AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001281.01

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MsG0180001281.01.T01 AT1G66980 48.252 286 137 4 180 458 794 1075 2.31e-88 293
MsG0180001281.01.T01 AT1G66980 48.252 286 137 4 180 458 811 1092 4.08e-88 292
MsG0180001281.01.T01 AT1G66980 48.252 286 137 4 180 458 840 1121 5.48e-88 292
MsG0180001281.01.T01 AT1G66980 48.252 286 137 4 180 458 838 1119 6.51e-88 292
MsG0180001281.01.T01 AT5G38260 47.138 297 141 5 171 458 318 607 4.43e-87 280
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MsG0180001281.01.T01 AT5G38240 46.885 305 146 6 171 469 332 626 7.43e-83 269
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MsG0180001281.01.T01 AT1G66930 42.105 285 127 4 180 458 352 604 2.59e-66 225
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MsG0180001281.01.T01 AT5G24080 41.414 297 158 8 168 458 401 687 4.89e-64 221
MsG0180001281.01.T01 AT5G24080 41.414 297 158 8 168 458 528 814 1.53e-63 221
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MsG0180001281.01.T01 AT4G00960 38.947 285 163 6 181 458 63 343 5.43e-54 186
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23180 39.007 282 164 5 181 458 355 632 1.80e-52 188
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MsG0180001281.01.T01 AT5G03140 35.256 312 176 11 154 455 362 657 5.10e-51 185
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23250 38.542 288 158 7 181 458 361 639 7.55e-50 183
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23230 38.596 285 167 5 181 461 344 624 1.15e-49 180
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23320 37.542 301 178 7 181 476 211 506 1.69e-49 177
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MsG0180001281.01.T01 AT1G60800 37.545 277 159 8 181 449 308 578 8.78e-49 177
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MsG0180001281.01.T01 AT4G11460 38.516 283 165 5 181 458 353 631 2.27e-48 177
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MsG0180001281.01.T01 AT1G11340 39.643 280 164 4 181 458 522 798 2.56e-48 178
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23270 38.380 284 164 6 181 458 333 611 5.21e-48 176
MsG0180001281.01.T01 AT1G29720 34.936 312 183 9 152 458 659 955 5.22e-48 178
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MsG0180001281.01.T01 AT1G56120 36.789 299 169 10 169 458 686 973 3.66e-47 176
MsG0180001281.01.T01 AT1G61380 38.095 294 165 8 181 466 495 779 4.44e-47 174
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23130 36.552 290 161 6 181 458 351 629 5.75e-47 173
MsG0180001281.01.T01 AT1G09440 37.226 274 160 6 181 448 164 431 7.20e-47 169
MsG0180001281.01.T01 AT1G09440 37.226 274 160 6 181 448 164 431 7.20e-47 169
MsG0180001281.01.T01 AT1G11350 37.762 286 172 4 176 458 514 796 7.90e-47 174
MsG0180001281.01.T01 AT5G56890 38.129 278 151 9 181 446 730 998 8.05e-47 175
MsG0180001281.01.T01 AT3G59110 37.184 277 156 7 181 448 197 464 9.52e-47 170
MsG0180001281.01.T01 AT2G13790 37.091 275 164 6 181 449 301 572 1.17e-46 171
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MsG0180001281.01.T01 AT4G23160 38.298 282 166 5 181 458 366 643 1.30e-46 172
MsG0180001281.01.T01 AT4G01330 37.269 271 164 4 181 448 169 436 1.39e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT4G11470 38.028 284 165 5 181 458 346 624 1.54e-46 172
MsG0180001281.01.T01 AT4G23190 38.028 284 167 4 181 458 279 559 1.67e-46 171
MsG0180001281.01.T01 AT4G23190 38.028 284 167 4 181 458 279 559 1.67e-46 171
MsG0180001281.01.T01 AT5G65240 36.634 303 173 6 154 449 272 562 1.73e-46 171
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MsG0180001281.01.T01 AT5G18500 35.165 273 167 5 181 448 173 440 1.86e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT5G18500 35.165 273 167 5 181 448 173 440 1.86e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT5G18500 35.165 273 167 5 181 448 173 440 1.86e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT5G18500 35.165 273 167 5 181 448 173 440 1.86e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT5G18500 35.165 273 167 5 181 448 173 440 1.86e-46 168
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MsG0180001281.01.T01 AT1G56720 35.165 273 167 5 181 448 186 453 2.02e-46 168
MsG0180001281.01.T01 AT1G56720 35.165 273 167 5 181 448 186 453 2.02e-46 168
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MsG0180001281.01.T01 AT4G01330 37.269 271 164 4 181 448 169 436 3.49e-46 167
MsG0180001281.01.T01 AT4G23150 37.589 282 168 5 181 458 343 620 4.28e-46 170
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MsG0180001281.01.T01 AT1G71830 36.000 275 167 5 181 449 309 580 6.35e-46 169
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MsG0180001281.01.T01 AT1G67520 35.143 350 188 12 138 458 236 575 8.12e-46 169
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MsG0180001281.01.T01 AT1G61430 37.589 282 167 6 181 458 473 749 1.40e-45 170
MsG0180001281.01.T01 AT1G11300 38.298 282 159 6 181 458 501 771 1.49e-45 170
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MsG0180001281.01.T01 AT1G61360 34.591 318 193 7 176 485 419 729 1.69e-45 169
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MsG0180001281.01.T01 AT2G42960 36.264 273 164 5 181 448 190 457 3.93e-45 165
MsG0180001281.01.T01 AT2G42960 36.264 273 164 5 181 448 190 457 3.93e-45 165
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MsG0180001281.01.T01 AT2G23950 35.789 285 164 9 172 449 300 572 2.37e-44 165
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MsG0180001281.01.T01 AT1G61490 37.589 282 167 6 181 458 471 747 2.44e-44 166
MsG0180001281.01.T01 AT1G61490 37.589 282 167 6 181 458 497 773 2.47e-44 167
MsG0180001281.01.T01 AT1G61490 37.589 282 167 6 181 458 497 773 2.47e-44 167
MsG0180001281.01.T01 AT1G61490 37.589 282 167 6 181 458 497 773 2.47e-44 167
MsG0180001281.01.T01 AT1G61490 37.589 282 167 6 181 458 497 773 2.47e-44 167
MsG0180001281.01.T01 AT5G59270 34.333 300 184 9 181 473 359 652 2.61e-44 166
MsG0180001281.01.T01 AT5G01540 37.407 270 148 9 188 448 381 638 2.66e-44 166
MsG0180001281.01.T01 AT3G20530 35.766 274 164 7 181 446 89 358 2.75e-44 160
MsG0180001281.01.T01 AT4G27300 38.284 303 176 7 181 479 507 802 3.03e-44 166
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MsG0180001281.01.T01 AT1G21590 33.217 286 165 7 181 453 416 688 3.15e-44 166
