AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042474.01

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MsG0880042474.01.T01 AT1G07570 29.830 352 195 11 347 649 20 368 8.73e-43 160
MsG0880042474.01.T01 AT1G07570 29.830 352 195 11 347 649 20 368 8.73e-43 160
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MsG0880042474.01.T01 AT4G34440 30.488 328 187 6 369 658 287 611 1.20e-42 164
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MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
MsG0880042474.01.T01 AT2G30740 33.125 320 167 7 358 633 37 353 1.83e-42 157
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MsG0880042474.01.T01 AT1G29720 32.660 297 164 6 382 643 661 956 1.85e-42 166
MsG0880042474.01.T01 AT1G53420 34.228 298 158 6 370 630 600 896 2.28e-42 165
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MsG0880042474.01.T01 AT5G58940 33.866 313 155 9 367 634 117 422 1.53e-39 152
MsG0880042474.01.T01 AT5G58940 33.866 313 155 9 367 634 117 422 1.53e-39 152
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MsG0880042474.01.T01 AT3G59350 31.562 320 174 6 357 633 78 395 1.70e-39 150
MsG0880042474.01.T01 AT5G62710 28.704 324 181 8 348 631 271 584 1.71e-39 154
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MsG0880042474.01.T01 AT1G56720 29.720 286 163 5 382 630 167 451 1.28e-38 150
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MsG0880042474.01.T01 AT3G05140 30.245 367 186 8 297 629 127 457 1.46e-38 150
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MsG0880042474.01.T01 AT5G02070 30.769 312 165 8 370 630 333 644 7.34e-38 150
MsG0880042474.01.T01 AT3G53380 31.959 291 156 6 380 629 362 651 8.01e-38 150
MsG0880042474.01.T01 AT1G25390 34.812 293 141 10 382 630 279 565 8.64e-38 149
MsG0880042474.01.T01 AT1G25390 34.812 293 141 10 382 630 279 565 8.64e-38 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G23260 32.624 282 153 4 381 625 315 596 9.13e-38 149
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MsG0880042474.01.T01 AT2G23450 32.722 327 175 11 382 665 336 660 1.13e-37 150
MsG0880042474.01.T01 AT1G55200 32.226 301 166 7 382 645 367 666 1.27e-37 149
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MsG0880042474.01.T01 AT1G55200 32.226 301 166 7 382 645 367 666 1.27e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT1G11303 33.684 285 144 5 382 629 497 773 1.28e-37 150
MsG0880042474.01.T01 AT5G35960 30.137 292 162 5 375 630 115 400 1.37e-37 145
MsG0880042474.01.T01 AT1G24030 31.271 291 158 8 382 630 50 340 1.49e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT1G24030 31.429 280 152 7 395 634 11 290 1.67e-37 142
MsG0880042474.01.T01 AT1G24030 31.271 291 158 8 382 630 64 354 1.73e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G28250 31.786 280 142 9 381 612 197 475 1.89e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT1G11050 34.510 255 122 5 382 592 283 536 1.99e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT5G49760 31.714 350 184 10 346 648 579 920 2.03e-37 150
MsG0880042474.01.T01 AT1G21240 33.582 268 143 5 397 630 420 686 2.07e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT5G35960 29.965 287 159 5 375 625 115 395 2.16e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT4G23270 31.034 290 163 4 381 633 313 602 2.17e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G13190 37.000 200 124 2 432 629 57 256 2.22e-37 141
MsG0880042474.01.T01 AT1G69270 32.517 286 155 5 382 630 249 533 2.37e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G23270 31.034 290 163 4 381 633 313 602 2.39e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G23270 31.034 290 163 4 381 633 313 602 2.39e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT3G20530 33.906 233 115 6 382 575 70 302 2.41e-37 142
MsG0880042474.01.T01 AT5G47070 32.441 299 152 8 382 633 74 369 2.46e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT3G45860 31.707 287 158 5 381 629 338 624 2.47e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT2G18890 32.847 274 144 8 376 612 50 320 2.63e-37 142
MsG0880042474.01.T01 AT4G23200 32.404 287 157 4 380 629 322 608 2.68e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G11900 34.629 283 143 5 386 629 529 808 2.91e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G11900 34.643 280 141 5 386 626 460 736 2.98e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT5G55830 31.010 287 157 6 380 626 351 636 2.98e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G31100 33.670 297 158 6 372 630 422 717 2.99e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G23280 31.119 286 160 4 381 629 329 614 3.23e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G31110 32.997 297 160 6 372 630 431 726 3.23e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G23280 31.119 286 160 4 381 629 331 616 3.46e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT4G31110 32.997 297 160 6 372 630 409 704 3.55e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G35600 28.617 311 176 6 382 647 74 383 3.69e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT4G35600 28.617 311 176 6 382 647 75 384 3.83e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT4G38830 31.410 312 173 6 358 629 308 618 3.98e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G18890 31.507 292 160 7 376 630 50 338 4.03e-37 143
MsG0880042474.01.T01 AT4G32000 29.538 325 180 9 365 646 94 412 4.32e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT1G74360 31.250 288 154 7 382 629 802 1085 4.33e-37 149
MsG0880042474.01.T01 AT4G32000 29.467 319 180 8 367 646 101 413 4.89e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT3G59740 30.405 296 165 7 371 626 310 604 5.42e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT2G43230 31.525 295 159 5 382 633 99 393 5.46e-37 143
