AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003534.01

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MsG0180003534.01.T01 AT2G42960 41.311 305 157 6 77 379 171 455 1.05e-68 226
MsG0180003534.01.T01 AT2G42960 41.311 305 157 6 77 379 171 455 1.05e-68 226
MsG0180003534.01.T01 AT3G17420 38.905 347 182 8 77 414 142 467 3.44e-68 224
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MsG0180003534.01.T01 AT1G56720 40.196 306 159 7 77 379 167 451 1.93e-67 223
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MsG0180003534.01.T01 AT4G32710 38.770 374 194 9 52 414 354 703 5.69e-66 224
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MsG0180003534.01.T01 AT3G53810 39.482 309 156 7 77 378 335 619 3.00e-58 202
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MsG0180003534.01.T01 AT1G51810 41.391 302 149 8 77 375 440 716 5.14e-58 203
MsG0180003534.01.T01 AT1G52540 36.275 306 172 6 75 378 23 307 5.79e-58 194
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MsG0180003534.01.T01 AT4G02410 39.145 304 155 6 81 378 347 626 3.41e-54 191
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MsG0180003534.01.T01 AT1G51860 37.464 347 184 10 61 403 417 734 7.57e-54 191
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MsG0180003534.01.T01 AT5G01950 35.514 321 173 7 72 385 609 902 1.05e-52 190
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MsG0180003534.01.T01 AT3G46355 37.346 324 157 9 86 408 2 280 1.16e-51 176
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MsG0180003534.01.T01 AT3G08760 34.844 353 199 9 41 381 122 455 1.36e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT2G41970 33.423 371 207 8 35 384 5 356 1.38e-51 178
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MsG0180003534.01.T01 AT3G46370 40.461 304 153 9 75 375 475 753 1.50e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT1G61390 34.066 364 213 10 54 416 320 657 1.93e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT2G19230 37.624 303 163 6 75 375 558 836 2.08e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT4G23160 36.577 298 169 5 82 378 352 630 2.21e-51 184
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MsG0180003534.01.T01 AT1G55610 38.941 321 156 9 74 381 844 1137 2.44e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT1G05700 34.568 324 188 6 62 383 543 844 2.47e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT5G65600 34.277 318 184 5 69 379 330 629 2.57e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT1G16130 39.355 310 160 10 75 378 402 689 2.82e-51 184
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MsG0180003534.01.T01 AT1G07550 35.635 362 199 11 55 413 534 864 2.85e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT5G24080 37.705 305 166 7 77 379 393 675 2.91e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT5G24080 37.705 305 166 7 77 379 393 675 2.91e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT1G05700 34.356 326 190 6 60 383 572 875 2.98e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT4G23140 36.577 298 169 5 82 378 344 622 3.07e-51 183
MsG0180003534.01.T01 AT5G57670 33.438 320 191 6 74 393 252 549 3.11e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT5G59680 37.391 345 185 10 75 413 568 887 3.22e-51 186
MsG0180003534.01.T01 AT4G32000 37.942 311 170 6 74 382 157 446 3.37e-51 179
MsG0180003534.01.T01 AT3G59750 35.505 307 176 7 77 381 291 577 3.44e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT4G27290 38.176 296 162 6 82 375 458 734 3.47e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT1G11303 38.199 322 171 7 74 394 494 788 3.54e-51 185
MsG0180003534.01.T01 AT3G59740 36.218 312 170 8 77 381 321 610 3.64e-51 183
MsG0180003534.01.T01 AT4G23240 34.983 303 178 4 77 378 16 300 4.35e-51 176
MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 465 820 4.41e-51 185
MsG0180003534.01.T01 AT5G11410 32.927 328 198 9 63 383 21 333 4.79e-51 176
MsG0180003534.01.T01 AT2G23200 35.362 345 193 10 77 418 474 791 5.05e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT4G00970 35.430 302 172 7 82 379 337 619 5.81e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT4G27290 38.176 296 162 6 82 375 504 780 5.84e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 457 812 6.00e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT1G79680 37.812 320 175 9 75 392 419 716 6.02e-51 184
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MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 522 877 6.49e-51 185
MsG0180003534.01.T01 AT5G61350 37.429 350 184 10 32 375 477 797 7.68e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT5G59270 36.570 309 164 8 77 379 340 622 8.03e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT5G59650 37.901 343 184 9 75 413 567 884 8.32e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT5G01560 37.785 307 165 7 77 380 351 634 8.51e-51 182
