AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041186.01

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MsG0780041186.01.T01 AT2G33170 28.673 422 253 14 33 435 48 440 1.62e-29 127
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MsG0780041186.01.T01 AT1G07570 43.624 298 156 5 584 872 56 350 9.07e-68 232
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MsG0780041186.01.T01 AT5G63710 31.874 571 322 16 332 884 21 542 1.06e-64 229
MsG0780041186.01.T01 AT5G63710 31.874 571 322 16 332 884 21 542 1.06e-64 229
MsG0780041186.01.T01 AT5G65240 32.653 588 320 18 332 884 26 572 1.11e-64 229
MsG0780041186.01.T01 AT3G04690 38.903 401 212 10 476 866 404 781 1.23e-64 234
MsG0780041186.01.T01 AT1G56130 43.729 295 158 3 583 877 482 768 1.44e-64 234
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MsG0780041186.01.T01 AT1G09970 26.687 978 546 28 18 872 22 951 9.03e-64 233
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MsG0780041186.01.T01 AT5G62710 31.188 606 324 20 337 894 1 561 1.01e-60 217
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MsG0780041186.01.T01 AT5G56040 29.380 371 221 14 77 433 155 498 2.24e-23 107
MsG0780041186.01.T01 AT4G34440 42.606 284 153 5 592 872 308 584 2.86e-60 218
MsG0780041186.01.T01 AT4G34440 42.606 284 153 5 592 872 308 584 2.86e-60 218
MsG0780041186.01.T01 AT1G51810 31.343 536 284 19 349 869 250 716 3.46e-60 219
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MsG0780041186.01.T01 AT1G08590 27.305 846 489 21 67 873 243 1001 4.82e-60 223
MsG0780041186.01.T01 AT1G08590 26.514 479 276 21 5 434 4 455 9.68e-24 108
MsG0780041186.01.T01 AT3G21630 38.381 383 208 12 498 875 234 593 4.93e-60 216
MsG0780041186.01.T01 AT2G25220 42.123 292 161 6 586 876 87 371 7.65e-60 209
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MsG0780041186.01.T01 AT1G56720 40.141 284 165 4 589 872 172 450 1.24e-58 209
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MsG0780041186.01.T01 AT5G48940 28.975 849 491 29 77 878 286 1069 2.01e-58 218
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MsG0780041186.01.T01 AT4G32710 45.339 236 121 3 583 815 376 606 4.92e-57 210
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MsG0780041186.01.T01 AT3G14840 26.667 330 193 11 127 439 28 325 7.53e-11 67.0
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MsG0780041186.01.T01 AT1G51890 32.851 484 261 15 394 869 136 563 6.41e-57 207
MsG0780041186.01.T01 AT2G11520 38.408 289 168 6 580 865 209 490 6.53e-57 205
MsG0780041186.01.T01 AT4G29990 32.288 542 280 20 340 869 373 839 7.24e-57 212
MsG0780041186.01.T01 AT4G23140 37.662 308 182 7 567 872 323 622 7.90e-57 209
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MsG0780041186.01.T01 AT1G06700 37.667 300 177 7 584 877 56 351 1.46e-55 197
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MsG0780041186.01.T01 AT3G13690 40.000 285 163 5 589 872 404 681 6.80e-55 204
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MsG0780041186.01.T01 AT5G54590 39.806 309 151 8 579 877 98 381 8.43e-54 194
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MsG0780041186.01.T01 AT4G23310 38.111 307 173 8 572 872 485 780 6.36e-53 199
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MsG0780041186.01.T01 AT1G51790 28.897 526 285 18 358 872 397 844 7.40e-53 200
MsG0780041186.01.T01 AT3G25490 38.689 305 174 7 589 888 101 397 7.58e-53 191
MsG0780041186.01.T01 AT5G10530 36.508 315 182 8 565 872 304 607 7.75e-53 196
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MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 30.323 310 166 13 22 315 28 303 2.24e-16 84.7
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 28.455 246 146 9 216 451 82 307 3.53e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 40.333 300 160 5 584 877 614 900 8.10e-53 200
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 30.323 310 166 13 22 315 28 303 2.24e-16 84.7
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 28.455 246 146 9 216 451 82 307 3.53e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 40.333 300 160 5 584 877 614 900 8.10e-53 200
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 30.323 310 166 13 22 315 28 303 2.24e-16 84.7
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 28.455 246 146 9 216 451 82 307 3.53e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 40.333 300 160 5 584 877 614 900 8.10e-53 200
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 30.323 310 166 13 22 315 28 303 2.24e-16 84.7
MsG0780041186.01.T01 AT5G01950 28.455 246 146 9 216 451 82 307 3.53e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT1G78530 39.100 289 169 2 584 872 63 344 8.97e-53 189
MsG0780041186.01.T01 AT4G23290 35.430 302 187 6 573 872 297 592 9.51e-53 196
MsG0780041186.01.T01 AT5G35960 36.747 332 187 10 548 870 80 397 1.04e-52 190
MsG0780041186.01.T01 AT4G04540 40.502 279 154 7 592 869 320 587 1.45e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT4G23200 37.024 289 174 6 587 873 327 609 1.48e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 36.957 322 192 7 570 890 649 960 1.63e-52 199
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 29.555 247 145 6 177 414 109 335 1.12e-13 76.3
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 26.761 355 170 12 6 312 28 340 2.38e-12 71.6
MsG0780041186.01.T01 AT1G11303 38.851 296 165 7 583 876 496 777 1.69e-52 198
MsG0780041186.01.T01 AT1G21250 38.944 303 176 5 589 888 402 698 1.92e-52 197
MsG0780041186.01.T01 AT1G34300 37.540 309 181 7 589 895 479 777 1.97e-52 198
MsG0780041186.01.T01 AT1G61610 37.801 291 173 6 583 872 512 795 1.98e-52 198
MsG0780041186.01.T01 AT4G23290 35.430 302 187 6 573 872 340 635 2.04e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT2G19230 29.851 536 278 18 350 872 389 839 2.48e-52 199
MsG0780041186.01.T01 AT1G11330 37.954 303 159 6 497 797 447 722 2.69e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT4G38830 42.308 234 129 3 566 797 314 543 2.84e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT2G47060 35.952 331 170 8 583 876 60 385 2.99e-52 188
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 37.987 308 183 6 584 890 628 928 3.21e-52 199
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 29.555 247 145 6 177 414 109 335 1.36e-13 75.9
MsG0780041186.01.T01 AT1G29730 26.761 355 170 12 6 312 28 340 3.38e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT4G04540 40.647 278 153 7 593 869 350 616 3.21e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT5G55830 36.482 307 180 7 584 881 353 653 3.27e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT1G48210 39.506 243 139 3 584 821 56 295 3.40e-52 186
MsG0780041186.01.T01 AT1G48210 39.506 243 139 3 584 821 56 295 3.40e-52 186
MsG0780041186.01.T01 AT1G48210 39.506 243 139 3 584 821 56 295 3.40e-52 186
MsG0780041186.01.T01 AT1G77280 38.542 288 166 6 589 872 397 677 3.40e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT1G77280 38.542 288 166 6 589 872 397 677 3.40e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT2G23950 29.724 508 281 10 329 802 34 499 3.49e-52 192
MsG0780041186.01.T01 AT2G23950 31.579 247 125 10 6 243 15 226 1.97e-12 71.2
MsG0780041186.01.T01 AT5G48740 30.458 568 300 19 353 879 368 881 3.62e-52 198
MsG0780041186.01.T01 AT2G47060 39.000 300 171 7 583 876 60 353 3.82e-52 187
MsG0780041186.01.T01 AT2G47060 39.000 300 171 7 583 876 60 353 3.82e-52 187
MsG0780041186.01.T01 AT1G21230 38.176 296 177 5 583 878 395 684 3.89e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT1G48220 36.667 300 177 6 584 876 56 349 4.10e-52 187
MsG0780041186.01.T01 AT2G28960 40.780 282 156 7 592 872 439 710 4.17e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT4G00970 33.889 360 199 11 540 872 271 618 4.73e-52 194
MsG0780041186.01.T01 AT1G79670 39.116 294 169 5 576 865 360 647 4.79e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT5G06740 35.329 334 192 11 584 901 318 643 4.82e-52 194
MsG0780041186.01.T01 AT1G79670 39.116 294 169 5 576 865 397 684 5.01e-52 196
MsG0780041186.01.T01 AT2G29000 29.947 571 295 18 327 872 344 834 5.19e-52 197
MsG0780041186.01.T01 AT5G06740 35.329 334 192 11 584 901 330 655 5.27e-52 194
MsG0780041186.01.T01 AT1G78530 43.966 232 123 2 584 815 63 287 6.46e-52 184
MsG0780041186.01.T01 AT4G23240 35.473 296 183 6 579 872 318 607 6.99e-52 194
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 37.255 306 184 6 584 885 146 447 7.78e-52 190
