7:61668454-61668473 None:intergenic 40.0%
ACCAAAGAAGGAACAAAACC+AGG - Chr7:61668551-61668570 None:intergenic 40.0%
ACCCTCAACACGGTTATTAA+TGG + Chr7:61669426-61669445 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGGAACAAAACCAGGTT+TGG - Chr7:61668546-61668565 None:intergenic 40.0%
AGACCACTACCACCAATTAT+AGG - Chr7:61666413-61666432 None:intergenic 40.0%
AGACTTTGCTAATTCACGTG+CGG + Chr7:61671622-61671641 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
AGGCACACTAATGAACCTAT+GGG - Chr7:61671083-61671102 None:intergenic 40.0%
AGGGAAATGCCTATAATTGG+TGG + Chr7:61666401-61666420 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
ATACCAGTGTTATGCGTTAG+AGG - Chr7:61671103-61671122 None:intergenic 40.0%
ATAGCTCACTTGATTCAGCT+AGG + Chr7:61667167-61667186 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
ATCCTTATTGAATCGGTGGA+AGG + Chr7:61673241-61673260 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
ATCCTTATTGAATCGGTGGA+AGG - Chr7:61673260-61673241 None:intergenic 40.0%
ATGCAGCCATTCTTTCTGAA+AGG + Chr7:61669855-61669874 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
CAAAGCCCTTTCAGAAAGAA+TGG - Chr7:61669864-61669883 None:intergenic 40.0%
CCGAAACAAAAGTGATATCG+AGG + Chr7:61668191-61668210 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
CGCAATACATTATACCACCA+CGG + Chr7:61670456-61670475 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
CGTGTTAGATCGAGATTGAA+CGG - Chr7:61670697-61670716 None:intergenic 40.0%
CTAACGCATAACACTGGTAT+AGG + Chr7:61671103-61671122 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
CTTATCAGACACTTACAAGG+TGG + Chr7:61672778-61672797 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGAGAGAGAAACGTTGA+TGG - Chr7:61668413-61668432 None:intergenic 40.0%
GAAGGACAATCTATGAAGCA+CGG + Chr7:61668032-61668051 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
GAGCATATCCTCTAGCAAAT+CGG - Chr7:61666439-61666458 None:intergenic 40.0%
GATCCAACCTTGTCAAATGA+CGG + Chr7:61670119-61670138 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
GCAATACCCATTCATCAAAG+TGG - Chr7:61668687-61668706 None:intergenic 40.0%
GCCAAGTTAAGCCAAATCTT+GGG + Chr7:61673036-61673055 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
GGTGAAAGTGGAAGATGAAT+TGG + Chr7:61668865-61668884 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
GTAGTGAAGGTTACAACATC+AGG - Chr7:61669525-61669544 None:intergenic 40.0%
GTCGATGAATCAAGCAAAAC+TGG - Chr7:61668595-61668614 None:intergenic 40.0%
GTGGAAATTGTGTGTTGTGA+AGG - Chr7:61668348-61668367 None:intergenic 40.0%
GTTTCTTAACTTATGCCCCA+AGG - Chr7:61667808-61667827 None:intergenic 40.0%
TAATCACATCGGTCTGACAA+TGG - Chr7:61669407-61669426 None:intergenic 40.0%
TAGCTCACTTGATTCAGCTA+GGG + Chr7:61667168-61667187 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TCATTGATCCAAACCAAACC+TGG + Chr7:61668530-61668549 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TCTATGTCGTGTATTGGATG+TGG + Chr7:61669239-61669258 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGCAAAATGTGAGAACC+AGG + Chr7:61672579-61672598 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TGAAAAGCTTTCCAAGCAAG+TGG - Chr7:61670909-61670928 None:intergenic 40.0%
TGAAATGCTTGAGAGTGGTT+TGG + Chr7:61668745-61668764 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
TGCACATGCAAAATTCCCAT+AGG + Chr7:61671065-61671084 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TGCCAAGTTAAGCCAAATCT+TGG + Chr7:61673035-61673054 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TGGGCTTGATCAAAACAAGA+AGG - Chr7:61673002-61673021 None:intergenic 40.0%