MsG0880042474.01.T01 AT3G53840 38.153 249 112 6 382 589 342 589 6.39e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G11460 31.818 286 158 4 381 629 258 543 6.82e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G23250 32.082 293 162 4 370 625 330 622 7.08e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G23130 30.769 286 161 4 381 629 327 612 7.16e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G11470 31.119 286 160 4 381 629 331 616 7.43e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G23130 30.363 303 173 5 365 629 314 616 7.57e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT5G63710 32.302 291 155 7 380 630 240 528 7.68e-37 146
MsG0880042474.01.T01 AT5G63710 32.302 291 155 7 380 630 240 528 7.68e-37 146
MsG0880042474.01.T01 AT2G43230 31.525 295 159 5 382 633 133 427 7.98e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT4G11470 31.119 286 160 4 381 629 326 611 8.40e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G00960 33.333 270 141 6 398 629 62 330 8.41e-37 142
MsG0880042474.01.T01 AT1G56145 31.959 291 161 6 374 629 564 852 8.45e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT1G21240 33.333 264 141 5 401 630 163 425 8.70e-37 144
MsG0880042474.01.T01 AT4G11460 31.818 286 158 4 381 629 333 618 8.73e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT1G56145 31.959 291 161 6 374 629 667 955 8.83e-37 148
MsG0880042474.01.T01 AT1G65800 32.039 309 160 6 370 629 491 798 9.29e-37 147
MsG0880042474.01.T01 AT3G25490 33.209 268 144 5 397 630 113 379 9.46e-37 143
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MsG0880042474.01.T01 AT1G29730 30.982 397 198 13 236 574 478 856 1.07e-36 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G04490 32.746 284 152 6 381 629 327 606 1.09e-36 146
MsG0880042474.01.T01 AT1G70520 31.534 352 182 9 370 665 301 649 1.13e-36 146
MsG0880042474.01.T01 AT1G15530 27.719 285 170 5 380 629 347 630 1.20e-36 146
MsG0880042474.01.T01 AT5G53890 32.215 298 163 7 380 640 740 1035 1.22e-36 147
MsG0880042474.01.T01 AT5G63710 32.302 291 155 7 380 630 276 564 1.24e-36 145
MsG0880042474.01.T01 AT2G18470 35.965 228 111 5 382 575 272 498 1.36e-36 144
MsG0880042474.01.T01 AT5G63710 32.302 291 155 7 380 630 275 563 1.39e-36 145
MsG0880042474.01.T01 AT4G04510 33.101 287 148 7 381 629 328 608 1.51e-36 146
MsG0880042474.01.T01 AT4G04510 33.101 287 148 7 381 629 326 606 1.68e-36 145
MsG0880042474.01.T01 AT5G10520 29.042 334 184 8 339 630 100 422 1.79e-36 143
MsG0880042474.01.T01 AT1G49730 37.387 222 99 5 377 561 312 530 1.86e-36 145
MsG0880042474.01.T01 AT2G23950 37.229 231 109 7 380 575 285 514 1.94e-36 144
MsG0880042474.01.T01 AT5G47850 31.579 304 157 6 381 633 430 733 1.95e-36 146
MsG0880042474.01.T01 AT4G23250 32.082 293 162 4 370 625 330 622 1.96e-36 147
MsG0880042474.01.T01 AT4G35030 31.081 296 164 7 375 631 85 379 2.10e-36 142
MsG0880042474.01.T01 AT4G35030 31.081 296 164 7 375 631 85 379 2.10e-36 142
MsG0880042474.01.T01 AT4G35030 31.081 296 164 7 375 631 85 379 2.10e-36 142

Find 122 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 402 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG 0.127422 8:+9308139 MsG0880042474.01.T01:CDS
CATGCAAAGATTGCTGATTT+TGG 0.147942 8:+9311944 MsG0880042474.01.T01:CDS
GATAACTTCAAAACTATTAT+TGG 0.154712 8:+9310894 MsG0880042474.01.T01:CDS
TGGTGTTCTTACTACTATTT+TGG 0.180474 8:+9307738 MsG0880042474.01.T01:CDS
TACACCTGTATCTATGAATT+TGG 0.199259 8:-9307954 None:intergenic
ATCAGAGTTTCTTTCTATTA+TGG 0.211532 8:+9308091 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTGTATTCTTGAAGATTTCT+AGG 0.223259 8:+9314444 MsG0880042474.01.T01:three_prime_UTR
CCTTTAGCTCTGCCAATATT+TGG 0.229251 8:-9314226 None:intergenic
AATATCCCCGCTCTTAACTA+TGG 0.229840 8:-9314087 None:intergenic
CATCCCATTGAAATTGTATA+GGG 0.243608 8:-9308657 None:intergenic
TTGAATTCTGTGTCTTATAA+AGG 0.257886 8:-9308876 None:intergenic
CTAATTCTGTATTATCATTC+TGG 0.260378 8:+9308347 MsG0880042474.01.T01:CDS
TATAAACCTCATAGGCATTC+AGG 0.261468 8:-9308912 None:intergenic
AAGGGAAATTTGATACCTTT+TGG 0.271863 8:-9308857 None:intergenic
GCATCCCATTGAAATTGTAT+AGG 0.284152 8:-9308658 None:intergenic
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG 0.287014 8:+9310909 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATCATCAATGCAAGGTTATA+AGG 0.287528 8:+9310992 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATAGGGGCACTGGCATTTAC+TGG 0.302792 8:-9308640 None:intergenic
ATTATTCTTATCGATAGTTT+AGG 0.326959 8:-9314532 None:intergenic
AGTTACGCCTTCAAATTCTA+AGG 0.346188 8:+9310809 MsG0880042474.01.T01:CDS
GCTAGACATAAGCCAAATAT+TGG 0.347240 8:+9314214 MsG0880042474.01.T01:CDS
GAAGAATAGTTCAAATGTTC+AGG 0.365397 8:-9307899 None:intergenic
ACACGCCCTGCTGGTACATT+TGG 0.368848 8:+9312010 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTCTATTATGGTAACTATGA+TGG 0.374519 8:+9308103 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG 0.381649 8:+9311962 MsG0880042474.01.T01:CDS
TGTCTTGTTAACACAGGAAA+TGG 0.387876 8:+9308259 MsG0880042474.01.T01:CDS
TGAATTCTGTGTCTTATAAA+GGG 0.389507 8:-9308875 None:intergenic
TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG 0.389612 8:-9311890 None:intergenic
AAAACATTCACATACTTCAA+TGG 0.393496 8:+9314057 MsG0880042474.01.T01:CDS
GAGATGGTTCAGAGAAATAA+TGG 0.394964 8:+9314263 MsG0880042474.01.T01:CDS
GACTAATGTACTATGTCATT+TGG 0.403762 8:-9314398 None:intergenic
GTGAATGACAAGTTATGGTT+TGG 0.409300 8:+9308772 MsG0880042474.01.T01:CDS
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG 0.413125 8:+9313942 MsG0880042474.01.T01:intron
AAAATGATATCTATAGCTTT+GGG 0.413409 8:+9313979 MsG0880042474.01.T01:CDS
GCCCTTTCCTTAGAATTTGA+AGG 0.418401 8:-9310816 None:intergenic
CCAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG 0.421625 8:+9314226 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATCGATAAGAATAATGTGTA+TGG 0.422062 8:+9314540 MsG0880042474.01.T01:three_prime_UTR
