AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048637.01

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MsG0080048637.01.T01 AT1G75900 30.982 326 195 10 12 318 43 357 2.91e-42 150
MsG0080048637.01.T01 AT5G63170 32.907 313 175 13 12 308 28 321 5.15e-42 149
MsG0080048637.01.T01 AT2G24560 31.988 322 196 11 12 316 34 349 1.62e-41 148
MsG0080048637.01.T01 AT4G01130 30.791 354 191 9 12 326 34 372 2.54e-41 148
MsG0080048637.01.T01 AT4G10950 28.529 340 219 10 12 334 71 403 2.73e-41 149
MsG0080048637.01.T01 AT4G30140 30.275 327 205 10 14 332 35 346 5.84e-41 146
MsG0080048637.01.T01 AT1G28640 29.738 343 203 10 8 320 31 365 7.96e-41 147
MsG0080048637.01.T01 AT4G18970 30.058 346 204 10 14 335 30 361 8.85e-41 146
MsG0080048637.01.T01 AT5G45670 29.480 346 206 10 14 335 31 362 8.94e-41 146
MsG0080048637.01.T01 AT1G29670 29.586 338 216 11 13 335 33 363 1.77e-40 145
MsG0080048637.01.T01 AT1G75880 31.761 318 202 8 12 316 52 367 2.90e-40 145
MsG0080048637.01.T01 AT4G18970 30.058 346 204 10 14 335 30 361 3.37e-40 146
MsG0080048637.01.T01 AT5G55050 31.195 343 204 13 13 332 40 373 8.67e-40 144
MsG0080048637.01.T01 AT2G03980 28.931 318 201 9 12 313 43 351 1.07e-39 144
MsG0080048637.01.T01 AT2G03980 28.931 318 201 9 12 313 43 351 1.07e-39 144
MsG0080048637.01.T01 AT2G03980 28.931 318 201 9 12 313 43 351 1.07e-39 144
MsG0080048637.01.T01 AT2G03980 28.931 318 201 9 12 313 43 351 1.07e-39 144
MsG0080048637.01.T01 AT1G29670 29.586 338 216 11 13 335 101 431 1.16e-39 145
MsG0080048637.01.T01 AT1G75880 31.546 317 203 8 12 316 52 366 1.69e-39 143
MsG0080048637.01.T01 AT1G75920 31.613 310 199 8 12 314 29 332 1.96e-39 142
MsG0080048637.01.T01 AT2G30310 30.124 322 202 11 12 316 34 349 2.26e-39 142
MsG0080048637.01.T01 AT4G10950 28.824 340 214 12 12 334 71 399 4.95e-39 142
MsG0080048637.01.T01 AT1G58520 31.429 315 183 13 12 310 30 327 9.83e-39 140
MsG0080048637.01.T01 AT1G58525 31.429 315 183 13 12 310 30 327 9.83e-39 140
MsG0080048637.01.T01 AT2G19010 29.179 329 210 9 13 332 31 345 1.68e-38 140
MsG0080048637.01.T01 AT1G54030 35.223 247 141 8 12 256 52 281 3.60e-38 138
MsG0080048637.01.T01 AT1G23500 32.808 317 192 11 12 319 35 339 3.94e-38 139
MsG0080048637.01.T01 AT2G30220 30.124 322 202 11 12 316 33 348 5.27e-38 139
MsG0080048637.01.T01 AT5G15720 33.708 267 163 8 12 268 30 292 5.53e-38 138
MsG0080048637.01.T01 AT3G43570 30.225 311 170 11 12 310 30 305 6.14e-38 138
MsG0080048637.01.T01 AT2G31540 31.677 322 197 11 12 316 35 350 6.75e-38 139
MsG0080048637.01.T01 AT2G19010 29.091 330 211 9 12 332 60 375 6.82e-38 139
MsG0080048637.01.T01 AT1G75930 34.076 314 190 10 12 316 29 334 6.86e-38 138
MsG0080048637.01.T01 AT3G26430 32.764 351 192 12 5 319 23 365 3.84e-37 137
MsG0080048637.01.T01 AT1G75920 30.154 325 199 8 12 314 24 342 2.23e-36 134
MsG0080048637.01.T01 AT1G28650 29.532 342 203 11 8 319 33 366 2.25e-36 135
