AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080047911.01

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MsG0080047911.01.T01 AT5G08310 24.312 218 157 2 462 672 143 359 3.90e-11 67.0
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MsG0080047911.01.T01 AT5G46680 21.887 265 197 4 429 686 17 278 7.85e-14 75.1
MsG0080047911.01.T01 AT5G46680 22.941 340 248 6 347 677 6 340 1.76e-12 70.9
MsG0080047911.01.T01 AT1G71210 19.324 414 328 3 278 685 103 516 9.36e-15 79.0
MsG0080047911.01.T01 AT4G16390 23.462 260 176 7 427 672 212 462 1.03e-14 78.6
MsG0080047911.01.T01 AT4G16390 21.302 338 217 7 280 569 128 464 4.51e-13 73.2
MsG0080047911.01.T01 AT2G17670 23.810 210 155 2 441 645 140 349 1.91e-14 75.9
MsG0080047911.01.T01 AT2G17670 30.189 159 109 2 318 474 191 349 2.13e-14 75.9
MsG0080047911.01.T01 AT2G17670 24.878 205 144 4 342 538 145 347 7.04e-11 65.1
MsG0080047911.01.T01 AT2G34400 21.649 388 262 13 347 712 123 490 2.56e-14 77.0
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MsG0080047911.01.T01 AT1G61870 22.289 332 220 7 324 650 83 381 3.56e-14 75.5
MsG0080047911.01.T01 AT4G39620 23.151 311 229 6 308 608 120 430 4.03e-14 76.3
MsG0080047911.01.T01 AT5G39980 22.549 408 262 10 312 674 181 579 5.03e-14 76.3
MsG0080047911.01.T01 AT5G39980 20.166 362 270 4 307 656 141 495 6.47e-11 66.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G62370 21.640 439 316 8 266 689 427 852 5.11e-14 76.6
MsG0080047911.01.T01 AT5G14080 21.028 428 322 9 274 689 32 455 5.59e-14 75.9
MsG0080047911.01.T01 AT5G14080 20.678 295 191 5 343 596 245 537 9.12e-11 65.9
MsG0080047911.01.T01 AT3G53170 23.636 220 162 4 323 536 252 471 5.93e-14 75.5
MsG0080047911.01.T01 AT3G53170 23.636 220 162 4 323 536 252 471 5.93e-14 75.5
MsG0080047911.01.T01 AT3G53170 23.636 220 162 4 323 536 202 421 9.40e-14 74.7
MsG0080047911.01.T01 AT3G17370 26.904 197 134 4 378 573 1 188 1.10e-13 71.2
MsG0080047911.01.T01 AT3G17370 24.880 209 137 5 347 549 5 199 5.77e-11 63.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G47360 32.215 149 89 5 423 559 159 307 1.35e-13 74.3
MsG0080047911.01.T01 AT1G11710 22.925 253 184 3 326 571 401 649 2.88e-13 73.6
MsG0080047911.01.T01 AT1G11710 21.759 432 306 8 289 689 59 489 3.40e-13 73.6
MsG0080047911.01.T01 AT1G11710 19.242 343 269 3 342 676 169 511 2.72e-11 67.4
MsG0080047911.01.T01 AT4G34830 21.526 367 244 4 332 693 414 741 3.57e-13 73.9
MsG0080047911.01.T01 AT1G11710 22.925 253 184 3 326 571 372 620 3.72e-13 73.2
MsG0080047911.01.T01 AT1G11710 21.014 414 302 6 289 689 59 460 3.99e-13 73.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G27110 19.572 327 250 5 327 650 113 429 3.85e-13 73.6
MsG0080047911.01.T01 AT5G25630 19.471 416 289 6 323 693 82 496 4.70e-13 72.8
MsG0080047911.01.T01 AT1G55890 21.141 298 227 4 297 587 50 346 4.71e-13 72.0
MsG0080047911.01.T01 AT1G55890 23.558 208 151 4 319 519 142 348 1.64e-11 67.4
MsG0080047911.01.T01 AT5G25630 19.471 416 289 6 323 693 31 445 5.39e-13 72.4
MsG0080047911.01.T01 AT5G57250 25.337 371 250 11 302 658 500 857 5.51e-13 73.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G57250 24.436 266 188 7 300 559 635 893 3.19e-12 70.9
MsG0080047911.01.T01 AT5G57250 20.866 254 165 3 424 677 206 423 3.60e-12 70.5
MsG0080047911.01.T01 AT3G49240 21.406 313 229 4 361 658 206 516 9.24e-13 72.0
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MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.955 377 253 4 372 704 123 498 2.46e-12 70.5
MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.973 329 247 5 320 641 213 535 1.59e-12 71.2
MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.955 377 253 4 372 704 123 498 2.46e-12 70.5
MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.973 329 247 5 320 641 213 535 1.59e-12 71.2
MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.955 377 253 4 372 704 123 498 2.46e-12 70.5
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MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.973 329 247 5 320 641 213 535 1.59e-12 71.2
MsG0080047911.01.T01 AT3G29290 20.955 377 253 4 372 704 123 498 2.46e-12 70.5
MsG0080047911.01.T01 AT1G66345 21.173 307 226 6 254 553 244 541 1.63e-12 71.2
MsG0080047911.01.T01 AT1G66345 24.370 238 175 2 390 622 303 540 3.24e-11 67.0
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MsG0080047911.01.T01 AT1G53600 20.741 270 206 3 316 584 234 496 4.41e-12 70.1
MsG0080047911.01.T01 AT1G19720 21.166 326 229 7 342 655 408 717 4.89e-12 70.1
MsG0080047911.01.T01 AT1G19720 22.674 344 258 6 251 588 175 516 7.01e-12 69.7
MsG0080047911.01.T01 AT3G13160 22.143 280 176 5 313 586 99 342 5.73e-12 68.6
MsG0080047911.01.T01 AT3G13160 21.678 286 207 4 424 698 70 349 3.27e-11 66.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G25630 21.220 377 242 8 323 689 82 413 9.56e-12 68.9
MsG0080047911.01.T01 AT4G36680 21.756 262 193 5 293 545 109 367 1.26e-11 67.8
MsG0080047911.01.T01 AT1G14470 24.303 251 165 7 408 650 117 350 1.28e-11 68.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G18950 21.765 340 256 6 359 693 116 450 2.59e-11 67.0
MsG0080047911.01.T01 AT5G18950 22.134 253 192 2 359 606 216 468 8.79e-11 65.5
MsG0080047911.01.T01 AT2G27800 23.488 281 158 8 307 533 158 435 3.89e-11 66.2
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MsG0080047911.01.T01 AT1G68930 19.941 341 246 8 319 648 233 557 6.95e-11 66.2
MsG0080047911.01.T01 AT5G27270 21.760 409 290 5 293 695 594 978 8.10e-11 66.2
MsG0080047911.01.T01 AT1G77405 24.554 224 148 5 372 575 181 403 8.38e-11 65.5

Find 165 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 408 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGGATTCTGATTGTGATTC+TGG 0.094493 contig142end:-57975 None:intergenic
ATTGAAAATCATTGCATTAT+AGG 0.205369 contig142end:-58732 None:intergenic
CTTATGCGTCTTTCAAAGTT+TGG 0.240425 contig142end:+59061 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGCTTTCTTTCTTGAGGGTT+TGG 0.247571 contig142end:+58643 MsG0080047911.01.T01:CDS
CGAAAGCAATTCAATTGTTT+GGG 0.266594 contig142end:+58372 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGTGATAATTATATTCTTCA+TGG 0.268808 contig142end:+57791 MsG0080047911.01.T01:CDS
TCGAAAGCAATTCAATTGTT+TGG 0.270549 contig142end:+58371 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGAGATACATTGGTGTAAAT+TGG 0.282293 contig142end:-57868 None:intergenic
GATGTAAATGTTGGTATTAT+TGG 0.285347 contig142end:+58104 MsG0080047911.01.T01:CDS
CTGGTAAAAGTTGGGAGATT+TGG 0.293574 contig142end:-57935 None:intergenic
ACCTAACAGAGAGGGCTTAC+AGG 0.302124 contig142end:+59293 MsG0080047911.01.T01:CDS
TAAATTGGGAAGAGGGTGTT+TGG 0.332146 contig142end:-57853 None:intergenic
GCTTTCTTTCTTGAGGGTTT+GGG 0.336829 contig142end:+58644 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATTGGTAAAGTATTGAACTT+TGG 0.339456 contig142end:+58122 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGTTGGTGGTTTGTCTAAGT+TGG 0.341008 contig142end:+58547 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTGGTAAAGTATTGAACTTT+GGG 0.351996 contig142end:+58123 MsG0080047911.01.T01:CDS
ACGTTTGCTTTCTTTCTTGA+GGG 0.352894 contig142end:+58638 MsG0080047911.01.T01:CDS
CAAGGAATTGTGCCTCCAAC+TGG 0.353390 contig142end:+58917 MsG0080047911.01.T01:CDS
GATGAAGCTTTAACCACAAA+TGG 0.354849 contig142end:-53339 None:intergenic
