AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043074.01

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MsG0880043074.01.T01 AT3G46370 35.943 281 157 5 91 351 1 278 1.01e-43 167
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MsG0880043074.01.T01 AT5G16900 44.495 218 100 2 357 574 666 862 3.15e-49 184
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MsG0880043074.01.T01 AT5G13160 35.242 227 119 4 354 575 178 381 9.83e-37 143
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MsG0880043074.01.T01 AT2G13800 41.071 168 95 3 391 555 267 433 5.52e-36 141
MsG0880043074.01.T01 AT4G33430 36.816 201 103 4 358 555 432 611 6.50e-36 143
MsG0880043074.01.T01 AT5G02290 36.816 201 104 4 358 556 173 352 6.88e-36 139
MsG0880043074.01.T01 AT5G02290 36.816 201 104 4 358 556 173 352 6.88e-36 139
MsG0880043074.01.T01 AT2G39110 37.788 217 110 4 339 550 157 353 7.07e-36 139
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MsG0880043074.01.T01 AT3G01300 35.500 200 107 3 358 555 238 417 1.09e-35 140
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MsG0880043074.01.T01 AT1G68690 33.945 218 114 5 353 563 464 658 1.13e-35 143
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MsG0880043074.01.T01 AT5G15080 36.000 200 106 3 358 555 244 423 1.16e-35 140
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MsG0880043074.01.T01 AT4G13190 37.000 200 102 4 358 554 20 198 1.89e-35 134
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MsG0880043074.01.T01 AT3G09010 35.500 200 106 4 358 556 141 318 1.25e-34 135
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MsG0880043074.01.T01 AT5G03320 38.579 197 99 3 357 551 183 359 1.41e-34 136
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MsG0880043074.01.T01 AT5G18610 36.500 200 103 4 358 554 179 357 3.51e-34 136
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MsG0880043074.01.T01 AT3G09830 37.056 197 102 3 357 551 186 362 4.58e-34 134
MsG0880043074.01.T01 AT1G29730 30.705 241 134 4 358 586 766 985 4.68e-34 139
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MsG0880043074.01.T01 AT2G42960 38.122 181 105 4 372 550 275 450 9.64e-34 135
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MsG0880043074.01.T01 AT2G18470 34.112 214 116 3 354 563 373 565 2.78e-33 135
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MsG0880043074.01.T01 AT4G34440 35.407 209 110 3 357 561 404 591 3.84e-33 135
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MsG0880043074.01.T01 AT5G18500 35.784 204 107 4 349 550 252 433 4.78e-33 132
MsG0880043074.01.T01 AT5G18500 35.784 204 107 4 349 550 252 433 4.78e-33 132
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MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
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MsG0880043074.01.T01 AT2G30740 36.098 205 104 3 358 558 172 353 5.85e-33 130
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MsG0880043074.01.T01 AT2G28940 37.563 197 100 4 358 551 89 265 5.94e-33 129
MsG0880043074.01.T01 AT1G07650 37.427 171 103 3 391 558 787 956 6.03e-33 135
MsG0880043074.01.T01 AT3G46280 28.150 373 213 13 5 343 1 352 6.16e-33 132
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MsG0880043074.01.T01 AT3G25560 34.328 201 109 3 357 555 404 583 6.58e-33 134
MsG0880043074.01.T01 AT4G32710 35.747 221 115 4 356 569 480 680 6.65e-33 134
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MsG0880043074.01.T01 AT3G25560 34.328 201 109 3 357 555 403 582 6.85e-33 134
MsG0880043074.01.T01 AT1G07570 35.749 207 108 5 358 561 57 241 7.15e-33 128
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MsG0880043074.01.T01 AT1G21240 36.634 202 100 4 358 555 509 686 1.37e-32 134
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MsG0880043074.01.T01 AT1G79620 33.498 203 106 3 358 555 731 909 1.00e-31 131
MsG0880043074.01.T01 AT5G18910 32.258 217 123 3 358 573 284 477 1.02e-31 129
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MsG0880043074.01.T01 AT5G65700 37.811 201 101 5 358 556 789 967 1.30e-31 131
MsG0880043074.01.T01 AT1G70130 34.389 221 119 6 335 551 403 601 1.38e-31 130
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MsG0880043074.01.T01 AT2G02800 33.981 206 109 5 358 559 186 368 1.40e-31 127
MsG0880043074.01.T01 AT1G29740 36.646 161 99 2 393 551 785 944 1.51e-31 131
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MsG0880043074.01.T01 AT1G07570 35.211 213 113 5 358 567 173 363 1.66e-31 127
MsG0880043074.01.T01 AT1G16670 39.375 160 95 2 393 551 153 311 1.77e-31 126
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MsG0880043074.01.T01 AT4G01330 38.182 165 98 3 389 551 268 430 2.70e-31 127
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MsG0880043074.01.T01 AT5G54590 36.139 202 87 5 358 551 206 373 4.40e-31 126
MsG0880043074.01.T01 AT4G31100 33.852 257 143 5 314 567 498 730 4.41e-31 129
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MsG0880043074.01.T01 AT1G30570 33.178 214 120 3 358 568 613 806 5.34e-31 129
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MsG0880043074.01.T01 AT2G28930 33.047 233 120 7 358 579 174 381 1.12e-30 124
MsG0880043074.01.T01 AT1G06700 34.634 205 107 3 358 558 169 350 1.14e-30 123
MsG0880043074.01.T01 AT1G06700 34.634 205 107 3 358 558 169 350 1.14e-30 123
MsG0880043074.01.T01 AT1G06700 34.634 205 107 3 358 558 169 350 1.14e-30 123
MsG0880043074.01.T01 AT1G31420 34.000 200 108 5 358 556 399 575 1.16e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT1G31420 34.000 200 108 5 358 556 399 575 1.16e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT1G34110 35.294 221 114 6 342 556 854 1051 1.18e-30 128