MsG0080048637.01.T01 AT1G33811 30.060 336 216 11 13 332 35 367 2.80e-36 134
MsG0080048637.01.T01 AT1G71691 34.100 261 164 5 12 268 55 311 4.07e-36 133
MsG0080048637.01.T01 AT2G27360 28.977 352 199 13 12 329 33 367 9.87e-36 134
MsG0080048637.01.T01 AT1G75910 31.833 311 198 9 12 314 28 332 1.58e-35 132
MsG0080048637.01.T01 AT1G71691 30.142 282 186 5 63 335 3 282 2.29e-35 130
MsG0080048637.01.T01 AT5G03610 32.288 319 181 11 7 307 38 339 2.87e-35 132
MsG0080048637.01.T01 AT1G73610 29.904 311 202 7 12 316 35 335 9.42e-35 130
MsG0080048637.01.T01 AT2G19050 31.474 251 150 6 14 255 33 270 1.37e-34 128
MsG0080048637.01.T01 AT3G09930 31.949 313 179 11 13 307 40 336 2.56e-34 129
MsG0080048637.01.T01 AT3G09930 31.949 313 179 11 13 307 40 336 2.56e-34 129
MsG0080048637.01.T01 AT3G43550 31.559 263 168 8 12 268 30 286 6.43e-33 124
MsG0080048637.01.T01 AT5G15720 28.920 287 188 7 64 335 48 333 7.06e-33 125
MsG0080048637.01.T01 AT5G33370 31.365 271 175 7 6 268 23 290 1.43e-32 124
MsG0080048637.01.T01 AT1G28660 28.529 340 209 11 8 319 31 364 1.48e-32 125
MsG0080048637.01.T01 AT1G28670 28.947 342 206 11 8 319 31 365 2.36e-32 124
MsG0080048637.01.T01 AT1G54790 29.310 348 191 11 12 319 32 364 2.65e-32 124
MsG0080048637.01.T01 AT1G28600 28.994 338 201 12 12 319 31 359 2.90e-32 124
MsG0080048637.01.T01 AT4G01130 31.655 278 156 6 12 268 34 298 3.76e-32 122
MsG0080048637.01.T01 AT1G28580 27.976 336 208 10 12 319 37 366 8.06e-32 123
MsG0080048637.01.T01 AT1G28570 27.139 339 207 10 12 319 34 363 8.18e-32 123
MsG0080048637.01.T01 AT1G67830 29.738 343 198 11 12 319 30 364 1.26e-31 122
MsG0080048637.01.T01 AT1G75920 29.930 284 188 7 38 314 25 304 2.75e-31 120
MsG0080048637.01.T01 AT1G75920 28.664 307 181 7 12 314 29 301 3.12e-31 120
MsG0080048637.01.T01 AT1G28590 27.976 336 208 10 12 319 36 365 4.14e-31 121
MsG0080048637.01.T01 AT1G31550 28.080 349 204 12 12 329 36 368 4.63e-31 121
MsG0080048637.01.T01 AT1G28660 28.529 340 208 12 8 319 31 363 5.33e-31 120
MsG0080048637.01.T01 AT3G48460 28.070 342 196 13 13 320 39 364 8.22e-31 120
MsG0080048637.01.T01 AT5G14450 29.769 346 192 10 12 319 41 373 1.01e-30 120
MsG0080048637.01.T01 AT2G24560 30.996 271 173 9 12 272 34 300 1.64e-30 118
MsG0080048637.01.T01 AT5G45910 29.619 341 201 10 12 319 30 364 2.90e-30 118
MsG0080048637.01.T01 AT1G54020 29.259 270 167 9 73 333 7 261 7.49e-30 115
MsG0080048637.01.T01 AT1G54020 29.259 270 167 9 73 333 7 261 7.49e-30 115
MsG0080048637.01.T01 AT1G54020 29.259 270 167 9 73 333 7 261 7.49e-30 115
MsG0080048637.01.T01 AT3G27950 30.769 338 198 10 12 322 32 360 1.22e-29 117
MsG0080048637.01.T01 AT5G03600 30.341 323 196 8 7 318 9 313 4.06e-29 114
MsG0080048637.01.T01 AT3G05180 28.242 347 206 11 12 324 36 373 4.38e-29 115
MsG0080048637.01.T01 AT5G03600 30.341 323 196 8 7 318 44 348 7.10e-29 114
MsG0080048637.01.T01 AT4G16230 36.000 225 132 8 5 220 22 243 1.29e-28 111
