AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039591.01

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MsG0780039591.01.T01 AT5G10530 35.764 288 159 7 501 771 322 600 1.63e-46 177
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MsG0780039591.01.T01 AT5G18500 36.054 294 166 7 502 781 154 439 4.80e-45 170
MsG0780039591.01.T01 AT5G18500 36.054 294 166 7 502 781 154 439 4.80e-45 170
MsG0780039591.01.T01 AT5G18500 36.054 294 166 7 502 781 154 439 4.80e-45 170
MsG0780039591.01.T01 AT5G18500 36.054 294 166 7 502 781 154 439 4.80e-45 170
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MsG0780039591.01.T01 AT3G46370 37.634 279 155 6 502 769 477 747 5.26e-45 174
MsG0780039591.01.T01 AT1G56130 37.234 282 157 7 502 771 682 955 5.76e-45 176
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MsG0780039591.01.T01 AT5G16900 37.500 280 156 6 503 771 564 835 7.19e-45 175
MsG0780039591.01.T01 AT2G42960 37.075 294 163 8 502 781 171 456 9.02e-45 169
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MsG0780039591.01.T01 AT2G42960 37.075 294 163 8 502 781 171 456 9.02e-45 169
MsG0780039591.01.T01 AT2G42960 37.075 294 163 8 502 781 171 456 9.02e-45 169
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MsG0780039591.01.T01 AT5G06740 31.611 329 187 9 501 805 317 631 8.53e-43 166
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MsG0780039591.01.T01 AT1G51860 33.562 292 176 6 501 782 573 856 1.21e-42 168
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MsG0780039591.01.T01 AT4G00970 33.542 319 183 9 501 805 331 634 1.35e-42 166
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MsG0780039591.01.T01 AT5G58940 35.099 302 169 11 502 783 135 429 2.98e-41 158
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MsG0780039591.01.T01 AT1G56120 41.743 218 116 5 502 716 680 889 1.06e-40 162
MsG0780039591.01.T01 AT3G59750 36.530 219 128 4 502 716 291 502 1.06e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT5G11020 34.211 304 177 6 500 789 66 360 1.07e-40 154
MsG0780039591.01.T01 AT5G49760 36.709 316 178 8 491 791 606 914 1.15e-40 162
MsG0780039591.01.T01 AT5G59700 33.448 290 173 8 507 783 475 757 1.16e-40 161
MsG0780039591.01.T01 AT5G01550 33.333 291 173 8 504 781 369 651 1.23e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT4G23240 34.812 293 170 7 501 779 322 607 1.30e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G69730 33.663 303 173 9 502 787 435 726 1.41e-40 161
MsG0780039591.01.T01 AT4G23140 39.269 219 124 4 501 716 338 550 1.54e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G51820 35.231 281 163 7 502 771 568 840 1.56e-40 161
MsG0780039591.01.T01 AT4G23130 38.813 219 125 3 501 716 327 539 1.66e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT4G00970 37.443 219 130 4 501 716 331 545 1.72e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G23130 38.813 219 125 3 501 716 331 543 1.77e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT1G16110 36.260 262 143 6 466 719 390 635 1.83e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT1G79680 33.449 287 164 8 502 771 421 697 2.18e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G70460 34.219 301 168 10 500 781 339 628 2.21e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT4G23160 39.269 219 124 4 501 716 346 558 2.27e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT2G25220 34.437 302 176 7 502 789 85 378 2.56e-40 153
MsG0780039591.01.T01 AT4G11900 36.101 277 158 5 506 769 460 730 2.61e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G52290 32.298 322 188 10 468 771 101 410 2.78e-40 156
MsG0780039591.01.T01 AT3G25560 34.576 295 167 8 502 781 300 583 2.82e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G11890 31.930 285 174 6 499 771 24 300 2.92e-40 152
MsG0780039591.01.T01 AT3G25560 34.576 295 167 8 502 781 301 584 3.01e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT3G25560 34.576 295 167 8 502 781 300 583 3.02e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT1G51800 33.096 281 170 6 501 771 575 847 3.25e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT4G23230 35.192 287 166 6 433 716 267 536 3.64e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G11890 30.769 299 186 7 485 771 12 301 3.68e-40 152
MsG0780039591.01.T01 AT4G21230 37.413 286 161 8 502 775 321 600 3.74e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT1G11330 40.826 218 120 3 502 716 512 723 3.75e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT1G69910 34.426 305 159 9 502 770 312 611 3.82e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G11900 35.315 286 166 5 506 778 529 808 3.90e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G07560 34.520 281 162 7 502 771 560 829 3.93e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT3G46290 32.765 293 177 8 504 783 475 760 4.05e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT4G23150 38.356 219 126 3 501 716 323 535 4.37e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G23140 39.189 222 126 4 501 716 338 556 4.74e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT1G56145 40.183 219 120 5 502 717 572 782 5.52e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G52290 37.255 255 145 7 465 716 98 340 5.65e-40 152
MsG0780039591.01.T01 AT1G21250 33.548 310 182 7 488 784 386 684 5.76e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT1G56145 40.183 219 120 5 502 717 675 885 6.04e-40 160
MsG0780039591.01.T01 AT1G26150 40.826 218 118 5 502 716 418 627 6.15e-40 157
MsG0780039591.01.T01 AT2G25220 34.437 302 176 7 502 789 134 427 6.29e-40 154
MsG0780039591.01.T01 AT1G61610 38.991 218 124 4 502 716 513 724 7.35e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT3G21630 33.882 304 170 10 501 787 309 598 7.39e-40 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G21390 33.670 297 178 6 489 773 505 794 7.71e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT4G32000 33.775 302 178 6 502 789 118 411 8.01e-40 153
MsG0780039591.01.T01 AT2G39110 35.410 305 166 7 491 771 68 365 8.36e-40 153
MsG0780039591.01.T01 AT1G29720 35.517 290 160 9 502 775 661 939 9.56e-40 159
MsG0780039591.01.T01 AT2G39110 36.066 305 164 8 491 771 53 350 9.87e-40 152
MsG0780039591.01.T01 AT4G21390 38.528 231 132 4 489 716 505 728 9.95e-40 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G23310 33.677 291 169 7 501 775 455 737 1.00e-39 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G32000 33.775 302 178 6 502 789 117 410 1.03e-39 152
MsG0780039591.01.T01 AT2G25220 34.437 302 176 7 502 789 139 432 1.12e-39 153
MsG0780039591.01.T01 AT5G07280 36.149 296 160 9 504 784 907 1188 1.12e-39 159
MsG0780039591.01.T01 AT1G51890 32.013 303 166 6 501 771 559 853 1.23e-39 159
MsG0780039591.01.T01 AT4G21410 35.648 216 132 3 504 716 222 433 1.36e-39 155
MsG0780039591.01.T01 AT3G45860 32.414 290 175 6 501 775 338 621 1.37e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G11890 31.802 283 173 6 501 771 29 303 1.39e-39 150
MsG0780039591.01.T01 AT1G74360 35.962 317 171 11 500 798 800 1102 1.58e-39 159
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MsG0780039591.01.T01 AT1G21210 32.277 347 208 10 453 785 353 686 1.73e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G23320 33.788 293 173 7 501 779 170 455 1.73e-39 154
MsG0780039591.01.T01 AT4G23320 33.788 293 173 7 501 779 170 455 1.73e-39 154
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.295 244 140 4 481 721 503 736 1.93e-39 158
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MsG0780039591.01.T01 AT3G13690 35.667 300 158 10 502 781 399 683 2.07e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT3G13690 35.667 300 158 10 502 781 399 683 2.07e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.903 248 133 6 481 721 561 794 2.17e-39 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.903 248 133 6 481 721 561 794 2.17e-39 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.903 248 133 6 481 721 589 822 2.35e-39 158
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.903 248 133 6 481 721 496 729 2.63e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G23320 33.788 293 173 7 501 779 191 476 2.65e-39 154
