AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039440.01

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MsG0780039440.01.T01 AT4G34440 45.055 273 141 6 375 643 258 525 1.30e-59 212
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MsG0780039440.01.T01 AT1G68690 40.525 343 184 10 315 643 254 590 2.27e-58 209
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MsG0780039440.01.T01 AT3G46370 44.397 232 123 4 413 643 475 701 6.83e-58 209
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MsG0780039440.01.T01 AT2G29000 45.690 232 120 4 413 643 553 779 7.39e-58 210
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MsG0780039440.01.T01 AT5G54590 38.312 308 160 6 343 626 7 308 2.60e-57 200
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MsG0780039440.01.T01 AT1G69730 45.798 238 125 3 415 650 435 670 6.27e-56 204
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MsG0780039440.01.T01 AT4G31100 43.673 245 133 4 413 654 430 672 2.33e-55 202
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MsG0780039440.01.T01 AT5G38210 39.130 345 173 12 320 645 260 586 4.14e-55 200
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MsG0780039440.01.T01 AT5G38210 40.000 335 164 12 330 645 258 574 5.22e-55 199
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MsG0780039440.01.T01 AT1G49270 45.652 230 121 4 415 643 324 550 9.15e-55 199
MsG0780039440.01.T01 AT1G26150 38.390 323 173 8 339 643 330 644 9.84e-55 200
MsG0780039440.01.T01 AT1G56120 40.187 321 158 6 324 643 619 906 1.03e-54 202
MsG0780039440.01.T01 AT1G18390 45.106 235 121 5 415 646 332 561 1.03e-54 198
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MsG0780039440.01.T01 AT5G58940 46.581 234 121 3 415 645 135 367 1.04e-54 194
MsG0780039440.01.T01 AT5G58940 46.581 234 121 3 415 645 135 367 1.04e-54 194
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MsG0780039440.01.T01 AT3G09830 43.548 248 130 4 405 643 63 309 1.13e-54 192
MsG0780039440.01.T01 AT1G18390 40.190 316 172 8 334 646 254 555 1.14e-54 198
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MsG0780039440.01.T01 AT2G18470 44.105 229 125 3 415 643 272 497 3.17e-54 196
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MsG0780039440.01.T01 AT1G16130 45.259 232 124 3 411 641 400 629 3.09e-53 196
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MsG0780039440.01.T01 AT4G02630 40.164 244 135 6 415 651 150 389 1.66e-52 189
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MsG0780039440.01.T01 AT1G55200 44.397 232 126 3 413 643 365 594 1.95e-52 192
MsG0780039440.01.T01 AT1G55200 44.397 232 126 3 413 643 365 594 1.95e-52 192
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MsG0780039440.01.T01 AT1G70740 42.174 230 130 3 415 643 38 265 3.19e-52 186
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MsG0780039440.01.T01 AT4G00330 43.882 237 126 4 415 645 107 342 5.18e-52 185
MsG0780039440.01.T01 AT1G16670 43.882 237 125 4 415 645 29 263 6.01e-52 184
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MsG0780039440.01.T01 AT3G13690 43.966 232 127 3 413 643 397 626 7.57e-52 192
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MsG0780039440.01.T01 AT1G07650 41.736 242 136 3 415 653 672 911 1.09e-51 193
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MsG0780039440.01.T01 AT2G28250 42.562 242 128 5 414 645 197 437 1.09e-51 188
MsG0780039440.01.T01 AT2G28250 42.562 242 128 5 414 645 197 437 1.09e-51 188
MsG0780039440.01.T01 AT2G28250 42.562 242 128 5 414 645 197 437 1.09e-51 188
MsG0780039440.01.T01 AT2G28250 42.562 242 128 5 414 645 197 437 1.09e-51 188
MsG0780039440.01.T01 AT5G49770 48.165 218 112 1 413 630 620 836 1.15e-51 193
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MsG0780039440.01.T01 AT1G66880 41.837 294 146 10 363 641 896 1179 2.87e-51 192
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MsG0780039440.01.T01 AT1G55610 42.373 236 129 4 413 643 845 1078 5.63e-51 191
MsG0780039440.01.T01 AT1G29740 42.017 238 135 3 415 651 665 900 6.06e-51 191
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MsG0780039440.01.T01 AT3G55950 47.222 216 98 4 413 613 482 696 8.99e-51 189
MsG0780039440.01.T01 AT4G23240 44.240 217 117 4 414 628 15 229 1.34e-50 180
MsG0780039440.01.T01 AT1G09440 40.260 231 134 3 415 643 145 373 1.75e-50 182
MsG0780039440.01.T01 AT1G09440 40.260 231 134 3 415 643 145 373 1.75e-50 182
MsG0780039440.01.T01 AT5G59270 40.086 232 136 3 413 643 335 564 1.96e-50 186
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MsG0780039440.01.T01 AT1G56720 39.419 241 140 4 415 651 167 405 2.00e-50 183
MsG0780039440.01.T01 AT1G56720 39.419 241 140 4 415 651 167 405 2.00e-50 183
MsG0780039440.01.T01 AT1G56720 39.419 241 140 4 415 651 167 405 2.00e-50 183
MsG0780039440.01.T01 AT4G11470 40.891 247 140 4 381 626 297 538 2.07e-50 186
MsG0780039440.01.T01 AT5G59270 40.086 232 136 3 413 643 354 583 2.08e-50 187
MsG0780039440.01.T01 AT4G23220 35.224 335 177 7 297 626 236 535 2.16e-50 186
MsG0780039440.01.T01 AT5G59270 40.086 232 136 3 413 643 338 567 2.22e-50 186
MsG0780039440.01.T01 AT4G11470 40.891 247 140 4 381 626 302 543 2.22e-50 186
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MsG0780039440.01.T01 AT4G11480 43.348 233 114 6 406 626 302 528 1.44e-49 184
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MsG0780039440.01.T01 AT2G42960 39.506 243 137 5 415 651 171 409 3.52e-49 179
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MsG0780039440.01.T01 AT2G35620 41.004 239 136 4 415 651 292 527 4.60e-49 181
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MsG0780039440.01.T01 AT5G18500 37.918 269 157 5 391 651 126 392 5.12e-49 179
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MsG0780039440.01.T01 AT1G48210 38.956 249 139 5 419 660 60 302 4.68e-48 171
