AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006580.01

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MsG0280006580.01.T01 AT1G61490 39.878 820 435 16 1 809 1 773 0.0 592
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MsG0280006580.01.T01 AT4G11900 37.951 693 366 19 25 667 24 702 5.73e-138 427
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MsG0280006580.01.T01 AT4G03230 26.331 357 182 13 99 429 30 331 4.14e-28 122
MsG0280006580.01.T01 AT4G03230 56.851 343 123 4 475 816 592 910 1.98e-123 395
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MsG0280006580.01.T01 AT4G03230 32.614 417 226 15 41 429 42 431 3.38e-59 219
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23160 55.975 318 117 2 495 812 352 646 1.30e-121 383
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23140 55.247 324 116 3 495 812 344 644 3.13e-120 379
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MsG0280006580.01.T01 AT1G61430 37.148 603 336 14 1 588 1 575 5.46e-120 375
MsG0280006580.01.T01 AT1G61430 37.522 573 320 12 31 588 3 552 5.86e-120 374
MsG0280006580.01.T01 AT1G61430 37.522 573 320 12 31 588 35 584 2.41e-119 374
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23150 51.585 347 143 4 468 812 300 623 4.71e-117 370
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23280 55.728 323 121 3 490 812 332 632 1.71e-116 369
MsG0280006580.01.T01 AT4G23280 55.728 323 121 3 490 812 330 630 1.82e-116 369
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23320 47.922 409 184 6 443 845 122 507 6.16e-115 360
MsG0280006580.01.T01 AT4G00970 43.579 475 230 10 372 838 216 660 6.23e-115 365
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23190 45.501 389 186 4 428 812 196 562 1.11e-114 362
MsG0280006580.01.T01 AT4G23320 47.922 409 184 6 443 845 143 528 2.53e-114 358
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23310 52.941 323 130 2 490 812 496 796 2.82e-113 365
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MsG0280006580.01.T01 AT1G67520 40.230 522 230 11 373 845 122 610 2.64e-110 351
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MsG0280006580.01.T01 AT4G04510 47.967 369 163 5 444 811 283 623 1.33e-105 340
MsG0280006580.01.T01 AT4G04500 48.641 368 162 7 443 806 287 631 1.10e-103 335
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MsG0280006580.01.T01 AT4G21400 44.203 414 168 10 460 838 182 567 8.60e-99 319
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MsG0280006580.01.T01 AT1G07650 43.207 368 177 7 438 802 624 962 2.09e-79 277
MsG0280006580.01.T01 AT1G70530 39.594 394 209 6 416 809 239 603 7.64e-79 268
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MsG0280006580.01.T01 AT1G56145 39.759 415 186 8 434 817 622 1003 3.31e-78 274
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MsG0280006580.01.T01 AT3G16030 30.982 652 361 15 7 590 6 636 1.44e-77 265
MsG0280006580.01.T01 AT1G53420 40.576 382 201 5 422 802 545 901 1.91e-77 271
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MsG0280006580.01.T01 AT1G53430 47.152 316 142 4 490 804 616 907 1.12e-76 269
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MsG0280006580.01.T01 AT1G53440 47.152 316 142 4 490 804 655 946 9.76e-76 267
MsG0280006580.01.T01 AT1G29730 44.510 337 160 5 490 824 628 939 1.77e-74 263
MsG0280006580.01.T01 AT5G24080 28.258 821 490 29 40 809 42 814 4.14e-74 260
MsG0280006580.01.T01 AT4G23180 65.896 173 59 0 495 667 341 513 6.86e-74 251
MsG0280006580.01.T01 AT1G29730 44.510 337 159 6 490 824 661 971 1.54e-73 260
MsG0280006580.01.T01 AT4G04500 55.310 226 98 3 443 667 287 510 2.15e-73 249
MsG0280006580.01.T01 AT4G04500 55.310 226 98 3 443 667 287 510 2.15e-73 249
MsG0280006580.01.T01 AT1G29740 45.566 327 150 6 490 814 665 965 8.35e-73 258
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MsG0280006580.01.T01 AT1G29720 44.602 352 159 9 495 839 666 988 2.32e-72 257
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MsG0280006580.01.T01 AT1G67520 41.176 340 147 6 373 667 330 661 1.08e-69 243
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MsG0280006580.01.T01 AT1G67520 31.349 252 160 5 29 270 25 273 1.28e-27 119
MsG0280006580.01.T01 AT1G29750 44.578 332 153 8 484 811 646 950 6.37e-69 247
MsG0280006580.01.T01 AT1G29750 44.578 332 153 8 484 811 661 965 9.14e-69 247
MsG0280006580.01.T01 AT4G04540 52.863 227 104 3 444 667 292 518 1.26e-68 237
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MsG0280006580.01.T01 AT4G11890 38.261 345 174 5 464 806 11 318 1.13e-67 229
MsG0280006580.01.T01 AT4G11890 38.871 319 165 3 490 806 27 317 1.63e-67 228
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MsG0280006580.01.T01 AT2G42960 39.252 321 170 4 489 808 170 466 4.33e-67 232
MsG0280006580.01.T01 AT2G42960 39.252 321 170 4 489 808 170 466 4.33e-67 232
MsG0280006580.01.T01 AT2G42960 39.252 321 170 4 489 808 170 466 4.33e-67 232
MsG0280006580.01.T01 AT1G56720 38.170 317 171 4 489 804 166 458 5.37e-66 229
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MsG0280006580.01.T01 AT1G56720 38.170 317 171 4 489 804 166 458 5.37e-66 229
MsG0280006580.01.T01 AT1G56720 38.170 317 171 4 489 804 166 458 5.37e-66 229
MsG0280006580.01.T01 AT3G20530 40.924 303 154 5 498 797 78 358 5.97e-66 225
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MsG0280006580.01.T01 AT5G18500 39.423 312 164 4 489 799 153 440 6.94e-65 225
MsG0280006580.01.T01 AT5G18500 39.423 312 164 4 489 799 153 440 6.94e-65 225