MsG0080048637.01.T01 AT1G09390 29.102 323 198 9 12 313 37 349 1.82e-28 113
MsG0080048637.01.T01 AT3G62280 27.835 291 193 4 41 316 61 349 5.18e-28 112
MsG0080048637.01.T01 AT1G28610 26.705 352 205 13 12 329 31 363 1.01e-27 112
MsG0080048637.01.T01 AT4G01130 28.425 292 168 7 70 326 1 286 1.63e-27 109
MsG0080048637.01.T01 AT1G56670 27.829 327 197 9 12 313 40 352 2.91e-27 110
MsG0080048637.01.T01 AT1G31550 27.011 348 206 12 12 329 36 365 3.94e-27 110
MsG0080048637.01.T01 AT1G54020 30.144 209 133 5 134 333 8 212 6.24e-27 106
MsG0080048637.01.T01 AT2G04020 35.238 210 106 8 12 206 43 237 1.19e-26 106
MsG0080048637.01.T01 AT3G14210 32.057 209 128 6 136 332 22 228 2.42e-26 105
MsG0080048637.01.T01 AT2G04020 35.238 210 106 8 12 206 43 237 4.09e-26 106
MsG0080048637.01.T01 AT1G54790 27.168 346 197 11 14 319 33 363 6.69e-26 107
MsG0080048637.01.T01 AT1G53970 59.459 74 30 0 6 79 14 87 7.09e-24 94.4
MsG0080048637.01.T01 AT1G53970 59.459 74 30 0 6 79 14 87 7.09e-24 94.4
MsG0080048637.01.T01 AT2G31550 30.732 205 121 7 114 306 4 199 3.17e-22 93.6
MsG0080048637.01.T01 AT1G54790 25.269 372 197 12 14 319 33 389 7.78e-21 92.8
MsG0080048637.01.T01 AT3G62280 28.839 267 174 6 9 270 33 288 2.86e-20 89.7
MsG0080048637.01.T01 AT1G56670 27.636 275 164 9 12 268 40 297 4.68e-19 86.3
MsG0080048637.01.T01 AT2G36325 28.616 318 188 13 9 307 44 341 2.59e-17 82.4
MsG0080048637.01.T01 AT1G28600 43.011 93 48 2 12 101 31 121 1.14e-16 78.2
MsG0080048637.01.T01 AT4G16233 31.707 123 78 2 216 332 5 127 1.76e-16 75.5
MsG0080048637.01.T01 AT5G03590 26.481 287 154 8 41 316 11 251 2.76e-16 77.8
MsG0080048637.01.T01 AT1G28610 40.217 92 44 2 16 101 35 121 1.43e-13 70.1

Find 65 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 118 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAATTTGGGTTGCTTAATT+TGG 0.083505 contig383end:+10036 MsG0080048637.01.T01:CDS
GACCTAGGTGGAAGAAAATT+TGG 0.128289 contig383end:+10022 MsG0080048637.01.T01:CDS
AATGGTGCTCTATTCATATT+TGG 0.192568 contig383end:+8506 MsG0080048637.01.T01:CDS
GAATTTATTCAGGGAGAAAT+TGG 0.207250 contig383end:+9730 MsG0080048637.01.T01:CDS
ATTTCCATTCCATATCAATT+TGG 0.257049 contig383end:-10501 None:intergenic
AAAAGGTAAAGAATTTATTC+AGG 0.269859 contig383end:+9720 MsG0080048637.01.T01:CDS
AATATTTCGCCAAATTGATA+TGG 0.273243 contig383end:+10492 MsG0080048637.01.T01:CDS
TTGCTTAATTTGGGTCCTTT+TGG 0.281909 contig383end:+10046 MsG0080048637.01.T01:CDS
CTTATGGACAGACTTTCTTT+AGG 0.319696 contig383end:+8600 MsG0080048637.01.T01:CDS
CAATTTGTTGATATTGTCAT+TGG 0.319994 contig383end:+9872 MsG0080048637.01.T01:CDS
GGAGATTCACTATTTGATAA+TGG 0.323480 contig383end:+8527 MsG0080048637.01.T01:CDS
CAGGCAAATTATCCTCCTTA+TGG 0.325189 contig383end:+8584 MsG0080048637.01.T01:CDS
CCATGACTATGGTAGTCTTC+TGG 0.327833 contig383end:+9811 MsG0080048637.01.T01:CDS