MsG0880043074.01.T01 AT1G31420 34.000 200 108 5 358 556 398 574 1.20e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT5G38990 32.500 240 135 5 358 590 622 841 1.35e-30 128
MsG0880043074.01.T01 AT1G34110 35.294 221 114 6 342 556 854 1051 1.40e-30 128
MsG0880043074.01.T01 AT1G54820 31.064 235 128 4 322 554 226 428 1.41e-30 125
MsG0880043074.01.T01 AT2G28930 33.047 233 120 7 358 579 177 384 1.44e-30 124
MsG0880043074.01.T01 AT1G72540 32.057 209 119 4 358 564 184 371 1.57e-30 125
MsG0880043074.01.T01 AT1G69790 31.944 216 119 5 358 571 176 365 1.63e-30 123
MsG0880043074.01.T01 AT1G21250 35.678 199 106 3 358 555 503 680 1.75e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT3G49670 36.816 201 103 5 358 556 785 963 1.83e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT5G56890 35.211 213 111 5 352 557 812 1004 2.28e-30 127
MsG0880043074.01.T01 AT1G69790 31.944 216 119 5 358 571 187 376 2.37e-30 123
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MsG0880043074.01.T01 AT5G11020 31.222 221 127 4 336 554 175 372 3.31e-28 117
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MsG0880043074.01.T01 AT4G00340 33.173 208 109 3 357 555 574 760 4.72e-28 120
MsG0880043074.01.T01 AT1G56130 36.970 165 101 3 391 554 652 814 4.72e-28 120
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MsG0880043074.01.T01 AT4G23270 35.119 168 107 1 393 558 435 602 5.03e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT4G23270 35.119 168 107 1 393 558 435 602 5.03e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT4G28650 33.498 203 111 4 357 557 799 979 5.06e-28 120
MsG0880043074.01.T01 AT5G65240 32.020 203 112 5 357 555 379 559 5.14e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G29750 35.385 195 118 4 386 573 767 960 5.21e-28 120
MsG0880043074.01.T01 AT2G25220 29.515 227 136 4 330 554 163 367 5.33e-28 116
MsG0880043074.01.T01 AT1G24030 33.990 203 109 4 358 555 67 249 5.97e-28 113
MsG0880043074.01.T01 AT1G55200 33.921 227 124 6 354 576 468 672 6.27e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G55200 33.921 227 124 6 354 576 468 672 6.27e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G55200 33.921 227 124 6 354 576 468 672 6.27e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G55200 33.921 227 124 6 354 576 468 672 6.27e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G56120 37.725 167 93 4 393 554 652 812 7.09e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G79670 32.524 206 117 3 352 556 472 656 7.13e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT5G25930 33.005 203 112 5 356 556 786 966 7.31e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G56130 37.423 163 99 3 393 554 802 962 7.32e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT4G23310 35.976 164 103 1 393 554 577 740 7.40e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT2G23950 42.069 145 61 3 358 500 391 514 7.53e-28 118
MsG0880043074.01.T01 AT4G23310 35.976 164 103 1 393 554 617 780 7.91e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G61610 33.742 163 108 0 393 555 634 796 8.03e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT2G37050 28.613 346 199 12 33 338 27 364 8.61e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G79670 32.524 206 117 3 352 556 509 693 8.89e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT2G37050 28.613 346 199 12 33 338 27 364 8.94e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT3G13690 34.906 212 111 5 358 567 504 690 9.25e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT3G13690 34.906 212 111 5 358 567 504 690 9.25e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT3G13690 34.906 212 111 5 358 567 504 690 9.25e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT4G31230 32.843 204 104 5 353 552 454 628 9.42e-28 118
MsG0880043074.01.T01 AT1G56120 37.725 167 93 4 393 554 800 960 9.46e-28 119
MsG0880043074.01.T01 AT4G22130 33.333 219 115 7 350 565 344 534 9.72e-28 118
MsG0880043074.01.T01 AT1G56120 37.725 167 93 4 393 554 818 978 1.05e-27 119
MsG0880043074.01.T01 AT3G05140 36.585 164 100 2 391 554 249 408 1.09e-27 116
MsG0880043074.01.T01 AT5G61480 38.323 167 97 3 393 556 836 999 1.22e-27 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G08590 36.471 170 99 4 393 557 838 1003 1.22e-27 119
MsG0880043074.01.T01 AT5G49780 30.045 223 131 3 358 575 627 829 1.41e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT3G19700 37.870 169 99 3 393 556 798 965 1.45e-27 119
MsG0880043074.01.T01 AT1G24030 33.990 203 109 4 358 555 104 286 1.51e-27 113
MsG0880043074.01.T01 AT5G61560 36.792 212 97 7 358 560 526 709 1.60e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G61560 36.792 212 97 7 358 560 526 709 1.60e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G49780 30.045 223 131 3 358 575 726 928 1.67e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G61560 36.792 212 97 7 358 560 545 728 1.68e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G61560 36.792 212 97 7 358 560 545 728 1.68e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G49780 30.045 223 131 3 358 575 748 950 1.70e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G61560 36.792 212 97 7 358 560 524 707 1.71e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT1G49730 36.321 212 101 8 360 564 452 636 1.75e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT3G05140 36.810 163 99 2 392 554 298 456 1.81e-27 116
MsG0880043074.01.T01 AT5G37450 36.628 172 100 3 393 560 536 702 1.87e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT1G26970 32.338 201 107 5 360 556 74 249 1.88e-27 112
MsG0880043074.01.T01 AT3G20530 38.194 144 68 2 358 500 179 302 1.89e-27 113
