AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047245.01


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MsG0880047245.01.T01 AT2G42960 50.540 463 144 9 3 389 31 484 4.52e-138 404
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MsG0880047245.01.T01 AT4G23280 33.824 272 129 6 143 368 359 625 1.39e-37 144
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MsG0880047245.01.T01 AT1G29740 34.375 256 127 4 143 359 694 947 1.37e-34 136
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MsG0880047245.01.T01 AT3G17410 32.824 262 131 4 143 360 86 346 2.03e-34 131
MsG0880047245.01.T01 AT3G59350 33.333 264 125 5 145 360 90 350 2.19e-34 131
MsG0880047245.01.T01 AT1G51860 32.222 270 138 5 146 376 603 866 2.21e-34 136
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MsG0880047245.01.T01 AT4G04510 33.083 266 130 6 143 367 356 614 4.49e-34 134
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MsG0880047245.01.T01 AT1G06700 32.184 261 132 4 145 360 87 347 5.64e-34 130
MsG0880047245.01.T01 AT4G04540 33.333 264 131 6 143 367 370 627 5.67e-34 134
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MsG0880047245.01.T01 AT2G39110 32.549 255 125 6 151 360 106 358 1.35e-32 127
MsG0880047245.01.T01 AT1G11330 30.796 289 155 6 143 387 539 826 1.37e-32 130
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MsG0880047245.01.T01 AT1G11330 30.796 289 155 6 143 387 541 828 1.48e-32 130
MsG0880047245.01.T01 AT4G21410 30.970 268 140 5 143 367 249 514 1.52e-32 129
MsG0880047245.01.T01 AT2G19230 31.295 278 142 4 145 383 588 855 1.66e-32 130
MsG0880047245.01.T01 AT2G19230 31.295 278 142 4 145 383 587 854 1.67e-32 130
MsG0880047245.01.T01 AT4G23240 30.526 285 152 6 129 368 335 618 1.71e-32 130
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MsG0880047245.01.T01 AT3G20530 37.245 196 83 3 151 306 108 303 3.94e-31 121
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MsG0880047245.01.T01 AT5G59270 29.688 256 140 4 143 360 369 622 5.04e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT4G11470 30.597 268 143 6 143 368 361 627 5.04e-31 125
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MsG0880047245.01.T01 AT1G67720 29.688 256 141 3 143 360 623 877 5.39e-31 126
MsG0880047245.01.T01 AT5G59270 29.688 256 140 4 143 360 385 638 5.47e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT1G53730 34.101 217 107 3 174 354 466 682 6.28e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT5G49780 32.197 264 123 7 145 361 553 807 6.38e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT4G30520 29.615 260 139 4 143 362 320 575 8.09e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT2G19130 30.492 305 161 9 112 368 478 779 8.47e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT5G49780 30.952 294 146 8 145 391 674 957 8.49e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT5G28680 32.296 257 133 3 143 360 538 792 8.84e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT5G28680 32.296 257 133 3 143 360 538 792 8.84e-31 125
MsG0880047245.01.T01 AT5G49780 32.197 264 123 7 145 361 652 906 1.05e-30 125
MsG0880047245.01.T01 AT1G34110 31.227 269 125 8 143 359 789 1049 1.07e-30 125