MsG0280006580.01.T01 AT5G18500 39.423 312 164 4 489 799 153 440 6.94e-65 225
MsG0280006580.01.T01 AT5G18500 39.423 312 164 4 489 799 153 440 6.94e-65 225
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MsG0280006580.01.T01 AT1G09440 38.141 312 168 4 489 799 144 431 7.62e-65 225
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MsG0280006580.01.T01 AT1G29730 53.394 221 102 1 490 710 628 847 1.01e-64 234
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MsG0280006580.01.T01 AT4G23210 58.427 178 72 1 490 667 348 523 5.93e-64 224
MsG0280006580.01.T01 AT3G24790 41.479 311 156 6 489 796 52 339 6.19e-64 219
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MsG0280006580.01.T01 AT4G34440 41.231 325 162 8 489 810 302 600 1.46e-62 224
MsG0280006580.01.T01 AT4G01330 36.449 321 179 4 489 808 149 445 2.67e-62 218
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MsG0280006580.01.T01 AT1G68690 42.953 298 144 6 498 793 373 646 1.41e-60 219
MsG0280006580.01.T01 AT1G68690 42.953 298 144 6 498 793 373 646 1.41e-60 219
MsG0280006580.01.T01 AT5G01550 35.294 374 200 7 432 799 315 652 1.50e-60 219
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MsG0280006580.01.T01 AT1G07870 40.193 311 160 7 490 797 91 378 1.63e-60 215
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MsG0280006580.01.T01 AT1G68690 43.098 297 143 6 498 792 373 645 2.09e-60 218
MsG0280006580.01.T01 AT1G52290 38.050 318 177 5 481 798 122 419 3.73e-60 213
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MsG0280006580.01.T01 AT5G18610 36.769 359 193 9 446 796 25 357 1.01e-59 212
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MsG0280006580.01.T01 AT3G13690 37.855 317 167 6 489 802 398 687 7.99e-55 203
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MsG0280006580.01.T01 AT5G48740 32.143 420 229 11 389 796 502 877 9.64e-55 204
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MsG0280006580.01.T01 AT5G65600 35.422 367 212 10 451 812 300 646 1.22e-54 201
MsG0280006580.01.T01 AT5G18910 37.304 319 169 7 490 807 180 468 1.25e-54 197
MsG0280006580.01.T01 AT2G13790 39.062 320 167 6 486 801 278 573 1.34e-54 200
MsG0280006580.01.T01 AT4G39400 38.554 332 172 7 470 795 849 1154 1.46e-54 206
MsG0280006580.01.T01 AT1G34210 37.931 348 178 9 464 801 265 584 1.60e-54 200
MsG0280006580.01.T01 AT1G34210 37.931 348 178 9 464 801 265 584 1.60e-54 200
MsG0280006580.01.T01 AT2G43700 33.820 411 224 14 439 840 279 650 1.68e-54 201
MsG0280006580.01.T01 AT2G02220 38.870 301 159 4 498 797 730 1006 2.07e-54 204
MsG0280006580.01.T01 AT1G16130 38.487 304 161 4 495 797 409 687 2.36e-54 202
MsG0280006580.01.T01 AT1G66150 37.380 313 169 7 489 796 575 865 2.78e-54 204
MsG0280006580.01.T01 AT3G25560 35.294 374 204 8 436 802 245 587 2.92e-54 199
MsG0280006580.01.T01 AT2G39360 37.920 327 175 5 468 793 456 755 3.27e-54 202
MsG0280006580.01.T01 AT3G25560 35.294 374 204 8 436 802 245 587 3.74e-54 199
MsG0280006580.01.T01 AT3G25560 35.294 374 204 8 436 802 246 588 3.95e-54 199
MsG0280006580.01.T01 AT1G31420 34.271 391 218 9 423 806 224 582 6.78e-54 197
MsG0280006580.01.T01 AT1G31420 34.527 391 218 9 423 806 224 583 6.97e-54 197
MsG0280006580.01.T01 AT1G31420 34.527 391 218 9 423 806 224 583 6.97e-54 197
MsG0280006580.01.T01 AT1G14370 36.994 346 171 10 487 815 71 386 9.22e-54 193
MsG0280006580.01.T01 AT3G23750 36.246 309 171 4 492 796 568 854 9.59e-54 202
MsG0280006580.01.T01 AT1G24030 35.962 317 176 4 482 793 42 336 1.43e-53 190
MsG0280006580.01.T01 AT1G16260 35.028 354 194 7 456 797 323 652 1.56e-53 199
MsG0280006580.01.T01 AT1G16260 35.028 354 194 7 456 797 332 661 1.66e-53 199
MsG0280006580.01.T01 AT1G16260 35.028 354 194 7 456 797 332 661 1.66e-53 199
MsG0280006580.01.T01 AT1G26970 38.416 341 161 11 477 797 52 363 1.74e-53 192
MsG0280006580.01.T01 AT1G70250 34.555 382 210 11 436 811 402 749 1.74e-53 200
MsG0280006580.01.T01 AT1G69790 37.389 337 163 10 480 797 45 352 1.97e-53 191
MsG0280006580.01.T01 AT1G24030 35.962 317 176 4 482 793 56 350 2.00e-53 190
MsG0280006580.01.T01 AT1G16150 35.043 351 195 7 456 797 369 695 2.27e-53 199
MsG0280006580.01.T01 AT1G72300 37.179 312 171 4 483 793 784 1071 2.34e-53 201
MsG0280006580.01.T01 AT1G69790 37.982 337 161 11 480 797 56 363 2.47e-53 191
MsG0280006580.01.T01 AT2G35620 35.200 375 208 9 438 806 235 580 2.81e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT2G35620 35.200 375 208 9 438 806 235 580 2.81e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT2G35620 35.200 375 208 9 438 806 235 580 2.81e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT2G35620 35.200 375 208 9 438 806 235 580 2.81e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT5G60320 35.753 372 203 9 482 844 328 672 3.23e-53 197
MsG0280006580.01.T01 AT1G24030 36.842 304 165 4 495 793 1 282 3.83e-53 187
MsG0280006580.01.T01 AT3G59740 32.713 376 213 10 434 802 271 613 4.74e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT5G11020 34.656 378 203 7 432 793 24 373 4.75e-53 190
MsG0280006580.01.T01 AT5G63710 35.000 380 214 9 434 805 182 536 4.83e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT5G63710 35.000 380 214 9 434 805 182 536 4.83e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT5G11020 34.656 378 203 7 432 793 20 369 5.20e-53 190
MsG0280006580.01.T01 AT3G45420 36.827 353 183 10 498 844 346 664 5.74e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT2G23450 36.688 308 171 4 487 793 333 617 5.79e-53 197
MsG0280006580.01.T01 AT2G23450 36.688 308 171 4 487 793 333 617 5.79e-53 197
