AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034225.01

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MsG0680034225.01.T01 AT3G14350 26.744 688 414 20 31 662 30 683 5.05e-51 189
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MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 37.368 190 108 2 75 253 219 408 9.64e-26 114
MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 30.741 270 121 6 35 240 34 301 1.37e-23 107
MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 33.133 166 101 1 74 229 362 527 4.62e-19 92.8
MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 35.758 165 96 1 78 232 318 482 1.00e-17 88.6
MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 32.530 166 102 1 74 229 242 407 1.30e-16 84.7
MsG0680034225.01.T01 AT5G56040 33.540 161 97 1 74 224 266 426 4.99e-16 82.8
MsG0680034225.01.T01 AT3G28450 30.631 555 284 19 147 669 90 575 2.33e-50 185
MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 26.984 630 349 19 85 669 400 963 2.68e-50 189
MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 33.125 160 96 2 78 227 202 360 3.69e-15 80.1
MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 26.449 276 147 8 7 232 1 270 2.08e-14 77.8
MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 32.609 138 83 1 96 223 291 428 2.55e-13 73.9
MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 30.247 162 104 2 74 226 222 383 1.56e-12 71.6
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MsG0680034225.01.T01 AT3G19700 32.051 156 92 3 93 238 193 344 1.92e-11 68.2
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MsG0680034225.01.T01 AT2G35620 28.462 650 339 20 34 669 34 571 3.63e-48 179
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MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 30.508 177 96 2 75 224 130 306 4.04e-14 76.6
MsG0680034225.01.T01 AT4G33430 32.203 295 177 6 391 669 323 610 2.42e-46 175
MsG0680034225.01.T01 AT4G33430 35.242 227 132 6 10 224 5 228 7.00e-21 97.8
MsG0680034225.01.T01 AT5G07180 27.244 624 359 16 74 669 361 917 2.55e-46 177
MsG0680034225.01.T01 AT5G07180 40.127 157 80 1 74 230 265 407 1.29e-22 103
MsG0680034225.01.T01 AT5G07180 36.364 198 106 6 78 260 198 390 7.74e-22 101
MsG0680034225.01.T01 AT5G07180 33.846 195 112 3 49 230 313 503 4.10e-20 95.9
MsG0680034225.01.T01 AT5G07180 29.889 271 141 5 17 252 17 273 1.09e-19 94.7
MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 35.714 294 173 5 387 669 652 940 2.55e-46 177
MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 30.387 181 112 3 60 230 80 256 2.37e-16 84.0
MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 34.899 149 82 2 98 231 91 239 2.02e-15 80.9
MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 29.064 203 108 4 78 244 142 344 8.39e-15 79.0
MsG0680034225.01.T01 AT1G53430 32.051 156 95 2 80 224 192 347 2.29e-13 74.3
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MsG0680034225.01.T01 AT4G08850 37.126 167 95 1 74 230 191 357 2.07e-24 109
MsG0680034225.01.T01 AT4G08850 36.782 174 97 2 71 231 161 334 3.55e-24 108
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MsG0680034225.01.T01 AT4G08850 36.111 180 102 2 63 229 225 404 2.27e-22 103
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MsG0680034225.01.T01 AT1G34210 32.542 295 176 6 391 669 292 579 2.93e-46 174
MsG0680034225.01.T01 AT1G34210 39.655 174 84 4 30 200 30 185 6.67e-21 97.8
MsG0680034225.01.T01 AT1G01540 31.322 348 202 7 305 622 26 366 3.08e-46 169
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MsG0680034225.01.T01 AT4G23740 26.048 668 375 21 34 672 31 608 1.72e-45 172
MsG0680034225.01.T01 AT5G35370 33.442 308 162 9 391 666 504 800 1.84e-45 174
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MsG0680034225.01.T01 AT4G23130 34.106 302 178 7 389 676 325 619 8.12e-45 170
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MsG0680034225.01.T01 AT5G10290 33.333 294 175 6 391 669 277 564 8.13e-45 170
MsG0680034225.01.T01 AT5G10290 36.765 204 112 3 5 207 3 190 5.27e-20 95.1
MsG0680034225.01.T01 AT4G23130 34.106 302 178 7 389 676 329 623 8.31e-45 171
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MsG0680034225.01.T01 AT1G68690 29.167 408 244 10 284 667 261 647 9.58e-45 171
MsG0680034225.01.T01 AT4G01330 32.872 289 178 4 392 669 150 433 1.12e-44 167
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MsG0680034225.01.T01 AT1G29740 33.880 183 108 2 60 232 88 267 2.82e-20 96.7
MsG0680034225.01.T01 AT1G29740 31.868 182 88 3 75 223 172 350 1.39e-12 71.6
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MsG0680034225.01.T01 AT3G57830 26.496 702 393 28 30 674 26 661 4.41e-44 168
MsG0680034225.01.T01 AT1G08590 26.562 640 373 20 75 670 415 1001 5.84e-44 170
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MsG0680034225.01.T01 AT2G18470 34.007 297 175 5 387 669 267 556 7.76e-44 167
MsG0680034225.01.T01 AT2G18470 34.007 297 175 5 387 669 267 556 7.76e-44 167
MsG0680034225.01.T01 AT5G62230 27.287 623 359 18 74 669 359 914 9.10e-44 169
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MsG0680034225.01.T01 AT5G62230 36.869 198 105 6 78 260 196 388 3.38e-21 99.4
