AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004477.01

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MsG0180004477.01.T01 AT1G51850 36.983 411 233 9 382 791 496 881 1.59e-75 264
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MsG0180004477.01.T01 AT5G02070 39.867 301 173 3 467 759 349 649 6.93e-67 235
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MsG0180004477.01.T01 AT5G59670 38.438 320 183 6 467 785 552 858 1.05e-62 227
MsG0180004477.01.T01 AT3G46355 39.322 295 154 6 478 772 2 271 1.54e-62 213
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MsG0180004477.01.T01 AT1G06700 38.225 293 173 3 469 754 56 347 2.86e-60 209
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MsG0180004477.01.T01 AT1G72300 37.829 304 181 3 458 754 776 1078 4.50e-56 209
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MsG0180004477.01.T01 AT5G15730 36.013 311 180 8 462 771 98 390 1.19e-55 198
MsG0180004477.01.T01 AT5G15730 36.013 311 180 8 462 771 98 390 1.19e-55 198
MsG0180004477.01.T01 AT1G60800 37.162 296 183 3 461 754 281 575 1.25e-55 203
MsG0180004477.01.T01 AT2G18890 36.364 297 172 6 467 753 54 343 1.44e-55 195
MsG0180004477.01.T01 AT5G03140 38.816 304 173 7 467 763 360 657 1.61e-55 204
MsG0180004477.01.T01 AT5G15730 36.013 311 178 8 462 771 98 388 1.95e-55 197
MsG0180004477.01.T01 AT2G23450 37.931 290 174 3 468 754 335 621 1.96e-55 204
MsG0180004477.01.T01 AT2G23450 37.931 290 174 3 468 754 335 621 1.96e-55 204
MsG0180004477.01.T01 AT4G32300 36.137 321 198 5 464 783 478 792 2.11e-55 205
MsG0180004477.01.T01 AT2G18890 36.301 292 175 5 467 754 54 338 2.18e-55 196
MsG0180004477.01.T01 AT1G54820 39.789 284 143 8 460 725 127 400 3.44e-55 196
MsG0180004477.01.T01 AT4G02420 37.234 282 172 4 471 750 340 618 4.06e-55 202
MsG0180004477.01.T01 AT1G49730 47.964 221 109 3 467 685 315 531 5.40e-55 201
MsG0180004477.01.T01 AT1G70740 35.331 317 188 4 460 764 32 343 5.77e-55 196
MsG0180004477.01.T01 AT2G39110 41.391 302 159 6 467 754 76 373 6.37e-55 196
MsG0180004477.01.T01 AT2G39110 41.391 302 159 6 467 754 61 358 7.02e-55 196
MsG0180004477.01.T01 AT2G41970 36.610 295 180 3 470 758 62 355 9.18e-55 194
MsG0180004477.01.T01 AT4G13190 42.437 238 130 3 466 699 56 290 9.81e-55 191
MsG0180004477.01.T01 AT1G16110 47.887 213 109 2 467 678 418 629 1.10e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT4G23220 35.849 318 196 5 450 763 308 621 1.26e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT3G13380 37.801 291 179 2 458 746 835 1125 1.39e-54 205
MsG0180004477.01.T01 AT4G13190 37.676 284 170 3 502 781 4 284 1.58e-54 191
MsG0180004477.01.T01 AT1G61420 34.906 318 204 2 468 783 331 647 1.93e-54 200
MsG0180004477.01.T01 AT1G61420 34.906 318 204 2 468 783 333 649 2.01e-54 200
MsG0180004477.01.T01 AT1G70130 37.288 295 181 3 469 762 322 613 3.30e-54 199
MsG0180004477.01.T01 AT5G63940 33.239 352 223 5 466 817 347 686 4.45e-54 200
MsG0180004477.01.T01 AT1G51940 39.145 304 157 9 469 753 329 623 4.51e-54 199
MsG0180004477.01.T01 AT4G39400 38.567 293 172 5 458 746 860 1148 5.61e-54 203
MsG0180004477.01.T01 AT1G61420 34.906 318 204 2 468 783 481 797 6.39e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT1G61420 34.906 318 204 2 468 783 483 799 6.45e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT1G61420 34.906 318 204 2 468 783 483 799 6.45e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT1G61610 38.676 287 172 4 469 754 513 796 7.34e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT2G37710 36.610 295 182 4 469 761 335 626 8.31e-54 199
MsG0180004477.01.T01 AT1G70530 35.256 312 192 6 450 759 294 597 9.13e-54 198
MsG0180004477.01.T01 AT1G29730 44.397 232 124 4 469 698 628 856 9.85e-54 201
MsG0180004477.01.T01 AT1G55610 37.162 296 183 2 458 750 836 1131 1.41e-53 202
MsG0180004477.01.T01 AT1G55610 37.162 296 183 2 458 750 836 1131 1.41e-53 202
MsG0180004477.01.T01 AT3G20200 41.404 285 146 8 467 746 439 707 1.52e-53 199
MsG0180004477.01.T01 AT5G57670 34.237 295 185 4 458 750 244 531 1.84e-53 196
MsG0180004477.01.T01 AT3G20200 41.404 285 146 8 467 746 439 707 1.90e-53 199
MsG0180004477.01.T01 AT3G20200 41.404 285 146 8 467 746 439 707 1.90e-53 199
MsG0180004477.01.T01 AT1G26970 42.520 254 133 6 506 754 3 248 2.04e-53 187
MsG0180004477.01.T01 AT5G65530 33.430 344 215 6 458 797 121 454 2.09e-53 192
MsG0180004477.01.T01 AT5G24080 34.226 336 210 4 469 801 393 720 2.25e-53 198
MsG0180004477.01.T01 AT5G24080 34.226 336 210 4 469 801 393 720 2.25e-53 198
MsG0180004477.01.T01 AT5G18910 35.789 285 174 4 467 750 178 454 2.28e-53 194
MsG0180004477.01.T01 AT3G26700 39.194 273 157 5 431 699 27 294 2.38e-53 188
MsG0180004477.01.T01 AT3G26700 39.194 273 157 5 431 699 27 294 2.38e-53 188