TTCATCTCATTCAATTGAAA+AGG 0.422385 8:-9308538 None:intergenic
GCAGTGCTCATCACAATTGC+TGG 0.425825 8:-9308610 None:intergenic
AATGATAATACAGAATTAGC+TGG 0.432377 8:-9308343 None:intergenic
AAACATTCACATACTTCAAT+GGG 0.434627 8:+9314058 MsG0880042474.01.T01:CDS
AATTCAGCATCAATTCAGTA+TGG 0.435058 8:+9314141 MsG0880042474.01.T01:CDS
TCTTAGTTTATAAACCTCAT+AGG 0.436597 8:-9308920 None:intergenic
AGCAGAGCAGACTGTTAAAC+AGG 0.437390 8:+9307988 MsG0880042474.01.T01:CDS
CTGAATTAATAGATCCTCAT+TGG 0.438596 8:-9308572 None:intergenic
GCCTTCAAATTCTAAGGAAA+GGG 0.439908 8:+9310815 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATTCTATTTGAGTTGATCAC+TGG 0.441757 8:+9314005 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTTGGAGTGACATTGAATAT+AGG 0.441879 8:-9314380 None:intergenic
TCATCTAGTAGTATGTTTGA+AGG 0.442337 8:-9311914 None:intergenic
AAACTCAAGTCGCTCTTAAG+AGG 0.443691 8:+9310961 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG 0.445181 8:+9308512 MsG0880042474.01.T01:CDS
TCACAGTGAATGACAAGTTA+TGG 0.445522 8:+9308767 MsG0880042474.01.T01:CDS
GGACTGGATTATCTGCATAA+TGG 0.446343 8:+9311857 MsG0880042474.01.T01:intron
TCGAGTACAAGACCTTTGAT+TGG 0.447874 8:+9308832 MsG0880042474.01.T01:CDS
TGTGAAGTGTAATGCATTGT+TGG 0.449879 8:-9308191 None:intergenic
GATGCCAAATTCATAGATAC+AGG 0.451670 8:+9307950 MsG0880042474.01.T01:CDS
AAAATTCAAATATCTTAAGT+TGG 0.452872 8:+9311726 MsG0880042474.01.T01:CDS
GTGCCCCTATACAATTTCAA+TGG 0.452923 8:+9308653 MsG0880042474.01.T01:CDS
CAGAGCTAAAGGAATGTCTA+TGG 0.453541 8:+9314237 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG 0.453587 8:+9307766 MsG0880042474.01.T01:CDS
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GTATTTACTGATCGGTATAC+AGG 0.460302 8:-9308805 None:intergenic
CGCCTTCAAATTCTAAGGAA+AGG 0.462807 8:+9310814 MsG0880042474.01.T01:CDS
TCATTTCAGTTATAGAATTG+AGG 0.465509 8:+9308290 MsG0880042474.01.T01:CDS
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG 0.469458 8:+9310924 MsG0880042474.01.T01:CDS
CATTGTTGATACAAGGTTGA+AGG 0.482164 8:+9314115 MsG0880042474.01.T01:CDS
CTTTAATGAGGTTGAAGAGC+TGG 0.482395 8:+9308717 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTGAAATTGTATAGGGGCAC+TGG 0.486931 8:-9308650 None:intergenic
ACATTTGAACTATTCTTCGT+TGG 0.489056 8:+9307904 MsG0880042474.01.T01:CDS
AATTCTATAACTGAAATGAA+TGG 0.490541 8:-9308286 None:intergenic
TTATAACCTTGCATTGATGA+TGG 0.493034 8:-9310990 None:intergenic
TTCAAAACATTGTTGATACA+AGG 0.495485 8:+9314108 MsG0880042474.01.T01:CDS
CCTCTACATGCACTTTAATG+AGG 0.501913 8:+9308705 MsG0880042474.01.T01:CDS
TTCAAAACTATTATTGGAGA+AGG 0.502648 8:+9310900 MsG0880042474.01.T01:CDS
GACCTTTGATTGGAGCCAAA+AGG 0.503242 8:+9308842 MsG0880042474.01.T01:CDS
ATTAAAACATACATTAGTCT+TGG 0.504874 8:-9311696 None:intergenic
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GATCGGTATACAGGTATCTC+AGG 0.505586 8:-9308796 None:intergenic
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GGCATTCAGGATTGGTGGAA+GGG 0.514117 8:-9308899 None:intergenic
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CATATATCTACACGCCCTGC+TGG 0.539923 8:+9312001 MsG0880042474.01.T01:CDS
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ATATCCCCGCTCTTAACTAT+GGG 0.555940 8:-9314086 None:intergenic
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AGGCATTCAGGATTGGTGGA+AGG 0.561765 8:-9308900 None:intergenic
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ATTGTTGATACAAGGTTGAA+GGG 0.570217 8:+9314116 MsG0880042474.01.T01:CDS
CCTGTACTGTAAGTTTGTGA+TGG 0.570759 8:-9308389 None:intergenic
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AAAGCACTAGTGAGAGCACC+CGG 0.581303 8:+9314032 MsG0880042474.01.T01:CDS
TACAGAATCAATGTAACAAG+TGG 0.591969 8:+9308055 MsG0880042474.01.T01:CDS
GGAATGTCTATGGTTGGAGA+TGG 0.597498 8:+9314247 MsG0880042474.01.T01:CDS
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ATGATAATACAGAATTAGCT+GGG 0.600097 8:-9308342 None:intergenic
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TTGTTATCTAGCTAAAACAG+TGG 0.613483 8:-9314336 None:intergenic
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AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG 0.620507 8:-9308136 None:intergenic
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GTGCTCATCACAATTGCTGG+TGG 0.634701 8:-9308607 None:intergenic
ATCCCATTGAAATTGTATAG+GGG 0.649327 8:-9308656 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!!! GATTATTTTTAAAAAAGAAT+TGG + Chr8:9311458-9311477 MsG0880042474.01.T01:intron 10.0%
!!! TAAATAACTGATAATTTTTT+TGG + Chr8:9308477-9308496 MsG0880042474.01.T01:intron 10.0%
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!!! TTTTGATTTCTTTTGGATTT+TGG + Chr8:9310542-9310561 MsG0880042474.01.T01:intron 20.0%
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! AAAATATAGATTGGGTACAT+GGG + Chr8:9309858-9309877 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! AAACATTCACATACTTCAAT+GGG + Chr8:9314058-9314077 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! AAAGAAGTTACAGATAACTT+TGG - Chr8:9312687-9312706 None:intergenic 25.0%
! AAAGTAAACTATGTGCAAAT+TGG + Chr8:9309286-9309305 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! AAATATGTTGAGTAAATCAC+CGG - Chr8:9309229-9309248 None:intergenic 25.0%
! AAATCGTAACCTTTATGTTT+AGG + Chr8:9313546-9313565 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! AACGAAAATATTCAAAGATG+TGG - Chr8:9310767-9310786 None:intergenic 25.0%
! AATATTCAAAGATGTGGAAA+AGG - Chr8:9310761-9310780 None:intergenic 25.0%
! AATCATAGAAAATAGGATAC+TGG - Chr8:9312249-9312268 None:intergenic 25.0%
! AATCCTTGTCATCAATAATA+AGG - Chr8:9311602-9311621 None:intergenic 25.0%
! AATGATAATACAGAATTAGC+TGG - Chr8:9308346-9308365 None:intergenic 25.0%
! AATGGAGAATCATAGAAAAT+AGG - Chr8:9312256-9312275 None:intergenic 25.0%