MsG0680034225.01.T01 AT5G62230 30.996 271 138 6 17 252 15 271 4.31e-21 99.0
MsG0680034225.01.T01 AT5G62230 33.854 192 110 3 49 227 311 498 2.96e-18 90.1
MsG0680034225.01.T01 AT5G62230 35.404 161 93 2 50 200 384 543 7.68e-12 69.3
MsG0680034225.01.T01 AT3G55550 35.254 295 173 6 387 669 329 617 9.77e-44 167
MsG0680034225.01.T01 AT1G29750 34.333 300 175 5 384 669 661 952 9.89e-44 169
MsG0680034225.01.T01 AT1G29750 32.432 222 118 6 74 284 101 301 4.25e-16 83.2
MsG0680034225.01.T01 AT1G29750 27.604 192 104 3 78 235 151 341 4.09e-12 70.1
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MsG0680034225.01.T01 AT5G18500 32.526 289 179 4 392 669 154 437 9.96e-44 164
MsG0680034225.01.T01 AT5G18500 32.526 289 179 4 392 669 154 437 9.96e-44 164
MsG0680034225.01.T01 AT5G18500 32.526 289 179 4 392 669 154 437 9.96e-44 164
MsG0680034225.01.T01 AT1G27190 28.856 603 303 17 98 671 73 578 1.06e-43 166
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MsG0680034225.01.T01 AT1G24030 35.621 306 171 10 383 669 55 353 1.34e-43 161
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MsG0680034225.01.T01 AT1G28440 26.372 656 363 24 72 670 371 963 2.22e-43 168
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MsG0680034225.01.T01 AT1G28440 35.032 157 91 1 85 230 120 276 2.81e-17 87.0
MsG0680034225.01.T01 AT1G28440 28.500 200 130 2 74 260 230 429 2.91e-14 77.0
MsG0680034225.01.T01 AT1G28440 29.126 206 128 3 38 230 363 563 1.46e-13 75.1
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MsG0680034225.01.T01 AT4G05200 32.353 306 187 7 374 666 335 633 4.72e-43 166
MsG0680034225.01.T01 AT1G10620 30.617 405 242 11 293 669 250 643 5.96e-43 166
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MsG0680034225.01.T01 AT1G09440 33.218 289 177 5 392 669 145 428 8.10e-43 161
MsG0680034225.01.T01 AT3G18810 32.997 297 178 5 387 669 320 609 8.41e-43 165
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MsG0680034225.01.T01 AT5G65530 34.797 296 167 9 389 669 128 412 1.45e-42 160
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MsG0680034225.01.T01 AT2G14440 30.058 519 253 18 164 672 417 835 2.02e-42 165
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MsG0680034225.01.T01 AT1G24030 35.959 292 161 10 397 669 1 285 2.41e-42 155
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MsG0680034225.01.T01 AT1G17230 36.306 157 90 1 84 230 198 354 1.77e-17 87.4
MsG0680034225.01.T01 AT1G17230 35.135 185 107 2 61 232 316 500 5.82e-17 85.9
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MsG0680034225.01.T01 AT1G17230 30.539 167 100 2 74 224 158 324 1.53e-14 78.2
MsG0680034225.01.T01 AT1G17230 31.148 183 113 2 61 230 388 570 5.04e-14 76.3
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MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 34.188 117 66 2 128 234 1 116 1.93e-11 68.2
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MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.301 292 162 10 392 669 614 895 7.00e-42 164
MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.792 212 117 4 31 226 31 241 1.04e-27 120
MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.301 292 162 10 392 669 614 895 7.00e-42 164
MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.792 212 117 4 31 226 31 241 1.04e-27 120
MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.301 292 162 10 392 669 614 895 7.00e-42 164
MsG0680034225.01.T01 AT5G01950 36.792 212 117 4 31 226 31 241 1.04e-27 120
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MsG0680034225.01.T01 AT1G07650 31.935 310 193 7 370 666 617 921 1.78e-41 162
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MsG0680034225.01.T01 AT1G07650 30.220 182 93 3 77 224 165 346 3.87e-12 70.5
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MsG0680034225.01.T01 AT1G74360 35.433 127 66 3 76 201 573 684 9.66e-11 65.9
MsG0680034225.01.T01 AT5G03140 33.446 296 169 8 392 669 362 647 2.08e-41 161
MsG0680034225.01.T01 AT4G04540 34.948 289 175 9 390 671 339 621 2.36e-41 160
MsG0680034225.01.T01 AT3G58690 29.367 395 217 12 298 669 8 363 2.84e-41 155
MsG0680034225.01.T01 AT4G23310 32.188 320 192 8 371 676 479 787 2.89e-41 161
MsG0680034225.01.T01 AT5G15730 33.096 281 174 8 391 667 103 373 3.37e-41 156
MsG0680034225.01.T01 AT5G15730 33.096 281 174 8 391 667 103 373 3.37e-41 156
MsG0680034225.01.T01 AT4G23280 32.476 311 189 7 380 676 320 623 3.46e-41 160
MsG0680034225.01.T01 AT4G11470 33.003 303 182 7 388 676 328 623 3.72e-41 160
MsG0680034225.01.T01 AT3G02880 27.116 697 371 29 14 667 8 610 3.92e-41 159
MsG0680034225.01.T01 AT4G11470 33.003 303 182 7 388 676 323 618 4.02e-41 160
MsG0680034225.01.T01 AT1G56130 34.528 307 170 9 388 674 678 973 4.33e-41 161
MsG0680034225.01.T01 AT1G56130 30.693 202 123 4 60 250 89 284 1.81e-16 84.3
MsG0680034225.01.T01 AT1G56130 32.571 175 105 3 63 224 182 356 1.77e-14 77.8
MsG0680034225.01.T01 AT1G56130 29.439 214 93 3 75 230 125 338 2.79e-14 77.4
MsG0680034225.01.T01 AT1G56130 33.690 187 90 6 63 228 214 387 1.39e-11 68.6
MsG0680034225.01.T01 AT4G23320 31.908 304 182 9 389 676 168 462 5.46e-41 157
