AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046094.01

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MsG0880046094.01.T01 AT1G79250 35.514 107 60 3 102 204 379 480 1.30e-12 68.2
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Find 83 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTGTGTAGATTGCAGATGTT+TGG 0.405367 8:+68949855 MsG0880046094.01.T01:intron
AAGGGTTCTGTTTGATCTCT+GGG 0.412250 8:-68950403 None:intergenic
ATTGTCTTGGAGTATGCTTC+TGG 0.434813 8:+68949025 MsG0880046094.01.T01:CDS
TTCTCATCTAGCCATTGTCT+TGG 0.448653 8:+68949012 MsG0880046094.01.T01:CDS
ATTGCAGATGTTTGGTCTTG+TGG 0.457819 8:+68949863 MsG0880046094.01.T01:CDS
ATCAGTAAATTCCAAACTAA+AGG 0.460433 8:+68950831 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR
GCAGAAATGCGTACATAGTC+GGG 0.462956 8:-68950087 None:intergenic
TTCTTCCAACAGCTAATATC+CGG 0.465322 8:+68949224 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCATGATTTCTTCCACACTT+TGG 0.465863 8:-68950505 None:intergenic
CATACAAGAGGCAAGGATAC+CGG 0.467352 8:+68950532 MsG0880046094.01.T01:CDS
TAAATTATACATACCTTGGC+AGG 0.474650 8:-68950150 None:intergenic
ATAATTGAAGCTGAAAGAAA+AGG 0.475849 8:+68950452 MsG0880046094.01.T01:CDS
CTAATAAACAATACAGATGA+AGG 0.482717 8:-68950668 None:intergenic
TCTAAAGTCGGCGATGGTAC+TGG 0.485026 8:+68950563 MsG0880046094.01.T01:CDS
TATTAAAATATCTGTTCTGC+AGG 0.492640 8:+68948976 MsG0880046094.01.T01:CDS
GAAATTGGAAAACACTCTGT+TGG 0.497718 8:+68949361 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCCTTTCGTGACAGAACCTC+GGG 0.505208 8:-68949641 None:intergenic
GGAGTTCCAACTGTTGACTT+TGG 0.506991 8:-68949605 None:intergenic
CAGAGATCAAACAGAACCCT+TGG 0.510180 8:+68950405 MsG0880046094.01.T01:CDS
TGCAGAAATGCGTACATAGT+CGG 0.521017 8:-68950088 None:intergenic
ACAAATTCTATTTCAAACCT+AGG 0.522631 8:-68950754 None:intergenic
TATACATACCTTGGCAGGAT+CGG 0.524879 8:-68950145 None:intergenic
ACCTCGGGAGCAATGTATGC+AGG 0.537056 8:-68949626 None:intergenic
ACACTCTATGTCATGTTAGT+TGG 0.538705 8:+68949890 MsG0880046094.01.T01:CDS
AAGACAATGGCTAGATGAGA+AGG 0.542672 8:-68949010 None:intergenic
AGCTGAAAGAAAAGGTTATG+TGG 0.543791 8:+68950460 MsG0880046094.01.T01:CDS
CTTTGTTGCCGATCCTGCCA+AGG 0.554698 8:+68950137 MsG0880046094.01.T01:CDS
GGTACTGGTCAAGCTGGTAC+CGG 0.555505 8:+68950578 MsG0880046094.01.T01:CDS
ATACAAGAGGCAAGGATACC+GGG 0.558772 8:+68950533 MsG0880046094.01.T01:CDS
TGTTAGCTACTGTCATTCAA+TGG 0.559708 8:+68949247 MsG0880046094.01.T01:CDS
GGCGATGGTACTGGTCAAGC+TGG 0.560744 8:+68950572 MsG0880046094.01.T01:CDS
TTGGAAAACACTCTGTTGGA+CGG 0.561740 8:+68949365 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCTGTATTGTTTATTAGACA+TGG 0.563285 8:+68950674 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR
TTGTGACTTTGGTTACTCCA+AGG 0.568602 8:+68949412 MsG0880046094.01.T01:CDS
CTCCTTTCGTGACAGAACCT+CGG 0.568828 8:-68949642 None:intergenic
GTTCTGTTTGATCTCTGGGA+TGG 0.570138 8:-68950399 None:intergenic
AGGTTATGTGGAAACAAAGA+AGG 0.571294 8:+68950472 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCTCAACCAAAGTCAACAGT+TGG 0.573857 8:+68949599 MsG0880046094.01.T01:CDS