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 37.255 306 184 6 584 885 146 447 7.78e-52 190
MsG0780041186.01.T01 AT3G45860 37.000 300 174 7 579 872 334 624 7.96e-52 194
MsG0780041186.01.T01 AT1G16130 40.283 283 163 4 583 865 403 679 9.03e-52 195
MsG0780041186.01.T01 AT5G65600 35.738 305 178 6 578 872 332 628 1.01e-51 194
MsG0780041186.01.T01 AT5G59260 37.153 288 174 4 585 872 344 624 1.13e-51 193
MsG0780041186.01.T01 AT1G21210 36.050 319 190 7 583 893 397 709 1.15e-51 194
MsG0780041186.01.T01 AT2G28990 41.463 287 153 8 589 872 572 846 1.18e-51 196
MsG0780041186.01.T01 AT2G28990 41.463 287 153 8 589 872 572 846 1.18e-51 196
MsG0780041186.01.T01 AT4G20450 30.582 533 269 17 350 872 404 845 1.43e-51 196
MsG0780041186.01.T01 AT2G28960 40.780 282 156 7 592 872 571 842 1.47e-51 196
MsG0780041186.01.T01 AT1G61420 32.440 373 214 9 492 863 273 608 1.56e-51 193
MsG0780041186.01.T01 AT4G05200 38.768 276 158 7 593 865 344 611 1.60e-51 193
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 37.255 306 184 6 584 885 263 564 2.12e-51 191
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 33.333 120 77 2 316 433 17 135 5.92e-11 66.6
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 37.255 306 184 6 584 885 263 564 2.12e-51 191
MsG0780041186.01.T01 AT2G13800 33.333 120 77 2 316 433 17 135 5.92e-11 66.6
MsG0780041186.01.T01 AT4G05200 38.768 276 158 7 593 865 362 629 2.26e-51 193
MsG0780041186.01.T01 AT4G11900 31.421 401 234 10 476 873 378 740 2.27e-51 194
MsG0780041186.01.T01 AT4G11530 37.024 289 166 7 581 863 337 615 2.36e-51 192

Find 273 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 345 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTAAAGATCTTAATCTTAA+TGG 0.074577 7:-87805639 MsG0780041186.01.T01:CDS
CGCTTTATGCTTATTGTTTC+AGG 0.086427 7:-87804888 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGTCAAATTTGAAGCTTTC+TGG 0.106557 7:-87805858 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTGAATAATAATCGGTTTA+TGG 0.135487 7:-87805556 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGGTTTCTCTTACTAGTTTA+TGG 0.153323 7:-87805719 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGACCTTTACCAACGCTAAA+TGG 0.161917 7:-87806122 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGTCCTTCTGTTGCAAATTT+AGG 0.176946 7:-87805279 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCTTTAGTTCAAATTAAAT+TGG 0.179227 7:-87805256 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAACTCATCCAAGGCTTTAT+TGG 0.179385 7:+87804537 None:intergenic
GGTCTTGTTCCTAGTTCTTT+AGG 0.189699 7:-87805603 MsG0780041186.01.T01:CDS
TAAAGCCTTGGATGAGTTTC+AGG 0.191767 7:-87804533 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCTAGTTCTTTAGGTGATA+TGG 0.200254 7:-87805595 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGAGCTAAAGTCTCAGATTT+TGG 0.207671 7:-87804220 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGACAGCATGACCCATTTC+TGG 0.209759 7:+87803287 None:intergenic
AACTGATATCACAAGATTTC+CGG 0.213480 7:+87804696 None:intergenic
CCCGAATTGTTAAGAGTCTT+TGG 0.215340 7:+87805813 None:intergenic
CGGCATCTAGTGGGCCTTAT+AGG 0.223891 7:-87804478 MsG0780041186.01.T01:CDS
TATTGATATTGTTGCTACTA+TGG 0.240966 7:-87805739 MsG0780041186.01.T01:CDS
GAGCTCGGCCGCGGTGGATT+TGG 0.242905 7:-87804631 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGGCCTTTGGTTTGGTTCTC+TGG 0.249939 7:+87803307 None:intergenic
GGCGGTTTGGTTTGGTTTGA+GGG 0.258698 7:+87806589 None:intergenic
TGCTGGAACCTTTGGATACT+TGG 0.266440 7:-87804149 MsG0780041186.01.T01:CDS
TACTGCTCTTACTGTCTTCT+AGG 0.267287 7:+87803123 None:intergenic
TTGGGCCATTGTAGGATGTC+TGG 0.268290 7:+87806314 None:intergenic
CTTCAAAACAACAAACTTAA+AGG 0.274926 7:-87806143 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTACTAGTTTATGGCTTCA+TGG 0.278042 7:-87805711 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTGCCATCCCTTGACCATT+TGG 0.278227 7:+87803177 None:intergenic
ACCCATGTGGTCCACCTTCT+TGG 0.281201 7:-87806280 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTCTTGTATCAGTTGTAATT+TGG 0.281936 7:-87805919 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCCATTTCTGGCCTTTGGTT+TGG 0.283378 7:+87803299 None:intergenic
ATTCTCAGGGGCAAAATTCT+TGG 0.285570 7:+87804654 None:intergenic
TGGATTTGGAGTTGTTTATA+AGG 0.286957 7:-87804617 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCAAAGACTCTTAACAATTC+GGG 0.287213 7:-87805813 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGAATAATAATCGGTTTAT+GGG 0.289603 7:-87805555 MsG0780041186.01.T01:CDS
AACAGTCCATCGGGTGGATC+TGG 0.290614 7:-87805051 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTAGCAATAGCTATCTTTA+CGG 0.295444 7:+87804792 None:intergenic
CATGACCCATTTCTGGCCTT+TGG 0.302687 7:+87803294 None:intergenic
AACCCTTGTTTAACTTGGTT+GGG 0.302881 7:-87805372 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCGGTTCACTGGTTCGATTC+CGG 0.304672 7:-87805685 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTCGAATTTGGTTGATTCA+TGG 0.308775 7:-87805404 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTCCTATGGATTTCTTTCA+AGG 0.308818 7:-87806050 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTTGAATTATCCTTCGAATT+TGG 0.318080 7:-87805415 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCAAAGACTCTTAACAATT+CGG 0.324369 7:-87805814 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGAGAGAGAAGTAAAGAGTT+TGG 0.327192 7:+87806567 None:intergenic
TTGCCATCCCTTGACCATTT+GGG 0.328743 7:+87803178 None:intergenic
TAATATTTCACCTCCTTTGC+CGG 0.329379 7:-87805154 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACCAAGCTTGCTGGAACCTT+TGG 0.338095 7:-87804157 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGGCGGTTTGGTTTGGTTTG+AGG 0.343519 7:+87806588 None:intergenic
GCTAATAATACCAATGGAAC+AGG 0.347331 7:-87804775 MsG0780041186.01.T01:CDS
CAAGGGATGGCAAGAGGCGG+AGG 0.350724 7:-87803168 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCGCGGCCGAGCTCATTCTC+AGG 0.350928 7:+87804640 None:intergenic
TTCTTTAGGTGATATGGAAT+TGG 0.352244 7:-87805589 MsG0780041186.01.T01:CDS
CAGAAGGGTGAGTTGTTATC+TGG 0.353016 7:-87805765 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGGGAAGGACACAAGTTATA+TGG 0.354138 7:-87803147 MsG0780041186.01.T01:CDS
GCAAATCCAGTAGGTCTTGC+AGG 0.356042 7:+87803098 None:intergenic
GGTTCGATTCCGGACAATAT+TGG 0.359997 7:-87805675 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTGCTAATGGAGCTGTTGTC+TGG 0.360420 7:-87803506 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGTCTACATTTAAGTGTTGA+TGG 0.371617 7:-87802834 MsG0780041186.01.T01:three_prime_UTR
GGATTTGGAGTTGTTTATAA+GGG 0.372594 7:-87804616 MsG0780041186.01.T01:CDS
GAGGACAAAGGATGGTTTCC+AGG 0.373148 7:-87804866 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATACTTGGCAGCATGGTTC+TGG 0.379479 7:-87803445 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGGAAGAGAAAGAGAAGAAA+TGG 0.380343 7:+87806419 None:intergenic
AGAGTTTGGGCGGTTTGGTT+TGG 0.382569 7:+87806581 None:intergenic
ATGGTGTTGTACCTAGTAAC+TGG 0.382841 7:-87805218 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACCAAACCAAAGGCCAGAAA+TGG 0.383259 7:-87803300 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTTCTGGTAACAGTTTAAC+CGG 0.384767 7:-87805843 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCTGTAGTGACCAAGCTTGC+TGG 0.385927 7:-87804166 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATGGAACAGGGAGTGGGAC+TGG 0.387066 7:-87804763 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTCAGTAGAATAACCTATA+AGG 0.389175 7:+87804464 None:intergenic
AGCTTGATTTGAATAATAAT+CGG 0.389417 7:-87805563 MsG0780041186.01.T01:CDS
CGAATTCGATTCCATTCCTA+TGG 0.390216 7:-87806063 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGTAAAGAGTTTGGGCGGTT+TGG 0.392270 7:+87806576 None:intergenic
CACAAGATTTCCGGCTTCAA+TGG 0.397388 7:+87804705 None:intergenic
GTTTATGGCTTCATGGTAAC+CGG 0.412648 7:-87805704 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCAATCCATTACTAAAATC+CGG 0.412780 7:+87805135 None:intergenic
ATGGCAAGAGGCGGAGGGGA+AGG 0.415113 7:-87803162 MsG0780041186.01.T01:CDS
GCAACCGCCACACCAGCAAT+AGG 0.417106 7:+87804928 None:intergenic
TCGGGTGGATCTGGGAATAC+TGG 0.420493 7:-87805042 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTCGTTTATGTCGAGGGTT+GGG 0.422154 7:+87803381 None:intergenic
CAGATAACAACTCACCCTTC+TGG 0.423558 7:+87805766 None:intergenic
TCTTCGTTTATGTCGAGGGT+TGG 0.423569 7:+87803380 None:intergenic
TCAATTATTGCTGAGCTAGC+TGG 0.423939 7:-87803341 MsG0780041186.01.T01:CDS