TTTGGGAACTTGGAAGATCT+TGG 0.357642 contig142end:+58389 MsG0080047911.01.T01:CDS
AATTCAATTGTTTGGGAACT+TGG 0.360438 contig142end:+58379 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGATTGTGATTCTGGGGTTT+CGG 0.367166 contig142end:-57967 None:intergenic
CGAAGAGGAGTTATTCTTGC+TGG 0.372945 contig142end:-53280 None:intergenic
GTCAAAACCATTCCCATTTG+TGG 0.373213 contig142end:+53326 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAGTGCATCAGCCACTTTCC+TGG 0.375944 contig142end:-58870 None:intergenic
GAAAAGGAGATCGTCAGAAC+TGG 0.376321 contig142end:+54936 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGGATTCTGATTGTGATTCT+GGG 0.382240 contig142end:-57974 None:intergenic
GCCTGTAAGCCCTCTCTGTT+AGG 0.390509 contig142end:-59294 None:intergenic
TAGAATGGATGAGGCTGTTA+AGG 0.390867 contig142end:+58676 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTGGTTTGTCTAAGTTGGGT+AGG 0.394525 contig142end:+58552 MsG0080047911.01.T01:CDS
TAATTACCATGTTATTGTTA+AGG 0.402868 contig142end:+58220 MsG0080047911.01.T01:CDS
GGAATTTCTTTGATTCCATA+AGG 0.404901 contig142end:-53456 None:intergenic
GAATCAAAGAAATTCCCATT+AGG 0.405136 contig142end:+53463 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATACCGCGTAGTTTATCTTC+AGG 0.412842 contig142end:-58020 None:intergenic
TGAGAGGGTTATGAAGGAAA+TGG 0.413528 contig142end:+58586 MsG0080047911.01.T01:CDS
TCAGAATCCAAATCCGTTGA+TGG 0.418697 contig142end:+57987 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGATTCTGGGGTTTCGGAAG+TGG 0.418968 contig142end:-57961 None:intergenic
TGGAGGAGGCTTTGCGCAAA+GGG 0.420469 contig142end:+59215 MsG0080047911.01.T01:CDS
CGACGTGAGAGCGTCGATAA+AGG 0.422814 contig142end:-58454 None:intergenic
GGCTGGTGCATGCACCATGC+TGG 0.425050 contig142end:+55640 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGGCAGTGATTTAACTGAAA+AGG 0.428814 contig142end:+54920 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTAGAGAAAGAACAGCCTTA+TGG 0.431142 contig142end:+53441 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATGAAGAATACAAACCTAAT+GGG 0.434746 contig142end:-53477 None:intergenic
CTTTCAAAGTTTGGAAAATG+TGG 0.436553 contig142end:+59070 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTCACAGGACAGATAACAAT+TGG 0.437028 contig142end:+54900 MsG0080047911.01.T01:CDS
CATGGTTTCCAACGTTTCAC+AGG 0.439942 contig142end:+54885 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAAGCAAACGTACTATAATC+AGG 0.440649 contig142end:-58626 None:intergenic
TTGGGAACTTGGAAGATCTT+GGG 0.442805 contig142end:+58390 MsG0080047911.01.T01:CDS
GGGGTTTCGGAAGTGGGTAC+TGG 0.445511 contig142end:-57954 None:intergenic
GAGATACATTGGTGTAAATT+GGG 0.447840 contig142end:-57867 None:intergenic
GTTAAAGCTTCATCTGAGGT+TGG 0.448034 contig142end:+53348 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTTGGCTTAACAGGTTGGGC+TGG 0.448195 contig142end:+55623 MsG0080047911.01.T01:intron
TCCATAGAAGAGAGTGAAAA+GGG 0.448366 contig142end:+53381 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGGTTTGTCTAAGTTGGGTA+GGG 0.449655 contig142end:+58553 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTTGGTGGTTTGTCTAAGTT+GGG 0.449721 contig142end:+58548 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTTGGGTAGAGCAGGTAGAA+TGG 0.450298 contig142end:+58661 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAATTGGGAAGAGGGTGTTT+GGG 0.452520 contig142end:-57852 None:intergenic
ATCCATAGAAGAGAGTGAAA+AGG 0.458324 contig142end:+53380 MsG0080047911.01.T01:CDS
TCTACCTCATACTCTTCAAA+TGG 0.460144 contig142end:-53423 None:intergenic
CTTGAGGGTTTGGGTAGAGC+AGG 0.464422 contig142end:+58653 MsG0080047911.01.T01:CDS
AATTGCTTTCGACACATGAC+TGG 0.467427 contig142end:-58360 None:intergenic
ATGCCTTCGCTCAAGTCCCA+TGG 0.469552 contig142end:-55690 None:intergenic
CCAACATCCTTAGGCACCAT+TGG 0.472091 contig142end:-58197 None:intergenic
TTACTGTATACAAGCCTGCT+AGG 0.473538 contig142end:-59244 None:intergenic
CATGTTATTGTTAAGGCACT+AGG 0.474344 contig142end:+58227 MsG0080047911.01.T01:CDS
TACGTTTGCTTTCTTTCTTG+AGG 0.475779 contig142end:+58637 MsG0080047911.01.T01:CDS
AGAAGTCATTGGCGCGATAA+CGG 0.476090 contig142end:+59358 MsG0080047911.01.T01:CDS
GCAAAGGGTTCTGCCCTAGC+AGG 0.477704 contig142end:+59230 MsG0080047911.01.T01:CDS
CATAGGTTATTTGAAAGTAC+AGG 0.478924 contig142end:-53197 None:intergenic
TAAATCATCATAGCAGCATA+TGG 0.479275 contig142end:-58983 None:intergenic
GACACGTATAATGTTGTTGT+TGG 0.480332 contig142end:+58530 MsG0080047911.01.T01:CDS
CCATGGGTCAGCTCTCAACT+TGG 0.485978 contig142end:-55673 None:intergenic
CATTGGTGTAAATTGGGAAG+AGG 0.486046 contig142end:-57861 None:intergenic
TTAGATGAGATGAAGTTGAA+TGG 0.488001 contig142end:+58284 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGAAAATGCCGTTCTTGTCA+TGG 0.492183 contig142end:+59195 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTAAAGCTTCATCTGAGGTT+GGG 0.492955 contig142end:+53349 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAGTGGGTACTGGTAAAAGT+TGG 0.494646 contig142end:-57944 None:intergenic
GTAAAAGTTGGGAGATTTGG+TGG 0.496209 contig142end:-57932 None:intergenic
TTGTTAAGGCACTAGGAAGA+AGG 0.496457 contig142end:+58234 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGAGATTGAGAGGGTTATGA+AGG 0.497769 contig142end:+58580 MsG0080047911.01.T01:CDS
GAGTCATGTGGGTCTTAGAC+AGG 0.500813 contig142end:+55713 MsG0080047911.01.T01:CDS
TACCGCGTAGTTTATCTTCA+GGG 0.501128 contig142end:-58019 None:intergenic
TGATGTTTGATGAGATGTTA+AGG 0.501851 contig142end:+58894 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTCAGAACTGGGAGGAACTC+TGG 0.502153 contig142end:+54948 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATTTACATCAATACATACAT+TGG 0.503659 contig142end:-58090 None:intergenic
GTGGAACATTGTTAAGTGTC+TGG 0.504980 contig142end:+59089 MsG0080047911.01.T01:CDS
ACGTTGGAAACCATGGTTCT+CGG 0.508175 contig142end:-54877 None:intergenic
GGAACCATTTGAAGAGTATG+AGG 0.510439 contig142end:+53419 MsG0080047911.01.T01:CDS
AACATTGTTAAGTGTCTGGC+AGG 0.511700 contig142end:+59093 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTGGAGCAGGCAGGCCAGCA+TGG 0.514443 contig142end:-55654 None:intergenic
TTTCCTGGTTCTGAGAAAAG+AGG 0.517292 contig142end:-58855 None:intergenic
TAAACAACCAATGGTGCCTA+AGG 0.517355 contig142end:+58190 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTCAGCTCTCAACTTGGAGC+AGG 0.519145 contig142end:-55667 None:intergenic
TGGTAATTACCAACATCCTT+AGG 0.520010 contig142end:-58206 None:intergenic
CAGAATCCAAATCCGTTGAT+GGG 0.520509 contig142end:+57988 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATGAAGGAAATGGAAGTTGA+GGG 0.521615 contig142end:+58596 MsG0080047911.01.T01:CDS
ACGTATAATGTTGTTGTTGG+TGG 0.522156 contig142end:+58533 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATGAAGCTTTAACCACAAAT+GGG 0.526957 contig142end:-53338 None:intergenic
GATTCTGGGGTTTCGGAAGT+GGG 0.527030 contig142end:-57960 None:intergenic
AGTGGGTACTGGTAAAAGTT+GGG 0.527276 contig142end:-57943 None:intergenic
TGCCGTTCTTGTCATGGAGG+AGG 0.528610 contig142end:+59201 MsG0080047911.01.T01:CDS
GCTCTCAACTTGGAGCAGGC+AGG 0.529655 contig142end:-55663 None:intergenic
GGGAGATTTGGTGGAGAATG+TGG 0.531304 contig142end:-57923 None:intergenic
ATGAAGCAGTTATGCAGCTA+TGG 0.532779 contig142end:+58956 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATTGGTGTAAATTGGGAAGA+GGG 0.533821 contig142end:-57860 None:intergenic
