AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene02609


Find 192 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr3.3 gene 74702427 74711924 74702427 ID=MS.gene02609
chr3.3 mRNA 74702427 74711924 74702427 ID=MS.gene02609.t1;Parent=MS.gene02609
chr3.3 exon 74702427 74703303 74702427 ID=MS.gene02609.t1.exon1;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 CDS 74702427 74703303 74702427 ID=cds.MS.gene02609.t1;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 exon 74704160 74704342 74704160 ID=MS.gene02609.t1.exon2;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 CDS 74704160 74704342 74704160 ID=cds.MS.gene02609.t1;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 exon 74710722 74711170 74710722 ID=MS.gene02609.t1.exon3;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 CDS 74710722 74711170 74710722 ID=cds.MS.gene02609.t1;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 exon 74711238 74711924 74711238 ID=MS.gene02609.t1.exon4;Parent=MS.gene02609.t1
chr3.3 CDS 74711238 74711924 74711238 ID=cds.MS.gene02609.t1;Parent=MS.gene02609.t1
Gene Sequence

>MS.gene02609

ATGGATGTGCACTCAAAACAGCTGCTGCTAATGGTGGTTGCTGTCATTTATACAAAAGCAGCGACTCAACCGGTGTCACTACCAAACTGCCCAACAAAGTGTGGCTCCATCACCATTCCCTTCCCATTTGGAACCACCAATAATTGTTCTCTAGACAATACCTTTCTCATTGATTGCAACAAAACATCTACCTCAACACACGTACCATTCTTGCCACAGAGTAATCAAAGTGTTCTAAACATCTCACTCGATGGTGAACTGCATGTTGCATGGCCAATAGGCAGTGATTGCTACGCTGAAAAGGGTAAACTGGTGAACCAAACATATCCGGGCATCAACATGACACATTTTCAAATCTCACCAACTGAAAACAAGTTGATAGCAGTTGGTTGTGACACAGTTGGAATATTCTCAGCAATTGATTCTGGGGGAAACAACTACACCACAGGATGCGTGGCTTTGTGTAATAGGTTTAGTGATATATTGGCCAATGAATCTTGTTCCGGCACTGGCTGTTGTGAAATTTCAATACCCCAAGATCACGTGTTTACTAGAGTAGACTATGGTTCTGGAGCCATAACTAATCACTCAGCAGTACATGACTTCAATCCATGTGGTTATGGTTTTTTGGTCGAAAATGGAGCCTACAACTTTTCATCCGCAGACCTCCTCAAGTTGGAGAAGGAAGAGTTTCCTGTGTTGTTGGATTGGGCAATAGGGAACCAAACGTGCGAGCAAGCTCAGAAGGACTTTTCAAGTTATGCTTGTAAGGCAAACAAAAGTATATGTTATGATGCAGCAACCGACAGATCTGGTTACCTTTGCAGATGCTTTCAGGGATATTGGGGAAATCCTTACCTCATTAACGGTTGCCAAGGTATTATATATATTTTATCTCTTGTCTGGATCATAATTTTGAGACATTTGTATGATTCTGCTCATCAAAATATAATTTTATTGGAGAAATGAAGAAATGTGACTTCATTGATCCATACTTTATATTATCTATATAAAATGTTACCGTCAACGGTTGTAATGAAATATGGATAGGTTTCTCATACGAATAGCGACAATATTGAGGGTGTCAAACGGACACCTATATGTGTCCTGTAGAAATATAGAAACAAATACGTGACTTTCAAAGACATTGATGAGACTTGTGATTATAAATTCATCTCTGAACTTAGACATGGCCGAGTCAAAATAACTTACAGTTGGCTCTTAATCAAGCAAGCTTCCATATATTTTTTTTTTTTTATCATTTTAATTTTTCTATATTTTTTTGTACGAATTTTCAATTTTCCTGGCTAAATTGGATTTATTCAAATTTTACATAATAAAAGATAACCAGTGAAGTGCCTCAAAATCTGTTACAAGCCGATATGCTATAGTATTTGGATTTAGAGTCGGTTACAATTCAGTTACATCAGTTTATGGCCATTATCGATTTAACTGATTCACTTGGGACTGCTATTAGTTCAGAGTTTGTATTCATGGGTCTATATAAATAGCGTAAGGTATCTCTATAGATGTGAAAAATTTAAGAGTCTAAGAAATATAGATATATGAGGCGTATTTATTCAACTCTCGCGTGAAAGAAAAAAAAAATTGAGTGGTTGAGGGATCAAAGGGAAGTGTGAAAATAAGCGTATCCATAACAGTAACTATTGTTCTTGGAAAACTCCATTGTCCATTGTGAAAACATAAATCAAAACTGACAAATTATCCTTTAGATATTAATGAATGCATGGAGTTCAATGACTGTGTTCCGGAGGCAACATGCATCAATCTTCCTGGAAGCTACCATTGTTTATGCCCGACGGGATATGAGGGAAACGGGAAGATGAATGAAACAAGCTGCAGTCCAAGATCCAGTGCCAAATCAAGGAAGGAGATCATATTGATCATTGCATTGAGTGAGTACAATACACTCTATTTTCGATTTCAATTCATTATCATTGCATTGAGTGAGTACAACACCTTCTATTTTCGACTGCCAACATGTTTAATATCAGAAAGAAAATTGTTAAAACTTGAAAGACATTTTATTAGAAAAAAAACAACATTAATCCTTGTTGGAACATGTGTGGAAATTGAGTTAAAAGACTAAACACAAATTCCCATGTTGGGTAGAACTAGTGTTGTGTGAATTGAAAAAAGTGGAAGTCCCACATCGGATGGAACACACACATTAGTAGTGTTTATATAGTGGGGGTGTACCTCTAATTAATGGGGGTACATAAGCACTAGAGAAAAAATATATATTGATATATATTTTATTATTTGGAAATGATAAATTTAATCATTATTAGAAAGTGCTTTCTTAGTCCCCAAGTTTTGCTAAAATATTTTGGTACATAATATAATATATTTTTGTACTAAATTTAATATATTTTAGTACTCAATTAAGATATTTTTGTACTAGATCTAATATGTGAATTACTTAATCGCAAAGTAATATGTTACTTGTTCCCAAAGTTTCTCATATTACTTGTTCCCAAAGTTTCTCACTTATTAGTTGTGAGTTTTCCCTATAAATAGAGAACTCACATAGTGCATTCCACACACCGAAAAGAATTTCATTGAGTTGTCGGGAATTCTTTTCTTCTCTTCTCCCTCCGACTTGTGTTAACAAGTTTCTTCTGCTTCTACTCCTTTCTGTCCCTTTCGGTTTCAAATAGAGCGGTTACGTACCGTATCGAGTGGCTTCGATCAATCGATTGAACCATATTTTTAAGAGTGTTCTTAAGACCATAGTCCCTGTTCGGTTTAATGTCCCTTCGGAATTAAGAGTGGTCTTAAGTTCATAGTCCCTTTCGATAATATATGTCCCTTCAGAATAAAGAGTACGATTAAGATCATAGTCCCTTTCGTAATAATAATGTCCCGTCGGAATTATGAATGATCTTAACAGTATATAAATTATTTAAATATTTTTCTATTTGAGGAGAAATGGTGGTATCACCATATTTGAGTGGTCGTAATACCATATTGAAAGTTTGGAGAACTTAAAGGTTAGAATGGTGGAAACACCATATTTGAGTGGTCTTAGCACCATAATAGAATGGTAATAATACCATATTAAAGTGGTTTCAGTATTAAAGAGTGGTCTTAGTACCATATTTGACGGTGTAATTCTCGAACGATTTTCTACAGTGCAGTAGTTAATCGAACAGTTGTAGCTGGGCTTGTTTTATCCTGGAGGCGGCGTGGTTGATAGTCTACCTTGCACAATTTTGGGTAGTGCCACGAAACGTCTTAAAGAGAGCGACCTGGTCGTGACTCAACCTAGTAACAACTTCGGTAGATAATAGAATTTGGAAATCCAAATACAACAGTTTGGAAATCCAAAAACAACAATTTTAAGACGTTTGGTACTGCTATGTCTACCGAAGAAGTTACTTATTGAGGTTAAGTTGTCCCTAAATACATTAAGGATAAATCTGGCTATATAGAATTACATCTTTCGACTGAAACTATGAAGTGGTTGTTTTTATAACAATAACACAAAGCATCACTAATATGCTAAAGATTAGTAATATTAGTTATTTGTTGGAACATACATCAATATTAGATTGAAGCTTGCATTGACTTCGGGAGCAGGCATAGCTTAGCACGTTCATACGTACGTTTCTTATTGGAGCAATCAACGTGAGCTTTGCTTGCAGCTTTTTTGTTTGAAAATTAATAGACAAAAAGGTATCTAAGACTAAGAGATGATCAAACATACCAGGTTGATTAAATCATGACTAGCGGATGTTACCCAAAAACAAAAGGAAAGCCTCTTCACTTATGACTGCTATAAATGTCATCGCGTATGTTTTGACATAGTTGAATCATTCTCTAGCACTTGATGTATGCTCCAAGAATAAGAAAGAATCTGAATTTCAGATTTCTATTGAATAAGACTGAGTTGACTCAGACTTAAAGAGAGACTTGTGTGTTATGCACTCTTGTTGGAAAAAGATGGCATGTTCAAAATTAAAATTCTCCTTCTATTTTATTAGTTGTGTGATTTTAATATTTGACTCATGAACAAGCGTTTAATTTTAAACTTGAGTAACTTGGATTTAATTCCAACGTTATATGATTAGACAATTTTATTTATTGCAGTCAAGATATATGAACCAAAAGTTCATATAAATCAGAATTTAGAGAATATGAATCTCTAAACATAATAAATTATGATATGTGTGAATTTGATGACACATAAATTAGAAATGATAAAATGATGTTTTTATCATATTTATTGATGACTGTGAATTTTGGAAAATAAAATTGATAAGCTTGATATGTTCAATTTTTATAACGAAAATTGAAATTTATAGAGTACTCAAGTCTAAGAACAAAAATTCTAATTAAGAAATTTTTGAAGAAAAGACAATCCAACTTGTCTTATTTTTGAACTTGGGATTGTCCGGACTATATTTGGCTTCAGGACCCCAAGAGAGTTAAACTCACTAGTAGAGCATATGAACGTGTATTCATTAGGTATGTTATAAATAACGAAGCATATAGGTTTTAGGACCTAAATGTTAAAGTGATCATAGAATTAAAAGATGCTGATTTCTATGAAGTAAGTACCCCTGTAAATTAAAGAATAGTGGGGGCACTAGTGGGGGTAAACTAAACTCCCTTCTAAAAATTAAGAACTAGTGGGGGCACTATATCTAATCACATTCATGTAATTAGAAATAGTTATGAAAACATCATACGAGATGTTATAGAACCTCAAGGAGGAAAGAAAGCTAAAATTGCTAAAGAGTATGAACTTGGTTTATACATTGGAAGAAGATTCATTAAGCCTTAAAGAAGTTATATCCTCATTGGATGCTGAATTATGGCAAAAAGCAATAAACGATGAAATGAATTTTCTAGAGTCTAACAAAACATGACACTTGGTTGTCTTGTCTCATAATTGCAAAATCAATCGGTTGTATTTGGATTTTGGAAAAAGGAACTAAAACCTGATGGTACGGTTGATGAATACAAGGCTTTCCTTGTAGTCAAAGGTTTTAGACAAAGAGAAAAATATAGACTTCTTCGACATTCATTCACCAGTCACGAAAATCATATCCATAAGAGTACTAGTCCATTTAGCCGTCGTTCATAACTCGATAGTACTCCAAATGGATGTGAAAGTTGCCTTCTTTTTTTTATGGTGAATAGAAGAAGAATTCTATATTAGACAACCTGAAGGTTTTGTGATTCATGGACAAGAAAACAATGTCTGTAAGTTAGATAATTCTTTGTATGGTCTAAAATAAACTCCTGAGGAATGGCATGAAAAATTGGCATTCTAATGCTATCGAATGAGTACAAAGTGAATGAAATTGACAAATAATATTTACACGATCATATGTCTCTATGAAGACAACTTGCTCATATTTGGTTTAAAGATTCATGTTATGAATTATGTGAAATCATTGTTTATCAACAACATTGATAAGAAAGACCTAGACAAAGTTGAAGTAATTCTTGGTTTCAAGATTACTAGATCATAAAAGAGAACCTTTTTGATAAATCTCACAAAGTTGAGAAGATCTTAAGGAAATGTAATTATTTCACCGTAAACTTGCAATCATATATTATGATCAAGTGTAAGAACACTTGAGATGGAGTTAGAAAAACTGATGCGAGCATCATTGGCAATACTTAGGTATGTCACTGAATGTATTAGACCCGACATTGCCGATGTCGTAAACCTCTTGTGCAAGTTTACTAGTAGACGGATGAGAAGCATTGTCATGCTATAGAAAGAGTCATGAGGTGCCTTAAGAAGACTATGACTCTAGAATTACTTCATGAGGAGTAACCTATTGTACTTAAATGGTACAAGATATAAAATAGAACATCTTTCAGATGAATATTTAGCGACTAGTGTTTGCATATTGAGCATCACTAGAGAAGTTATTTGTTGAAACAAATGATATTGACTCAGTCCACTATGGAATGAATCTGAGATGAGAACACTAGAGAAAACTAGTGAAGAAGCAAGTTGATAAGATACTTGCTAGTTGAAATCCCTTAGTGGATAAAACCGTTTCCAGAAGTGTACGTTAATTTATTGTGATAGTCTGCAGCTATTACAAAATTGAGAATCGTTACCACAATGGTAAGAGGCGATTATTAAGGCACGAACACATAGAGAAATAGAGAGCTAGCTACTCTCAAAAGGAACGGTTAAACTAGATCATGTACGTACTGATAAAGAATTAGTTAATCCTTTGACGAAAGGAATTACTAAAAAGAAAGTCCTAAACACATCCAATAGGATGGGACTTATGCCCAAAGGTCACAAGTGATGGTAACCCGACCTACATGACTGGAGATCCCAAGAAATAGGTTCAATGGGTAATAACAAGTCACAAGTGATAGAACATGCTATGATAAAAGTAAGAAAGCATGATTCCTGCAGTGCAGTGATAGAAGGATGAGATAATAGAAACTCTTAATGAGATCTATACTCTATATGGAGTGGAGTACATAGCTACAGGAGTACTCTTGATAGACTCACCTATACGAATGTGGAACTAAGGGCCGGTTCCTATGGGATTCGGGGCAGAATACCTAGAGCGTTCGTTAAAACCGGGATACACGTGCAAGGCCATAAACGCACGGGCTTTTAGAATACACCTTATGAAAAGGTTTGTGTGTGAGTTCTATGTCTGAGATAGAGTTCAATGCTGTAAGCAACTCTTGTTAATCAGAATTTTACTCGCTATGCAAAGGTTCAAGTTGTAAGCGACACCTTTGTTTACTAGCAAATCTTATGGAGACGTTTTTGACGTTACTTCTGAAACCATTTTTTAAATTCAAGTGGGGGATTGTTGGAACATGTGTGGAAATTGAGTTAAAAGACTAAACACAAATTCCCATGTTGGGTAGAACTAGTGTTGTGTGAATTGAAAAAAGTGGAAGTCCCACATCGGATGGAACACACACATTAGTAGTGTTTATATAGTGGGGGTGTACCTCTAATTAATGGGGGTACATAAGCACTAGAGAAAAAATATATATTGATATATATTTTATTATTTGGAAATGATAAATTTAATCATTATTAGAAAGTGCTTTCTTAGTCCCCAAGTTTTGCTAAAATATTTTGGTACATAATATAATATATTTTTGTACTAAATTTAATATATTTTAGTACTCAATTAAGATATTTTTGTACTAGATCTAATATGTGAATTACTTAATCGCAAAGTAATATGTTACTTGTTCCCAAAGTTTCTCATATTACTTGTTCCCAAAGTTTCTCACTTATTAGTTGTGAGTTTTCCCTATAAATAGAGAACTCACATAGTGCATTCCACACACCGAAAAGAATTTCATTGAGTTGTCGGGAATTCTTTTCTTCTCTTCTCCCTCCGACTTGTGTTAACAAGTTTCTTCTGCTTCTACTCCTTTCTGTCCCTTTCGGTTTCAAATAGAGCGGTTACGTACCGTATCGAGTGGCTTCGATCAATCGATTGAACCATATTTTTAAGAGTGTTCTTAAGACCATAGTCCCTGTTCGGTTTAATGTCCCTTCGGAATTAAGAGTGGTCTTAAGTTCATAGTCCCTTTCGATAATATATGTCTCTTCGGAATAAAGAGTACGATTAAGATCATAGTCCCTTTCGTAATAATAATGTCCCGTCGGAATTATGAATGATCTTAACAGTATATAAATTATTTAAATATTTTTCTATTTGAGGAGAAATGGTGGTATCACCATATTTGAGTGGTCGTAATACCATATTGAAAGTTTGGAGAACTTAAAGGTTAGAATGGTGGAAACACCATATTTGAGTGGTCTTAGCACCATAATAGAATGGTAATAATACCATATTAAAGTGGTTTCAGTATTAAAGAGTGGTCTTAGTACCATATTTGACGGTGTAATTCTCGAACGATTTTCTACAGTGCAGTAGTTAATCGAACAGTTGTAGCTGGGCTTGTTTTATCCTGGAGGCGGCGTGGTTGATAGTCTACCTTGCACAATTTTGGGTAGTGCCACGAAACGTCTTAAAGAGAGCGACCTGGTCGTGACTCAACCTAGTAACAACTTCGGTAGATAATAGAATTTGGAAATCCAAATACAACAGTTTGGAAATCCAAAAACAACAATCCTTGTTGTGAATTGTTGTTCTGAACTGAAACTCAAAGCCAAGGAATTCAGTCCTTCAAGACCAGAACAATAGCATTTTGAGATTTTGACTAATGTATTTGAATACATGAAGTTGACTTTGAACATCCACAAAGCATAGCAGAAAGAAAATGATTATGTTTCCATTTGTTTATGTTCAGGTGTCAGTGTAAGCCTCGTAGCACTGCTCATTGGAAGCTTTTATGCATATTTAGCATTCAAGAAAAGAAAGTTCATTAAACTTAAGGAACATTTTTTTCAACAAAATGGTGGCTTACTGTTACAACAACAGATAGGGAGGCACAGAGGGTCAACTGAAATAGCTAAAGTCTTCAAAGTTGAGGAGCTAAAAGAAGCAACCAACAACTTCGATGAAGGCAAGATCCTAGGCCAAGGTGGTCAGGGTATTGTTTACAAAGGAGTTTTACAAGATAACAGAATTGTAGCAATAAAAAAATCCAAAATCAGTGACCCAAACCAGATTGAGCCGTTCATCAATGAAGTGGTCGTTCTTTCCCAAATCAACCATAGAAATGTGGTAAAGCTTTTGGGCTGTTGTTTAGAGACAGAAGTTCCGTTACTTGTTTATGAATTTATTCCCAATGGTACTGTTTATGAGCATATTCACGATCAAAACCAATCTATAAAGCTTACATGGAAAGCAAGATTAAGAATAGCAAAAGAAACAGCTGGTGTCCTGGCATACTTACACTGCTGCTTCTACGCCAATCATACATAGAGATGTGAAGTCTACAAATATACTCCTAGACCACAATCTCACTGCAAAGGTTTCTGATTTTGGAGCTTCAAGGATTGTTCCTCTTGATCATAGTCAGATAACCACTCTAGTGCAGGGGACATTAGGGTATCTTGACCCAGAGTACTTCCTCACAAGCCAGTTAACAGAGAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGGGTGGTCCTAGCAGAGCTGCTGACAGGGAAAAAGGCACTATCTTTGGTCAGGCCAGAGGTTGATAGAAACCTTGCCGCGTACTTTGTTTCTTCAATGAAAGAGGGTCAGTTAGTTCATATTTTGGACAAAAATATAGATGAGGCAAATATTGAGCAATTAAAGGAGGTTGCCCATATTGTAGAGCGGTGTTTAAGGGTGAAGGGTGAGGACAGACCAACCATGAATGAAGTGGCAATGGAATTAGAGGGAATACTAGTTATTGAAGAGCGTCGTTGGGGAAGCGACAATTTATCTTCAGAAGAGACTGAAAACTTGCTTAAAACAACACGGTCAATTAAAAACGTTGAAGATGTCGTTGGTGGAAGTGGCATTAGTTCTTTTGAATCATATAGCTTAAACCAGATTTCAATGTCTTTGATTGGTGGGAGATGA

Protein sequence

>MS.gene02609.t1

MDVHSKQLLLMVVAVIYTKAATQPVSLPNCPTKCGSITIPFPFGTTNNCSLDNTFLIDCNKTSTSTHVPFLPQSNQSVLNISLDGELHVAWPIGSDCYAEKGKLVNQTYPGINMTHFQISPTENKLIAVGCDTVGIFSAIDSGGNNYTTGCVALCNRFSDILANESCSGTGCCEISIPQDHVFTRVDYGSGAITNHSAVHDFNPCGYGFLVENGAYNFSSADLLKLEKEEFPVLLDWAIGNQTCEQAQKDFSSYACKANKSICYDAATDRSGYLCRCFQGYWGNPYLINGCQDINECMEFNDCVPEATCINLPGSYHCLCPTGYEGNGKMNETSCSPRSSAKSRKEIILIIALSVSVSLVALLIGSFYAYLAFKKRKFIKLKEHFFQQNGGLLLQQQIGRHRGSTEIAKVFKVEELKEATNNFDEGKILGQGGQGIVYKGVLQDNRIVAIKKSKISDPNQIEPFINEVVVLSQINHRNVVKLLGCCLETEVPLLVYEFIPNGTQKKQLVSWHTYTAASTPIIHRDVKSTNILLDHNLTAKVSDFGASRIVPLDHSQITTLVQGTLGYLDPEYFLTSQLTEKSDVYSFGVVLAELLTGKKALSLVRPEVDRNLAAYFVSSMKEGQLVHILDKNIDEANIEQLKEVAHIVERCLRVKGEDRPTMNEVAMELEGILVIEERRWGSDNLSSEETENLLKTTRSIKNVEDVVGGSGISSFESYSLNQISMSLIGGR