AATAGCTGCTTTAGATTGTA+AGG 0.329509 contig383end:-10539 None:intergenic
CAATACAACCATTGGTAATC+AGG 0.333928 contig383end:+8565 MsG0080048637.01.T01:CDS
GGCTGACCTGGATGCAAATA+TGG 0.336272 contig383end:-9484 None:intergenic
AAATTTGGGTTGCTTAATTT+GGG 0.339152 contig383end:+10037 MsG0080048637.01.T01:CDS
ACTAAATAAGTATACAGATT+TGG 0.363697 contig383end:-9780 None:intergenic
GGTAGAAGAACACCAGAGTT+TGG 0.379836 contig383end:-9836 None:intergenic
ATGAAGTATCCTTCAAACTA+TGG 0.406479 contig383end:+10247 MsG0080048637.01.T01:CDS
TTAACTCCATAGATATATTC+AGG 0.408590 contig383end:-9505 None:intergenic
ACCTAGGTGGAAGAAAATTT+GGG 0.409923 contig383end:+10023 MsG0080048637.01.T01:CDS
ACAAATTGTTGATGATCAAC+AGG 0.420612 contig383end:-9857 None:intergenic
AAAATCGTACCAACAAAATC+TGG 0.421278 contig383end:-8659 None:intergenic
GGTCAGCCTGAATATATCTA+TGG 0.427944 contig383end:+9499 MsG0080048637.01.T01:CDS
AAGTTAGAGAACCAGCTAAA+GGG 0.429952 contig383end:+10178 MsG0080048637.01.T01:CDS
AATATTTGAACCCCTTTAGC+TGG 0.444991 contig383end:-10189 None:intergenic
ACTTTCTTTAGGTACCCTTC+TGG 0.449686 contig383end:+8611 MsG0080048637.01.T01:CDS
CTAAAGAAAGTCTGTCCATA+AGG 0.454791 contig383end:-8599 None:intergenic
TTGAACAATATTCTTATGCT+AGG 0.458302 contig383end:-10076 None:intergenic
AAAGGTAAAGAATTTATTCA+GGG 0.463738 contig383end:+9721 MsG0080048637.01.T01:CDS
TCTGTATACTTATTTAGTGT+TGG 0.466966 contig383end:+9785 MsG0080048637.01.T01:CDS
AATTTATTCAGGGAGAAATT+GGG 0.469419 contig383end:+9731 MsG0080048637.01.T01:CDS
AAATTGATATGGAATGGAAA+TGG 0.479120 contig383end:+10503 MsG0080048637.01.T01:CDS
GCATGTTGTGGAAGTGGCTG+TGG 0.481080 contig383end:+10386 MsG0080048637.01.T01:CDS
AACTACATCAATACAACCAT+TGG 0.488567 contig383end:+8557 MsG0080048637.01.T01:CDS
TTCGCCAAATTGATATGGAA+TGG 0.491966 contig383end:+10497 MsG0080048637.01.T01:CDS
AGTGTTGGAAGCCATGACTA+TGG 0.494878 contig383end:+9800 MsG0080048637.01.T01:CDS
TATTGATTAGCTTTCTCTGT+AGG 0.500420 contig383end:-10473 None:intergenic
GAAGTTAGAGAACCAGCTAA+AGG 0.510335 contig383end:+10177 MsG0080048637.01.T01:CDS
TGCAAATATGGTGGAAGTAG+AGG 0.513679 contig383end:-9472 None:intergenic
TTGTAGGAAATTTATGACCT+AGG 0.513937 contig383end:+10007 MsG0080048637.01.T01:intron
TAGATATATTCAGGCTGACC+TGG 0.524719 contig383end:-9496 None:intergenic
GAATGTGTACCATAGTTTGA+AGG 0.527964 contig383end:-10256 None:intergenic
CTTCCACCATATTTGCATCC+AGG 0.531243 contig383end:+9478 MsG0080048637.01.T01:CDS
AGTCTTCTGGATCCAAACTC+TGG 0.534866 contig383end:+9824 MsG0080048637.01.T01:CDS
GCACTCTCTCAAACTTCTCA+AGG 0.540073 contig383end:+9550 MsG0080048637.01.T01:CDS
ATAATTTGCCTGATTACCAA+TGG 0.540395 contig383end:-8573 None:intergenic
TGGTGGAAGTAGAGGCAACT+TGG 0.541652 contig383end:-9464 None:intergenic
ATGCTAGGATAGCAGCCAAA+AGG 0.547875 contig383end:-10061 None:intergenic
GAAGCAAGTGTAGCATGTTG+TGG 0.548799 contig383end:+10374 MsG0080048637.01.T01:CDS
