AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000955.01

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MsG0180000955.01.T01 AT5G24080 45.397 315 162 7 33 342 517 826 4.74e-82 268
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MsG0180000955.01.T01 AT4G23190 38.671 331 190 7 29 351 331 656 2.10e-63 214
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MsG0180000955.01.T01 AT4G23240 36.364 319 185 7 34 338 14 328 7.04e-60 197
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MsG0180000955.01.T01 AT4G23270 35.484 310 192 4 29 332 307 614 1.79e-59 203
MsG0180000955.01.T01 AT4G23210 34.463 354 218 7 13 360 324 669 1.97e-59 204
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MsG0180000955.01.T01 AT1G67520 36.721 305 183 5 36 332 276 578 1.78e-58 200
MsG0180000955.01.T01 AT4G23320 36.570 309 188 4 29 331 185 491 3.11e-58 197
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MsG0180000955.01.T01 AT4G23260 36.364 308 182 6 34 332 325 627 1.96e-57 198
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MsG0180000955.01.T01 AT1G60800 39.333 300 157 9 35 319 221 510 7.99e-57 194
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MsG0180000955.01.T01 AT4G11460 31.733 375 243 6 3 368 226 596 8.20e-57 196
MsG0180000955.01.T01 AT2G13800 40.203 296 161 9 35 319 262 552 8.57e-57 195
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MsG0180000955.01.T01 AT4G21410 35.347 331 200 9 38 357 222 549 8.67e-57 194
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MsG0180000955.01.T01 AT4G01330 38.144 291 169 7 36 319 150 436 1.12e-55 190
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61490 36.207 290 175 6 47 331 491 775 8.56e-55 193
MsG0180000955.01.T01 AT1G61490 36.207 290 175 6 47 331 491 775 8.56e-55 193
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61370 35.667 300 180 6 47 340 351 643 6.14e-54 189
MsG0180000955.01.T01 AT4G00960 42.991 214 115 4 34 242 42 253 6.18e-54 179
MsG0180000955.01.T01 AT3G59110 33.636 330 202 8 36 352 178 503 7.51e-54 186
MsG0180000955.01.T01 AT1G52290 34.237 295 180 7 36 320 131 421 8.73e-54 185
MsG0180000955.01.T01 AT4G23250 35.484 310 182 7 34 332 340 642 1.06e-53 191
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61420 35.640 289 178 5 47 331 497 781 1.09e-53 190
MsG0180000955.01.T01 AT4G21390 35.016 317 197 6 32 344 514 825 1.25e-53 190
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MsG0180000955.01.T01 AT4G04540 43.913 230 125 3 47 275 354 580 1.51e-53 186
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MsG0180000955.01.T01 AT1G55200 38.591 298 165 11 33 320 364 653 2.13e-53 187
MsG0180000955.01.T01 AT1G55200 38.591 298 165 11 33 320 364 653 2.13e-53 187
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MsG0180000955.01.T01 AT2G28970 35.088 285 182 2 34 317 467 749 5.00e-53 187
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61500 34.551 301 185 6 47 341 474 768 1.25e-52 187
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MsG0180000955.01.T01 AT2G42960 35.739 291 176 7 36 319 171 457 8.11e-52 180