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MsG0780039440.01.T01 AT4G23240 44.240 217 117 4 414 628 322 536 5.47e-48 179
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MsG0780039440.01.T01 AT1G61420 41.410 227 131 2 415 640 334 559 5.82e-48 179
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MsG0780039440.01.T01 AT3G59350 39.407 236 136 1 415 643 59 294 6.56e-48 172
MsG0780039440.01.T01 AT5G01950 49.730 185 87 2 413 592 612 795 6.62e-48 181
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MsG0780039440.01.T01 AT2G25220 35.987 314 187 7 335 645 60 362 7.79e-48 174
MsG0780039440.01.T01 AT1G23540 36.678 289 136 6 347 594 254 536 7.99e-48 177
MsG0780039440.01.T01 AT4G23270 44.550 211 115 2 414 623 313 522 8.04e-48 179
MsG0780039440.01.T01 AT4G23270 44.550 211 115 2 414 623 313 522 8.04e-48 179
MsG0780039440.01.T01 AT3G59350 39.407 236 136 1 415 643 101 336 8.36e-48 172
MsG0780039440.01.T01 AT5G53890 36.657 341 183 6 299 626 633 953 8.66e-48 181
MsG0780039440.01.T01 AT5G62230 42.544 228 128 3 416 642 637 862 8.79e-48 181
MsG0780039440.01.T01 AT4G29050 40.086 232 137 2 415 645 332 562 9.10e-48 179
MsG0780039440.01.T01 AT1G54820 40.574 244 128 4 415 645 135 374 9.86e-48 174
MsG0780039440.01.T01 AT1G70530 41.553 219 123 4 409 626 307 521 1.02e-47 176
MsG0780039440.01.T01 AT1G11340 36.071 280 166 4 348 626 515 782 1.04e-47 180
MsG0780039440.01.T01 AT4G23270 44.550 211 115 2 414 623 313 522 1.11e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT4G29050 40.086 232 137 2 415 645 346 576 1.12e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT4G11490 42.056 214 122 2 414 626 308 520 1.19e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT5G60300 39.738 229 135 3 415 643 332 557 1.19e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT5G60300 39.738 229 135 3 415 643 332 557 1.19e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT5G62230 42.544 228 128 3 416 642 589 814 1.20e-47 181
MsG0780039440.01.T01 AT1G21270 45.536 224 118 4 408 629 384 605 1.38e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT4G23140 40.408 245 136 5 414 652 338 578 1.41e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT1G11340 36.071 280 166 4 348 626 447 714 1.43e-47 180
MsG0780039440.01.T01 AT4G23160 40.408 245 136 5 414 652 346 586 1.44e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT3G59350 39.407 236 136 1 415 643 116 351 1.48e-47 173
MsG0780039440.01.T01 AT1G48210 39.655 232 131 3 419 643 60 289 1.50e-47 172
MsG0780039440.01.T01 AT1G48210 39.655 232 131 3 419 643 60 289 1.50e-47 172
MsG0780039440.01.T01 AT1G48210 39.655 232 131 3 419 643 60 289 1.50e-47 172
MsG0780039440.01.T01 AT1G48210 39.655 232 131 3 419 643 60 289 1.50e-47 172
MsG0780039440.01.T01 AT1G61420 41.410 227 131 2 415 640 482 707 1.56e-47 180
MsG0780039440.01.T01 AT3G59350 39.407 236 136 1 415 643 101 336 1.59e-47 173
MsG0780039440.01.T01 AT3G59350 39.407 236 136 1 415 643 101 336 1.59e-47 173
MsG0780039440.01.T01 AT1G61420 41.410 227 131 2 415 640 484 709 1.69e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT1G61420 41.410 227 131 2 415 640 484 709 1.69e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT4G04540 35.577 312 172 7 313 623 266 549 1.72e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT4G23130 44.186 215 116 4 414 626 331 543 1.82e-47 176
MsG0780039440.01.T01 AT1G61390 43.333 210 117 2 415 623 340 548 1.88e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT4G21410 35.671 328 178 9 309 626 129 433 1.93e-47 176
MsG0780039440.01.T01 AT5G10290 35.652 345 187 7 297 637 188 501 1.93e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT5G10290 35.652 345 187 7 297 637 188 501 1.93e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT5G65240 43.723 231 119 6 413 637 270 495 2.02e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT5G60300 39.738 229 135 3 415 643 332 557 2.26e-47 179
MsG0780039440.01.T01 AT1G51940 43.304 224 118 4 415 634 329 547 2.45e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT1G67520 42.009 219 125 2 409 626 241 458 2.70e-47 176
MsG0780039440.01.T01 AT2G39110 41.633 245 133 3 409 643 57 301 2.80e-47 172
MsG0780039440.01.T01 AT2G39110 41.633 245 133 3 409 643 72 316 2.83e-47 173
MsG0780039440.01.T01 AT1G70530 41.553 219 123 4 409 626 307 521 2.99e-47 177
MsG0780039440.01.T01 AT1G61610 42.991 214 118 4 415 626 513 724 3.40e-47 178
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
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MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT2G30740 39.241 237 135 3 415 643 59 294 3.49e-47 171
MsG0780039440.01.T01 AT5G65240 43.723 231 119 6 413 637 270 495 3.64e-47 177

Find 188 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 311 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCATGGAAGTGGAGGTTTC+TGG 0.100148 7:-64111954 None:intergenic
GTGGCCAAGGTTTCTGATTT+TGG 0.122441 7:+64112099 MsG0780039440.01.T01:CDS
CAAGATTGCATCATAGTAAT+TGG 0.146238 7:-64111263 None:intergenic
AAAGCCTATGCATTTGTAAA+TGG 0.166137 7:+64110610 MsG0780039440.01.T01:CDS
GATTCATTCAAAAGCTTAAA+AGG 0.211231 7:+64108322 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTTGACGAATCTTTGATTCT+TGG 0.229073 7:+64111685 MsG0780039440.01.T01:CDS
CAGTGTTTCTGAGACTGCTT+TGG 0.250194 7:+64110495 MsG0780039440.01.T01:CDS
TGTTGCCTCCTAAAGTATTC+TGG 0.260342 7:-64112198 None:intergenic
CTGCACTTGAGAATGTTTAT+AGG 0.265383 7:+64110728 MsG0780039440.01.T01:CDS
CCTAAACATGCCAGTATCTT+TGG 0.269763 7:-64110782 None:intergenic
TTGATTGGGCTATTTGCTTT+TGG 0.270519 7:+64111463 MsG0780039440.01.T01:CDS
ACTTGGATCCAGAATACTTT+AGG 0.288644 7:+64112190 MsG0780039440.01.T01:CDS
CCATGGAAGTGGAGGTTTCT+GGG 0.299045 7:-64111953 None:intergenic
ATTCTTGGTGTGGGAGGATT+TGG 0.304988 7:+64111700 MsG0780039440.01.T01:CDS
TGGCTTCCACTTTCTCTTTA+CGG 0.316547 7:+64111544 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAGGTGCCGGTGACGAAGTT+TGG 0.329521 7:-64111836 None:intergenic
