AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005420.01

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MsG0180005420.01.T01 AT5G61550 37.967 482 261 11 103 550 364 841 7.99e-97 313
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MsG0180005420.01.T01 AT2G19410 42.611 406 209 8 155 550 421 812 2.05e-94 306
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MsG0180005420.01.T01 AT5G61560 42.408 382 203 7 183 550 413 791 6.85e-93 301
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MsG0180005420.01.T01 AT5G61560 42.408 382 203 7 183 550 432 810 8.57e-93 301
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MsG0180005420.01.T01 AT1G17540 38.950 362 190 8 131 470 329 681 1.16e-71 243
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MsG0180005420.01.T01 AT3G20200 37.340 391 235 7 82 466 334 720 2.70e-70 240
MsG0180005420.01.T01 AT3G20200 37.340 391 235 7 82 466 334 720 2.79e-70 241
MsG0180005420.01.T01 AT1G72760 40.741 324 184 5 181 498 373 694 3.06e-70 239
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MsG0180005420.01.T01 AT2G24370 43.448 290 159 4 182 468 463 750 6.39e-68 234
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MsG0180005420.01.T01 AT1G16760 40.694 317 182 5 155 467 404 718 1.48e-67 233
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MsG0180005420.01.T01 AT5G12000 41.667 300 154 5 182 470 405 694 2.27e-66 228
MsG0180005420.01.T01 AT5G35380 40.952 315 164 7 198 501 413 716 3.89e-61 215
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MsG0180005420.01.T01 AT5G01950 36.458 288 172 5 186 462 613 900 1.46e-47 178
MsG0180005420.01.T01 AT5G01950 36.458 288 172 5 186 462 613 900 1.46e-47 178
MsG0180005420.01.T01 AT1G24030 35.986 289 159 9 187 454 64 347 2.29e-47 169
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MsG0180005420.01.T01 AT5G10530 34.602 289 164 7 187 457 323 604 1.49e-44 167
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MsG0180005420.01.T01 AT5G37450 36.691 278 159 7 186 451 642 914 4.63e-44 168
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MsG0180005420.01.T01 AT3G15890 35.862 290 166 9 187 461 27 311 9.58e-44 159
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MsG0180005420.01.T01 AT5G54590 33.910 289 168 9 187 462 103 381 2.32e-42 157
MsG0180005420.01.T01 AT5G56460 33.634 333 174 11 163 466 47 361 2.83e-42 157
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MsG0180005420.01.T01 AT3G04690 35.294 289 166 9 187 460 505 787 5.73e-41 159
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MsG0180005420.01.T01 AT5G28680 35.640 289 165 9 187 460 509 791 6.37e-41 158
MsG0180005420.01.T01 AT1G72760 44.578 166 90 2 181 344 373 538 6.37e-41 155
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MsG0180005420.01.T01 AT5G39000 33.562 292 172 7 187 460 506 793 1.39e-40 157
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MsG0180005420.01.T01 AT4G00330 33.951 324 178 11 167 465 92 404 1.40e-40 152
MsG0180005420.01.T01 AT1G09440 34.629 283 163 8 187 453 145 421 1.53e-40 153
MsG0180005420.01.T01 AT1G09440 34.629 283 163 8 187 453 145 421 1.53e-40 153
MsG0180005420.01.T01 AT3G18810 39.738 229 128 4 187 411 325 547 1.95e-40 156
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MsG0180005420.01.T01 AT1G24030 35.918 245 134 7 228 454 3 242 2.05e-40 147
MsG0180005420.01.T01 AT3G20530 33.887 301 162 10 187 462 70 358 2.09e-40 151
MsG0180005420.01.T01 AT5G15730 33.115 305 184 10 184 480 101 393 2.13e-40 152
MsG0180005420.01.T01 AT5G15730 33.007 306 185 10 184 480 101 395 2.15e-40 152
MsG0180005420.01.T01 AT5G15730 33.007 306 185 10 184 480 101 395 2.15e-40 152
MsG0180005420.01.T01 AT5G56890 37.662 308 169 13 187 477 711 1012 2.44e-40 157
MsG0180005420.01.T01 AT3G02810 39.269 219 123 5 187 398 52 267 2.53e-40 154
MsG0180005420.01.T01 AT1G10620 33.788 293 156 9 187 454 358 637 3.29e-40 155
MsG0180005420.01.T01 AT3G19300 39.726 219 123 5 184 398 313 526 3.55e-40 155
MsG0180005420.01.T01 AT1G79620 36.552 290 158 10 187 457 626 908 3.76e-40 156
MsG0180005420.01.T01 AT1G30570 32.716 324 193 10 187 490 508 826 4.31e-40 156
MsG0180005420.01.T01 AT2G28590 40.000 220 120 5 186 398 85 299 4.47e-40 148
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MsG0180005420.01.T01 AT1G79620 36.396 283 157 9 187 453 652 927 4.81e-40 156
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MsG0180005420.01.T01 AT2G05940 38.288 222 122 4 187 398 75 291 1.11e-39 150
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MsG0180005420.01.T01 AT5G02290 34.130 293 162 9 187 453 56 343 1.22e-39 149
MsG0180005420.01.T01 AT2G19210 29.003 331 198 9 137 453 532 839 1.26e-39 154
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MsG0180005420.01.T01 AT3G01300 34.084 311 157 11 187 464 124 419 2.10e-39 150
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MsG0180005420.01.T01 AT3G09830 33.562 292 164 8 187 453 72 358 2.84e-39 149
MsG0180005420.01.T01 AT3G09830 33.562 292 164 8 187 453 72 358 2.84e-39 149
MsG0180005420.01.T01 AT3G46330 33.214 280 168 8 187 453 556 829 2.99e-39 153
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MsG0180005420.01.T01 AT5G38560 37.500 216 127 4 187 398 327 538 7.93e-39 151
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MsG0180005420.01.T01 AT1G51790 31.683 303 182 10 187 475 567 858 1.13e-38 152
MsG0180005420.01.T01 AT2G23200 34.028 288 167 9 189 460 478 758 1.29e-38 151
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MsG0180005420.01.T01 AT1G61860 32.530 332 176 12 165 467 57 369 1.43e-38 146
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MsG0180005420.01.T01 AT5G18610 35.154 293 166 10 187 461 71 357 1.82e-38 148
MsG0180005420.01.T01 AT1G21240 33.333 336 191 12 156 465 361 689 2.02e-38 150
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MsG0180005420.01.T01 AT2G07180 33.117 308 163 8 187 465 78 371 2.53e-38 146
MsG0180005420.01.T01 AT2G25220 32.628 331 192 12 167 476 111 431 2.59e-38 146
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MsG0180005420.01.T01 AT2G23450 35.145 276 150 8 187 442 336 602 3.22e-38 150
MsG0180005420.01.T01 AT1G20650 39.726 219 121 5 186 398 65 278 3.26e-38 145
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MsG0180005420.01.T01 AT4G34440 38.428 229 131 4 187 411 300 522 3.95e-38 149
MsG0180005420.01.T01 AT1G49730 38.197 233 131 6 170 398 334 557 4.04e-38 149
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MsG0180005420.01.T01 AT2G42960 33.226 310 176 10 169 453 144 447 5.53e-38 146
MsG0180005420.01.T01 AT2G42960 33.226 310 176 10 169 453 144 447 5.53e-38 146
MsG0180005420.01.T01 AT2G39660 35.965 228 126 5 186 398 54 276 6.32e-38 144
MsG0180005420.01.T01 AT2G28960 35.060 251 136 8 187 421 431 670 7.04e-38 149
MsG0180005420.01.T01 AT4G05200 34.397 282 165 7 187 453 335 611 7.76e-38 148
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MsG0180005420.01.T01 AT3G26700 33.220 295 168 10 187 461 67 352 7.84e-38 144
MsG0180005420.01.T01 AT3G26700 33.220 295 168 10 187 461 67 352 7.84e-38 144
MsG0180005420.01.T01 AT1G70110 34.375 288 164 8 187 457 332 611 7.89e-38 148
MsG0180005420.01.T01 AT4G05200 34.397 282 165 7 187 453 353 629 1.05e-37 148
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MsG0180005420.01.T01 AT2G28990 32.215 298 164 10 178 453 558 839 1.35e-37 149
MsG0180005420.01.T01 AT4G23240 30.100 299 188 8 187 469 16 309 1.48e-37 142
MsG0180005420.01.T01 AT5G18500 32.087 321 192 10 149 453 120 430 1.58e-37 145
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MsG0180005420.01.T01 AT5G18500 32.087 321 192 10 149 453 120 430 1.58e-37 145
