AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene24536

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GCTTGACGTAAACGATATAA+TGG 0.357113 1.2:-5905450 None:intergenic
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AATGTTTCTGTGATTCCTTT+GGG 0.381600 1.2:+5906128 MS.gene24536:CDS
GGTTGTAAAATGGGAGATAA+AGG 0.383106 1.2:-5906764 None:intergenic
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GGGGCAGAAGCCTGCTGGTC+GGG 0.389223 1.2:+5905941 MS.gene24536:CDS
CACAGAAACATTTGGAAAAC+CGG 0.393418 1.2:-5906117 None:intergenic
CATTGAATGGTGTTTGGGTG+GGG 0.394694 1.2:+5905592 MS.gene24536:CDS
ATAGTAGAGGCAACGAAGTC+GGG 0.395260 1.2:+5906723 MS.gene24536:CDS
AGCGGGAGGAGGCTAGGGTT+AGG 0.395735 1.2:+5905292 MS.gene24536:CDS
ATCTTAGGAACTCTTTCAAA+AGG 0.395819 1.2:-5895349 None:intergenic
TACAAGCATTGAATGGTGTT+TGG 0.397248 1.2:+5905586 MS.gene24536:CDS
CCGATATCTGCCACCCTGGC+TGG 0.398507 1.2:-5905090 None:intergenic
AAAGGAATCACAGAAACATT+TGG 0.400967 1.2:-5906125 None:intergenic
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CGGGGAGTGTGTTGGCAAAT+CGG 0.432852 1.2:+5900827 MS.gene24536:CDS
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GGAGCTTGGATTCGTGTATA+CGG 0.441606 1.2:+5906284 MS.gene24536:CDS
TGTTGTACAGAAGGGGCATC+AGG 0.442329 1.2:+5905755 MS.gene24536:CDS
TTTGGTGTCAGACACCCTTC+GGG 0.449754 1.2:-5926576 None:intergenic
ATTCCTGACCGCGAGAGTTA+CGG 0.451024 1.2:-5905518 None:intergenic
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TATTCTGTAACTTCCACAAC+TGG 0.451998 1.2:+5906234 MS.gene24536:CDS
TGTCAGTGAGGGAGTTAGAA+AGG 0.452072 1.2:+5905829 MS.gene24536:CDS
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AAGAGGATCAGATGGTCATC+GGG 0.454055 1.2:+5905194 MS.gene24536:CDS
GTACAGAAGGGGCATCAGGC+GGG 0.454071 1.2:+5905759 MS.gene24536:CDS
CAAAATATACATACCTGACT+AGG 0.457704 1.2:-5895529 None:intergenic
AACAGATGAAGGAGGAAACT+TGG 0.460141 1.2:-5895488 None:intergenic
CTGAAGGTGGGAGTGGAGAA+GGG 0.464334 1.2:+5905699 MS.gene24536:CDS
GTCTTTCCAACAAAGAATAG+AGG 0.468094 1.2:+5906091 MS.gene24536:CDS
CAATAGAATAAACCGCTCAT+TGG 0.469034 1.2:-5900500 None:intergenic
GTCAGTGGTGGTGTCAGTGA+GGG 0.469998 1.2:+5905818 MS.gene24536:CDS
CCGGATCGTTTGTTGTCGTA+AGG 0.470228 1.2:-5926656 None:intergenic
GGAAACTTGGCTTGATAAGA+AGG 0.470311 1.2:-5895475 None:intergenic