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MsG0180000955.01.T01 AT5G65240 35.494 324 191 8 11 319 241 561 1.01e-51 182
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MsG0180000955.01.T01 AT2G43700 34.139 331 202 9 1 321 286 610 1.51e-51 182
MsG0180000955.01.T01 AT4G04960 35.202 321 182 11 12 319 316 623 1.54e-51 182
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MsG0180000955.01.T01 AT4G34440 37.919 298 163 9 36 320 300 588 2.57e-51 182
MsG0180000955.01.T01 AT5G59270 35.473 296 174 8 33 319 353 640 2.60e-51 182
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MsG0180000955.01.T01 AT3G24790 36.897 290 171 8 36 316 35 321 2.99e-51 175
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MsG0180000955.01.T01 AT3G45410 37.037 297 169 8 33 320 327 614 9.24e-51 180
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61400 36.093 302 167 8 47 331 501 793 9.88e-51 182
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MsG0180000955.01.T01 AT1G56720 34.708 291 179 7 36 319 167 453 1.46e-50 176
MsG0180000955.01.T01 AT1G56720 34.708 291 179 7 36 319 167 453 1.46e-50 176
MsG0180000955.01.T01 AT1G11280 32.588 313 198 6 36 340 491 798 1.50e-50 181
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61360 33.229 319 188 7 36 340 405 712 1.59e-50 180
MsG0180000955.01.T01 AT1G61360 33.229 319 188 7 36 340 405 712 1.59e-50 180
MsG0180000955.01.T01 AT1G61360 33.229 319 188 7 36 340 405 712 1.59e-50 180
MsG0180000955.01.T01 AT2G20300 36.458 288 170 7 36 317 337 617 1.68e-50 180
MsG0180000955.01.T01 AT2G48010 36.025 322 185 11 34 342 269 582 1.80e-50 179
MsG0180000955.01.T01 AT1G11280 32.588 313 198 6 36 340 493 800 1.82e-50 181
MsG0180000955.01.T01 AT1G23540 34.641 306 176 9 34 322 357 655 1.83e-50 180
MsG0180000955.01.T01 AT5G40380 34.891 321 194 8 35 345 302 617 1.99e-50 179
MsG0180000955.01.T01 AT5G57670 34.256 289 173 7 36 316 255 534 2.02e-50 178
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MsG0180000955.01.T01 AT1G26150 36.333 300 174 8 36 322 418 713 7.03e-48 173
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MsG0180000955.01.T01 AT5G65700 33.754 317 178 8 52 353 700 999 9.68e-48 174
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MsG0180000955.01.T01 AT1G29730 41.379 232 129 5 36 264 661 888 1.20e-47 173
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MsG0180000955.01.T01 AT5G02290 34.783 299 175 7 36 317 56 351 1.28e-47 166
MsG0180000955.01.T01 AT4G20450 34.266 286 179 5 36 317 581 861 1.31e-47 173
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MsG0180000955.01.T01 AT3G09830 32.615 325 198 8 36 343 72 392 1.41e-47 167
MsG0180000955.01.T01 AT2G07180 36.709 316 170 10 16 317 69 368 1.55e-47 167
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MsG0180000955.01.T01 AT1G61460 33.910 289 165 6 47 331 455 721 1.64e-47 172
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MsG0180000955.01.T01 AT5G03320 34.653 303 177 9 36 321 69 367 3.15e-47 166
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MsG0180000955.01.T01 AT3G08870 33.442 308 170 10 33 323 353 642 3.62e-47 171