MsG0180003534.01.T01 AT1G61390 34.066 364 213 10 54 416 488 825 8.66e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT5G49770 41.353 266 137 5 120 382 659 908 8.75e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 464 819 8.87e-51 184
MsG0180003534.01.T01 AT4G23320 34.985 323 179 9 77 393 171 468 8.90e-51 179
MsG0180003534.01.T01 AT4G23320 34.985 323 179 9 77 393 171 468 8.90e-51 179
MsG0180003534.01.T01 AT2G32800 37.764 331 160 10 73 375 101 413 8.99e-51 184
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MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 550 905 9.58e-51 184
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MsG0180003534.01.T01 AT5G59270 36.570 309 164 8 77 379 356 638 1.18e-50 182
MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 622 977 1.22e-50 184
MsG0180003534.01.T01 AT4G03230 34.483 377 216 8 28 394 622 977 1.22e-50 184
MsG0180003534.01.T01 AT5G24080 37.705 305 166 7 77 379 520 802 1.30e-50 184

Find 148 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 235 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTAATACTTCACTCATCTT+AGG 0.148546 1:+63853713 None:intergenic
AGCTATTTAATGAAAATTTA+AGG 0.172384 1:-63853131 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
GCAAGACCTCGCAAAATATT+AGG 0.193655 1:+63852935 None:intergenic
CTCATCTTAGGGCGATTCTT+TGG 0.198086 1:+63853725 None:intergenic
CTGATTATTCTAGATTTAAA+TGG 0.201457 1:-63853513 MsG0180003534.01.T01:exon
GCTAGGTCTTTGGGACAAAT+TGG 0.218095 1:+63856137 None:intergenic
TGCAATTTCTATACATTGTT+AGG 0.219204 1:+63853189 None:intergenic
CTCTCAGGTTGCTAGGTCTT+TGG 0.235382 1:+63856127 None:intergenic
AGCCAAAACCAGATTGTAAT+TGG 0.251432 1:-63853571 MsG0180003534.01.T01:CDS
CCAACAAGAATTTGAGAAAA+TGG 0.252867 1:+63853321 None:intergenic
AACAGCTGCTGCTCACCCTT+TGG 0.268372 1:+63853881 None:intergenic
CAAATCTTCAAATATCCTTC+TGG 0.270939 1:-63854557 MsG0180003534.01.T01:CDS
AACCAATTACAATCTGGTTT+TGG 0.277102 1:+63853569 None:intergenic
TTTCTGATCGCGGGGATAAA+TGG 0.297243 1:+63854849 None:intergenic
ATGCTTGGCGAGGGTGGATT+CGG 0.298390 1:-63856051 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTGGTGGCTGATTTCAGTTC+AGG 0.307690 1:+63856093 None:intergenic
GCCAACTAGTTTCACAAGAT+TGG 0.311872 1:+63854949 None:intergenic
AACCAGATTGTAATTGGTTT+AGG 0.318885 1:-63853565 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAGAGGAATCCAGCGGCTTT+TGG 0.331806 1:-63854906 MsG0180003534.01.T01:CDS
CAGCATGTTCTTAAAAGCTT+TGG 0.334054 1:+63853533 None:intergenic
CGTCCTGTTTGAATATATTC+AGG 0.344652 1:+63853989 None:intergenic
ACAGCTGCTGCTCACCCTTT+GGG 0.345866 1:+63853882 None:intergenic
TCTCAGGTTGCTAGGTCTTT+GGG 0.349252 1:+63856128 None:intergenic
GTCCGGAGTCTGACACTTCT+TGG 0.351987 1:-63853394 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TCATCTTAGGGCGATTCTTT+GGG 0.358848 1:+63853726 None:intergenic
CTAATACTTCACTCATCTTA+GGG 0.359637 1:+63853714 None:intergenic
CTATCGAACAACTCTACTTA+TGG 0.372609 1:-63856249 MsG0180003534.01.T01:CDS
ACTTGGTAAAAGAGGAATTC+AGG 0.386646 1:-63855959 MsG0180003534.01.T01:CDS
GACTTTGGATTAGCAAGATT+GGG 0.387686 1:-63854508 MsG0180003534.01.T01:CDS
TGACTTTGGATTAGCAAGAT+TGG 0.399662 1:-63854509 MsG0180003534.01.T01:CDS
CATCAGGTTGTAGGAACAAT+GGG 0.400624 1:-63854022 MsG0180003534.01.T01:intron
CAAGACCTCGCAAAATATTA+GGG 0.403141 1:+63852936 None:intergenic
CTAGGTCTTTGGGACAAATT+GGG 0.405908 1:+63856138 None:intergenic
TGGTTCTGAATTGAATTCTC+TGG 0.408769 1:-63856205 MsG0180003534.01.T01:CDS
CCAACTAGTTTCACAAGATT+GGG 0.411699 1:+63854950 None:intergenic
AACCTAAACCAATTACAATC+TGG 0.412422 1:+63853563 None:intergenic
GCAATTTCTATACATTGTTA+GGG 0.413837 1:+63853190 None:intergenic
ACATAGATGGTAATTATAGA+TGG 0.419722 1:+63853444 None:intergenic
TGCTTGGCGAGGGTGGATTC+GGG 0.420754 1:-63856050 MsG0180003534.01.T01:CDS
CAACCAGATGCATTAGCATT+AGG 0.422676 1:+63853022 None:intergenic
TTCCTCTATGAACTCATTAC+CGG 0.424755 1:-63853929 MsG0180003534.01.T01:CDS
AACATACCTCCACGAGGAAA+TGG 0.425390 1:-63854771 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAACTCCTCTCCCATGGAAC+AGG 0.429660 1:-63854829 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTTCGGCTTACAGGGGCATA+AGG 0.431764 1:-63855014 MsG0180003534.01.T01:intron
AATGCAAAGCTGTCTGACTT+TGG 0.440119 1:-63854523 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTCGGTCGCTCTGTTATGCT+TGG 0.444323 1:-63856066 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATTGTAATTGGTTTAGGTTG+TGG 0.446905 1:-63853559 MsG0180003534.01.T01:CDS
GATGAGTGAAGTATTAGAAA+TGG 0.448870 1:-63853708 MsG0180003534.01.T01:CDS
GGCTGAGGCTACACTATTCA+AGG 0.450678 1:+63853640 None:intergenic
CCCAATCTTGTGAAACTAGT+TGG 0.459218 1:-63854950 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTGAATATCAAGGTAGAGGT+TGG 0.459409 1:-63853076 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TAATGTATTCATCAGGTTGT+AGG 0.461527 1:-63854031 MsG0180003534.01.T01:intron
TTAAGCCGCGAGCAGCATCT+TGG 0.461669 1:+63854792 None:intergenic
GAGCCTAATGCTAATGCATC+TGG 0.464372 1:-63853025 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TAAGCCGCGAGCAGCATCTT+GGG 0.464999 1:+63854793 None:intergenic