! AATTATCCAATCTGAATCAA+GGG - Chr8:9312952-9312971 None:intergenic 25.0%
! ACTTACAAATATGTGATTCT+TGG - Chr8:9309479-9309498 None:intergenic 25.0%
! ATAAAAAAAGGCCAAAGTTT+CGG + Chr8:9313597-9313616 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! ATCAGAGTTTCTTTCTATTA+TGG + Chr8:9308091-9308110 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! ATCGATAAGAATAATGTGTA+TGG + Chr8:9314540-9314559 MsG0880042474.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! ATGATAATACAGAATTAGCT+GGG - Chr8:9308345-9308364 None:intergenic 25.0%
! ATTTCCAAATTTAATGGAGT+TGG - Chr8:9309916-9309935 None:intergenic 25.0%
! CAAAGAGGATACTATATTTA+AGG - Chr8:9309026-9309045 None:intergenic 25.0%
! CTAATTCTGTATTATCATTC+TGG + Chr8:9308347-9308366 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! CTTACAAATATGTGATTCTT+GGG - Chr8:9309478-9309497 None:intergenic 25.0%
! GAATTTAAGCATATGGTTTA+AGG - Chr8:9309510-9309529 None:intergenic 25.0%
! GAGTTAAGAATGCAAATTAT+TGG - Chr8:9312302-9312321 None:intergenic 25.0%
! GATTGTTCATCATAGAAATT+TGG + Chr8:9311162-9311181 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! GCAATTGAAAATATACAAAG+AGG - Chr8:9309041-9309060 None:intergenic 25.0%
! GGAAATTATTCTCTCTTTAT+TGG + Chr8:9309930-9309949 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! GTATTCATAAATCAATGCTT+TGG - Chr8:9311221-9311240 None:intergenic 25.0%
! GTTGACTGTTGAATAAAAAA+AGG + Chr8:9313585-9313604 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! TAATATAAGTTCCGAAACTT+TGG - Chr8:9313611-9313630 None:intergenic 25.0%
! TAATTATCCAATCTGAATCA+AGG - Chr8:9312953-9312972 None:intergenic 25.0%
! TACATTTGATACATCAACAT+GGG - Chr8:9310075-9310094 None:intergenic 25.0%
! TCATAGTATCAACTAGTATT+TGG - Chr8:9309343-9309362 None:intergenic 25.0%
! TCATTTCAGTTATAGAATTG+AGG + Chr8:9308290-9308309 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! TCGATATAGTATTTACTGAT+CGG - Chr8:9308816-9308835 None:intergenic 25.0%
! TCTTAGTTTATAAACCTCAT+AGG - Chr8:9308923-9308942 None:intergenic 25.0%
! TGAATTCTGTGTCTTATAAA+GGG - Chr8:9308878-9308897 None:intergenic 25.0%
! TGACGGTTTATTTATAAAAG+AGG + Chr8:9312155-9312174 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! TTACAAATATGTGATTCTTG+GGG - Chr8:9309477-9309496 None:intergenic 25.0%
! TTACATTTGATACATCAACA+TGG - Chr8:9310076-9310095 None:intergenic 25.0%
! TTATCAAACAATAGCTTGAA+CGG + Chr8:9309998-9310017 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAAACATTGTTGATACA+AGG + Chr8:9314108-9314127 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAAACTATTATTGGAGA+AGG + Chr8:9310900-9310919 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG - Chr8:9311893-9311912 None:intergenic 25.0%
! TTCATCTCATTCAATTGAAA+AGG - Chr8:9308541-9308560 None:intergenic 25.0%
! TTCTATTATGGTAACTATGA+TGG + Chr8:9308103-9308122 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAATTCTGTGTCTTATAA+AGG - Chr8:9308879-9308898 None:intergenic 25.0%
! TTGTATTCTTGAAGATTTCT+AGG + Chr8:9314444-9314463 MsG0880042474.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TTTCACAAAATTTAGCTGAA+AGG + Chr8:9314192-9314211 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTATTTTCACAGTTAACTG+TGG + Chr8:9311102-9311121 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
!! CATTTTCTTTTGGTATTGTT+TGG + Chr8:9307718-9307737 MsG0880042474.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTTTTCTTATACATATCTC+AGG + Chr8:9307851-9307870 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTTATATCACACTTACAC+TGG - Chr8:9312046-9312065 None:intergenic 25.0%
!!! ACATGGTAAAGTATTGTTTA+TGG + Chr8:9311781-9311800 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
!!! AGAAATTTTTTGCAGTGATT+TGG + Chr8:9312999-9313018 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCATTGATTTATGAATACA+TGG + Chr8:9311222-9311241 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
!!! CCTTTAAAATATAGGTAAAC+CGG - Chr8:9311326-9311345 None:intergenic 25.0%
!!! TAGTATATTAGTGTCATTTG+TGG + Chr8:9309260-9309279 MsG0880042474.01.T01:intron 25.0%
AAAACTATTATTGGAGAAGG+AGG + Chr8:9310903-9310922 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
AAACATCAAGAATGCTTATG+GGG + Chr8:9309364-9309383 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
AAAGTTATTGCCTTCTATGA+TGG - Chr8:9313429-9313448 None:intergenic 30.0%
AAATATAGATTGGGTACATG+GGG + Chr8:9309859-9309878 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG - Chr8:9311890-9311909 None:intergenic 30.0%
AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG - Chr8:9308139-9308158 None:intergenic 30.0%
AAGCTTAAAGACTCATCAAT+GGG - Chr8:9313372-9313391 None:intergenic 30.0%
AATTCAGCATCAATTCAGTA+TGG + Chr8:9314141-9314160 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
AATTCATGACACCAAATTGA+CGG + Chr8:9312138-9312157 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
ACAAACATCAAGAATGCTTA+TGG + Chr8:9309362-9309381 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
ACATTTGAACTATTCTTCGT+TGG + Chr8:9307904-9307923 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
ATAAACATCATCTTTGTACC+TGG - Chr8:9308503-9308522 None:intergenic 30.0%
ATCATCAATGCAAGGTTATA+AGG + Chr8:9310992-9311011 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
ATCCCATTGAAATTGTATAG+GGG - Chr8:9308659-9308678 None:intergenic 30.0%
ATTAGGCCACACTTAATTAA+CGG - Chr8:9313518-9313537 None:intergenic 30.0%
ATTCTTACAGTTTCAAAGAG+AGG + Chr8:9312423-9312442 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
ATTGTTGATACAAGGTTGAA+GGG + Chr8:9314116-9314135 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
ATTTATGAATACATGGCCAA+TGG + Chr8:9311229-9311248 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
CAAAATATAGATTGGGTACA+TGG + Chr8:9309857-9309876 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