MsG0880047245.01.T01 AT1G34110 31.227 269 125 8 143 359 789 1049 1.13e-30 125
MsG0880047245.01.T01 AT4G21380 31.716 268 140 4 143 368 543 809 1.15e-30 125
MsG0880047245.01.T01 AT1G21250 29.965 287 157 6 117 361 397 681 1.18e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT5G35960 31.154 260 127 6 143 360 151 400 1.33e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT1G49100 31.048 248 129 4 151 359 606 850 1.37e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT4G38830 31.538 260 135 4 143 360 361 619 1.41e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT1G11350 30.070 286 160 3 143 389 529 813 1.76e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT4G11460 30.502 259 138 4 143 359 363 621 1.83e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT3G46760 32.800 250 137 3 143 363 67 314 1.92e-30 120
MsG0880047245.01.T01 AT4G28490 28.667 300 151 6 144 386 701 994 1.94e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT5G49760 33.080 263 121 8 145 361 650 903 1.99e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT4G00340 32.812 256 123 6 151 360 487 739 2.00e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT4G00340 32.812 256 123 6 151 360 508 760 2.05e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT3G53380 30.584 291 154 6 148 393 399 686 2.11e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT1G28440 30.996 271 127 5 145 360 695 960 2.19e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT5G07180 31.076 251 128 4 150 361 579 823 2.29e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT2G28250 30.284 317 162 9 112 374 193 504 2.49e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT1G70740 29.856 278 148 6 143 374 79 355 2.75e-30 121
MsG0880047245.01.T01 AT4G21400 29.097 299 141 5 143 371 239 536 2.84e-30 123
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MsG0880047245.01.T01 AT5G07180 31.076 251 128 4 150 361 675 919 3.05e-30 124
MsG0880047245.01.T01 AT2G24230 31.469 286 131 6 143 363 563 848 3.13e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT3G16030 30.996 271 142 6 143 369 544 813 3.30e-30 123
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MsG0880047245.01.T01 AT4G21400 29.097 299 141 5 143 371 340 637 3.53e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT3G16030 31.418 261 137 5 143 362 421 680 3.96e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT5G11410 31.197 234 120 6 160 355 4 234 3.99e-30 117
MsG0880047245.01.T01 AT1G61430 28.975 283 157 5 143 382 483 764 4.09e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT1G61430 28.975 283 157 5 143 382 483 764 4.09e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT1G61430 28.975 283 157 5 143 382 483 764 4.09e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT4G35030 29.644 253 138 2 143 355 121 373 4.14e-30 120
MsG0880047245.01.T01 AT1G61430 28.975 283 157 5 143 382 506 787 4.27e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT3G16030 31.418 261 137 5 143 362 565 824 4.30e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT4G11460 30.350 257 138 4 143 359 288 543 4.31e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT4G11460 30.350 257 138 4 143 359 363 618 4.55e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT4G35030 29.661 236 126 2 167 362 4 239 4.59e-30 118