AATGCGTACATAGTCGGGAA+TGG 0.574086 8:-68950082 None:intergenic
CCGACTTTAGATCCTTGTCC+CGG 0.576410 8:-68950551 None:intergenic
CTGTCACGAAAGGAGTATGA+TGG 0.577564 8:+68949650 MsG0880046094.01.T01:CDS
TTTGAGAGGATATGCTCCGC+TGG 0.580317 8:+68949058 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCCTGCATACATTGCTCCCG+AGG 0.588654 8:+68949625 MsG0880046094.01.T01:CDS
GTCTTGGAGTATGCTTCTGG+TGG 0.588868 8:+68949028 MsG0880046094.01.T01:CDS
AGACAATGGCTAGATGAGAA+GGG 0.591203 8:-68949009 None:intergenic
ACGAAAGGAGTATGATGGAA+AGG 0.592849 8:+68949655 MsG0880046094.01.T01:CDS
TGGTCGATTTAGTGAAGATG+AGG 0.610578 8:+68949078 MsG0880046094.01.T01:CDS
TCCCGAGGTTCTGTCACGAA+AGG 0.611743 8:+68949640 MsG0880046094.01.T01:CDS
AATCATGAGGATCATACAAG+AGG 0.615898 8:+68950520 MsG0880046094.01.T01:CDS
TAACACCGGATATTAGCTGT+TGG 0.619127 8:-68949229 None:intergenic
TGAGGATCATACAAGAGGCA+AGG 0.620545 8:+68950525 MsG0880046094.01.T01:CDS
AATATGAAAATGTCTGATTG+AGG 0.620671 8:+68950645 MsG0880046094.01.T01:exon
CAAGGATCTAAAGTCGGCGA+TGG 0.622302 8:+68950557 MsG0880046094.01.T01:CDS
GACAATGGCTAGATGAGAAG+GGG 0.626872 8:-68949008 None:intergenic
GTTATGCACACACTATACCT+AGG 0.628588 8:+68950737 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR
CTGGTGGTGAACTCTTTGAG+AGG 0.633551 8:+68949044 MsG0880046094.01.T01:CDS
GGACCAACTAAGCCAAAGTG+TGG 0.635861 8:+68950493 MsG0880046094.01.T01:CDS
TGGTACCGGTTCAATGAACA+TGG 0.636032 8:+68950592 MsG0880046094.01.T01:CDS
TACGCATTTCTGCAGAGTGT+AGG 0.650923 8:+68950097 MsG0880046094.01.T01:CDS
GAGGCAAGGATACCGGGACA+AGG 0.652151 8:+68950539 MsG0880046094.01.T01:CDS
AAATTTCAGAAAGACTATTG+GGG 0.653338 8:+68949946 MsG0880046094.01.T01:CDS
AATGAACATGGAAGATGACG+AGG 0.658921 8:+68950604 MsG0880046094.01.T01:CDS
CCGGGACAAGGATCTAAAGT+CGG 0.663026 8:+68950551 MsG0880046094.01.T01:CDS
TGGACGGAAATCCATCCCCT+CGG 0.666386 8:+68949381 MsG0880046094.01.T01:CDS
ATCTTCACTAAATCGACCAG+CGG 0.676335 8:-68949074 None:intergenic
AAAGTGTGGAAGAAATCATG+AGG 0.678349 8:+68950507 MsG0880046094.01.T01:CDS
AGAAGCATACTCCAAGACAA+TGG 0.679365 8:-68949023 None:intergenic
TGAATGACAGTAGCTAACAC+CGG 0.702962 8:-68949243 None:intergenic
GACGAGGAAATTGATGTCAG+TGG 0.725402 8:+68950620 MsG0880046094.01.T01:CDS
ATAACATGAATGTTGCAGTG+TGG 0.833772 8:-68950719 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATGAAATAATATTAACCT+TGG - Chr8:68949432-68949451 None:intergenic 15.0%
!! ATTCGTAATTCTAATATTAT+AGG - Chr8:68950222-68950241 None:intergenic 15.0%
!! AATATGATATATCTCCATAA+AGG - Chr8:68949462-68949481 None:intergenic 20.0%
!! CTGTTAATAGAAATAAAATG+TGG - Chr8:68949733-68949752 None:intergenic 20.0%
!! GATATCTTATATTATATCCA+AGG + Chr8:68949484-68949503 MsG0880046094.01.T01:intron 20.0%
!! GTATCAGAAATTATTCATAA+TGG - Chr8:68950004-68950023 None:intergenic 20.0%
!! GTGAATAACATTTGATAAAA+AGG + Chr8:68950789-68950808 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!! TTCATTTATATGAACCTTTA+TGG + Chr8:68949445-68949464 MsG0880046094.01.T01:intron 20.0%
!! TTGATAAATTATACATACCT+TGG - Chr8:68950157-68950176 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTTTAATAGATCAACCA+AGG + Chr8:68950247-68950266 MsG0880046094.01.T01:intron 20.0%