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MsG0180000955.01.T01 AT2G35620 35.693 339 198 10 1 330 254 581 4.72e-47 169
MsG0180000955.01.T01 AT2G35620 35.693 339 198 10 1 330 254 581 4.72e-47 169
MsG0180000955.01.T01 AT3G55450 34.768 302 170 11 36 316 49 344 4.76e-47 165
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MsG0180000955.01.T01 AT5G53890 37.153 288 170 7 37 317 743 1026 4.93e-47 172
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MsG0180000955.01.T01 AT3G46370 35.231 281 177 4 35 313 476 753 5.53e-47 171
MsG0180000955.01.T01 AT1G51860 34.386 285 173 5 35 313 429 705 5.60e-47 171
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MsG0180000955.01.T01 AT5G54590 34.828 290 168 7 34 316 101 376 5.71e-47 166
MsG0180000955.01.T01 AT1G30570 33.611 360 214 10 28 372 500 849 5.77e-47 171
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MsG0180000955.01.T01 AT2G39110 36.042 283 163 6 71 338 121 400 6.78e-47 165
MsG0180000955.01.T01 AT1G49270 42.791 215 115 7 36 246 324 534 7.39e-47 170

Find 84 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 102 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACCAATGTGGTTCGACTTAT+TGG 0.129070 1:-13632422 MsG0180000955.01.T01:CDS
GATATTTCTCTTTCTAAAAT+TGG 0.146759 1:-13632809 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
AGATTTACCCAACATCTTTA+TGG 0.161939 1:+13632502 None:intergenic
TCTTTGTATGAATACCTTAT+TGG 0.165229 1:+13632620 None:intergenic
AAAGATGTTGGGTAAATCTA+AGG 0.259376 1:-13632498 MsG0180000955.01.T01:CDS
ACAGGAGCATTACAAGTAAT+TGG 0.262157 1:-13632863 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
CCAATGTGGTTCGACTTATT+GGG 0.290071 1:-13632421 MsG0180000955.01.T01:CDS
GGCTTTGGAGCTGTTTATAA+AGG 0.290405 1:-13632551 MsG0180000955.01.T01:CDS
TAAAATTAATCCAACAAATA+AGG 0.290790 1:+13633043 None:intergenic
TTTGGATACAAAGAGGGTTT+TGG 0.297392 1:+13631738 None:intergenic
GCTATATACATCAGCCTTGT+AGG 0.304892 1:+13632037 None:intergenic
TCTAAAATTGGCATAGAGAT+AGG 0.317105 1:-13632797 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
TCTTCCTCAATCATTTCATT+TGG 0.329978 1:+13631720 None:intergenic
AAGACCAAAGTCTGAAACTT+TGG 0.331110 1:+13632166 None:intergenic
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AGACCAAAGTCTGAAACTTT+GGG 0.358138 1:+13632167 None:intergenic
TCTCATCGAGTAGGATGTTA+TGG 0.359434 1:+13632198 None:intergenic
TCTATCACTTTGTTCATTGA+AGG 0.369448 1:+13631798 None:intergenic
TCCAACAAATAAGGATATAA+TGG 0.373931 1:+13633052 None:intergenic
TAATCAATTGATTGAAGAAA+AGG 0.374006 1:-13631919 MsG0180000955.01.T01:CDS
ATCCCCAAAGTTTCAGACTT+TGG 0.392376 1:-13632170 MsG0180000955.01.T01:CDS
AGAAAGAGAAATATCTTCCT+TGG 0.397768 1:+13632817 None:intergenic
ACCATTATATCCTTATTTGT+TGG 0.408516 1:-13633053 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
AAGGCTGATGTATATAGCTT+TGG 0.426749 1:-13632032 MsG0180000955.01.T01:CDS
GGAGTACCTTGATGCCAATA+AGG 0.429180 1:-13632634 MsG0180000955.01.T01:CDS
AAGTTGGGTGAAGGAGGCTT+TGG 0.436176 1:-13632566 MsG0180000955.01.T01:CDS
TTAAAATTGACTTAGACAAA+TGG 0.441414 1:-13633081 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
