AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035884.01

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MsG0680035884.01.T01 AT4G36180 31.667 480 282 16 88 544 592 1048 1.89e-44 171
MsG0680035884.01.T01 AT4G36180 30.472 233 122 7 5 206 8 231 5.57e-14 76.3
MsG0680035884.01.T01 AT1G72300 28.044 542 340 16 106 624 571 1085 3.47e-44 170
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MsG0680035884.01.T01 AT3G19700 26.375 618 328 20 69 617 408 967 4.31e-44 170
MsG0680035884.01.T01 AT4G34220 26.094 663 321 21 28 538 34 679 7.29e-44 168
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MsG0680035884.01.T01 AT5G07180 27.801 241 158 8 27 256 34 269 6.36e-16 82.4
MsG0680035884.01.T01 AT5G07180 27.385 566 332 18 67 611 312 819 5.03e-43 166
MsG0680035884.01.T01 AT4G37250 24.619 788 381 24 7 620 8 756 1.75e-42 164
MsG0680035884.01.T01 AT2G15300 25.772 745 374 27 23 616 26 742 2.38e-42 163
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MsG0680035884.01.T01 AT1G62950 28.546 557 343 16 88 617 357 885 7.71e-42 162
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MsG0680035884.01.T01 AT1G67720 27.344 512 310 18 117 615 416 878 1.55e-37 150
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MsG0680035884.01.T01 AT4G23260 30.662 287 160 7 331 595 313 582 8.60e-34 137
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MsG0680035884.01.T01 AT4G22130 27.766 479 276 17 117 558 28 473 1.35e-33 135
MsG0680035884.01.T01 AT4G29990 26.667 555 308 20 84 615 366 844 1.43e-33 137
MsG0680035884.01.T01 AT1G52540 31.852 270 172 6 347 611 43 305 1.60e-33 132
MsG0680035884.01.T01 AT1G01540 30.943 265 168 7 346 603 159 415 1.61e-33 134
MsG0680035884.01.T01 AT4G02420 32.130 277 171 8 346 614 355 622 2.88e-33 135
MsG0680035884.01.T01 AT4G23280 31.010 287 175 8 331 603 327 604 2.88e-33 135
MsG0680035884.01.T01 AT5G61480 26.208 538 327 16 97 617 517 1001 2.98e-33 137
MsG0680035884.01.T01 AT5G61480 27.907 215 97 7 51 208 59 272 8.01e-11 65.9
MsG0680035884.01.T01 AT5G18500 30.201 298 185 11 334 618 154 441 3.03e-33 134
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MsG0680035884.01.T01 AT5G18500 30.201 298 185 11 334 618 154 441 3.03e-33 134
MsG0680035884.01.T01 AT5G18500 30.201 298 185 11 334 618 154 441 3.03e-33 134
MsG0680035884.01.T01 AT5G18500 30.201 298 185 11 334 618 154 441 3.03e-33 134
MsG0680035884.01.T01 AT5G18500 30.201 298 185 11 334 618 154 441 3.03e-33 134
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MsG0680035884.01.T01 AT2G33170 29.193 322 192 11 320 618 796 1104 3.11e-33 137
MsG0680035884.01.T01 AT2G33170 29.464 224 114 10 23 208 35 252 6.08e-11 66.2
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MsG0680035884.01.T01 AT3G59110 28.990 307 194 11 334 626 178 474 3.45e-33 134
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MsG0680035884.01.T01 AT1G23540 28.784 403 232 13 242 603 246 634 4.54e-33 135
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MsG0680035884.01.T01 AT3G09010 31.119 286 181 7 347 625 52 328 9.02e-33 130
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MsG0680035884.01.T01 AT2G42960 27.687 307 198 10 334 626 171 467 1.17e-32 132
MsG0680035884.01.T01 AT2G42960 27.687 307 198 10 334 626 171 467 1.17e-32 132
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MsG0680035884.01.T01 AT2G28990 25.632 554 324 17 84 615 361 848 1.31e-32 134
MsG0680035884.01.T01 AT4G27290 27.895 380 212 11 239 603 441 773 1.32e-32 134
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MsG0680035884.01.T01 AT1G56720 28.477 302 185 9 334 618 167 454 1.41e-32 132
MsG0680035884.01.T01 AT1G56720 28.477 302 185 9 334 618 167 454 1.41e-32 132
MsG0680035884.01.T01 AT4G27290 31.169 308 186 9 309 603 433 727 1.45e-32 134
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MsG0680035884.01.T01 AT3G47580 25.682 623 319 21 88 618 430 1000 1.89e-32 134
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MsG0680035884.01.T01 AT1G17750 33.553 152 96 4 72 220 560 709 3.14e-11 67.4
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MsG0680035884.01.T01 AT4G34440 28.475 295 188 8 342 626 313 594 2.03e-31 130
MsG0680035884.01.T01 AT3G45860 29.965 287 179 8 331 603 336 614 2.38e-31 130
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MsG0680035884.01.T01 AT4G23310 29.617 287 179 8 331 603 493 770 4.23e-31 130
MsG0680035884.01.T01 AT2G27060 31.613 310 184 9 320 616 626 920 4.48e-31 130
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MsG0680035884.01.T01 AT5G02800 32.646 291 177 9 281 558 8 292 5.21e-31 125
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MsG0680035884.01.T01 AT1G51790 26.489 487 282 18 147 615 418 846 5.50e-31 129
MsG0680035884.01.T01 AT5G56040 27.483 433 234 16 94 497 529 910 6.13e-31 129
MsG0680035884.01.T01 AT5G56040 31.694 183 112 6 27 202 34 210 1.07e-11 68.6
MsG0680035884.01.T01 AT5G16900 26.190 546 318 15 84 615 184 658 6.56e-31 129
MsG0680035884.01.T01 AT4G23190 26.166 386 225 8 228 603 279 614 6.87e-31 128
MsG0680035884.01.T01 AT4G21410 27.520 367 219 10 238 595 160 488 7.02e-31 127
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MsG0680035884.01.T01 AT5G06740 30.556 288 183 8 333 607 317 600 7.09e-31 128
MsG0680035884.01.T01 AT1G09440 27.425 299 192 9 334 618 145 432 1.06e-30 126
MsG0680035884.01.T01 AT1G09440 27.425 299 192 9 334 618 145 432 1.06e-30 126
MsG0680035884.01.T01 AT1G61380 30.795 302 184 10 307 595 305 594 1.10e-30 128
MsG0680035884.01.T01 AT4G21410 27.520 367 219 10 238 595 285 613 1.29e-30 127
MsG0680035884.01.T01 AT2G13790 30.492 305 188 8 334 618 282 582 1.33e-30 127