MsG0880043074.01.T01 AT5G37450 36.628 172 100 3 393 560 715 881 1.96e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT4G31230 32.843 204 104 5 353 552 553 727 2.17e-27 117
MsG0880043074.01.T01 AT5G37450 36.628 172 100 3 393 560 739 905 2.20e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT4G22130 33.333 219 115 7 350 565 485 675 2.25e-27 117
MsG0880043074.01.T01 AT5G37450 36.628 172 100 3 393 560 763 929 2.25e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT3G45860 35.028 177 111 2 393 565 460 636 2.25e-27 117
MsG0880043074.01.T01 AT2G47060 38.728 173 85 2 357 528 171 323 2.28e-27 114
MsG0880043074.01.T01 AT5G49660 34.361 227 118 6 358 578 757 958 2.34e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT3G21630 30.952 210 113 5 358 559 410 595 2.37e-27 117
MsG0880043074.01.T01 AT3G02130 36.145 166 102 2 394 556 964 1128 2.39e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT3G02130 36.145 166 102 2 394 556 981 1145 2.54e-27 118
MsG0880043074.01.T01 AT5G66790 33.628 226 121 7 358 576 408 611 2.63e-27 117
MsG0880043074.01.T01 AT3G59750 28.959 221 135 3 332 551 372 571 3.03e-27 117

Find 117 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 420 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCATCATCTTGTTCAGTTTC+TGG 0.031142 8:-18585516 None:intergenic
CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG 0.111609 8:+18584255 MsG0880043074.01.T01:CDS
GCTTGGCGTTCTTACTATTT+TGG 0.135961 8:+18583815 MsG0880043074.01.T01:CDS
AATATCTCCTCCTTCAACTA+TGG 0.185059 8:-18590235 None:intergenic
TCTATCTTGAAAAGGGAAAT+TGG 0.186182 8:-18585429 None:intergenic
CCAAGAAGGCTTTGCATTCA+TGG 0.233230 8:+18584311 MsG0880043074.01.T01:CDS
CCATGAATGCAAAGCCTTCT+TGG 0.238890 8:-18584311 None:intergenic
ACAATGACTACTAGGATATT+TGG 0.243359 8:-18590549 None:intergenic
CATGCCAAGATAGCTGATTT+TGG 0.273027 8:+18589885 MsG0880043074.01.T01:CDS
TTTAGTACAGCACATTTAAC+TGG 0.304838 8:+18585393 MsG0880043074.01.T01:CDS
GACATGGTTCAGAGAAATAA+TGG 0.317102 8:+18590411 MsG0880043074.01.T01:CDS
CTTTAATGAAGTTGAAAATC+TGG 0.329941 8:+18585278 MsG0880043074.01.T01:CDS
CACCCGACCTGCTGGTACAC+TGG 0.335027 8:+18589950 MsG0880043074.01.T01:CDS
GCTCAAGGAATGTCTATCTT+TGG 0.343240 8:+18590389 MsG0880043074.01.T01:CDS
TCACAGTGAATGACGAGTTT+TGG 0.350534 8:+18585328 MsG0880043074.01.T01:CDS
AGTAAGAACGCCAAGCAATA+TGG 0.353492 8:-18583808 None:intergenic
CACCAGAACTAGAGATGAAT+TGG 0.357416 8:+18590437 MsG0880043074.01.T01:CDS
ACCAGACATGAGCAAAATAT+TGG 0.361400 8:+18590362 MsG0880043074.01.T01:CDS
AATACATTCACATACTTCAA+TGG 0.363574 8:+18590205 MsG0880043074.01.T01:CDS
AAAGGGTCACTGGCATTTGC+CGG 0.374856 8:-18585201 None:intergenic
TTTGGCCTAAGTAGAGCTTT+TGG 0.382458 8:+18589903 MsG0880043074.01.T01:CDS
AACCAATTCATCTCTAGTTC+TGG 0.384086 8:-18590439 None:intergenic
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG 0.385459 8:+18590090 MsG0880043074.01.T01:intron
TTGAATTCTCTATCTTGAAA+AGG 0.388989 8:-18585437 None:intergenic
CTAAATTCACCTTGCAACCT+TGG 0.396488 8:-18590273 None:intergenic
CATGAATGCAAAGCCTTCTT+GGG 0.398083 8:-18584310 None:intergenic
TGAAATGTAATTTATGTTTG+TGG 0.404145 8:-18584040 None:intergenic
GCGCTGCTCATCACAATTGC+TGG 0.404533 8:-18585171 None:intergenic
TTGAACGCTCTAGTTTCATT+TGG 0.407260 8:-18585303 None:intergenic
TTCTATTATGGAAACTATGA+TGG 0.413859 8:+18584219 MsG0880043074.01.T01:CDS
CCATCGAAAACTTACAATAT+CGG 0.416346 8:+18584508 MsG0880043074.01.T01:CDS
TAGGCCAAAATCAGCTATCT+TGG 0.419128 8:-18589889 None:intergenic
ATACAAGCTCAGTATCAATC+AGG 0.437426 8:+18583843 MsG0880043074.01.T01:CDS
GATGACAAATTCATAGATAC+AGG 0.439857 8:+18584063 MsG0880043074.01.T01:CDS
GTAATACAAATATCTTGAAA+TGG 0.440507 8:+18589463 MsG0880043074.01.T01:CDS
CAAATACAACAATGACTACT+AGG 0.445380 8:-18590557 None:intergenic
TAAATGCGGTAGCTACTTGC+CGG 0.449231 8:-18585374 None:intergenic
ACCCAGTGTACCAGCAGGTC+GGG 0.451465 8:-18589952 None:intergenic
CATTCCAATGGAATTCTAAA+GGG 0.452346 8:-18585218 None:intergenic
TGAATTCTCTATCTTGAAAA+GGG 0.455865 8:-18585436 None:intergenic
TATAAATTTCATAGGCATTG+AGG 0.458100 8:-18585473 None:intergenic
TTCAAATCCCTATGCACAAT+GGG 0.460046 8:-18589831 None:intergenic
TTCAAAATGTTGTTGATCCA+AGG 0.462386 8:+18590256 MsG0880043074.01.T01:CDS
ACTCTCTGTACGATCTTACA+TGG 0.465623 8:+18584476 MsG0880043074.01.T01:CDS
ATACATTCACATACTTCAAT+GGG 0.466493 8:+18590206 MsG0880043074.01.T01:CDS
GTGACCCTTTAGAATTCCAT+TGG 0.468324 8:+18585214 MsG0880043074.01.T01:CDS
GTAGCTACTTGCCGGTATAT+AGG 0.469738 8:-18585366 None:intergenic
GCATTCCAATGGAATTCTAA+AGG 0.470332 8:-18585219 None:intergenic
GCTGGTGGTTCAAAATCATT+CGG 0.476314 8:-18585153 None:intergenic
CAAAATATTGGTAGAGCTCA+AGG 0.479001 8:+18590374 MsG0880043074.01.T01:CDS
AATTCTATTACTGAAATGAA+TGG 0.480597 8:-18584399 None:intergenic
TCATTTCAGTAATAGAATTG+AGG 0.490078 8:+18584403 MsG0880043074.01.T01:CDS
TGGGTTATTCCCATAGTTGA+AGG 0.490933 8:+18590225 MsG0880043074.01.T01:CDS
TAAACCACCCATTGTGCATA+GGG 0.493461 8:+18589824 MsG0880043074.01.T01:CDS
AGGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG 0.504050 8:-18585461 None:intergenic
ACCCGACCTGCTGGTACACT+GGG 0.507425 8:+18589951 MsG0880043074.01.T01:CDS
CAAAATGAAGATCAAATTGT+GGG 0.509056 8:-18584254 None:intergenic
TCATCTAGTAATATGTTGGC+AGG 0.511503 8:-18589855 None:intergenic
CATATATCCACCCGACCTGC+TGG 0.511865 8:+18589942 MsG0880043074.01.T01:CDS
ATATCTCCTCCTTCAACTAT+GGG 0.513550 8:-18590234 None:intergenic
TTACATTATCTGCATTCCAA+TGG 0.516492 8:-18585230 None:intergenic
TGGTTATCTAGCTAAAATAG+TGG 0.527365 8:-18590484 None:intergenic
TTTAAAGAGTGTTGGTGCAA+CGG 0.530173 8:+18589561 MsG0880043074.01.T01:CDS
ATGGAATTCTAAAGGGTCAC+TGG 0.531390 8:-18585211 None:intergenic
