AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042492.01

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MsG0880042492.01.T01 AT2G23950 31.360 456 182 13 364 703 28 468 8.00e-51 189
MsG0880042492.01.T01 AT3G05990 31.568 472 275 20 31 481 28 472 1.62e-49 182
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MsG0880042492.01.T01 AT5G63710 31.221 426 199 11 364 703 46 463 1.31e-48 182
MsG0880042492.01.T01 AT5G63710 31.221 426 199 11 364 703 45 462 1.48e-48 182
MsG0880042492.01.T01 AT1G52290 49.390 164 82 1 540 703 151 313 1.12e-47 174
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MsG0880042492.01.T01 AT1G68690 49.390 164 81 2 540 703 385 546 2.28e-42 165
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MsG0880042492.01.T01 AT5G37450 48.824 170 83 1 540 705 639 808 5.26e-41 162
MsG0880042492.01.T01 AT4G11530 48.295 176 88 2 540 712 360 535 5.42e-41 160
MsG0880042492.01.T01 AT4G01330 47.590 166 84 2 540 703 170 334 5.46e-41 157
MsG0880042492.01.T01 AT4G01330 47.590 166 84 2 540 703 170 334 5.72e-41 157
MsG0880042492.01.T01 AT1G24650 51.479 169 76 3 540 703 555 722 5.75e-41 162
MsG0880042492.01.T01 AT1G24650 38.053 113 55 4 371 478 327 429 1.65e-12 71.6
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MsG0880042492.01.T01 AT2G18470 47.561 164 85 1 540 703 292 454 2.23e-40 158
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MsG0880042492.01.T01 AT2G42960 46.988 166 85 2 540 703 191 355 1.73e-39 153
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MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 598 773 4.86e-39 156
MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 598 773 4.86e-39 156
MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 540 715 5.29e-39 155
MsG0880042492.01.T01 AT3G59110 46.386 166 86 2 540 703 198 362 5.38e-39 152
MsG0880042492.01.T01 AT3G25560 29.132 357 182 9 414 703 130 482 5.68e-39 154
MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 626 801 5.69e-39 156
MsG0880042492.01.T01 AT4G23130 44.505 182 98 2 534 712 342 523 6.54e-39 154
MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 698 873 6.66e-39 156
MsG0880042492.01.T01 AT4G03230 47.753 178 86 3 540 712 698 873 6.66e-39 156
MsG0880042492.01.T01 AT5G39000 47.647 170 84 3 541 705 527 696 6.85e-39 155
MsG0880042492.01.T01 AT5G49770 37.712 236 131 4 547 767 649 883 6.91e-39 155
MsG0880042492.01.T01 AT4G23130 44.505 182 98 2 534 712 346 527 7.55e-39 154
MsG0880042492.01.T01 AT2G17220 47.126 174 81 3 540 703 95 267 8.56e-39 149
MsG0880042492.01.T01 AT4G00970 44.944 178 93 3 540 712 352 529 8.57e-39 154
MsG0880042492.01.T01 AT5G38990 47.647 170 84 3 541 705 534 703 9.37e-39 155
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MsG0880042492.01.T01 AT2G17220 47.126 174 81 3 540 703 94 266 1.11e-38 149
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MsG0880042492.01.T01 AT2G07180 45.029 171 86 2 540 703 98 267 3.19e-38 148
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MsG0880042492.01.T01 AT1G61380 47.305 167 83 2 540 703 349 513 5.33e-38 151
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MsG0880042492.01.T01 AT3G09830 44.253 174 87 2 540 703 92 265 2.14e-37 145
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MsG0880042492.01.T01 AT1G69790 42.529 174 87 2 540 703 92 262 2.32e-37 144
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MsG0880042492.01.T01 AT1G61490 46.667 165 87 1 540 703 498 662 2.73e-37 150
MsG0880042492.01.T01 AT1G61490 46.667 165 87 1 540 703 498 662 2.73e-37 150
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MsG0880042492.01.T01 AT1G61490 46.667 165 87 1 540 703 472 636 2.84e-37 150
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MsG0880042492.01.T01 AT1G11330 45.455 176 93 2 540 712 532 707 5.57e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT4G23320 45.143 175 93 2 541 712 192 366 5.84e-37 146
MsG0880042492.01.T01 AT4G23320 45.143 175 93 2 541 712 192 366 5.84e-37 146
MsG0880042492.01.T01 AT5G58940 36.290 248 138 7 540 768 155 401 5.85e-37 145
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MsG0880042492.01.T01 AT5G58940 36.290 248 138 7 540 768 155 401 5.85e-37 145
MsG0880042492.01.T01 AT5G58940 36.290 248 138 7 540 768 155 401 5.85e-37 145
MsG0880042492.01.T01 AT2G05940 43.860 171 88 2 540 703 95 264 6.34e-37 145
MsG0880042492.01.T01 AT4G39400 43.931 173 89 4 541 708 892 1061 6.70e-37 150
MsG0880042492.01.T01 AT1G61420 46.061 165 88 1 540 703 354 518 6.78e-37 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G53420 36.900 271 152 7 515 770 608 874 6.93e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT4G11900 47.904 167 83 2 535 697 468 634 7.12e-37 147
MsG0880042492.01.T01 AT4G23320 45.143 175 93 2 541 712 213 387 7.26e-37 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G61420 46.061 165 88 1 540 703 352 516 7.38e-37 148
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MsG0880042492.01.T01 AT4G11900 47.904 167 83 2 535 697 537 703 7.87e-37 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G53430 46.386 166 86 3 540 703 636 800 8.53e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT5G44700 32.873 362 164 11 416 703 772 1128 8.70e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT1G53430 46.386 166 86 3 540 703 677 841 9.08e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT2G02220 48.485 165 82 2 541 703 743 906 9.55e-37 149
MsG0880042492.01.T01 AT5G24080 44.242 165 89 2 541 703 412 575 9.73e-37 148
MsG0880042492.01.T01 AT5G24080 44.242 165 89 2 541 703 412 575 9.73e-37 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G74360 44.509 173 88 3 536 703 818 987 1.05e-36 149
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 267 442 1.08e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT4G17660 42.197 173 88 2 540 703 99 268 1.12e-36 142