MsG0280006580.01.T01 AT5G65710 35.884 379 211 9 433 796 625 986 5.80e-53 200
MsG0280006580.01.T01 AT5G10290 37.805 328 176 6 478 801 266 569 6.17e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT5G10290 37.805 328 176 6 478 801 266 569 6.17e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT5G63710 35.000 380 214 9 434 805 218 572 6.75e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT1G66910 34.341 364 211 8 452 811 294 633 7.81e-53 196
MsG0280006580.01.T01 AT5G63710 35.000 380 214 9 434 805 217 571 7.91e-53 195
MsG0280006580.01.T01 AT5G35960 35.072 345 187 7 459 798 89 401 8.07e-53 190
MsG0280006580.01.T01 AT2G11520 38.111 307 156 8 492 792 215 493 8.51e-53 192
MsG0280006580.01.T01 AT3G59750 33.693 371 213 8 434 802 241 580 1.04e-52 195
MsG0280006580.01.T01 AT1G66910 34.341 364 211 8 452 811 297 636 1.05e-52 196
MsG0280006580.01.T01 AT5G42440 35.207 338 189 8 465 797 41 353 1.42e-52 187
MsG0280006580.01.T01 AT2G01950 35.511 352 180 6 464 796 803 1126 1.44e-52 199
MsG0280006580.01.T01 AT5G11020 34.656 378 203 7 432 793 58 407 1.48e-52 190
MsG0280006580.01.T01 AT2G43690 34.146 369 206 9 438 802 241 576 1.54e-52 194
MsG0280006580.01.T01 AT1G71830 37.861 346 181 9 464 801 262 581 1.65e-52 194
MsG0280006580.01.T01 AT1G24030 41.564 243 136 3 482 719 42 283 1.68e-52 185
MsG0280006580.01.T01 AT2G07180 37.855 317 164 7 489 797 77 368 1.75e-52 190
MsG0280006580.01.T01 AT2G07180 37.855 317 164 7 489 797 77 368 1.75e-52 190
MsG0280006580.01.T01 AT1G16120 42.745 255 136 4 457 702 375 628 1.80e-52 196
MsG0280006580.01.T01 AT2G23950 34.109 387 220 8 422 801 215 573 2.06e-52 194
MsG0280006580.01.T01 AT1G67720 38.141 312 159 6 489 796 595 876 2.59e-52 197
MsG0280006580.01.T01 AT5G47070 38.298 329 162 10 481 796 65 365 2.72e-52 188
MsG0280006580.01.T01 AT5G03320 37.015 335 178 7 472 796 51 362 2.89e-52 188
MsG0280006580.01.T01 AT5G03320 37.015 335 178 7 472 796 51 362 2.89e-52 188
MsG0280006580.01.T01 AT5G11020 34.771 371 198 7 439 793 4 346 3.16e-52 187
MsG0280006580.01.T01 AT5G65240 38.907 311 162 6 495 801 277 563 3.35e-52 194

Find 142 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 222 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GACATTGTTGGTCTTTCTTC+TGG 0.164590 2:+3667447 None:intergenic
CCAAGCGTTCCGCGCTTAAT+TGG 0.189335 2:-3668339 MsG0280006580.01.T01:CDS
TACTTGAATACACTTTAAAA+TGG 0.211074 2:+3667494 None:intergenic
AGCTTGGACTCCTTATTATT+TGG 0.211883 2:-3668465 MsG0280006580.01.T01:intron
AAACCTGGCCTTCTAGGTTT+TGG 0.226352 2:+3667384 None:intergenic
GAATACAAACCTGGCCTTCT+AGG 0.227713 2:+3667378 None:intergenic
TTGGAGACTTATTTGATATA+AGG 0.232416 2:-3669709 MsG0280006580.01.T01:CDS
CGAAATCTCGTCAAGCTTCT+TGG 0.234809 2:-3668543 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTCTGGGCCTCAAATTCATC+TGG 0.234872 2:-3670580 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATACACTTTAAAATGGATTC+AGG 0.249888 2:+3667501 None:intergenic
CCATTCAAACACTTGCAAAT+TGG 0.254248 2:+3669989 None:intergenic
CTATGTTCCAACTACCCTTT+TGG 0.257419 2:+3668129 None:intergenic
CCTTGTTGCAGCTTCAATAA+TGG 0.273513 2:+3669164 None:intergenic
TCAGAAACATAGTTGTTAAA+TGG 0.274020 2:+3670869 None:intergenic
TGAACATTCATTTGAGTTCT+TGG 0.280355 2:-3670396 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAGGAGTCCAAGCTTCTATT+TGG 0.280464 2:+3668474 None:intergenic
TATGGTATTTGTGGTGCTTA+TGG 0.296049 2:-3670034 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTTGGTTGGAACTTCAAAAC+TGG 0.299598 2:-3670421 MsG0280006580.01.T01:CDS
ACAAAGGTGATCCAGCTCTA+AGG 0.302730 2:-3670246 MsG0280006580.01.T01:CDS
GATGTATTTAAGAAGTTTAT+AGG 0.304313 2:-3669878 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTTCTTGGTTGTTGCATTCA+AGG 0.316308 2:-3668528 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGAGCTACTGGATTCTTTGC+AGG 0.323802 2:+3670556 None:intergenic
TTCACATAAAGAATATTGTT+TGG 0.327064 2:-3670699 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAATCTGATGTTTATAGCTT+TGG 0.329582 2:-3667972 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTTACACATATCTTGGTATA+TGG 0.334682 2:-3670732 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAAAGGCTCTCAGAGAATTC+TGG 0.336086 2:-3668621 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAGATTGGAGAAGGTGGATT+TGG 0.339457 2:-3669123 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATTGGTCTAGTGGATGTGTT+AGG 0.346883 2:-3669928 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGGAGACTTATTTGATATAA+GGG 0.347257 2:-3669708 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTCCAACCAAGTTTCATTCC+TGG 0.355870 2:+3670433 None:intergenic
TGTGTTAGGCATGGAAGCTT+TGG 0.356251 2:-3667581 MsG0280006580.01.T01:intron
CCAATTTGCAAGTGTTTGAA+TGG 0.356619 2:-3669989 MsG0280006580.01.T01:CDS
AATTCAAAAGTTTGTAGAAA+TGG 0.359169 2:-3669902 MsG0280006580.01.T01:CDS
TCACATAAAGAATATTGTTT+GGG 0.367375 2:-3670698 MsG0280006580.01.T01:CDS
GAGAGACCAACCAAATAATA+AGG 0.368557 2:+3668455 None:intergenic
AACGTTGATGATCCTTCTTC+GGG 0.370146 2:-3670370 MsG0280006580.01.T01:CDS
TCACGTGGTATGCTCAATTC+TGG 0.372352 2:-3667324 MsG0280006580.01.T01:CDS
CCCAGAAAACATTTCCTTTG+TGG 0.373510 2:+3670596 None:intergenic
AATTCCACTTACACATATCT+TGG 0.373623 2:-3670739 MsG0280006580.01.T01:CDS
GAACGTTGATGATCCTTCTT+CGG 0.380090 2:-3670371 MsG0280006580.01.T01:CDS
TAGCAATTTACTTTGTATAC+AGG 0.388122 2:+3669099 None:intergenic
AATGGTTGTATTGCTTGGTT+TGG 0.389804 2:-3669728 MsG0280006580.01.T01:CDS
AGCCAAGGAATATGCATGAT+TGG 0.394471 2:-3669961 MsG0280006580.01.T01:CDS