GTCTTGTTAACACTGGCAAA+GGG 0.531546 8:+18584373 MsG0880043074.01.T01:CDS
ATTCTATTTGAGTTGATCAC+CGG 0.540559 8:+18590153 MsG0880043074.01.T01:CDS
ATTCTCATCTAGTAATATGT+TGG 0.542839 8:-18589859 None:intergenic
CGTTACCAAAAGCTCTACTT+AGG 0.544248 8:-18589908 None:intergenic
TGTCTTGTTAACACTGGCAA+AGG 0.544429 8:+18584372 MsG0880043074.01.T01:CDS
GTAAACCACCCATTGTGCAT+AGG 0.546391 8:+18589823 MsG0880043074.01.T01:CDS
AATTTCATAGGCATTGAGGA+TGG 0.549696 8:-18585469 None:intergenic
AACTAGATCATCACTGTGAA+GGG 0.550924 8:-18585130 None:intergenic
GGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG 0.555226 8:-18585460 None:intergenic
TGAAAATAGCTCAAATGTTG+AGG 0.555929 8:-18584012 None:intergenic
GACCTGTGACACCTATATAC+CGG 0.556224 8:+18585355 MsG0880043074.01.T01:CDS
TTGCCAGTGTTAACAAGACA+TGG 0.556705 8:-18584369 None:intergenic
TGCCGGTATATAGGTGTCAC+AGG 0.562567 8:-18585357 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!!! GTTATTTGTTGGTTACATTT+TGG + Chr8:18586922-18586941 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTAATTGGATTTTAGTTGT+TGG + Chr8:18585871-18585890 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
!!! TTACACTGCAGTAATTTTTT+TGG + Chr8:18589768-18589787 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGTTCTTTTAAAGAGTGT+TGG + Chr8:18589553-18589572 MsG0880043074.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTATTTTTTACTTTCGGG+TGG + Chr8:18586466-18586485 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTGGATTTTCAGGAT+TGG + Chr8:18589782-18589801 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTTTTTGTCGTGTGT+TGG + Chr8:18588241-18588260 MsG0880043074.01.T01:intron 25.0%
AAATGAAGATCAAATTGTGG+GGG - Chr8:18584255-18584274 None:intergenic 30.0%
AACCAGGTTATAAGAAAAAG+GGG - Chr8:18586647-18586666 None:intergenic 30.0%
AACTTACAATATCGGTAAGA+TGG + Chr8:18584516-18584535 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
AAGTCTTGAAAACAGAGTAA+AGG + Chr8:18589621-18589640 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
AATTAATCTCTCTGTATTGG+GGG + Chr8:18587912-18587931 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
AATTTAGCATCAATTCAGCA+TGG + Chr8:18590289-18590308 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
ACAATGACTACTAGGATATT+TGG - Chr8:18590552-18590571 None:intergenic 30.0%
ACGTAGAAGGATATATTCAA+AGG - Chr8:18585763-18585782 None:intergenic 30.0%
AGAATGGGATATAGATTTGA+GGG - Chr8:18588881-18588900 None:intergenic 30.0%
AGACTATAGTCACTATACTT+TGG - Chr8:18587852-18587871 None:intergenic 30.0%
AGTAGTGTATGTTTGATTGA+AGG + Chr8:18587677-18587696 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
ATAGTGACTATAGTCTCATT+TGG + Chr8:18587856-18587875 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
ATCTATGAATACATGGCTAA+TGG + Chr8:18589231-18589250 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
CAAAAGGTCAATGATTATCA+CGG + Chr8:18585674-18585693 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
CAAATACAACAATGACTACT+AGG - Chr8:18590560-18590579 None:intergenic 30.0%
CATGGTCAAAATCTAAGAAA+AGG + Chr8:18588965-18588984 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
CATTCCAATGGAATTCTAAA+GGG - Chr8:18585221-18585240 None:intergenic 30.0%
CCAAAATGAAGATCAAATTG+TGG - Chr8:18584258-18584277 None:intergenic 30.0%
CCATAAAAAAATGTTAAGGG+TGG + Chr8:18586311-18586330 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
CCATCGAAAACTTACAATAT+CGG + Chr8:18584508-18584527 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
CGTAGAAGGATATATTCAAA+GGG - Chr8:18585762-18585781 None:intergenic 30.0%
CTTAATAGATATCAGAGAAC+AGG + Chr8:18590090-18590109 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
CTTACAAAGATGTGATTCTT+TGG - Chr8:18587485-18587504 None:intergenic 30.0%
CTTCAAACTATTATTGGAGA+AGG + Chr8:18589048-18589067 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
GAACCAGGTTATAAGAAAAA+GGG - Chr8:18586648-18586667 None:intergenic 30.0%
GATGACAAATTCATAGATAC+AGG + Chr8:18584063-18584082 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
GATTGTTCATCATAGAAGTT+TGG + Chr8:18589164-18589183 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
GGAAATTAATCTCTCTGTAT+TGG + Chr8:18587909-18587928 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
GGAGCCATAAAAAAATGTTA+AGG + Chr8:18586307-18586326 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
GTAGTGTATGTTTGATTGAA+GGG + Chr8:18587678-18587697 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
GTTAGTGTAAATTAGCAAGA+TGG + Chr8:18584718-18584737 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
TAAATGTGCTGTACTAAATG+CGG - Chr8:18585391-18585410 None:intergenic 30.0%
TAGAATGGGATATAGATTTG+AGG - Chr8:18588882-18588901 None:intergenic 30.0%
TATTCAAAGGGAAACTATTG+AGG - Chr8:18585750-18585769 None:intergenic 30.0%
TCACCAGGTTATAAGAAAAA+GGG - Chr8:18586493-18586512 None:intergenic 30.0%
TCTATCTTGAAAAGGGAAAT+TGG - Chr8:18585432-18585451 None:intergenic 30.0%
TGAAAATAGCTCAAATGTTG+AGG - Chr8:18584015-18584034 None:intergenic 30.0%
TGGTTATCTAGCTAAAATAG+TGG - Chr8:18590487-18590506 None:intergenic 30.0%
TTAACTGTGGAAAATATTGC+AGG - Chr8:18589097-18589116 None:intergenic 30.0%
TTACATTATCTGCATTCCAA+TGG - Chr8:18585233-18585252 None:intergenic 30.0%
TTATATCTGAAAATGCAACC+AGG + Chr8:18587557-18587576 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
TTCAAAATGTTGTTGATCCA+AGG + Chr8:18590256-18590275 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGAACAAGAAAAACAAG+AGG - Chr8:18589324-18589343 None:intergenic 30.0%
TTGTTCACCAAAATTAGCAT+CGG + Chr8:18586741-18586760 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
TTGTTTGATAAATCCCTGAA+AGG - Chr8:18587971-18587990 None:intergenic 30.0%
