AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004938.01

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MsG0180004938.01.T01 AT1G61360 38.261 230 115 10 401 621 487 698 3.36e-26 114
MsG0180004938.01.T01 AT3G46930 37.850 214 110 10 419 626 207 403 3.47e-26 113
MsG0180004938.01.T01 AT3G46930 37.850 214 110 10 419 626 172 368 3.52e-26 112
MsG0180004938.01.T01 AT3G22750 31.950 241 131 8 408 626 69 298 3.70e-26 111
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MsG0180004938.01.T01 AT2G31010 37.019 208 113 7 419 623 525 717 3.91e-26 114
MsG0180004938.01.T01 AT3G01490 33.188 229 121 8 419 626 114 331 6.94e-26 110
MsG0180004938.01.T01 AT4G00330 35.981 214 114 8 419 622 125 325 7.68e-26 110
MsG0180004938.01.T01 AT4G00330 35.981 214 114 8 419 622 125 325 7.68e-26 110
MsG0180004938.01.T01 AT5G64430 43.478 138 65 4 55 185 44 175 1.36e-25 111
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MsG0180004938.01.T01 AT1G14000 36.916 214 115 8 419 625 168 368 3.68e-25 109
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MsG0180004938.01.T01 AT2G19230 36.364 209 109 8 419 620 575 766 4.20e-25 111
MsG0180004938.01.T01 AT4G05150 45.794 107 55 2 55 158 58 164 7.40e-25 108
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MsG0180004938.01.T01 AT3G26510 49.038 104 47 2 56 154 10 112 7.92e-25 102
MsG0180004938.01.T01 AT3G26510 49.038 104 47 2 56 154 10 112 7.92e-25 102
MsG0180004938.01.T01 AT3G26510 49.038 104 47 2 56 154 10 112 7.92e-25 102
MsG0180004938.01.T01 AT3G26510 49.038 104 47 2 56 154 10 112 7.92e-25 102
MsG0180004938.01.T01 AT3G26510 49.038 104 47 2 56 154 10 112 7.92e-25 102
MsG0180004938.01.T01 AT1G51860 37.069 232 113 9 419 634 590 804 8.45e-25 110
MsG0180004938.01.T01 AT1G51860 37.069 232 113 9 419 634 446 660 8.73e-25 110
MsG0180004938.01.T01 AT5G40540 33.019 212 133 5 418 626 31 236 1.02e-24 106
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MsG0180004938.01.T01 AT1G51880 38.095 210 105 8 419 620 598 790 1.16e-24 110
MsG0180004938.01.T01 AT5G40540 33.019 212 133 5 418 626 31 236 1.18e-24 104
MsG0180004938.01.T01 AT1G51880 38.095 210 105 8 419 620 572 764 1.45e-24 109
MsG0180004938.01.T01 AT2G01820 37.555 229 116 12 405 621 575 788 1.54e-24 109
MsG0180004938.01.T01 AT1G70740 31.907 257 138 9 385 621 22 261 1.92e-24 107
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MsG0180004938.01.T01 AT4G31170 37.017 181 102 7 412 586 127 301 2.05e-24 104
MsG0180004938.01.T01 AT4G31170 37.017 181 102 7 412 586 127 301 2.05e-24 104
MsG0180004938.01.T01 AT4G31170 37.017 181 102 7 412 586 127 301 2.05e-24 104
MsG0180004938.01.T01 AT1G70740 31.907 257 138 9 385 621 10 249 2.05e-24 107
MsG0180004938.01.T01 AT1G05700 32.800 250 138 10 379 620 571 798 2.32e-24 108
MsG0180004938.01.T01 AT1G05700 33.884 242 130 11 387 620 548 767 2.58e-24 108
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MsG0180004938.01.T01 AT1G70520 33.636 220 121 9 410 621 322 524 5.82e-24 107
MsG0180004938.01.T01 AT1G51870 36.207 232 115 9 419 634 537 751 6.16e-24 107
MsG0180004938.01.T01 AT5G66710 32.883 222 136 8 407 623 65 278 6.39e-24 105
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MsG0180004938.01.T01 AT5G09620 46.364 110 53 2 55 158 39 148 1.18e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT2G01190 48.148 108 51 2 55 157 74 181 1.63e-23 106
MsG0180004938.01.T01 AT1G51890 37.619 210 106 8 419 620 304 496 1.76e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT3G46420 37.441 211 106 9 419 620 537 730 2.53e-23 105
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MsG0180004938.01.T01 AT1G79620 35.681 213 112 10 418 622 643 838 3.21e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT1G51890 37.619 210 106 8 419 620 576 768 3.80e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT2G28970 38.278 209 103 9 419 618 450 641 4.00e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT2G28970 38.278 209 103 9 419 618 485 676 4.37e-23 105
MsG0180004938.01.T01 AT3G50720 33.784 222 130 10 412 626 47 258 5.39e-23 102
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MsG0180004938.01.T01 AT5G38210 32.331 266 140 11 367 621 332 568 1.07e-22 103
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MsG0180004938.01.T01 AT1G66880 30.769 260 140 10 373 621 556 786 2.06e-22 102
MsG0180004938.01.T01 AT2G14510 36.190 210 109 8 419 620 569 761 2.29e-22 102
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MsG0180004938.01.T01 AT2G14510 36.190 210 109 8 419 620 577 769 2.43e-22 102
MsG0180004938.01.T01 AT1G61420 35.217 230 122 11 401 621 485 696 2.51e-22 102
MsG0180004938.01.T01 AT1G61420 35.217 230 122 11 401 621 485 696 2.51e-22 102
MsG0180004938.01.T01 AT1G66880 30.769 260 140 10 373 621 935 1165 2.72e-22 102
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MsG0180004938.01.T01 AT1G51805 34.764 233 118 10 419 634 559 774 3.27e-22 102
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MsG0180004938.01.T01 AT5G58940 31.923 260 142 12 380 622 109 350 3.27e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT5G58940 31.923 260 142 12 380 622 109 350 3.27e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT5G58940 31.923 260 142 12 380 622 109 350 3.27e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT5G38990 33.333 219 116 8 412 617 524 725 3.87e-22 102
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MsG0180004938.01.T01 AT1G51830 34.764 233 118 10 419 634 392 607 6.48e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT3G24540 34.419 215 117 9 415 622 185 382 7.01e-22 99.8
MsG0180004938.01.T01 AT1G70640 51.765 85 40 1 56 139 8 92 7.29e-22 93.6
MsG0180004938.01.T01 AT1G61480 34.599 237 122 11 401 621 477 696 7.68e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT1G66150 35.211 213 113 10 419 621 594 791 8.35e-22 101
MsG0180004938.01.T01 AT1G51910 35.714 210 108 8 419 620 579 769 9.32e-22 100
MsG0180004938.01.T01 AT3G50730 31.278 227 139 9 407 626 30 246 9.51e-22 98.2
MsG0180004938.01.T01 AT5G15730 29.317 249 150 7 388 626 84 316 9.92e-22 99.0
MsG0180004938.01.T01 AT5G15730 29.317 249 150 7 388 626 84 316 9.92e-22 99.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G52290 35.071 211 113 9 419 622 149 342 1.00e-21 98.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G52290 35.071 211 113 9 419 622 149 342 1.01e-21 99.8
MsG0180004938.01.T01 AT3G24550 34.884 215 116 9 415 622 282 479 1.12e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT5G59670 34.545 220 117 10 419 629 570 771 1.17e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT5G59670 34.545 220 117 10 419 629 570 771 1.17e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT1G61390 34.914 232 120 12 401 621 341 552 1.20e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT1G06840 33.945 218 114 9 418 622 630 830 1.25e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT4G34440 35.071 211 113 9 419 622 318 511 1.30e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT4G34440 35.071 211 113 9 419 622 318 511 1.30e-21 100
