AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046274.01

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MsG0880046274.01.T01 AT1G10210 26.836 354 200 12 52 393 13 319 5.07e-21 94.0
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MsG0880046274.01.T01 AT2G17290 24.251 334 174 10 63 390 80 340 5.05e-13 70.9
MsG0880046274.01.T01 AT2G17290 24.251 334 174 10 63 390 80 340 5.05e-13 70.9
MsG0880046274.01.T01 AT3G50000 25.283 265 142 12 136 395 178 391 7.78e-13 70.1
MsG0880046274.01.T01 AT3G06030 25.974 231 134 7 67 287 67 270 8.32e-13 70.5
MsG0880046274.01.T01 AT3G53930 23.494 332 174 8 68 393 20 277 8.44e-13 70.5
MsG0880046274.01.T01 AT3G53930 23.494 332 174 8 68 393 20 277 8.66e-13 70.5
MsG0880046274.01.T01 AT1G45160 26.122 245 132 8 68 286 670 891 8.98e-13 70.5
MsG0880046274.01.T01 AT5G19450 27.542 236 131 9 60 286 49 253 9.62e-13 70.1
MsG0880046274.01.T01 AT5G19450 27.542 236 131 9 60 286 49 253 9.62e-13 70.1
MsG0880046274.01.T01 AT1G45160 26.122 245 132 8 68 286 670 891 9.89e-13 70.5
MsG0880046274.01.T01 AT2G23080 24.528 265 144 12 136 395 108 321 1.01e-12 68.9
MsG0880046274.01.T01 AT5G64960 25.681 257 149 7 138 393 57 272 1.19e-12 69.7
MsG0880046274.01.T01 AT1G49580 26.939 245 137 9 58 290 140 354 1.21e-12 70.1
MsG0880046274.01.T01 AT1G74740 25.547 274 157 10 50 306 33 276 1.36e-12 69.7
MsG0880046274.01.T01 AT5G27790 30.723 166 93 4 150 308 106 256 2.17e-12 68.2
MsG0880046274.01.T01 AT4G08500 25.649 308 168 11 13 310 294 550 2.45e-12 68.9
MsG0880046274.01.T01 AT5G25110 28.807 243 130 9 64 296 39 248 3.11e-12 68.6
MsG0880046274.01.T01 AT1G69220 23.982 221 137 4 69 286 223 415 5.38e-12 68.2
MsG0880046274.01.T01 AT1G71530 22.523 333 197 9 73 395 152 433 6.60e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT5G28290 22.530 253 158 7 68 312 4 226 6.99e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT5G28290 22.530 253 158 7 68 312 4 226 7.25e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT5G28290 22.530 253 158 7 68 312 4 226 7.25e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT3G63280 22.000 250 161 8 67 310 3 224 8.22e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT3G63280 22.000 250 161 8 67 310 3 224 8.22e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT3G63280 22.000 250 161 8 67 310 3 224 8.22e-12 67.4
MsG0880046274.01.T01 AT1G54610 24.159 327 195 10 73 393 123 402 8.78e-12 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT1G54610 24.159 327 195 10 73 393 123 402 8.78e-12 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT1G54610 24.159 327 195 10 73 393 123 402 8.78e-12 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT5G01810 25.735 272 157 9 61 317 5 246 9.08e-12 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT3G20860 21.695 295 191 8 68 357 4 263 9.29e-12 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT3G63280 22.000 250 161 8 67 310 57 278 9.65e-12 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT5G01810 25.735 272 157 9 61 317 5 246 1.06e-11 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT5G01810 25.735 272 157 9 61 317 5 246 1.06e-11 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT1G12680 25.000 328 167 12 68 394 107 356 1.10e-11 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT3G63340 26.070 257 144 8 170 393 127 370 1.13e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT2G26980 25.461 271 152 8 65 311 11 255 1.16e-11 65.1
MsG0880046274.01.T01 AT2G25090 26.638 229 143 8 64 286 11 220 1.26e-11 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT2G41920 27.778 252 144 10 75 308 13 244 1.26e-11 65.9
MsG0880046274.01.T01 AT3G63340 26.459 257 143 9 170 393 793 1036 1.41e-11 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT3G63340 26.459 257 143 9 170 393 792 1035 1.44e-11 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT3G63340 26.459 257 143 9 170 393 792 1035 1.44e-11 67.0