CCAAAGATACTGGCATGTTT+AGG 0.338631 7:+64110782 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGTGTTTCTGAGACTGCTTT+GGG 0.361647 7:+64110496 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCAGATAAGGATCAGTGATT+TGG 0.363662 7:-64112367 None:intergenic
CCCACGTTTAATTGCAACTT+TGG 0.367254 7:-64111758 None:intergenic
TATGTTGTATTTGCTCCCAC+TGG 0.374253 7:+64111187 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCCACATTCAAATGGGGTTC+CGG 0.377632 7:+64111153 MsG0780039440.01.T01:CDS
GGATACTCAAGCTTCACTTC+TGG 0.383366 7:-64110868 None:intergenic
GTCTATGATCATATGGCATA+TGG 0.386024 7:+64111904 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATTTCGCCTTCCAAAGATAC+TGG 0.386832 7:+64110772 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCCCACTGGGCCACCGCAGC+AGG 0.388285 7:+64111201 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTTCTCATTTGCTGAAATCA+AGG 0.390016 7:+64111648 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGAGCATTTCAATTTCAGTT+TGG 0.392147 7:-64111813 None:intergenic
TCCTGCTGCGGTGGCCCAGT+GGG 0.392589 7:-64111202 None:intergenic
CAGTGATAGTAAAGGTAATC+TGG 0.398923 7:+64111309 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCAGTAGAAGTATAAATATC+AGG 0.399787 7:-64110652 None:intergenic
GCAATATAAGATGGTGTTCC+CGG 0.403242 7:-64110892 None:intergenic
AAGCCTATGCATTTGTAAAT+GGG 0.404160 7:+64110611 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATCTCAAGCCTTTGCTTCCA+TGG 0.409084 7:-64111970 None:intergenic
GGAATCATTGCTGGAGGTAT+TGG 0.409414 7:+64111418 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAGATTGCATCATAGTAATT+GGG 0.411199 7:-64111262 None:intergenic
CTTGCTCCTTAGCAAGTGTT+GGG 0.417055 7:-64112296 None:intergenic
CAAGTGAAGGGCCGTCTGGC+TGG 0.418618 7:+64111524 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCTGCCAAGACGAACACAAC+TGG 0.422258 7:+64111586 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGACTTAATTGATCCGTCAT+TGG 0.425709 7:+64111363 MsG0780039440.01.T01:CDS
GATCCTTGTCTATGATCATA+TGG 0.426831 7:+64111897 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATGGCAATATCAGCTTGAAT+TGG 0.427766 7:+64110956 MsG0780039440.01.T01:CDS
GCTTGAATTGGAACTTGACT+TGG 0.431485 7:+64110968 MsG0780039440.01.T01:CDS
ACTTGCTCCTTAGCAAGTGT+TGG 0.433205 7:-64112297 None:intergenic
TTTGACCTTCCACATTCAAA+TGG 0.433871 7:+64111145 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTGACCTTCCACATTCAAAT+GGG 0.434504 7:+64111146 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATCATAGACAAGGATCATTT+CGG 0.434673 7:-64111890 None:intergenic
TCTTGCACCTGGGGAGGAGG+AGG 0.435842 7:-64111343 None:intergenic
ATTTGGTGTGGTTCTATTCG+AGG 0.437111 7:+64112248 MsG0780039440.01.T01:CDS
GACCAACCCTCCTCCTCCCC+AGG 0.437460 7:+64111336 MsG0780039440.01.T01:CDS
CACCTGGGGAGGAGGAGGGT+TGG 0.439879 7:-64111338 None:intergenic
CATGTAAGTACCGTGGTAAA+GGG 0.440743 7:+64112156 MsG0780039440.01.T01:CDS
TCATGTAAGTACCGTGGTAA+AGG 0.441029 7:+64112155 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAATGACGACAAAGGTTTGA+TGG 0.441193 7:-64111628 None:intergenic
AGTCATACAGGAATCATTGC+TGG 0.449120 7:+64111409 MsG0780039440.01.T01:CDS
TACTATGATGCAATCTTGAA+TGG 0.450281 7:+64111268 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAATCCGATGTGTACTCATT+TGG 0.450793 7:+64112231 MsG0780039440.01.T01:CDS
GCAAGTGTTGGGTTCAAAGC+CGG 0.452120 7:-64112285 None:intergenic
AGCCTTTGCTTCCATGGAAG+TGG 0.453244 7:-64111964 None:intergenic
TTGGGCTTAGAAGTTGCATC+TGG 0.456891 7:-64111244 None:intergenic
AATGATTCCTGTATGACTCT+TGG 0.457273 7:-64111404 None:intergenic
TGCATAGGCTTTAGATGCAT+TGG 0.457979 7:-64110599 None:intergenic
CGCAATCCTACACCGTGCTT+CGG 0.460584 7:+64110467 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAAGTGAAGTCTCACAAGAT+AGG 0.462377 7:-64111014 None:intergenic
TGGGAATCCACTCTCTGAGC+AGG 0.464566 7:+64111777 MsG0780039440.01.T01:CDS
ACCGTGGTAAAGGGTAGTTT+TGG 0.466071 7:+64112165 MsG0780039440.01.T01:CDS
GTTTACAAAGGAGAAATTGA+TGG 0.467395 7:+64111727 MsG0780039440.01.T01:CDS
TGAGTACACATCGGATTTGT+CGG 0.467789 7:-64112226 None:intergenic
CGGCACCTTGTTTCATTGAT+CGG 0.468325 7:+64111850 MsG0780039440.01.T01:CDS
CAAGTGTTGGGTTCAAAGCC+GGG 0.476885 7:-64112284 None:intergenic
AGTACAAGTGAAGGGCCGTC+TGG 0.480075 7:+64111520 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGTAAATCCAAGAGTCATAC+AGG 0.480177 7:+64111397 MsG0780039440.01.T01:CDS
CTGGATGCAGCGCAAGCCAC+AGG 0.480683 7:-64111225 None:intergenic
TATTGCATTCATGTTGATGA+AGG 0.482318 7:+64110547 MsG0780039440.01.T01:CDS
CGAGGTACTTTGTGCTCGCC+CGG 0.484268 7:+64112266 MsG0780039440.01.T01:CDS
GCCATTCGGACCCATCGATC+TGG 0.484917 7:-64110938 None:intergenic
AACCACCATGATTGTTGGTA+CGG 0.486168 7:+64110678 MsG0780039440.01.T01:CDS
CGAATCTTTGATTCTTGGTG+TGG 0.489368 7:+64111690 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTTATAGGTTAAACGTGGGT+GGG 0.492398 7:+64110743 MsG0780039440.01.T01:CDS
GATAGTAAAGGTAATCTGGC+AGG 0.501043 7:+64111313 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTTGCGGTATGCGTAAATAG+AGG 0.501623 7:-64108252 None:intergenic
AAGTCTTGCACCTGGGGAGG+AGG 0.502311 7:-64111346 None:intergenic
GATATTTATACTTCTACTGA+TGG 0.503525 7:+64110655 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATGTTGTATTTGCTCCCACT+GGG 0.508147 7:+64111188 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGCCACAGGTCCTGCTGCGG+TGG 0.510165 7:-64111211 None:intergenic
GCAATCTTGCCCTTCAGATA+AGG 0.516793 7:-64112380 None:intergenic
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GAATTATGATTACATTGTGA+AGG 0.518572 7:+64110522 MsG0780039440.01.T01:CDS
ACTTCCAGTTGTGTTCGTCT+TGG 0.520438 7:-64111590 None:intergenic
CTTCACATCACGGTGGATGA+TGG 0.520458 7:-64112046 None:intergenic
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GTCCTGCTGCGGTGGCCCAG+TGG 0.522516 7:-64111203 None:intergenic
TGGAGTAAAAGTCACATTCA+AGG 0.522687 7:-64110572 None:intergenic