CCTGGTAACAATGTATTAGA+AGG 0.396848 2:+3670451 None:intergenic
AGAGTTTCAGCTTCAGAACT+AGG 0.410180 2:-3669653 MsG0280006580.01.T01:intron
ACATGAAAGTCTACAGAATC+TGG 0.411392 2:+3669845 None:intergenic
AGGTAAAGCCATTGAGTTGA+TGG 0.412796 2:-3667553 MsG0280006580.01.T01:CDS
AGGAGATTCAACTTGTGATC+AGG 0.413291 2:+3667897 None:intergenic
TGTGGTTGATAATTAAGAAA+TGG 0.415459 2:-3669397 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTTGGAATGGCAAGAATGTT+TGG 0.417111 2:-3668175 MsG0280006580.01.T01:CDS
GGAATGATCATCGTTCGAAT+TGG 0.420582 2:-3670096 MsG0280006580.01.T01:CDS
GTGTCTAGAAGCTGAGCTAC+TGG 0.428408 2:+3670544 None:intergenic
GGCGACCAATGCGATGGTTA+TGG 0.431579 2:-3670052 MsG0280006580.01.T01:CDS
GCATGGAAGCTTTGGAATGA+AGG 0.433868 2:-3667573 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATGATTGGAAAATGCTTGAT+TGG 0.434355 2:-3669946 MsG0280006580.01.T01:CDS
AATACCACTGATGACATTGT+TGG 0.435476 2:+3667435 None:intergenic
TTCCAATCATGCATATTCCT+TGG 0.437028 2:+3669959 None:intergenic
CCAATTAAGCGCGGAACGCT+TGG 0.441302 2:+3668339 None:intergenic
GTGGTAATGGTTGTATTGCT+TGG 0.442914 2:-3669733 MsG0280006580.01.T01:CDS
GATGATTTGTGGTGGAGTTA+TGG 0.445957 2:+3670825 None:intergenic
TGCGATGGTTATGGTATTTG+TGG 0.450840 2:-3670043 MsG0280006580.01.T01:CDS
CCTTCTAATACATTGTTACC+AGG 0.458867 2:-3670451 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGTTGCTCCCAAAACCTAGA+AGG 0.459318 2:-3667392 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTCCCAAAACCTAGAAGGCC+AGG 0.461206 2:-3667387 MsG0280006580.01.T01:CDS
GAAAAGACCAAAAGGGTAGT+TGG 0.464391 2:-3668136 MsG0280006580.01.T01:CDS
TACACTTTAAAATGGATTCA+GGG 0.465078 2:+3667502 None:intergenic
TGCAGGCCCAGATGAATTTG+AGG 0.467192 2:+3670573 None:intergenic
TGTCCATCCATTGCGTACTC+TGG 0.468582 2:+3668005 None:intergenic
ACATTATTAACGGCATTGCT+AGG 0.468714 2:-3668303 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAACTGAAGAAAAGACCAAA+AGG 0.472159 2:-3668144 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGGTTACCAGTGATGATTTG+TGG 0.474376 2:+3670814 None:intergenic
TCTGGGCCTCAAATTCATCT+GGG 0.481958 2:-3670579 MsG0280006580.01.T01:CDS
TACCAGGAATGAAACTTGGT+TGG 0.482534 2:-3670435 MsG0280006580.01.T01:CDS
CAAAGGTGATCCAGCTCTAA+GGG 0.482977 2:-3670245 MsG0280006580.01.T01:CDS
CATTATTAACGGCATTGCTA+GGG 0.486578 2:-3668302 MsG0280006580.01.T01:CDS
GATATAAATGCTAGTGGTAA+TGG 0.486965 2:-3669746 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAGAAATGGAGAAGAAATAG+AGG 0.488924 2:-3669383 MsG0280006580.01.T01:intron
ACATTAGCATTCAACAATGA+TGG 0.491626 2:-3670637 MsG0280006580.01.T01:CDS
GTGAAGGTGAAATTAGTGTT+TGG 0.494631 2:+3670794 None:intergenic
AGTGGTAACAGTTATGTCAT+TGG 0.494991 2:+3667299 None:intergenic
CAGAAGTGGACCATGGTATG+TGG 0.495463 2:-3670275 MsG0280006580.01.T01:CDS
TATAATAAGATTGGAGAAGG+TGG 0.495834 2:-3669129 MsG0280006580.01.T01:CDS
CCGCGCTTAATTGGCAAAAG+AGG 0.498487 2:-3668330 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTTCTCGTCCTGATGGAAGC+TGG 0.501184 2:+3668652 None:intergenic
GACGAGAAATAGCAGTGAAA+AGG 0.504712 2:-3668638 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATAAGGGAGGATTCTGTGAA+TGG 0.510746 2:-3669692 MsG0280006580.01.T01:CDS
CACCTCTCTGAATACAAACC+TGG 0.512876 2:+3667369 None:intergenic
AAGAGGCTAGACATTATTAA+CGG 0.516836 2:-3668313 MsG0280006580.01.T01:CDS
ACTGCTATTTCTCGTCCTGA+TGG 0.519708 2:+3668645 None:intergenic
GTCATCAGTGGTATTAATGT+TGG 0.523239 2:-3667427 MsG0280006580.01.T01:CDS
TATACCAAGATATGTGTAAG+TGG 0.525860 2:+3670735 None:intergenic
TAATGGATCCATCAACTCAA+TGG 0.528239 2:+3667545 None:intergenic
GACACTTGATCCTCAAGTAA+TGG 0.528925 2:+3667528 None:intergenic
CTGTATGCAGCTAAAGAGAC+AGG 0.536833 2:-3669246 MsG0280006580.01.T01:intron
TTGTTACCAGGAATGAAACT+TGG 0.549768 2:-3670439 MsG0280006580.01.T01:CDS
TAACTATATTCACCCGAAGA+AGG 0.555124 2:+3670358 None:intergenic
GTACCATTGTGATTAAGAAG+TGG 0.555990 2:+3670658 None:intergenic
GGAGATTCAACTTGTGATCA+GGG 0.558287 2:+3667898 None:intergenic
GTTGATGGATCCATTACTTG+AGG 0.560632 2:-3667538 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATACATGCCAAATAGAAGCT+TGG 0.561237 2:-3668481 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTGGTCTAGTGGATGTGTTA+GGG 0.563396 2:-3669927 MsG0280006580.01.T01:CDS
TCTCCAGAGTACGCAATGGA+TGG 0.567880 2:-3668008 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTCTCAGAGAATTCTGGACA+AGG 0.570112 2:-3668615 MsG0280006580.01.T01:CDS
GTTTAATTCAGCATTTCACA+TGG 0.571667 2:-3670117 MsG0280006580.01.T01:CDS
GAATTAAACCAGATTCACTA+AGG 0.572755 2:+3670131 None:intergenic
TTATAACACTCACATGGCCT+AGG 0.578354 2:+3667877 None:intergenic
CTCATTATTCTTAACCACAA+AGG 0.579574 2:-3670610 MsG0280006580.01.T01:CDS
ACTCCACCACAAATCATCAC+TGG 0.581459 2:-3670820 MsG0280006580.01.T01:CDS
AACTGAAGAAAAGACCAAAA+GGG 0.581591 2:-3668143 MsG0280006580.01.T01:CDS
TCAAGGAGAAGATAAAATGT+TGG 0.582049 2:-3668511 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGTTACCACTACTGTAGTAG+AGG 0.582817 2:-3667286 MsG0280006580.01.T01:CDS
GATCACAAGTTGAATCTCCT+AGG 0.583205 2:-3667894 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAAATGCTTGATTGGTCTAG+TGG 0.583365 2:-3669938 MsG0280006580.01.T01:CDS
AGACTTATTTGATATAAGGG+AGG 0.585584 2:-3669705 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAATACCATAACCATCGCAT+TGG 0.603112 2:+3670047 None:intergenic
TTGTATTGTTCCACATACCA+TGG 0.604052 2:+3670265 None:intergenic
GTAGCTCAGCTTCTAGACAC+TGG 0.604149 2:-3670541 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGCTGAGGTAATAATAGTAG+AGG 0.604441 2:+3669421 None:intergenic