AAGGCTGCACCGATGCTTCA+AGG 0.470358 1.2:-5906841 None:intergenic
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CGGGGAGCGGCGACAAGCAA+TGG 0.472294 1.2:+5905213 MS.gene24536:CDS
TAAGAGACAAATCCCTAGTC+AGG 0.472658 1.2:+5895516 MS.gene24536:CDS
GGAGGAAAGGCGGATGTGAT+GGG 0.473137 1.2:+5905921 MS.gene24536:CDS
CAAGGTCCCTGGTTGGTGCA+AGG 0.473171 1.2:-5906860 None:intergenic
AACAATGAAGCTCGGTTCAG+AGG 0.474574 1.2:+5905866 MS.gene24536:CDS
TGATGCTTTCGTTAGGCAGC+GGG 0.475240 1.2:+5905275 MS.gene24536:CDS
GCCAGGGTGGCAGATATCGG+GGG 0.476743 1.2:+5905093 MS.gene24536:CDS
GGAGCATAACTTGGGTGGAT+TGG 0.479204 1.2:+5900848 MS.gene24536:CDS
GTTCTTCTACACTGCACTGA+TGG 0.480543 1.2:+5906161 MS.gene24536:CDS
TTCGATATGAACGTGGAGCT+TGG 0.481320 1.2:+5906270 MS.gene24536:CDS
GGAGCTACTGCTGTCGAGAT+TGG 0.481790 1.2:-5906785 None:intergenic
GCTTGAATGGTTAACATGGT+TGG 0.484426 1.2:-5900805 None:intergenic
CGATATAATGGCATATTCTC+CGG 0.484470 1.2:-5905438 None:intergenic
GGAGGAAAGGAAGGGAGGAA+AGG 0.485175 1.2:+5905908 MS.gene24536:CDS
TGAATGGCACGCAGCTGACT+TGG 0.485389 1.2:+5905362 MS.gene24536:CDS
GGGTCGGGGTCCAGCCAGGG+TGG 0.485475 1.2:+5905080 MS.gene24536:CDS
ACACCGTAACTCTCGCGGTC+AGG 0.488737 1.2:+5905515 MS.gene24536:CDS
GCATTGAATGGTGTTTGGGT+GGG 0.489554 1.2:+5905591 MS.gene24536:CDS
AACGTGCTGGTTTGGAACAA+TGG 0.490018 1.2:+5895239 MS.gene24536:CDS
GAAGGGTTGGATGAGGTTCA+AGG 0.490807 1.2:+5906602 MS.gene24536:CDS
GATTCTCTCTGATTTGTATG+TGG 0.491094 1.2:+5905488 MS.gene24536:CDS
GAAGGTGGGAGTGGAGAAGG+GGG 0.492569 1.2:+5905701 MS.gene24536:CDS
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GTAGGAGTGGCGGAATCCAT+TGG 0.495462 1.2:+5905001 MS.gene24536:CDS
TCGAGGGAGGAAAGGAAGGG+AGG 0.496459 1.2:+5905903 MS.gene24536:CDS
AATAGTAGAGGCAACGAAGT+CGG 0.496668 1.2:+5906722 MS.gene24536:CDS
CCACATTTCTTATGCGCTGA+AGG 0.497218 1.2:-5907013 None:intergenic
GAATTATGACATTAATATTG+TGG 0.499277 1.2:+5906487 MS.gene24536:CDS
GAATCCATTGGGCTAGTCAA+TGG 0.499467 1.2:+5905013 MS.gene24536:CDS
TTGGCTTGATAAGAAGGAGT+TGG 0.500843 1.2:-5895469 None:intergenic
GTTTGTTGTCGTAAGGTTCG+TGG 0.502488 1.2:-5926649 None:intergenic
CGTCCTCTTCCGTATGGACC+AGG 0.503162 1.2:-5900613 None:intergenic
TGGATGAGGTTCAAGGCGAA+TGG 0.503373 1.2:+5906609 MS.gene24536:CDS
CGTAAGGTTCGTGGTGGTCG+TGG 0.503726 1.2:-5926640 None:intergenic
GGCTGAGGAGCAGAAGGTTA+CGG 0.504293 1.2:+5905791 MS.gene24536:CDS