MsG0180004938.01.T01 AT3G18750 31.818 220 133 6 419 634 34 240 1.48e-21 99.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G18750 31.818 220 133 6 419 634 34 240 1.48e-21 99.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G18750 31.818 220 133 6 419 634 34 240 1.48e-21 99.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G18750 31.818 220 133 6 419 634 16 222 1.58e-21 99.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G22420 33.036 224 128 8 419 635 30 238 1.72e-21 99.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G49160 31.364 220 134 6 419 634 34 240 1.80e-21 99.0
MsG0180004938.01.T01 AT3G04910 34.071 226 125 9 419 636 30 239 1.80e-21 99.8
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MsG0180004938.01.T01 AT2G18470 33.333 231 112 11 411 625 282 486 1.67e-20 96.3
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MsG0180004938.01.T01 AT1G48210 34.545 220 109 9 419 622 74 274 1.75e-20 94.0
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MsG0180004938.01.T01 AT1G48210 34.545 220 109 9 419 622 74 274 4.41e-20 92.0
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MsG0180004938.01.T01 AT3G20200 28.829 333 187 14 310 622 352 654 5.31e-20 95.1
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MsG0180004938.01.T01 AT1G61490 32.530 249 134 12 390 621 459 690 6.09e-20 95.1
MsG0180004938.01.T01 AT1G61490 32.530 249 134 12 390 621 459 690 6.09e-20 95.1
MsG0180004938.01.T01 AT1G61490 32.530 249 134 12 390 621 459 690 6.09e-20 95.1
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MsG0180004938.01.T01 AT5G54590 32.057 209 120 8 419 622 119 310 1.07e-18 89.7
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MsG0180004938.01.T01 AT5G44700 32.018 228 127 8 413 626 948 1161 1.41e-18 90.9
MsG0180004938.01.T01 AT4G21400 34.884 215 112 10 417 620 365 562 1.45e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT2G41970 31.193 218 120 8 419 622 79 280 1.45e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT4G21400 34.419 215 113 10 417 620 353 550 1.52e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G61370 34.222 225 120 11 405 620 495 700 1.54e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT3G22420 28.854 253 132 7 419 635 30 270 1.56e-18 90.1
MsG0180004938.01.T01 AT5G16500 32.394 213 115 8 419 619 80 275 1.65e-18 90.1
MsG0180004938.01.T01 AT1G17230 33.636 220 123 9 419 630 805 1009 1.67e-18 90.9
MsG0180004938.01.T01 AT1G07650 30.000 250 133 11 394 620 648 878 1.68e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G17230 33.636 220 123 9 419 630 805 1009 1.73e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G07650 30.000 250 133 11 394 620 654 884 1.76e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G29730 30.088 226 133 10 402 620 663 870 1.83e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G29730 30.088 226 133 10 402 620 663 870 1.93e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT3G53590 33.028 218 116 8 419 623 627 827 1.93e-18 90.5
MsG0180004938.01.T01 AT1G78530 32.579 221 120 9 408 622 75 272 2.02e-18 86.7
MsG0180004938.01.T01 AT4G28350 30.579 242 145 9 391 622 323 551 2.12e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT5G39420 29.614 233 127 9 402 620 94 303 2.15e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT1G78530 32.857 210 117 8 419 622 81 272 2.17e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT5G16000 35.111 225 122 11 405 623 305 511 2.27e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT4G04570 30.894 246 137 12 390 620 320 547 2.33e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT4G04570 32.159 227 126 11 404 620 175 383 2.44e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT4G08500 32.093 215 123 9 419 627 339 536 2.49e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G22420 28.854 253 132 7 419 635 30 270 2.53e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT4G20450 32.895 228 123 10 419 633 597 807 2.55e-18 90.1
MsG0180004938.01.T01 AT5G38280 32.870 216 108 10 417 617 335 528 2.56e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT4G33430 33.645 214 117 9 419 623 295 492 2.92e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT5G40540 33.735 166 102 4 463 626 1 160 2.97e-18 85.9
MsG0180004938.01.T01 AT5G47070 32.093 215 117 8 419 619 92 291 2.97e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT3G06230 30.472 233 136 9 411 634 51 266 2.97e-18 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT1G34300 33.953 215 115 9 418 623 489 685 3.13e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT1G56120 32.258 217 123 9 412 621 543 742 3.38e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT5G38280 32.870 216 108 10 417 617 335 528 3.40e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT5G65600 34.272 213 113 10 418 621 355 549 3.42e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT5G38560 33.803 213 115 9 419 622 345 540 3.45e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G56120 32.258 217 123 9 412 621 709 908 3.59e-18 89.7
MsG0180004938.01.T01 AT5G55830 31.628 215 119 9 419 622 371 568 3.70e-18 89.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G56120 32.258 217 123 9 412 621 691 890 3.95e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT4G33430 33.645 214 117 9 419 623 342 539 3.98e-18 89.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G09000 31.111 225 118 10 419 627 75 278 4.12e-18 89.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G29730 29.956 227 133 10 402 620 630 838 4.12e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G29730 29.956 227 133 10 402 620 630 838 4.20e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G09970 33.190 232 118 11 413 622 666 882 4.44e-18 89.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G09000 31.111 225 118 10 419 627 75 278 4.73e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT2G39360 32.727 220 116 10 412 619 486 685 4.93e-18 89.0
MsG0180004938.01.T01 AT3G61960 28.846 208 131 7 419 623 16 209 5.00e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT5G10530 33.491 212 115 8 418 621 340 533 5.30e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT3G15220 32.174 230 137 8 401 627 3 216 5.42e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT1G69790 31.336 217 115 9 419 619 90 288 5.66e-18 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT5G13160 33.953 215 112 9 419 621 92 288 5.67e-18 87.4
MsG0180004938.01.T01 AT3G61960 28.704 216 137 7 411 623 8 209 5.85e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G53165 32.609 230 136 8 401 627 3 216 5.85e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT1G69790 31.336 217 115 9 419 619 79 277 6.07e-18 86.7
MsG0180004938.01.T01 AT5G39020 32.273 220 125 11 417 628 500 703 6.22e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT1G53165 32.609 230 136 8 401 627 3 216 6.46e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G53165 32.609 230 136 8 401 627 3 216 6.83e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT5G41990 32.273 220 132 6 419 634 35 241 7.19e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT4G04570 30.894 246 137 12 390 620 320 547 7.23e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G07550 33.810 210 115 8 419 621 566 758 7.41e-18 88.6