MsG0180005420.01.T01 AT5G18500 32.087 321 192 10 149 453 120 430 1.58e-37 145
MsG0180005420.01.T01 AT5G18500 32.087 321 192 10 149 453 120 430 1.58e-37 145
MsG0180005420.01.T01 AT5G18500 32.087 321 192 10 149 453 120 430 1.58e-37 145
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MsG0180005420.01.T01 AT1G56720 33.216 283 167 8 187 453 167 443 2.60e-37 144
MsG0180005420.01.T01 AT1G56720 33.216 283 167 8 187 453 167 443 2.60e-37 144
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MsG0180005420.01.T01 AT2G47060 36.039 308 161 12 182 464 56 352 2.69e-37 142
MsG0180005420.01.T01 AT4G34500 33.887 301 170 11 187 465 133 426 3.06e-37 143
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MsG0180005420.01.T01 AT2G29000 32.416 327 187 10 149 462 530 835 3.49e-37 147
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MsG0180005420.01.T01 AT1G07570 32.468 308 176 9 186 467 55 356 3.75e-37 142
MsG0180005420.01.T01 AT1G05700 38.140 215 123 5 187 398 560 767 5.35e-37 147
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MsG0180005420.01.T01 AT1G68690 37.963 216 123 5 187 398 365 573 6.09e-37 146
MsG0180005420.01.T01 AT2G47060 40.086 232 114 8 182 398 56 277 6.21e-37 141
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MsG0180005420.01.T01 AT1G11410 31.378 341 204 9 143 458 463 798 1.27e-36 145
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MsG0180005420.01.T01 AT1G70130 31.469 286 175 6 187 457 322 601 1.84e-36 144
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MsG0180005420.01.T01 AT3G26700 37.900 219 120 7 187 398 67 276 2.50e-36 138
MsG0180005420.01.T01 AT1G56140 37.327 217 126 4 187 399 681 891 2.56e-36 145
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MsG0180005420.01.T01 AT1G56145 36.866 217 127 4 187 399 572 782 2.87e-36 144
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MsG0180005420.01.T01 AT1G11330 31.677 322 178 9 163 458 488 793 3.02e-36 144
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MsG0180005420.01.T01 AT4G23260 32.155 283 171 8 187 453 316 593 5.56e-36 142
MsG0180005420.01.T01 AT5G06740 35.217 230 131 6 187 406 318 539 6.16e-36 142
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MsG0180005420.01.T01 AT1G51805 31.786 280 171 9 187 453 543 815 6.54e-36 143
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MsG0180005420.01.T01 AT1G11300 37.557 221 128 5 183 398 478 693 7.48e-36 143
MsG0180005420.01.T01 AT2G26290 34.685 222 130 3 187 398 76 292 7.67e-36 139
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MsG0180005420.01.T01 AT5G49760 35.030 334 185 11 151 462 583 906 1.30e-35 142
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MsG0180005420.01.T01 AT5G11020 31.609 348 207 13 137 464 43 379 1.42e-35 138
MsG0180005420.01.T01 AT1G67520 33.445 299 170 10 183 459 480 771 1.49e-35 142
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MsG0180005420.01.T01 AT4G21390 38.009 221 127 5 183 398 513 728 1.70e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT1G67520 33.445 299 170 10 183 459 437 728 1.73e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT1G56120 33.214 280 168 6 187 453 532 805 1.92e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT1G56130 36.866 217 127 4 187 399 682 892 2.09e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT1G26150 38.426 216 123 5 187 398 418 627 2.18e-35 141
MsG0180005420.01.T01 AT1G11303 37.557 221 128 5 183 398 493 708 2.24e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT5G11020 31.609 348 207 13 137 464 77 413 2.42e-35 138
MsG0180005420.01.T01 AT1G26970 34.363 259 142 8 221 462 1 248 2.58e-35 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G29740 32.646 291 174 8 186 461 664 947 2.66e-35 142
MsG0180005420.01.T01 AT3G59750 36.239 218 127 6 187 398 291 502 2.74e-35 140
MsG0180005420.01.T01 AT3G46340 32.384 281 169 9 187 453 575 848 2.79e-35 141
MsG0180005420.01.T01 AT3G59740 36.283 226 123 6 187 400 321 537 2.97e-35 140
MsG0180005420.01.T01 AT5G03140 32.075 318 180 12 163 457 340 644 3.02e-35 141
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MsG0180005420.01.T01 AT3G08870 35.443 237 139 6 169 397 358 588 4.44e-35 140
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MsG0180005420.01.T01 AT1G07650 31.988 322 192 10 186 487 671 985 9.36e-35 140
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MsG0180005420.01.T01 AT1G61360 30.363 303 175 8 175 453 393 683 9.68e-35 139
MsG0180005420.01.T01 AT1G54820 37.991 229 117 8 187 398 135 355 1.09e-34 135
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MsG0180005420.01.T01 AT5G58940 32.343 303 181 8 187 469 135 433 1.15e-34 137
MsG0180005420.01.T01 AT5G58940 32.343 303 181 8 187 469 135 433 1.15e-34 137
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MsG0180005420.01.T01 AT5G38210 32.441 299 164 12 187 462 360 643 1.42e-33 136
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MsG0180005420.01.T01 AT4G23190 31.250 304 179 9 173 457 251 543 1.54e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT4G27290 30.903 288 178 7 182 453 448 730 1.73e-33 136
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MsG0180005420.01.T01 AT4G27290 30.903 288 178 7 182 453 494 776 2.10e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G21240 34.799 273 156 10 208 465 163 428 2.25e-33 133
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MsG0180005420.01.T01 AT4G23190 31.250 304 179 9 173 457 329 621 2.39e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT4G20450 31.488 289 163 9 178 453 572 838 2.40e-33 135
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MsG0180005420.01.T01 AT1G16260 33.803 284 165 9 186 453 377 653 2.55e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G16260 33.803 284 165 9 186 453 377 653 2.55e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT5G63710 31.902 326 193 10 158 462 211 528 2.64e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT5G63710 31.902 326 193 10 158 462 211 528 2.64e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G55200 35.484 217 129 4 187 398 367 577 2.66e-33 135
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MsG0180005420.01.T01 AT1G55200 35.484 217 129 4 187 398 367 577 2.66e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G55200 35.484 217 129 4 187 398 367 577 2.66e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G61390 35.217 230 139 5 187 411 340 564 2.67e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT4G23250 31.667 300 179 10 182 461 333 626 2.68e-33 135
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MsG0180005420.01.T01 AT2G45340 33.446 296 174 10 178 457 396 684 2.81e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT4G31100 32.000 300 177 10 173 453 418 709 2.98e-33 135
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MsG0180005420.01.T01 AT5G35370 34.274 248 144 8 160 398 475 712 3.09e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT3G16030 32.660 297 175 9 183 459 532 823 3.47e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G11280 31.164 292 174 10 183 453 484 769 3.66e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G11350 31.193 327 199 8 148 458 465 781 3.70e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G29720 35.648 216 129 5 187 398 661 870 3.74e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT4G04540 33.217 286 150 9 195 457 320 587 3.84e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT3G16030 32.660 297 175 9 183 459 511 802 4.02e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G21250 39.013 223 123 8 182 398 392 607 4.04e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G66880 33.110 299 162 12 187 462 957 1240 4.20e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT5G63710 31.902 326 193 10 158 462 246 563 4.39e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G16150 31.325 332 189 11 144 453 373 687 4.45e-33 134