MsG0680034225.01.T01 AT4G23320 31.908 304 182 9 389 676 168 462 5.46e-41 157
MsG0680034225.01.T01 AT5G37450 33.788 293 171 8 392 671 416 698 5.48e-41 160
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MsG0680034225.01.T01 AT1G51820 26.195 523 299 12 161 672 142 588 1.81e-40 157
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MsG0680034225.01.T01 AT4G23270 31.646 316 191 8 368 669 294 598 1.82e-40 157
MsG0680034225.01.T01 AT4G34440 33.447 293 172 6 392 669 300 584 1.98e-40 157
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MsG0680034225.01.T01 AT5G57670 32.660 297 182 7 384 671 249 536 2.04e-40 156
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MsG0680034225.01.T01 AT5G54590 33.101 287 174 7 390 669 101 376 3.85e-40 153
MsG0680034225.01.T01 AT1G51830 27.969 522 282 16 164 672 218 658 4.35e-40 157
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MsG0680034225.01.T01 AT2G42960 31.834 289 181 4 392 669 171 454 5.32e-40 154
MsG0680034225.01.T01 AT2G42960 31.834 289 181 4 392 669 171 454 5.32e-40 154
MsG0680034225.01.T01 AT2G42960 31.834 289 181 4 392 669 171 454 5.32e-40 154
MsG0680034225.01.T01 AT1G51830 27.969 522 282 16 164 672 225 665 6.04e-40 157
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MsG0680034225.01.T01 AT5G20480 31.061 264 152 10 8 258 5 251 8.52e-22 101
MsG0680034225.01.T01 AT5G20480 37.975 158 87 2 85 231 356 513 1.43e-21 100
MsG0680034225.01.T01 AT5G20480 33.871 124 71 1 117 229 340 463 4.34e-13 73.6
MsG0680034225.01.T01 AT3G17420 30.450 289 185 4 392 669 142 425 7.08e-40 153
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MsG0680034225.01.T01 AT1G61420 29.396 381 218 14 299 665 421 764 7.20e-40 157
MsG0680034225.01.T01 AT3G13690 32.180 289 179 5 392 669 399 681 7.56e-40 157
MsG0680034225.01.T01 AT3G13690 32.180 289 179 5 392 669 399 681 7.56e-40 157
MsG0680034225.01.T01 AT3G13690 32.180 289 179 5 392 669 399 681 7.56e-40 157
MsG0680034225.01.T01 AT4G11480 32.258 310 183 7 388 676 305 608 9.38e-40 155
MsG0680034225.01.T01 AT1G61360 31.420 331 197 12 355 669 374 690 9.99e-40 156
MsG0680034225.01.T01 AT1G61360 31.420 331 197 12 355 669 374 690 9.99e-40 156
MsG0680034225.01.T01 AT1G61360 31.420 331 197 12 355 669 374 690 9.99e-40 156
MsG0680034225.01.T01 AT1G79620 29.306 389 222 12 295 669 559 908 1.07e-39 157
MsG0680034225.01.T01 AT1G79620 30.216 278 140 8 5 240 15 280 4.18e-20 95.9
MsG0680034225.01.T01 AT1G51820 26.195 523 299 12 161 672 404 850 1.22e-39 157
MsG0680034225.01.T01 AT1G70110 30.263 304 193 6 382 673 322 618 1.24e-39 155
MsG0680034225.01.T01 AT1G79620 29.306 389 222 12 295 669 585 934 1.28e-39 157
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MsG0680034225.01.T01 AT1G55200 31.142 289 182 5 392 669 367 649 2.73e-38 151
MsG0680034225.01.T01 AT1G55200 31.142 289 182 5 392 669 367 649 2.73e-38 151
MsG0680034225.01.T01 AT4G29990 26.782 519 277 16 164 669 414 842 2.76e-38 152
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MsG0680034225.01.T01 AT4G23200 32.226 301 181 8 387 673 321 612 3.09e-38 151
MsG0680034225.01.T01 AT1G25390 33.003 303 177 8 384 669 271 564 3.12e-38 150
MsG0680034225.01.T01 AT1G25390 33.003 303 177 8 384 669 271 564 3.12e-38 150
MsG0680034225.01.T01 AT2G17220 31.561 301 175 8 392 669 74 366 3.83e-38 147
MsG0680034225.01.T01 AT2G17220 31.561 301 175 8 392 669 75 367 4.21e-38 147
MsG0680034225.01.T01 AT1G61400 28.646 384 213 15 297 665 431 768 4.41e-38 152
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MsG0680034225.01.T01 AT5G16900 26.824 507 275 14 185 672 230 659 5.37e-38 150
MsG0680034225.01.T01 AT4G04570 37.273 220 131 6 391 609 171 384 5.88e-38 146
MsG0680034225.01.T01 AT1G61500 30.903 288 178 9 392 665 461 741 6.36e-38 151
MsG0680034225.01.T01 AT4G11900 33.673 294 173 8 392 671 456 741 6.68e-38 151
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MsG0680034225.01.T01 AT4G11900 33.673 294 173 8 392 671 525 810 1.27e-37 150
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MsG0680034225.01.T01 AT3G59750 34.551 301 167 10 391 673 290 578 1.46e-37 149
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MsG0680034225.01.T01 AT2G28250 31.250 304 178 8 390 669 196 492 2.49e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT2G28250 31.250 304 178 8 390 669 196 492 2.49e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT2G28250 31.250 304 178 8 390 669 196 492 2.49e-36 144
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MsG0680034225.01.T01 AT5G24080 31.058 293 176 8 392 669 520 801 2.81e-36 146
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MsG0680034225.01.T01 AT1G67520 32.990 291 171 9 392 666 491 773 3.82e-36 146
MsG0680034225.01.T01 AT4G23190 30.341 323 169 9 294 608 275 549 3.89e-36 144
