AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180002988.01

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MsG0180002988.01.T01 AT3G45430 39.465 299 144 5 268 539 331 619 7.42e-59 208
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MsG0180002988.01.T01 AT4G04510 33.333 345 185 7 229 542 286 616 1.03e-50 185
MsG0180002988.01.T01 AT1G61420 31.204 407 220 12 182 549 245 630 1.10e-50 185
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MsG0180002988.01.T01 AT4G23320 33.846 325 177 5 254 550 158 472 4.60e-50 181
MsG0180002988.01.T01 AT4G11460 33.438 317 175 4 268 556 333 641 5.57e-50 184
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MsG0180002988.01.T01 AT1G51805 33.618 351 184 8 219 533 510 847 6.86e-50 185
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MsG0180002988.01.T01 AT4G03230 33.758 314 172 4 269 554 578 883 7.77e-50 185
MsG0180002988.01.T01 AT4G11460 33.438 317 178 4 268 556 333 644 8.20e-50 183
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MsG0180002988.01.T01 AT4G03230 33.758 314 172 4 269 554 678 983 1.03e-49 185
MsG0180002988.01.T01 AT1G07650 35.463 313 163 6 255 537 439 742 1.08e-49 184
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MsG0180002988.01.T01 AT4G23310 31.212 330 191 4 249 550 476 797 3.09e-49 183
MsG0180002988.01.T01 AT1G07650 33.724 341 183 7 227 537 634 961 3.40e-49 184
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MsG0180002988.01.T01 AT3G16030 34.628 309 166 4 269 548 536 837 1.23e-48 181
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MsG0180002988.01.T01 AT5G24080 36.893 309 151 9 265 540 516 813 2.29e-48 181
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MsG0180002988.01.T01 AT1G67520 34.727 311 163 5 269 548 276 577 3.16e-48 177
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MsG0180002988.01.T01 AT4G23190 30.595 353 199 7 227 548 224 561 3.67e-48 177
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MsG0180002988.01.T01 AT1G67520 34.727 311 163 5 269 548 484 785 1.28e-47 178
MsG0180002988.01.T01 AT1G67520 34.727 311 163 5 269 548 491 792 1.44e-47 178
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MsG0180002988.01.T01 AT1G11410 33.795 361 182 8 249 564 467 815 2.60e-47 177
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61490 30.534 393 227 9 187 549 400 776 3.65e-47 177
MsG0180002988.01.T01 AT1G61490 30.534 393 227 9 187 549 400 776 3.65e-47 177
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61490 30.534 393 227 9 187 549 374 750 4.07e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT4G04500 33.141 347 187 8 231 546 301 633 4.44e-47 175
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 29.188 394 235 7 184 549 375 752 6.13e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 29.188 394 235 7 184 549 375 752 6.13e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 29.188 394 235 7 184 549 375 752 6.13e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT1G61500 28.708 418 240 9 182 563 396 791 6.55e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT1G61500 28.708 418 240 9 182 563 401 796 6.62e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT2G29220 34.884 301 168 8 256 539 329 618 7.03e-47 174
MsG0180002988.01.T01 AT1G61500 28.708 418 240 9 182 563 378 773 8.27e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT4G01330 32.993 294 163 4 269 535 150 436 9.05e-47 171
MsG0180002988.01.T01 AT1G61400 29.219 397 239 8 184 549 409 794 9.22e-47 176
MsG0180002988.01.T01 AT4G01330 32.993 294 163 4 269 535 150 436 9.51e-47 171
MsG0180002988.01.T01 AT3G14840 32.628 331 180 6 235 537 633 948 1.20e-46 176
MsG0180002988.01.T01 AT2G04300 33.531 337 169 8 231 533 496 811 1.23e-46 176
MsG0180002988.01.T01 AT2G04300 33.531 337 169 8 231 533 537 852 2.15e-46 175
MsG0180002988.01.T01 AT1G51820 33.721 344 177 9 227 533 257 586 2.61e-46 172
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MsG0180002988.01.T01 AT2G29250 36.770 291 155 7 267 539 338 617 3.11e-46 172
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61370 34.932 292 154 6 269 532 489 772 1.79e-45 172
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MsG0180002988.01.T01 AT2G28960 35.739 291 145 6 267 528 561 838 5.13e-45 171
MsG0180002988.01.T01 AT1G29730 34.915 295 155 4 269 535 661 946 6.50e-45 171
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61390 33.562 292 156 4 269 532 508 789 3.14e-44 168
MsG0180002988.01.T01 AT1G29740 35.052 291 154 3 269 532 665 947 3.17e-44 169
MsG0180002988.01.T01 AT1G61380 30.203 394 226 9 184 549 402 774 3.44e-44 168
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MsG0180002988.01.T01 AT1G61360 35.048 311 162 7 269 549 486 786 5.36e-44 167
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MsG0180002988.01.T01 AT1G11280 33.555 301 162 7 269 539 491 783 9.23e-44 167
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MsG0180002988.01.T01 AT4G04570 39.367 221 99 3 268 460 171 384 1.61e-42 157