MsG0880042492.01.T01 AT4G32300 42.529 174 96 3 540 711 501 672 1.17e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 296 471 1.21e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 296 471 1.21e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61360 46.061 165 88 1 540 703 425 589 1.23e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G61360 46.061 165 88 1 540 703 425 589 1.23e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G61360 46.061 165 88 1 540 703 425 589 1.23e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G61360 46.061 165 88 1 540 703 506 670 1.27e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT4G23250 46.286 175 91 2 541 712 363 537 1.33e-36 149
MsG0880042492.01.T01 AT5G24080 44.242 165 89 2 541 703 539 702 1.44e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT4G04540 48.101 158 81 1 540 696 361 518 1.51e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G61610 45.455 176 93 2 540 712 533 708 1.56e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G14370 43.429 175 86 3 540 703 94 266 1.61e-36 143
MsG0880042492.01.T01 AT3G21630 44.444 171 87 4 540 709 330 493 1.68e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G61420 46.061 165 88 1 540 703 502 666 1.69e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G61400 46.951 164 86 1 541 703 509 672 1.70e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT3G16030 47.159 176 90 2 540 712 412 587 1.71e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT3G16030 47.159 176 90 2 540 712 535 710 1.71e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G61420 46.061 165 88 1 540 703 504 668 1.77e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61420 46.061 165 88 1 540 703 504 668 1.77e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT3G13380 44.186 172 91 3 541 708 867 1037 1.81e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT4G38830 45.304 181 87 5 540 712 352 528 2.05e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT2G19130 45.783 166 85 3 541 703 502 665 2.21e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT3G28690 41.954 174 90 2 540 703 34 206 2.23e-36 141
MsG0880042492.01.T01 AT3G16030 47.159 176 90 2 540 712 556 731 2.44e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT5G12000 45.087 173 87 4 536 703 341 510 2.45e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G61440 46.341 164 87 1 541 703 492 655 2.54e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT5G35380 46.821 173 84 4 536 703 418 587 2.55e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61480 45.455 165 89 1 540 703 504 668 2.63e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61440 46.341 164 87 1 541 703 487 650 2.68e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61610 45.455 176 93 2 540 712 533 708 2.70e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G35710 31.180 356 174 8 414 704 678 1027 2.80e-36 148
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 461 636 2.95e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT5G16500 47.024 168 85 3 540 703 82 249 3.13e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 504 679 3.14e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT3G46270 31.452 372 223 16 4 363 8 359 3.15e-36 143
MsG0880042492.01.T01 AT1G67520 46.591 176 91 2 540 712 511 686 3.21e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT3G46270 31.452 372 223 16 4 363 16 367 3.27e-36 143
MsG0880042492.01.T01 AT5G02070 42.938 177 94 2 541 710 372 548 3.52e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT2G23450 44.444 171 94 1 541 711 357 526 3.75e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT2G23450 44.444 171 94 1 541 711 357 526 3.75e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G34110 31.445 353 169 9 418 703 602 948 3.85e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G34110 31.445 353 169 9 418 703 602 948 4.41e-36 147
MsG0880042492.01.T01 AT1G61500 46.061 165 88 1 540 703 499 663 4.44e-36 146
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MsG0880042492.01.T01 AT1G61460 44.848 165 90 1 540 703 462 626 4.67e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G61500 46.061 165 88 1 540 703 481 645 4.85e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G61500 46.061 165 88 1 540 703 504 668 4.98e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT5G12000 45.087 173 87 4 536 703 426 595 5.03e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G76360 44.253 174 86 2 540 703 171 343 5.06e-36 143
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MsG0880042492.01.T01 AT1G11300 44.318 176 95 2 540 712 502 677 5.52e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G09970 31.016 374 169 8 415 703 484 853 5.61e-36 147
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MsG0880042492.01.T01 AT1G11300 44.318 176 95 2 540 712 517 692 5.89e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT4G11900 47.305 167 84 2 535 697 537 703 6.17e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G53440 45.181 166 88 3 540 703 675 839 6.45e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT4G11900 47.305 167 84 2 535 697 537 703 6.49e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT4G11900 47.305 167 84 2 535 697 537 703 6.49e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G34300 42.775 173 97 2 541 712 493 664 6.50e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G65790 44.886 176 94 2 540 712 527 702 7.13e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT4G33430 45.238 168 86 4 540 703 297 462 7.34e-36 144
MsG0880042492.01.T01 AT1G66910 43.713 167 89 3 540 704 356 519 7.62e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT1G09970 30.769 377 172 8 415 706 484 856 7.71e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT5G20480 32.571 350 153 11 433 703 556 901 7.79e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT5G20480 32.571 350 153 11 433 703 556 901 7.79e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G66910 43.713 167 89 3 540 704 353 516 8.03e-36 145
MsG0880042492.01.T01 AT5G06740 42.246 187 102 4 540 721 338 523 8.41e-36 144
MsG0880042492.01.T01 AT3G28450 30.833 360 172 10 413 703 127 478 8.58e-36 144
MsG0880042492.01.T01 AT4G33430 45.238 168 86 4 540 703 344 509 8.89e-36 144
MsG0880042492.01.T01 AT1G07650 44.444 171 91 2 536 703 656 825 9.10e-36 146