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MsG0180005420.01.T01 AT4G23200 30.945 307 181 10 169 453 304 601 4.66e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G34300 30.508 295 158 11 187 453 474 749 4.68e-33 135
MsG0180005420.01.T01 AT1G79670 33.333 282 167 9 187 453 372 647 4.76e-33 134
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MsG0180005420.01.T01 AT4G04510 33.096 281 166 8 187 453 329 601 4.98e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT2G19130 35.455 220 126 7 186 398 482 692 4.98e-33 134
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MsG0180005420.01.T01 AT1G11280 31.164 292 174 10 183 453 474 759 5.37e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT4G04540 32.653 294 157 9 187 457 341 616 5.66e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G61390 35.217 230 139 5 187 411 508 732 5.79e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT1G79670 33.922 283 164 10 187 453 409 684 6.04e-33 134
MsG0180005420.01.T01 AT4G23150 34.978 223 135 5 181 398 318 535 6.21e-33 134
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MsG0180005420.01.T01 AT5G63710 31.902 326 193 10 158 462 247 564 6.42e-33 133
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MsG0180005420.01.T01 AT4G11480 31.973 294 172 9 187 461 309 593 7.41e-33 133
MsG0180005420.01.T01 AT4G11530 31.229 301 186 8 187 471 340 635 8.00e-33 133
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MsG0180005420.01.T01 AT2G23950 37.727 220 118 7 186 397 286 494 8.20e-33 133
MsG0180005420.01.T01 AT1G29730 32.404 287 166 8 186 453 627 904 8.60e-33 134
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MsG0180005420.01.T01 AT4G23320 29.254 335 201 10 187 491 171 499 8.74e-33 132
MsG0180005420.01.T01 AT3G46355 31.419 296 161 12 196 479 2 267 9.53e-33 127
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MsG0180005420.01.T01 AT1G06700 35.371 229 131 7 182 398 51 274 1.01e-32 129
MsG0180005420.01.T01 AT1G06700 35.371 229 131 7 182 398 51 274 1.01e-32 129
MsG0180005420.01.T01 AT4G23190 32.692 260 159 7 173 427 329 577 1.03e-32 132
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MsG0180005420.01.T01 AT1G61430 33.594 256 149 8 153 400 425 667 1.28e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT1G61430 33.594 256 149 8 153 400 425 667 1.28e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT1G61430 33.594 256 149 8 153 400 425 667 1.37e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT5G38210 32.441 299 164 12 187 462 348 631 1.46e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT1G61430 33.594 256 149 8 153 400 448 690 1.52e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT4G23320 29.254 335 201 10 187 491 192 520 1.53e-32 131
MsG0180005420.01.T01 AT2G39110 35.452 299 160 10 187 457 78 371 1.54e-32 130
MsG0180005420.01.T01 AT5G07280 34.219 301 157 12 191 467 909 1192 1.58e-32 133
MsG0180005420.01.T01 AT3G46420 36.667 210 121 7 194 398 528 730 1.59e-32 133

Find 163 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 332 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AAACGTATACTTTAGATATT+TGG 0.134058 1:+91636525 None:intergenic
GTTGAAGTGCTGAGAAAATT+TGG 0.160656 1:-91639049 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCTTGCAACAACACTGTTAA+AGG 0.168225 1:+91640469 None:intergenic
TTTGACCAATCTTGGAAAAT+TGG 0.176036 1:-91638947 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCCTTGTTTGGGTTGGGAAT+TGG 0.187137 1:-91636645 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
CCAAACCTGTTAACACTAAT+TGG 0.204841 1:-91638204 MsG0180005420.01.T01:CDS
AAGGAAATCTTCTCCTTGTT+TGG 0.206867 1:-91636657 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
CCTTGTTTGGGTTGGGAATT+GGG 0.212939 1:-91636644 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TCACTATGTGGCAATTATAA+TGG 0.243023 1:+91636876 None:intergenic
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ATCTTCTCCTTGTTTGGGTT+GGG 0.277510 1:-91636651 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TGCATTACATAATGCCATTC+TGG 0.281358 1:-91636924 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTCTTTAGTTCAGCACAATA+TGG 0.299059 1:-91637935 MsG0180005420.01.T01:CDS
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AGCTTCCAATTAGTGTTAAC+AGG 0.305921 1:+91638199 None:intergenic
GACATGGAAGCGACTGAAAA+TGG 0.323382 1:-91640524 MsG0180005420.01.T01:CDS
CCAATTAGTGTTAACAGGTT+TGG 0.331329 1:+91638204 None:intergenic
AATCCCCAGGTCACCAAGTT+TGG 0.333046 1:+91637960 None:intergenic
TTTCAAGGCTACCGTTGTTT+AGG 0.337391 1:+91638145 None:intergenic
GTGAAGAAAGTAGGTGATAG+AGG 0.340472 1:-91636696 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
ATGGATAATACAAGGCTTGC+TGG 0.347774 1:+91638029 None:intergenic
ACCTTTGATAATTTCACTAT+AGG 0.357579 1:-91636745 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TGCAGGCAAGATGGCTTTCA+AGG 0.371952 1:+91638130 None:intergenic
CACTATGTGGCAATTATAAT+GGG 0.373830 1:+91636877 None:intergenic
AAGTGGAGTCCTGTCTTTGC+AGG 0.382322 1:+91638113 None:intergenic
CAAACTTGAACACACAGATT+TGG 0.383463 1:-91636957 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCTAACTGGAAGACCACTTC+CGG 0.384696 1:-91637776 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATACTGTTACAACTTCTAAC+TGG 0.395933 1:-91637790 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATGATCTTCACCTGGACAAT+GGG 0.401040 1:+91637490 None:intergenic
TACACTTGGACTCAAACATT+TGG 0.402148 1:+91639179 None:intergenic
ATATGAAGAAGAGGCAATAA+GGG 0.405022 1:-91637023 MsG0180005420.01.T01:CDS
AATCTGTGTGTTCAAGTTTG+AGG 0.405950 1:+91636960 None:intergenic
CACTCTTGAATATAAGAGTT+AGG 0.406949 1:-91636801 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
AAAAGAAGTTGAAGTACAAT+TGG 0.407303 1:-91639299 MsG0180005420.01.T01:CDS
CAGATCTTGTGTCAGAAATC+TGG 0.412134 1:-91637606 MsG0180005420.01.T01:CDS
AAATATCTAAAGTATACGTT+TGG 0.419219 1:-91636523 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
CTAACTGGAAGACCACTTCC+GGG 0.423154 1:-91637775 MsG0180005420.01.T01:CDS
AAGCCATCTGCAGCTATGTA+TGG 0.423583 1:+91637049 None:intergenic
CCAAAATATTTCAATACATC+GGG 0.423711 1:+91640681 None:intergenic
TCAAGTTTGAGGTTTGTCAT+AGG 0.424631 1:+91636971 None:intergenic
CAAGTTTGAGGTTTGTCATA+GGG 0.427372 1:+91636972 None:intergenic
TGCCTCATTGATCTCCATAA+AGG 0.430212 1:+91638979 None:intergenic
TTTCCTTGAAACTTATCAAA+AGG 0.430524 1:+91639116 None:intergenic
GCATAAACGTTTGGCGTATG+TGG 0.434133 1:-91637875 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTGGCTTTGACAACCATAAG+AGG 0.442545 1:+91638856 None:intergenic
TTGAACATGCAAACGCAGTT+AGG 0.444157 1:-91639075 MsG0180005420.01.T01:CDS
TAATAACTCGCATAAACGTT+TGG 0.447472 1:-91637884 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATGATGAAGAATTACAAAAC+TGG 0.449121 1:-91639345 MsG0180005420.01.T01:CDS
TATGAAATGCGCATTGGAAA+AGG 0.450760 1:-91637740 MsG0180005420.01.T01:CDS
AATCTTCTCCTTGTTTGGGT+TGG 0.452769 1:-91636652 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
GAGTCAGACGTGTATTCGTT+TGG 0.454055 1:-91637817 MsG0180005420.01.T01:CDS
GCCATCTTGCCTGCAAAGAC+AGG 0.454484 1:-91638122 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATTTCAAGTTGTCTAAATTG+AGG 0.457041 1:-91636551 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TGGGAATTTGAAGCCTAGTA+AGG 0.458925 1:-91638007 MsG0180005420.01.T01:CDS
GGTTTCTAAGAGCTGAACTT+TGG 0.465879 1:+91639200 None:intergenic
AATAATATGTGAATTGCAAA+TGG 0.469112 1:-91639230 MsG0180005420.01.T01:CDS
GCTAACTTTGTAGCCAAACT+TGG 0.470253 1:-91637973 MsG0180005420.01.T01:CDS