TACAGAAGGGGCATCAGGCG+GGG 0.504789 1.2:+5905760 MS.gene24536:CDS
ACAAGAAGTTGCTGAAGAGC+TGG 0.505762 1.2:-5906987 None:intergenic
GAGGGCATGCAAGGCCTACA+TGG 0.507583 1.2:+5921611 MS.gene24536:CDS
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TTTGGGAGAGGTTTCTGAAA+GGG 0.509717 1.2:+5895416 MS.gene24536:CDS
TTCTTCTACACTGCACTGAT+GGG 0.510273 1.2:+5906162 MS.gene24536:CDS
CCAGGGTGGCAGATATCGGG+GGG 0.511049 1.2:+5905094 MS.gene24536:CDS
CCAAAGAATCAGACCAGTTG+TGG 0.511260 1.2:-5906247 None:intergenic
ACGGTATTCCTGTACATGCT+TGG 0.511403 1.2:+5906303 MS.gene24536:CDS
AGGAATGGGGATGTAATTTG+GGG 0.512409 1.2:+5906510 MS.gene24536:CDS
GTAGAGAGGGATACATGATT+CGG 0.512493 1.2:-5900524 None:intergenic
TAGGAGTGGCGGAATCCATT+GGG 0.513148 1.2:+5905002 MS.gene24536:CDS
TCTCCGGCAGAGAGACATCA+TGG 0.514181 1.2:+5905054 MS.gene24536:CDS
GAGGCAATGGTCCTTTAGTA+AGG 0.515491 1.2:-5895384 None:intergenic
CATGCAAGGAGGATCGAGAA+TGG 0.518288 1.2:+5906021 MS.gene24536:CDS
GTCAAGCCTTTGAAGTCTGT+GGG 0.518358 1.2:+5905466 MS.gene24536:CDS
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TTATCATTCCAAGCATGTAC+AGG 0.519718 1.2:-5906311 None:intergenic
GTCGAGATTGGTTGTAAAAT+GGG 0.520887 1.2:-5906773 None:intergenic
ACTCCCACCTTCAGCTCTGC+CGG 0.521962 1.2:-5905690 None:intergenic
CTAGACTGAATTTGTAGAGA+GGG 0.522832 1.2:-5900537 None:intergenic
ACGATCCGGAAGTTCGTTGA+AGG 0.523091 1.2:+5926670 MS.gene24536:CDS
CTTGCACCAACCAGGGACCT+TGG 0.523339 1.2:+5906861 MS.gene24536:CDS
ATGACTGAATTTATTATCGA+CGG 0.523600 1.2:+5906461 MS.gene24536:CDS
GCAGTTTGCACCCGACCAGC+AGG 0.526036 1.2:-5905951 None:intergenic
ATGGTAGCTCATATAAAGGC+GGG 0.526178 1.2:+5906056 MS.gene24536:CDS
CACACGTCCTCCCACAACAT+TGG 0.528505 1.2:-5905331 None:intergenic
GGTTCAAGGCGAATGGGAGT+TGG 0.528596 1.2:+5906616 MS.gene24536:CDS
TAATTATGAAGGGTTGGATG+AGG 0.529292 1.2:+5906595 MS.gene24536:CDS
CTGTCGTGTGTTGGCAAGAG+AGG 0.530207 1.2:+5905617 MS.gene24536:CDS
CTGTGGTGAGGTCTAGGAAG+AGG 0.530752 1.2:+5905133 MS.gene24536:CDS
AGCATTGAATGGTGTTTGGG+TGG 0.531805 1.2:+5905590 MS.gene24536:CDS
ATGCAAGGAGGATCGAGAAT+GGG 0.532320 1.2:+5906022 MS.gene24536:CDS
CAAGAGGATCAGATGGTCAT+CGG 0.532415 1.2:+5905193 MS.gene24536:CDS
CAACAAAGAATAGAGGATGC+CGG 0.533146 1.2:+5906098 MS.gene24536:CDS
ACAGAAGGGGCATCAGGCGG+GGG 0.533982 1.2:+5905761 MS.gene24536:CDS