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MsG0180001281.01.T01 AT5G59270 34.333 300 184 9 181 473 375 668 3.69e-44 165
MsG0180001281.01.T01 AT3G25560 35.870 276 163 7 180 449 318 585 4.05e-44 164
MsG0180001281.01.T01 AT3G25560 35.870 276 163 7 180 449 318 585 4.28e-44 164
MsG0180001281.01.T01 AT4G04500 37.324 284 167 7 181 456 352 632 4.54e-44 164
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MsG0180001281.01.T01 AT4G34500 34.915 295 169 8 181 466 152 432 5.58e-44 160
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MsG0180001281.01.T01 AT1G61440 36.207 290 176 6 181 466 490 774 1.21e-43 165
MsG0180001281.01.T01 AT4G04540 42.857 203 112 3 181 382 360 559 1.35e-43 162
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MsG0180001281.01.T01 AT4G27290 36.842 266 161 4 181 442 518 780 3.65e-43 163
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MsG0180001281.01.T01 AT4G27290 36.842 266 161 4 181 442 472 734 3.82e-43 163
MsG0180001281.01.T01 AT4G03230 36.749 283 170 6 181 458 597 875 4.01e-43 164
MsG0180001281.01.T01 AT4G03230 36.749 283 170 6 181 458 597 875 4.01e-43 164
MsG0180001281.01.T01 AT4G03230 36.749 283 170 6 181 458 539 817 4.16e-43 163
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MsG0180001281.01.T01 AT1G07650 34.843 287 170 7 181 458 659 937 4.57e-43 164
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MsG0180001281.01.T01 AT5G45780 33.750 320 198 9 170 484 256 566 5.79e-43 160
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MsG0180001281.01.T01 AT5G65700 35.197 304 172 9 155 445 674 965 2.00e-42 162
MsG0180001281.01.T01 AT5G16000 36.101 277 161 7 181 449 319 587 2.02e-42 160
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MsG0180001281.01.T01 AT4G29050 37.500 288 160 12 181 459 365 641 3.46e-42 159
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MsG0180001281.01.T01 AT4G34440 36.396 283 151 8 181 448 319 587 4.09e-42 159
MsG0180001281.01.T01 AT4G32710 35.484 310 175 7 181 475 396 695 4.29e-42 160
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MsG0180001281.01.T01 AT1G15530 33.935 277 161 7 181 447 368 632 7.40e-42 158
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MsG0180001281.01.T01 AT5G63710 35.401 274 169 5 181 449 261 531 8.36e-42 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G77280 32.394 284 172 7 181 453 411 685 8.39e-42 159
MsG0180001281.01.T01 AT1G77280 32.394 284 172 7 181 453 411 685 8.39e-42 159
MsG0180001281.01.T01 AT1G61500 35.593 295 180 7 169 458 485 774 8.94e-42 159
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MsG0180001281.01.T01 AT1G61390 36.972 284 164 9 181 458 359 633 9.54e-42 158
MsG0180001281.01.T01 AT1G61500 35.593 295 180 7 169 458 467 756 1.17e-41 159
MsG0180001281.01.T01 AT1G61500 35.593 295 180 7 169 458 490 779 1.21e-41 159
MsG0180001281.01.T01 AT5G63710 35.401 274 169 5 181 449 297 567 1.53e-41 157
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MsG0180001281.01.T01 AT2G18470 36.691 278 157 9 181 448 291 559 1.85e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT5G63710 35.401 274 169 5 181 449 296 566 2.14e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT5G35960 34.767 279 164 7 181 453 141 407 2.18e-41 153
MsG0180001281.01.T01 AT2G19210 37.226 274 155 9 181 446 583 847 2.27e-41 158
MsG0180001281.01.T01 AT1G11410 39.286 280 165 4 181 458 415 691 2.38e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G70110 37.729 273 153 11 181 445 351 614 2.46e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT4G23210 42.029 207 116 3 181 386 365 568 2.73e-41 156
MsG0180001281.01.T01 AT4G02010 34.767 279 160 8 181 446 387 656 3.06e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G61390 36.972 284 164 9 181 458 527 801 3.08e-41 158
MsG0180001281.01.T01 AT1G11410 39.286 280 165 4 181 458 530 806 3.58e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT5G10530 35.336 283 170 7 181 456 342 618 3.68e-41 156
MsG0180001281.01.T01 AT1G11410 39.286 280 165 4 181 458 506 782 4.08e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G11410 39.286 280 165 4 181 458 537 813 4.24e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT3G49670 33.553 304 177 9 155 445 670 961 4.70e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT4G28650 34.812 293 165 9 181 457 706 988 5.06e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G61430 43.204 206 113 3 181 385 473 675 5.07e-41 156
MsG0180001281.01.T01 AT1G61430 43.204 206 113 3 181 385 496 698 5.26e-41 156
MsG0180001281.01.T01 AT1G61430 43.204 206 113 3 181 385 496 698 5.26e-41 156
MsG0180001281.01.T01 AT2G28590 32.899 307 166 8 154 445 91 372 5.43e-41 152
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MsG0180001281.01.T01 AT4G28490 34.982 283 160 6 181 446 690 965 6.03e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT1G67720 34.859 284 165 9 170 446 607 877 6.58e-41 157
MsG0180001281.01.T01 AT2G18890 35.018 277 160 8 181 448 75 340 7.40e-41 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G07870 31.949 313 185 8 181 479 110 408 9.02e-41 151
MsG0180001281.01.T01 AT3G26940 34.532 278 164 8 181 446 81 352 9.73e-41 152
MsG0180001281.01.T01 AT1G20650 40.476 210 120 3 181 387 85 292 9.82e-41 150
MsG0180001281.01.T01 AT3G07070 34.161 322 189 11 181 487 86 399 1.28e-40 151
MsG0180001281.01.T01 AT4G04960 35.088 285 163 11 181 454 354 627 1.31e-40 155
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MsG0180001281.01.T01 AT1G34110 34.643 280 159 8 181 445 779 1049 1.37e-40 156
MsG0180001281.01.T01 AT4G23300 34.843 287 172 6 181 458 360 640 1.82e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT1G56145 31.013 316 188 6 181 469 694 1006 1.88e-40 156
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MsG0180001281.01.T01 AT5G59670 34.317 271 166 6 181 446 571 834 2.45e-40 155
MsG0180001281.01.T01 AT2G19230 35.055 271 164 7 181 446 576 839 2.47e-40 155
MsG0180001281.01.T01 AT5G02800 35.036 274 163 6 181 445 80 347 2.48e-40 149
MsG0180001281.01.T01 AT4G20270 35.793 271 164 7 181 445 717 983 2.98e-40 155
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MsG0180001281.01.T01 AT5G15730 33.220 295 181 8 154 445 94 375 4.09e-40 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G11330 40.000 210 122 3 181 389 531 737 4.36e-40 154