CTAGTATATGTATCAATGCT+AGG 0.533968 contig142end:-58824 None:intergenic
ACTTATGTAATGCAATAGCT+TGG 0.537502 contig142end:+53160 MsG0080047911.01.T01:CDS
GCTTTAACCACAAATGGGAA+TGG 0.539254 contig142end:-53333 None:intergenic
GAATTTGAGTGTTGAAGCTA+TGG 0.539679 contig142end:+58145 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATGGAGGAGGCTTTGCGCAA+AGG 0.548012 contig142end:+59214 MsG0080047911.01.T01:CDS
GGAGAATGTGGTGTTCATCA+AGG 0.549396 contig142end:-57911 None:intergenic
TTTGTAGTGATGAGATACAT+TGG 0.551293 contig142end:-57878 None:intergenic
GTCATTGGCGCGATAACGGT+TGG 0.554179 contig142end:+59362 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGCCTTCGCTCAAGTCCCAT+GGG 0.555041 contig142end:-55689 None:intergenic
CCAAGTTGAGAGCTGACCCA+TGG 0.559223 contig142end:+55673 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTGGGCACTTAAACAACCAA+TGG 0.565969 contig142end:+58181 MsG0080047911.01.T01:CDS
GAACTTGGAAGATCTTGGGT+TGG 0.566004 contig142end:+58394 MsG0080047911.01.T01:CDS
CAAGTTGAGAGCTGACCCAT+GGG 0.568929 contig142end:+55674 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGAAGGAAATGGAAGTTGAG+GGG 0.572519 contig142end:+58597 MsG0080047911.01.T01:CDS
TACTGTATACAAGCCTGCTA+GGG 0.573012 contig142end:-59243 None:intergenic
AAAAGGAGATCGTCAGAACT+GGG 0.577814 contig142end:+54937 MsG0080047911.01.T01:CDS
GTATGTATTGATGTAAATGT+TGG 0.577889 contig142end:+58095 MsG0080047911.01.T01:CDS
GAGCGAAGGCATGAGTCATG+TGG 0.578134 contig142end:+55701 MsG0080047911.01.T01:CDS
TAGAGCAGGTAGAATGGATG+AGG 0.578557 contig142end:+58667 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGCTTCAAACCTAACAGAGA+GGG 0.579793 contig142end:+59285 MsG0080047911.01.T01:CDS
GAGGTTATAGTCCCAGTTGG+AGG 0.585102 contig142end:-58929 None:intergenic
CCAATGGTGCCTAAGGATGT+TGG 0.586324 contig142end:+58197 MsG0080047911.01.T01:CDS
TATGAAGGAAATGGAAGTTG+AGG 0.586660 contig142end:+58595 MsG0080047911.01.T01:CDS
AGCCTCCTCCATGACAAGAA+CGG 0.588267 contig142end:-59203 None:intergenic
GGATTCTGATTGTGATTCTG+GGG 0.590941 contig142end:-57973 None:intergenic
GTAGGGTGAATGAGATTGAG+AGG 0.598961 contig142end:+58570 MsG0080047911.01.T01:CDS
GCTGCATAACTGCTTCATGA+AGG 0.602264 contig142end:-58951 None:intergenic
GACCCATGGGACTTGAGCGA+AGG 0.604030 contig142end:+55687 MsG0080047911.01.T01:CDS
TAGTGCATAGTTAATGACAT+AGG 0.604051 contig142end:-53214 None:intergenic
AAGGAGGTTATAGTCCCAGT+TGG 0.604260 contig142end:-58932 None:intergenic
GGCAGGAGATGCAAGAATGT+GGG 0.604659 contig142end:+59110 MsG0080047911.01.T01:CDS
ATCAGTGGTCTTTACAACAT+AGG 0.607926 contig142end:+59166 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAGGAATTGTGCCTCCAACT+GGG 0.609211 contig142end:+58918 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGTGGTTAAAGCTTCATCTG+AGG 0.609444 contig142end:+53344 MsG0080047911.01.T01:CDS
CTAGTGCCTTAACAATAACA+TGG 0.609804 contig142end:-58226 None:intergenic
AGCGAAGGCATGAGTCATGT+GGG 0.614982 contig142end:+55702 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTTGATGAGATGTTAAGGCA+AGG 0.615366 contig142end:+58899 MsG0080047911.01.T01:CDS
ACCGCGTAGTTTATCTTCAG+GGG 0.615513 contig142end:-58018 None:intergenic
ATTAGAGTGTAAGATATCAA+CGG 0.619495 contig142end:+59021 MsG0080047911.01.T01:CDS
TCATGTGGGTCTTAGACAGG+AGG 0.625276 contig142end:+55716 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTATCTGTCCTGTGAAACGT+TGG 0.628814 contig142end:-54893 None:intergenic
ATCATCATAGCAGCATATGG+TGG 0.629346 contig142end:-58980 None:intergenic
TATAATGAGATGTTGAGTGA+TGG 0.629639 contig142end:+58794 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAGAGATGAATGACCACGAG+TGG 0.632329 contig142end:-53239 None:intergenic
GCATAACTGCTTCATGAAGG+AGG 0.632627 contig142end:-58948 None:intergenic
AAAGGGTAAAGAAGAACAAG+AGG 0.634533 contig142end:+53398 MsG0080047911.01.T01:CDS
TAGGGTGAATGAGATTGAGA+GGG 0.636775 contig142end:+58571 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGGCAGGAGATGCAAGAATG+TGG 0.637681 contig142end:+59109 MsG0080047911.01.T01:CDS
TGGGTTGGATCATGATACTG+AGG 0.640683 contig142end:+58409 MsG0080047911.01.T01:CDS
CTGTGAAACGTTGGAAACCA+TGG 0.643321 contig142end:-54884 None:intergenic
GCTCACAGATCCGAGAACCA+TGG 0.655836 contig142end:+54867 MsG0080047911.01.T01:intron
GTTTGAGAAACTACACGAAG+AGG 0.660772 contig142end:-53295 None:intergenic
GTTTATGAGTACATCATCAG+TGG 0.662916 contig142end:+59151 MsG0080047911.01.T01:CDS
CATGTGGGTCTTAGACAGGA+GGG 0.663237 contig142end:+55717 MsG0080047911.01.T01:CDS
CTTTATCGACGCTCTCACGT+CGG 0.681383 contig142end:+58455 MsG0080047911.01.T01:CDS
ACTATGCACTACTCCACTCG+TGG 0.692610 contig142end:+53226 MsG0080047911.01.T01:CDS
AAATGCCGTTCTTGTCATGG+AGG 0.695423 contig142end:+59198 MsG0080047911.01.T01:CDS
TTGCTTCAAACCTAACAGAG+AGG 0.703672 contig142end:+59284 MsG0080047911.01.T01:CDS
AGGAGATCGTCAGAACTGGG+AGG 0.758092 contig142end:+54940 MsG0080047911.01.T01:CDS
TCCCCTGAAGATAAACTACG+CGG 0.789552 contig142end:+58017 MsG0080047911.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAAAAAAAGTTAATTAAGT+TGG + contig142end:56207-56226 MsG0080047911.01.T01:intron 10.0%
!!! ATAAAATTTTAGACTAAAAT+TGG + contig142end:57084-57103 MsG0080047911.01.T01:intron 10.0%
!!! GATATTAAATTTATTTTTTG+AGG - contig142end:57195-57214 None:intergenic 10.0%
!!! GTAATAAACTTTTATATTAT+TGG - contig142end:55386-55405 None:intergenic 10.0%
!!! TATTAAATTTATTTTTTGAG+GGG - contig142end:57193-57212 None:intergenic 10.0%
!! AAAATAAATTTAATATCGTG+CGG + contig142end:57198-57217 MsG0080047911.01.T01:intron 15.0%
!! AAATTATTAAATGATTGTGT+TGG - contig142end:56075-56094 None:intergenic 15.0%
!! AGAAGAATTGAAATTTAAAA+TGG - contig142end:57765-57784 None:intergenic 15.0%
!! GGATAAAATTCAATAAATAA+GGG - contig142end:53926-53945 None:intergenic 15.0%
!! TGGATAAAATTCAATAAATA+AGG - contig142end:53927-53946 None:intergenic 15.0%
!! TTCATTATCTATAACATAAA+TGG + contig142end:57527-57546 MsG0080047911.01.T01:intron 15.0%
!! TTGAGATAATTAAACATATA+TGG + contig142end:53533-53552 MsG0080047911.01.T01:intron 15.0%
!!! AAAATACTCATATCTTTTAA+CGG - contig142end:56578-56597 None:intergenic 15.0%
!!! AATAAATAAGGGTATAATAA+TGG - contig142end:56389-56408 None:intergenic 15.0%
!!! ATTAAATTTATTTTTTGAGG+GGG - contig142end:57192-57211 None:intergenic 15.0%
!!! TATGGTTATGTTTTTTAATT+GGG + contig142end:58163-58182 MsG0080047911.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTGGAATATAGTTTTTAAAA+TGG - contig142end:55441-55460 None:intergenic 15.0%
!!! TTTAGATGTCTTTAATTTTT+GGG - contig142end:55918-55937 None:intergenic 15.0%
!! AAAAGAATAACAGATTAACA+TGG - contig142end:56748-56767 None:intergenic 20.0%
!! AAACACAATGTCAAATTTAA+AGG - contig142end:56964-56983 None:intergenic 20.0%
!! AAATGATAAATCATTTAGAG+TGG - contig142end:57508-57527 None:intergenic 20.0%
!! AACACAATGTCAAATTTAAA+GGG - contig142end:56963-56982 None:intergenic 20.0%
!! ATCTTTCTTCAAAAACTTAA+AGG + contig142end:58041-58060 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTATCTATAACATAAATGG+TGG + contig142end:57530-57549 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!! ATTGAAAATCATTGCATTAT+AGG - contig142end:58735-58754 None:intergenic 20.0%
!! ATTTACATCAATACATACAT+TGG - contig142end:58093-58112 None:intergenic 20.0%