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.903 248 133 6 481 721 504 737 2.85e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT2G01820 33.333 291 166 7 502 771 573 856 3.07e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G32000 33.775 302 178 6 502 789 160 453 3.10e-39 152
MsG0780039591.01.T01 AT1G24030 38.397 237 121 8 550 769 11 239 3.61e-39 147
MsG0780039591.01.T01 AT1G24650 34.256 289 164 8 503 772 536 817 3.70e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT1G16160 37.054 224 125 4 502 719 420 633 3.77e-39 156
MsG0780039591.01.T01 AT4G31110 33.333 309 172 11 481 771 404 696 3.79e-39 156
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.295 244 140 4 481 721 661 894 4.14e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT4G03230 37.295 244 140 4 481 721 661 894 4.14e-39 157
MsG0780039591.01.T01 AT1G21590 32.997 297 178 7 489 771 344 633 4.23e-39 155

Find 217 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 383 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GATATACAGTTTAAAGAAAA+TGG 0.145852 7:-66399100 None:intergenic
TGGAAAGTTGACATCTTTAT+TGG 0.160694 7:+66397949 MsG0780039591.01.T01:CDS
AAATCAGATGTTTATTCTTT+TGG 0.178067 7:+66397851 MsG0780039591.01.T01:CDS
CGCTCTTCGCTCTGCAATTC+AGG 0.193245 7:+66399033 MsG0780039591.01.T01:CDS
CAGCTCTCGGCAACAGAATT+TGG 0.215423 7:-66395601 None:intergenic
TCACCAGAAGCAAGGAATTC+AGG 0.258796 7:-66397818 None:intergenic
AGAGTAAATTGAATTTGATT+TGG 0.262510 7:+66393869 MsG0780039591.01.T01:CDS
GACCCTGAATTCCTTGCTTC+TGG 0.268965 7:+66397815 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCCAATCTGATCACTCTTAT+AGG 0.270789 7:+66397455 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGGAATCCGAAAGCTTATTA+TGG 0.284993 7:+66394620 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATTTGGGCAATACAGAATTC+TGG 0.293310 7:+66393886 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATATATCCTCTTGTTTATAT+AGG 0.293382 7:+66399248 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR
CCTGTTCTTTGTATTGTTGC+AGG 0.295688 7:-66393742 None:intergenic
GAGTAAATTGAATTTGATTT+GGG 0.314398 7:+66393870 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTTCATTTACTTTGTCTCTC+TGG 0.314666 7:-66396744 None:intergenic
TGAATTGAATCTGAGGAAAA+TGG 0.318041 7:+66396672 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCCCGCGTCTAAAAGTTTCT+TGG 0.319798 7:-66395953 None:intergenic
GAAATGGAGAATATTGAAAA+AGG 0.322867 7:+66394573 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTTCTTAAGAGTTCTATATA+AGG 0.331087 7:+66399209 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR
GAGTTCGGTTCGCGATGTTC+GGG 0.340034 7:+66393771 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGAGTTCGGTTCGCGATGTT+CGG 0.340839 7:+66393770 MsG0780039591.01.T01:CDS
GTAATAATAATACACAGTTT+TGG 0.342069 7:+66397759 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAAACCCTCCAATGTCATTC+TGG 0.343650 7:+66397667 MsG0780039591.01.T01:CDS
GACATCTTTATTGGATCCTT+TGG 0.343938 7:+66397958 MsG0780039591.01.T01:CDS
GATGCAATGAGGGCTTCTTC+TGG 0.345686 7:+66398094 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGATCCTTCAATGAACTTGC+GGG 0.348981 7:-66394358 None:intergenic
TTCAGATGTATGGAGGATAT+TGG 0.352086 7:+66398072 MsG0780039591.01.T01:CDS
GTGAAATATGCAGTAGATAC+TGG 0.352587 7:+66397929 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCATCAACCACAATTTGATT+AGG 0.354527 7:-66393811 None:intergenic
ATCCGCGTTTGCCATGATAA+TGG 0.358592 7:-66397566 None:intergenic
GTCAGTAAGCTTAGCGACTT+TGG 0.363647 7:+66397701 MsG0780039591.01.T01:CDS
AAGATCGGCGAAGGTGGATA+TGG 0.366487 7:+66397054 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTCAAAGGGATCATTGTTGC+AGG 0.372953 7:-66393943 None:intergenic
AAAGAATAAACATCTGATTT+CGG 0.379856 7:-66397848 None:intergenic
TTGTCAAGGATGAGTCCTTC+AGG 0.384404 7:+66395535 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTGCTCCCATAATAAGCTTT+CGG 0.385160 7:-66394626 None:intergenic
TCTGGTGGTACAAACTCCTT+TGG 0.394704 7:+66398112 MsG0780039591.01.T01:CDS
CATCAGATAAGAATTATTCT+AGG 0.396009 7:+66394649 MsG0780039591.01.T01:CDS
GGCTGAACAGTTAGCTCGCT+TGG 0.400874 7:+66398003 MsG0780039591.01.T01:CDS
AACTGTTCAGCCTGCACAAA+TGG 0.406732 7:-66397992 None:intergenic
ACCTCAAAAGAAGTGATATA+AGG 0.408419 7:-66399176 None:intergenic
GGATATGGAAATATATATAA+AGG 0.410314 7:+66397069 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTTTGTATTGTTGCAGGCAT+AGG 0.410706 7:-66393736 None:intergenic
TTACACTGGGGCAAAATCAT+AGG 0.411050 7:+66395347 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAAGATCCTCATCTTTAATC+AGG 0.411629 7:-66395654 None:intergenic
TTCCTAGACATATTATAAAC+AGG 0.411673 7:-66399125 None:intergenic
TAGACAAGAGACCAGGATTC+CGG 0.415793 7:-66397485 None:intergenic
AGTCCGAGCTTACCGGGAAA+TGG 0.420454 7:+66394384 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGCAGGCAAGACGGTCTTCA+AGG 0.426309 7:-66397529 None:intergenic
TTCGCTCTGCAATTCAGGAT+TGG 0.426365 7:+66399038 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTTGAAGGTCTCACAGAGTT+AGG 0.429014 7:-66395313 None:intergenic
TGGATCCTTTGGCCGGAGAC+TGG 0.432767 7:+66397969 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGGATGTGTGTTATCCTTGC+AGG 0.435149 7:-66397546 None:intergenic
CACTCTTATAGGAGCCTGTC+CGG 0.439781 7:+66397466 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTACAAATTACTTACTCAAA+GGG 0.441957 7:-66393957 None:intergenic
ATCAAGAAGTCCGAGCTTAC+CGG 0.447215 7:+66394377 MsG0780039591.01.T01:CDS
TAGAACTCTTAAGAAACAAA+AGG 0.447822 7:-66399202 None:intergenic
GGAATCCGAAAGCTTATTAT+GGG 0.450686 7:+66394621 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGCAGAGCGAAGAGCGCGGT+TGG 0.450732 7:-66399026 None:intergenic
AAGATCTCAATCTATTACAC+TGG 0.450832 7:+66395333 MsG0780039591.01.T01:CDS
TAGGAGCCTGTCCGGAATCC+TGG 0.451304 7:+66397474 MsG0780039591.01.T01:CDS
AAGAACAGGTTCTGTGAGTT+CGG 0.452517 7:+66393756 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATTCCCCGCAAGTTCATTGA+AGG 0.457187 7:+66394354 MsG0780039591.01.T01:CDS
CGGAGACTGGCCATTTGTGC+AGG 0.460090 7:+66397982 MsG0780039591.01.T01:CDS
GTTGACTGGGAGACCGGCAT+TGG 0.461081 7:+66397892 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAAAACCCCTCAGTGTCAAC+TGG 0.463647 7:-66395460 None:intergenic
GCTAGCTGTCATTCCATCAT+TGG 0.467605 7:-66395419 None:intergenic
GTCTATGAGTATTTGCCAAA+CGG 0.469246 7:+66397503 MsG0780039591.01.T01:CDS
TAGTTAGTTACCTGGAAGAT+TGG 0.469416 7:-66398181 None:intergenic
TCCTTAGTTATTCCCAATGC+CGG 0.472051 7:-66397905 None:intergenic
TACCCTGCGTATGGCTTCAA+TGG 0.472556 7:-66395991 None:intergenic
ATAAACAAGAGGATATATAT+AGG 0.473129 7:-66399243 None:intergenic
GTAATAGATTGAGATCTTGA+AGG 0.474421 7:-66395328 None:intergenic
GCAGAGCGAAGAGCGCGGTT+GGG 0.475866 7:-66399025 None:intergenic
ATGTAGACAAAAGTTCCCTT+TGG 0.476705 7:-66397791 None:intergenic
TCCTTTGGTCTAAGTTCTGA+AGG 0.477222 7:+66398127 MsG0780039591.01.T01:CDS
CGGACCTTCATTCAGATGTA+TGG 0.479594 7:+66398062 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCTATAAGAGTGATCAGATT+GGG 0.479971 7:-66397455 None:intergenic
ATATACAGTTTAAAGAAAAT+GGG 0.480109 7:-66399099 None:intergenic
AGAGAAATTGCATATCGAAA+TGG 0.480457 7:+66394557 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTAGGCACTTGCTGCAGCAA+AGG 0.480941 7:-66395295 None:intergenic
TTCGAATATGTCAACGGATG+GGG 0.482213 7:+66394443 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATCGTCTGAAGTTATGATAC+AGG 0.484371 7:+66396816 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAGATTGTTGACTGGGAGAC+CGG 0.486866 7:+66397886 MsG0780039591.01.T01:CDS
CAGAGCGAAGAGCGCGGTTG+GGG 0.487896 7:-66399024 None:intergenic
TTGATCCTTCAATGAACTTG+CGG 0.489337 7:-66394359 None:intergenic
ACAGAATTTGGTGTCAGTGT+TGG 0.489550 7:-66395589 None:intergenic
TCTGTACCTCGCCTGTTACA+TGG 0.490438 7:-66395487 None:intergenic
CTGCACAAATGGCCAGTCTC+CGG 0.491730 7:-66397981 None:intergenic
TTGACTGGGAGACCGGCATT+GGG 0.496222 7:+66397893 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTTCCATTTCCCGGTAAGCT+CGG 0.496242 7:-66394387 None:intergenic
CGGTCTTCAAGGCTTCCGTT+TGG 0.496729 7:-66397518 None:intergenic
CACCAGAAGCAAGGAATTCA+GGG 0.501661 7:-66397817 None:intergenic
TGCGGTGTTGTGAGATGAAT+AGG 0.502198 7:+66398029 MsG0780039591.01.T01:CDS