CCTCAGAATATCACGAGCTC+TGG 0.534242 1.2:-5921592 None:intergenic
GGATGAGGTTCAAGGCGAAT+GGG 0.535007 1.2:+5906610 MS.gene24536:CDS
CAAGAGAGGCAAGGTTCGAT+AGG 0.536229 1.2:+5905631 MS.gene24536:CDS
TTGTAGCGTCCTCTTCCGTA+TGG 0.537017 1.2:-5900619 None:intergenic
TCTTAGGAACTCTTTCAAAA+GGG 0.537953 1.2:-5895348 None:intergenic
TAGGCAGCGGGAGGAGGCTA+GGG 0.538384 1.2:+5905287 MS.gene24536:CDS
TTCAGATTGCTGAGTGGGGA+AGG 0.538958 1.2:+5900422 MS.gene24536:intron
AATCAATGCTCCAAGGTCCC+TGG 0.540294 1.2:-5906871 None:intergenic
ACCGCGTCGGAGCTACTCTC+CGG 0.543162 1.2:+5905038 MS.gene24536:CDS
GGGAGTTAGAAAGGAAGAAG+AGG 0.543677 1.2:+5905838 MS.gene24536:CDS
TGAAGGTGGGAGTGGAGAAG+GGG 0.544252 1.2:+5905700 MS.gene24536:CDS
CTCTCCCAAACAGGTGCAAG+AGG 0.544373 1.2:-5895403 None:intergenic
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CCTTGCATGTCGTATATGCT+GGG 0.545996 1.2:-5906007 None:intergenic
AACGTTACAAAATGGCGTAA+AGG 0.547258 1.2:+5900664 MS.gene24536:CDS
ACCATGTTAACCATTCAAGC+GGG 0.549181 1.2:+5900808 MS.gene24536:CDS
TCAAGGATGATGCTTTCGTT+AGG 0.549185 1.2:+5905268 MS.gene24536:CDS
CGATGGAAATTCCAATGTTG+TGG 0.549562 1.2:+5905320 MS.gene24536:CDS
TGACTGAATTTATTATCGAC+GGG 0.550761 1.2:+5906462 MS.gene24536:CDS
CTGAAGAAGGAAAATCAAAA+GGG 0.552666 1.2:+5895071 MS.gene24536:CDS
TGGTTGTATAGATTCTGATC+CGG 0.552691 1.2:-5926604 None:intergenic
GGAACTGGATCGACAAGGAC+GGG 0.553509 1.2:+5905164 MS.gene24536:CDS
CAAGCTTGCCGTCCATATTG+TGG 0.554887 1.2:+5900711 MS.gene24536:CDS
CTTGTTCAGATTGCTGAGTG+GGG 0.555008 1.2:+5900418 MS.gene24536:intron
GAAGGTTACGGTGGGGTCAG+TGG 0.555754 1.2:+5905803 MS.gene24536:CDS
ATCAGATGGTCATCGGGGAG+CGG 0.555809 1.2:+5905200 MS.gene24536:CDS
GTGATGGGGCAGAAGCCTGC+TGG 0.555946 1.2:+5905936 MS.gene24536:CDS
AGGGCTTTGGCATCTGAAGA+AGG 0.556245 1.2:+5895058 MS.gene24536:CDS
GGTCAGTGGTGGTGTCAGTG+AGG 0.556330 1.2:+5905817 MS.gene24536:CDS
TATGTGTATCTGGCTTCGGT+CGG 0.556468 1.2:+5906345 MS.gene24536:CDS
GACTGCAACTGTTGTACAGA+AGG 0.556822 1.2:+5905746 MS.gene24536:CDS
TTTGATGATCCTGGTCCATA+CGG 0.557830 1.2:+5900604 MS.gene24536:CDS
GTCGTGGTTGTTCGCATCAG+TGG 0.558181 1.2:-5926624 None:intergenic
GATCCTGGTCCATACGGAAG+AGG 0.560466 1.2:+5900610 MS.gene24536:CDS
ATATTATGGATCAGATTTGA+CGG 0.562286 1.2:-5895271 None:intergenic
AAACTGTTACAAGCATTGAA+TGG 0.564926 1.2:+5905579 MS.gene24536:CDS