CTCATCGAGTAGGATGTTAT+GGG 0.449163 1:+13632199 None:intergenic
CAATTGATTATAAATCCAAA+TGG 0.450777 1:+13631932 None:intergenic
GGTATTGCTTATTTACATCA+AGG 0.458500 1:-13632257 MsG0180000955.01.T01:CDS
GCTATGCAGCGGACCATTTG+TGG 0.465786 1:-13632525 MsG0180000955.01.T01:CDS
AATGCATGAAATTACATATG+AGG 0.467920 1:-13631889 MsG0180000955.01.T01:CDS
CCTGTGAAGTGTGAAGTATC+AGG 0.471474 1:+13632881 None:intergenic
AAAATGTACGAGATATCTCT+TGG 0.473673 1:-13632290 MsG0180000955.01.T01:CDS
GGTGTGATGTATTCTTCCTA+TGG 0.477971 1:+13632442 None:intergenic
TTGGGTAAATCTAAGGGTAA+TGG 0.481265 1:-13632491 MsG0180000955.01.T01:CDS
GTGACAATGCTAATCTCGTT+AGG 0.486538 1:+13632131 None:intergenic
TAGAAGTTTCAGAGACAAGT+TGG 0.488633 1:-13632582 MsG0180000955.01.T01:CDS
AACATCTTTATGGCCACAAA+TGG 0.495995 1:+13632512 None:intergenic
ATTTGTGGCCATAAAGATGT+TGG 0.498067 1:-13632510 MsG0180000955.01.T01:CDS
TTTGTGGCCATAAAGATGTT+GGG 0.499851 1:-13632509 MsG0180000955.01.T01:CDS
CCTGATACTTCACACTTCAC+AGG 0.503119 1:-13632881 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
TTCAGAGACAAGTTGGGTGA+AGG 0.504254 1:-13632575 MsG0180000955.01.T01:CDS
TTGTCACTTTAACTGCAGCT+AGG 0.506870 1:-13632115 MsG0180000955.01.T01:CDS
GTTTATGAATTCATGTCCAA+TGG 0.506899 1:-13632368 MsG0180000955.01.T01:CDS
AAAGTGATAGAGATGCTTGA+AGG 0.507932 1:-13631786 MsG0180000955.01.T01:CDS
ATATTTATCAAGAGAACCAT+TGG 0.514795 1:+13632352 None:intergenic
GTATCCAAATGAAATGATTG+AGG 0.516878 1:-13631724 MsG0180000955.01.T01:CDS
TAAATCTAAGGGTAATGGAC+AGG 0.522814 1:-13632486 MsG0180000955.01.T01:CDS
AATTGATTATAAATCCAAAT+GGG 0.525153 1:+13631933 None:intergenic
GAAAATTTGACTTGAACGAT+CGG 0.529326 1:+13631959 None:intergenic
TGTCACTTTAACTGCAGCTA+GGG 0.532147 1:-13632114 MsG0180000955.01.T01:CDS
AGAAGTTTCAGAGACAAGTT+GGG 0.539610 1:-13632581 MsG0180000955.01.T01:CDS
TGAATACCTTATTGGCATCA+AGG 0.540411 1:+13632628 None:intergenic
ATTAGTGAAGTCGCAACCAT+AGG 0.549249 1:-13632458 MsG0180000955.01.T01:CDS
GAAAATCTCACTATAAGTGA+TGG 0.552222 1:+13632749 None:intergenic
GAAGACCTTGACGTCAACTC+TGG 0.553198 1:-13631702 MsG0180000955.01.T01:CDS
ATCTTCCTTGGATAATGCAT+AGG 0.558137 1:+13632829 None:intergenic
GACCTTGACGTCAACTCTGG+TGG 0.558860 1:-13631699 MsG0180000955.01.T01:CDS
CCCAATAAGTCGAACCACAT+TGG 0.560344 1:+13632421 None:intergenic
ATTTCATTTGGATACAAAGA+GGG 0.563555 1:+13631732 None:intergenic
TAAATATATTTCCTCTAGAG+AGG 0.568850 1:-13632336 MsG0180000955.01.T01:CDS
AGAGACAAGTTGGGTGAAGG+AGG 0.569410 1:-13632572 MsG0180000955.01.T01:CDS
TTCATTGAAGGACGATCACA+AGG 0.575029 1:+13631810 None:intergenic
CATTTCATTTGGATACAAAG+AGG 0.576335 1:+13631731 None:intergenic
GGAATTGAATCAGAAAATGA+TGG 0.584236 1:-13631678 MsG0180000955.01.T01:CDS
TTCTTGCAAGGAAGGAAGGA+AGG 0.589392 1:-13633123 None:intergenic
AAGATGTTGGGTAAATCTAA+GGG 0.591106 1:-13632497 MsG0180000955.01.T01:CDS
ATAGAGATAGGAAGAATCAC+AGG 0.591621 1:-13632785 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR
CTGTGAAGTGTGAAGTATCA+GGG 0.592732 1:+13632882 None:intergenic
ATATCTCTTGGAGTGGCTCG+TGG 0.598525 1:-13632278 MsG0180000955.01.T01:CDS
GTCACTTTAACTGCAGCTAG+GGG 0.600417 1:-13632113 MsG0180000955.01.T01:CDS