GCATCAAGGAGAACCTTACT+AGG 0.471071 1:+91637994 None:intergenic
CCAATCGGAGTTTCAGCATC+AGG 0.473565 1:-91638837 MsG0180005420.01.T01:intron
ATTCGAATTTGCCATGGAAG+TGG 0.481219 1:+91638096 None:intergenic
ATTGGGATCTTTCTAAAATG+AGG 0.481638 1:-91636627 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
CAGATTTCTGACACAAGATC+TGG 0.482469 1:+91637607 None:intergenic
ACTTCATCAAACCACACAAC+TGG 0.485890 1:-91637674 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGAAGAAAGTAGGTGATAGA+GGG 0.488288 1:-91636695 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TCCTGTCTTTGCAGGCAAGA+TGG 0.490244 1:+91638121 None:intergenic
TAAGAGCTGAACTTTGGTCT+CGG 0.495744 1:+91639206 None:intergenic
ACCAAAATATTTCAATACAT+CGG 0.498638 1:+91640680 None:intergenic
AGCAAGCCTTGTATTATCCA+TGG 0.499478 1:-91638027 MsG0180005420.01.T01:CDS
CAACTCGGTTACCGTACACT+TGG 0.502741 1:+91639165 None:intergenic
GCTGAGAAAATTTGGAGAAG+TGG 0.503417 1:-91639041 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCAGAACTATTTGCATCGAC+AGG 0.505039 1:-91637567 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATAAGAGTTAGGATAAATGA+AGG 0.505295 1:-91636790 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
GGAAAATCTTAAAACTGTGT+TGG 0.507120 1:-91637719 MsG0180005420.01.T01:CDS
GTTGATGCTCGGATCAAATA+CGG 0.507304 1:-91640742 MsG0180005420.01.T01:exon
TTCTGCATTTAAAGAACAGC+GGG 0.509279 1:+91640496 None:intergenic
AGTTGTGTGGTTTGATGAAG+TGG 0.509295 1:+91637676 None:intergenic
AAAATTGGAGAGGGAAGGTA+TGG 0.515519 1:-91638932 MsG0180005420.01.T01:CDS
AGAGGCAATAAGGGGATGGT+TGG 0.521858 1:-91637014 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTGGGATCTTTCTAAAATGA+GGG 0.523532 1:-91636626 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
AGGGAATTCTACCACATAAG+AGG 0.523800 1:+91639009 None:intergenic
GTAGCCAAACTTGGTGACCT+GGG 0.525752 1:-91637964 MsG0180005420.01.T01:CDS
GGAGATCAATGAGGCAACTC+AGG 0.528779 1:-91638972 MsG0180005420.01.T01:CDS
GTAGACAGTGAAAACACGCC+TGG 0.530170 1:-91640786 MsG0180005420.01.T01:five_prime_UTR
TGTAGCCAAACTTGGTGACC+TGG 0.531434 1:-91637965 MsG0180005420.01.T01:CDS
CAATATGGATTCAGCTGACA+CGG 0.532343 1:-91637920 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTCATATCTCTAACTAGCCC+CGG 0.533444 1:+91637757 None:intergenic
TCGATGCAAATAGTTCTGAA+TGG 0.533657 1:+91637571 None:intergenic
TCTCTAACTAGCCCCGGAAG+TGG 0.534740 1:+91637763 None:intergenic
TACAAGGCTTGCTGGAGTGA+AGG 0.536029 1:+91638037 None:intergenic
TACTAGGCTTCAAATTCCCA+TGG 0.536678 1:+91638010 None:intergenic
GATCCGAGCATCAACACTAC+GGG 0.537549 1:+91640750 None:intergenic
GTGAAAAGACTTGGCTGGAC+CGG 0.538665 1:-91637630 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATTACAAAACTGGCGTGCTA+AGG 0.540083 1:-91639335 MsG0180005420.01.T01:CDS
AATGTTGTTAAGAATGAAAG+CGG 0.540747 1:+91636580 None:intergenic
AACGAATACACGTCTGACTC+TGG 0.540992 1:+91637820 None:intergenic
AAATTCCCATGGATAATACA+AGG 0.541684 1:+91638021 None:intergenic
ATCTCCATAAAGGAAAATGC+AGG 0.543733 1:+91638989 None:intergenic
ATATTGTGCTGAACTAAAGA+AGG 0.546147 1:+91637937 None:intergenic
GCTGTTCTTTAAATGCAGAA+TGG 0.547015 1:-91640493 MsG0180005420.01.T01:CDS
TAGAGATATGAAATGCGCAT+TGG 0.550036 1:-91637746 MsG0180005420.01.T01:CDS
CCCAATTCCCAACCCAAACA+AGG 0.555166 1:+91636644 None:intergenic
TTATGGTTGTCAAAGCCAAT+CGG 0.555858 1:-91638852 MsG0180005420.01.T01:CDS
AAGACAGGACTCCACTTCCA+TGG 0.557366 1:-91638107 MsG0180005420.01.T01:CDS
TATGATCTTCACCTGGACAA+TGG 0.558714 1:+91637489 None:intergenic
TGATCCGAGCATCAACACTA+CGG 0.560461 1:+91640749 None:intergenic
AAGAAGAGGCAATAAGGGGA+TGG 0.564036 1:-91637018 MsG0180005420.01.T01:CDS
GATCCAGAGTGTCTTGTCAC+TGG 0.567019 1:-91637853 MsG0180005420.01.T01:CDS
GGATACTACATCCTCTTATG+TGG 0.567760 1:-91639020 MsG0180005420.01.T01:CDS
GAAGAAAGTAGGTGATAGAG+GGG 0.569489 1:-91636694 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
CCTGATGCTGAAACTCCGAT+TGG 0.570918 1:+91638837 None:intergenic
ATGGATATTCGAATTTGCCA+TGG 0.571381 1:+91638090 None:intergenic
AAGGTATGGAAGTGTTTACA+AGG 0.575455 1:-91638918 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGGCTACAAAGTTAGCATCA+AGG 0.575495 1:+91637980 None:intergenic
AGCCATCTGCAGCTATGTAT+GGG 0.575695 1:+91637050 None:intergenic
ACCTATAGTGAAATTATCAA+AGG 0.575736 1:+91636744 None:intergenic
GACAGACTTGCTTGTTCATG+AGG 0.576556 1:-91640438 MsG0180005420.01.T01:intron
CAGTTGCTGCCACTCCAGAA+TGG 0.583925 1:+91636910 None:intergenic
AAGTTTGAGGTTTGTCATAG+GGG 0.584721 1:+91636973 None:intergenic
CAAGTGTACGGTAACCGAGT+TGG 0.585564 1:-91639164 MsG0180005420.01.T01:CDS
AGAGCATATGTCAGTAGCAA+TGG 0.587474 1:+91638071 None:intergenic
TTCCTTTATGGAGATCAATG+AGG 0.588471 1:-91638981 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGGCTTTACATATGAAGAAG+AGG 0.592436 1:-91637032 MsG0180005420.01.T01:CDS
GCAAGCCTTGTATTATCCAT+GGG 0.592441 1:-91638026 MsG0180005420.01.T01:CDS
CTTGGAAAATTGGAGAGGGA+AGG 0.593416 1:-91638937 MsG0180005420.01.T01:CDS
AAGTTGAAGTACAATTGGCA+AGG 0.594392 1:-91639294 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGAGGTGTTGTGAAAAGACT+TGG 0.595000 1:-91637639 MsG0180005420.01.T01:CDS
TAGCCAAACTTGGTGACCTG+GGG 0.598990 1:-91637963 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGGACATTTCAGCTGGTGAG+TGG 0.599146 1:-91637699 MsG0180005420.01.T01:CDS
TATAATCTTCTCTTCCAACT+CGG 0.600105 1:+91639150 None:intergenic
AATGTTTGAGTCCAAGTGTA+CGG 0.601163 1:-91639176 MsG0180005420.01.T01:CDS
CAATCTTGGAAAATTGGAGA+GGG 0.604320 1:-91638941 MsG0180005420.01.T01:CDS
TACATAATGCCATTCTGGAG+TGG 0.604717 1:-91636919 MsG0180005420.01.T01:CDS
AGTTGAAGTACAATTGGCAA+GGG 0.607913 1:-91639293 MsG0180005420.01.T01:CDS
CCAATCTTGGAAAATTGGAG+AGG 0.612442 1:-91638942 MsG0180005420.01.T01:CDS
AGAGAAGATTATATCAGCTG+TGG 0.615225 1:-91639140 MsG0180005420.01.T01:CDS
GACCCATACATAGCTGCAGA+TGG 0.616616 1:-91637052 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGGCTTTGACAACCATAAGA+GGG 0.617660 1:+91638857 None:intergenic
AACTGGCATACTTAGCATTG+AGG 0.618114 1:-91637657 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATGTTGTTAAGAATGAAAGC+GGG 0.622408 1:+91636581 None:intergenic
TTACCAGTGACAAGACACTC+TGG 0.624233 1:+91637850 None:intergenic
GTGTAATTTACATCACTATG+TGG 0.627704 1:+91636864 None:intergenic
GTGTTGTGAAAAGACTTGGC+TGG 0.632028 1:-91637635 MsG0180005420.01.T01:CDS
ACTGTGTTGGACATTTCAGC+TGG 0.632064 1:-91637706 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTGTGCAGATTCTGGTGACA+TGG 0.641765 1:-91640540 MsG0180005420.01.T01:intron
GAACTAAAGAAGGAATCCCC+AGG 0.642674 1:+91637947 None:intergenic
TAAGAGTTAGGATAAATGAA+GGG 0.642801 1:-91636789 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TATGAAGAAGAGGCAATAAG+GGG 0.644142 1:-91637022 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCTCCATAAAGGAAAATGCA+GGG 0.649266 1:+91638990 None:intergenic
AATATGGATTCAGCTGACAC+GGG 0.650390 1:-91637919 MsG0180005420.01.T01:CDS
TGATCTTCACCTGGACAATG+GGG 0.653734 1:+91637491 None:intergenic
TGCTAAGTATGCCAGTTGTG+TGG 0.654208 1:+91637663 None:intergenic
ATGGGGCAGACAAAATGAGA+AGG 0.659925 1:+91637508 None:intergenic
AAGAAAGTAGGTGATAGAGG+GGG 0.660539 1:-91636693 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR
TAACTGGAAGACCACTTCCG+GGG 0.666165 1:-91637774 MsG0180005420.01.T01:CDS
TTTCTGACACAAGATCTGGC+CGG 0.666966 1:+91637611 None:intergenic
ATAAGGGGATGGTTGGACAG+TGG 0.667883 1:-91637007 MsG0180005420.01.T01:CDS
ATTCTGCATTTAAAGAACAG+CGG 0.688741 1:+91640495 None:intergenic
ATCCGAGCATCAACACTACG+GGG 0.730366 1:+91640751 None:intergenic
GTGTACGAATACCTAAACAA+CGG 0.736880 1:-91638156 MsG0180005420.01.T01:CDS
AGGTATGGAAGTGTTTACAA+GGG 0.739487 1:-91638917 MsG0180005420.01.T01:CDS
