AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003635.01

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MsG0180003635.01.T01 AT2G33680 30.450 555 347 5 1 555 265 780 1.69e-85 282
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MsG0180003635.01.T01 AT2G44880 30.866 554 335 7 1 554 89 594 3.63e-84 274
MsG0180003635.01.T01 AT2G44880 30.866 554 335 7 1 554 91 596 3.65e-84 274
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MsG0180003635.01.T01 AT1G17630 25.250 400 265 11 19 400 42 425 4.86e-27 116
MsG0180003635.01.T01 AT1G17630 24.390 287 187 10 241 506 12 289 4.74e-11 66.2
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MsG0180003635.01.T01 AT2G42920 33.131 495 327 3 52 545 39 530 9.56e-84 271
MsG0180003635.01.T01 AT2G42920 29.515 227 148 6 1 224 229 446 2.18e-17 85.9
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MsG0180003635.01.T01 AT3G22150 24.813 536 343 14 29 557 210 692 4.39e-33 135
MsG0180003635.01.T01 AT3G22150 22.677 538 325 17 1 490 76 570 1.15e-24 109
MsG0180003635.01.T01 AT3G22150 21.472 489 281 14 81 515 50 489 5.18e-17 85.1
MsG0180003635.01.T01 AT4G33990 30.667 525 326 5 32 555 239 726 4.09e-82 273
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MsG0180003635.01.T01 AT4G33990 30.667 525 326 5 32 555 246 733 5.39e-82 273
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MsG0180003635.01.T01 AT3G14330 30.722 485 290 6 53 527 143 591 5.94e-82 271
MsG0180003635.01.T01 AT3G14330 29.958 237 158 3 1 237 207 435 2.83e-26 114
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MsG0180003635.01.T01 AT1G56690 23.478 460 285 11 82 503 29 459 8.58e-21 97.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G56690 23.054 334 230 7 177 508 20 328 1.60e-17 86.7
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MsG0180003635.01.T01 AT5G19020 26.130 509 291 12 69 502 106 604 7.03e-40 154
MsG0180003635.01.T01 AT5G19020 25.660 265 190 3 144 408 46 303 1.02e-26 115
MsG0180003635.01.T01 AT5G06540 31.226 522 346 4 41 554 15 531 1.33e-81 268
MsG0180003635.01.T01 AT5G42450 31.187 497 319 8 62 542 12 501 1.36e-81 265
MsG0180003635.01.T01 AT5G42450 29.528 254 140 7 29 247 89 338 4.54e-23 103
MsG0180003635.01.T01 AT1G03510 33.493 418 270 5 101 515 12 424 1.37e-81 262
MsG0180003635.01.T01 AT1G03510 27.670 206 119 2 57 232 70 275 4.73e-19 90.1
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MsG0180003635.01.T01 AT1G56570 24.084 382 251 7 76 456 51 394 3.95e-33 134
MsG0180003635.01.T01 AT1G56570 24.400 250 184 4 202 450 42 287 1.72e-12 70.5
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MsG0180003635.01.T01 AT3G63370 24.522 314 191 10 145 451 86 360 5.72e-21 97.8
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MsG0180003635.01.T01 AT4G33170 27.600 250 131 6 134 377 44 249 5.98e-17 85.1
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MsG0180003635.01.T01 AT4G14050 23.137 255 160 3 146 400 10 228 2.02e-15 79.7
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MsG0180003635.01.T01 AT3G63370 28.529 333 189 7 76 395 122 418 1.47e-31 130
MsG0180003635.01.T01 AT3G63370 24.522 314 191 10 145 451 86 360 4.42e-21 98.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G77010 30.337 534 327 5 13 515 173 692 1.23e-77 259
MsG0180003635.01.T01 AT1G77010 25.249 503 285 8 74 502 128 613 4.30e-41 158
MsG0180003635.01.T01 AT1G77010 25.108 462 276 14 55 507 46 446 4.15e-27 116
MsG0180003635.01.T01 AT1G77010 27.985 268 151 5 1 236 290 547 2.59e-26 114
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 30.060 499 318 4 69 538 207 703 1.39e-77 259
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 21.814 408 279 8 74 453 54 449 6.47e-20 94.4
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 30.542 203 128 6 1 200 409 601 1.61e-17 86.7
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MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 30.060 499 318 4 69 538 207 703 1.39e-77 259
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 21.814 408 279 8 74 453 54 449 6.47e-20 94.4
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 30.542 203 128 6 1 200 409 601 1.61e-17 86.7
MsG0180003635.01.T01 AT1G53600 23.618 398 221 11 172 502 48 429 9.21e-16 81.3
MsG0180003635.01.T01 AT3G05240 29.944 531 314 9 1 518 78 563 1.46e-77 255
MsG0180003635.01.T01 AT3G05240 27.129 505 266 15 89 542 60 513 2.07e-39 152
MsG0180003635.01.T01 AT5G50390 29.492 512 321 5 52 559 140 615 3.04e-77 258
MsG0180003635.01.T01 AT4G16835 30.584 497 298 5 69 564 123 573 5.35e-77 256
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MsG0180003635.01.T01 AT2G03880 28.803 493 304 7 72 558 98 549 6.26e-77 256
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MsG0180003635.01.T01 AT1G74630 26.522 230 158 6 1 227 255 476 5.91e-14 75.5
MsG0180003635.01.T01 AT4G21065 30.864 405 246 3 154 557 3 374 1.19e-73 242
MsG0180003635.01.T01 AT4G21065 29.503 322 188 8 54 373 7 291 2.82e-33 132
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MsG0180003635.01.T01 AT4G22760 22.022 277 199 7 227 502 60 320 8.67e-16 80.9
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MsG0180003635.01.T01 AT1G33350 28.457 499 351 4 55 548 41 538 6.92e-73 242
MsG0180003635.01.T01 AT3G20730 30.452 509 311 8 1 506 85 553 3.05e-72 241
MsG0180003635.01.T01 AT3G20730 25.112 223 134 2 161 383 35 224 1.22e-14 77.4
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MsG0180003635.01.T01 AT2G04860 25.859 495 295 11 27 456 42 529 6.58e-41 157
MsG0180003635.01.T01 AT2G02750 29.399 466 317 6 56 514 150 610 1.32e-71 241
MsG0180003635.01.T01 AT2G02750 26.036 507 281 15 30 508 28 468 1.83e-40 155
MsG0180003635.01.T01 AT2G02750 24.551 334 206 7 4 295 200 529 1.33e-18 90.1
MsG0180003635.01.T01 AT3G18840 28.219 567 364 9 12 542 104 663 5.28e-71 241
MsG0180003635.01.T01 AT3G18840 28.219 567 364 9 12 542 104 663 5.28e-71 241