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MsG0180002988.01.T01 AT5G02290 31.661 319 170 8 253 532 41 350 2.44e-42 156
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MsG0180002988.01.T01 AT2G28990 34.448 299 152 8 262 529 558 843 1.10e-41 161
MsG0180002988.01.T01 AT4G23190 33.579 271 139 4 227 469 302 559 1.13e-41 159
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MsG0180002988.01.T01 AT1G51880 33.033 333 164 9 233 533 530 835 2.37e-41 160
MsG0180002988.01.T01 AT1G60800 31.437 334 186 9 234 536 257 578 2.40e-41 158
MsG0180002988.01.T01 AT3G07070 31.003 329 192 4 256 555 54 376 2.63e-41 154
MsG0180002988.01.T01 AT1G51880 33.033 333 164 9 233 533 556 861 2.73e-41 160
MsG0180002988.01.T01 AT3G13380 31.879 298 162 7 267 532 844 1132 2.76e-41 160
MsG0180002988.01.T01 AT1G11330 30.925 346 174 8 165 469 412 733 2.79e-41 159
MsG0180002988.01.T01 AT4G04540 39.367 221 99 3 268 460 340 553 2.98e-41 157
MsG0180002988.01.T01 AT5G60310 39.583 240 108 6 268 480 330 559 3.00e-41 158
MsG0180002988.01.T01 AT1G07870 31.210 314 177 6 260 542 82 387 3.13e-41 154
MsG0180002988.01.T01 AT3G59730 41.277 235 96 6 232 439 298 517 3.18e-41 156
MsG0180002988.01.T01 AT2G23950 31.351 370 204 10 199 536 221 572 3.36e-41 158
MsG0180002988.01.T01 AT1G11340 39.091 220 99 3 269 460 571 783 3.40e-41 159
MsG0180002988.01.T01 AT2G28930 33.438 317 165 7 251 529 40 348 3.52e-41 154
MsG0180002988.01.T01 AT2G28930 33.438 317 165 7 251 529 43 351 3.62e-41 154
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MsG0180002988.01.T01 AT1G55610 32.990 291 155 7 267 525 845 1127 3.78e-41 160
MsG0180002988.01.T01 AT5G38280 33.117 308 163 7 267 542 319 615 3.78e-41 158
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MsG0180002988.01.T01 AT5G38280 33.117 308 163 7 267 542 319 615 4.80e-41 158
MsG0180002988.01.T01 AT3G46420 34.173 278 143 5 284 532 534 800 4.90e-41 159
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MsG0180002988.01.T01 AT2G28930 33.438 317 165 7 251 529 51 359 6.31e-41 153
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MsG0180002988.01.T01 AT1G07570 33.016 315 165 7 253 529 41 347 1.21e-40 152
MsG0180002988.01.T01 AT1G52540 33.981 309 166 7 269 548 25 324 1.28e-40 150
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MsG0180002988.01.T01 AT4G35600 33.548 310 146 7 267 532 73 366 2.56e-40 152
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MsG0180002988.01.T01 AT2G18470 31.788 302 161 7 269 537 272 561 3.23e-40 155
MsG0180002988.01.T01 AT1G70530 35.032 314 158 9 269 549 311 611 3.60e-40 155
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MsG0180002988.01.T01 AT5G35370 30.061 326 168 9 266 546 502 812 6.50e-40 155
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MsG0180002988.01.T01 AT4G02010 29.345 351 196 8 227 532 312 655 8.00e-40 155
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MsG0180002988.01.T01 AT1G71830 30.422 332 191 8 235 536 259 580 1.21e-39 153
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MsG0180002988.01.T01 AT5G16900 33.000 300 159 6 263 532 555 842 1.88e-39 154
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MsG0180002988.01.T01 AT1G56720 31.650 297 169 5 269 538 167 456 2.17e-39 150
MsG0180002988.01.T01 AT1G56720 31.650 297 169 5 269 538 167 456 2.17e-39 150
MsG0180002988.01.T01 AT4G29990 32.781 302 150 7 265 532 560 842 2.28e-39 154
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MsG0180002988.01.T01 AT1G67720 31.959 291 157 6 271 532 598 876 2.83e-39 154
MsG0180002988.01.T01 AT1G70460 33.775 302 154 9 269 536 341 630 2.99e-39 153
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MsG0180002988.01.T01 AT5G18610 31.561 301 169 5 262 532 64 357 4.24e-39 150
MsG0180002988.01.T01 AT5G18610 31.561 301 169 5 262 532 64 357 4.24e-39 150
MsG0180002988.01.T01 AT3G25560 34.219 301 154 8 267 536 299 586 4.42e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT3G25560 34.219 301 154 8 267 536 298 585 4.68e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT2G13790 32.000 300 167 6 267 536 280 572 5.11e-39 151
MsG0180002988.01.T01 AT3G25560 34.219 301 154 8 267 536 298 585 5.23e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT4G00340 32.698 315 164 7 256 534 438 740 5.31e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT2G07180 33.333 297 152 7 272 532 81 367 5.32e-39 148
MsG0180002988.01.T01 AT2G07180 33.333 297 152 7 272 532 81 367 5.32e-39 148
MsG0180002988.01.T01 AT1G26150 35.714 238 117 6 269 479 418 646 5.63e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT2G02220 31.864 295 165 5 267 533 720 1006 6.21e-39 153
MsG0180002988.01.T01 AT5G38560 30.769 299 163 6 269 533 327 615 6.48e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT1G78530 29.042 334 193 8 231 532 23 344 6.63e-39 146
MsG0180002988.01.T01 AT4G23210 37.652 247 116 6 243 460 321 558 6.70e-39 151