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MsG0180001281.01.T01 AT2G37050 35.294 272 166 6 181 446 611 878 4.76e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT4G29180 34.155 284 163 6 181 446 572 849 4.98e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT4G39400 34.944 269 170 5 181 446 890 1156 5.12e-40 155
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MsG0180001281.01.T01 AT3G05140 34.164 281 168 7 181 455 198 467 5.60e-40 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G49270 38.494 239 134 7 181 417 343 570 5.61e-40 153
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MsG0180001281.01.T01 AT4G29180 34.155 284 163 6 181 446 571 848 6.17e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT1G55610 34.307 274 170 8 180 446 865 1135 6.56e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT1G55610 34.307 274 170 8 180 446 865 1135 6.56e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT5G63930 36.601 306 159 12 180 464 746 1037 7.27e-40 154
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MsG0180001281.01.T01 AT5G63930 36.601 306 159 12 180 464 810 1101 7.67e-40 154
MsG0180001281.01.T01 AT5G01020 33.793 290 165 9 181 452 76 356 7.94e-40 149
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MsG0180001281.01.T01 AT5G35960 40.404 198 110 4 181 376 141 332 2.17e-39 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G66460 32.239 335 187 12 142 454 132 448 2.30e-39 149
MsG0180001281.01.T01 AT3G19700 35.548 301 161 7 171 446 672 964 2.45e-39 152
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MsG0180001281.01.T01 AT5G18610 31.579 304 193 6 181 475 90 387 2.62e-39 149
MsG0180001281.01.T01 AT5G18610 31.579 304 193 6 181 475 90 387 2.62e-39 149
MsG0180001281.01.T01 AT1G68690 33.700 273 168 6 181 446 384 650 2.77e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G68690 33.700 273 168 6 181 446 384 650 2.77e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G68690 33.700 273 168 6 181 446 384 650 2.77e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT5G16900 33.942 274 163 8 181 446 394 657 2.91e-39 151
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MsG0180001281.01.T01 AT1G51880 34.815 270 163 7 181 445 599 860 3.06e-39 152
MsG0180001281.01.T01 AT4G21390 41.981 212 119 3 181 391 536 744 3.07e-39 152
MsG0180001281.01.T01 AT1G51880 34.815 270 163 7 181 445 573 834 3.22e-39 152
MsG0180001281.01.T01 AT1G61430 42.584 209 113 4 181 385 496 701 3.24e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G26150 36.719 256 139 7 131 376 386 628 3.61e-39 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G29730 40.639 219 124 5 177 394 643 856 3.95e-39 152
MsG0180001281.01.T01 AT3G46330 34.014 294 179 8 156 442 548 833 4.48e-39 152
MsG0180001281.01.T01 AT4G11890 32.500 280 182 5 180 456 43 318 4.51e-39 145
MsG0180001281.01.T01 AT3G46330 34.014 294 179 8 156 442 524 809 4.85e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G68690 38.326 227 127 6 181 404 384 600 5.09e-39 150
MsG0180001281.01.T01 AT4G11890 32.500 280 182 5 180 456 44 319 5.54e-39 145
MsG0180001281.01.T01 AT2G14510 35.793 271 159 9 181 445 578 839 5.64e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT4G11890 32.500 280 182 5 180 456 46 321 5.84e-39 145
MsG0180001281.01.T01 AT3G58690 33.456 272 172 4 181 445 94 363 6.39e-39 146
MsG0180001281.01.T01 AT5G16900 32.013 303 177 9 163 446 551 843 6.50e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT5G16900 32.013 303 177 9 163 446 551 843 6.50e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT2G14510 35.793 271 159 9 181 445 570 831 6.77e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G51890 34.444 270 164 7 181 445 305 566 6.85e-39 149
MsG0180001281.01.T01 AT5G54590 33.453 278 151 9 181 445 120 376 7.20e-39 147
MsG0180001281.01.T01 AT5G54590 33.453 278 151 9 181 445 120 376 7.20e-39 147
MsG0180001281.01.T01 AT5G54590 33.453 278 151 9 181 445 120 376 7.20e-39 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G09970 35.192 287 158 7 181 446 673 952 7.89e-39 151
MsG0180001281.01.T01 AT1G09970 34.843 287 160 7 181 446 673 953 9.78e-39 150
MsG0180001281.01.T01 AT2G28970 34.559 272 164 9 181 446 451 714 9.97e-39 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G70530 40.088 227 121 6 154 377 309 523 1.01e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT2G28970 34.559 272 164 9 181 446 486 749 1.11e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G48210 32.852 277 169 5 181 446 75 345 1.13e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G48210 32.852 277 169 5 181 446 75 345 1.13e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G48210 32.852 277 169 5 181 446 75 345 1.13e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G48210 32.852 277 169 5 181 446 75 345 1.13e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G29730 40.476 210 119 4 177 385 676 880 1.23e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT2G28990 34.074 270 168 6 181 446 584 847 1.33e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT2G28990 34.074 270 168 6 181 446 584 847 1.33e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G51890 34.444 270 164 7 181 445 513 774 1.41e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT4G20450 33.210 271 169 7 181 446 598 861 1.44e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT1G61610 40.094 212 123 3 181 391 532 740 1.53e-38 149
MsG0180001281.01.T01 AT1G51890 34.444 270 164 7 181 445 577 838 1.95e-38 150
MsG0180001281.01.T01 AT2G28960 33.579 271 168 6 181 446 448 711 2.12e-38 149
MsG0180001281.01.T01 AT1G76370 41.117 197 113 2 181 376 82 276 2.23e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT3G15890 32.143 308 186 8 181 474 46 344 2.36e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G24030 32.852 277 170 7 181 446 15 286 2.40e-38 142
MsG0180001281.01.T01 AT1G61860 31.229 301 192 6 181 470 92 388 2.53e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT4G28350 34.058 276 161 10 181 446 356 620 3.04e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT4G13190 30.195 308 175 7 181 463 78 370 3.16e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT5G11020 34.307 274 160 8 181 445 87 349 3.59e-38 143
MsG0180001281.01.T01 AT2G28960 33.579 271 168 6 181 446 580 843 3.74e-38 149