MsG0180004477.01.T01 AT4G11480 36.190 315 187 6 469 775 312 620 3.07e-53 196
MsG0180004477.01.T01 AT2G23950 37.500 296 178 4 461 754 279 569 3.11e-53 196
MsG0180004477.01.T01 AT4G11480 36.190 315 187 6 469 775 309 617 3.11e-53 196
MsG0180004477.01.T01 AT4G22130 32.039 412 254 7 362 753 123 528 3.26e-53 194
MsG0180004477.01.T01 AT3G20200 41.404 285 146 8 467 746 439 707 3.33e-53 198
MsG0180004477.01.T01 AT4G23150 37.993 279 170 3 472 749 327 603 3.81e-53 196
MsG0180004477.01.T01 AT5G53890 37.370 289 180 1 466 754 739 1026 4.73e-53 200
MsG0180004477.01.T01 AT1G11303 37.943 282 165 5 469 749 497 769 5.06e-53 198
MsG0180004477.01.T01 AT1G61480 36.268 284 180 1 467 750 482 764 5.28e-53 198

Find 179 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 202 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GATGATACGCCTTATCTTTA+TGG 0.073872 1:-78650831 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTTGCAAAGGTTTCAGATTT+TGG 0.102171 1:-78649385 MsG0180004477.01.T01:CDS
GCAAACTTGTTCAAGCTTTC+AGG 0.129380 1:+78649079 None:intergenic
ACATGACCCTGGTTCATATT+TGG 0.149476 1:+78649346 None:intergenic
TTCTACCGAATAAACGTTAT+TGG 0.187719 1:-78651265 MsG0180004477.01.T01:CDS
AAAGATGAATCTTTATTATT+AGG 0.191232 1:-78651473 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTCATCATCATCGTCCTTTC+GGG 0.205372 1:+78648774 None:intergenic
ATATCTCCGGTTCAAGATTC+TGG 0.224256 1:-78650873 MsG0180004477.01.T01:CDS
CCAGACAACAAATACCTTTC+AGG 0.244201 1:-78651398 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGTCATCATCATCGTCCTTT+CGG 0.245141 1:+78648773 None:intergenic
TGTTGTCTTCTAAAATATTC+AGG 0.247948 1:+78649286 None:intergenic
TACAAGGGTGTTATTGATAA+TGG 0.251340 1:-78649757 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTGATCTTTCCTTTGAGATT+TGG 0.263448 1:+78649103 None:intergenic
TTTGATGAGTCCAATGTTAT+TGG 0.272666 1:-78649802 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATTGGACTCATCAAAATTCT+TGG 0.280754 1:+78649810 None:intergenic
AAACAAAAGGAAAGGAAAAT+TGG 0.286922 1:-78649140 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGTCTGATGTTTACTCATTC+GGG 0.293927 1:-78649252 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTTGACAATTTGAGAGAAAA+TGG 0.296155 1:+78648796 None:intergenic
TAACGTTTATTCGGTAGAAT+AGG 0.299856 1:+78651269 None:intergenic
GTTTGTGCATTCAACAAAAT+AGG 0.301941 1:+78651500 None:intergenic
CCTGAAAGGTATTTGTTGTC+TGG 0.312181 1:+78651398 None:intergenic
TCAAGTTGGTTGCCTCTCTA+TGG 0.326004 1:-78649958 MsG0180004477.01.T01:CDS
TAATAAAGATTCATCTTTGT+TGG 0.326020 1:+78651478 None:intergenic
TTCCATGATAAAGTATCTAT+TGG 0.332682 1:+78649529 None:intergenic
GTTATTGGTGTAGGAGGGTT+TGG 0.333397 1:-78649787 MsG0180004477.01.T01:CDS
TAAAGGAGTGCCTACTTATA+AGG 0.345478 1:-78650508 MsG0180004477.01.T01:CDS
AAGTCTGATGTTTACTCATT+CGG 0.348099 1:-78649253 MsG0180004477.01.T01:CDS
CTTAGCCAATAACGTTTATT+CGG 0.349640 1:+78651260 None:intergenic
ATAATATTCCGGCTTTGAAT+CGG 0.351781 1:+78650419 None:intergenic
TTATTATTAGGATGTGGTTT+AGG 0.359084 1:-78651461 MsG0180004477.01.T01:CDS
CTTGTTAAGTACATCGAATT+CGG 0.363194 1:+78650642 None:intergenic
GCAAGGCTAACTTGTTCCTT+TGG 0.366088 1:+78649178 None:intergenic
ACAAGTTAGCCTTGCAGATT+GGG 0.368805 1:-78649170 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGTATAGCATCATAATATTC+CGG 0.373547 1:+78650408 None:intergenic
TGATCCTGTTGATTTCGTTC+CGG 0.374585 1:+78649921 None:intergenic
AACAATCAAACGGCGCAGGC+TGG 0.382113 1:-78650558 MsG0180004477.01.T01:CDS
CGGTAGAATAGGGAATTTGT+AGG 0.382203 1:+78651280 None:intergenic
TTCACTCCTTGTTCTGATTG+TGG 0.385173 1:+78649706 None:intergenic
AAACATTTAGTGTCTTTGAT+AGG 0.392221 1:-78649640 MsG0180004477.01.T01:CDS
AACGTTTATTCGGTAGAATA+GGG 0.392308 1:+78651270 None:intergenic
CAAACTTGTTCAAGCTTTCA+GGG 0.399154 1:+78649080 None:intergenic
TAATATTCCGGCTTTGAATC+GGG 0.402957 1:+78650420 None:intergenic
TATTCGAGGCATTGTGTTCA+AGG 0.405555 1:-78649222 MsG0180004477.01.T01:CDS
CAGGCTGGGGCAGATGTCAT+TGG 0.410290 1:-78650543 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGGATCAGGGAAGAGTACTA+TGG 0.410666 1:-78649905 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGAACGAAATCAACAGGATC+AGG 0.416385 1:-78649919 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGTGATTTATGTTCAAGATC+AGG 0.428893 1:-78650481 MsG0180004477.01.T01:CDS
AACAAGTTAGCCTTGCAGAT+TGG 0.440932 1:-78649171 MsG0180004477.01.T01:CDS
CATGTTAGTACAGTGGTAAA+AGG 0.441363 1:-78649328 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATTCCACAACAGATCATTCA+TGG 0.441445 1:+78649009 None:intergenic
TTTGTTATCGGTGGTGCTGC+CGG 0.442392 1:-78650253 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATTCAACATCAAGATCAAT+GGG 0.443906 1:-78650720 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTCGATTCACCTTCGTTGGT+CGG 0.446220 1:-78650972 MsG0180004477.01.T01:CDS
