AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047238.01

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MsG0880047238.01.T01 AT2G28930 38.202 178 91 3 42 218 181 340 1.62e-32 122
MsG0880047238.01.T01 AT3G59110 41.011 178 87 2 43 220 290 449 2.11e-32 123
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MsG0880047238.01.T01 AT4G35030 43.697 119 66 1 45 162 206 324 3.08e-26 105
MsG0880047238.01.T01 AT4G35030 43.697 119 66 1 45 162 206 324 3.08e-26 105
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MsG0880047238.01.T01 AT4G04500 49.020 102 52 0 42 143 443 544 6.33e-26 105
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MsG0880047238.01.T01 AT4G23190 34.574 188 107 3 33 220 441 612 1.19e-25 105
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MsG0880047238.01.T01 AT4G32000 40.110 182 87 5 42 221 228 389 2.68e-25 103
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MsG0880047238.01.T01 AT2G35620 38.150 173 88 4 43 215 401 554 3.23e-25 103
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MsG0880047238.01.T01 AT1G51850 48.739 119 60 1 29 147 663 780 6.34e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT4G23180 48.039 102 53 0 43 144 447 548 6.39e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT3G53590 44.444 162 73 5 42 195 718 870 6.55e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT1G61480 48.673 113 58 0 46 158 598 710 6.89e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT1G61370 40.397 151 90 0 45 195 602 752 6.90e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT5G59650 40.000 175 84 3 41 214 684 838 6.99e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT1G51850 48.739 119 60 1 29 147 643 760 7.07e-25 103
MsG0880047238.01.T01 AT4G11530 35.088 171 95 1 46 216 454 608 7.21e-25 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G11050 50.962 104 50 1 43 146 400 502 8.34e-25 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G20270 38.728 173 88 4 45 216 812 967 9.17e-25 102
MsG0880047238.01.T01 AT3G13065 36.723 177 83 5 45 218 519 669 9.58e-25 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G29750 35.897 195 105 4 21 214 759 934 9.95e-25 102
MsG0880047238.01.T01 AT3G46290 36.257 171 92 1 45 215 585 738 1.01e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT2G23950 36.702 188 102 4 30 217 383 553 1.02e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G51805 35.238 210 112 3 29 237 638 824 1.03e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G00340 36.723 177 100 3 45 220 561 726 1.04e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G00340 36.723 177 100 3 45 220 582 747 1.05e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G11900 47.059 102 54 0 43 144 567 668 1.07e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G29750 35.897 195 105 4 21 214 744 919 1.10e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G61440 46.903 113 60 0 46 158 580 692 1.10e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G51805 35.238 210 112 3 29 237 662 848 1.16e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G11900 35.057 174 96 3 43 216 636 792 1.18e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT3G46340 36.932 176 92 2 45 220 687 843 1.20e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G00960 36.250 160 91 4 43 195 61 216 1.20e-24 99.4
