AlfalfaGEDB | MsG0080049101.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080049101.01

KEGG: -
GO: -
PFAM: PF01453

Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsG0080049101.01.T03	MTR_6g012810	26.437	261	165	7	11	250	101	355	4.48e-15	78.2
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MsG0080049101.01.T03	MTR_7g056680	31.937	191	111	7	32	210	28	211	2.44e-14	75.9
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MsG0080049101.01.T03	MTR_7g056617	22.296	453	268	19	25	411	27	461	1.80e-13	72.8
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!!	TGATGGAGGGTGCCAAAAAT+GGG	+	contig70end:6120-6139	MsG0080049101.01.T06:CDS	45.0%
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	ACACAGTCTTTGACCCGTTG+GGG	-	contig70end:5676-5695	None:intergenic	50.0%
	ACGGGTCAAAGACTGTGTTG+TGG	+	contig70end:5678-5697	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
	CAACACAGTCTTTGACCCGT+TGG	-	contig70end:5678-5697	None:intergenic	50.0%
	CGACAAACCACAACGAGTGA+AGG	-	contig70end:7478-7497	None:intergenic	50.0%
	GGGAGGATAAACCAACTTGC+AGG	+	contig70end:6140-6159	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
	GGGATGCTAACGAGTGATGA+AGG	+	contig70end:6055-6074	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
	TGAGAGCGAAGATGCTCACT+TGG	+	contig70end:5430-5449	MsG0080049101.01.T06:intron	50.0%
	TGTGGGGGTGGGTATGAAAA+CGG	+	contig70end:7212-7231	MsG0080049101.01.T06:intron	50.0%
	TTCAGGGTGGACACTAGACT+GGG	+	contig70end:6030-6049	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
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!	TGTCATGGTTGACTCCTTCG+CGG	+	contig70end:5786-5805	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
!!	GTGATGGAGGGTGCCAAAAA+TGG	+	contig70end:6119-6138	MsG0080049101.01.T06:CDS	50.0%
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	TCACCAGGTTCCCTGCAAGT+TGG	-	contig70end:6154-6173	None:intergenic	55.0%
	TCACCTGAAGTTGTCCGCGA+AGG	-	contig70end:5803-5822	None:intergenic	55.0%
!!	TGGAGGGTGCCAAAAATGGG+AGG	+	contig70end:6123-6142	MsG0080049101.01.T06:CDS	55.0%
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Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
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Gene Sequence

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