MsG0180004938.01.T01 AT1G54960 31.390 223 120 11 419 627 74 277 8.13e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT1G54960 31.390 223 120 11 419 627 74 277 8.13e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT5G66850 30.000 230 134 8 419 636 352 566 8.43e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT5G66850 30.000 230 134 8 419 636 352 566 8.84e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT5G60320 32.075 212 117 11 419 622 354 546 9.49e-18 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT1G56145 32.093 215 122 10 412 619 583 780 9.60e-18 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G56130 32.558 215 121 9 412 619 494 691 1.05e-17 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT3G56370 31.390 223 129 9 418 632 683 889 1.07e-17 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G56130 32.558 215 121 9 412 619 545 742 1.09e-17 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT2G13790 32.710 214 119 9 419 623 300 497 1.10e-17 87.4
MsG0180004938.01.T01 AT1G56130 32.558 215 121 9 412 619 693 890 1.10e-17 88.2
MsG0180004938.01.T01 AT1G71830 32.900 231 129 10 402 623 292 505 1.15e-17 87.4
MsG0180004938.01.T01 AT5G54380 33.333 213 117 9 413 617 510 705 1.25e-17 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT2G28590 33.913 230 122 10 408 625 93 304 1.28e-17 85.1
MsG0180004938.01.T01 AT4G00960 31.556 225 126 11 408 621 51 258 1.32e-17 85.5
MsG0180004938.01.T01 AT3G02810 33.178 214 113 9 419 619 70 266 1.32e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT4G23190 31.855 248 137 12 387 621 322 550 1.34e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G56145 32.093 215 122 10 412 619 686 883 1.46e-17 87.8
MsG0180004938.01.T01 AT2G28590 35.160 219 112 10 419 625 104 304 1.51e-17 85.9
MsG0180004938.01.T01 AT4G23240 32.579 221 119 11 412 621 27 228 1.51e-17 85.1
MsG0180004938.01.T01 AT3G25560 36.232 207 109 10 419 619 318 507 1.70e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G34210 33.645 214 117 9 419 623 311 508 1.71e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT1G34210 33.645 214 117 9 419 623 311 508 1.71e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT3G25560 36.232 207 109 10 419 619 319 508 1.75e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT3G25560 36.232 207 109 10 419 619 318 507 1.77e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT4G23190 31.855 248 137 12 387 621 322 550 2.09e-17 86.7
MsG0180004938.01.T01 AT4G28670 31.364 220 122 11 412 619 330 532 2.11e-17 86.7
MsG0180004938.01.T01 AT1G61460 33.990 203 108 9 417 610 458 643 2.30e-17 86.7
MsG0180004938.01.T01 AT4G08850 30.357 224 135 8 407 622 769 979 2.32e-17 87.0
MsG0180004938.01.T01 AT5G65530 33.493 209 115 10 419 619 150 342 2.39e-17 85.5
MsG0180004938.01.T01 AT4G23190 31.765 255 142 12 380 621 237 472 2.50e-17 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT4G23190 31.765 255 142 12 380 621 237 472 2.50e-17 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT2G28250 32.420 219 118 10 419 622 216 419 2.59e-17 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT2G28250 32.420 219 118 10 419 622 216 419 2.59e-17 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT2G28250 32.420 219 118 10 419 622 216 419 2.59e-17 86.3
MsG0180004938.01.T01 AT2G28250 32.420 219 118 10 419 622 216 419 2.59e-17 86.3

Find 152 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 296 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TATCTAATGTTCAGTTATTT+AGG 0.082708 1:-84699921 MsG0180004938.01.T01:CDS
CACTATGTTGTTGCTGTTAA+TGG 0.116783 1:-84700225 MsG0180004938.01.T01:CDS
CAACCCAACCTCTTCAAATT+TGG 0.137237 1:-84700055 MsG0180004938.01.T01:CDS
GATCAATAGGTTGGAGATTT+TGG 0.155419 1:-84696916 MsG0180004938.01.T01:intron
CTCGAATTCTTTCGCGGACT+TGG 0.213055 1:+84700192 None:intergenic
CCGTAAAATGCCACCACATT+TGG 0.250584 1:+84697512 None:intergenic
TTTGACAACTGCTGCTGATT+TGG 0.253343 1:+84698667 None:intergenic
GTCTGAACTTCATGGTTTAC+AGG 0.258662 1:-84698439 MsG0180004938.01.T01:intron
AAACGCAACACACTTGTTTC+GGG 0.258976 1:-84696880 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAGTACTTGACCGTCGTAAA+AGG 0.280044 1:-84697321 MsG0180004938.01.T01:CDS
AATCAGAGGTATTTGCAAAT+TGG 0.280891 1:+84700142 None:intergenic
ACATTCAATGCTGTTAAATA+TGG 0.284228 1:+84700009 None:intergenic
TAAACGCAACACACTTGTTT+CGG 0.287401 1:-84696881 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATAAAGTTTCTATGTAGTTT+TGG 0.288476 1:-84700594 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAATTCGAGTGGGATGAATT+TGG 0.290662 1:-84700178 MsG0180004938.01.T01:CDS
AATGGGTTCTGATAGCAATT+TGG 0.296303 1:-84700883 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTATTACCATCCAGTAATTC+TGG 0.299938 1:+84696826 None:intergenic
ATGGATGGCACCAGAATTAC+TGG 0.305741 1:-84696836 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATCTAATGTTCAGTTATTTA+GGG 0.338103 1:-84699920 MsG0180004938.01.T01:CDS
AGCTTCCCGTCATTTGGCCT+TGG 0.345866 1:+84700558 None:intergenic
GAAATAGAGTCTGAACTTCA+TGG 0.346108 1:-84698447 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGCAAATTGGCTTGTGTGAC+TGG 0.354394 1:+84700155 None:intergenic
TATCTCAGCTTCCCGTCATT+TGG 0.358593 1:+84700552 None:intergenic
CCTTACTTTCAGAGCATGAT+TGG 0.359661 1:+84698615 None:intergenic
ATGTTGCTGAAGTTGATAAC+AGG 0.371849 1:-84700830 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGCAACTGTAGCAGAATATA+TGG 0.372016 1:-84697459 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACCTTACATACAGGCCGTTC+AGG 0.375706 1:+84697193 None:intergenic
ATGCATTGTGGTGCCATCAT+AGG 0.383380 1:-84696558 MsG0180004938.01.T01:CDS
AATGTTCCACCTGGGCCATC+TGG 0.384225 1:+84697482 None:intergenic
TTTAATTTAGTATCCAGATA+TGG 0.385866 1:-84698818 MsG0180004938.01.T01:intron
TTTCCACTATCAGTTCTTGC+AGG 0.391237 1:+84698504 None:intergenic
CCTCCATTTGCCATGATAAA+CGG 0.396469 1:+84697892 None:intergenic
ATGAAGTTCAGACTCTATTT+CGG 0.396907 1:+84698449 None:intergenic
AGTGAAGAAGAAACCATATC+TGG 0.409873 1:+84698805 None:intergenic
CATGACACACGAGGAACTTA+CGG 0.418307 1:-84700490 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGTTGCGTTTAATTCTTGAT+AGG 0.420868 1:+84696893 None:intergenic
GAGTTAGGATCTGGAACCTT+TGG 0.423100 1:-84697917 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACGGTTGATTACATATCTTC+AGG 0.427473 1:-84698641 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAACCGTTTATCATGGCAAA+TGG 0.430156 1:-84697895 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACCTTTGGAACCGTTTATCA+TGG 0.433267 1:-84697902 MsG0180004938.01.T01:CDS
CCACAATGCATGTTTGCATA+AGG 0.438625 1:+84696570 None:intergenic
TGATAATTTACTTGTCAACT+TGG 0.441548 1:-84697221 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGGAAACTTCACTAAGCCTA+TGG 0.442016 1:-84698487 MsG0180004938.01.T01:CDS
TCCTGAACGGCCTGTATGTA+AGG 0.445203 1:-84697194 MsG0180004938.01.T01:intron
ATGACACACGAGGAACTTAC+GGG 0.452609 1:-84700489 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTTGCCAAATTTGAAGAGGT+TGG 0.453073 1:+84700051 None:intergenic
ATTGCAATGGATGCAGCCTT+TGG 0.458822 1:-84697292 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAACTTACGGGGAAGACTTA+CGG 0.471313 1:-84700477 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTCTTTAGGCAGTACACGGA+TGG 0.475870 1:+84699951 None:intergenic