MsG0180003635.01.T01 AT1G34160 28.598 535 330 9 36 560 1 493 7.61e-71 238
MsG0180003635.01.T01 AT1G34160 28.235 255 154 5 2 236 59 304 6.52e-25 109
MsG0180003635.01.T01 AT4G20770 27.991 468 299 6 51 515 329 761 8.19e-71 242
MsG0180003635.01.T01 AT4G20770 26.327 471 278 7 50 485 21 457 2.49e-41 159
MsG0180003635.01.T01 AT4G20770 23.632 402 251 12 1 395 387 739 9.26e-24 106
MsG0180003635.01.T01 AT2G41080 28.777 556 324 8 34 554 41 559 8.95e-71 239
MsG0180003635.01.T01 AT2G41080 25.428 409 257 9 135 502 40 441 4.94e-31 128
MsG0180003635.01.T01 AT2G33760 29.537 518 324 7 52 564 23 504 1.58e-70 237
MsG0180003635.01.T01 AT2G33760 32.364 275 167 6 2 264 78 345 1.32e-39 152
MsG0180003635.01.T01 AT4G16470 33.498 406 237 3 134 539 103 475 2.24e-70 235
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MsG0180003635.01.T01 AT2G36730 30.769 507 305 8 43 543 20 486 5.93e-70 234
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MsG0180003635.01.T01 AT5G40405 28.358 268 155 5 1 237 77 338 2.01e-26 114
MsG0180003635.01.T01 AT5G46460 27.730 577 352 10 1 554 72 606 7.52e-67 230
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MsG0180003635.01.T01 AT4G19220 25.444 338 211 5 52 385 104 404 1.71e-25 112
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MsG0180003635.01.T01 AT3G50420 23.988 321 206 6 74 388 26 314 1.07e-22 103
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MsG0180003635.01.T01 AT1G59720 30.321 343 180 11 30 359 148 444 3.38e-31 129
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MsG0180003635.01.T01 AT3G61170 25.536 466 275 8 74 503 63 492 1.89e-35 142
MsG0180003635.01.T01 AT1G09220 33.239 352 230 4 169 516 153 503 2.64e-61 211
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MsG0180003635.01.T01 AT4G18840 28.032 503 281 6 1 502 111 533 1.39e-60 210
MsG0180003635.01.T01 AT4G18840 22.196 419 231 13 221 559 90 493 2.42e-14 76.3
MsG0180003635.01.T01 AT4G18840 28.032 503 281 6 1 502 111 533 1.39e-60 210
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MsG0180003635.01.T01 AT5G43790 28.151 476 288 10 52 514 23 457 2.56e-60 207
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MsG0180003635.01.T01 AT1G77170 29.012 324 212 7 13 330 100 411 5.00e-36 140
MsG0180003635.01.T01 AT4G08210 27.459 488 312 7 32 516 237 685 8.87e-60 211
MsG0180003635.01.T01 AT4G08210 26.551 403 265 7 51 439 21 406 1.21e-36 145
MsG0180003635.01.T01 AT4G08210 21.913 575 331 14 1 502 77 606 5.30e-28 119
MsG0180003635.01.T01 AT4G08210 30.622 209 134 6 8 213 420 620 7.33e-18 87.8
MsG0180003635.01.T01 AT1G26900 28.778 483 301 7 18 496 110 553 2.85e-59 207
MsG0180003635.01.T01 AT1G26900 24.057 424 274 8 86 502 75 457 1.03e-25 111
MsG0180003635.01.T01 AT3G28660 27.220 518 331 9 41 545 12 496 4.28e-59 205
MsG0180003635.01.T01 AT3G28660 31.081 222 146 4 14 233 97 313 8.28e-27 114
MsG0180003635.01.T01 AT3G28660 27.523 218 145 6 4 219 192 398 1.31e-13 73.9
MsG0180003635.01.T01 AT4G31070 29.025 472 289 8 52 517 177 608 8.85e-59 207
MsG0180003635.01.T01 AT4G31070 25.801 562 327 15 6 522 32 548 5.71e-42 160
MsG0180003635.01.T01 AT4G31070 29.025 472 289 8 52 517 177 608 8.85e-59 207
MsG0180003635.01.T01 AT4G31070 25.801 562 327 15 6 522 32 548 5.71e-42 160
MsG0180003635.01.T01 AT3G58590 28.665 457 309 9 2 456 287 728 6.29e-58 206
MsG0180003635.01.T01 AT3G58590 24.615 455 266 11 54 507 234 612 6.08e-31 128
MsG0180003635.01.T01 AT3G58590 24.433 397 249 9 59 451 42 391 2.17e-24 108
MsG0180003635.01.T01 AT3G28640 27.027 518 332 8 41 545 12 496 7.68e-58 201
MsG0180003635.01.T01 AT2G37320 29.056 413 258 4 138 549 119 497 9.12e-58 201
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MsG0180003635.01.T01 AT1G71420 27.065 569 349 15 1 555 133 649 9.19e-58 206
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MsG0180003635.01.T01 AT1G22960 24.324 518 360 14 4 502 177 681 6.98e-28 119
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MsG0180003635.01.T01 AT1G22960 22.778 360 225 9 65 376 338 692 3.94e-14 75.9
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MsG0180003635.01.T01 AT5G39710 21.648 522 331 14 21 507 193 671 4.61e-27 116
MsG0180003635.01.T01 AT5G39710 23.869 398 275 10 131 507 161 551 2.39e-23 105
MsG0180003635.01.T01 AT5G39710 21.716 373 256 7 51 392 326 693 5.11e-16 82.0
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MsG0180003635.01.T01 AT1G62910 24.561 285 191 8 12 283 275 548 4.07e-17 85.1
MsG0180003635.01.T01 AT3G22470 22.177 487 305 11 12 436 52 526 4.45e-26 113
MsG0180003635.01.T01 AT5G02860 22.863 468 302 13 1 436 355 795 1.11e-25 112
MsG0180003635.01.T01 AT5G02860 22.532 466 329 12 65 507 274 730 1.23e-19 93.6
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MsG0180003635.01.T01 AT3G09060 22.829 403 258 11 69 422 289 687 8.83e-15 78.2
MsG0180003635.01.T01 AT5G28370 22.139 402 257 9 69 449 328 694 8.99e-16 81.3
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MsG0180003635.01.T01 AT1G30290 21.008 357 256 9 100 439 206 553 1.13e-12 71.2
MsG0180003635.01.T01 AT5G57250 23.529 408 263 13 130 507 125 513 2.00e-15 80.5
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MsG0180003635.01.T01 AT3G53170 21.930 342 193 8 69 402 214 489 5.63e-15 78.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G79080 20.650 431 304 9 65 468 136 555 6.39e-15 78.2
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MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 20.954 482 315 15 29 458 143 610 4.25e-14 75.9
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MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 20.758 501 297 14 62 509 139 592 8.88e-13 71.6
MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 22.050 322 220 8 137 436 110 422 9.38e-15 78.2
MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 20.954 482 315 15 29 458 143 610 4.25e-14 75.9
MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 22.348 443 262 11 25 393 353 787 1.81e-13 73.9
MsG0180003635.01.T01 AT2G17140 20.758 501 297 14 62 509 139 592 8.88e-13 71.6
MsG0180003635.01.T01 AT2G18940 22.785 395 274 9 51 424 191 575 1.68e-14 77.4
MsG0180003635.01.T01 AT2G18940 20.524 458 307 14 64 503 380 798 1.80e-14 77.0
MsG0180003635.01.T01 AT3G49730 25.424 295 198 10 228 506 119 407 1.68e-14 77.0
MsG0180003635.01.T01 AT3G49730 22.396 384 249 13 29 381 198 563 3.62e-13 72.8
MsG0180003635.01.T01 AT3G49730 22.222 396 260 11 104 462 120 504 2.44e-12 70.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G13630 23.250 400 233 10 61 391 348 742 4.21e-14 75.9
MsG0180003635.01.T01 AT1G13630 21.016 433 284 11 92 507 178 569 7.93e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G13630 23.056 373 264 7 70 425 222 588 1.80e-12 70.9
MsG0180003635.01.T01 AT1G63230 23.729 236 159 6 44 262 81 312 4.25e-14 73.9
MsG0180003635.01.T01 AT3G22670 25.974 231 155 7 11 233 219 441 5.37e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT3G22670 22.963 270 162 8 178 436 170 404 2.39e-12 70.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 23.313 326 199 9 234 515 189 507 5.74e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 24.345 267 184 6 12 266 205 465 2.98e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 23.313 326 199 9 234 515 189 507 5.74e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 24.345 267 184 6 12 266 205 465 2.98e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 23.313 326 199 9 234 515 189 507 5.74e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 24.345 267 184 6 12 266 205 465 2.98e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 23.313 326 199 9 234 515 189 507 5.74e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G16420 24.345 267 184 6 12 266 205 465 2.98e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G50280 23.058 399 283 9 45 425 283 675 7.22e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G50280 22.564 390 258 14 99 463 271 641 1.13e-13 74.7
MsG0180003635.01.T01 AT1G13800 19.747 395 290 8 64 448 495 872 8.39e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G13800 21.795 390 272 10 81 450 302 678 1.56e-11 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT1G13800 19.747 395 290 8 64 448 495 872 8.39e-14 75.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G13800 21.795 390 272 10 81 450 302 678 1.56e-11 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT2G34370 27.206 136 98 1 330 464 165 300 8.49e-14 74.3
MsG0180003635.01.T01 AT4G26800 22.995 374 245 9 65 429 8 347 1.00e-13 73.6
MsG0180003635.01.T01 AT4G26800 23.867 331 199 11 169 449 8 335 1.16e-11 67.0
MsG0180003635.01.T01 AT4G26800 23.431 239 139 5 64 258 77 315 6.19e-11 64.7
MsG0180003635.01.T01 AT5G28460 24.000 250 171 6 65 300 506 750 1.17e-13 74.7
MsG0180003635.01.T01 AT5G46680 24.834 302 185 10 2 280 89 371 1.30e-13 73.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G46680 21.727 359 250 12 100 439 47 393 1.63e-13 73.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G62370 19.957 466 310 13 64 510 336 757 1.76e-13 74.3
MsG0180003635.01.T01 AT1G79490 22.909 275 189 8 178 436 247 514 5.94e-13 72.4
MsG0180003635.01.T01 AT3G60050 25.926 270 154 8 19 280 205 436 6.32e-13 71.6
MsG0180003635.01.T01 AT3G60050 25.926 270 154 8 19 280 205 436 6.32e-13 71.6
MsG0180003635.01.T01 AT3G53170 22.619 252 171 6 69 300 214 461 9.46e-13 70.9
MsG0180003635.01.T01 AT3G16710 21.891 402 267 9 11 403 64 427 1.11e-12 70.9
MsG0180003635.01.T01 AT3G16710 22.581 279 205 5 234 504 151 426 1.22e-11 67.4
MsG0180003635.01.T01 AT3G16710 22.843 197 137 4 64 248 252 445 1.88e-11 67.0
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.761 268 192 5 168 423 388 652 1.24e-12 71.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.768 224 158 4 65 276 424 644 4.69e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.761 268 192 5 168 423 388 652 1.24e-12 71.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.768 224 158 4 65 276 424 644 4.69e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.761 268 192 5 168 423 388 652 1.24e-12 71.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.768 224 158 4 65 276 424 644 4.69e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.761 268 192 5 168 423 388 652 1.24e-12 71.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74750 22.768 224 158 4 65 276 424 644 4.69e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT4G20090 20.290 414 307 10 86 480 132 541 3.54e-12 69.7
MsG0180003635.01.T01 AT4G20090 21.649 485 334 18 7 463 160 626 1.35e-11 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT4G20090 20.290 414 307 10 86 480 132 541 3.54e-12 69.7
MsG0180003635.01.T01 AT4G20090 21.649 485 334 18 7 463 160 626 1.35e-11 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT2G37230 22.139 402 273 12 64 436 179 569 3.82e-12 69.7
MsG0180003635.01.T01 AT1G10910 22.131 366 209 13 152 507 144 443 5.99e-12 68.9
MsG0180003635.01.T01 AT1G77340 27.092 251 165 7 29 267 151 395 7.01e-12 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT1G10910 20.056 359 255 9 152 496 144 484 8.11e-12 68.6
MsG0180003635.01.T01 AT5G46100 31.092 238 135 13 64 280 186 415 8.40e-12 68.2
MsG0180003635.01.T01 AT5G06400 21.134 388 248 8 65 436 184 529 1.37e-11 68.2
MsG0180003635.01.T01 AT4G16390 21.479 284 206 6 173 441 174 455 1.45e-11 67.8
MsG0180003635.01.T01 AT4G16390 25.000 276 177 11 26 283 203 466 2.30e-11 67.0
MsG0180003635.01.T01 AT4G16390 20.772 337 248 7 99 422 173 503 6.44e-11 65.9
MsG0180003635.01.T01 AT5G18475 20.000 300 205 5 169 461 191 462 1.48e-11 67.4
MsG0180003635.01.T01 AT3G02650 27.404 208 134 5 76 269 342 546 2.09e-11 67.0