AGTTAGAGAACCAGCTAAAG+GGG 0.574728 contig383end:+10179 MsG0080048637.01.T01:CDS
AGTGTAGCATGTTGTGGAAG+TGG 0.577374 contig383end:+10380 MsG0080048637.01.T01:CDS
CCGTCAGAAAATCTACCAGA+AGG 0.595079 contig383end:-8626 None:intergenic
CTTAGACGAAATTTCAGCAG+TGG 0.595629 contig383end:+10117 MsG0080048637.01.T01:CDS
TGTTGTGGAAGTGGCTGTGG+AGG 0.606060 contig383end:+10389 MsG0080048637.01.T01:CDS
ATACTTTGATGACATTTGTG+AGG 0.609808 contig383end:-9898 None:intergenic
CCAGAAGACTACCATAGTCA+TGG 0.611085 contig383end:-9811 None:intergenic
AAGAAAGTCTGTCCATAAGG+AGG 0.620676 contig383end:-8596 None:intergenic
ATAAGAATATTGTTCAACAA+TGG 0.633055 contig383end:+10082 MsG0080048637.01.T01:CDS
CGTCAGAAAATCTACCAGAA+GGG 0.641192 contig383end:-8625 None:intergenic
TAGGAAATTTATGACCTAGG+TGG 0.647961 contig383end:+10010 MsG0080048637.01.T01:intron
GTTGTGGAAGTGGCTGTGGA+GGG 0.661412 contig383end:+10390 MsG0080048637.01.T01:CDS
ATGGAAATGGCAGTGTCACA+TGG 0.664922 contig383end:+10516 MsG0080048637.01.T01:CDS
TGACCTGGATGCAAATATGG+TGG 0.706043 contig383end:-9481 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! TTTATGTTTGATAAATTTTT+GGG + contig383end:10340-10359 MsG0080048637.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTATGTTTGATAAATTTT+TGG + contig383end:10339-10358 MsG0080048637.01.T01:intron 10.0%
!! AAATATATCATATACATTGT+TGG - contig383end:9954-9973 None:intergenic 15.0%
!! AGAATTATATTTCAAGAAAA+AGG + contig383end:9266-9285 MsG0080048637.01.T01:intron 15.0%
!! TATATGATATGTTTATTTGT+AGG + contig383end:9991-10010 MsG0080048637.01.T01:intron 15.0%
!!! AAGTTAACTTTTTTTTAAGA+AGG - contig383end:9069-9088 None:intergenic 15.0%
!!! ATATATAGTTTTCATTTTAG+AGG - contig383end:9618-9637 None:intergenic 15.0%
!!! TTCCAACTTTTTTTTTTATA+GGG + contig383end:8681-8700 MsG0080048637.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTCCAACTTTTTTTTTTAT+AGG + contig383end:8680-8699 MsG0080048637.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTCTTGAAATATAATTCT+CGG - contig383end:9266-9285 None:intergenic 15.0%
!! AAAAGGTAAAGAATTTATTC+AGG + contig383end:9720-9739 MsG0080048637.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAGGTAAAGAATTTATTCA+GGG + contig383end:9721-9740 MsG0080048637.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTAAATAAGTATACAGATT+TGG - contig383end:9783-9802 None:intergenic 20.0%
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!! TTGTAACACTTTAATCAAAA+TGG - contig383end:9196-9215 None:intergenic 20.0%
!!! TCCAACTTTTTTTTTTATAG+GGG + contig383end:8682-8701 MsG0080048637.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTGTTTTCTTAGAAATCA+AGG - contig383end:9403-9422 None:intergenic 20.0%
! AAATTGATATGGAATGGAAA+TGG + contig383end:10503-10522 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
! AACTCCTAAAAAAAATGTGA+CGG - contig383end:8927-8946 None:intergenic 25.0%