AGTCTCCTGTTCCATGGGAG+AGG 0.465054 1:+63854824 None:intergenic
GCTCCTGAATATATTCAAAC+AGG 0.466449 1:-63853992 MsG0180003534.01.T01:CDS
TGGATTCGGGTGTGTCTACA+AGG 0.467477 1:-63856037 MsG0180003534.01.T01:CDS
AGCCTCAGCCGATGATTCTC+AGG 0.468497 1:-63853627 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAGTGTTTGTGCAACATAGA+TGG 0.474314 1:+63853431 None:intergenic
GTGACTGAAGTGAATGTTCT+TGG 0.476663 1:-63854986 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTTGGGCGATTTCGATCTAA+AGG 0.476715 1:+63853899 None:intergenic
TGGGAAATGCATTCCTCCTA+AGG 0.478707 1:+63856157 None:intergenic
CTTGCAAATGCAATCACTCT+CGG 0.482464 1:-63856274 MsG0180003534.01.T01:CDS
TCGATCTAAAGGACGCCTGC+CGG 0.482702 1:+63853910 None:intergenic
GCTTACAGGGGCATAAGGAA+TGG 0.485551 1:-63855009 MsG0180003534.01.T01:intron
ACAACAGTTCCGACTCCCTT+AGG 0.486500 1:-63856173 MsG0180003534.01.T01:CDS
CATTAAATAGCTTCACAAGC+TGG 0.487091 1:+63853142 None:intergenic
CTTCGTATTGAAGACGTGTC+CGG 0.488418 1:-63853411 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
GTTAAACAACTTGGTAAAAG+AGG 0.489578 1:-63855967 MsG0180003534.01.T01:CDS
TGGTGTTCCAAGCTTCTGTT+GGG 0.491944 1:+63854869 None:intergenic
GGGAGTGACATGAGAAGAAC+TGG 0.492216 1:-63856225 MsG0180003534.01.T01:CDS
GGAGAGGAGTTTCTGATCGC+GGG 0.494728 1:+63854840 None:intergenic
GGATCGGATTGTGGAGTCTT+CGG 0.502194 1:-63853684 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAGGGAGTCGGAACTGTTGT+CGG 0.510467 1:+63856176 None:intergenic
TTGCAAATGCAATCACTCTC+GGG 0.510829 1:-63856273 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAATGGATCAAAGCTATGAA+TGG 0.510830 1:-63853496 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TCACTTCAAAGATTGATGTA+TGG 0.511855 1:-63853964 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATGGTGTTCCAAGCTTCTGT+TGG 0.515106 1:+63854868 None:intergenic
TATGTGTAGATTACCATCCT+TGG 0.515476 1:-63853275 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TTCAGTGTCCTGAGAATCAT+CGG 0.521888 1:+63853619 None:intergenic
AGAAATGGTGGATCGGATTG+TGG 0.523207 1:-63853693 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTTCCATTCAACATCATCTA+CGG 0.524013 1:-63856321 MsG0180003534.01.T01:CDS
CTTACAGGGGCATAAGGAAT+GGG 0.528403 1:-63855008 MsG0180003534.01.T01:intron
CAGGTACAGTAAATACTCTC+AGG 0.529207 1:+63856112 None:intergenic
TATAGTAGCTAACAGATGCT+TGG 0.529772 1:-63853756 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTAAATACTCTCAGGTTGCT+AGG 0.530272 1:+63856120 None:intergenic
AAAGGGTGAGCAGCAGCTGT+TGG 0.530444 1:-63853879 MsG0180003534.01.T01:CDS
CGCTCTGTTATGCTTGGCGA+GGG 0.530662 1:-63856060 MsG0180003534.01.T01:CDS
CAAGATTGGGACCATCTGAC+GGG 0.535782 1:-63854495 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTGAGCAGCAGCTGTTGGAA+TGG 0.537569 1:-63853874 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATATATGCCCAACAGAAGCT+TGG 0.538764 1:-63854876 MsG0180003534.01.T01:CDS
GAAATTGCAGTTAAACAACT+TGG 0.539923 1:-63855976 MsG0180003534.01.T01:CDS
AACTAACAAGAAGAGAATCA+TGG 0.540225 1:-63853594 MsG0180003534.01.T01:CDS
CATTCCACTGCTCGTCCAGA+AGG 0.541101 1:+63854542 None:intergenic
AGGTGTTTCCTCTCAAGTCT+AGG 0.544879 1:+63853803 None:intergenic
TCATCAGGTTGTAGGAACAA+TGG 0.548203 1:-63854023 MsG0180003534.01.T01:intron
AAGATTGATGTATGGAGCTA+CGG 0.548302 1:-63853956 MsG0180003534.01.T01:CDS
GACAAGAAGGGTGATGCTAA+AGG 0.555030 1:-63856297 MsG0180003534.01.T01:CDS
CATCATCTACGGAGACAAGA+AGG 0.557880 1:-63856310 MsG0180003534.01.T01:CDS
CATTGTTAGGGGAGATGAAG+AGG 0.560138 1:+63853202 None:intergenic
GGAACAAATTGTGAATATCA+AGG 0.560266 1:-63853086 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
AATTGTGAATATCAAGGTAG+AGG 0.562308 1:-63853080 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TGACATGACGTTGACACACG+TGG 0.563478 1:-63853361 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
GCAAGATTGGGACCATCTGA+CGG 0.563517 1:-63854496 MsG0180003534.01.T01:CDS
TCTGTTATGCTTGGCGAGGG+TGG 0.565028 1:-63856057 MsG0180003534.01.T01:CDS
TTAGATCGAAATCGCCCAAA+GGG 0.565910 1:-63853896 MsG0180003534.01.T01:CDS
GAGTGAAGTATTAGAAATGG+TGG 0.568147 1:-63853705 MsG0180003534.01.T01:CDS
TCGCTCTGTTATGCTTGGCG+AGG 0.570280 1:-63856061 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATATCCTTCTGGACGAGCAG+TGG 0.571689 1:-63854546 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATGCAATATTCAAGTAGTTG+AGG 0.571865 1:-63853107 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
TCTCCGTAGATGATGTTGAA+TGG 0.572839 1:+63856318 None:intergenic
TGCATTCCTCCTAAGGGAGT+CGG 0.573570 1:+63856164 None:intergenic
ACAGTTCCGACTCCCTTAGG+AGG 0.582720 1:-63856170 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATTCATATACCAAAAGCCGC+TGG 0.583800 1:+63854897 None:intergenic
TGTGCTGATGATGATGAAAG+AGG 0.588459 1:-63854923 MsG0180003534.01.T01:CDS
CACCAAGAAGTGTCAGACTC+CGG 0.588504 1:+63853392 None:intergenic
CGAACAACTCTACTTATGGC+GGG 0.590307 1:-63856245 MsG0180003534.01.T01:CDS