! AAATATCTTGCCTGAAATAT+AGG - Chr8:68949206-68949225 None:intergenic 25.0%
! AAATTTCAGAAAGACTATTG+GGG + Chr8:68949946-68949965 MsG0880046094.01.T01:CDS 25.0%
! AATATGAAAATGTCTGATTG+AGG + Chr8:68950645-68950664 MsG0880046094.01.T01:exon 25.0%
! ACAAATTCTATTTCAAACCT+AGG - Chr8:68950757-68950776 None:intergenic 25.0%
! AGAAATTTCAGAAAGACTAT+TGG + Chr8:68949944-68949963 MsG0880046094.01.T01:CDS 25.0%
! AGTAAACTGTTTATTCGATT+CGG - Chr8:68949794-68949813 None:intergenic 25.0%
! ATAATTGAAGCTGAAAGAAA+AGG + Chr8:68950452-68950471 MsG0880046094.01.T01:CDS 25.0%
! ATCAGTAAATTCCAAACTAA+AGG + Chr8:68950831-68950850 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! ATGTGTTAATTGTTAAACCA+TGG - Chr8:68949756-68949775 None:intergenic 25.0%
! ATTCCAAACTAAAGGAAAAA+TGG + Chr8:68950839-68950858 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! CTAATAAACAATACAGATGA+AGG - Chr8:68950671-68950690 None:intergenic 25.0%
! GAAATTTCAGAAAGACTATT+GGG + Chr8:68949945-68949964 MsG0880046094.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTCAAATACTATTAACCT+TGG - Chr8:68949504-68949523 None:intergenic 25.0%
! TATGAATAATTTCTGATACC+AGG + Chr8:68950005-68950024 MsG0880046094.01.T01:intron 25.0%
! TATTAAAATATCTGTTCTGC+AGG + Chr8:68948976-68948995 MsG0880046094.01.T01:CDS 25.0%
! TCTGTATTGTTTATTAGACA+TGG + Chr8:68950674-68950693 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! TGAATAGGAATTTAAACACA+CGG - Chr8:68949155-68949174 None:intergenic 25.0%
! TTTGATAAAAAGGCTTGAAT+TGG + Chr8:68950799-68950818 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! AAACCATTTTTCCTTTAGTT+TGG - Chr8:68950845-68950864 None:intergenic 25.0%
!!! ATAGTCTTTCTGAAATTTCT+AGG - Chr8:68949944-68949963 None:intergenic 25.0%
!!! TTTATTTCTATTAACAGCCA+TGG + Chr8:68949736-68949755 MsG0880046094.01.T01:intron 25.0%
AAAATGAGAGACAAAATCTC+AGG - Chr8:68949683-68949702 None:intergenic 30.0%
AATTCTATCAGTGATGTTAG+AGG - Chr8:68950283-68950302 None:intergenic 30.0%
ACAAGAGCCAAAAATACTTA+CGG - Chr8:68949839-68949858 None:intergenic 30.0%
ATTTCTGATCCTTGTTAAAG+AGG + Chr8:68950372-68950391 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
GAATCAGAGTTAAAATTTCC+TGG - Chr8:68950026-68950045 None:intergenic 30.0%
GCATATTCTTCAAAAACCAA+GGG - Chr8:68950424-68950443 None:intergenic 30.0%
GTAAACTGTTTATTCGATTC+GGG - Chr8:68949793-68949812 None:intergenic 30.0%
TAAATTATACATACCTTGGC+AGG - Chr8:68950153-68950172 None:intergenic 30.0%
TCAGCTTCAATTATCTCTTT+AGG - Chr8:68950446-68950465 None:intergenic 30.0%
TCGTAAGTTTCAATGTGAAT+AGG - Chr8:68949170-68949189 None:intergenic 30.0%
TCTGTTTGGTAGAGAATAAT+AGG + Chr8:68950048-68950067 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
TTAGAGGAATTTCATTACCT+TGG - Chr8:68950267-68950286 None:intergenic 30.0%
TTTCTGATCCTTGTTAAAGA+GGG + Chr8:68950373-68950392 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
! GGACAATTTTCCTATATTTC+AGG + Chr8:68949193-68949212 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