MsG0880047245.01.T01 AT4G23290 30.556 288 154 6 126 368 317 603 4.67e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT5G10530 32.171 258 130 6 151 367 361 614 4.73e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT1G61430 28.975 283 157 5 143 382 509 790 4.97e-30 123
MsG0880047245.01.T01 AT5G11410 30.081 246 131 6 148 355 82 324 5.18e-30 119
MsG0880047245.01.T01 AT5G16500 31.274 259 132 4 142 359 96 349 5.49e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT3G55550 31.373 255 135 4 151 367 372 624 6.08e-30 122
MsG0880047245.01.T01 AT5G16900 33.977 259 125 7 143 360 590 843 6.96e-30 122

Find 101 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 179 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAGTCAAAAGGGCTCGTTTA+AGG 0.184720 8:+83742891 None:intergenic
CTTCCGTTGGACTTGGAATC+TGG 0.197941 8:+83742474 None:intergenic
CAAGAATTTGGTTAGACTTT+TGG 0.204094 8:-83744327 MsG0880047245.01.T01:CDS
TCATGTGAGGCACAAGAATT+TGG 0.263154 8:-83744339 MsG0880047245.01.T01:CDS
CGTCTCCACGTCAGTACTTC+TGG 0.274667 8:+83742533 None:intergenic
ATTTATGAGTATGTTAATAA+TGG 0.276125 8:-83743865 MsG0880047245.01.T01:CDS
GCCCGGATTAAAATTCTTCT+TGG 0.280692 8:-83743784 MsG0880047245.01.T01:CDS
GCTCCAGAATATGCCAATTC+TGG 0.293038 8:-83743355 MsG0880047245.01.T01:CDS
CCCGCTTTCTTCACCTGATT+GGG 0.298902 8:+83744776 None:intergenic
GTTCATTGTAATCATCCTTC+TGG 0.307320 8:-83745069 MsG0880047245.01.T01:CDS
CCCCGCTTTCTTCACCTGAT+TGG 0.308344 8:+83744775 None:intergenic
AGAGATCAAAGAGATTAAAA+TGG 0.311668 8:-83744961 MsG0880047245.01.T01:CDS
GACTCATAAAAGAGCCGCTT+TGG 0.315906 8:+83744913 None:intergenic
TATATTCCCCGTTCTTTGTT+TGG 0.319142 8:+83744847 None:intergenic
AAGCCAGAATTGGCATATTC+TGG 0.325319 8:+83743352 None:intergenic
CTCTTTGATCTCTTCTGAAA+TGG 0.325625 8:+83744971 None:intergenic
CGTTTAAGGGCACTTGTTGA+TGG 0.325653 8:+83742905 None:intergenic
CATGGTGCCATGCGGCAATA+TGG 0.344318 8:-83743823 MsG0880047245.01.T01:CDS
CTCGTTTAGTAAGCCAGAAT+TGG 0.344493 8:+83743342 None:intergenic
TTGCTCCTTGAAGCAATTAC+AGG 0.354352 8:-83743292 MsG0880047245.01.T01:CDS
GATTCTCAATGGACAACTTT+CGG 0.356487 8:+83743624 None:intergenic
ATTCCTTCTTCCGTTGGACT+TGG 0.359864 8:+83742467 None:intergenic
AGAGTGGAATTTGAGGCTAT+TGG 0.362960 8:-83744362 MsG0880047245.01.T01:CDS
TGAAGATGATGGTAGGTAAT+AGG 0.375363 8:-83742967 MsG0880047245.01.T01:CDS
CCGAGTTCTCTCACCTTGGA+TGG 0.385954 8:-83744692 MsG0880047245.01.T01:CDS
ACTCATAAAAGAGCCGCTTT+GGG 0.388575 8:+83744914 None:intergenic
GATGGTCTCGTCTCAATGTT+TGG 0.397821 8:+83742923 None:intergenic
TTACTTGACTTGATTCTCAA+TGG 0.407255 8:+83743613 None:intergenic
AGTCAAAAGGGCTCGTTTAA+GGG 0.410344 8:+83742892 None:intergenic
CTCTTCCTGTAATTGCTTCA+AGG 0.416666 8:+83743287 None:intergenic
CCTTTGATTCCTTCTTCCGT+TGG 0.420720 8:+83742461 None:intergenic
ACTTCACCATCGCCTTTGTC+TGG 0.424499 8:-83744719 MsG0880047245.01.T01:CDS
GGCAATATGGTTATCTTACA+TGG 0.432994 8:-83743810 MsG0880047245.01.T01:CDS
CAAAGAGATTAAAATGGATC+AGG 0.434504 8:-83744955 MsG0880047245.01.T01:CDS
AAGAGTGATGTGTATAGCTT+TGG 0.437184 8:-83743319 MsG0880047245.01.T01:CDS
CTGGATTCCCGTTGATAAGC+TGG 0.443135 8:+83744572 None:intergenic