TGATATTCTGAGGGCATGCA+AGG 0.567559 1.2:+5921602 MS.gene24536:CDS
TGGATCGACAAGGACGGGAC+AGG 0.568590 1.2:+5905169 MS.gene24536:CDS
AAATCCAAATTCAGCTTCGT+CGG 0.569207 1.2:+5900577 MS.gene24536:CDS
AATGGCGTAAAGGCTCTCAA+TGG 0.571190 1.2:+5900674 MS.gene24536:CDS
CCAGAGCTCGTGATATTCTG+AGG 0.571288 1.2:+5921592 MS.gene24536:CDS
CAAACAGGTGCAAGAGGCAA+TGG 0.572308 1.2:-5895397 None:intergenic
CATTCAAGCGGGGAGTGTGT+TGG 0.572448 1.2:+5900819 MS.gene24536:CDS
ACTTGGGTGGATTGGTCTAG+AGG 0.573299 1.2:+5900856 MS.gene24536:CDS
GAACATACCGGCAGAGCTGA+AGG 0.573329 1.2:+5905683 MS.gene24536:CDS
TGTACAGAAGGGGCATCAGG+CGG 0.574312 1.2:+5905758 MS.gene24536:CDS
CCCCGCTTGAATGGTTAACA+TGG 0.575864 1.2:-5900809 None:intergenic
AATCAGAAAACTATATCAGA+AGG 0.576715 1.2:+5906902 MS.gene24536:CDS
TTCAAAATAATAATTATGAA+GGG 0.577830 1.2:+5906585 MS.gene24536:CDS
GAGGAAAGGCGGATGTGATG+GGG 0.578579 1.2:+5905922 MS.gene24536:CDS
TAAGATGGCTGAGGAGCAGA+AGG 0.580151 1.2:+5905785 MS.gene24536:CDS
GAAGATTCTTTCATGTCGGA+CGG 0.580156 1.2:+5906533 MS.gene24536:CDS
GGATAGGGGAAATTGGACTG+TGG 0.581156 1.2:+5905116 MS.gene24536:CDS
CGGAACTGGATCGACAAGGA+CGG 0.585403 1.2:+5905163 MS.gene24536:CDS
GCATGCAAGGCCTACATGGA+AGG 0.585478 1.2:+5921615 MS.gene24536:CDS
TCACAGTCACCTTGAAGCAT+CGG 0.586088 1.2:+5906832 MS.gene24536:CDS
GCACGCAGCTGACTTGGTGA+TGG 0.586502 1.2:+5905368 MS.gene24536:CDS
CCAGCACGTTCTTCAACACA+TGG 0.586978 1.2:-5895226 None:intergenic
ACTAACATCCATACCTCCAC+GGG 0.587678 1.2:-5921642 None:intergenic
GAGGAGGCTAGGGTTAGGAT+TGG 0.590450 1.2:+5905297 MS.gene24536:CDS
AACCATGTTAACCATTCAAG+CGG 0.590819 1.2:+5900807 MS.gene24536:CDS
AACTAACATCCATACCTCCA+CGG 0.591282 1.2:-5921643 None:intergenic
GGCAGAGAGACATCATGGGG+GGG 0.591782 1.2:+5905059 MS.gene24536:CDS
GACGTGTGGTGTCTGCTGAA+TGG 0.592213 1.2:+5905346 MS.gene24536:CDS
GTTGCCATTGACTAGCCCAA+TGG 0.592575 1.2:-5905017 None:intergenic
AACTATATCAGAAGGAGGTG+TGG 0.593462 1.2:+5906910 MS.gene24536:CDS
AAAATATACATACCTGACTA+GGG 0.593555 1.2:-5895528 None:intergenic
GAGAATCCCACAGACTTCAA+AGG 0.593598 1.2:-5905472 None:intergenic
CCTTACGACAACAAACGATC+CGG 0.594062 1.2:+5926656 MS.gene24536:CDS
CTAGTCAATGGCAACCGCGT+CGG 0.594222 1.2:+5905025 MS.gene24536:CDS
GTTTGGGAGAGGTTTCTGAA+AGG 0.596050 1.2:+5895415 MS.gene24536:CDS
TTCTTGTTCAGATTGCTGAG+TGG 0.597688 1.2:+5900416 MS.gene24536:intron