GGATTCGGGTGTGTCTACAA+GGG 0.590577 1:-63856036 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTAAAAGAGGAATTCAGGCA+AGG 0.590579 1:-63855954 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTCCTGAGAATCATCGGCTG+AGG 0.593242 1:+63853625 None:intergenic
AAGTATTAGAAATGGTGGAT+CGG 0.597599 1:-63853700 MsG0180003534.01.T01:CDS
AAATAGCTTCACAAGCTGGA+AGG 0.602305 1:+63853146 None:intergenic
TCTATGAACTCATTACCGGC+AGG 0.608136 1:-63853925 MsG0180003534.01.T01:CDS
ACATGAGTTAACCCGTCAGA+TGG 0.610870 1:+63854484 None:intergenic
GGGAAATGCATTCCTCCTAA+GGG 0.615851 1:+63856158 None:intergenic
TCGAACAACTCTACTTATGG+CGG 0.623638 1:-63856246 MsG0180003534.01.T01:CDS
GATCAGAAACTCCTCTCCCA+TGG 0.626116 1:-63854835 MsG0180003534.01.T01:CDS
CAATTTCTATACATTGTTAG+GGG 0.627487 1:+63853191 None:intergenic
GGGAGAGGAGTTTCTGATCG+CGG 0.630915 1:+63854839 None:intergenic
TTTAGATCGAAATCGCCCAA+AGG 0.632269 1:-63853897 MsG0180003534.01.T01:CDS
ATCATCTACGGAGACAAGAA+GGG 0.633057 1:-63856309 MsG0180003534.01.T01:CDS
CCTGAAAATCCATTTCCTCG+TGG 0.642833 1:+63854762 None:intergenic
TGCCGGTAATGAGTTCATAG+AGG 0.644982 1:+63853927 None:intergenic
GAGGAAACACCTCTTAAAGT+CGG 0.647365 1:-63853792 MsG0180003534.01.T01:CDS
CTCTTTGTGATGTCCAAGGA+TGG 0.656069 1:+63853262 None:intergenic
GCTGAGGCTACACTATTCAA+GGG 0.665999 1:+63853641 None:intergenic
GAGAGGAGTTTCTGATCGCG+GGG 0.675528 1:+63854841 None:intergenic
CAATGTATAGAAATTGCATG+TGG 0.678772 1:-63853184 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
ATAGCCCAAGATGCTGCTCG+CGG 0.681122 1:-63854797 MsG0180003534.01.T01:CDS
TGAGCTCTTTGTGATGTCCA+AGG 0.685861 1:+63853258 None:intergenic
GAGGCTACACTATTCAAGGG+TGG 0.687379 1:+63853644 None:intergenic
GAAAATCCATTTCCTCGTGG+AGG 0.688122 1:+63854765 None:intergenic
GACATGACGTTGACACACGT+GGG 0.693249 1:-63853360 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR
CGGCTTAACATACCTCCACG+AGG 0.739059 1:-63854777 MsG0180003534.01.T01:CDS
GTTAACTCATGTCTCAACAG+CGG 0.747807 1:-63854473 MsG0180003534.01.T01:intron
ATCAGGTTGTAGGAACAATG+GGG 0.752085 1:-63854021 MsG0180003534.01.T01:intron
ATGATGAAAGAGGAATCCAG+CGG 0.769009 1:-63854913 MsG0180003534.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGCTATTTAATGAAAATTTA+AGG - Chr1:63856076-63856095 MsG0180003534.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAAATATAAAATTGAAGTG+TGG + Chr1:63853786-63853805 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTTCATATATGTAAATAG+TGG + Chr1:63854798-63854817 None:intergenic 15.0%
!!! GAAAAAGTTTCAAATAATTT+TGG - Chr1:63855379-63855398 MsG0180003534.01.T01:intron 15.0%
!!! TAAAATTGATTTTTGTATGT+TGG - Chr1:63853505-63853524 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!! CAATTCAATTAGTATTTGTT+TGG + Chr1:63853733-63853752 None:intergenic 20.0%
!! CTATAAAATAGCTTATAGAT+AGG - Chr1:63854096-63854115 MsG0180003534.01.T01:intron 20.0%
!! CTGATTATTCTAGATTTAAA+TGG - Chr1:63855694-63855713 MsG0180003534.01.T01:intron 20.0%
!! TTATGAAAATAAGCGAAAAA+AGG + Chr1:63854025-63854044 None:intergenic 20.0%
!!! AAAGAAATTAAAGTCTTGTT+TGG + Chr1:63854171-63854190 None:intergenic 20.0%
!!! AAGACTTTTGTAAAATATGA+TGG - Chr1:63853832-63853851 MsG0180003534.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTCTATTCAAGGATATAA+AGG - Chr1:63854480-63854499 MsG0180003534.01.T01:CDS 20.0%
! AAATCAGAGATGAAAAGAAA+TGG + Chr1:63854765-63854784 None:intergenic 25.0%
! ACACACAATTAATGTTCATA+TGG - Chr1:63855145-63855164 MsG0180003534.01.T01:intron 25.0%
! ACATAGATGGTAATTATAGA+TGG + Chr1:63855766-63855785 None:intergenic 25.0%
! ACTGTGTTTAAGTATCATAA+AGG - Chr1:63853408-63853427 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! CAATTTCTATACATTGTTAG+GGG + Chr1:63856019-63856038 None:intergenic 25.0%
! CACATTAGAATCAGTTAAAT+AGG + Chr1:63853557-63853576 None:intergenic 25.0%
! GCAATTTCTATACATTGTTA+GGG + Chr1:63856020-63856039 None:intergenic 25.0%
! TGCAATTTCTATACATTGTT+AGG + Chr1:63856021-63856040 None:intergenic 25.0%
! TTATAAGCAAGAGAGTAATT+TGG - Chr1:63854819-63854838 MsG0180003534.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGCATAACTTTTCTATTCA+AGG - Chr1:63854471-63854490 MsG0180003534.01.T01:intron 25.0%
!! GACTTTAATTTCTTTCCTTT+CGG - Chr1:63854176-63854195 MsG0180003534.01.T01:intron 25.0%
!! TGTTTTCATCTAAGCTATAT+TGG + Chr1:63854053-63854072 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGGTTGATAACTGTATT+AGG + Chr1:63855103-63855122 None:intergenic 25.0%
!!! AATGGTTGATAACTGTATTA+GGG + Chr1:63855102-63855121 None:intergenic 25.0%
!!! GCAATTTCAATTTTTTTAGC+AGG + Chr1:63853219-63853238 None:intergenic 25.0%
!!! TTAAGTCTTCAAAGTACTTT+TGG + Chr1:63853488-63853507 None:intergenic 25.0%
AAATCAGCCACCAAAAATTT+CGG - Chr1:63853123-63853142 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
AAATGGATCAAAGCTATGAA+TGG - Chr1:63855711-63855730 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
AACCTAAACCAATTACAATC+TGG + Chr1:63855647-63855666 None:intergenic 30.0%