AAGTCAAACCTCTCTAGGTA+TGG 0.448479 8:+83742787 None:intergenic
AACTTGGAGCAATGGCTTCA+TGG 0.452147 8:-83743841 MsG0880047245.01.T01:CDS
AAATGGATAACCTATGGCTC+AGG 0.455039 8:+83744988 None:intergenic
GACGCTGCTGACTCCCAATC+AGG 0.456640 8:-83744789 MsG0880047245.01.T01:CDS
CCCAATCAGGTGAAGAAAGC+GGG 0.458352 8:-83744776 MsG0880047245.01.T01:CDS
AGAATTTAGAGTGGAATTTG+AGG 0.459042 8:-83744369 MsG0880047245.01.T01:CDS
ATCAAGGCCAGCTTATCAAC+GGG 0.463001 8:-83744579 MsG0880047245.01.T01:intron
AGAAGGCCTGTGCGCAGAAA+CGG 0.467927 8:+83744744 None:intergenic
TCTCACCTTGGATGGGACAC+TGG 0.470295 8:-83744684 MsG0880047245.01.T01:intron
CACATCTCAAAGGAGTCAAA+AGG 0.471876 8:+83742879 None:intergenic
AGGTAATAGGCATGCGGAAG+AGG 0.476996 8:-83742954 MsG0880047245.01.T01:CDS
TCTTCCGAGTTCTCTCACCT+TGG 0.482962 8:-83744696 MsG0880047245.01.T01:CDS
GCTTGCTTCCCCTGAGCCAT+AGG 0.489668 8:-83744998 MsG0880047245.01.T01:CDS
TGTAGGTAAATTTAGTTGAC+TGG 0.496368 8:-83742991 MsG0880047245.01.T01:intron
ATTCCAAGTCCAACGGAAGA+AGG 0.497537 8:-83742470 MsG0880047245.01.T01:CDS
CTAAGTCCGTTTCTGCGCAC+AGG 0.497972 8:-83744750 MsG0880047245.01.T01:CDS
AAGAAATCTAGAAGAGTCAA+TGG 0.498447 8:-83745020 MsG0880047245.01.T01:CDS
CTTCTGAAATGGATAACCTA+TGG 0.501448 8:+83744982 None:intergenic
GGGGAATATAGCAGTCAATC+AGG 0.501521 8:-83744834 MsG0880047245.01.T01:CDS
AGTGGTTCGCATGCTTGAAT+CGG 0.503584 8:-83742819 MsG0880047245.01.T01:CDS
CCATCCAAGGTGAGAGAACT+CGG 0.509825 8:+83744692 None:intergenic
TAGGCATGCGGAAGAGGTGG+TGG 0.510653 8:-83742948 MsG0880047245.01.T01:CDS
GTTATCTTACATGGGATGCC+CGG 0.513132 8:-83743801 MsG0880047245.01.T01:CDS
CGAGTTCTCTCACCTTGGAT+GGG 0.518532 8:-83744691 MsG0880047245.01.T01:CDS
ATAATGGAAACTTGGAGCAA+TGG 0.527133 8:-83743849 MsG0880047245.01.T01:CDS
GTATGTTAATAATGGAAACT+TGG 0.531322 8:-83743857 MsG0880047245.01.T01:CDS
CATTGTAATCATCCTTCTGG+TGG 0.536752 8:-83745066 MsG0880047245.01.T01:CDS
AGGCGATGGTGAAGTTAAGA+AGG 0.552623 8:+83744727 None:intergenic
AGTCAAACCTCTCTAGGTAT+GGG 0.553289 8:+83742788 None:intergenic
ACATCTCAAAGGAGTCAAAA+GGG 0.555722 8:+83742880 None:intergenic
TACTGACGTGGAGACGCAAA+AGG 0.563609 8:-83742526 MsG0880047245.01.T01:CDS
AGTTGACTGGCTGAAGATGA+TGG 0.567613 8:-83742978 MsG0880047245.01.T01:CDS
GCTGAGCGGCTATAATCCAC+TGG 0.567624 8:+83743262 None:intergenic
TATCAAGGCCAGCTTATCAA+CGG 0.568457 8:-83744580 MsG0880047245.01.T01:intron
AACAGAAGTCAAACCTCTCT+AGG 0.569900 8:+83742782 None:intergenic
TTTGCATTGAAGGCACTCAC+AGG 0.572233 8:-83744301 MsG0880047245.01.T01:intron
CTCATAAAAGAGCCGCTTTG+GGG 0.581188 8:+83744915 None:intergenic
CCAACGGAAGAAGGAATCAA+AGG 0.589741 8:-83742461 MsG0880047245.01.T01:CDS
AGAATATCCCATACCTAGAG+AGG 0.591870 8:-83742795 MsG0880047245.01.T01:intron
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AATGGATAACCTATGGCTCA+GGG 0.603378 8:+83744989 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!!! GTGTTTTATTTTATATATAT+TGG - Chr8:83743324-83743343 MsG0880047245.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTTCAAAAGAAAATATTAT+TGG - Chr8:83742919-83742938 MsG0880047245.01.T01:CDS 10.0%
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!!! TATTTTTAACATGAATTTCT+TGG - Chr8:83743537-83743556 MsG0880047245.01.T01:intron 15.0%