TGTATTGCGATGCCAGAAAT+TGG - Chr7:61670445-61670464 None:intergenic 40.0%
TTCAAACCTAGATGCAAGCA+CGG - Chr7:61669981-61670000 None:intergenic 40.0%
TTCACAGTCAGAGAGTCTAT+GGG - Chr7:61670411-61670430 None:intergenic 40.0%
TTCTCTCTCTTTCTCTTCTC+CGG + Chr7:61668420-61668439 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
TTTATGATCTTACCCTTGGC+CGG - Chr7:61671811-61671830 None:intergenic 40.0%
TTTCATGTCATCCACTTGCT+TGG + Chr7:61670895-61670914 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
! AATGGTAGCACCATCACTTT+TGG + Chr7:61666352-61666371 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
! AGAGTGTTATATGGCCTTCA+GGG + Chr7:61669813-61669832 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
! AGTTTGGCGTTGAAAGTTCT+TGG + Chr7:61673128-61673147 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
! ATACATGGACTAAGCAAGGA+CGG + Chr7:61669126-61669145 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
! ATGAATGGGTATTGCTCAGT+TGG + Chr7:61668692-61668711 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
! ATGCCTATAATTGGTGGTAG+TGG + Chr7:61666407-61666426 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
! CAATGCTTGAGAGGACTTTT+TGG - Chr7:61670648-61670667 None:intergenic 40.0%
! CAGTCGACTCATACATTTAG+AGG - Chr7:61670672-61670691 None:intergenic 40.0%
! CGGGTTTTTAATAACATGGG+TGG + Chr7:61669697-61669716 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
! GAACAAAACCAGGTTTGGTT+TGG - Chr7:61668541-61668560 None:intergenic 40.0%
! GAGAGTCTATGGGATTTTGT+CGG - Chr7:61670401-61670420 None:intergenic 40.0%
! TCAGGCTTCAAACCATTTTC+AGG - Chr7:61669615-61669634 None:intergenic 40.0%
! TCCCAAGATTTGGCTTAACT+TGG - Chr7:61673040-61673059 None:intergenic 40.0%
! TGCAGCCATTCTTTCTGAAA+GGG + Chr7:61669856-61669875 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
! TGTTGTGTTGATATTGGGTC+TGG - Chr7:61671874-61671893 None:intergenic 40.0%
!! ATGGTAGCACCATCACTTTT+GGG + Chr7:61666353-61666372 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGCTCAGTTGGTGGAATT+AGG + Chr7:61668702-61668721 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!! CATGTTAACTTGTGCCCTAA+GGG - Chr7:61667944-61667963 None:intergenic 40.0%
!! CGGTGTTATCTTATGAAGCA+CGG - Chr7:61668174-61668193 None:intergenic 40.0%
!! CTCTTTAACTTGTGCCCTTA+GGG + Chr7:61667927-61667946 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!! GAGAGTTGATGTGTAAGTTG+TGG + Chr7:61668837-61668856 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGTTCTGGCATGTTCAATG+AGG + Chr7:61669884-61669903 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!! TCATGTTAACTTGTGCCCTA+AGG - Chr7:61667945-61667964 None:intergenic 40.0%
!! TCTCTTTAACTTGTGCCCTT+AGG + Chr7:61667926-61667945 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!! TTCCTTCCACCGATTCAATA+AGG + Chr7:61672186-61672205 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!! TTCCTTCCACCGATTCAATA+AGG - Chr7:61672205-61672186 None:intergenic 40.0%
!! TTCTTAAAAGTGCCCAATGG+TGG - Chr7:61673211-61673230 None:intergenic 40.0%
!! TTGATTTGCGGGTTTCTAAG+GGG + Chr7:61668794-61668813 MsG0780039302.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGCTCAGTTGGTGGAATTA+GGG + Chr7:61668703-61668722 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
!!! ACCTGGTTTTGTTCCTTCTT+TGG + Chr7:61668547-61668566 MsG0780039302.01.T01:intron 40.0%