MsG0680035884.01.T01 AT2G13790 31.000 200 99 8 26 216 34 203 6.32e-11 65.9
MsG0680035884.01.T01 AT4G00960 32.828 198 122 3 347 536 62 256 1.38e-30 121
MsG0680035884.01.T01 AT1G61380 30.795 302 184 10 307 595 452 741 1.39e-30 128
MsG0680035884.01.T01 AT4G23230 30.712 267 164 7 347 603 343 598 1.46e-30 127
MsG0680035884.01.T01 AT4G11900 31.429 280 160 8 334 595 456 721 1.46e-30 128
MsG0680035884.01.T01 AT5G13290 31.734 271 168 6 336 595 113 377 1.50e-30 124
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MsG0680035884.01.T01 AT1G79620 26.835 395 233 12 238 619 563 914 3.41e-29 124
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MsG0680035884.01.T01 AT2G13800 30.317 221 115 8 6 217 9 199 2.34e-14 76.6
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MsG0680035884.01.T01 AT5G54590 27.990 393 254 12 242 621 8 384 5.30e-29 120
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MsG0680035884.01.T01 AT3G13690 28.727 275 180 6 332 599 402 667 7.87e-29 122
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MsG0680035884.01.T01 AT1G11330 31.518 257 159 6 347 595 530 777 8.95e-29 122
MsG0680035884.01.T01 AT4G23210 33.495 206 126 4 344 542 361 562 9.54e-29 122
MsG0680035884.01.T01 AT1G51850 25.547 548 336 18 84 615 358 849 9.80e-29 122
MsG0680035884.01.T01 AT1G61610 34.653 202 123 4 347 542 531 729 1.03e-28 122
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MsG0680035884.01.T01 AT1G34210 31.034 203 103 7 26 221 34 206 3.08e-12 70.1
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MsG0680035884.01.T01 AT5G37450 26.977 215 119 8 23 204 31 240 8.11e-12 68.9
MsG0680035884.01.T01 AT4G13190 34.762 210 124 6 362 564 4 207 1.60e-27 113
MsG0680035884.01.T01 AT5G15730 29.316 307 184 9 335 628 108 394 1.72e-27 116
MsG0680035884.01.T01 AT5G15730 29.316 307 184 9 335 628 108 394 1.72e-27 116
MsG0680035884.01.T01 AT1G11330 34.010 197 121 4 347 537 530 723 1.74e-27 118
MsG0680035884.01.T01 AT5G35960 28.479 309 194 8 298 594 86 379 1.77e-27 115
MsG0680035884.01.T01 AT1G11350 31.356 236 141 6 347 565 518 749 1.79e-27 118
MsG0680035884.01.T01 AT5G56890 27.974 311 198 11 334 627 711 1012 1.81e-27 119
MsG0680035884.01.T01 AT5G37450 30.526 285 164 7 347 616 661 926 1.85e-27 119
MsG0680035884.01.T01 AT5G37450 30.093 216 121 9 23 217 31 237 1.82e-14 77.8
MsG0680035884.01.T01 AT1G79670 25.979 281 194 6 345 619 425 697 1.93e-27 118
MsG0680035884.01.T01 AT1G79670 25.979 281 194 6 345 619 388 660 2.03e-27 118
MsG0680035884.01.T01 AT1G56120 30.709 254 162 5 347 595 698 942 2.05e-27 119
MsG0680035884.01.T01 AT1G16150 25.974 308 211 6 329 626 407 707 2.11e-27 118
MsG0680035884.01.T01 AT2G28930 29.195 298 187 9 346 626 85 375 2.23e-27 115
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MsG0680035884.01.T01 AT2G28930 29.195 298 187 9 346 626 74 364 2.53e-27 115
MsG0680035884.01.T01 AT2G28930 29.195 298 187 9 346 626 77 367 2.89e-27 115
MsG0680035884.01.T01 AT1G76370 33.636 220 133 7 346 558 80 293 3.00e-27 114
MsG0680035884.01.T01 AT1G70520 28.041 296 173 8 320 595 308 583 3.32e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT1G79680 26.871 294 199 6 334 617 421 708 3.43e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT1G07650 29.630 297 193 6 324 614 452 738 3.71e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT5G10520 28.519 270 171 7 346 606 158 414 3.85e-27 115
MsG0680035884.01.T01 AT2G19230 24.652 503 294 14 119 615 418 841 4.24e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT1G61440 30.859 256 162 7 347 595 489 736 4.94e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT1G51800 24.104 502 308 14 122 609 415 857 5.00e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT1G61440 30.859 256 162 7 347 595 484 731 5.08e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT3G46340 23.835 558 355 15 84 627 369 870 5.20e-27 117
MsG0680035884.01.T01 AT5G01560 29.412 306 186 10 333 619 350 644 5.71e-27 116
MsG0680035884.01.T01 AT5G59650 26.692 517 285 19 131 627 434 876 5.75e-27 117
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MsG0680035884.01.T01 AT1G07650 40.659 91 52 2 94 183 145 234 3.84e-12 70.1
MsG0680035884.01.T01 AT5G57670 30.584 291 177 10 346 628 272 545 5.91e-27 116

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGACGTCAATGTTACCTTTA+AGG 0.073893 6:-113958561 None:intergenic
GAGTCTTGGTATACTCATTT+TGG 0.178617 6:+113960492 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTCGAAAACATGAACCTTAA+AGG 0.189356 6:+113958547 MsG0680035884.01.T01:CDS
ACAATACGGCTCAAATTTAT+TGG 0.198097 6:-113959452 None:intergenic
AGAGCCGCTGCTGAGATATT+AGG 0.258259 6:+113959773 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATGCATCTCTATTACGTTAC+TGG 0.282088 6:+113961004 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TTAAGGAAGATTTGTCTTCA+TGG 0.289831 6:+113960862 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
ATGAGGTGAGGTTAGTATAT+TGG 0.312466 6:+113961061 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
ACTAAACAACAAGAAGAATT+AGG 0.316854 6:+113959551 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTTGTTACAAAGGAAATGTT+TGG 0.317607 6:+113958515 MsG0680035884.01.T01:CDS
CCGACGTTACATTATCTTCA+TGG 0.325700 6:+113958440 MsG0680035884.01.T01:CDS
GATATACGGTAAATCTTTGA+TGG 0.327842 6:-113958587 None:intergenic
TTAAGCGTTTCTCTAAATTC+AGG 0.332992 6:-113958868 None:intergenic
TGCATTGGCATGTTGTGATA+TGG 0.333650 6:+113960693 MsG0680035884.01.T01:CDS
AACAAATGAACAATGTTAAT+AGG 0.337937 6:+113959867 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTGAGTTGAGTTTAGCGAAT+TGG 0.344307 6:+113960569 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTTTCTCTAAATTCAGGAAT+AGG 0.350893 6:-113958862 None:intergenic