MsG0880046274.01.T01 AT3G20410 22.346 358 219 10 62 386 85 416 1.53e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT3G20410 22.346 358 219 10 62 386 85 416 1.53e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT3G63340 26.459 257 143 9 170 393 826 1069 1.65e-11 66.6
MsG0880046274.01.T01 AT2G34650 25.466 322 170 14 22 295 37 336 1.85e-11 65.9
MsG0880046274.01.T01 AT3G01085 21.687 332 208 9 68 393 115 400 1.87e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT3G01085 21.687 332 208 9 68 393 115 400 1.87e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT3G01085 21.687 332 208 9 68 393 115 400 1.97e-11 66.2
MsG0880046274.01.T01 AT4G04695 25.092 271 163 8 68 327 28 269 2.61e-11 65.5
MsG0880046274.01.T01 AT1G33770 25.926 243 143 7 73 307 146 359 3.08e-11 65.5
MsG0880046274.01.T01 AT5G39440 25.503 298 176 8 63 353 14 272 4.07e-11 65.1
MsG0880046274.01.T01 AT2G26980 26.022 269 149 8 67 311 13 255 4.21e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT2G20470 23.651 241 155 7 68 286 124 357 4.24e-11 65.1
MsG0880046274.01.T01 AT2G41860 24.681 235 139 8 60 286 46 250 4.67e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT2G20470 23.651 241 155 7 68 286 124 357 4.69e-11 65.1
MsG0880046274.01.T01 AT2G20470 23.651 241 155 7 68 286 124 357 4.69e-11 65.1
MsG0880046274.01.T01 AT2G26980 26.022 269 149 8 67 311 13 255 4.77e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT2G26980 26.022 269 149 8 67 311 23 265 5.11e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT4G38230 23.242 327 176 10 68 390 24 279 5.18e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT4G38230 23.242 327 176 10 68 390 24 279 5.18e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT3G01090 27.459 244 140 8 62 299 36 248 5.23e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT3G10540 23.431 239 158 8 59 291 35 254 5.29e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT4G38230 23.242 327 176 10 68 390 54 309 5.59e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT3G01090 27.059 255 149 8 51 299 2 225 5.67e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT3G01090 27.059 255 149 8 51 299 2 225 5.67e-11 64.7
MsG0880046274.01.T01 AT2G26980 25.830 271 151 8 65 311 11 255 5.73e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT1G18890 24.752 303 177 13 64 353 59 323 6.22e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT2G41860 24.681 235 139 8 60 286 46 250 7.68e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT1G54510 22.000 250 161 9 67 310 3 224 8.07e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT1G54510 22.000 250 161 9 67 310 3 224 8.07e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT1G54510 22.000 250 161 9 67 310 3 224 8.07e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT1G54510 22.000 250 161 9 67 310 3 224 8.07e-11 64.3
MsG0880046274.01.T01 AT3G29160 27.376 263 145 11 62 313 14 241 9.24e-11 63.2

Find 141 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 281 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATTATCAGAACTAAGATTT+TGG 0.138732 8:-71386035 None:intergenic
AAAACTACCTTTGGGGTTTC+AGG 0.145290 8:-71385999 None:intergenic
GCTATCAAGGTTATTGATTT+TGG 0.163270 8:+71388472 MsG0880046274.01.T01:CDS
CATGGCCTCTCCTCTTTAAT+TGG 0.189820 8:-71389459 None:intergenic
AGCTGATGTTCGAATCTATT+TGG 0.213862 8:+71389683 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR
CTCTGGTGTTTCCTTGTTGA+TGG 0.227006 8:+71386588 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR
CGTGATCTAACTTTAGTTAA+TGG 0.227906 8:-71389355 None:intergenic
TTGCATCACAATACTGTTTC+GGG 0.253780 8:-71389421 None:intergenic
AGGGCGGAAAACAGCTAAAA+AGG 0.276811 8:-71389532 None:intergenic
AAAATGGGAGAAGGAACTTT+TGG 0.291357 8:+71387393 MsG0880046274.01.T01:CDS
AGATAAGATACACAGCAAAA+TGG 0.304017 8:+71387377 MsG0880046274.01.T01:intron
ATTTCAAGCTATGCTCCTTC+AGG 0.312094 8:+71386856 MsG0880046274.01.T01:CDS
CCCAACCTCGCTCGCTTCCT+TGG 0.317671 8:-71385966 None:intergenic
GTATGTCAGAAGAGGTAAAT+TGG 0.325008 8:+71389023 MsG0880046274.01.T01:CDS
ATTGCATCACAATACTGTTT+CGG 0.355114 8:-71389422 None:intergenic