MsG0880042492.01.T01 AT1G61430 46.341 164 87 1 541 703 475 638 9.44e-36 145

Find 151 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 287 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTAAATGATCTCCTTGATTT+TGG 0.116869 8:+9523919 None:intergenic
CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG 0.138412 8:-9523986 MsG0880042492.01.T01:CDS
CCTTTAGCTCGAATAATATT+TGG 0.149790 8:+9519854 None:intergenic
CATGCAAAGATTGCTGATTT+TGG 0.197765 8:-9520469 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTGAACTCTCTGTCTTAAAA+AGG 0.224458 8:+9523244 None:intergenic
CTCTTCCAGAGATATGATTT+TGG 0.253339 8:-9523761 MsG0880042492.01.T01:CDS
AAAGTAGAGACCCTATATTT+TGG 0.269666 8:-9523303 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGTCGTTCATCATAGAAATT+TGG 0.269705 8:-9520901 MsG0880042492.01.T01:CDS
TCTTGATTTCTCTTGGAGTT+TGG 0.270595 8:-9521651 MsG0880042492.01.T01:CDS
AATCTCCAACAACAATTATT+AGG 0.276590 8:-9520810 MsG0880042492.01.T01:intron
ATTGGGGCACTGGCATTTAC+TGG 0.278552 8:+9523480 None:intergenic
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG 0.287014 8:-9521176 MsG0880042492.01.T01:intron
TTCCTTATCAATTCATTGAT+TGG 0.293272 8:-9523590 MsG0880042492.01.T01:CDS
AAGGGAAATATCATAGCTTT+TGG 0.309005 8:+9523263 None:intergenic
TCAAAGGTCTTCCAAAATAT+AGG 0.320355 8:+9523292 None:intergenic
CATCATCACTACTACAGTTT+AGG 0.321075 8:+9522826 None:intergenic
ACTTACAAAGATGTGATTCT+TGG 0.324232 8:+9522792 None:intergenic
ATCTTCAATGCAAGGTTATA+AGG 0.324422 8:-9521093 MsG0880042492.01.T01:CDS
ACAAACATCAAGAATGCTTA+TGG 0.324968 8:-9522906 MsG0880042492.01.T01:CDS
TAACATAGTGAGCTTTGATA+TGG 0.327093 8:+9522647 None:intergenic
GCTAAAGGAATGTCTATCTT+TGG 0.327562 8:-9519839 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTTATGGAGTGACTAGAAAT+TGG 0.344107 8:-9522890 MsG0880042492.01.T01:CDS
GTGGGGAAGAACAGACTTAC+AGG 0.360240 8:-9522234 MsG0880042492.01.T01:CDS
ACTCGCCCTGCTGGTACATT+TGG 0.361485 8:-9520403 MsG0880042492.01.T01:CDS
CGCTATTGAATTGAGGACTT+TGG 0.365454 8:-9523831 MsG0880042492.01.T01:CDS
CACTCCAGTGAAATTGCATT+GGG 0.365656 8:+9523463 None:intergenic
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG 0.368982 8:-9523614 MsG0880042492.01.T01:CDS
ATCAGAGCTACTTTCTATTA+CGG 0.371081 8:-9524034 MsG0880042492.01.T01:CDS
AGAAATTTGGTCTCCCTCAT+TGG 0.374295 8:-9520888 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTTACAAAGATGTGATTCTT+GGG 0.376698 8:+9522793 None:intergenic
TCATTCCAGTTTAAGATCTT+CGG 0.378085 8:+9520682 None:intergenic
TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG 0.381649 8:-9520451 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTATCAAACAATAGCTTAAA+CGG 0.381690 8:-9522386 MsG0880042492.01.T01:CDS
GTAATCCTCTTGATTTCTCT+TGG 0.381715 8:-9521658 MsG0880042492.01.T01:CDS
AACATTCTCATCATTGTATC+CGG 0.387175 8:+9524465 None:intergenic
AATAATATTTGGCTCATGTC+TGG 0.387808 8:+9519865 None:intergenic
TCTGGCCTTTCAATTGCATT+TGG 0.394015 8:+9519883 None:intergenic
TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG 0.396445 8:+9520523 None:intergenic
GTGAAATTGCATTGGGGCAC+TGG 0.396452 8:+9523470 None:intergenic
AATTACCTAATAATTGTTGT+TGG 0.405326 8:+9520805 None:intergenic
TATGATGAACGACCGTTAGA+AGG 0.410029 8:+9520910 None:intergenic
CAAAGGTCTTCCAAAATATA+GGG 0.417929 8:+9523293 None:intergenic
CCAAATATTATTCGAGCTAA+AGG 0.421831 8:-9519854 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTCATTGGATATTGTAATGA+AGG 0.430576 8:-9520873 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTGTCTTCAAGTGGATTGAC+AGG 0.430730 8:-9522684 MsG0880042492.01.T01:CDS
AAAATCCGAAGATCTTAAAC+TGG 0.432287 8:-9520687 MsG0880042492.01.T01:CDS
AACACCGCATCCCACATATT+AGG 0.433062 8:+9523962 None:intergenic
TGCAGTTGCATCATGAAATC+AGG 0.434077 8:+9522356 None:intergenic
GATGCTGAATTCATAGATAC+AGG 0.436902 8:-9524184 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTTTAATGAGGTTGAGAAGC+TGG 0.440124 8:-9523403 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTATAACCTTGCATTGAAGA+TGG 0.444421 8:+9521095 None:intergenic
TGGAACCAAAATCATATCTC+TGG 0.446124 8:+9523756 None:intergenic
GTCCAATCAATGAATTGATA+AGG 0.451257 8:+9523588 None:intergenic
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG 0.453587 8:-9524393 MsG0880042492.01.T01:intron
TTTGTGTTTGATACAAGCTC+AGG 0.464128 8:-9524403 MsG0880042492.01.T01:CDS
GCAGTGCTCATAACTATTGC+CGG 0.464408 8:+9523510 None:intergenic
CCATCACAAATTTAGCATAC+AGG 0.468370 8:-9523736 MsG0880042492.01.T01:intron
GGATTGGAGTATCTGCATAA+TGG 0.468756 8:-9520556 MsG0880042492.01.T01:CDS
TCATTCAATATCACTGTGAA+TGG 0.472383 8:-9523363 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG 0.476489 8:-9521161 MsG0880042492.01.T01:CDS
TCATTTCCGCTATTGAATTG+AGG 0.481392 8:-9523838 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTCATCATCTAACAATATGT+TGG 0.482288 8:+9520495 None:intergenic
GTGAATGGAGACCGTTTGTA+TGG 0.494258 8:-9523348 MsG0880042492.01.T01:CDS
AGGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG 0.499312 8:+9523220 None:intergenic
TAGATCATTATTGTTAAATG+AGG 0.499432 8:+9523554 None:intergenic
TGCATCACGCCCCAAAATCA+AGG 0.500563 8:-9523930 MsG0880042492.01.T01:CDS
CATATATCCACTCGCCCTGC+TGG 0.502203 8:-9520412 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTCACATTCAGAAACTCATC+AGG 0.507976 8:-9523172 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTAAACTGTAGTAGTGATGA+TGG 0.512262 8:-9522825 MsG0880042492.01.T01:CDS
TATAAATCTCAAAGGCATTG+AGG 0.513718 8:+9523208 None:intergenic
ACTTTAGCATCAATTCAGCT+TGG 0.514622 8:-9519939 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTTTCACCATCTTCAATGCA+AGG 0.515083 8:-9521101 MsG0880042492.01.T01:CDS
ACCAGGAATTTGTCTTCAAG+TGG 0.515998 8:-9522693 MsG0880042492.01.T01:intron
ACACTCCAGTGAAATTGCAT+TGG 0.517436 8:+9523462 None:intergenic
AATCTCAAAGGCATTGAGGA+TGG 0.517999 8:+9523212 None:intergenic
GTGCCCCAATGCAATTTCAC+TGG 0.518136 8:-9523467 MsG0880042492.01.T01:CDS
CCTTCCCACATGTAATTCAC+AGG 0.518706 8:+9522849 None:intergenic
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG 0.518986 8:+9522204 None:intergenic
AATTCAATAGCGGAAATGAA+TGG 0.519295 8:+9523842 None:intergenic