GTTCGAACAATACTGTAGAC+CGG 0.597734 1.2:+5900756 MS.gene24536:CDS
ACTGCAACTGTTGTACAGAA+GGG 0.598057 1.2:+5905747 MS.gene24536:CDS
GGTTACGGTGGGGTCAGTGG+TGG 0.598133 1.2:+5905806 MS.gene24536:CDS
ATGATGCTTTCGTTAGGCAG+CGG 0.601505 1.2:+5905274 MS.gene24536:CDS
GAGGAGCAGAAGGTTACGGT+GGG 0.603375 1.2:+5905795 MS.gene24536:CDS
CCTTCAGCGCATAAGAAATG+TGG 0.604144 1.2:+5907013 MS.gene24536:CDS
GGCAAATCGGAGCATAACTT+GGG 0.604748 1.2:+5900840 MS.gene24536:CDS
TCCGGCAGAGAGACATCATG+GGG 0.605201 1.2:+5905056 MS.gene24536:CDS
ATTAATATTGTGGAGGAATG+GGG 0.607635 1.2:+5906497 MS.gene24536:CDS
GACAGGTCAAGAGGATCAGA+TGG 0.611286 1.2:+5905186 MS.gene24536:CDS
CAAGGACGGGACAGGTCAAG+AGG 0.611837 1.2:+5905177 MS.gene24536:CDS
TTTAAGCAAGATGCAATCGA+GGG 0.613015 1.2:+5895039 None:intergenic
TTATGACATTAATATTGTGG+AGG 0.613292 1.2:+5906490 MS.gene24536:CDS
AGAATGGGCGAATTCAGGTA+TGG 0.613720 1.2:+5906037 MS.gene24536:CDS
TACTTGACATCTCCAATGAG+CGG 0.613960 1.2:+5900488 MS.gene24536:CDS
TGCTTTCGTTAGGCAGCGGG+AGG 0.617001 1.2:+5905278 MS.gene24536:CDS
AGGATGAAAACAATGAAGCT+CGG 0.617398 1.2:+5905858 MS.gene24536:CDS
TGAGGAGCAGAAGGTTACGG+TGG 0.618581 1.2:+5905794 MS.gene24536:CDS
GGTAGCTCATATAAAGGCGG+GGG 0.620733 1.2:+5906058 MS.gene24536:CDS
TATGCTGGGATAAAGCGTGC+TGG 0.621823 1.2:-5905993 None:intergenic
CTCCGGCAGAGAGACATCAT+GGG 0.623737 1.2:+5905055 MS.gene24536:CDS
CCATGTGTTGAAGAACGTGC+TGG 0.624165 1.2:+5895226 MS.gene24536:CDS
AAAACACAACACATAGTGCA+AGG 0.624692 1.2:-5895129 None:intergenic
CGACAAGCAATGGACAGCAT+CGG 0.625909 1.2:+5905223 MS.gene24536:CDS
GCTAGGGTTAGGATTGGCGA+TGG 0.627028 1.2:+5905303 MS.gene24536:CDS
CTGCAACTGTTGTACAGAAG+GGG 0.628118 1.2:+5905748 MS.gene24536:CDS
CAGAAAACTATATCAGAAGG+AGG 0.631713 1.2:+5906905 MS.gene24536:CDS
CAATGTTGTGGGAGGACGTG+TGG 0.633002 1.2:+5905332 MS.gene24536:CDS
CAGAGCTCGTGATATTCTGA+GGG 0.634977 1.2:+5921593 MS.gene24536:CDS
AATGACTTGACACCAGAGGA+GGG 0.635614 1.2:+5906560 MS.gene24536:CDS
GATGTATCACCGAATAGTAG+AGG 0.637696 1.2:+5906710 MS.gene24536:CDS
TGTAGGTGACAAGAACATAC+CGG 0.637740 1.2:+5905671 MS.gene24536:CDS
CGGCAGAGAGACATCATGGG+GGG 0.639069 1.2:+5905058 MS.gene24536:CDS
AAAACTGAGCGTAGGAGTGG+CGG 0.641032 1.2:+5904991 MS.gene24536:CDS
CAGGGTGGCAGATATCGGGG+GGG 0.641589 1.2:+5905095 MS.gene24536:CDS
TGTTGTCGTAAGGTTCGTGG+TGG 0.641895 1.2:-5926646 None:intergenic