!! TAAAACTATATACTGTGTTT+GGG + contig142end:54611-54630 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!! TAATTACCATGTTATTGTTA+AGG + contig142end:58220-58239 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTGATAATTATATTCTTCA+TGG + contig142end:57791-57810 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTCTCATGTTAAAACAA+CGG - contig142end:56841-56860 None:intergenic 20.0%
!! TTTCTATATTATGCATACTA+TGG - contig142end:55410-55429 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTTTAGACTAAAATTGG+TGG + contig142end:57087-57106 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTTTAGACTAAAATTGGT+GGG + contig142end:57088-57107 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!!! ACATATATGGTTAAATGTTT+TGG + contig142end:53546-53565 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTAATTGTGTTGATTTCAA+TGG - contig142end:56484-56503 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTCAATTTCATTTCGAT+TGG + contig142end:58746-58765 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTTCATTTTTATGATGC+AGG + contig142end:58259-58278 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!!! CGACAATACTTAATTTTTAA+TGG + contig142end:56159-56178 MsG0080047911.01.T01:intron 20.0%
!!! CTATGGTTATGTTTTTTAAT+TGG + contig142end:58162-58181 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTGTTTTTAATTCAATGAAA+GGG + contig142end:58489-58508 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTAGATGTCTTTAATTTT+TGG - contig142end:55919-55938 None:intergenic 20.0%
!!! TCTGTTTTTAATTCAATGAA+AGG + contig142end:58488-58507 MsG0080047911.01.T01:CDS 20.0%
! AAGTACTTAAGTCATATTCA+CGG - contig142end:54194-54213 None:intergenic 25.0%
! AGTATGTGTTTATAAAGTTC+TGG + contig142end:55518-55537 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! ATGAAGAATACAAACCTAAT+GGG - contig142end:53480-53499 None:intergenic 25.0%
! ATTAGAGTGTAAGATATCAA+CGG + contig142end:59021-59040 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTATGCATATGATAGCAA+TGG + contig142end:54360-54379 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! CTCAAAATAACAGTTGTTTA+AGG - contig142end:54055-54074 None:intergenic 25.0%
! GATGTAAATGTTGGTATTAT+TGG + contig142end:58104-58123 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
! GTAAAACTATATACTGTGTT+TGG + contig142end:54610-54629 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! TAAAAAATGCAAGAAGTCAT+TGG + contig142end:59347-59366 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
! TAAGCAAACATATATATACC+TGG - contig142end:55235-55254 None:intergenic 25.0%
! TACACAATTTGGAAAAGAAT+TGG + contig142end:54731-54750 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! TACAGGATCAATATCTAAAT+AGG + contig142end:56802-56821 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! TCAGTTTAATATCTGATATG+TGG - contig142end:57233-57252 None:intergenic 25.0%
! TCCACTAACTACAATTAATA+AGG + contig142end:56431-56450 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
! TCCTTATTAATTGTAGTTAG+TGG - contig142end:56435-56454 None:intergenic 25.0%
!! AAATGGTTTAGAGTATTTGA+AGG - contig142end:57748-57767 None:intergenic 25.0%
!! ATATATGTGAGTGACTATTT+TGG + contig142end:55359-55378 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTAGACTAAAATTGGTG+GGG + contig142end:57089-57108 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!! GTATGTATTGATGTAAATGT+TGG + contig142end:58095-58114 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCTATTTCTCTGTATTTAC+AGG + contig142end:56785-56804 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!! TTGTTTATAAGTTGAGCATA+TGG + contig142end:54123-54142 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTGCATTCTCATGATTAA+CGG - contig142end:54758-54777 None:intergenic 25.0%
!!! AAACAACTGTTATTTTGAGA+CGG + contig142end:54056-54075 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!!! AAATCATTTAGAGTGGATTT+TGG - contig142end:57501-57520 None:intergenic 25.0%
!!! AACTTTTTTAGTCCAACTAA+TGG + contig142end:56999-57018 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!!! AGATGTTCAACATTTTGATT+CGG - contig142end:54655-54674 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGGTAAAGTATTGAACTT+TGG + contig142end:58122-58141 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATTTTAACAAACACCTATT+GGG + contig142end:57710-57729 MsG0080047911.01.T01:intron 25.0%
!!! CTATATTTTGATTGATGTGA+TGG - contig142end:57059-57078 None:intergenic 25.0%
!!! TTCTTGCATTTTTTAGTGAA+CGG - contig142end:59342-59361 None:intergenic 25.0%
!!! TTGGTAAAGTATTGAACTTT+GGG + contig142end:58123-58142 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTAGTTTTAATAAGCGAA+GGG - contig142end:55066-55085 None:intergenic 25.0%
!!! TTTGTAGTTTTAATAAGCGA+AGG - contig142end:55067-55086 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTAATTCAATGAAAGGGA+AGG + contig142end:58493-58512 MsG0080047911.01.T01:CDS 25.0%
AAACGACTAATATTGTGAGA+CGG + contig142end:56533-56552 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
AAAGCAAACGTACTATAATC+AGG - contig142end:58629-58648 None:intergenic 30.0%
AAGTGACAATTATTGTGAGA+CGG - contig142end:56298-56317 None:intergenic 30.0%
AATCAGTGAAGTAGTTAAGT+TGG - contig142end:53947-53966 None:intergenic 30.0%
AATGATTACCATACATGTCT+GGG - contig142end:56904-56923 None:intergenic 30.0%
AATTCAATTGTTTGGGAACT+TGG + contig142end:58379-58398 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATGTAATGCAATAGCT+TGG + contig142end:53160-53179 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
ATAGTCACTCACATATATAG+AGG - contig142end:55357-55376 None:intergenic 30.0%
ATATGAGAACCAAAAAGTGA+TGG - contig142end:55865-55884 None:intergenic 30.0%
ATCATGCTCAAAACAGTAAT+TGG + contig142end:54232-54251 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
ATTAATGTCATAAGCTAGCA+TGG - contig142end:53727-53746 None:intergenic 30.0%
ATTACCACTAAAACAAAGAC+AGG - contig142end:56262-56281 None:intergenic 30.0%
CGAAAGCAATTCAATTGTTT+GGG + contig142end:58372-58391 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
CTAGTATATGTATCAATGCT+AGG - contig142end:58827-58846 None:intergenic 30.0%
CTCACAATATTAGTCGTTTA+AGG - contig142end:56532-56551 None:intergenic 30.0%
CTTTCAAAGTTTGGAAAATG+TGG + contig142end:59070-59089 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
GAATCAAAGAAATTCCCATT+AGG + contig142end:53463-53482 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
GAGATACATTGGTGTAAATT+GGG - contig142end:57870-57889 None:intergenic 30.0%
GATGAAGAATACAAACCTAA+TGG - contig142end:53481-53500 None:intergenic 30.0%
GGAATTTCTTTGATTCCATA+AGG - contig142end:53459-53478 None:intergenic 30.0%
TAAACTGAAAACACAGCTTA+TGG - contig142end:53690-53709 None:intergenic 30.0%
TAAATCATCATAGCAGCATA+TGG - contig142end:58986-59005 None:intergenic 30.0%
TAGTCACTCACATATATAGA+GGG - contig142end:55356-55375 None:intergenic 30.0%
TAGTGCATAGTTAATGACAT+AGG - contig142end:53217-53236 None:intergenic 30.0%
TATAATGAGATGTTGAGTGA+TGG + contig142end:58794-58813 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
TCGAAAGCAATTCAATTGTT+TGG + contig142end:58371-58390 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCAAAAACTTAAAGGCA+AGG + contig142end:58046-58065 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
TGAGATACATTGGTGTAAAT+TGG - contig142end:57871-57890 None:intergenic 30.0%
TGATGTTTGATGAGATGTTA+AGG + contig142end:58894-58913 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