MsG0180002988.01.T01 AT4G33430 32.333 300 166 6 267 536 322 614 6.97e-39 151
MsG0180002988.01.T01 AT4G00340 32.698 315 164 7 256 534 459 761 7.01e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT5G16000 32.558 301 161 7 267 536 298 587 7.25e-39 151
MsG0180002988.01.T01 AT4G20450 33.893 298 153 7 262 528 572 856 8.17e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT5G65240 31.761 318 176 8 250 536 255 562 9.29e-39 150
MsG0180002988.01.T01 AT5G65240 31.761 318 176 8 250 536 255 562 9.44e-39 151
MsG0180002988.01.T01 AT2G20300 32.107 299 161 6 263 532 331 616 9.69e-39 152
MsG0180002988.01.T01 AT5G01950 33.876 307 153 7 267 538 527 818 1.17e-38 152
MsG0180002988.01.T01 AT1G74490 32.198 323 174 6 253 545 64 371 1.23e-38 146
MsG0180002988.01.T01 AT1G66150 32.710 321 173 9 250 533 552 866 1.38e-38 152
MsG0180002988.01.T01 AT2G17220 32.808 317 162 7 269 545 74 379 1.38e-38 147
MsG0180002988.01.T01 AT1G72540 31.773 299 160 6 269 532 72 361 1.43e-38 147
MsG0180002988.01.T01 AT2G17220 32.808 317 162 7 269 545 75 380 1.60e-38 146
MsG0180002988.01.T01 AT1G72300 32.759 290 161 5 267 529 789 1071 1.63e-38 152
MsG0180002988.01.T01 AT1G52290 32.787 305 139 9 227 481 74 362 1.92e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT1G20650 31.757 296 164 6 267 532 64 351 1.94e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT1G49100 32.110 327 178 7 235 532 539 850 1.95e-38 151
MsG0180002988.01.T01 AT5G01950 33.876 307 153 7 267 538 612 903 2.10e-38 151
MsG0180002988.01.T01 AT5G01950 33.876 307 153 7 267 538 612 903 2.10e-38 151
MsG0180002988.01.T01 AT5G01950 33.876 307 153 7 267 538 612 903 2.10e-38 151
MsG0180002988.01.T01 AT5G01950 33.876 307 153 7 267 538 612 903 2.10e-38 151
MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 30.218 321 183 5 184 476 375 682 2.32e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 30.218 321 183 5 184 476 398 705 3.12e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT1G61430 30.218 321 183 5 184 476 398 705 3.12e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT2G14440 29.049 389 219 10 176 533 471 833 3.39e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT4G32000 32.237 304 168 5 267 544 116 407 3.56e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT4G32000 32.237 304 168 5 267 544 115 406 3.60e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT3G09830 31.692 325 163 9 267 543 70 383 3.63e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT3G09830 31.692 325 163 9 267 543 70 383 3.63e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT3G09830 31.692 325 163 9 267 543 70 383 3.63e-38 145
MsG0180002988.01.T01 AT5G15080 31.348 319 169 7 253 532 115 422 3.86e-38 147
MsG0180002988.01.T01 AT3G53590 30.982 326 177 6 242 534 582 892 3.96e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT3G17420 30.333 300 173 5 269 540 142 433 4.56e-38 146
MsG0180002988.01.T01 AT1G16130 31.707 287 161 4 273 532 408 686 4.74e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT4G13190 32.258 248 134 3 263 482 53 294 4.82e-38 142
MsG0180002988.01.T01 AT1G06840 31.269 323 160 7 267 556 611 904 5.18e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT4G34440 32.119 302 160 8 269 537 300 589 5.94e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT4G34440 32.119 302 160 8 269 537 300 589 5.94e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT2G19230 32.542 295 157 7 267 532 558 839 6.64e-38 150
MsG0180002988.01.T01 AT2G39660 32.797 311 160 7 262 532 48 349 6.83e-38 144
MsG0180002988.01.T01 AT2G18470 35.833 240 113 6 269 479 272 499 7.01e-38 147
MsG0180002988.01.T01 AT2G11520 30.201 298 167 6 262 528 206 493 7.31e-38 146
MsG0180002988.01.T01 AT2G19230 32.542 295 157 7 267 532 557 838 7.32e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT1G01540 33.333 249 127 4 267 482 140 382 7.58e-38 144
MsG0180002988.01.T01 AT3G55450 31.464 321 173 8 251 532 32 344 7.65e-38 144
MsG0180002988.01.T01 AT5G38260 30.295 373 202 12 227 562 277 628 7.77e-38 148
MsG0180002988.01.T01 AT1G55200 32.215 298 165 6 266 535 364 652 8.12e-38 148
MsG0180002988.01.T01 AT1G55200 32.215 298 165 6 266 535 364 652 8.12e-38 148
MsG0180002988.01.T01 AT1G55200 32.215 298 165 6 266 535 364 652 8.12e-38 148
MsG0180002988.01.T01 AT1G55200 32.215 298 165 6 266 535 364 652 8.12e-38 148
MsG0180002988.01.T01 AT3G13690 32.333 300 162 8 266 535 396 684 8.71e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT3G13690 32.333 300 162 8 266 535 396 684 8.71e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT3G13690 32.333 300 162 8 266 535 396 684 8.71e-38 149
MsG0180002988.01.T01 AT3G02810 30.892 314 174 6 267 543 50 357 9.72e-38 147
MsG0180002988.01.T01 AT4G32000 32.237 304 168 5 267 544 158 449 1.13e-37 145
MsG0180002988.01.T01 AT2G35620 29.867 375 210 10 198 539 224 578 1.13e-37 147
MsG0180002988.01.T01 AT2G35620 29.867 375 210 10 198 539 224 578 1.13e-37 147