MsG0880047238.01.T01 AT4G39400 45.455 110 60 0 36 145 976 1085 1.22e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G00960 36.250 160 91 4 43 195 68 223 1.32e-24 99.4
MsG0880047238.01.T01 AT1G61420 44.248 113 63 0 46 158 448 560 1.40e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G61420 44.248 113 63 0 46 158 446 558 1.46e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G49730 50.000 106 51 1 41 144 423 528 1.54e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G70740 43.421 152 83 3 45 195 163 312 1.64e-24 100
MsG0880047238.01.T01 AT5G37790 49.020 102 52 0 45 146 320 421 1.69e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G31420 47.273 110 57 1 43 152 404 512 1.72e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G31420 47.273 110 57 1 43 152 404 512 1.72e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G61380 36.207 174 94 2 46 219 590 746 1.72e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G31420 47.273 110 57 1 43 152 403 511 1.76e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G51870 37.297 185 97 3 43 227 681 846 1.81e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT1G51870 37.297 185 97 3 43 227 629 794 1.82e-24 102
MsG0880047238.01.T01 AT4G21410 46.667 105 54 1 42 144 455 559 1.90e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G49730 50.000 106 51 1 41 144 453 558 1.91e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G21270 38.068 176 91 4 45 220 505 662 1.93e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT4G21410 46.667 105 54 1 42 144 330 434 1.95e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G61360 47.458 118 52 2 46 158 519 631 2.28e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G61360 47.458 118 52 2 46 158 519 631 2.28e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G61360 47.458 118 52 2 46 158 519 631 2.28e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G70520 38.983 177 84 6 46 216 427 585 2.29e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT2G28970 40.698 172 83 2 45 216 580 732 2.32e-24 101
MsG0880047238.01.T01 AT1G61360 47.458 118 52 2 46 158 600 712 2.35e-24 101

Find 50 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 137 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGACAATGATGCTCATATT+TGG 0.218314 8:-83687092 None:intergenic
GTGTGTTGATGTTAGATTAA+AGG 0.229281 8:+83686874 MsG0880047238.01.T01:CDS
AAGAGTGATGTTTACAGTTT+TGG 0.230925 8:+83686441 MsG0880047238.01.T01:CDS
CTTCATTCTACCCGTGTTCT+TGG 0.298078 8:+83686131 MsG0880047238.01.T01:CDS
TGAAGACGTGCGGCTGCATC+AGG 0.312879 8:-83686113 None:intergenic
ATACTGTTGGAACTCTTAAC+TGG 0.326795 8:+83686468 MsG0880047238.01.T01:CDS
ACCTTATCTTCACTAAGCTT+TGG 0.344614 8:-83686845 None:intergenic
ACCCGTGTTCTTGGAACCTT+TGG 0.345311 8:+83686140 MsG0880047238.01.T01:CDS