TCCGAGCATCAACACTACGG+GGG 0.746958 1:+91640752 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTAAAATATACATATGACA+TGG - Chr1:91638846-91638865 MsG0180005420.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTCATTAAGTAAGATTATT+TGG + Chr1:91638976-91638995 None:intergenic 15.0%
!!! AGAATACAAATTTTAAAAAG+AGG + Chr1:91638916-91638935 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTTGTATTTTTCTTTTGT+TGG - Chr1:91640126-91640145 MsG0180005420.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTTTCAAATTAACAATAA+AGG + Chr1:91636680-91636699 None:intergenic 15.0%
!!! CTTTATTGTTAATTTGAAAA+TGG - Chr1:91636678-91636697 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!!! GTATATTTTAATTTGTTTAC+TGG + Chr1:91638838-91638857 None:intergenic 15.0%
!!! TTACAAAGAAACTTTTTATT+AGG + Chr1:91637378-91637397 None:intergenic 15.0%
!!! TTGAAATTTTGAAATGATTT+TGG - Chr1:91637073-91637092 MsG0180005420.01.T01:intron 15.0%
!! AAACGTATACTTTAGATATT+TGG + Chr1:91640780-91640799 None:intergenic 20.0%
!! AATAATATGTGAATTGCAAA+TGG - Chr1:91638072-91638091 MsG0180005420.01.T01:CDS 20.0%
!! ACCAAAATATTTCAATACAT+CGG + Chr1:91636625-91636644 None:intergenic 20.0%
!! TTATTTATTGAAAATGCAAC+TGG - Chr1:91639904-91639923 MsG0180005420.01.T01:intron 20.0%
!! TTGAAAACAAGAAAAATGAT+AGG + Chr1:91638609-91638628 None:intergenic 20.0%
!!! AAATATCTAAAGTATACGTT+TGG - Chr1:91640779-91640798 MsG0180005420.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!!! AATTTCACTATAGGTATTTT+CGG - Chr1:91640566-91640585 MsG0180005420.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTAATCTTTTCAGATTGTT+TGG + Chr1:91636589-91636608 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGAAATGATTTTGGATAT+TGG - Chr1:91637080-91637099 MsG0180005420.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTAAAAGAAGAATGCTA+GGG - Chr1:91638682-91638701 MsG0180005420.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTTAAAAGAAGAATGCT+AGG - Chr1:91638681-91638700 MsG0180005420.01.T01:intron 20.0%
! AAAAGAAGTTGAAGTACAAT+TGG - Chr1:91638003-91638022 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! AATGTTGTTAAGAATGAAAG+CGG + Chr1:91640725-91640744 None:intergenic 25.0%
! ACCTATAGTGAAATTATCAA+AGG + Chr1:91640561-91640580 None:intergenic 25.0%
! ATAAGAGTTAGGATAAATGA+AGG - Chr1:91640512-91640531 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTATTGCTTCGAATTTC+AGG - Chr1:91639049-91639068 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! ATGATGAAGAATTACAAAAC+TGG - Chr1:91637957-91637976 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTTGCATACAATAAAGTT+AGG + Chr1:91639875-91639894 None:intergenic 25.0%
! ATTAATCTGACAATCCTTTA+CGG + Chr1:91637784-91637803 None:intergenic 25.0%
! ATTTCATATGCATAACATCA+CGG + Chr1:91637731-91637750 None:intergenic 25.0%
! CCAAAATATTTCAATACATC+GGG + Chr1:91636624-91636643 None:intergenic 25.0%
! GAAATTTAACTACAAAGCTA+TGG + Chr1:91637619-91637638 None:intergenic 25.0%
! GCATTATGTAATGCATAATT+AGG + Chr1:91640373-91640392 None:intergenic 25.0%
! TAAGAGTTAGGATAAATGAA+GGG - Chr1:91640513-91640532 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! TAGAAATGGAAAGTAGAAAA+TGG - Chr1:91637300-91637319 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
! TATAAATCACCATCTGATTA+TGG - Chr1:91637868-91637887 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGAGAGATATAGTAAGAT+GGG - Chr1:91639981-91640000 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
! TTCAAAGCATAAAGATTTGT+TGG - Chr1:91637636-91637655 MsG0180005420.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAGAGAGATATAGTAAGA+TGG - Chr1:91639980-91639999 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
! TTTCCTTGAAACTTATCAAA+AGG + Chr1:91638189-91638208 None:intergenic 25.0%
!! ACCTTTGATAATTTCACTAT+AGG - Chr1:91640557-91640576 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!! GCTTTTGATAAAAATGAATC+TGG + Chr1:91639853-91639872 None:intergenic 25.0%
!! TGTATTTTTCTTTTGTTGGT+GGG - Chr1:91640130-91640149 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!! TTCTTTGTAAAATTTTGCTC+TGG - Chr1:91637388-91637407 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!! TTGTATTTTTCTTTTGTTGG+TGG - Chr1:91640129-91640148 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!! TTTCGGAATGTAAGTATTTT+CGG - Chr1:91640583-91640602 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!!! AATTGTAATTGTTTTGCAAG+AGG - Chr1:91637173-91637192 MsG0180005420.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTCAAGTTGTCTAAATTG+AGG - Chr1:91640751-91640770 MsG0180005420.01.T01:exon 25.0%
AAAGGATTGTCAGATTAATG+TGG - Chr1:91637785-91637804 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
AAATTCCCATGGATAATACA+AGG + Chr1:91639284-91639303 None:intergenic 30.0%
AACTTAATCTAGTAGACCAA+AGG + Chr1:91638788-91638807 None:intergenic 30.0%
AGCACATTTCAGGAATAAAA+TGG + Chr1:91637916-91637935 None:intergenic 30.0%
AGTATTGTTCTCTTTATAGC+TGG - Chr1:91638629-91638648 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
ATAAAACTGTGAGTTTCTCA+TGG + Chr1:91639017-91639036 None:intergenic 30.0%
ATACTGTTACAACTTCTAAC+TGG - Chr1:91639512-91639531 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
ATAGATACTTGAAAGATCAG+AGG + Chr1:91638950-91638969 None:intergenic 30.0%
ATATGAAGAAGAGGCAATAA+GGG - Chr1:91640279-91640298 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
ATATTGTGCTGAACTAAAGA+AGG + Chr1:91639368-91639387 None:intergenic 30.0%
ATGTTGTTAAGAATGAAAGC+GGG + Chr1:91640724-91640743 None:intergenic 30.0%
ATTCTGCATTTAAAGAACAG+CGG + Chr1:91636810-91636829 None:intergenic 30.0%
ATTGTCCTACCACAAAATAA+TGG + Chr1:91636965-91636984 None:intergenic 30.0%
CACTATGTGGCAATTATAAT+GGG + Chr1:91640428-91640447 None:intergenic 30.0%
CACTCTTGAATATAAGAGTT+AGG - Chr1:91640501-91640520 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
CATGCATGAAAATAGCATAA+AGG + Chr1:91636920-91636939 None:intergenic 30.0%
GGAAAATCTTAAAACTGTGT+TGG - Chr1:91639583-91639602 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
GTATTGTTCTCTTTATAGCT+GGG - Chr1:91638630-91638649 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
GTGTAATTTACATCACTATG+TGG + Chr1:91640441-91640460 None:intergenic 30.0%
GTTAATTCCTTTCCTGTTAA+CGG - Chr1:91640179-91640198 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
TAATAACTCGCATAAACGTT+TGG - Chr1:91639418-91639437 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
TATAATCTTCTCTTCCAACT+CGG + Chr1:91638155-91638174 None:intergenic 30.0%
TATGAATTATGATCTTCACC+TGG + Chr1:91639823-91639842 None:intergenic 30.0%
TATGAGAAAAGATGAGTTTC+TGG + Chr1:91639947-91639966 None:intergenic 30.0%
TCACTATGTGGCAATTATAA+TGG + Chr1:91640429-91640448 None:intergenic 30.0%
TTTGACCAATCTTGGAAAAT+TGG - Chr1:91638355-91638374 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
! ATATAGTGGAGTGTGTTTAA+AGG - Chr1:91638874-91638893 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
! CCCGATGTATTGAAATATTT+TGG - Chr1:91636621-91636640 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! CTTCAACTTGAACTTTTTAC+AGG - Chr1:91637934-91637953 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
! GATAAAAATGAATCTGGAAC+AGG + Chr1:91639847-91639866 None:intergenic 30.0%
! TCTGATCTTTCAAGTATCTA+TGG - Chr1:91638949-91638968 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
! TTCGGAATGTAAGTATTTTC+GGG - Chr1:91640584-91640603 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
! TTCTTTAGTTCAGCACAATA+TGG - Chr1:91639367-91639386 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
!! AAACTTTTTCCTCCAAATTC+AGG - Chr1:91637661-91637680 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGGGATCTTTCTAAAATG+AGG - Chr1:91640675-91640694 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
!! CACATATTATTTTATCTCGC+TGG + Chr1:91638063-91638082 None:intergenic 30.0%