TAACCCTTGTTTAACTTGGT+TGG 0.430080 7:-87805373 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGGACTCGAGCCTCTCTCT+TGG 0.430426 7:-87804366 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTAATGGAAATGAGCTTGT+TGG 0.430497 7:-87805624 MsG0780041186.01.T01:CDS
GAGAGAGAAGTAAAGAGTTT+GGG 0.431066 7:+87806568 None:intergenic
TATGTCGAGGGTTGGGTCAA+TGG 0.434700 7:+87803388 None:intergenic
GACCTTTACCAACGCTAAAT+GGG 0.439305 7:-87806121 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGAGCTGTTGTCTGGATTGA+TGG 0.440450 7:-87803498 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCTTTAGTTCAAATTAAATT+GGG 0.441268 7:-87805255 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGTATCCCTGCAAGACCTAC+TGG 0.443339 7:-87803104 MsG0780041186.01.T01:CDS
TAATGCAAGAGTGTCTAAAC+TGG 0.444159 7:+87806022 None:intergenic
ATCCCTTGACCATTTGGGTA+AGG 0.446354 7:+87803183 None:intergenic
GCCAAGTATTGGCTTTCCTC+AGG 0.447088 7:+87803458 None:intergenic
AGTTGAAGAGATGGGTTAGT+TGG 0.448647 7:+87806171 None:intergenic
TGTGTGGTTCATGGTTGTTA+TGG 0.448676 7:+87806442 None:intergenic
TGTATCAGTTGTAATTTGGT+TGG 0.452966 7:-87805915 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGAACTGAAGGTCCTTCCTC+GGG 0.453712 7:-87805078 MsG0780041186.01.T01:CDS
GATGACCCCGATGAGTATTC+CGG 0.455054 7:-87803224 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAATTCAAGTCCAAGTGATT+CGG 0.455241 7:-87804998 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGGGCCATTGTAGGATGTCT+GGG 0.459888 7:+87806315 None:intergenic
AGTTGTTTATAAGGGAGAGT+TGG 0.460183 7:-87804608 MsG0780041186.01.T01:CDS
TATAAGGGAGAGTTGGATGA+TGG 0.461459 7:-87804601 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCCAAGAAAATCAGGCAAA+GGG 0.462504 7:+87805892 None:intergenic
GAAGCTTTAAACTTCGGAAT+CGG 0.463236 7:+87805531 None:intergenic
AGTCCCACTCCCTGTTCCAT+TGG 0.463721 7:+87804765 None:intergenic
AGAACCATGCTGCCAAGTAT+TGG 0.463913 7:+87803447 None:intergenic
TAGTCTTCCCCTTACCCAAA+TGG 0.465344 7:-87803192 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGTAGAAACAGCAGTGCAAT+CGG 0.466845 7:-87804739 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTTGGTTGTTGTGAGGACTA+AGG 0.471024 7:+87806385 None:intergenic
TTGATCGTAGCACCTATTGC+TGG 0.473320 7:-87804940 MsG0780041186.01.T01:CDS
CAACAAACCATTTGTTTCAC+CGG 0.474258 7:+87803051 None:intergenic
CCCTTGACCATTTGGGTAAG+GGG 0.475571 7:+87803185 None:intergenic
GATGGGAATTCTCTGTTGAA+TGG 0.477484 7:-87805102 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTCAAGCTAGTCCAGTTACT+AGG 0.477637 7:+87805207 None:intergenic
ACCTGAGGAAAGCCAATACT+TGG 0.477702 7:-87803459 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCGATGCCGGAATACTCATC+GGG 0.477788 7:+87803218 None:intergenic
ACCCTTGTTTAACTTGGTTG+GGG 0.477841 7:-87805371 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCAAAGGTTCCAGCAAGCT+TGG 0.479865 7:+87804156 None:intergenic
TAGTAATGGATTGAAACCTA+TGG 0.482304 7:-87805127 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGAGGACTAAGGAGGGTGAG+AGG 0.484398 7:+87806396 None:intergenic
TCCGGACAATATTGGTGACT+TGG 0.485007 7:-87805667 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTAGGATGTCTGGGTTGTCT+AGG 0.485319 7:+87806324 None:intergenic
GTAGAAACAGCAGTGCAATC+GGG 0.486979 7:-87804738 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATCAGACAAGAAGAAACTAA+TGG 0.490735 7:-87803414 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCGTATCAGACGGATCTCT+AGG 0.491854 7:+87804820 None:intergenic
GGAATAACCCTTGTTTAACT+TGG 0.493072 7:-87805377 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTCATGGTAACCGGTTCAC+TGG 0.493230 7:-87805696 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTGTTACTATAAGAAACCT+TGG 0.494766 7:+87805509 None:intergenic
TCAATGCTTCTAACAATGGT+TGG 0.500556 7:-87805986 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACAGTCCATCGGGTGGATCT+GGG 0.504206 7:-87805050 MsG0780041186.01.T01:CDS
AACCCATTTAGCGTTGGTAA+AGG 0.504815 7:+87806119 None:intergenic
CGCGGCCGAGCTCATTCTCA+GGG 0.505607 7:+87804641 None:intergenic
ACTAACCCATCTCTTCAACT+TGG 0.506293 7:-87806168 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATACCAATGGAACAGGGAG+TGG 0.513022 7:-87804769 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGTTTCTTCGTTTATGTCGA+GGG 0.513381 7:+87803376 None:intergenic
TCCGAAGTTTAAAGCTTCCA+AGG 0.513574 7:-87805526 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATCGGCAAGCAAAATGTTTG+AGG 0.514851 7:+87804249 None:intergenic
CCTGAGAATGAGCTCGGCCG+CGG 0.515299 7:-87804640 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAGAAATGGTGTGTGGTTCA+TGG 0.516108 7:+87806433 None:intergenic
ACCTTGGAAGCTTTAAACTT+CGG 0.517182 7:+87805525 None:intergenic
GAAGACCCAAGTTGAAGAGA+TGG 0.518516 7:+87806162 None:intergenic
GAGGAGGCTTAATATTGCCT+TGG 0.519307 7:-87804341 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCCTTGACCATTTGGGTAA+GGG 0.519575 7:+87803184 None:intergenic
TGGAACTGAAGGTCCTTCCT+CGG 0.519655 7:-87805079 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTCAACCACTATTACACCAC+TGG 0.519862 7:+87802910 None:intergenic
TCATCGGGGTCATCGTCAAA+CGG 0.520357 7:+87803233 None:intergenic
TTACGAATGAACTTGGTGCC+TGG 0.521562 7:+87804848 None:intergenic
GGATTGAAACCTATGGTTGA+TGG 0.521780 7:-87805120 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAGACCCAAGTTGAAGAGAT+GGG 0.522048 7:+87806163 None:intergenic
CCGGAATCGAACCAGTGAAC+CGG 0.522380 7:+87805685 None:intergenic
GTGGTTCATGGTTGTTATGG+TGG 0.522693 7:+87806445 None:intergenic
CCCTAGAGATCCGTCTGATA+CGG 0.522974 7:-87804821 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCCAAGAAGGTGGACCACA+TGG 0.523380 7:+87806278 None:intergenic
GAGAATGAGCTCGGCCGCGG+TGG 0.524391 7:-87804637 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCATTTGTTTCACCGGCCAT+CGG 0.525456 7:+87803058 None:intergenic
GAACCTAAATTTGCAACAGA+AGG 0.525623 7:+87805276 None:intergenic
GTTCATGGTTGTTATGGTGG+TGG 0.526082 7:+87806448 None:intergenic
TTCGTTTCAACCGAATCACT+TGG 0.526240 7:+87804988 None:intergenic
ATGGAACAGGGAGTGGGACT+GGG 0.527269 7:-87804762 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGAAAGAAATCCATAGGAA+TGG 0.527388 7:+87806052 None:intergenic
ACAAGCATTCTCATTGATTG+TGG 0.528235 7:+87802796 None:intergenic
CCAAACCAAAGGCCAGAAAT+GGG 0.528419 7:-87803299 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGGTGAAACTTGCTCCTAA+TGG 0.529142 7:-87804196 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACCAAGTCACCAATATTGTC+CGG 0.529750 7:+87805666 None:intergenic
GGTTGTTGTGAGGACTAAGG+AGG 0.531158 7:+87806388 None:intergenic
GCCGTAAAACGAATGGAAGC+AGG 0.533412 7:-87804568 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTGTTGAATGGTGGAACTGA+AGG 0.534441 7:-87805090 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCCTATGGATTTCTTTCAA+GGG 0.534553 7:-87806049 MsG0780041186.01.T01:CDS
GACTCTCATACCATTGAAGC+CGG 0.534744 7:-87804715 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGCCTCTCTCTTGGAAGAGG+AGG 0.534933 7:-87804357 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTATAGGTTATTCTACTGA+AGG 0.535913 7:-87804463 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTGAGGAATCTGAATGTGT+TGG 0.537016 7:-87805190 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCCCTTACCCAAATGGTCA+AGG 0.537027 7:-87803186 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTGAGGTAAAGTTCCAGAA+AGG 0.537664 7:+87806201 None:intergenic
ATGTTTCTTCGTTTATGTCG+AGG 0.538427 7:+87803375 None:intergenic
TGTGATAACCAATAAAGCCT+TGG 0.538695 7:-87804545 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCGAGCCTCTCTCTTGGAAG+AGG 0.539156 7:-87804360 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAGGGATGGCAAGAGGCGGA+GGG 0.540729 7:-87803167 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTTGAATCCTGCAAAGAAGA+AGG 0.541684 7:+87805957 None:intergenic
CTAACCCATCTCTTCAACTT+GGG 0.543191 7:-87806167 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGGAAATTCATCTTCTGCGA+CGG 0.545315 7:-87806260 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTCCAAGAAAATCAGGCAA+AGG 0.545832 7:+87805891 None:intergenic
GATTGAAACCTATGGTTGAT+GGG 0.546758 7:-87805119 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTTGGTTGATTCATGGAGT+GGG 0.547385 7:-87805398 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTGGGAGGTAATCATCTCAA+TGG 0.547737 7:-87805237 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATCTCAATGCTTCTAACAA+TGG 0.551192 7:-87805990 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCGTATCAGACGGATCTCTA+GGG 0.556362 7:+87804821 None:intergenic
ATCCCCAACCAAGTTAAACA+AGG 0.558834 7:+87805369 None:intergenic