ACACTTTAAAATGGATTCAG+GGG 0.605126 2:+3667503 None:intergenic
CTATTATTACCTCAGCATTG+TGG 0.605731 2:-3669415 MsG0280006580.01.T01:CDS
CCATTATTGAAGCTGCAACA+AGG 0.607513 2:-3669164 MsG0280006580.01.T01:CDS
TTACCAGTGATGATTTGTGG+TGG 0.612380 2:+3670817 None:intergenic
CAAATGTTGAGAGAAACAAA+AGG 0.612762 2:-3669481 MsG0280006580.01.T01:CDS
CTTGCAAGAATTCAAGAATG+AGG 0.614362 2:-3668592 MsG0280006580.01.T01:CDS
GGAATGGCAAGAATGTTTGG+TGG 0.615053 2:-3668172 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAACTTGATATAAATGCTAG+TGG 0.617738 2:-3669752 MsG0280006580.01.T01:CDS
ATTATTAACGGCATTGCTAG+GGG 0.625542 2:-3668301 MsG0280006580.01.T01:CDS
GTTCAAGGCGACCAATGCGA+TGG 0.628666 2:-3670058 MsG0280006580.01.T01:CDS
ACGACCCTCTACTACAGTAG+TGG 0.639494 2:+3667281 None:intergenic
GTTACCACTACTGTAGTAGA+GGG 0.644845 2:-3667285 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAGACCAACAATGTCATCAG+TGG 0.651796 2:-3667439 MsG0280006580.01.T01:CDS
TCAGTGGTATTAATGTTGGA+TGG 0.656056 2:-3667423 MsG0280006580.01.T01:CDS
CATGTCTCCAGAGTACGCAA+TGG 0.657696 2:-3668012 MsG0280006580.01.T01:CDS
CATTCATTATAACACTCACA+TGG 0.658171 2:+3667871 None:intergenic
AAACCACTTCTTAATCACAA+TGG 0.664935 2:-3670661 MsG0280006580.01.T01:CDS
AATTATCAACCACAATGCTG+AGG 0.667716 2:+3669406 None:intergenic
GGCCAGGTTTGTATTCAGAG+AGG 0.675873 2:-3667371 MsG0280006580.01.T01:CDS
TGGTATGTGGAACAATACAA+AGG 0.690585 2:-3670262 MsG0280006580.01.T01:CDS
CATTAACATTGATCAATGTG+AGG 0.698074 2:-3669813 MsG0280006580.01.T01:CDS
AAAAGCTGAGGAAGTCCACG+TGG 0.713817 2:+3670325 None:intergenic
AGTTATAGTGTTGATCCACG+TGG 0.736693 2:-3670340 MsG0280006580.01.T01:CDS
GAGACAGATTCATCATCACG+TGG 0.744966 2:-3667339 MsG0280006580.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAGTTTAGATTAAATAAA+TGG + Chr2:3669209-3669228 None:intergenic 10.0%
!! TAAAAAATTGACATGTTATA+TGG - Chr2:3670535-3670554 MsG0280006580.01.T01:CDS 15.0%
!! TATAAAAGATGAAAAAAGTT+TGG + Chr2:3670117-3670136 None:intergenic 15.0%
!! TTTCCTTCAAATAAAATTTA+AGG - Chr2:3669294-3669313 MsG0280006580.01.T01:intron 15.0%
!!! AATATTGCAATTTTATCTTA+AGG + Chr2:3670489-3670508 None:intergenic 15.0%
!!! ATAATATTTTTTTTCTGTTG+TGG - Chr2:3668678-3668697 MsG0280006580.01.T01:intron 15.0%
!!! TATAACATGTCAATTTTTTA+TGG + Chr2:3670535-3670554 None:intergenic 15.0%
!!! TTCTCTTTTTATAATAAGAT+TGG - Chr2:3669053-3669072 MsG0280006580.01.T01:intron 15.0%
!! AATTCAAAAGTTTGTAGAAA+TGG - Chr2:3668289-3668308 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!! GATGTATTTAAGAAGTTTAT+AGG - Chr2:3668313-3668332 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATGGAAATCTCAAAAAAT+GGG + Chr2:3669013-3669032 None:intergenic 20.0%
!! TCACATAAAGAATATTGTTT+GGG - Chr2:3667493-3667512 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!! TCAGAATCAAAAACAAAAAT+CGG + Chr2:3667989-3668008 None:intergenic 20.0%
!! TTCACATAAAGAATATTGTT+TGG - Chr2:3667492-3667511 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAACAAGTTTTAGTAACTT+TGG - Chr2:3669421-3669440 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAAAATTTAAGGTCATGTT+TGG - Chr2:3669304-3669323 MsG0280006580.01.T01:intron 20.0%
!!! ATAATGGAAATCTCAAAAAA+TGG + Chr2:3669014-3669033 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTAAAGTGTATTCAAGT+AGG - Chr2:3670699-3670718 MsG0280006580.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTCAATTTGTTATTACAATT+TGG + Chr2:3670406-3670425 None:intergenic 20.0%
!!! TACTTGAATACACTTTAAAA+TGG + Chr2:3670700-3670719 None:intergenic 20.0%
!!! TGACCTTAAATTTTATTTGA+AGG + Chr2:3669300-3669319 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATAATAAGATTGGAGA+AGG - Chr2:3669059-3669078 MsG0280006580.01.T01:intron 20.0%
! AAACTTGATATAAATGCTAG+TGG - Chr2:3668439-3668458 MsG0280006580.01.T01:intron 25.0%
! AAAGATGAAAAAAGTTTGGT+AGG + Chr2:3670113-3670132 None:intergenic 25.0%
! AAATCTGATGTTTATAGCTT+TGG - Chr2:3670219-3670238 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
! AATCCAAAAATTTCTGACTT+TGG - Chr2:3669998-3670017 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
! ACTAGGTATGAGTATATATA+TGG - Chr2:3668555-3668574 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
! ATACTAATCAAAGAAGACTA+TGG + Chr2:3668898-3668917 None:intergenic 25.0%
! ATAGTTGTTGTAAAACTAAG+AGG + Chr2:3669486-3669505 None:intergenic 25.0%
! CAACAACTATGATAATATCT+TGG - Chr2:3669496-3669515 MsG0280006580.01.T01:intron 25.0%
! GGTAAACTAAAGATTTATTG+TGG - Chr2:3668829-3668848 MsG0280006580.01.T01:intron 25.0%
! TAGCAATTTACTTTGTATAC+AGG + Chr2:3669095-3669114 None:intergenic 25.0%
! TAGTTGTTGTAAAACTAAGA+GGG + Chr2:3669485-3669504 None:intergenic 25.0%
! TCAGAAACATAGTTGTTAAA+TGG + Chr2:3667325-3667344 None:intergenic 25.0%
! TGGAGACTTATTTGATATAA+GGG - Chr2:3668483-3668502 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGAGACTTATTTGATATA+AGG - Chr2:3668482-3668501 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAAATTTCTGACTTTGGAA+TGG - Chr2:3670003-3670022 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGAAGAAAATTTTCAGAAG+TGG - Chr2:3667902-3667921 MsG0280006580.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTCCAAAGTCAGAAATTTT+TGG + Chr2:3670004-3670023 None:intergenic 25.0%
!! TATGTGTAAGTGGAATTTTT+AGG + Chr2:3667449-3667468 None:intergenic 25.0%
!! TGAAGGAAATAGTACTATTT+TGG + Chr2:3669283-3669302 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCTGAGTTTAATGTTCA+AGG - Chr2:3668118-3668137 MsG0280006580.01.T01:intron 25.0%
!!! AAACTTGTTTTGCAAGAAAT+TGG + Chr2:3669412-3669431 None:intergenic 25.0%