GAACTACATGAGTTAGGATC+TGG 0.478701 1:-84697926 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATCGAAGAACTACATGAGTT+AGG 0.479980 1:-84697932 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGCATTTGATTCAGAGGCAA+AGG 0.480448 1:-84700082 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACTCTTGATTCATTAGAACT+TGG 0.483678 1:+84700273 None:intergenic
ACAGTTGCCAATGTTCCACC+TGG 0.483732 1:+84697473 None:intergenic
TATTTCTGTTTGTTCTGATG+AGG 0.484936 1:-84700394 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTCATTTGGCATCACAATGT+GGG 0.488755 1:-84696613 MsG0180004938.01.T01:CDS
AGTAATTCTGGTGCCATCCA+TGG 0.494213 1:+84696838 None:intergenic
GTGTCAGAGGGACCCTTCCA+TGG 0.494703 1:-84696855 MsG0180004938.01.T01:CDS
TTGCCAAATTTGAAGAGGTT+GGG 0.495942 1:+84700052 None:intergenic
ATCCCACTCGAATTCTTTCG+CGG 0.496526 1:+84700186 None:intergenic
TATGAAGAGCTTGAAAGAGC+TGG 0.504504 1:-84700348 MsG0180004938.01.T01:CDS
TACTGCCAAGGCCAAATGAC+GGG 0.505746 1:-84700563 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGTTGCTGTTAATGGTATGT+TGG 0.505965 1:-84700217 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAGACACGTATTATATCGAT+TGG 0.507712 1:-84700519 MsG0180004938.01.T01:CDS
TAGCCTGCAAGAACTGATAG+TGG 0.512021 1:-84698507 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGCAGTACACGGATGGGAGA+TGG 0.512698 1:+84699958 None:intergenic
CACATCTGCATTTGATTCAG+AGG 0.519558 1:-84700088 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAGGAATGTTCTCTTGAAGA+AGG 0.520329 1:-84697423 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTTGTTTCGGGTGGTGTCAG+AGG 0.520333 1:-84696868 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACAATGTGGGAAATCTTGAC+CGG 0.523642 1:-84696600 MsG0180004938.01.T01:CDS
ACAACAGTCCACATTTCCAT+AGG 0.524565 1:-84700119 MsG0180004938.01.T01:CDS
AAAATATAGATTATTGAGAA+TGG 0.527356 1:-84697959 MsG0180004938.01.T01:intron
CAGCAAAGTACCTTACATAC+AGG 0.528687 1:+84697184 None:intergenic
TCAGAGATTGCTTTAGCTAG+AGG 0.533287 1:-84700855 MsG0180004938.01.T01:CDS
AGAGCGTCAAGATCCTCTCC+AGG 0.533806 1:+84700417 None:intergenic
CAATGTGGGAAATCTTGACC+GGG 0.538394 1:-84696599 MsG0180004938.01.T01:CDS
CAGAGGGACCCTTCCATGGA+TGG 0.540276 1:-84696851 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTGGAGGATCTCAACGACTT+CGG 0.548418 1:-84700329 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGTTTCTTCTTCACTAAGAG+AGG 0.549877 1:-84698797 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGCTATAATTGGAATTAACA+TGG 0.557445 1:+84696525 None:intergenic
AGATGGCCCAGGTGGAACAT+TGG 0.562163 1:-84697480 MsG0180004938.01.T01:CDS
CAAGATCCTCTCCAGGGAGT+TGG 0.564911 1:+84700424 None:intergenic
AGTATACAGGATTGTCGTCA+TGG 0.566499 1:+84698767 None:intergenic
CAACAGTCCACATTTCCATA+GGG 0.567077 1:-84700118 MsG0180004938.01.T01:CDS
CGCAACACACTTGTTTCGGG+TGG 0.567379 1:-84696877 MsG0180004938.01.T01:CDS
CCGTTTATCATGGCAAATGG+AGG 0.567507 1:-84697892 MsG0180004938.01.T01:CDS
TATGCTTGCCAAATTTGAAG+AGG 0.569459 1:+84700047 None:intergenic
TAAAAGGATCATGATTGCAA+TGG 0.569979 1:-84697305 MsG0180004938.01.T01:CDS
TTGTTTCGGGTGGTGTCAGA+GGG 0.573425 1:-84696867 MsG0180004938.01.T01:CDS
GATGTTTCTGAATCACCCAT+AGG 0.574247 1:+84698471 None:intergenic
AAGGACGAAAACATAGTCAC+TGG 0.576327 1:-84698733 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGTATACTACCAGAACCAAA+AGG 0.576714 1:-84698752 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATTCTGGTGCCATCCATGGA+AGG 0.580537 1:+84696842 None:intergenic
GCCATGATAAACGGTTCCAA+AGG 0.581052 1:+84697901 None:intergenic
AAAACATTATTCCCTTGTCA+CGG 0.583546 1:-84699873 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATGGAAACAGTATTCTCAGA+AGG 0.583634 1:-84700632 MsG0180004938.01.T01:intron
ATTATCAAATACCAACTCCC+TGG 0.583809 1:-84700435 MsG0180004938.01.T01:CDS
CGTTTATCATGGCAAATGGA+GGG 0.584108 1:-84697891 MsG0180004938.01.T01:CDS
AGACACGTATTATATCGATT+GGG 0.584475 1:-84700518 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGACGGGAAGCTGAGATATG+TGG 0.587779 1:-84700547 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGAAGCTGAGATATGTGGGT+GGG 0.587896 1:-84700542 MsG0180004938.01.T01:CDS
GATAATTTACTTGTCAACTT+GGG 0.588217 1:-84697220 MsG0180004938.01.T01:CDS
CAGATGTGGATGATTCCCTA+TGG 0.589760 1:+84700103 None:intergenic
TCTCATTTGGCATCACAATG+TGG 0.590849 1:-84696614 MsG0180004938.01.T01:CDS
GTTTGCATAAGGTTCTTCCC+CGG 0.592101 1:+84696581 None:intergenic
ATGTTCTCTTGAAGAAGGAA+AGG 0.592932 1:-84697418 MsG0180004938.01.T01:intron
GAAGCTGAGATATGTGGGTG+GGG 0.594441 1:-84700541 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGAGTAGTTCCAGATGGCCC+AGG 0.596402 1:-84697491 MsG0180004938.01.T01:CDS
TTAGCTCTTTAGGCAGTACA+CGG 0.599367 1:+84699947 None:intergenic
GGAAACTTCACTAAGCCTAT+GGG 0.599918 1:-84698486 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGTCTTATAAGACAAGCATC+AGG 0.600235 1:-84700767 MsG0180004938.01.T01:intron
TATAAGACCGTGTTTCACAC+TGG 0.604394 1:+84700781 None:intergenic
ATGTGGACTGTTGTAATCAG+AGG 0.604907 1:+84700128 None:intergenic
CAGCATTGAATGTACCAAGA+AGG 0.605979 1:-84699999 MsG0180004938.01.T01:CDS
GTAGCAGAATATATGGTACA+TGG 0.608705 1:-84697452 MsG0180004938.01.T01:CDS
CTCTGAATCAAATGCAGATG+TGG 0.615252 1:+84700089 None:intergenic
AGCAGCAGTTGTCAAAGAGA+CGG 0.615272 1:-84698660 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGATCTTCAACATATGATTG+AGG 0.615496 1:-84700373 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATACTGCCAAGGCCAAATGA+CGG 0.618019 1:-84700564 MsG0180004938.01.T01:CDS
TCAACTTGGGCGATCCTGAA+CGG 0.618144 1:-84697207 MsG0180004938.01.T01:CDS
GTTTATCATGGCAAATGGAG+GGG 0.619569 1:-84697890 MsG0180004938.01.T01:CDS
AACTCTTCACCATCCAAATG+TGG 0.619573 1:-84697525 MsG0180004938.01.T01:CDS
TTGGAGGTCGAATACTGCCA+AGG 0.620421 1:-84700575 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATGCAAATATTCCATGCCAA+AGG 0.621118 1:+84697276 None:intergenic
TTCTGGTGCCATCCATGGAA+GGG 0.626409 1:+84696843 None:intergenic
AATGGATGCAGCCTTTGGCA+TGG 0.631626 1:-84697287 MsG0180004938.01.T01:CDS
CAAATACCAACTCCCTGGAG+AGG 0.635278 1:-84700430 MsG0180004938.01.T01:CDS
AAAATGCCACCACATTTGGA+TGG 0.637736 1:+84697516 None:intergenic
GACGGGAAGCTGAGATATGT+GGG 0.638887 1:-84700546 MsG0180004938.01.T01:CDS
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TCTTTAGGCAGTACACGGAT+GGG 0.644700 1:+84699952 None:intergenic
AGTACACGGATGGGAGATGG+AGG 0.645122 1:+84699961 None:intergenic
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TCTTCACCATCCAAATGTGG+TGG 0.663538 1:-84697522 MsG0180004938.01.T01:CDS
GAGCGTCAAGATCCTCTCCA+GGG 0.667258 1:+84700418 None:intergenic
CAGTTGCCAATGTTCCACCT+GGG 0.674933 1:+84697474 None:intergenic
GGTAGATTTCAGAGCAAGAG+CGG 0.676765 1:-84697824 MsG0180004938.01.T01:intron
GTTGCTGAAGTTGATAACAG+GGG 0.677698 1:-84700828 MsG0180004938.01.T01:CDS
GTAGTTCCAGATGGCCCAGG+TGG 0.678964 1:-84697488 MsG0180004938.01.T01:CDS
ATGGCACCAGAATTACTGGA+TGG 0.681050 1:-84696832 MsG0180004938.01.T01:CDS
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GCAAGCATAATGTCAAAACA+AGG 0.699137 1:-84700033 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGGGAAGAACATGACACACG+AGG 0.699408 1:-84700499 MsG0180004938.01.T01:CDS
GGGAAGCTGAGATATGTGGG+TGG 0.721717 1:-84700543 MsG0180004938.01.T01:CDS
GTAGATACCAGTGTGAAACA+CGG 0.727058 1:-84700788 MsG0180004938.01.T01:CDS
AATGTGGGAAATCTTGACCG+GGG 0.741561 1:-84696598 MsG0180004938.01.T01:CDS