TTTAGTACAGCACATTTAAC+TGG + Chr8:18585393-18585412 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
TTTCAAAGGTCTTACACTAA+TGG + Chr8:18586191-18586210 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
TTTGGATTAACAGACACAAA+AGG + Chr8:18588614-18588633 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
! AATTTTGTCTCTGACTTTGT+AGG - Chr8:18587117-18587136 None:intergenic 30.0%
! ATGTAATCCTTTTGATCTCT+TGG + Chr8:18588589-18588608 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTGTCTCTGACTTTGTA+GGG - Chr8:18587116-18587135 None:intergenic 30.0%
! CATTACCAAATAAGTGTTGT+TGG - Chr8:18589263-18589282 None:intergenic 30.0%
! CATTTTCTTTCCATATTGCT+TGG + Chr8:18583798-18583817 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
! CCACAATTTGATCTTCATTT+TGG + Chr8:18584255-18584274 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
! CCGTTTTACCTTTTATACTA+AGG - Chr8:18588213-18588232 None:intergenic 30.0%
! GAACATTTGAGATTTAGTGT+CGG - Chr8:18590676-18590695 None:intergenic 30.0%
! TTCAATTTTCTTTACCACAG+TGG + Chr8:18588939-18588958 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
! TTGACATTTGGAACTTACTT+AGG - Chr8:18589987-18590006 None:intergenic 30.0%
! TTGTATTCCGAAAGTTTTCT+AGG + Chr8:18590868-18590887 MsG0880043074.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!! AGCATTGATCTATGAATACA+TGG + Chr8:18589224-18589243 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
!! ATTCTATTTGAGTTGATCAC+CGG + Chr8:18590153-18590172 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
!! TATTTGTAGCTTTGAGTATG+AGG - Chr8:18588356-18588375 None:intergenic 30.0%
!! TTGAAGGGTATTGAAATTGA+TGG + Chr8:18587693-18587712 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
!! TTGTAAGTTTTCGATGGATT+TGG - Chr8:18584505-18584524 None:intergenic 30.0%
!!! AATAGAGACCTTTTAAAGCA+GGG - Chr8:18586674-18586693 None:intergenic 30.0%
!!! CCACCCTTAACATTTTTTTA+TGG - Chr8:18586314-18586333 None:intergenic 30.0%
!!! GGCATTAGTCTTTGAAATTT+TGG - Chr8:18589423-18589442 None:intergenic 30.0%
!!! GTCTCTTTTTTTATGTCTCT+TGG + Chr8:18589730-18589749 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
!!! TCATTTTGGAGCTAATCTTT+GGG + Chr8:18584269-18584288 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCATTTTGGAGCTAATCTT+TGG + Chr8:18584268-18584287 MsG0880043074.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTATTTTTTGCTTTCGGG+TGG + Chr8:18586614-18586633 MsG0880043074.01.T01:intron 30.0%
AAACAGGTTCACTATCATTG+AGG + Chr8:18588326-18588345 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
AAACTATTGAGGCTTAATGC+CGG - Chr8:18585739-18585758 None:intergenic 35.0%
AACACACTTAAAAGCAGGAA+TGG + Chr8:18586286-18586305 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
AACAGCAACTAGAATATGTG+AGG + Chr8:18584121-18584140 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
AACATAAACTACGACGTAGA+AGG - Chr8:18585776-18585795 None:intergenic 35.0%
AACTAGATCATCACTGTGAA+GGG - Chr8:18585133-18585152 None:intergenic 35.0%
AATATCTCCTCCTTCAACTA+TGG - Chr8:18590238-18590257 None:intergenic 35.0%
AATGAAAACATGCAAGGATG+TGG - Chr8:18588921-18588940 None:intergenic 35.0%
ACCAGACATGAGCAAAATAT+TGG + Chr8:18590362-18590381 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
ACGCTGAACATTCTTTCTTA+TGG + Chr8:18588811-18588830 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
ACTCTCCAACAACACTTATT+TGG + Chr8:18589255-18589274 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
AGCATGACCCTTAGTATAAA+AGG + Chr8:18588202-18588221 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
AGTATAGGGGAAATTGCTAA+CGG + Chr8:18588092-18588111 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
ATACAAGCTCAGTATCAATC+AGG + Chr8:18583843-18583862 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTCCTCCTTCAACTAT+GGG - Chr8:18590237-18590256 None:intergenic 35.0%
ATATTTGAGGATACCAGATG+CGG - Chr8:18585080-18585099 None:intergenic 35.0%
ATCCACACTGAAGAAGTTAA+AGG - Chr8:18588491-18588510 None:intergenic 35.0%
ATCTCTACCAAAGTTAACTG+TGG - Chr8:18589110-18589129 None:intergenic 35.0%
ATTAATCTCTCTGTATTGGG+GGG + Chr8:18587913-18587932 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
CAAAATATTGGTAGAGCTCA+AGG + Chr8:18590374-18590393 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTCAGCAGTAATGTAG+TGG - Chr8:18587020-18587039 None:intergenic 35.0%
CACCAGGTTATAAGAAAAAG+GGG - Chr8:18586492-18586511 None:intergenic 35.0%
CACTACATTACTGCTGAATT+TGG + Chr8:18587018-18587037 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
CATCAAGAATACTTATGAGG+TGG + Chr8:18587377-18587396 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
CTCAAAACACACTTAAAAGC+AGG + Chr8:18586281-18586300 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
CTTCATTAAAGTGCATGTAG+AGG - Chr8:18585269-18585288 None:intergenic 35.0%
GAAAATCTAGTGTTAAGAGC+TGG + Chr8:18590583-18590602 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
GAATGAGAGACTCAAAATTG+CGG + Chr8:18589485-18589504 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
GAATGGGATATAGATTTGAG+GGG - Chr8:18588880-18588899 None:intergenic 35.0%
GACATGGTTCAGAGAAATAA+TGG + Chr8:18590411-18590430 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
GATACTGTCATACAAAGTTC+AGG - Chr8:18588520-18588539 None:intergenic 35.0%
GATTGGAATATCTGCATGAT+GGG + Chr8:18589799-18589818 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
GCATTCCAATGGAATTCTAA+AGG - Chr8:18585222-18585241 None:intergenic 35.0%
GGAACCAGGTTATAAGAAAA+AGG - Chr8:18586649-18586668 None:intergenic 35.0%
GGATTCATTAGCATAGATTG+TGG + Chr8:18583985-18584004 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
GGGAACTAATTCTAGTAAAG+TGG - Chr8:18586833-18586852 None:intergenic 35.0%