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GCTTTAGATGCATTGGCAGA+TGG 0.525566 7:-64110592 None:intergenic
CTCCACTTCCATGGAAGCAA+AGG 0.526107 7:+64111962 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATCATTGCTGGAGGTATTGG+TGG 0.526822 7:+64111421 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTCAAGCTGATATTGCCATT+CGG 0.530247 7:-64110952 None:intergenic
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TTCAAAATCAGTGATAGTAA+AGG 0.531042 7:+64111301 MsG0780039440.01.T01:CDS
ATCAATTAAGTCTTGCACCT+GGG 0.531792 7:-64111353 None:intergenic
GTGAAGCTTGAGTATCCTCC+GGG 0.534369 7:+64110874 MsG0780039440.01.T01:CDS
GTTTATAGGTTAAACGTGGG+TGG 0.534566 7:+64110742 MsG0780039440.01.T01:CDS
TAATTGATCCGTCATTGGCT+AGG 0.535412 7:+64111368 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAAGATTCTAGTACAAGTGA+AGG 0.535424 7:+64111511 MsG0780039440.01.T01:CDS
CTTTGCTTCCATGGAAGTGG+AGG 0.536700 7:-64111961 None:intergenic
TGCTCTCCAAACTTCGTCAC+CGG 0.539694 7:+64111830 MsG0780039440.01.T01:CDS
GAATTACCGTAAAGAGAAAG+TGG 0.544867 7:-64111550 None:intergenic
TTTGAACCCAACACTTGCTA+AGG 0.545338 7:+64112290 MsG0780039440.01.T01:CDS
TTAGATGTGAACTATTACAC+GGG 0.545838 7:+64108352 MsG0780039440.01.T01:CDS
AAGTGCAGTGCTGTTGTCAA+TGG 0.547218 7:-64110713 None:intergenic
AATCCCATTTACAAATGCAT+AGG 0.548090 7:-64110614 None:intergenic
CAATCCAAAATCAGAAACCT+TGG 0.548795 7:-64112103 None:intergenic
ACATCTCGTCGCCGTAGGAA+TGG 0.550784 7:+64111487 MsG0780039440.01.T01:CDS
TACATGACGGCCAGATCGAT+GGG 0.551907 7:+64110928 MsG0780039440.01.T01:CDS
AGTGAAGCTTGAGTATCCTC+CGG 0.552496 7:+64110873 MsG0780039440.01.T01:CDS
GATGGAACCACCATGATTGT+TGG 0.555774 7:+64110673 MsG0780039440.01.T01:CDS
TGGTGTGGGAGGATTTGGCA+AGG 0.556779 7:+64111705 MsG0780039440.01.T01:CDS
AATCACTGATCCTTATCTGA+AGG 0.558077 7:+64112370 MsG0780039440.01.T01:CDS
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GAAAGTGGAAGCCAGCCAGA+CGG 0.561986 7:-64111535 None:intergenic
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CTAGATTTCCTAGCCAATGA+CGG 0.565634 7:-64111376 None:intergenic
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GCCGTCATGTAAACATCGGA+CGG 0.605338 7:-64110916 None:intergenic
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CRISPR-GE

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AAAGCCTATGCATTTGTAAA+TGG + Chr7:64110610-64110629 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
AAGATTCTAGTACAAGTGAA+GGG + Chr7:64111512-64111531 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
AAGCCTATGCATTTGTAAAT+GGG + Chr7:64110611-64110630 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
AATCCCATTTACAAATGCAT+AGG - Chr7:64110617-64110636 None:intergenic 30.0%
ACAACATAATCTTTATGCAC+CGG - Chr7:64111175-64111194 None:intergenic 30.0%
ACATGAGTATTATCCAATGT+AGG - Chr7:64112141-64112160 None:intergenic 30.0%
AGATTGTTGAAGAAGGAAAT+GGG - Chr7:64109783-64109802 None:intergenic 30.0%
ATCATAGACAAGGATCATTT+CGG - Chr7:64111893-64111912 None:intergenic 30.0%
ATTACACGGGTAATTTCAAA+AGG + Chr7:64108365-64108384 MsG0780039440.01.T01:intron 30.0%
CAAGATTGCATCATAGTAAT+TGG - Chr7:64111266-64111285 None:intergenic 30.0%
GAATGACAAAGCAAAAAAGA+AGG - Chr7:64108915-64108934 None:intergenic 30.0%
GAATGTTTATAGGTTAAACG+TGG + Chr7:64110738-64110757 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
GTTTACAAAGGAGAAATTGA+TGG + Chr7:64111727-64111746 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
TACTATGATGCAATCTTGAA+TGG + Chr7:64111268-64111287 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
TTAGATGTGAACTATTACAC+GGG + Chr7:64108352-64108371 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
TTAGTGAGCTAATCTGTAAA+TGG + Chr7:64109538-64109557 MsG0780039440.01.T01:intron 30.0%
TTGAATAATGAAGGTGAAGA+TGG - Chr7:64110005-64110024 None:intergenic 30.0%
TTTGACGAATCTTTGATTCT+TGG + Chr7:64111685-64111704 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTCAAAAAGAAACGCAA+AGG + Chr7:64109279-64109298 MsG0780039440.01.T01:intron 30.0%
! ACATTTTACTAGATGAGAAG+TGG + Chr7:64112076-64112095 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAGTATAAATATCAGGCA+TGG - Chr7:64110650-64110669 None:intergenic 30.0%
! AGAGCATTTCAATTTCAGTT+TGG - Chr7:64111816-64111835 None:intergenic 30.0%
! AGTGTTGAAGAAAAAGAAAG+GGG - Chr7:64109967-64109986 None:intergenic 30.0%
! ATGATGTGCGTTACATTTTT+GGG + Chr7:64110815-64110834 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
! CATTTTACTAGATGAGAAGT+GGG + Chr7:64112077-64112096 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
! TAGAATCTTTTCCATTCCTA+CGG - Chr7:64111501-64111520 None:intergenic 30.0%
! TATTGCATTCATGTTGATGA+AGG + Chr7:64110547-64110566 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGATTTTCTCAATGATTC+TGG + Chr7:64110987-64111006 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCTCATTTGCTGAAATCA+AGG + Chr7:64111648-64111667 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
!! AAACAAGGGTTTGTTATTTG+TGG + Chr7:64110272-64110291 MsG0780039440.01.T01:intron 30.0%
!! GATTTTGGATTGTCTAAAAC+AGG + Chr7:64112114-64112133 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTGCTTTACTACTTTTGAT+TGG + Chr7:64111448-64111467 MsG0780039440.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATCTAGTTGGTAACATTTTC+CGG - Chr7:64108596-64108615 None:intergenic 30.0%
!!! GACTTAGTTTTAGTTAGTGT+TGG - Chr7:64108421-64108440 None:intergenic 30.0%
AAAGTGAAGTCTCACAAGAT+AGG - Chr7:64111017-64111036 None:intergenic 35.0%
AAATCCGATGTGTACTCATT+TGG + Chr7:64112231-64112250 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
AAATGACGACAAAGGTTTGA+TGG - Chr7:64111631-64111650 None:intergenic 35.0%
AACTATTACTTCCTTTGCGA+GGG - Chr7:64109165-64109184 None:intergenic 35.0%
AATGATTCCTGTATGACTCT+TGG - Chr7:64111407-64111426 None:intergenic 35.0%