CTTGCAGTTGTGTGCAAATA+CGG 0.358647 8:+71387648 MsG0880046274.01.T01:intron
CACTAGTTCTCTATCTGTTA+AGG 0.362226 8:+71386897 MsG0880046274.01.T01:CDS
TTTCAGGCTTTAGGTCAGTA+TGG 0.373744 8:-71388120 None:intergenic
GGAGTCATCCATGTGATATA+TGG 0.382656 8:+71388691 MsG0880046274.01.T01:CDS
ATGGCCTCTCCTCTTTAATT+GGG 0.390954 8:-71389458 None:intergenic
CAACATCTCAATTTCTATCA+TGG 0.397192 8:-71387502 None:intergenic
ACTTTCTTGAAATACGAGTT+TGG 0.399089 8:-71388436 None:intergenic
ATTGATCTTGTCCGTGAGAT+TGG 0.402071 8:+71387863 MsG0880046274.01.T01:CDS
TTGGGCAGGTATTGGAATGC+TGG 0.414675 8:+71387412 MsG0880046274.01.T01:CDS
AAACTACCTTTGGGGTTTCA+GGG 0.414780 8:-71385998 None:intergenic
TTAATATTAGATTCGATCTC+TGG 0.415244 8:+71386571 MsG0880046274.01.T01:intron
GTTAAGGGTGTTGCTCGAAA+TGG 0.421905 8:+71386913 MsG0880046274.01.T01:CDS
TAACAGGTCTTTGAGAAACT+TGG 0.425003 8:+71387791 MsG0880046274.01.T01:intron
TCCCTCGAGGTTGCACCCAC+TGG 0.430466 8:-71389051 None:intergenic
TCTCTTAACAGATTTCATCT+AGG 0.432223 8:+71388410 MsG0880046274.01.T01:intron
TCTTTAATTGGGAAGGGCCG+TGG 0.432385 8:-71389447 None:intergenic
GGAATGTCTGAGGGCTTCCT+TGG 0.434007 8:-71389300 None:intergenic
GATAAGATACACAGCAAAAT+GGG 0.438226 8:+71387378 MsG0880046274.01.T01:intron
CAGCTTGGTAAACATGATAT+AGG 0.439164 8:+71387528 MsG0880046274.01.T01:CDS
TTTAGAGCACCTTGCCATGA+TGG 0.439718 8:+71388852 MsG0880046274.01.T01:CDS
GCCATGATGGAGAGGGTACT+TGG 0.443817 8:+71388865 MsG0880046274.01.T01:CDS
CTTGGCTGTGATTCTTTCAG+AGG 0.445082 8:-71389282 None:intergenic
TCAGGAACTTTGACATAGTC+TGG 0.446838 8:-71388160 None:intergenic
TTGGCTGTGATTCTTTCAGA+GGG 0.450954 8:-71389281 None:intergenic
TATGTATTGTAGGTCTTGGC+TGG 0.452458 8:+71388670 MsG0880046274.01.T01:intron
TTTCAAGCTATGCTCCTTCA+GGG 0.453060 8:+71386857 MsG0880046274.01.T01:CDS
CCAAGGAAGCGAGCGAGGTT+GGG 0.453475 8:+71385966 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR
ACTAGTTCTCTATCTGTTAA+GGG 0.454556 8:+71386898 MsG0880046274.01.T01:CDS
CCTCTCCTCTTTAATTGGGA+AGG 0.464488 8:-71389454 None:intergenic
CGAAGAAAATCGTATAAGCT+TGG 0.464676 8:-71387815 None:intergenic
CTCCAACAGCAAAAGTGTAA+TGG 0.467758 8:-71386969 None:intergenic
ATGGAGTGTGGGTTGTATAT+TGG 0.469593 8:+71388710 MsG0880046274.01.T01:CDS
CCAACAATGTCGGTTAAGTA+CGG 0.470798 8:+71389797 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR
GAAGCGAGCGAGGTTGGGTT+GGG 0.471855 8:+71385971 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR
CTCTCCTCTTTAATTGGGAA+GGG 0.473366 8:-71389453 None:intergenic
ACCAAGGAAGCGAGCGAGGT+TGG 0.473712 8:+71385965 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR
GGAAGCGAGCGAGGTTGGGT+TGG 0.474492 8:+71385970 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR
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AATCTCACGGACAAGATCAA+TGG 0.477143 8:-71387861 None:intergenic
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CRISPR-GE

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TCTCTTAACAGATTTCATCT+AGG + Chr8:71388410-71388429 MsG0880046274.01.T01:intron 30.0%
TGGCACTGTAAAAAATTTCT+TGG + Chr8:71389480-71389499 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TTGGAGACAAAAATTATGGA+AGG - Chr8:71389770-71389789 None:intergenic 30.0%
! ACTAGTTCTCTATCTGTTAA+GGG + Chr8:71386898-71386917 MsG0880046274.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGCTTATACGATTTTCTT+CGG + Chr8:71387816-71387835 MsG0880046274.01.T01:CDS 30.0%
! TATTCCACGGACAATTTTAA+TGG - Chr8:71387463-71387482 None:intergenic 30.0%
! TATTTCTATGGTTGTAGATC+TGG + Chr8:71386072-71386091 MsG0880046274.01.T01:intron 30.0%
! TGATGTGAATCTTTTGTACT+TGG + Chr8:71386640-71386659 MsG0880046274.01.T01:intron 30.0%
!! AGAACTAAGATTTTGGGAAT+TGG - Chr8:71386031-71386050 None:intergenic 30.0%
!! TAAAGCCATAATGGGTTTAT+TGG - Chr8:71388368-71388387 None:intergenic 30.0%
!!! AGAAATTTTTTACAGTGCCA+TGG - Chr8:71389480-71389499 None:intergenic 30.0%