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! ACTTAATAATCTGTGAGTAT+TGG - Chr8:83743011-83743030 MsG0880047245.01.T01:intron 25.0%
! AGAGATCAAAGAGATTAAAA+TGG - Chr8:83742583-83742602 MsG0880047245.01.T01:intron 25.0%
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!!! TTCCAAGAAGAATTTTAATC+CGG + Chr8:83743765-83743784 None:intergenic 25.0%
AAGAAATCTAGAAGAGTCAA+TGG - Chr8:83742524-83742543 MsG0880047245.01.T01:CDS 30.0%
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CAATCACCCAAATGAAATTT+AGG + Chr8:83744532-83744551 None:intergenic 30.0%
CAATGCTTCATTTGAGAAAT+CGG + Chr8:83744957-83744976 None:intergenic 30.0%
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GAAAACTCACCAAAGTAAAA+CGG + Chr8:83743844-83743863 None:intergenic 30.0%
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! TAAAGTTGTGAAGTACTACA+GGG + Chr8:83744461-83744480 None:intergenic 30.0%
! TAGTCCAAAGTCAGATATTT+TGG + Chr8:83743983-83744002 None:intergenic 30.0%
! TTAAAGTTGTGAAGTACTAC+AGG + Chr8:83744462-83744481 None:intergenic 30.0%
! TTACTTGACTTGATTCTCAA+TGG + Chr8:83743934-83743953 None:intergenic 30.0%
!! AAATGAAGCATTGATGTTTC+AGG - Chr8:83744964-83744983 MsG0880047245.01.T01:CDS 30.0%
!! AGATTTTAAAGAAGTTGCGA+AGG + Chr8:83744857-83744876 None:intergenic 30.0%
!! TCCAAGAAGAATTTTAATCC+GGG + Chr8:83743764-83743783 None:intergenic 30.0%
!!! TTTGGTCTTTTTTCAGAATC+TGG + Chr8:83744696-83744715 None:intergenic 30.0%
AAGACCAAAAATGAGTCAAG+TGG - Chr8:83744707-83744726 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGTGATGTGTATAGCTT+TGG - Chr8:83744225-83744244 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
ACATCTCAAAGGAGTCAAAA+GGG + Chr8:83744667-83744686 None:intergenic 35.0%
AGACTCCCCTAAATTTCATT+TGG - Chr8:83744522-83744541 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
AGCTCTCTGTCTATAGATTT+AGG - Chr8:83744063-83744082 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
ATCTATGATTTATTGCAGGC+TGG - Chr8:83743875-83743894 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
ATTATTGGTGAAGGAGGATA+TGG - Chr8:83742934-83742953 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGTAAAACGGAACTTTC+TGG + Chr8:83743834-83743853 None:intergenic 35.0%
GACTCCCCTAAATTTCATTT+GGG - Chr8:83744523-83744542 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
GATTCTCAATGGACAACTTT+CGG + Chr8:83743923-83743942 None:intergenic 35.0%
GCCAAAATCAAGATGAAAGT+AGG + Chr8:83743420-83743439 None:intergenic 35.0%
GCTATGTCAAGTCAATCAAA+AGG + Chr8:83743442-83743461 None:intergenic 35.0%
GGATATGGAGTTGTTTATCA+AGG - Chr8:83742949-83742968 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
GGCAATATGGTTATCTTACA+TGG - Chr8:83743734-83743753 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
GTACTACAGGGAAATTTCTA+AGG + Chr8:83744449-83744468 None:intergenic 35.0%
GTTCATTGTAATCATCCTTC+TGG - Chr8:83742475-83742494 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
TATATTCCCCGTTCTTTGTT+TGG + Chr8:83742700-83742719 None:intergenic 35.0%
TCACAGGTAAGCATACAATT+TGG - Chr8:83743259-83743278 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
TTCATTTGGGTGATTGTTGT+AGG - Chr8:83744536-83744555 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