CAAGGGTCCTTGCATGCTGT+TGG 0.502556 7:-66397133 None:intergenic
CCTGCAACAATACAAAGAAC+AGG 0.503782 7:+66393742 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGAAGTTATGATACAGGAGT+TGG 0.503965 7:+66396822 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCATCCAGAATGACATTGGA+GGG 0.505066 7:-66397671 None:intergenic
TGTTGGATCAATTGCACTAT+CGG 0.511500 7:-66395572 None:intergenic
AGGACCCTTGGAGTTTCAGC+AGG 0.513937 7:+66397146 MsG0780039591.01.T01:CDS
TATTATTGAGATTGTTGACT+GGG 0.516001 7:+66397879 MsG0780039591.01.T01:CDS
CACCTCCTGCTGAAACTCCA+AGG 0.519574 7:-66397151 None:intergenic
CCTTCGCCGATCTTTAGAGA+TGG 0.522406 7:-66397045 None:intergenic
TAAGTTCTGATGAGTCAGAT+AGG 0.527078 7:+66395512 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCCTCCAATGTCATTCTGGA+TGG 0.527851 7:+66397671 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTGCATGCCAACAGCATGCA+AGG 0.531300 7:+66397126 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACCGGCATTGGGAATAACTA+AGG 0.532680 7:+66397904 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATTGGACAAATAAAATATGA+AGG 0.533202 7:-66398163 None:intergenic
GAGGATATTGGATGCAATGA+GGG 0.533753 7:+66398084 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTTAATCCATCTCTAAAGAT+CGG 0.533815 7:+66397039 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCCTATAAGAGTGATCAGAT+TGG 0.534173 7:-66397456 None:intergenic
AGAACTCTTAAGAAACAAAA+GGG 0.534414 7:-66399201 None:intergenic
GACAAAAGTTCCCTTTGGAT+CGG 0.534777 7:-66397786 None:intergenic
CAACAGCATGCAAGGACCCT+TGG 0.536311 7:+66397134 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGATGCATTCTCACAGCTCT+CGG 0.536801 7:-66395614 None:intergenic
GCTACAAATTACTTACTCAA+AGG 0.538132 7:-66393958 None:intergenic
TCTTCTCCAGTTGACACTGA+GGG 0.539587 7:+66395454 MsG0780039591.01.T01:CDS
CGAGTGAGGTCTGCCAATGA+TGG 0.539809 7:+66395406 MsG0780039591.01.T01:CDS
CATCATTGGCAGACCTCACT+CGG 0.539868 7:-66395405 None:intergenic
TCTTCGAATATGTCAACGGA+TGG 0.540103 7:+66394441 MsG0780039591.01.T01:CDS
CAAAATCTTTATAGCCACTT+CGG 0.540401 7:-66397106 None:intergenic
GAGAATTCTGAGAACAATTG+AGG 0.542147 7:-66396985 None:intergenic
TCCTCCATACATCTGAATGA+AGG 0.543487 7:-66398066 None:intergenic
ATAACACACATCCATTATCA+TGG 0.549249 7:+66397555 MsG0780039591.01.T01:CDS
GGCGGAGGAAGAACTAAGAA+AGG 0.549893 7:+66396693 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGAAGACCGTCTTGCCTGCA+AGG 0.550120 7:+66397532 MsG0780039591.01.T01:CDS
GTTTCCATCCAGAATGACAT+TGG 0.551266 7:-66397675 None:intergenic
CTCTCAATGCATTATCACGC+TGG 0.552967 7:-66396912 None:intergenic
TCTTTATTGGATCCTTTGGC+CGG 0.553910 7:+66397962 MsG0780039591.01.T01:CDS
GTGAGATGAATAGGAAGAGC+CGG 0.553951 7:+66398038 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCAAGAAGTCCGAGCTTACC+GGG 0.555284 7:+66394378 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAGTCACCTGATTAAAGATG+AGG 0.559607 7:+66395648 MsG0780039591.01.T01:CDS
TACCTGTTTATAATATGTCT+AGG 0.562354 7:+66399123 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR
GACCACTGTCAAGCCACCCT+CGG 0.562776 7:-66398952 None:intergenic
GCAATGAGGGCTTCTTCTGG+TGG 0.563184 7:+66398097 MsG0780039591.01.T01:CDS
CATACATCTGAATGAAGGTC+CGG 0.564031 7:-66398061 None:intergenic
ATATTATTGAGATTGTTGAC+TGG 0.564645 7:+66397878 MsG0780039591.01.T01:CDS
TAATCAAATTGTGGTTGATG+AGG 0.566819 7:+66393813 MsG0780039591.01.T01:CDS
CTTCGAATATGTCAACGGAT+GGG 0.567931 7:+66394442 MsG0780039591.01.T01:CDS
CAGACATAGCTTGTTCGAGT+TGG 0.568950 7:-66395902 None:intergenic
TTATAGCCACTTCGGTGTGA+CGG 0.569615 7:-66397098 None:intergenic
AGTTAGCTCGCTTGGCCTTG+CGG 0.569708 7:+66398011 MsG0780039591.01.T01:CDS
AGATCTCAATCTATTACACT+GGG 0.571229 7:+66395334 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTTATCGCCTCCAAGTGTAC+TGG 0.573928 7:+66395681 MsG0780039591.01.T01:CDS
GATCCGCATGTAGCTGCAGA+TGG 0.577006 7:+66398905 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCTCTAAAGATCGGCGAAGG+TGG 0.578943 7:+66397048 MsG0780039591.01.T01:CDS
TACAAAGTTACAAGAACGAG+CGG 0.580773 7:+66396875 MsG0780039591.01.T01:CDS
AATGGCCAGTCTCCGGCCAA+AGG 0.581062 7:-66397974 None:intergenic
AAGAGTTATTTCGCCGAGTG+AGG 0.581160 7:+66395392 MsG0780039591.01.T01:CDS
AATTTATCATGTGATGTGCC+CGG 0.583461 7:+66394183 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCCATCCAGAATGACATTGG+AGG 0.585022 7:-66397672 None:intergenic
TGAATCTATTATAATGGCTG+TGG 0.587591 7:+66393708 None:intergenic
AAATATGAAGGAGGTTGATG+TGG 0.588845 7:-66398151 None:intergenic
AGAGGAACCTAATCAAATTG+TGG 0.590022 7:+66393804 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACCCTTGGAGTTTCAGCAGG+AGG 0.592436 7:+66397149 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACCTCCTGCTGAAACTCCAA+GGG 0.592910 7:-66397150 None:intergenic
CAGAACAGTTACCCTGCGTA+TGG 0.593728 7:-66396000 None:intergenic
CTTCTCCAGTTGACACTGAG+GGG 0.594288 7:+66395455 MsG0780039591.01.T01:CDS
TACGAAGCGGAGGCTATCCG+AGG 0.594939 7:+66398935 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATGCCATTGAAGCCATACGC+AGG 0.595774 7:+66395988 MsG0780039591.01.T01:CDS
GATCCTTCAATGAACTTGCG+GGG 0.596051 7:-66394357 None:intergenic
GAGCTTACCGGGAAATGGAA+AGG 0.597003 7:+66394389 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCGAATATGTCAACGGATGG+GGG 0.598683 7:+66394444 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCCTTCAGAACTTAGACCAA+AGG 0.599809 7:-66398128 None:intergenic
AATCTATGTTGCTGTGTCAA+AGG 0.602900 7:+66393837 MsG0780039591.01.T01:CDS
AAGAGACCAGGATTCCGGAC+AGG 0.607594 7:-66397480 None:intergenic
ATACAGATGAATTGAATCTG+AGG 0.608486 7:+66396665 MsG0780039591.01.T01:CDS
GCAGAAGATCATATCTGCTG+TGG 0.609538 7:+66396846 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAGTGAGTTCACCAGAAGCA+AGG 0.611270 7:-66397826 None:intergenic
TCGATGTATTGAGTAAGCTA+AGG 0.612045 7:+66397429 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGAGAGAGGCTGAAGATCTG+AGG 0.612665 7:+66396929 MsG0780039591.01.T01:CDS
GGACAAATAAAATATGAAGG+AGG 0.616242 7:-66398160 None:intergenic
AGTTTAAAGAAAATGGGCAT+AGG 0.616624 7:-66399093 None:intergenic
ATTTAACCTATATAAACAAG+AGG 0.617355 7:-66399254 None:intergenic
ATTGAACACTAGCAGGATGG+TGG 0.618695 7:+66395858 MsG0780039591.01.T01:intron
ATGAGTCAGATAGGTTGTCA+AGG 0.618772 7:+66395521 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAATCTGAGGAAAATGGCGG+AGG 0.619896 7:+66396678 MsG0780039591.01.T01:CDS
AATATCTTCGAATATGTCAA+CGG 0.620264 7:+66394437 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGCCATTGAAGCCATACGCA+GGG 0.621582 7:+66395989 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGTTATCCTTGCAGGCAAGA+CGG 0.621693 7:-66397538 None:intergenic
ATTCATCTCACAACACCGCA+AGG 0.622116 7:-66398026 None:intergenic
GATGAATAGGAAGAGCCGGC+CGG 0.622770 7:+66398042 MsG0780039591.01.T01:CDS
GGAGGATATTGGATGCAATG+AGG 0.629485 7:+66398083 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTCTTCTCCAGTTGACACTG+AGG 0.630213 7:+66395453 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCATCTCTAAAGATCGGCGA+AGG 0.630582 7:+66397045 MsG0780039591.01.T01:CDS
CCTTTGGTCTAAGTTCTGAA+GGG 0.631775 7:+66398128 MsG0780039591.01.T01:CDS
GAGAAAGTTGACAAACCTGA+AGG 0.638725 7:-66395550 None:intergenic
AGTTCGGTTCGCGATGTTCG+GGG 0.642047 7:+66393772 MsG0780039591.01.T01:CDS
AGTCGCTAAGCTTACTGACA+AGG 0.642196 7:-66397697 None:intergenic
AAGCGGAGGCTATCCGAGGG+TGG 0.642779 7:+66398939 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATAGAACTTATATCTCAGCA+TGG 0.644335 7:+66394600 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACCTTCATTCAGATGTATGG+AGG 0.645721 7:+66398065 MsG0780039591.01.T01:CDS
GCGTGATAATGCATTGAGAG+AGG 0.646364 7:+66396915 MsG0780039591.01.T01:CDS
AAACCTCACAGTATAGTGCA+TGG 0.648506 7:+66397638 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATCCGAGGGTGGCTTGACAG+TGG 0.648751 7:+66398950 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATCCATTATCATGGCAAACG+CGG 0.649229 7:+66397564 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTTAGATGAACGAAACGTAG+AGG 0.654092 7:+66395264 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGGGCAATACAGAATTCTGG+AGG 0.656083 7:+66393889 MsG0780039591.01.T01:CDS
CATCTGAATGAAGGTCCGGC+CGG 0.657472 7:-66398057 None:intergenic