MsG0180001281.01.T01 AT5G11020 34.307 274 160 8 181 445 148 410 3.74e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G61460 34.397 282 158 7 181 458 461 719 4.05e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT5G11020 34.307 274 160 8 181 445 110 372 4.17e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT5G11020 34.307 274 160 8 181 445 114 376 4.36e-38 144
MsG0180001281.01.T01 AT2G18470 39.352 216 122 5 181 395 291 498 4.65e-38 146
MsG0180001281.01.T01 AT2G28590 37.339 233 124 6 154 380 91 307 5.59e-38 142
MsG0180001281.01.T01 AT5G39000 34.545 275 166 9 181 446 525 794 5.84e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT5G38990 34.545 275 166 9 181 446 532 801 5.85e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT2G14440 35.793 271 159 9 181 445 571 832 7.00e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT1G51910 34.657 277 154 8 181 446 580 840 7.27e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT2G18890 34.444 270 157 8 181 441 75 333 8.28e-38 142
MsG0180001281.01.T01 AT1G07550 35.556 270 160 9 181 445 567 827 8.53e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT5G37790 30.864 324 193 11 142 448 187 496 9.06e-38 145
MsG0180001281.01.T01 AT1G66150 31.769 277 173 6 181 446 595 866 9.10e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT1G17230 34.155 284 172 8 169 445 797 1072 9.37e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT1G17230 34.155 284 172 8 169 445 797 1072 9.69e-38 148
MsG0180001281.01.T01 AT3G46420 35.955 267 159 7 181 442 538 797 1.04e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT5G57670 33.700 273 161 8 181 445 274 534 1.12e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT2G19190 32.841 271 169 7 181 446 581 843 1.30e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT5G10520 34.296 277 161 8 181 448 160 424 1.37e-37 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G24030 32.852 277 170 7 181 446 83 354 1.44e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT1G24030 32.852 277 170 7 181 446 69 340 1.44e-37 141
MsG0180001281.01.T01 AT4G35600 31.338 284 167 8 181 446 93 366 1.63e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT4G35600 31.338 284 167 8 181 446 94 367 1.76e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT1G55200 34.286 280 159 10 181 448 386 652 1.87e-37 146
MsG0180001281.01.T01 AT1G55200 34.286 280 159 10 181 448 386 652 1.87e-37 146
MsG0180001281.01.T01 AT1G55200 34.286 280 159 10 181 448 386 652 1.87e-37 146
MsG0180001281.01.T01 AT1G55200 34.286 280 159 10 181 448 386 652 1.87e-37 146
MsG0180001281.01.T01 AT5G49770 33.463 257 164 4 193 446 653 905 2.07e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G51820 34.082 267 164 6 181 442 323 582 2.10e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT3G53590 31.987 297 156 8 181 455 628 900 2.12e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G51850 33.708 267 165 6 181 442 565 824 2.13e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G51850 33.708 267 165 6 181 442 585 844 2.19e-37 147
MsG0180001281.01.T01 AT1G31420 33.700 273 167 7 181 448 313 576 2.26e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT1G69790 33.103 290 153 10 181 446 80 352 2.38e-37 141
MsG0180001281.01.T01 AT3G59740 35.125 279 160 9 181 447 340 609 2.47e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT3G55450 31.438 299 179 9 178 457 65 356 2.50e-37 141
MsG0180001281.01.T01 AT1G70450 34.021 291 168 9 172 450 50 328 2.64e-37 141
MsG0180001281.01.T01 AT1G51860 32.177 317 195 9 134 445 407 708 2.68e-37 146
MsG0180001281.01.T01 AT1G61590 32.975 279 167 7 181 446 106 377 2.71e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT3G55450 31.438 299 179 9 178 457 102 393 3.46e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT2G25220 34.909 275 164 7 178 445 101 367 3.51e-37 141
MsG0180001281.01.T01 AT1G31420 33.333 273 169 7 181 448 313 577 3.53e-37 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G31420 33.333 273 169 7 181 448 313 577 3.53e-37 144
MsG0180001281.01.T01 AT1G51820 34.082 267 164 6 181 442 585 844 4.28e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT1G69790 33.103 290 153 10 181 446 91 363 4.32e-37 140
MsG0180001281.01.T01 AT1G51860 32.177 317 195 9 134 445 551 852 4.34e-37 145
MsG0180001281.01.T01 AT5G35580 32.258 310 179 10 181 471 83 380 4.60e-37 142
MsG0180001281.01.T01 AT5G37450 35.018 277 163 7 177 446 431 697 4.97e-37 145

Find 106 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 184 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTCCCAAAATCACAGATTT+TGG 0.138240 1:+18738028 MsG0180001281.01.T01:CDS
CAATCCAAAATCTGTGATTT+TGG 0.144766 1:-18738032 None:intergenic
GTTTCTCCCCTTATTCTTTC+GGG 0.202357 1:+18737178 MsG0180001281.01.T01:CDS
TCTTCACGGCTACTAGAATT+TGG 0.216876 1:-18737679 None:intergenic
CTTTCGGGTGAAACTGTATC+TGG 0.222306 1:+18737193 MsG0180001281.01.T01:CDS
TCAAAAGCTGCCATATAAAT+TGG 0.250031 1:-18737103 None:intergenic
GGAAATCATCTTTGTTGTTT+GGG 0.257939 1:-18737874 None:intergenic
GATTTCTTGTCCAATTTATA+TGG 0.258801 1:+18737093 MsG0180001281.01.T01:CDS
AGTTTCTCCCCTTATTCTTT+CGG 0.268671 1:+18737177 MsG0180001281.01.T01:CDS
CAGTTTCACCCGAAAGAATA+AGG 0.281846 1:-18737186 None:intergenic
CTCAATGTTGTTCGTTTGCT+TGG 0.282977 1:+18737773 MsG0180001281.01.T01:CDS
AGGAAATCATCTTTGTTGTT+TGG 0.283198 1:-18737875 None:intergenic
CTAATTAGAGTGTCGTCTTT+TGG 0.300953 1:-18736298 None:intergenic
TCTCCATCTTCATGATCAAT+AGG 0.327269 1:-18738310 None:intergenic
TCATCTAGCAAGACATTATG+AGG 0.363616 1:-18737998 None:intergenic
GTGCCTTTAGGTATGATTCA+TGG 0.363731 1:+18736344 MsG0180001281.01.T01:CDS
ATGGGTTGTTGTCGCTTGTT+TGG 0.371281 1:+18736226 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGTATCACAGATTTCATTGC+CGG 0.377730 1:-18738400 None:intergenic
CAGTTACGATATGTTATTGT+TGG 0.378157 1:+18738180 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTTCCATTCCGGATTATTGA+TGG 0.379116 1:+18736956 MsG0180001281.01.T01:CDS
AACAATATTAGCATTTGTAT+TGG 0.384383 1:-18738488 None:intergenic
TTTGTATTGGTTGTAGTTGT+TGG 0.387687 1:-18738475 None:intergenic
AATTTCTGCAACGAACCATT+TGG 0.397285 1:-18737842 None:intergenic
GCTCATGGTGCTGTTTATAA+AGG 0.402176 1:+18737644 MsG0180001281.01.T01:CDS
GGCTACTCGTTGGTGCCTTT+AGG 0.411688 1:+18736332 MsG0180001281.01.T01:CDS
GACGACACTCTAATTAGAAA+AGG 0.419809 1:+18736304 MsG0180001281.01.T01:CDS
AGCAAATTGTGTATCCAGTC+TGG 0.428313 1:-18738268 None:intergenic