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MsG0680034225.01.T01 AT2G43700 33.562 292 174 8 391 670 299 582 3.97e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT2G43700 33.562 292 174 8 391 670 299 582 3.97e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT4G28670 32.423 293 173 8 392 667 319 603 4.25e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT2G43700 33.562 292 174 8 391 670 323 606 4.44e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT3G14350 25.399 689 394 21 31 662 30 655 4.75e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT5G40380 33.824 272 149 7 376 632 293 548 4.87e-36 143
MsG0680034225.01.T01 AT5G59260 31.525 295 183 8 391 673 342 629 5.12e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT3G46400 31.633 294 179 8 391 672 565 848 6.14e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT4G21390 32.381 315 184 12 309 616 442 734 6.45e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT4G23180 35.622 233 139 6 379 608 323 547 6.81e-36 143
MsG0680034225.01.T01 AT1G52310 31.741 293 180 8 392 669 178 465 6.85e-36 142
MsG0680034225.01.T01 AT4G21380 31.208 298 184 7 394 676 516 807 7.26e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT1G61380 29.333 300 194 7 382 669 319 612 7.36e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT1G65790 29.932 294 184 7 399 676 514 801 9.20e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT4G23160 30.263 304 188 8 381 669 336 630 9.22e-36 144
MsG0680034225.01.T01 AT2G19230 25.486 514 267 14 171 669 426 838 9.68e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT2G19210 26.769 523 268 19 166 669 420 846 9.93e-36 145
MsG0680034225.01.T01 AT2G19130 31.973 294 174 10 392 669 483 766 1.02e-35 144
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 26.332 638 367 22 78 669 414 994 1.05e-35 145
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 34.711 242 135 8 20 248 13 244 3.74e-24 108
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 35.503 169 99 1 69 227 357 525 1.92e-17 87.4
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 37.333 150 83 2 92 230 331 480 3.72e-16 83.2
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 34.524 168 95 4 66 219 152 318 2.98e-15 80.5
MsG0680034225.01.T01 AT3G47570 31.765 170 105 2 74 232 337 506 4.32e-14 76.6
MsG0680034225.01.T01 AT3G02810 31.959 291 177 9 392 666 52 337 1.06e-35 142
MsG0680034225.01.T01 AT2G18890 32.082 293 176 9 385 662 46 330 1.09e-35 138
MsG0680034225.01.T01 AT1G61380 29.333 300 194 7 382 669 466 759 1.12e-35 144
MsG0680034225.01.T01 AT1G51805 25.564 532 289 16 161 672 381 825 1.15e-35 144
MsG0680034225.01.T01 AT3G21630 33.887 301 164 11 388 669 306 590 1.19e-35 143
MsG0680034225.01.T01 AT2G18890 31.667 300 182 9 385 669 46 337 1.22e-35 139
MsG0680034225.01.T01 AT1G10850 24.636 686 377 24 30 667 32 625 1.23e-35 143
MsG0680034225.01.T01 AT5G47070 31.803 305 177 9 388 669 69 365 1.31e-35 139

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTTGTGTATGAATACAATT+TGG 0.165366 6:-83989429 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTTCATAACAATACCCTTTC+TGG 0.195032 6:-83990195 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTGCAAGGAAAAGGACTTTC+TGG 0.198916 6:-83991305 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGCTGAACTAAAAGCACTTT+TGG 0.203506 6:-83991453 MsG0680034225.01.T01:CDS
AAAAGCGATGTTTACGCTTT+TGG 0.223225 6:-83987684 MsG0680034225.01.T01:CDS
CTTTCTCGGCTGAGATGTTT+TGG 0.235667 6:+83987856 None:intergenic
ACCTTCTGAGATTGGTAAAA+TGG 0.245707 6:-83991132 MsG0680034225.01.T01:CDS
AACTTTATATCGGCAGTTTC+TGG 0.247779 6:+83989293 None:intergenic
ATCATTGAGGAATGATAATT+TGG 0.250903 6:-83988766 MsG0680034225.01.T01:CDS
GCTAGTGATCTTATGCTTTC+CGG 0.267092 6:+83987638 None:intergenic
TATGCTTTCCGGTGAGTATC+TGG 0.274658 6:+83987649 None:intergenic
TTTGGATTTAAAGTCAAGTT+TGG 0.296723 6:-83991435 MsG0680034225.01.T01:CDS
ACTAGAGTTTCTATCGTAAA+AGG 0.304201 6:-83988612 MsG0680034225.01.T01:CDS
GACATGATCTGAAGCATTGC+AGG 0.321259 6:+83989373 None:intergenic
CCATAAGGTTCAGGTCTGTT+TGG 0.324711 6:+83989347 None:intergenic
AGAATCGTCCATGGAGATTC+TGG 0.329666 6:+83987568 None:intergenic
GGAACATCAGCTAGTTTAGT+TGG 0.333073 6:+83990237 None:intergenic
CGGCCGGTGGTAGTGTATTC+AGG 0.335766 6:+83987717 None:intergenic
GATTCTGGTCAATGAATTCT+TGG 0.336888 6:+83987583 None:intergenic
TTGTCTTCATGGAAAATTCA+TGG 0.352670 6:-83991395 MsG0680034225.01.T01:CDS
AACTTTAGTGCAACGTATAA+AGG 0.353842 6:-83988888 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTTAGCCTTGAATATGCTAA+TGG 0.357636 6:-83989044 MsG0680034225.01.T01:CDS
TATTACTGTCGGCATAGTTC+TGG 0.359254 6:-83989216 MsG0680034225.01.T01:CDS
CCAAACAGACCTGAACCTTA+TGG 0.366404 6:-83989347 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTGCATTACAATTCTTTGTA+TGG 0.368304 6:-83991233 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTTGTGTATGAATACAATTT+GGG 0.368364 6:-83989428 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGGACGAGGTGAATGCTTCT+TGG 0.370554 6:-83988715 MsG0680034225.01.T01:CDS
CATTGTCTTCTCTTCACTAA+AGG 0.380936 6:-83987766 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTCTCGGAGTTGAATTTGTT+GGG 0.383375 6:-83988918 MsG0680034225.01.T01:CDS
AATCCGGTGCTCTCGGATTC+CGG 0.387386 6:-83987813 MsG0680034225.01.T01:CDS
CAGTGTTTGTGTTTGGTTTG+AGG 0.388219 6:+83991639 None:intergenic
AATGAATTCTTGGAACTTGA+AGG 0.389731 6:+83987593 None:intergenic