MsG0180002988.01.T01 AT2G35620 29.867 375 210 10 198 539 224 578 1.13e-37 147
MsG0180002988.01.T01 AT2G35620 29.867 375 210 10 198 539 224 578 1.13e-37 147
MsG0180002988.01.T01 AT3G19300 33.229 319 163 10 253 538 299 600 1.17e-37 148
MsG0180002988.01.T01 AT5G18500 30.872 298 170 5 269 538 154 443 1.23e-37 145

Find 109 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 144 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACAACAAGCCATTCACAATT+TGG 0.195730 1:+54420572 MsG0180002988.01.T01:CDS
CACGAAGATCTGGGGTAATT+TGG 0.201800 1:-54420510 None:intergenic
TGGATTTGGAACTGTTTATA+AGG 0.229579 1:+54421351 MsG0180002988.01.T01:CDS
TCTTGTGCATACATATTTCT+TGG 0.253973 1:-54421950 None:intergenic
TATTGGGTTTGGGAGCTTTA+TGG 0.261225 1:+54421995 MsG0180002988.01.T01:CDS
ATCAATATAAACAATATCTT+TGG 0.268726 1:+54420808 MsG0180002988.01.T01:CDS
TAAATATAGTATTGTGTATT+GGG 0.271008 1:+54421979 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTCACTCGATTGGTTAAAT+AGG 0.275733 1:-54421579 None:intergenic
AAGCTTGGTGAAGGTGGATT+TGG 0.279271 1:+54421337 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTGAAATTGTGCTTATTCT+TGG 0.286317 1:+54422079 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGTTTCAACCGTCGCTCTTC+TGG 0.291359 1:-54421876 None:intergenic
TGCATTTGGTGTACTTGTTT+TGG 0.298677 1:+54421907 MsG0180002988.01.T01:CDS
TCCTTTAGTCGATATTTCTT+TGG 0.301901 1:-54421277 None:intergenic
ACTGTTCTGATGGTTCTTAA+TGG 0.321539 1:+54422148 MsG0180002988.01.T01:CDS
ATTATTCGACAGTACTTGAT+TGG 0.324470 1:+54421611 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGCAGGAACACCGGGCTATA+TGG 0.330917 1:+54421835 MsG0180002988.01.T01:CDS
TAGTATTGTGTATTGGGTTT+GGG 0.335778 1:+54421985 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGATTCTATGGAGACCCTTT+TGG 0.344997 1:+54420954 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTGGTCTTTCATGTGGATT+TGG 0.350320 1:-54422118 None:intergenic
ATAGTATTGTGTATTGGGTT+TGG 0.358857 1:+54421984 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTTCATCACCACGAAGATC+TGG 0.362382 1:-54420520 None:intergenic
TCTCCACCAGGGGAAGTTAC+AGG 0.369498 1:-54420649 None:intergenic
ATAAATATAGTATTGTGTAT+TGG 0.376632 1:+54421978 MsG0180002988.01.T01:CDS
TAGTTAGTGCAGTTGATGAT+AGG 0.381952 1:+54422029 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGTATCTGAAGTTAAGATAA+AGG 0.388505 1:-54420680 None:intergenic
GGATTTGGAACTGTTTATAA+GGG 0.405686 1:+54421352 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTGTGTTATCACTTTCGTC+AGG 0.410180 1:-54420709 None:intergenic
ACTAAGGTCAATCTTTCATC+TGG 0.410564 1:+54420856 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGGTTTGAAACAAGCATCAT+TGG 0.412329 1:+54420828 MsG0180002988.01.T01:CDS
ATAGCCGAAGTTACAACAAT+TGG 0.414111 1:+54421451 MsG0180002988.01.T01:CDS
ATCATAGCCGTTACCAAAGT+TGG 0.414388 1:+54420394 MsG0180002988.01.T01:CDS
TATCACTTTGTTGAAAGGTT+GGG 0.416631 1:-54420435 None:intergenic
TTGAAATTGTGCTTATTCTT+GGG 0.432737 1:+54422080 MsG0180002988.01.T01:CDS
GAAACAGATGTGTATGCATT+TGG 0.442549 1:+54421893 MsG0180002988.01.T01:CDS
ACTGTTTATAAGGGAATCCT+TGG 0.443073 1:+54421361 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTTTACGAGTTCATGCCTAA+TGG 0.447950 1:+54421541 MsG0180002988.01.T01:CDS
TTGATTCCAACAAGATTGTC+AGG 0.451253 1:-54420790 None:intergenic
CATTCAACAAAGGAAATTGC+AGG 0.453655 1:+54421818 MsG0180002988.01.T01:CDS
GATGGTCCTGACAATCTTGT+TGG 0.456830 1:+54420784 MsG0180002988.01.T01:CDS
TTATCACTTTGTTGAAAGGT+TGG 0.458781 1:-54420436 None:intergenic
TTGAGAGAGGAAGGCATAGC+AGG 0.462839 1:-54422220 None:intergenic
TGAGTGCTGATGATTGATAT+TGG 0.463904 1:-54420363 None:intergenic
TGAATTTGATCCTCTATCCT+TGG 0.464405 1:-54421238 None:intergenic
TGAAGAGGATGAAATTGAAA+AGG 0.466556 1:+54422057 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGATAAGAAGAGAGACTAAG+AGG 0.466967 1:-54420985 None:intergenic
TTCATTGTTGGTCTTTCATG+TGG 0.475632 1:-54422124 None:intergenic
GTGATTCGAGTTCACTCGAT+TGG 0.475986 1:-54421588 None:intergenic
AAGGAATTGATGAAAGCAAC+AGG 0.480444 1:+54421295 MsG0180002988.01.T01:CDS
CAGTACTTGATTGGAAAACT+AGG 0.482637 1:+54421620 MsG0180002988.01.T01:CDS
AATGGTTCCGATTGAAAGAC+CGG 0.484048 1:+54422186 MsG0180002988.01.T01:CDS
GGTCTTTCAATCGGAACCAT+TGG 0.491064 1:-54422184 None:intergenic
GCTTCCAATTGTTGTAACTT+CGG 0.500892 1:-54421455 None:intergenic
TCGTGACGTGGCTCAAGCAT+TGG 0.503384 1:+54421654 MsG0180002988.01.T01:CDS
GTAACTTCCCCTGGTGGAGA+AGG 0.503918 1:+54420652 MsG0180002988.01.T01:CDS
ACAAAAGCCGGTCTTTCAAT+CGG 0.506992 1:-54422193 None:intergenic
CAAAACAAGCTTGGTGAAGG+TGG 0.508170 1:+54421331 MsG0180002988.01.T01:CDS
TAAGAGGTGGAGATACCAAA+AGG 0.509300 1:-54420969 None:intergenic
TTTCATCACCACGAAGATCT+GGG 0.511690 1:-54420519 None:intergenic
AACAATGAAAACTGTTCTGA+TGG 0.512551 1:+54422138 MsG0180002988.01.T01:CDS
TTTGATAATCATAGGTGTGT+TGG 0.512584 1:+54421156 MsG0180002988.01.T01:intron
ACCAAAGAAATATCGACTAA+AGG 0.512692 1:+54421276 MsG0180002988.01.T01:CDS