TGTGTTGATGTTAGATTAAA+GGG 0.347996 8:+83686875 MsG0880047238.01.T01:CDS
GAACGAGTATTATTCATTAG+AGG 0.384912 8:-83687125 None:intergenic
ATTAGACACTTAAACGTTGC+CGG 0.401479 8:+83685169 MsG0880047238.01.T01:CDS
AACAAGGCTTTGTTGTCCTC+GGG 0.405417 8:-83686516 None:intergenic
GACAACAAAGCCTTGTTACC+TGG 0.417583 8:+83686522 MsG0880047238.01.T01:CDS
CTCATATTTGGTCGAAAACT+CGG 0.434417 8:-83687080 None:intergenic
AGATTTAACGTCAAGTGAAC+CGG 0.455375 8:-83685188 None:intergenic
TAACAAGGCTTTGTTGTCCT+CGG 0.482592 8:-83686517 None:intergenic
ATGAAGATATTCAAGGCCTC+TGG 0.483124 8:-83685982 None:intergenic
AATTACCTTTGCAACTGACT+TGG 0.490782 8:-83686909 None:intergenic
TAGTAACATACTTCTATTTG+AGG 0.492514 8:+83686046 MsG0880047238.01.T01:CDS
ACCAAAGCTTAGTGAAGATA+AGG 0.494907 8:+83686844 MsG0880047238.01.T01:CDS
CCTTGAATATCTTCATGAAA+AGG 0.497793 8:+83685989 MsG0880047238.01.T01:CDS
AACCAGGTCAAGTTCTGTCA+TGG 0.525020 8:+83685930 MsG0880047238.01.T01:CDS
GGTGTCAAGGGTGCAGAACC+AGG 0.536754 8:+83685914 MsG0880047238.01.T01:CDS
CCCTTCCAAGTCAGTTGCAA+AGG 0.540407 8:+83686904 MsG0880047238.01.T01:CDS
TACAGGACGCAAAGGTGTCA+AGG 0.540781 8:+83685901 MsG0880047238.01.T01:intron
ACCTTTGCAACTGACTTGGA+AGG 0.545057 8:-83686905 None:intergenic
CCTTTGCAACTGACTTGGAA+GGG 0.555600 8:-83686904 None:intergenic
CTGAAGAGTAAAATTGCTGT+TGG 0.555673 8:+83685954 MsG0880047238.01.T01:CDS
ACAACAAAGCCTTGTTACCT+GGG 0.560532 8:+83686523 MsG0880047238.01.T01:CDS
AAGACGTGCGGCTGCATCAG+GGG 0.565018 8:-83686111 None:intergenic
TATGACAGGTATGCAATGAC+TGG 0.568876 8:+83686405 MsG0880047238.01.T01:intron
ACTGTTCAATCAACATCGTA+AGG 0.571785 8:+83685216 MsG0880047238.01.T01:CDS
TACTGTTGGAACTCTTAACT+GGG 0.582183 8:+83686469 MsG0880047238.01.T01:CDS
AACCAAAGGTTCCAAGAACA+CGG 0.583305 8:-83686142 None:intergenic
GAAGACGTGCGGCTGCATCA+GGG 0.585979 8:-83686112 None:intergenic
ACCAGGTCAAGTTCTGTCAT+GGG 0.587121 8:+83685931 MsG0880047238.01.T01:CDS
AAACATCACTCTTTGAAGAG+AGG 0.596344 8:-83686431 None:intergenic
AACATACTTCTATTTGAGGA+CGG 0.597225 8:+83686050 MsG0880047238.01.T01:CDS
CTCTGGAGCATGATAACCAA+AGG 0.598090 8:-83686156 None:intergenic
GATATCATACCCAGGTAACA+AGG 0.598142 8:-83686532 None:intergenic
ATATCTTCATGAAAAGGCAG+AGG 0.598146 8:+83685995 MsG0880047238.01.T01:CDS
ACAGGACGCAAAGGTGTCAA+GGG 0.599175 8:+83685902 MsG0880047238.01.T01:intron
GCCCATGACAGAACTTGACC+TGG 0.615329 8:-83685932 None:intergenic
TCGGGGAAGTGTATGATCAA+CGG 0.640328 8:-83686498 None:intergenic
ATTTCGGATACAGGACGCAA+AGG 0.652203 8:+83685893 MsG0880047238.01.T01:intron
ACCAAAGGTTCCAAGAACAC+GGG 0.654567 8:-83686141 None:intergenic
ATTGCTGTTGGAGCAGCCAG+AGG 0.660967 8:+83685966 MsG0880047238.01.T01:CDS
ACAAGGCTTTGTTGTCCTCG+GGG 0.675466 8:-83686515 None:intergenic
ACGGGTAGAATGAAGACGTG+CGG 0.712379 8:-83686123 None:intergenic
GTTGATCATACACTTCCCCG+AGG 0.794362 8:+83686500 MsG0880047238.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAAAATCATTATACCAA+CGG - Chr8:83686605-83686624 None:intergenic 15.0%
!! AAAATGTAAAACTGTAAAAA+TGG - Chr8:83685516-83685535 None:intergenic 15.0%
!! AAATGTAAAACTGTAAAAAT+GGG - Chr8:83685515-83685534 None:intergenic 15.0%