!!! GCTATCAAGGTTATTGATTT+TGG + Chr8:71388472-71388491 MsG0880046274.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCAGACATTCCTTTTTTATG+AGG + Chr8:71389312-71389331 MsG0880046274.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTATTGGTAGGGTTTTTAGT+GGG + Chr8:71386741-71386760 MsG0880046274.01.T01:intron 30.0%
AACAGCTAAAAAGGGATCTT+TGG - Chr8:71389526-71389545 None:intergenic 35.0%
AACATGATATAGGTGGCAAT+CGG + Chr8:71387538-71387557 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
AATCAACTTCTTAGCTGAGA+TGG - Chr8:71388645-71388664 None:intergenic 35.0%
ACAGCTAAAAAGGGATCTTT+GGG - Chr8:71389525-71389544 None:intergenic 35.0%
ACGATACAAATAAGGACACA+CGG - Chr8:71388004-71388023 None:intergenic 35.0%
ACTAAACAAACCTGTAGTCT+AGG - Chr8:71389102-71389121 None:intergenic 35.0%
ACTCTCTTCAACATATGCAT+TGG - Chr8:71388898-71388917 None:intergenic 35.0%
AGCTGATGTTCGAATCTATT+TGG + Chr8:71389683-71389702 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ATCTCATACATCTGTTGCAA+GGG + Chr8:71389243-71389262 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
ATGGCAAAGTGTAATTACAG+CGG - Chr8:71387008-71387027 None:intergenic 35.0%
CAGCTTGGTAAACATGATAT+AGG + Chr8:71387528-71387547 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
CCCCCACATTATTTGTATAT+TGG - Chr8:71387743-71387762 None:intergenic 35.0%
CGAAGAAAATCGTATAAGCT+TGG - Chr8:71387818-71387837 None:intergenic 35.0%
CTAAACAAACCTGTAGTCTA+GGG - Chr8:71389101-71389120 None:intergenic 35.0%
CTTAACAGATAGAGAACTAG+TGG - Chr8:71386899-71386918 None:intergenic 35.0%
CTTGGTAAACATGATATAGG+TGG + Chr8:71387531-71387550 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
GAAACAGTATTGTGATGCAA+TGG + Chr8:71389424-71389443 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GACTCTGAGTTCTTAATGTA+GGG + Chr8:71388802-71388821 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
GAGAGAAAAAACTACCTTTG+GGG - Chr8:71386009-71386028 None:intergenic 35.0%
GATGTTCGAATCTATTTGGA+AGG + Chr8:71389687-71389706 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GGAGAGAAAAAACTACCTTT+GGG - Chr8:71386010-71386029 None:intergenic 35.0%
GTATGTCAGAAGAGGTAAAT+TGG + Chr8:71389023-71389042 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
TATATTGGTCGAGTTATGCA+CGG + Chr8:71388725-71388744 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
TCATGCAAACTCAGTGAAAA+AGG - Chr8:71388602-71388621 None:intergenic 35.0%
TGACTCTGAGTTCTTAATGT+AGG + Chr8:71388801-71388820 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
TGGAGAGAAAAAACTACCTT+TGG - Chr8:71386011-71386030 None:intergenic 35.0%
TGGGAGACAAAAATTATGGA+AGG - Chr8:71389723-71389742 None:intergenic 35.0%
TGGTTATGTATTGTAGGTCT+TGG + Chr8:71388666-71388685 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
TTGCATCACAATACTGTTTC+GGG - Chr8:71389424-71389443 None:intergenic 35.0%
! AAAATGGGAGAAGGAACTTT+TGG + Chr8:71387393-71387412 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
! AAATGGGAGAAGGAACTTTT+GGG + Chr8:71387394-71387413 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
! CACTAGTTCTCTATCTGTTA+AGG + Chr8:71386897-71386916 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGAAACAATCTGAGATGA+TGG + Chr8:71386713-71386732 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
! TAACAGGTCTTTGAGAAACT+TGG + Chr8:71387791-71387810 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
! TGGGTTGGAGACAAAAATTA+TGG - Chr8:71389774-71389793 None:intergenic 35.0%
! TTCAACATATGCATTGGTAG+TGG - Chr8:71388892-71388911 None:intergenic 35.0%
!! CTCAGCTAAGAAGTTGATTT+TGG + Chr8:71388646-71388665 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
!! GAAACAAGGAGTATGTTTTC+AGG - Chr8:71388139-71388158 None:intergenic 35.0%
!! GTTATTGGTAGGGTTTTTAG+TGG + Chr8:71386740-71386759 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
!! TTGATGGATCTGTTAGGTTT+TGG + Chr8:71386183-71386202 MsG0880046274.01.T01:intron 35.0%
!!! GCTCAGGTAGAATTGTTTTT+TGG + Chr8:71386817-71386836 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTTTTTTGGACAAGAGCTT+GGG + Chr8:71386830-71386849 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGTTTTTTGGACAAGAGCT+TGG + Chr8:71386829-71386848 MsG0880046274.01.T01:CDS 35.0%