CAAACATCAAGAATGCTTAT+GGG + Chr8:9309363-9309382 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
CAAGTTCATATTCTCAAACA+AGG + Chr8:9310607-9310626 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
CATAGTAGATTTAGTACTTC+CGG + Chr8:9311304-9311323 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
CATCCCATTGAAATTGTATA+GGG - Chr8:9308660-9308679 None:intergenic 30.0%
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG - Chr8:9308142-9308161 None:intergenic 30.0%
CTGAATTAATAGATCCTCAT+TGG - Chr8:9308575-9308594 None:intergenic 30.0%
CTGCACTAAAAACTTTATCT+GGG - Chr8:9311411-9311430 None:intergenic 30.0%
CTGGAAAACTAATGTCATAA+GGG - Chr8:9313735-9313754 None:intergenic 30.0%
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG + Chr8:9313942-9313961 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
GAAACCAACTCCATTAAATT+TGG + Chr8:9309909-9309928 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
GAAGAATAGTTCAAATGTTC+AGG - Chr8:9307902-9307921 None:intergenic 30.0%
GACTAATGTACTATGTCATT+TGG - Chr8:9314401-9314420 None:intergenic 30.0%
GAGGATACTATATTTAAGGA+CGG - Chr8:9309022-9309041 None:intergenic 30.0%
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG + Chr8:9310924-9310943 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
GTTAACTGTGAAAATAATGC+AGG - Chr8:9311100-9311119 None:intergenic 30.0%
TACAAATATGTGATTCTTGG+GGG - Chr8:9309476-9309495 None:intergenic 30.0%
TACACCTGTATCTATGAATT+TGG - Chr8:9307957-9307976 None:intergenic 30.0%
TACAGAATCAATGTAACAAG+TGG + Chr8:9308055-9308074 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
TCATCTAGTAGTATGTTTGA+AGG - Chr8:9311917-9311936 None:intergenic 30.0%
TCCAAAATAAACTCTTCCAT+AGG + Chr8:9312635-9312654 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
TCCACACTGAAAAAAGATAA+AGG - Chr8:9310430-9310449 None:intergenic 30.0%
TCTGCACTAAAAACTTTATC+TGG - Chr8:9311412-9311431 None:intergenic 30.0%
TGACACAAGTATAAAACTCT+AGG - Chr8:9310704-9310723 None:intergenic 30.0%
TGGATATTCAGAAGACAAAA+AGG + Chr8:9310562-9310581 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
TTATAAGGAATTTCACTCAG+AGG + Chr8:9311007-9311026 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
TTATAGCCGTTAATTAAGTG+TGG + Chr8:9313509-9313528 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
TTCTTACAGTTTCAAAGAGA+GGG + Chr8:9312424-9312443 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
TTGTTATCTAGCTAAAACAG+TGG - Chr8:9314339-9314358 None:intergenic 30.0%
! AAGGGAAATTTGATACCTTT+TGG - Chr8:9308860-9308879 None:intergenic 30.0%
! AAGTATGTGAATGTTTTCTC+CGG - Chr8:9314054-9314073 None:intergenic 30.0%
! ACACCTTATTATTGATGACA+AGG + Chr8:9311596-9311615 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
! ATAATAAGGTGTTAACTCAG+TGG - Chr8:9311588-9311607 None:intergenic 30.0%
! ATTTTACAACTGTCCCATAT+GGG + Chr8:9311521-9311540 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTGTGAAATGCATGACA+TGG - Chr8:9314183-9314202 None:intergenic 30.0%
! CATGTACCCAATCTATATTT+TGG - Chr8:9309859-9309878 None:intergenic 30.0%
! CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG + Chr8:9308139-9308158 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
! TATGTTTGGATGAAGGATTT+TGG + Chr8:9309695-9309714 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
! TCCTATGGAAGAGTTTATTT+TGG - Chr8:9312639-9312658 None:intergenic 30.0%
! TGGTGTTCTTACTACTATTT+TGG + Chr8:9307738-9307757 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
! TTATAACCTTGCATTGATGA+TGG - Chr8:9310993-9311012 None:intergenic 30.0%
! TTGTTAGCGGTATTTCTATT+TGG - Chr8:9312881-9312900 None:intergenic 30.0%
! TTTGGAGTGACATTGAATAT+AGG - Chr8:9314383-9314402 None:intergenic 30.0%
! TTTTTGCAGACTATATCCAT+AGG - Chr8:9313779-9313798 None:intergenic 30.0%
!! ATATCTTAAGTTGGAATGAG+AGG + Chr8:9311735-9311754 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTCTATTTGAGTTGATCAC+TGG + Chr8:9314005-9314024 MsG0880042474.01.T01:CDS 30.0%
!! CCGGTTTACCTATATTTTAA+AGG + Chr8:9311323-9311342 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
!! CCTATATTTTAAAGGTTAGC+CGG + Chr8:9311331-9311350 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
!! TACTTAAGATTTTCGAGATG+CGG + Chr8:9312194-9312213 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
!! TGAAAAAAGATAAAGGTGCT+AGG - Chr8:9310423-9310442 None:intergenic 30.0%
!!! AACTGATAATTTTTTTGGCC+AGG + Chr8:9308482-9308501 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
!!! ACCTTTATCTTTTTTCAGTG+TGG + Chr8:9310426-9310445 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
!!! GCAATCCTTTTGATTTCTTT+TGG + Chr8:9310535-9310554 MsG0880042474.01.T01:intron 30.0%
AAAGAAGACTAGGGTATGTT+TGG + Chr8:9309681-9309700 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
AAATCGTGGCCTAAACATAA+AGG - Chr8:9313558-9313577 None:intergenic 35.0%
AACAGGAACTACAATATGTG+AGG + Chr8:9308005-9308024 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
AACTTACAGTACAGGTAAGA+TGG + Chr8:9308397-9308416 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
ACAAATATGTGACAGAAAGC+AGG - Chr8:9307814-9307833 None:intergenic 35.0%
ACAAATATGTGATTCTTGGG+GGG - Chr8:9309475-9309494 None:intergenic 35.0%
ACAGAGTTCAAATCCCATAT+GGG - Chr8:9311537-9311556 None:intergenic 35.0%
AGTCAACTTGTAACAAATCG+TGG - Chr8:9313572-9313591 None:intergenic 35.0%
AGTCCTGAAAATTGACACTA+AGG - Chr8:9311842-9311861 None:intergenic 35.0%
AGTTACGCCTTCAAATTCTA+AGG + Chr8:9310809-9310828 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
ATATAATTCACAGGACCACA+TGG - Chr8:9309413-9309432 None:intergenic 35.0%
ATATATTTGGGAATGCAACC+AGG + Chr8:9309557-9309576 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
ATCTGAATCAAGGGTTGTAA+TGG - Chr8:9312943-9312962 None:intergenic 35.0%
ATGACACAATAGACAATAGC+TGG - Chr8:9313754-9313773 None:intergenic 35.0%