TCTTCTCCGTCACACCGAAG+TGG 0.659369 7:+66397092 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCAACTCCATGTAACAGGCG+AGG 0.659667 7:+66395481 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACAAAGTTACAAGAACGAGC+GGG 0.660348 7:+66396876 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGTTCGGGGAGAAATTGAAG+AGG 0.660431 7:+66393786 MsG0780039591.01.T01:CDS
ATACTCATAGACAAGAGACC+AGG 0.669398 7:-66397492 None:intergenic
AAACCATCTGCAGCTACATG+CGG 0.669836 7:-66398908 None:intergenic
GAAAGTGTACTATTTGTCAT+CGG 0.675482 7:-66398986 None:intergenic
ACGAAGCGGAGGCTATCCGA+GGG 0.685886 7:+66398936 MsG0780039591.01.T01:CDS
ACTCGAACAAGCTATGTCTG+AGG 0.688480 7:+66395905 MsG0780039591.01.T01:CDS
GGCATTGGGAATAACTAAGG+AGG 0.688662 7:+66397907 MsG0780039591.01.T01:CDS
TTGCAGGCACATGAACAAAG+AGG 0.689192 7:-66393927 None:intergenic
ATTGAATCTGAGGAAAATGG+CGG 0.726865 7:+66396675 MsG0780039591.01.T01:CDS
TCACCATGCACTATACTGTG+AGG 0.743174 7:-66397641 None:intergenic
CAATTACTGAAGATACCACG+TGG 0.750271 7:-66399279 None:intergenic
ATATAGGTTAAATAACCACG+TGG 0.770833 7:+66399264 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR
GATCTCAATCTATTACACTG+GGG 0.776939 7:+66395335 MsG0780039591.01.T01:CDS
TGAATGAAGAAAGATGAGCG+CGG 0.796394 7:-66397612 None:intergenic
GAATTGCAGAGCGAAGAGCG+CGG 0.797222 7:-66399030 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAATATTTTAATTTTAAA+AGG - Chr7:66396049-66396068 None:intergenic 0.0%
!! AAATGATCAAAATAATAATA+TGG - Chr7:66394704-66394723 None:intergenic 10.0%
!!! ATATTTTTAAAAATACTGTT+TGG + Chr7:66396061-66396080 MsG0780039591.01.T01:intron 10.0%
!! ATATACAGTTTAAAGAAAAT+GGG - Chr7:66399102-66399121 None:intergenic 15.0%
!! CAAAATAATAATATGGTTTA+GGG - Chr7:66394697-66394716 None:intergenic 15.0%
!! CTTAATCATTTAAATTATCT+TGG - Chr7:66396133-66396152 None:intergenic 15.0%
!! TCAAAATAATAATATGGTTT+AGG - Chr7:66394698-66394717 None:intergenic 15.0%
!!! TTACAACATATCAATATTTT+AGG - Chr7:66395071-66395090 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTCTTTTGTTTAAAGT+GGG + Chr7:66394325-66394344 MsG0780039591.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTCTTTTGTTTAAAG+TGG + Chr7:66394324-66394343 MsG0780039591.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAGATAATTAAGGTTTGT+AGG + Chr7:66397360-66397379 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!! AAAGAATAAACATCTGATTT+CGG - Chr7:66397851-66397870 None:intergenic 20.0%
!! AAGGTTGTAAAAAAATATAG+TGG - Chr7:66399160-66399179 None:intergenic 20.0%
!! ACTAAAACAAATATAGAGAT+TGG - Chr7:66394888-66394907 None:intergenic 20.0%
!! AGAGAAGAAAAAGATAATTA+AGG + Chr7:66397352-66397371 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!! AGAGTAAATTGAATTTGATT+TGG + Chr7:66393869-66393888 MsG0780039591.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAACAAGAGGATATATAT+AGG - Chr7:66399246-66399265 None:intergenic 20.0%
!! ATTGGACAAATAAAATATGA+AGG - Chr7:66398166-66398185 None:intergenic 20.0%
!! ATTTAACCTATATAAACAAG+AGG - Chr7:66399257-66399276 None:intergenic 20.0%
!! GATATACAGTTTAAAGAAAA+TGG - Chr7:66399103-66399122 None:intergenic 20.0%
!! GGATATGGAAATATATATAA+AGG + Chr7:66397069-66397088 MsG0780039591.01.T01:CDS 20.0%
!! TCACATTCAAAAAGTTTATA+TGG + Chr7:66398602-66398621 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!! TGGTATTTATATCAGTAATT+TGG - Chr7:66395224-66395243 None:intergenic 20.0%
!! TTATACTTAAGAATGAAAAC+AGG - Chr7:66398558-66398577 None:intergenic 20.0%
!! TTTCTTAAGAGTTCTATATA+AGG + Chr7:66399209-66399228 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! AAATCAGATGTTTATTCTTT+TGG + Chr7:66397851-66397870 MsG0780039591.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATGATTAAGCATCATTTT+AGG + Chr7:66396142-66396161 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATATCCTCTTGTTTATAT+AGG + Chr7:66399248-66399267 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! ATGTTTTTAGTTTCATATAG+TGG + Chr7:66394284-66394303 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!!! GAGTAAATTGAATTTGATTT+GGG + Chr7:66393870-66393889 MsG0780039591.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTAATAATAATACACAGTTT+TGG + Chr7:66397759-66397778 MsG0780039591.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTTATTTTGGTTATTCTT+AGG + Chr7:66396297-66396316 MsG0780039591.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTCAAAACTATCATACAA+AGG - Chr7:66397189-66397208 None:intergenic 20.0%
! AAACATTCAAAAGGATTAGA+GGG - Chr7:66396605-66396624 None:intergenic 25.0%
! AATAAAAAAGTCAGGTCAAA+CGG + Chr7:66396104-66396123 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
! AATAAACACTTGTGCTATAA+GGG - Chr7:66398263-66398282 None:intergenic 25.0%
! AATAATAATATGGTTTAGGG+AGG - Chr7:66394694-66394713 None:intergenic 25.0%
! AATATCTTCGAATATGTCAA+CGG + Chr7:66394437-66394456 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
! ACAACTTATGAAATAGCATT+CGG - Chr7:66394836-66394855 None:intergenic 25.0%
! AGAACTCTTAAGAAACAAAA+GGG - Chr7:66399204-66399223 None:intergenic 25.0%
! ATAATAATATGGTTTAGGGA+GGG - Chr7:66394693-66394712 None:intergenic 25.0%
! ATATTATTGAGATTGTTGAC+TGG + Chr7:66397878-66397897 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGAAAGAGAAGATACAAA+AGG - Chr7:66396459-66396478 None:intergenic 25.0%
! CATCAGATAAGAATTATTCT+AGG + Chr7:66394649-66394668 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
! CTACAAATTACTTACTCAAA+GGG - Chr7:66393960-66393979 None:intergenic 25.0%
! CTTAAACCAAACAAATTGTA+GGG - Chr7:66398513-66398532 None:intergenic 25.0%
! GAAAGAAAGATACACAATAT+AGG - Chr7:66398735-66398754 None:intergenic 25.0%
! GAAATGGAGAATATTGAAAA+AGG + Chr7:66394573-66394592 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
! TAATAAACACTTGTGCTATA+AGG - Chr7:66398264-66398283 None:intergenic 25.0%
! TACCTGTTTATAATATGTCT+AGG + Chr7:66399123-66399142 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TAGAACTCTTAAGAAACAAA+AGG - Chr7:66399205-66399224 None:intergenic 25.0%
! TATGGAGAAATAAAAAAGTC+AGG + Chr7:66396096-66396115 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
! TCTTAAACCAAACAAATTGT+AGG - Chr7:66398514-66398533 None:intergenic 25.0%
! TTCCTAGACATATTATAAAC+AGG - Chr7:66399128-66399147 None:intergenic 25.0%
!! TATTATTGAGATTGTTGACT+GGG + Chr7:66397879-66397898 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
!! TGGAATGATAAAAGCTTTTT+AGG + Chr7:66398813-66398832 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
!! TTTAATCCATCTCTAAAGAT+CGG + Chr7:66397039-66397058 MsG0780039591.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACAATTTTGACACCATTTTT+TGG + Chr7:66397394-66397413 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
!!! ACTATGTTTTTCAATGTTTG+TGG + Chr7:66393999-66394018 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
!!! CAACATATCAATATTTTAGG+AGG - Chr7:66395068-66395087 None:intergenic 25.0%
!!! GTGTGATTATCTTTCTTTTT+TGG + Chr7:66399351-66399370 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TTTGATCATTTTTTCGCTAA+TGG + Chr7:66394713-66394732 MsG0780039591.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTATTTCTCCATAGAAG+AGG - Chr7:66396092-66396111 None:intergenic 25.0%
AAGATCTCAATCTATTACAC+TGG + Chr7:66395333-66395352 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
ACCTCAAAAGAAGTGATATA+AGG - Chr7:66399179-66399198 None:intergenic 30.0%
AGAGAAATTGCATATCGAAA+TGG + Chr7:66394557-66394576 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
AGATCTCAATCTATTACACT+GGG + Chr7:66395334-66395353 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
AGTTTAAAGAAAATGGGCAT+AGG - Chr7:66399096-66399115 None:intergenic 30.0%
ATAAATACCATATCAACGCA+GGG + Chr7:66395234-66395253 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
ATAACACACATCCATTATCA+TGG + Chr7:66397555-66397574 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
ATAATAGCTAGTTAGTTACC+TGG - Chr7:66398192-66398211 None:intergenic 30.0%
ATACAGATGAATTGAATCTG+AGG + Chr7:66396665-66396684 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
ATAGAACTTATATCTCAGCA+TGG + Chr7:66394600-66394619 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
ATATAGGTTAAATAACCACG+TGG + Chr7:66399264-66399283 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