ATCGATGCCGGAATACTCAT+CGG 0.562884 7:+87803217 None:intergenic
AATGGAGTATCTTCATACTC+TGG 0.563886 7:-87804305 MsG0780041186.01.T01:CDS
GCTATTGCTAATAATACCAA+TGG 0.566771 7:-87804781 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCGATGGCCGGTGAAACAAA+TGG 0.566945 7:-87803058 MsG0780041186.01.T01:exon
CATGAATCAACCAAATTCGA+AGG 0.566967 7:+87805405 None:intergenic
TTAGTTCAAATTAAATTGGG+AGG 0.567614 7:-87805252 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGACTAAGGAGGGTGAGAGG+AGG 0.569117 7:+87806399 None:intergenic
GACTTTAGCTCTAAAATCAT+CGG 0.570963 7:+87804231 None:intergenic
TAAGATTGCCGTAAAACGAA+TGG 0.572180 7:-87804575 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATTTGGTTGATTCATGGAG+TGG 0.572594 7:-87805399 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTGCCCCTGAGAATGAGCT+CGG 0.572851 7:-87804646 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGAGAATTCCCATCAACCAT+AGG 0.572878 7:+87805111 None:intergenic
AGAGAAGTAAAGAGTTTGGG+CGG 0.575239 7:+87806571 None:intergenic
CAAAGACTCTTAACAATTCG+GGG 0.575309 7:-87805812 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTGATAACCCATTTAGCGT+TGG 0.579512 7:+87806113 None:intergenic
TCCATATCACCTAAAGAACT+AGG 0.582577 7:+87805594 None:intergenic
GGTTGTCTTTGAAGTCGTTG+AGG 0.583566 7:+87806345 None:intergenic
GAGTACCAGTGGTGTAATAG+TGG 0.584773 7:-87802915 MsG0780041186.01.T01:three_prime_UTR
AAAGCCAATACTTGGCAGCA+TGG 0.586304 7:-87803451 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGTTCGACATCGGCATCTAG+TGG 0.586754 7:-87804488 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGGAAGACTATAATCGATGC+CGG 0.587361 7:+87803205 None:intergenic
TTCAGCCTGAAACTCATCCA+AGG 0.589642 7:+87804528 None:intergenic
GGGTGAATTACGAATGAACT+TGG 0.591221 7:+87804841 None:intergenic
CGGCCAGAGAACCAAACCAA+AGG 0.592761 7:-87803310 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTTATGCTTATTGTTTCAGG+AGG 0.593527 7:-87804885 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGTTTCAGGAGGACAAAGGA+TGG 0.593550 7:-87804874 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCCCTTACCCAAATGGTCAA+GGG 0.597823 7:-87803185 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTTGGATGTTGCTAGAGGAA+TGG 0.600590 7:-87804323 MsG0780041186.01.T01:CDS
CAAATCCAGTAGGTCTTGCA+GGG 0.600855 7:+87803099 None:intergenic
AAGAGTCTTTGGAATCTCGC+CGG 0.601081 7:+87805824 None:intergenic
TTACTAAAATCCGGCAAAGG+AGG 0.601340 7:+87805144 None:intergenic
AACCCTTGAAAGAAATCCAT+AGG 0.602134 7:+87806047 None:intergenic
TAGAAACAGCAGTGCAATCG+GGG 0.605058 7:-87804737 MsG0780041186.01.T01:CDS
AAGATGAATTTCCAAGAAGG+TGG 0.606577 7:+87806269 None:intergenic
TTCATGTGAGAAGTGAGTGA+AGG 0.606669 7:+87806474 None:intergenic
CGTAGCACCTATTGCTGGTG+TGG 0.607314 7:-87804935 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGTCAAGGGATGGCAAGAGG+CGG 0.610039 7:-87803171 MsG0780041186.01.T01:CDS
CAGAAGATGAATTTCCAAGA+AGG 0.614005 7:+87806266 None:intergenic
GTTCGACATCGGCATCTAGT+GGG 0.618340 7:-87804487 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATGGTCAAGGGATGGCAAG+AGG 0.619242 7:-87803174 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTGAAACAATAAGCATAAAG+CGG 0.619378 7:+87804889 None:intergenic
AGCCTCCTCTTCCAAGAGAG+AGG 0.620524 7:+87804355 None:intergenic
AAAGAATCTGCAAATCCAGT+AGG 0.621311 7:+87803089 None:intergenic
TGAGCTAGCTGGACACTGCA+CGG 0.621816 7:-87803330 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTCTGGAGCCAAGTATCCAA+AGG 0.623165 7:+87804141 None:intergenic
TTCTGTCAAAAGTTCGACAT+CGG 0.628077 7:-87804498 MsG0780041186.01.T01:CDS
TCCCCAACCAAGTTAAACAA+GGG 0.629084 7:+87805370 None:intergenic
TTACCCAAATGGTCAAGGGA+TGG 0.631936 7:-87803181 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGCACCTATTGCTGGTGTGG+CGG 0.636031 7:-87804932 MsG0780041186.01.T01:CDS
TACTTGGCTCCAGAATATGC+AGG 0.637140 7:-87804133 MsG0780041186.01.T01:intron
GAAAGAGAAGAAATGGTGTG+TGG 0.638759 7:+87806426 None:intergenic
GGGATTAAATGCAATGCTGA+TGG 0.639052 7:-87805351 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTGCCTTGGATGTTGCTAG+AGG 0.639723 7:-87804328 MsG0780041186.01.T01:CDS
CCATTACTAAAATCCGGCAA+AGG 0.642132 7:+87805141 None:intergenic
ATACCAATGGAACAGGGAGT+GGG 0.643745 7:-87804768 MsG0780041186.01.T01:CDS
ATTCTACTGAAGGTAATGAG+AGG 0.647267 7:-87804453 MsG0780041186.01.T01:CDS
GGGAATTCTCTGTTGAATGG+TGG 0.648292 7:-87805099 MsG0780041186.01.T01:CDS
AGGGATGGCAAGAGGCGGAG+GGG 0.648954 7:-87803166 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTTGTTGTGAGGACTAAGGA+GGG 0.650878 7:+87806389 None:intergenic
GTATTCCCAGATCCACCCGA+TGG 0.651847 7:+87805045 None:intergenic
AGGCAAAATGTGAGTACCAG+TGG 0.655176 7:-87802926 MsG0780041186.01.T01:three_prime_UTR
GAATACTGGTGAAGATACGA+AGG 0.658624 7:-87805028 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTAATAATACCAATGGAACA+GGG 0.659562 7:-87804774 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTAGTAACTGGACTAGCTTG+AGG 0.663858 7:-87805206 MsG0780041186.01.T01:CDS
CGTCTGGGTTGGTTGTTGTG+AGG 0.665003 7:+87806378 None:intergenic
TCCAAGAAGGTGGACCACAT+GGG 0.665384 7:+87806279 None:intergenic
CATTCCTCTAGCAACATCCA+AGG 0.671298 7:+87804324 None:intergenic
ACGGTACTGTCCGTATCAGA+CGG 0.672474 7:+87804811 None:intergenic
GCCATAACTTCAAAAGAACA+AGG 0.673744 7:+87805459 None:intergenic
GAACTGAAGGTCCTTCCTCG+GGG 0.674116 7:-87805077 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACATATGGCAATGAACGTTG+AGG 0.674411 7:+87802753 None:intergenic
ACTTGATGAGAGCAGACCTG+AGG 0.679600 7:-87803474 MsG0780041186.01.T01:CDS
GCTGTGGTTGAATAACCAGA+AGG 0.683334 7:-87805781 MsG0780041186.01.T01:CDS
TGCTGACTGAGAGCACCTTG+TGG 0.687886 7:+87804409 None:intergenic
ATTCGGGGTTGCAAATGCTG+TGG 0.690840 7:-87805797 MsG0780041186.01.T01:CDS
GTGTATGAGTATATGCCACA+AGG 0.691912 7:-87804424 MsG0780041186.01.T01:CDS
CTGTGGTTGAATAACCAGAA+GGG 0.697805 7:-87805780 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACAACCCAGACATCCTACAA+TGG 0.703196 7:-87806319 MsG0780041186.01.T01:CDS
TTATTGTTTCAGGAGGACAA+AGG 0.704940 7:-87804878 MsG0780041186.01.T01:CDS
AATACTGGTGAAGATACGAA+GGG 0.706490 7:-87805027 MsG0780041186.01.T01:CDS
ACTGGTGAAGATACGAAGGG+AGG 0.724022 7:-87805024 MsG0780041186.01.T01:CDS
GCGGCCGAGCTCATTCTCAG+GGG 0.726114 7:+87804642 None:intergenic
CGATGCCGGAATACTCATCG+GGG 0.741984 7:+87803219 None:intergenic
AAACAACTCCAAATCCACCG+CGG 0.812229 7:+87804623 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TCTTTAGTTCAAATTAAATT+GGG - Chr7:87804101-87804120 MsG0780041186.01.T01:intron 15.0%
!!! TTCTTTAGTTCAAATTAAAT+TGG - Chr7:87804100-87804119 MsG0780041186.01.T01:intron 15.0%
!! AAAATCAAAAAAGAAAAGCT+TGG - Chr7:87804391-87804410 MsG0780041186.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATTTAACAAAAAAAACCC+AGG + Chr7:87805777-87805796 None:intergenic 20.0%
!! CTTAAAGATCTTAATCTTAA+TGG - Chr7:87803717-87803736 MsG0780041186.01.T01:intron 20.0%
!!! AGCTTGATTTGAATAATAAT+CGG - Chr7:87803793-87803812 MsG0780041186.01.T01:intron 20.0%
!!! GATTTTTGTTTAAATGAAAC+TGG - Chr7:87803870-87803889 MsG0780041186.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGAATAATAATCGGTTTAT+GGG - Chr7:87803801-87803820 MsG0780041186.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGAATAATAATCGGTTTA+TGG - Chr7:87803800-87803819 MsG0780041186.01.T01:intron 20.0%
! AAAAAATTACCTGCATATTC+TGG + Chr7:87805235-87805254 None:intergenic 25.0%
! AAAGATAAAAAGAAGGTGAA+AGG + Chr7:87806362-87806381 None:intergenic 25.0%
! ATTAGCAATAGCTATCTTTA+CGG + Chr7:87804567-87804586 None:intergenic 25.0%
! ATTGTTACTATAAGAAACCT+TGG + Chr7:87803850-87803869 None:intergenic 25.0%
! CCTAATGAAAGATAAAAAGA+AGG + Chr7:87806369-87806388 None:intergenic 25.0%
! CTTCAAAACAACAAACTTAA+AGG - Chr7:87803213-87803232 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
! TATTGATATTGTTGCTACTA+TGG - Chr7:87803617-87803636 MsG0780041186.01.T01:intron 25.0%
! TCAAATGTTATACTAATCCT+GGG - Chr7:87805757-87805776 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTAAATATATTCAGTGAC+TGG - Chr7:87805787-87805806 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGTTCAAATTAAATTGGG+AGG - Chr7:87804104-87804123 MsG0780041186.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAATGTTATACTAATCC+TGG - Chr7:87805756-87805775 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAATCCATTACTAAAATC+CGG + Chr7:87804224-87804243 None:intergenic 25.0%
!! AAAGTAGATGTTTTCAGTTT+TGG - Chr7:87805823-87805842 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTAGATGTTTTCAGTTTT+GGG - Chr7:87805824-87805843 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTGCAGATTCTTTTACTT+CGG - Chr7:87806275-87806294 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