!!! ACAAAAATCGGTTTGAAAAT+TGG + Chr2:3667977-3667996 None:intergenic 25.0%
!!! ATACACTTTAAAATGGATTC+AGG + Chr2:3670693-3670712 None:intergenic 25.0%
!!! GTCAATTTTTTATGGTAAAG+TGG + Chr2:3670527-3670546 None:intergenic 25.0%
!!! TACACTTTAAAATGGATTCA+GGG + Chr2:3670692-3670711 None:intergenic 25.0%
!!! TGTGGTTGATAATTAAGAAA+TGG - Chr2:3668794-3668813 MsG0280006580.01.T01:intron 25.0%
AAACCACTTCTTAATCACAA+TGG - Chr2:3667530-3667549 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
AAACTGAAGAAAAGACCAAA+AGG - Chr2:3670047-3670066 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
AACTGAAGAAAAGACCAAAA+GGG - Chr2:3670048-3670067 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAATGGAGAAGAAATAG+AGG - Chr2:3668808-3668827 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
AAGAGGCTAGACATTATTAA+CGG - Chr2:3669878-3669897 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
AATTCCACTTACACATATCT+TGG - Chr2:3667452-3667471 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
ACATTAGCATTCAACAATGA+TGG - Chr2:3667554-3667573 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
ACATTGTAGAGAAATCTGAT+CGG - Chr2:3670424-3670443 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
ACCATAGTGGTAAAATATGT+GGG + Chr2:3669255-3669274 None:intergenic 30.0%
AGACTTATTTGATATAAGGG+AGG - Chr2:3668486-3668505 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
ATGATTGGAAAATGCTTGAT+TGG - Chr2:3668245-3668264 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
CAAATGTTGAGAGAAACAAA+AGG - Chr2:3668710-3668729 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
CATTAACATTGATCAATGTG+AGG - Chr2:3668378-3668397 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
CATTCATTATAACACTCACA+TGG + Chr2:3670323-3670342 None:intergenic 30.0%
CTCATTATTCTTAACCACAA+AGG - Chr2:3667581-3667600 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
CTTACACATATCTTGGTATA+TGG - Chr2:3667459-3667478 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
GAATTAAACCAGATTCACTA+AGG + Chr2:3668063-3668082 None:intergenic 30.0%
GATATAAATGCTAGTGGTAA+TGG - Chr2:3668445-3668464 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
GCACTTTGAATGATTAGATT+TGG + Chr2:3669376-3669395 None:intergenic 30.0%
GTTTAATTCAGCATTTCACA+TGG - Chr2:3668074-3668093 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
TACCATAGTGGTAAAATATG+TGG + Chr2:3669256-3669275 None:intergenic 30.0%
TATAATAAGATTGGAGAAGG+TGG - Chr2:3669062-3669081 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
TATACCAAGATATGTGTAAG+TGG + Chr2:3667459-3667478 None:intergenic 30.0%
TCAAGGAGAAGATAAAATGT+TGG - Chr2:3669680-3669699 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
TCACATTAACGATTCTTTGT+TGG - Chr2:3668602-3668621 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
! AAAACTCTGACGAAATTTTG+TGG - Chr2:3667702-3667721 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
! AGATTTTTCCTTAGTGAATC+TGG - Chr2:3668052-3668071 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
! CCAAGTTCAAAATTTTGTGA+AGG + Chr2:3667416-3667435 None:intergenic 30.0%
! CCTTCACAAAATTTTGAACT+TGG - Chr2:3667413-3667432 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
! TGAACATTCATTTGAGTTCT+TGG - Chr2:3667795-3667814 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
! TGGATCTGTTGTAACTTTTA+GGG - Chr2:3669516-3669535 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
! TTGGATCTGTTGTAACTTTT+AGG - Chr2:3669515-3669534 MsG0280006580.01.T01:intron 30.0%
!! ACACTTTAAAATGGATTCAG+GGG + Chr2:3670691-3670710 None:intergenic 30.0%
!! ATGGTATTTTCTGCTTTTGA+AGG + Chr2:3667350-3667369 None:intergenic 30.0%
!! ATGTTCTGAAATTGTTACAG+TGG - Chr2:3670153-3670172 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
!! CATGAATTGATAATGTACCA+TGG - Chr2:3670584-3670603 MsG0280006580.01.T01:CDS 30.0%
AAATACCATAACCATCGCAT+TGG + Chr2:3668147-3668166 None:intergenic 35.0%
AATACCACTGATGACATTGT+TGG + Chr2:3670759-3670778 None:intergenic 35.0%
AATGGTTGTATTGCTTGGTT+TGG - Chr2:3668463-3668482 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
AATTATCAACCACAATGCTG+AGG + Chr2:3668788-3668807 None:intergenic 35.0%
ACACTAGTATGTTTGTGTAG+AGG + Chr2:3669138-3669157 None:intergenic 35.0%
ACATGAAAGTCTACAGAATC+TGG + Chr2:3668349-3668368 None:intergenic 35.0%
ACATTATTAACGGCATTGCT+AGG - Chr2:3669888-3669907 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATTGGAAAGCTTCAAC+TGG + Chr2:3669398-3669417 None:intergenic 35.0%
AGCTTGGACTCCTTATTATT+TGG - Chr2:3669726-3669745 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
AGTGGTAACAGTTATGTCAT+TGG + Chr2:3670895-3670914 None:intergenic 35.0%
ATACATGCCAAATAGAAGCT+TGG - Chr2:3669710-3669729 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
ATGTACCATGGAAATGTGTT+AGG - Chr2:3670596-3670615 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
ATTATTAACGGCATTGCTAG+GGG - Chr2:3669890-3669909 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
CATTATTAACGGCATTGCTA+GGG - Chr2:3669889-3669908 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
CCAATTTGCAAGTGTTTGAA+TGG - Chr2:3668202-3668221 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
CCATTCAAACACTTGCAAAT+TGG + Chr2:3668205-3668224 None:intergenic 35.0%
CCTGGTAACAATGTATTAGA+AGG + Chr2:3667743-3667762 None:intergenic 35.0%
CCTTCTAATACATTGTTACC+AGG - Chr2:3667740-3667759 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
CTATTATTACCTCAGCATTG+TGG - Chr2:3668776-3668795 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