AACTAACAAGAAGAGAATCA+TGG - Chr1:63855613-63855632 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
AATAAGCGAAAAAAGGCTTA+TGG + Chr1:63854018-63854037 None:intergenic 30.0%
AATTGTGAATATCAAGGTAG+AGG - Chr1:63856127-63856146 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
ACAATTAATGTTCATATGGC+TGG - Chr1:63855149-63855168 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
AGTTATCAACCATTTATAGC+TGG - Chr1:63855108-63855127 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
ATGCAATATTCAAGTAGTTG+AGG - Chr1:63856100-63856119 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
CAAATCTTCAAATATCCTTC+TGG - Chr1:63854650-63854669 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
CAATGTATAGAAATTGCATG+TGG - Chr1:63856023-63856042 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
CCAACAAGAATTTGAGAAAA+TGG + Chr1:63855889-63855908 None:intergenic 30.0%
CTAATACTTCACTCATCTTA+GGG + Chr1:63855496-63855515 None:intergenic 30.0%
GAAATTGCAGTTAAACAACT+TGG - Chr1:63853231-63853250 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
GAGTAATTTGGTATGAGAAT+AGG - Chr1:63854831-63854850 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
GGAACAAATTGTGAATATCA+AGG - Chr1:63856121-63856140 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
GTCTATGTTTAACGTACATT+CGG + Chr1:63855015-63855034 None:intergenic 30.0%
GTTAAACAACTTGGTAAAAG+AGG - Chr1:63853240-63853259 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TCACTTCAAAGATTGATGTA+TGG - Chr1:63855243-63855262 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
TCTAATACTTCACTCATCTT+AGG + Chr1:63855497-63855516 None:intergenic 30.0%
TGGTGTATAATGTATTCATC+AGG - Chr1:63855169-63855188 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
TTTCCATTCAACATCATCTA+CGG - Chr1:63852886-63852905 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TTTGCTTCTGTAATGTTGAT+AGG - Chr1:63853317-63853336 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! AAAACTTAAAAGTGCGCTTA+AGG + Chr1:63853681-63853700 None:intergenic 30.0%
! AACCAGATTGTAATTGGTTT+AGG - Chr1:63855642-63855661 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
! ACTGATTCTAATGTGAAGTT+AGG - Chr1:63853562-63853581 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
! AGCTACTATAGCAAGTTTTT+GGG + Chr1:63855441-63855460 None:intergenic 30.0%
! CCATTTTCTCAAATTCTTGT+TGG - Chr1:63855886-63855905 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
! CTGTAATGTTGATAGGTAAT+AGG - Chr1:63853324-63853343 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! GATGAGTGAAGTATTAGAAA+TGG - Chr1:63855499-63855518 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
! TAATGTATTCATCAGGTTGT+AGG - Chr1:63855176-63855195 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
! TAGCTACTATAGCAAGTTTT+TGG + Chr1:63855442-63855461 None:intergenic 30.0%
! TATGTTTGAATGCAGGATTT+TGG - Chr1:63854870-63854889 MsG0180003534.01.T01:CDS 30.0%
! TGATGTATGCTTTTATAGCA+CGG + Chr1:63855073-63855092 None:intergenic 30.0%
! TGCTATAAAAGCATACATCA+TGG - Chr1:63855073-63855092 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
! TTTTTCACATCTGAAAGGTA+TGG + Chr1:63855365-63855384 None:intergenic 30.0%
!! AACCAATTACAATCTGGTTT+TGG + Chr1:63855641-63855660 None:intergenic 30.0%
!! AAGTATTAGAAATGGTGGAT+CGG - Chr1:63855507-63855526 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
!! ATGGTTGATAACTGTATTAG+GGG + Chr1:63855101-63855120 None:intergenic 30.0%
!! ATTGTAATTGGTTTAGGTTG+TGG - Chr1:63855648-63855667 MsG0180003534.01.T01:intron 30.0%
!! TTAGTATTTGTTTGGTTCTG+TGG + Chr1:63853725-63853744 None:intergenic 30.0%
!!! GAAACTTTTTCACATCTGAA+AGG + Chr1:63855370-63855389 None:intergenic 30.0%
AAGATTGATGTATGGAGCTA+CGG - Chr1:63855251-63855270 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
AAGTGTTTGTGCAACATAGA+TGG + Chr1:63855779-63855798 None:intergenic 35.0%
ACTTGGTAAAAGAGGAATTC+AGG - Chr1:63853248-63853267 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AGAATAGGAACCTGAATCTA+AGG - Chr1:63854846-63854865 MsG0180003534.01.T01:CDS 35.0%
AGCCAAAACCAGATTGTAAT+TGG - Chr1:63855636-63855655 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
ATGTTTAACGTACATTCGGA+TGG + Chr1:63855011-63855030 None:intergenic 35.0%
ATTGCTGTACTAACTGTTTG+TGG - Chr1:63854599-63854618 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
CAAGACCTCGCAAAATATTA+GGG + Chr1:63856274-63856293 None:intergenic 35.0%
CACTAGATTCCAGCTATAAA+TGG + Chr1:63855120-63855139 None:intergenic 35.0%
CAGCATGTTCTTAAAAGCTT+TGG + Chr1:63855677-63855696 None:intergenic 35.0%
CATTAAATAGCTTCACAAGC+TGG + Chr1:63856068-63856087 None:intergenic 35.0%
CGTCCTGTTTGAATATATTC+AGG + Chr1:63855221-63855240 None:intergenic 35.0%
CTATCGAACAACTCTACTTA+TGG - Chr1:63852958-63852977 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GAATAGGAACCTGAATCTAA+GGG - Chr1:63854847-63854866 MsG0180003534.01.T01:CDS 35.0%
GCTCCTGAATATATTCAAAC+AGG - Chr1:63855215-63855234 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
TACTCAAGGTTATTCCTATC+TGG + Chr1:63853871-63853890 None:intergenic 35.0%