! TTGTCATAGAGATCTGAAAT+TGG + Chr8:68949346-68949365 MsG0880046094.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTCTCTCATTTTCTTGA+GGG + Chr8:68949688-68949707 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGTCTCTCATTTTCTTG+AGG + Chr8:68949687-68949706 MsG0880046094.01.T01:intron 30.0%
!! AAACACACGGATTTTTCAAA+AGG - Chr8:68949142-68949161 None:intergenic 30.0%
AAAGTGTGGAAGAAATCATG+AGG + Chr8:68950507-68950526 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
AATCATGAGGATCATACAAG+AGG + Chr8:68950520-68950539 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
ACACTCTATGTCATGTTAGT+TGG + Chr8:68949890-68949909 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
AGCTGAAAGAAAAGGTTATG+TGG + Chr8:68950460-68950479 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTATGTGGAAACAAAGA+AGG + Chr8:68950472-68950491 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
ATAACATGAATGTTGCAGTG+TGG - Chr8:68950722-68950741 None:intergenic 35.0%
ATCTTCCATGTTCATTGAAC+CGG - Chr8:68950600-68950619 None:intergenic 35.0%
CAAGAGCCAAAAATACTTAC+GGG - Chr8:68949838-68949857 None:intergenic 35.0%
CGGCTTAAAATTTGTGACTT+TGG + Chr8:68949401-68949420 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
GAAATTGGAAAACACTCTGT+TGG + Chr8:68949361-68949380 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
GGCATATTCTTCAAAAACCA+AGG - Chr8:68950425-68950444 None:intergenic 35.0%
GTGGCTTGACATTATTCTTT+AGG - Chr8:68949714-68949733 None:intergenic 35.0%
TAACTCTGATTCTCTCTGTT+TGG + Chr8:68950034-68950053 MsG0880046094.01.T01:intron 35.0%
TCACATTGAAACTTACGAAG+TGG + Chr8:68949172-68949191 MsG0880046094.01.T01:intron 35.0%
TCATGATTTCTTCCACACTT+TGG - Chr8:68950508-68950527 None:intergenic 35.0%
TGTTAGCTACTGTCATTCAA+TGG + Chr8:68949247-68949266 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTCCAACAGCTAATATC+CGG + Chr8:68949224-68949243 MsG0880046094.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGTAGATTGCAGATGTT+TGG + Chr8:68949855-68949874 MsG0880046094.01.T01:intron 35.0%
! AAGTCACAAATTTTAAGCCG+AGG - Chr8:68949401-68949420 None:intergenic 35.0%
! AGTCACAAATTTTAAGCCGA+GGG - Chr8:68949400-68949419 None:intergenic 35.0%
! TTTCGACCCGTAAGTATTTT+TGG + Chr8:68949829-68949848 MsG0880046094.01.T01:intron 35.0%
!! CTGAAATTTCTAGGATCTTC+TGG - Chr8:68949935-68949954 None:intergenic 35.0%
AAGACAATGGCTAGATGAGA+AGG - Chr8:68949013-68949032 None:intergenic 40.0%
AAGGGTTCTGTTTGATCTCT+GGG - Chr8:68950406-68950425 None:intergenic 40.0%
AATGAACATGGAAGATGACG+AGG + Chr8:68950604-68950623 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
AGACAATGGCTAGATGAGAA+GGG - Chr8:68949012-68949031 None:intergenic 40.0%
ATCTTCACTAAATCGACCAG+CGG - Chr8:68949077-68949096 None:intergenic 40.0%
ATTGTCTTGGAGTATGCTTC+TGG + Chr8:68949025-68949044 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
GTTATGCACACACTATACCT+AGG + Chr8:68950737-68950756 MsG0880046094.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TAACACCGGATATTAGCTGT+TGG - Chr8:68949232-68949251 None:intergenic 40.0%
TATACATACCTTGGCAGGAT+CGG - Chr8:68950148-68950167 None:intergenic 40.0%
TATATTACGCTTCGTGTTGC+AGG + Chr8:68949319-68949338 MsG0880046094.01.T01:intron 40.0%
TCTCAACCAAAGTCAACAGT+TGG + Chr8:68949599-68949618 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
TGAATGACAGTAGCTAACAC+CGG - Chr8:68949246-68949265 None:intergenic 40.0%
TGCAGAAATGCGTACATAGT+CGG - Chr8:68950091-68950110 None:intergenic 40.0%
TTCTCATCTAGCCATTGTCT+TGG + Chr8:68949012-68949031 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAAACACTCTGTTGGA+CGG + Chr8:68949365-68949384 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGACTTTGGTTACTCCA+AGG + Chr8:68949412-68949431 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
! ACGAAAGGAGTATGATGGAA+AGG + Chr8:68949655-68949674 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAGCATACTCCAAGACAA+TGG - Chr8:68949026-68949045 None:intergenic 40.0%
! GTCACAAATTTTAAGCCGAG+GGG - Chr8:68949399-68949418 None:intergenic 40.0%
! TGGTCGATTTAGTGAAGATG+AGG + Chr8:68949078-68949097 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGCAGATGTTTGGTCTTG+TGG + Chr8:68949863-68949882 MsG0880046094.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATCTTCTGGTTCTTCAAA+TGG - Chr8:68949923-68949942 None:intergenic 40.0%
AATGCGTACATAGTCGGGAA+TGG - Chr8:68950085-68950104 None:intergenic 45.0%
ATACAAGAGGCAAGGATACC+GGG + Chr8:68950533-68950552 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
CAAGGGTTCTGTTTGATCTC+TGG - Chr8:68950407-68950426 None:intergenic 45.0%
CAGAGATCAAACAGAACCCT+TGG + Chr8:68950405-68950424 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
CATACAAGAGGCAAGGATAC+CGG + Chr8:68950532-68950551 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
GACAATGGCTAGATGAGAAG+GGG - Chr8:68949011-68949030 None:intergenic 45.0%
GACGAGGAAATTGATGTCAG+TGG + Chr8:68950620-68950639 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
GATGGTGACCCTCTTTAACA+AGG - Chr8:68950384-68950403 None:intergenic 45.0%
GCAGAAATGCGTACATAGTC+GGG - Chr8:68950090-68950109 None:intergenic 45.0%
TACGCATTTCTGCAGAGTGT+AGG + Chr8:68950097-68950116 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
TGAGGATCATACAAGAGGCA+AGG + Chr8:68950525-68950544 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
! CAAATTTTAAGCCGAGGGGA+TGG - Chr8:68949395-68949414 None:intergenic 45.0%
! CTGTCACGAAAGGAGTATGA+TGG + Chr8:68949650-68949669 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
! CTTCCACACTTTGGCTTAGT+TGG - Chr8:68950499-68950518 None:intergenic 45.0%
! GTTCTGTTTGATCTCTGGGA+TGG - Chr8:68950402-68950421 None:intergenic 45.0%
!! GGAGTTCCAACTGTTGACTT+TGG - Chr8:68949608-68949627 None:intergenic 45.0%
!! TGGTACCGGTTCAATGAACA+TGG + Chr8:68950592-68950611 MsG0880046094.01.T01:CDS 45.0%
CCGACTTTAGATCCTTGTCC+CGG - Chr8:68950554-68950573 None:intergenic 50.0%
CTCCTTTCGTGACAGAACCT+CGG - Chr8:68949645-68949664 None:intergenic 50.0%
GGACCAACTAAGCCAAAGTG+TGG + Chr8:68950493-68950512 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
GTCTTGGAGTATGCTTCTGG+TGG + Chr8:68949028-68949047 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
TCCTTTCGTGACAGAACCTC+GGG - Chr8:68949644-68949663 None:intergenic 50.0%
TTTGAGAGGATATGCTCCGC+TGG + Chr8:68949058-68949077 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