CTCTTCTTATCTTAAACAAG+AGG 0.515043 1:+54420996 MsG0180002988.01.T01:CDS
CTTTCAATCGGAACCATTGG+AGG 0.519285 1:-54422181 None:intergenic
GTTTGGGAGCTTTATGGAGA+GGG 0.528076 1:+54422001 MsG0180002988.01.T01:CDS
AAGGCTATGCCTTCTCCACC+AGG 0.529975 1:-54420661 None:intergenic
TGGAGAAGCTTCTCCTCCAA+TGG 0.530974 1:+54422168 MsG0180002988.01.T01:CDS
ACAAGTCCTGTAACTTCCCC+TGG 0.531429 1:+54420643 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGATTTATCACTTTGTTGAA+AGG 0.535382 1:-54420440 None:intergenic
TTCAGCCATCAAAACAAGCT+TGG 0.535928 1:+54421322 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGATACATATCCAAGGATAG+AGG 0.537234 1:+54421228 MsG0180002988.01.T01:CDS
CAAATTACCCCAGATCTTCG+TGG 0.537429 1:+54420511 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGTGATAACACAACAGCAGA+TGG 0.537951 1:+54420718 MsG0180002988.01.T01:CDS
CTTAAACAAGAGGTTTATGT+CGG 0.544778 1:+54421006 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGCATCATTGGAAAACACTA+AGG 0.545324 1:+54420840 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGATGATAGGATTAGTGAAG+AGG 0.547546 1:+54422042 MsG0180002988.01.T01:CDS
GAGAACAAAAGTGGTGTTGA+AGG 0.547676 1:-54420617 None:intergenic
CGACAAAGTTCCACGCAAGA+TGG 0.553400 1:+54420766 MsG0180002988.01.T01:CDS
TCTCTTTATTGATTTCTCCA+AGG 0.554157 1:-54421378 None:intergenic
TCAAATTCAGTACTCGTCAA+TGG 0.558122 1:+54421252 MsG0180002988.01.T01:CDS
AAAGGAAATTGCAGGAACAC+CGG 0.558303 1:+54421826 MsG0180002988.01.T01:CDS
AAGGAAATTGCAGGAACACC+GGG 0.560381 1:+54421827 MsG0180002988.01.T01:CDS
TATCTGTCTAAGCTTCCATT+AGG 0.565108 1:-54421556 None:intergenic
CTTGATTGGAAAACTAGGAA+TGG 0.568389 1:+54421625 MsG0180002988.01.T01:CDS
CATCAAAACAAGCTTGGTGA+AGG 0.570171 1:+54421328 MsG0180002988.01.T01:CDS
TAAGAAGAGAGACTAAGAGG+TGG 0.575252 1:-54420982 None:intergenic
GTCTCAAAGAATTCGCGTCA+AGG 0.581847 1:+54421415 MsG0180002988.01.T01:CDS
TTGTGTTATCACTTTCGTCA+GGG 0.582340 1:-54420708 None:intergenic
ATAGCAGGCCAAACAAAAGC+CGG 0.583293 1:-54422205 None:intergenic
AAGATCTGGGGTAATTTGGA+TGG 0.584846 1:-54420506 None:intergenic
ATTTCCGGTGCCATATAGCC+CGG 0.586818 1:-54421845 None:intergenic
GTATTTGCTTAGTAGCAAGT+TGG 0.598060 1:-54420464 None:intergenic
AAAACAGCCAACTTTGGTAA+CGG 0.602699 1:-54420401 None:intergenic
TCGTAAAGTGAAAAGAAGCA+TGG 0.606326 1:+54421195 MsG0180002988.01.T01:CDS
GGTTTGGGAGCTTTATGGAG+AGG 0.607727 1:+54422000 MsG0180002988.01.T01:CDS
AACACCGGGCTATATGGCAC+CGG 0.614034 1:+54421841 MsG0180002988.01.T01:CDS
GCATTGGATTATCTTCACAA+TGG 0.616813 1:+54421670 MsG0180002988.01.T01:CDS
AAGAGGTGGAGATACCAAAA+GGG 0.617347 1:-54420968 None:intergenic
GGCTATGCCTTCTCCACCAG+GGG 0.618206 1:-54420659 None:intergenic
TTCAAGAAGATACATATCCA+AGG 0.619242 1:+54421221 MsG0180002988.01.T01:CDS
TGAAACTCATCATTCAACAA+AGG 0.622799 1:+54421808 MsG0180002988.01.T01:CDS
ACTTGGTGAAGCTCATTGGT+TGG 0.623278 1:+54421491 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGCAGATGGAATTCTTGCAG+TGG 0.632479 1:+54420732 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGGCTATGCCTTCTCCACCA+GGG 0.640300 1:-54420660 None:intergenic
ATTGTCAGGACCATCTTGCG+TGG 0.650565 1:-54420776 None:intergenic
GAATGGTGTGATTCGTGACG+TGG 0.651335 1:+54421642 MsG0180002988.01.T01:CDS
TTCATCACCACGAAGATCTG+GGG 0.654727 1:-54420518 None:intergenic
ACTTGTGTTGAGAACAAAAG+TGG 0.665250 1:-54420626 None:intergenic
GAATTGATGAAAGCAACAGG+TGG 0.671311 1:+54421298 MsG0180002988.01.T01:CDS
AGTCCTGTAACTTCCCCTGG+TGG 0.685403 1:+54420646 MsG0180002988.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAACAGATATTATATCAT+TGG - Chr1:54420911-54420930 None:intergenic 15.0%
!! ATAAATATAGTATTGTGTAT+TGG + Chr1:54421978-54421997 MsG0180002988.01.T01:CDS 15.0%
!! ATCAATATAAACAATATCTT+TGG + Chr1:54420808-54420827 MsG0180002988.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAAAATTCAAATGATTCTA+TGG + Chr1:54420942-54420961 MsG0180002988.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAATATAGTATTGTGTATT+GGG + Chr1:54421979-54421998 MsG0180002988.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATGATATAATATCTGTTTT+TGG + Chr1:54420910-54420929 MsG0180002988.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTCCAATTTGATAATCAT+AGG + Chr1:54421148-54421167 MsG0180002988.01.T01:intron 20.0%
! TGATTTATCACTTTGTTGAA+AGG - Chr1:54420443-54420462 None:intergenic 25.0%
! TTGAAATTGTGCTTATTCTT+GGG + Chr1:54422080-54422099 MsG0180002988.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGATTACGTTGCAAAATT+GGG + Chr1:54421749-54421768 MsG0180002988.01.T01:intron 25.0%
!! CTTCTGGTTAAAAATATTTC+CGG - Chr1:54421863-54421882 None:intergenic 25.0%
!! TGTATCTGAAGTTAAGATAA+AGG - Chr1:54420683-54420702 None:intergenic 25.0%
!! TTTTTGTTCCAAATTGTGAA+TGG - Chr1:54420583-54420602 None:intergenic 25.0%
!!! AATTTCATTTTGTTTGAGAG+AGG - Chr1:54422236-54422255 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGATTACGTTGCAAAAT+TGG + Chr1:54421748-54421767 MsG0180002988.01.T01:intron 25.0%