AACAACAAAGATGATTTCCT+TGG 0.429800 1:+18737878 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGTATCCATGACTGCGGCTA+AGG 0.436384 1:+18738084 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTGCTTGGCTTCTGCGCAGA+TGG 0.437698 1:+18737788 MsG0180001281.01.T01:CDS
CTCCATCTTCATGATCAATA+GGG 0.437930 1:-18738309 None:intergenic
AAAACTTAATCTTATTATCA+TGG 0.441701 1:+18737224 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGCATTGTTAAGAATCTTCA+CGG 0.441829 1:-18737693 None:intergenic
TTCATTGCCGGACGATGTAA+AGG 0.452855 1:-18738388 None:intergenic
ACCAAGAAATGATTGAGAAA+AGG 0.454087 1:-18736262 None:intergenic
TGGATACACAATTTGCTTGA+AGG 0.464532 1:+18738274 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGCCTTTAGGTATGATTCAT+GGG 0.470176 1:+18736345 MsG0180001281.01.T01:CDS
AGTTTCACCCGAAAGAATAA+GGG 0.470496 1:-18737185 None:intergenic
CGATATGTTATTGTTGGAGA+TGG 0.471300 1:+18738186 MsG0180001281.01.T01:CDS
ATGTTATTGTTGGAGATGGT+TGG 0.474116 1:+18738190 MsG0180001281.01.T01:CDS
GTTGGTCCGAACGGATTAGT+AGG 0.476220 1:-18738457 None:intergenic
CTTAACAATGCAGAGGGAGA+TGG 0.476811 1:+18737704 MsG0180001281.01.T01:CDS
ATGGCACCCTTTACATCGTC+CGG 0.477300 1:+18738381 MsG0180001281.01.T01:CDS
CTCTAATTAGAAAAGGGTAT+AGG 0.478470 1:+18736311 MsG0180001281.01.T01:CDS
TCTGTGATACAAATGCTTCA+AGG 0.482007 1:+18738412 MsG0180001281.01.T01:CDS
GACGATGTAAAGGGTGCCAT+TGG 0.485205 1:-18738378 None:intergenic
ATCCCTATTGATCATGAAGA+TGG 0.489987 1:+18738307 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACAAAGATGATTTCCTTGGA+TGG 0.499740 1:+18737882 MsG0180001281.01.T01:CDS
AATTGGCAACTGTGGGACTT+TGG 0.503564 1:+18738350 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACTCAGAACCATCAATAATC+CGG 0.507999 1:-18736964 None:intergenic
CTTAATCTTATTATCATGGT+CGG 0.514341 1:+18737228 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACTGCGGCTAAGGGAACATT+AGG 0.516435 1:+18738094 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTTAGGTATGATTCATGGGA+TGG 0.516910 1:+18736349 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTAACAATGCAGAGGGAGAT+GGG 0.518350 1:+18737705 MsG0180001281.01.T01:CDS
TCATTTCTTGGTGAATCTTG+TGG 0.522959 1:+18736273 MsG0180001281.01.T01:CDS
GAATTCTTTGATCACAACCT+TGG 0.523010 1:-18737958 None:intergenic
GTTGTAGTTGTTGGTCCGAA+CGG 0.527000 1:-18738466 None:intergenic
ACGACACTCTAATTAGAAAA+GGG 0.530873 1:+18736305 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTGTTGAGACAACTTGGTAC+AGG 0.533579 1:-18737155 None:intergenic
AGAAACTTGTTGAGACAACT+TGG 0.533612 1:-18737161 None:intergenic
GTTGCAATTTATCCCATCCA+AGG 0.533826 1:-18737895 None:intergenic
CAAAGATGATTTCCTTGGAT+GGG 0.534420 1:+18737883 MsG0180001281.01.T01:CDS
GTATCCATGACTGCGGCTAA+GGG 0.536784 1:+18738085 MsG0180001281.01.T01:CDS
ATACAAATGCTTCAAGGAGA+GGG 0.537480 1:+18738418 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGTTCCCTTAGCCGCAGTCA+TGG 0.538261 1:-18738089 None:intergenic
ATAAATGAAGTGGGAACCAT+GGG 0.539261 1:+18737737 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTCTTTGATTGTTCTTCACT+AGG 0.539627 1:+18737022 MsG0180001281.01.T01:CDS
GAAGGAATTCATAAATGAAG+TGG 0.544267 1:+18737727 MsG0180001281.01.T01:CDS
TCATTGCCGGACGATGTAAA+GGG 0.546975 1:-18738387 None:intergenic
ATCCCATGAATCATACCTAA+AGG 0.551442 1:-18736347 None:intergenic
ATTTCACTAGGCATAGCAAA+TGG 0.552256 1:+18737920 MsG0180001281.01.T01:CDS
AAAGTGCCTACTAATCCGTT+CGG 0.554527 1:+18738451 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTTCGGGTGAAACTGTATCT+GGG 0.556166 1:+18737194 MsG0180001281.01.T01:CDS
GAACCATCAATAATCCGGAA+TGG 0.560682 1:-18736959 None:intergenic
TTATTGTTGGAGATGGTTGG+AGG 0.560779 1:+18738193 MsG0180001281.01.T01:CDS
TAAGGGAACATTAGGCTACA+TGG 0.564694 1:+18738102 MsG0180001281.01.T01:CDS
TACAAATGCTTCAAGGAGAG+GGG 0.568086 1:+18738419 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACAATCAAAGAAACTAATGT+TGG 0.575239 1:-18737011 None:intergenic
AAGATAGGTGAAGGAGCTCA+TGG 0.575417 1:+18737629 MsG0180001281.01.T01:intron
CAATGCAGAGGGAGATGGGA+AGG 0.575501 1:+18737709 MsG0180001281.01.T01:CDS
CATAAATGAAGTGGGAACCA+TGG 0.577886 1:+18737736 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTAGGTATGATTCATGGGAT+GGG 0.580060 1:+18736350 MsG0180001281.01.T01:CDS
CTACTATGGAGATTTGCAGC+AGG 0.581261 1:+18737066 MsG0180001281.01.T01:CDS
AAGGAATTCATAAATGAAGT+GGG 0.581739 1:+18737728 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACAACTTGGTACAGGATACA+AGG 0.589746 1:-18737147 None:intergenic
AGAACGTATGAATTTAGAGC+TGG 0.597304 1:+18738513 MsG0180001281.01.T01:CDS
TATTGTTGGAGATGGTTGGA+GGG 0.598068 1:+18738194 MsG0180001281.01.T01:CDS
AAATTGCAACAAATTTCACT+AGG 0.606382 1:+18737908 MsG0180001281.01.T01:CDS
GAAATCATCTTTGTTGTTTG+GGG 0.611114 1:-18737873 None:intergenic
TTGGTAAATTCATCTAATTG+CGG 0.615891 1:-18736992 None:intergenic
TACAAGTTGAGTATCCAGAC+TGG 0.616463 1:+18738254 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGAATGTATCTCACCTGCAG+AGG 0.618845 1:-18737311 None:intergenic
AAGATTCTTAACAATGCAGA+GGG 0.626874 1:+18737698 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACGTATGAATTTAGAGCTGG+AGG 0.633417 1:+18738516 MsG0180001281.01.T01:CDS
AAAGGGTATAGGCTACTCGT+TGG 0.636983 1:+18736322 MsG0180001281.01.T01:CDS
GCAAACGAACAACATTGAGA+TGG 0.640847 1:-18737769 None:intergenic
GATACAAATGCTTCAAGGAG+AGG 0.641717 1:+18738417 MsG0180001281.01.T01:CDS
GAAGATTCTTAACAATGCAG+AGG 0.642934 1:+18737697 MsG0180001281.01.T01:CDS
TGGGACTTTGGTGTATCCAA+TGG 0.645612 1:+18738362 MsG0180001281.01.T01:CDS
ACAAATGCTTCAAGGAGAGG+GGG 0.654010 1:+18738420 MsG0180001281.01.T01:CDS
CATCTAGCAAGACATTATGA+GGG 0.654208 1:-18737997 None:intergenic
GTTTCACCCGAAAGAATAAG+GGG 0.660077 1:-18737184 None:intergenic
TCGGAAACAAATCTCGACAA+AGG 0.670173 1:+18737247 MsG0180001281.01.T01:CDS
GGCATTGAGTATCTACACCA+AGG 0.679880 1:+18737941 MsG0180001281.01.T01:CDS
AAGTATTGTATCCATGACTG+CGG 0.704791 1:+18738078 MsG0180001281.01.T01:CDS
TTCATGGGATGGGAAAGACA+TGG 0.748608 1:+18736360 MsG0180001281.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAAATTTAAAGATAAGAT+AGG + Chr1:18737614-18737633 MsG0180001281.01.T01:intron 10.0%
!!! GTTTTATTTTTCAAATATAT+CGG + Chr1:18737483-18737502 MsG0180001281.01.T01:intron 10.0%