AAACTCTAGTTGACCATTCA+AGG 0.400679 6:+83988625 None:intergenic
ATTGTCTTCTCTTCACTAAA+GGG 0.401006 6:-83987765 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGTTGTTCAGTGTTTGTGTT+TGG 0.402133 6:+83991632 None:intergenic
AAAAGCTAATCCTTCAGTTA+AGG 0.412636 6:+83987291 None:intergenic
TGGTTTGATCGGTACTTAAA+CGG 0.418624 6:+83989099 None:intergenic
AGGTGTAGCTTGTAATGAAA+AGG 0.419803 6:-83991348 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGCTAATGGATGGGACCCTT+TGG 0.426986 6:-83989030 MsG0680034225.01.T01:CDS
ACTCCTGCTCCATAAGGTTC+AGG 0.427178 6:+83989338 None:intergenic
TTGAATGTTAATCATTTGTC+TGG 0.431305 6:-83991161 MsG0680034225.01.T01:CDS
CATCGATCAGCGACAGAATC+CGG 0.434366 6:-83987829 MsG0680034225.01.T01:CDS
AATGTTTCATTGCAAGGAAA+AGG 0.435033 6:-83991314 MsG0680034225.01.T01:CDS
ATTGCAAGGCAACTTTATAT+CGG 0.435539 6:+83989283 None:intergenic
ACAATTGCAGTGTCAGCAAT+AGG 0.445730 6:-83989191 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTCAAGTTAGCAATTTCCTT+AGG 0.452240 6:+83991203 None:intergenic
TTTCTCGGAGTTGAATTTGT+TGG 0.454039 6:-83988919 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGTAAAATGGAGAGTCTTCA+AGG 0.454606 6:-83991119 MsG0680034225.01.T01:intron
GTTGCAAATGTTTCATTGCA+AGG 0.460623 6:-83991320 MsG0680034225.01.T01:CDS
CGTTGGTGAGAAGCTTATAT+AGG 0.463958 6:+83987790 None:intergenic
GATAATTTGGTGAGGTTGAG+AGG 0.467183 6:-83988753 MsG0680034225.01.T01:CDS
AATTTGGGATTATGCGGAGT+TGG 0.469520 6:-83989413 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGTGAAATACCTTCTGAGAT+TGG 0.470768 6:-83991140 MsG0680034225.01.T01:CDS
CTGATCGATGAGCACTTTCT+CGG 0.472370 6:+83987842 None:intergenic
CCTGCTAGTCTAGGTGACTT+AGG 0.473690 6:-83990309 MsG0680034225.01.T01:CDS
ACATCCAAAACTTGAAGAAA+AGG 0.475328 6:+83990216 None:intergenic
GTATATTCCCTTGGTTTGAT+CGG 0.477245 6:+83989088 None:intergenic
TTCTTGAACAATAGCTTCCA+TGG 0.479326 6:+83987473 None:intergenic
GTTTGTGTTTGGTTTGAGGA+TGG 0.480822 6:+83991643 None:intergenic
AGCTGCAAAACTAGCAAGAA+TGG 0.482951 6:-83987535 MsG0680034225.01.T01:CDS
AAGTAAAACTAGTTGCAAAT+CGG 0.488793 6:-83988826 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGTGTTTGGTTTGAGGATGG+TGG 0.490740 6:+83991646 None:intergenic
GAAGCTATTGTTCAAGAACT+TGG 0.492886 6:-83987468 MsG0680034225.01.T01:CDS
GACAAAAGTTTGTAGAGAAG+TGG 0.492950 6:+83991676 None:intergenic
CCCATCCATTAGCATATTCA+AGG 0.493272 6:+83989039 None:intergenic
CAGGAGGTACATTGCCAGAA+AGG 0.494974 6:+83990181 None:intergenic
GGTGATTTGAAGCATTTGAC+AGG 0.495782 6:-83991263 MsG0680034225.01.T01:CDS
TAGGTTCAACTTGGAAGAAG+TGG 0.500035 6:-83988958 MsG0680034225.01.T01:CDS
CTACAGTCAAACAAGTTAGC+TGG 0.501343 6:-83990339 MsG0680034225.01.T01:CDS
GATCAAAACCTTTGTGATGA+TGG 0.502905 6:-83987354 MsG0680034225.01.T01:three_prime_UTR
GGGACCCTTTGGCTGATAGT+AGG 0.503316 6:-83989019 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGAACAATAGCTTCCATGGT+TGG 0.509942 6:+83987477 None:intergenic
CCTAAGTCACCTAGACTAGC+AGG 0.510741 6:+83990309 None:intergenic
GGTGTAGCTTGTAATGAAAA+GGG 0.511284 6:-83991347 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTCTCAATACCTTGATGTGA+AGG 0.511375 6:-83988664 MsG0680034225.01.T01:CDS
GCCTTGAATATGCTAATGGA+TGG 0.511991 6:-83989040 MsG0680034225.01.T01:CDS
GAACCAACTCCTGCTCCATA+AGG 0.512110 6:+83989332 None:intergenic
ACTAAAGGGTAGTGCTGCAA+AGG 0.515638 6:-83987751 MsG0680034225.01.T01:CDS
ATCGTAAAAGGAATTGCTAA+AGG 0.517811 6:-83988600 MsG0680034225.01.T01:intron
GAACCTTATGGAGCAGGAGT+TGG 0.518055 6:-83989335 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTCCGGTGAGTATCTGGAAA+AGG 0.522381 6:+83987655 None:intergenic
ACGAAGGTGAATTTCTCAAA+GGG 0.525849 6:-83988803 MsG0680034225.01.T01:CDS
AGGAGGTACATTGCCAGAAA+GGG 0.526549 6:+83990182 None:intergenic
TGTTCTATGTCCTTAACTGA+AGG 0.526863 6:-83987301 MsG0680034225.01.T01:three_prime_UTR
ATCCGCGACTCAGTATTTCT+CGG 0.529606 6:-83988934 MsG0680034225.01.T01:CDS
CGTCGGCGTAAGCAAAAGCT+TGG 0.529640 6:-83989146 MsG0680034225.01.T01:CDS
ATCAAACCAAGGGAATATAC+AGG 0.532235 6:-83989085 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGCTTCAAATCACCAATGGC+TGG 0.532238 6:+83991272 None:intergenic
GCGACAGAATCCGGTGCTCT+CGG 0.536005 6:-83987820 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTTGTATGGTGATATACCTA+AGG 0.536019 6:-83991219 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTTTGGTTTGAGGATGGTGG+AGG 0.550731 6:+83991649 None:intergenic
GGTAAATTATCACCAGCCAT+TGG 0.551123 6:-83991284 MsG0680034225.01.T01:CDS
CTTTCTGGCAATGTACCTCC+TGG 0.552315 6:-83990180 MsG0680034225.01.T01:intron
CCTTCAAAAGATTCATCACA+AGG 0.552974 6:+83991368 None:intergenic
AGACCTGAACCTTATGGAGC+AGG 0.553469 6:-83989341 MsG0680034225.01.T01:CDS
TGGCATCGAGTTGTATTGCA+AGG 0.562069 6:+83989269 None:intergenic
TCCATGGTTGGCCTCTCGAA+AGG 0.564493 6:+83987489 None:intergenic
AATTCCTACTATCAGCCAAA+GGG 0.565172 6:+83989015 None:intergenic
CTAAAGGGTAGTGCTGCAAA+GGG 0.568009 6:-83987750 MsG0680034225.01.T01:CDS
CATCACCTTCCTTCACATCA+AGG 0.568527 6:+83988655 None:intergenic
TTCATTGACCAGAATCTCCA+TGG 0.568978 6:-83987576 MsG0680034225.01.T01:CDS
TAAAACTTGTGCGTTAGTGA+TGG 0.569116 6:+83987396 None:intergenic