AACAATGAAAACTGTTCTGA+TGG + Chr1:54422138-54422157 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
ATAGTATTGTGTATTGGGTT+TGG + Chr1:54421984-54422003 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
ATTATTCGACAGTACTTGAT+TGG + Chr1:54421611-54421630 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
CACAATGGTTGTGAAAAAAA+GGG + Chr1:54421685-54421704 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
CACACCTATGATTATCAAAT+TGG - Chr1:54421155-54421174 None:intergenic 30.0%
CTCTTCTTATCTTAAACAAG+AGG + Chr1:54420996-54421015 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
CTTAAACAAGAGGTTTATGT+CGG + Chr1:54421006-54421025 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
GAAATAAAAACAGCCAACTT+TGG - Chr1:54420410-54420429 None:intergenic 30.0%
GTAATAAGACTAATCTCTTG+TGG + Chr1:54421111-54421130 MsG0180002988.01.T01:intron 30.0%
GTTGAAATTGTGCTTATTCT+TGG + Chr1:54422079-54422098 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
TAGTATTGTGTATTGGGTTT+GGG + Chr1:54421985-54422004 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
TATCACTTTGTTGAAAGGTT+GGG - Chr1:54420438-54420457 None:intergenic 30.0%
TCACAATGGTTGTGAAAAAA+AGG + Chr1:54421684-54421703 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTTAGTCGATATTTCTT+TGG - Chr1:54421280-54421299 None:intergenic 30.0%
TCTTGTGCATACATATTTCT+TGG - Chr1:54421953-54421972 None:intergenic 30.0%
TGAAACTCATCATTCAACAA+AGG + Chr1:54421808-54421827 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
TGAAGAGGATGAAATTGAAA+AGG + Chr1:54422057-54422076 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
TTATCACTTTGTTGAAAGGT+TGG - Chr1:54420439-54420458 None:intergenic 30.0%
TTCAAGAAGATACATATCCA+AGG + Chr1:54421221-54421240 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
! AAAATTGGGTGATTTTGGAT+TGG + Chr1:54421763-54421782 MsG0180002988.01.T01:intron 30.0%
! ACCAAAGAAATATCGACTAA+AGG + Chr1:54421276-54421295 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAGAACAGTTTTCATTGT+TGG - Chr1:54422139-54422158 None:intergenic 30.0%
! GGATTTGGAACTGTTTATAA+GGG + Chr1:54421352-54421371 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
! TGGATTTGGAACTGTTTATA+AGG + Chr1:54421351-54421370 MsG0180002988.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGATAATCATAGGTGTGT+TGG + Chr1:54421156-54421175 MsG0180002988.01.T01:intron 30.0%
!! TCTCTTTATTGATTTCTCCA+AGG - Chr1:54421381-54421400 None:intergenic 30.0%
AAAACAGCCAACTTTGGTAA+CGG - Chr1:54420404-54420423 None:intergenic 35.0%
AAGGAATTGATGAAAGCAAC+AGG + Chr1:54421295-54421314 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ACAACAAGCCATTCACAATT+TGG + Chr1:54420572-54420591 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ACTAAGGTCAATCTTTCATC+TGG + Chr1:54420856-54420875 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ACTGTTCTGATGGTTCTTAA+TGG + Chr1:54422148-54422167 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ACTGTTTATAAGGGAATCCT+TGG + Chr1:54421361-54421380 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGTGTTGAGAACAAAAG+TGG - Chr1:54420629-54420648 None:intergenic 35.0%
AGATAAGAAGAGAGACTAAG+AGG - Chr1:54420988-54421007 None:intergenic 35.0%
AGATACATATCCAAGGATAG+AGG + Chr1:54421228-54421247 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
AGCATCATTGGAAAACACTA+AGG + Chr1:54420840-54420859 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
ATAGCCGAAGTTACAACAAT+TGG + Chr1:54421451-54421470 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
CAGTACTTGATTGGAAAACT+AGG + Chr1:54421620-54421639 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAACAAAGGAAATTGC+AGG + Chr1:54421818-54421837 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
CTAATCTCTTGTGGCTTATT+TGG + Chr1:54421120-54421139 MsG0180002988.01.T01:intron 35.0%
CTTGATTGGAAAACTAGGAA+TGG + Chr1:54421625-54421644 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
GAAACAGATGTGTATGCATT+TGG + Chr1:54421893-54421912 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
GCATTGGATTATCTTCACAA+TGG + Chr1:54421670-54421689 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCCAATTGTTGTAACTT+CGG - Chr1:54421458-54421477 None:intergenic 35.0%
GTATTTGCTTAGTAGCAAGT+TGG - Chr1:54420467-54420486 None:intergenic 35.0%
TAAAGCAAGCAACATAATGC+TGG + Chr1:54421724-54421743 MsG0180002988.01.T01:intron 35.0%
TATCTGTCTAAGCTTCCATT+AGG - Chr1:54421559-54421578 None:intergenic 35.0%
TCAAATTCAGTACTCGTCAA+TGG + Chr1:54421252-54421271 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
TCGTAAAGTGAAAAGAAGCA+TGG + Chr1:54421195-54421214 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
TGAATTTGATCCTCTATCCT+TGG - Chr1:54421241-54421260 None:intergenic 35.0%
TTGATTCCAACAAGATTGTC+AGG - Chr1:54420793-54420812 None:intergenic 35.0%
TTGTGTTATCACTTTCGTCA+GGG - Chr1:54420711-54420730 None:intergenic 35.0%
! AAAAACTTGGTGAAGCTCAT+TGG + Chr1:54421487-54421506 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTTTAACCAGAAGAGCGA+CGG + Chr1:54421868-54421887 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