MsG0180003635.01.T01 AT4G20740 22.701 348 241 9 65 393 223 561 2.43e-11 67.0
MsG0180003635.01.T01 AT1G26500 26.471 238 158 7 35 262 148 378 2.65e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT4G30825 21.723 267 185 7 28 280 624 880 3.61e-11 66.6
MsG0180003635.01.T01 AT3G13150 27.686 242 143 9 80 301 132 361 4.41e-11 65.9
MsG0180003635.01.T01 AT3G46610 20.798 351 225 11 125 456 331 647 4.45e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT3G46610 20.798 351 225 11 125 456 331 647 4.45e-11 66.2
MsG0180003635.01.T01 AT1G74900 22.845 232 161 6 65 284 156 381 5.29e-11 65.5
MsG0180003635.01.T01 AT3G59040 19.303 373 279 8 76 432 152 518 5.41e-11 65.9
MsG0180003635.01.T01 AT3G59040 21.284 296 213 9 180 459 152 443 6.72e-11 65.5
MsG0180003635.01.T01 AT3G59040 19.303 373 279 8 76 432 145 511 6.21e-11 65.5
MsG0180003635.01.T01 AT3G59040 21.284 296 213 9 180 459 145 436 9.51e-11 65.1
MsG0180003635.01.T01 AT5G65820 22.420 281 199 8 236 504 147 420 7.67e-11 65.5
MsG0180003635.01.T01 AT5G65820 22.047 381 250 11 30 381 215 577 8.97e-11 65.1
MsG0180003635.01.T01 AT1G20300 23.390 295 203 7 1 283 192 475 7.74e-11 65.1

Find 135 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 144 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTGAATGGAGCTTCTATTTA+TGG 0.132089 1:-65533966 MsG0180003635.01.T01:CDS
ACTTTAGCAGTTGGCTTAAA+TGG 0.164046 1:+65534002 None:intergenic
CAGTCGAAGGATCTTTCTTT+TGG 0.207859 1:-65534860 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATTTCTGGGTATATGATTAA+TGG 0.215025 1:-65534677 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGTTATAGGTCGATTATTTC+TGG 0.221849 1:-65534692 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTTGATACTTATGCAAAGTT+AGG 0.225007 1:-65534368 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAAGTACGAGCTTGATAATT+TGG 0.229039 1:-65534307 MsG0180003635.01.T01:CDS
CAGTTGCCACGTATATATTT+TGG 0.255776 1:+65534396 None:intergenic
TTGACAGCTTGTGCTCATTC+CGG 0.283015 1:-65534170 MsG0180003635.01.T01:CDS
TACAGGGAATTACATAATTA+TGG 0.299070 1:-65533886 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGGAAGAAGCTCTTAGGATT+AGG 0.308338 1:-65533836 MsG0180003635.01.T01:CDS
AACACAGAAGTCAATGTAAC+TGG 0.314950 1:+65534191 None:intergenic
TAAGCCAACTGCTAAAGTTT+GGG 0.315385 1:-65533997 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTAGAAAGTGTGACAACATT+TGG 0.318987 1:+65534500 None:intergenic
TGACAGCTTGTGCTCATTCC+GGG 0.321570 1:-65534169 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAAGTTAGGGTTTATTCATT+TGG 0.322391 1:-65534354 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTAAGCCAACTGCTAAAGTT+TGG 0.322773 1:-65533998 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGAAAGATGAGGTAAGTTAT+AGG 0.332380 1:-65534706 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTTCTGGGTATATGATTAAT+GGG 0.333294 1:-65534676 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATTTATGGCAACGTTGAAAT+CGG 0.347360 1:-65533951 MsG0180003635.01.T01:CDS
TAACCAGTTTGAACGAGCTT+TGG 0.355907 1:-65534564 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGCGTCGTTGAAGAGGGATT+TGG 0.362076 1:+65535291 None:intergenic
GTATGCAAAATGTGGAAGTT+TGG 0.367936 1:-65534762 MsG0180003635.01.T01:CDS
TCGTGAGTTGTTTGATGAAA+TGG 0.370936 1:-65534732 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAGAAACAAACGACGCGAAT+AGG 0.376298 1:+65535263 None:intergenic
GGAGATGGGAAGAAGCTCTT+AGG 0.376501 1:-65533842 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTTTGAACGAGCTTTGGATT+TGG 0.382444 1:-65534558 MsG0180003635.01.T01:CDS
GATTAATGGGTTTGTCGATA+AGG 0.387468 1:-65534663 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAGTTTGTATTTGAAGATGT+TGG 0.388718 1:-65534948 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAAACCCTGGATTGAGTACT+TGG 0.402974 1:-65534616 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGTTGGTCACATGTTATTGT+AGG 0.407887 1:-65535087 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGAAGAAGCTCTTAGGATTA+GGG 0.413356 1:-65533835 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTTAGAGAGATGCCGGGGTT+TGG 0.421600 1:-65534536 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATGTAATTCCCTGTATGTTC+AGG 0.425212 1:+65533894 None:intergenic
GCAAATTTGTATTCACGTGC+TGG 0.431910 1:-65533864 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTTATAGGTCGATTATTTCT+GGG 0.432082 1:-65534691 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGTTGGGTTTGGAAGGGAAA+GGG 0.433463 1:-65534931 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAACTGGGTTGCAGAAGATC+CGG 0.433717 1:-65533800 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGTATTCACGTGCTGGGAGA+TGG 0.434267 1:-65533857 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTAGTCATAGTAAAGTTATC+AGG 0.436799 1:+65535220 None:intergenic
TTGATACTTATGCAAAGTTA+GGG 0.441511 1:-65534367 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAGATTGAGCCTGAACATAC+AGG 0.443028 1:-65533903 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGTTTGTATTTGAAGATGTT+GGG 0.444388 1:-65534947 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTTGGTTTGATGAGGGAAGA+AGG 0.445113 1:-65533675 MsG0180003635.01.T01:CDS
TCGTATTTCTCAAACCTTCG+AGG 0.445977 1:-65534461 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTGAAGATGTTGGGTTTGGA+AGG 0.446829 1:-65534938 MsG0180003635.01.T01:CDS
GCACTGCTGGAAGGGTTGCT+TGG 0.447658 1:-65533693 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGATGAGATTTATGCACTGC+TGG 0.447996 1:-65533706 MsG0180003635.01.T01:CDS
AATCCAAAGCTCGTTCAAAC+TGG 0.448702 1:+65534561 None:intergenic
TTTATGGCAACGTTGAAATC+GGG 0.455563 1:-65533950 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAATGATGTGATTCCTGGTA+TGG 0.457266 1:-65534594 MsG0180003635.01.T01:CDS
CATTTCATTTGACATATCCT+TGG 0.458116 1:+65533731 None:intergenic
GTTTATTCATTTGGCAAGGT+GGG 0.462063 1:-65534345 MsG0180003635.01.T01:CDS