!! TGAGTAAAATTCAATAAAAA+GGG - Chr8:83686790-83686809 None:intergenic 15.0%
!! TTCAGTTAATTGATATTAAT+TGG + Chr8:83686210-83686229 MsG0880047238.01.T01:intron 15.0%
!! TTGAGTAAAATTCAATAAAA+AGG - Chr8:83686791-83686810 None:intergenic 15.0%
!!! AAATTATGGATTATATAATC+CGG + Chr8:83685460-83685479 MsG0880047238.01.T01:intron 15.0%
!!! CAATTAGTTTAACATAATTT+CGG + Chr8:83685877-83685896 MsG0880047238.01.T01:intron 15.0%
!! AATGTAAAACTGTAAAAATG+GGG - Chr8:83685514-83685533 None:intergenic 20.0%
!!! ACAACATTTTATCTACAAAA+TGG - Chr8:83686951-83686970 None:intergenic 20.0%
!!! CATAATTTTCATAGATATTC+CGG - Chr8:83685448-83685467 None:intergenic 20.0%
!!! TGGTTTTTAAGAACTAAAAA+TGG + Chr8:83686371-83686390 MsG0880047238.01.T01:intron 20.0%
! AAAATAATGATATCATACCC+AGG - Chr8:83686543-83686562 None:intergenic 25.0%
! ATATTCCGGAATATATAATC+CGG - Chr8:83685434-83685453 None:intergenic 25.0%
! ATGTAAAACTGTAAAAATGG+GGG - Chr8:83685513-83685532 None:intergenic 25.0%
! CGGAATATCTATGAAAATTA+TGG + Chr8:83685446-83685465 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
! CTGTAAAAGTAAAATGTAGT+AGG - Chr8:83686348-83686367 None:intergenic 25.0%
! GTTGCAAAGGTAATTTAATT+TGG + Chr8:83686917-83686936 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
! TAGTAACATACTTCTATTTG+AGG + Chr8:83686046-83686065 MsG0880047238.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTAACTTAGTAATATGTG+TGG + Chr8:83686250-83686269 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
! TTAACTGAAAAAAAGAAGTC+AGG - Chr8:83686199-83686218 None:intergenic 25.0%
! TTAGACTCATGAGTATAAAT+TGG + Chr8:83686308-83686327 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
! TTTAACATAATTTCGGATAC+AGG + Chr8:83685884-83685903 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
!! TGTGTTGATGTTAGATTAAA+GGG + Chr8:83686875-83686894 MsG0880047238.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACATTTTACTTTTACAGTTG+TGG + Chr8:83686351-83686370 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
!!! TAAGGTTCAAATTTGCTATT+TGG + Chr8:83685234-83685253 MsG0880047238.01.T01:intron 25.0%
!!! TACTCTTTTTGTTTTCGATT+GGG - Chr8:83685353-83685372 None:intergenic 25.0%
!!! TTACTCTTTTTGTTTTCGAT+TGG - Chr8:83685354-83685373 None:intergenic 25.0%
AACATACTTCTATTTGAGGA+CGG + Chr8:83686050-83686069 MsG0880047238.01.T01:CDS 30.0%
AATTGCACAATCCACTAATT+AGG - Chr8:83685862-83685881 None:intergenic 30.0%
ATTGCACAATCCACTAATTA+GGG - Chr8:83685861-83685880 None:intergenic 30.0%
CCTTGAATATCTTCATGAAA+AGG + Chr8:83685989-83686008 MsG0880047238.01.T01:CDS 30.0%
GAGTAAGAAAACTCCAAATT+TGG - Chr8:83685606-83685625 None:intergenic 30.0%
TGTTTGATTACCCTAATTAG+TGG + Chr8:83685848-83685867 MsG0880047238.01.T01:intron 30.0%
TTATACTCATGAGTCTAAAG+TGG - Chr8:83686306-83686325 None:intergenic 30.0%
TTGACAATGATGCTCATATT+TGG - Chr8:83687095-83687114 None:intergenic 30.0%
! AAGAGTGATGTTTACAGTTT+TGG + Chr8:83686441-83686460 MsG0880047238.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTGATTTATATGCACCGT+TGG + Chr8:83686586-83686605 MsG0880047238.01.T01:intron 30.0%
! CCTTTTCATGAAGATATTCA+AGG - Chr8:83685992-83686011 None:intergenic 30.0%