!! CCTTCTTTTTATCTTTCATT+AGG - Chr7:87806366-87806385 MsG0780041186.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCATTTTTCCAAGAAAATC+AGG + Chr7:87803474-87803493 None:intergenic 25.0%
AAAACCATATGCAGAAACTT+CGG + Chr7:87805326-87805345 None:intergenic 30.0%
AAATTCAAGTCCAAGTGATT+CGG - Chr7:87804358-87804377 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
AACTGATATCACAAGATTTC+CGG + Chr7:87804663-87804682 None:intergenic 30.0%
AATCTCAATGCTTCTAACAA+TGG - Chr7:87803366-87803385 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGACAAGAAGAAACTAA+TGG - Chr7:87805942-87805961 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
ATTCCTATGGATTTCTTTCA+AGG - Chr7:87803306-87803325 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
CTAATAATACCAATGGAACA+GGG - Chr7:87804582-87804601 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
CTGAAACAATAAGCATAAAG+CGG + Chr7:87804470-87804489 None:intergenic 30.0%
CTTATAGGTTATTCTACTGA+AGG - Chr7:87804893-87804912 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
CTTCAGTAGAATAACCTATA+AGG + Chr7:87804895-87804914 None:intergenic 30.0%
GCTATTGCTAATAATACCAA+TGG - Chr7:87804575-87804594 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
GTCTTGTATCAGTTGTAATT+TGG - Chr7:87803437-87803456 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
GTTGAATTATCCTTCGAATT+TGG - Chr7:87803941-87803960 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
TCCAAAGACTCTTAACAATT+CGG - Chr7:87803542-87803561 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
TGTATCAGTTGTAATTTGGT+TGG - Chr7:87803441-87803460 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
TTCCTATGGATTTCTTTCAA+GGG - Chr7:87803307-87803326 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTTAGGTGATATGGAAT+TGG - Chr7:87803767-87803786 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
TTGAAAGAAATCCATAGGAA+TGG + Chr7:87803307-87803326 None:intergenic 30.0%
TTTATGCTTATTGTTTCAGG+AGG - Chr7:87804471-87804490 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
TTTGATTAATGTTGTTAGCC+TGG - Chr7:87805456-87805475 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! ACTACAGATTTTTCACCATT+AGG + Chr7:87805178-87805197 None:intergenic 30.0%
! AGTAGATGTTTTCAGTTTTG+GGG - Chr7:87805825-87805844 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! GGATTTGGAGTTGTTTATAA+GGG - Chr7:87804740-87804759 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! TAAAGTCTCAGATTTTGGAT+TGG - Chr7:87805141-87805160 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! TCATTTCTGCATTTTCTATC+TGG - Chr7:87805706-87805725 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! TGGATTTGGAGTTGTTTATA+AGG - Chr7:87804739-87804758 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
! TGGTTTCTCTTACTAGTTTA+TGG - Chr7:87803637-87803656 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
! TTGAAGTTATGGCTCTTTTA+GGG - Chr7:87803907-87803926 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
! TTGTCAAATTTGAAGCTTTC+TGG - Chr7:87803498-87803517 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
!! ACCTCTTAATTTGTCTTCTA+GGG - Chr7:87805418-87805437 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGCAACGTTTTAATCTTAG+TGG - Chr7:87804047-87804066 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
!! GACTTTAGCTCTAAAATCAT+CGG + Chr7:87805128-87805147 None:intergenic 30.0%
!! TAGTAATGGATTGAAACCTA+TGG - Chr7:87804229-87804248 MsG0780041186.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTCTACATTTAAGTGTTGA+TGG - Chr7:87806522-87806541 MsG0780041186.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
!! TTTGAAGTTATGGCTCTTTT+AGG - Chr7:87803906-87803925 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
!!! TCCTTGTTCTTTTGAAGTTA+TGG - Chr7:87803896-87803915 MsG0780041186.01.T01:intron 30.0%
AAAGAATCTGCAAATCCAGT+AGG + Chr7:87806270-87806289 None:intergenic 35.0%
AACCCTTGAAAGAAATCCAT+AGG + Chr7:87803312-87803331 None:intergenic 35.0%
AAGATGAATTTCCAAGAAGG+TGG + Chr7:87803090-87803109 None:intergenic 35.0%
AATACTGGTGAAGATACGAA+GGG - Chr7:87804329-87804348 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
ACCAAAAACTTGAACCTTTC+TGG - Chr7:87803141-87803160 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAGAGAAAGAGAAGAAA+TGG + Chr7:87802940-87802959 None:intergenic 35.0%
AGTCCTTCTGTTGCAAATTT+AGG - Chr7:87804077-87804096 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
AGTTGTTTATAAGGGAGAGT+TGG - Chr7:87804748-87804767 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAAGCTCTTGAAGTAAC+AGG + Chr7:87805620-87805639 None:intergenic 35.0%
ATGTTTCTTCGTTTATGTCG+AGG + Chr7:87805984-87806003 None:intergenic 35.0%
ATTCTACTGAAGGTAATGAG+AGG - Chr7:87804903-87804922 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGACTCTTAACAATTCG+GGG - Chr7:87803544-87803563 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
CAACAAACCATTTGTTTCAC+CGG + Chr7:87806308-87806327 None:intergenic 35.0%
CAGAAGATGAATTTCCAAGA+AGG + Chr7:87803093-87803112 None:intergenic 35.0%
CATGAATCAACCAAATTCGA+AGG + Chr7:87803954-87803973 None:intergenic 35.0%
CCAAAGACTCTTAACAATTC+GGG - Chr7:87803543-87803562 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
CGCTTTATGCTTATTGTTTC+AGG - Chr7:87804468-87804487 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
CTTAATGGAAATGAGCTTGT+TGG - Chr7:87803732-87803751 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
CTTTCTGTCTAAAAATGCCA+AGG - Chr7:87806410-87806429 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
GAACCTAAATTTGCAACAGA+AGG + Chr7:87804083-87804102 None:intergenic 35.0%
GAATCAGTTACTCAATTACC+AGG + Chr7:87805477-87805496 None:intergenic 35.0%
GAGAGAGAAGTAAAGAGTTT+GGG + Chr7:87802791-87802810 None:intergenic 35.0%
GATTGAAACCTATGGTTGAT+GGG - Chr7:87804237-87804256 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
GCCATAACTTCAAAAGAACA+AGG + Chr7:87803900-87803919 None:intergenic 35.0%
GCTAATAATACCAATGGAAC+AGG - Chr7:87804581-87804600 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
GGGAAAAATAGTTGAATGAG+TGG + Chr7:87805596-87805615 None:intergenic 35.0%
TAAGATTGCCGTAAAACGAA+TGG - Chr7:87804781-87804800 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TAATATTTCACCTCCTTTGC+CGG - Chr7:87804202-87804221 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAGCTCTTGAAGTAACA+GGG + Chr7:87805619-87805638 None:intergenic 35.0%
TCAATGCTTCTAACAATGGT+TGG - Chr7:87803370-87803389 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TCCATATCACCTAAAGAACT+AGG + Chr7:87803765-87803784 None:intergenic 35.0%
TGAGAGAGAAGTAAAGAGTT+TGG + Chr7:87802792-87802811 None:intergenic 35.0%
TGTGATAACCAATAAAGCCT+TGG - Chr7:87804811-87804830 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTCTTCGTTTATGTCGA+GGG + Chr7:87805983-87806002 None:intergenic 35.0%
TTATTGTTTCAGGAGGACAA+AGG - Chr7:87804478-87804497 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAAGAAAATCAGGCAAA+GGG + Chr7:87803467-87803486 None:intergenic 35.0%
TTCTGTCAAAAGTTCGACAT+CGG - Chr7:87804858-87804877 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
TTTCCAAGAAAATCAGGCAA+AGG + Chr7:87803468-87803487 None:intergenic 35.0%
! AAACTCATCCAAGGCTTTAT+TGG + Chr7:87804822-87804841 None:intergenic 35.0%
! AATGGAGTATCTTCATACTC+TGG - Chr7:87805051-87805070 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
! AATTTGGTTGATTCATGGAG+TGG - Chr7:87803957-87803976 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! ACAAGCATTCTCATTGATTG+TGG + Chr7:87806563-87806582 None:intergenic 35.0%
! AGAGCTAAAGTCTCAGATTT+TGG - Chr7:87805136-87805155 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
! AGTAGTGTCAGTTTTCTGTA+AGG - Chr7:87805351-87805370 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTGGTTGATTCATGGAGT+GGG - Chr7:87803958-87803977 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! CTTACTAGTTTATGGCTTCA+TGG - Chr7:87803645-87803664 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! CTTCGAATTTGGTTGATTCA+TGG - Chr7:87803952-87803971 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! CTTTCTGGTAACAGTTTAAC+CGG - Chr7:87803513-87803532 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
! GAATTTTCCTTCTTCTTTGC+AGG - Chr7:87803392-87803411 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
! GGAATAACCCTTGTTTAACT+TGG - Chr7:87803979-87803998 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! GTTAGTTGGTTGAGATTTTG+AGG + Chr7:87803174-87803193 None:intergenic 35.0%