GCAGATGTCATTGGTTGGAC+AGG 0.450437 1:-78650534 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATCAAGGTAAGCTTGTGATA+AGG 0.450881 1:+78651121 None:intergenic
GGAAGATGATGAAATGTGTT+TGG 0.451278 1:-78649608 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTTAAATTGTTGTAAACAGA+AGG 0.455366 1:+78651224 None:intergenic
CAAGTGAATATTCTTTATCA+AGG 0.456018 1:+78651105 None:intergenic
ACAATCAAACGGCGCAGGCT+GGG 0.461239 1:-78650557 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGTGCTGCCGGAGGTGCTGC+AGG 0.461612 1:-78650241 MsG0180004477.01.T01:CDS
CTTGGCACACAATAATGAAA+TGG 0.462879 1:-78648894 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGCAAAACCTGCAGCACCTC+CGG 0.463156 1:+78650234 None:intergenic
ATTCGGGGTTGTTCTATTCG+AGG 0.464148 1:-78649236 MsG0180004477.01.T01:CDS
ACAGTGGTAAAAGGTAGTTT+TGG 0.467964 1:-78649319 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTCTTATGAGTTGAACCATC+GGG 0.468627 1:+78648956 None:intergenic
TATTCAACTTATTCAAATGC+CGG 0.469225 1:-78651003 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGAATTTGAAGAGGTGAACT+TGG 0.472495 1:-78648912 MsG0180004477.01.T01:CDS
TCCAATGTTATTGGTGTAGG+AGG 0.474158 1:-78649793 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTATTCAACATCAAGATCAA+TGG 0.477437 1:-78650721 MsG0180004477.01.T01:CDS
CAAAGGTTGGAGATTTGCAT+TGG 0.478776 1:-78649505 MsG0180004477.01.T01:CDS
AATGCTCCCTCATGGTTCCA+TGG 0.479088 1:+78649569 None:intergenic
ACTTGTTCCTTTGGAAGGCT+AGG 0.479645 1:+78649187 None:intergenic
TGGTGGGCAATTTATATCTC+CGG 0.481501 1:-78650886 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATTGGGCTTTGCTAAACAAA+AGG 0.485424 1:-78649153 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGCTAACTTGTTCCTTTGGA+AGG 0.487750 1:+78649182 None:intergenic
TTAAGAACATTTGAATTCAA+AGG 0.488449 1:+78651080 None:intergenic
AAAATACGCGCTGACATGTA+TGG 0.490875 1:+78651317 None:intergenic
TATCTTTATGGTGCTTCCAC+CGG 0.490883 1:-78650819 MsG0180004477.01.T01:CDS
CTCAAACCAGAATCTTGAAC+CGG 0.493669 1:+78650867 None:intergenic
CGAGGCATTGTGTTCAAGGC+CGG 0.494846 1:-78649218 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATTGGTTGGACAGGCGGTAA+AGG 0.495246 1:-78650525 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATTATGATGCTATACTCAA+TGG 0.495567 1:-78650402 MsG0180004477.01.T01:intron
ACAGCCGGAACGAAATCAAC+AGG 0.496440 1:-78649925 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTTGTTCGATTCACCTTCGT+TGG 0.497870 1:-78650976 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTTGTATAAATGCTCCCTCA+TGG 0.499947 1:+78649561 None:intergenic
CACAGGAAGAAGAGAGCACC+AGG 0.507170 1:-78650181 MsG0180004477.01.T01:intron
TGTTTAGATTAAATGTTGGT+GGG 0.509563 1:-78650902 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATGTTTAGATTAAATGTTGG+TGG 0.509838 1:-78650903 MsG0180004477.01.T01:CDS
GCACCATTGTGTTTATCAGA+AGG 0.510986 1:+78651044 None:intergenic
GTGTTTGGTTTATGATTACA+TGG 0.511667 1:-78649593 MsG0180004477.01.T01:CDS
CAATCAAACGGCGCAGGCTG+GGG 0.514098 1:-78650556 MsG0180004477.01.T01:CDS
GAAAAGTGTCTGTCTGATCA+TGG 0.514781 1:-78649046 MsG0180004477.01.T01:CDS
TCCGGCTTTGAATCGGGCGA+TGG 0.516430 1:+78650426 None:intergenic
GAATCTTTATTATTAGGATG+TGG 0.517053 1:-78651467 MsG0180004477.01.T01:CDS
AACCAATAGATACTTTATCA+TGG 0.517675 1:-78649531 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTTATCATGGAAGCAAAGGT+TGG 0.520928 1:-78649518 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGGCAGGTGATGATCAACTT+TGG 0.522609 1:-78650461 MsG0180004477.01.T01:CDS
CATGCTCACTTCCAAGGCTA+AGG 0.523667 1:+78648855 None:intergenic
AGCAGCTTGATTCGTAATAC+CGG 0.524977 1:+78650800 None:intergenic
TTATTGAATTTCCTCCTGAA+AGG 0.526596 1:+78651384 None:intergenic
GTTTATGATTACATGGCCCA+TGG 0.526688 1:-78649586 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGAATTTCTGATAAAAGAGA+AGG 0.530794 1:+78651338 None:intergenic
CGAATTCGATGTACTTAACA+AGG 0.536704 1:-78650641 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATTGATAATGGTGTTAAAG+TGG 0.537126 1:-78649746 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGTGAATCGAACAACAAATC+CGG 0.538564 1:+78650984 None:intergenic
CCCTCCTACACCAATAACAT+TGG 0.539622 1:+78649792 None:intergenic
ATGCTCCCTCATGGTTCCAT+GGG 0.542539 1:+78649570 None:intergenic
ATACTTTATCATGGAAGCAA+AGG 0.543022 1:-78649522 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGGTGTAGGAGGGTTTGGAA+AGG 0.543513 1:-78649782 MsG0180004477.01.T01:CDS
AAATGAGAGTGAATTTGAAG+AGG 0.543765 1:-78648921 MsG0180004477.01.T01:CDS
ACAATGTTTAGATTAAATGT+TGG 0.545554 1:-78650906 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTACAACAATTTAAACCCAT+CGG 0.548056 1:-78651216 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATCTTTGTCAACAATCAAA+CGG 0.549789 1:-78650568 MsG0180004477.01.T01:CDS