GGATAAAGTTCTCATCGAGT+AGG 0.612234 1:+13632189 None:intergenic
GACCAAAGTCTGAAACTTTG+GGG 0.616014 1:+13632168 None:intergenic
GTACGAGATATCTCTTGGAG+TGG 0.623860 1:-13632285 MsG0180000955.01.T01:CDS
AGAGATAGTATCCTCTCTAG+AGG 0.624594 1:+13632325 None:intergenic
TGACTTGAACGATCGGCATG+TGG 0.625227 1:+13631966 None:intergenic
TTCCACCAGAGTTGACGTCA+AGG 0.630944 1:+13631697 None:intergenic
TCATCGAGTAGGATGTTATG+GGG 0.638362 1:+13632200 None:intergenic
TATTGGAGGAGTATCCTACA+AGG 0.662026 1:-13632051 MsG0180000955.01.T01:CDS
TATAAAGGAAAGCTATGCAG+CGG 0.677988 1:-13632536 MsG0180000955.01.T01:CDS
TCACTTTAACTGCAGCTAGG+GGG 0.698772 1:-13632112 MsG0180000955.01.T01:CDS
AAGAATACATCACACCAATG+TGG 0.730236 1:-13632435 MsG0180000955.01.T01:CDS
ACAAAACAAAGAAAACCATG+AGG 0.756438 1:+13632720 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATATATATATATATATAT+AGG + Chr1:13631782-13631763 None:intergenic 0.0%
!! AATTGATTATAAATCCAAAT+GGG + Chr1:13632801-13632820 None:intergenic 15.0%
!! TAAAATTAATCCAACAAATA+AGG + Chr1:13631691-13631710 None:intergenic 15.0%
!! CAATTGATTATAAATCCAAA+TGG + Chr1:13632802-13632821 None:intergenic 20.0%
!! GAATTGTTCTACAAAAATAT+TGG - Chr1:13632663-13632682 MsG0180000955.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATCAATTGATTGAAGAAA+AGG - Chr1:13632812-13632831 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!!! ATATTTTTGTAGAACAATTC+TGG + Chr1:13632663-13632682 None:intergenic 20.0%
!!! GATATTTCTCTTTCTAAAAT+TGG - Chr1:13631922-13631941 MsG0180000955.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAAAATTGACTTAGACAAA+TGG - Chr1:13631650-13631669 MsG0180000955.01.T01:CDS 20.0%
! AATGCATGAAATTACATATG+AGG - Chr1:13632842-13632861 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! AGATGTTCATAATTGCATTA+TGG - Chr1:13632883-13632902 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! ATATTTATCAAGAGAACCAT+TGG + Chr1:13632382-13632401 None:intergenic 25.0%
! ATTTCATTTGGATACAAAGA+GGG + Chr1:13633002-13633021 None:intergenic 25.0%
! TATTGATGAATTCTGCTTAA+AGG - Chr1:13633114-13633133 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
! TCCAACAAATAAGGATATAA+TGG + Chr1:13631682-13631701 None:intergenic 25.0%
! TCTTTGTATGAATACCTTAT+TGG + Chr1:13632114-13632133 None:intergenic 25.0%
! TTGTTCTACAAAAATATTGG+AGG - Chr1:13632666-13632685 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! AATATTGAAGTTTTTCTTCG+TGG - Chr1:13632075-13632094 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! ACCATTATATCCTTATTTGT+TGG - Chr1:13631678-13631697 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTATAGTGAGATTTTCAT+TGG - Chr1:13631987-13632006 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTGAAGTTTTTCTTCGT+GGG - Chr1:13632076-13632095 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTATAGTGAGATTTTCATT+GGG - Chr1:13631988-13632007 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAATATATTTCCTCTAGAG+AGG - Chr1:13632395-13632414 MsG0180000955.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAGGGAAAAACAATATTTTT+TGG + Chr1:13631834-13631853 None:intergenic 25.0%