!! AAAACTTAATCTTATTATCA+TGG + Chr1:18737224-18737243 MsG0180001281.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAATACTAAAGAAATACTA+TGG + Chr1:18736724-18736743 MsG0180001281.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTTCTATTTTGGATTTT+CGG - Chr1:18736670-18736689 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTAGAATTCCAAAAAAAT+TGG + Chr1:18738333-18738352 MsG0180001281.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAATTGAAGAAGAGAAAT+TGG - Chr1:18736939-18736958 None:intergenic 20.0%
!! AAACAGACAGATAATAAAAT+TGG + Chr1:18736690-18736709 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!! AACAATATTAGCATTTGTAT+TGG - Chr1:18738491-18738510 None:intergenic 20.0%
!! AACAGACAGATAATAAAATT+GGG + Chr1:18736691-18736710 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!! ACAATTGTTAAGCTTAAATA+GGG + Chr1:18736623-18736642 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!! TACAATTGTTAAGCTTAAAT+AGG + Chr1:18736622-18736641 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!!! AAATTTCTAGAAAAAACTTC+AGG - Chr1:18738130-18738149 None:intergenic 20.0%
!!! AAGAATTGAAAACTTTTTGA+AGG + Chr1:18737535-18737554 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!!! GAAGTTTTTTCTAGAAATTT+TGG + Chr1:18738130-18738149 MsG0180001281.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATATTGATGTTTAATTTGT+AGG + Chr1:18737422-18737441 MsG0180001281.01.T01:intron 20.0%
!!! GTCTGTTTTATTTTCTATTT+TGG - Chr1:18736678-18736697 None:intergenic 20.0%
! AAATTGCAACAAATTTCACT+AGG + Chr1:18737908-18737927 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! AAGGAATTCATAAATGAAGT+GGG + Chr1:18737728-18737747 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! ACAATCAAAGAAACTAATGT+TGG - Chr1:18737014-18737033 None:intergenic 25.0%
! AGAAAGAATACAAAAACAAC+CGG + Chr1:18738217-18738236 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! CTTAATCTTATTATCATGGT+CGG + Chr1:18737228-18737247 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! GATTTCTTGTCCAATTTATA+TGG + Chr1:18737093-18737112 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! TATCTAAAAAAGGACTACTA+TGG + Chr1:18737052-18737071 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTTATCAAAATGAGAACT+CGG - Chr1:18736793-18736812 None:intergenic 25.0%
! TTCACTTCTATACTTTCATT+TGG + Chr1:18737330-18737349 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
! TTGGTAAATTCATCTAATTG+CGG - Chr1:18736995-18737014 None:intergenic 25.0%
! TTTAAAGATAAGATAGGTGA+AGG + Chr1:18737620-18737639 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
!! AATCCAAAATCTGTGATTTT+GGG - Chr1:18738034-18738053 None:intergenic 25.0%
!! TAATTTGTAGGTACAATCAT+TGG + Chr1:18737434-18737453 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
!!! AAACTTTTTGAAGGATTACA+AGG + Chr1:18737544-18737563 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
!!! ACTTTCATTTGGTTTGATTT+TGG + Chr1:18737341-18737360 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTCATTTGGTTTGATTTT+GGG + Chr1:18737342-18737361 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
!!! GTATATGAACTTTTTCCAAA+TGG + Chr1:18737827-18737846 MsG0180001281.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCATTTGGTTTGATTTTG+GGG + Chr1:18737343-18737362 MsG0180001281.01.T01:intron 25.0%
AACAACAAAGATGATTTCCT+TGG + Chr1:18737878-18737897 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
AAGATTCTTAACAATGCAGA+GGG + Chr1:18737698-18737717 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAGAAATGATTGAGAAA+AGG - Chr1:18736265-18736284 None:intergenic 30.0%
ACGACACTCTAATTAGAAAA+GGG + Chr1:18736305-18736324 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
CAGTTACGATATGTTATTGT+TGG + Chr1:18738180-18738199 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
CTTTATCAAAATGAGAACTC+GGG - Chr1:18736792-18736811 None:intergenic 30.0%
GAAGGAATTCATAAATGAAG+TGG + Chr1:18737727-18737746 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
GATAGATATGTAAGCAACTT+GGG + Chr1:18736400-18736419 MsG0180001281.01.T01:intron 30.0%
TCAAAAGCTGCCATATAAAT+TGG - Chr1:18737106-18737125 None:intergenic 30.0%
TGATAGATATGTAAGCAACT+TGG + Chr1:18736399-18736418 MsG0180001281.01.T01:intron 30.0%
TGCATTGTTAAGAATCTTCA+CGG - Chr1:18737696-18737715 None:intergenic 30.0%
TTCTTTGATTGTTCTTCACT+AGG + Chr1:18737022-18737041 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
TTGGACTGAAATAAGAGTTA+TGG - Chr1:18736920-18736939 None:intergenic 30.0%
! AAGTACTGCATTTATTCAGT+GGG - Chr1:18736869-18736888 None:intergenic 30.0%
! AGTTATGGAAGACAATTTTC+AGG - Chr1:18736905-18736924 None:intergenic 30.0%
! ATGTAGCTGAGAATTTTTCA+AGG + Chr1:18737400-18737419 MsG0180001281.01.T01:intron 30.0%
! CAAAATCACAGATTTTGGAT+TGG + Chr1:18738033-18738052 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
! CAATCCAAAATCTGTGATTT+TGG - Chr1:18738035-18738054 None:intergenic 30.0%
! CTCTAATTAGAAAAGGGTAT+AGG + Chr1:18736311-18736330 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
! CTTCTTCAATTTTTCCATTC+CGG + Chr1:18736945-18736964 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
! TAAGTACTGCATTTATTCAG+TGG - Chr1:18736870-18736889 None:intergenic 30.0%
! TAGAGAGTTTTCTCAATTTC+CGG - Chr1:18736564-18736583 None:intergenic 30.0%
!! AACTTGTTCCTTTTCAATCT+AGG - Chr1:18736501-18736520 None:intergenic 30.0%
!! AAGATTATTTTATCCTCTGC+AGG + Chr1:18737298-18737317 MsG0180001281.01.T01:CDS 30.0%
!! AGGAAATCATCTTTGTTGTT+TGG - Chr1:18737878-18737897 None:intergenic 30.0%
!! GAAATCATCTTTGTTGTTTG+GGG - Chr1:18737876-18737895 None:intergenic 30.0%
!! GGAAATCATCTTTGTTGTTT+GGG - Chr1:18737877-18737896 None:intergenic 30.0%
!! TTTGTATTGGTTGTAGTTGT+TGG - Chr1:18738478-18738497 None:intergenic 30.0%
AAGAATACAAAAACAACCGG+TGG + Chr1:18738220-18738239 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
AATTTCTGCAACGAACCATT+TGG - Chr1:18737845-18737864 None:intergenic 35.0%
ACAAAGATGATTTCCTTGGA+TGG + Chr1:18737882-18737901 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ACTCAGAACCATCAATAATC+CGG - Chr1:18736967-18736986 None:intergenic 35.0%
ACTGTGCTTCTTCTTCTATT+TGG + Chr1:18737461-18737480 MsG0180001281.01.T01:intron 35.0%
AGGACAACGCTATCTAAAAA+AGG + Chr1:18737042-18737061 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
AGTTTCACCCGAAAGAATAA+GGG - Chr1:18737188-18737207 None:intergenic 35.0%
AGTTTCTCCCCTTATTCTTT+CGG + Chr1:18737177-18737196 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ATAAATGAAGTGGGAACCAT+GGG + Chr1:18737737-18737756 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ATACAAATGCTTCAAGGAGA+GGG + Chr1:18738418-18738437 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ATCCCATGAATCATACCTAA+AGG - Chr1:18736350-18736369 None:intergenic 35.0%