TATAGTAGCTAACAGATGCT+TGG - Chr1:63855451-63855470 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
TATGTGTAGATTACCATCCT+TGG - Chr1:63855932-63855951 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
TCAAACATACCCTTAGATTC+AGG + Chr1:63854859-63854878 None:intergenic 35.0%
TTCCTCTATGAACTCATTAC+CGG - Chr1:63855278-63855297 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
TTGCTGTACTAACTGTTTGT+GGG - Chr1:63854600-63854619 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
! CCAACTAGTTTCACAAGATT+GGG + Chr1:63854260-63854279 None:intergenic 35.0%
! GAGTGAAGTATTAGAAATGG+TGG - Chr1:63855502-63855521 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
! TTTGAATGCAGGATTTTGGA+AGG - Chr1:63854874-63854893 MsG0180003534.01.T01:CDS 35.0%
!! GACTTTGGATTAGCAAGATT+GGG - Chr1:63854699-63854718 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
!! TGACTTTGGATTAGCAAGAT+TGG - Chr1:63854698-63854717 MsG0180003534.01.T01:intron 35.0%
!! TGCAGTAGAAAAAGTACTCA+AGG + Chr1:63853885-63853904 None:intergenic 35.0%
!! TGGTTCTGAATTGAATTCTC+TGG - Chr1:63853002-63853021 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!! TTGAATGCAGGATTTTGGAA+GGG - Chr1:63854875-63854894 MsG0180003534.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTAGTCTCCTGTTCCAT+GGG + Chr1:63854391-63854410 None:intergenic 35.0%
!!! AAGAGGTGCAACGTTTTTTA+TGG + Chr1:63855991-63856010 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTTAGTCTCCTGTTCCA+TGG + Chr1:63854392-63854411 None:intergenic 35.0%
AAATAGCTTCACAAGCTGGA+AGG + Chr1:63856064-63856083 None:intergenic 40.0%
AATGCAAAGCTGTCTGACTT+TGG - Chr1:63854684-63854703 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
AGCTTCTCCTAACTTCCTTT+AGG + Chr1:63854524-63854543 None:intergenic 40.0%
AGTCTTTCGAAGATCGAGTA+AGG + Chr1:63853818-63853837 None:intergenic 40.0%
ATATATGCCCAACAGAAGCT+TGG - Chr1:63854331-63854350 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
ATCATCTACGGAGACAAGAA+GGG - Chr1:63852898-63852917 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
ATGATGAAAGAGGAATCCAG+CGG - Chr1:63854294-63854313 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
ATTCATATACCAAAAGCCGC+TGG + Chr1:63854313-63854332 None:intergenic 40.0%
CAACCAGATGCATTAGCATT+AGG + Chr1:63856188-63856207 None:intergenic 40.0%
CAGGTACAGTAAATACTCTC+AGG + Chr1:63853098-63853117 None:intergenic 40.0%
CCCAATCTTGTGAAACTAGT+TGG - Chr1:63854257-63854276 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
CTTCTCCTAACTTCCTTTAG+GGG + Chr1:63854522-63854541 None:intergenic 40.0%
CTTGCAAATGCAATCACTCT+CGG - Chr1:63852933-63852952 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GAGGAAACACCTCTTAAAGT+CGG - Chr1:63855415-63855434 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
GCAAGACCTCGCAAAATATT+AGG + Chr1:63856275-63856294 None:intergenic 40.0%
GCTTCTCCTAACTTCCTTTA+GGG + Chr1:63854523-63854542 None:intergenic 40.0%
GTAAAAGAGGAATTCAGGCA+AGG - Chr1:63853253-63853272 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GTGAATATCAAGGTAGAGGT+TGG - Chr1:63856131-63856150 MsG0180003534.01.T01:CDS 40.0%
GTGACTGAAGTGAATGTTCT+TGG - Chr1:63854221-63854240 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
GTTAACTCATGTCTCAACAG+CGG - Chr1:63854734-63854753 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TCATCTTAGGGCGATTCTTT+GGG + Chr1:63855484-63855503 None:intergenic 40.0%
TCGAACAACTCTACTTATGG+CGG - Chr1:63852961-63852980 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TCTCCGTAGATGATGTTGAA+TGG + Chr1:63852892-63852911 None:intergenic 40.0%
TGCTGTACTAACTGTTTGTG+GGG - Chr1:63854601-63854620 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TTAACGTACATTCGGATGGA+GGG + Chr1:63855007-63855026 None:intergenic 40.0%
TTAGATCGAAATCGCCCAAA+GGG - Chr1:63855311-63855330 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TTCAGTGTCCTGAGAATCAT+CGG + Chr1:63855591-63855610 None:intergenic 40.0%
TTCTCCTAACTTCCTTTAGG+GGG + Chr1:63854521-63854540 None:intergenic 40.0%
TTCTTTCCTTTCGGCTTACA+GGG - Chr1:63854185-63854204 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TTGCAAATGCAATCACTCTC+GGG - Chr1:63852934-63852953 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TTTAACGTACATTCGGATGG+AGG + Chr1:63855008-63855027 None:intergenic 40.0%
TTTAGATCGAAATCGCCCAA+AGG - Chr1:63855310-63855329 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TTTCTTTCCTTTCGGCTTAC+AGG - Chr1:63854184-63854203 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
TTTGGGCGATTTCGATCTAA+AGG + Chr1:63855311-63855330 None:intergenic 40.0%
! AACAGAGCGACCGAAATTTT+TGG + Chr1:63853136-63853155 None:intergenic 40.0%
! ATCAGGTTGTAGGAACAATG+GGG - Chr1:63855186-63855205 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
! CATCAGGTTGTAGGAACAAT+GGG - Chr1:63855185-63855204 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
! CTAAGGGTATGTTTGAATGC+AGG - Chr1:63854863-63854882 MsG0180003534.01.T01:CDS 40.0%