ACCAAAGTTGCAATTAAACG+TGG + Chr7:64111757-64111776 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGGATCCAGAATACTTT+AGG + Chr7:64112190-64112209 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
AGACTTAATTGATCCGTCAT+TGG + Chr7:64111363-64111382 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
AGATCAGGAAAGTAAATTGG+GGG - Chr7:64110148-64110167 None:intergenic 35.0%
AGTAAATCCAAGAGTCATAC+AGG + Chr7:64111397-64111416 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
AGTATCCGATCAATGAAACA+AGG - Chr7:64111858-64111877 None:intergenic 35.0%
ATAGTAAAGGTAATCTGGCA+GGG + Chr7:64111314-64111333 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATTAAGTCTTGCACCT+GGG - Chr7:64111356-64111375 None:intergenic 35.0%
ATGCCATATGATCATAGACA+AGG - Chr7:64111903-64111922 None:intergenic 35.0%
ATGGCAATATCAGCTTGAAT+TGG + Chr7:64110956-64110975 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
CAAATGAGAAATGACGACAA+AGG - Chr7:64111639-64111658 None:intergenic 35.0%
CAAGTTAGTGAGTTACAACT+TGG + Chr7:64109724-64109743 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
CAATCCAAAATCAGAAACCT+TGG - Chr7:64112106-64112125 None:intergenic 35.0%
CACTGGAAACTATAGGTATA+CGG - Chr7:64110362-64110381 None:intergenic 35.0%
CAGATCAGGAAAGTAAATTG+GGG - Chr7:64110149-64110168 None:intergenic 35.0%
CAGTGATAGTAAAGGTAATC+TGG + Chr7:64111309-64111328 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
CATGATGATTCCGTTTATGA+CGG + Chr7:64110318-64110337 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
CCAAAGTTGCAATTAAACGT+GGG + Chr7:64111758-64111777 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
CCAATTTACTTTCCTGATCT+GGG + Chr7:64110148-64110167 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
CCAGATCAGGAAAGTAAATT+GGG - Chr7:64110150-64110169 None:intergenic 35.0%
CTACCACGTTGTACTTTATT+CGG + Chr7:64110398-64110417 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
CTGCACTTGAGAATGTTTAT+AGG + Chr7:64110728-64110747 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
GAACACTCTTTGATTGATCT+TGG - Chr7:64111062-64111081 None:intergenic 35.0%
GAAGAAAGATGAGCTGAAAA+AGG - Chr7:64109926-64109945 None:intergenic 35.0%
GAATTACCGTAAAGAGAAAG+TGG - Chr7:64111553-64111572 None:intergenic 35.0%
GAGATTGTTGAAGAAGGAAA+TGG - Chr7:64109784-64109803 None:intergenic 35.0%
GATCCTTGTCTATGATCATA+TGG + Chr7:64111897-64111916 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTTGAAGAAGGAAATG+GGG - Chr7:64109782-64109801 None:intergenic 35.0%
GTCTATGATCATATGGCATA+TGG + Chr7:64111904-64111923 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGGAGAAATTGATGG+CGG + Chr7:64111730-64111749 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
TCAGATAAGGATCAGTGATT+TGG - Chr7:64112370-64112389 None:intergenic 35.0%
TGCATTTGTAAATGGGATTG+AGG + Chr7:64110618-64110637 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGTAAAAGTCACATTCA+AGG - Chr7:64110575-64110594 None:intergenic 35.0%
TGTTTGTAGTCTTCACATCA+CGG - Chr7:64112059-64112078 None:intergenic 35.0%
TTCAAGCTGATATTGCCATT+CGG - Chr7:64110955-64110974 None:intergenic 35.0%
TTGACCTTCCACATTCAAAT+GGG + Chr7:64111146-64111165 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
TTTATAGGTTAAACGTGGGT+GGG + Chr7:64110743-64110762 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
TTTGACCTTCCACATTCAAA+TGG + Chr7:64111145-64111164 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
! AGAGTGTTCGATATATTCCT+CGG + Chr7:64111073-64111092 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
! ATTTTCACCGGACATTATGT+AGG + Chr7:64109075-64109094 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
! GAATCTTTGATTCTTGGTGT+GGG + Chr7:64111691-64111710 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
! GATGATGGTATATTTAGCAC+CGG - Chr7:64112034-64112053 None:intergenic 35.0%
! GATGATGTGCGTTACATTTT+TGG + Chr7:64110814-64110833 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
! TAATACTCATGTAAGTACCG+TGG + Chr7:64112149-64112168 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTGTTGTGTATGTAGAGT+CGG - Chr7:64109874-64109893 None:intergenic 35.0%
! TGATGTGCGTTACATTTTTG+GGG + Chr7:64110816-64110835 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
! TGTACTTTATTCGGTTCGTA+TGG + Chr7:64110407-64110426 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
! TTGATTGGGCTATTTGCTTT+TGG + Chr7:64111463-64111482 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
!! GATCTAGTTGGTACATTTTC+CGG - Chr7:64108716-64108735 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTGGATTGTTGTGTTCA+TGG + Chr7:64110294-64110313 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
!!! AAAGGGTAGTTTTGGTTACT+TGG + Chr7:64112173-64112192 MsG0780039440.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTTTTAGAACACCCAGATC+AGG - Chr7:64110163-64110182 None:intergenic 35.0%
!!! GGGTTTGTTATTTGTGGTTT+TGG + Chr7:64110278-64110297 MsG0780039440.01.T01:intron 35.0%
AACACTGAAATTCCGAAGCA+CGG - Chr7:64110482-64110501 None:intergenic 40.0%
AACATGCCAGTATCTTTGGA+AGG - Chr7:64110781-64110800 None:intergenic 40.0%
AACCACCATGATTGTTGGTA+CGG + Chr7:64110678-64110697 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAGGTTTGATGGAAGAG+TGG - Chr7:64111623-64111642 None:intergenic 40.0%
ACCAAAACTACCCTTTACCA+CGG - Chr7:64112169-64112188 None:intergenic 40.0%
AGCTGAAAAAGGAAGCAACT+TGG - Chr7:64109915-64109934 None:intergenic 40.0%
AGTCATACAGGAATCATTGC+TGG + Chr7:64111409-64111428 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
ATACTGGCATGTTTAGGTCA+TGG + Chr7:64110788-64110807 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
ATATGGCATATGGAACACTC+AGG + Chr7:64111914-64111933 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTTCTTCCCATGGCATA+AGG + Chr7:64109936-64109955 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
ATGTTGTATTTGCTCCCACT+GGG + Chr7:64111188-64111207 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCGCCTTCCAAAGATAC+TGG + Chr7:64110772-64110791 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGGCTTGAGATATGCAT+TGG + Chr7:64111979-64111998 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