!! TAATTTGTTTACTGGTTACC+AGG + Chr1:91638830-91638849 None:intergenic 30.0%
!! TTGGGATCTTTCTAAAATGA+GGG - Chr1:91640676-91640695 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
!! TTGTAGAGGCATTATAGAAA+TGG - Chr1:91637286-91637305 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
!!! CTCACAGTTTTATTTTACCA+TGG - Chr1:91639024-91639043 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGATTTTTTGGTTAAAGTCA+TGG - Chr1:91637022-91637041 MsG0180005420.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTCTTTTTTAGTGTCTACT+TGG - Chr1:91638499-91638518 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTGGTTTTACAGGAAGTTA+TGG - Chr1:91640225-91640244 MsG0180005420.01.T01:intron 30.0%
AAAGGACTTACTCAAGAAAG+GGG + Chr1:91638770-91638789 None:intergenic 35.0%
AACAACACACAACAACTAAG+CGG + Chr1:91637469-91637488 None:intergenic 35.0%
AACATGAAACAGGAAGGATT+TGG - Chr1:91637263-91637282 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
AAGGAAATCTTCTCCTTGTT+TGG - Chr1:91640645-91640664 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
AAGTTGAAGTACAATTGGCA+AGG - Chr1:91638008-91638027 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
AATCACCATCTGATTATGGA+TGG - Chr1:91637872-91637891 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
AATGTTTGAGTCCAAGTGTA+CGG - Chr1:91638126-91638145 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
ACCCAAAATAGATCTCAGAA+TGG - Chr1:91638559-91638578 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
AGAGAAGATTATATCAGCTG+TGG - Chr1:91638162-91638181 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
AGCTTCCAATTAGTGTTAAC+AGG + Chr1:91639106-91639125 None:intergenic 35.0%
AGGAAAAACGAGATAAGCTA+AGG - Chr1:91638203-91638222 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
AGTAGAAAATGGTTCCATTG+AGG - Chr1:91637311-91637330 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
AGTATGCTAAGGGATCATAT+TGG + Chr1:91640042-91640061 None:intergenic 35.0%
AGTTGAAGTACAATTGGCAA+GGG - Chr1:91638009-91638028 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
ATAAAAATGCTGCCCTCTTA+TGG - Chr1:91638433-91638452 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
ATATGATCCCTTAGCATACT+TGG - Chr1:91640042-91640061 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
ATCTCCATAAAGGAAAATGC+AGG + Chr1:91638316-91638335 None:intergenic 35.0%
ATGACATGGCTTCAATATAG+TGG - Chr1:91638860-91638879 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
ATGGATATTCGAATTTGCCA+TGG + Chr1:91639215-91639234 None:intergenic 35.0%
CAAAAAATCCTTTCAAGACC+AGG + Chr1:91637012-91637031 None:intergenic 35.0%
CAAACTTGAACACACAGATT+TGG - Chr1:91640345-91640364 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
CAAAGGACTTACTCAAGAAA+GGG + Chr1:91638771-91638790 None:intergenic 35.0%
CAATCTTGGAAAATTGGAGA+GGG - Chr1:91638361-91638380 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
CATATCCATCCATAATCAGA+TGG + Chr1:91637880-91637899 None:intergenic 35.0%
CATATGAAGAAGAGGCAATA+AGG - Chr1:91640278-91640297 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
CCAAACCTGTTAACACTAAT+TGG - Chr1:91639098-91639117 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
CCAATTAGTGTTAACAGGTT+TGG + Chr1:91639101-91639120 None:intergenic 35.0%
CCCAAAATAGATCTCAGAAT+GGG - Chr1:91638560-91638579 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
CCTTAGTAGAGTGTGTTTAA+AGG + Chr1:91638715-91638734 None:intergenic 35.0%
CCTTTAAACACACTCTACTA+AGG - Chr1:91638712-91638731 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
CTCTACTAAGGTAAATCGAT+TGG - Chr1:91638724-91638743 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
GAAGCAACCAGAAAATGTAA+AGG + Chr1:91636943-91636962 None:intergenic 35.0%
GCTGTTCTTTAAATGCAGAA+TGG - Chr1:91636809-91636828 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GTGTACGAATACCTAAACAA+CGG - Chr1:91639146-91639165 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
GTTAACGGCAATGATAATCA+TGG - Chr1:91640194-91640213 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TACACTTGGACTCAAACATT+TGG + Chr1:91638126-91638145 None:intergenic 35.0%
TACTTGAAAGATCAGAGGAT+AGG + Chr1:91638945-91638964 None:intergenic 35.0%
TAGAGATATGAAATGCGCAT+TGG - Chr1:91639556-91639575 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TATGAAATGCGCATTGGAAA+AGG - Chr1:91639562-91639581 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TATGAAGAAGAGGCAATAAG+GGG - Chr1:91640280-91640299 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TCGAAGCAATAATATAGCCA+TGG + Chr1:91639044-91639063 None:intergenic 35.0%
TCTCCATAAAGGAAAATGCA+GGG + Chr1:91638315-91638334 None:intergenic 35.0%
TCTTGCAACAACACTGTTAA+AGG + Chr1:91636836-91636855 None:intergenic 35.0%
TGAAGAAAGTAGGTGATAGA+GGG - Chr1:91640607-91640626 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TGATTATCATTGCCGTTAAC+AGG + Chr1:91640194-91640213 None:intergenic 35.0%
TGCATTACATAATGCCATTC+TGG - Chr1:91640378-91640397 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TGTTCATAAATGTCCAAGCA+TGG + Chr1:91637818-91637837 None:intergenic 35.0%
TTATGGTTGTCAAAGCCAAT+CGG - Chr1:91638450-91638469 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TTCAAAATGGCGGTTAAACT+AGG + Chr1:91637535-91637554 None:intergenic 35.0%
TTCCTTTATGGAGATCAATG+AGG - Chr1:91638321-91638340 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
TTCTGCATTTAAAGAACAGC+GGG + Chr1:91636809-91636828 None:intergenic 35.0%
! AAGTTTGAGGTTTGTCATAG+GGG + Chr1:91640332-91640351 None:intergenic 35.0%
! AATCTGTGTGTTCAAGTTTG+AGG + Chr1:91640345-91640364 None:intergenic 35.0%
! AGCATAAAGGTATGCAAACA+AGG + Chr1:91636907-91636926 None:intergenic 35.0%
! AGGAAATCTTCTCCTTGTTT+GGG - Chr1:91640646-91640665 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
! ATAAGAGGGCAGCATTTTTA+TGG + Chr1:91638434-91638453 None:intergenic 35.0%
! ATGCATGCCTTTACATTTTC+TGG - Chr1:91636933-91636952 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
! ATTCCCTGCATTTTCCTTTA+TGG - Chr1:91638309-91638328 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
! CAAGTTTGAGGTTTGTCATA+GGG + Chr1:91640333-91640352 None:intergenic 35.0%
! CTGTTTTCTTTCAACCTCAA+TGG + Chr1:91637328-91637347 None:intergenic 35.0%
! GGACCTTTTGATAAGTTTCA+AGG - Chr1:91638183-91638202 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
! GGCGAATATAACTTGTGAAA+TGG - Chr1:91636739-91636758 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! TCAAGTTTGAGGTTTGTCAT+AGG + Chr1:91640334-91640353 None:intergenic 35.0%
! TGGCTTTACATATGAAGAAG+AGG - Chr1:91640270-91640289 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! AAGGTATGGAAGTGTTTACA+AGG - Chr1:91638384-91638403 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! AATGAAGGCATTGTGTCTTA+CGG + Chr1:91637692-91637711 None:intergenic 35.0%
!! AGATGAGTTTCTGGTTTAGA+AGG + Chr1:91639938-91639957 None:intergenic 35.0%
!! AGGTATGGAAGTGTTTACAA+GGG - Chr1:91638385-91638404 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! ATAATCATGGCGGTTGTTTT+TGG - Chr1:91640207-91640226 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTTTCTTTTGTTGGTGGG+TGG - Chr1:91640133-91640152 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGAAGTGCTGAGAAAATT+TGG - Chr1:91638253-91638272 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!! TCGATGCAAATAGTTCTGAA+TGG + Chr1:91639734-91639753 None:intergenic 35.0%
!! TGCTTCCATTATTTTGTGGT+AGG - Chr1:91636957-91636976 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTTGCTTCCATTATTTTG+TGG - Chr1:91636953-91636972 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCAAGTTGAAGCACATTTC+AGG + Chr1:91637926-91637945 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCCTCCAAATTCAGGTT+AGG - Chr1:91637666-91637685 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTCTTTTGTTGGTGGGT+GGG - Chr1:91640134-91640153 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!!! ACCCATTCTGAGATCTATTT+TGG + Chr1:91638564-91638583 None:intergenic 35.0%