! CTTTGTTTGTTGGATTTATC+AGG + Chr8:83686817-83686836 MsG0880047238.01.T01:intron 30.0%
! GTGTGTTGATGTTAGATTAA+AGG + Chr8:83686874-83686893 MsG0880047238.01.T01:CDS 30.0%
! TCAATGTGATCTTTGTTTGT+TGG + Chr8:83686807-83686826 MsG0880047238.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTGTTTTGTTTGCAAAAGT+TGG + Chr8:83687024-83687043 MsG0880047238.01.T01:intron 30.0%
AATTACCTTTGCAACTGACT+TGG - Chr8:83686912-83686931 None:intergenic 35.0%
ACAGAAGCAAAACAACATTC+TGG - Chr8:83685795-83685814 None:intergenic 35.0%
ACCAAAGCTTAGTGAAGATA+AGG + Chr8:83686844-83686863 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTATCTTCACTAAGCTT+TGG - Chr8:83686848-83686867 None:intergenic 35.0%
ACTGTTCAATCAACATCGTA+AGG + Chr8:83685216-83685235 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
AGATTTAACGTCAAGTGAAC+CGG - Chr8:83685191-83685210 None:intergenic 35.0%
ATACTGTTGGAACTCTTAAC+TGG + Chr8:83686468-83686487 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTTCATGAAAAGGCAG+AGG + Chr8:83685995-83686014 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGACACTTAAACGTTGC+CGG + Chr8:83685169-83685188 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGTGGTGTTCGGAATTT+GGG - Chr8:83685578-83685597 None:intergenic 35.0%
CAGAAGCAAAACAACATTCT+GGG - Chr8:83685794-83685813 None:intergenic 35.0%
CATCCAGAAATAACTTACTC+TGG - Chr8:83686176-83686195 None:intergenic 35.0%
CCAAATTTGGACAAGATTTG+TGG - Chr8:83685593-83685612 None:intergenic 35.0%
CCACAAATCTTGTCCAAATT+TGG + Chr8:83685590-83685609 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
CTCATATTTGGTCGAAAACT+CGG - Chr8:83687083-83687102 None:intergenic 35.0%
CTGAAGAGTAAAATTGCTGT+TGG + Chr8:83685954-83685973 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
TACTGTTGGAACTCTTAACT+GGG + Chr8:83686469-83686488 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
TCAACCTATGTCAAACATCA+TGG + Chr8:83685640-83685659 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
TTAGTAATATGTGTGGTCTG+TGG + Chr8:83686257-83686276 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
TTTGTCCGAATTTCGAATTC+CGG - Chr8:83685771-83685790 None:intergenic 35.0%
! AAACATCACTCTTTGAAGAG+AGG - Chr8:83686434-83686453 None:intergenic 35.0%
! AGTATAAATTGGTTCCGTGT+TGG + Chr8:83686319-83686338 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
! GTAATACTTTTCACACCCTA+TGG + Chr8:83685370-83685389 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
! GTTTGACATAGGTTGAAATG+TGG - Chr8:83685636-83685655 None:intergenic 35.0%
! TGGCTTGATTTTTGTATGAC+AGG + Chr8:83686391-83686410 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
! TTTTATACGTCGCAATTGTC+CGG - Chr8:83685482-83685501 None:intergenic 35.0%
!! AGCCTTTAAAGTGAAGGATT+GGG + Chr8:83685321-83685340 MsG0880047238.01.T01:intron 35.0%
!! GCTTGTTGGTAATTTGCATA+GGG - Chr8:83685408-83685427 None:intergenic 35.0%
!!! CAGTTTTGGAGTTATACTGT+TGG + Chr8:83686455-83686474 MsG0880047238.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGTTTTCGATTGGGCAT+GGG - Chr8:83685347-83685366 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTGTTTTCGATTGGGCA+TGG - Chr8:83685348-83685367 None:intergenic 35.0%