GGTTGTATGTAATCTAGTGA+TGG - Chr8:18584351-18584370 None:intergenic 35.0%
GTCACCAGGTTATAAGAAAA+AGG - Chr8:18586494-18586513 None:intergenic 35.0%
TAACAATTTCTCACTCCACT+AGG - Chr8:18584153-18584172 None:intergenic 35.0%
TCATCTAGTAATATGTTGGC+AGG - Chr8:18589858-18589877 None:intergenic 35.0%
TCTTATAACCTGGTGACATT+GGG + Chr8:18586497-18586516 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
TGGTCCCTTAAGTTATTTGT+TGG + Chr8:18586911-18586930 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
TTAGACTACTAGAAATCCGA+AGG - Chr8:18585856-18585875 None:intergenic 35.0%
TTCAAATCCCTATGCACAAT+GGG - Chr8:18589834-18589853 None:intergenic 35.0%
TTCTTATAACCTGGTGACAT+TGG + Chr8:18586496-18586515 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
TTGAAGATGAACACACTCTA+AGG + Chr8:18586784-18586803 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
TTGCATCAGAAAATCAGGTA+AGG - Chr8:18588008-18588027 None:intergenic 35.0%
! AACCAATTCATCTCTAGTTC+TGG - Chr8:18590442-18590461 None:intergenic 35.0%
! ACCAATATTTTGCTCATGTC+TGG - Chr8:18590366-18590385 None:intergenic 35.0%
! ATCATCTCCGATGCTAATTT+TGG - Chr8:18586751-18586770 None:intergenic 35.0%
! CCGATATTGTAAGTTTTCGA+TGG - Chr8:18584511-18584530 None:intergenic 35.0%
! CTGATTTTCTGATGCAACTA+CGG + Chr8:18588011-18588030 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
! CTTTGTAGGGTGCTTTAAAT+AGG - Chr8:18587103-18587122 None:intergenic 35.0%
! TTGAACGCTCTAGTTTCATT+TGG - Chr8:18585306-18585325 None:intergenic 35.0%
!! AATTTCATAGGCATTGAGGA+TGG - Chr8:18585472-18585491 None:intergenic 35.0%
!! ATTTCATAGGCATTGAGGAT+GGG - Chr8:18585471-18585490 None:intergenic 35.0%
!! ATTTGATGATGTGCATGACA+TGG - Chr8:18590331-18590350 None:intergenic 35.0%
!! CGGATTTCTAGTAGTCTAAT+TGG + Chr8:18585857-18585876 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
!! TTTAAAGAGTGTTGGTGCAA+CGG + Chr8:18589561-18589580 MsG0880043074.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACCTGTTTTTGATCTCTCA+AGG - Chr8:18588315-18588334 None:intergenic 35.0%
!!! ACTTTTAAAGTGTGGAGAAG+TGG + Chr8:18586034-18586053 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
!!! CAATAGAGACCTTTTAAAGC+AGG - Chr8:18586675-18586694 None:intergenic 35.0%
!!! GATCACACACTTTTAAAGTG+TGG + Chr8:18586026-18586045 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTGGTTCAATAGCCTAG+TGG + Chr8:18586000-18586019 MsG0880043074.01.T01:intron 35.0%
AACTATTGAGGCTTAATGCC+GGG - Chr8:18585738-18585757 None:intergenic 40.0%
AATCTAGTGTTAAGAGCTGG+TGG + Chr8:18590586-18590605 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
ACCAGGAATTTGTCTTCAAG+TGG + Chr8:18587574-18587593 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
ACCAGGGACAAATATTTGCA+GGG - Chr8:18586084-18586103 None:intergenic 40.0%
ACTAATGCTTCTGCATATCC+AGG - Chr8:18589687-18589706 None:intergenic 40.0%
ACTCTCTGTACGATCTTACA+TGG + Chr8:18584476-18584495 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
AGAAAAAGAGACCCGTAATC+TGG + Chr8:18588689-18588708 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
AGTAAAGTGGTAACCCACTT+GGG - Chr8:18586820-18586839 None:intergenic 40.0%
AGTAAGAACGCCAAGCAATA+TGG - Chr8:18583811-18583830 None:intergenic 40.0%
AGTGCATGTAGAGGTAGTAT+CGG - Chr8:18585260-18585279 None:intergenic 40.0%
ATAAAGAAGACTGTTCAGCG+GGG - Chr8:18588755-18588774 None:intergenic 40.0%
ATACTAAGGGTCATGCTAAC+CGG - Chr8:18588199-18588218 None:intergenic 40.0%
ATATACTTCACAGGACCACA+TGG - Chr8:18587423-18587442 None:intergenic 40.0%
ATTTGGTCCCAACTCTCATA+AGG + Chr8:18587035-18587054 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
CACCAGAACTAGAGATGAAT+TGG + Chr8:18590437-18590456 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
CATAAAGAAGACTGTTCAGC+GGG - Chr8:18588756-18588775 None:intergenic 40.0%
CATATCCAGGGTTTGAGAAT+GGG - Chr8:18589674-18589693 None:intergenic 40.0%
CATGAATGCAAAGCCTTCTT+GGG - Chr8:18584313-18584332 None:intergenic 40.0%
CCAAAGTCCAAGAGATCAAA+AGG - Chr8:18588599-18588618 None:intergenic 40.0%
CCAGAAACTGAACAAGATGA+TGG + Chr8:18585516-18585535 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
CCATAAAGAAGACTGTTCAG+CGG - Chr8:18588757-18588776 None:intergenic 40.0%
CCATCATCTTGTTCAGTTTC+TGG - Chr8:18585519-18585538 None:intergenic 40.0%
CGTAGTTGCATCAGAAAATC+AGG - Chr8:18588013-18588032 None:intergenic 40.0%
CGTTACCAAAAGCTCTACTT+AGG - Chr8:18589911-18589930 None:intergenic 40.0%
CTAAATTCACCTTGCAACCT+TGG - Chr8:18590276-18590295 None:intergenic 40.0%
CTAATGCTTCTGCATATCCA+GGG - Chr8:18589686-18589705 None:intergenic 40.0%
CTCCTTGAGAGATCAAAAAC+AGG + Chr8:18588310-18588329 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
CTCGTTGGATATTGTGATGA+AGG + Chr8:18589192-18589211 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
CTCTCTGTACGATCTTACAT+GGG + Chr8:18584477-18584496 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
CTTATAACCTGGTGACATTG+GGG + Chr8:18586498-18586517 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
CTTATGAGGTGGCTAGAAAT+TGG + Chr8:18587388-18587407 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
CTTCAAATCCCTATGCACAA+TGG - Chr8:18589835-18589854 None:intergenic 40.0%
GAACTAGATCATCACTGTGA+AGG - Chr8:18585134-18585153 None:intergenic 40.0%
GCTCAAGGAATGTCTATCTT+TGG + Chr8:18590389-18590408 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
GCTGGTGGTTCAAAATCATT+CGG - Chr8:18585156-18585175 None:intergenic 40.0%
GGAATGTCTATCTTTGGACA+TGG + Chr8:18590395-18590414 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
GGATTGGAATATCTGCATGA+TGG + Chr8:18589798-18589817 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
GTATAGGGGAAATTGCTAAC+GGG + Chr8:18588093-18588112 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