ATGTAACCAAATGTACCAGC+AGG 0.520385 8:+9520397 None:intergenic
AGCATTGATTTATGAATACA+TGG 0.524548 8:-9520841 MsG0880042492.01.T01:CDS
TACAGTGTGGATGATAATCC+TGG 0.527255 8:-9521754 MsG0880042492.01.T01:intron
GTATCAAACACAAAATAGTA+AGG 0.531108 8:+9524412 None:intergenic
ATTTATGAATACATGGCCAA+TGG 0.533355 8:-9520834 MsG0880042492.01.T01:CDS
TAATCCTGGTCTTTGTATGA+AGG 0.534791 8:-9521740 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG 0.538785 8:+9523221 None:intergenic
TGGAAGAGTGATAACACTAC+TGG 0.541951 8:+9523776 None:intergenic
TTGTTGTTGGAGATTTCCAT+TGG 0.551023 8:+9520818 None:intergenic
TGTCTTGTTAACACAGGCAA+AGG 0.553002 8:-9523869 MsG0880042492.01.T01:CDS
ATCTCAAAGGCATTGAGGAT+GGG 0.555694 8:+9523213 None:intergenic
TCAGAAACTCATCAGGATGA+TGG 0.558935 8:-9523165 MsG0880042492.01.T01:intron
TCATTGGATATTGTAATGAA+GGG 0.560265 8:-9520872 MsG0880042492.01.T01:CDS
GTCTTGTTAACACAGGCAAA+GGG 0.563362 8:-9523868 MsG0880042492.01.T01:CDS
GCATCTCAGGTCCATACAAA+CGG 0.565140 8:+9523337 None:intergenic
CCTGTATGCTAAATTTGTGA+TGG 0.565968 8:+9523736 None:intergenic
TCAGAATTCTTATGAGCCAC+CGG 0.567990 8:-9523529 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTATAAGGAATTTCAATCAG+AGG 0.570275 8:-9521078 MsG0880042492.01.T01:intron
TCATGTGTAAACAGAAATGT+GGG 0.570449 8:-9522252 MsG0880042492.01.T01:intron
TTACAAAGATGTGATTCTTG+GGG 0.572174 8:+9522794 None:intergenic
GTCATGTGTAAACAGAAATG+TGG 0.573153 8:-9522253 MsG0880042492.01.T01:intron
TCATCTAACAATATGTTGGA+CGG 0.573636 8:+9520499 None:intergenic
TGGATGTTCAGAAGACAGAA+AGG 0.577553 8:-9521631 MsG0880042492.01.T01:intron
TTGCATCATGAAATCAGGTA+AGG 0.577850 8:+9522361 None:intergenic
CTTCATTACAATATCCAATG+AGG 0.578887 8:+9520874 None:intergenic
TAGCAGTTTCTCACTCCACT+AGG 0.579653 8:+9524091 None:intergenic
TACAAAGATGTGATTCTTGG+GGG 0.580872 8:+9522795 None:intergenic
AACTACACTGAGAAGATCAC+AGG 0.582797 8:-9524223 MsG0880042492.01.T01:CDS
ATGTAATTCACAGGGGCACA+TGG 0.587032 8:+9522858 None:intergenic
TTGCCTGTGTTAACAAGACA+TGG 0.589284 8:+9523872 None:intergenic
TTCATTACAATATCCAATGA+GGG 0.590456 8:+9520875 None:intergenic
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG 0.593683 8:+9520526 None:intergenic
TACGATATAAATGTAAACAT+TGG 0.596871 8:-9524070 MsG0880042492.01.T01:CDS
CTTCACCAAATGCAATTGAA+AGG 0.597439 8:-9519888 MsG0880042492.01.T01:CDS
AAATGTACCAGCAGGGCGAG+TGG 0.599436 8:+9520405 None:intergenic
CTTCCCACATGTAATTCACA+GGG 0.599484 8:+9522850 None:intergenic
TGATGTTTATGATCGCATCT+GGG 0.599878 8:-9523613 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGATTCATTAGTATAGATTG+TGG 0.601339 8:-9524262 MsG0880042492.01.T01:CDS
TCAAAGGCATTGAGGATGGG+TGG 0.601987 8:+9523216 None:intergenic
AAACTCCAAGAGAAATCAAG+AGG 0.603537 8:+9521653 None:intergenic
GACATAGTTCAGAGAAACTG+TGG 0.604415 8:-9519817 MsG0880042492.01.T01:CDS
GTTGTTGATTCAAGGTTGCA+CGG 0.615800 8:-9519964 MsG0880042492.01.T01:intron
TGATGAGTAATCATCTCTGC+AGG 0.619525 8:+9524142 None:intergenic
AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG 0.620507 8:+9523989 None:intergenic
CATTGGATATTGTAATGAAG+GGG 0.620957 8:-9520871 MsG0880042492.01.T01:CDS
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG 0.622537 8:+9523986 None:intergenic
TGGACCTAATATGTGGGATG+CGG 0.623857 8:-9523966 MsG0880042492.01.T01:CDS
TGGTTATCTAGCTGAAAGAG+TGG 0.624419 8:+9519744 None:intergenic
GATTCCTTCATACAAAGACC+AGG 0.624516 8:+9521736 None:intergenic
ACAAAGATGTGATTCTTGGG+GGG 0.624725 8:+9522796 None:intergenic
GTCTTCAAGTGGATTGACAG+GGG 0.630396 8:-9522682 MsG0880042492.01.T01:CDS
TGTCTTCAAGTGGATTGACA+GGG 0.631425 8:-9522683 MsG0880042492.01.T01:CDS
GATGCAGGCACACCTTCTAA+CGG 0.643212 8:-9520922 MsG0880042492.01.T01:intron
CTTACAGGGTTAGTTCCAAG+TGG 0.653070 8:-9522219 MsG0880042492.01.T01:CDS
TTTGTAAGGAGCTTTCCTAG+TGG 0.655908 8:-9524106 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGTTGTATGTAATCGTGTGA+TGG 0.659504 8:+9523893 None:intergenic
CAAAGTCCTCAATTCAATAG+CGG 0.661218 8:+9523832 None:intergenic
CCTGTGAATTACATGTGGGA+AGG 0.664411 8:-9522849 MsG0880042492.01.T01:CDS
CAACCATGTCTTGTTAACAC+AGG 0.665613 8:-9523875 MsG0880042492.01.T01:CDS
ATTTGGTGAAGTGCATGACA+TGG 0.670695 8:+9519900 None:intergenic
GTGCCCCTGTGAATTACATG+TGG 0.673171 8:-9522854 MsG0880042492.01.T01:CDS
GGAGTGACTAGAAATTGGCA+AGG 0.673760 8:-9522885 MsG0880042492.01.T01:CDS
ATTGCAGTTGATGCAGCACA+CGG 0.677933 8:-9520649 MsG0880042492.01.T01:intron
GTGCTCATAACTATTGCCGG+TGG 0.686350 8:+9523513 None:intergenic
TGTAACCAAATGTACCAGCA+GGG 0.690029 8:+9520398 None:intergenic
AAACAGGTTCACTATCACTG+AGG 0.702118 8:-9522179 MsG0880042492.01.T01:intron
TGGGGAAGAACAGACTTACA+GGG 0.715607 8:-9522233 MsG0880042492.01.T01:CDS
GCTGAAAATGAAGCAATGAG+TGG 0.729992 8:+9521688 None:intergenic
TGCCCCTGTGAATTACATGT+GGG 0.734463 8:-9522853 MsG0880042492.01.T01:CDS
ACTCCAGTGAAATTGCATTG+GGG 0.760661 8:+9523464 None:intergenic
TTCCCACATGTAATTCACAG+GGG 0.779604 8:+9522851 None:intergenic
CATGTGTAAACAGAAATGTG+GGG 0.793922 8:-9522251 MsG0880042492.01.T01:intron

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTATATATATGGTTTATTTA+AGG + Chr8:9521451-9521470 None:intergenic 10.0%
!! AAGGAAAAAAATTTAAATGA+AGG + Chr8:9521795-9521814 None:intergenic 15.0%
!! ACATTATCATAAAAAATCAA+AGG + Chr8:9522241-9522260 None:intergenic 15.0%
!! ATAAAGAAATTACATTTCTT+GGG + Chr8:9521900-9521919 None:intergenic 15.0%
!! ATCTCATTTCATTAAATAAA+TGG - Chr8:9521604-9521623 MsG0880042492.01.T01:intron 15.0%
!! TAAAATTTAAATATTGATGC+AGG - Chr8:9523272-9523291 MsG0880042492.01.T01:CDS 15.0%
!! TATAAAATTCATGTATAGTA+AGG + Chr8:9522766-9522785 None:intergenic 15.0%
!! TTATTTAATGAAATGAGATT+AGG + Chr8:9521603-9521622 None:intergenic 15.0%
!! TTTCGTATTCAAAAAAAAAA+AGG + Chr8:9521266-9521285 None:intergenic 15.0%
!!! ACATGAATTTTATATTTTGT+TGG - Chr8:9522772-9522791 MsG0880042492.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTAAATTTTTTTCCTTTC+AGG - Chr8:9521797-9521816 MsG0880042492.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTTTCATTGTTATATTTAA+GGG + Chr8:9521112-9521131 None:intergenic 15.0%
!!! TCACATTTTATATTTTCTTA+TGG + Chr8:9521925-9521944 None:intergenic 15.0%