TTAGTTATATATATATTTGC+TGG 0.360915 6:+113960804 MsG0680035884.01.T01:exon
TTGTTACAAAGGAAATGTTT+GGG 0.361200 6:+113958516 MsG0680035884.01.T01:CDS
TGAGTTGAGTTTAGCGAATT+GGG 0.362879 6:+113960570 MsG0680035884.01.T01:CDS
AAGCTAATCGTTCTGATATA+CGG 0.365012 6:-113958601 None:intergenic
TCCCTTTACCACTTTGTTGT+AGG 0.369238 6:-113960546 None:intergenic
TGAGACCGGTGAGTTTGTTT+AGG 0.372270 6:-113958657 None:intergenic
AAGCTGTGTGGAGTCCCTTT+AGG 0.375098 6:+113959404 MsG0680035884.01.T01:CDS
CAGAGAATTTATTATTAGAA+AGG 0.388996 6:-113958690 None:intergenic
GTAATGGTGATAATGCAAAT+TGG 0.395347 6:+113958482 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTTTCTAATAATAAATTCTC+TGG 0.396035 6:+113958691 MsG0680035884.01.T01:CDS
TGTTCTATTGAGTGAGTCAT+TGG 0.396074 6:+113960342 MsG0680035884.01.T01:CDS
GGATGTTGCTCACGAAATAA+TGG 0.397737 6:+113960408 MsG0680035884.01.T01:CDS
CCGGTGAGTTTGTTTAGGTT+TGG 0.397801 6:-113958652 None:intergenic
AATGCAGGATACCATTCTAT+AGG 0.404201 6:+113960196 MsG0680035884.01.T01:intron
TTCACTATCTTCAATCTGCT+TGG 0.413549 6:-113960238 None:intergenic
ACCTCGCTGCTCCACTCTTC+CGG 0.419260 6:-113960607 None:intergenic
GAAGTGAGTCTTCAAAATTA+AGG 0.420155 6:+113960845 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TATGGATATTGATAAGAGAT+TGG 0.420979 6:+113960711 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGTAATACCAGTAGCAGAAA+AGG 0.423615 6:+113959686 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTATGTTCCCAATGGCAGTT+TGG 0.426286 6:+113959997 MsG0680035884.01.T01:CDS
TCAATCTGCTTGGCCAATCA+AGG 0.427349 6:-113960228 None:intergenic
TACAAGGCTGCTCTGTTGAC+TGG 0.428607 6:+113959818 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTCATGTGCTCTTGAAACTC+TGG 0.439446 6:-113959890 None:intergenic
TTCCTACAACAAAGTGGTAA+AGG 0.443203 6:+113960544 MsG0680035884.01.T01:CDS
TCCTACAACAAAGTGGTAAA+GGG 0.446230 6:+113960545 MsG0680035884.01.T01:CDS
AATCAATTTCCTCATGAATG+AGG 0.453233 6:+113960899 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TTGGCCACGTGGTATCGAAT+TGG 0.454663 6:-113958633 None:intergenic
CGTAGCGAATAATCAATTAG+AGG 0.454792 6:+113958900 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATCCCTTGAAACGCTTCTGC+TGG 0.463528 6:-113958721 None:intergenic
AGTTTGGCCGTTCGCCTTCA+CGG 0.466265 6:+113960013 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTTAGTATATTGGAGAGTTG+AGG 0.467210 6:+113961071 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
GATAATAATAATCAAAAGAA+AGG 0.469508 6:+113959611 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTCATGCCAAGTCATGTTGT+TGG 0.470878 6:-113960926 None:intergenic
TCGACGAACATGCTCCTAAA+GGG 0.472449 6:-113959418 None:intergenic
GCGAACGGCCAAACTGCCAT+TGG 0.477118 6:-113960005 None:intergenic
CAAGAGCACATGAGAAGACT+AGG 0.477802 6:+113959899 MsG0680035884.01.T01:CDS
GAAGCAAGGGAAGTTGGAAT+AGG 0.478732 6:-113958790 None:intergenic
GGCAATGAAGCAAGGGAAGT+TGG 0.481037 6:-113958796 None:intergenic
AATCCGTAGTCGGTTAGTAT+AGG 0.481634 6:-113960367 None:intergenic
GCTACGAGAGGAAGGAGATT+CGG 0.482364 6:-113959935 None:intergenic
AAGAAGAAAGTGATGAAGAA+TGG 0.487410 6:-113958337 None:intergenic
TAGGTGCAAACACGAGCGGC+AGG 0.487644 6:+113959588 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTTGAGCCGTATTGTGGTCG+TGG 0.489089 6:+113959460 MsG0680035884.01.T01:CDS
GGCTTTCCTGTCCTATAGAA+TGG 0.490621 6:-113960207 None:intergenic
AGTCAACAGAGCAGCCTTGT+AGG 0.491321 6:-113959816 None:intergenic
CCATGAGGCGCAATCAAGTT+CGG 0.492088 6:-113960301 None:intergenic
TAGGACAGGAAAGCCTTGAT+TGG 0.493876 6:+113960215 MsG0680035884.01.T01:CDS
TAATGGTGATAATGCAAATT+GGG 0.496226 6:+113958483 MsG0680035884.01.T01:CDS
AATAAATTTGAGCCGTATTG+TGG 0.497798 6:+113959454 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTTTGTTGTAGGAAATTAGC+AGG 0.499681 6:-113960535 None:intergenic
CACCTGAGTATTTGCAGCAT+GGG 0.502075 6:+113960443 MsG0680035884.01.T01:CDS
AATTCCCAGTGTAATTAATG+AGG 0.502401 6:+113961044 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TTGATATCGTTGCGGTTGGA+TGG 0.502927 6:+113958823 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATTCCAGCAGAAGCGTTTCA+AGG 0.506859 6:+113958718 MsG0680035884.01.T01:CDS
GGAATCTTGCTAAGGTTGGC+AGG 0.507203 6:-113958931 None:intergenic
TTCGACGAACATGCTCCTAA+AGG 0.508999 6:-113959419 None:intergenic
GGAGTTAACAAGTAATAATG+AGG 0.510778 6:+113960645 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTGAGATGAGGTGCACTTTG+AGG 0.513030 6:+113961123 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TGCATCTCTATTACGTTACT+GGG 0.517134 6:+113961005 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
CAAGGCAATGGCATGAATGA+TGG 0.518906 6:+113960960 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
ATCAATTTCCTCATGAATGA+GGG 0.523418 6:+113960900 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
AAGACTGATGTGTGGAGTCT+TGG 0.523797 6:+113960478 MsG0680035884.01.T01:CDS
CGAACGGCCAAACTGCCATT+GGG 0.525037 6:-113960004 None:intergenic
ACATCCATGCCTCCATGTAA+TGG 0.525492 6:+113958466 MsG0680035884.01.T01:CDS
CCTCACCTCATTAATTACAC+TGG 0.531383 6:-113961049 None:intergenic
AGCTGGAATCTTGCTAAGGT+TGG 0.531491 6:-113958935 None:intergenic
AAGGTAAATGTTCTTGAGAC+CGG 0.531549 6:-113958671 None:intergenic
CTCACCTCATTAATTACACT+GGG 0.538763 6:-113961048 None:intergenic
CCGAACTTGATTGCGCCTCA+TGG 0.539596 6:+113960301 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTTGCATTATCACCATTACA+TGG 0.539932 6:-113958478 None:intergenic
CTCGACAATAATCAGTTCAC+TGG 0.540630 6:+113958766 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGGATACCATTCTATAGGAC+AGG 0.545004 6:+113960201 MsG0680035884.01.T01:intron