CAACTATTACTTCCTTTGCG+AGG - Chr7:64109166-64109185 None:intergenic 40.0%
CACACCAAATGAGTACACAT+CGG - Chr7:64112238-64112257 None:intergenic 40.0%
CCAAAGATACTGGCATGTTT+AGG + Chr7:64110782-64110801 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
CCCAATTTACTTTCCTGATC+TGG + Chr7:64110147-64110166 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
CCCACGTTTAATTGCAACTT+TGG - Chr7:64111761-64111780 None:intergenic 40.0%
CCCAGATCAGGAAAGTAAAT+TGG - Chr7:64110151-64110170 None:intergenic 40.0%
CCTAAACATGCCAGTATCTT+TGG - Chr7:64110785-64110804 None:intergenic 40.0%
CGAATAAAGTACAACGTGGT+AGG - Chr7:64110400-64110419 None:intergenic 40.0%
CGAATCTTTGATTCTTGGTG+TGG + Chr7:64111690-64111709 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
CGTATACCTATAGTTTCCAG+TGG + Chr7:64110360-64110379 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
CTAGATTTCCTAGCCAATGA+CGG - Chr7:64111379-64111398 None:intergenic 40.0%
GAACCGAATAAAGTACAACG+TGG - Chr7:64110404-64110423 None:intergenic 40.0%
GAGAGAGAGATTGTTGAAGA+AGG - Chr7:64109790-64109809 None:intergenic 40.0%
GATAGTAAAGGTAATCTGGC+AGG + Chr7:64111313-64111332 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
GATCAATTAAGTCTTGCACC+TGG - Chr7:64111357-64111376 None:intergenic 40.0%
GATCAGGAAAGTAAATTGGG+GGG - Chr7:64110147-64110166 None:intergenic 40.0%
GCAATATAAGATGGTGTTCC+CGG - Chr7:64110895-64110914 None:intergenic 40.0%
GCTTGAATTGGAACTTGACT+TGG + Chr7:64110968-64110987 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
GGATTTGGCAAGGTTTACAA+AGG + Chr7:64111715-64111734 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
GTTTATAGGTTAAACGTGGG+TGG + Chr7:64110742-64110761 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TATGGCATATGGAACACTCA+GGG + Chr7:64111915-64111934 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TATGTTGTATTTGCTCCCAC+TGG + Chr7:64111187-64111206 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TCAATTAAGTCTTGCACCTG+GGG - Chr7:64111355-64111374 None:intergenic 40.0%
TGACCTTCCACATTCAAATG+GGG + Chr7:64111147-64111166 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TGAGTACACATCGGATTTGT+CGG - Chr7:64112229-64112248 None:intergenic 40.0%
TGGATCCAGAATACTTTAGG+AGG + Chr7:64112193-64112212 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TGGCTTCCACTTTCTCTTTA+CGG + Chr7:64111544-64111563 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TTGACAAATTTCGTCGGAGT+TGG + Chr7:64108830-64108849 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
TTGGGGGGTTATGATGAAAT+TGG - Chr7:64110132-64110151 None:intergenic 40.0%
TTTACTAGATGAGAAGTGGG+TGG + Chr7:64112080-64112099 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCGGTATGCGTAAATAG+AGG - Chr7:64108255-64108274 None:intergenic 40.0%
! ACAAAGGAGAAATTGATGGC+GGG + Chr7:64111731-64111750 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
! ACTTTATTCGGTTCGTATGG+TGG + Chr7:64110410-64110429 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
! CATGTAAGTACCGTGGTAAA+GGG + Chr7:64112156-64112175 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTATTCGGTTCGTATGGT+GGG + Chr7:64110411-64110430 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
! GTCTAAAACAGGTCCTACAT+TGG + Chr7:64112125-64112144 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
! TAATTGATCCGTCATTGGCT+AGG + Chr7:64111368-64111387 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
! TAATTTGGTTTCCCTCGCAA+AGG + Chr7:64109151-64109170 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
! TCATGTAAGTACCGTGGTAA+AGG + Chr7:64112155-64112174 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTGCCTCCTAAAGTATTC+TGG - Chr7:64112201-64112220 None:intergenic 40.0%
! TTTGAACCCAACACTTGCTA+AGG + Chr7:64112290-64112309 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTGTTTCTGAGACTGCTTT+GGG + Chr7:64110496-64110515 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGGTGTGGTTCTATTCG+AGG + Chr7:64112248-64112267 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGAGACTTCACTTTTGTGA+GGG + Chr7:64111022-64111041 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
!! TGCATAGGCTTTAGATGCAT+TGG - Chr7:64110602-64110621 None:intergenic 40.0%
!! TGTGAGACTTCACTTTTGTG+AGG + Chr7:64111021-64111040 MsG0780039440.01.T01:intron 40.0%
!!! TACATTTTTGGGGCTGCATT+TGG + Chr7:64110826-64110845 MsG0780039440.01.T01:CDS 40.0%
AAAACACGCGCCGTCATAAA+CGG - Chr7:64110331-64110350 None:intergenic 45.0%
AACGTGGTAGGAACATCCAA+CGG - Chr7:64110388-64110407 None:intergenic 45.0%
ACCACCATGATTGTTGGTAC+GGG + Chr7:64110679-64110698 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
ACTTCCAGTTGTGTTCGTCT+TGG - Chr7:64111593-64111612 None:intergenic 45.0%
ACTTGCTCCTTAGCAAGTGT+TGG - Chr7:64112300-64112319 None:intergenic 45.0%
AGTACCCGTACCAACAATCA+TGG - Chr7:64110686-64110705 None:intergenic 45.0%
AGTGAAGCTTGAGTATCCTC+CGG + Chr7:64110873-64110892 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
ATATAAGATGGTGTTCCCGG+AGG - Chr7:64110892-64110911 None:intergenic 45.0%
ATCTCAAGCCTTTGCTTCCA+TGG - Chr7:64111973-64111992 None:intergenic 45.0%
CATACAGGAATCATTGCTGG+AGG + Chr7:64111412-64111431 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
CGATCAATGAAACAAGGTGC+CGG - Chr7:64111852-64111871 None:intergenic 45.0%
CTTGCTCCTTAGCAAGTGTT+GGG - Chr7:64112299-64112318 None:intergenic 45.0%
GAACCCCATTTGAATGTGGA+AGG - Chr7:64111153-64111172 None:intergenic 45.0%
GATGGAACCACCATGATTGT+TGG + Chr7:64110673-64110692 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
GCAGCTCATTGCTACAAGAA+AGG + Chr7:64112335-64112354 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
GGATACTCAAGCTTCACTTC+TGG - Chr7:64110871-64110890 None:intergenic 45.0%
GGTCTACACTATCTTCACAC+CGG + Chr7:64112012-64112031 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