!!! AGGGGGAGGATATTTTTTTA+AGG - Chr1:91640626-91640645 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
!!! CCCATTCTGAGATCTATTTT+GGG + Chr1:91638563-91638582 None:intergenic 35.0%
!!! CTGGTCTTGAAAGGATTTTT+TGG - Chr1:91637010-91637029 MsG0180005420.01.T01:CDS 35.0%
!!! TATTTTCGGGTGAAGAAAGT+AGG - Chr1:91640597-91640616 MsG0180005420.01.T01:intron 35.0%
AAAATCCTTTCAAGACCAGG+AGG + Chr1:91637009-91637028 None:intergenic 40.0%
AAAATTGGAGAGGGAAGGTA+TGG - Chr1:91638370-91638389 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AACCTGAATATCAGCCGTAA+AGG - Chr1:91637767-91637786 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
AACGGCAATGATAATCATGG+CGG - Chr1:91640197-91640216 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AACTGGCATACTTAGCATTG+AGG - Chr1:91639645-91639664 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AAGAAAGTAGGTGATAGAGG+GGG - Chr1:91640609-91640628 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AATATGGATTCAGCTGACAC+GGG - Chr1:91639383-91639402 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
ACTTCATCAAACCACACAAC+TGG - Chr1:91639628-91639647 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AGAGCATATGTCAGTAGCAA+TGG + Chr1:91639234-91639253 None:intergenic 40.0%
AGCTCCAGACTTCTTCAAAA+TGG + Chr1:91637548-91637567 None:intergenic 40.0%
AGCTGCTAAGAACATGAAAC+AGG - Chr1:91637253-91637272 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AGCTGTTGTGAACTGAGTTT+GGG + Chr1:91640096-91640115 None:intergenic 40.0%
AGGCAAAACGAATGGAATAC+TGG - Chr1:91637218-91637237 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AGGGAATTCTACCACATAAG+AGG + Chr1:91638296-91638315 None:intergenic 40.0%
AGGTATGCAAACAAGGTTGA+AGG + Chr1:91636900-91636919 None:intergenic 40.0%
AGTTGTGTGGTTTGATGAAG+TGG + Chr1:91639629-91639648 None:intergenic 40.0%
ATCATTGCCGTTAACAGGAA+AGG + Chr1:91640189-91640208 None:intergenic 40.0%
ATCCTTTACGGCTGATATTC+AGG + Chr1:91637772-91637791 None:intergenic 40.0%
ATGATCTTCACCTGGACAAT+GGG + Chr1:91639815-91639834 None:intergenic 40.0%
ATGGATAATACAAGGCTTGC+TGG + Chr1:91639276-91639295 None:intergenic 40.0%
ATTACAAAACTGGCGTGCTA+AGG - Chr1:91637967-91637986 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
ATTCGAATTTGCCATGGAAG+TGG + Chr1:91639209-91639228 None:intergenic 40.0%
CAATATGGATTCAGCTGACA+CGG - Chr1:91639382-91639401 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
CAGATCTTGTGTCAGAAATC+TGG - Chr1:91639696-91639715 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
CAGATTTCTGACACAAGATC+TGG + Chr1:91639698-91639717 None:intergenic 40.0%
CCAAAGGACTTACTCAAGAA+AGG + Chr1:91638772-91638791 None:intergenic 40.0%
CCAATCTTGGAAAATTGGAG+AGG - Chr1:91638360-91638379 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
CCTTTCTTGAGTAAGTCCTT+TGG - Chr1:91638769-91638788 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GAAGAAAGTAGGTGATAGAG+GGG - Chr1:91640608-91640627 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GCAAGAGGTTGAAGATGAAA+GGG - Chr1:91637188-91637207 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GCTAACTTTGTAGCCAAACT+TGG - Chr1:91639329-91639348 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
GCTAAGAACATGAAACAGGA+AGG - Chr1:91637257-91637276 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GCTGAGAAAATTTGGAGAAG+TGG - Chr1:91638261-91638280 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GGATACTACATCCTCTTATG+TGG - Chr1:91638282-91638301 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GTGAAGAAAGTAGGTGATAG+AGG - Chr1:91640606-91640625 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
GTTGATGCTCGGATCAAATA+CGG - Chr1:91636560-91636579 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TAAGAGCTGAACTTTGGTCT+CGG + Chr1:91638099-91638118 None:intergenic 40.0%
TAATGACAAGTGACATGAGC+TGG + Chr1:91636719-91636738 None:intergenic 40.0%
TACTAGGCTTCAAATTCCCA+TGG + Chr1:91639295-91639314 None:intergenic 40.0%
TAGCTGTTGTGAACTGAGTT+TGG + Chr1:91640097-91640116 None:intergenic 40.0%
TATGATCTTCACCTGGACAA+TGG + Chr1:91639816-91639835 None:intergenic 40.0%
TCATATGCATAACATCACGG+TGG + Chr1:91637728-91637747 None:intergenic 40.0%
TCCAGACTTCTTCAAAATGG+CGG + Chr1:91637545-91637564 None:intergenic 40.0%
TGAAATGGTTGTGCAGATTC+TGG - Chr1:91636754-91636773 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TGAGTTTGGGAGTCTACAAA+TGG + Chr1:91640083-91640102 None:intergenic 40.0%
TGCAAGAGGTTGAAGATGAA+AGG - Chr1:91637187-91637206 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
TGCCTCATTGATCTCCATAA+AGG + Chr1:91638326-91638345 None:intergenic 40.0%
TGGCTACAAAGTTAGCATCA+AGG + Chr1:91639325-91639344 None:intergenic 40.0%
TTCATATCTCTAACTAGCCC+CGG + Chr1:91639548-91639567 None:intergenic 40.0%
TTGAACATGCAAACGCAGTT+AGG - Chr1:91638227-91638246 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAAGGCTACCGTTGTTT+AGG + Chr1:91639160-91639179 None:intergenic 40.0%
! AATCTTCTCCTTGTTTGGGT+TGG - Chr1:91640650-91640669 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
! AGCAAGCCTTGTATTATCCA+TGG - Chr1:91639275-91639294 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
! AGCTCATGTCACTTGTCATT+AGG - Chr1:91636718-91636737 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! ATCTTCTCCTTGTTTGGGTT+GGG - Chr1:91640651-91640670 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
! CCTCTCCAATTTTCCAAGAT+TGG + Chr1:91638363-91638382 None:intergenic 40.0%
! CTGACATCTTCTGTCAGTTT+TGG - Chr1:91637141-91637160 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
! GCAAGCCTTGTATTATCCAT+GGG - Chr1:91639276-91639295 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
! GGTTTCTAAGAGCTGAACTT+TGG + Chr1:91638105-91638124 None:intergenic 40.0%
! TACATAATGCCATTCTGGAG+TGG - Chr1:91640383-91640402 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
! TCAGAACTATTTGCATCGAC+AGG - Chr1:91639735-91639754 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
! TGGGAATTTGAAGCCTAGTA+AGG - Chr1:91639295-91639314 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
! TTGCTTCGAATTTCAGGTAG+AGG - Chr1:91639055-91639074 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGTATACGTTTGGTTCTGC+AGG - Chr1:91640788-91640807 MsG0180005420.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!! AGTATACGTTTGGTTCTGCA+GGG - Chr1:91640789-91640808 MsG0180005420.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!! CTCAGGATTTTGACCAATCT+TGG - Chr1:91638347-91638366 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
!! TGAGGTGTTGTGAAAAGACT+TGG - Chr1:91639663-91639682 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
!! TGGCTTTGACAACCATAAGA+GGG + Chr1:91638448-91638467 None:intergenic 40.0%
!! TTGGCTTTGACAACCATAAG+AGG + Chr1:91638449-91638468 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGAAGAAGTCTGGAGCT+TGG - Chr1:91637548-91637567 MsG0180005420.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCGGTTGTTTTTGGTTTTAC+AGG - Chr1:91640216-91640235 MsG0180005420.01.T01:intron 40.0%
AACACGCACCAAGTATGCTA+AGG + Chr1:91640053-91640072 None:intergenic 45.0%
AACGAATACACGTCTGACTC+TGG + Chr1:91639485-91639504 None:intergenic 45.0%
AAGAAGAGGCAATAAGGGGA+TGG - Chr1:91640284-91640303 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
AAGCCATCTGCAGCTATGTA+TGG + Chr1:91640256-91640275 None:intergenic 45.0%
ACACGCACCAAGTATGCTAA+GGG + Chr1:91640052-91640071 None:intergenic 45.0%
ACTGTGTTGGACATTTCAGC+TGG - Chr1:91639596-91639615 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