AACCAAAGGTTCCAAGAACA+CGG - Chr8:83686145-83686164 None:intergenic 40.0%
AATGTAGTAGGAGACCAACA+CGG - Chr8:83686336-83686355 None:intergenic 40.0%
ATGAAGATATTCAAGGCCTC+TGG - Chr8:83685985-83686004 None:intergenic 40.0%
CCTATGTCAAACATCATGGA+AGG + Chr8:83685644-83685663 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
CCTATTCCGGAAAACAAATC+CGG - Chr8:83685738-83685757 None:intergenic 40.0%
CCTTCCATGATGTTTGACAT+AGG - Chr8:83685647-83685666 None:intergenic 40.0%
GAATTCTGTCGAATGCAATC+CGG + Chr8:83685716-83685735 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
GATATCATACCCAGGTAACA+AGG - Chr8:83686535-83686554 None:intergenic 40.0%
GATTTGTGGTGTTCGGAATT+TGG - Chr8:83685579-83685598 None:intergenic 40.0%
TATGACAGGTATGCAATGAC+TGG + Chr8:83686405-83686424 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
TCCGGAATATATAATCCGGA+GGG - Chr8:83685430-83685449 None:intergenic 40.0%
TGGACAAGATTTGTGGTGTT+CGG - Chr8:83685586-83685605 None:intergenic 40.0%
TTCCGGAATATATAATCCGG+AGG - Chr8:83685431-83685450 None:intergenic 40.0%
! GCTCCAGAGTAAGTTATTTC+TGG + Chr8:83686170-83686189 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
!! ACAACAAAGCCTTGTTACCT+GGG + Chr8:83686523-83686542 MsG0880047238.01.T01:CDS 40.0%
!! CGATGATATTGACTTCAGAG+CGG - Chr8:83685301-83685320 None:intergenic 40.0%
!! GAGCCTTTAAAGTGAAGGAT+TGG + Chr8:83685320-83685339 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
!! GGCTTGTTGGTAATTTGCAT+AGG - Chr8:83685409-83685428 None:intergenic 40.0%
!! TAACAAGGCTTTGTTGTCCT+CGG - Chr8:83686520-83686539 None:intergenic 40.0%
!! TCATCGAGCCTTTAAAGTGA+AGG + Chr8:83685315-83685334 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
!! TGCAATCCGGATTTGTTTTC+CGG + Chr8:83685729-83685748 MsG0880047238.01.T01:intron 40.0%
AACCAGGTCAAGTTCTGTCA+TGG + Chr8:83685930-83685949 MsG0880047238.01.T01:CDS 45.0%
ACCAAAGGTTCCAAGAACAC+GGG - Chr8:83686144-83686163 None:intergenic 45.0%
ACCAGGTCAAGTTCTGTCAT+GGG + Chr8:83685931-83685950 MsG0880047238.01.T01:CDS 45.0%
AGAGAGAGAGAGAGAGAATG+GGG - Chr8:83685544-83685563 None:intergenic 45.0%
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAA+TGG - Chr8:83685546-83685565 None:intergenic 45.0%
ATATAATCCGGAGGGCTTGT+TGG - Chr8:83685422-83685441 None:intergenic 45.0%
ATTTCGGATACAGGACGCAA+AGG + Chr8:83685893-83685912 MsG0880047238.01.T01:intron 45.0%
CAAATTACCAACAAGCCCTC+CGG + Chr8:83685412-83685431 MsG0880047238.01.T01:intron 45.0%
CTTCATTCTACCCGTGTTCT+TGG + Chr8:83686131-83686150 MsG0880047238.01.T01:CDS 45.0%
GAGAGAGAGAGAGAGAGAAT+GGG - Chr8:83685545-83685564 None:intergenic 45.0%
GCCCTCCGGATTATATATTC+CGG + Chr8:83685426-83685445 MsG0880047238.01.T01:intron 45.0%
GGCCCAATCCTTCACTTTAA+AGG - Chr8:83685326-83685345 None:intergenic 45.0%
! TCGGGGAAGTGTATGATCAA+CGG - Chr8:83686501-83686520 None:intergenic 45.0%
!! AACAAGGCTTTGTTGTCCTC+GGG - Chr8:83686519-83686538 None:intergenic 45.0%
!! ACCTTTGCAACTGACTTGGA+AGG - Chr8:83686908-83686927 None:intergenic 45.0%