ATCGTGAAGATTAGAATTCT+TGG + Chr7:66396565-66396584 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
ATTAACTAATAAACACCACC+GGG - Chr7:66397291-66397310 None:intergenic 30.0%
ATTCTAATCTTCACGATTAG+AGG - Chr7:66396562-66396581 None:intergenic 30.0%
CAAAATCTTTATAGCCACTT+CGG - Chr7:66397109-66397128 None:intergenic 30.0%
CAAACATTCAAAAGGATTAG+AGG - Chr7:66396606-66396625 None:intergenic 30.0%
CACTTATAATTTCCTGATAC+AGG + Chr7:66394527-66394546 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
CATATACAGTTTATCTGCAA+AGG + Chr7:66395016-66395035 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
CCTGATAAGAAACCAAAAAA+TGG - Chr7:66397409-66397428 None:intergenic 30.0%
CTTTGCAGATAAACTGTATA+TGG - Chr7:66395018-66395037 None:intergenic 30.0%
GAAAGATACACAATATAGGA+TGG - Chr7:66398731-66398750 None:intergenic 30.0%
GATTAACTAATAAACACCAC+CGG - Chr7:66397292-66397311 None:intergenic 30.0%
GCTACAAATTACTTACTCAA+AGG - Chr7:66393961-66393980 None:intergenic 30.0%
GGACAAATAAAATATGAAGG+AGG - Chr7:66398163-66398182 None:intergenic 30.0%
GGTGTTTATTAGTTAATCCT+TGG + Chr7:66397294-66397313 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
GTAATAGATTGAGATCTTGA+AGG - Chr7:66395331-66395350 None:intergenic 30.0%
GTATTGTTATCTTGTGTGAA+AGG + Chr7:66396380-66396399 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
GTTGTTATCATAAGTTATCC+TGG + Chr7:66398371-66398390 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TAAATTGTCTTTGCCTATAG+TGG + Chr7:66395178-66395197 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TAGTTAGAGTAGTTAAGAGT+TGG + Chr7:66396222-66396241 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TATAAATACCATATCAACGC+AGG + Chr7:66395233-66395252 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TCACACAAGATAACAATACA+TGG - Chr7:66396379-66396398 None:intergenic 30.0%
TCATCAACCACAATTTGATT+AGG - Chr7:66393814-66393833 None:intergenic 30.0%
TCGTGAAGATTAGAATTCTT+GGG + Chr7:66396566-66396585 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TGAATTGAATCTGAGGAAAA+TGG + Chr7:66396672-66396691 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAAGTTGACATCTTTAT+TGG + Chr7:66397949-66397968 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTCTCTCAGAGATTTAA+GGG - Chr7:66397341-66397360 None:intergenic 30.0%
TTGCAACTTGATAAACTGTT+AGG + Chr7:66396191-66396210 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
TTTCTTCTCTCAGAGATTTA+AGG - Chr7:66397342-66397361 None:intergenic 30.0%
! AATAACCCCAAAACAGTTTT+TGG + Chr7:66398406-66398425 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
! ACCTTATATCACTTCTTTTG+AGG + Chr7:66399175-66399194 MsG0780039591.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! AGTGAGTTGTTAAGTTTGTT+AGG + Chr7:66396261-66396280 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
! ATGCTGATGCTTTGAATAAT+GGG + Chr7:66395835-66395854 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
! GAAAGTGTACTATTTGTCAT+CGG - Chr7:66398989-66399008 None:intergenic 30.0%
! TAATCAAATTGTGGTTGATG+AGG + Chr7:66393813-66393832 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
! TATGCTGATGCTTTGAATAA+TGG + Chr7:66395834-66395853 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGAATGTGAGAAACTCT+GGG - Chr7:66398594-66398613 None:intergenic 30.0%
! TTTTTGAATGTGAGAAACTC+TGG - Chr7:66398595-66398614 None:intergenic 30.0%
!! AGTCTTTAAAATATCCCTCA+AGG + Chr7:66396321-66396340 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
!! GTCTTTAAAATATCCCTCAA+GGG + Chr7:66396322-66396341 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
!! TATTTTTGTACCAGTACACT+TGG - Chr7:66395694-66395713 None:intergenic 30.0%
!! TTTTATTTGTCCAATCTTCC+AGG + Chr7:66398171-66398190 MsG0780039591.01.T01:CDS 30.0%
!!! CCATTTTTTGGTTTCTTATC+AGG + Chr7:66397406-66397425 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTGCTAAGAGTTGTTATTT+TGG + Chr7:66396286-66396305 MsG0780039591.01.T01:intron 30.0%
AACAAATTGTAGGGTCTGTT+TGG - Chr7:66398504-66398523 None:intergenic 35.0%
AACTGTATATGGCAAGAAGA+TGG - Chr7:66395007-66395026 None:intergenic 35.0%
AATCTATGTTGCTGTGTCAA+AGG + Chr7:66393837-66393856 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
AATCTTCACGATTAGAGGAA+TGG - Chr7:66396557-66396576 None:intergenic 35.0%
AATTAACCACTACAGTCTAC+CGG - Chr7:66394205-66394224 None:intergenic 35.0%
AATTTATCATGTGATGTGCC+CGG + Chr7:66394183-66394202 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
AGAGGAACCTAATCAAATTG+TGG + Chr7:66393804-66393823 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
AGGATTAGAGGGTTTATGTT+AGG - Chr7:66396594-66396613 None:intergenic 35.0%
ATATGATAACCTTGCACAGA+AGG - Chr7:66396426-66396445 None:intergenic 35.0%
ATCTTCACGATTAGAGGAAT+GGG - Chr7:66396556-66396575 None:intergenic 35.0%
ATGACATAACAGGAGAATGA+TGG + Chr7:66394940-66394959 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
ATGTAGACAAAAGTTCCCTT+TGG - Chr7:66397794-66397813 None:intergenic 35.0%
ATTGAATCTGAGGAAAATGG+CGG + Chr7:66396675-66396694 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGGCAATACAGAATTC+TGG + Chr7:66393886-66393905 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
CATGATCTTCATACTTATGC+AGG + Chr7:66398871-66398890 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
CCTATAAGAGTGATCAGATT+GGG - Chr7:66397458-66397477 None:intergenic 35.0%
CTTCATTTACTTTGTCTCTC+TGG - Chr7:66396747-66396766 None:intergenic 35.0%
CTTTCCAAACTGATGGAAAA+TGG + Chr7:66398793-66398812 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
GAAGATCCTCATCTTTAATC+AGG - Chr7:66395657-66395676 None:intergenic 35.0%
GAAGATCTGAGGAAAAAACA+AGG + Chr7:66396940-66396959 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
GACATCTTTATTGGATCCTT+TGG + Chr7:66397958-66397977 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
GATCTCAATCTATTACACTG+GGG + Chr7:66395335-66395354 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
GGAATCCGAAAGCTTATTAT+GGG + Chr7:66394621-66394640 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAAATTACAAGTGAGCA+TGG - Chr7:66394815-66394834 None:intergenic 35.0%
GTCTATGAGTATTTGCCAAA+CGG + Chr7:66397503-66397522 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
GTGAAATATGCAGTAGATAC+TGG + Chr7:66397929-66397948 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGTTACAAGAACGAG+CGG + Chr7:66396875-66396894 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TAGCTGAAGCTGAAAAACAA+AGG - Chr7:66398217-66398236 None:intergenic 35.0%
TAGTTAGTTACCTGGAAGAT+TGG - Chr7:66398184-66398203 None:intergenic 35.0%
TCCTATAAGAGTGATCAGAT+TGG - Chr7:66397459-66397478 None:intergenic 35.0%
TCGATGTATTGAGTAAGCTA+AGG + Chr7:66397429-66397448 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGTTATGATACAGGAGT+TGG + Chr7:66396822-66396841 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGGGAAACAAAAATGAA+GGG - Chr7:66394751-66394770 None:intergenic 35.0%
TGCAATACTTTCCAAACTGA+TGG + Chr7:66398786-66398805 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
TGGAATCCGAAAGCTTATTA+TGG + Chr7:66394620-66394639 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TGTTGGATCAATTGCACTAT+CGG - Chr7:66395575-66395594 None:intergenic 35.0%
TTCAGATGTATGGAGGATAT+TGG + Chr7:66398072-66398091 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
TTGATCCTTCAATGAACTTG+CGG - Chr7:66394362-66394381 None:intergenic 35.0%
TTTAGATGAACGAAACGTAG+AGG + Chr7:66395264-66395283 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGGGAACTTTTGTCTACA+TGG + Chr7:66397793-66397812 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
! AACAGACCCTACAATTTGTT+TGG + Chr7:66398504-66398523 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
! AACTCGTCCAAAAACTGTTT+TGG - Chr7:66398416-66398435 None:intergenic 35.0%
! ACTCGTCCAAAAACTGTTTT+GGG - Chr7:66398415-66398434 None:intergenic 35.0%
! ATCGTCTGAAGTTATGATAC+AGG + Chr7:66396816-66396835 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
! CATTCCATTTTCCATCAGTT+TGG - Chr7:66398800-66398819 None:intergenic 35.0%
! GAGAATTCTGAGAACAATTG+AGG - Chr7:66396988-66397007 None:intergenic 35.0%
! TAAGTTCTGATGAGTCAGAT+AGG + Chr7:66395512-66395531 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