! GTTCACTCGATTGGTTAAAT+AGG - Chr1:54421582-54421601 None:intergenic 35.0%
! GTTGCAAAATTGGGTGATTT+TGG + Chr1:54421758-54421777 MsG0180002988.01.T01:intron 35.0%
! TGATGATAGGATTAGTGAAG+AGG + Chr1:54422042-54422061 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTTTGAAACAAGCATCAT+TGG + Chr1:54420828-54420847 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGTGTGTTGGTATTTTTCT+TGG + Chr1:54421168-54421187 MsG0180002988.01.T01:intron 35.0%
!! TAGTTAGTGCAGTTGATGAT+AGG + Chr1:54422029-54422048 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
!! TCATTTTGTTTGAGAGAGGA+AGG - Chr1:54422232-54422251 None:intergenic 35.0%
!! TGAGTGCTGATGATTGATAT+TGG - Chr1:54420366-54420385 None:intergenic 35.0%
!! TTCATTGTTGGTCTTTCATG+TGG - Chr1:54422127-54422146 None:intergenic 35.0%
!!! CTTGTTTTGGAAATTGTGTG+TGG + Chr1:54421920-54421939 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGCATTTGGTGTACTTGTTT+TGG + Chr1:54421907-54421926 MsG0180002988.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGAAATTGCAGGAACAC+CGG + Chr1:54421826-54421845 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGGTGGAGATACCAAAA+GGG - Chr1:54420971-54420990 None:intergenic 40.0%
AAGCCTTCACCACAAAAACT+TGG + Chr1:54421474-54421493 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
AATGGTTCCGATTGAAAGAC+CGG + Chr1:54422186-54422205 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAAGCCGGTCTTTCAAT+CGG - Chr1:54422196-54422215 None:intergenic 40.0%
AGACAAACAGTGTAAGAGCA+TGG + Chr1:54421058-54421077 MsG0180002988.01.T01:intron 40.0%
AGTGATAACACAACAGCAGA+TGG + Chr1:54420718-54420737 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
ATCATAGCCGTTACCAAAGT+TGG + Chr1:54420394-54420413 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGATGAAAGCAACAGG+TGG + Chr1:54421298-54421317 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTGTTATCACTTTCGTC+AGG - Chr1:54420712-54420731 None:intergenic 40.0%
GTTTACGAGTTCATGCCTAA+TGG + Chr1:54421541-54421560 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
TAAGAAGAGAGACTAAGAGG+TGG - Chr1:54420985-54421004 None:intergenic 40.0%
TAAGAGGTGGAGATACCAAA+AGG - Chr1:54420972-54420991 None:intergenic 40.0%
TATTGGGTTTGGGAGCTTTA+TGG + Chr1:54421995-54422014 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
TCTTACACTGTTTGTCTCTG+TGG - Chr1:54421055-54421074 None:intergenic 40.0%
TTCAGCCATCAAAACAAGCT+TGG + Chr1:54421322-54421341 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
TTTCATCACCACGAAGATCT+GGG - Chr1:54420522-54420541 None:intergenic 40.0%
! AAGATCTGGGGTAATTTGGA+TGG - Chr1:54420509-54420528 None:intergenic 40.0%
! CATCAAAACAAGCTTGGTGA+AGG + Chr1:54421328-54421347 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
! GACAAACAGTGTAAGAGCAT+GGG + Chr1:54421059-54421078 MsG0180002988.01.T01:intron 40.0%
! GAGAACAAAAGTGGTGTTGA+AGG - Chr1:54420620-54420639 None:intergenic 40.0%
! GTAAGAGCATGGGAATTCAA+CGG + Chr1:54421069-54421088 MsG0180002988.01.T01:intron 40.0%
! TAAGAGCATGGGAATTCAAC+GGG + Chr1:54421070-54421089 MsG0180002988.01.T01:intron 40.0%
! TCACCAAGTTTTTGTGGTGA+AGG - Chr1:54421480-54421499 None:intergenic 40.0%
! TGAGCTTCACCAAGTTTTTG+TGG - Chr1:54421486-54421505 None:intergenic 40.0%
! TGATTCTATGGAGACCCTTT+TGG + Chr1:54420954-54420973 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGGTCTTTCATGTGGATT+TGG - Chr1:54422121-54422140 None:intergenic 40.0%
!! TTGAAAGACCGGCTTTTGTT+TGG + Chr1:54422197-54422216 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTTCACCAAGCTTGTTTTGA+TGG - Chr1:54421330-54421349 None:intergenic 40.0%
!!! GAAACTCGTCACTTTTACTC+TGG + Chr1:54420538-54420557 MsG0180002988.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAAATTGCAGGAACACC+GGG + Chr1:54421827-54421846 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGATGGAATTCTTGCAG+TGG + Chr1:54420732-54420751 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
ATAGCAGGCCAAACAAAAGC+CGG - Chr1:54422208-54422227 None:intergenic 45.0%
CAAATTACCCCAGATCTTCG+TGG + Chr1:54420511-54420530 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAATCGGAACCATTGG+AGG - Chr1:54422184-54422203 None:intergenic 45.0%
GATGGTCCTGACAATCTTGT+TGG + Chr1:54420784-54420803 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
GGTCTTTCAATCGGAACCAT+TGG - Chr1:54422187-54422206 None:intergenic 45.0%
GTCTCAAAGAATTCGCGTCA+AGG + Chr1:54421415-54421434 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCATCACCACGAAGATC+TGG - Chr1:54420523-54420542 None:intergenic 45.0%
TTCATCACCACGAAGATCTG+GGG - Chr1:54420521-54420540 None:intergenic 45.0%
! AAGCTTGGTGAAGGTGGATT+TGG + Chr1:54421337-54421356 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTGGTGAAGCTCATTGGT+TGG + Chr1:54421491-54421510 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
! CAAAACAAGCTTGGTGAAGG+TGG + Chr1:54421331-54421350 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