GACGAAGGTGAATTTCTCAA+AGG 0.570106 6:-83988804 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGAGCTATACCTGCTAGTCT+AGG 0.572059 6:-83990318 MsG0680034225.01.T01:CDS
AGGAGTTGGTTCTATGTCAA+AGG 0.572684 6:-83989321 MsG0680034225.01.T01:CDS
GCCTCTCGAAAGGAGAGTCG+TGG 0.576047 6:+83987499 None:intergenic
ACGCCGACGGTACATTGTAA+AGG 0.578169 6:+83989160 None:intergenic
GAATACAATTTGGGATTATG+CGG 0.579531 6:-83989419 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGTGAGAAGCTTATATAGGC+CGG 0.579917 6:+83987794 None:intergenic
TCCTTTCGAGAGGCCAACCA+TGG 0.581206 6:-83987490 MsG0680034225.01.T01:CDS
GGAAGCATACCTACTCAGCT+TGG 0.587811 6:-83990390 MsG0680034225.01.T01:CDS
CAAATGCTTCAAATCACCAA+TGG 0.591769 6:+83991268 None:intergenic
CAATACCTTGATGTGAAGGA+AGG 0.592235 6:-83988660 MsG0680034225.01.T01:CDS
AGGCCGGAATCCGAGAGCAC+CGG 0.593500 6:+83987810 None:intergenic
TGAAGAGAAGACAATGTCGT+TGG 0.596163 6:+83987773 None:intergenic
GCTGATAGTAGGAATTTCAA+CGG 0.596242 6:-83989008 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTCAGATCACCAAGCTGAGT+AGG 0.599147 6:+83990381 None:intergenic
AAAACAGCATCTATTACTGT+CGG 0.601513 6:-83989227 MsG0680034225.01.T01:CDS
AAATTCCTACTATCAGCCAA+AGG 0.605608 6:+83989014 None:intergenic
CCTTGAATATGCTAATGGAT+GGG 0.606008 6:-83989039 MsG0680034225.01.T01:CDS
CCCACGACTCTCCTTTCGAG+AGG 0.608182 6:-83987500 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTGATGGTGAAGTCCTTGAA+TGG 0.618540 6:-83988638 MsG0680034225.01.T01:CDS
GTGACTTAGGAATGTTGATG+AGG 0.622938 6:-83990296 MsG0680034225.01.T01:CDS
CCTCTCGAAAGGAGAGTCGT+GGG 0.625965 6:+83987500 None:intergenic
CTGAATACACTACCACCGGC+CGG 0.626402 6:-83987716 MsG0680034225.01.T01:CDS
CGGTGAGTATCTGGAAAAGG+AGG 0.629633 6:+83987658 None:intergenic
GCTCCTGAATACACTACCAC+CGG 0.633750 6:-83987720 MsG0680034225.01.T01:CDS
TTTAAGTACCGATCAAACCA+AGG 0.637158 6:-83989096 MsG0680034225.01.T01:CDS
CATATTCGAAGAATCGTCCA+TGG 0.642015 6:+83987559 None:intergenic
GCATATTCAAGGCTAACCAA+AGG 0.643023 6:+83989050 None:intergenic
TTTATCGGTGAACCGGCCGG+TGG 0.643109 6:+83987704 None:intergenic
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CRISPR-GE

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ACGAAGGTGAATTTCTCAAA+GGG - Chr6:83990157-83990176 MsG0680034225.01.T01:intron 35.0%
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CATTGTCTTCTCTTCACTAA+AGG - Chr6:83991194-83991213 MsG0680034225.01.T01:CDS 35.0%
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! CCTTGTGATGAATCTTTTGA+AGG - Chr6:83987592-83987611 MsG0680034225.01.T01:CDS 35.0%
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! GTATATTCCCTTGGTTTGAT+CGG + Chr6:83989875-83989894 None:intergenic 35.0%
! TCCATTTTACCAATCTCAGA+AGG + Chr6:83987832-83987851 None:intergenic 35.0%
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!! GTTAGCCTTGAATATGCTAA+TGG - Chr6:83989916-83989935 MsG0680034225.01.T01:intron 35.0%
!! TGAACCTTGATTTGTGAATC+AGG - Chr6:83991033-83991052 MsG0680034225.01.T01:intron 35.0%
!! TTAAGTACCGATCAAACCAA+GGG - Chr6:83989865-83989884 MsG0680034225.01.T01:intron 35.0%
!! TTTAAGTACCGATCAAACCA+AGG - Chr6:83989864-83989883 MsG0680034225.01.T01:intron 35.0%
!!! TGAGATGTTTTGGTGAACAA+GGG + Chr6:83991097-83991116 None:intergenic 35.0%
!!! TGCTGAACTAAAAGCACTTT+TGG - Chr6:83987507-83987526 MsG0680034225.01.T01:CDS 35.0%
AACAGCGTCTCACACATTTA+CGG + Chr6:83989150-83989169 None:intergenic 40.0%
AAGTCAAGTTTGGATCCACA+AGG - Chr6:83987535-83987554 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
AATCATGCAGTCATGACTGT+TGG - Chr6:83990570-83990589 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
ACAATTGCAGTGTCAGCAAT+AGG - Chr6:83989769-83989788 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
ACTCATCACCATCATCACAA+AGG + Chr6:83991617-83991636 None:intergenic 40.0%
AGCTGCAAAACTAGCAAGAA+TGG - Chr6:83991425-83991444 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
ATATAATGTGCACCAGGGAA+CGG + Chr6:83990790-83990809 None:intergenic 40.0%
ATATACTGTTTACCGTTCCC+TGG - Chr6:83990775-83990794 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
ATGTCGTCCGTTAGTTAGTT+TGG + Chr6:83989032-83989051 None:intergenic 40.0%
CAATACCTTGATGTGAAGGA+AGG - Chr6:83990300-83990319 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
CAGGAAAAATGGATCTCCTT+TGG - Chr6:83989894-83989913 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
CATATTCGAAGAATCGTCCA+TGG + Chr6:83991404-83991423 None:intergenic 40.0%
CCCATCCATTAGCATATTCA+AGG + Chr6:83989924-83989943 None:intergenic 40.0%
CCGAAGATGTATTTCAAGCT+CGG + Chr6:83990653-83990672 None:intergenic 40.0%
CCGAGCTTGAAATACATCTT+CGG - Chr6:83990650-83990669 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
CTACAGTCAAACAAGTTAGC+TGG - Chr6:83988621-83988640 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
GACGAAGGTGAATTTCTCAA+AGG - Chr6:83990156-83990175 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
GCATATTCAAGGCTAACCAA+AGG + Chr6:83989913-83989932 None:intergenic 40.0%
GCCTTGAATATGCTAATGGA+TGG - Chr6:83989920-83989939 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
GCTAGTGATCTTATGCTTTC+CGG + Chr6:83991325-83991344 None:intergenic 40.0%