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG + Chr8:9308512-9308531 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG + Chr8:9310909-9310928 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
ATTGAAAGTTCCTGAGATAC+AGG - Chr8:9312721-9312740 None:intergenic 35.0%
CAAGCTTAAAGACTCATCAA+TGG - Chr8:9313373-9313392 None:intergenic 35.0%
CATTGTTGATACAAGGTTGA+AGG + Chr8:9314115-9314134 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
CTCAACATATTTAAGGACGA+AGG + Chr8:9309237-9309256 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
GAGATGGTTCAGAGAAATAA+TGG + Chr8:9314263-9314282 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
GATACCATATTCGTATTAGG+AGG - Chr8:9310377-9310396 None:intergenic 35.0%
GATACTATATTTAAGGACGG+AGG - Chr8:9309019-9309038 None:intergenic 35.0%
GATGAGAAAAGATTCTTTGC+CGG - Chr8:9311353-9311372 None:intergenic 35.0%
GATGCCAAATTCATAGATAC+AGG + Chr8:9307950-9307969 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
GCATCCCATTGAAATTGTAT+AGG - Chr8:9308661-9308680 None:intergenic 35.0%
GCTAGACATAAGCCAAATAT+TGG + Chr8:9314214-9314233 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
GCTGGAAAACTAATGTCATA+AGG - Chr8:9313736-9313755 None:intergenic 35.0%
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG + Chr8:9307872-9307891 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
GGTGATACCATATTCGTATT+AGG - Chr8:9310380-9310399 None:intergenic 35.0%
GGTTGTATGTAATCTTGTGA+TGG - Chr8:9308238-9308257 None:intergenic 35.0%
GTATCTCAGGAACTTTCAAT+GGG + Chr8:9312721-9312740 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
GTATTTACTGATCGGTATAC+AGG - Chr8:9308808-9308827 None:intergenic 35.0%
GTCCTGAAAATTGACACTAA+GGG - Chr8:9311841-9311860 None:intergenic 35.0%
GTGAATGACAAGTTATGGTT+TGG + Chr8:9308772-9308791 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTCCCATAGTTAAGAG+CGG + Chr8:9314080-9314099 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
TAACAATTTCTCACTCCACT+AGG - Chr8:9308037-9308056 None:intergenic 35.0%
TAATCCTGATCTTTGTACGA+CGG + Chr8:9310453-9310472 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TATAAACCTCATAGGCATTC+AGG - Chr8:9308915-9308934 None:intergenic 35.0%
TCACAGTGAATGACAAGTTA+TGG + Chr8:9308767-9308786 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
TCAGAAACTCAACAAGATGA+TGG + Chr8:9308955-9308974 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
TCATAAGGGATAATAGACAC+CGG - Chr8:9313721-9313740 None:intergenic 35.0%
TCATCCTCCTAATACGAATA+TGG + Chr8:9310370-9310389 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TCTGAATCAAGGGTTGTAAT+GGG - Chr8:9312942-9312961 None:intergenic 35.0%
TCTGTGTTAGCAGAAATGTA+GGG + Chr8:9310186-9310205 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TGCATCAGAAAATCAGGTAA+AGG - Chr8:9310025-9310044 None:intergenic 35.0%
TGCCCCTATACAATTTCAAT+GGG + Chr8:9308654-9308673 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
TGGTCCTGTGAATTATATGT+GGG + Chr8:9309415-9309434 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TGTATCTCAGGAACTTTCAA+TGG + Chr8:9312720-9312739 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TGTCTTCAACTGGATTAACA+GGG + Chr8:9309584-9309603 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TGTGAAGTGTAATGCATTGT+TGG - Chr8:9308194-9308213 None:intergenic 35.0%
TTACAACCCTTGATTCAGAT+TGG + Chr8:9312943-9312962 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TTACAGTGCACAAGAATGAT+TGG - Chr8:9313045-9313064 None:intergenic 35.0%
TTATTCCCATAGTTAAGAGC+GGG + Chr8:9314081-9314100 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
TTCATCACAATATCCAAGGA+GGG - Chr8:9311191-9311210 None:intergenic 35.0%
TTCTGTGTTAGCAGAAATGT+AGG + Chr8:9310185-9310204 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TTGTCTTCAACTGGATTAAC+AGG + Chr8:9309583-9309602 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
TTTCCTGTGTTAACAAGACA+TGG - Chr8:9308259-9308278 None:intergenic 35.0%
TTTGGACAAGATTCTCTGAT+TGG - Chr8:9312669-9312688 None:intergenic 35.0%
! AGTATGTGAATGTTTTCTCC+GGG - Chr8:9314053-9314072 None:intergenic 35.0%
! AGTGATGTTCTTCTTTTTGC+AGG - Chr8:9310482-9310501 None:intergenic 35.0%
! CAACATAGTGAGCTTTGATA+TGG - Chr8:9309623-9309642 None:intergenic 35.0%
! CATTTTACAACTGTCCCATA+TGG + Chr8:9311520-9311539 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
! GCCTTCAAATTCTAAGGAAA+GGG + Chr8:9310815-9310834 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCTTGTTAACACAGGAAA+TGG + Chr8:9308259-9308278 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG + Chr8:9311962-9311981 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGTGTTGGAGATTTCCAT+TGG - Chr8:9311248-9311267 None:intergenic 35.0%
!! AATCTTTCTGAAGCTCGTTA+TGG - Chr8:9313158-9313177 None:intergenic 35.0%
!! CCGGCTAACCTTTAAAATAT+AGG - Chr8:9311334-9311353 None:intergenic 35.0%
!! CGGAAGTACTAAATCTACTA+TGG - Chr8:9311306-9311325 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATCTCCAACACTTTTT+AGG + Chr8:9311250-9311269 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
!! TAGCTTTGACTTTGAGTATG+AGG - Chr8:9310288-9310307 None:intergenic 35.0%
!! TTAGTGTCAATTTTCAGGAC+TGG + Chr8:9311841-9311860 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
!!! AACCTGTTTTTGATCTCTCA+AGG - Chr8:9310247-9310266 None:intergenic 35.0%
!!! ATGAAGGATTTTGGAATTGC+GGG + Chr8:9309704-9309723 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
!!! CATGCAAAGATTGCTGATTT+TGG + Chr8:9311944-9311963 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
!!! GATGAAGGATTTTGGAATTG+CGG + Chr8:9309703-9309722 MsG0880042474.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTGGTTTTGATACAAGCTC+AGG + Chr8:9307756-9307775 MsG0880042474.01.T01:CDS 35.0%
AAACAGGTTCACTATCTCTG+AGG + Chr8:9310258-9310277 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
AAACTCAAGTCGCTCTTAAG+AGG + Chr8:9310961-9310980 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
