AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039728.01

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MsG0780039728.01.T01 AT5G61560 32.500 120 64 3 225 341 685 790 6.86e-12 69.3
MsG0780039728.01.T01 AT5G61560 32.500 120 64 3 225 341 683 788 7.03e-12 69.3
MsG0780039728.01.T01 AT2G45720 26.296 270 191 4 379 646 162 425 1.08e-11 68.2
MsG0780039728.01.T01 AT2G45720 26.296 270 191 4 379 646 162 425 1.08e-11 68.2
MsG0780039728.01.T01 AT2G45720 26.296 270 191 4 379 646 162 425 1.08e-11 68.2
MsG0780039728.01.T01 AT2G45720 26.296 270 191 4 379 646 162 425 1.08e-11 68.2
MsG0780039728.01.T01 AT2G45720 26.296 270 191 4 379 646 162 425 1.08e-11 68.2
MsG0780039728.01.T01 AT3G49060 45.455 66 36 0 276 341 726 791 2.49e-11 67.4
MsG0780039728.01.T01 AT3G49060 45.455 66 36 0 276 341 736 801 2.57e-11 67.4
MsG0780039728.01.T01 AT3G49060 45.455 66 36 0 276 341 703 768 2.65e-11 67.4
MsG0780039728.01.T01 AT5G50900 28.488 172 121 1 371 540 149 320 3.71e-11 66.6
MsG0780039728.01.T01 AT4G25160 41.026 78 43 2 264 341 757 831 5.17e-11 66.6
MsG0780039728.01.T01 AT1G68940 25.641 234 148 6 266 491 288 503 5.66e-11 66.6
MsG0780039728.01.T01 AT1G68940 25.641 234 148 6 266 491 235 450 6.07e-11 66.2
MsG0780039728.01.T01 AT1G68940 25.641 234 148 6 266 491 288 503 6.50e-11 66.2
MsG0780039728.01.T01 AT5G61550 32.283 127 71 4 225 351 739 850 9.31e-11 65.9

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GACATAATTTCAAGTGTTAT+TGG 0.211508 7:-68181798 None:intergenic
CAAACACATGTTGCCTCTTA+TGG 0.212487 7:+68180472 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCAAACATGGAATTTCTTCT+TGG 0.230264 7:-68182464 None:intergenic
AGCTTTACTTCAATTGTTAA+AGG 0.235604 7:+68182974 MsG0780039728.01.T01:CDS
GCTGCACATTCCTTGTTCTT+TGG 0.262492 7:-68183128 None:intergenic
ATAATAGAAGTGTTGGAAAA+TGG 0.285128 7:+68182732 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCAAGAAGAAATTCCATGTT+TGG 0.295569 7:+68182464 MsG0780039728.01.T01:CDS
TGTAATAAATTTACCAAAGC+TGG 0.326531 7:-68182849 None:intergenic
TTGGTAAATTTATTACAAAA+TGG 0.326549 7:+68182855 MsG0780039728.01.T01:CDS
GCTTGGAAGAAGCACTTCTT+TGG 0.328604 7:+68181752 MsG0780039728.01.T01:CDS
CTTCTTCCAAGCATCTTATT+AGG 0.336614 7:-68181741 None:intergenic
TTCCTCGAAACGGCGTTGTT+TGG 0.340973 7:+68180522 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTACAAAATGGAACAGTTAG+AGG 0.342439 7:+68182867 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCAACCTCATGCCTCCCTTC+AGG 0.349557 7:-68183056 None:intergenic
GTCAAATGGGATTCCAGCTT+TGG 0.350357 7:+68182836 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTCAGCAATTAAATTTCTTA+AGG 0.357358 7:-68182370 None:intergenic
CGAAGAAAAGCGCATCTCTA+AGG 0.359752 7:-68180553 None:intergenic
TCCGAAGACAAGGCAGCCTT+TGG 0.394785 7:+68182320 MsG0780039728.01.T01:CDS
GAGGTTGTAGGAATGTCAAA+TGG 0.401695 7:+68182822 MsG0780039728.01.T01:CDS
AACCAAACAACGCCGTTTCG+AGG 0.411594 7:-68180524 None:intergenic
AAATTTCTTAAGGCACAGTT+TGG 0.411871 7:-68182360 None:intergenic
TGGCCACTTGCAATAATAAC+AGG 0.415456 7:-68181825 None:intergenic
ACTTTGGCAGCACTTCAGTT+TGG 0.417472 7:+68183191 MsG0780039728.01.T01:CDS
ATCGAATCGGTGGTTCAATT+CGG 0.419143 7:+68180398 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCCAAAGGCTGCCTTGTCTT+CGG 0.419783 7:-68182321 None:intergenic
ACAACGCCGTTTCGAGGAAC+AGG 0.427957 7:-68180518 None:intergenic
GATGAAAATAAAGAGGTTGT+AGG 0.431054 7:+68182810 MsG0780039728.01.T01:CDS
TAGCTCTCTCTTTATTTGCA+TGG 0.433322 7:-68182932 None:intergenic
ATTGTTAAAGGACAGAAACT+TGG 0.435496 7:+68182986 MsG0780039728.01.T01:CDS