GGTAAAATGGAGAGTCTTCA+AGG - Chr6:83987841-83987860 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
GGTAAATTATCACCAGCCAT+TGG - Chr6:83987676-83987695 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
GTCTCAATACCTTGATGTGA+AGG - Chr6:83990296-83990315 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
GTGACTTAGGAATGTTGATG+AGG - Chr6:83988664-83988683 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
TACAAATAGATGCCTGCAAG+TGG + Chr6:83990534-83990553 None:intergenic 40.0%
TAGGTATGCTTCCTGTTAAC+TGG + Chr6:83988563-83988582 None:intergenic 40.0%
TAGGTTCAACTTGGAAGAAG+TGG - Chr6:83990002-83990021 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
TATTACTGTCGGCATAGTTC+TGG - Chr6:83989744-83989763 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
TCGAGGACCAAACTAACTAA+CGG - Chr6:83989279-83989298 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
TGAACAATAGCTTCCATGGT+TGG + Chr6:83991486-83991505 None:intergenic 40.0%
TGAAGAGAAGACAATGTCGT+TGG + Chr6:83991190-83991209 None:intergenic 40.0%
TGCAAAACGAAACACACTTG+AGG + Chr6:83988956-83988975 None:intergenic 40.0%
TGTCCTTTACAATGTACCGT+CGG - Chr6:83989797-83989816 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
TTCATTGACCAGAATCTCCA+TGG - Chr6:83991384-83991403 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAAGGAAAAGGACTTTC+TGG - Chr6:83987655-83987674 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGTACATCCGGTAACAA+CGG + Chr6:83988920-83988939 None:intergenic 40.0%
! AATTTGGGATTATGCGGAGT+TGG - Chr6:83989547-83989566 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
! CGTTGGTGAGAAGCTTATAT+AGG + Chr6:83991173-83991192 None:intergenic 40.0%
! GATAATTTGGTGAGGTTGAG+AGG - Chr6:83990207-83990226 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
! GGAACATCAGCTAGTTTAGT+TGG + Chr6:83988726-83988745 None:intergenic 40.0%
! GGTGATTTGAAGCATTTGAC+AGG - Chr6:83987697-83987716 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
!! AGGAGTTGGTTCTATGTCAA+AGG - Chr6:83989639-83989658 MsG0680034225.01.T01:intron 40.0%
!! CAGTGTTTGTGTTTGGTTTG+AGG + Chr6:83987324-83987343 None:intergenic 40.0%
!! GAAGTGCCTCTGAGTTTTAA+GGG + Chr6:83990752-83990771 None:intergenic 40.0%
!! GGTGAAATACCTTCTGAGAT+TGG - Chr6:83987820-83987839 MsG0680034225.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTTGTGTTTGGTTTGAGGA+TGG + Chr6:83987320-83987339 None:intergenic 40.0%
!!! AGAAGTGCCTCTGAGTTTTA+AGG + Chr6:83990753-83990772 None:intergenic 40.0%
!!! CTGAGATGTTTTGGTGAACA+AGG + Chr6:83991098-83991117 None:intergenic 40.0%
AACGGCGTCTCACACATTTA+CGG + Chr6:83988902-83988921 None:intergenic 45.0%
ACTAAAGGGTAGTGCTGCAA+AGG - Chr6:83991209-83991228 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
ACTAGTTGCAAATCGGACGA+AGG - Chr6:83990141-83990160 MsG0680034225.01.T01:intron 45.0%
AGAATCGTCCATGGAGATTC+TGG + Chr6:83991395-83991414 None:intergenic 45.0%
ATCCGCGACTCAGTATTTCT+CGG - Chr6:83990026-83990045 MsG0680034225.01.T01:intron 45.0%
CATCACCTTCCTTCACATCA+AGG + Chr6:83990308-83990327 None:intergenic 45.0%
CCAAACAGACCTGAACCTTA+TGG - Chr6:83989613-83989632 MsG0680034225.01.T01:intron 45.0%
CCATAAGGTTCAGGTCTGTT+TGG + Chr6:83989616-83989635 None:intergenic 45.0%
CTAAAGGGTAGTGCTGCAAA+GGG - Chr6:83991210-83991229 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
CTGATCGATGAGCACTTTCT+CGG + Chr6:83991121-83991140 None:intergenic 45.0%
CTTGATGTGAAGGAAGGTGA+TGG - Chr6:83990306-83990325 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCAACTTGATTACCAGG+AGG + Chr6:83988798-83988817 None:intergenic 45.0%
GGTGAGAAGCTTATATAGGC+CGG + Chr6:83991169-83991188 None:intergenic 45.0%
GTTCTCGTTGTCTCGTAACT+TGG - Chr6:83990497-83990516 MsG0680034225.01.T01:intron 45.0%
TATGCTTTCCGGTGAGTATC+TGG + Chr6:83991314-83991333 None:intergenic 45.0%
TGCTTCAAATCACCAATGGC+TGG + Chr6:83987691-83987710 None:intergenic 45.0%
TTCAGATCACCAAGCTGAGT+AGG + Chr6:83988582-83988601 None:intergenic 45.0%
TTCCGGTGAGTATCTGGAAA+AGG + Chr6:83991308-83991327 None:intergenic 45.0%
! ACTAACGGACGACATATCTG+AGG - Chr6:83989037-83989056 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! AGAGGATTTTGTTGCTCGAG+GGG - Chr6:83990225-83990244 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! AGGAGGTACATTGCCAGAAA+GGG + Chr6:83988781-83988800 None:intergenic 45.0%
! CTCCTTTTCCAGATACTCAC+CGG - Chr6:83991303-83991322 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTCTCGGCTGAGATGTTT+TGG + Chr6:83991107-83991126 None:intergenic 45.0%
! GAGAGGATTTTGTTGCTCGA+GGG - Chr6:83990224-83990243 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! GTGATGGTGAAGTCCTTGAA+TGG - Chr6:83990322-83990341 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGAGGATTTTGTTGCTCG+AGG - Chr6:83990223-83990242 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
! TGGCATCGAGTTGTATTGCA+AGG + Chr6:83989694-83989713 None:intergenic 45.0%
! TGGTAGTGTATTCAGGAGCA+AGG + Chr6:83991239-83991258 None:intergenic 45.0%
!! CATCGCTTTTATCGGTGAAC+CGG + Chr6:83991266-83991285 None:intergenic 45.0%
!! GACATGATCTGAAGCATTGC+AGG + Chr6:83989590-83989609 None:intergenic 45.0%