GTAATCAAACTGCTGCGGAT+GGG + Chr7:64111095-64111114 MsG0780039440.01.T01:intron 45.0%
TAATCAAACTGCTGCGGATG+GGG + Chr7:64111096-64111115 MsG0780039440.01.T01:intron 45.0%
TACGCATACCGCAAAAGTCA+AGG + Chr7:64108260-64108279 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
TCAGCTCATCTTTCTTCCCA+TGG + Chr7:64109929-64109948 MsG0780039440.01.T01:intron 45.0%
TCCACATTCAAATGGGGTTC+CGG + Chr7:64111153-64111172 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
TCCGTCCGATGTTTACATGA+CGG + Chr7:64110915-64110934 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
TCGGACGGAGCAATATAAGA+TGG - Chr7:64110904-64110923 None:intergenic 45.0%
TCTGGCCGTCATGTAAACAT+CGG - Chr7:64110923-64110942 None:intergenic 45.0%
TGAAGGTGAAGATGGTGTGA+AGG - Chr7:64109997-64110016 None:intergenic 45.0%
TGACATGACGTTGCAATGAG+AGG - Chr7:64109479-64109498 None:intergenic 45.0%
TTGGGCTTAGAAGTTGCATC+TGG - Chr7:64111247-64111266 None:intergenic 45.0%
TTGTAGTCTTCACATCACGG+TGG - Chr7:64112056-64112075 None:intergenic 45.0%
! AAGTGCAGTGCTGTTGTCAA+TGG - Chr7:64110716-64110735 None:intergenic 45.0%
! ACCGTGGTAAAGGGTAGTTT+TGG + Chr7:64112165-64112184 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! AGCAACTTGGTGAGTCAAAG+AGG - Chr7:64109902-64109921 None:intergenic 45.0%
! AGGGGTTTTACCTTATGCCA+TGG - Chr7:64109949-64109968 None:intergenic 45.0%
! AGTGCTGTTGTCAATGGTGA+AGG - Chr7:64110710-64110729 None:intergenic 45.0%
! ATTCTTGGTGTGGGAGGATT+TGG + Chr7:64111700-64111719 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! CGATGTGTACTCATTTGGTG+TGG + Chr7:64112236-64112255 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! CGGCACCTTGTTTCATTGAT+CGG + Chr7:64111850-64111869 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! CTCTTGCTCCTTGACTTTTG+CGG - Chr7:64108271-64108290 None:intergenic 45.0%
! GCTTTAGATGCATTGGCAGA+TGG - Chr7:64110595-64110614 None:intergenic 45.0%
! GGAATCATTGCTGGAGGTAT+TGG + Chr7:64111418-64111437 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! GGGGTTTTACCTTATGCCAT+GGG - Chr7:64109948-64109967 None:intergenic 45.0%
! GTGCTGTTGTCAATGGTGAA+GGG - Chr7:64110709-64110728 None:intergenic 45.0%
! GTGGCCAAGGTTTCTGATTT+TGG + Chr7:64112099-64112118 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTTGATTCTTGGTGTGGG+AGG + Chr7:64111694-64111713 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCATTGCTGGAGGTATTGG+TGG + Chr7:64111421-64111440 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
!! CAGTGTTTCTGAGACTGCTT+TGG + Chr7:64110495-64110514 MsG0780039440.01.T01:CDS 45.0%
AAGGTCAAAACTACCTGCCC+AGG - Chr7:64111134-64111153 None:intergenic 50.0%
ACCCGTACCAACAATCATGG+TGG - Chr7:64110683-64110702 None:intergenic 50.0%
ACCGGAACCCCATTTGAATG+TGG - Chr7:64111157-64111176 None:intergenic 50.0%
ACGGAGCCACTGGAAACTAT+AGG - Chr7:64110369-64110388 None:intergenic 50.0%
AGCAAGTGAGTCTAGCTGAG+TGG + Chr7:64112313-64112332 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
AGCCTTTGCTTCCATGGAAG+TGG - Chr7:64111967-64111986 None:intergenic 50.0%
ATAGTTTCCAGTGGCTCCGT+TGG + Chr7:64110369-64110388 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
ATATGCATTGGAGCTGCTCG+AGG + Chr7:64111991-64112010 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
ATGGGGCTGATGTTATTGCC+TGG + Chr7:64111113-64111132 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
ATTAAGTCTTGCACCTGGGG+AGG - Chr7:64111352-64111371 None:intergenic 50.0%
CCATGGAAGTGGAGGTTTCT+GGG - Chr7:64111956-64111975 None:intergenic 50.0%
CCTCGGTAATCAAACTGCTG+CGG + Chr7:64111090-64111109 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
CGTTGCAATGAGAGGAGTTG+AGG - Chr7:64109471-64109490 None:intergenic 50.0%
CTCCACTTCCATGGAAGCAA+AGG + Chr7:64111962-64111981 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
CTGTCACAACAAACGCGCAT+CGG - Chr7:64110447-64110466 None:intergenic 50.0%
CTTCACATCACGGTGGATGA+TGG - Chr7:64112049-64112068 None:intergenic 50.0%
CTTTGCTTCCATGGAAGTGG+AGG - Chr7:64111964-64111983 None:intergenic 50.0%
GAAATTCCGAAGCACGGTGT+AGG - Chr7:64110476-64110495 None:intergenic 50.0%
GCCGTCATGTAAACATCGGA+CGG - Chr7:64110919-64110938 None:intergenic 50.0%
GGTAATCAAACTGCTGCGGA+TGG + Chr7:64111094-64111113 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
GTGAAGCTTGAGTATCCTCC+GGG + Chr7:64110874-64110893 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
TACATGACGGCCAGATCGAT+GGG + Chr7:64110928-64110947 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
TCCATGGAAGTGGAGGTTTC+TGG - Chr7:64111957-64111976 None:intergenic 50.0%
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC+TGG + Chr7:64109800-64109819 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
TCTGCCAAGACGAACACAAC+TGG + Chr7:64111586-64111605 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
TGCTCTCCAAACTTCGTCAC+CGG + Chr7:64111830-64111849 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
TGGGGCTGATGTTATTGCCT+GGG + Chr7:64111114-64111133 MsG0780039440.01.T01:intron 50.0%
TTACATGACGGCCAGATCGA+TGG + Chr7:64110927-64110946 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
!! ATTGCTGGAGGTATTGGTGG+AGG + Chr7:64111424-64111443 MsG0780039440.01.T01:CDS 50.0%
!! CAAGTGTTGGGTTCAAAGCC+GGG - Chr7:64112287-64112306 None:intergenic 50.0%
!! GCAAGTGTTGGGTTCAAAGC+CGG - Chr7:64112288-64112307 None:intergenic 50.0%
ACATCTCGTCGCCGTAGGAA+TGG + Chr7:64111487-64111506 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
AGATGAGAAGTGGGTGGCCA+AGG + Chr7:64112086-64112105 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
AGTACAAGTGAAGGGCCGTC+TGG + Chr7:64111520-64111539 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
CCCAGAAACCTCCACTTCCA+TGG + Chr7:64111953-64111972 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
CCGCAGCAGTTTGATTACCG+AGG - Chr7:64111093-64111112 None:intergenic 55.0%
CGCAATCCTACACCGTGCTT+CGG + Chr7:64110467-64110486 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