AAAAACCTATGCATTATCCA+AGG - Chr1:13631897-13631916 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
AAAATGTACGAGATATCTCT+TGG - Chr1:13632441-13632460 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
AAAGATGTTGGGTAAATCTA+AGG - Chr1:13632233-13632252 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
AAGATGTTGGGTAAATCTAA+GGG - Chr1:13632234-13632253 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAACAAAGAAAACCATG+AGG + Chr1:13632014-13632033 None:intergenic 30.0%
AGAAAGAGAAATATCTTCCT+TGG + Chr1:13631917-13631936 None:intergenic 30.0%
AGATTTACCCAACATCTTTA+TGG + Chr1:13632232-13632251 None:intergenic 30.0%
CATTTCATTTGGATACAAAG+AGG + Chr1:13633003-13633022 None:intergenic 30.0%
GAAAATCTCACTATAAGTGA+TGG + Chr1:13631985-13632004 None:intergenic 30.0%
GGAATTGAATCAGAAAATGA+TGG - Chr1:13633053-13633072 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
GGTATTGCTTATTTACATCA+AGG - Chr1:13632474-13632493 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
GTATCCAAATGAAATGATTG+AGG - Chr1:13633007-13633026 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
GTTTATGAATTCATGTCCAA+TGG - Chr1:13632363-13632382 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
TCTATCACTTTGTTCATTGA+AGG + Chr1:13632936-13632955 None:intergenic 30.0%
TCTTCCTCAATCATTTCATT+TGG + Chr1:13633014-13633033 None:intergenic 30.0%
! GTCAAATTTTCTTTCCCATT+TGG - Chr1:13632784-13632803 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! TCTAAAATTGGCATAGAGAT+AGG - Chr1:13631934-13631953 MsG0180000955.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAAATTTGACTTGAACGAT+CGG + Chr1:13632775-13632794 None:intergenic 30.0%
AAAGTGATAGAGATGCTTGA+AGG - Chr1:13632945-13632964 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
AACATCTTTATGGCCACAAA+TGG + Chr1:13632222-13632241 None:intergenic 35.0%
AAGAATACATCACACCAATG+TGG - Chr1:13632296-13632315 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
AAGGCTGATGTATATAGCTT+TGG - Chr1:13632699-13632718 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGTTTCAGAGACAAGTT+GGG - Chr1:13632150-13632169 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
ATAGAGATAGGAAGAATCAC+AGG - Chr1:13631946-13631965 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTCCTTGGATAATGCAT+AGG + Chr1:13631905-13631924 None:intergenic 35.0%
ATTTGTGGCCATAAAGATGT+TGG - Chr1:13632221-13632240 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAGTTTCAGAGACAAGT+TGG - Chr1:13632149-13632168 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
TATAAAGGAAAGCTATGCAG+CGG - Chr1:13632195-13632214 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
TGAATACCTTATTGGCATCA+AGG + Chr1:13632106-13632125 None:intergenic 35.0%
TTGGGTAAATCTAAGGGTAA+TGG - Chr1:13632240-13632259 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTGGCCATAAAGATGTT+GGG - Chr1:13632222-13632241 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
! AAGACCAAAGTCTGAAACTT+TGG + Chr1:13632568-13632587 None:intergenic 35.0%
! AGACCAAAGTCTGAAACTTT+GGG + Chr1:13632567-13632586 None:intergenic 35.0%
! TGGAATGCTTTTGATGGAAA+TGG - Chr1:13632719-13632738 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGATACAAAGAGGGTTT+TGG + Chr1:13632996-13633015 None:intergenic 35.0%