CCTTATGCAAACATGCATTG+TGG 0.750277 1:-84696570 MsG0180004938.01.T01:CDS
TGACACACGAGGAACTTACG+GGG 0.752310 1:-84700488 MsG0180004938.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ACAATAATAATTTTGTTAAT+CGG - Chr1:84697604-84697623 MsG0180004938.01.T01:intron 10.0%
!! AAAATATAGATTATTGAGAA+TGG - Chr1:84699462-84699481 MsG0180004938.01.T01:intron 15.0%
!! AAAATTAAAAAGCCAAAAAT+TGG + Chr1:84699369-84699388 None:intergenic 15.0%
!! AAATTTCATTAGGTATTATT+TGG - Chr1:84699076-84699095 MsG0180004938.01.T01:intron 15.0%
!! ACAACTTTCTTAAATAAAAT+TGG + Chr1:84700459-84700478 None:intergenic 15.0%
!! TAGTTTATTTGAAAAAACAA+AGG + Chr1:84698546-84698565 None:intergenic 15.0%
!! TATATGTGAATTAATGTTAA+TGG + Chr1:84699783-84699802 None:intergenic 15.0%
!! TTCTTATAAAAAGTTATTCA+TGG - Chr1:84699704-84699723 MsG0180004938.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTATTTAAGAAAGTTGT+TGG - Chr1:84700459-84700478 MsG0180004938.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTATTTTTGTATCAATAGTT+GGG + Chr1:84700381-84700400 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATAATATGAGTTTGAA+AGG + Chr1:84699683-84699702 None:intergenic 15.0%
!! ACAAAACCAATTAGTAAAAA+AGG + Chr1:84699131-84699150 None:intergenic 20.0%
!! ATAAACTCTCAAATTTCATT+AGG - Chr1:84699066-84699085 MsG0180004938.01.T01:intron 20.0%
!! ATCTAATGTTCAGTTATTTA+GGG - Chr1:84697501-84697520 MsG0180004938.01.T01:CDS 20.0%
!! CAAAACCAATTAGTAAAAAA+GGG + Chr1:84699130-84699149 None:intergenic 20.0%
!! GTTTATTCTTATATCAAAGA+TGG + Chr1:84699052-84699071 None:intergenic 20.0%
!! TATCTAATGTTCAGTTATTT+AGG - Chr1:84697500-84697519 MsG0180004938.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAAAGTTTCTATGTAGTTT+TGG - Chr1:84696827-84696846 MsG0180004938.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTATTTTTGTATCAATAGT+TGG + Chr1:84700382-84700401 None:intergenic 20.0%
!!! TATGTTATATAATTGACTTG+TGG - Chr1:84698875-84698894 MsG0180004938.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTTACACATGAAGTATT+CGG + Chr1:84699448-84699467 None:intergenic 20.0%
!!! TTAGATATTTTTAGCTCTTT+AGG + Chr1:84697487-84697506 None:intergenic 20.0%
!!! TTCAATTTGTTTATACTCAA+TGG + Chr1:84699634-84699653 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAATTTAGTATCCAGATA+TGG - Chr1:84698603-84698622 MsG0180004938.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTCATTAGCAACATTATA+TGG + Chr1:84697532-84697551 None:intergenic 20.0%
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! ATTAAAAAGCCAAAAATTGG+AGG + Chr1:84699366-84699385 None:intergenic 25.0%
! ATTATAACAATCTTCCTCAA+GGG - Chr1:84697634-84697653 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
! GATAATTTACTTGTCAACTT+GGG - Chr1:84700201-84700220 MsG0180004938.01.T01:CDS 25.0%
! TATTATAACAATCTTCCTCA+AGG - Chr1:84697633-84697652 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
! TATTTAATTCCAGTAATACG+AGG - Chr1:84699187-84699206 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
! TCCTAGTAATCAATATATGT+TGG - Chr1:84697677-84697696 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
! TGATAATTTACTTGTCAACT+TGG - Chr1:84700200-84700219 MsG0180004938.01.T01:CDS 25.0%
!! ATAATTTGAAATTGTCGTGT+TGG - Chr1:84698834-84698853 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
!! ATTGGTTGTTTGATGAATTT+TGG + Chr1:84698403-84698422 None:intergenic 25.0%
!! TCCAACATATATTGATTACT+AGG + Chr1:84697681-84697700 None:intergenic 25.0%
!! TTCTCTAGACTAAAGATTTT+TGG - Chr1:84699853-84699872 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
!!! ATAAAAAGTAGTTGTTTTGC+TGG - Chr1:84699576-84699595 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTTACACATGAAGTATTC+GGG + Chr1:84699447-84699466 None:intergenic 25.0%
!!! TAGGTTGATATTTTCTCATT+TGG - Chr1:84700794-84700813 MsG0180004938.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGTTATTTTTGTCTGTATG+AGG - Chr1:84699801-84699820 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
!!! TATCTCCCTTTTTTACTAAT+TGG - Chr1:84699122-84699141 MsG0180004938.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTGATTAAATGACCTTCT+TGG + Chr1:84697439-84697458 None:intergenic 25.0%
AAAAAATATCCCGACAATAC+GGG + Chr1:84700422-84700441 None:intergenic 30.0%
AAAACATTATTCCCTTGTCA+CGG - Chr1:84697548-84697567 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
AAACAACCAATATGATGTGT+CGG - Chr1:84698412-84698431 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
AACTACTTTCTGTCATCTTT+AGG - Chr1:84700775-84700794 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
AAGGGAGATAAGTAAATAAG+TGG + Chr1:84699112-84699131 None:intergenic 30.0%
AATCATGCAAAGACTAATAG+TGG - Chr1:84699284-84699303 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
ACTCTTGATTCATTAGAACT+TGG + Chr1:84697151-84697170 None:intergenic 30.0%
ATGAAGTTCAGACTCTATTT+CGG + Chr1:84698975-84698994 None:intergenic 30.0%
CTAAAATTCGATCAATAGGT+TGG - Chr1:84700496-84700515 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAAATATCCCGACAATA+CGG + Chr1:84700423-84700442 None:intergenic 30.0%
TAAAAGGATCATGATTGCAA+TGG - Chr1:84700116-84700135 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
TACACTGCAAAAATAAACAC+TGG - Chr1:84698172-84698191 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
TCATAAGCAATTGTGTCTAA+TGG + Chr1:84698365-84698384 None:intergenic 30.0%
TGAGAGACAATCTTGTTAAA+TGG + Chr1:84697841-84697860 None:intergenic 30.0%
TGGAAAAATCTTACCTATGA+TGG + Chr1:84700879-84700898 None:intergenic 30.0%
TTCAAGAGATTGTCAGAAAT+TGG - Chr1:84698138-84698157 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
TTGGCTAAAATTCGATCAAT+AGG - Chr1:84700492-84700511 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
TTTCAAGACAATTATCTGGT+AGG - Chr1:84696682-84696701 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
! AGACACGTATTATATCGATT+GGG - Chr1:84696903-84696922 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
! ATAGAAACTTCGAGTTCTTT+GGG - Chr1:84698025-84698044 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
! TAGATGTGTTGTAAGTGTTT+TGG + Chr1:84698226-84698245 None:intergenic 30.0%
! TATTTCTGTTTGTTCTGATG+AGG - Chr1:84697027-84697046 MsG0180004938.01.T01:intron 30.0%
!! AATCAGAGGTATTTGCAAAT+TGG + Chr1:84697282-84697301 None:intergenic 30.0%
!! AGTTGTTGGTTTAATCTCTT+TGG - Chr1:84700473-84700492 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAGTTTCTATGTAGTTTTGG+AGG - Chr1:84696830-84696849 MsG0180004938.01.T01:CDS 30.0%
ACAACACATCTACTACAACA+TGG - Chr1:84698234-84698253 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
ACATGTAAACCTCGTATTAC+TGG + Chr1:84699199-84699218 None:intergenic 35.0%
ACCAATACACCAAAATCTAG+TGG + Chr1:84699015-84699034 None:intergenic 35.0%
ACGGTTGATTACATATCTTC+AGG - Chr1:84698780-84698799 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
ACTGCAAAAATAAACACTGG+TGG - Chr1:84698175-84698194 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
AGAGTATACACTAGCTATCT+CGG - Chr1:84698505-84698524 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAGAAGAAACCATATC+TGG + Chr1:84698619-84698638 None:intergenic 35.0%
ATCGAAGAACTACATGAGTT+AGG - Chr1:84699489-84699508 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
ATGCAAATATTCCATGCCAA+AGG + Chr1:84700148-84700167 None:intergenic 35.0%
ATGGAAACAGTATTCTCAGA+AGG - Chr1:84696789-84696808 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