! AATATTTCGCCAAATTGATA+TGG + contig383end:10492-10511 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
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! ATTTCCATTCCATATCAATT+TGG - contig383end:10504-10523 None:intergenic 25.0%
! TCCCCTATAAAAAAAAAAGT+TGG - contig383end:8686-8705 None:intergenic 25.0%
! TCTGTATACTTATTTAGTGT+TGG + contig383end:9785-9804 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
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! TTGAACAATATTCTTATGCT+AGG - contig383end:10079-10098 None:intergenic 25.0%
!! ACTTTTTATCCAAGAAATTG+TGG + contig383end:9085-9104 MsG0080048637.01.T01:intron 25.0%
!! TTCGATTGTTGTTAACATAT+AGG + contig383end:9664-9683 MsG0080048637.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAATTTGGGTTGCTTAATT+TGG + contig383end:10036-10055 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATTTGGGTTGCTTAATTT+GGG + contig383end:10037-10056 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAATTTGTTGATATTGTCAT+TGG + contig383end:9872-9891 MsG0080048637.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTTGATAAATTTTTGGGA+AGG + contig383end:10344-10363 MsG0080048637.01.T01:intron 25.0%
AAAATCGTACCAACAAAATC+TGG - contig383end:8662-8681 None:intergenic 30.0%
AACTACATCAATACAACCAT+TGG + contig383end:8557-8576 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
AATGGTGCTCTATTCATATT+TGG + contig383end:8506-8525 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
AGACTCCTAACAATTATGTA+GGG - contig383end:8761-8780 None:intergenic 30.0%
ATTGTTGGCACAAAAAATCA+AGG - contig383end:9939-9958 None:intergenic 30.0%
GAATTTATTCAGGGAGAAAT+TGG + contig383end:9730-9749 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
GGAGATTCACTATTTGATAA+TGG + contig383end:8527-8546 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
TACATAATTGTTAGGAGTCT+GGG + contig383end:8761-8780 MsG0080048637.01.T01:intron 30.0%
TACATGATGTTGTCTAATGA+CGG + contig383end:9155-9174 MsG0080048637.01.T01:intron 30.0%
TTGTAGGAAATTTATGACCT+AGG + contig383end:10007-10026 MsG0080048637.01.T01:intron 30.0%
! AATAACTCAACTGAGTTTTC+AGG - contig383end:9697-9716 None:intergenic 30.0%
! AATAGCTGCTTTAGATTGTA+AGG - contig383end:10542-10561 None:intergenic 30.0%
! ATAATTTGCCTGATTACCAA+TGG - contig383end:8576-8595 None:intergenic 30.0%
! ATACTTTGATGACATTTGTG+AGG - contig383end:9901-9920 None:intergenic 30.0%
! ATGAAGTATCCTTCAAACTA+TGG + contig383end:10247-10266 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
! TATGGAGTTAATTTTGCATC+AGG + contig383end:9517-9536 MsG0080048637.01.T01:CDS 30.0%
!! AATAGAGCACCATTTTTCTT+GGG - contig383end:8500-8519 None:intergenic 30.0%
!! ACAAATTGTTGATGATCAAC+AGG - contig383end:9860-9879 None:intergenic 30.0%
!! TATTGATTAGCTTTCTCTGT+AGG - contig383end:10476-10495 None:intergenic 30.0%
!!! CATTCCGTCACATTTTTTTT+AGG + contig383end:8920-8939 MsG0080048637.01.T01:intron 30.0%