ACTTGGAATGATGTGATTCC+TGG 0.462577 1:-65534599 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGATTTGGTTAGAGAGATGC+CGG 0.464979 1:-65534543 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAAGTCAATGTAACTGGGTC+AGG 0.470973 1:+65534197 None:intergenic
CTACCAATCGTAACAGCATT+CGG 0.473604 1:+65534902 None:intergenic
CATCGTTCTGTGAAGGATGA+TGG 0.476533 1:-65534827 MsG0180003635.01.T01:CDS
AACTGGGTTGCAGAAGATCC+GGG 0.477407 1:-65533799 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAAGTCCTCTATCTAACATC+TGG 0.477917 1:+65534222 None:intergenic
ATATATCTTGCAAGAAGAGT+TGG 0.478313 1:-65533652 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTATTTGAAGATGTTGGGTT+TGG 0.479533 1:-65534942 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGTGAGTTGTTTGATGAAAT+GGG 0.480462 1:-65534731 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATATATGCTTATGCTTCTCA+TGG 0.486763 1:-65534275 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGCTAAGCGCGTCGTTGAAG+AGG 0.486789 1:+65535284 None:intergenic
TGAAGATGTTGGGTTTGGAA+GGG 0.487495 1:-65534937 MsG0180003635.01.T01:CDS
CATGTTATTGTAGGTGTGGT+AGG 0.491061 1:-65535078 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAGCACTATGCCTGCATGGT+TGG 0.491095 1:-65534080 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTTTGGGGCGCTCTGCTGAA+TGG 0.498674 1:-65533981 MsG0180003635.01.T01:CDS
CCGGGCTGGTGAATGAAGCT+TGG 0.499444 1:-65534151 MsG0180003635.01.T01:CDS
GCGCCCCAAACTTTAGCAGT+TGG 0.500428 1:+65533993 None:intergenic
GTTGGTGTTCTTAGTCGAGC+TGG 0.504179 1:-65534062 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTTATTATGCTTTATTGCCA+AGG 0.505586 1:-65533748 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGTTTATTCATTTGGCAAGG+TGG 0.507683 1:-65534346 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGCTTGTGCTCATTCCGGGC+TGG 0.508514 1:-65534165 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGGGCTGGTGAATGAAGCTT+GGG 0.509679 1:-65534150 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGTATTTCTCAAACCTTCGA+GGG 0.510231 1:-65534460 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTGCCGAATGCTGTTACGAT+TGG 0.511003 1:-65534905 MsG0180003635.01.T01:CDS
TCATTCCAAGTACTCAATCC+AGG 0.514065 1:+65534611 None:intergenic
TATAACCAGATGTTAGATAG+AGG 0.519701 1:-65534227 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTATTCACGTGCTGGGAGAT+GGG 0.521678 1:-65533856 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGAAGATCCGGGGAAGTAGT+TGG 0.523411 1:-65533788 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGGGTTGCTTGGTTTGATGA+GGG 0.523768 1:-65533682 MsG0180003635.01.T01:CDS
TCTTAGGATTAGGGAAAAGA+TGG 0.524572 1:-65533826 MsG0180003635.01.T01:CDS
GCTAAGCGCGTCGTTGAAGA+GGG 0.527246 1:+65535285 None:intergenic
AATGCGATGCCTTCAAAACA+TGG 0.528815 1:-65534119 MsG0180003635.01.T01:CDS
CAGGCATAGTGCTCCACCAC+AGG 0.550397 1:+65534089 None:intergenic
GTCACATGTTATTGTAGGTG+TGG 0.551628 1:-65535082 MsG0180003635.01.T01:CDS
TAGGATAGACATTGCGAGGA+AGG 0.553968 1:-65535059 MsG0180003635.01.T01:CDS
GCACCTCTTTCAGCCCTCGA+AGG 0.556072 1:+65534447 None:intergenic
GGAAGTATAAGCAATGATCA+TGG 0.558823 1:+65535312 None:intergenic
CAAATTTGTATTCACGTGCT+GGG 0.559022 1:-65533863 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAGGGTTGCTTGGTTTGATG+AGG 0.559036 1:-65533683 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGTTTGCGTTCTTAACGCGT+TGG 0.559251 1:-65535104 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGTAGTTGGATTAAAACTAG+TGG 0.567960 1:-65533774 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGGTTATTCTGAACCATACC+AGG 0.568718 1:+65534581 None:intergenic
TAGGGTTTATTCATTTGGCA+AGG 0.569164 1:-65534349 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAGCCAACTGCTAAAGTTTG+GGG 0.569743 1:-65533996 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAGATTTATGCACTGCTGGA+AGG 0.572938 1:-65533702 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAACCTTCGAGGGCTGAAAG+AGG 0.573182 1:-65534450 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGTGGAGCACTATGCCTGCA+TGG 0.575107 1:-65534084 MsG0180003635.01.T01:CDS
CTTTGCATAAGTATCAAGAA+TGG 0.575525 1:+65534373 None:intergenic
CCAAGCTTCATTCACCAGCC+CGG 0.576540 1:+65534151 None:intergenic
ACTAAGAACACCAACCATGC+AGG 0.580891 1:+65534070 None:intergenic
CATTCCAAGTACTCAATCCA+GGG 0.583892 1:+65534612 None:intergenic
GTGACGTGGAATGCTATGAT+TGG 0.586122 1:-65535007 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGGAGATACATTGTTGTCAG+TGG 0.587423 1:+65535240 None:intergenic
AATCTCAAACAAATGATCAC+AGG 0.587888 1:+65533920 None:intergenic
ACATGGGATTCAACCTGTGG+TGG 0.589795 1:-65534102 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATGTTGGGTTTGGAAGGGAA+AGG 0.591513 1:-65534932 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGATTGAGCCTGAACATACA+GGG 0.591530 1:-65533902 MsG0180003635.01.T01:CDS
GAAGGTGTTTGATGAGATGA+CGG 0.592354 1:-65535041 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGATTTATGCACTGCTGGAA+GGG 0.592635 1:-65533701 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGAGATGCTAGTTTAGCACT+TGG 0.596910 1:-65534254 MsG0180003635.01.T01:CDS
GATTTGGTTAGAGAGATGCC+GGG 0.597868 1:-65534542 MsG0180003635.01.T01:CDS
GGAAGTTCATCGTTCTGTGA+AGG 0.599943 1:-65534834 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTAAAGGGAATAGAAAACCC+TGG 0.603369 1:-65534629 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATGCGATGCCTTCAAAACAT+GGG 0.608725 1:-65534118 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTCAAATTCAAACCAAACCC+CGG 0.611798 1:+65534524 None:intergenic
ATTGGTGGTTATTCTCAGAG+TGG 0.614719 1:-65534989 MsG0180003635.01.T01:CDS
ACGTGGAATGCTATGATTGG+TGG 0.624632 1:-65535004 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATTGCCATGTATGCAAAATG+TGG 0.629695 1:-65534770 MsG0180003635.01.T01:CDS
GCAAGCGTGTGGTCAGTCGA+AGG 0.632980 1:-65534873 MsG0180003635.01.T01:CDS
AGCTGGAAAGCTCTCAGAAG+CGG 0.637156 1:-65534045 MsG0180003635.01.T01:CDS