TTATTTCGTGAGCAACATCC+TGG 0.548044 6:-113960405 None:intergenic
GAGTTAACAAGTAATAATGA+GGG 0.549943 6:+113960646 MsG0680035884.01.T01:CDS
TCTAAATTCAGGAATAGGAC+CGG 0.552373 6:-113958857 None:intergenic
CTTCCCTTGCTTCATTGCCG+AGG 0.553747 6:+113958800 MsG0680035884.01.T01:CDS
CGCCCATGCTGCAAATACTC+AGG 0.559365 6:-113960445 None:intergenic
GAAGATTTGTCTTCATGGCA+AGG 0.560898 6:+113960867 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TCACCTGAGTATTTGCAGCA+TGG 0.561820 6:+113960442 MsG0680035884.01.T01:CDS
CAAGAACCACGACCACAATA+CGG 0.561907 6:-113959466 None:intergenic
TTGGGTGGATTCTGTTGTGC+CGG 0.562592 6:+113960588 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTGTCACAGTTCATCCTACA+AGG 0.563011 6:+113959802 MsG0680035884.01.T01:CDS
TAGTGAAAGGCATAGCGAAA+GGG 0.563560 6:+113960254 MsG0680035884.01.T01:CDS
GGTGATAATGCAAATTGGGC+GGG 0.563631 6:+113958487 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCTAATTTCCTACAACAAAG+TGG 0.569810 6:+113960538 MsG0680035884.01.T01:CDS
TCAACCTCGGCAATGAAGCA+AGG 0.571010 6:-113958804 None:intergenic
TTCCAGCAGAAGCGTTTCAA+GGG 0.571901 6:+113958719 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGTAGTAAGCTACGAGAGGA+AGG 0.572524 6:-113959943 None:intergenic
ATGAAGCTGGAATCTTGCTA+AGG 0.579600 6:-113958939 None:intergenic
GCGGGCGTTCTTTGTTACAA+AGG 0.581316 6:+113958505 MsG0680035884.01.T01:CDS
CAACAAGAAGAATTAGGAGA+AGG 0.581330 6:+113959557 MsG0680035884.01.T01:CDS
GAGGTTGATATCGTTGCGGT+TGG 0.582578 6:+113958819 MsG0680035884.01.T01:CDS
CTGAGTATTTGCAGCATGGG+CGG 0.585142 6:+113960446 MsG0680035884.01.T01:CDS
GAAAATACCGTGAAGGCGAA+CGG 0.586901 6:-113960020 None:intergenic
GAGCCTATACTAACCGACTA+CGG 0.587465 6:+113960364 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTAGGAGAAGGAGCTGGTGT+AGG 0.589012 6:+113959569 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTTGTTTAGGTTTGGCCACG+TGG 0.590581 6:-113958644 None:intergenic
TTGGATGGAAATAAATTCAC+CGG 0.595437 6:+113958838 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATTCTGTTGTGCCGGAAGAG+TGG 0.599415 6:+113960596 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCATGAATGCTTGCAATGCA+AGG 0.599808 6:+113960942 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
ATCACCATTACATGGAGGCA+TGG 0.600503 6:-113958470 None:intergenic
CCAGTGTAATTAATGAGGTG+AGG 0.604639 6:+113961049 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
GCATGAATGATGGAAATCAA+TGG 0.605810 6:+113960970 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TGTTACAAAGGAAATGTTTG+GGG 0.606282 6:+113958517 MsG0680035884.01.T01:CDS
TAGCAAGTTGTCCTTTGTGA+GGG 0.606310 6:+113959712 MsG0680035884.01.T01:CDS
CAACCTCGGCAATGAAGCAA+GGG 0.609773 6:-113958803 None:intergenic
AAGCGTTTCAAGGGATGCAG+TGG 0.613015 6:+113958728 MsG0680035884.01.T01:CDS
ACTGCCATTGGGAACATAGT+CGG 0.614272 6:-113959993 None:intergenic
GCTGCTGAGATATTAGGAAG+TGG 0.614484 6:+113959779 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGCAGATTGAAGATAGTGAA+AGG 0.615062 6:+113960241 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTAGCGAATAATCAATTAGA+GGG 0.615938 6:+113958901 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTTGGCAACCCTCATTCATG+AGG 0.617231 6:-113960908 None:intergenic
ATAGCAAGTTGTCCTTTGTG+AGG 0.617595 6:+113959711 MsG0680035884.01.T01:CDS
TTGTAGTAGTAAGCTACGAG+AGG 0.618442 6:-113959947 None:intergenic
CACAGGTACTAATCCGTAGT+CGG 0.621055 6:-113960377 None:intergenic
ATAGTGAAAGGCATAGCGAA+AGG 0.622418 6:+113960253 MsG0680035884.01.T01:CDS
GAAGAATTAGGAGAAGGAGC+TGG 0.622672 6:+113959563 MsG0680035884.01.T01:CDS
TGCCGAGGTTGATATCGTTG+CGG 0.624169 6:+113958815 MsG0680035884.01.T01:CDS
GGGTTGCCAACAACATGACT+TGG 0.624218 6:+113960920 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
TGGTGATAATGCAAATTGGG+CGG 0.624840 6:+113958486 MsG0680035884.01.T01:CDS
TCAAATAATAATACAGACGA+TGG 0.627565 6:+113959641 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTTGAGTTTAGCGAATTGGG+TGG 0.628345 6:+113960573 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCAACATCCTGGTTTATCAC+AGG 0.636701 6:-113960394 None:intergenic
GGTGTAGGTGCAAACACGAG+CGG 0.637693 6:+113959584 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGGGATTGAATATCTATACA+AGG 0.638914 6:+113960273 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATCACCGACTATGTTCCCAA+TGG 0.640029 6:+113959989 MsG0680035884.01.T01:CDS
GTTAACAAGTAATAATGAGG+GGG 0.641051 6:+113960648 MsG0680035884.01.T01:CDS
ATGCTTGCAATGCAAGGCAA+TGG 0.643500 6:+113960948 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
GATACAAGAGAATAATCATG+AGG 0.648379 6:+113960765 MsG0680035884.01.T01:CDS
TGAAGAGGAAAATACCGTGA+AGG 0.657310 6:-113960027 None:intergenic
AGGTGCAAACACGAGCGGCA+GGG 0.657351 6:+113959589 MsG0680035884.01.T01:CDS
AACCGCAACGATATCAACCT+CGG 0.658575 6:-113958817 None:intergenic
CCAAACCTAAACAAACTCAC+CGG 0.658795 6:+113958652 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGCACATGAGAAGACTAGGA+AGG 0.663845 6:+113959903 MsG0680035884.01.T01:CDS
TAAATAATGAATTTGAGATG+AGG 0.665056 6:+113961111 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR
AGATACTTCTTCCCTCACAA+AGG 0.675586 6:-113959723 None:intergenic
CCATGAAGATAATGTAACGT+CGG 0.677837 6:-113958440 None:intergenic
ATTAGTACCTGTGATAAACC+AGG 0.678364 6:+113960387 MsG0680035884.01.T01:CDS
AGTTAACAAGTAATAATGAG+GGG 0.681453 6:+113960647 MsG0680035884.01.T01:CDS
ACTTCCTAATATCTCAGCAG+CGG 0.681716 6:-113959777 None:intergenic
GACGATTTAAGATGACCATG+AGG 0.683184 6:-113960316 None:intergenic
TCACAAAGAAGACTGATGTG+TGG 0.685945 6:+113960470 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCATTATCACCATTACATGG+AGG 0.691980 6:-113958475 None:intergenic