! TAATATCCTCGCGATGTTTT+AGG + Chr7:66398662-66398681 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
! TACCAAGAAACTTTTAGACG+CGG + Chr7:66395951-66395970 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTTTATCATGCCATGTGT+CGG + Chr7:66396166-66396185 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
!! AAATATGAAGGAGGTTGATG+TGG - Chr7:66398154-66398173 None:intergenic 35.0%
!! AGAATGACAAGTGTTGATTG+CGG - Chr7:66398695-66398714 None:intergenic 35.0%
!! AGATGGTTTTACTTACGAAG+CGG + Chr7:66398922-66398941 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGTTGTTAAGTTTGTTAGG+TGG + Chr7:66396264-66396283 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGATGATACATTATGCCA+AGG - Chr7:66397314-66397333 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTTCAGCTTCAGCTATT+TGG + Chr7:66398219-66398238 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
!! TTCATTTTTGTTTCCCCTCA+GGG + Chr7:66394751-66394770 MsG0780039591.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTGGAAAACCGATCCAAA+GGG + Chr7:66397776-66397795 MsG0780039591.01.T01:CDS 35.0%
AAAATATCCCTCAAGGGTAG+AGG + Chr7:66396328-66396347 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
AAACCTCACAGTATAGTGCA+TGG + Chr7:66397638-66397657 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
AAGAACAGGTTCTGTGAGTT+CGG + Chr7:66393756-66393775 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
AAGTTATCCTGGAGAGCTTA+TGG + Chr7:66398382-66398401 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
ACAAAGTTACAAGAACGAGC+GGG + Chr7:66396876-66396895 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
ACCTTCATTCAGATGTATGG+AGG + Chr7:66398065-66398084 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
AGATGCTTTAGCCTGTTGAT+TGG - Chr7:66396635-66396654 None:intergenic 40.0%
ATACTCATAGACAAGAGACC+AGG - Chr7:66397495-66397514 None:intergenic 40.0%
ATCCATTATCATGGCAAACG+CGG + Chr7:66397564-66397583 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
ATGAGTCAGATAGGTTGTCA+AGG + Chr7:66395521-66395540 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
ATTAACCACTACAGTCTACC+GGG - Chr7:66394204-66394223 None:intergenic 40.0%
ATTGTAGGGTCTGTTTGGAT+TGG - Chr7:66398499-66398518 None:intergenic 40.0%
CAATTACTGAAGATACCACG+TGG - Chr7:66399282-66399301 None:intergenic 40.0%
CATACATCTGAATGAAGGTC+CGG - Chr7:66398064-66398083 None:intergenic 40.0%
CCAAAAGCAATGACCACTAT+AGG - Chr7:66395194-66395213 None:intergenic 40.0%
CCCAATCTGATCACTCTTAT+AGG + Chr7:66397455-66397474 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
CCTGCAACAATACAAAGAAC+AGG + Chr7:66393742-66393761 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
CCTGTTCTTTGTATTGTTGC+AGG - Chr7:66393745-66393764 None:intergenic 40.0%
CTGAGGAAAAAACAAGGAGA+AGG + Chr7:66396946-66396965 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
CTGAGGGGAAACAAAAATGA+AGG - Chr7:66394752-66394771 None:intergenic 40.0%
CTGCTCCCATAATAAGCTTT+CGG - Chr7:66394629-66394648 None:intergenic 40.0%
CTTCGAATATGTCAACGGAT+GGG + Chr7:66394442-66394461 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGTATTGTTGCAGGCAT+AGG - Chr7:66393739-66393758 None:intergenic 40.0%
GACAAAAGTTCCCTTTGGAT+CGG - Chr7:66397789-66397808 None:intergenic 40.0%
GAGAAAGTTGACAAACCTGA+AGG - Chr7:66395553-66395572 None:intergenic 40.0%
GAGGATATTGGATGCAATGA+GGG + Chr7:66398084-66398103 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
GAGTCACCTGATTAAAGATG+AGG + Chr7:66395648-66395667 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGGTTCAAACATTCAAA+AGG - Chr7:66396614-66396633 None:intergenic 40.0%
GTTTCCATCCAGAATGACAT+TGG - Chr7:66397678-66397697 None:intergenic 40.0%
GTTTGGACTAACCTCTTCTA+TGG + Chr7:66396078-66396097 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
TAATGGGATTGAACACTAGC+AGG + Chr7:66395851-66395870 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
TCCTCCATACATCTGAATGA+AGG - Chr7:66398069-66398088 None:intergenic 40.0%
TCCTTAGTTATTCCCAATGC+CGG - Chr7:66397908-66397927 None:intergenic 40.0%
TCGCGAGGATATTATTCATC+TGG - Chr7:66398656-66398675 None:intergenic 40.0%
TCTTCGAATATGTCAACGGA+TGG + Chr7:66394441-66394460 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
TCTTTATTGGATCCTTTGGC+CGG + Chr7:66397962-66397981 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
TGAATGAAGAAAGATGAGCG+CGG - Chr7:66397615-66397634 None:intergenic 40.0%
TGATCCTTCAATGAACTTGC+GGG - Chr7:66394361-66394380 None:intergenic 40.0%
TTACACTGGGGCAAAATCAT+AGG + Chr7:66395347-66395366 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
TTCGAATATGTCAACGGATG+GGG + Chr7:66394443-66394462 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTGTATAGTGTACGTGA+AGG - Chr7:66397253-66397272 None:intergenic 40.0%
! ACCAAGAAACTTTTAGACGC+GGG + Chr7:66395952-66395971 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
! AGCTTGTTCACATACGTAGA+TGG - Chr7:66394984-66395003 None:intergenic 40.0%
! ATGTGAGAAACTCTGGGAAA+AGG - Chr7:66398588-66398607 None:intergenic 40.0%
! CCTATAGTGGTCATTGCTTT+TGG + Chr7:66395191-66395210 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
! CTCGTCCAAAAACTGTTTTG+GGG - Chr7:66398414-66398433 None:intergenic 40.0%
! GATGCTTTAGCCTGTTGATT+GGG - Chr7:66396634-66396653 None:intergenic 40.0%
! GGTTTTCAACTCCATGTAAC+AGG + Chr7:66395476-66395495 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
! GTTATTTCCATAAGCTCTCC+AGG - Chr7:66398392-66398411 None:intergenic 40.0%
! TCCTTTGGTCTAAGTTCTGA+AGG + Chr7:66398127-66398146 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTGTACCAGTACACTTGG+AGG - Chr7:66395691-66395710 None:intergenic 40.0%
!! ACAGAATTTGGTGTCAGTGT+TGG - Chr7:66395592-66395611 None:intergenic 40.0%
!! CAGTTTGGAAAGTATTGCAC+AGG - Chr7:66398785-66398804 None:intergenic 40.0%
!! CCTTTGGTCTAAGTTCTGAA+GGG + Chr7:66398128-66398147 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTCATTTTTGTTTCCCCTC+AGG + Chr7:66394750-66394769 MsG0780039591.01.T01:intron 40.0%
!! GTTTAGGGAGGGTTTTAATC+TGG - Chr7:66394682-66394701 None:intergenic 40.0%
!! TTATCCATGAAGCACTGACA+CGG - Chr7:66395161-66395180 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTGGAAAACCGATCCAA+AGG + Chr7:66397775-66397794 MsG0780039591.01.T01:CDS 40.0%
AAACCATCTGCAGCTACATG+CGG - Chr7:66398911-66398930 None:intergenic 45.0%
AACTGTTCAGCCTGCACAAA+TGG - Chr7:66397995-66398014 None:intergenic 45.0%
AACTTTCTCCTCTACCCTTG+AGG - Chr7:66396339-66396358 None:intergenic 45.0%
AAGGCCACCTTATACACACA+AGG + Chr7:66395035-66395054 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
ACGAGCTTGCATGACATAAC+AGG + Chr7:66394930-66394949 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
ACTCGAACAAGCTATGTCTG+AGG + Chr7:66395905-66395924 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTCTCCTCTACCCTTGA+GGG - Chr7:66396338-66396357 None:intergenic 45.0%
AGATGGCTTTCCTAGATCTG+AGG - Chr7:66394967-66394986 None:intergenic 45.0%
AGTCGCTAAGCTTACTGACA+AGG - Chr7:66397700-66397719 None:intergenic 45.0%
ATCAAGAAGTCCGAGCTTAC+CGG + Chr7:66394377-66394396 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
ATCCGCGTTTGCCATGATAA+TGG - Chr7:66397569-66397588 None:intergenic 45.0%
ATTCATCTCACAACACCGCA+AGG - Chr7:66398029-66398048 None:intergenic 45.0%
ATTCCCCGCAAGTTCATTGA+AGG + Chr7:66394354-66394373 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
ATTGAACACTAGCAGGATGG+TGG + Chr7:66395858-66395877 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
CAAGTTGCAATACCGACACA+TGG - Chr7:66396181-66396200 None:intergenic 45.0%
CACCAGAAGCAAGGAATTCA+GGG - Chr7:66397820-66397839 None:intergenic 45.0%
CCATCCAGAATGACATTGGA+GGG - Chr7:66397674-66397693 None:intergenic 45.0%
CCCTTCAGAACTTAGACCAA+AGG - Chr7:66398131-66398150 None:intergenic 45.0%
CCTCGTACCTTGTGTGTATA+AGG - Chr7:66395045-66395064 None:intergenic 45.0%
CCTTATACACACAAGGTACG+AGG + Chr7:66395042-66395061 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
CGGACCTTCATTCAGATGTA+TGG + Chr7:66398062-66398081 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
CGTACCTTGTGTGTATAAGG+TGG - Chr7:66395042-66395061 None:intergenic 45.0%
CTCAAAGGGATCATTGTTGC+AGG - Chr7:66393946-66393965 None:intergenic 45.0%
CTCTCAATGCATTATCACGC+TGG - Chr7:66396915-66396934 None:intergenic 45.0%