AAAACATGGGATTCAACCTG+TGG 0.643296 1:-65534105 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTTGAGAAATACGAAAACAA+AGG 0.643935 1:+65534470 None:intergenic
CGAGGGCTGAAAGAGGTGCA+TGG 0.646536 1:-65534443 MsG0180003635.01.T01:CDS
GTGGTAGGATAGACATTGCG+AGG 0.657824 1:-65535063 MsG0180003635.01.T01:CDS
CGGAGAGAGATATTGTGACG+TGG 0.662807 1:-65535021 MsG0180003635.01.T01:CDS
ACTGGGTTGCAGAAGATCCG+GGG 0.678845 1:-65533798 MsG0180003635.01.T01:CDS
ACACAGAAGTCAATGTAACT+GGG 0.685498 1:+65534192 None:intergenic
GGTAGTGTGATGCAAGCGTG+TGG 0.702185 1:-65534884 MsG0180003635.01.T01:CDS
ATTTGGTTAGAGAGATGCCG+GGG 0.702509 1:-65534541 MsG0180003635.01.T01:CDS
TTATGACCAAAATATATACG+TGG 0.719396 1:-65534402 MsG0180003635.01.T01:CDS
TGAAATGGGTGAGAAAGATG+AGG 0.735581 1:-65534717 MsG0180003635.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
! AAAGTTAGGGTTTATTCATT+TGG - Chr1:65534594-65534613 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTTGTATTTGAAGATGTT+GGG - Chr1:65534001-65534020 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! TACAGGGAATTACATAATTA+TGG - Chr1:65535062-65535081 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! TTATGACCAAAATATATACG+TGG - Chr1:65534546-65534565 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATACTTATGCAAAGTTA+GGG - Chr1:65534581-65534600 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCTGGGTATATGATTAAT+GGG - Chr1:65534272-65534291 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGAGAAATACGAAAACAA+AGG + Chr1:65534481-65534500 None:intergenic 25.0%
!! ATTTCTGGGTATATGATTAA+TGG - Chr1:65534271-65534290 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAGGCTTTAGATGTTTTAAA+GGG - Chr1:65534304-65534323 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAGGCTTTAGATGTTTTAA+AGG - Chr1:65534303-65534322 MsG0180003635.01.T01:CDS 25.0%
AATCTCAAACAAATGATCAC+AGG + Chr1:65535031-65535050 None:intergenic 30.0%
AGAAAGATGAGGTAAGTTAT+AGG - Chr1:65534242-65534261 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
AGTAGTTGGATTAAAACTAG+TGG - Chr1:65535174-65535193 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
AGTTATAGGTCGATTATTTC+TGG - Chr1:65534256-65534275 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
ATATATCTTGCAAGAAGAGT+TGG - Chr1:65535296-65535315 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
ATATATGCTTATGCTTCTCA+TGG - Chr1:65534673-65534692 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
ATTTATGGCAACGTTGAAAT+CGG - Chr1:65534997-65535016 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATTTGACATATCCT+TGG + Chr1:65535220-65535239 None:intergenic 30.0%
CTAGTCATAGTAAAGTTATC+AGG + Chr1:65533731-65533750 None:intergenic 30.0%
CTTGATACTTATGCAAAGTT+AGG - Chr1:65534580-65534599 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
CTTTGCATAAGTATCAAGAA+TGG + Chr1:65534578-65534597 None:intergenic 30.0%
GAGTTTGTATTTGAAGATGT+TGG - Chr1:65534000-65534019 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
TATAACCAGATGTTAGATAG+AGG - Chr1:65534721-65534740 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGTACGAGCTTGATAATT+TGG - Chr1:65534641-65534660 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
! GTTATAGGTCGATTATTTCT+GGG - Chr1:65534257-65534276 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
! GTTATTATGCTTTATTGCCA+AGG - Chr1:65535200-65535219 MsG0180003635.01.T01:CDS 30.0%
AACACAGAAGTCAATGTAAC+TGG + Chr1:65534760-65534779 None:intergenic 35.0%
ACACAGAAGTCAATGTAACT+GGG + Chr1:65534759-65534778 None:intergenic 35.0%
AGGGAAAAGATGGAAAAAAC+TGG - Chr1:65535132-65535151 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
ATGTAATTCCCTGTATGTTC+AGG + Chr1:65535057-65535076 None:intergenic 35.0%
ATTGCCATGTATGCAAAATG+TGG - Chr1:65534178-65534197 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTTGTATTCACGTGCT+GGG - Chr1:65535085-65535104 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
CGTGAGTTGTTTGATGAAAT+GGG - Chr1:65534217-65534236 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
CTGAATGGAGCTTCTATTTA+TGG - Chr1:65534982-65535001 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
GGGAAAAGATGGAAAAAACT+GGG - Chr1:65535133-65535152 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
GTATGCAAAATGTGGAAGTT+TGG - Chr1:65534186-65534205 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
GTATTTGAAGATGTTGGGTT+TGG - Chr1:65534006-65534025 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATTCATTTGGCAAGGT+GGG - Chr1:65534603-65534622 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TAAGCCAACTGCTAAAGTTT+GGG - Chr1:65534951-65534970 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TAGGGTTTATTCATTTGGCA+AGG - Chr1:65534599-65534618 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TCGTGAGTTGTTTGATGAAA+TGG - Chr1:65534216-65534235 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TCTTAGGATTAGGGAAAAGA+TGG - Chr1:65535122-65535141 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAGGGAATAGAAAACCC+TGG - Chr1:65534319-65534338 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGCCAACTGCTAAAGTT+TGG - Chr1:65534950-65534969 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAATTCAAACCAAACCC+CGG + Chr1:65534427-65534446 None:intergenic 35.0%
TTTATGGCAACGTTGAAATC+GGG - Chr1:65534998-65535017 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTCCACATTTTGCATACA+TGG + Chr1:65534185-65534204 None:intergenic 35.0%
! ACTTTAGCAGTTGGCTTAAA+TGG + Chr1:65534949-65534968 None:intergenic 35.0%
! CAGTTGCCACGTATATATTT+TGG + Chr1:65534555-65534574 None:intergenic 35.0%
! CTAGAAAGTGTGACAACATT+TGG + Chr1:65534451-65534470 None:intergenic 35.0%
! TCTTTTACGCGGATTTTACT+CGG - Chr1:65533820-65533839 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTAATCCAACTACTTCCC+CGG + Chr1:65535170-65535189 None:intergenic 35.0%