CAAAAGGAAAGGAAAATTGG+AGG 0.551396 1:-78649137 MsG0180004477.01.T01:CDS
CTGGGGCAGATGTCATTGGT+TGG 0.551558 1:-78650539 MsG0180004477.01.T01:CDS
TAAGGTCATGCTCACTTCCA+AGG 0.561591 1:+78648849 None:intergenic
TCCATCGCCCGATTCAAAGC+CGG 0.563924 1:-78650427 MsG0180004477.01.T01:CDS
CCAATGTTATTGGTGTAGGA+GGG 0.565797 1:-78649792 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATGTGTTGCTGTTCATCAC+AGG 0.569246 1:-78650198 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGAAGGCTAGGATTTAAAGC+CGG 0.570174 1:+78649199 None:intergenic
ATCACATAATCCTTATAAGT+AGG 0.570967 1:+78650498 None:intergenic
CAGTTGAGTCATGATGACTA+AGG 0.572428 1:+78648831 None:intergenic
GGATCAGGGAAGAGTACTAT+GGG 0.572823 1:-78649904 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGGGTTTGGAAAGGTTTACA+AGG 0.576960 1:-78649773 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATTTGCATTGGTGCTGCAAG+AGG 0.579803 1:-78649493 MsG0180004477.01.T01:CDS
AACAGGTCCAAATATGAACC+AGG 0.580856 1:-78649353 MsG0180004477.01.T01:CDS
TCTCAAATTGTCAACCCGAA+AGG 0.581411 1:-78648788 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTGGAAGCACCATAAAGATA+AGG 0.584617 1:+78650822 None:intergenic
ATTTATGTTCAAGATCAGGC+AGG 0.585703 1:-78650477 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATTACGAATCAAGCTGCTA+AGG 0.587872 1:-78650796 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGGAAGAGTACTATGGGCAG+TGG 0.590693 1:-78649898 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATACTTGATCCAAATCTCAA+AGG 0.592034 1:-78649112 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGTCAACAATCAAACGGCGC+AGG 0.592278 1:-78650562 MsG0180004477.01.T01:CDS
GCAAACTTAGCCATGGCTCA+AGG 0.593025 1:-78649874 MsG0180004477.01.T01:CDS
TATGGAAATTCTCACACAGC+CGG 0.594106 1:-78649940 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTTCTTATGAGTTGAACCAT+CGG 0.599843 1:+78648955 None:intergenic
GTCTGATGTTTACTCATTCG+GGG 0.603536 1:-78649251 MsG0180004477.01.T01:CDS
GATGTCATTGGTTGGACAGG+CGG 0.603635 1:-78650531 MsG0180004477.01.T01:CDS
GAACGAAATCAACAGGATCA+GGG 0.606009 1:-78649918 MsG0180004477.01.T01:CDS
AATGGTGGCAAAGATTCAGA+TGG 0.607239 1:-78651434 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTTAAATCCTAGCCTTCCAA+AGG 0.608327 1:-78649194 MsG0180004477.01.T01:CDS
GAATTTCTGATAAAAGAGAA+GGG 0.608379 1:+78651339 None:intergenic
TCATGAGGAGCAATGTATTG+AGG 0.610414 1:+78650747 None:intergenic
AATAATAAAGATGTCAACAT+GGG 0.611454 1:-78650696 MsG0180004477.01.T01:CDS
CCACTGTACTAACATGACCC+TGG 0.612958 1:+78649335 None:intergenic
GGGTTTGGAAAGGTTTACAA+GGG 0.613010 1:-78649772 MsG0180004477.01.T01:CDS
AAATAATAAAGATGTCAACA+TGG 0.613585 1:-78650697 MsG0180004477.01.T01:CDS
ATGAGGGAGCATTTATACAA+AGG 0.613695 1:-78649559 MsG0180004477.01.T01:CDS
ACACAAACACCACATCAAGT+TGG 0.616219 1:-78649972 MsG0180004477.01.T01:CDS
CAGTGGTGCAAACTTAGCCA+TGG 0.616247 1:-78649881 MsG0180004477.01.T01:CDS
GATGTTGAATAAACATCATG+AGG 0.617201 1:+78650732 None:intergenic
ATTCTGGTTTGAGTCGAACA+TGG 0.618680 1:-78650857 MsG0180004477.01.T01:CDS
AAGATTCAGATGGAAGACAA+TGG 0.619065 1:-78651424 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTGTGAGAATTTCCATAGAG+AGG 0.619601 1:+78649946 None:intergenic
CCTCCATGAATGATCTGTTG+TGG 0.621051 1:-78649012 MsG0180004477.01.T01:CDS
TTAGCAAAGCCCAATCTGCA+AGG 0.624337 1:+78649161 None:intergenic
AAGCCTTCTGATAAACACAA+TGG 0.625622 1:-78651047 MsG0180004477.01.T01:CDS
TCGACATAGTCCTTGAGCCA+TGG 0.626357 1:+78649864 None:intergenic
GGATGTGGTTTAGGTGACAA+TGG 0.628922 1:-78651452 MsG0180004477.01.T01:CDS
GAGTCCAATGTTATTGGTGT+AGG 0.629978 1:-78649796 MsG0180004477.01.T01:CDS
GAGAGGCAACCAACTTGATG+TGG 0.631753 1:+78649963 None:intergenic
GCTTTGCTAAACAAAAGGAA+AGG 0.635617 1:-78649148 MsG0180004477.01.T01:CDS
CACAACAGATCATTCATGGA+GGG 0.637806 1:+78649013 None:intergenic
GACAACAAATACCTTTCAGG+AGG 0.642318 1:-78651395 MsG0180004477.01.T01:CDS
ACATGGGATACAATCTCACA+TGG 0.644612 1:-78650680 MsG0180004477.01.T01:CDS
TCAAATCCACAATCAGAACA+AGG 0.646234 1:-78649712 MsG0180004477.01.T01:CDS
GTTATCGGTGGTGCTGCCGG+AGG 0.646742 1:-78650250 MsG0180004477.01.T01:CDS
AACCTTCAAGAAAATCCCGA+TGG 0.662626 1:-78648971 MsG0180004477.01.T01:CDS
CATGGCCCATGGAACCATGA+GGG 0.664312 1:-78649575 MsG0180004477.01.T01:CDS
AGCTTGATTCGTAATACCGG+TGG 0.670377 1:+78650803 None:intergenic
TCATCATAACCGACCAACGA+AGG 0.672557 1:+78650963 None:intergenic
TGTACTTTGCACCTGTGTGA+AGG 0.687579 1:+78649461 None:intergenic
CGGTTATGATGATCAAACCA+TGG 0.687635 1:-78650952 MsG0180004477.01.T01:CDS
ACATGGCCCATGGAACCATG+AGG 0.688092 1:-78649576 MsG0180004477.01.T01:CDS
GGTCTTCATTACCTTCACAC+AGG 0.689583 1:-78649472 MsG0180004477.01.T01:CDS
CCAGGGTCATGTTAGTACAG+TGG 0.692830 1:-78649335 MsG0180004477.01.T01:CDS
CCACAACAGATCATTCATGG+AGG 0.707604 1:+78649012 None:intergenic