! TCCTAGTTCTTTAGGTGATA+TGG - Chr7:87803761-87803780 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
! TGAAGTCGTTGAGGATTTTA+AGG + Chr7:87803005-87803024 None:intergenic 35.0%
! TTTGAGGTAAAGTTCCAGAA+AGG + Chr7:87803158-87803177 None:intergenic 35.0%
! TTTGATAACCCATTTAGCGT+TGG + Chr7:87803246-87803265 None:intergenic 35.0%
!! AACCCTTGTTTAACTTGGTT+GGG - Chr7:87803984-87804003 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
!! ACCTTGGAAGCTTTAAACTT+CGG + Chr7:87803834-87803853 None:intergenic 35.0%
!! CTTTTTCATTGGAAGAGCTT+TGG - Chr7:87804971-87804990 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAGCTTTAAACTTCGGAAT+CGG + Chr7:87803828-87803847 None:intergenic 35.0%
!! GACCTCTTAATTTGTCTTCT+AGG - Chr7:87805417-87805436 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTTTCCATTTTTCAACAAG+TGG + Chr7:87806105-87806124 None:intergenic 35.0%
!! TAACCCTTGTTTAACTTGGT+TGG - Chr7:87803983-87804002 MsG0780041186.01.T01:intron 35.0%
!! TAATGCAAGAGTGTCTAAAC+TGG + Chr7:87803337-87803356 None:intergenic 35.0%
!! TCAGTCAGCATCTTTTTCAT+TGG - Chr7:87804960-87804979 MsG0780041186.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCAGAAAGGTTCAAGTTTT+TGG + Chr7:87803145-87803164 None:intergenic 35.0%
AAAAACAACAACGACCCATG+TGG - Chr7:87803063-87803082 MsG0780041186.01.T01:exon 40.0%
AAAGCTCTTGAAGTAACAGG+GGG + Chr7:87805617-87805636 None:intergenic 40.0%
AAGAAATGGTGTGTGGTTCA+TGG + Chr7:87802926-87802945 None:intergenic 40.0%
ACCAAGTCACCAATATTGTC+CGG + Chr7:87803693-87803712 None:intergenic 40.0%
ACTAACCCATCTCTTCAACT+TGG - Chr7:87803188-87803207 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAAGTAAAGAGTTTGGG+CGG + Chr7:87802788-87802807 None:intergenic 40.0%
AGAGAATTCCCATCAACCAT+AGG + Chr7:87804248-87804267 None:intergenic 40.0%
AGGAGAAGAAAAAGAGAGTG+TGG + Chr7:87802865-87802884 None:intergenic 40.0%
AGTAGAAACAGCAGTGCAAT+CGG - Chr7:87804617-87804636 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
ATCCCCAACCAAGTTAAACA+AGG + Chr7:87803990-87804009 None:intergenic 40.0%
ATCGGCAAGCAAAATGTTTG+AGG + Chr7:87805110-87805129 None:intergenic 40.0%
ATTCTCAGGGGCAAAATTCT+TGG + Chr7:87804705-87804724 None:intergenic 40.0%
CAAAGCTCTTGAAGTAACAG+GGG + Chr7:87805618-87805637 None:intergenic 40.0%
CCATTACTAAAATCCGGCAA+AGG + Chr7:87804218-87804237 None:intergenic 40.0%
CCCGAATTGTTAAGAGTCTT+TGG + Chr7:87803546-87803565 None:intergenic 40.0%
CGAATTCGATTCCATTCCTA+TGG - Chr7:87803293-87803312 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
CTAACCCATCTCTTCAACTT+GGG - Chr7:87803189-87803208 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
CTGTGGTTGAATAACCAGAA+GGG - Chr7:87803576-87803595 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
CTTACCGAAGTTTCTGCATA+TGG - Chr7:87805319-87805338 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAGGAATCTGAATGTGT+TGG - Chr7:87804166-87804185 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGAGAAGAAATGGTGTG+TGG + Chr7:87802933-87802952 None:intergenic 40.0%
GAATACTGGTGAAGATACGA+AGG - Chr7:87804328-87804347 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GACCTTTACCAACGCTAAAT+GGG - Chr7:87803235-87803254 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GATGGGAATTCTCTGTTGAA+TGG - Chr7:87804254-87804273 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GCCCTAGAAGACAAATTAAG+AGG + Chr7:87805422-87805441 None:intergenic 40.0%
GGATTGAAACCTATGGTTGA+TGG - Chr7:87804236-87804255 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GGGATTAAATGCAATGCTGA+TGG - Chr7:87804005-87804024 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
GGGTGAATTACGAATGAACT+TGG + Chr7:87804518-87804537 None:intergenic 40.0%
GTGTATGAGTATATGCCACA+AGG - Chr7:87804932-87804951 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAATCCTGCAAAGAAGA+AGG + Chr7:87803402-87803421 None:intergenic 40.0%
GTTTATGGCTTCATGGTAAC+CGG - Chr7:87803652-87803671 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
TAAAGCCTTGGATGAGTTTC+AGG - Chr7:87804823-87804842 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
TACTGCTCTTACTGTCTTCT+AGG + Chr7:87806236-87806255 None:intergenic 40.0%
TATAAGGGAGAGTTGGATGA+TGG - Chr7:87804755-87804774 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
TCAATTATTGCTGAGCTAGC+TGG - Chr7:87806015-87806034 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
TCCCCAACCAAGTTAAACAA+GGG + Chr7:87803989-87804008 None:intergenic 40.0%
TGGAAATTCATCTTCTGCGA+CGG - Chr7:87803096-87803115 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTGGTTCATGGTTGTTA+TGG + Chr7:87802917-87802936 None:intergenic 40.0%
TTACTAAAATCCGGCAAAGG+AGG + Chr7:87804215-87804234 None:intergenic 40.0%
TTCATGTGAGAAGTGAGTGA+AGG + Chr7:87802885-87802904 None:intergenic 40.0%
TTCGTTTCAACCGAATCACT+TGG + Chr7:87804371-87804390 None:intergenic 40.0%
TTGGGAGGTAATCATCTCAA+TGG - Chr7:87804119-87804138 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
! AAGACCCAAGTTGAAGAGAT+GGG + Chr7:87803196-87803215 None:intergenic 40.0%
! ACCTGCTTCCATTCGTTTTA+CGG + Chr7:87804792-87804811 None:intergenic 40.0%
! TCCGAAGTTTAAAGCTTCCA+AGG - Chr7:87803830-87803849 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
! TCGCACCACTTGTTGAAAAA+TGG - Chr7:87806097-87806116 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
! TGTCAGTTTTCTGTAAGGTG+TGG - Chr7:87805356-87805375 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGTGAAACTTGCTCCTAA+TGG - Chr7:87805160-87805179 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
!! AACCCATTTAGCGTTGGTAA+AGG + Chr7:87803240-87803259 None:intergenic 40.0%
!! ACCCTTGTTTAACTTGGTTG+GGG - Chr7:87803985-87804004 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
!! AGTTGAAGAGATGGGTTAGT+TGG + Chr7:87803188-87803207 None:intergenic 40.0%
!! ATGGTGTTGTACCTAGTAAC+TGG - Chr7:87804138-87804157 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTGCCGGATTTTAGTAA+TGG - Chr7:87804215-87804234 MsG0780041186.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTCTTGTTCCTAGTTCTTT+AGG - Chr7:87803753-87803772 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
!!! ACATGGGTCGTTGTTGTTTT+TGG + Chr7:87803064-87803083 None:intergenic 40.0%
!!! ATGGCTCTTTTAGGGTTTCT+TGG - Chr7:87803915-87803934 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
!!! CATGGGTCGTTGTTGTTTTT+GGG + Chr7:87803063-87803082 None:intergenic 40.0%
!!! CTCTTTTAGGGTTTCTTGGT+GGG - Chr7:87803919-87803938 MsG0780041186.01.T01:intron 40.0%
!!! TGAGGATTTTAAGGTCGTCT+GGG + Chr7:87802996-87803015 None:intergenic 40.0%
!!! TGTTGTTTTTGGGCCATTGT+AGG + Chr7:87803053-87803072 None:intergenic 40.0%
!!! TTGAGGATTTTAAGGTCGTC+TGG + Chr7:87802997-87803016 None:intergenic 40.0%
AAACAACTCCAAATCCACCG+CGG + Chr7:87804736-87804755 None:intergenic 45.0%
AAAGCCAATACTTGGCAGCA+TGG - Chr7:87805905-87805924 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
AAGCTCTTGAAGTAACAGGG+GGG + Chr7:87805616-87805635 None:intergenic 45.0%
AATACCAATGGAACAGGGAG+TGG - Chr7:87804587-87804606 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
AATACTTGGCAGCATGGTTC+TGG - Chr7:87805911-87805930 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
ACAACCCAGACATCCTACAA+TGG - Chr7:87803037-87803056 MsG0780041186.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
ACCAAACCAAAGGCCAGAAA+TGG - Chr7:87806056-87806075 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
ACCTGAGGAAAGCCAATACT+TGG - Chr7:87805897-87805916 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
AGAACCATGCTGCCAAGTAT+TGG + Chr7:87805912-87805931 None:intergenic 45.0%
AGGCAAAATGTGAGTACCAG+TGG - Chr7:87806430-87806449 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
AGTAAAGAGTTTGGGCGGTT+TGG + Chr7:87802783-87802802 None:intergenic 45.0%
ATACCAATGGAACAGGGAGT+GGG - Chr7:87804588-87804607 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
ATCCCTTGACCATTTGGGTA+AGG + Chr7:87806176-87806195 None:intergenic 45.0%
ATCGATGCCGGAATACTCAT+CGG + Chr7:87806142-87806161 None:intergenic 45.0%
ATTGCCTTGGATGTTGCTAG+AGG - Chr7:87805028-87805047 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
CAAATCCAGTAGGTCTTGCA+GGG + Chr7:87806260-87806279 None:intergenic 45.0%
CACAAGATTTCCGGCTTCAA+TGG + Chr7:87804654-87804673 None:intergenic 45.0%
CAGAAGGGTGAGTTGTTATC+TGG - Chr7:87803591-87803610 MsG0780041186.01.T01:intron 45.0%
CAGATAACAACTCACCCTTC+TGG + Chr7:87803593-87803612 None:intergenic 45.0%
CATTCCTCTAGCAACATCCA+AGG + Chr7:87805035-87805054 None:intergenic 45.0%
CCAAACCAAAGGCCAGAAAT+GGG - Chr7:87806057-87806076 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