!! GAAGGATCTTTCTTTTGGAA+TGG - Chr1:65534093-65534112 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
!! GATTAATGGGTTTGTCGATA+AGG - Chr1:65534285-65534304 MsG0180003635.01.T01:CDS 35.0%
AAAACATGGGATTCAACCTG+TGG - Chr1:65534843-65534862 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AAAACCCTGGATTGAGTACT+TGG - Chr1:65534332-65534351 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAACAAACGACGCGAAT+AGG + Chr1:65533688-65533707 None:intergenic 40.0%
AAGCCAACTGCTAAAGTTTG+GGG - Chr1:65534952-65534971 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AATCCAAAGCTCGTTCAAAC+TGG + Chr1:65534390-65534409 None:intergenic 40.0%
AATGCGATGCCTTCAAAACA+TGG - Chr1:65534829-65534848 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGAATGATGTGATTCC+TGG - Chr1:65534349-65534368 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AGATTGAGCCTGAACATACA+GGG - Chr1:65535046-65535065 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AGATTTATGCACTGCTGGAA+GGG - Chr1:65535247-65535266 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGATACATTGTTGTCAG+TGG + Chr1:65533711-65533730 None:intergenic 40.0%
ATGCGATGCCTTCAAAACAT+GGG - Chr1:65534830-65534849 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
CATGTTATTGTAGGTGTGGT+AGG - Chr1:65533870-65533889 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
CATTCCAAGTACTCAATCCA+GGG + Chr1:65534339-65534358 None:intergenic 40.0%
CGTATTTCTCAAACCTTCGA+GGG - Chr1:65534488-65534507 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
CGTTGGTCACATGTTATTGT+AGG - Chr1:65533861-65533880 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
CTACCAATCGTAACAGCATT+CGG + Chr1:65534049-65534068 None:intergenic 40.0%
GAAGTCCTCTATCTAACATC+TGG + Chr1:65534729-65534748 None:intergenic 40.0%
GAATGATGTGATTCCTGGTA+TGG - Chr1:65534354-65534373 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
GCAAATTTGTATTCACGTGC+TGG - Chr1:65535084-65535103 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGAAGCTCTTAGGATTA+GGG - Chr1:65535113-65535132 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
GGTTTATTCATTTGGCAAGG+TGG - Chr1:65534602-65534621 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
GTCACATGTTATTGTAGGTG+TGG - Chr1:65533866-65533885 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TAACCAGTTTGAACGAGCTT+TGG - Chr1:65534384-65534403 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TCATTCCAAGTACTCAATCC+AGG + Chr1:65534340-65534359 None:intergenic 40.0%
TCGTATTTCTCAAACCTTCG+AGG - Chr1:65534487-65534506 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATGGGTGAGAAAGATG+AGG - Chr1:65534231-65534250 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGATGTTGGGTTTGGAA+GGG - Chr1:65534011-65534030 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TGATGAGATTTATGCACTGC+TGG - Chr1:65535242-65535261 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTATTCTGAACCATACC+AGG + Chr1:65534370-65534389 None:intergenic 40.0%
TTGAAGATGTTGGGTTTGGA+AGG - Chr1:65534010-65534029 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGGTGGTTATTCTCAGAG+TGG - Chr1:65533959-65533978 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTCGAAGGATCTTTCTTT+TGG - Chr1:65534088-65534107 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
! CATTGTTCTGCTCTTTTACG+CGG - Chr1:65533809-65533828 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
!! GAAGGTGTTTGATGAGATGA+CGG - Chr1:65533907-65533926 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTGAATCCCATGTTTTGA+AGG + Chr1:65534841-65534860 None:intergenic 40.0%
!! GTTTGAACGAGCTTTGGATT+TGG - Chr1:65534390-65534409 MsG0180003635.01.T01:CDS 40.0%
AAACTGGGTTGCAGAAGATC+CGG - Chr1:65535148-65535167 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
ACGTGGAATGCTATGATTGG+TGG - Chr1:65533944-65533963 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
ACTAAGAACACCAACCATGC+AGG + Chr1:65534881-65534900 None:intergenic 45.0%
ATGTTGGGTTTGGAAGGGAA+AGG - Chr1:65534016-65534035 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
ATTTGGTTAGAGAGATGCCG+GGG - Chr1:65534407-65534426 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
CATCGTTCTGTGAAGGATGA+TGG - Chr1:65534121-65534140 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTCAATGTAACTGGGTC+AGG + Chr1:65534754-65534773 None:intergenic 45.0%
GAGATTGAGCCTGAACATAC+AGG - Chr1:65535045-65535064 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
GAGATTTATGCACTGCTGGA+AGG - Chr1:65535246-65535265 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGTTCATCGTTCTGTGA+AGG - Chr1:65534114-65534133 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAGAAGCTCTTAGGATT+AGG - Chr1:65535112-65535131 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
GTGACGTGGAATGCTATGAT+TGG - Chr1:65533941-65533960 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
TAGGATAGACATTGCGAGGA+AGG - Chr1:65533889-65533908 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGGGTTTGGAAGGGAAA+GGG - Chr1:65534017-65534036 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
TGTTTGCGTTCTTAACGCGT+TGG - Chr1:65533844-65533863 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
TTGACAGCTTGTGCTCATTC+CGG - Chr1:65534778-65534797 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! AAGGGTTGCTTGGTTTGATG+AGG - Chr1:65535265-65535284 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! AGGGTTGCTTGGTTTGATGA+GGG - Chr1:65535266-65535285 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGGTTTGATGAGGGAAGA+AGG - Chr1:65535273-65535292 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! GATTTGGTTAGAGAGATGCC+GGG - Chr1:65534406-65534425 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGATGCTAGTTTAGCACT+TGG - Chr1:65534694-65534713 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
! GGATTTGGTTAGAGAGATGC+CGG - Chr1:65534405-65534424 MsG0180003635.01.T01:CDS 45.0%