TTAGATGAGATGAAGTTGAA+TGG + contig142end:58284-58303 MsG0080047911.01.T01:CDS 30.0%
TTCCATATTCTAACCAATGT+GGG - contig142end:55496-55515 None:intergenic 30.0%
TTTGTAGTGATGAGATACAT+TGG - contig142end:57881-57900 None:intergenic 30.0%
! AGACAAATTTGAGTCTGTTT+TGG + contig142end:55139-55158 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
! AGGTTTATGCACGATTTTTA+AGG - contig142end:54035-54054 None:intergenic 30.0%
! ATGAAGCTTTAACCACAAAT+GGG - contig142end:53341-53360 None:intergenic 30.0%
! CATAGGTTATTTGAAAGTAC+AGG - contig142end:53200-53219 None:intergenic 30.0%
! GACAAATTTGAGTCTGTTTT+GGG + contig142end:55140-55159 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!! AAAGTTAATTAAGTTGGAGC+TGG + contig142end:56213-56232 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!! GCATTTTAACAAACACCTAT+TGG + contig142end:57709-57728 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!!! ACTTTTTGGTTCTCATATTG+TGG + contig142end:55867-55886 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!!! AGACAATTATTTTGAGACGA+AGG - contig142end:53826-53845 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTTGGTTCTCATATTGT+GGG + contig142end:55868-55887 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!!! GACAATTATTTTGAGACGAA+GGG - contig142end:53825-53844 None:intergenic 30.0%
!!! TATACCTGTCTTTGTTTTAG+TGG + contig142end:56255-56274 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
!!! TCTTGCATTTTTTAGTGAAC+GGG - contig142end:59341-59360 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTGGTTCTCATATTGTG+GGG + contig142end:55869-55888 MsG0080047911.01.T01:intron 30.0%
AAAACACAGCTTATGGTCTA+TGG - contig142end:53683-53702 None:intergenic 35.0%
AAAGGGTAAAGAAGAACAAG+AGG + contig142end:53398-53417 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
AACCAAAAAGTGATGGTTCA+AGG - contig142end:55858-55877 None:intergenic 35.0%
AACTTAATGCTACACCATCT+TGG + contig142end:55459-55478 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
AAGATGGTGTAGCATTAAGT+TGG - contig142end:55460-55479 None:intergenic 35.0%
ACGTTTGCTTTCTTTCTTGA+GGG + contig142end:58638-58657 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
AGGTATATGTTCATTGCACT+GGG - contig142end:56242-56261 None:intergenic 35.0%
AGGTTTGTGCACGATTATTA+AGG - contig142end:56512-56531 None:intergenic 35.0%
AGTTAGTGGAGTAGTTAAGT+TGG - contig142end:56421-56440 None:intergenic 35.0%
ATATCTGATATGTGGACCAA+TGG - contig142end:57225-57244 None:intergenic 35.0%
ATCAGTGGTCTTTACAACAT+AGG + contig142end:59166-59185 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
ATCCATAGAAGAGAGTGAAA+AGG + contig142end:53380-53399 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGGAAATGGAAGTTGA+GGG + contig142end:58596-58615 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGAATGCAAAACAGACA+TGG + contig142end:54764-54783 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
ATGATTACCATACATGTCTG+GGG - contig142end:56903-56922 None:intergenic 35.0%
ATGCTCAAAACAGTAATTGG+AGG + contig142end:54235-54254 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
ATGTTACTCTAAGCTAAACC+AGG + contig142end:55214-55233 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
ATTCTCGCAAGTGTTTATGT+CGG - contig142end:53624-53643 None:intergenic 35.0%
ATTGGTGTAAATTGGGAAGA+GGG - contig142end:57863-57882 None:intergenic 35.0%
CAAAACCGATGTTAAAGTAG+TGG - contig142end:55279-55298 None:intergenic 35.0%
CAATGATTACCATACATGTC+TGG - contig142end:56905-56924 None:intergenic 35.0%
CTAGTGCCTTAACAATAACA+TGG - contig142end:58229-58248 None:intergenic 35.0%
CTTATGCGTCTTTCAAAGTT+TGG + contig142end:59061-59080 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGGTAATGTACACAATT+TGG + contig142end:54720-54739 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
GACACGTATAATGTTGTTGT+TGG + contig142end:58530-58549 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
GCAGATGTCAGATATAAAAG+GGG - contig142end:57327-57346 None:intergenic 35.0%
GGCAGATGTCAGATATAAAA+GGG - contig142end:57328-57347 None:intergenic 35.0%
GTGAATAATCAAACGCACAA+CGG - contig142end:56108-56127 None:intergenic 35.0%
GTTACAACTCATACCTTTCT+CGG - contig142end:57292-57311 None:intergenic 35.0%
GTTCCATATTCTAACCAATG+TGG - contig142end:55497-55516 None:intergenic 35.0%
GTTTATGAGTACATCATCAG+TGG + contig142end:59151-59170 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TACACTTGATCTTAGCCAAA+AGG + contig142end:57266-57285 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
TACAGTTTCTTGACCATACA+GGG - contig142end:54531-54550 None:intergenic 35.0%
TACGTTTGCTTTCTTTCTTG+AGG + contig142end:58637-58656 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TACTTAAGTCATATTCACGG+AGG - contig142end:54191-54210 None:intergenic 35.0%
TATGAAGGAAATGGAAGTTG+AGG + contig142end:58595-58614 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TCCATAGAAGAGAGTGAAAA+GGG + contig142end:53381-53400 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TCTACCTCATACTCTTCAAA+TGG - contig142end:53426-53445 None:intergenic 35.0%
TGGATTCTGATTGTGATTCT+GGG - contig142end:57977-57996 None:intergenic 35.0%
TGGCAGATGTCAGATATAAA+AGG - contig142end:57329-57348 None:intergenic 35.0%
TGGCAGTGATTTAACTGAAA+AGG + contig142end:54920-54939 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TGGTAATTACCAACATCCTT+AGG - contig142end:58209-58228 None:intergenic 35.0%
TTCACAGGACAGATAACAAT+TGG + contig142end:54900-54919 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCAAAGTTGCCATTAGT+TGG - contig142end:57014-57033 None:intergenic 35.0%
TTGGATTCTGATTGTGATTC+TGG - contig142end:57978-57997 None:intergenic 35.0%
TTGGGACCAAAATTGAGATA+TGG + contig142end:54629-54648 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
TTTGATGAGATGTTAAGGCA+AGG + contig142end:58899-58918 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
! AAGCCAACGTTGACTAAATT+AGG - contig142end:54261-54280 None:intergenic 35.0%
! ACACGTCATATAATTTGCCT+AGG - contig142end:54426-54445 None:intergenic 35.0%
! ACGTATAATGTTGTTGTTGG+TGG + contig142end:58533-58552 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
! AGATGGTTATTTGAAAGTGC+AGG - contig142end:57418-57437 None:intergenic 35.0%
! ATAAGTTGAGCATATGGTTG+TGG + contig142end:54129-54148 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
! ATTCGGCCATATCTCAATTT+TGG - contig142end:54638-54657 None:intergenic 35.0%
! CATGTTATTGTTAAGGCACT+AGG + contig142end:58227-58246 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
! GATGAAGCTTTAACCACAAA+TGG - contig142end:53342-53361 None:intergenic 35.0%
! GTTTAGCTTAGAGTAACATC+AGG - contig142end:55213-55232 None:intergenic 35.0%
! TAAGGTTTTCGGTAGTATGA+AGG + contig142end:58694-58713 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAAGCTTCATCTGAGGTT+GGG + contig142end:53349-53368 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
! TTTATAAAGTTCTGGCATGC+TGG + contig142end:55526-55545 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
!! CACTACAATAGCTTGCTATT+GGG - contig142end:57163-57182 None:intergenic 35.0%
!! GAATTTGAGTGTTGAAGCTA+TGG + contig142end:58145-58164 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
!! TCACTACAATAGCTTGCTAT+TGG - contig142end:57164-57183 None:intergenic 35.0%
!! TTTCGATTGGAGATTTTGAC+AGG + contig142end:58759-58778 MsG0080047911.01.T01:CDS 35.0%