GCCATGCCTAATAAGATGCT+TGG 0.439094 7:+68181735 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCCAACACTTCTATTATAGC+TGG 0.443786 7:-68182726 None:intergenic
TTCCGATGAAGTAAAAGAAC+AGG 0.446755 7:+68180893 MsG0780039728.01.T01:CDS
CTTGTTGAGTTTACTAGAGA+AGG 0.448455 7:+68183101 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCACCGATTCGATGAGTCCT+TGG 0.449883 7:-68180388 None:intergenic
TAAGAAATTTAATTGCTGAA+TGG 0.452536 7:+68182373 MsG0780039728.01.T01:CDS
CAATGGTGTGGTGGTGGTGG+AGG 0.458616 7:+68180361 MsG0780039728.01.T01:CDS
ATGCAATGGTGTGGTGGTGG+TGG 0.460589 7:+68180358 MsG0780039728.01.T01:CDS
AAATAAAACTGTACCTATAG+AGG 0.463139 7:-68183333 None:intergenic
AACCTTGTTAGAGAAAGAAA+AGG 0.469867 7:+68181612 MsG0780039728.01.T01:CDS
CTACTTGTGTTGACTCCTGA+AGG 0.474106 7:+68183041 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCCAGCTATAATAGAAGTGT+TGG 0.478569 7:+68182725 MsG0780039728.01.T01:CDS
GAAACGGCGTTGTTTGGTTG+AGG 0.484598 7:+68180528 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCTTTCGATAATGGCACTAT+CGG 0.487902 7:-68181526 None:intergenic
GAGGTAGAAACATTGGCTGT+TGG 0.489533 7:+68181588 MsG0780039728.01.T01:CDS
AAAGAGAGAGCTATAAAAGC+TGG 0.489962 7:+68182942 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGGCTGCCTTGTCTTCGGAC+AGG 0.490475 7:-68182316 None:intergenic
TATGATAGGATTTGTACTAA+TGG 0.494085 7:-68182606 None:intergenic
AGCTAATGCACGTGCAACTC+AGG 0.495077 7:+68181418 MsG0780039728.01.T01:CDS
TGTTATTATTGCAAGTGGCC+AGG 0.495390 7:+68181827 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCCAAGCATCTTATTAGGCA+TGG 0.497480 7:-68181736 None:intergenic
TTGATTGAGATTAAAGAAAG+TGG 0.499336 7:+68183227 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCGCGAAGGTCTTCCATAAG+AGG 0.499928 7:-68180485 None:intergenic
ATGAAACAGGTGACTTTCAA+TGG 0.506498 7:+68180262 None:intergenic
ACCTTCTTAACAGATTCAAA+AGG 0.513046 7:+68181667 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGGTTGTAGGAATGTCAAAT+GGG 0.515034 7:+68182823 MsG0780039728.01.T01:CDS
AATGATTGATGAAAATAAAG+AGG 0.519990 7:+68182803 MsG0780039728.01.T01:CDS
AACAGATTCAAAAGGACTGC+AGG 0.520736 7:+68181675 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGAGCTAGCAATGGATATGA+TGG 0.525717 7:+68181473 MsG0780039728.01.T01:CDS
ATTCAAAAGGACTGCAGGCA+TGG 0.529095 7:+68181680 MsG0780039728.01.T01:CDS
TCCATCAAAGACATATGAAA+GGG 0.529147 7:+68182257 MsG0780039728.01.T01:intron
GGTGTGCCTTGTGATGAATT+AGG 0.529466 7:+68180867 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTGTTGAGTTTACTAGAGAA+GGG 0.533693 7:+68183102 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTCCATCAAAGACATATGAA+AGG 0.536197 7:+68182256 MsG0780039728.01.T01:intron
TACAAAATGGAACAGTTAGA+GGG 0.549728 7:+68182868 MsG0780039728.01.T01:CDS
CAACTTAGAACATCAAAGAA+AGG 0.556469 7:+68182506 MsG0780039728.01.T01:CDS
GTTCTAAGTTGATCGACGAT+AGG 0.558574 7:-68182494 None:intergenic
TTAGGCATGGGAAGGTGAGA+TGG 0.558729 7:+68180794 MsG0780039728.01.T01:intron
GATCCAAGGACTCATCGAAT+CGG 0.565695 7:+68180385 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTGTTAAAGGACAGAAACTT+GGG 0.566313 7:+68182987 MsG0780039728.01.T01:CDS
CGTCATCCTGTTCCTCGAAA+CGG 0.567042 7:+68180512 MsG0780039728.01.T01:CDS
ACCTTGTTAGAGAAAGAAAA+GGG 0.568955 7:+68181613 MsG0780039728.01.T01:CDS
GATCCTGTTATTATTGCAAG+TGG 0.569659 7:+68181822 MsG0780039728.01.T01:CDS
GGATCTTGAGGTAGAAACAT+TGG 0.571196 7:+68181581 MsG0780039728.01.T01:CDS
AATGGAAGGAACAGAAGAGA+GGG 0.575343 7:+68180280 MsG0780039728.01.T01:exon