GTGTGTTGGCAAGAGAGGCA+AGG 0.642971 1.2:+5905622 MS.gene24536:CDS
GAATATCACGAGCTCTGGTG+AGG 0.644273 1.2:-5921587 None:intergenic
GTGATGGCTGACAACAGTGA+TGG 0.644858 1.2:+5905384 MS.gene24536:CDS
TCAATCCAATCAATGCTCCA+AGG 0.645481 1.2:-5906878 None:intergenic
CTGAATTTATTATCGACGGG+AGG 0.645667 1.2:+5906465 MS.gene24536:CDS
CATACCGGCAGAGCTGAAGG+TGG 0.647985 1.2:+5905686 MS.gene24536:CDS
AGGACGCTACAACCCAAACA+TGG 0.648045 1.2:+5900630 MS.gene24536:CDS
TGTCTGACACCAAATCAAGC+CGG 0.648215 1.2:+5926585 MS.gene24536:CDS
GTCTAGGAAGAGGAAAGCGA+CGG 0.648548 1.2:+5905143 MS.gene24536:CDS
GGGGAAATTGGACTGTGGTG+AGG 0.649027 1.2:+5905121 MS.gene24536:CDS
AACATCCATACCTCCACGGG+AGG 0.649070 1.2:-5921639 None:intergenic
TGCTCGTCGACATAACAAGC+CGG 0.649367 1.2:-5900775 None:intergenic
GTGCAGCCTTGCACCAACCA+GGG 0.650783 1.2:+5906854 MS.gene24536:CDS
AATGCTCCAAGGTCCCTGGT+TGG 0.651689 1.2:-5906867 None:intergenic
TCTTCTACACTGCACTGATG+GGG 0.652301 1.2:+5906163 MS.gene24536:CDS
GTTTCTGTGATTCCTTTGGG+AGG 0.652494 1.2:+5906131 MS.gene24536:CDS
CACGGGAGGACCTTCCATGT+AGG 0.652512 1.2:-5921625 None:intergenic
TTCGAACTTAGGATAAAATG+CGG 0.652612 1.2:-5900740 None:intergenic
ACTAGACTGAATTTGTAGAG+AGG 0.654314 1.2:-5900538 None:intergenic
GGAAATTCCAATGTTGTGGG+AGG 0.654815 1.2:+5905324 MS.gene24536:CDS
AAATCGGAGCATAACTTGGG+TGG 0.655678 1.2:+5900843 MS.gene24536:CDS
AATGAAGCTCGGTTCAGAGG+GGG 0.658116 1.2:+5905869 MS.gene24536:CDS
CATGGAAGGTCCTCCCGTGG+AGG 0.662058 1.2:+5921629 MS.gene24536:CDS
GGTGTCTTCCACAATATGGA+CGG 0.663514 1.2:-5900719 None:intergenic
TGGTAGCTCATATAAAGGCG+GGG 0.664536 1.2:+5906057 MS.gene24536:CDS
GCACGACACCGTAACTCTCG+CGG 0.664622 1.2:+5905510 MS.gene24536:CDS
GATGGAAATTCCAATGTTGT+GGG 0.666226 1.2:+5905321 MS.gene24536:CDS
TGATGGCTGACAACAGTGAT+GGG 0.667303 1.2:+5905385 MS.gene24536:CDS
ATACCGGCAGAGCTGAAGGT+GGG 0.667891 1.2:+5905687 MS.gene24536:CDS
TATGGTAGCTCATATAAAGG+CGG 0.668572 1.2:+5906055 MS.gene24536:CDS
CCCAGCATATACGACATGCA+AGG 0.672588 1.2:+5906007 MS.gene24536:CDS
AGACACACAGTGAACCCGAA+GGG 0.673178 1.2:+5926562 MS.gene24536:intron
TAGACACACAGTGAACCCGA+AGG 0.673499 1.2:+5926561 MS.gene24536:intron
CTACATGGAAGGTCCTCCCG+TGG 0.674007 1.2:+5921626 MS.gene24536:CDS
AAATGACTTGACACCAGAGG+AGG 0.676784 1.2:+5906559 MS.gene24536:CDS
CCGGCAGAGAGACATCATGG+GGG 0.680160 1.2:+5905057 MS.gene24536:CDS