! CACGAAGATCTGGGGTAATT+TGG - Chr1:54420513-54420532 None:intergenic 45.0%
! GTGATTCGAGTTCACTCGAT+TGG - Chr1:54421591-54421610 None:intergenic 45.0%
! GTTTGGGAGCTTTATGGAGA+GGG + Chr1:54422001-54422020 MsG0180002988.01.T01:CDS 45.0%
ACAAGTCCTGTAACTTCCCC+TGG + Chr1:54420643-54420662 MsG0180002988.01.T01:CDS 50.0%
ATTGTCAGGACCATCTTGCG+TGG - Chr1:54420779-54420798 None:intergenic 50.0%
CGACAAAGTTCCACGCAAGA+TGG + Chr1:54420766-54420785 MsG0180002988.01.T01:CDS 50.0%
GAATGGTGTGATTCGTGACG+TGG + Chr1:54421642-54421661 MsG0180002988.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGAAGCTTCTCCTCCAA+TGG + Chr1:54422168-54422187 MsG0180002988.01.T01:CDS 50.0%
TGTTTCAACCGTCGCTCTTC+TGG - Chr1:54421879-54421898 None:intergenic 50.0%
! GGTTTGGGAGCTTTATGGAG+AGG + Chr1:54422000-54422019 MsG0180002988.01.T01:CDS 50.0%
! TTGAGAGAGGAAGGCATAGC+AGG - Chr1:54422223-54422242 None:intergenic 50.0%
!! ATTTCCGGTGCCATATAGCC+CGG - Chr1:54421848-54421867 None:intergenic 50.0%
AACACCGGGCTATATGGCAC+CGG + Chr1:54421841-54421860 MsG0180002988.01.T01:CDS 55.0%
AAGGCTATGCCTTCTCCACC+AGG - Chr1:54420664-54420683 None:intergenic 55.0%
AGGCTATGCCTTCTCCACCA+GGG - Chr1:54420663-54420682 None:intergenic 55.0%
AGTCCTGTAACTTCCCCTGG+TGG + Chr1:54420646-54420665 MsG0180002988.01.T01:CDS 55.0%
GTAACTTCCCCTGGTGGAGA+AGG + Chr1:54420652-54420671 MsG0180002988.01.T01:CDS 55.0%
TCGTGACGTGGCTCAAGCAT+TGG + Chr1:54421654-54421673 MsG0180002988.01.T01:CDS 55.0%
TCTCCACCAGGGGAAGTTAC+AGG - Chr1:54420652-54420671 None:intergenic 55.0%
TGCAGGAACACCGGGCTATA+TGG + Chr1:54421835-54421854 MsG0180002988.01.T01:CDS 55.0%
GGCTATGCCTTCTCCACCAG+GGG - Chr1:54420662-54420681 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 54420340 54422264 54420340 ID=MsG0180002988.01;Name=MsG0180002988.01
Chr1 mRNA 54420340 54422264 54420340 ID=MsG0180002988.01.T01;Parent=MsG0180002988.01;Name=MsG0180002988.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|564
Chr1 exon 54420340 54421027 54420340 ID=MsG0180002988.01.T01:exon:2875;Parent=MsG0180002988.01.T01
Chr1 exon 54421170 54421706 54421170 ID=MsG0180002988.01.T01:exon:2876;Parent=MsG0180002988.01.T01
Chr1 exon 54421795 54422264 54421795 ID=MsG0180002988.01.T01:exon:2877;Parent=MsG0180002988.01.T01
Chr1 CDS 54420340 54421027 54420340 ID=MsG0180002988.01.T01:cds;Parent=MsG0180002988.01.T01
Chr1 CDS 54421170 54421706 54421170 ID=MsG0180002988.01.T01:cds;Parent=MsG0180002988.01.T01
Chr1 CDS 54421795 54422264 54421795 ID=MsG0180002988.01.T01:cds;Parent=MsG0180002988.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180002988.01.T01

ATGGTGAACTTGTCTTTGCTACTCCAATATCAATCATCAGCACTCATATTCAGTATCATAGCCGTTACCAAAGTTGGCTGTTTTTATTTCAATTTCCCAACCTTTCAACAAAGTGATAAATCAACCAACTTGCTACTAAGCAAATACTCAAACATATACAAAGATGCCATCCAAATTACCCCAGATCTTCGTGGTGATGAAACTCGTCACTTTTACTCTGGTCGTGCTTTATACAACAAGCCATTCACAATTTGGAACAAAAACAAAACAATAGCTTCCTTCAACACCACTTTTGTTCTCAACACAAGTCCTGTAACTTCCCCTGGTGGAGAAGGCATAGCCTTTATCTTAACTTCAGATACAGCTCTCCCTGACGAAAGTGATAACACAACAGCAGATGGAATTCTTGCAGTGGAGTTCAATACACGACAAAGTTCCACGCAAGATGGTCCTGACAATCTTGTTGGAATCAATATAAACAATATCTTTGGTTTGAAACAAGCATCATTGGAAAACACTAAGGTCAATCTTTCATCTGGTTTAGATGTAACTATGAGAATTCAATATTCCAATGATATAATATCTGTTTTTGGTTCAATGAGTAAAAATTCAAATGATTCTATGGAGACCCTTTTGGTATCTCCACCTCTTAGTCTCTCTTCTTATCTTAAACAAGAGGTTTATGTCGGTGTGTTGGTATTTTTCTTGGTATATCGTAAAGTGAAAAGAAGCATGGAGATTCAAGAAGATACATATCCAAGGATAGAGGATCAAATTCAGTACTCGTCAATGGCACCAAAGAAATATCGACTAAAGGAATTGATGAAAGCAACAGGTGGATTCAGCCATCAAAACAAGCTTGGTGAAGGTGGATTTGGAACTGTTTATAAGGGAATCCTTGGAGAAATCAATAAAGAGATAGCTGTGAAGAGAGTCTCAAAGAATTCGCGTCAAGGAAAGAAAGAATTTATAGCCGAAGTTACAACAATTGGAAGCCTTCACCACAAAAACTTGGTGAAGCTCATTGGTTGGTGCTATGAGAAAAAAGAGCTTCTCATTGTTTACGAGTTCATGCCTAATGGAAGCTTAGACAGATACCTATTTAACCAATCGAGTGAACTCGAATCACATTATTCGACAGTACTTGATTGGAAAACTAGGAATGGTGTGATTCGTGACGTGGCTCAAGCATTGGATTATCTTCACAATGGTTGTGAAAAAAAGGTTCAAATGAGAAATGAAACTCATCATTCAACAAAGGAAATTGCAGGAACACCGGGCTATATGGCACCGGAAATATTTTTAACCAGAAGAGCGACGGTTGAAACAGATGTGTATGCATTTGGTGTACTTGTTTTGGAAATTGTGTGTGGAAAAAGACCAAGAAATATGTATGCACAAGATGATTATAAATATAGTATTGTGTATTGGGTTTGGGAGCTTTATGGAGAGGGAAAAATAGTTAGTGCAGTTGATGATAGGATTAGTGAAGAGGATGAAATTGAAAAGGTTGAAATTGTGCTTATTCTTGGGTTGTCTTGTTGTCATCCAAATCCACATGAAAGACCAACAATGAAAACTGTTCTGATGGTTCTTAATGGAGAAGCTTCTCCTCCAATGGTTCCGATTGAAAGACCGGCTTTTGTTTGGCCTGCTATGCCTTCCTCTCTCAAACAAAATGAAATTGTTCTCTAA
Protein sequence

>MsG0180002988.01.T01

MVNLSLLLQYQSSALIFSIIAVTKVGCFYFNFPTFQQSDKSTNLLLSKYSNIYKDAIQITPDLRGDETRHFYSGRALYNKPFTIWNKNKTIASFNTTFVLNTSPVTSPGGEGIAFILTSDTALPDESDNTTADGILAVEFNTRQSSTQDGPDNLVGININNIFGLKQASLENTKVNLSSGLDVTMRIQYSNDIISVFGSMSKNSNDSMETLLVSPPLSLSSYLKQEVYVGVLVFFLVYRKVKRSMEIQEDTYPRIEDQIQYSSMAPKKYRLKELMKATGGFSHQNKLGEGGFGTVYKGILGEINKEIAVKRVSKNSRQGKKEFIAEVTTIGSLHHKNLVKLIGWCYEKKELLIVYEFMPNGSLDRYLFNQSSELESHYSTVLDWKTRNGVIRDVAQALDYLHNGCEKKVQMRNETHHSTKEIAGTPGYMAPEIFLTRRATVETDVYAFGVLVLEIVCGKRPRNMYAQDDYKYSIVYWVWELYGEGKIVSAVDDRISEEDEIEKVEIVLILGLSCCHPNPHERPTMKTVLMVLNGEASPPMVPIERPAFVWPAMPSSLKQNEIVL*