!!! CACTACTTTAACATCGGTTT+TGG + contig142end:55277-55296 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
!!! CTGTTTTTGGGACCAAAATT+TGG + contig142end:54681-54700 MsG0080047911.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGATTTTGGTTTTTCTTGC+TGG - contig142end:57488-57507 None:intergenic 35.0%
AAAAGGAGATCGTCAGAACT+GGG + contig142end:54937-54956 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
AACATTGTTAAGTGTCTGGC+AGG + contig142end:59093-59112 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
AAGCGAAGGGTAAGAATAAC+AGG - contig142end:55053-55072 None:intergenic 40.0%
AATTGCTTTCGACACATGAC+TGG - contig142end:58363-58382 None:intergenic 40.0%
ACAGTTTCTTGACCATACAG+AGG - contig142end:54403-54422 None:intergenic 40.0%
ACAGTTTCTTGACCATACAG+GGG - contig142end:54403-54422 None:intergenic 40.0%
ACTCTTCTGATTACACGATG+TGG + contig142end:57354-57373 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
AGCAATGGTAATAGCAATCC+AGG + contig142end:54375-54394 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
AGGCCTAATTTAGTCAACGT+TGG + contig142end:54255-54274 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
ATACCGCGTAGTTTATCTTC+AGG - contig142end:58023-58042 None:intergenic 40.0%
ATCATCATAGCAGCATATGG+TGG - contig142end:58983-59002 None:intergenic 40.0%
ATGAAGCAGTTATGCAGCTA+TGG + contig142end:58956-58975 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
ATTTAGCATTCCTACAGCAG+AGG - contig142end:55106-55125 None:intergenic 40.0%
CAGAATCCAAATCCGTTGAT+GGG + contig142end:57988-58007 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
CAGGTATATGTTCATTGCAC+TGG - contig142end:56243-56262 None:intergenic 40.0%
CATCAGGCAGCATTATAACT+TGG - contig142end:55197-55216 None:intergenic 40.0%
CATTGGTGTAAATTGGGAAG+AGG - contig142end:57864-57883 None:intergenic 40.0%
CTCTTCTGATTACACGATGT+GGG + contig142end:57355-57374 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
CTGGTAAAAGTTGGGAGATT+TGG - contig142end:57938-57957 None:intergenic 40.0%
CTGTAGGAATGCTAAATACG+TGG + contig142end:55109-55128 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
GACAATTATTGTGAGACGGA+GGG - contig142end:56294-56313 None:intergenic 40.0%
GACTAATATTGTGAGACGGA+GGG + contig142end:56537-56556 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
GAGCAGGAAAGTTAATGAGA+TGG - contig142end:57435-57454 None:intergenic 40.0%
GCGTTCCACTACTTTAACAT+CGG + contig142end:55271-55290 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
GCTTATGCAATGCAATAGCT+TGG + contig142end:57378-57397 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
GCTTTAACCACAAATGGGAA+TGG - contig142end:53336-53355 None:intergenic 40.0%
GCTTTCTTTCTTGAGGGTTT+GGG + contig142end:58644-58663 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
GGATTCATTATGTCCCACAT+TGG + contig142end:55480-55499 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
GGATTCTGATTGTGATTCTG+GGG - contig142end:57976-57995 None:intergenic 40.0%
GGGACATAATGAATCCAAGA+TGG - contig142end:55476-55495 None:intergenic 40.0%
GGTATATGTTCATTGCACTG+GGG - contig142end:56241-56260 None:intergenic 40.0%
GGTATTCAGAAGAACCCAAT+AGG - contig142end:57727-57746 None:intergenic 40.0%
GTAAAAGTTGGGAGATTTGG+TGG - contig142end:57935-57954 None:intergenic 40.0%
GTACAGTTTCTTGACCATAC+AGG - contig142end:54532-54551 None:intergenic 40.0%
GTAGAGAAAGAACAGCCTTA+TGG + contig142end:53441-53460 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAAACCATTCCCATTTG+TGG + contig142end:53326-53345 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
GTCTAAGGGAATGATTAGCA+AGG - contig142end:56881-56900 None:intergenic 40.0%
GTGGAACATTGTTAAGTGTC+TGG + contig142end:59089-59108 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
GTTAAAACAACGGCAACGTT+CGG - contig142end:56831-56850 None:intergenic 40.0%
GTTTGAGAAACTACACGAAG+AGG - contig142end:53298-53317 None:intergenic 40.0%
TAAACAACCAATGGTGCCTA+AGG + contig142end:58190-58209 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TACCGCGTAGTTTATCTTCA+GGG - contig142end:58022-58041 None:intergenic 40.0%
TACTGTATACAAGCCTGCTA+GGG - contig142end:59246-59265 None:intergenic 40.0%
TAGAATGGATGAGGCTGTTA+AGG + contig142end:58676-58695 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TAGGGTGAATGAGATTGAGA+GGG + contig142end:58571-58590 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TATGGTCAAGAAACTGTCCT+AGG + contig142end:54406-54425 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
TCAGAATCCAAATCCGTTGA+TGG + contig142end:57987-58006 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCTGATTACACGATGTG+GGG + contig142end:57356-57375 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
TGAAAATGCCGTTCTTGTCA+TGG + contig142end:59195-59214 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGAAATGGAAGTTGAG+GGG + contig142end:58597-58616 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGACAATTATTGTGAGACGG+AGG - contig142end:56295-56314 None:intergenic 40.0%
TGAGAGGGTTATGAAGGAAA+TGG + contig142end:58586-58605 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGAGATTGAGAGGGTTATGA+AGG + contig142end:58580-58599 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTCAAACCTAACAGAGA+GGG + contig142end:59285-59304 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTTCTTTCTTGAGGGTT+TGG + contig142end:58643-58662 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TGTAATCAGAAGAGTGACAC+TGG - contig142end:57349-57368 None:intergenic 40.0%
TGTGAGCTTAGTTCACAAAC+AGG - contig142end:54854-54873 None:intergenic 40.0%
TGTGGTTAAAGCTTCATCTG+AGG + contig142end:53344-53363 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TTACTGTATACAAGCCTGCT+AGG - contig142end:59247-59266 None:intergenic 40.0%
TTATCTGTCCTGTGAAACGT+TGG - contig142end:54896-54915 None:intergenic 40.0%
TTGCTTCAAACCTAACAGAG+AGG + contig142end:59284-59303 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGAACTTGGAAGATCTT+GGG + contig142end:58390-58409 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGCACTTAAACAACCAA+TGG + contig142end:58181-58200 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
TTTAATATCGTGCGGACCAT+TGG + contig142end:57206-57225 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
TTTGGGAACTTGGAAGATCT+TGG + contig142end:58389-58408 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! ACCCTTTTCACTCTCTTCTA+TGG - contig142end:53385-53404 None:intergenic 40.0%
! CAAAAACCCATCAACGGATT+TGG - contig142end:57997-58016 None:intergenic 40.0%
! GATGAGGCTGTTAAGGTTTT+CGG + contig142end:58683-58702 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! GGAACCATTTGAAGAGTATG+AGG + contig142end:53419-53438 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! GTCCCACATTGGTTAGAATA+TGG + contig142end:55491-55510 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
! GTTAAAGCTTCATCTGAGGT+TGG + contig142end:53348-53367 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! TAACCTCTTTTCTCAGAACC+AGG + contig142end:58852-58871 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! TGGTTTGTCTAAGTTGGGTA+GGG + contig142end:58553-58572 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! TTGTTAAGGCACTAGGAAGA+AGG + contig142end:58234-58253 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGAGCTCAGTACTAGCTT+TGG + contig142end:53575-53594 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