AATCTCGATCTAACACGTCC+CGG + Chr7:61670700-61670719 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
AGGTTGCAGGTTCGATTATC+GGG - Chr7:61668453-61668472 None:intergenic 45.0%
ATGCATGTTTGGATGAGAGG+CGG + Chr7:61666802-61666821 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
ATTGGATGTGGACAAGGCAA+GGG + Chr7:61669251-61669270 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
CAGTCCCTATCCAGATAACA+AGG + Chr7:61670185-61670204 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
CGATGTGATTACCCTCAACA+CGG + Chr7:61669416-61669435 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
CGTGTTGAGGGTAATCACAT+CGG - Chr7:61669418-61669437 None:intergenic 45.0%
CTTCACAGTCAGAGAGTCTA+TGG - Chr7:61670412-61670431 None:intergenic 45.0%
GACAAGGTTGGATCTTCAGA+TGG - Chr7:61670113-61670132 None:intergenic 45.0%
GAGGCACACTAATGAACCTA+TGG - Chr7:61671084-61671103 None:intergenic 45.0%
GATGTGTAAGTTGTGGGAGA+GGG + Chr7:61668844-61668863 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
GCTGTGCGAGCATACTTATA+AGG + Chr7:61669203-61669222 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
GCTTGACAATGACCATAACG+TGG + Chr7:61672413-61672432 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
GGAAGATGAATTGGGTGTGA+AGG + Chr7:61668874-61668893 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
GGAAGCTCTATGTCGTGTAT+TGG + Chr7:61669233-61669252 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
GGGACTTGGAGGTAAGTTAT+GGG - Chr7:61672033-61672052 None:intergenic 45.0%
GTCAAGCTAAGCCAAGTCTT+GGG - Chr7:61672400-61672419 None:intergenic 45.0%
TAATCAGGTCAAGACAGGAC+CGG + Chr7:61671789-61671808 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
TAGCAAGAAGTGACGCTATG+AGG + Chr7:61671648-61671667 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
TATTGGATGTGGACAAGGCA+AGG + Chr7:61669250-61669269 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
TCACCGTCATTTGACAAGGT+TGG - Chr7:61670125-61670144 None:intergenic 45.0%
TCCGACAAACTACTACCACA+CGG - Chr7:61668979-61668998 None:intergenic 45.0%
TCGATTATCGGGAATGGAAC+CGG - Chr7:61668442-61668461 None:intergenic 45.0%
TCGTGTATTGGATGTGGACA+AGG + Chr7:61669245-61669264 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
TGATAACCGTGCTTGCATCT+AGG + Chr7:61669972-61669991 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
TGATGTGTAAGTTGTGGGAG+AGG + Chr7:61668843-61668862 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
TGGAATGGAGTAACTTAGCG+AGG - Chr7:61668479-61668498 None:intergenic 45.0%
TGGGACTTGGAGGTAAGTTA+TGG - Chr7:61672034-61672053 None:intergenic 45.0%
TGTCAAGCTAAGCCAAGTCT+TGG - Chr7:61672401-61672420 None:intergenic 45.0%
TGTCGGAGGAGGTTGTTTAT+GGG + Chr7:61668992-61669011 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
TTGGCAATGACCATAACGGT+GGG - Chr7:61673021-61673040 None:intergenic 45.0%
TTGTCGGAGGAGGTTGTTTA+TGG + Chr7:61668991-61669010 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
TTTAGAGGGCAATGCTTGAG+AGG - Chr7:61670657-61670676 None:intergenic 45.0%
TTTGATCAAGCCCACCGTTA+TGG + Chr7:61673008-61673027 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
! AATGGGTATTGCTCAGTTGG+TGG + Chr7:61668695-61668714 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
! ACCGTGTGGTAGTAGTTTGT+CGG + Chr7:61668975-61668994 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
! ATGGTTTTTGCAAGATGGGG+AGG + Chr7:61669445-61669464 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
! CAGAGTGTTATATGGCCTTC+AGG + Chr7:61669812-61669831 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