CTCAACCACTATTACACCAC+TGG + Chr7:87806449-87806468 None:intergenic 45.0%
CTCAAGCTAGTCCAGTTACT+AGG + Chr7:87804152-87804171 None:intergenic 45.0%
CTTCGTTTATGTCGAGGGTT+GGG + Chr7:87805978-87805997 None:intergenic 45.0%
CTTGGATGTTGCTAGAGGAA+TGG - Chr7:87805033-87805052 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GACTCTCATACCATTGAAGC+CGG - Chr7:87804641-87804660 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GAGGAGGCTTAATATTGCCT+TGG - Chr7:87805015-87805034 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTCAATAGCTACCACAT+CGG + Chr7:87805403-87805422 None:intergenic 45.0%
GAGTACCAGTGGTGTAATAG+TGG - Chr7:87806441-87806460 MsG0780041186.01.T01:exon 45.0%
GCTGTGGTTGAATAACCAGA+AGG - Chr7:87803575-87803594 MsG0780041186.01.T01:intron 45.0%
GGACCTTTACCAACGCTAAA+TGG - Chr7:87803234-87803253 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAGACTATAATCGATGC+CGG + Chr7:87806154-87806173 None:intergenic 45.0%
GGGAATTCTCTGTTGAATGG+TGG - Chr7:87804257-87804276 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GGGGAAGGACACAAGTTATA+TGG - Chr7:87806209-87806228 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCGATTCCGGACAATAT+TGG - Chr7:87803681-87803700 MsG0780041186.01.T01:intron 45.0%
GTAGAAACAGCAGTGCAATC+GGG - Chr7:87804618-87804637 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
GTGGTTCATGGTTGTTATGG+TGG + Chr7:87802914-87802933 None:intergenic 45.0%
GTTCATGGTTGTTATGGTGG+TGG + Chr7:87802911-87802930 None:intergenic 45.0%
GTTGGTTGTTGTGAGGACTA+AGG + Chr7:87802974-87802993 None:intergenic 45.0%
GTTGTTGTGAGGACTAAGGA+GGG + Chr7:87802970-87802989 None:intergenic 45.0%
TACTTGGCTCCAGAATATGC+AGG - Chr7:87805223-87805242 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TAGAAACAGCAGTGCAATCG+GGG - Chr7:87804619-87804638 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TAGTCTTCCCCTTACCCAAA+TGG - Chr7:87806164-87806183 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TCCCTTGACCATTTGGGTAA+GGG + Chr7:87806175-87806194 None:intergenic 45.0%
TCTTCGTTTATGTCGAGGGT+TGG + Chr7:87805979-87805998 None:intergenic 45.0%
TGCTGGAACCTTTGGATACT+TGG - Chr7:87805207-87805226 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TGTTTCAGGAGGACAAAGGA+TGG - Chr7:87804482-87804501 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TTACCCAAATGGTCAAGGGA+TGG - Chr7:87806175-87806194 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TTCAGCCTGAAACTCATCCA+AGG + Chr7:87804831-87804850 None:intergenic 45.0%
TTGACAGCATGACCCATTTC+TGG + Chr7:87806072-87806091 None:intergenic 45.0%
TTGATCGTAGCACCTATTGC+TGG - Chr7:87804416-87804435 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
TTGCCATCCCTTGACCATTT+GGG + Chr7:87806181-87806200 None:intergenic 45.0%
! CTGGTACTCACATTTTGCCT+TGG + Chr7:87806430-87806449 None:intergenic 45.0%
! CTGTTGAATGGTGGAACTGA+AGG - Chr7:87804266-87804285 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
! GAAGACCCAAGTTGAAGAGA+TGG + Chr7:87803197-87803216 None:intergenic 45.0%
! GATTCTTTTACTTCGGCCGA+TGG - Chr7:87806282-87806301 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
! TCCGGACAATATTGGTGACT+TGG - Chr7:87803689-87803708 MsG0780041186.01.T01:intron 45.0%
!! AAGAGTCTTTGGAATCTCGC+CGG + Chr7:87803535-87803554 None:intergenic 45.0%
!! CTAGTAACTGGACTAGCTTG+AGG - Chr7:87804150-87804169 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTTGTCTTTGAAGTCGTTG+AGG + Chr7:87803014-87803033 None:intergenic 45.0%
!! TTACGAATGAACTTGGTGCC+TGG + Chr7:87804511-87804530 None:intergenic 45.0%
!! TTCTGGAGCCAAGTATCCAA+AGG + Chr7:87805218-87805237 None:intergenic 45.0%
!!! CAGTTTTGGGGTTGTGCTAA+TGG - Chr7:87805837-87805856 MsG0780041186.01.T01:CDS 45.0%
!!! GATTTTAAGGTCGTCTGGGT+TGG + Chr7:87802992-87803011 None:intergenic 45.0%
!!! GCTCTTTTAGGGTTTCTTGG+TGG - Chr7:87803918-87803937 MsG0780041186.01.T01:intron 45.0%
AATGGTCAAGGGATGGCAAG+AGG - Chr7:87806182-87806201 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
ACGGTACTGTCCGTATCAGA+CGG + Chr7:87804548-87804567 None:intergenic 50.0%
ACTGGTGAAGATACGAAGGG+AGG - Chr7:87804332-87804351 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
ACTTGATGAGAGCAGACCTG+AGG - Chr7:87805882-87805901 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
AGTATCCCTGCAAGACCTAC+TGG - Chr7:87806252-87806271 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
AGTGATCTCTCTAGCCGATG+TGG - Chr7:87805386-87805405 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
AGTTCGACATCGGCATCTAG+TGG - Chr7:87804868-87804887 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
ATTCGGGGTTGCAAATGCTG+TGG - Chr7:87803559-87803578 MsG0780041186.01.T01:intron 50.0%
CCATTTGTTTCACCGGCCAT+CGG + Chr7:87806301-87806320 None:intergenic 50.0%
CCCCTTACCCAAATGGTCAA+GGG - Chr7:87806171-87806190 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
CCCTAGAGATCCGTCTGATA+CGG - Chr7:87804535-87804554 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
CCCTTGACCATTTGGGTAAG+GGG + Chr7:87806174-87806193 None:intergenic 50.0%
CCGTATCAGACGGATCTCTA+GGG + Chr7:87804538-87804557 None:intergenic 50.0%
CTCGGGGAAAAACAGTCCAT+CGG - Chr7:87804295-87804314 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
CTTGCCATCCCTTGACCATT+TGG + Chr7:87806182-87806201 None:intergenic 50.0%
GAGGACAAAGGATGGTTTCC+AGG - Chr7:87804490-87804509 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
GATGACCCCGATGAGTATTC+CGG - Chr7:87806132-87806151 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
GCAAATCCAGTAGGTCTTGC+AGG + Chr7:87806261-87806280 None:intergenic 50.0%
GCCGTAAAACGAATGGAAGC+AGG - Chr7:87804788-87804807 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
GGAGCTGTTGTCTGGATTGA+TGG - Chr7:87805858-87805877 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
GGTTGTTGTGAGGACTAAGG+AGG + Chr7:87802971-87802990 None:intergenic 50.0%
GTAGGATGTCTGGGTTGTCT+AGG + Chr7:87803035-87803054 None:intergenic 50.0%
GTGCTAATGGAGCTGTTGTC+TGG - Chr7:87805850-87805869 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
GTTCGACATCGGCATCTAGT+GGG - Chr7:87804869-87804888 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
TATGTCGAGGGTTGGGTCAA+TGG + Chr7:87805971-87805990 None:intergenic 50.0%
TCATCGGGGTCATCGTCAAA+CGG + Chr7:87806126-87806145 None:intergenic 50.0%
TCCAAAGGTTCCAGCAAGCT+TGG + Chr7:87805203-87805222 None:intergenic 50.0%
TCCAAGAAGGTGGACCACAT+GGG + Chr7:87803080-87803099 None:intergenic 50.0%
TCCCCTTACCCAAATGGTCA+AGG - Chr7:87806170-87806189 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
TCCGTATCAGACGGATCTCT+AGG + Chr7:87804539-87804558 None:intergenic 50.0%
TCGATGCCGGAATACTCATC+GGG + Chr7:87806141-87806160 None:intergenic 50.0%
TCGGGGAAAAACAGTCCATC+GGG - Chr7:87804296-87804315 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
TCTGTAGTGACCAAGCTTGC+TGG - Chr7:87805190-87805209 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
TGGAACTGAAGGTCCTTCCT+CGG - Chr7:87804277-87804296 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
TGGGCCATTGTAGGATGTCT+GGG + Chr7:87803044-87803063 None:intergenic 50.0%
TTCCAAGAAGGTGGACCACA+TGG + Chr7:87803081-87803100 None:intergenic 50.0%
TTGGGCCATTGTAGGATGTC+TGG + Chr7:87803045-87803064 None:intergenic 50.0%
TTTGCCCCTGAGAATGAGCT+CGG - Chr7:87804710-87804729 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
! CATCGGCTAGAGAGATCACT+AGG + Chr7:87805386-87805405 None:intergenic 50.0%
! CTTCATGGTAACCGGTTCAC+TGG - Chr7:87803660-87803679 MsG0780041186.01.T01:intron 50.0%
! GGCCCTTTGCCTGATTTTCT+TGG - Chr7:87803462-87803481 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
!! ACCAAGCTTGCTGGAACCTT+TGG - Chr7:87805199-87805218 MsG0780041186.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAGTTTGGGCGGTTTGGTT+TGG + Chr7:87802778-87802797 None:intergenic 50.0%
!! CATGACCCATTTCTGGCCTT+TGG + Chr7:87806065-87806084 None:intergenic 50.0%
!! CCCATTTCTGGCCTTTGGTT+TGG + Chr7:87806060-87806079 None:intergenic 50.0%
!! GCCAAGTATTGGCTTTCCTC+AGG + Chr7:87805901-87805920 None:intergenic 50.0%
!! GGCGGTTTGGTTTGGTTTGA+GGG + Chr7:87802770-87802789 None:intergenic 50.0%
!! TGGCCTTTGGTTTGGTTCTC+TGG + Chr7:87806052-87806071 None:intergenic 50.0%
AACAGTCCATCGGGTGGATC+TGG - Chr7:87804305-87804324 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
AATGGAACAGGGAGTGGGAC+TGG - Chr7:87804593-87804612 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
ACAGTCCATCGGGTGGATCT+GGG - Chr7:87804306-87804325 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