CTCTCAGAGATTTAAGGGCA+AGG - Chr7:66397336-66397355 None:intergenic 45.0%
CTTGAAGGTCTCACAGAGTT+AGG - Chr7:66395316-66395335 None:intergenic 45.0%
GAAACCCTCCAATGTCATTC+TGG + Chr7:66397667-66397686 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
GATCCTTCAATGAACTTGCG+GGG - Chr7:66394360-66394379 None:intergenic 45.0%
GCAGAAGATCATATCTGCTG+TGG + Chr7:66396846-66396865 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
GCTAGCTGTCATTCCATCAT+TGG - Chr7:66395422-66395441 None:intergenic 45.0%
GGAGGATATTGGATGCAATG+AGG + Chr7:66398083-66398102 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
GTGAGATGAATAGGAAGAGC+CGG + Chr7:66398038-66398057 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGAACCACCCAATCAAC+AGG + Chr7:66396621-66396640 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
TAGACAAGAGACCAGGATTC+CGG - Chr7:66397488-66397507 None:intergenic 45.0%
TCACCAGAAGCAAGGAATTC+AGG - Chr7:66397821-66397840 None:intergenic 45.0%
TCACCATGCACTATACTGTG+AGG - Chr7:66397644-66397663 None:intergenic 45.0%
TCCATCCAGAATGACATTGG+AGG - Chr7:66397675-66397694 None:intergenic 45.0%
TCCCGCGTCTAAAAGTTTCT+TGG - Chr7:66395956-66395975 None:intergenic 45.0%
TCGAATATGTCAACGGATGG+GGG + Chr7:66394444-66394463 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TCTGGTGGTACAAACTCCTT+TGG + Chr7:66398112-66398131 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TCTTCTCCAGTTGACACTGA+GGG + Chr7:66395454-66395473 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TGATGCATTCTCACAGCTCT+CGG - Chr7:66395617-66395636 None:intergenic 45.0%
TGGATGTGTGTTATCCTTGC+AGG - Chr7:66397549-66397568 None:intergenic 45.0%
TGGGCAATACAGAATTCTGG+AGG + Chr7:66393889-66393908 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TGTTATCCTTGCAGGCAAGA+CGG - Chr7:66397541-66397560 None:intergenic 45.0%
TGTTCGGGGAGAAATTGAAG+AGG + Chr7:66393786-66393805 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TTCGCTCTGCAATTCAGGAT+TGG + Chr7:66399038-66399057 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TTCTTCTCCAGTTGACACTG+AGG + Chr7:66395453-66395472 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TTGCAGGCACATGAACAAAG+AGG - Chr7:66393930-66393949 None:intergenic 45.0%
TTGTCAAGGATGAGTCCTTC+AGG + Chr7:66395535-66395554 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TTTATCGCCTCCAAGTGTAC+TGG + Chr7:66395681-66395700 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
TTTCCATTTCCCGGTAAGCT+CGG - Chr7:66394390-66394409 None:intergenic 45.0%
! AAGAGTTATTTCGCCGAGTG+AGG + Chr7:66395392-66395411 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
! ACCGGCATTGGGAATAACTA+AGG + Chr7:66397904-66397923 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
! CGTTTTGCCTTTCCATTTCC+CGG - Chr7:66394399-66394418 None:intergenic 45.0%
! GCGTGATAATGCATTGAGAG+AGG + Chr7:66396915-66396934 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
! GGCATTGGGAATAACTAAGG+AGG + Chr7:66397907-66397926 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
! TTATAGCCACTTCGGTGTGA+CGG - Chr7:66397101-66397120 None:intergenic 45.0%
!! ATGACAAGTGTTGATTGCGG+TGG - Chr7:66398692-66398711 None:intergenic 45.0%
!! CAGACATAGCTTGTTCGAGT+TGG - Chr7:66395905-66395924 None:intergenic 45.0%
!! GAATGATGGACCTCAGATCT+AGG + Chr7:66394954-66394973 MsG0780039591.01.T01:intron 45.0%
!! TGCGGTGTTGTGAGATGAAT+AGG + Chr7:66398029-66398048 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGTTTTACTTACGAAGCGG+AGG + Chr7:66398925-66398944 MsG0780039591.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATTTAAATTTTAATATTCAA+AGG + Chr7:66394118-66394137 MsG0780039591.01.T01:intron 5.0%
AAGATCGGCGAAGGTGGATA+TGG + Chr7:66397054-66397073 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
ACCTCCTGCTGAAACTCCAA+GGG - Chr7:66397153-66397172 None:intergenic 50.0%
ATGCCATTGAAGCCATACGC+AGG + Chr7:66395988-66396007 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
CAACCACTTGTGCTAGATCC+CGG + Chr7:66397270-66397289 MsG0780039591.01.T01:intron 50.0%
CACTCTTATAGGAGCCTGTC+CGG + Chr7:66397466-66397485 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
CAGAACAGTTACCCTGCGTA+TGG - Chr7:66396003-66396022 None:intergenic 50.0%
CAGCTCTCGGCAACAGAATT+TGG - Chr7:66395604-66395623 None:intergenic 50.0%
CATCATTGGCAGACCTCACT+CGG - Chr7:66395408-66395427 None:intergenic 50.0%
CCCTCCAATGTCATTCTGGA+TGG + Chr7:66397671-66397690 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
CGTGTAACCAAACACCCTGA+GGG - Chr7:66394768-66394787 None:intergenic 50.0%
CTTCTCCAGTTGACACTGAG+GGG + Chr7:66395455-66395474 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GAAAACCCCTCAGTGTCAAC+TGG - Chr7:66395463-66395482 None:intergenic 50.0%
GAATCTGAGGAAAATGGCGG+AGG + Chr7:66396678-66396697 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GACCCTGAATTCCTTGCTTC+TGG + Chr7:66397815-66397834 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GAGCTTACCGGGAAATGGAA+AGG + Chr7:66394389-66394408 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GAGTGAGTTCACCAGAAGCA+AGG - Chr7:66397829-66397848 None:intergenic 50.0%
GATGCAATGAGGGCTTCTTC+TGG + Chr7:66398094-66398113 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GGACATCCTAAAACATCGCG+AGG - Chr7:66398671-66398690 None:intergenic 50.0%
GGCGGAGGAAGAACTAAGAA+AGG + Chr7:66396693-66396712 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
GGGATTGAACACTAGCAGGA+TGG + Chr7:66395855-66395874 MsG0780039591.01.T01:intron 50.0%
GTGTAACCAAACACCCTGAG+GGG - Chr7:66394767-66394786 None:intergenic 50.0%
TACCCTGCGTATGGCTTCAA+TGG - Chr7:66395994-66396013 None:intergenic 50.0%
TCAACTCCATGTAACAGGCG+AGG + Chr7:66395481-66395500 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
TCAAGAAGTCCGAGCTTACC+GGG + Chr7:66394378-66394397 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
TCGTGTAACCAAACACCCTG+AGG - Chr7:66394769-66394788 None:intergenic 50.0%
TCTGTACCTCGCCTGTTACA+TGG - Chr7:66395490-66395509 None:intergenic 50.0%
TGAGAGAGGCTGAAGATCTG+AGG + Chr7:66396929-66396948 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
TGCCATTGAAGCCATACGCA+GGG + Chr7:66395989-66396008 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
TTGCATGCCAACAGCATGCA+AGG + Chr7:66397126-66397145 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
! CCATCTCTAAAGATCGGCGA+AGG + Chr7:66397045-66397064 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
! CCTTCGCCGATCTTTAGAGA+TGG - Chr7:66397048-66397067 None:intergenic 50.0%
! GAGATTGTTGACTGGGAGAC+CGG + Chr7:66397886-66397905 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
! GCTTTAGCCTGTTGATTGGG+TGG - Chr7:66396631-66396650 None:intergenic 50.0%
! TCTCTAAAGATCGGCGAAGG+TGG + Chr7:66397048-66397067 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
! TGAGTTCGGTTCGCGATGTT+CGG + Chr7:66393770-66393789 MsG0780039591.01.T01:CDS 50.0%
! TTAGGCACTTGCTGCAGCAA+AGG - Chr7:66395298-66395317 None:intergenic 50.0%
! TTGTTTCCCCTCAGGGTGTT+TGG + Chr7:66394758-66394777 MsG0780039591.01.T01:intron 50.0%
!! GAAAGGAGAGTGCTCCTTTG+CGG + Chr7:66396397-66396416 MsG0780039591.01.T01:intron 50.0%
AAGAGACCAGGATTCCGGAC+AGG - Chr7:66397483-66397502 None:intergenic 55.0%
ACCCTTGGAGTTTCAGCAGG+AGG + Chr7:66397149-66397168 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
AGGACCCTTGGAGTTTCAGC+AGG + Chr7:66397146-66397165 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
AGTCCGAGCTTACCGGGAAA+TGG + Chr7:66394384-66394403 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
ATGTGCCCGGTAGACTGTAG+TGG + Chr7:66394196-66394215 MsG0780039591.01.T01:intron 55.0%
CAACAGCATGCAAGGACCCT+TGG + Chr7:66397134-66397153 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
CAAGGGTCCTTGCATGCTGT+TGG - Chr7:66397136-66397155 None:intergenic 55.0%
CACCTCCTGCTGAAACTCCA+AGG - Chr7:66397154-66397173 None:intergenic 55.0%
CATCTGAATGAAGGTCCGGC+CGG - Chr7:66398060-66398079 None:intergenic 55.0%
CGAGTGAGGTCTGCCAATGA+TGG + Chr7:66395406-66395425 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
CGCTCTTCGCTCTGCAATTC+AGG + Chr7:66399033-66399052 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
CGGGATCTAGCACAAGTGGT+TGG - Chr7:66397272-66397291 None:intergenic 55.0%
CGGTCTTCAAGGCTTCCGTT+TGG - Chr7:66397521-66397540 None:intergenic 55.0%