AATATCCCCGCTCTTAACTA+TGG - Chr8:9314090-9314109 None:intergenic 40.0%
AATTTGCGGCCTAAACTGAA+TGG + Chr8:9313645-9313664 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACAAGATTCTCTGATTGGAG+AGG - Chr8:9312664-9312683 None:intergenic 40.0%
ACAAGGATTATGAACAAGCC+AGG + Chr8:9311613-9311632 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACACGTTCAAAGAAGCCATA+AGG + Chr8:9313132-9313151 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACCAGGAATTTGTCTTCAAC+TGG + Chr8:9309574-9309593 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACCTGTCAACAGTAGTAAAC+CGG + Chr8:9313699-9313718 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACTAGGGTATGTTTGGATGA+AGG + Chr8:9309688-9309707 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ACTATATTTAAGGACGGAGG+AGG - Chr8:9309016-9309035 None:intergenic 40.0%
AGCTTGACATAAAACGTGCT+AGG + Chr8:9313387-9313406 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG + Chr8:9307766-9307785 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
ATATCCCCGCTCTTAACTAT+GGG - Chr8:9314089-9314108 None:intergenic 40.0%
ATGGCTTCTTTGAACGTGTA+TGG - Chr8:9313131-9313150 None:intergenic 40.0%
CAAAGATGTGGAAAAGGATG+TGG - Chr8:9310755-9310774 None:intergenic 40.0%
CAAGATTCTCTGATTGGAGA+GGG - Chr8:9312663-9312682 None:intergenic 40.0%
CAAGGATTATGAACAAGCCA+GGG + Chr8:9311614-9311633 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
CACCATCAATACTGCAGTTT+AGG - Chr8:9309445-9309464 None:intergenic 40.0%
CAGAGCTAAAGGAATGTCTA+TGG + Chr8:9314237-9314256 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
CAGCTTGTATAGAGTACAAC+TGG - Chr8:9313202-9313221 None:intergenic 40.0%
CCAAATATTGGCAGAGCTAA+AGG + Chr8:9314226-9314245 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
CCATCACAAACTTACAGTAC+AGG + Chr8:9308389-9308408 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
CCTCATTAAAGTGCATGTAG+AGG - Chr8:9308708-9308727 None:intergenic 40.0%
CCTCTACATGCACTTTAATG+AGG + Chr8:9308705-9308724 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
CCTGTACTGTAAGTTTGTGA+TGG - Chr8:9308392-9308411 None:intergenic 40.0%
CCTGTGAATTATATGTGGGA+AGG + Chr8:9309419-9309438 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
CCTTCCCACATATAATTCAC+AGG - Chr8:9309422-9309441 None:intergenic 40.0%
CGTCCACACTTTCAAATTTG+CGG + Chr8:9313631-9313650 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
CTATAACTCTTGCAAAACCG+TGG - Chr8:9313495-9313514 None:intergenic 40.0%
CTCCTTGAGAGATCAAAAAC+AGG + Chr8:9310242-9310261 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
CTCCTTGGATATTGTGATGA+AGG + Chr8:9311190-9311209 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
CTTCATCACAATATCCAAGG+AGG - Chr8:9311192-9311211 None:intergenic 40.0%
CTTTAATGAGGTTGAAGAGC+TGG + Chr8:9308717-9308736 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCACCATCATCAATGCA+AGG + Chr8:9310984-9311003 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
GAAACGATTAAGCACCAATG+AGG + Chr8:9308558-9308577 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
GAACGTGTATGGACAGAAAA+TGG - Chr8:9313120-9313139 None:intergenic 40.0%
GAAGAACATCACTGTACCAT+TGG + Chr8:9310489-9310508 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
GACAGAGTTCAAATCCCATA+TGG - Chr8:9311538-9311557 None:intergenic 40.0%
GACCTTCATCACAATATCCA+AGG - Chr8:9311195-9311214 None:intergenic 40.0%
GCCCTTTCCTTAGAATTTGA+AGG - Chr8:9310819-9310838 None:intergenic 40.0%
GCGGTATCATGTTCTTATGA+TGG + Chr8:9312213-9312232 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
GCTAAAGGAATGTCTATGGT+TGG + Chr8:9314241-9314260 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAAAACGATGTAACCAA+TGG - Chr8:9310508-9310527 None:intergenic 40.0%
GGAAAAGGATGTGGTAGAAT+AGG - Chr8:9310746-9310765 None:intergenic 40.0%
GGACTGGATTATCTGCATAA+TGG + Chr8:9311857-9311876 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
GTCTTCAACTGGATTAACAG+GGG + Chr8:9309585-9309604 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
GTGCCCCTATACAATTTCAA+TGG + Chr8:9308653-9308672 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
GTGGTCCTGTGAATTATATG+TGG + Chr8:9309414-9309433 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
TATTCCCATAGTTAAGAGCG+GGG + Chr8:9314082-9314101 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAGAGAGGGAAATGAGT+GGG + Chr8:9312435-9312454 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
TCACCGGAATTAAGCAAGTT+TGG - Chr8:9309213-9309232 None:intergenic 40.0%
TCATCACAATATCCAAGGAG+GGG - Chr8:9311190-9311209 None:intergenic 40.0%
TCCAGTTGAAGACAAATTCC+TGG - Chr8:9309578-9309597 None:intergenic 40.0%
TCGAGTACAAGACCTTTGAT+TGG + Chr8:9308832-9308851 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
TGACACTAAGGGCAATGTAA+GGG - Chr8:9311830-9311849 None:intergenic 40.0%
TGCTAGGAATACAACTGATG+CGG + Chr8:9313403-9313422 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
TGGAATTCTTAAAAGTGGGC+AGG - Chr8:9312619-9312638 None:intergenic 40.0%
TTCAAAGAGAGGGAAATGAG+TGG + Chr8:9312434-9312453 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
TTGACACTAAGGGCAATGTA+AGG - Chr8:9311831-9311850 None:intergenic 40.0%
! CAACCATGTCTTGTTAACAC+AGG + Chr8:9308253-9308272 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
! CGCCTTCAAATTCTAAGGAA+AGG + Chr8:9310814-9310833 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
! GCTCCAAACTTGCTTAATTC+CGG + Chr8:9309207-9309226 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
! GTCTATTGTGTCATTGCCTA+TGG + Chr8:9313760-9313779 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
! TGCCCTTAGTGTCAATTTTC+AGG + Chr8:9311836-9311855 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
! TTCTGGAAACGATCTGATGT+AGG + Chr8:9308364-9308383 MsG0880042474.01.T01:CDS 40.0%
! TTGAAATTGTATAGGGGCAC+TGG - Chr8:9308653-9308672 None:intergenic 40.0%