GGTTATGATCAAATTTCAGA+AGG 0.576249 7:+68180815 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCTGAAGGGAGGCATGAGGT+TGG 0.577701 7:+68183056 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTGTTGAAATTGTGTAGCCA+AGG 0.579205 7:+68180584 MsG0780039728.01.T01:CDS
GATAGGATTTGTACTAATGG+TGG 0.579251 7:-68182603 None:intergenic
TCACAGTGTTGAGGATCTTG+AGG 0.580007 7:+68181569 MsG0780039728.01.T01:CDS
ACGTGCAACTCAGGAGGGCA+AGG 0.580025 7:+68181427 MsG0780039728.01.T01:CDS
AAGGCACACCATCAAAAGCT+TGG 0.581211 7:-68180854 None:intergenic
GTTGGAAAATGGAAGTATTG+TGG 0.585943 7:+68182743 MsG0780039728.01.T01:CDS
AACAGGTGACTTTCAATGGA+AGG 0.586665 7:+68180266 None:intergenic
ACAAAACCTGTCCGAAGACA+AGG 0.586908 7:+68182310 MsG0780039728.01.T01:CDS
GGAAGGAACAGAAGAGAGGG+AGG 0.596520 7:+68180283 MsG0780039728.01.T01:CDS
TACTTGTGTTGACTCCTGAA+GGG 0.600412 7:+68183042 MsG0780039728.01.T01:CDS
GTTGGAGCTTCACAGTGTTG+AGG 0.602329 7:+68181560 MsG0780039728.01.T01:CDS
TAATGCACGTGCAACTCAGG+AGG 0.604700 7:+68181421 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGAAGGGACTCCAAAGAACA+AGG 0.610142 7:+68183118 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGAATGCAATGGTGTGGTGG+TGG 0.611482 7:+68180355 MsG0780039728.01.T01:CDS
CAGGATGACGAAGGTCGCGA+AGG 0.612050 7:-68180499 None:intergenic
TGTGTTTGAAACGACGAGCG+AGG 0.614739 7:-68180457 None:intergenic
AAAGGGAAAGCATAGAGAAG+TGG 0.617041 7:+68182274 MsG0780039728.01.T01:CDS
CTATGATTAGTTACTACATG+TGG 0.621984 7:+68183478 MsG0780039728.01.T01:three_prime_UTR
CCGATAGTGCCATTATCGAA+AGG 0.622407 7:+68181526 MsG0780039728.01.T01:CDS
CAATGGAAGGAACAGAAGAG+AGG 0.623216 7:+68180279 MsG0780039728.01.T01:exon
AGAACCAGAACCAAGCAACC+CGG 0.629178 7:+68180313 MsG0780039728.01.T01:CDS
CCAAGGACTCATCGAATCGG+TGG 0.636194 7:+68180388 MsG0780039728.01.T01:CDS
ACAAGACATAGAGCTAGCAA+TGG 0.643295 7:+68181464 MsG0780039728.01.T01:CDS
AATGCACGTGCAACTCAGGA+GGG 0.649570 7:+68181422 MsG0780039728.01.T01:CDS
GTGGTGGTGGAGGAGATCCA+AGG 0.649832 7:+68180371 MsG0780039728.01.T01:CDS
CGAAGAATGCAATGGTGTGG+TGG 0.651605 7:+68180352 MsG0780039728.01.T01:CDS
ATCATCATCAAAGATAACAT+CGG 0.668304 7:-68181709 None:intergenic
ATTGGACACAGAAACTCATG+AGG 0.669256 7:-68181780 None:intergenic
GAAATTCCTAATTCATCACA+AGG 0.670041 7:-68180873 None:intergenic
GCTAATTGAAGATGTTCCAA+AGG 0.672940 7:-68182336 None:intergenic
TTGTGTTGACTCCTGAAGGG+AGG 0.680618 7:+68183045 MsG0780039728.01.T01:CDS
GACTCCTGAAGGGAGGCATG+AGG 0.693867 7:+68183052 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTCGAGGAACAGGATGACGA+AGG 0.707878 7:-68180508 None:intergenic
GTGGTACAAATAGAGCACAA+AGG 0.710749 7:+68183246 MsG0780039728.01.T01:CDS
CTTAGAACATCAAAGAAAGG+CGG 0.713277 7:+68182509 MsG0780039728.01.T01:CDS
GCTAGCAATGGATATGATGG+TGG 0.719121 7:+68181476 MsG0780039728.01.T01:CDS
AATGAAGACGAAGAATGCAA+TGG 0.723105 7:+68180344 MsG0780039728.01.T01:CDS
AGACGAAGAATGCAATGGTG+TGG 0.734591 7:+68180349 MsG0780039728.01.T01:CDS
TTGGACACAGAAACTCATGA+GGG 0.736149 7:-68181779 None:intergenic
GCGAATACAGAAGAACACAA+AGG 0.740376 7:+68180420 MsG0780039728.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAACTTATATCAAAAGA+AGG + Chr7:68182696-68182715 MsG0780039728.01.T01:CDS 15.0%
!! TCAATATATAATTATGTCTA+TGG + Chr7:68180991-68181010 MsG0780039728.01.T01:intron 15.0%
!! TGAAATAATGTTATATACTT+TGG + Chr7:68181381-68181400 MsG0780039728.01.T01:intron 15.0%
!! TTCGTATTATAAATTTGATT+CGG + Chr7:68182018-68182037 MsG0780039728.01.T01:intron 15.0%
!! TTGGTAAATTTATTACAAAA+TGG + Chr7:68182855-68182874 MsG0780039728.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATGTGTAATTATTAAGAG+CGG - Chr7:68181167-68181186 None:intergenic 20.0%