ACAGGTCCAAATATGAACCA+GGG 0.717637 1:-78649352 MsG0180004477.01.T01:CDS
TGTGGTTTAGGTGACAATGG+TGG 0.761475 1:-78651449 MsG0180004477.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAGATGAATCTTTATTATT+AGG - Chr1:78648817-78648836 MsG0180004477.01.T01:CDS 15.0%
!!! AACTTTTCAAAACAAAAAAA+TGG - Chr1:78650001-78650020 MsG0180004477.01.T01:intron 15.0%
!! AAATAATAAAGATGTCAACA+TGG - Chr1:78649593-78649612 MsG0180004477.01.T01:CDS 20.0%
!! AATAATAAAGATGTCAACAT+GGG - Chr1:78649594-78649613 MsG0180004477.01.T01:CDS 20.0%
!! ACAATGTTTAGATTAAATGT+TGG - Chr1:78649384-78649403 MsG0180004477.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATAAAGATTCATCTTTGT+TGG + Chr1:78648815-78648834 None:intergenic 20.0%
!! TTAAGAACATTTGAATTCAA+AGG + Chr1:78649213-78649232 None:intergenic 20.0%
!! TTTAAATTGTTGTAAACAGA+AGG + Chr1:78649069-78649088 None:intergenic 20.0%
! AAACAAAAGGAAAGGAAAAT+TGG - Chr1:78651150-78651169 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! AAACATTTAGTGTCTTTGAT+AGG - Chr1:78650650-78650669 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! AACCAATAGATACTTTATCA+TGG - Chr1:78650759-78650778 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! AGTATAGCATCATAATATTC+CGG + Chr1:78649885-78649904 None:intergenic 25.0%
! ATCACATAATCCTTATAAGT+AGG + Chr1:78649795-78649814 None:intergenic 25.0%
! ATGTTTAGATTAAATGTTGG+TGG - Chr1:78649387-78649406 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! CAAGTGAATATTCTTTATCA+AGG + Chr1:78649188-78649207 None:intergenic 25.0%
! GAATCTTTATTATTAGGATG+TGG - Chr1:78648823-78648842 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! GAATTTCTGATAAAAGAGAA+GGG + Chr1:78648954-78648973 None:intergenic 25.0%
! TATCTTTGTCAACAATCAAA+CGG - Chr1:78649722-78649741 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TATTATGATGCTATACTCAA+TGG - Chr1:78649888-78649907 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TATTCAACATCAAGATCAAT+GGG - Chr1:78649570-78649589 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TATTCAACTTATTCAAATGC+CGG - Chr1:78649287-78649306 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAAACAGAAGGATAAAAA+TGG + Chr1:78649059-78649078 None:intergenic 25.0%
! TGTTTAGATTAAATGTTGGT+GGG - Chr1:78649388-78649407 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TTACAACAATTTAAACCCAT+CGG - Chr1:78649074-78649093 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTATTAGGATGTGGTTT+AGG - Chr1:78648829-78648848 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTCAACATCAAGATCAA+TGG - Chr1:78649569-78649588 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
!! CTAATTTTGTATCTGATAAC+AGG - Chr1:78650290-78650309 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAATAGTTGTTATTCTCGT+TGG + Chr1:78650260-78650279 None:intergenic 25.0%
!! TGATGAAAATTTTGTTGCAA+AGG - Chr1:78650892-78650911 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCCATGATAAAGTATCTAT+TGG + Chr1:78650764-78650783 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAGGTAGTTTTGGATATT+TGG - Chr1:78650979-78650998 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATAACAAGAGTTTTGTTAT+CGG - Chr1:78650025-78650044 MsG0180004477.01.T01:intron 25.0%
!!! TATTGATAATGGTGTTAAAG+TGG - Chr1:78650544-78650563 MsG0180004477.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTGTCTTCTAAAATATTC+AGG + Chr1:78651007-78651026 None:intergenic 25.0%
AAATGAGAGTGAATTTGAAG+AGG - Chr1:78651369-78651388 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
AACGTTTATTCGGTAGAATA+GGG + Chr1:78649023-78649042 None:intergenic 30.0%
AAGTCTGATGTTTACTCATT+CGG - Chr1:78651037-78651056 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
ATACTTGATCCAAATCTCAA+AGG - Chr1:78651178-78651197 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
ATACTTTATCATGGAAGCAA+AGG - Chr1:78650768-78650787 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGACTCATCAAAATTCT+TGG + Chr1:78650483-78650502 None:intergenic 30.0%
CTATCAAGAATAACATTACC+TGG + Chr1:78650130-78650149 None:intergenic 30.0%
CTTAGCCAATAACGTTTATT+CGG + Chr1:78649033-78649052 None:intergenic 30.0%
CTTGTTAAGTACATCGAATT+CGG + Chr1:78649651-78649670 None:intergenic 30.0%
GATGTTGAATAAACATCATG+AGG + Chr1:78649561-78649580 None:intergenic 30.0%
GGAATTTCTGATAAAAGAGA+AGG + Chr1:78648955-78648974 None:intergenic 30.0%
GTTGACAATTTGAGAGAAAA+TGG + Chr1:78651497-78651516 None:intergenic 30.0%
GTTTGTGCATTCAACAAAAT+AGG + Chr1:78648793-78648812 None:intergenic 30.0%
TAACGTTTATTCGGTAGAAT+AGG + Chr1:78649024-78649043 None:intergenic 30.0%
TGTGATTTATGTTCAAGATC+AGG - Chr1:78649809-78649828 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCAATCATCATATCAGA+AGG + Chr1:78649966-78649985 None:intergenic 30.0%
TTATTGAATTTCCTCCTGAA+AGG + Chr1:78648909-78648928 None:intergenic 30.0%