! CAAGGATCTAAAGTCGGCGA+TGG + Chr8:68950557-68950576 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
! CCGGGACAAGGATCTAAAGT+CGG + Chr8:68950551-68950570 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
! CTGGTGGTGAACTCTTTGAG+AGG + Chr8:68949044-68949063 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
! TCTAAAGTCGGCGATGGTAC+TGG + Chr8:68950563-68950582 MsG0880046094.01.T01:CDS 50.0%
ACCTCGGGAGCAATGTATGC+AGG - Chr8:68949629-68949648 None:intergenic 55.0%
CTTTGTTGCCGATCCTGCCA+AGG + Chr8:68950137-68950156 MsG0880046094.01.T01:CDS 55.0%
TCCCGAGGTTCTGTCACGAA+AGG + Chr8:68949640-68949659 MsG0880046094.01.T01:CDS 55.0%
TCCTGCATACATTGCTCCCG+AGG + Chr8:68949625-68949644 MsG0880046094.01.T01:CDS 55.0%
TGGACGGAAATCCATCCCCT+CGG + Chr8:68949381-68949400 MsG0880046094.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTACTGGTCAAGCTGGTAC+CGG + Chr8:68950578-68950597 MsG0880046094.01.T01:CDS 55.0%
GAGGCAAGGATACCGGGACA+AGG + Chr8:68950539-68950558 MsG0880046094.01.T01:CDS 60.0%
!! GGCGATGGTACTGGTCAAGC+TGG + Chr8:68950572-68950591 MsG0880046094.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 68948971 68950867 68948971 ID=MsG0880046094.01;Name=MsG0880046094.01
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Chr8 exon 68948971 68949099 68948971 ID=MsG0880046094.01.T01:exon:32649;Parent=MsG0880046094.01.T01
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Chr8 exon 68949341 68949433 68949341 ID=MsG0880046094.01.T01:exon:32651;Parent=MsG0880046094.01.T01
Chr8 exon 68949584 68949676 68949584 ID=MsG0880046094.01.T01:exon:32652;Parent=MsG0880046094.01.T01
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Chr8 three_prime_UTR 68950662 68950867 68950662 ID=MsG0880046094.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0880046094.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880046094.01.T01

ATGAATATTAAAATATCTGTTCTGCAGGTCTTGCTGACCCCTTCTCATCTAGCCATTGTCTTGGAGTATGCTTCTGGTGGTGAACTCTTTGAGAGGATATGCTCCGCTGGTCGATTTAGTGAAGATGAGGCAAGATATTTCTTCCAACAGCTAATATCCGGTGTTAGCTACTGTCATTCAATGGAAATTTGTCATAGAGATCTGAAATTGGAAAACACTCTGTTGGACGGAAATCCATCCCCTCGGCTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCCAAGTCTGCAATACTGCACTCTCAACCAAAGTCAACAGTTGGAACTCCTGCATACATTGCTCCCGAGGTTCTGTCACGAAAGGAGTATGATGGAAAGATTGCAGATGTTTGGTCTTGTGGTGTGACACTCTATGTCATGTTAGTTGGTGCATATCCATTTGAAGAACCAGAAGATCCTAGAAATTTCAGAAAGACTATTGGGAGAATAATAGGTGTTCAGTACTCCATTCCCGACTATGTACGCATTTCTGCAGAGTGTAGGAATCTTCTATCTCGCATCTTTGTTGCCGATCCTGCCAAGAGGGTCACCATCCCAGAGATCAAACAGAACCCTTGGTTTTTGAAGAATATGCCTAAAGAGATAATTGAAGCTGAAAGAAAAGGTTATGTGGAAACAAAGAAGGACCAACTAAGCCAAAGTGTGGAAGAAATCATGAGGATCATACAAGAGGCAAGGATACCGGGACAAGGATCTAAAGTCGGCGATGGTACTGGTCAAGCTGGTACCGGTTCAATGAACATGGAAGATGACGAGGAAATTGATGTCAGTGGTGAATATGAAAATGTCTGA
Protein sequence

>MsG0880046094.01.T01

MNIKISVLQVLLTPSHLAIVLEYASGGELFERICSAGRFSEDEARYFFQQLISGVSYCHSMEICHRDLKLENTLLDGNPSPRLKICDFGYSKSAILHSQPKSTVGTPAYIAPEVLSRKEYDGKIADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEEPEDPRNFRKTIGRIIGVQYSIPDYVRISAECRNLLSRIFVADPAKRVTIPEIKQNPWFLKNMPKEIIEAERKGYVETKKDQLSQSVEEIMRIIQEARIPGQGSKVGDGTGQAGTGSMNMEDDEEIDVSGEYENV*