!! AATGATTGATGAAAATAAAG+AGG + Chr7:68182803-68182822 MsG0780039728.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTAGTCATATTTATGAAAA+TGG + Chr7:68181916-68181935 MsG0780039728.01.T01:intron 20.0%
!! CTATATAATAATGCTAACAA+AGG + Chr7:68182196-68182215 MsG0780039728.01.T01:intron 20.0%
!! TAAGAAATTTAATTGCTGAA+TGG + Chr7:68182373-68182392 MsG0780039728.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCAGCAATTAAATTTCTTA+AGG - Chr7:68182373-68182392 None:intergenic 20.0%
!!! AAGTAATTCATCTTTTACTT+TGG + Chr7:68183175-68183194 MsG0780039728.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTACACTTTTAACTATACT+TGG - Chr7:68183439-68183458 None:intergenic 20.0%
!!! CAATTTTAGATCTCATAAAA+AGG + Chr7:68183279-68183298 MsG0780039728.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTGAATAACTGAAGTATT+TGG + Chr7:68181222-68181241 MsG0780039728.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTCTTTTATTTTTGAATC+TGG - Chr7:68182633-68182652 None:intergenic 20.0%
!!! TTGATTATGTTTTGATGAAT+AGG + Chr7:68180744-68180763 MsG0780039728.01.T01:intron 20.0%
! AAATAAAACTGTACCTATAG+AGG - Chr7:68183336-68183355 None:intergenic 25.0%
! AATGCATATATTTGTGAATG+CGG - Chr7:68181049-68181068 None:intergenic 25.0%
! AGCTTTACTTCAATTGTTAA+AGG + Chr7:68182974-68182993 MsG0780039728.01.T01:CDS 25.0%
! ATCATCATCAAAGATAACAT+CGG - Chr7:68181712-68181731 None:intergenic 25.0%
! TATGATAGGATTTGTACTAA+TGG - Chr7:68182609-68182628 None:intergenic 25.0%
! TATTGAATAACTGGTGTATT+TGG - Chr7:68181261-68181280 None:intergenic 25.0%
! TCTATGATTTCTCTTCTTTA+AGG + Chr7:68180695-68180714 MsG0780039728.01.T01:intron 25.0%
! TGTAATAAATTTACCAAAGC+TGG - Chr7:68182852-68182871 None:intergenic 25.0%
! TTGATTGAGATTAAAGAAAG+TGG + Chr7:68183227-68183246 MsG0780039728.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTAGGTTTATTGAATAAC+TGG - Chr7:68181270-68181289 None:intergenic 25.0%
!! GACATAATTTCAAGTGTTAT+TGG - Chr7:68181801-68181820 None:intergenic 25.0%
!! TTGTTGCTTATAATAGTGAT+CGG + Chr7:68181297-68181316 MsG0780039728.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTTGAATCTGGATATGAT+AGG - Chr7:68182623-68182642 None:intergenic 25.0%
!!! AACTTTCTTTTGATAACATG+CGG - Chr7:68182545-68182564 None:intergenic 25.0%
!!! AAGCAACAAATCATTTTTGT+AGG - Chr7:68181286-68181305 None:intergenic 25.0%
!!! ATAATAGAAGTGTTGGAAAA+TGG + Chr7:68182732-68182751 MsG0780039728.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAAAAGTTTGTTATTTACG+AGG - Chr7:68180622-68180641 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTTTTTTCTTGCGTTTT+AGG + Chr7:68180776-68180795 MsG0780039728.01.T01:intron 25.0%
AAATTTCTTAAGGCACAGTT+TGG - Chr7:68182363-68182382 None:intergenic 30.0%
AACCTTGTTAGAGAAAGAAA+AGG + Chr7:68181612-68181631 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTCTTAACAGATTCAAA+AGG + Chr7:68181667-68181686 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTGTTAGAGAAAGAAAA+GGG + Chr7:68181613-68181632 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTTAAAGGACAGAAACT+TGG + Chr7:68182986-68183005 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
CAACTTAGAACATCAAAGAA+AGG + Chr7:68182506-68182525 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTCCTAATTCATCACA+AGG - Chr7:68180876-68180895 None:intergenic 30.0%
GATGAAAATAAAGAGGTTGT+AGG + Chr7:68182810-68182829 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
GGTTATGATCAAATTTCAGA+AGG + Chr7:68180815-68180834 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
TACAAAATGGAACAGTTAGA+GGG + Chr7:68182868-68182887 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