! ACTTGTTTGTTGCAAGTTCT+AGG + Chr8:83742900-83742919 None:intergenic 35.0%
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! CAGAAAGTTCCGTTTTACTT+TGG - Chr8:83743832-83743851 MsG0880047245.01.T01:CDS 35.0%
! CTCTTTGATCTCTTCTGAAA+TGG + Chr8:83742576-83742595 None:intergenic 35.0%
! GCCTACTTTCATCTTGATTT+TGG - Chr8:83743416-83743435 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
! TCAACTTGCAGGTCTTATAA+TGG + Chr8:83744934-83744953 None:intergenic 35.0%
! TGAAGATGATGGTAGGTAAT+AGG - Chr8:83744577-83744596 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGCTCCAAACAAAGAAC+GGG - Chr8:83742690-83742709 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
!! CTTCTGAAATGGATAACCTA+TGG + Chr8:83742565-83742584 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTTGGGTTTTTGCATTGA+AGG - Chr8:83743233-83743252 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
!!! GAATTTTGACTGTGGTGAAT+AGG - Chr8:83744420-83744439 MsG0880047245.01.T01:intron 35.0%
AAATGGATAACCTATGGCTC+AGG + Chr8:83742559-83742578 None:intergenic 40.0%
AACAGAAGTCAAACCTCTCT+AGG + Chr8:83744765-83744784 None:intergenic 40.0%
AAGATAACCATATTGCCGCA+TGG + Chr8:83743731-83743750 None:intergenic 40.0%
AAGCCAGAATTGGCATATTC+TGG + Chr8:83744195-83744214 None:intergenic 40.0%
AAGTCAAACCTCTCTAGGTA+TGG + Chr8:83744760-83744779 None:intergenic 40.0%
AATGGATAACCTATGGCTCA+GGG + Chr8:83742558-83742577 None:intergenic 40.0%
AATTACAGGAAGAGATCCAG+TGG - Chr8:83744266-83744285 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
AGAATATCCCATACCTAGAG+AGG - Chr8:83744749-83744768 MsG0880047245.01.T01:CDS 40.0%
AGTCAAAAGGGCTCGTTTAA+GGG + Chr8:83744655-83744674 None:intergenic 40.0%
AGTCAAACCTCTCTAGGTAT+GGG + Chr8:83744759-83744778 None:intergenic 40.0%
CACATCTCAAAGGAGTCAAA+AGG + Chr8:83744668-83744687 None:intergenic 40.0%
CACATTACGACTCGTGTAAT+GGG - Chr8:83744030-83744049 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
CATTGTAATCATCCTTCTGG+TGG - Chr8:83742478-83742497 MsG0880047245.01.T01:CDS 40.0%
CTCGTTTAGTAAGCCAGAAT+TGG + Chr8:83744205-83744224 None:intergenic 40.0%
CTCTTCCTGTAATTGCTTCA+AGG + Chr8:83744260-83744279 None:intergenic 40.0%
GCCCGGATTAAAATTCTTCT+TGG - Chr8:83743760-83743779 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
TATCAAGGCCAGCTTATCAA+CGG - Chr8:83742964-83742983 MsG0880047245.01.T01:CDS 40.0%
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TCATGTGAGGCACAAGAATT+TGG - Chr8:83743205-83743224 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
TCTGGATCAACACATCTCAA+AGG + Chr8:83744678-83744697 None:intergenic 40.0%
TTGCTCCTTGAAGCAATTAC+AGG - Chr8:83744252-83744271 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
TTTGCTCCAAACAAAGAACG+GGG - Chr8:83742691-83742710 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
! ACTCATAAAAGAGCCGCTTT+GGG + Chr8:83742633-83742652 None:intergenic 40.0%
! AGAGTGGAATTTGAGGCTAT+TGG - Chr8:83743182-83743201 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
! AGTCGTAATGTGACTTTTGC+CGG + Chr8:83744022-83744041 None:intergenic 40.0%
! CGAACCACTTGACTCATTTT+TGG + Chr8:83744714-83744733 None:intergenic 40.0%
!! AGTAGCTTTTTGATAGCCAC+TGG + Chr8:83742994-83743013 None:intergenic 40.0%