!! ACAGGAGCATTACAAGTAAT+TGG - Chr1:13631868-13631887 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTATTGGGTTTTGTGTTGA+AGG - Chr1:13632324-13632343 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAATCTAAGGGTAATGGAC+AGG - Chr1:13632245-13632264 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGCTTTGGAATGCTTTTGA+TGG - Chr1:13632713-13632732 MsG0180000955.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATGTGGTTCGACTTAT+TGG - Chr1:13632309-13632328 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
AGAGATAGTATCCTCTCTAG+AGG + Chr1:13632409-13632428 None:intergenic 40.0%
ATCCCCAAAGTTTCAGACTT+TGG - Chr1:13632561-13632580 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
ATTAGTGAAGTCGCAACCAT+AGG - Chr1:13632273-13632292 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
CCAATGTGGTTCGACTTATT+GGG - Chr1:13632310-13632329 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
CTCATCGAGTAGGATGTTAT+GGG + Chr1:13632535-13632554 None:intergenic 40.0%
GGATAAAGTTCTCATCGAGT+AGG + Chr1:13632545-13632564 None:intergenic 40.0%
GGTGTGATGTATTCTTCCTA+TGG + Chr1:13632292-13632311 None:intergenic 40.0%
GTGACAATGCTAATCTCGTT+AGG + Chr1:13632603-13632622 None:intergenic 40.0%
TCATCGAGTAGGATGTTATG+GGG + Chr1:13632534-13632553 None:intergenic 40.0%
TCTCATCGAGTAGGATGTTA+TGG + Chr1:13632536-13632555 None:intergenic 40.0%
TTCATTGAAGGACGATCACA+AGG + Chr1:13632924-13632943 None:intergenic 40.0%
! CTGTGAAGTGTGAAGTATCA+GGG + Chr1:13631852-13631871 None:intergenic 40.0%
! GACCAAAGTCTGAAACTTTG+GGG + Chr1:13632566-13632585 None:intergenic 40.0%
! GCTATATACATCAGCCTTGT+AGG + Chr1:13632697-13632716 None:intergenic 40.0%
!! GGCTTTGGAGCTGTTTATAA+AGG - Chr1:13632180-13632199 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
!! TATTGGAGGAGTATCCTACA+AGG - Chr1:13632680-13632699 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCACTTTAACTGCAGCTA+GGG - Chr1:13632617-13632636 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTCACTTTAACTGCAGCT+AGG - Chr1:13632616-13632635 MsG0180000955.01.T01:CDS 40.0%
CCCAATAAGTCGAACCACAT+TGG + Chr1:13632313-13632332 None:intergenic 45.0%
CCTGATACTTCACACTTCAC+AGG - Chr1:13631850-13631869 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
GTACGAGATATCTCTTGGAG+TGG - Chr1:13632446-13632465 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
TAGGGGGACAATTGGATACA+TGG - Chr1:13632635-13632654 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
TCACTTTAACTGCAGCTAGG+GGG - Chr1:13632619-13632638 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
! CCTGTGAAGTGTGAAGTATC+AGG + Chr1:13631853-13631872 None:intergenic 45.0%
! GAGATTTTCATTGGGCCTCA+TGG - Chr1:13631996-13632015 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGTACCTTGATGCCAATA+AGG - Chr1:13632097-13632116 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
! GTCACTTTAACTGCAGCTAG+GGG - Chr1:13632618-13632637 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
! TTCAGAGACAAGTTGGGTGA+AGG - Chr1:13632156-13632175 MsG0180000955.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATACAAAGAGGGTTTTGG+AGG + Chr1:13632993-13633012 None:intergenic 45.0%