CTGCACAAATGGCCAGTCTC+CGG - Chr7:66397984-66398003 None:intergenic 55.0%
GAATTGCAGAGCGAAGAGCG+CGG - Chr7:66399033-66399052 None:intergenic 55.0%
GATCCGCATGTAGCTGCAGA+TGG + Chr7:66398905-66398924 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
GATGAATAGGAAGAGCCGGC+CGG + Chr7:66398042-66398061 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
GCAATGAGGGCTTCTTCTGG+TGG + Chr7:66398097-66398116 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
GGCTGAACAGTTAGCTCGCT+TGG + Chr7:66398003-66398022 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
GTGTCCGTGTCAGTGCTTCA+TGG + Chr7:66395154-66395173 MsG0780039591.01.T01:intron 55.0%
GTTTCAGCAGGAGGTGAGGA+TGG + Chr7:66397158-66397177 MsG0780039591.01.T01:intron 55.0%
TCTCTGCTCGCACCTGTATC+AGG - Chr7:66394542-66394561 None:intergenic 55.0%
TCTTCTCCGTCACACCGAAG+TGG + Chr7:66397092-66397111 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
TGAAGACCGTCTTGCCTGCA+AGG + Chr7:66397532-66397551 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
TGCACAGAAGGCTACCGCAA+AGG - Chr7:66396414-66396433 None:intergenic 55.0%
TGCAGGCAAGACGGTCTTCA+AGG - Chr7:66397532-66397551 None:intergenic 55.0%
TGGAGTTTCAGCAGGAGGTG+AGG + Chr7:66397154-66397173 MsG0780039591.01.T01:intron 55.0%
TTGACTGGGAGACCGGCATT+GGG + Chr7:66397893-66397912 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
TTGCGGTAGCCTTCTGTGCA+AGG + Chr7:66396414-66396433 MsG0780039591.01.T01:intron 55.0%
! AGTTCGGTTCGCGATGTTCG+GGG + Chr7:66393772-66393791 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
! CTGCGATCCCTGCGTTGATA+TGG - Chr7:66395244-66395263 None:intergenic 55.0%
! GAGTTCGGTTCGCGATGTTC+GGG + Chr7:66393771-66393790 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
!! AGTTAGCTCGCTTGGCCTTG+CGG + Chr7:66398011-66398030 MsG0780039591.01.T01:CDS 55.0%
AATGGCCAGTCTCCGGCCAA+AGG - Chr7:66397977-66397996 None:intergenic 60.0%
ACGAAGCGGAGGCTATCCGA+GGG + Chr7:66398936-66398955 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
ATCCGAGGGTGGCTTGACAG+TGG + Chr7:66398950-66398969 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
CCACCGGGATCTAGCACAAG+TGG - Chr7:66397276-66397295 None:intergenic 60.0%
CCACTTGTGCTAGATCCCGG+TGG + Chr7:66397273-66397292 MsG0780039591.01.T01:intron 60.0%
GACCACTGTCAAGCCACCCT+CGG - Chr7:66398955-66398974 None:intergenic 60.0%
GTTGACTGGGAGACCGGCAT+TGG + Chr7:66397892-66397911 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
TACGAAGCGGAGGCTATCCG+AGG + Chr7:66398935-66398954 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
TAGGAGCCTGTCCGGAATCC+TGG + Chr7:66397474-66397493 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
TGGATCCTTTGGCCGGAGAC+TGG + Chr7:66397969-66397988 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
! CGGAGACTGGCCATTTGTGC+AGG + Chr7:66397982-66398001 MsG0780039591.01.T01:CDS 60.0%
AAGCGGAGGCTATCCGAGGG+TGG + Chr7:66398939-66398958 MsG0780039591.01.T01:CDS 65.0%
! CAGAGCGAAGAGCGCGGTTG+GGG - Chr7:66399027-66399046 None:intergenic 65.0%
! GCAGAGCGAAGAGCGCGGTT+GGG - Chr7:66399028-66399047 None:intergenic 65.0%
! TGCAGAGCGAAGAGCGCGGT+TGG - Chr7:66399029-66399048 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 66393721 66399370 66393721 ID=MsG0780039591.01;Name=MsG0780039591.01
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Chr7 exon 66394140 66394204 66394140 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10553;Parent=MsG0780039591.01.T01
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Chr7 exon 66394549 66394670 66394549 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10555;Parent=MsG0780039591.01.T01
Chr7 exon 66395255 66395702 66395255 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10556;Parent=MsG0780039591.01.T01
Chr7 exon 66395873 66396010 66395873 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10557;Parent=MsG0780039591.01.T01
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Chr7 exon 66397428 66398192 66397428 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10559;Parent=MsG0780039591.01.T01
Chr7 exon 66398893 66399330 66398893 ID=MsG0780039591.01.T01:exon:10560;Parent=MsG0780039591.01.T01
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Chr7 three_prime_UTR 66399076 66399330 66399076 ID=MsG0780039591.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780039591.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 66399351 66399370 66399351 ID=MsG0780039591.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780039591.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039591.01.T01

ATGGCTGTGGTGAGTCCTATGCCTGCAACAATACAAAGAACAGGTTCTGTGAGTTCGGTTCGCGATGTTCGGGGAGAAATTGAAGAGGAACCTAATCAAATTGTGGTTGATGAGGTAATCTATGTTGCTGTGTCAAAGGATGTAAAAGAGAGTAAATTGAATTTGATTTGGGCAATACAGAATTCTGGAGGAAAAAAGATCTGTATCCTCTTTGTTCATGTGCCTGCAACAATGATCCCTTTGAGTAAGTTTATGTTACTACTTTATGATATTGTTGTGTTGAATTTGTCAAATTTATCATGTGATGTGCCCGTGGGTGCTAAATTCCCCGCAAGTTCATTGAAGGATCAAGAAGTCCGAGCTTACCGGGAAATGGAAAGGCAAAACGTGCATAAGACTCTTGATGAATATCTTCGAATATGTCAACGGATGGGGGTGCGAGCAGAGAAATTGCATATCGAAATGGAGAATATTGAAAAAGGAATAATAGAACTTATATCTCAGCATGGAATCCGAAAGCTTATTATGGGAGCAGCATCAGATAAGAATTATTCTAGGGATCGCAGTTTAGATGAACGAAACGTAGAGGTTGCATCTCCTTTGCTGCAGCAAGTGCCTAACTCTGTGAGACCTTCAAGATCTCAATCTATTACACTGGGGCAAAATCATAGGACAGATTCAATAAGTTCTTCTCAAGAGTTATTTCGCCGAGTGAGGTCTGCCAATGATGGAATGACAGCTAGCATCACAACTAATTCTTCTCCAGTTGACACTGAGGGGTTTTCAACTCCATGTAACAGGCGAGGTACAGAAGTAAGTTCTGATGAGTCAGATAGGTTGTCAAGGATGAGTCCTTCAGGTTTGTCAACTTTCTCCGATAGTGCAATTGATCCAACACTGACACCAAATTCTGTTGCCGAGAGCTGTGAGAATGCATCAGACTTGACTTTGAGTCACCTGATTAAAGATGAGGATCTTCGTCATTTATCGCCTCCAAGTGTACTGGATGGTGGAGTGAACGATACGCTCTATGACCAACTCGAACAAGCTATGTCTGAGGCTAACAATGCTACTCGACATGCATACCAAGAAACTTTTAGACGCGGGAAAGCTGAAAAAGATGCCATTGAAGCCATACGCAGGGCTAAAGCATCTGAAAGCTTATATACAGATGAATTGAATCTGAGGAAAATGGCGGAGGAAGAACTAAGAAAGGAAAAAGAAGAACTTGAGAGTGTGACGAGCCAGAGAGACAAAGTAAATGAAGAACTTCAACTTGCTGTTGATCTGAAGTCATCACTTGAGAGTCAGCTTGCATCGTCTGAAGTTATGATACAGGAGTTGGAGCAGAAGATCATATCTGCTGTGGAGCTGTTACAAAGTTACAAGAACGAGCGGGATGAATTGCAGATCCAGCGTGATAATGCATTGAGAGAGGCTGAAGATCTGAGGAAAAAACAAGGAGAAGGCTCAAGCACTCATGTGCCTCAATTGTTCTCAGAATTCTCTTTTTCAGAAATCGAAGAAGCAACAAGTAACTTTAATCCATCTCTAAAGATCGGCGAAGGTGGATATGGAAATATATATAAAGGTCTTCTCCGTCACACCGAAGTGGCTATAAAGATTTTGCATGCCAACAGCATGCAAGGACCCTTGGAGTTTCAGCAGGAGGTCGATGTATTGAGTAAGCTAAGGCATCCCAATCTGATCACTCTTATAGGAGCCTGTCCGGAATCCTGGTCTCTTGTCTATGAGTATTTGCCAAACGGAAGCCTTGAAGACCGTCTTGCCTGCAAGGATAACACACATCCATTATCATGGCAAACGCGGATTCGAATTGCTGCAGAACTCTGCTCCGCGCTCATCTTTCTTCATTCAAGTAAACCTCACAGTATAGTGCATGGTGACTTGAAACCCTCCAATGTCATTCTGGATGGAAACCTTGTCAGTAAGCTTAGCGACTTTGGAATCTGTCGCATATTATCAAATTACGAGAATTCTAGTAATAATAATACACAGTTTTGGAAAACCGATCCAAAGGGAACTTTTGTCTACATGGACCCTGAATTCCTTGCTTCTGGTGAACTCACTCCGAAATCAGATGTTTATTCTTTTGGAATCATATTATTGAGATTGTTGACTGGGAGACCGGCATTGGGAATAACTAAGGAGGTGAAATATGCAGTAGATACTGGAAAGTTGACATCTTTATTGGATCCTTTGGCCGGAGACTGGCCATTTGTGCAGGCTGAACAGTTAGCTCGCTTGGCCTTGCGGTGTTGTGAGATGAATAGGAAGAGCCGGCCGGACCTTCATTCAGATGTATGGAGGATATTGGATGCAATGAGGGCTTCTTCTGGTGGTACAAACTCCTTTGGTCTAAGTTCTGAAGGGCCACATCAACCTCCTTCATATTTTATTTGTCCAATCTTCCAGGAAGTCATGCGAGATCCGCATGTAGCTGCAGATGGTTTTACTTACGAAGCGGAGGCTATCCGAGGGTGGCTTGACAGTGGTCATGACACTTCACCGATGACAAATAGTACACTTTCACATCAGAATTTAGTCCCCAACCGCGCTCTTCGCTCTGCAATTCAGGATTGGCTTCAAAGTCACTGA
Protein sequence

>MsG0780039591.01.T01

MAVVSPMPATIQRTGSVSSVRDVRGEIEEEPNQIVVDEVIYVAVSKDVKESKLNLIWAIQNSGGKKICILFVHVPATMIPLSKFMLLLYDIVVLNLSNLSCDVPVGAKFPASSLKDQEVRAYREMERQNVHKTLDEYLRICQRMGVRAEKLHIEMENIEKGIIELISQHGIRKLIMGAASDKNYSRDRSLDERNVEVASPLLQQVPNSVRPSRSQSITLGQNHRTDSISSSQELFRRVRSANDGMTASITTNSSPVDTEGFSTPCNRRGTEVSSDESDRLSRMSPSGLSTFSDSAIDPTLTPNSVAESCENASDLTLSHLIKDEDLRHLSPPSVLDGGVNDTLYDQLEQAMSEANNATRHAYQETFRRGKAEKDAIEAIRRAKASESLYTDELNLRKMAEEELRKEKEELESVTSQRDKVNEELQLAVDLKSSLESQLASSEVMIQELEQKIISAVELLQSYKNERDELQIQRDNALREAEDLRKKQGEGSSTHVPQLFSEFSFSEIEEATSNFNPSLKIGEGGYGNIYKGLLRHTEVAIKILHANSMQGPLEFQQEVDVLSKLRHPNLITLIGACPESWSLVYEYLPNGSLEDRLACKDNTHPLSWQTRIRIAAELCSALIFLHSSKPHSIVHGDLKPSNVILDGNLVSKLSDFGICRILSNYENSSNNNTQFWKTDPKGTFVYMDPEFLASGELTPKSDVYSFGIILLRLLTGRPALGITKEVKYAVDTGKLTSLLDPLAGDWPFVQAEQLARLALRCCEMNRKSRPDLHSDVWRILDAMRASSGGTNSFGLSSEGPHQPPSYFICPIFQEVMRDPHVAADGFTYEAEAIRGWLDSGHDTSPMTNSTLSHQNLVPNRALRSAIQDWLQSH*