! TTTTCTCAGAACCAGGAAAG+TGG + contig142end:58859-58878 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
!! AAATTGGGAAGAGGGTGTTT+GGG - contig142end:57855-57874 None:intergenic 40.0%
!! AAGTGGGTACTGGTAAAAGT+TGG - contig142end:57947-57966 None:intergenic 40.0%
!! AGTGGGTACTGGTAAAAGTT+GGG - contig142end:57946-57965 None:intergenic 40.0%
!! CTCCTTGAACCATCACTTTT+TGG + contig142end:55853-55872 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
!! GTTGGTGGTTTGTCTAAGTT+GGG + contig142end:58548-58567 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
!! TAAATTGGGAAGAGGGTGTT+TGG - contig142end:57856-57875 None:intergenic 40.0%
!! TCAACGTTGGCTTATAGTTG+TGG + contig142end:54268-54287 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
!! TGATTGTGATTCTGGGGTTT+CGG - contig142end:57970-57989 None:intergenic 40.0%
!! TGTTGGTGGTTTGTCTAAGT+TGG + contig142end:58547-58566 MsG0080047911.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCCTGGTTCTGAGAAAAG+AGG - contig142end:58858-58877 None:intergenic 40.0%
!!! AACATCTGCAGTGCTGTTTT+TGG + contig142end:54668-54687 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
!!! ACATCTGCAGTGCTGTTTTT+GGG + contig142end:54669-54688 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
!!! CAACTGTTATTTTGAGACGG+AGG + contig142end:54059-54078 MsG0080047911.01.T01:intron 40.0%
AAATGCCGTTCTTGTCATGG+AGG + contig142end:59198-59217 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGATGAATGACCACGAG+TGG - contig142end:53242-53261 None:intergenic 45.0%
AAGGAATTGTGCCTCCAACT+GGG + contig142end:58918-58937 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAGGTTATAGTCCCAGT+TGG - contig142end:58935-58954 None:intergenic 45.0%
AAGTGATGGTTCAAGGAGCT+AGG - contig142end:55851-55870 None:intergenic 45.0%
ACCGCGTAGTTTATCTTCAG+GGG - contig142end:58021-58040 None:intergenic 45.0%
ACGTTGGAAACCATGGTTCT+CGG - contig142end:54880-54899 None:intergenic 45.0%
ACTTGCGAGAATGCTCAAGA+GGG + contig142end:53632-53651 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
AGAAGTCATTGGCGCGATAA+CGG + contig142end:59358-59377 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
AGGGAATGATTAGCAAGGTC+AGG - contig142end:56876-56895 None:intergenic 45.0%
AGGGGACAAAAACCCATCAA+CGG - contig142end:58003-58022 None:intergenic 45.0%
ATGCTATCTTCCTCTGCTGT+AGG + contig142end:55093-55112 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
ATGGAGATGGAACATGGCTT+TGG + contig142end:55605-55624 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
ATGTTCCATCTCCATCACCT+TGG - contig142end:55600-55619 None:intergenic 45.0%
CATGGTTTCCAACGTTTCAC+AGG + contig142end:54885-54904 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
CGAAGAGGAGTTATTCTTGC+TGG - contig142end:53283-53302 None:intergenic 45.0%
CGACTAATATTGTGAGACGG+AGG + contig142end:56536-56555 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
CTGTGAAACGTTGGAAACCA+TGG - contig142end:54887-54906 None:intergenic 45.0%
GAAAAGGAGATCGTCAGAAC+TGG + contig142end:54936-54955 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
GAACTTGGAAGATCTTGGGT+TGG + contig142end:58394-58413 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
GCAACGTGATCTAACATGCT+CGG - contig142end:56929-56948 None:intergenic 45.0%
GCATAACTGCTTCATGAAGG+AGG - contig142end:58951-58970 None:intergenic 45.0%
GCTGCATAACTGCTTCATGA+AGG - contig142end:58954-58973 None:intergenic 45.0%
GGAGAATGTGGTGTTCATCA+AGG - contig142end:57914-57933 None:intergenic 45.0%
GTAGGGTGAATGAGATTGAG+AGG + contig142end:58570-58589 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
TAGAGCAGGTAGAATGGATG+AGG + contig142end:58667-58686 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
TCCCCTGAAGATAAACTACG+CGG + contig142end:58017-58036 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
TTTGCGTTGCACTTCTGCAT+TGG - contig142end:57124-57143 None:intergenic 45.0%
TTTGGGTAGAGCAGGTAGAA+TGG + contig142end:58661-58680 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
! AATGCAGAAGTGCAACGCAA+AGG + contig142end:57123-57142 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
! ACTTGGTACTGCTACTTCCT+CGG - contig142end:55180-55199 None:intergenic 45.0%
! AGCAAAAAGCACACTAGAGC+AGG - contig142end:57451-57470 None:intergenic 45.0%
! CATACATGTCTGGGGTCTAA+GGG - contig142end:56895-56914 None:intergenic 45.0%
! GTGGTTTGTCTAAGTTGGGT+AGG + contig142end:58552-58571 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
! TCATACCTTTCTCGGCCTTT+TGG - contig142end:57284-57303 None:intergenic 45.0%
! TGGGTTGGATCATGATACTG+AGG + contig142end:58409-58428 MsG0080047911.01.T01:CDS 45.0%
! TTCTGCAGCTGGCCAAATTT+TGG - contig142end:54696-54715 None:intergenic 45.0%
!! AAGGTGATGGAGATGGAACA+TGG + contig142end:55599-55618 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
!! ATGGCTTTGGCTTAACAGGT+TGG + contig142end:55618-55637 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
!! GAACATGGCTTTGGCTTAAC+AGG + contig142end:55614-55633 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
!! GCTCAGTACTAGCTTTGGAT+TGG + contig142end:53580-53599 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
!! TGGCTTTGGCTTAACAGGTT+GGG + contig142end:55619-55638 MsG0080047911.01.T01:intron 45.0%
!! ATTATTCAAAAAAAAATTAA+TGG + contig142end:56136-56155 MsG0080047911.01.T01:intron 5.0%
!!! ATATTAAATTTATTTTTTGA+GGG - contig142end:57194-57213 None:intergenic 5.0%
ACAGCTCCTACTCCTAACAG+TGG + contig142end:55780-55799 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
ACCTAACAGAGAGGGCTTAC+AGG + contig142end:59293-59312 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
ACTATGCACTACTCCACTCG+TGG + contig142end:53226-53245 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
AGCCTCCTCCATGACAAGAA+CGG - contig142end:59206-59225 None:intergenic 50.0%
ATCCCTCCACTGTTAGGAGT+AGG - contig142end:55789-55808 None:intergenic 50.0%
ATTTGGCCAGCTGCAGAATG+TGG + contig142end:54698-54717 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
CAAGCTAGCATTACCCAGCT+CGG - contig142end:55560-55579 None:intergenic 50.0%
CAAGGAATTGTGCCTCCAAC+TGG + contig142end:58917-58936 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
CACTTGCGAGAATGCTCAAG+AGG + contig142end:53631-53650 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
CATGTGGGTCTTAGACAGGA+GGG + contig142end:55717-55736 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
CCAACATCCTTAGGCACCAT+TGG - contig142end:58200-58219 None:intergenic 50.0%
CCAATGGTGCCTAAGGATGT+TGG + contig142end:58197-58216 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
CCTTAGACCCCAGACATGTA+TGG + contig142end:56893-56912 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
CTCCTACTCCTAACAGTGGA+GGG + contig142end:55784-55803 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
CTTAGCCAAAAGGCCGAGAA+AGG + contig142end:57276-57295 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
CTTTATCGACGCTCTCACGT+CGG + contig142end:58455-58474 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTATAGTCCCAGTTGG+AGG - contig142end:58932-58951 None:intergenic 50.0%
GAGTCATGTGGGTCTTAGAC+AGG + contig142end:55713-55732 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
GCAATCCAGGTACCTCTGTA+TGG + contig142end:54388-54407 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