! CTGAAAGGGCTTTGTAGTTC+TGG + Chr7:61669870-61669889 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
! CTGCCATAATCCAAAGCATC+CGG - Chr7:61670722-61670741 None:intergenic 45.0%
! GTTTCTAAGGGGAAGGGATT+GGG + Chr7:61668805-61668824 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
! TGCCATAATCCAAAGCATCC+GGG - Chr7:61670721-61670740 None:intergenic 45.0%
! TGGTTTTTGCAAGATGGGGA+GGG + Chr7:61669446-61669465 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTTGGAAGGTATCATGGTG+CGG + Chr7:61669038-61669057 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGATGGGCTTCTTCGAAA+CGG - Chr7:61668398-61668417 None:intergenic 45.0%
!! TGGTAGCACCATCACTTTTG+GGG + Chr7:61666354-61666373 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGCACGCTTTTTTTGCCGTA+TGG + Chr7:61670782-61670801 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
!!! GCACGCTTTTTTTGCCGTAT+GGG + Chr7:61670783-61670802 MsG0780039302.01.T01:intron 45.0%
!!! GGTCTTTTCCGATTTGCTAG+AGG + Chr7:61666428-61666447 MsG0780039302.01.T01:CDS 45.0%
!! AATAGATAAAAATATATAAT+AGG - Chr7:61671749-61671768 None:intergenic 5.0%
!!! TTAAATAACTAATTTTATTA+TGG + Chr7:61672062-61672081 MsG0780039302.01.T01:intron 5.0%
AAGGACGGTGATTGTATGCG+AGG + Chr7:61669141-61669160 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
ACAAGAGATAGCTTCCGTGG+TGG - Chr7:61670473-61670492 None:intergenic 50.0%
ATCCTCCATGTCACACAGTC+AGG - Chr7:61670053-61670072 None:intergenic 50.0%
ATCGGTGGAAGGAACATTGC+AGG + Chr7:61673252-61673271 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
ATCGGTGGAAGGAACATTGC+AGG - Chr7:61673271-61673252 None:intergenic 50.0%
ATGGGCTTCTTCGAAACGGT+TGG - Chr7:61668394-61668413 None:intergenic 50.0%
ATTGCGGAAGAGTTACCGTG+TGG + Chr7:61668961-61668980 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
CACGGAGACCGAATAGACAT+TGG - Chr7:61668156-61668175 None:intergenic 50.0%
CGCTATGAGGTCAATTGCAC+CGG + Chr7:61671661-61671680 MsG0780039302.01.T01:intron 50.0%
CTTGGCAATGACCATAACGG+TGG - Chr7:61673022-61673041 None:intergenic 50.0%
GAAGGAAACAACATGCACCG+TGG + Chr7:61670336-61670355 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
GCAACAAGAGATAGCTTCCG+TGG - Chr7:61670476-61670495 None:intergenic 50.0%
GCAGGTTCGATTATCGGGAA+TGG - Chr7:61668448-61668467 None:intergenic 50.0%
GCTATGAGGTCAATTGCACC+GGG + Chr7:61671662-61671681 MsG0780039302.01.T01:intron 50.0%
GGAGTAACTTAGCGAGGAGA+AGG - Chr7:61668473-61668492 None:intergenic 50.0%
GGATTCCTCCCCAAAAGTGA+TGG - Chr7:61666365-61666384 None:intergenic 50.0%
GTATGGCACCCATACTGAGA+TGG + Chr7:61666911-61666930 MsG0780039302.01.T01:intron 50.0%
GTGCCTCTAACGCATAACAC+TGG + Chr7:61671097-61671116 MsG0780039302.01.T01:intron 50.0%
GTTGCAGAGAGAGTGGAGAA+TGG - Chr7:61668370-61668389 None:intergenic 50.0%
TCCTCCATGTCACACAGTCA+GGG - Chr7:61670052-61670071 None:intergenic 50.0%
! GGTTTCTAAGGGGAAGGGAT+TGG + Chr7:61668804-61668823 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
! GTCCCGGATGCTTTGGATTA+TGG + Chr7:61670716-61670735 MsG0780039302.01.T01:intron 50.0%
! GTGTGGTAGTAGTTTGTCGG+AGG + Chr7:61668978-61668997 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
! TGCCAGAAATTGGCTCCTCA+CGG - Chr7:61670435-61670454 None:intergenic 50.0%
! TGGTAGTAGTTTGTCGGAGG+AGG + Chr7:61668981-61669000 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
! TTGAGGTGTGCAGAAAGCAC+TGG - Chr7:61671708-61671727 None:intergenic 50.0%