GTCATGAACAAACACAACAC+AGG + Chr8:18585034-18585053 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
GTTATTCCCATAGTTGAAGG+AGG + Chr8:18590228-18590247 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
TAAACCACCCATTGTGCATA+GGG + Chr8:18589824-18589843 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
TACCAGGGACAAATATTTGC+AGG - Chr8:18586085-18586104 None:intergenic 40.0%
TAGATACAGGTGTAAGCAAG+AGG + Chr8:18584076-18584095 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
TAGGCCAAAATCAGCTATCT+TGG - Chr8:18589892-18589911 None:intergenic 40.0%
TAGTAAAGTGGTAACCCACT+TGG - Chr8:18586821-18586840 None:intergenic 40.0%
TCCACTTGAAGACAAATTCC+TGG - Chr8:18587578-18587597 None:intergenic 40.0%
TGCCATCAATACTGCAGTTT+AGG - Chr8:18587455-18587474 None:intergenic 40.0%
TGGGGAAGAACAAACTTACA+GGG + Chr8:18588272-18588291 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
TGGGTTATTCCCATAGTTGA+AGG + Chr8:18590225-18590244 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
TGGTCCTGTGAAGTATATGT+GGG + Chr8:18587425-18587444 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
TTGCCAGTGTTAACAAGACA+TGG - Chr8:18584372-18584391 None:intergenic 40.0%
! ATGGAATTCTAAAGGGTCAC+TGG - Chr8:18585214-18585233 None:intergenic 40.0%
! CAACCATGTCTTGTTAACAC+TGG + Chr8:18584366-18584385 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
! CACCTTTAACTTCTTCAGTG+TGG + Chr8:18588486-18588505 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
! CCTTTTGATCTCTTGGACTT+TGG + Chr8:18588596-18588615 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
! GCTTGGCGTTCTTACTATTT+TGG + Chr8:18583815-18583834 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
! GTCTTGTTAACACTGGCAAA+GGG + Chr8:18584373-18584392 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
! TCACAGTGAATGACGAGTTT+TGG + Chr8:18585328-18585347 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
! TGTCTTGTTAACACTGGCAA+AGG + Chr8:18584372-18584391 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGCCTAAGTAGAGCTTT+TGG + Chr8:18589903-18589922 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
!! AACATTTTGACATAGGACCC+CGG - Chr8:18588124-18588143 None:intergenic 40.0%
!! ATGATGTTTTTGACCGCATC+TGG + Chr8:18585064-18585083 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
!! CATGCCAAGATAGCTGATTT+TGG + Chr8:18589885-18589904 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGACCCTTTAGAATTCCAT+TGG + Chr8:18585214-18585233 MsG0880043074.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTCTTCAAGTGGATTGAC+TGG + Chr8:18587583-18587602 MsG0880043074.01.T01:intron 40.0%
AAATCCCTATGCACAATGGG+TGG - Chr8:18589831-18589850 None:intergenic 45.0%
AAGGGAAATTGGATAGCGTG+TGG - Chr8:18585421-18585440 None:intergenic 45.0%
AAGGTCACAATCAACCCAAG+TGG + Chr8:18586803-18586822 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
AAGTGTGTGATCTAGCCACT+AGG - Chr8:18586018-18586037 None:intergenic 45.0%
AATTGGAAGGGAGATCCATG+TGG + Chr8:18587405-18587424 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
ACCAACTGAGCTACACTTAC+AGG + Chr8:18586108-18586127 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
AGAAGTTTGGTCTCTCTCGT+TGG + Chr8:18589177-18589196 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
AGGTCAATGATTATCACGGC+TGG + Chr8:18585678-18585697 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
AGGTCACAATCAACCCAAGT+GGG + Chr8:18586804-18586823 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
CCAAGAAGGCTTTGCATTCA+TGG + Chr8:18584311-18584330 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
CCAGGGACAAATATTTGCAG+GGG - Chr8:18586083-18586102 None:intergenic 45.0%
CCATCTGAATGCAAGCAGAT+AGG - Chr8:18589444-18589463 None:intergenic 45.0%
CCATGAATGCAAAGCCTTCT+TGG - Chr8:18584314-18584333 None:intergenic 45.0%
CCGCTGAACAGTCTTCTTTA+TGG + Chr8:18588754-18588773 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
CCTATCTGCTTGCATTCAGA+TGG + Chr8:18589441-18589460 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
CCTGTGAAGTATATGTGGGA+AGG + Chr8:18587429-18587448 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
CCTTCCCACATATACTTCAC+AGG - Chr8:18587432-18587451 None:intergenic 45.0%
CTCGACCGAATTCCAGATTA+CGG - Chr8:18588704-18588723 None:intergenic 45.0%
GACCTGTGACACCTATATAC+CGG + Chr8:18585355-18585374 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTGGCTAGAAATTGGAA+GGG + Chr8:18587393-18587412 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
GCATATCCAGGGTTTGAGAA+TGG - Chr8:18589675-18589694 None:intergenic 45.0%
GTAAACCACCCATTGTGCAT+AGG + Chr8:18589823-18589842 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
GTAGCTACTTGCCGGTATAT+AGG - Chr8:18585369-18585388 None:intergenic 45.0%
GTGGGGAAGAACAAACTTAC+AGG + Chr8:18588271-18588290 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
GTGGTCCTGTGAAGTATATG+TGG + Chr8:18587424-18587443 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
GTTGTTGATCCAAGGTTGCA+AGG + Chr8:18590264-18590283 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
TAAATGCGGTAGCTACTTGC+CGG - Chr8:18585377-18585396 None:intergenic 45.0%
TACTAAGGGTCATGCTAACC+GGG - Chr8:18588198-18588217 None:intergenic 45.0%
TAGATCATCACTGTGAAGGG+AGG - Chr8:18585130-18585149 None:intergenic 45.0%
TATGTGAGGAGCTTTCCTAG+TGG + Chr8:18584135-18584154 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGTAAGTGTAGCTCAGT+TGG - Chr8:18586112-18586131 None:intergenic 45.0%
TCGACCGAATTCCAGATTAC+GGG - Chr8:18588703-18588722 None:intergenic 45.0%
TCTTTACCACAGTGGCTACA+TGG + Chr8:18588947-18588966 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
TGAGGTGGCTAGAAATTGGA+AGG + Chr8:18587392-18587411 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