TTCTACCGAATAAACGTTAT+TGG - Chr1:78649025-78649044 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
TTTGATGAGTCCAATGTTAT+TGG - Chr1:78650488-78650507 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
! GGATTCGTATTTTTCTGTAA+CGG - Chr1:78649095-78649114 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
! GTGTTTGGTTTATGATTACA+TGG - Chr1:78650697-78650716 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
! TATTTTTCTGTAACGGCAAA+TGG - Chr1:78649102-78649121 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
! TGAGTAAACATCAGACTTTT+CGG + Chr1:78651035-78651054 None:intergenic 30.0%
!! ATAATATTCCGGCTTTGAAT+CGG + Chr1:78649874-78649893 None:intergenic 30.0%
!! TACAAGGGTGTTATTGATAA+TGG - Chr1:78650533-78650552 MsG0180004477.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGATCTTTCCTTTGAGATT+TGG + Chr1:78651190-78651209 None:intergenic 30.0%
!!! ATGCAAATTTTTAGCATCCA+TGG + Chr1:78649358-78649377 None:intergenic 30.0%
AAGATTCAGATGGAAGACAA+TGG - Chr1:78648866-78648885 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
AAGCCTTCTGATAAACACAA+TGG - Chr1:78649243-78649262 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
ACAGAAAAATACGAATCCGA+TGG + Chr1:78649093-78649112 None:intergenic 35.0%
AGTCTGATGTTTACTCATTC+GGG - Chr1:78651038-78651057 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
ATATCAGAAGGTTGAGGATT+CGG + Chr1:78649954-78649973 None:intergenic 35.0%
ATCAAGGTAAGCTTGTGATA+AGG + Chr1:78649172-78649191 None:intergenic 35.0%
ATCATCATATCAGAAGGTTG+AGG + Chr1:78649960-78649979 None:intergenic 35.0%
ATTCCACAACAGATCATTCA+TGG + Chr1:78651284-78651303 None:intergenic 35.0%
ATTGGGCTTTGCTAAACAAA+AGG - Chr1:78651137-78651156 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
ATTTATGTTCAAGATCAGGC+AGG - Chr1:78649813-78649832 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAGGAAAGGAAAATTGG+AGG - Chr1:78651153-78651172 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
CAGAAAAATACGAATCCGAT+GGG + Chr1:78649092-78649111 None:intergenic 35.0%
CATGTTAGTACAGTGGTAAA+AGG - Chr1:78650962-78650981 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
CATTACAAAAACCTTAGCCT+TGG - Chr1:78651424-78651443 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
CGAATTCGATGTACTTAACA+AGG - Chr1:78649649-78649668 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGCACACAATAATGAAA+TGG - Chr1:78651396-78651415 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
GATGATACGCCTTATCTTTA+TGG - Chr1:78649459-78649478 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
GATGATTGAACATGACAATC+AGG - Chr1:78649974-78649993 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
GCTTTGCTAAACAAAAGGAA+AGG - Chr1:78651142-78651161 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
GGAAGATGATGAAATGTGTT+TGG - Chr1:78650682-78650701 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
TATTACGAATCAAGCTGCTA+AGG - Chr1:78649494-78649513 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
TCAAATCCACAATCAGAACA+AGG - Chr1:78650578-78650597 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
TGAATTTGAAGAGGTGAACT+TGG - Chr1:78651378-78651397 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
TTTATCATGGAAGCAAAGGT+TGG - Chr1:78650772-78650791 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTATAAATGCTCCCTCA+TGG + Chr1:78650732-78650751 None:intergenic 35.0%
! ACAGTGGTAAAAGGTAGTTT+TGG - Chr1:78650971-78650990 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
! CAAACTTGTTCAAGCTTTCA+GGG + Chr1:78651213-78651232 None:intergenic 35.0%
! GATTTTGGATTGTCGAAAAC+AGG - Chr1:78650920-78650939 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
! GTCTTTGATAGGTTTTTGTG+AGG - Chr1:78650661-78650680 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
! GTTCTTATGAGTTGAACCAT+CGG + Chr1:78651338-78651357 None:intergenic 35.0%
! GTTGCAAAGGTTTCAGATTT+TGG - Chr1:78650905-78650924 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTTATGAGTTGAACCATC+GGG + Chr1:78651337-78651356 None:intergenic 35.0%
! TTTAAATCCTAGCCTTCCAA+AGG - Chr1:78651096-78651115 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGAGGGAGCATTTATACAA+AGG - Chr1:78650731-78650750 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
!! CTCAATGATACTGATTTGTC+TGG - Chr1:78649927-78649946 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTGCTTTTGCTTTTGTTAA+TGG - Chr1:78649264-78649283 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAAGGAGTGCCTACTTATA+AGG - Chr1:78649782-78649801 MsG0180004477.01.T01:CDS 35.0%
!! TAATATTCCGGCTTTGAATC+GGG + Chr1:78649873-78649892 None:intergenic 35.0%
!!! AACAAGAGTTTTGTTATCGG+TGG - Chr1:78650028-78650047 MsG0180004477.01.T01:intron 35.0%
AACAGGTCCAAATATGAACC+AGG - Chr1:78650937-78650956 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