ATGTTCTCTTGAAGAAGGAA+AGG - Chr1:84700003-84700022 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
ATTATCAAATACCAACTCCC+TGG - Chr1:84696986-84697005 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
ATTGTGTCTAATGGTAACCA+TGG + Chr1:84698356-84698375 None:intergenic 35.0%
CATCTAGGAGAGATAAATGA+TGG - Chr1:84698061-84698080 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
CATTAAGTGGAAATTGCAAG+TGG + Chr1:84697983-84698002 None:intergenic 35.0%
CCAAAAATTGGAGGAAAGAT+TGG + Chr1:84699357-84699376 None:intergenic 35.0%
CTATTACCATCCAGTAATTC+TGG + Chr1:84700598-84700617 None:intergenic 35.0%
CTGAGAATACTGTTTCCATA+AGG + Chr1:84696788-84696807 None:intergenic 35.0%
CTGCAAAAATAAACACTGGT+GGG - Chr1:84698176-84698195 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
CTTAAATGCTCATAGTCAGA+AGG + Chr1:84700281-84700300 None:intergenic 35.0%
GAAATAGAGTCTGAACTTCA+TGG - Chr1:84698974-84698993 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
GAATACTGTTTCCATAAGGA+TGG + Chr1:84696784-84696803 None:intergenic 35.0%
GAGACACGTATTATATCGAT+TGG - Chr1:84696902-84696921 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
GCAAGCATAATGTCAAAACA+AGG - Chr1:84697388-84697407 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
GGAGATTATTCACGATATAG+TGG - Chr1:84700713-84700732 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
GGATCTTCAACATATGATTG+AGG - Chr1:84697048-84697067 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
GTAGCAGAATATATGGTACA+TGG - Chr1:84699969-84699988 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
TAAACGCAACACACTTGTTT+CGG - Chr1:84700540-84700559 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
TACACCAAAATCTAGTGGTT+TGG + Chr1:84699010-84699029 None:intergenic 35.0%
TATGCTTGCCAAATTTGAAG+AGG + Chr1:84697377-84697396 None:intergenic 35.0%
TCTTTCCCATTCATTCATCA+TGG + Chr1:84699740-84699759 None:intergenic 35.0%
TGAACCTTCGTTGTTACTAA+AGG + Chr1:84697816-84697835 None:intergenic 35.0%
TGCTTCCATGATGAATGAAT+GGG - Chr1:84699732-84699751 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
TGTATACTACCAGAACCAAA+AGG - Chr1:84698669-84698688 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
TTAATTGAGCAAATCGTGCT+AGG - Chr1:84699313-84699332 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
TTGACCATGCACTTATATAG+TGG - Chr1:84700671-84700690 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
TTGCCAAATTTGAAGAGGTT+GGG + Chr1:84697372-84697391 None:intergenic 35.0%
TTGTCTCTCTCAACATTAAG+TGG + Chr1:84697996-84698015 None:intergenic 35.0%
TTGTGTCTAATGGTAACCAT+GGG + Chr1:84698355-84698374 None:intergenic 35.0%
! ACTGTAATTCTAAAGAGCCA+GGG + Chr1:84698462-84698481 None:intergenic 35.0%
! CAATCATGATCCTTTTACGA+CGG + Chr1:84700113-84700132 None:intergenic 35.0%
! CACTATGTTGTTGCTGTTAA+TGG - Chr1:84697196-84697215 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
! CATAGAAACTTCGAGTTCTT+TGG - Chr1:84698024-84698043 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
! CCAATCTTTCCTCCAATTTT+TGG - Chr1:84699354-84699373 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
! GCATAAATGGTTGGAGTATT+TGG + Chr1:84696741-84696760 None:intergenic 35.0%
! TGAAGTATTCGGGTTAAACA+TGG + Chr1:84699437-84699456 None:intergenic 35.0%
! TGACTATGTTTTCGTCCTTT+TGG + Chr1:84698687-84698706 None:intergenic 35.0%
! TGAGTCATCGAGTGTATTTT+CGG - Chr1:84697869-84697888 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTGCTGTTAATGGTATGT+TGG - Chr1:84697204-84697223 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
! TTATCTGGTAGGTTTTCTGA+CGG - Chr1:84696693-84696712 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
!! ACCACTAGATTTTGGTGTAT+TGG - Chr1:84699011-84699030 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
!! ATGTTGCTGAAGTTGATAAC+AGG - Chr1:84696591-84696610 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTCTCTAGAAGTGTTGAGT+CGG + Chr1:84697943-84697962 None:intergenic 35.0%
!! GACTAAAGATTTTTGGAGAG+AGG - Chr1:84699860-84699879 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
!! GATCAATAGGTTGGAGATTT+TGG - Chr1:84700505-84700524 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
!! GCGTTTTCAAGACAATTATC+TGG - Chr1:84696678-84696697 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
!! TGTTGCTGAAGTTGATAACA+GGG - Chr1:84696592-84696611 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTTTCGGTGTCTGATGATA+GGG - Chr1:84697884-84697903 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
!!! CATCAAAATTTGCCGACTTT+TGG - Chr1:84698102-84698121 MsG0180004938.01.T01:intron 35.0%
!!! TATTTTCGGTGTCTGATGAT+AGG - Chr1:84697883-84697902 MsG0180004938.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGGTTCTGGTAGTATAC+AGG + Chr1:84698670-84698689 None:intergenic 35.0%
AAAATGCCACCACATTTGGA+TGG + Chr1:84699908-84699927 None:intergenic 40.0%
AAACGCAACACACTTGTTTC+GGG - Chr1:84700541-84700560 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
AAATACACTCGATGACTCAG+AGG + Chr1:84697868-84697887 None:intergenic 40.0%
AACTCTTCACCATCCAAATG+TGG - Chr1:84699896-84699915 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
AAGGACGAAAACATAGTCAC+TGG - Chr1:84698688-84698707 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
ACAACAGTCCACATTTCCAT+AGG - Chr1:84697302-84697321 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
ACAATGTGGGAAATCTTGAC+CGG - Chr1:84700821-84700840 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
ACATACAAAGAGTTGTCACC+TGG + Chr1:84697582-84697601 None:intergenic 40.0%
AGATCAGCAGCATAAATGGT+TGG + Chr1:84696750-84696769 None:intergenic 40.0%
AGTATACAGGATTGTCGTCA+TGG + Chr1:84698657-84698676 None:intergenic 40.0%
ATATGGTACATGGATCACTG+AGG - Chr1:84699979-84699998 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
CAACAGTCCACATTTCCATA+GGG - Chr1:84697303-84697322 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
CAACCCAACCTCTTCAAATT+TGG - Chr1:84697366-84697385 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
CACATCTGCATTTGATTCAG+AGG - Chr1:84697333-84697352 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
CAGCATTAGACTTCTTGACA+TGG + Chr1:84697710-84697729 None:intergenic 40.0%
CCACAATGCATGTTTGCATA+AGG + Chr1:84700854-84700873 None:intergenic 40.0%
CCATCCACTATATAAGTGCA+TGG + Chr1:84700678-84700697 None:intergenic 40.0%
CCTCCATTTGCCATGATAAA+CGG + Chr1:84699532-84699551 None:intergenic 40.0%
CCTTACTTTCAGAGCATGAT+TGG + Chr1:84698809-84698828 None:intergenic 40.0%
CCTTATGCAAACATGCATTG+TGG - Chr1:84700851-84700870 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
CGTTTATCATGGCAAATGGA+GGG - Chr1:84699530-84699549 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
CTCATTTGGCATCACAATGT+GGG - Chr1:84700808-84700827 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
CTCTGAATCAAATGCAGATG+TGG + Chr1:84697335-84697354 None:intergenic 40.0%
CTTATCTCTTCACAGTCCAT+TGG - Chr1:84698313-84698332 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
CTTGCCAAATTTGAAGAGGT+TGG + Chr1:84697373-84697392 None:intergenic 40.0%
GAACCGTTTATCATGGCAAA+TGG - Chr1:84699526-84699545 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GAACTACATGAGTTAGGATC+TGG - Chr1:84699495-84699514 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GAATTCGAGTGGGATGAATT+TGG - Chr1:84697243-84697262 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