CTTGCAAGAATTCAAGAATG+AGG - Chr2:3669599-3669618 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
GAGAGACCAACCAAATAATA+AGG + Chr2:3669739-3669758 None:intergenic 35.0%
GTACCATTGTGATTAAGAAG+TGG + Chr2:3667536-3667555 None:intergenic 35.0%
GTCATCAGTGGTATTAATGT+TGG - Chr2:3670764-3670783 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
GTGAAGGTGAAATTAGTGTT+TGG + Chr2:3667400-3667419 None:intergenic 35.0%
TAACTATATTCACCCGAAGA+AGG + Chr2:3667836-3667855 None:intergenic 35.0%
TATGGTATTTGTGGTGCTTA+TGG - Chr2:3668157-3668176 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
TCAGTGGTATTAATGTTGGA+TGG - Chr2:3670768-3670787 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
TGCTGAGGTAATAATAGTAG+AGG + Chr2:3668773-3668792 None:intergenic 35.0%
TGGACTCCTTATTATTTGGT+TGG - Chr2:3669730-3669749 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
TGGTATGTGGAACAATACAA+AGG - Chr2:3667929-3667948 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAATCATGCATATTCCT+TGG + Chr2:3668235-3668254 None:intergenic 35.0%
TTGAGTGGCAAGAAAAACAA+AGG - Chr2:3670261-3670280 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
TTGTATTGTTCCACATACCA+TGG + Chr2:3667929-3667948 None:intergenic 35.0%
TTGTTACCAGGAATGAAACT+TGG - Chr2:3667752-3667771 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
! AAATTTTCAGAAGTGGACCA+TGG - Chr2:3667909-3667928 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
! ACCACAAAGGAAATGTTTTC+TGG - Chr2:3667594-3667613 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
! CCACAAAGGAAATGTTTTCT+GGG - Chr2:3667595-3667614 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
! GCAAGCAATGTTCTTTTAGA+TGG - Chr2:3669968-3669987 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
! GGTGCAATAAAGTTTTACAC+TGG - Chr2:3670452-3670471 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
! TAATGGATCCATCAACTCAA+TGG + Chr2:3670649-3670668 None:intergenic 35.0%
! TCCCACATATTTTACCACTA+TGG - Chr2:3669251-3669270 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGAATGGCAAGAATGTT+TGG - Chr2:3670016-3670035 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAATGCTTGATTGGTCTAG+TGG - Chr2:3668253-3668272 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTCAGCTTTTTCTTCAAAA+AGG - Chr2:3667878-3667897 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTTTTTGAAGAAAAAGCTG+AGG + Chr2:3667881-3667900 None:intergenic 35.0%
!! GCTATTTCTCTGTGATTATG+TGG - Chr2:3669111-3669130 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAAGGTCATGTTTGGTTTG+AGG - Chr2:3669311-3669330 MsG0280006580.01.T01:intron 35.0%
!!! TATTTTGGAGTGTACCATAG+TGG + Chr2:3669268-3669287 None:intergenic 35.0%
!!! TTACTTTTAGAGCTGTTGAG+TGG - Chr2:3670246-3670265 MsG0280006580.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTTCCTATCATGCCTAC+TGG + Chr2:3669175-3669194 None:intergenic 35.0%
AAAAGGCTCTCAGAGAATTC+TGG - Chr2:3669570-3669589 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
AAGACCAACAATGTCATCAG+TGG - Chr2:3670752-3670771 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
AAGGAGTCCAAGCTTCTATT+TGG + Chr2:3669720-3669739 None:intergenic 40.0%
ACTAAGAGGGTAAGTAGCTT+TGG + Chr2:3669472-3669491 None:intergenic 40.0%
AGAGAAATCTGATCGGATGA+AGG - Chr2:3670431-3670450 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTTTCAGCTTCAGAACT+AGG - Chr2:3668538-3668557 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
AGCCAAGGAATATGCATGAT+TGG - Chr2:3668230-3668249 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGATTCAACTTGTGATC+AGG + Chr2:3670297-3670316 None:intergenic 40.0%
ATAAGGGAGGATTCTGTGAA+TGG - Chr2:3668499-3668518 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
CCATTATTGAAGCTGCAACA+AGG - Chr2:3669027-3669046 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
CCCAGAAAACATTTCCTTTG+TGG + Chr2:3667598-3667617 None:intergenic 40.0%
CCTTGTTGCAGCTTCAATAA+TGG + Chr2:3669030-3669049 None:intergenic 40.0%
CTTCTTGGTTGTTGCATTCA+AGG - Chr2:3669663-3669682 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGTTGGAACTTCAAAAC+TGG - Chr2:3667770-3667789 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
GAAAAGACCAAAAGGGTAGT+TGG - Chr2:3670055-3670074 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
GACACTTGATCCTCAAGTAA+TGG + Chr2:3670666-3670685 None:intergenic 40.0%
GACGAGAAATAGCAGTGAAA+AGG - Chr2:3669553-3669572 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
GGAATGATCATCGTTCGAAT+TGG - Chr2:3668095-3668114 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
GGAGATTCAACTTGTGATCA+GGG + Chr2:3670296-3670315 None:intergenic 40.0%
GTTACCACTACTGTAGTAGA+GGG - Chr2:3670906-3670925 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
TACCAGGAATGAAACTTGGT+TGG - Chr2:3667756-3667775 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
TAGAACAACTGTCTTCCAGT+AGG - Chr2:3669157-3669176 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
TGCGATGGTTATGGTATTTG+TGG - Chr2:3668148-3668167 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTACCAGTGATGATTTG+TGG + Chr2:3667380-3667399 None:intergenic 40.0%
TGTTACCACTACTGTAGTAG+AGG - Chr2:3670905-3670924 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
TTATAACACTCACATGGCCT+AGG + Chr2:3670317-3670336 None:intergenic 40.0%
TTCCAACCAAGTTTCATTCC+TGG + Chr2:3667761-3667780 None:intergenic 40.0%
! AAGATTGGAGAAGGTGGATT+TGG - Chr2:3669068-3669087 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
! ATTGGATTTTCCCTTAGAGC+TGG + Chr2:3667959-3667978 None:intergenic 40.0%
! ATTGGTCTAGTGGATGTGTT+AGG - Chr2:3668263-3668282 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