AAGAAAGTGATGAAGAATGG+TGG 0.692073 6:-113958334 None:intergenic
GATGGTTCAGTAAGATCACG+TGG 0.694944 6:+113959659 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCCGGAAGAGTGGAGCAGCG+AGG 0.728032 6:+113960606 MsG0680035884.01.T01:CDS
GCAGGTAATGAAAAGCTGTG+TGG 0.763339 6:+113959392 MsG0680035884.01.T01:intron
ACAACCAATTCGATACCACG+TGG 0.769573 6:+113958629 MsG0680035884.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATATTGAATTTATATTCT+CGG - Chr6:113960070-113960089 None:intergenic 10.0%
!! GATAATAATAATCAAAAGAA+AGG + Chr6:113959611-113959630 MsG0680035884.01.T01:CDS 15.0%
!! TTAGTTATATATATATTTGC+TGG + Chr6:113960804-113960823 MsG0680035884.01.T01:exon 15.0%
!!! ATGTATATATATACCTTTTA+TGG + Chr6:113959057-113959076 MsG0680035884.01.T01:intron 15.0%
!! AACAAATGAACAATGTTAAT+AGG + Chr6:113959867-113959886 MsG0680035884.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTAATATGCTAGATCTTT+CGG - Chr6:113960117-113960136 None:intergenic 20.0%
!! ATGAATTCAAAGAATAAATG+TGG + Chr6:113958996-113959015 MsG0680035884.01.T01:intron 20.0%
!! ATGTAAAAGTTAGTTATACT+AGG - Chr6:113960174-113960193 None:intergenic 20.0%
!! CAGAGAATTTATTATTAGAA+AGG - Chr6:113958693-113958712 None:intergenic 20.0%
!! CTTTCTAATAATAAATTCTC+TGG + Chr6:113958691-113958710 MsG0680035884.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAAACTGTTTATCCATAAA+AGG - Chr6:113959073-113959092 None:intergenic 20.0%
!!! TAAATAATGAATTTGAGATG+AGG + Chr6:113961111-113961130 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! TAGTTTTTCTTCTTTTCATA+AGG - Chr6:113959535-113959554 None:intergenic 20.0%
! AATGAATTGATACGAAATGA+TGG + Chr6:113959364-113959383 MsG0680035884.01.T01:intron 25.0%
! ACTAAACAACAAGAAGAATT+AGG + Chr6:113959551-113959570 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTAACAAGTAATAATGAG+GGG + Chr6:113960647-113960666 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTTAACAAGTAATAATGA+GGG + Chr6:113960646-113960665 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! TATGGATATTGATAAGAGAT+TGG + Chr6:113960711-113960730 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! TCAAATAATAATACAGACGA+TGG + Chr6:113959641-113959660 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! TGAATAGTATATGCATGTTT+GGG - Chr6:113959345-113959364 None:intergenic 25.0%
! TTGAATAGTATATGCATGTT+TGG - Chr6:113959346-113959365 None:intergenic 25.0%
! TTGTTACAAAGGAAATGTTT+GGG + Chr6:113958516-113958535 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTTACAAAGGAAATGTT+TGG + Chr6:113958515-113958534 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
!! CTAACTTTTACATTTAATGC+AGG + Chr6:113960181-113960200 MsG0680035884.01.T01:intron 25.0%
!! TAATGGTGATAATGCAAATT+GGG + Chr6:113958483-113958502 MsG0680035884.01.T01:CDS 25.0%
AAGAAGAAAGTGATGAAGAA+TGG - Chr6:113958340-113958359 None:intergenic 30.0%
AAGCTAATCGTTCTGATATA+CGG - Chr6:113958604-113958623 None:intergenic 30.0%
AATAAATTTGAGCCGTATTG+TGG + Chr6:113959454-113959473 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
AATCAATTTCCTCATGAATG+AGG + Chr6:113960899-113960918 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
AATTCCCAGTGTAATTAATG+AGG + Chr6:113961044-113961063 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
ACAATACGGCTCAAATTTAT+TGG - Chr6:113959455-113959474 None:intergenic 30.0%
AGGGATTGAATATCTATACA+AGG + Chr6:113960273-113960292 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
ATCAATTTCCTCATGAATGA+GGG + Chr6:113960900-113960919 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
CACAGACATAAGTATTTGTA+AGG - Chr6:113959301-113959320 None:intergenic 30.0%
CTTACAAATACTTATGTCTG+TGG + Chr6:113959299-113959318 MsG0680035884.01.T01:intron 30.0%
GAAGTGAGTCTTCAAAATTA+AGG + Chr6:113960845-113960864 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
GATACAAGAGAATAATCATG+AGG + Chr6:113960765-113960784 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
GATATACGGTAAATCTTTGA+TGG - Chr6:113958590-113958609 None:intergenic 30.0%
GGAGTTAACAAGTAATAATG+AGG + Chr6:113960645-113960664 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
GTAGCGAATAATCAATTAGA+GGG + Chr6:113958901-113958920 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
GTTAACAAGTAATAATGAGG+GGG + Chr6:113960648-113960667 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
GTTTATTAGTTGAAGTGAAG+AGG - Chr6:113960045-113960064 None:intergenic 30.0%
GTTTCTCTAAATTCAGGAAT+AGG - Chr6:113958865-113958884 None:intergenic 30.0%
TGTTACAAAGGAAATGTTTG+GGG + Chr6:113958517-113958536 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
TTAAGCGTTTCTCTAAATTC+AGG - Chr6:113958871-113958890 None:intergenic 30.0%
TTAAGGAAGATTTGTCTTCA+TGG + Chr6:113960862-113960881 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TTGGATGGAAATAAATTCAC+CGG + Chr6:113958838-113958857 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCATTATCACCATTACA+TGG - Chr6:113958481-113958500 None:intergenic 30.0%
! CGAGGTTTTTGATAAAGATA+TGG + Chr6:113960624-113960643 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
! GTAATGGTGATAATGCAAAT+TGG + Chr6:113958482-113958501 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTATCTTTTGACGACAA+CGG - Chr6:113959849-113959868 None:intergenic 30.0%
!! CTCATTTTGGAAATTCTAAC+CGG + Chr6:113960505-113960524 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAGCTTTTGAAGATTGCAT+TGG + Chr6:113960678-113960697 MsG0680035884.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAAGTGATGAAGAATGG+TGG - Chr6:113958337-113958356 None:intergenic 35.0%
AAGGTAAATGTTCTTGAGAC+CGG - Chr6:113958674-113958693 None:intergenic 35.0%