!!! TGTTTTCATTGTTATATTTA+AGG + Chr8:9521113-9521132 None:intergenic 15.0%
!!! TTTAAATTTTTTTCCTTTCA+GGG - Chr8:9521798-9521817 MsG0880042492.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTGATTTTTTATGATAATG+TGG - Chr8:9522240-9522259 MsG0880042492.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTACTTTATAAATCTCAA+AGG + Chr8:9521012-9521031 None:intergenic 15.0%
!! AATAAATAAATGCGATTGAA+AGG - Chr8:9521720-9521739 MsG0880042492.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTACCTAATAATTGTTGT+TGG + Chr8:9523407-9523426 None:intergenic 20.0%
!! AGGTTATTATTCTCTTTAAT+GGG - Chr8:9521753-9521772 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!! ATGATGTCATTCAAAAAAAT+AGG - Chr8:9522622-9522641 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTCCAAATATAACTTAAG+AGG + Chr8:9521493-9521512 None:intergenic 20.0%
!! GATAAAGAAATTACATTTCT+TGG + Chr8:9521901-9521920 None:intergenic 20.0%
!! TACGATATAAATGTAAACAT+TGG - Chr8:9520139-9520158 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!! TAGATCATTATTGTTAAATG+AGG + Chr8:9520658-9520677 None:intergenic 20.0%
!! TCTATTTAGTTACTTCTTAA+AGG - Chr8:9522660-9522679 MsG0880042492.01.T01:CDS 20.0%
!! TGATGTCATTCAAAAAAATA+GGG - Chr8:9522623-9522642 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!! TTATCAAACAATAGCTTAAA+CGG - Chr8:9521823-9521842 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!!! ACATTCACATATTTTAAGTA+AGG + Chr8:9522397-9522416 None:intergenic 20.0%
!!! ACTGTATAGCTAAAATTTTA+TGG + Chr8:9522873-9522892 None:intergenic 20.0%
!!! ATGGTTTTCAAATAAACTAA+AGG + Chr8:9521079-9521098 None:intergenic 20.0%
!!! CACCAAATTTAAAATTGTTA+GGG - Chr8:9521197-9521216 MsG0880042492.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTATTGTTATTAACATTAC+AGG + Chr8:9522139-9522158 None:intergenic 20.0%
!!! TGGTTTTCAAATAAACTAAA+GGG + Chr8:9521078-9521097 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATATTAACACTTACTC+TGG + Chr8:9523842-9523861 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTGCTTATAATATTGAC+CGG + Chr8:9520523-9520542 None:intergenic 20.0%
! AAGAACAACATGATCAATAT+AGG - Chr8:9523186-9523205 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! AATCTCCAACAACAATTATT+AGG - Chr8:9523399-9523418 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! AGTGAAACAATGTTGATATT+AGG + Chr8:9522191-9522210 None:intergenic 25.0%
! ATAAGTTCAGCAAAGATAAT+TGG - Chr8:9522154-9522173 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! ATTTGGGTAGAGTATATTTA+AGG - Chr8:9522687-9522706 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! CAGGTTATTATTCTCTTTAA+TGG - Chr8:9521752-9521771 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCCTCTTAAGTTATATT+TGG - Chr8:9521486-9521505 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! GACAACTTCAAAACTATTAT+TGG - Chr8:9523018-9523037 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! GGTTATTATTCTCTTTAATG+GGG - Chr8:9521754-9521773 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! GTATCAAACACAAAATAGTA+AGG + Chr8:9519800-9519819 None:intergenic 25.0%
! TAAGTTCAGCAAAGATAATT+GGG - Chr8:9522155-9522174 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! TCAAGAAAGAAAAGGAAAAA+AGG - Chr8:9522796-9522815 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! TCATTGGATATTGTAATGAA+GGG - Chr8:9523337-9523356 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! TGACAATAAATTCATCCAAA+AGG - Chr8:9522356-9522375 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
! TGGATGAATTTATTGTCATA+AGG + Chr8:9522354-9522373 None:intergenic 25.0%
! TTAAATGAAGGCTTACAATT+TGG + Chr8:9521783-9521802 None:intergenic 25.0%
! TTAATGATGTATGCATGTAT+AGG - Chr8:9520565-9520584 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! TTATAAGGAATTTCAATCAG+AGG - Chr8:9523131-9523150 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAAACTATTATTGGAGA+AGG - Chr8:9523024-9523043 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAATCTCTATGCATAAT+AGG + Chr8:9523689-9523708 None:intergenic 25.0%
! TTCATCATCTAACAATATGT+TGG + Chr8:9523717-9523736 None:intergenic 25.0%
! TTCATTACAATATCCAATGA+GGG + Chr8:9523337-9523356 None:intergenic 25.0%
! TTCCTTATCAATTCATTGAT+TGG - Chr8:9520619-9520638 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
!! AACAACAACTACATTTTGTA+AGG - Chr8:9520089-9520108 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
!! CCACCAAATTTAAAATTGTT+AGG - Chr8:9521196-9521215 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
!! CCTAACAATTTTAAATTTGG+TGG + Chr8:9521199-9521218 None:intergenic 25.0%
!! GTCCCTAACAATTTTAAATT+TGG + Chr8:9521202-9521221 None:intergenic 25.0%
!! TAAATGATCTCCTTGATTTT+GGG + Chr8:9520292-9520311 None:intergenic 25.0%
!! TTTAAAATTGTTAGGGACAA+AGG - Chr8:9521204-9521223 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCATTGATTTATGAATACA+TGG - Chr8:9523368-9523387 MsG0880042492.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTTTTTTTTTCTTTCTTGC+TGG - Chr8:9522326-9522345 MsG0880042492.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAATATAGCTTTGAGTATG+AGG + Chr8:9522064-9522083 None:intergenic 25.0%
AAAAAAGGATTACCACACAA+AGG + Chr8:9521251-9521270 None:intergenic 30.0%
AAAAATGATACCTACAGCTT+TGG - Chr8:9524108-9524127 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
AAAACTATTATTGGAGAAGG+AGG - Chr8:9523027-9523046 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
AAAATCCGAAGATCTTAAAC+TGG - Chr8:9523522-9523541 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
AAAATGATACCTACAGCTTT+GGG - Chr8:9524109-9524128 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
AAACCATACACATTCTTCAA+TGG - Chr8:9524186-9524205 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
AAATCTCTATGCATAATAGG+TGG + Chr8:9523686-9523705 None:intergenic 30.0%
AAATGAAGATCAAATTGTGG+TGG + Chr8:9520223-9520242 None:intergenic 30.0%
AACCATACACATTCTTCAAT+GGG - Chr8:9524187-9524206 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
AACTAATTCTCTCTCATGAA+TGG - Chr8:9521135-9521154 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
ACAAACATCAAGAATGCTTA+TGG - Chr8:9521303-9521322 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