!! CCGGATTTGTTTTCCGGAAT+AGG + Chr8:83685735-83685754 MsG0880047238.01.T01:intron 45.0%
!! CCTTTGCAACTGACTTGGAA+GGG - Chr8:83686907-83686926 None:intergenic 45.0%
!! CTCTGGAGCATGATAACCAA+AGG - Chr8:83686159-83686178 None:intergenic 45.0%
!! GACAACAAAGCCTTGTTACC+TGG + Chr8:83686522-83686541 MsG0880047238.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGGTTTGGACTCGAGAAT+TGG - Chr8:83685269-83685288 None:intergenic 45.0%
ACCCGTGTTCTTGGAACCTT+TGG + Chr8:83686140-83686159 MsG0880047238.01.T01:CDS 50.0%
ACGGGTAGAATGAAGACGTG+CGG - Chr8:83686126-83686145 None:intergenic 50.0%
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GCGCTCCGGAATTCGAAATT+CGG + Chr8:83685763-83685782 MsG0880047238.01.T01:intron 50.0%
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TCAGAGCGGATCACTTGAGT+TGG - Chr8:83685287-83685306 None:intergenic 50.0%
!! ACAAGGCTTTGTTGTCCTCG+GGG - Chr8:83686518-83686537 None:intergenic 50.0%
!! ACAGGACGCAAAGGTGTCAA+GGG + Chr8:83685902-83685921 MsG0880047238.01.T01:intron 50.0%
!! GCGGATCACTTGAGTTGGTT+TGG - Chr8:83685282-83685301 None:intergenic 50.0%
!! TACAGGACGCAAAGGTGTCA+AGG + Chr8:83685901-83685920 MsG0880047238.01.T01:intron 50.0%
CGGAATAGGTTGTTGCGCTC+CGG + Chr8:83685749-83685768 MsG0880047238.01.T01:intron 55.0%
CGGAGCGCAACAACCTATTC+CGG - Chr8:83685751-83685770 None:intergenic 55.0%
GCCCATGACAGAACTTGACC+TGG - Chr8:83685935-83685954 None:intergenic 55.0%
! ATTGCTGTTGGAGCAGCCAG+AGG + Chr8:83685966-83685985 MsG0880047238.01.T01:CDS 55.0%
! TAATTTGCATAGGGCGCGCG+AGG - Chr8:83685399-83685418 None:intergenic 55.0%
AAGACGTGCGGCTGCATCAG+GGG - Chr8:83686114-83686133 None:intergenic 60.0%
GAAGACGTGCGGCTGCATCA+GGG - Chr8:83686115-83686134 None:intergenic 60.0%
TGAAGACGTGCGGCTGCATC+AGG - Chr8:83686116-83686135 None:intergenic 60.0%
! GGTGTCAAGGGTGCAGAACC+AGG + Chr8:83685914-83685933 MsG0880047238.01.T01:CDS 60.0%
TTTGCATAGGGCGCGCGAGG+AGG - Chr8:83685396-83685415 None:intergenic 65.0%
AGGGCGCGCGAGGAGGCCAT+AGG - Chr8:83685389-83685408 None:intergenic 75.0%
GGGCGCGCGAGGAGGCCATA+GGG - Chr8:83685388-83685407 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 83685163 83687138 83685163 ID=MsG0880047238.01;Name=MsG0880047238.01
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Gene Sequence

>MsG0880047238.01.T01

ATGTTTATTAGACACTTAAACGTTGCCGGTTCACTTGACGTTAAATCTGTATCACTGTTCAATCAACATCGTAAGGACGCAAAGGTGTCAAGGGTGCAGAACCAGGTCAAGTTCTGTCATGGGCTGAAGAGTAAAATTGCTGTTGGAGCAGCCAGAGGCCTTGAATATCTTCATGAAAAGGCAGAGGTTCATATTGTTCATCGTTACATTAAGTCTAGTAACATACTTCTATTTGAGGACGGCGTTGCAAAGATTGCTGATTTTGATCTGTCGAATCAAGCCCCTGATGCAGCCGCACGTCTTCATTCTACCCGTGTTCTTGGAACCTTTGGTTATCATGCTCCAGAGTATGCAATGACTGGAAACCTCTCTTCAAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTTATACTGTTGGAACTCTTAACTGGGCGTAAACCGTTGATCATACACTTCCCCGAGGACAACAAAGCCTTGTTACCTGGCACAAAACTGTCTGTTTACACTGACAGTGCATCAAAATTAAACTTTTCATTTGCAACACCAAAGCTTAGTGAAGATAAGGTGAAGCAGTGTGTTGATGTTAGATTAAAGGGAGAGTACCCTTCCAAGTCAGTTGCAAAGTTGGCTGTTGTTGCTGCATTGTGTGTTCAATATGAAGCCGAGTTTTCGACCAAATATGAGCATCATTGTCAAAGCTTTACAGCCTCTAATGAATAA
Protein sequence

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