AATGCAGGATACCATTCTAT+AGG + Chr6:113960196-113960215 MsG0680035884.01.T01:intron 35.0%
AGCAGATTGAAGATAGTGAA+AGG + Chr6:113960241-113960260 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
AGTAATACCAGTAGCAGAAA+AGG + Chr6:113959686-113959705 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
ATAAAAACGGCTTACACATG+AGG - Chr6:113959132-113959151 None:intergenic 35.0%
ATGAGGTGAGGTTAGTATAT+TGG + Chr6:113961061-113961080 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ATGCATCTCTATTACGTTAC+TGG + Chr6:113961004-113961023 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ATTAGTACCTGTGATAAACC+AGG + Chr6:113960387-113960406 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
CAACAAGAAGAATTAGGAGA+AGG + Chr6:113959557-113959576 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
CCATGAAGATAATGTAACGT+CGG - Chr6:113958443-113958462 None:intergenic 35.0%
CGTAGCGAATAATCAATTAG+AGG + Chr6:113958900-113958919 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
CTCACCTCATTAATTACACT+GGG - Chr6:113961051-113961070 None:intergenic 35.0%
CTCGAAAACATGAACCTTAA+AGG + Chr6:113958547-113958566 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
GATCTTTCGGAAATAGTAAG+AGG - Chr6:113960104-113960123 None:intergenic 35.0%
GCTAATTTCCTACAACAAAG+TGG + Chr6:113960538-113960557 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGTATATTGGAGAGTTG+AGG + Chr6:113961071-113961090 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TAAAAACGGCTTACACATGA+GGG - Chr6:113959131-113959150 None:intergenic 35.0%
TCCTACAACAAAGTGGTAAA+GGG + Chr6:113960545-113960564 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
TCGGAAATAGTAAGAGGAAA+AGG - Chr6:113960098-113960117 None:intergenic 35.0%
TCTAAATTCAGGAATAGGAC+CGG - Chr6:113958860-113958879 None:intergenic 35.0%
TGCATCTCTATTACGTTACT+GGG + Chr6:113961005-113961024 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TGTTCTATTGAGTGAGTCAT+TGG + Chr6:113960342-113960361 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
TTACCAGAAAAAGATGAAGC+TGG - Chr6:113958955-113958974 None:intergenic 35.0%
TTCACTATCTTCAATCTGCT+TGG - Chr6:113960241-113960260 None:intergenic 35.0%
TTCCTACAACAAAGTGGTAA+AGG + Chr6:113960544-113960563 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
! ATTCCAGCTTCATCTTTTTC+TGG + Chr6:113958949-113958968 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTGTTGTAGGAAATTAGC+AGG - Chr6:113960538-113960557 None:intergenic 35.0%
! GAAATTAGCAGGAAGTTTTC+CGG - Chr6:113960527-113960546 None:intergenic 35.0%
! GAGTCTTGGTATACTCATTT+TGG + Chr6:113960492-113960511 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
! GCATGAATGATGGAAATCAA+TGG + Chr6:113960970-113960989 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! TGAGTTGAGTTTAGCGAATT+GGG + Chr6:113960570-113960589 MsG0680035884.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTATTTTCACAAGCTCTTC+AGG - Chr6:113959222-113959241 None:intergenic 35.0%
AAGTAATAATGAGGGGGAGA+TGG + Chr6:113960654-113960673 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
AATCCGTAGTCGGTTAGTAT+AGG - Chr6:113960370-113960389 None:intergenic 40.0%
ACTTCCTAATATCTCAGCAG+CGG - Chr6:113959780-113959799 None:intergenic 40.0%
AGATACTTCTTCCCTCACAA+AGG - Chr6:113959726-113959745 None:intergenic 40.0%
AGGATACCATTCTATAGGAC+AGG + Chr6:113960201-113960220 MsG0680035884.01.T01:intron 40.0%
ATAGCAAGTTGTCCTTTGTG+AGG + Chr6:113959711-113959730 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAGCTGGAATCTTGCTA+AGG - Chr6:113958942-113958961 None:intergenic 40.0%
CCAAACCTAAACAAACTCAC+CGG + Chr6:113958652-113958671 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
CCAGTGTAATTAATGAGGTG+AGG + Chr6:113961049-113961068 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
CCGACGTTACATTATCTTCA+TGG + Chr6:113958440-113958459 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
CCTCACCTCATTAATTACAC+TGG - Chr6:113961052-113961071 None:intergenic 40.0%
CGACGTCAATGTTACCTTTA+AGG - Chr6:113958564-113958583 None:intergenic 40.0%
CTCGACAATAATCAGTTCAC+TGG + Chr6:113958766-113958785 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
GAAGATTTGTCTTCATGGCA+AGG + Chr6:113960867-113960886 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GCATTATCACCATTACATGG+AGG - Chr6:113958478-113958497 None:intergenic 40.0%
GGATGTTGCTCACGAAATAA+TGG + Chr6:113960408-113960427 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
TACTAGGTAGTTGTTCTCAC+TGG - Chr6:113960158-113960177 None:intergenic 40.0%
TAGCAAGTTGTCCTTTGTGA+GGG + Chr6:113959712-113959731 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
TCACAAAGAAGACTGATGTG+TGG + Chr6:113960470-113960489 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGAGGAAAATACCGTGA+AGG - Chr6:113960030-113960049 None:intergenic 40.0%
TTATTTCGTGAGCAACATCC+TGG - Chr6:113960408-113960427 None:intergenic 40.0%
TTCATGCCAAGTCATGTTGT+TGG - Chr6:113960929-113960948 None:intergenic 40.0%
TTGTAGTAGTAAGCTACGAG+AGG - Chr6:113959950-113959969 None:intergenic 40.0%
TTGTCACAGTTCATCCTACA+AGG + Chr6:113959802-113959821 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
! ATAGTGAAAGGCATAGCGAA+AGG + Chr6:113960253-113960272 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
! ATCTTTTGACGACAACGGTA+GGG - Chr6:113959844-113959863 None:intergenic 40.0%
! GACGATTTAAGATGACCATG+AGG - Chr6:113960319-113960338 None:intergenic 40.0%
! GTGAGTTGAGTTTAGCGAAT+TGG + Chr6:113960569-113960588 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
! TAGTGAAAGGCATAGCGAAA+GGG + Chr6:113960254-113960273 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
! TATCTTTTGACGACAACGGT+AGG - Chr6:113959845-113959864 None:intergenic 40.0%