AAGTTAGAGAACCAGCTAAA+GGG + contig383end:10178-10197 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
AATATTTGAACCCCTTTAGC+TGG - contig383end:10192-10211 None:intergenic 35.0%
ACATAATTGTTAGGAGTCTG+GGG + contig383end:8762-8781 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
ACCTAGGTGGAAGAAAATTT+GGG + contig383end:10023-10042 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
ACTTCACTACCACAATTTCT+TGG - contig383end:9097-9116 None:intergenic 35.0%
ATCCTCCCTACATAATTGTT+AGG + contig383end:8753-8772 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
CAGACTCCTAACAATTATGT+AGG - contig383end:8762-8781 None:intergenic 35.0%
CTAAAGAAAGTCTGTCCATA+AGG - contig383end:8602-8621 None:intergenic 35.0%
CTACATAATTGTTAGGAGTC+TGG + contig383end:8760-8779 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
CTTATGGACAGACTTTCTTT+AGG + contig383end:8600-8619 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
GAATGTGTACCATAGTTTGA+AGG - contig383end:10259-10278 None:intergenic 35.0%
GATTGTCAAAAAACCTGAAC+AGG + contig383end:9348-9367 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
TAGGAAATTTATGACCTAGG+TGG + contig383end:10010-10029 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
TTCGCCAAATTGATATGGAA+TGG + contig383end:10497-10516 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
! ACACAGTAGTACTAGTCTAT+AGG - contig383end:9380-9399 None:intergenic 35.0%
! CAATACAACCATTGGTAATC+AGG + contig383end:8565-8584 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
! GAGTTAATTTTGCATCAGGA+GGG + contig383end:9521-9540 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTGTCTGATAACGAAACT+TGG + contig383end:9013-9032 MsG0080048637.01.T01:intron 35.0%
!! GAATAGAGCACCATTTTTCT+TGG - contig383end:8501-8520 None:intergenic 35.0%
!! TTGCTTAATTTGGGTCCTTT+TGG + contig383end:10046-10065 MsG0080048637.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAAGTCTGTCCATAAGG+AGG - contig383end:8599-8618 None:intergenic 40.0%
AAGTGCTTGCCCAAGAAAAA+TGG + contig383end:8488-8507 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTCTTTAGGTACCCTTC+TGG + contig383end:8611-8630 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
AGTTAGAGAACCAGCTAAAG+GGG + contig383end:10179-10198 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
CAGGCAAATTATCCTCCTTA+TGG + contig383end:8584-8603 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
CATAATTGTTAGGAGTCTGG+GGG + contig383end:8763-8782 MsG0080048637.01.T01:intron 40.0%
CGTCAGAAAATCTACCAGAA+GGG - contig383end:8628-8647 None:intergenic 40.0%
CTATAGGACAAATCCTGTTC+AGG - contig383end:9364-9383 None:intergenic 40.0%
CTCCATAACCATAAGAGAGA+GGG + contig383end:8862-8881 MsG0080048637.01.T01:intron 40.0%
CTCCTAACAATTATGTAGGG+AGG - contig383end:8758-8777 None:intergenic 40.0%
CTTAGACGAAATTTCAGCAG+TGG + contig383end:10117-10136 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTTAGAGAACCAGCTAA+AGG + contig383end:10177-10196 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