TCCATCAAAGACATATGAAA+GGG + Chr7:68182257-68182276 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
TTACAAAATGGAACAGTTAG+AGG + Chr7:68182867-68182886 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATCAAAGACATATGAA+AGG + Chr7:68182256-68182275 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
TTGTTAAAGGACAGAAACTT+GGG + Chr7:68182987-68183006 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGAGTTTACTAGAGAA+GGG + Chr7:68183102-68183121 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
TTTCACATTTAAGCCTAAGT+TGG + Chr7:68181887-68181906 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
! AAATTAAGCCAAGCTTTTGA+TGG + Chr7:68180846-68180865 MsG0780039728.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTGGAATGAAGAAAACTT+AGG + Chr7:68182165-68182184 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
! ATGATTAGTTACTACATGTG+AGG + Chr7:68183480-68183499 MsG0780039728.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TACCTGTTCTTTTACTTCAT+CGG - Chr7:68180898-68180917 None:intergenic 30.0%
! TCCTTTTGAATCTGTTAAGA+AGG - Chr7:68181671-68181690 None:intergenic 30.0%
! TGACATGAAGAACAGATTTT+TGG - Chr7:68182423-68182442 None:intergenic 30.0%
! TTATGAAAATGGATTCGATG+CGG + Chr7:68181927-68181946 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
!! TGGAATTTCTTCTTGGTTTT+CGG - Chr7:68182460-68182479 None:intergenic 30.0%
!!! ATGGAACCCTTATTTTATTC+CGG + Chr7:68181010-68181029 MsG0780039728.01.T01:intron 30.0%
AAAGAGAGAGCTATAAAAGC+TGG + Chr7:68182942-68182961 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
AATGAAGACGAAGAATGCAA+TGG + Chr7:68180344-68180363 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTGCCGGAATAAAATAA+GGG - Chr7:68181019-68181038 None:intergenic 35.0%
ACTACTAGCAACATAGTGAT+CGG - Chr7:68181336-68181355 None:intergenic 35.0%
ACTGTTGCATACATATTGGA+CGG + Chr7:68181982-68182001 MsG0780039728.01.T01:intron 35.0%
AGGTTGTAGGAATGTCAAAT+GGG + Chr7:68182823-68182842 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
CCAAACATGGAATTTCTTCT+TGG - Chr7:68182467-68182486 None:intergenic 35.0%
CCAAGAAGAAATTCCATGTT+TGG + Chr7:68182464-68182483 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
CTTAGAACATCAAAGAAAGG+CGG + Chr7:68182509-68182528 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
CTTCTTCCAAGCATCTTATT+AGG - Chr7:68181744-68181763 None:intergenic 35.0%
CTTGTTGAGTTTACTAGAGA+AGG + Chr7:68183101-68183120 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
GAACTTAATTCGTGATTACC+TGG - Chr7:68181848-68181867 None:intergenic 35.0%
GACTAGTATCTTTCCAACTT+AGG - Chr7:68181903-68181922 None:intergenic 35.0%
GATAGGATTTGTACTAATGG+TGG - Chr7:68182606-68182625 None:intergenic 35.0%
GATCCTGTTATTATTGCAAG+TGG + Chr7:68181822-68181841 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
GCTAATTGAAGATGTTCCAA+AGG - Chr7:68182339-68182358 None:intergenic 35.0%
TCCAACACTTCTATTATAGC+TGG - Chr7:68182729-68182748 None:intergenic 35.0%
TCCAATCTTTATCCAACAGT+CGG + Chr7:68182061-68182080 MsG0780039728.01.T01:intron 35.0%
TCCCTTTCATATGTCTTTGA+TGG - Chr7:68182261-68182280 None:intergenic 35.0%
TGCTTATAATAGTGATCGGA+TGG + Chr7:68181301-68181320 MsG0780039728.01.T01:intron 35.0%
TTCCGATGAAGTAAAAGAAC+AGG + Chr7:68180893-68180912 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTGAAATTGTGTAGCCA+AGG + Chr7:68180584-68180603 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
! ATCATGCTTTTCTCCTCTAT+AGG + Chr7:68183320-68183339 MsG0780039728.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! GATAGGTTTTCAACCAAACA+TGG - Chr7:68182480-68182499 None:intergenic 35.0%