! TCCCTTTACCACTTTGTTGT+AGG - Chr6:113960549-113960568 None:intergenic 40.0%
! TGCATTGGCATGTTGTGATA+TGG + Chr6:113960693-113960712 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
! TGGTGATAATGCAAATTGGG+CGG + Chr6:113958486-113958505 MsG0680035884.01.T01:CDS 40.0%
AACCGCAACGATATCAACCT+CGG - Chr6:113958820-113958839 None:intergenic 45.0%
AAGACTGATGTGTGGAGTCT+TGG + Chr6:113960478-113960497 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
ACAACCAATTCGATACCACG+TGG + Chr6:113958629-113958648 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
ACATCCATGCCTCCATGTAA+TGG + Chr6:113958466-113958485 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCCATTGGGAACATAGT+CGG - Chr6:113959996-113960015 None:intergenic 45.0%
AGCACATGAGAAGACTAGGA+AGG + Chr6:113959903-113959922 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGGAATCTTGCTAAGGT+TGG - Chr6:113958938-113958957 None:intergenic 45.0%
AGTAGTAAGCTACGAGAGGA+AGG - Chr6:113959946-113959965 None:intergenic 45.0%
ATCACCATTACATGGAGGCA+TGG - Chr6:113958473-113958492 None:intergenic 45.0%
ATGCTTGCAATGCAAGGCAA+TGG + Chr6:113960948-113960967 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CAAGAACCACGACCACAATA+CGG - Chr6:113959469-113959488 None:intergenic 45.0%
CAAGGCAATGGCATGAATGA+TGG + Chr6:113960960-113960979 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CACAGGTACTAATCCGTAGT+CGG - Chr6:113960380-113960399 None:intergenic 45.0%
CACCTGAGTATTTGCAGCAT+GGG + Chr6:113960443-113960462 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
CTATGTTCCCAATGGCAGTT+TGG + Chr6:113959997-113960016 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
CTCATGTGCTCTTGAAACTC+TGG - Chr6:113959893-113959912 None:intergenic 45.0%
GAAAATACCGTGAAGGCGAA+CGG - Chr6:113960023-113960042 None:intergenic 45.0%
GAAGAATTAGGAGAAGGAGC+TGG + Chr6:113959563-113959582 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
GAAGCAAGGGAAGTTGGAAT+AGG - Chr6:113958793-113958812 None:intergenic 45.0%
GAGCCTATACTAACCGACTA+CGG + Chr6:113960364-113960383 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
GATGGTTCAGTAAGATCACG+TGG + Chr6:113959659-113959678 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
GCAACATCCTGGTTTATCAC+AGG - Chr6:113960397-113960416 None:intergenic 45.0%
GCAGGTAATGAAAAGCTGTG+TGG + Chr6:113959392-113959411 MsG0680035884.01.T01:intron 45.0%
GCATGAATGCTTGCAATGCA+AGG + Chr6:113960942-113960961 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GCTGCTGAGATATTAGGAAG+TGG + Chr6:113959779-113959798 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
GGCTTTCCTGTCCTATAGAA+TGG - Chr6:113960210-113960229 None:intergenic 45.0%
GTTGAGTTTAGCGAATTGGG+TGG + Chr6:113960573-113960592 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
TAGGACAGGAAAGCCTTGAT+TGG + Chr6:113960215-113960234 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
TCAATCTGCTTGGCCAATCA+AGG - Chr6:113960231-113960250 None:intergenic 45.0%
TCACCTGAGTATTTGCAGCA+TGG + Chr6:113960442-113960461 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
TCGACGAACATGCTCCTAAA+GGG - Chr6:113959421-113959440 None:intergenic 45.0%
TTCGACGAACATGCTCCTAA+AGG - Chr6:113959422-113959441 None:intergenic 45.0%
TTGAGATGAGGTGCACTTTG+AGG + Chr6:113961123-113961142 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TTGATATCGTTGCGGTTGGA+TGG + Chr6:113958823-113958842 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
! ATCACCGACTATGTTCCCAA+TGG + Chr6:113959989-113960008 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGAGCACATGAGAAGACT+AGG + Chr6:113959899-113959918 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
! CCGGTGAGTTTGTTTAGGTT+TGG - Chr6:113958655-113958674 None:intergenic 45.0%
! GCTATCTCCTTTTCTGCTAC+TGG - Chr6:113959696-113959715 None:intergenic 45.0%
! GGTGATAATGCAAATTGGGC+GGG + Chr6:113958487-113958506 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGACCGGTGAGTTTGTTT+AGG - Chr6:113958660-113958679 None:intergenic 45.0%
! TTTGTTTAGGTTTGGCCACG+TGG - Chr6:113958647-113958666 None:intergenic 45.0%
!! ATTCCAGCAGAAGCGTTTCA+AGG + Chr6:113958718-113958737 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCCAGCAGAAGCGTTTCAA+GGG + Chr6:113958719-113958738 MsG0680035884.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTTATTTTTTGTTATAAAAA+CGG - Chr6:113959145-113959164 None:intergenic 5.0%
AAGCGTTTCAAGGGATGCAG+TGG + Chr6:113958728-113958747 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
AAGCTGTGTGGAGTCCCTTT+AGG + Chr6:113959404-113959423 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCCGCTGCTGAGATATT+AGG + Chr6:113959773-113959792 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
ATCCCTTGAAACGCTTCTGC+TGG - Chr6:113958724-113958743 None:intergenic 50.0%
ATTCTGTTGTGCCGGAAGAG+TGG + Chr6:113960596-113960615 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
CAACCTCGGCAATGAAGCAA+GGG - Chr6:113958806-113958825 None:intergenic 50.0%
CCATGAGGCGCAATCAAGTT+CGG - Chr6:113960304-113960323 None:intergenic 50.0%
CTGAGTATTTGCAGCATGGG+CGG + Chr6:113960446-113960465 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
GCGGGCGTTCTTTGTTACAA+AGG + Chr6:113958505-113958524 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
GCTACGAGAGGAAGGAGATT+CGG - Chr6:113959938-113959957 None:intergenic 50.0%
GGAATCTTGCTAAGGTTGGC+AGG - Chr6:113958934-113958953 None:intergenic 50.0%
GGCAATGAAGCAAGGGAAGT+TGG - Chr6:113958799-113958818 None:intergenic 50.0%
GGGTTGCCAACAACATGACT+TGG + Chr6:113960920-113960939 MsG0680035884.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
GTTGGCAACCCTCATTCATG+AGG - Chr6:113960911-113960930 None:intergenic 50.0%