GGCAGGAGATGCAAGAATGT+GGG + contig142end:59110-59129 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
TCATGTGGGTCTTAGACAGG+AGG + contig142end:55716-55735 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
TGGCAGGAGATGCAAGAATG+TGG + contig142end:59109-59128 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
TTCAAGGAGCTAGGCTCACT+AGG - contig142end:55842-55861 None:intergenic 50.0%
! AAGTGCATCAGCCACTTTCC+TGG - contig142end:58873-58892 None:intergenic 50.0%
! AGCGAAGGCATGAGTCATGT+GGG + contig142end:55702-55721 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
! CAAGTTGAGAGCTGACCCAT+GGG + contig142end:55674-55693 MsG0080047911.01.T01:CDS 50.0%
! CCATACATGTCTGGGGTCTA+AGG - contig142end:56896-56915 None:intergenic 50.0%
! CTAGCTTGTGACCCAAGTTG+GGG + contig142end:55572-55591 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
! CTTGGTACTGCTACTTCCTC+GGG - contig142end:55179-55198 None:intergenic 50.0%
! GCTAGCTTGTGACCCAAGTT+GGG + contig142end:55571-55590 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
! TAGACAGGAGGGTATAGCGT+GGG + contig142end:55728-55747 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
! TGCTAGCTTGTGACCCAAGT+TGG + contig142end:55570-55589 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
! TTAGACAGGAGGGTATAGCG+TGG + contig142end:55727-55746 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
! TTTGGCTTAACAGGTTGGGC+TGG + contig142end:55623-55642 MsG0080047911.01.T01:intron 50.0%
!! CTTGACCATACAGAGGTACC+TGG - contig142end:54396-54415 None:intergenic 50.0%
!! GATTCTGGGGTTTCGGAAGT+GGG - contig142end:57963-57982 None:intergenic 50.0%
!! GGGAGATTTGGTGGAGAATG+TGG - contig142end:57926-57945 None:intergenic 50.0%
!! TGATTCTGGGGTTTCGGAAG+TGG - contig142end:57964-57983 None:intergenic 50.0%
ACCCTTCCACATTCTGCAGC+TGG - contig142end:54707-54726 None:intergenic 55.0%
AGGAGATCGTCAGAACTGGG+AGG + contig142end:54940-54959 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
ATGCCTTCGCTCAAGTCCCA+TGG - contig142end:55693-55712 None:intergenic 55.0%
ATGGAGGAGGCTTTGCGCAA+AGG + contig142end:59214-59233 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
CCATGGGTCAGCTCTCAACT+TGG - contig142end:55676-55695 None:intergenic 55.0%
CCTAACAGTGGAGGGATCAC+AGG + contig142end:55792-55811 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
CCTGTGATCCCTCCACTGTT+AGG - contig142end:55795-55814 None:intergenic 55.0%
CTAAAATTGGTGGGGTGCGC+CGG + contig142end:57097-57116 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
CTTGAGGGTTTGGGTAGAGC+AGG + contig142end:58653-58672 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
GACGAAGGGAGTGAGTGCTT+AGG - contig142end:53811-53830 None:intergenic 55.0%
GCAATCCAGGTACCCCTGTA+TGG + contig142end:54515-54534 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
GCCAGCTGCAGAATGTGGAA+GGG + contig142end:54703-54722 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
GCCTGTAAGCCCTCTCTGTT+AGG - contig142end:59297-59316 None:intergenic 55.0%
GCTCACAGATCCGAGAACCA+TGG + contig142end:54867-54886 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
GCTCCTACTCCTAACAGTGG+AGG + contig142end:55783-55802 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
GGGAACAAAACCAGAACCCG+AGG + contig142end:55160-55179 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
GTCAGAACTGGGAGGAACTC+TGG + contig142end:54948-54967 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
GTCAGCTCTCAACTTGGAGC+AGG - contig142end:55670-55689 None:intergenic 55.0%
TAAAATTGGTGGGGTGCGCC+GGG + contig142end:57098-57117 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
TGCCGTTCTTGTCATGGAGG+AGG + contig142end:59201-59220 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
TGCCTTCGCTCAAGTCCCAT+GGG - contig142end:55692-55711 None:intergenic 55.0%
TGGAGGAGGCTTTGCGCAAA+GGG + contig142end:59215-59234 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
! AAGTTGGGGCACCAAGGTGA+TGG + contig142end:55586-55605 MsG0080047911.01.T01:intron 55.0%
! ACTGCTACTTCCTCGGGTTC+TGG - contig142end:55173-55192 None:intergenic 55.0%
! CCAAGTTGAGAGCTGACCCA+TGG + contig142end:55673-55692 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
! GAGCGAAGGCATGAGTCATG+TGG + contig142end:55701-55720 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
! GCTAGGCTCACTAGGTGTTG+TGG - contig142end:55834-55853 None:intergenic 55.0%
! GCTCACTAGGTGTTGTGGAC+CGG - contig142end:55829-55848 None:intergenic 55.0%
! GTCATTGGCGCGATAACGGT+TGG + contig142end:59362-59381 MsG0080047911.01.T01:CDS 55.0%
! GTTGCACTTCTGCATTGGCC+CGG - contig142end:57119-57138 None:intergenic 55.0%
!! ATCACCTTGGTGCCCCAACT+TGG - contig142end:55587-55606 None:intergenic 55.0%
!! CGACGTGAGAGCGTCGATAA+AGG - contig142end:58457-58476 None:intergenic 55.0%
!! CTTGACCATACAGGGGTACC+TGG - contig142end:54523-54542 None:intergenic 55.0%
!! TCACCTTGGTGCCCCAACTT+GGG - contig142end:55586-55605 None:intergenic 55.0%
GACCCATGGGACTTGAGCGA+AGG + contig142end:55687-55706 MsG0080047911.01.T01:CDS 60.0%
GCAAAGGGTTCTGCCCTAGC+AGG + contig142end:59230-59249 MsG0080047911.01.T01:CDS 60.0%
GCTCTCAACTTGGAGCAGGC+AGG - contig142end:55666-55685 None:intergenic 60.0%
GCTGGTATTGTCGCCGAGCT+GGG + contig142end:55544-55563 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
GGCCAGCTGCAGAATGTGGA+AGG + contig142end:54702-54721 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
GGGGTTTCGGAAGTGGGTAC+TGG - contig142end:57957-57976 None:intergenic 60.0%
TGCTGGTATTGTCGCCGAGC+TGG + contig142end:55543-55562 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
! AGGAGGGTATAGCGTGGGAC+TGG + contig142end:55733-55752 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
! CACTAGGTGTTGTGGACCGG+AGG - contig142end:55826-55845 None:intergenic 60.0%
! TGACCCAAGTTGGGGCACCA+AGG + contig142end:55580-55599 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
!! GGGCACCAAGGTGATGGAGA+TGG + contig142end:55592-55611 MsG0080047911.01.T01:intron 60.0%
ATCACAGGCCGCTGCACCTC+CGG + contig142end:55807-55826 MsG0080047911.01.T01:intron 65.0%
GGCTGGTGCATGCACCATGC+TGG + contig142end:55640-55659 MsG0080047911.01.T01:CDS 65.0%
TTGGAGCAGGCAGGCCAGCA+TGG - contig142end:55657-55676 None:intergenic 65.0%
! GTTGTGGACCGGAGGTGCAG+CGG - contig142end:55818-55837 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig142end gene 53153 59393 53153 ID=MsG0080047911.01;Name=MsG0080047911.01
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contig142end CDS 57787 59393 57787 ID=MsG0080047911.01.T01:cds;Parent=MsG0080047911.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0080047911.01.T01

MWDLCNAIAWSLLVNLYFQITYVINYALLHSWSFISLLCTLIASKNNSSSCSFSNTLLSKPFPFVVKASSEVGSEASIEESEKGKEEQEEPFEEYEVEKEQPYGIKEIPIRSENHGFQRFTGQITIGSDLTEKEIVRTGRNSGVGLVHAPCWPACSKLRADPWDLSEGMSHVGLRQEVTVIIIFFMAFRFSQFLLHLSKPKHPLPNLHQCISSLQNSSNLDEHHILHQISQLLPVPTSETPESQSESKSVDGFLSPEDKLRGIFLQKLKGKAAIEQALTNVCIDVNVGIIGKVLNFGNLSVEAMVMFFNWALKQPMVPKDVGNYHVIVKALGRRKFFIFMMQVLDEMKLNGIKADLLMLSIVIDSFVNASHVSKAIQLFGNLEDLGLDHDTEALNVLFLCLYRRSHVGAAASVFNSMKGKVSFNVDTYNVVVGGLSKLGRVNEIERVMKEMEVEGFSPDYSTFAFFLEGLGRAGRMDEAVKVFGSMKEKDTATYNAMIFNFISIGDFDRCMKYYNEMLSDGCEPSIDTYTRIITSFLRTRKVADALLMFDEMLRQGIVPPTGTITSFMKQLCSYGPPYAAMMIYKKTRKLECKISTEAYKILLMRLSKFGKCGTLLSVWQEMQECGYSSDVEVYEYIISGLYNIGQLENAVLVMEEALRKGFCPSRLVYSKLSNKLIASNLTERAYRLFLKIKHARSLKNARSHWRDNGWHF*