GCGACGGAACTGGATCGACA+AGG 0.682958 1.2:+5905159 MS.gene24536:CDS
GGAATGGGGATGTAATTTGG+GGG 0.683415 1.2:+5906511 MS.gene24536:CDS
AGCGCATAAGAAATGTGGAG+TGG 0.683440 1.2:+5907018 MS.gene24536:CDS
GCCGGAGAGTAGCTCCGACG+CGG 0.683725 1.2:-5905039 None:intergenic
AGAACTCGATCACCTCCCAA+AGG 0.684925 1.2:-5906143 None:intergenic
TCTTTGGTTCGATATGAACG+TGG 0.687901 1.2:+5906263 MS.gene24536:CDS
AGCATATACGACATGCAAGG+AGG 0.706074 1.2:+5906010 MS.gene24536:CDS
CCATGTTAACCATTCAAGCG+GGG 0.708045 1.2:+5900809 MS.gene24536:CDS
TTATGGATCAGATTTGACGG+AGG 0.709604 1.2:-5895268 None:intergenic
TGAAAATGACTTGACACCAG+AGG 0.712663 1.2:+5906556 MS.gene24536:CDS
CAATGAAGCTCGGTTCAGAG+GGG 0.736250 1.2:+5905868 MS.gene24536:CDS
AGAGGATCAGATGGTCATCG+GGG 0.743548 1.2:+5905195 MS.gene24536:CDS
AGGAGCAGAAGGTTACGGTG+GGG 0.758539 1.2:+5905796 MS.gene24536:CDS
GTATGTTGATAAATGCACTG+CGG 0.858829 1.2:+5906373 MS.gene24536:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
chr1.2 gene 5895049 5926689 5895049 ID=MS.gene24536
chr1.2 mRNA 5895049 5926689 5895049 ID=MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536
chr1.2 exon 5895049 5895537 5895049 ID=MS.gene24536.t1.exon1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5895049 5895537 5895049 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 exon 5900427 5900877 5900427 ID=MS.gene24536.t1.exon2;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5900427 5900877 5900427 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 exon 5901337 5901379 5901337 ID=MS.gene24536.t1.exon3;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5901337 5901379 5901337 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 exon 5904984 5907039 5904984 ID=MS.gene24536.t1.exon4;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5904984 5907039 5904984 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 exon 5921558 5921650 5921558 ID=MS.gene24536.t1.exon5;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5921558 5921650 5921558 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 exon 5926564 5926689 5926564 ID=MS.gene24536.t1.exon6;Parent=MS.gene24536.t1
chr1.2 CDS 5926564 5926689 5926564 ID=cds.MS.gene24536.t1;Parent=MS.gene24536.t1
Gene Sequence

>MS.gene24536

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