! TAGCTCTCTCTTTATTTGCA+TGG - Chr7:68182935-68182954 None:intergenic 35.0%
! TCCAGCTATAATAGAAGTGT+TGG + Chr7:68182725-68182744 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
! TCCCTTTTCTTTCTCTAACA+AGG - Chr7:68181617-68181636 None:intergenic 35.0%
! TCGTCTTCATTCTCATTTTC+CGG - Chr7:68180335-68180354 None:intergenic 35.0%
! TTTTGCAAGCCTTTCGATAA+TGG - Chr7:68181538-68181557 None:intergenic 35.0%
!! AGAATTTTAGTCGCCGAAAA+CGG + Chr7:68182573-68182592 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTCTTCTTGGTTTTCGGT+TGG - Chr7:68182456-68182475 None:intergenic 35.0%
!! GTTGGAAAATGGAAGTATTG+TGG + Chr7:68182743-68182762 MsG0780039728.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCTTGCGTTTTAGGCAT+GGG + Chr7:68180782-68180801 MsG0780039728.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTTCTTGCGTTTTAGGCA+TGG + Chr7:68180781-68180800 MsG0780039728.01.T01:intron 35.0%
AACAGATTCAAAAGGACTGC+AGG + Chr7:68181675-68181694 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
AATGGAAGGAACAGAAGAGA+GGG + Chr7:68180280-68180299 MsG0780039728.01.T01:exon 40.0%
ACAAGACATAGAGCTAGCAA+TGG + Chr7:68181464-68181483 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
AGAGCTAGCAATGGATATGA+TGG + Chr7:68181473-68181492 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
AGGCCAAAATCCACAAACTT+CGG - Chr7:68182138-68182157 None:intergenic 40.0%
ATCGAATCGGTGGTTCAATT+CGG + Chr7:68180398-68180417 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGACACAGAAACTCATG+AGG - Chr7:68181783-68181802 None:intergenic 40.0%
CAAACACATGTTGCCTCTTA+TGG + Chr7:68180472-68180491 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
CACCTTGCCGGAATAAAATA+AGG - Chr7:68181020-68181039 None:intergenic 40.0%
CATTCGTGCAATTTGCACAT+TGG - Chr7:68181113-68181132 None:intergenic 40.0%
CGAAAGGCTTGCAAAAAAGT+TGG + Chr7:68181542-68181561 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
CTCGACTGTTGCATACATAT+TGG + Chr7:68181978-68181997 MsG0780039728.01.T01:intron 40.0%
CTTCATTCCAGATTCTCGAA+AGG - Chr7:68182158-68182177 None:intergenic 40.0%
GAGGTTGTAGGAATGTCAAA+TGG + Chr7:68182822-68182841 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
GCGAATACAGAAGAACACAA+AGG + Chr7:68180420-68180439 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTTGAGGTAGAAACAT+TGG + Chr7:68181581-68181600 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
GTGGTACAAATAGAGCACAA+AGG + Chr7:68183246-68183265 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAGCATCTTATTAGGCA+TGG - Chr7:68181739-68181758 None:intergenic 40.0%
TCCGACTGTTGGATAAAGAT+TGG - Chr7:68182065-68182084 None:intergenic 40.0%
TGGCCACTTGCAATAATAAC+AGG - Chr7:68181828-68181847 None:intergenic 40.0%
TGTTATTATTGCAAGTGGCC+AGG + Chr7:68181827-68181846 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
TTGGACACAGAAACTCATGA+GGG - Chr7:68181782-68181801 None:intergenic 40.0%
! AAAGGGAAAGCATAGAGAAG+TGG + Chr7:68182274-68182293 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTGCACATTGGTGGTTGT+TGG - Chr7:68181103-68181122 None:intergenic 40.0%
! CCTTTCGATAATGGCACTAT+CGG - Chr7:68181529-68181548 None:intergenic 40.0%
! CGTCTTCATTCTCATTTTCC+GGG - Chr7:68180334-68180353 None:intergenic 40.0%
!! ATTTTGGCCTTTCGAGAATC+TGG + Chr7:68182148-68182167 MsG0780039728.01.T01:intron 40.0%
!! GTTCTAAGTTGATCGACGAT+AGG - Chr7:68182497-68182516 None:intergenic 40.0%
!! TACTTGTGTTGACTCCTGAA+GGG + Chr7:68183042-68183061 MsG0780039728.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACCCTTATTTTATTCCGGCA+AGG + Chr7:68181015-68181034 MsG0780039728.01.T01:intron 40.0%