GAGACCTTTAGTAACAACGA+AGG - Chr1:84697809-84697828 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GAGGAATGTTCTCTTGAAGA+AGG - Chr1:84699998-84700017 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
GATGATTCCCTATGGAAATG+TGG + Chr1:84697313-84697332 None:intergenic 40.0%
GGAAACTTCACTAAGCCTAT+GGG - Chr1:84698935-84698954 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GGAGAATGTTCAGTACATCT+AGG - Chr1:84698046-84698065 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GGCAACTGTAGCAGAATATA+TGG - Chr1:84699962-84699981 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
GGGTTAAACATGGATACTTG+TGG + Chr1:84699427-84699446 None:intergenic 40.0%
GGTTTCTTCTTCACTAAGAG+AGG - Chr1:84698624-84698643 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
GTAGATACCAGTGTGAAACA+CGG - Chr1:84696633-84696652 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GTCTGAACTTCATGGTTTAC+AGG - Chr1:84698982-84699001 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GTGCTTCCATGATGAATGAA+TGG - Chr1:84699731-84699750 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
GTGTATACTCTGTGTCAGTT+TGG + Chr1:84698496-84698515 None:intergenic 40.0%
GTTTATCATGGCAAATGGAG+GGG - Chr1:84699531-84699550 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
TATAAGACCGTGTTTCACAC+TGG + Chr1:84696643-84696662 None:intergenic 40.0%
TATGAAGAGCTTGAAAGAGC+TGG - Chr1:84697073-84697092 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
TCAGAGATTGCTTTAGCTAG+AGG - Chr1:84696566-84696585 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
TCTCATTTGGCATCACAATG+TGG - Chr1:84700807-84700826 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
TGCATTTGATTCAGAGGCAA+AGG - Chr1:84697339-84697358 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
TGGAAACTTCACTAAGCCTA+TGG - Chr1:84698934-84698953 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
TTGCTCGATCATACTTCCAA+TGG + Chr1:84698332-84698351 None:intergenic 40.0%
TTGTCTCCGACACATCATAT+TGG + Chr1:84698421-84698440 None:intergenic 40.0%
TTTCCACTATCAGTTCTTGC+AGG + Chr1:84698920-84698939 None:intergenic 40.0%
! ATGGACTGTGAAGAGATAAG+AGG + Chr1:84698313-84698332 None:intergenic 40.0%
! ATGTGGACTGTTGTAATCAG+AGG + Chr1:84697296-84697315 None:intergenic 40.0%
! CAGCAAAGTACCTTACATAC+AGG + Chr1:84700240-84700259 None:intergenic 40.0%
! CAGCATTGAATGTACCAAGA+AGG - Chr1:84697422-84697441 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
! CCAAATGTGGTGGCATTTTA+CGG - Chr1:84699909-84699928 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
! CCATGCACTTATATAGTGGA+TGG - Chr1:84700675-84700694 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
! CTGTAATTCTAAAGAGCCAG+GGG + Chr1:84698461-84698480 None:intergenic 40.0%
! GACTGTAATTCTAAAGAGCC+AGG + Chr1:84698463-84698482 None:intergenic 40.0%
! GATGTTTCTGAATCACCCAT+AGG + Chr1:84698953-84698972 None:intergenic 40.0%
! GGTACCAAACCACTAGATTT+TGG - Chr1:84699003-84699022 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
! GGTCTTATAAGACAAGCATC+AGG - Chr1:84696654-84696673 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
! TGTAATTCTAAAGAGCCAGG+GGG + Chr1:84698460-84698479 None:intergenic 40.0%
! TTAGCTCTTTAGGCAGTACA+CGG + Chr1:84697477-84697496 None:intergenic 40.0%
! TTTGACAACTGCTGCTGATT+TGG + Chr1:84698757-84698776 None:intergenic 40.0%
! TTTTACGGAGTAGTTCCAGA+TGG - Chr1:84699924-84699943 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
!! ACCTTTGGAACCGTTTATCA+TGG - Chr1:84699519-84699538 MsG0180004938.01.T01:intron 40.0%
!! CCAATCATGCTCTGAAAGTA+AGG - Chr1:84698806-84698825 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGCTGAAGTTGATAACAG+GGG - Chr1:84696593-84696612 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGTTCGAGAGTATCTGAGA+AGG - Chr1:84700615-84700634 MsG0180004938.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGAACTTTTTCCGTGACAA+GGG + Chr1:84697562-84697581 None:intergenic 40.0%
!!! TGTTTTCGTCCTTTTGGTTC+TGG + Chr1:84698681-84698700 None:intergenic 40.0%
AAGTATGATCGAGCAACCCA+TGG - Chr1:84698336-84698355 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
AATGTGGGAAATCTTGACCG+GGG - Chr1:84700823-84700842 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
AGCAGCAGTTGTCAAAGAGA+CGG - Chr1:84698761-84698780 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
AGGAAAGATTGGATCTCAGG+TGG + Chr1:84699346-84699365 None:intergenic 45.0%
ATACGGGAGCAGGATAACAA+CGG + Chr1:84700406-84700425 None:intergenic 45.0%
ATACTGCCAAGGCCAAATGA+CGG - Chr1:84696857-84696876 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
ATAGAGCAAGTGCTTTCGTG+GGG - Chr1:84700736-84700755 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
ATCCCACTCGAATTCTTTCG+CGG + Chr1:84697238-84697257 None:intergenic 45.0%
ATGACACACGAGGAACTTAC+GGG - Chr1:84696932-84696951 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
ATGGATGGCACCAGAATTAC+TGG - Chr1:84700585-84700604 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
ATGGCACCAGAATTACTGGA+TGG - Chr1:84700589-84700608 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCAATGGATGCAGCCTT+TGG - Chr1:84700129-84700148 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
CAATGTGGGAAATCTTGACC+GGG - Chr1:84700822-84700841 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
CAGATGTGGATGATTCCCTA+TGG + Chr1:84697321-84697340 None:intergenic 45.0%
CATGACACACGAGGAACTTA+CGG - Chr1:84696931-84696950 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
CATGGTGCTTCTCATCTTCA+CGG - Chr1:84698252-84698271 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
CCGTAAAATGCCACCACATT+TGG + Chr1:84699912-84699931 None:intergenic 45.0%
CCGTTTATCATGGCAAATGG+AGG - Chr1:84699529-84699548 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
CTAGCGCTTGTTCCAAAAGT+CGG + Chr1:84698117-84698136 None:intergenic 45.0%
CTAGGATGACAGTTCACACA+TGG + Chr1:84697663-84697682 None:intergenic 45.0%
CTTGTCACGGAAAAAGTTCC+AGG - Chr1:84697561-84697580 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
GAACTTACGGGGAAGACTTA+CGG - Chr1:84696944-84696963 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
GAGGAGATCAGCAGCATAAA+TGG + Chr1:84696754-84696773 None:intergenic 45.0%
GAGTACTTGACCGTCGTAAA+AGG - Chr1:84700100-84700119 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
GATAGAGCAAGTGCTTTCGT+GGG - Chr1:84700735-84700754 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
GCCATGATAAACGGTTCCAA+AGG + Chr1:84699523-84699542 None:intergenic 45.0%
GGTAGATTTCAGAGCAAGAG+CGG - Chr1:84699597-84699616 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
GTTTGCATAAGGTTCTTCCC+CGG + Chr1:84700843-84700862 None:intergenic 45.0%
TAGCCTGCAAGAACTGATAG+TGG - Chr1:84698914-84698933 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
TATCTCAGCTTCCCGTCATT+TGG + Chr1:84696872-84696891 None:intergenic 45.0%
TCTTCACCATCCAAATGTGG+TGG - Chr1:84699899-84699918 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
TCTTTAGGCAGTACACGGAT+GGG + Chr1:84697472-84697491 None:intergenic 45.0%
TGGAGGAAAGATTGGATCTC+AGG + Chr1:84699349-84699368 None:intergenic 45.0%
TTATCCTGCTCCCGTATTGT+CGG - Chr1:84700409-84700428 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTTAGGATCTGGAACCTT+TGG - Chr1:84699504-84699523 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