CTCTCTCTCTGGTCTCCAAC+TGG + Chr7:64109817-64109836 MsG0780039440.01.T01:intron 55.0%
GAAAGTGGAAGCCAGCCAGA+CGG - Chr7:64111538-64111557 None:intergenic 55.0%
GCAGACTTGCAGTTGCCAGT+TGG - Chr7:64109835-64109854 None:intergenic 55.0%
GCTGATGTTATTGCCTGGGC+AGG + Chr7:64111118-64111137 MsG0780039440.01.T01:intron 55.0%
GGGAATCCACTCTCTGAGCA+GGG + Chr7:64111778-64111797 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
TGGGAATCCACTCTCTGAGC+AGG + Chr7:64111777-64111796 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
TGGTGTGGGAGGATTTGGCA+AGG + Chr7:64111705-64111724 MsG0780039440.01.T01:CDS 55.0%
!! AAGGTGCCGGTGACGAAGTT+TGG - Chr7:64111839-64111858 None:intergenic 55.0%
AAGTCTTGCACCTGGGGAGG+AGG - Chr7:64111349-64111368 None:intergenic 60.0%
GCCAGATCGATGGGTCCGAA+TGG + Chr7:64110937-64110956 MsG0780039440.01.T01:CDS 60.0%
GCCATTCGGACCCATCGATC+TGG - Chr7:64110941-64110960 None:intergenic 60.0%
GGAACATCCAACGGAGCCAC+TGG - Chr7:64110379-64110398 None:intergenic 60.0%
TGCACACCCTGCTCAGAGAG+TGG - Chr7:64111787-64111806 None:intergenic 60.0%
TTGGCACATCTCGTCGCCGT+AGG + Chr7:64111482-64111501 MsG0780039440.01.T01:CDS 60.0%
! CGAGGTACTTTGTGCTCGCC+CGG + Chr7:64112266-64112285 MsG0780039440.01.T01:CDS 60.0%
CAAGTGAAGGGCCGTCTGGC+TGG + Chr7:64111524-64111543 MsG0780039440.01.T01:CDS 65.0%
CTGGATGCAGCGCAAGCCAC+AGG - Chr7:64111228-64111247 None:intergenic 65.0%
CTTGCACCTGGGGAGGAGGA+GGG - Chr7:64111345-64111364 None:intergenic 65.0%
GCAAGCCACAGGTCCTGCTG+CGG - Chr7:64111217-64111236 None:intergenic 65.0%
TCTTGCACCTGGGGAGGAGG+AGG - Chr7:64111346-64111365 None:intergenic 65.0%
AGCCACAGGTCCTGCTGCGG+TGG - Chr7:64111214-64111233 None:intergenic 70.0%
CACCTGGGGAGGAGGAGGGT+TGG - Chr7:64111341-64111360 None:intergenic 70.0%
GACCAACCCTCCTCCTCCCC+AGG + Chr7:64111336-64111355 MsG0780039440.01.T01:CDS 70.0%
TCCTGCTGCGGTGGCCCAGT+GGG - Chr7:64111205-64111224 None:intergenic 70.0%
GGCCACCGCAGCAGGACCTG+TGG + Chr7:64111209-64111228 MsG0780039440.01.T01:CDS 75.0%
GTCCTGCTGCGGTGGCCCAG+TGG - Chr7:64111206-64111225 None:intergenic 75.0%
TCCCACTGGGCCACCGCAGC+AGG + Chr7:64111201-64111220 MsG0780039440.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 64108196 64112389 64108196 ID=MsG0780039440.01;Name=MsG0780039440.01
Chr7 mRNA 64108196 64112389 64108196 ID=MsG0780039440.01.T01;Parent=MsG0780039440.01;Name=MsG0780039440.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.54;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|660
Chr7 exon 64108196 64108373 64108196 ID=MsG0780039440.01.T01:exon:16620;Parent=MsG0780039440.01.T01
Chr7 exon 64110467 64111021 64110467 ID=MsG0780039440.01.T01:exon:16619;Parent=MsG0780039440.01.T01
Chr7 exon 64111140 64112389 64111140 ID=MsG0780039440.01.T01:exon:16618;Parent=MsG0780039440.01.T01
Chr7 CDS 64108196 64108373 64108196 ID=MsG0780039440.01.T01:cds;Parent=MsG0780039440.01.T01
Chr7 CDS 64110467 64111021 64110467 ID=MsG0780039440.01.T01:cds;Parent=MsG0780039440.01.T01
Chr7 CDS 64111140 64112389 64111140 ID=MsG0780039440.01.T01:cds;Parent=MsG0780039440.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039440.01.T01

ATGCTAATCAGTTCTTTATTTAATAATCACATCATCATCAAATTGAACAAGTATCGCCTCTATTTACGCATACCGCAAAAGTCAAGGAGCAAGAGACAGTACAGCATTAAGAAACAAAAATGCAAAGATTCATTCAAAAGCTTAAAAGGAGAAAATTTAGATGTGAACTATTACACGGCGCAATCCTACACCGTGCTTCGGAATTTCAGTGTTTCTGAGACTGCTTTGGGTTTGAATTATGATTACATTGTGAAGGAATATTGCATTCATGTTGATGAAGGAACCTTGAATGTGACTTTTACTCCATCTGCCAATGCATCTAAAGCCTATGCATTTGTAAATGGGATTGAGGTTGTGTCCATGCCTGATATTTATACTTCTACTGATGGAACCACCATGATTGTTGGTACGGGTACTCCCTTCACCATTGACAACAGCACTGCACTTGAGAATGTTTATAGGTTAAACGTGGGTGGGAATGATATTTCGCCTTCCAAAGATACTGGCATGTTTAGGTCATGGACCGATGATGTGCGTTACATTTTTGGGGCTGCATTTGGAGTTACTGAGACTGCTGATCCAGAAGTGAAGCTTGAGTATCCTCCGGGAACACCATCTTATATTGCTCCGTCCGATGTTTACATGACGGCCAGATCGATGGGTCCGAATGGCAATATCAGCTTGAATTGGAACTTGACTTGGATTTTCTCAATGATTCTGGTTTTCCTATCTTGTAGTTTTGACCTTCCACATTCAAATGGGGTTCCGGTGCATAAAGATTATGTTGTATTTGCTCCCACTGGGCCACCGCAGCAGGACCTGTGGCTTGCGCTGCATCCAGATGCAACTTCTAAGCCCAATTACTATGATGCAATCTTGAATGGAGTAGAAATATTCAAAATCAGTGATAGTAAAGGTAATCTGGCAGGGACCAACCCTCCTCCTCCCCAGGTGCAAGACTTAATTGATCCGTCATTGGCTAGGAAATCTAGTAAATCCAAGAGTCATACAGGAATCATTGCTGGAGGTATTGGTGGAGGAGTTGCTTTACTACTTTTGATTGGGCTATTTGCTTTTGGCACATCTCGTCGCCGTAGGAATGGAAAAGATTCTAGTACAAGTGAAGGGCCGTCTGGCTGGCTTCCACTTTCTCTTTACGGTAATTCACACTCTGCAGCTTCTGCCAAGACGAACACAACTGGAAGTTACACTTCCACTCTTCCATCAAACCTTTGTCGTCATTTCTCATTTGCTGAAATCAAGGCTGCTACAAACAACTTTGACGAATCTTTGATTCTTGGTGTGGGAGGATTTGGCAAGGTTTACAAAGGAGAAATTGATGGCGGGTCAACCAAAGTTGCAATTAAACGTGGGAATCCACTCTCTGAGCAGGGTGTGCACGAATTCCAAACTGAAATTGAAATGCTCTCCAAACTTCGTCACCGGCACCTTGTTTCATTGATCGGATACTGTGAAGAGAACACCGAAATGATCCTTGTCTATGATCATATGGCATATGGAACACTCAGGGAGCATCTATACAAGACCCAGAAACCTCCACTTCCATGGAAGCAAAGGCTTGAGATATGCATTGGAGCTGCTCGAGGTCTACACTATCTTCACACCGGTGCTAAATATACCATCATCCACCGTGATGTGAAGACTACAAACATTTTACTAGATGAGAAGTGGGTGGCCAAGGTTTCTGATTTTGGATTGTCTAAAACAGGTCCTACATTGGATAATACTCATGTAAGTACCGTGGTAAAGGGTAGTTTTGGTTACTTGGATCCAGAATACTTTAGGAGGCAACAACTGACCGACAAATCCGATGTGTACTCATTTGGTGTGGTTCTATTCGAGGTACTTTGTGCTCGCCCGGCTTTGAACCCAACACTTGCTAAGGAGCAAGTGAGTCTAGCTGAGTGGCAGCTCATTGCTACAAGAAAGGCATTCTTGACCAAATCACTGATCCTTATCTGA
Protein sequence

>MsG0780039440.01.T01

MLISSLFNNHIIIKLNKYRLYLRIPQKSRSKRQYSIKKQKCKDSFKSLKGENLDVNYYTAQSYTVLRNFSVSETALGLNYDYIVKEYCIHVDEGTLNVTFTPSANASKAYAFVNGIEVVSMPDIYTSTDGTTMIVGTGTPFTIDNSTALENVYRLNVGGNDISPSKDTGMFRSWTDDVRYIFGAAFGVTETADPEVKLEYPPGTPSYIAPSDVYMTARSMGPNGNISLNWNLTWIFSMILVFLSCSFDLPHSNGVPVHKDYVVFAPTGPPQQDLWLALHPDATSKPNYYDAILNGVEIFKISDSKGNLAGTNPPPPQVQDLIDPSLARKSSKSKSHTGIIAGGIGGGVALLLLIGLFAFGTSRRRRNGKDSSTSEGPSGWLPLSLYGNSHSAASAKTNTTGSYTSTLPSNLCRHFSFAEIKAATNNFDESLILGVGGFGKVYKGEIDGGSTKVAIKRGNPLSEQGVHEFQTEIEMLSKLRHRHLVSLIGYCEENTEMILVYDHMAYGTLREHLYKTQKPPLPWKQRLEICIGAARGLHYLHTGAKYTIIHRDVKTTNILLDEKWVAKVSDFGLSKTGPTLDNTHVSTVVKGSFGYLDPEYFRRQQLTDKSDVYSFGVVLFEVLCARPALNPTLAKEQVSLAEWQLIATRKAFLTKSLILI*