! TTGCGGGTTTCTAAGGGGAA+GGG + Chr7:61668799-61668818 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
! TTTGCGGGTTTCTAAGGGGA+AGG + Chr7:61668798-61668817 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGAAGGTGTTGACGAGACT+AGG + Chr7:61669298-61669317 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
!! TAGCACCATCACTTTTGGGG+AGG + Chr7:61666357-61666376 MsG0780039302.01.T01:CDS 50.0%
!! TGAGGTGTGCAGAAAGCACT+GGG - Chr7:61671707-61671726 None:intergenic 50.0%
!! TTTACACTGGGCACCGACAT+GGG - Chr7:61668077-61668096 None:intergenic 50.0%
!!! TTTTACACTGGGCACCGACA+TGG - Chr7:61668078-61668097 None:intergenic 50.0%
AGCCGTGAGGAGCCAATTTC+TGG + Chr7:61670430-61670449 MsG0780039302.01.T01:intron 55.0%
AGGGATGTGACACTGCTGGA+AGG + Chr7:61670318-61670337 MsG0780039302.01.T01:CDS 55.0%
AGGGGAAGGGATTGGGAAAG+TGG + Chr7:61668812-61668831 MsG0780039302.01.T01:CDS 55.0%
CCTCCATGTCACACAGTCAG+GGG - Chr7:61670051-61670070 None:intergenic 55.0%
CTAACACGTCCCGGATGCTT+TGG + Chr7:61670709-61670728 MsG0780039302.01.T01:intron 55.0%
CTTAGCGAGGAGAAGGTTGC+AGG - Chr7:61668466-61668485 None:intergenic 55.0%
GCAGAGAGAGTGGAGAATGG+TGG - Chr7:61668367-61668386 None:intergenic 55.0%
GGGGAAGGGATTGGGAAAGT+GGG + Chr7:61668813-61668832 MsG0780039302.01.T01:CDS 55.0%
GGTTGGAGTTGCAGAGAGAG+TGG - Chr7:61668377-61668396 None:intergenic 55.0%
GTTGTGGGAGAGGGTGAAAG+TGG + Chr7:61668853-61668872 MsG0780039302.01.T01:CDS 55.0%
TCTCTGACTGTGAAGCCGTG+AGG + Chr7:61670417-61670436 MsG0780039302.01.T01:intron 55.0%
!! GAAGGTATCATGGTGCGGCT+AGG + Chr7:61669043-61669062 MsG0780039302.01.T01:CDS 55.0%
CCCCTGACTGTGTGACATGG+AGG + Chr7:61670048-61670067 MsG0780039302.01.T01:CDS 60.0%
GACGCCACGGATGAGTTACC+CGG - Chr7:61671683-61671702 None:intergenic 60.0%
GGGGGATGCAATGCGTGCAT+AGG - Chr7:61670607-61670626 None:intergenic 60.0%
GTCAAGACAGGACCGGCCAA+GGG + Chr7:61671796-61671815 MsG0780039302.01.T01:CDS 60.0%
TGCACCGGGTAACTCATCCG+TGG + Chr7:61671676-61671695 MsG0780039302.01.T01:intron 60.0%
TGGCCCCTGACTGTGTGACA+TGG + Chr7:61670045-61670064 MsG0780039302.01.T01:CDS 60.0%
GGTCAAGACAGGACCGGCCA+AGG + Chr7:61671795-61671814 MsG0780039302.01.T01:intron 65.0%
!! GAAAGCACTGGGCGACGCCA+CGG - Chr7:61671696-61671715 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 61666317 61673318 61666317 ID=MsG0780039302.01;Name=MsG0780039302.01
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Chr7 exon 61666317 61666507 61666317 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17232;Parent=MsG0780039302.01.T01
Chr7 exon 61668724 61668887 61668724 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17231;Parent=MsG0780039302.01.T01
Chr7 exon 61668953 61669621 61668953 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17230;Parent=MsG0780039302.01.T01
Chr7 exon 61669994 61670140 61669994 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17229;Parent=MsG0780039302.01.T01
Chr7 exon 61670301 61670425 61670301 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17228;Parent=MsG0780039302.01.T01
Chr7 exon 61671796 61671817 61671796 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17227;Parent=MsG0780039302.01.T01
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Chr7 exon 61673118 61673318 61673118 ID=MsG0780039302.01.T01:exon:17225;Parent=MsG0780039302.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780039302.01.T01

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Protein sequence

>MsG0780039302.01.T01

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