AGATGGGAGCAGAAATGCAA+AGG - Chr1:91639997-91640016 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
AGCCATCTGCAGCTATGTAT+GGG + Chr1:91640255-91640274 None:intergenic 45.0%
ATGGGGCAGACAAAATGAGA+AGG + Chr1:91639797-91639816 None:intergenic 45.0%
ATGTGGTGAATGTCCATGCT+TGG - Chr1:91637802-91637821 MsG0180005420.01.T01:CDS 45.0%
CTTACGGCCTAACCTGAATT+TGG + Chr1:91637676-91637695 None:intergenic 45.0%
CTTGGAAAATTGGAGAGGGA+AGG - Chr1:91638365-91638384 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GAACAGGTAGGCAAAACGAA+TGG - Chr1:91637210-91637229 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GAACTAAAGAAGGAATCCCC+AGG + Chr1:91639358-91639377 None:intergenic 45.0%
GAAGATGAAAGGGAACAGGT+AGG - Chr1:91637198-91637217 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GACACAATGCCTTCATTACC+AGG - Chr1:91637695-91637714 MsG0180005420.01.T01:CDS 45.0%
GACATGGAAGCGACTGAAAA+TGG - Chr1:91636778-91636797 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GAGTCAGACGTGTATTCGTT+TGG - Chr1:91639485-91639504 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GATGGGAGCAGAAATGCAAA+GGG - Chr1:91639998-91640017 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GCATAAACGTTTGGCGTATG+TGG - Chr1:91639427-91639446 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GCATCAAGGAGAACCTTACT+AGG + Chr1:91639311-91639330 None:intergenic 45.0%
GGTTGAAGATGAAAGGGAAC+AGG - Chr1:91637194-91637213 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
GTGTTGTGAAAAGACTTGGC+TGG - Chr1:91639667-91639686 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
TAAGCGGTATCCGACTAAGT+GGG + Chr1:91637453-91637472 None:intergenic 45.0%
TCTAACTGGAAGACCACTTC+CGG - Chr1:91639526-91639545 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
TGATCCGAGCATCAACACTA+CGG + Chr1:91636556-91636575 None:intergenic 45.0%
TGATCTTCACCTGGACAATG+GGG + Chr1:91639814-91639833 None:intergenic 45.0%
TGCATAACATCACGGTGGTA+AGG + Chr1:91637723-91637742 None:intergenic 45.0%
TGCTAAGTATGCCAGTTGTG+TGG + Chr1:91639642-91639661 None:intergenic 45.0%
TTACCAGTGACAAGACACTC+TGG + Chr1:91639455-91639474 None:intergenic 45.0%
TTGTGCAGATTCTGGTGACA+TGG - Chr1:91636762-91636781 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TTTCTGACACAAGATCTGGC+CGG + Chr1:91639694-91639713 None:intergenic 45.0%
TTTGCTCTGGCTGCTAATCA+GGG - Chr1:91637401-91637420 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
! CAGGAAGGATTTGGTTGTAG+AGG - Chr1:91637272-91637291 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
! GACAGACTTGCTTGTTCATG+AGG - Chr1:91636864-91636883 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
! GGTAAGGATCCTGGTAATGA+AGG + Chr1:91637707-91637726 None:intergenic 45.0%
! TTTTGCTCTGGCTGCTAATC+AGG - Chr1:91637400-91637419 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
!! ACCGCCATTTTGAAGAAGTC+TGG - Chr1:91637541-91637560 MsG0180005420.01.T01:CDS 45.0%
!! AGCATACTTGGTGCGTGTTT+GGG - Chr1:91640054-91640073 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
!! ATCATCCTCCTGGTCTTGAA+AGG - Chr1:91637001-91637020 MsG0180005420.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTTGTTTGGGTTGGGAATT+GGG - Chr1:91640658-91640677 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
!! GGTTAAACTAGGAAGCACTC+TGG + Chr1:91637524-91637543 None:intergenic 45.0%
!! TAGCATACTTGGTGCGTGTT+TGG - Chr1:91640053-91640072 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
!! TCCTTGTTTGGGTTGGGAAT+TGG - Chr1:91640657-91640676 MsG0180005420.01.T01:intron 45.0%
AAAGTAGGTGATAGAGGGGG+AGG - Chr1:91640612-91640631 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
AAGACAGGACTCCACTTCCA+TGG - Chr1:91639195-91639214 MsG0180005420.01.T01:CDS 50.0%
AAGCGGTATCCGACTAAGTG+GGG + Chr1:91637452-91637471 None:intergenic 50.0%
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AATCCCCAGGTCACCAAGTT+TGG + Chr1:91639345-91639364 None:intergenic 50.0%
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AGAGGCAATAAGGGGATGGT+TGG - Chr1:91640288-91640307 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
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ATCCGAGCATCAACACTACG+GGG + Chr1:91636554-91636573 None:intergenic 50.0%
CAACTCGGTTACCGTACACT+TGG + Chr1:91638140-91638159 None:intergenic 50.0%
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CCCAATTCCCAACCCAAACA+AGG + Chr1:91640661-91640680 None:intergenic 50.0%
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CTAACTGGAAGACCACTTCC+GGG - Chr1:91639527-91639546 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
CTAAGCGGTATCCGACTAAG+TGG + Chr1:91637454-91637473 None:intergenic 50.0%
GACCCATACATAGCTGCAGA+TGG - Chr1:91640250-91640269 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
GATCCGAGCATCAACACTAC+GGG + Chr1:91636555-91636574 None:intergenic 50.0%
GGAGATCAATGAGGCAACTC+AGG - Chr1:91638330-91638349 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
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TCCTGTCTTTGCAGGCAAGA+TGG + Chr1:91639184-91639203 None:intergenic 50.0%
TGCAGGCAAGATGGCTTTCA+AGG + Chr1:91639175-91639194 None:intergenic 50.0%
TGCATCTCAACTTGCACACC+TGG - Chr1:91638809-91638828 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
TGGACATTTCAGCTGGTGAG+TGG - Chr1:91639603-91639622 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
! GATCCAGAGTGTCTTGTCAC+TGG - Chr1:91639449-91639468 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
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! TTTTGTCTGCCCCATTGTCC+AGG - Chr1:91639802-91639821 MsG0180005420.01.T01:intron 50.0%
!! TACAAGGCTTGCTGGAGTGA+AGG + Chr1:91639268-91639287 None:intergenic 50.0%
CAGTTGCTGCCACTCCAGAA+TGG + Chr1:91640395-91640414 None:intergenic 55.0%
CATCACGGTGGTAAGGATCC+TGG + Chr1:91637716-91637735 None:intergenic 55.0%
CCAGGAGGATGATGTCACAC+AGG + Chr1:91636994-91637013 None:intergenic 55.0%
CCTGTGTGACATCATCCTCC+TGG - Chr1:91636991-91637010 MsG0180005420.01.T01:CDS 55.0%
GCCATCTTGCCTGCAAAGAC+AGG - Chr1:91639180-91639199 MsG0180005420.01.T01:CDS 55.0%
GGTATCCGACTAAGTGGGGT+CGG + Chr1:91637448-91637467 None:intergenic 55.0%
TCCGAGCATCAACACTACGG+GGG + Chr1:91636553-91636572 None:intergenic 55.0%
TCTCTAACTAGCCCCGGAAG+TGG + Chr1:91639542-91639561 None:intergenic 55.0%
ACGGGGGCAGTCACTATTCC+AGG + Chr1:91636537-91636556 None:intergenic 60.0%
ACTAAGTGGGGTCGGCTACG+TGG + Chr1:91637440-91637459 None:intergenic 60.0%
CGTAGCCGACCCCACTTAGT+CGG - Chr1:91637440-91637459 MsG0180005420.01.T01:intron 60.0%
!! GCCCCCGTAGTGTTGATGCT+CGG - Chr1:91636549-91636568 MsG0180005420.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 91636515 91640809 91636515 ID=MsG0180005420.01;Name=MsG0180005420.01
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Chr1 exon 91636515 91637086 91636515 ID=MsG0180005420.01.T01:exon:17943;Parent=MsG0180005420.01.T01
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Chr1 exon 91640682 91640809 91640682 ID=MsG0180005420.01.T01:exon:17939;Parent=MsG0180005420.01.T01
Chr1 five_prime_UTR 91640761 91640809 91640761 ID=MsG0180005420.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180005420.01.T01
Chr1 CDS 91640682 91640760 91640682 ID=MsG0180005420.01.T01:cds;Parent=MsG0180005420.01.T01
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Chr1 CDS 91636907 91637086 91636907 ID=MsG0180005420.01.T01:cds;Parent=MsG0180005420.01.T01
Chr1 three_prime_UTR 91636515 91636906 91636515 ID=MsG0180005420.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0180005420.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180005420.01.T01

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Protein sequence

>MsG0180005420.01.T01

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