AACCTTCAAGAAAATCCCGA+TGG - Chr1:78651319-78651338 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
AATGGTGGCAAAGATTCAGA+TGG - Chr1:78648856-78648875 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
ACACAAACACCACATCAAGT+TGG - Chr1:78650318-78650337 MsG0180004477.01.T01:intron 40.0%
ACAGGTCCAAATATGAACCA+GGG - Chr1:78650938-78650957 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
ACATGACCCTGGTTCATATT+TGG + Chr1:78650947-78650966 None:intergenic 40.0%
ACATGGGATACAATCTCACA+TGG - Chr1:78649610-78649629 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
AGGGTTTGGAAAGGTTTACA+AGG - Chr1:78650517-78650536 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
ATATCTCCGGTTCAAGATTC+TGG - Chr1:78649417-78649436 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGGTTGGAGATTTGCAT+TGG - Chr1:78650785-78650804 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
CACAACAGATCATTCATGGA+GGG + Chr1:78651280-78651299 None:intergenic 40.0%
CAGTTGAGTCATGATGACTA+AGG + Chr1:78651462-78651481 None:intergenic 40.0%
CCAATGTTATTGGTGTAGGA+GGG - Chr1:78650498-78650517 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
CCAGACAACAAATACCTTTC+AGG - Chr1:78648892-78648911 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
CGGTAGAATAGGGAATTTGT+AGG + Chr1:78649013-78649032 None:intergenic 40.0%
CGGTTATGATGATCAAACCA+TGG - Chr1:78649338-78649357 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
CTCAAACCAGAATCTTGAAC+CGG + Chr1:78649426-78649445 None:intergenic 40.0%
GAACGAAATCAACAGGATCA+GGG - Chr1:78650372-78650391 MsG0180004477.01.T01:intron 40.0%
GACAACAAATACCTTTCAGG+AGG - Chr1:78648895-78648914 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
GAGTCCAATGTTATTGGTGT+AGG - Chr1:78650494-78650513 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
GCACCATTGTGTTTATCAGA+AGG + Chr1:78649249-78649268 None:intergenic 40.0%
GGGTTTGGAAAGGTTTACAA+GGG - Chr1:78650518-78650537 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAATCGAACAACAAATC+CGG + Chr1:78649309-78649328 None:intergenic 40.0%
GTCTGATGTTTACTCATTCG+GGG - Chr1:78651039-78651058 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
GTGTGAGAATTTCCATAGAG+AGG + Chr1:78650347-78650366 None:intergenic 40.0%
GTTTATGATTACATGGCCCA+TGG - Chr1:78650704-78650723 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
TATCTTTATGGTGCTTCCAC+CGG - Chr1:78649471-78649490 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
TATGGAAATTCTCACACAGC+CGG - Chr1:78650350-78650369 MsG0180004477.01.T01:intron 40.0%
TCATGAGGAGCAATGTATTG+AGG + Chr1:78649546-78649565 None:intergenic 40.0%
TCCAATGTTATTGGTGTAGG+AGG - Chr1:78650497-78650516 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
TCTCAAATTGTCAACCCGAA+AGG - Chr1:78651502-78651521 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
TTCACTCCTTGTTCTGATTG+TGG + Chr1:78650587-78650606 None:intergenic 40.0%
! AAAATACGCGCTGACATGTA+TGG + Chr1:78648976-78648995 None:intergenic 40.0%
! AACCATCGGGATTTTCTTGA+AGG + Chr1:78651324-78651343 None:intergenic 40.0%
! AGCAGCTTGATTCGTAATAC+CGG + Chr1:78649493-78649512 None:intergenic 40.0%
! GCAAACTTGTTCAAGCTTTC+AGG + Chr1:78651214-78651233 None:intergenic 40.0%
! TATGTGTTGCTGTTCATCAC+AGG - Chr1:78650092-78650111 MsG0180004477.01.T01:intron 40.0%
! TGGTGGGCAATTTATATCTC+CGG - Chr1:78649404-78649423 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! AACAAGTTAGCCTTGCAGAT+TGG - Chr1:78651119-78651138 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! ACAAGTTAGCCTTGCAGATT+GGG - Chr1:78651120-78651139 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTCTGGTTTGAGTCGAACA+TGG - Chr1:78649433-78649452 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTGAAAGGTATTTGTTGTC+TGG + Chr1:78648895-78648914 None:intergenic 40.0%
!! GAAAAGTGTCTGTCTGATCA+TGG - Chr1:78651244-78651263 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGGAAGCACCATAAAGATA+AGG + Chr1:78649471-78649490 None:intergenic 40.0%
!! TATTCGAGGCATTGTGTTCA+AGG - Chr1:78651068-78651087 MsG0180004477.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATCCTGTTGATTTCGTTC+CGG + Chr1:78650372-78650391 None:intergenic 40.0%
AGGCAGGTGATGATCAACTT+TGG - Chr1:78649829-78649848 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
ATTCGGGGTTGTTCTATTCG+AGG - Chr1:78651054-78651073 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
CCACAACAGATCATTCATGG+AGG + Chr1:78651281-78651300 None:intergenic 45.0%
CCCTCCTACACCAATAACAT+TGG + Chr1:78650501-78650520 None:intergenic 45.0%
CCTCCATGAATGATCTGTTG+TGG - Chr1:78651278-78651297 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
GGAACGAAATCAACAGGATC+AGG - Chr1:78650371-78650390 MsG0180004477.01.T01:intron 45.0%
GGATGTGGTTTAGGTGACAA+TGG - Chr1:78648838-78648857 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