AAGTTGGGTGAAGGAGGCTT+TGG - Chr1:13632165-13632184 MsG0180000955.01.T01:CDS 50.0%
ATATCTCTTGGAGTGGCTCG+TGG - Chr1:13632453-13632472 MsG0180000955.01.T01:CDS 50.0%
GAAGACCTTGACGTCAACTC+TGG - Chr1:13633029-13633048 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
TGACTTGAACGATCGGCATG+TGG + Chr1:13632768-13632787 None:intergenic 50.0%
TTCCACCAGAGTTGACGTCA+AGG + Chr1:13633037-13633056 None:intergenic 50.0%
! AGAGACAAGTTGGGTGAAGG+AGG - Chr1:13632159-13632178 MsG0180000955.01.T01:CDS 50.0%
ACTGCAGCTAGGGGGACAAT+TGG - Chr1:13632627-13632646 MsG0180000955.01.T01:CDS 55.0%
GACCTTGACGTCAACTCTGG+TGG - Chr1:13633032-13633051 MsG0180000955.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
GCTATGCAGCGGACCATTTG+TGG - Chr1:13632206-13632225 MsG0180000955.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 13631620 13633133 13631620 ID=MsG0180000955.01;Name=MsG0180000955.01
Chr1 mRNA 13631620 13633133 13631620 ID=MsG0180000955.01.T01;Parent=MsG0180000955.01;Name=MsG0180000955.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=395|-1|0|1|-1|1|1|0|372
Chr1 exon 13631620 13633133 13631620 ID=MsG0180000955.01.T01:exon:9482;Parent=MsG0180000955.01.T01
Chr1 five_prime_UTR 13632739 13633133 13632739 ID=MsG0180000955.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180000955.01.T01
Chr1 CDS 13631620 13632738 13631620 ID=MsG0180000955.01.T01:cds;Parent=MsG0180000955.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180000955.01.T01

ATGGTTTTCTTTGTTTTGTTGATATATACATGTCGAAGCAGACATAATTCAATTTACGAAAATATTGAAGTTTTTCTTCGTGGGAGTACCTTGATGCCAATAAGGTATTCATACAAAGAAATCAAAAAGATGACTAGAAGTTTCAGAGACAAGTTGGGTGAAGGAGGCTTTGGAGCTGTTTATAAAGGAAAGCTATGCAGCGGACCATTTGTGGCCATAAAGATGTTGGGTAAATCTAAGGGTAATGGACAGGATTTCATTAGTGAAGTCGCAACCATAGGAAGAATACATCACACCAATGTGGTTCGACTTATTGGGTTTTGTGTTGAAGGATCAAAGCGTGCTCTTGTTTATGAATTCATGTCCAATGGTTCTCTTGATAAATATATTTCCTCTAGAGAGGATACTATCTCTCTAAGTTATCAGAAAATGTACGAGATATCTCTTGGAGTGGCTCGTGGTATTGCTTATTTACATCAAGGATGCGACATGCAAATTTTGCATTTTGACATTAAGCCCCATAACATCCTACTCGATGAGAACTTTATCCCCAAAGTTTCAGACTTTGGTCTTGCAAAGCTTTATCCTAACGAGATTAGCATTGTCACTTTAACTGCAGCTAGGGGGACAATTGGATACATGGCTCCAGAATTGTTCTACAAAAATATTGGAGGAGTATCCTACAAGGCTGATGTATATAGCTTTGGAATGCTTTTGATGGAAATGGCAAGTAAGAAAAGAAATTTAAATCCACATGCCGATCGTTCAAGTCAAATTTTCTTTCCCATTTGGATTTATAATCAATTGATTGAAGAAAAGGAGATAGAAATGCATGAAATTACATATGAGGAAAATAATAATGTGAAGAAGATGTTCATAATTGCATTATGGTGTATACAATTAAAACCTTGTGATCGTCCTTCAATGAACAAAGTGATAGAGATGCTTGAAGGAGATATTGAAAATATTGAAATGCCTCCAAAACCCTCTTTGTATCCAAATGAAATGATTGAGGAAGACCTTGACGTCAACTCTGGTGGAATTGAATCAGAAAATGATGGCTCTACTAGTTTTATCGAAGAAGATACAACAAAGTCTTTATTGATGAATTCTGCTTAA
Protein sequence

>MsG0180000955.01.T01

MVFFVLLIYTCRSRHNSIYENIEVFLRGSTLMPIRYSYKEIKKMTRSFRDKLGEGGFGAVYKGKLCSGPFVAIKMLGKSKGNGQDFISEVATIGRIHHTNVVRLIGFCVEGSKRALVYEFMSNGSLDKYISSREDTISLSYQKMYEISLGVARGIAYLHQGCDMQILHFDIKPHNILLDENFIPKVSDFGLAKLYPNEISIVTLTAARGTIGYMAPELFYKNIGGVSYKADVYSFGMLLMEMASKKRNLNPHADRSSQIFFPIWIYNQLIEEKEIEMHEITYEENNNVKKMFIIALWCIQLKPCDRPSMNKVIEMLEGDIENIEMPPKPSLYPNEMIEEDLDVNSGGIESENDGSTSFIEEDTTKSLLMNSA*