AATCTCACGGACAAGATCAA+TGG - Chr8:71387864-71387883 None:intergenic 40.0%
ATAAAACCATGCAAACACCG+TGG - Chr8:71386352-71386371 None:intergenic 40.0%
ATACAAATAAGGACACACGG+AGG - Chr8:71388001-71388020 None:intergenic 40.0%
ATACACAGCAAAATGGGAGA+AGG + Chr8:71387384-71387403 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
ATCTCACGGACAAGATCAAT+GGG - Chr8:71387863-71387882 None:intergenic 40.0%
ATGGCCTCTCCTCTTTAATT+GGG - Chr8:71389461-71389480 None:intergenic 40.0%
ATTGAGATGTTGCAACAGCT+TGG + Chr8:71387513-71387532 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
ATTGATCTTGTCCGTGAGAT+TGG + Chr8:71387863-71387882 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCAAGCTATGCTCCTTC+AGG + Chr8:71386856-71386875 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
CACATACCAAGGATAACTTC+AGG - Chr8:71388559-71388578 None:intergenic 40.0%
CCATGTGATATATGGAGTGT+GGG + Chr8:71388699-71388718 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCCTCTTTAATTGGGAA+GGG - Chr8:71389456-71389475 None:intergenic 40.0%
CTGGCTATTGCTGTATAACA+CGG + Chr8:71386228-71386247 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
CTTGCAGTTGTGTGCAAATA+CGG + Chr8:71387648-71387667 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
GATCTCATACATCTGTTGCA+AGG + Chr8:71389242-71389261 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
GGAGTCATCCATGTGATATA+TGG + Chr8:71388691-71388710 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGTAAGTGAACGACAA+TGG + Chr8:71388916-71388935 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
GTTGCCATTAAAATTGTCCG+TGG + Chr8:71387456-71387475 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
TAACCGACATTGTTGGAAGT+GGG - Chr8:71389793-71389812 None:intergenic 40.0%
TAGATCTGGTGGAATTGTTG+AGG + Chr8:71386086-71386105 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
TATGTATTGTAGGTCTTGGC+TGG + Chr8:71388670-71388689 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
TCAGAAGAGGTAAATTGGAC+TGG + Chr8:71389028-71389047 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
TCAGGAACTTTGACATAGTC+TGG - Chr8:71388163-71388182 None:intergenic 40.0%
TCCATGTGATATATGGAGTG+TGG + Chr8:71388698-71388717 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
TGACATACTTCTCAGCATGT+CGG - Chr8:71389011-71389030 None:intergenic 40.0%
TGACATAGTCTGGTGAAACA+AGG - Chr8:71388153-71388172 None:intergenic 40.0%
TGATGGAGAGGTTATTGGTA+GGG + Chr8:71386730-71386749 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
TGGCAAAGTGTAATTACAGC+GGG - Chr8:71387007-71387026 None:intergenic 40.0%
TGGGTGGGAGACAAAAATTA+TGG - Chr8:71389727-71389746 None:intergenic 40.0%
TGTCAAAGTTCCTGACTACA+AGG + Chr8:71388168-71388187 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
TTAACCGACATTGTTGGAAG+TGG - Chr8:71389794-71389813 None:intergenic 40.0%
TTCTATGGTTGTAGATCTGG+TGG + Chr8:71386075-71386094 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
TTGGCTGTGATTCTTTCAGA+GGG - Chr8:71389284-71389303 None:intergenic 40.0%
TTTCAAGCTATGCTCCTTCA+GGG + Chr8:71386857-71386876 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
! AACCTTGATAGCACTAGACT+TGG - Chr8:71388464-71388483 None:intergenic 40.0%
! ACCTTGATAGCACTAGACTT+GGG - Chr8:71388463-71388482 None:intergenic 40.0%
! AGGTTCGGTATGTTTGATTG+AGG + Chr8:71386106-71386125 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
! ATGATGGAGAGGTTATTGGT+AGG + Chr8:71386729-71386748 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
! ATGGAGTGTGGGTTGTATAT+TGG + Chr8:71388710-71388729 MsG0880046274.01.T01:CDS 40.0%
! ATGTGCTGATGTAGCAGAAT+TGG + Chr8:71388574-71388593 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
! CAACAATGTCGGTTAAGTAC+GGG + Chr8:71389798-71389817 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! CCAACAATGTCGGTTAAGTA+CGG + Chr8:71389797-71389816 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! CTCCAACAGCAAAAGTGTAA+TGG - Chr8:71386972-71386991 None:intergenic 40.0%