AAACCTTCGAGGGCTGAAAG+AGG - Chr1:65534498-65534517 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
AACTGGGTTGCAGAAGATCC+GGG - Chr1:65535149-65535168 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
ACATGGGATTCAACCTGTGG+TGG - Chr1:65534846-65534865 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
AGAAGATCCGGGGAAGTAGT+TGG - Chr1:65535160-65535179 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
AGCTGGAAAGCTCTCAGAAG+CGG - Chr1:65534903-65534922 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
CGGAGAGAGATATTGTGACG+TGG - Chr1:65533927-65533946 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
CTGCCGAATGCTGTTACGAT+TGG - Chr1:65534043-65534062 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
GGAGATGGGAAGAAGCTCTT+AGG - Chr1:65535106-65535125 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
GTATTCACGTGCTGGGAGAT+GGG - Chr1:65535092-65535111 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTAGGATAGACATTGCG+AGG - Chr1:65533885-65533904 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
TGACAGCTTGTGCTCATTCC+GGG - Chr1:65534779-65534798 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
TGTATTCACGTGCTGGGAGA+TGG - Chr1:65535091-65535110 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGGTGTTCTTAGTCGAGC+TGG - Chr1:65534886-65534905 MsG0180003635.01.T01:CDS 50.0%
ACTGGGTTGCAGAAGATCCG+GGG - Chr1:65535150-65535169 MsG0180003635.01.T01:CDS 55.0%
CCAAGCTTCATTCACCAGCC+CGG + Chr1:65534800-65534819 None:intergenic 55.0%
CGCGTCGTTGAAGAGGGATT+TGG + Chr1:65533660-65533679 None:intergenic 55.0%
GAGCACTATGCCTGCATGGT+TGG - Chr1:65534868-65534887 MsG0180003635.01.T01:CDS 55.0%
GCGCCCCAAACTTTAGCAGT+TGG + Chr1:65534958-65534977 None:intergenic 55.0%
GCTAAGCGCGTCGTTGAAGA+GGG + Chr1:65533666-65533685 None:intergenic 55.0%
GGTAGTGTGATGCAAGCGTG+TGG - Chr1:65534064-65534083 MsG0180003635.01.T01:CDS 55.0%
GTTAGAGAGATGCCGGGGTT+TGG - Chr1:65534412-65534431 MsG0180003635.01.T01:CDS 55.0%
!! CGGGCTGGTGAATGAAGCTT+GGG - Chr1:65534798-65534817 MsG0180003635.01.T01:CDS 55.0%
AGCTTGTGCTCATTCCGGGC+TGG - Chr1:65534783-65534802 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
CAGGCATAGTGCTCCACCAC+AGG + Chr1:65534862-65534881 None:intergenic 60.0%
GCAAGCGTGTGGTCAGTCGA+AGG - Chr1:65534075-65534094 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
GCACCTCTTTCAGCCCTCGA+AGG + Chr1:65534504-65534523 None:intergenic 60.0%
GCACTGCTGGAAGGGTTGCT+TGG - Chr1:65535255-65535274 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
GGCTAAGCGCGTCGTTGAAG+AGG + Chr1:65533667-65533686 None:intergenic 60.0%
! CGAGGGCTGAAAGAGGTGCA+TGG - Chr1:65534505-65534524 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
! GGTGGAGCACTATGCCTGCA+TGG - Chr1:65534864-65534883 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
! GTTTGGGGCGCTCTGCTGAA+TGG - Chr1:65534967-65534986 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
!! CCGGGCTGGTGAATGAAGCT+TGG - Chr1:65534797-65534816 MsG0180003635.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 65533638 65535332 65533638 ID=MsG0180003635.01;Name=MsG0180003635.01
Chr1 mRNA 65533638 65535332 65533638 ID=MsG0180003635.01.T01;Parent=MsG0180003635.01;Name=MsG0180003635.01.T01;_AED=0.29;_eAED=0.29;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|564
Chr1 exon 65533638 65535332 65533638 ID=MsG0180003635.01.T01:exon:50676;Parent=MsG0180003635.01.T01
Chr1 CDS 65533638 65535332 65533638 ID=MsG0180003635.01.T01:cds;Parent=MsG0180003635.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003635.01.T01

ATGATCATTGCTTATACTTCCAAATCCCTCTTCAACGACGCGCTTAGCCTATTCGCGTCGTTTGTTTCTTCCACTGACAACAATGTATCTCCTGATAACTTTACTATGACTAGCATCTTGAAGACGTTAGCGTTGTCTTCTTCTGTGTGCTATAAATCAGCAAAGCAGATTCATTGTTCTGCTCTTTTACGCGGATTTTACTCGGATGTTTGCGTTCTTAACGCGTTGGTCACATGTTATTGTAGGTGTGGTAGGATAGACATTGCGAGGAAGGTGTTTGATGAGATGACGGAGAGAGATATTGTGACGTGGAATGCTATGATTGGTGGTTATTCTCAGAGTGGATTTTATGAAGAATGCAAGAGTTTGTATTTGAAGATGTTGGGTTTGGAAGGGAAAGGGATTCTGCCGAATGCTGTTACGATTGGTAGTGTGATGCAAGCGTGTGGTCAGTCGAAGGATCTTTCTTTTGGAATGGAAGTTCATCGTTCTGTGAAGGATGATGGAATTGAGACTGATGTGTTTCTTTGTAATGCTATAATTGCCATGTATGCAAAATGTGGAAGTTTGGATTATGCTCGTGAGTTGTTTGATGAAATGGGTGAGAAAGATGAGGTAAGTTATAGGTCGATTATTTCTGGGTATATGATTAATGGGTTTGTCGATAAGGCTTTAGATGTTTTAAAGGGAATAGAAAACCCTGGATTGAGTACTTGGAATGATGTGATTCCTGGTATGGTTCAGAATAACCAGTTTGAACGAGCTTTGGATTTGGTTAGAGAGATGCCGGGGTTTGGTTTGAATTTGAAGCCAAATGTTGTCACACTTTCTAGCATTATTCCTTTGTTTTCGTATTTCTCAAACCTTCGAGGGCTGAAAGAGGTGCATGGTTATGCAATAAGAAGAAGTTATGACCAAAATATATACGTGGCAACTGCCATTCTTGATACTTATGCAAAGTTAGGGTTTATTCATTTGGCAAGGTGGGTTTTTGATCAGTCACAAAGTACGAGCTTGATAATTTGGACTTCAATTATATATGCTTATGCTTCTCATGGAGATGCTAGTTTAGCACTTGGTCTCTATAACCAGATGTTAGATAGAGGACTTCAGCCTGACCCAGTTACATTGACTTCTGTGTTGACAGCTTGTGCTCATTCCGGGCTGGTGAATGAAGCTTGGGATGTTTTCAATGCGATGCCTTCAAAACATGGGATTCAACCTGTGGTGGAGCACTATGCCTGCATGGTTGGTGTTCTTAGTCGAGCTGGAAAGCTCTCAGAAGCGGCAAAGTTCATTTCTAAGATGCCATTTAAGCCAACTGCTAAAGTTTGGGGCGCTCTGCTGAATGGAGCTTCTATTTATGGCAACGTTGAAATCGGGAAGTTTGCCTGTGATCATTTGTTTGAGATTGAGCCTGAACATACAGGGAATTACATAATTATGGCAAATTTGTATTCACGTGCTGGGAGATGGGAAGAAGCTCTTAGGATTAGGGAAAAGATGGAAAAAACTGGGTTGCAGAAGATCCGGGGAAGTAGTTGGATTAAAACTAGTGGAAAGTTATTATGCTTTATTGCCAAGGATATGTCAAATGAAATGTCTGATGAGATTTATGCACTGCTGGAAGGGTTGCTTGGTTTGATGAGGGAAGAAGGATATATCTTGCAAGAAGAGTTGGATTATGAGATGTGA
Protein sequence

>MsG0180003635.01.T01

MIIAYTSKSLFNDALSLFASFVSSTDNNVSPDNFTMTSILKTLALSSSVCYKSAKQIHCSALLRGFYSDVCVLNALVTCYCRCGRIDIARKVFDEMTERDIVTWNAMIGGYSQSGFYEECKSLYLKMLGLEGKGILPNAVTIGSVMQACGQSKDLSFGMEVHRSVKDDGIETDVFLCNAIIAMYAKCGSLDYARELFDEMGEKDEVSYRSIISGYMINGFVDKALDVLKGIENPGLSTWNDVIPGMVQNNQFERALDLVREMPGFGLNLKPNVVTLSSIIPLFSYFSNLRGLKEVHGYAIRRSYDQNIYVATAILDTYAKLGFIHLARWVFDQSQSTSLIIWTSIIYAYASHGDASLALGLYNQMLDRGLQPDPVTLTSVLTACAHSGLVNEAWDVFNAMPSKHGIQPVVEHYACMVGVLSRAGKLSEAAKFISKMPFKPTAKVWGALLNGASIYGNVEIGKFACDHLFEIEPEHTGNYIIMANLYSRAGRWEEALRIREKMEKTGLQKIRGSSWIKTSGKLLCFIAKDMSNEMSDEIYALLEGLLGLMREEGYILQEELDYEM*