!! GACTCGTGTAATGGGTATTT+GGG - Chr8:83744038-83744057 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
!! TTTGGACTAGCCAAGTTACT+TGG - Chr8:83743994-83744013 MsG0880047245.01.T01:intron 40.0%
AACTTGGAGCAATGGCTTCA+TGG - Chr8:83743703-83743722 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
ACGAATAGTCATCCCCAAAG+CGG - Chr8:83742617-83742636 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
AGCATAGAGGTGACTCATCA+CGG - Chr8:83743351-83743370 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
AGGCGATGGTGAAGTTAAGA+AGG + Chr8:83742820-83742839 None:intergenic 45.0%
AGTGGTTCGCATGCTTGAAT+CGG - Chr8:83744725-83744744 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
ATCAAGGCCAGCTTATCAAC+GGG - Chr8:83742965-83742984 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
ATGGATAACCTATGGCTCAG+GGG + Chr8:83742557-83742576 None:intergenic 45.0%
ATTCCAAGTCCAACGGAAGA+AGG - Chr8:83745074-83745093 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCTTCTTCCGTTGGACT+TGG + Chr8:83745080-83745099 None:intergenic 45.0%
CATCCAGATTCCAAGTCCAA+CGG - Chr8:83745067-83745086 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
CCAACGGAAGAAGGAATCAA+AGG - Chr8:83745083-83745102 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTGATTCCTTCTTCCGT+TGG + Chr8:83745086-83745105 None:intergenic 45.0%
GACATATCGATACCACCAGA+AGG + Chr8:83742493-83742512 None:intergenic 45.0%
GACTCATAAAAGAGCCGCTT+TGG + Chr8:83742634-83742653 None:intergenic 45.0%
GAGTCAAAAGGGCTCGTTTA+AGG + Chr8:83744656-83744675 None:intergenic 45.0%
GATGGTAGGTAATAGGCATG+CGG - Chr8:83744584-83744603 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
GATGGTCTCGTCTCAATGTT+TGG + Chr8:83744624-83744643 None:intergenic 45.0%
GCTCCAGAATATGCCAATTC+TGG - Chr8:83744189-83744208 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
GGGGAATATAGCAGTCAATC+AGG - Chr8:83742710-83742729 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
GTTATCTTACATGGGATGCC+CGG - Chr8:83743743-83743762 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
TCCCAATCAGGTGAAGAAAG+CGG - Chr8:83742767-83742786 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
TGAGAAATCGGTCAACTTGC+AGG + Chr8:83744945-83744964 None:intergenic 45.0%
TTGAGGCTATTGGTCATGTG+AGG - Chr8:83743192-83743211 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
! AGTTGACTGGCTGAAGATGA+TGG - Chr8:83744566-83744585 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
! CTCATAAAAGAGCCGCTTTG+GGG + Chr8:83742632-83742651 None:intergenic 45.0%
! TTGCACACTGCTTTGAGTAC+TGG - Chr8:83743600-83743619 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
!! CGACTCGTGTAATGGGTATT+TGG - Chr8:83744037-83744056 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
!! CGTTTAAGGGCACTTGTTGA+TGG + Chr8:83744642-83744661 None:intergenic 45.0%
!! GGGACACTGGTTTACATTGA+GGG - Chr8:83742873-83742892 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
!! TAATGCCAGAAGTACTGACG+TGG - Chr8:83745006-83745025 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGGACACTGGTTTACATTG+AGG - Chr8:83742872-83742891 MsG0880047245.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGCATTGAAGGCACTCAC+AGG - Chr8:83743243-83743262 MsG0880047245.01.T01:intron 45.0%