AAGGCACACCATCAAAAGCT+TGG - Chr7:68180857-68180876 None:intergenic 45.0%
ACAAAACCTGTCCGAAGACA+AGG + Chr7:68182310-68182329 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTGGCAGCACTTCAGTT+TGG + Chr7:68183191-68183210 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGGGACTCCAAAGAACA+AGG + Chr7:68183118-68183137 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
AGACGAAGAATGCAATGGTG+TGG + Chr7:68180349-68180368 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
ATTCAAAAGGACTGCAGGCA+TGG + Chr7:68181680-68181699 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGTCGGACATATGCAA+CGG + Chr7:68182074-68182093 MsG0780039728.01.T01:intron 45.0%
CAATGGAAGGAACAGAAGAG+AGG + Chr7:68180279-68180298 MsG0780039728.01.T01:exon 45.0%
GATCCAAGGACTCATCGAAT+CGG + Chr7:68180385-68180404 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
GCCATGCCTAATAAGATGCT+TGG + Chr7:68181735-68181754 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
GCTAGCAATGGATATGATGG+TGG + Chr7:68181476-68181495 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
GCTGCACATTCCTTGTTCTT+TGG - Chr7:68183131-68183150 None:intergenic 45.0%
GGTGTGCCTTGTGATGAATT+AGG + Chr7:68180867-68180886 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
GTCAAATGGGATTCCAGCTT+TGG + Chr7:68182836-68182855 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
GTGCAAATTGCACGAATGCA+CGG + Chr7:68181115-68181134 MsG0780039728.01.T01:intron 45.0%
TCGTGCAATTTGCACATTGG+TGG - Chr7:68181110-68181129 None:intergenic 45.0%
! AGATGCGCTTTTCTTCGCTA+AGG + Chr7:68180559-68180578 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
! CCGATAGTGCCATTATCGAA+AGG + Chr7:68181526-68181545 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
! CGAAGAAAAGCGCATCTCTA+AGG - Chr7:68180556-68180575 None:intergenic 45.0%
! CGAGGTGAATTTTGCTTCCT+TGG - Chr7:68180604-68180623 None:intergenic 45.0%
! GAGGTAGAAACATTGGCTGT+TGG + Chr7:68181588-68181607 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
! GGACCGAAGTTTGTGGATTT+TGG + Chr7:68182132-68182151 MsG0780039728.01.T01:intron 45.0%
! TCACAGTGTTGAGGATCTTG+AGG + Chr7:68181569-68181588 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
! TGGTGGTATTCCTCCGTTTT+CGG - Chr7:68182589-68182608 None:intergenic 45.0%
! TTCTCATTTTCCGGGTTGCT+TGG - Chr7:68180326-68180345 None:intergenic 45.0%
!! ATTTTAGTCGCCGAAAACGG+AGG + Chr7:68182576-68182595 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
!! CTACTTGTGTTGACTCCTGA+AGG + Chr7:68183041-68183060 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTCGGACAGGTTTTGTGAT+TGG - Chr7:68182307-68182326 None:intergenic 45.0%
!! GCTTGGAAGAAGCACTTCTT+TGG + Chr7:68181752-68181771 MsG0780039728.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCTTGGTTTTCGGTTGGAG+TGG - Chr7:68182451-68182470 None:intergenic 45.0%
AACCAAACAACGCCGTTTCG+AGG - Chr7:68180527-68180546 None:intergenic 50.0%
AATGCACGTGCAACTCAGGA+GGG + Chr7:68181422-68181441 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
ACATCGTAGTGCAGCTGTAG+AGG + Chr7:68182111-68182130 MsG0780039728.01.T01:intron 50.0%
AGAACCAGAACCAAGCAACC+CGG + Chr7:68180313-68180332 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
AGAATGCAATGGTGTGGTGG+TGG + Chr7:68180355-68180374 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
AGCTAATGCACGTGCAACTC+AGG + Chr7:68181418-68181437 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
ATGCGGTGAATACACCTTGC+CGG - Chr7:68181032-68181051 None:intergenic 50.0%