!! GACGCTGTTACACTGATTTG+CGG - Chr6:83989161-83989180 MsG0680034225.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTGTTTGGTTTGAGGATGG+TGG + Chr6:83987317-83987336 None:intergenic 45.0%
!!! ATGTTTTGGTGAACAAGGGC+TGG + Chr6:83991093-83991112 None:intergenic 45.0%
!!! TGAGTTTTAAGGGCGGCAAA+AGG + Chr6:83990742-83990761 None:intergenic 45.0%
!!! CTAAAATATAATTTTTAATT+AGG - Chr6:83988046-83988065 MsG0680034225.01.T01:intron 5.0%
ACGCCGACGGTACATTGTAA+AGG + Chr6:83989803-83989822 None:intergenic 50.0%
ACTCCTGCTCCATAAGGTTC+AGG + Chr6:83989625-83989644 None:intergenic 50.0%
ACTTGAAGGATTCTGCTGCG+AGG + Chr6:83991356-83991375 None:intergenic 50.0%
AGACCTGAACCTTATGGAGC+AGG - Chr6:83989619-83989638 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
CAACGAGAACCTTACCGTAG+TGG + Chr6:83990487-83990506 None:intergenic 50.0%
CATCGATCAGCGACAGAATC+CGG - Chr6:83991131-83991150 MsG0680034225.01.T01:CDS 50.0%
CCTAAGTCACCTAGACTAGC+AGG + Chr6:83988654-83988673 None:intergenic 50.0%
CCTTTGCACTACTGCCACTA+CGG - Chr6:83990470-83990489 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
CGGTGAGTATCTGGAAAAGG+AGG + Chr6:83991305-83991324 None:intergenic 50.0%
CTCCGAGAAATACTGAGTCG+CGG + Chr6:83990031-83990050 None:intergenic 50.0%
CTCGTTGTCTCGTAACTTGG+AGG - Chr6:83990500-83990519 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
GAACCAACTCCTGCTCCATA+AGG + Chr6:83989631-83989650 None:intergenic 50.0%
GAACCTTATGGAGCAGGAGT+TGG - Chr6:83989625-83989644 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
TTGCCGCCCTTAAAACTCAG+AGG - Chr6:83990743-83990762 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
! CAAGCTTTTGCTTACGCCGA+CGG + Chr6:83989816-83989835 None:intergenic 50.0%
! CAGGAGGTACATTGCCAGAA+AGG + Chr6:83988782-83988801 None:intergenic 50.0%
! CCTGCTAGTCTAGGTGACTT+AGG - Chr6:83988651-83988670 MsG0680034225.01.T01:CDS 50.0%
! CTTTCTGGCAATGTACCTCC+TGG - Chr6:83988780-83988799 MsG0680034225.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGCATACCTACTCAGCT+TGG - Chr6:83988570-83988589 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
! GGAGCTATACCTGCTAGTCT+AGG - Chr6:83988642-83988661 MsG0680034225.01.T01:CDS 50.0%
! TGCTAATGGATGGGACCCTT+TGG - Chr6:83989930-83989949 MsG0680034225.01.T01:intron 50.0%
!! GTTTGGTTTGAGGATGGTGG+AGG + Chr6:83987314-83987333 None:intergenic 50.0%
!! TTTTAAGGGCGGCAAAAGGC+GGG + Chr6:83990738-83990757 None:intergenic 50.0%
!!! GTGCCTCTGAGTTTTAAGGG+CGG + Chr6:83990749-83990768 None:intergenic 50.0%
!!! GTTTTAAGGGCGGCAAAAGG+CGG + Chr6:83990739-83990758 None:intergenic 50.0%
AATCCGGTGCTCTCGGATTC+CGG - Chr6:83991147-83991166 MsG0680034225.01.T01:CDS 55.0%
CCGTAGTGGCAGTAGTGCAA+AGG + Chr6:83990473-83990492 None:intergenic 55.0%
CCTCTCGAAAGGAGAGTCGT+GGG + Chr6:83991463-83991482 None:intergenic 55.0%
CGTCGGCGTAAGCAAAAGCT+TGG - Chr6:83989814-83989833 MsG0680034225.01.T01:intron 55.0%
GAGGCAATCTCTCCACTTGC+AGG - Chr6:83990519-83990538 MsG0680034225.01.T01:intron 55.0%
GCACTACTGCCACTACGGTA+AGG - Chr6:83990475-83990494 MsG0680034225.01.T01:intron 55.0%
GGGACCCTTTGGCTGATAGT+AGG - Chr6:83989941-83989960 MsG0680034225.01.T01:intron 55.0%
GGGACGAGGTGAATGCTTCT+TGG - Chr6:83990245-83990264 MsG0680034225.01.T01:CDS 55.0%
GTGGCAGTAGTGCAAAGGCT+TGG + Chr6:83990468-83990487 None:intergenic 55.0%
GTGTGAGACGCCGTTGTTAC+CGG - Chr6:83988907-83988926 MsG0680034225.01.T01:CDS 55.0%
TCCTTTCGAGAGGCCAACCA+TGG - Chr6:83991470-83991489 MsG0680034225.01.T01:CDS 55.0%
! CTTTTATCGGTGAACCGGCC+GGG + Chr6:83991261-83991280 None:intergenic 55.0%
! GCTTTTATCGGTGAACCGGC+CGG + Chr6:83991262-83991281 None:intergenic 55.0%
! TTTTGTTGCTCGAGGGGACG+AGG - Chr6:83990231-83990250 MsG0680034225.01.T01:CDS 55.0%
!! AGTGCTGACTGCGTAATGCG+TGG - Chr6:83990686-83990705 MsG0680034225.01.T01:intron 55.0%
!! TCCATGGTTGGCCTCTCGAA+AGG + Chr6:83991474-83991493 None:intergenic 55.0%
CCCACGACTCTCCTTTCGAG+AGG - Chr6:83991460-83991479 MsG0680034225.01.T01:CDS 60.0%
GCCTCTCGAAAGGAGAGTCG+TGG + Chr6:83991464-83991483 None:intergenic 60.0%
GCGACAGAATCCGGTGCTCT+CGG - Chr6:83991140-83991159 MsG0680034225.01.T01:CDS 60.0%
GGGCGGCAAAAGGCGGGATT+TGG + Chr6:83990732-83990751 None:intergenic 65.0%
! AGGCCGGAATCCGAGAGCAC+CGG + Chr6:83991153-83991172 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 83987259 83991723 83987259 ID=MsG0680034225.01;Name=MsG0680034225.01
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Chr6 exon 83991120 83991723 83991120 ID=MsG0680034225.01.T01:exon:19428;Parent=MsG0680034225.01.T01
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Chr6 exon 83988601 83989473 83988601 ID=MsG0680034225.01.T01:exon:19430;Parent=MsG0680034225.01.T01
Chr6 exon 83987259 83987927 83987259 ID=MsG0680034225.01.T01:exon:19431;Parent=MsG0680034225.01.T01
Chr6 five_prime_UTR 83991565 83991723 83991565 ID=MsG0680034225.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0680034225.01.T01
Chr6 CDS 83991120 83991564 83991120 ID=MsG0680034225.01.T01:cds;Parent=MsG0680034225.01.T01
Chr6 CDS 83990181 83990411 83990181 ID=MsG0680034225.01.T01:cds;Parent=MsG0680034225.01.T01
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