TACAAGGCTGCTCTGTTGAC+TGG + Chr6:113959818-113959837 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
TACGAAATGATGGTCAGCGC+AGG + Chr6:113959374-113959393 MsG0680035884.01.T01:intron 50.0%
TCAACCTCGGCAATGAAGCA+AGG - Chr6:113958807-113958826 None:intergenic 50.0%
TTAGGAGAAGGAGCTGGTGT+AGG + Chr6:113959569-113959588 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
TTTGAGCCGTATTGTGGTCG+TGG + Chr6:113959460-113959479 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
! AGTCAACAGAGCAGCCTTGT+AGG - Chr6:113959819-113959838 None:intergenic 50.0%
! TTGGCCACGTGGTATCGAAT+TGG - Chr6:113958636-113958655 None:intergenic 50.0%
! TTGGGTGGATTCTGTTGTGC+CGG + Chr6:113960588-113960607 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGTTGATATCGTTGCGGT+TGG + Chr6:113958819-113958838 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
!! TGCCGAGGTTGATATCGTTG+CGG + Chr6:113958815-113958834 MsG0680035884.01.T01:CDS 50.0%
AGTTTGGCCGTTCGCCTTCA+CGG + Chr6:113960013-113960032 MsG0680035884.01.T01:CDS 55.0%
CCGAACTTGATTGCGCCTCA+TGG + Chr6:113960301-113960320 MsG0680035884.01.T01:CDS 55.0%
CGAACGGCCAAACTGCCATT+GGG - Chr6:113960007-113960026 None:intergenic 55.0%
CGCCCATGCTGCAAATACTC+AGG - Chr6:113960448-113960467 None:intergenic 55.0%
CTTCCCTTGCTTCATTGCCG+AGG + Chr6:113958800-113958819 MsG0680035884.01.T01:CDS 55.0%
GGTGTAGGTGCAAACACGAG+CGG + Chr6:113959584-113959603 MsG0680035884.01.T01:CDS 55.0%
ACCTCGCTGCTCCACTCTTC+CGG - Chr6:113960610-113960629 None:intergenic 60.0%
AGGTGCAAACACGAGCGGCA+GGG + Chr6:113959589-113959608 MsG0680035884.01.T01:CDS 60.0%
GCGAACGGCCAAACTGCCAT+TGG - Chr6:113960008-113960027 None:intergenic 60.0%
TAGGTGCAAACACGAGCGGC+AGG + Chr6:113959588-113959607 MsG0680035884.01.T01:CDS 60.0%
GCCGGAAGAGTGGAGCAGCG+AGG + Chr6:113960606-113960625 MsG0680035884.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 113958328 113961151 113958328 ID=MsG0680035884.01;Name=MsG0680035884.01
Chr6 mRNA 113958328 113961151 113958328 ID=MsG0680035884.01.T01;Parent=MsG0680035884.01;Name=MsG0680035884.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0.5|0.33|1|1|1|3|344|628
Chr6 exon 113958328 113958970 113958328 ID=MsG0680035884.01.T01:exon:9982;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 exon 113959396 113960034 113959396 ID=MsG0680035884.01.T01:exon:9983;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 exon 113960203 113961151 113960203 ID=MsG0680035884.01.T01:exon:9984;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 CDS 113958328 113958970 113958328 ID=MsG0680035884.01.T01:cds;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 CDS 113959396 113960034 113959396 ID=MsG0680035884.01.T01:cds;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 CDS 113960203 113960807 113960203 ID=MsG0680035884.01.T01:cds;Parent=MsG0680035884.01.T01
Chr6 three_prime_UTR 113960808 113961151 113960808 ID=MsG0680035884.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0680035884.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035884.01.T01

ATGGCACCACCATTCTTCATCACTTTCTTCTTTTCTATTAATCTCATTAACATTGCTTATTGTATTTCAGACATAGATTCTCTTCTCAAATTTAAAAACTCTCTTCAAAACACCGACGTTACATTATCTTCATGGAACACATCCATGCCTCCATGTAATGGTGATAATGCAAATTGGGCGGGCGTTCTTTGTTACAAAGGAAATGTTTGGGGATTCAAACTCGAAAACATGAACCTTAAAGGTAACATTGACGTCGATTCCATCAAAGATTTACCGTATATCAGAACGATTAGCTTAATGAACAACCAATTCGATACCACGTGGCCAAACCTAAACAAACTCACCGGTCTCAAGAACATTTACCTTTCTAATAATAAATTCTCTGGCGAGATTCCAGCAGAAGCGTTTCAAGGGATGCAGTGGCTGAAGAAAATTTATCTCGACAATAATCAGTTCACTGGTCCTATTCCAACTTCCCTTGCTTCATTGCCGAGGTTGATATCGTTGCGGTTGGATGGAAATAAATTCACCGGTCCTATTCCTGAATTTAGAGAAACGCTTAAATCATTCAGCGTAGCGAATAATCAATTAGAGGGTGAAATACCTGCCAACCTTAGCAAGATTCCAGCTTCATCTTTTTCTGGTAATGAAAAGCTGTGTGGAGTCCCTTTAGGAGCATGTTCGTCGAATAAGAAATCACCAATAAATTTGAGCCGTATTGTGGTCGTGGTTCTTGTTAGTCTTGCACTTCTTGTGATTGCAGCAGTAATAGTATATGTCCTTATGAAAAGAAGAAAAACTAAACAACAAGAAGAATTAGGAGAAGGAGCTGGTGTAGGTGCAAACACGAGCGGCAGGGATAATAATAATCAAAAGAAAGGATCATCATCAAATAATAATACAGACGATGGTTCAGTAAGATCACGTGGAAGCAGTAATACCAGTAGCAGAAAAGGAGATAGCAAGTTGTCCTTTGTGAGGGAAGAAGTATCTGCAGAATTTGATTTGCAAGATCTTTTGAGAGCCGCTGCTGAGATATTAGGAAGTGGTTGTCACAGTTCATCCTACAAGGCTGCTCTGTTGACTGGCCCTACCGTTGTCGTCAAAAGATACAAACAAATGAACAATGTTAATAGGCCAGAGTTTCAAGAGCACATGAGAAGACTAGGAAGGTTGAATCATCCGAATCTCCTTCCTCTCGTAGCTTACTACTACAAAAGAGACGAGAAACTTTTTATCACCGACTATGTTCCCAATGGCAGTTTGGCCGTTCGCCTTCACGGATACCATTCTATAGGACAGGAAAGCCTTGATTGGCCAAGCAGATTGAAGATAGTGAAAGGCATAGCGAAAGGGATTGAATATCTATACAAGGAGATGCCGAACTTGATTGCGCCTCATGGTCATCTTAAATCGTCAAATGTTCTATTGAGTGAGTCATTGGAGCCTATACTAACCGACTACGGATTAGTACCTGTGATAAACCAGGATGTTGCTCACGAAATAATGGTTATATACGCGTCACCTGAGTATTTGCAGCATGGGCGGATCACAAAGAAGACTGATGTGTGGAGTCTTGGTATACTCATTTTGGAAATTCTAACCGGAAAACTTCCTGCTAATTTCCTACAACAAAGTGGTAAAGGGAGTGAGTTGAGTTTAGCGAATTGGGTGGATTCTGTTGTGCCGGAAGAGTGGAGCAGCGAGGTTTTTGATAAAGATATGGAGTTAACAAGTAATAATGAGGGGGAGATGGTTAAGCTTTTGAAGATTGCATTGGCATGTTGTGATATGGATATTGATAAGAGATTGGATTTGAAAGAAGCTGCTGAAAGAATTCAAGAGATACAAGAGAATAATCATGAGGATGATTTGAATTCTTCTTAG
Protein sequence

>MsG0680035884.01.T01

MAPPFFITFFFSINLINIAYCISDIDSLLKFKNSLQNTDVTLSSWNTSMPPCNGDNANWAGVLCYKGNVWGFKLENMNLKGNIDVDSIKDLPYIRTISLMNNQFDTTWPNLNKLTGLKNIYLSNNKFSGEIPAEAFQGMQWLKKIYLDNNQFTGPIPTSLASLPRLISLRLDGNKFTGPIPEFRETLKSFSVANNQLEGEIPANLSKIPASSFSGNEKLCGVPLGACSSNKKSPINLSRIVVVVLVSLALLVIAAVIVYVLMKRRKTKQQEELGEGAGVGANTSGRDNNNQKKGSSSNNNTDDGSVRSRGSSNTSSRKGDSKLSFVREEVSAEFDLQDLLRAAAEILGSGCHSSSYKAALLTGPTVVVKRYKQMNNVNRPEFQEHMRRLGRLNHPNLLPLVAYYYKRDEKLFITDYVPNGSLAVRLHGYHSIGQESLDWPSRLKIVKGIAKGIEYLYKEMPNLIAPHGHLKSSNVLLSESLEPILTDYGLVPVINQDVAHEIMVIYASPEYLQHGRITKKTDVWSLGILILEILTGKLPANFLQQSGKGSELSLANWVDSVVPEEWSSEVFDKDMELTSNNEGEMVKLLKIALACCDMDIDKRLDLKEAAERIQEIQENNHEDDLNSS*