CGAAGAATGCAATGGTGTGG+TGG + Chr7:68180352-68180371 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
CGTCATCCTGTTCCTCGAAA+CGG + Chr7:68180512-68180531 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
CGTTGCATATGTCCGACTGT+TGG - Chr7:68182076-68182095 None:intergenic 50.0%
CTGTAGAGGACCGAAGTTTG+TGG + Chr7:68182125-68182144 MsG0780039728.01.T01:intron 50.0%
GAAACGGCGTTGTTTGGTTG+AGG + Chr7:68180528-68180547 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
GTTGGAGCTTCACAGTGTTG+AGG + Chr7:68181560-68181579 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
TAATGCACGTGCAACTCAGG+AGG + Chr7:68181421-68181440 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
TCCAAAGGCTGCCTTGTCTT+CGG - Chr7:68182324-68182343 None:intergenic 50.0%
TCGCGAAGGTCTTCCATAAG+AGG - Chr7:68180488-68180507 None:intergenic 50.0%
TTAGGCATGGGAAGGTGAGA+TGG + Chr7:68180794-68180813 MsG0780039728.01.T01:intron 50.0%
TTCCTCGAAACGGCGTTGTT+TGG + Chr7:68180522-68180541 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
TTCGAGGAACAGGATGACGA+AGG - Chr7:68180511-68180530 None:intergenic 50.0%
! TGTGTTTGAAACGACGAGCG+AGG - Chr7:68180460-68180479 None:intergenic 50.0%
! TTTTCCGGGTTGCTTGGTTC+TGG - Chr7:68180320-68180339 None:intergenic 50.0%
!! CTTGCGTTTTAGGCATGGGA+AGG + Chr7:68180786-68180805 MsG0780039728.01.T01:intron 50.0%
!! TTGTGTTGACTCCTGAAGGG+AGG + Chr7:68183045-68183064 MsG0780039728.01.T01:CDS 50.0%
ACAACGCCGTTTCGAGGAAC+AGG - Chr7:68180521-68180540 None:intergenic 55.0%
CCAAGGACTCATCGAATCGG+TGG + Chr7:68180388-68180407 MsG0780039728.01.T01:CDS 55.0%
GGAAGGAACAGAAGAGAGGG+AGG + Chr7:68180283-68180302 MsG0780039728.01.T01:CDS 55.0%
TCCGAAGACAAGGCAGCCTT+TGG + Chr7:68182320-68182339 MsG0780039728.01.T01:CDS 55.0%
!! ATGCAATGGTGTGGTGGTGG+TGG + Chr7:68180358-68180377 MsG0780039728.01.T01:CDS 55.0%
!! CCACCGATTCGATGAGTCCT+TGG - Chr7:68180391-68180410 None:intergenic 55.0%
ACGTGCAACTCAGGAGGGCA+AGG + Chr7:68181427-68181446 MsG0780039728.01.T01:CDS 60.0%
AGGCTGCCTTGTCTTCGGAC+AGG - Chr7:68182319-68182338 None:intergenic 60.0%
CAGGATGACGAAGGTCGCGA+AGG - Chr7:68180502-68180521 None:intergenic 60.0%
CCAACCTCATGCCTCCCTTC+AGG - Chr7:68183059-68183078 None:intergenic 60.0%
! CCTGAAGGGAGGCATGAGGT+TGG + Chr7:68183056-68183075 MsG0780039728.01.T01:CDS 60.0%
! GACTCCTGAAGGGAGGCATG+AGG + Chr7:68183052-68183071 MsG0780039728.01.T01:CDS 60.0%
!! CAATGGTGTGGTGGTGGTGG+AGG + Chr7:68180361-68180380 MsG0780039728.01.T01:CDS 60.0%
!! GTGGTGGTGGAGGAGATCCA+AGG + Chr7:68180371-68180390 MsG0780039728.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 68180269 68183499 68180269 ID=MsG0780039728.01;Name=MsG0780039728.01
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Chr7 three_prime_UTR 68183317 68183499 68183317 ID=MsG0780039728.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780039728.01.T01
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Protein sequence

>MsG0780039728.01.T01

MEGTEEREENVEPEPSNPENENEDEECNGVVVVEEIQGLIESVVQFGEYRRTQRKESHNLARRFKHMLPLMEDLRDLRHPVPRNGVVWLRNLRDALFFAKDLLKLCSQGSKIHLAWEGEMVMIKFQKVYEKLSQAFDGVPCDELGISDEVKEQLELMHVQLRRARRRTDTQDIELAMDMMVVFSDEDDRNADSAIIERLAKKLELHSVEDLEVETLAVGNLVRERKGKQSDSTKKIIDLLNRFKRTAGMEETDVIFDDDHAMPNKMLGRSTSLVIPHEFLCPITLEIMSDPVIIASGQTYERESIEKWFKSNHKTCPKTRQPLEHLQLAPNCALRNLIAEWCENNNFKLPKICSSCQETTPTENQEEIPCLVENLSSINLEHQRKAVERIRMLSKESSENRILVAENGGIPPLVQILSYPDSKIKEHAVTALLNLSIDEANKKLISKEGAIPAIIEVLENGSIVAKENSAAALFSLSMIDENKEVVGMSNGIPALVNLLQNGTVRGKKDAATALFSLSLNHANKERAIKAGIVTALLQLLKDRNLGMIDEALSILLLLVLTPEGRHEVGQLSFIETLVEFTREGTPKNKECAASVLLELCSSNSSFTLAALQFGVYEHLIEIKESGTNRAQRKANAILDLIKRSEQI*