GACCTAGGTGGAAGAAAATT+TGG + contig383end:10022-10041 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAGCCTGAATATATCTA+TGG + contig383end:9499-9518 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
GTAATCTCTACATCATGTCG+CGG - contig383end:8956-8975 None:intergenic 40.0%
TAGATATATTCAGGCTGACC+TGG - contig383end:9499-9518 None:intergenic 40.0%
! ACCCAAATTTTCTTCCACCT+AGG - contig383end:10027-10046 None:intergenic 40.0%
! CCTTCTGGTAGATTTTCTGA+CGG + contig383end:8626-8645 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
! CGCATGATACCAGATTTTGT+TGG + contig383end:8650-8669 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGTTAATTTTGCATCAGG+AGG + contig383end:9520-9539 MsG0080048637.01.T01:CDS 40.0%
! TGCAAATATGGTGGAAGTAG+AGG - contig383end:9475-9494 None:intergenic 40.0%
AGTCTTCTGGATCCAAACTC+TGG + contig383end:9824-9843 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
AGTGTAGCATGTTGTGGAAG+TGG + contig383end:10380-10399 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
ATGCTAGGATAGCAGCCAAA+AGG - contig383end:10064-10083 None:intergenic 45.0%
ATGGAAATGGCAGTGTCACA+TGG + contig383end:10516-10535 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
ATGTGACACCCTCTCTCTTA+TGG - contig383end:8873-8892 None:intergenic 45.0%
CACCCTCTCTCTTATGGTTA+TGG - contig383end:8867-8886 None:intergenic 45.0%
CCAGAAGACTACCATAGTCA+TGG - contig383end:9814-9833 None:intergenic 45.0%
CCATGACTATGGTAGTCTTC+TGG + contig383end:9811-9830 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
CCGTCAGAAAATCTACCAGA+AGG - contig383end:8629-8648 None:intergenic 45.0%
CTTCCACCATATTTGCATCC+AGG + contig383end:9478-9497 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCAAGTGTAGCATGTTG+TGG + contig383end:10374-10393 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
GCACTCTCTCAAACTTCTCA+AGG + contig383end:9550-9569 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCATAACCATAAGAGAG+AGG + contig383end:8861-8880 MsG0080048637.01.T01:intron 45.0%
GGTAGAAGAACACCAGAGTT+TGG - contig383end:9839-9858 None:intergenic 45.0%
TGACCTGGATGCAAATATGG+TGG - contig383end:9484-9503 None:intergenic 45.0%
! AATTTTGCATCAGGAGGGTC+TGG + contig383end:9526-9545 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
! AGTGTTGGAAGCCATGACTA+TGG + contig383end:9800-9819 MsG0080048637.01.T01:CDS 45.0%
GGCTGACCTGGATGCAAATA+TGG - contig383end:9487-9506 None:intergenic 50.0%
TGGTGGAAGTAGAGGCAACT+TGG - contig383end:9467-9486 None:intergenic 50.0%
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GTTGTGGAAGTGGCTGTGGA+GGG + contig383end:10390-10409 MsG0080048637.01.T01:CDS 55.0%
TGTTGTGGAAGTGGCTGTGG+AGG + contig383end:10389-10408 MsG0080048637.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

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