! GAGATCCCTAATATTTTGCG+AGG - Chr1:63856266-63856285 MsG0180003534.01.T01:CDS 40.0%
! GCCAACTAGTTTCACAAGAT+TGG + Chr1:63854261-63854280 None:intergenic 40.0%
! GTAAATACTCTCAGGTTGCT+AGG + Chr1:63853090-63853109 None:intergenic 40.0%
! TCATCAGGTTGTAGGAACAA+TGG - Chr1:63855184-63855203 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
! TGTGCTGATGATGATGAAAG+AGG - Chr1:63854284-63854303 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
! TTTTGGATCCTAGACTTGAG+AGG - Chr1:63855396-63855415 MsG0180003534.01.T01:intron 40.0%
!! CTAGGTCTTTGGGACAAATT+GGG + Chr1:63853072-63853091 None:intergenic 40.0%
!! GTGTGACTGTGTGTTACTTA+GGG - Chr1:63853914-63853933 MsG0180003534.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTGTGACTGTGTGTTACTT+AGG - Chr1:63853913-63853932 MsG0180003534.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGTTTGGTTCTGTGGTCA+TGG + Chr1:63853719-63853738 None:intergenic 40.0%
AACATACCTCCACGAGGAAA+TGG - Chr1:63854436-63854455 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
ACATGAGTTAACCCGTCAGA+TGG + Chr1:63854726-63854745 None:intergenic 45.0%
AGGTGTTTCCTCTCAAGTCT+AGG + Chr1:63855407-63855426 None:intergenic 45.0%
ATGGTGTTCCAAGCTTCTGT+TGG + Chr1:63854342-63854361 None:intergenic 45.0%
CATCATCTACGGAGACAAGA+AGG - Chr1:63852897-63852916 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CATTGTTAGGGGAGATGAAG+AGG + Chr1:63856008-63856027 None:intergenic 45.0%
CCTGAAAATCCATTTCCTCG+TGG + Chr1:63854448-63854467 None:intergenic 45.0%
CGAACAACTCTACTTATGGC+GGG - Chr1:63852962-63852981 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CTCATCTTAGGGCGATTCTT+TGG + Chr1:63855485-63855504 None:intergenic 45.0%
CTCTTTGTGATGTCCAAGGA+TGG + Chr1:63855948-63855967 None:intergenic 45.0%
CTGTACTAACTGTTTGTGGG+GGG - Chr1:63854603-63854622 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
CTTCGTATTGAAGACGTGTC+CGG - Chr1:63855796-63855815 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
GAAAATCCATTTCCTCGTGG+AGG + Chr1:63854445-63854464 None:intergenic 45.0%
GACAAGAAGGGTGATGCTAA+AGG - Chr1:63852910-63852929 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GAGCCTAATGCTAATGCATC+TGG - Chr1:63856182-63856201 MsG0180003534.01.T01:CDS 45.0%
GCTGAGGCTACACTATTCAA+GGG + Chr1:63855569-63855588 None:intergenic 45.0%
GCTGTACTAACTGTTTGTGG+GGG - Chr1:63854602-63854621 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
GGGAAATGCATTCCTCCTAA+GGG + Chr1:63853052-63853071 None:intergenic 45.0%
TCTATGAACTCATTACCGGC+AGG - Chr1:63855282-63855301 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
TCTTTCCTTTCGGCTTACAG+GGG - Chr1:63854186-63854205 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
TGAGCTCTTTGTGATGTCCA+AGG + Chr1:63855952-63855971 None:intergenic 45.0%
TGCCGGTAATGAGTTCATAG+AGG + Chr1:63855283-63855302 None:intergenic 45.0%
TGGGAAATGCATTCCTCCTA+AGG + Chr1:63853053-63853072 None:intergenic 45.0%
TGGTGTTCCAAGCTTCTGTT+GGG + Chr1:63854341-63854360 None:intergenic 45.0%
TGTAGAAACTCACCCCCTAA+AGG - Chr1:63854506-63854525 MsG0180003534.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTGATCGCGGGGATAAA+TGG + Chr1:63854361-63854380 None:intergenic 45.0%
! CTTACAGGGGCATAAGGAAT+GGG - Chr1:63854199-63854218 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
! TCTCAGGTTGCTAGGTCTTT+GGG + Chr1:63853082-63853101 None:intergenic 45.0%
! TTGGTGGCTGATTTCAGTTC+AGG + Chr1:63853117-63853136 None:intergenic 45.0%
!! AGAAATGGTGGATCGGATTG+TGG - Chr1:63855514-63855533 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
!! AGAGCGACCGAAATTTTTGG+TGG + Chr1:63853133-63853152 None:intergenic 45.0%
!! ATTCGGATGGAGGGTTTTGA+AGG + Chr1:63854998-63855017 None:intergenic 45.0%
!! CCACGAGGAAATGGATTTTC+AGG - Chr1:63854445-63854464 MsG0180003534.01.T01:intron 45.0%
!! GCTAGGTCTTTGGGACAAAT+TGG + Chr1:63853073-63853092 None:intergenic 45.0%
!! GTTTTTGGGCCGACTTTAAG+AGG + Chr1:63855427-63855446 None:intergenic 45.0%
!!! TTCGGATGGAGGGTTTTGAA+GGG + Chr1:63854997-63855016 None:intergenic 45.0%
AAACTCCTCTCCCATGGAAC+AGG - Chr1:63854378-63854397 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
AAGGGAGTCGGAACTGTTGT+CGG + Chr1:63853034-63853053 None:intergenic 50.0%
ACAACAGTTCCGACTCCCTT+AGG - Chr1:63853034-63853053 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
ATATCCTTCTGGACGAGCAG+TGG - Chr1:63854661-63854680 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
CAAGATTGGGACCATCTGAC+GGG - Chr1:63854712-63854731 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
CTCACCCCCTAAAGGAAGTT+AGG - Chr1:63854514-63854533 MsG0180003534.01.T01:CDS 50.0%
CTCATGTCTCAACAGCGGTA+TGG - Chr1:63854739-63854758 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
GACATGACGTTGACACACGT+GGG - Chr1:63855847-63855866 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
GAGGCTACACTATTCAAGGG+TGG + Chr1:63855566-63855585 None:intergenic 50.0%
GATCAGAAACTCCTCTCCCA+TGG - Chr1:63854372-63854391 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