ACTTACAAAGATGTGATTCT+TGG + Chr8:9521420-9521439 None:intergenic 30.0%
ACTTCTTAAAGGTTGCATTT+GGG - Chr8:9522671-9522690 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
ATCTTCAATGCAAGGTTATA+AGG - Chr8:9523116-9523135 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
ATGAATGATGCCTTGTAAAT+GGG - Chr8:9522723-9522742 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
ATTTATGAATACATGGCCAA+TGG - Chr8:9523375-9523394 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGGTCTTCCAAAATATA+GGG + Chr8:9520919-9520938 None:intergenic 30.0%
CATAATAGATTTCAGAGAAC+AGG - Chr8:9524072-9524091 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
CATTGGATATTGTAATGAAG+GGG - Chr8:9523338-9523357 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG + Chr8:9520226-9520245 None:intergenic 30.0%
CCAAATATTATTCGAGCTAA+AGG - Chr8:9524355-9524374 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
CTCATTGGATATTGTAATGA+AGG - Chr8:9523336-9523355 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
CTTACAAAGATGTGATTCTT+GGG + Chr8:9521419-9521438 None:intergenic 30.0%
CTTCATTACAATATCCAATG+AGG + Chr8:9523338-9523357 None:intergenic 30.0%
GAAACAATGTTGATATTAGG+AGG + Chr8:9522188-9522207 None:intergenic 30.0%
GGATTCATTAGTATAGATTG+TGG - Chr8:9519947-9519966 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
GGATTTGGAAAAGTTTACTT+TGG - Chr8:9523048-9523067 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
GTCCAATCAATGAATTGATA+AGG + Chr8:9520624-9520643 None:intergenic 30.0%
TACTTCTTAAAGGTTGCATT+TGG - Chr8:9522670-9522689 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
TATGAATGATGCCTTGTAAA+TGG - Chr8:9522722-9522741 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
TCAAAGGTCTTCCAAAATAT+AGG + Chr8:9520920-9520939 None:intergenic 30.0%
TCATCTAACAATATGTTGGA+CGG + Chr8:9523713-9523732 None:intergenic 30.0%
TCATGTATAGTAAGGACAAA+TGG + Chr8:9522758-9522777 None:intergenic 30.0%
TCATGTGTAAACAGAAATGT+GGG - Chr8:9521957-9521976 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
TCATTCAATATCACTGTGAA+TGG - Chr8:9520846-9520865 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
TGAACTCTCTGTCTTAAAAA+GGG + Chr8:9520967-9520986 None:intergenic 30.0%
TTACAAAGATGTGATTCTTG+GGG + Chr8:9521418-9521437 None:intergenic 30.0%
TTATAACCTTGCATTGAAGA+TGG + Chr8:9523117-9523136 None:intergenic 30.0%
TTATATTTGGAAATGCAACC+AGG - Chr8:9521499-9521518 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
TTGAACTCTCTGTCTTAAAA+AGG + Chr8:9520968-9520987 None:intergenic 30.0%
TTGTTTGATAAATCCCTGAA+AGG + Chr8:9521814-9521833 None:intergenic 30.0%
! AAAGTAGAGACCCTATATTT+TGG - Chr8:9520906-9520925 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
! AAATGATCTCCTTGATTTTG+GGG + Chr8:9520291-9520310 None:intergenic 30.0%
! AAGGGAAATATCATAGCTTT+TGG + Chr8:9520949-9520968 None:intergenic 30.0%
! AATAATATTTGGCTCATGTC+TGG + Chr8:9524347-9524366 None:intergenic 30.0%
! AATGTTGCTGCATTTTCTTT+CGG - Chr8:9519761-9519780 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
! AATTCAATAGCGGAAATGAA+TGG + Chr8:9520370-9520389 None:intergenic 30.0%
! ATCAGAGCTACTTTCTATTA+CGG - Chr8:9520175-9520194 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTCCACTGTATGCAAAT+AGG + Chr8:9523507-9523526 None:intergenic 30.0%
! CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG - Chr8:9520223-9520242 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
! CCTTTAGCTCGAATAATATT+TGG + Chr8:9524358-9524377 None:intergenic 30.0%
! CGCATATTTTCACTTTAATG+AGG - Chr8:9520794-9520813 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
! GTAAATGATCTCCTTGATTT+TGG + Chr8:9520293-9520312 None:intergenic 30.0%
! TAACATAGTGAGCTTTGATA+TGG + Chr8:9521565-9521584 None:intergenic 30.0%
! TATGTTTAGATGGCGAATTT+TGG - Chr8:9521638-9521657 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
! TCAGTGTAGTTTGAATTTTC+AGG + Chr8:9519977-9519996 None:intergenic 30.0%
! TCATTCCAGTTTAAGATCTT+CGG + Chr8:9523530-9523549 None:intergenic 30.0%
! TCATTTTGGACCTAATATGT+GGG - Chr8:9520237-9520256 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
! TTCATTTTGGACCTAATATG+TGG - Chr8:9520236-9520255 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGAATGACATCATTCCT+AGG + Chr8:9522618-9522637 None:intergenic 30.0%
!! AATATAGGGTCTCTACTTTT+TGG + Chr8:9520905-9520924 None:intergenic 30.0%
!! ATTCTATTTGAGTTGATCAC+TGG - Chr8:9524135-9524154 MsG0880042492.01.T01:CDS 30.0%
!! CTGTTCTCTGAAATCTATTA+TGG + Chr8:9524074-9524093 None:intergenic 30.0%
!! TATAAATCTCAAAGGCATTG+AGG + Chr8:9521004-9521023 None:intergenic 30.0%
!! TTGTTGGTTCAAGAAAGAAA+AGG - Chr8:9522788-9522807 MsG0880042492.01.T01:intron 30.0%
!!! GTCTCTACTTTTTGGTATTT+AGG + Chr8:9520897-9520916 None:intergenic 30.0%
!!! TGTAGTTTGAATTTTCAGGT+AGG + Chr8:9519973-9519992 None:intergenic 30.0%
AAACTCCAAGAGAAATCAAG+AGG + Chr8:9522559-9522578 None:intergenic 35.0%
AACCCATTGAAGAATGTGTA+TGG + Chr8:9524192-9524211 None:intergenic 35.0%
AATATCTCCTCCTTCAACTA+TGG + Chr8:9524219-9524238 None:intergenic 35.0%
ACTTTAGCATCAATTCAGCT+TGG - Chr8:9524270-9524289 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
ATATCTCCTCCTTCAACTAT+GGG + Chr8:9524218-9524237 None:intergenic 35.0%
ATGATGTTTATGATCGCATC+TGG - Chr8:9520595-9520614 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
ATTATTGGAGAAGGAGGATT+TGG - Chr8:9523033-9523052 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
ATTTAAGGGCGAAGATAGTA+TGG + Chr8:9521098-9521117 None:intergenic 35.0%
CAAAGTCCTCAATTCAATAG+CGG + Chr8:9520380-9520399 None:intergenic 35.0%
CATCATCACTACTACAGTTT+AGG + Chr8:9521386-9521405 None:intergenic 35.0%
CATGTGTAAACAGAAATGTG+GGG - Chr8:9521958-9521977 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
CCATCACAAATTTAGCATAC+AGG - Chr8:9520473-9520492 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
CCTGTATGCTAAATTTGTGA+TGG + Chr8:9520476-9520495 None:intergenic 35.0%
CTAAACTGTAGTAGTGATGA+TGG - Chr8:9521384-9521403 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
CTTATGGAGTGACTAGAAAT+TGG - Chr8:9521319-9521338 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