GGTCTTCATTACCTTCACAC+AGG - Chr1:78650818-78650837 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
GTTATTGGTGTAGGAGGGTT+TGG - Chr1:78650503-78650522 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTTCGATTCACCTTCGT+TGG - Chr1:78649314-78649333 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
TAAGGTCATGCTCACTTCCA+AGG + Chr1:78651444-78651463 None:intergenic 45.0%
TCATCATAACCGACCAACGA+AGG + Chr1:78649330-78649349 None:intergenic 45.0%
TGTACTTTGCACCTGTGTGA+AGG + Chr1:78650832-78650851 None:intergenic 45.0%
TGTGGTTTAGGTGACAATGG+TGG - Chr1:78648841-78648860 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
TTAGCAAAGCCCAATCTGCA+AGG + Chr1:78651132-78651151 None:intergenic 45.0%
TTCGATTCACCTTCGTTGGT+CGG - Chr1:78649318-78649337 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTGTTCCTTTGGAAGGCT+AGG + Chr1:78651106-78651125 None:intergenic 45.0%
! AGCTTGATTCGTAATACCGG+TGG + Chr1:78649490-78649509 None:intergenic 45.0%
! GGAAGGCTAGGATTTAAAGC+CGG + Chr1:78651094-78651113 None:intergenic 45.0%
!! AGGATCAGGGAAGAGTACTA+TGG - Chr1:78650385-78650404 MsG0180004477.01.T01:intron 45.0%
!! ATTTGCATTGGTGCTGCAAG+AGG - Chr1:78650797-78650816 MsG0180004477.01.T01:CDS 45.0%
!! GCAAGGCTAACTTGTTCCTT+TGG + Chr1:78651115-78651134 None:intergenic 45.0%
!! GGATCAGGGAAGAGTACTAT+GGG - Chr1:78650386-78650405 MsG0180004477.01.T01:intron 45.0%
!! GGCTAACTTGTTCCTTTGGA+AGG + Chr1:78651111-78651130 None:intergenic 45.0%
!! TCAAGTTGGTTGCCTCTCTA+TGG - Chr1:78650332-78650351 MsG0180004477.01.T01:intron 45.0%
AATGCTCCCTCATGGTTCCA+TGG + Chr1:78650724-78650743 None:intergenic 50.0%
ACAGCCGGAACGAAATCAAC+AGG - Chr1:78650365-78650384 MsG0180004477.01.T01:intron 50.0%
ATGCTCCCTCATGGTTCCAT+GGG + Chr1:78650723-78650742 None:intergenic 50.0%
ATTGGTTGGACAGGCGGTAA+AGG - Chr1:78649765-78649784 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
CAGTGGTGCAAACTTAGCCA+TGG - Chr1:78650409-78650428 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
CATGCTCACTTCCAAGGCTA+AGG + Chr1:78651438-78651457 None:intergenic 50.0%
CCACTGTACTAACATGACCC+TGG + Chr1:78650958-78650977 None:intergenic 50.0%
CCAGGGTCATGTTAGTACAG+TGG - Chr1:78650955-78650974 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
GAGAGGCAACCAACTTGATG+TGG + Chr1:78650330-78650349 None:intergenic 50.0%
GCAAACTTAGCCATGGCTCA+AGG - Chr1:78650416-78650435 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
TCGACATAGTCCTTGAGCCA+TGG + Chr1:78650429-78650448 None:intergenic 50.0%
TGGTGTAGGAGGGTTTGGAA+AGG - Chr1:78650508-78650527 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
TGTCAACAATCAAACGGCGC+AGG - Chr1:78649728-78649747 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
! GATGTCATTGGTTGGACAGG+CGG - Chr1:78649759-78649778 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
! GCAGATGTCATTGGTTGGAC+AGG - Chr1:78649756-78649775 MsG0180004477.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTGTTATCGGTGGTGCTGC+CGG - Chr1:78650037-78650056 MsG0180004477.01.T01:intron 50.0%
AACAATCAAACGGCGCAGGC+TGG - Chr1:78649732-78649751 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
ACAATCAAACGGCGCAGGCT+GGG - Chr1:78649733-78649752 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
ACATGGCCCATGGAACCATG+AGG - Chr1:78650714-78650733 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
CATGGCCCATGGAACCATGA+GGG - Chr1:78650715-78650734 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
CTGGGGCAGATGTCATTGGT+TGG - Chr1:78649751-78649770 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
TCCATCGCCCGATTCAAAGC+CGG - Chr1:78649863-78649882 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
TGCAAAACCTGCAGCACCTC+CGG + Chr1:78650059-78650078 None:intergenic 55.0%
!! CACAGGAAGAAGAGAGCACC+AGG - Chr1:78650109-78650128 MsG0180004477.01.T01:intron 55.0%
!! CGAGGCATTGTGTTCAAGGC+CGG - Chr1:78651072-78651091 MsG0180004477.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGAAGAGTACTATGGGCAG+TGG - Chr1:78650392-78650411 MsG0180004477.01.T01:intron 55.0%
CAATCAAACGGCGCAGGCTG+GGG - Chr1:78649734-78649753 MsG0180004477.01.T01:CDS 60.0%
CAGGCTGGGGCAGATGTCAT+TGG - Chr1:78649747-78649766 MsG0180004477.01.T01:CDS 60.0%
!! TCCGGCTTTGAATCGGGCGA+TGG + Chr1:78649867-78649886 None:intergenic 60.0%
!! GTTATCGGTGGTGCTGCCGG+AGG - Chr1:78650040-78650059 MsG0180004477.01.T01:intron 65.0%
!! GGTGCTGCCGGAGGTGCTGC+AGG - Chr1:78650049-78650068 MsG0180004477.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 78648781 78651531 78648781 ID=MsG0180004477.01;Name=MsG0180004477.01
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Gene Sequence

>MsG0180004477.01.T01

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Protein sequence

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