!! AAAACTACCTTTGGGGTTTC+AGG - Chr8:71386002-71386021 None:intergenic 40.0%
!! AAACTACCTTTGGGGTTTCA+GGG - Chr8:71386001-71386020 None:intergenic 40.0%
!! AACAATCTGAGATGATGGAG+AGG + Chr8:71386718-71386737 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
!! CAGAAAAGTACCTTGTAGTC+AGG - Chr8:71388181-71388200 None:intergenic 40.0%
!! GGAGTATGTTTTCAGGCTTT+AGG - Chr8:71388132-71388151 None:intergenic 40.0%
!! GTATCGTGTTTGTTGTGATG+TGG + Chr8:71388017-71388036 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
!! TGAGATGATGGAGAGGTTAT+TGG + Chr8:71386725-71386744 MsG0880046274.01.T01:intron 40.0%
!! TTTCAGGCTTTAGGTCAGTA+TGG - Chr8:71388123-71388142 None:intergenic 40.0%
AACTTCTTAGCTGAGATGGC+TGG - Chr8:71388641-71388660 None:intergenic 45.0%
AATGAAGCTCCCTAGACTAC+AGG + Chr8:71389089-71389108 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
ACAGTTGTCTGCCAATCTCA+CGG - Chr8:71387877-71387896 None:intergenic 45.0%
AGGGCGGAAAACAGCTAAAA+AGG - Chr8:71389535-71389554 None:intergenic 45.0%
ATGAATCGATGGCTGTGTGT+AGG + Chr8:71386795-71386814 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
CAACCCACTTCCAACAATGT+CGG + Chr8:71389787-71389806 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
CAATTAAAGAGGAGAGGCCA+TGG + Chr8:71389460-71389479 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CAGCATGTTGATCATTCAGC+TGG + Chr8:71389218-71389237 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
CATGGCCTCTCCTCTTTAAT+TGG - Chr8:71389462-71389481 None:intergenic 45.0%
CCCACACTCCATATATCACA+TGG - Chr8:71388702-71388721 None:intergenic 45.0%
CCGTACTTAACCGACATTGT+TGG - Chr8:71389800-71389819 None:intergenic 45.0%
CCTCTCCTCTTTAATTGGGA+AGG - Chr8:71389457-71389476 None:intergenic 45.0%
CCTTCCCAATTAAAGAGGAG+AGG + Chr8:71389454-71389473 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CGTATTTGCACACAACTGCA+AGG - Chr8:71387650-71387669 None:intergenic 45.0%
CTCTGGTGTTTCCTTGTTGA+TGG + Chr8:71386588-71386607 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
CTGATCTACTCGCTCATAAG+TGG - Chr8:71388503-71388522 None:intergenic 45.0%
CTGGTGGAATTGTTGAGGTT+CGG + Chr8:71386091-71386110 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
CTTGGCTGTGATTCTTTCAG+AGG - Chr8:71389285-71389304 None:intergenic 45.0%
CTTTGTCATCATCTCGCCAA+GGG - Chr8:71386945-71386964 None:intergenic 45.0%
GGACAGAGAAAGGAAGGAAA+TGG + Chr8:71387434-71387453 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
GGGCGGAAAACAGCTAAAAA+GGG - Chr8:71389534-71389553 None:intergenic 45.0%
GTATTGTGATGCAATGGCCA+CGG + Chr8:71389430-71389449 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GTTAAGGTCTGCTTCACAGA+TGG - Chr8:71388271-71388290 None:intergenic 45.0%
GTTAGTGGTGCATGAATCGA+TGG + Chr8:71386784-71386803 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
GTTGTGTGCAAATACGGAAC+TGG + Chr8:71387654-71387673 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
TATAGGTGGCAATCGGTAAG+TGG + Chr8:71387545-71387564 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
TCTTTGTCATCATCTCGCCA+AGG - Chr8:71386946-71386965 None:intergenic 45.0%
TGAGATTGGCAGACAACTGT+TGG + Chr8:71387877-71387896 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
TGCTACATCAGCACATACCA+AGG - Chr8:71388570-71388589 None:intergenic 45.0%
TGGCGAGATGATGACAAAGA+TGG + Chr8:71386946-71386965 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
TGGCTGTGATTCTTTCAGAG+GGG - Chr8:71389283-71389302 None:intergenic 45.0%
TGTTATCCACGGTGTTTGCA+TGG + Chr8:71386343-71386362 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
TTCAAGCTATGCTCCTTCAG+GGG + Chr8:71386858-71386877 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTCATCATCTCGCCAAG+GGG - Chr8:71386944-71386963 None:intergenic 45.0%
! AGAGCACCTGAAGTTATCCT+TGG + Chr8:71388550-71388569 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
! AGCTTTAATACTCTCCCTCG+AGG - Chr8:71389067-71389086 None:intergenic 45.0%
! AGGAACTTTTGGGCAGGTAT+TGG + Chr8:71387404-71387423 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