ACCCATGTGGTCCACCTTCT+TGG - Chr7:87803076-87803095 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
AGCACCTATTGCTGGTGTGG+CGG - Chr7:87804424-87804443 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
AGCCTCCTCTTCCAAGAGAG+AGG + Chr7:87805004-87805023 None:intergenic 55.0%
AGCCTCTCTCTTGGAAGAGG+AGG - Chr7:87804999-87805018 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
AGTCCCACTCCCTGTTCCAT+TGG + Chr7:87804594-87804613 None:intergenic 55.0%
ATGGAACAGGGAGTGGGACT+GGG - Chr7:87804594-87804613 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
CCGATGGCCGGTGAAACAAA+TGG - Chr7:87806298-87806317 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
CCGGAATCGAACCAGTGAAC+CGG + Chr7:87803674-87803693 None:intergenic 55.0%
CGATGCCGGAATACTCATCG+GGG + Chr7:87806140-87806159 None:intergenic 55.0%
CGGCCAGAGAACCAAACCAA+AGG - Chr7:87806046-87806065 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
CGTAGCACCTATTGCTGGTG+TGG - Chr7:87804421-87804440 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
GAACTGAAGGTCCTTCCTCG+GGG - Chr7:87804279-87804298 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
GGAACTGAAGGTCCTTCCTC+GGG - Chr7:87804278-87804297 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
GGGAAAAACAGTCCATCGGG+TGG - Chr7:87804299-87804318 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
GTATTCCCAGATCCACCCGA+TGG + Chr7:87804314-87804333 None:intergenic 55.0%
TCGAGCCTCTCTCTTGGAAG+AGG - Chr7:87804996-87805015 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
TCGGGTGGATCTGGGAATAC+TGG - Chr7:87804314-87804333 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
TGAGCTAGCTGGACACTGCA+CGG - Chr7:87806026-87806045 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
TGAGGACTAAGGAGGGTGAG+AGG + Chr7:87802963-87802982 None:intergenic 55.0%
TTGGACTCGAGCCTCTCTCT+TGG - Chr7:87804990-87805009 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
! CGGCATCTAGTGGGCCTTAT+AGG - Chr7:87804878-87804897 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
! CTTTTACTTCGGCCGATGGC+CGG - Chr7:87806286-87806305 MsG0780041186.01.T01:CDS 55.0%
!! CCGGTTCACTGGTTCGATTC+CGG - Chr7:87803671-87803690 MsG0780041186.01.T01:intron 55.0%
!! CGTCTGGGTTGGTTGTTGTG+AGG + Chr7:87802981-87803000 None:intergenic 55.0%
!! GGACTGTTTTTCCCCGAGGA+AGG + Chr7:87804293-87804312 None:intergenic 55.0%
!! GGGCGGTTTGGTTTGGTTTG+AGG + Chr7:87802771-87802790 None:intergenic 55.0%
!! TGCTGACTGAGAGCACCTTG+TGG + Chr7:87804950-87804969 None:intergenic 55.0%
!!! CGATGGACTGTTTTTCCCCG+AGG + Chr7:87804297-87804316 None:intergenic 55.0%
AAGGGATGGCAAGAGGCGGA+GGG - Chr7:87806189-87806208 MsG0780041186.01.T01:CDS 60.0%
GCAACCGCCACACCAGCAAT+AGG + Chr7:87804431-87804450 None:intergenic 60.0%
GGACTAAGGAGGGTGAGAGG+AGG + Chr7:87802960-87802979 None:intergenic 60.0%
GGTCAAGGGATGGCAAGAGG+CGG - Chr7:87806185-87806204 MsG0780041186.01.T01:CDS 60.0%
AGGGATGGCAAGAGGCGGAG+GGG - Chr7:87806190-87806209 MsG0780041186.01.T01:CDS 65.0%
ATGGCAAGAGGCGGAGGGGA+AGG - Chr7:87806194-87806213 MsG0780041186.01.T01:CDS 65.0%
CAAGGGATGGCAAGAGGCGG+AGG - Chr7:87806188-87806207 MsG0780041186.01.T01:CDS 65.0%
CCTGAGAATGAGCTCGGCCG+CGG - Chr7:87804716-87804735 MsG0780041186.01.T01:CDS 65.0%
CGCGGCCGAGCTCATTCTCA+GGG + Chr7:87804718-87804737 None:intergenic 65.0%
GCGGCCGAGCTCATTCTCAG+GGG + Chr7:87804717-87804736 None:intergenic 65.0%
CCGCGGCCGAGCTCATTCTC+AGG + Chr7:87804719-87804738 None:intergenic 70.0%
GAGAATGAGCTCGGCCGCGG+TGG - Chr7:87804719-87804738 MsG0780041186.01.T01:CDS 70.0%
! GAGCTCGGCCGCGGTGGATT+TGG - Chr7:87804725-87804744 MsG0780041186.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 87802760 87806618 87802760 ID=MsG0780041186.01;Name=MsG0780041186.01
Chr7 mRNA 87802760 87806618 87802760 ID=MsG0780041186.01.T01;Parent=MsG0780041186.01;Name=MsG0780041186.01.T01;_AED=0.10;_eAED=0.10;_QI=165|1|1|1|1|1|2|307|942
Chr7 exon 87802760 87803575 87802760 ID=MsG0780041186.01.T01:exon:12132;Parent=MsG0780041186.01.T01
Chr7 exon 87804134 87806618 87804134 ID=MsG0780041186.01.T01:exon:12131;Parent=MsG0780041186.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 87806454 87806618 87806454 ID=MsG0780041186.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780041186.01.T01
Chr7 CDS 87804134 87806453 87804134 ID=MsG0780041186.01.T01:cds;Parent=MsG0780041186.01.T01
Chr7 CDS 87803067 87803575 87803067 ID=MsG0780041186.01.T01:cds;Parent=MsG0780041186.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 87802760 87803066 87802760 ID=MsG0780041186.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780041186.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041186.01.T01

ATGAACCACACACCATTTCTTCTCTTTCTCTTCCTCCTCTCACCCTCCTTAGTCCTCACAACAACCAACCCAGACGACCTTAAAATCCTCAACGACTTCAAAGACAACCTAGACAACCCAGACATCCTACAATGGCCCAAAAACAACAACGACCCATGTGGTCCACCTTCTTGGAAATTCATCTTCTGCGACGGTGATAGAGTTTCACAGATTCAAACCAAAAACTTGAACCTTTCTGGAACTTTACCTCAAAATCTCAACCAACTAACCCATCTCTTCAACTTGGGTCTTCAAAACAACAAACTTAAAGGACCTTTACCAACGCTAAATGGGTTATCAAATCTCAAATACGTTTTTCTTGATAACAACGAATTCGATTCCATTCCTATGGATTTCTTTCAAGGGTTAACCAGTTTAGACACTCTTGCATTAGATAACAATAATCTCAATGCTTCTAACAATGGTTGGAATTTTCCTTCTTCTTTGCAGGATTCAACTCAGTTAAGAGATTTGTCTTGTATCAGTTGTAATTTGGTTGGCCCTTTGCCTGATTTTCTTGGAAAAATGAATTCTTTGTCAAATTTGAAGCTTTCTGGTAACAGTTTAACCGGCGAGATTCCAAAGACTCTTAACAATTCGGGGTTGCAAATGCTGTGGTTGAATAACCAGAAGGGTGAGTTGTTATCTGGAACTATTGATATTGTTGCTACTATGGTTTCTCTTACTAGTTTATGGCTTCATGGTAACCGGTTCACTGGTTCGATTCCGGACAATATTGGTGACTTGGTTTCTCTTAAAGATCTTAATCTTAATGGAAATGAGCTTGTTGGTCTTGTTCCTAGTTCTTTAGGTGATATGGAATTGGATAAGCTTGATTTGAATAATAATCGGTTTATGGGTCCGATTCCGAAGTTTAAAGCTTCCAAGGTTTCTTATAGTAACAATGATTTTTGTTTAAATGAAACTGGCGTTCCTTGTTCTTTTGAAGTTATGGCTCTTTTAGGGTTTCTTGGTGGGTTGAATTATCCTTCGAATTTGGTTGATTCATGGAGTGGGAATAACCCTTGTTTAACTTGGTTGGGGATTAAATGCAATGCTGATGGTAAAGTCTCTATGATTAATATGCAACGTTTTAATCTTAGTGGTACTTTAAGTCCTTCTGTTGCAAATTTAGGTTCTTTAGTTCAAATTAAATTGGGAGGTAATCATCTCAATGGTGTTGTACCTAGTAACTGGACTAGCTTGAGGAATCTGAATGTGTTGGATCTGAGTGACAATAATATTTCACCTCCTTTGCCGGATTTTAGTAATGGATTGAAACCTATGGTTGATGGGAATTCTCTGTTGAATGGTGGAACTGAAGGTCCTTCCTCGGGGAAAAACAGTCCATCGGGTGGATCTGGGAATACTGGTGAAGATACGAAGGGAGGCTCAAATTCAAGTCCAAGTGATTCGGTTGAAACGAAAAAATCAAAAAAGAAAAGCTTGGTTTTGATCGTAGCACCTATTGCTGGTGTGGCGGTTGCTGCTTTTCTGTTGATACCGCTTTATGCTTATTGTTTCAGGAGGACAAAGGATGGTTTCCAGGCACCAAGTTCATTCGTAATTCACCCTAGAGATCCGTCTGATACGGACAGTACCGTAAAGATAGCTATTGCTAATAATACCAATGGAACAGGGAGTGGGACTGGGAGTAGAAACAGCAGTGCAATCGGGGACTCTCATACCATTGAAGCCGGAAATCTTGTGATATCAGTTCAAGTTCTAAGAAACGTGACCAAGAATTTTGCCCCTGAGAATGAGCTCGGCCGCGGTGGATTTGGAGTTGTTTATAAGGGAGAGTTGGATGATGGAACTAAGATTGCCGTAAAACGAATGGAAGCAGGTGTGATAACCAATAAAGCCTTGGATGAGTTTCAGGCTGAAATTGCAGTTCTGTCAAAAGTTCGACATCGGCATCTAGTGGGCCTTATAGGTTATTCTACTGAAGGTAATGAGAGGATTCTAGTGTATGAGTATATGCCACAAGGTGCTCTCAGTCAGCATCTTTTTCATTGGAAGAGCTTTGGACTCGAGCCTCTCTCTTGGAAGAGGAGGCTTAATATTGCCTTGGATGTTGCTAGAGGAATGGAGTATCTTCATACTCTGGCTCATCAGAGCTTCATTCATAGAGATCTTAAGTCCTCAAACATTTTGCTTGCCGATGATTTTAGAGCTAAAGTCTCAGATTTTGGATTGGTGAAACTTGCTCCTAATGGTGAAAAATCTGTAGTGACCAAGCTTGCTGGAACCTTTGGATACTTGGCTCCAGAATATGCAGTGACTGGAAAAATCACTACTAAAGTAGATGTTTTCAGTTTTGGGGTTGTGCTAATGGAGCTGTTGTCTGGATTGATGGCACTTGATGAGAGCAGACCTGAGGAAAGCCAATACTTGGCAGCATGGTTCTGGAATATAAAATCAGACAAGAAGAAACTAATGGCTGCCATTGACCCAACCCTCGACATAAACGAAGAAACATTCGAAAGTGTCTCAATTATTGCTGAGCTAGCTGGACACTGCACGGCCAGAGAACCAAACCAAAGGCCAGAAATGGGTCATGCTGTCAATGTTCTCGCACCACTTGTTGAAAAATGGAAACCGTTTGACGATGACCCCGATGAGTATTCCGGCATCGATTATAGTCTTCCCCTTACCCAAATGGTCAAGGGATGGCAAGAGGCGGAGGGGAAGGACACAAGTTATATGGACCTAGAAGACAGTAAGAGCAGTATCCCTGCAAGACCTACTGGATTTGCAGATTCTTTTACTTCGGCCGATGGCCGGTGA
Protein sequence

>MsG0780041186.01.T01

MNHTPFLLFLFLLSPSLVLTTTNPDDLKILNDFKDNLDNPDILQWPKNNNDPCGPPSWKFIFCDGDRVSQIQTKNLNLSGTLPQNLNQLTHLFNLGLQNNKLKGPLPTLNGLSNLKYVFLDNNEFDSIPMDFFQGLTSLDTLALDNNNLNASNNGWNFPSSLQDSTQLRDLSCISCNLVGPLPDFLGKMNSLSNLKLSGNSLTGEIPKTLNNSGLQMLWLNNQKGELLSGTIDIVATMVSLTSLWLHGNRFTGSIPDNIGDLVSLKDLNLNGNELVGLVPSSLGDMELDKLDLNNNRFMGPIPKFKASKVSYSNNDFCLNETGVPCSFEVMALLGFLGGLNYPSNLVDSWSGNNPCLTWLGIKCNADGKVSMINMQRFNLSGTLSPSVANLGSLVQIKLGGNHLNGVVPSNWTSLRNLNVLDLSDNNISPPLPDFSNGLKPMVDGNSLLNGGTEGPSSGKNSPSGGSGNTGEDTKGGSNSSPSDSVETKKSKKKSLVLIVAPIAGVAVAAFLLIPLYAYCFRRTKDGFQAPSSFVIHPRDPSDTDSTVKIAIANNTNGTGSGTGSRNSSAIGDSHTIEAGNLVISVQVLRNVTKNFAPENELGRGGFGVVYKGELDDGTKIAVKRMEAGVITNKALDEFQAEIAVLSKVRHRHLVGLIGYSTEGNERILVYEYMPQGALSQHLFHWKSFGLEPLSWKRRLNIALDVARGMEYLHTLAHQSFIHRDLKSSNILLADDFRAKVSDFGLVKLAPNGEKSVVTKLAGTFGYLAPEYAVTGKITTKVDVFSFGVVLMELLSGLMALDESRPEESQYLAAWFWNIKSDKKKLMAAIDPTLDINEETFESVSIIAELAGHCTAREPNQRPEMGHAVNVLAPLVEKWKPFDDDPDEYSGIDYSLPLTQMVKGWQEAEGKDTSYMDLEDSKSSIPARPTGFADSFTSADGR*