! CTATGTTCCAACTACCCTTT+TGG + Chr2:3670065-3670084 None:intergenic 40.0%
! GATCACAAGTTGAATCTCCT+AGG - Chr2:3670297-3670316 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
! GATGATTTGTGGTGGAGTTA+TGG + Chr2:3667369-3667388 None:intergenic 40.0%
! GTTGATGGATCCATTACTTG+AGG - Chr2:3670653-3670672 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
! TTACCAGTGATGATTTGTGG+TGG + Chr2:3667377-3667396 None:intergenic 40.0%
! TTGGTCTAGTGGATGTGTTA+GGG - Chr2:3668264-3668283 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
!! AACGTTGATGATCCTTCTTC+GGG - Chr2:3667821-3667840 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
!! AGGTAAAGCCATTGAGTTGA+TGG - Chr2:3670638-3670657 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTTATAGTGTTGATCCACG+TGG - Chr2:3667851-3667870 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
!! GAACGTTGATGATCCTTCTT+CGG - Chr2:3667820-3667839 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
!! GACATTGTTGGTCTTTCTTC+TGG + Chr2:3670747-3670766 None:intergenic 40.0%
!! GCTTTGGTAGCTTTTCTTGA+TGG + Chr2:3669456-3669475 None:intergenic 40.0%
!! GTGGTAATGGTTGTATTGCT+TGG - Chr2:3668458-3668477 MsG0280006580.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTTGAATGGTTTTGAGCCA+AGG - Chr2:3668215-3668234 MsG0280006580.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAGGTGATCCAGCTCTA+AGG - Chr2:3667945-3667964 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
ACTCCACCACAAATCATCAC+TGG - Chr2:3667371-3667390 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGCATACAGAGGTAAAG+AGG + Chr2:3668937-3668956 None:intergenic 45.0%
CACCTCTCTGAATACAAACC+TGG + Chr2:3670825-3670844 None:intergenic 45.0%
CCATGCCTAACACATTTCCA+TGG + Chr2:3670604-3670623 None:intergenic 45.0%
CCATGGAAATGTGTTAGGCA+TGG - Chr2:3670601-3670620 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
CGAAATCTCGTCAAGCTTCT+TGG - Chr2:3669648-3669667 MsG0280006580.01.T01:intron 45.0%
CTCTCAGAGAATTCTGGACA+AGG - Chr2:3669576-3669595 MsG0280006580.01.T01:intron 45.0%
CTGTATGCAGCTAAAGAGAC+AGG - Chr2:3668945-3668964 MsG0280006580.01.T01:intron 45.0%
GAGACAGATTCATCATCACG+TGG - Chr2:3670852-3670871 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
GGAATGGCAAGAATGTTTGG+TGG - Chr2:3670019-3670038 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
GTCTCTTTAGCTGCATACAG+AGG + Chr2:3668945-3668964 None:intergenic 45.0%
TCACGTGGTATGCTCAATTC+TGG - Chr2:3670867-3670886 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
TCTGGGCCTCAAATTCATCT+GGG - Chr2:3667612-3667631 MsG0280006580.01.T01:intron 45.0%
TGAGCTACTGGATTCTTTGC+AGG + Chr2:3667638-3667657 None:intergenic 45.0%
TGTCTTCCAGTAGGCATGAT+AGG - Chr2:3669166-3669185 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTTAGGCATGGAAGCTT+TGG - Chr2:3670610-3670629 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGCTCCCAAAACCTAGA+AGG - Chr2:3670799-3670818 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
TTCTGGGCCTCAAATTCATC+TGG - Chr2:3667611-3667630 MsG0280006580.01.T01:intron 45.0%
! CAAAGGTGATCCAGCTCTAA+GGG - Chr2:3667946-3667965 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
! CCTCTTTTGCCAATTAAGCG+CGG + Chr2:3669864-3669883 None:intergenic 45.0%
! GAATACAAACCTGGCCTTCT+AGG + Chr2:3670816-3670835 None:intergenic 45.0%
!! AAACCTGGCCTTCTAGGTTT+TGG + Chr2:3670810-3670829 None:intergenic 45.0%
!! AACCTGGCCTTCTAGGTTTT+GGG + Chr2:3670809-3670828 None:intergenic 45.0%
!! ACTGCTATTTCTCGTCCTGA+TGG + Chr2:3669549-3669568 None:intergenic 45.0%
!! GCATGGAAGCTTTGGAATGA+AGG - Chr2:3670618-3670637 MsG0280006580.01.T01:CDS 45.0%
AAAAGCTGAGGAAGTCCACG+TGG + Chr2:3667869-3667888 None:intergenic 50.0%
ACGACCCTCTACTACAGTAG+TGG + Chr2:3670913-3670932 None:intergenic 50.0%
CAGAAGTGGACCATGGTATG+TGG - Chr2:3667916-3667935 MsG0280006580.01.T01:CDS 50.0%
CATGTCTCCAGAGTACGCAA+TGG - Chr2:3670179-3670198 MsG0280006580.01.T01:CDS 50.0%
CCGCGCTTAATTGGCAAAAG+AGG - Chr2:3669861-3669880 MsG0280006580.01.T01:CDS 50.0%
GGCCAGGTTTGTATTCAGAG+AGG - Chr2:3670820-3670839 MsG0280006580.01.T01:CDS 50.0%
GTAGCTCAGCTTCTAGACAC+TGG - Chr2:3667650-3667669 MsG0280006580.01.T01:intron 50.0%
GTGTCTAGAAGCTGAGCTAC+TGG + Chr2:3667650-3667669 None:intergenic 50.0%
TCTCCAGAGTACGCAATGGA+TGG - Chr2:3670183-3670202 MsG0280006580.01.T01:CDS 50.0%
TGCAGGCCCAGATGAATTTG+AGG + Chr2:3667621-3667640 None:intergenic 50.0%
TGTCCATCCATTGCGTACTC+TGG + Chr2:3670189-3670208 None:intergenic 50.0%
TTTCTCGTCCTGATGGAAGC+TGG + Chr2:3669542-3669561 None:intergenic 50.0%
!!! TTTTAGGGCCAGCTTCCATC+AGG - Chr2:3669531-3669550 MsG0280006580.01.T01:intron 50.0%
CCAAGCGTTCCGCGCTTAAT+TGG - Chr2:3669852-3669871 MsG0280006580.01.T01:CDS 55.0%
CCAATTAAGCGCGGAACGCT+TGG + Chr2:3669855-3669874 None:intergenic 55.0%
CTCCCAAAACCTAGAAGGCC+AGG - Chr2:3670804-3670823 MsG0280006580.01.T01:CDS 55.0%
GGCGACCAATGCGATGGTTA+TGG - Chr2:3668139-3668158 MsG0280006580.01.T01:CDS 55.0%
GTTCAAGGCGACCAATGCGA+TGG - Chr2:3668133-3668152 MsG0280006580.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 3667278 3670935 3667278 ID=MsG0280006580.01;Name=MsG0280006580.01
Chr2 mRNA 3667278 3670935 3667278 ID=MsG0280006580.01.T01;Parent=MsG0280006580.01;Name=MsG0280006580.01.T01;_AED=0.17;_eAED=0.18;_QI=0|0|0|1|1|1|7|0|845
Chr2 exon 3669654 3670935 3669654 ID=MsG0280006580.01.T01:exon:1765;Parent=MsG0280006580.01.T01
Chr2 exon 3669384 3669506 3669384 ID=MsG0280006580.01.T01:exon:1764;Parent=MsG0280006580.01.T01
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