ACTTCACCATCGCCTTTGTC+TGG - Chr8:83742825-83742844 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
AGGTAATAGGCATGCGGAAG+AGG - Chr8:83744590-83744609 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
CCAATCAGGTGAAGAAAGCG+GGG - Chr8:83742769-83742788 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
CCATCCAAGGTGAGAGAACT+CGG + Chr8:83742855-83742874 None:intergenic 50.0%
CCCAATCAGGTGAAGAAAGC+GGG - Chr8:83742768-83742787 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
CCCGCTTTCTTCACCTGATT+GGG + Chr8:83742771-83742790 None:intergenic 50.0%
CGAGTTCTCTCACCTTGGAT+GGG - Chr8:83742853-83742872 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCGTTGGACTTGGAATC+TGG + Chr8:83745073-83745092 None:intergenic 50.0%
GAACTCGGAAGACCAGACAA+AGG + Chr8:83742840-83742859 None:intergenic 50.0%
GCTTATCAACGGGAATCCAG+TGG - Chr8:83742975-83742994 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
GTAAACCAGTGTCCCATCCA+AGG + Chr8:83742868-83742887 None:intergenic 50.0%
TAATAGGCATGCGGAAGAGG+TGG - Chr8:83744593-83744612 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
TACTGACGTGGAGACGCAAA+AGG - Chr8:83745018-83745037 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCCGAGTTCTCTCACCT+TGG - Chr8:83742848-83742867 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
TTTGCCGGCACCAAGTAACT+TGG + Chr8:83744007-83744026 None:intergenic 50.0%
! CTGGATTCCCGTTGATAAGC+TGG + Chr8:83742975-83742994 None:intergenic 50.0%
! GACTGGCTGAAGATGATGGT+AGG - Chr8:83744570-83744589 MsG0880047245.01.T01:CDS 50.0%
!! AATGGCTTCATGGTGCCATG+CGG - Chr8:83743713-83743732 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
!! CTAGCCAAGTTACTTGGTGC+CGG - Chr8:83744000-83744019 MsG0880047245.01.T01:intron 50.0%
AGAAGGCCTGTGCGCAGAAA+CGG + Chr8:83742803-83742822 None:intergenic 55.0%
CCCCGCTTTCTTCACCTGAT+TGG + Chr8:83742772-83742791 None:intergenic 55.0%
CCGAGTTCTCTCACCTTGGA+TGG - Chr8:83742852-83742871 MsG0880047245.01.T01:CDS 55.0%
CGTCTCCACGTCAGTACTTC+TGG + Chr8:83745014-83745033 None:intergenic 55.0%
CTAAGTCCGTTTCTGCGCAC+AGG - Chr8:83742794-83742813 MsG0880047245.01.T01:intron 55.0%
GACATACCTCAGCTGCTGAG+CGG + Chr8:83744299-83744318 None:intergenic 55.0%
GCTGAGCGGCTATAATCCAC+TGG + Chr8:83744285-83744304 None:intergenic 55.0%
GGAAGACCAGACAAAGGCGA+TGG + Chr8:83742834-83742853 None:intergenic 55.0%
TCTCACCTTGGATGGGACAC+TGG - Chr8:83742860-83742879 MsG0880047245.01.T01:CDS 55.0%
TGACGTGGAGACGCAAAAGG+AGG - Chr8:83745021-83745040 MsG0880047245.01.T01:CDS 55.0%
TGTTTCAGGATCGCAGACGC+AGG - Chr8:83744978-83744997 MsG0880047245.01.T01:CDS 55.0%
TTATAGCCGCTCAGCAGCTG+AGG - Chr8:83744290-83744309 MsG0880047245.01.T01:intron 55.0%
!! CATGGTGCCATGCGGCAATA+TGG - Chr8:83743721-83743740 MsG0880047245.01.T01:intron 55.0%
GCTTGCTTCCCCTGAGCCAT+AGG - Chr8:83742546-83742565 MsG0880047245.01.T01:CDS 60.0%
TAGGCATGCGGAAGAGGTGG+TGG - Chr8:83744596-83744615 MsG0880047245.01.T01:intron 60.0%
!! GACGCTGCTGACTCCCAATC+AGG - Chr8:83742755-83742774 MsG0880047245.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

>MsG0880047245.01.T01

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Protein sequence

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