! GGTGGGTTCGATGAAAAAGT+TGG - Chr1:84698193-84698212 MsG0180004938.01.T01:intron 45.0%
! GGTTGGAGTATTTGGTATCG+AGG + Chr1:84696733-84696752 None:intergenic 45.0%
!! AGTAATTCTGGTGCCATCCA+TGG + Chr1:84700586-84700605 None:intergenic 45.0%
!! ATGCATTGTGGTGCCATCAT+AGG - Chr1:84700863-84700882 MsG0180004938.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGGAACTTTTTCCGTGACA+AGG + Chr1:84697563-84697582 None:intergenic 45.0%
!! TGCAAATTGGCTTGTGTGAC+TGG + Chr1:84697269-84697288 None:intergenic 45.0%
AATGGATGCAGCCTTTGGCA+TGG - Chr1:84700134-84700153 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
ACAGTTGCCAATGTTCCACC+TGG + Chr1:84699951-84699970 None:intergenic 50.0%
ACCTTACATACAGGCCGTTC+AGG + Chr1:84700231-84700250 None:intergenic 50.0%
AGTCCGCGAAAGAATTCGAG+TGG - Chr1:84697232-84697251 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
CAAATACCAACTCCCTGGAG+AGG - Chr1:84696991-84697010 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
CAGTTGCCAATGTTCCACCT+GGG + Chr1:84699950-84699969 None:intergenic 50.0%
CTCGAATTCTTTCGCGGACT+TGG + Chr1:84697232-84697251 None:intergenic 50.0%
CTCTTTAGGCAGTACACGGA+TGG + Chr1:84697473-84697492 None:intergenic 50.0%
CTGGAGGATCTCAACGACTT+CGG - Chr1:84697092-84697111 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
GAAGAGCTTGAAAGAGCTGG+AGG - Chr1:84697076-84697095 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
GAAGCTGAGATATGTGGGTG+GGG - Chr1:84696880-84696899 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
GACGGGAAGCTGAGATATGT+GGG - Chr1:84696875-84696894 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
GATTTCAGAGCAAGAGCGGT+TGG - Chr1:84699601-84699620 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
GGAAGCTGAGATATGTGGGT+GGG - Chr1:84696879-84696898 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
GGATAGAGCAAGTGCTTTCG+TGG - Chr1:84700734-84700753 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
GTCCGCGAAAGAATTCGAGT+GGG - Chr1:84697233-84697252 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TACGGGAGCAGGATAACAAC+GGG + Chr1:84700405-84700424 None:intergenic 50.0%
TACTGCCAAGGCCAAATGAC+GGG - Chr1:84696858-84696877 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TATCCTGCTCCCGTATTGTC+GGG - Chr1:84700410-84700429 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TCAACTTGGGCGATCCTGAA+CGG - Chr1:84700214-84700233 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TCCTGAACGGCCTGTATGTA+AGG - Chr1:84700227-84700246 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TGACACACGAGGAACTTACG+GGG - Chr1:84696933-84696952 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
TGACGGGAAGCTGAGATATG+TGG - Chr1:84696874-84696893 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
TGGGAAGAACATGACACACG+AGG - Chr1:84696922-84696941 MsG0180004938.01.T01:intron 50.0%
TTCACACATGGAGACCCTTG+AGG + Chr1:84697651-84697670 None:intergenic 50.0%
TTGGAGGTCGAATACTGCCA+AGG - Chr1:84696846-84696865 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
! ATTCTAAAGAGCCAGGGGGA+TGG + Chr1:84698456-84698475 None:intergenic 50.0%
! TTCTAAAGAGCCAGGGGGAT+GGG + Chr1:84698455-84698474 None:intergenic 50.0%
! TTGTTTCGGGTGGTGTCAGA+GGG - Chr1:84700554-84700573 MsG0180004938.01.T01:CDS 50.0%
!! ATTCTGGTGCCATCCATGGA+AGG + Chr1:84700582-84700601 None:intergenic 50.0%
!! TTCTGGTGCCATCCATGGAA+GGG + Chr1:84700581-84700600 None:intergenic 50.0%
AATGTTCCACCTGGGCCATC+TGG + Chr1:84699942-84699961 None:intergenic 55.0%
ACGGGAGCAGGATAACAACG+GGG + Chr1:84700404-84700423 None:intergenic 55.0%
AGATGGCCCAGGTGGAACAT+TGG - Chr1:84699941-84699960 MsG0180004938.01.T01:CDS 55.0%
AGCTTCCCGTCATTTGGCCT+TGG + Chr1:84696866-84696885 None:intergenic 55.0%
AGTACACGGATGGGAGATGG+AGG + Chr1:84697463-84697482 None:intergenic 55.0%
CAAGATCCTCTCCAGGGAGT+TGG + Chr1:84697000-84697019 None:intergenic 55.0%
CCATAAGGATGGCACGAACG+AGG + Chr1:84696773-84696792 None:intergenic 55.0%
CCTCGTTCGTGCCATCCTTA+TGG - Chr1:84696770-84696789 MsG0180004938.01.T01:intron 55.0%
CGCAACACACTTGTTTCGGG+TGG - Chr1:84700544-84700563 MsG0180004938.01.T01:CDS 55.0%
GAGCGTCAAGATCCTCTCCA+GGG + Chr1:84697006-84697025 None:intergenic 55.0%
GGATGGAGCAAGTGCTTTCG+TGG - Chr1:84700692-84700711 MsG0180004938.01.T01:intron 55.0%
GGGAAGCTGAGATATGTGGG+TGG - Chr1:84696878-84696897 MsG0180004938.01.T01:CDS 55.0%
TATCCCGACAATACGGGAGC+AGG + Chr1:84700416-84700435 None:intergenic 55.0%
! AGAGCGTCAAGATCCTCTCC+AGG + Chr1:84697007-84697026 None:intergenic 55.0%
! CTTGTTTCGGGTGGTGTCAG+AGG - Chr1:84700553-84700572 MsG0180004938.01.T01:CDS 55.0%
AAAGAGCCAGGGGGATGGGT+CGG + Chr1:84698451-84698470 None:intergenic 60.0%
CAGAGGGACCCTTCCATGGA+TGG - Chr1:84700570-84700589 MsG0180004938.01.T01:CDS 60.0%
GGAGTAGTTCCAGATGGCCC+AGG - Chr1:84699930-84699949 MsG0180004938.01.T01:CDS 60.0%
GGCAGTACACGGATGGGAGA+TGG + Chr1:84697466-84697485 None:intergenic 60.0%
GTAGTTCCAGATGGCCCAGG+TGG - Chr1:84699933-84699952 MsG0180004938.01.T01:CDS 60.0%
GTGTCAGAGGGACCCTTCCA+TGG - Chr1:84700566-84700585 MsG0180004938.01.T01:CDS 60.0%
AAGAGCCAGGGGGATGGGTC+GGG + Chr1:84698450-84698469 None:intergenic 65.0%
AGATGCCCGACCCATCCCCC+TGG - Chr1:84698442-84698461 MsG0180004938.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 84696539 84700904 84696539 ID=MsG0180004938.01;Name=MsG0180004938.01
Chr1 mRNA 84696539 84700904 84696539 ID=MsG0180004938.01.T01;Parent=MsG0180004938.01;Name=MsG0180004938.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.51;_QI=0|0|0|1|0.5|0.66|9|0|638
Chr1 exon 84700768 84700904 84700768 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9426;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84699861 84700644 84699861 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9425;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84698621 84698830 84698621 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9424;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84698440 84698526 84698440 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9423;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84697825 84697972 84697825 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9422;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84697419 84697575 84697419 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9421;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84697195 84697342 84697195 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9420;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84696792 84696929 84696792 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9419;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 exon 84696539 84696646 84696539 ID=MsG0180004938.01.T01:exon:9418;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 CDS 84700768 84700904 84700768 ID=MsG0180004938.01.T01:cds;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 CDS 84699861 84700644 84699861 ID=MsG0180004938.01.T01:cds;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 CDS 84698621 84698830 84698621 ID=MsG0180004938.01.T01:cds;Parent=MsG0180004938.01.T01
Chr1 CDS 84698440 84698526 84698440 ID=MsG0180004938.01.T01:cds;Parent=MsG0180004938.01.T01
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