ATCCCTATTGATCATGAAGA+TGG + Chr1:18738307-18738326 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTATTGTTGGAGATGGT+TGG + Chr1:18738190-18738209 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCACTAGGCATAGCAAA+TGG + Chr1:18737920-18737939 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGATGATTTCCTTGGAT+GGG + Chr1:18737883-18737902 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
CATCTAGCAAGACATTATGA+GGG - Chr1:18738000-18738019 None:intergenic 35.0%
CCAAAAAAATTGGCAACTGT+GGG + Chr1:18738343-18738362 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
CGATATGTTATTGTTGGAGA+TGG + Chr1:18738186-18738205 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
CTCCATCTTCATGATCAATA+GGG - Chr1:18738312-18738331 None:intergenic 35.0%
GAAGATTCTTAACAATGCAG+AGG + Chr1:18737697-18737716 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
GAATATTGAGACATCAAGAG+AGG + Chr1:18736424-18736443 MsG0180001281.01.T01:intron 35.0%
GAATTCTTTGATCACAACCT+TGG - Chr1:18737961-18737980 None:intergenic 35.0%
GACGACACTCTAATTAGAAA+AGG + Chr1:18736304-18736323 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
GCGACAAACTTGTGAAAATA+GGG + Chr1:18736526-18736545 MsG0180001281.01.T01:intron 35.0%
GCTTAACAATTGTAGCTAAG+AGG - Chr1:18736616-18736635 None:intergenic 35.0%
GGGAAATAACAAAACCCTAA+TGG + Chr1:18736643-18736662 MsG0180001281.01.T01:intron 35.0%
TCATCTAGCAAGACATTATG+AGG - Chr1:18738001-18738020 None:intergenic 35.0%
TCATTTCTTGGTGAATCTTG+TGG + Chr1:18736273-18736292 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAAAAAATTGGCAACTG+TGG + Chr1:18738342-18738361 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TCTCCATCTTCATGATCAAT+AGG - Chr1:18738313-18738332 None:intergenic 35.0%
TCTGCATAAGAGAATCTAGT+TGG - Chr1:18737578-18737597 None:intergenic 35.0%
TCTGTGATACAAATGCTTCA+AGG + Chr1:18738412-18738431 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TGCCTTTAGGTATGATTCAT+GGG + Chr1:18736345-18736364 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TGTATCACAGATTTCATTGC+CGG - Chr1:18738403-18738422 None:intergenic 35.0%
TTAGGTATGATTCATGGGAT+GGG + Chr1:18736350-18736369 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAAAGGAACAAGTTTGC+AGG + Chr1:18736504-18736523 MsG0180001281.01.T01:intron 35.0%
TTTAGGTATGATTCATGGGA+TGG + Chr1:18736349-18736368 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
TTTCCATTCCGGATTATTGA+TGG + Chr1:18736956-18736975 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTATTGTATCCATGACTG+CGG + Chr1:18738078-18738097 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! ACTCCCAAAATCACAGATTT+TGG + Chr1:18738028-18738047 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! AGAACGTATGAATTTAGAGC+TGG + Chr1:18738513-18738532 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! GCCTTTTCTCAATCATTTCT+TGG + Chr1:18736261-18736280 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATACACAATTTGCTTGA+AGG + Chr1:18738274-18738293 MsG0180001281.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTATGTTTTCTTCACCAC+CGG - Chr1:18738239-18738258 None:intergenic 35.0%
! TTTGGATTTTCGGACCATTA+GGG - Chr1:18736660-18736679 None:intergenic 35.0%
! TTTTGGATTTTCGGACCATT+AGG - Chr1:18736661-18736680 None:intergenic 35.0%
!! AGAAACTTGTTGAGACAACT+TGG - Chr1:18737164-18737183 None:intergenic 35.0%
!!! CTAATTAGAGTGTCGTCTTT+TGG - Chr1:18736301-18736320 None:intergenic 35.0%
AATAGGGTTTCAGAATCCAC+CGG + Chr1:18736542-18736561 MsG0180001281.01.T01:intron 40.0%
ACAACTTGGTACAGGATACA+AGG - Chr1:18737150-18737169 None:intergenic 40.0%
AGCAAATTGTGTATCCAGTC+TGG - Chr1:18738271-18738290 None:intergenic 40.0%
CAGTTTCACCCGAAAGAATA+AGG - Chr1:18737189-18737208 None:intergenic 40.0%
CATAAATGAAGTGGGAACCA+TGG + Chr1:18737736-18737755 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATGTTGTTCGTTTGCT+TGG + Chr1:18737773-18737792 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
CTGACTACGTCAATTTCCTA+AGG - Chr1:18736454-18736473 None:intergenic 40.0%
GAACCATCAATAATCCGGAA+TGG - Chr1:18736962-18736981 None:intergenic 40.0%
GATACAAATGCTTCAAGGAG+AGG + Chr1:18738417-18738436 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
GCAAACGAACAACATTGAGA+TGG - Chr1:18737772-18737791 None:intergenic 40.0%
GCGCTAAACCTAGATTGAAA+AGG + Chr1:18736490-18736509 MsG0180001281.01.T01:intron 40.0%
GGCGACAAACTTGTGAAAAT+AGG + Chr1:18736525-18736544 MsG0180001281.01.T01:intron 40.0%
GTGCCTTTAGGTATGATTCA+TGG + Chr1:18736344-18736363 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCAATTTATCCCATCCA+AGG - Chr1:18737898-18737917 None:intergenic 40.0%
GTTTCACCCGAAAGAATAAG+GGG - Chr1:18737187-18737206 None:intergenic 40.0%
GTTTCTCCCCTTATTCTTTC+GGG + Chr1:18737178-18737197 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGGAACATTAGGCTACA+TGG + Chr1:18738102-18738121 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TACAAATGCTTCAAGGAGAG+GGG + Chr1:18738419-18738438 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TATTGTTGGAGATGGTTGGA+GGG + Chr1:18738194-18738213 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TCGGAAACAAATCTCGACAA+AGG + Chr1:18737247-18737266 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCACGGCTACTAGAATT+TGG - Chr1:18737682-18737701 None:intergenic 40.0%
TTAACAATGCAGAGGGAGAT+GGG + Chr1:18737705-18737724 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TTATTGTTGGAGATGGTTGG+AGG + Chr1:18738193-18738212 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGGAGTTAACAATGCA+TGG - Chr1:18736821-18736840 None:intergenic 40.0%
TTGTTGAGACAACTTGGTAC+AGG - Chr1:18737158-18737177 None:intergenic 40.0%
! AAAGTGCCTACTAATCCGTT+CGG + Chr1:18738451-18738470 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
! ACGTATGAATTTAGAGCTGG+AGG + Chr1:18738516-18738535 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
! AGAGTTTTCTCAATTTCCGG+TGG - Chr1:18736561-18736580 None:intergenic 40.0%
! GAGATGGTGAATTTTTCCCA+TGG - Chr1:18737756-18737775 None:intergenic 40.0%
! TACAAGTTGAGTATCCAGAC+TGG + Chr1:18738254-18738273 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
! TTTCGGGTGAAACTGTATCT+GGG + Chr1:18737194-18737213 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
!! GCTCATGGTGCTGTTTATAA+AGG + Chr1:18737644-18737663 MsG0180001281.01.T01:CDS 40.0%