GCAAGATTGGGACCATCTGA+CGG - Chr1:63854711-63854730 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
GCACGATTGCTACACCAGAT+AGG - Chr1:63853854-63853873 MsG0180003534.01.T01:CDS 50.0%
GGATCGGATTGTGGAGTCTT+CGG - Chr1:63855523-63855542 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
GGATTCGGGTGTGTCTACAA+GGG - Chr1:63853171-63853190 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GGCTGAGGCTACACTATTCA+AGG + Chr1:63855570-63855589 None:intergenic 50.0%
GGGAGTGACATGAGAAGAAC+TGG - Chr1:63852982-63853001 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TGACATGACGTTGACACACG+TGG - Chr1:63855846-63855865 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
TGCATTCCTCCTAAGGGAGT+CGG + Chr1:63853046-63853065 None:intergenic 50.0%
TGGATTCGGGTGTGTCTACA+AGG - Chr1:63853170-63853189 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TTATGCCCCTGTAAGCCGAA+AGG + Chr1:63854194-63854213 None:intergenic 50.0%
TTCGGTCGCTCTGTTATGCT+TGG - Chr1:63853141-63853160 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
! AAGAGGAATCCAGCGGCTTT+TGG - Chr1:63854301-63854320 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
! CTCTCAGGTTGCTAGGTCTT+TGG + Chr1:63853083-63853102 None:intergenic 50.0%
! GCTTACAGGGGCATAAGGAA+TGG - Chr1:63854198-63854217 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
! TTTCGGCTTACAGGGGCATA+AGG - Chr1:63854193-63854212 MsG0180003534.01.T01:intron 50.0%
!! CACCAAGAAGTGTCAGACTC+CGG + Chr1:63855818-63855837 None:intergenic 50.0%
AAAGGGTGAGCAGCAGCTGT+TGG - Chr1:63855328-63855347 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
AACAGCTGCTGCTCACCCTT+TGG + Chr1:63855329-63855348 None:intergenic 55.0%
ACAGCTGCTGCTCACCCTTT+GGG + Chr1:63855328-63855347 None:intergenic 55.0%
ACAGTTCCGACTCCCTTAGG+AGG - Chr1:63853037-63853056 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
AGCCTCAGCCGATGATTCTC+AGG - Chr1:63855580-63855599 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
AGTCTCCTGTTCCATGGGAG+AGG + Chr1:63854386-63854405 None:intergenic 55.0%
ATAGCCCAAGATGCTGCTCG+CGG - Chr1:63854410-63854429 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
CATTCCACTGCTCGTCCAGA+AGG + Chr1:63854668-63854687 None:intergenic 55.0%
CGCTCTGTTATGCTTGGCGA+GGG - Chr1:63853147-63853166 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CGGCTTAACATACCTCCACG+AGG - Chr1:63854430-63854449 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
GAGAGGAGTTTCTGATCGCG+GGG + Chr1:63854369-63854388 None:intergenic 55.0%
GGAGAGGAGTTTCTGATCGC+GGG + Chr1:63854370-63854389 None:intergenic 55.0%
GGGAGAGGAGTTTCTGATCG+CGG + Chr1:63854371-63854390 None:intergenic 55.0%
GTCCGGAGTCTGACACTTCT+TGG - Chr1:63855813-63855832 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
GTGAGCAGCAGCTGTTGGAA+TGG - Chr1:63855333-63855352 MsG0180003534.01.T01:intron 55.0%
TAAGCCGCGAGCAGCATCTT+GGG + Chr1:63854417-63854436 None:intergenic 55.0%
TCGATCTAAAGGACGCCTGC+CGG + Chr1:63855300-63855319 None:intergenic 55.0%
TCGCTCTGTTATGCTTGGCG+AGG - Chr1:63853146-63853165 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
TCTGTTATGCTTGGCGAGGG+TGG - Chr1:63853150-63853169 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
TTAAGCCGCGAGCAGCATCT+TGG + Chr1:63854418-63854437 None:intergenic 55.0%
! ATGCTTGGCGAGGGTGGATT+CGG - Chr1:63853156-63853175 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
! GTCCTGAGAATCATCGGCTG+AGG + Chr1:63855585-63855604 None:intergenic 55.0%
! TGCTTGGCGAGGGTGGATTC+GGG - Chr1:63853157-63853176 MsG0180003534.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 63852877 63856352 63852877 ID=MsG0180003534.01;Name=MsG0180003534.01
Chr1 mRNA 63852877 63856352 63852877 ID=MsG0180003534.01.T01;Parent=MsG0180003534.01;Name=MsG0180003534.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.30;_QI=0|0.66|0.75|1|1|1|4|655|435
Chr1 exon 63852877 63854038 63852877 ID=MsG0180003534.01.T01:exon:23713;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 exon 63854474 63854596 63854474 ID=MsG0180003534.01.T01:exon:23712;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 exon 63854763 63855023 63854763 ID=MsG0180003534.01.T01:exon:23711;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 exon 63855936 63856352 63855936 ID=MsG0180003534.01.T01:exon:23710;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 CDS 63855936 63856352 63855936 ID=MsG0180003534.01.T01:cds;Parent=MsG0180003534.01.T01
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Chr1 CDS 63854474 63854596 63854474 ID=MsG0180003534.01.T01:cds;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 CDS 63853532 63854038 63853532 ID=MsG0180003534.01.T01:cds;Parent=MsG0180003534.01.T01
Chr1 three_prime_UTR 63852877 63853531 63852877 ID=MsG0180003534.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0180003534.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003534.01.T01

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Protein sequence

>MsG0180003534.01.T01

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