!! CCTTTAGCTCTGCCAATATT+TGG - Chr8:9314229-9314248 None:intergenic 40.0%
!! CTAAACTGCAGTATTGATGG+TGG + Chr8:9309443-9309462 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
!! CTTACTGGATTAGTTCCAAG+TGG + Chr8:9310218-9310237 MsG0880042474.01.T01:intron 40.0%
!!! TACCTTTTGGCTCCAATCAA+AGG - Chr8:9308847-9308866 None:intergenic 40.0%
ACCAATCCTGAATGCCTATG+AGG + Chr8:9308906-9308925 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
ACCTCATAGGCATTCAGGAT+TGG - Chr8:9308910-9308929 None:intergenic 45.0%
AGCAGAGCAGACTGTTAAAC+AGG + Chr8:9307988-9308007 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCGCAAATTTGAAAGTG+TGG - Chr8:9313637-9313656 None:intergenic 45.0%
AGTTCATCTGCCTGTATCTC+AGG + Chr8:9312708-9312727 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAGTTGACACAGCACA+TGG + Chr8:9311764-9311783 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
CATCAAGAATGCTTATGGGG+TGG + Chr8:9309367-9309386 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
CATCACAATATCCAAGGAGG+GGG - Chr8:9311189-9311208 None:intergenic 45.0%
CGTAACCAAATGTACCAGCA+GGG - Chr8:9312018-9312037 None:intergenic 45.0%
CTGAGCTGCATCAGAAAATC+AGG - Chr8:9310031-9310050 None:intergenic 45.0%
CTGATAAATTCCACCGTGCA+GGG - Chr8:9312793-9312812 None:intergenic 45.0%
CTTATGGGGTGGCTAGAAAT+TGG + Chr8:9309378-9309397 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
GACCTTTGATTGGAGCCAAA+AGG + Chr8:9308842-9308861 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
GAGCTCAGACTGTTAAAGTG+AGG - Chr8:9312747-9312766 None:intergenic 45.0%
GATCGGTATACAGGTATCTC+AGG - Chr8:9308799-9308818 None:intergenic 45.0%
GATTCCGTCGTACAAAGATC+AGG - Chr8:9310460-9310479 None:intergenic 45.0%
GGAATGTCTATGGTTGGAGA+TGG + Chr8:9314247-9314266 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
GTAGGGACGAACAAACTTAC+TGG + Chr8:9310203-9310222 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
GTTGTTGTCCGTAAGCAACT+TGG + Chr8:9312463-9312482 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
TATGAACAAGCCAGGGAGAA+GGG + Chr8:9311621-9311640 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
TATGTGAGGAGCTTTCCTAG+TGG + Chr8:9308019-9308038 MsG0880042474.01.T01:CDS 45.0%
TCATAGGCATTCAGGATTGG+TGG - Chr8:9308907-9308926 None:intergenic 45.0%
TCTGATAAATTCCACCGTGC+AGG - Chr8:9312794-9312813 None:intergenic 45.0%
TCTTGCTGAGCTCAGTTTGT+TGG - Chr8:9313465-9313484 None:intergenic 45.0%
TTATGAACAAGCCAGGGAGA+AGG + Chr8:9311620-9311639 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
! ACCGGTTTACTACTGTTGAC+AGG - Chr8:9313703-9313722 None:intergenic 45.0%
! CTGATTTTCTGATGCAGCTC+AGG + Chr8:9310029-9310048 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
! GGCCTAAACTGCAGTATTGA+TGG + Chr8:9309440-9309459 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
! GGTTGTAATGGGACAGTTGA+AGG - Chr8:9312931-9312950 None:intergenic 45.0%
! TGAAGCTCGTTATGGCCTTA+TGG - Chr8:9313150-9313169 None:intergenic 45.0%
! TTCCTCGTCGAGCTTTTTAC+TGG + Chr8:9312569-9312588 MsG0880042474.01.T01:intron 45.0%
!!! ATTATTTTTAAAAAAGAATT+GGG + Chr8:9311459-9311478 MsG0880042474.01.T01:intron 5.0%
AATTGGCAGGGAGATCCATG+TGG + Chr8:9309395-9309414 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
ACTGATGCGGCCATCATAGA+AGG + Chr8:9313416-9313435 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
ACTTTCCATCACTCCCTGCA+CGG + Chr8:9312777-9312796 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
AGAAATTTGGTCCCCCTCCT+TGG + Chr8:9311175-9311194 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
AGAGGGAAATGAGTGGGATG+AGG + Chr8:9312441-9312460 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
ATGAGATGTGGTCGAGCTTC+TGG + Chr8:9312499-9312518 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
CATATATCTACACGCCCTGC+TGG + Chr8:9312001-9312020 MsG0880042474.01.T01:CDS 50.0%
CGTCCTCACCAAGTTGCTTA+CGG - Chr8:9312474-9312493 None:intergenic 50.0%
CTCAGCAAGAGTTAGAGCCA+CGG + Chr8:9313475-9313494 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
CTGATTGGAGAGGGATCCTA+TGG - Chr8:9312654-9312673 None:intergenic 50.0%
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG - Chr8:9310236-9310255 None:intergenic 50.0%
GCAGTGCTCATCACAATTGC+TGG - Chr8:9308613-9308632 None:intergenic 50.0%
GCGTAACCAAATGTACCAGC+AGG - Chr8:9312019-9312038 None:intergenic 50.0%
GTGCTCATCACAATTGCTGG+TGG - Chr8:9308610-9308629 None:intergenic 50.0%
TGCCAGTAAAAAGCTCGACG+AGG - Chr8:9312574-9312593 None:intergenic 50.0%
! AGGCATTCAGGATTGGTGGA+AGG - Chr8:9308903-9308922 None:intergenic 50.0%
! CGTAAGCAACTTGGTGAGGA+CGG + Chr8:9312472-9312491 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
! GGCATTCAGGATTGGTGGAA+GGG - Chr8:9308902-9308921 None:intergenic 50.0%
! TGTCCGTAAGCAACTTGGTG+AGG + Chr8:9312468-9312487 MsG0880042474.01.T01:intron 50.0%
!! AAAGCACTAGTGAGAGCACC+CGG + Chr8:9314032-9314051 MsG0880042474.01.T01:CDS 50.0%
!! ATAGGGGCACTGGCATTTAC+TGG - Chr8:9308643-9308662 None:intergenic 50.0%
ACACGCCCTGCTGGTACATT+TGG + Chr8:9312010-9312029 MsG0880042474.01.T01:CDS 55.0%
ACTACAGTTGCCCTTCTCCC+TGG - Chr8:9311634-9311653 None:intergenic 55.0%
ATGTGGTCGAGCTTCTGGTG+AGG + Chr8:9312504-9312523 MsG0880042474.01.T01:intron 55.0%
CTGAACGAGACACGAAGCAG+AGG + Chr8:9312528-9312547 MsG0880042474.01.T01:intron 55.0%
GAGGACGGAGAGATGAGATG+TGG + Chr8:9312487-9312506 MsG0880042474.01.T01:intron 55.0%
GGGGTGGCTAGAAATTGGCA+GGG + Chr8:9309383-9309402 MsG0880042474.01.T01:intron 55.0%
TGGGGTGGCTAGAAATTGGC+AGG + Chr8:9309382-9309401 MsG0880042474.01.T01:intron 55.0%
TTCCACCGTGCAGGGAGTGA+TGG - Chr8:9312785-9312804 None:intergenic 60.0%
TTCCATCACTCCCTGCACGG+TGG + Chr8:9312780-9312799 MsG0880042474.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 9307715 9314589 9307715 ID=MsG0880042474.01;Name=MsG0880042474.01
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