!!! CCCACAGTTGCCAATTTTTT+TGG - Chr1:18738346-18738365 None:intergenic 40.0%
AAGATAGGTGAAGGAGCTCA+TGG + Chr1:18737629-18737648 MsG0180001281.01.T01:intron 45.0%
AATTGGCAACTGTGGGACTT+TGG + Chr1:18738350-18738369 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
ACAAATGCTTCAAGGAGAGG+GGG + Chr1:18738420-18738439 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
CATCAAGAGAGGAGATCCTT+AGG + Chr1:18736435-18736454 MsG0180001281.01.T01:intron 45.0%
CTACTATGGAGATTTGCAGC+AGG + Chr1:18737066-18737085 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
CTTAACAATGCAGAGGGAGA+TGG + Chr1:18737704-18737723 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTAGTTGTTGGTCCGAA+CGG - Chr1:18738469-18738488 None:intergenic 45.0%
TCATTGCCGGACGATGTAAA+GGG - Chr1:18738390-18738409 None:intergenic 45.0%
TGAATGTATCTCACCTGCAG+AGG - Chr1:18737314-18737333 None:intergenic 45.0%
TTATTCAGTGGGATCCACGA+GGG - Chr1:18736858-18736877 None:intergenic 45.0%
TTCATGGGATGGGAAAGACA+TGG + Chr1:18736360-18736379 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
TTCATTGCCGGACGATGTAA+AGG - Chr1:18738391-18738410 None:intergenic 45.0%
TTTATTCAGTGGGATCCACG+AGG - Chr1:18736859-18736878 None:intergenic 45.0%
! AAAGGGTATAGGCTACTCGT+TGG + Chr1:18736322-18736341 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
! ATGGGTTGTTGTCGCTTGTT+TGG + Chr1:18736226-18736245 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGACGTAGTCAGAAGCGT+AGG + Chr1:18736460-18736479 MsG0180001281.01.T01:intron 45.0%
! CTTTCGGGTGAAACTGTATC+TGG + Chr1:18737193-18737212 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
! GGCATTGAGTATCTACACCA+AGG + Chr1:18737941-18737960 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
! TGGGACTTTGGTGTATCCAA+TGG + Chr1:18738362-18738381 MsG0180001281.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCGGCTAAGGGAACATT+AGG + Chr1:18738094-18738113 MsG0180001281.01.T01:CDS 50.0%
ATGGCACCCTTTACATCGTC+CGG + Chr1:18738381-18738400 MsG0180001281.01.T01:CDS 50.0%
GAGGGTGGTCTCTTGTTCAT+TGG - Chr1:18736840-18736859 None:intergenic 50.0%
GGTGGTCTCTTGTTCATTGG+AGG - Chr1:18736837-18736856 None:intergenic 50.0%
GTATCCATGACTGCGGCTAA+GGG + Chr1:18738085-18738104 MsG0180001281.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGGAGACTGATGTAGGA+GGG - Chr1:18736753-18736772 None:intergenic 50.0%
TGTATCCATGACTGCGGCTA+AGG + Chr1:18738084-18738103 MsG0180001281.01.T01:CDS 50.0%
! GGCAGCTTTTGACGACGATA+TGG + Chr1:18737114-18737133 MsG0180001281.01.T01:CDS 50.0%
!! GACGATGTAAAGGGTGCCAT+TGG - Chr1:18738381-18738400 None:intergenic 50.0%
!! GTTGGTCCGAACGGATTAGT+AGG - Chr1:18738460-18738479 None:intergenic 50.0%
ACTCGGGTCGAGTTCTTCAG+TGG - Chr1:18736776-18736795 None:intergenic 55.0%
CAATGCAGAGGGAGATGGGA+AGG + Chr1:18737709-18737728 MsG0180001281.01.T01:CDS 55.0%
GTCGAGTTCTTCAGTGGTGG+AGG - Chr1:18736770-18736789 None:intergenic 55.0%
GTGGAGGAGACTGATGTAGG+AGG - Chr1:18736754-18736773 None:intergenic 55.0%
TGAACAAGAGACCACCCTCG+TGG + Chr1:18736841-18736860 MsG0180001281.01.T01:intron 55.0%
TGTTCCCTTAGCCGCAGTCA+TGG - Chr1:18738092-18738111 None:intergenic 55.0%
TTGCTTGGCTTCTGCGCAGA+TGG + Chr1:18737788-18737807 MsG0180001281.01.T01:CDS 55.0%
! GGCTACTCGTTGGTGCCTTT+AGG + Chr1:18736332-18736351 MsG0180001281.01.T01:CDS 55.0%
! GTGGTGGAGGAGACTGATGT+AGG - Chr1:18736757-18736776 None:intergenic 55.0%
CGGGTCGAGTTCTTCAGTGG+TGG - Chr1:18736773-18736792 None:intergenic 60.0%
TTCAGTGGGATCCACGAGGG+TGG - Chr1:18736855-18736874 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 18736226 18738558 18736226 ID=MsG0180001281.01;Name=MsG0180001281.01
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Chr1 exon 18736226 18736381 18736226 ID=MsG0180001281.01.T01:exon:32541;Parent=MsG0180001281.01.T01
Chr1 exon 18736935 18737319 18736935 ID=MsG0180001281.01.T01:exon:32542;Parent=MsG0180001281.01.T01
Chr1 exon 18737636 18738558 18737636 ID=MsG0180001281.01.T01:exon:32543;Parent=MsG0180001281.01.T01
Chr1 CDS 18736226 18736381 18736226 ID=MsG0180001281.01.T01:cds;Parent=MsG0180001281.01.T01
Chr1 CDS 18736935 18737319 18736935 ID=MsG0180001281.01.T01:cds;Parent=MsG0180001281.01.T01
Chr1 CDS 18737636 18738558 18737636 ID=MsG0180001281.01.T01:cds;Parent=MsG0180001281.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001281.01.T01

ATGGGTTGTTGTCGCTTGTTTGGAACTCTATTTAAGCCTTTTCTCAATCATTTCTTGGTGAATCTTGTGGTACCAAAAGACGACACTCTAATTAGAAAAGGGTATAGGCTACTCGTTGGTGCCTTTAGGTATGATTCATGGGATGGGAAAGACATGTCCAATTTCTCTTCTTCAATTTTTCCATTCCGGATTATTGATGGTTCTGAGTTGCAACCGCAATTAGATGAATTTACCAACATTAGTTTCTTTGATTGTTCTTCACTAGGACAACGCTATCTAAAAAAGGACTACTATGGAGATTTGCAGCAGGAAATGATTTCTTGTCCAATTTATATGGCAGCTTTTGACGACGATATGGTTGAATTGAACCTTGTATCCTGTACCAAGTTGTCTCAACAAGTTTCTCCCCTTATTCTTTCGGGTGAAACTGTATCTGGGATAGAACAAAACTTAATCTTATTATCATGGTCGGAAACAAATCTCGACAAAGGATGCTTTAAATGCAAGAACAAATCAAAGAAGATTATTTTATCCTCTGCAGGTGAAGGAGCTCATGGTGCTGTTTATAAAGGTAAATTATCGAACCAAATTCTAGTAGCCGTGAAGATTCTTAACAATGCAGAGGGAGATGGGAAGGAATTCATAAATGAAGTGGGAACCATGGGAAAAATTCACCATCTCAATGTTGTTCGTTTGCTTGGCTTCTGCGCAGATGGTTTTCGTCGTGCTTTAGTATATGAACTTTTTCCAAATGGTTCGTTGCAGAAATTCATATCTGCCCCAAACAACAAAGATGATTTCCTTGGATGGGATAAATTGCAACAAATTTCACTAGGCATAGCAAATGGCATTGAGTATCTACACCAAGGTTGTGATCAAAGAATTCTACACTTTGACATCAACCCTCATAATGTCTTGCTAGATGACAATTTCACTCCCAAAATCACAGATTTTGGATTGGCTAAGATGTGTTCGAAAAATCAAAGTATTGTATCCATGACTGCGGCTAAGGGAACATTAGGCTACATGGCACCTGAAGTTTTTTCTAGAAATTTTGGAAATGTCTCGTATAAGTCTGATATATACAGTTACGATATGTTATTGTTGGAGATGGTTGGAGGGAGAAAGAATACAAAAACAACCGGTGGTGAAGAAAACATACAAGTTGAGTATCCAGACTGGATACACAATTTGCTTGAAGGAGATATACAAATCCCTATTGATCATGAAGATGGAGATTTTAGAATTCCAAAAAAATTGGCAACTGTGGGACTTTGGTGTATCCAATGGCACCCTTTACATCGTCCGGCAATGAAATCTGTGATACAAATGCTTCAAGGAGAGGGGGACAAGTTAAAAGTGCCTACTAATCCGTTCGGACCAACAACTACAACCAATACAAATGCTAATATTGTTGCAGAACGTATGAATTTAGAGCTGGAGGTGATTGAAGAATTAGAATAG
Protein sequence

>MsG0180001281.01.T01

MGCCRLFGTLFKPFLNHFLVNLVVPKDDTLIRKGYRLLVGAFRYDSWDGKDMSNFSSSIFPFRIIDGSELQPQLDEFTNISFFDCSSLGQRYLKKDYYGDLQQEMISCPIYMAAFDDDMVELNLVSCTKLSQQVSPLILSGETVSGIEQNLILLSWSETNLDKGCFKCKNKSKKIILSSAGEGAHGAVYKGKLSNQILVAVKILNNAEGDGKEFINEVGTMGKIHHLNVVRLLGFCADGFRRALVYELFPNGSLQKFISAPNNKDDFLGWDKLQQISLGIANGIEYLHQGCDQRILHFDINPHNVLLDDNFTPKITDFGLAKMCSKNQSIVSMTAAKGTLGYMAPEVFSRNFGNVSYKSDIYSYDMLLLEMVGGRKNTKTTGGEENIQVEYPDWIHNLLEGDIQIPIDHEDGDFRIPKKLATVGLWCIQWHPLHRPAMKSVIQMLQGEGDKLKVPTNPFGPTTTTNTNANIVAERMNLELEVIEELE*