! CTCTGAAAGAATCACAGCCA+AGG + Chr8:71389283-71389302 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
! GCTGAGAAGTATGTCAGAAG+AGG + Chr8:71389015-71389034 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
! TTTAGAGCACCTTGCCATGA+TGG + Chr8:71388852-71388871 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
! TTTTTGTCTCCCACCCACTT+TGG + Chr8:71389730-71389749 MsG0880046274.01.T01:intron 45.0%
!! GGCCATTACACTTTTGCTGT+TGG + Chr8:71386967-71386986 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTAAGGGTGTTGCTCGAAA+TGG + Chr8:71386913-71386932 MsG0880046274.01.T01:CDS 45.0%
!! AATATTAAAAATTAATATCA+AGG - Chr8:71386499-71386518 None:intergenic 5.0%
!! TATTACATAAAATTATATAA+AGG - Chr8:71386444-71386463 None:intergenic 5.0%
AACGAACGGTCCTTCCAAAG+TGG - Chr8:71389747-71389766 None:intergenic 50.0%
AATCGACAGCCGAAGTGATG+AGG - Chr8:71389555-71389574 None:intergenic 50.0%
ACCAAGTACCCTCTCCATCA+TGG - Chr8:71388869-71388888 None:intergenic 50.0%
ACGAACGGTCCTTCCAAAGT+GGG - Chr8:71389746-71389765 None:intergenic 50.0%
ACGGCCCTTCCCAATTAAAG+AGG + Chr8:71389449-71389468 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
AGAACTAGTGGTGTGTTCCG+AGG - Chr8:71386887-71386906 None:intergenic 50.0%
ATCGACAGCCGAAGTGATGA+GGG - Chr8:71389554-71389573 None:intergenic 50.0%
ATGCTGGGACAGAGAAAGGA+AGG + Chr8:71387428-71387447 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
CACGTTAGATCCACACTGCA+GGG + Chr8:71389374-71389393 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
CGAATTTCCCCACACTCACA+TGG + Chr8:71385935-71385954 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
CGACATTGTTGGAAGTGGGT+TGG - Chr8:71389789-71389808 None:intergenic 50.0%
GAACTAGTGGTGTGTTCCGA+GGG - Chr8:71386886-71386905 None:intergenic 50.0%
GCCCAAGTCTAGTGCTATCA+AGG + Chr8:71388459-71388478 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
TCACGTTAGATCCACACTGC+AGG + Chr8:71389373-71389392 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TCGACGATCCATGTGAGTGT+GGG - Chr8:71385946-71385965 None:intergenic 50.0%
TCTTTAATTGGGAAGGGCCG+TGG - Chr8:71389450-71389469 None:intergenic 50.0%
TGGAATGCTGGGACAGAGAA+AGG + Chr8:71387424-71387443 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
TTGTCATCATCTCGCCAAGG+GGG - Chr8:71386943-71386962 None:intergenic 50.0%
! GTTTTCCGCCCTCATCACTT+CGG + Chr8:71389543-71389562 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! AGGTAAATTGGACTGGCCAG+TGG + Chr8:71389035-71389054 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTAAATTGGACTGGCCAGT+GGG + Chr8:71389036-71389055 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGGCAGGTATTGGAATGCT+GGG + Chr8:71387413-71387432 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGGGCAGGTATTGGAATGC+TGG + Chr8:71387412-71387431 MsG0880046274.01.T01:CDS 50.0%
AACGGTCCTTCCAAAGTGGG+TGG - Chr8:71389743-71389762 None:intergenic 55.0%
ACGGTCCTTCCAAAGTGGGT+GGG - Chr8:71389742-71389761 None:intergenic 55.0%
CGACGATCCATGTGAGTGTG+GGG - Chr8:71385945-71385964 None:intergenic 55.0%
CTCACATGGATCGTCGACCA+AGG + Chr8:71385949-71385968 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
CTCGAAATGGTTCTCCCCCT+TGG + Chr8:71386926-71386945 MsG0880046274.01.T01:CDS 55.0%
GAAGACGCGTTCCATCTCCA+TGG - Chr8:71385916-71385935 None:intergenic 55.0%
GGAATGTCTGAGGGCTTCCT+TGG - Chr8:71389303-71389322 None:intergenic 55.0%
GGATGTCCCTGAAACCCCAA+AGG + Chr8:71385992-71386011 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
GTACCCTCTCCATCATGGCA+AGG - Chr8:71388864-71388883 None:intergenic 55.0%
GTCGACGATCCATGTGAGTG+TGG - Chr8:71385947-71385966 None:intergenic 55.0%
TGTCTCCCACCCACTTTGGA+AGG + Chr8:71389734-71389753 MsG0880046274.01.T01:intron 55.0%
! AGCACCTTGCCATGATGGAG+AGG + Chr8:71388857-71388876 MsG0880046274.01.T01:CDS 55.0%
! GCACCTTGCCATGATGGAGA+GGG + Chr8:71388858-71388877 MsG0880046274.01.T01:CDS 55.0%
! GGGAGAAGGAACTTTTGGGC+AGG + Chr8:71387398-71387417 MsG0880046274.01.T01:CDS 55.0%
!! GCCATGATGGAGAGGGTACT+TGG + Chr8:71388865-71388884 MsG0880046274.01.T01:CDS 55.0%