TGGAGTGACACCGAATATGT+AGG - Chr8:18590532-18590551 None:intergenic 45.0%
! GAGACCCGTAATCTGGAATT+CGG + Chr8:18588696-18588715 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! GGCCCCTTTTTCTTATAACC+TGG + Chr8:18586487-18586506 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! GGCCTAAACTGCAGTATTGA+TGG + Chr8:18587450-18587469 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! GGTTCCATCCCTGCTTTAAA+AGG + Chr8:18586663-18586682 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! TAATCTGGAATTCGGTCGAG+AGG + Chr8:18588704-18588723 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! TCGTGTGTTGGCAGAAATGT+GGG + Chr8:18588253-18588272 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
! TCTTGCTAGTGCTTTTCGAC+CGG - Chr8:18590175-18590194 None:intergenic 45.0%
! TTTAAAGCAGGGATGGAACC+AGG - Chr8:18586663-18586682 None:intergenic 45.0%
! TTTTGACCATGTAGCCACTG+TGG - Chr8:18588956-18588975 None:intergenic 45.0%
!! ATTATCACGGCTGGCTTAAG+AGG + Chr8:18585687-18585706 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
!! CTTACAGGGTTAGTTCCAAG+TGG + Chr8:18588286-18588305 MsG0880043074.01.T01:intron 45.0%
!! GTGAATGACGAGTTTTGGCA+TGG + Chr8:18585333-18585352 MsG0880043074.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAGACCTTTTAAAGCAGGGA+TGG - Chr8:18586670-18586689 None:intergenic 45.0%
!!! AATTTTAATATTTATAAAAG+AGG + Chr8:18584572-18584591 MsG0880043074.01.T01:intron 5.0%
!!! TATTTTTTATTTTTTACTTT+CGG + Chr8:18586462-18586481 MsG0880043074.01.T01:intron 5.0%
AAAGGGTCACTGGCATTTGC+CGG - Chr8:18585204-18585223 None:intergenic 50.0%
ACAAATATTTGCAGGGGCCG+GGG - Chr8:18586077-18586096 None:intergenic 50.0%
ACATAACCCAGTGTACCAGC+AGG - Chr8:18589960-18589979 None:intergenic 50.0%
ATAACCTGGTGACATTGGGG+AGG + Chr8:18586501-18586520 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
CCCCTGCAAATATTTGTCCC+TGG + Chr8:18586080-18586099 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
CGTTACCCATTCTCAAACCC+TGG + Chr8:18589666-18589685 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
CTGCTCATCACAATTGCTGG+TGG - Chr8:18585171-18585190 None:intergenic 50.0%
GAATGCAAAGCCTTCTTGGG+AGG - Chr8:18584310-18584329 None:intergenic 50.0%
GACAAATATTTGCAGGGGCC+GGG - Chr8:18586078-18586097 None:intergenic 50.0%
GATCTCTCAAGGAGTCCACT+TGG - Chr8:18588304-18588323 None:intergenic 50.0%
GATGAGCAGCGCTATTACAC+CGG + Chr8:18585182-18585201 MsG0880043074.01.T01:CDS 50.0%
GGACAAATATTTGCAGGGGC+CGG - Chr8:18586079-18586098 None:intergenic 50.0%
GTGAAGTTGACCTCCCAAGA+AGG + Chr8:18584297-18584316 MsG0880043074.01.T01:CDS 50.0%
TTGCATGCTTAACCAGTGCC+CGG + Chr8:18588177-18588196 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
! AAATTGCTAACGGGTGCCTC+CGG + Chr8:18588102-18588121 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
! ATTGCGGTTGATGCAGCACA+TGG + Chr8:18589501-18589520 MsG0880043074.01.T01:CDS 50.0%
! CGTGTGTTGGCAGAAATGTG+GGG + Chr8:18588254-18588273 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
! GTCGTGTGTTGGCAGAAATG+TGG + Chr8:18588252-18588271 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
! TGCCGGTATATAGGTGTCAC+AGG - Chr8:18585360-18585379 None:intergenic 50.0%
!! AGCTCAGTTGGTAGCTACCA+GGG - Chr8:18586100-18586119 None:intergenic 50.0%
!! ATTTTGACATAGGACCCCGG+AGG - Chr8:18588121-18588140 None:intergenic 50.0%
!! TAGCTCAGTTGGTAGCTACC+AGG - Chr8:18586101-18586120 None:intergenic 50.0%
!! TCATAGGCATTGAGGATGGG+TGG - Chr8:18585468-18585487 None:intergenic 50.0%
!! TTTTGCTTTCGGGTGGCGAT+GGG + Chr8:18586621-18586640 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
!! TTTTTGCTTTCGGGTGGCGA+TGG + Chr8:18586620-18586639 MsG0880043074.01.T01:intron 50.0%
AACCCAGTGTACCAGCAGGT+CGG - Chr8:18589956-18589975 None:intergenic 55.0%
AAGAGGCTGCCACTAGAGCA+AGG + Chr8:18585704-18585723 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
AGAATCCGAGGTTCGAACCC+CGG + Chr8:18586057-18586076 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
AGAGGCTGCCACTAGAGCAA+GGG + Chr8:18585705-18585724 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
CATATATCCACCCGACCTGC+TGG + Chr8:18589942-18589961 MsG0880043074.01.T01:CDS 55.0%
CTGGAATTCGGTCGAGAGGT+AGG + Chr8:18588708-18588727 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
CTTTCCTCCCCAATGTCACC+AGG - Chr8:18586508-18586527 None:intergenic 55.0%
GCCACTAGAGCAAGGGCTTT+AGG + Chr8:18585712-18585731 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
GCCTAAAGCCCTTGCTCTAG+TGG - Chr8:18585716-18585735 None:intergenic 55.0%
GCGCTGCTCATCACAATTGC+TGG - Chr8:18585174-18585193 None:intergenic 55.0%
GTGGAGAAGTGGAGAATCCG+AGG + Chr8:18586045-18586064 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
! AATTGCTAACGGGTGCCTCC+GGG + Chr8:18588103-18588122 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
! GGCATTGAGGATGGGTGGAA+GGG - Chr8:18585463-18585482 None:intergenic 55.0%
!! AGGCATTGAGGATGGGTGGA+AGG - Chr8:18585464-18585483 None:intergenic 55.0%
!! TAGAGCAAGGGCTTTAGGCC+CGG + Chr8:18585717-18585736 MsG0880043074.01.T01:intron 55.0%
ACCCAGTGTACCAGCAGGTC+GGG - Chr8:18589955-18589974 None:intergenic 60.0%
ACCCGACCTGCTGGTACACT+GGG + Chr8:18589951-18589970 MsG0880043074.01.T01:CDS 60.0%
! ATTGCTAACGGGTGCCTCCG+GGG + Chr8:18588104-18588123 MsG0880043074.01.T01:intron 60.0%
CACCCGACCTGCTGGTACAC+TGG + Chr8:18589950-18589969 MsG0880043074.01.T01:CDS 65.0%
CAGTGTACCAGCAGGTCGGG+TGG - Chr8:18589952-18589971 None:intergenic 65.0%
GGGTCATGCTAACCGGGCAC+TGG - Chr8:18588192-18588211 None:intergenic 65.0%
AGGGGCCGGGGTTCGAACCT+CGG - Chr8:18586065-18586084 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

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