CTTCACCAAATGCAATTGAA+AGG - Chr8:9524321-9524340 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
GATGCTGAATTCATAGATAC+AGG - Chr8:9520025-9520044 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
GATTGAAAGGATATCTCTTC+AGG - Chr8:9521733-9521752 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
GCATTTCAAACCCATTTACA+AGG + Chr8:9522736-9522755 None:intergenic 35.0%
GCTAAAGGAATGTCTATCTT+TGG - Chr8:9524370-9524389 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
GGTCGTTCATCATAGAAATT+TGG - Chr8:9523308-9523327 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
GTAATCCTCTTGATTTCTCT+TGG - Chr8:9522551-9522570 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
GTCATGTGTAAACAGAAATG+TGG - Chr8:9521956-9521975 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
TAATGCCTATTTGCATACAG+TGG - Chr8:9523499-9523518 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGATGTGATTCTTGG+GGG + Chr8:9521417-9521436 None:intergenic 35.0%
TAGAATTATCCCAAAGCTGT+AGG + Chr8:9524121-9524140 None:intergenic 35.0%
TAGTTGAAGGAGGAGATATT+CGG - Chr8:9524219-9524238 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
TCATTTCCGCTATTGAATTG+AGG - Chr8:9520371-9520390 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
TCCTACATATATCTCTTCTC+AGG - Chr8:9519926-9519945 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
TCCTGAGAAGAGATATATGT+AGG + Chr8:9519930-9519949 None:intergenic 35.0%
TCTTGATTTCTCTTGGAGTT+TGG - Chr8:9522558-9522577 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
TGATGTTTATGATCGCATCT+GGG - Chr8:9520596-9520615 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
TGCTTATAATATTGACCGGA+GGG + Chr8:9520519-9520538 None:intergenic 35.0%
TGGAACCAAAATCATATCTC+TGG + Chr8:9520456-9520475 None:intergenic 35.0%
TTGCATCATGAAATCAGGTA+AGG + Chr8:9521851-9521870 None:intergenic 35.0%
TTGCTTATAATATTGACCGG+AGG + Chr8:9520520-9520539 None:intergenic 35.0%
TTTGTGTTTGATACAAGCTC+AGG - Chr8:9519806-9519825 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
! AAAACGACAGATTTTCAACG+AGG - Chr8:9522101-9522120 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
! CATTTTCTTTCGGTATTGCT+TGG - Chr8:9519771-9519790 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
! CTCTTCCAGAGATATGATTT+TGG - Chr8:9520448-9520467 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
! GATGCTTTTGTTAGTGCTTT+TGG + Chr8:9524161-9524180 None:intergenic 35.0%
! GTCTTCAAACTCTAAGGAAA+GGG - Chr8:9522940-9522959 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
! TAATCCTGGTCTTTGTATGA+AGG - Chr8:9522469-9522488 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
! TATTGATCGTTCAAGCCTTT+TGG + Chr8:9522374-9522393 None:intergenic 35.0%
! TCTTCAAACTCTAAGGAAAG+GGG - Chr8:9522941-9522960 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
! TTGTTGTTGGAGATTTCCAT+TGG + Chr8:9523394-9523413 None:intergenic 35.0%
! TTTGGTCTAAGTAGAGCTTT+TGG - Chr8:9523758-9523777 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGGTATTTAGGCATCTC+AGG + Chr8:9520888-9520907 None:intergenic 35.0%
!! AATTTCTAGAGTCCTTTGTG+TGG - Chr8:9521236-9521255 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
!! TATTTTGGAAGACCTTTGAC+TGG - Chr8:9520921-9520940 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
!! TTAGTGTGGATTTTCAGGAT+TGG - Chr8:9523637-9523656 MsG0880042492.01.T01:intron 35.0%
!! TTCGGAATGTTGTTGATTCA+AGG - Chr8:9524237-9524256 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACCTGTTTTTGATCTCTCA+AGG + Chr8:9522019-9522038 None:intergenic 35.0%
!!! ATGGCGAATTTTGGAATTGT+GGG - Chr8:9521647-9521666 MsG0880042492.01.T01:CDS 35.0%
AAACAGGTTCACTATCACTG+AGG - Chr8:9522030-9522049 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
AACTACACTGAGAAGATCAC+AGG - Chr8:9519986-9520005 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
ACAAAGATGTGATTCTTGGG+GGG + Chr8:9521416-9521435 None:intergenic 40.0%
ACACTCCAGTGAAATTGCAT+TGG + Chr8:9520750-9520769 None:intergenic 40.0%
ACCAGGAATTTGTCTTCAAG+TGG - Chr8:9521516-9521535 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
ACTCCAGTGAAATTGCATTG+GGG + Chr8:9520748-9520767 None:intergenic 40.0%
AGAAATTTGGTCTCCCTCAT+TGG - Chr8:9523321-9523340 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
AGCTACGTCTTCAAACTCTA+AGG - Chr8:9522934-9522953 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
ATACAAGCTCAGGATCAATC+AGG - Chr8:9519816-9519835 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
ATGTAACCAAATGTACCAGC+AGG + Chr8:9523815-9523834 None:intergenic 40.0%
CACTCCAGTGAAATTGCATT+GGG + Chr8:9520749-9520768 None:intergenic 40.0%
CCACACTAAGTGCAATGTAA+GGG + Chr8:9523626-9523645 None:intergenic 40.0%
CGCCATCTAAACATACTCAT+GGG + Chr8:9521633-9521652 None:intergenic 40.0%
CGCTATTGAATTGAGGACTT+TGG - Chr8:9520378-9520397 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
CTCACATTCAGAAACTCATC+AGG - Chr8:9521037-9521056 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
CTCCTTGAGAGATCAAAAAC+AGG - Chr8:9522014-9522033 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
CTTCCCACATGTAATTCACA+GGG + Chr8:9521362-9521381 None:intergenic 40.0%
CTTTAATGAGGTTGAGAAGC+TGG - Chr8:9520806-9520825 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
CTTTCACCATCTTCAATGCA+AGG - Chr8:9523108-9523127 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
GACATAGTTCAGAGAAACTG+TGG - Chr8:9524392-9524411 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
GACCCATGAGTATGTTTAGA+TGG - Chr8:9521628-9521647 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
GATTCCTTCATACAAAGACC+AGG + Chr8:9522476-9522495 None:intergenic 40.0%
GCTGAAAATGAAGCAATGAG+TGG + Chr8:9522524-9522543 None:intergenic 40.0%
GGTTGTATGTAATCGTGTGA+TGG + Chr8:9520319-9520338 None:intergenic 40.0%
GTAGGAGCAAAGAAAACTTC+AGG + Chr8:9519912-9519931 None:intergenic 40.0%
GTTATTCCCATAGTTGAAGG+AGG - Chr8:9524209-9524228 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
TACAGTGTGGATGATAATCC+TGG - Chr8:9522455-9522474 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
TATGATGAACGACCGTTAGA+AGG + Chr8:9523302-9523321 None:intergenic 40.0%
TCAGAAACTCATCAGGATGA+TGG - Chr8:9521044-9521063 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