ACACTGCAGGGTCGTCGTCA+AGG + Chr8:71389386-71389405 MsG0880046274.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
ACCAAGGAAGCGAGCGAGGT+TGG + Chr8:71385965-71385984 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
CCAAGGAAGCGAGCGAGGTT+GGG + Chr8:71385966-71385985 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
CGATGGCTGTGTGTAGGCTC+AGG + Chr8:71386801-71386820 MsG0880046274.01.T01:intron 60.0%
GAAGCGAGCGAGGTTGGGTT+GGG + Chr8:71385971-71385990 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
GACAGCCGAAGTGATGAGGG+CGG - Chr8:71389551-71389570 None:intergenic 60.0%
TGCTCCTTCAGGGGTTCCCT+CGG + Chr8:71386867-71386886 MsG0880046274.01.T01:CDS 60.0%
TGTTCCGAGGGAACCCCTGA+AGG - Chr8:71386874-71386893 None:intergenic 60.0%
TTGACGACGACCCTGCAGTG+TGG - Chr8:71389387-71389406 None:intergenic 60.0%
CCCAACCTCGCTCGCTTCCT+TGG - Chr8:71385969-71385988 None:intergenic 65.0%
GCCAGTGGGTGCAACCTCGA+GGG + Chr8:71389050-71389069 MsG0880046274.01.T01:CDS 65.0%
GGAAGCGAGCGAGGTTGGGT+TGG + Chr8:71385970-71385989 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 65.0%
GTCGACCAAGGAAGCGAGCG+AGG + Chr8:71385961-71385980 MsG0880046274.01.T01:five_prime_UTR 65.0%
TCCCTCGAGGTTGCACCCAC+TGG - Chr8:71389054-71389073 None:intergenic 65.0%
GGCCAGTGGGTGCAACCTCG+AGG + Chr8:71389049-71389068 MsG0880046274.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 71385915 71389841 71385915 ID=MsG0880046274.01;Name=MsG0880046274.01
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Chr8 exon 71386817 71387009 71386817 ID=MsG0880046274.01.T01:exon:27779;Parent=MsG0880046274.01.T01
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Chr8 exon 71389008 71389110 71389008 ID=MsG0880046274.01.T01:exon:27787;Parent=MsG0880046274.01.T01
Chr8 exon 71389206 71389747 71389206 ID=MsG0880046274.01.T01:exon:27788;Parent=MsG0880046274.01.T01
Chr8 exon 71389795 71389841 71389795 ID=MsG0880046274.01.T01:exon:27789;Parent=MsG0880046274.01.T01
Chr8 five_prime_UTR 71385915 71386045 71385915 ID=MsG0880046274.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0880046274.01.T01
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Chr8 three_prime_UTR 71389347 71389747 71389347 ID=MsG0880046274.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0880046274.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880046274.01.T01

ATGAATTACGCTCAGGTAGAATTGTTTTTTGGACAAGAGCTTGGGAATATTTCAAGCTATGCTCCTTCAGGGGTTCCCTCGGAACACACCACTAGTTCTCTATCTGTTAAGGGTGTTGCTCGAAATGGTTCTCCCCCTTGGCGAGATGATGACAAAGATGGCCATTACACTTTTGCTGTTGGAGAAAATTTAACTTCCCGCTATAAGATACACAGCAAAATGGGAGAAGGAACTTTTGGGCAGGTATTGGAATGCTGGGACAGAGAAAGGAAGGAAATGGTTGCCATTAAAATTGTCCGTGGAATAAAAAAATATCGTGAAGCAGCCATGATAGAAATTGAGATGTTGCAACAGCTTGGTAAACATGATATAGGTGGCAATCGTTGTGTGCAAATACGGAACTGGTTTGACTATCGTAATCATATATGTATTGTCTTTGAGAAACTTGGACCAAGCTTATACGATTTTCTTCGGAAAAACAATTATCGCTCATTTCCCATTGATCTTGTCCGTGAGATTGGCAGACAACTGTTGGAATGTATAGCATTTATGCATGATTTGCGCATGATCCATACTGACCTAAAGCCTGAAAACATACTCCTTGTTTCACCAGACTATGTCAAAGTTCCTGACTACAAGATTTCATCTAGGTCACCAAACTCGTATTTCAAGAAAGTGCCCAAGTCTAGTGCTATCAAGGTTATTGATTTTGGAAGCACCACTTATGAGCGAGTAGATCAGAGCTACATTGTCTCAACTCGTCATTATAGAGCACCTGAAGTTATCCTTGGTCTTGGCTGGAGTCATCCATGTGATATATGGAGTGTGGGTTGTATATTGGTCGAGTTATGCACGGGCGAAGCTTTGTTTCAGACTCATGAAAATTTAGAGCACCTTGCCATGATGGAGAGGGTACTTGGTCCACTACCAATGCATATGTTGAAGAGAGTTGACCGACATGCTGAGAAGTATGTCAGAAGAGGTAAATTGGACTGGCCAGTGGGTGCAACCTCGAGGGAGAGTATTAAAGCTGTAATGAAGCTCCCTAGACTACAGAATCTAATAATGCAGCATGTTGATCATTCAGCTGGTGATCTCATACATCTGTTGCAAGGGTTACTTAGATATGACCCCTCTGAAAGAATCACAGCCAAGGAAGCCCTCAGACATTCCTTTTTTATGAGGAGATCACATTAG
Protein sequence

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MNYAQVELFFGQELGNISSYAPSGVPSEHTTSSLSVKGVARNGSPPWRDDDKDGHYTFAVGENLTSRYKIHSKMGEGTFGQVLECWDRERKEMVAIKIVRGIKKYREAAMIEIEMLQQLGKHDIGGNRCVQIRNWFDYRNHICIVFEKLGPSLYDFLRKNNYRSFPIDLVREIGRQLLECIAFMHDLRMIHTDLKPENILLVSPDYVKVPDYKISSRSPNSYFKKVPKSSAIKVIDFGSTTYERVDQSYIVSTRHYRAPEVILGLGWSHPCDIWSVGCILVELCTGEALFQTHENLEHLAMMERVLGPLPMHMLKRVDRHAEKYVRRGKLDWPVGATSRESIKAVMKLPRLQNLIMQHVDHSAGDLIHLLQGLLRYDPSERITAKEALRHSFFMRRSH*