TCAGAATTCTTATGAGCCAC+CGG - Chr8:9520680-9520699 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
TCCACACTAAGTGCAATGTA+AGG + Chr8:9523627-9523646 None:intergenic 40.0%
TCCACACTGTAAGAAGTCAA+AGG + Chr8:9522446-9522465 None:intergenic 40.0%
TCCACTTGAAGACAAATTCC+TGG + Chr8:9521520-9521539 None:intergenic 40.0%
TCGCCATCTAAACATACTCA+TGG + Chr8:9521634-9521653 None:intergenic 40.0%
TGATGAGTAATCATCTCTGC+AGG + Chr8:9520070-9520089 None:intergenic 40.0%
TGCAGTTGCATCATGAAATC+AGG + Chr8:9521856-9521875 None:intergenic 40.0%
TGGAAGAGTGATAACACTAC+TGG + Chr8:9520436-9520455 None:intergenic 40.0%
TGGATGTTCAGAAGACAGAA+AGG - Chr8:9522578-9522597 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
TGGGTTATTCCCATAGTTGA+AGG - Chr8:9524206-9524225 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
TGTAACCAAATGTACCAGCA+GGG + Chr8:9523814-9523833 None:intergenic 40.0%
TTCCCACATGTAATTCACAG+GGG + Chr8:9521361-9521380 None:intergenic 40.0%
TTGCCTGTGTTAACAAGACA+TGG + Chr8:9520340-9520359 None:intergenic 40.0%
TTTGTAAGGAGCTTTCCTAG+TGG - Chr8:9520103-9520122 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! ACCTTTGACTTCTTACAGTG+TGG - Chr8:9522442-9522461 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! ATTTGGTGAAGTGCATGACA+TGG + Chr8:9524312-9524331 None:intergenic 40.0%
! CAACCATGTCTTGTTAACAC+AGG - Chr8:9520334-9520353 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! CGTCTTCAAACTCTAAGGAA+AGG - Chr8:9522939-9522958 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! GGATTGGAGTATCTGCATAA+TGG - Chr8:9523653-9523672 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! GTCTTGTTAACACAGGCAAA+GGG - Chr8:9520341-9520360 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! TCTGGCCTTTCAATTGCATT+TGG + Chr8:9524329-9524348 None:intergenic 40.0%
! TGCACTTAGTGTGGATTTTC+AGG - Chr8:9523632-9523651 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
! TGTCTTGTTAACACAGGCAA+AGG - Chr8:9520340-9520359 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
!! AATCTCAAAGGCATTGAGGA+TGG + Chr8:9521000-9521019 None:intergenic 40.0%
!! ATCTCAAAGGCATTGAGGAT+GGG + Chr8:9520999-9521018 None:intergenic 40.0%
!! GACAGAAAGGTACTTCTTGA+AGG - Chr8:9522591-9522610 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
!! GTTGTTGATTCAAGGTTGCA+CGG - Chr8:9524245-9524264 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCTTCAAGTGGATTGACA+GGG - Chr8:9521526-9521545 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
!! TTGTCTTCAAGTGGATTGAC+AGG - Chr8:9521525-9521544 MsG0880042492.01.T01:intron 40.0%
!!! GATGGCGAATTTTGGAATTG+TGG - Chr8:9521646-9521665 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGGCGAATTTTGGAATTGTG+GGG - Chr8:9521648-9521667 MsG0880042492.01.T01:CDS 40.0%
AACACCGCATCCCACATATT+AGG + Chr8:9520250-9520269 None:intergenic 45.0%
AGCTCAGGATCAATCAGGTT+TGG - Chr8:9519821-9519840 MsG0880042492.01.T01:CDS 45.0%
AGGTACTTCTTGAAGGACCT+AGG - Chr8:9522598-9522617 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
CCCTTACATTGCACTTAGTG+TGG - Chr8:9523623-9523642 MsG0880042492.01.T01:CDS 45.0%
CCTGTGAATTACATGTGGGA+AGG - Chr8:9521360-9521379 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
CCTTCCCACATGTAATTCAC+AGG + Chr8:9521363-9521382 None:intergenic 45.0%
GCAGTGCTCATAACTATTGC+CGG + Chr8:9520702-9520721 None:intergenic 45.0%
GCATCTCAGGTCCATACAAA+CGG + Chr8:9520875-9520894 None:intergenic 45.0%
GCTCAGGATCAATCAGGTTT+GGG - Chr8:9519822-9519841 MsG0880042492.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTGACTAGAAATTGGCA+AGG - Chr8:9521324-9521343 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
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TAGCAGTTTCTCACTCCACT+AGG + Chr8:9520121-9520140 None:intergenic 45.0%
TGCCCCTGTGAATTACATGT+GGG - Chr8:9521356-9521375 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
TGGACCTAATATGTGGGATG+CGG - Chr8:9520243-9520262 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
TGGGGAAGAACAGACTTACA+GGG - Chr8:9521976-9521995 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
! ATGTAATTCACAGGGGCACA+TGG + Chr8:9521354-9521373 None:intergenic 45.0%
! ATTGCAGTTGATGCAGCACA+CGG - Chr8:9523560-9523579 MsG0880042492.01.T01:CDS 45.0%
! TGCAATGTAAGGGTACACAG+AGG + Chr8:9523616-9523635 None:intergenic 45.0%
!! CTTACAGGGTTAGTTCCAAG+TGG - Chr8:9521990-9522009 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
!! GTCTTCAAGTGGATTGACAG+GGG - Chr8:9521527-9521546 MsG0880042492.01.T01:intron 45.0%
!!! TAGCTTTTGGCTCCAGTCAA+AGG + Chr8:9520936-9520955 None:intergenic 45.0%
!!! AGTTTTAAAATTTATATATA+TGG + Chr8:9521462-9521481 None:intergenic 5.0%
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG + Chr8:9522008-9522027 None:intergenic 50.0%
GATGCAGGCACACCTTCTAA+CGG - Chr8:9523287-9523306 MsG0880042492.01.T01:CDS 50.0%
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GTGCCCCAATGCAATTTCAC+TGG - Chr8:9520742-9520761 MsG0880042492.01.T01:intron 50.0%
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GTGCTCATAACTATTGCCGG+TGG + Chr8:9520699-9520718 None:intergenic 50.0%
GTGGGGAAGAACAGACTTAC+AGG - Chr8:9521975-9521994 MsG0880042492.01.T01:intron 50.0%
TGCATCACGCCCCAAAATCA+AGG - Chr8:9520279-9520298 MsG0880042492.01.T01:intron 50.0%
!! ATTGGGGCACTGGCATTTAC+TGG + Chr8:9520732-9520751 None:intergenic 50.0%
!! TCAAAGGCATTGAGGATGGG+TGG + Chr8:9520996-9521015 None:intergenic 50.0%
AAATGTACCAGCAGGGCGAG+TGG + Chr8:9523807-9523826 None:intergenic 55.0%
ACTCGCCCTGCTGGTACATT+TGG - Chr8:9523806-9523825 MsG0880042492.01.T01:CDS 55.0%
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! GGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG + Chr8:9520991-9521010 None:intergenic 55.0%
!! AGGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG + Chr8:9520992-9521011 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 9519747 9524484 9519747 ID=MsG0880042492.01;Name=MsG0880042492.01
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>MsG0880042492.01.T01

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Protein sequence

>MsG0880042492.01.T01

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